SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_22845 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_22845 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2vi7C Structure of a putative acetyltransferase (pa1377)from pseudomonas aeruginosa (see paper)
70% identity, 94% coverage: 6:168/173 of query aligns to 2:165/165 of 2vi7C

query
sites
2vi7C
P
 
P
V
 
T
I
 
I
S
 
R
I
 
L
E
 
E
R
 
R
M
 
Y
S
 
S
E
 
E
A
 
R
H
 
H
I
 
V
E
 
E
G
 
G
I
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
P
 
P
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
M
 
M
P
 
P
F
 
Y
Q
 
Q
S
 
S
T
 
V
E
 
E
V
 
Q
W
 
R
R
 
R
K
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
H
-
 
D
P
 
S
E
 
D
N
 
D
E
 
D
R
 
R
V
 
L
V
 
L
Q
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
S
V
 
A
G
 
S
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
V
 
H
S
 
P
R
|
R
I
|
I
R
 
R
R
 
R
S
 
S
H
 
H
C
 
S
A
 
G
N
 
S
I
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
W
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
V
G
 
G
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
E
V
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
D
N
 
N
W
 
W
M
 
M
N
 
N
V
 
L
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
A
 
T
D
 
D
N
 
N
E
 
A
A
 
P
A
 
A
I
 
L
G
 
A
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
D
 
E
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
E
F
 
M
R
 
R
E
 
D
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
V
 
R
L
 
F
V
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
Y
S
 
S
M
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
L
R
 
R
R
 
R

2ge3A Crystal structure of probable acetyltransferase from agrobacterium tumefaciens
44% identity, 62% coverage: 58:164/173 of query aligns to 55:160/164 of 2ge3A

query
sites
2ge3A
Q
 
Q
L
 
F
V
 
V
A
 
A
L
 
I
H
 
A
Q
 
D
G
 
G
Q
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
W
V
 
C
G
 
D
L
 
I
E
 
R
Q
 
R
V
 
Q
S
 
D
R
 
R
I
 
A
R
 
T
R
 
R
S
 
A
H
 
H
C
 
C
A
 
G
N
 
T
I
 
L
G
 
G
M
|
M
G
|
G
V
x
I
A
 
L
V
 
P
A
 
A
W
 
Y
Q
x
R
G
x
N
K
 
K
G
|
G
V
 
L
G
|
G
S
x
A
R
 
R
L
 
L
L
 
M
A
 
R
A
 
R
V
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
A
A
 
A
D
 
H
N
 
E
W
 
F
M
 
-
N
 
G
V
 
L
Q
 
H
R
 
R
V
 
I
E
 
E
L
 
L
S
|
S
V
|
V
Y
 
H
A
 
A
D
 
D
N
|
N
E
 
A
A
x
R
A
|
A
I
 
I
G
x
A
L
|
L
Y
|
Y
R
 
E
K
|
K
F
 
I
G
 
G
F
 
F
D
 
A
T
 
H
E
 
E
G
 
G
L
 
R
F
 
A
R
 
R
E
 
D
Y
 
A
A
 
V
V
 
S
R
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
H
L
 
Y
V
 
I
D
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
N
M
 
M
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3wr7A Crystal structure of spermidine acetyltransferase from escherichia coli (see paper)
27% identity, 83% coverage: 21:164/173 of query aligns to 16:159/170 of 3wr7A

query
sites
3wr7A
I
 
V
T
 
H
A
 
Q
L
 
L
Y
 
D
N
 
N
D
 
N
P
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
M
R
 
R
Q
x
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
x
Y
Q
 
E
S
 
A
-
 
F
-
 
V
-
x
E
-
 
L
T
 
S
E
 
D
V
 
L
W
 
Y
R
 
D
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
Q
N
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
-
V
 
-
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
V
L
 
E
H
 
C
Q
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
K
I
 
A
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
V
Q
 
E
V
 
I
S
 
N
R
 
H
I
 
V
R
 
H
R
 
R
S
 
R
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
x
Q
M
x
I
G
 
I
V
 
I
A
 
S
V
 
P
A
 
E
W
 
Y
Q
|
Q
G
|
G
K
|
K
G
|
G
V
x
L
G
x
A
S
 
T
R
 
R
L
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
A
L
 
M
D
 
D
L
 
Y
A
 
G
D
 
F
N
 
T
W
 
V
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
Y
R
 
K
V
 
L
E
 
Y
L
 
L
S
x
I
V
 
V
Y
 
D
A
 
K
D
 
E
N
 
N
E
 
E
A
x
K
A
 
A
I
 
I
G
 
H
L
 
I
Y
|
Y
R
 
R
K
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
G
-
 
E
L
 
L
F
 
M
R
 
H
E
 
E
Y
 
F
A
 
F
V
 
I
R
 
-
D
 
N
G
 
G
V
 
Q
L
 
Y
V
 
R
D
 
N
A
 
A
L
 
I
S
 
R
M
 
M
A
 
C

P0A951 Spermidine N(1)-acetyltransferase; SAT; Spermidine/spermine N(1)-acetyltransferase; SSAT; EC 2.3.1.57 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
27% identity, 83% coverage: 21:164/173 of query aligns to 20:163/186 of P0A951

query
sites
P0A951
I
 
V
T
 
H
A
 
Q
L
 
L
Y
 
D
N
 
N
D
 
N
P
 
A
A
 
S
V
 
V
A
 
M
R
 
R
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
 
L
T
 
S
E
 
D
V
 
L
W
 
Y
R
 
D
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
Q
N
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
-
V
 
-
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
V
L
 
E
H
 
C
Q
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
K
I
 
A
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
V
Q
x
E
V
 
I
S
 
N
R
 
H
I
 
V
R
 
H
R
 
R
S
 
R
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
S
V
 
P
A
 
E
W
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
L
G
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
A
L
 
M
D
 
D
L
 
Y
A
 
G
D
 
F
N
 
T
W
 
V
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
Y
R
 
K
V
 
L
E
 
Y
L
 
L
S
 
I
V
 
V
Y
 
D
A
 
K
D
 
E
N
 
N
E
 
E
A
 
K
A
 
A
I
 
I
G
 
H
L
 
I
Y
|
Y
R
 
R
K
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
G
-
 
E
L
 
L
F
 
M
R
 
H
E
 
E
Y
 
F
A
 
F
V
 
I
R
 
-
D
 
N
G
 
G
V
 
Q
L
 
Y
V
 
R
D
 
N
A
 
A
L
 
I
S
 
R
M
 
M
A
 
C

Sites not aligning to the query:

4r9mA Crystal structure of spermidine n-acetyltransferase from escherichia coli (see paper)
26% identity, 84% coverage: 19:164/173 of query aligns to 15:160/169 of 4r9mA

query
sites
4r9mA
E
 
E
G
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
Y
L
 
V
Y
 
H
N
 
Q
D
 
L
P
 
D
A
 
S
V
 
V
A
 
M
R
 
R
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
 
L
T
 
S
E
 
D
V
 
L
W
 
Y
R
 
D
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
Q
N
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
-
V
 
-
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
A
 
V
L
 
E
H
 
C
Q
 
D
G
 
G
Q
 
E
V
 
K
I
 
A
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
V
Q
x
E
V
 
I
S
 
N
R
 
H
I
 
V
R
 
H
R
 
R
S
 
R
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
S
V
 
P
A
 
E
W
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
L
G
 
A
S
 
T
R
 
R
L
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
A
L
 
M
D
 
D
L
 
Y
A
 
G
D
 
F
N
 
T
W
 
V
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
Y
R
 
K
V
 
L
E
 
Y
L
 
L
S
 
I
V
 
V
Y
 
D
A
 
K
D
 
E
N
 
N
E
 
E
A
 
K
A
 
A
I
 
I
G
 
H
L
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
S
T
 
V
E
 
E
G
 
G
-
 
E
L
 
L
F
 
M
R
 
H
E
 
E
Y
 
F
A
 
F
V
 
I
R
 
-
D
 
N
G
 
G
V
 
Q
L
 
Y
V
 
R
D
 
N
A
 
A
L
 
I
S
 
R
M
 
M
A
 
C

6e1xC Crystal structure of product-bound complex of spermidine/spermine n- acetyltransferase speg
26% identity, 96% coverage: 2:167/173 of query aligns to 2:168/176 of 6e1xC

query
sites
6e1xC
S
 
N
A
 
A
I
 
M
D
 
N
P
 
S
V
 
Q
I
 
L
S
 
T
I
 
L
E
 
R
R
 
A
M
 
L
S
 
E
E
 
R
A
 
G
H
 
D
I
 
L
E
 
R
G
 
F
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
x
W
L
 
F
Q
 
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
x
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
A
S
 
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
 
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

6cx8A Crystal structure of spermidine/spermine n-acetyltransferase speg from vibrio cholerae in complex with manganese ions.
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 18:165/173 of 6cx8A

query
sites
6cx8A
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
x
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
A
S
 
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
 
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

Q9KL03 Spermidine N(1)-acetyltransferase; SAT; Spermidine/spermine N(1)-acetyltransferase; SSAT; EC 2.3.1.57 from Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) (see 2 papers)
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 18:165/173 of Q9KL03

query
sites
Q9KL03
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
x
M
R
 
S
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
x
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
x
H
L
x
I
A
x
H
P
x
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
x
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
x
E
I
x
F
G
x
Q
M
x
I
G
x
I
V
x
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
|
Q
G
|
G
K
|
K
G
|
G
V
x
F
G
x
A
S
x
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
 
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
|
N
E
x
P
A
x
K
A
|
A
I
x
V
G
x
H
L
|
L
Y
|
Y
R
x
E
K
x
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

6e1xA Crystal structure of product-bound complex of spermidine/spermine n- acetyltransferase speg
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 17:164/170 of 6e1xA

query
sites
6e1xA
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
x
W
L
 
F
Q
 
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
x
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
A
S
 
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
x
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
x
E
A
x
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

5cnpB X-ray crystal structure of spermidine n1-acetyltransferase from vibrio cholerae. (see paper)
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 17:164/171 of 5cnpB

query
sites
5cnpB
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
x
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
A
S
 
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
 
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

4r87A Crystal structure of spermidine n-acetyltransferase from vibrio cholerae in complex with coa and spermine (see paper)
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 17:164/170 of 4r87A

query
sites
4r87A
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
x
W
L
 
F
Q
 
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
x
I
G
x
I
V
x
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
|
Q
G
|
G
K
 
K
G
|
G
V
 
F
G
x
A
S
x
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
x
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
|
L
Y
|
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

4r57A Crystal structure of spermidine n-acetyltransferase from vibrio cholerae in complex with acetyl-coa (see paper)
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 17:164/170 of 4r57A

query
sites
4r57A
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
x
Y
V
x
W
L
 
F
Q
 
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
x
Q
M
x
I
G
x
I
V
x
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
|
Q
G
|
G
K
 
K
G
|
G
V
x
F
G
x
A
S
x
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
x
H
V
|
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
|
N
E
 
P
A
x
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
|
L
Y
|
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

4nczA Spermidine n-acetyltransferase from vibrio cholerae in complex with 2- [n-cyclohexylamino]ethane sulfonate. (see paper)
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 17:164/170 of 4nczA

query
sites
4nczA
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
x
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
A
S
 
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
 
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

4mi4A Crystal structure of spermidine n-acetyltransferase from vibrio cholerae in complex with spermine (see paper)
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 17:164/170 of 4mi4A

query
sites
4mi4A
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
x
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
x
E
P
 
P
F
x
Y
Q
x
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
x
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
A
S
 
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
 
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

4mhdA Crystal structure of spermidine n-acetyltransferase from vibrio cholerae in complex with spermidine (see paper)
28% identity, 85% coverage: 21:167/173 of query aligns to 17:164/170 of 4mhdA

query
sites
4mhdA
I
 
I
T
 
H
A
 
N
L
 
L
Y
 
N
N
 
N
D
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
x
Y
Q
 
E
S
 
S
-
 
F
-
 
D
-
x
E
-
 
L
T
 
E
E
 
E
V
 
L
W
 
Y
R
 
N
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
N
N
 
A
E
 
E
R
 
R
V
 
R
V
 
F
Q
 
-
L
 
V
V
 
V
A
 
E
L
 
D
H
 
A
Q
 
Q
G
 
K
Q
 
N
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
I
Q
 
E
V
 
I
S
 
N
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
S
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
A
V
 
P
A
 
E
W
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
F
G
 
A
S
 
R
R
 
T
L
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
V
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
Y
A
 
S
D
 
F
N
 
T
W
 
I
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
 
H
V
 
V
Y
 
A
A
 
V
D
 
E
N
 
N
E
 
P
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
K
 
E
F
 
C
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
H
F
 
L
R
 
V
E
 
E
Y
 
E
A
 
F
V
 
F
R
 
I
D
 
N
G
 
G
V
 
R
L
 
Y
V
 
Q
D
 
D
A
 
V
L
 
K
S
 
R
M
 
M
A
 
Y
R
 
I
L
 
L
R
 
Q

6yzzA Arabidopsis thaliana naa50 in complex with accoa (see paper)
37% identity, 38% coverage: 89:153/173 of query aligns to 75:138/151 of 6yzzA

query
sites
6yzzA
M
 
L
G
|
G
V
|
V
A
 
L
V
 
A
A
 
P
W
 
Y
Q
x
R
G
|
G
K
 
I
G
|
G
V
 
I
G
|
G
S
|
S
R
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
H
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
M
A
 
C
D
 
S
N
 
K
W
 
-
M
 
Q
N
 
N
V
 
M
Q
 
C
R
 
E
V
 
I
E
 
Y
L
|
L
S
 
H
V
 
V
Y
 
Q
A
 
T
D
 
N
N
 
N
E
 
E
A
 
D
A
 
A
I
 
I
G
 
K
L
x
F
Y
|
Y
R
 
K
K
|
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
D
 
E
T
 
I
E
 
T
G
 
D
L
 
T
F
 
I
R
 
Q
E
 
N
Y
 
Y
A
 
Y
V
 
I
R
 
N

6z00A Arabidopsis thaliana naa50 in complex with bisubstrate analogue coa- ac-mvnal (see paper)
38% identity, 37% coverage: 89:152/173 of query aligns to 80:142/156 of 6z00A

query
sites
6z00A
M
x
L
G
|
G
V
|
V
A
 
L
V
 
A
A
 
P
W
 
Y
Q
x
R
G
|
G
K
 
I
G
|
G
V
 
I
G
|
G
S
|
S
R
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
H
V
 
V
L
 
L
D
 
D
L
 
M
A
 
C
D
 
S
N
 
K
W
 
-
M
 
Q
N
 
N
V
 
M
Q
 
C
R
 
E
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
x
H
V
|
V
Y
 
Q
A
 
T
D
 
N
N
 
N
E
 
E
A
x
D
A
 
A
I
 
I
G
 
K
L
x
F
Y
|
Y
R
 
K
K
 
K
F
 
F
G
 
G
F
 
F
D
 
E
T
 
I
E
 
T
G
 
D
L
 
T
F
 
I
R
 
Q
E
 
N
Y
|
Y
A
x
Y
V
 
I

Sites not aligning to the query:

2i79A The crystal structure of the acetyltransferase of gnat family from streptococcus pneumoniae
27% identity, 73% coverage: 40:166/173 of query aligns to 44:170/171 of 2i79A

query
sites
2i79A
Q
 
E
S
 
E
T
 
M
E
 
E
V
 
I
W
 
F
R
 
L
K
 
N
R
 
K
L
 
Q
A
 
A
P
 
S
E
 
S
N
 
D
E
 
N
R
 
Q
V
 
I
V
 
T
Q
 
-
L
 
L
V
 
L
A
 
A
L
 
F
H
 
L
Q
 
N
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
I
 
A
G
 
G
N
 
I
V
 
V
G
 
N
L
 
I
E
 
T
Q
 
A
V
 
D
S
 
Q
R
 
R
I
 
K
R
 
R
R
 
V
S
 
R
H
 
H
C
 
I
A
 
G
N
 
D
I
 
L
G
x
F
M
x
I
G
x
V
V
x
I
A
 
G
V
 
K
A
 
R
W
 
Y
Q
x
W
G
x
N
K
 
N
G
|
G
V
 
L
G
|
G
S
|
S
R
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
E
V
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
W
A
 
A
D
 
Q
N
 
A
W
 
S
M
 
G
N
 
I
V
 
L
Q
 
R
R
 
R
V
 
L
E
 
Q
L
|
L
S
 
T
V
 
V
Y
 
Q
A
 
T
D
 
R
N
 
N
E
x
Q
A
|
A
A
 
A
I
 
V
G
x
H
L
 
L
Y
|
Y
R
 
Q
K
 
K
F
 
H
G
 
G
F
 
F
D
 
V
T
 
I
E
 
E
G
 
G
L
 
S
F
 
Q
R
 
E
E
 
R
Y
 
G
A
 
A
-
 
Y
V
 
I
R
 
E
D
 
E
G
 
G
V
 
K
L
 
F
V
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
Y
S
 
L
M
 
M
A
 
G
R
 
K
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6d72B Crystal structure of spermidine/spermine n-acetyltransferase speg from yersinia pestis in complex with calcium ions.
26% identity, 72% coverage: 21:145/173 of query aligns to 21:145/176 of 6d72B

query
sites
6d72B
I
 
V
T
 
H
A
 
Q
L
 
L
Y
 
D
N
 
N
D
 
N
P
 
A
A
 
S
V
 
I
A
 
M
R
 
R
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
 
Y
Q
 
E
S
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
E
-
 
L
T
 
C
E
 
D
V
 
L
W
 
Y
R
 
D
K
 
K
R
 
H
L
 
I
A
 
H
P
 
D
E
 
Q
N
 
S
E
 
E
R
 
R
V
 
-
V
 
-
Q
 
R
L
 
F
V
 
I
A
 
I
L
 
E
H
 
S
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
T
V
 
K
I
 
I
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
V
Q
x
E
V
 
I
S
 
N
R
 
H
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
R
H
 
-
C
 
-
A
 
A
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
D
V
 
P
A
 
T
W
 
H
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
Y
G
 
A
S
 
G
R
 
A
L
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
L
V
 
A
L
 
M
D
 
E
L
 
Y
A
 
G
D
 
F
N
 
S
W
 
V
M
 
L
N
 
N
V
 
L
Q
 
Y
R
 
K
V
 
L
E
 
Y
L
 
L
S
 
I
V
 
V
Y
 
D
A
 
K
D
 
E
N
 
N
E
 
E
A
 
K
A
 
A
I
 
I
G
 
H
L
 
I
Y
 
Y
R
 
S
K
 
K
F
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
E
T
 
I
E
 
E
G
 
G

6vfnA Crystal structure of speg allosteric polyamine acetyltransferase from bacillus thuringiensis in complex with spermine (see paper)
22% identity, 87% coverage: 18:168/173 of query aligns to 12:162/167 of 6vfnA

query
sites
6vfnA
I
 
L
E
 
K
G
 
F
I
 
V
T
 
H
A
 
E
L
 
L
Y
x
N
N
 
N
D
 
N
P
 
A
A
 
H
V
 
I
A
 
M
R
 
S
Q
 
Y
V
 
W
L
 
F
Q
x
E
M
 
E
P
 
P
F
x
Y
Q
x
E
S
 
A
-
 
F
-
 
V
-
x
E
-
 
L
T
 
Q
E
 
D
V
 
L
W
 
Y
R
 
D
K
 
K
R
 
H
L
x
I
A
 
H
P
x
D
E
x
Q
N
 
S
E
 
E
R
|
R
V
 
-
V
 
-
Q
 
R
L
 
F
V
 
I
A
 
V
L
 
E
H
 
K
Q
 
D
G
 
N
Q
 
E
V
 
M
I
 
V
G
 
G
N
 
L
V
 
V
G
 
E
L
 
L
E
 
V
Q
 
E
V
 
I
S
 
D
R
 
Y
I
 
I
R
 
H
R
 
R
S
 
R
H
 
-
C
 
-
A
 
T
N
 
E
I
 
F
G
 
Q
M
 
I
G
 
I
V
 
I
A
 
D
V
 
P
A
 
N
W
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
K
 
Y
G
 
G
V
 
Y
G
 
A
S
 
V
R
 
D
L
 
A
L
 
T
A
 
R
A
 
L
V
 
A
L
 
M
D
 
D
L
 
Y
A
 
A
D
 
F
N
 
S
W
 
V
M
 
L
N
 
N
V
 
M
Q
 
H
R
 
K
V
 
I
E
 
Y
L
 
L
S
 
V
V
 
V
Y
 
D
A
 
K
D
 
E
N
 
N
E
 
E
A
 
K
A
 
A
I
 
V
G
 
H
L
 
V
Y
 
Y
R
 
K
K
 
K
F
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
M
T
 
V
E
 
E
G
 
G
-
 
E
L
 
L
F
 
I
R
 
D
E
 
E
Y
 
F
A
 
F
V
 
V
R
 
-
D
 
D
G
 
G
V
 
N
L
 
Y
V
 
H
D
 
N
A
 
A
L
 
I
S
 
R
M
 
M
A
 
C
R
 
M
L
 
F
R
 
Q
R
 
K

Query Sequence

>AO353_22845 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_22845
MSAIDPVISIERMSEAHIEGITALYNDPAVARQVLQMPFQSTEVWRKRLAPENERVVQLV
ALHQGQVIGNVGLEQVSRIRRSHCANIGMGVAVAWQGKGVGSRLLAAVLDLADNWMNVQR
VELSVYADNEAAIGLYRKFGFDTEGLFREYAVRDGVLVDALSMARLRRLLKAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory