SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_23780 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_23780 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
36% identity, 83% coverage: 23:286/317 of query aligns to 16:280/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
V
 
V
L
 
L
D
 
K
G
 
D
I
 
A
G
 
G
K
 
L
V
 
E
S
 
V
F
 
I
L
 
Y
H
 
E
D
 
E
Y
 
Y
P
 
P
A
 
-
D
 
D
H
 
E
P
 
D
T
 
R
L
 
L
S
 
V
D
 
E
R
 
L
L
 
V
Q
 
K
S
 
D
F
 
V
E
 
E
V
 
A
I
 
I
C
 
I
V
 
V
M
 
-
R
 
R
E
 
S
R
 
K
T
 
P
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
R
A
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
E
N
 
S
L
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
V
L
 
I
V
 
A
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
V
R
 
G
N
 
L
A
 
D
A
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
E
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
V
 
V
C
 
V
G
 
N
T
 
A
D
 
P
S
 
A
-
 
A
Y
x
S
K
 
S
Q
 
R
A
 
S
A
x
V
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
A
W
 
V
T
 
G
L
 
L
I
 
M
M
 
F
A
 
S
L
 
V
T
 
A
R
 
R
N
 
K
L
 
I
L
 
A
A
 
F
E
 
A
A
 
D
N
 
R
A
 
K
L
 
M
R
 
R
A
 
E
G
 
G
H
 
V
W
 
W
-
 
A
-
 
K
Q
 
K
Q
 
E
G
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
I
D
 
E
L
 
L
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
R
 
Q
I
 
V
A
 
A
E
 
K
F
 
I
G
 
A
Q
 
N
V
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
R
 
N
V
 
I
I
 
L
A
 
L
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
 
Y
L
 
P
T
 
N
A
 
E
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
K
E
 
E
A
 
V
G
 
N
V
 
G
T
 
K
F
 
F
V
 
V
S
 
D
K
 
L
R
 
E
E
 
T
L
 
L
F
 
L
E
 
K
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
V
S
 
T
I
 
I
H
 
H
L
x
V
V
x
P
L
 
L
S
 
V
E
 
E
R
 
S
S
x
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
G
 
K
W
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
S
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
P
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
N
 
G
R
 
W
L
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
L
A
 
P
A
 
K
D
 
D
H
 
H
P
 
P
F
 
L
R
 
T
T
 
K
L
 
F
P
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
33% identity, 74% coverage: 52:286/317 of query aligns to 49:290/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
V
 
L
I
 
V
C
 
T
V
x
M
M
x
L
R
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
-
L
 
-
F
 
I
D
 
D
E
 
Q
A
 
E
L
 
V
L
 
F
R
 
E
N
 
N
L
 
A
P
 
P
K
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
L
 
V
V
 
A
T
 
N
G
x
Y
G
x
A
M
x
V
R
x
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
K
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
Y
V
 
V
C
 
T
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
D
S
 
V
Y
x
L
K
 
T
Q
 
N
A
 
A
A
x
T
P
 
A
E
 
D
L
 
H
T
 
A
W
 
F
T
 
A
L
 
L
I
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
T
T
 
A
R
 
R
N
 
H
L
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
G
A
 
D
N
 
K
A
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
H
 
E
W
 
W
Q
 
K
Q
 
R
G
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
Y
D
 
E
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
R
F
 
R
G
 
A
Q
 
K
V
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
R
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
Y
W
 
Y
S
|
S
E
x
R
N
 
T
L
 
R
T
 
K
A
 
S
E
 
Q
R
 
A
A
 
E
A
 
K
E
 
E
A
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
E
F
 
Y
V
 
R
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
L
E
 
K
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
S
 
I
I
 
L
H
x
A
L
x
V
V
x
P
L
 
L
S
 
T
E
 
K
R
 
E
S
x
T
R
 
M
G
 
Y
L
 
M
V
 
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
G
 
K
W
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
N
 
G
R
 
W
L
 
I
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
A
 
N
D
 
E
H
 
E
P
 
L
F
 
F
R
 
-
T
 
S
L
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
35% identity, 73% coverage: 55:286/317 of query aligns to 46:279/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
V
 
L
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
T
F
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
E
L
 
V
L
 
L
R
 
A
N
 
A
L
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
A
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
V
R
 
G
N
 
L
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
R
G
 
G
I
 
V
Q
 
L
V
 
V
C
 
V
G
 
N
T
 
A
D
 
P
S
 
T
Y
 
S
K
x
N
-
 
I
Q
 
H
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
A
W
 
L
T
 
A
L
 
L
I
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
A
T
 
S
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
A
E
 
A
A
 
D
N
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
H
H
 
T
W
 
W
Q
 
K
Q
 
R
G
 
S
L
 
S
-
 
F
-
 
S
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
F
 
R
G
 
I
Q
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
R
 
Y
V
 
V
I
 
V
A
 
A
W
 
Y
S
 
D
E
 
P
N
 
Y
L
 
V
T
 
S
A
 
P
E
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
E
F
 
L
V
 
L
S
 
S
K
 
L
R
 
D
E
 
D
L
 
L
F
 
L
E
 
A
Q
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
S
I
 
V
H
 
H
L
 
L
V
 
P
L
 
K
S
 
T
E
 
P
R
 
E
S
 
T
R
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
W
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
S
 
G
A
 
V
L
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
Q
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
T
Q
 
G
N
 
G
R
 
H
L
 
V
K
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
-
A
 
C
A
 
T
D
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
R
 
F
T
 
E
L
 
L
P
 
A
N
 
Q
V
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
35% identity, 73% coverage: 55:286/317 of query aligns to 47:280/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
V
 
L
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
T
F
 
V
D
 
D
E
 
A
A
 
E
L
 
V
L
 
L
R
 
A
N
 
A
L
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
K
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
A
T
x
R
G
 
A
G
 
G
M
x
V
R
 
G
N
 
L
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
A
L
 
R
G
 
G
I
 
V
Q
 
L
V
 
V
C
 
V
G
 
N
T
 
A
D
 
P
S
 
T
Y
 
S
K
x
N
-
 
I
Q
 
H
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
A
W
 
L
T
 
A
L
 
L
I
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
A
T
 
S
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
A
E
 
A
A
 
D
N
 
A
A
 
S
L
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
H
H
 
T
W
 
W
Q
 
K
Q
 
R
G
 
S
L
 
S
-
 
F
-
 
S
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
F
 
R
G
 
I
Q
 
A
V
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
R
 
Y
V
 
V
I
 
V
A
 
A
W
 
Y
S
 
D
E
 
P
N
 
Y
L
 
V
T
 
S
A
 
P
E
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
V
 
I
T
 
E
F
 
L
V
 
L
S
 
S
K
 
L
R
 
D
E
 
D
L
 
L
F
 
L
E
 
A
Q
 
R
A
 
A
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
S
I
 
V
H
 
H
L
 
L
V
 
P
L
 
K
S
 
T
E
 
P
R
 
E
S
 
T
R
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
A
W
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
S
 
G
A
 
V
L
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
Q
 
D
A
 
A
L
 
I
E
 
T
Q
 
G
N
 
G
R
 
H
L
 
V
K
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
A
R
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
-
A
 
C
A
 
T
D
 
D
H
 
S
P
 
P
F
 
L
R
 
F
T
 
E
L
 
L
P
 
A
N
 
Q
V
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3kb6B Crystal structure of d-lactate dehydrogenase from aquifex aeolicus complexed with NAD and lactic acid (see paper)
30% identity, 84% coverage: 45:310/317 of query aligns to 38:320/334 of 3kb6B

query
sites
3kb6B
D
 
N
R
 
E
L
 
L
Q
 
K
S
 
K
F
 
A
E
 
E
V
 
L
I
 
I
C
 
S
V
 
V
M
x
F
R
 
V
E
 
Y
R
 
D
T
 
K
L
 
L
F
 
T
D
 
E
E
 
E
A
 
-
L
 
L
L
 
L
R
 
S
N
 
K
L
 
M
P
 
P
K
 
R
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
I
V
 
H
T
 
T
G
 
R
G
x
S
M
x
V
R
x
G
N
 
F
A
 
D
A
 
H
I
 
I
D
 
D
L
 
L
K
 
D
A
 
Y
A
 
C
A
 
K
A
 
K
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
T
G
 
H
T
 
I
D
 
P
S
 
A
Y
|
Y
K
x
S
-
 
P
Q
 
E
A
 
S
A
x
V
P
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
T
W
 
F
T
 
A
L
 
M
I
 
I
M
 
L
A
 
T
L
 
L
T
 
V
R
 
K
N
 
R
L
 
L
L
 
K
A
 
R
E
 
I
A
 
E
N
 
D
A
 
R
L
 
V
R
 
K
A
 
K
G
 
L
H
 
N
W
 
F
Q
 
S
Q
 
Q
G
 
D
-
 
S
-
 
E
-
 
I
L
 
L
G
 
A
G
 
R
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
R
K
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
S
R
 
R
I
 
V
A
 
A
E
 
M
F
 
Y
G
 
G
Q
 
L
V
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
C
W
 
Y
S
 
-
E
x
D
N
x
V
L
 
V
T
 
K
A
 
R
E
 
E
R
 
D
A
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
C
T
 
V
F
 
Y
V
 
T
S
 
S
K
 
L
R
 
D
E
 
E
L
 
L
F
 
L
E
 
K
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
S
I
 
L
H
 
H
L
 
V
V
x
P
L
 
Y
S
 
T
E
 
K
R
 
E
S
 
T
R
 
H
G
 
H
L
 
M
V
 
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
I
G
 
S
W
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
D
S
 
G
A
 
V
L
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
Y
Q
 
R
A
 
A
L
 
Y
E
 
Q
Q
 
R
N
 
G
R
 
K
L
 
F
K
 
S
G
 
G
A
 
L
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
D
E
|
E
P
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
T
-
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
A
A
 
T
D
 
D
H
 
K
P
 
N
F
 
L
R
 
K
T
 
I
L
 
L
P
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
C
-
 
K
-
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
x
A
Y
|
Y
V
 
Y
S
 
T
E
 
D
Q
 
K
N
 
S
Y
 
L
R
 
E
L
 
R
F
 
I
F
 
R
S
 
E
Q
 
E
M
 
T
I
 
V
E
 
K
D
 
V
I
 
V
Q
 
K
A
 
A
W
 
F
T
 
V
T
 
K
G
 
G

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 44:282/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
Q
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
S
 
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 47:285/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
D
 
P
S
 
N
Y
 
G
K
 
N
Q
 
S
-
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
 
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 46:284/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
D
 
P
S
 
N
Y
 
G
K
x
N
Q
 
S
-
 
L
A
 
S
A
|
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 47:285/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
Q
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
|
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
 
Y
S
x
D
E
 
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 47:285/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
Q
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
 
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
34% identity, 77% coverage: 47:291/317 of query aligns to 41:286/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
L
 
L
Q
 
Q
S
 
D
F
 
C
E
 
E
V
 
G
I
 
L
C
 
-
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
Q
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
x
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 46:284/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
Q
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
|
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 47:285/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
Q
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
|
G
S
x
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
 
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
 
P
L
 
L
S
x
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 48:286/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
x
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
Q
 
L
A
 
S
A
|
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
34% identity, 75% coverage: 55:291/317 of query aligns to 52:290/533 of O43175

query
sites
O43175
V
 
I
M
 
V
R
 
R
E
 
S
R
 
A
T
 
T
L
 
K
F
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
D
L
 
V
L
 
I
R
 
N
N
 
A
L
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
x
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
D
 
P
S
 
N
Y
 
G
K
 
N
Q
 
S
-
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
x
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
 
Y
S
x
D
E
 
P
N
 
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
 
H
L
x
T
V
 
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
x
L
G
|
G
Y
x
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
35% identity, 69% coverage: 72:291/317 of query aligns to 55:276/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
K
 
K
L
 
L
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
V
 
G
T
 
R
G
 
A
G
 
G
M
 
T
R
 
G
N
 
V
A
 
D
A
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
R
L
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
L
V
 
V
C
 
M
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
N
S
 
G
Y
 
N
K
 
S
Q
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
x
R
I
 
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
 
I
L
x
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
x
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
 
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
x
S
S
 
T
R
 
T
G
 
G
L
|
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
V
 
L
G
 
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

5z20F The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with nadh and oxamate (see paper)
33% identity, 83% coverage: 48:310/317 of query aligns to 50:328/336 of 5z20F

query
sites
5z20F
Q
 
Q
S
 
G
F
 
F
E
 
E
V
 
V
I
 
V
C
 
C
V
 
A
M
 
F
R
 
V
E
 
N
R
 
D
T
 
D
L
 
L
F
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
S
L
 
R
P
 
P
K
 
V
L
 
L
K
 
E
L
 
R
L
 
L
V
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
G
M
 
T
R
 
R
N
 
L
A
 
V
A
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
-
 
H
I
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
L
Q
 
P
V
 
V
C
 
V
G
 
H
T
 
V
D
 
P
S
 
A
Y
|
Y
K
x
S
-
 
P
Q
 
H
A
 
A
A
 
V
P
 
A
E
 
E
L
 
H
T
 
A
W
 
V
T
 
G
L
 
L
I
 
I
M
 
L
A
 
T
L
 
L
T
 
N
R
 
R
N
 
R
L
 
L
L
 
H
A
 
R
E
 
A
A
 
Y
N
 
N
A
 
R
L
 
T
R
 
R
A
 
E
G
 
G
H
 
D
W
 
F
Q
 
S
-
 
L
Q
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
T
G
 
G
-
 
F
D
 
D
L
 
L
Y
 
H
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
|
G
S
x
Q
I
|
I
G
 
G
K
 
E
R
 
T
I
 
F
A
 
A
E
 
R
F
 
I
G
 
M
Q
 
A
V
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
C
R
 
E
V
 
L
I
 
L
A
 
A
W
x
Y
S
 
-
E
x
D
N
x
P
L
 
Y
T
 
P
A
 
N
E
 
P
R
 
R
A
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
G
T
 
R
F
 
Y
V
 
L
S
 
A
K
 
L
R
 
D
E
 
A
L
 
L
F
 
L
E
 
A
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
I
L
 
V
S
 
S
I
 
L
H
 
H
L
x
C
V
x
P
L
 
L
S
 
T
E
 
A
R
 
D
S
x
T
R
 
R
G
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
A
 
R
L
 
L
G
 
A
W
 
T
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
G
A
 
A
L
 
M
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
A
I
 
L
V
 
V
D
 
N
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
I
Q
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
L
K
 
G
G
 
Y
A
 
L
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
Y
E
 
E
R
 
E
E
|
E
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
Q
P
 
P
L
 
L
A
 
Q
A
 
D
D
 
D
H
 
V
P
 
L
F
 
A
R
 
R
-
 
L
-
 
L
T
 
S
L
 
F
P
 
P
N
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
A
H
|
H
V
 
Q
G
x
A
Y
 
F
V
 
L
S
 
T
E
 
R
Q
 
E
N
 
A
Y
 
L
R
 
A
L
 
A
F
 
I
F
 
A
S
 
D
Q
 
T
M
 
T
I
 
L
E
 
D
D
 
N
I
 
I
Q
 
A
A
 
A
W
 
W
T
 
Q
T
 
D
G
 
G

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
35% identity, 72% coverage: 58:286/317 of query aligns to 57:289/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
E
 
D
R
 
R
T
 
E
L
 
V
F
 
F
D
 
D
E
 
A
A
 
A
L
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
L
 
-
P
 
P
K
 
R
L
 
L
K
 
R
L
 
I
L
 
V
V
 
A
T
 
N
G
 
Y
G
 
A
M
x
V
R
 
G
N
 
Y
A
 
D
A
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
I
K
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
A
 
K
L
 
R
G
 
G
I
 
I
Q
 
Y
V
 
V
C
 
T
G
 
N
T
 
T
-
 
P
D
 
D
S
 
V
Y
x
L
K
 
T
Q
 
D
A
 
A
A
x
T
P
 
A
E
 
D
L
 
L
T
 
A
W
 
W
T
 
A
L
 
L
I
 
L
M
 
L
A
 
A
L
 
A
T
 
A
R
 
R
N
 
H
L
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
G
A
 
D
N
 
K
A
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
H
 
E
W
 
W
Q
 
K
Q
 
R
G
 
R
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
Y
D
 
D
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
K
F
 
R
G
 
A
Q
 
K
V
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
Y
W
 
T
S
x
A
E
x
R
N
x
S
L
 
R
T
x
K
A
 
P
E
 
E
R
 
A
A
 
E
A
 
K
E
 
E
A
 
L
G
 
G
V
 
A
T
 
E
F
 
F
V
 
K
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
L
E
 
R
Q
 
E
A
 
S
D
 
D
V
 
F
L
 
V
S
 
V
I
 
L
H
 
A
L
x
V
V
x
P
L
 
L
S
 
T
E
 
K
R
x
E
S
x
T
R
 
Y
G
 
H
L
 
M
V
 
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
E
A
 
R
L
 
L
G
 
R
W
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
A
L
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
N
 
G
R
 
W
L
 
I
K
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
E
 
E
R
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
A
 
D
D
 
E
H
 
E
P
 
L
F
 
F
R
 
-
T
 
A
L
 
L
P
 
D
N
 
N
V
 
V
L
 
V
A
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
I
G
|
G

7cvpA The crystal structure of human phgdh from biortus.
36% identity, 58% coverage: 107:291/317 of query aligns to 54:239/254 of 7cvpA

query
sites
7cvpA
A
 
S
A
 
A
P
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
T
W
 
C
T
 
G
L
 
M
I
 
I
M
 
M
A
 
C
L
 
L
T
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
I
L
 
P
A
 
Q
E
 
A
A
 
T
N
 
A
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
D
G
 
G
H
 
K
W
 
W
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
-
 
K
-
 
F
L
 
M
G
 
G
G
 
T
D
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
L
G
|
G
L
 
L
G
|
G
S
x
R
I
|
I
G
 
G
K
 
R
R
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
T
F
 
R
G
 
M
Q
 
Q
V
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
R
 
K
V
 
T
I
 
I
A
 
G
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
I
L
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
R
 
V
A
 
S
A
 
A
E
 
S
A
 
F
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
F
 
Q
V
 
L
S
 
P
K
 
L
R
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
W
E
 
P
Q
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
F
L
 
I
S
 
T
I
 
V
H
|
H
L
x
T
V
x
P
L
 
L
S
 
L
E
 
P
R
 
S
S
x
T
R
 
T
G
 
G
L
 
L
V
 
L
D
 
N
E
 
D
Q
 
N
A
 
T
L
 
F
G
 
A
W
 
Q
M
 
C
K
 
K
P
 
K
S
 
G
A
 
V
L
 
R
L
 
V
I
 
V
N
 
N
T
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
Q
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
C
K
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
E
 
T
R
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
-
A
 
P
A
 
R
D
 
D
H
 
R
P
 
A
F
 
L
R
 
V
T
 
D
L
 
H
P
 
E
N
 
N
V
 
V
L
 
I
A
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
V
 
L
G
|
G
Y
 
A
V
 
S
S
 
T
E
 
K
Q
 
E

4u6sA Ctbp1 in complex with substrate phenylpyruvate (see paper)
33% identity, 77% coverage: 67:310/317 of query aligns to 61:316/328 of 4u6sA

query
sites
4u6sA
L
 
L
R
 
E
N
 
K
L
 
F
P
 
K
K
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
R
G
x
I
G
|
G
M
x
S
R
x
G
N
 
F
A
 
D
A
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
I
K
 
K
A
 
S
A
 
A
A
 
G
A
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
Q
 
A
V
 
V
C
 
C
G
 
N
T
 
V
D
 
P
S
 
A
Y
 
A
K
x
S
-
 
V
Q
 
E
A
 
E
A
x
T
P
 
A
E
 
D
L
 
S
T
 
T
W
 
L
T
 
C
L
 
H
I
 
I
M
 
L
A
 
N
L
 
L
T
 
Y
R
 
R
N
 
R
L
 
A
L
 
T
A
 
W
E
 
L
A
 
H
N
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
G
H
 
T
W
 
R
Q
 
V
Q
 
Q
G
 
S
L
 
V
-
 
E
-
 
Q
-
 
I
-
 
R
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
G
G
 
A
G
 
A
D
 
R
L
 
I
Y
 
R
G
 
G
K
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
 
L
G
|
G
S
x
R
I
x
V
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
L
F
 
R
G
 
A
Q
 
K
V
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
R
 
N
V
 
V
I
 
L
A
 
F
W
x
Y
S
x
D
E
x
P
N
x
Y
L
 
L
T
 
S
-
 
D
-
 
G
A
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
-
A
 
-
G
 
G
V
 
L
T
 
Q
F
 
R
V
 
V
S
 
S
K
 
T
-
 
L
R
 
Q
E
 
D
L
 
L
F
 
L
E
 
F
Q
 
H
A
 
S
D
 
D
V
 
C
L
 
V
S
 
T
I
 
L
H
|
H
L
x
C
V
x
G
L
 
L
S
 
N
E
 
E
R
 
H
S
x
N
R
 
H
G
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
N
E
 
D
Q
 
F
A
 
T
L
 
V
G
 
K
W
 
Q
M
 
M
K
 
R
P
 
Q
S
 
G
A
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
I
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
N
 
G
R
 
R
L
 
I
K
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
H
E
 
E
R
 
S
E
|
E
P
 
P
L
 
F
A
 
S
-
 
F
A
 
S
D
 
Q
H
 
G
P
 
P
F
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
A
P
 
P
N
 
N
V
 
L
L
 
I
A
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
V
 
A
G
 
A
Y
x
W
V
 
Y
S
 
S
E
 
E
Q
 
Q
N
 
A
Y
 
S
R
 
I
L
 
E
F
x
M
F
 
R
S
 
E
Q
 
E
M
 
A
I
 
A
E
 
R
D
 
E
I
 
I
Q
 
R
A
 
R
W
 
A
T
 
I
T
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AO353_23780 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_23780
MTVQIAVIDDWQGVARHVVDWSVLDGIGKVSFLHDYPADHPTLSDRLQSFEVICVMRERT
LFDEALLRNLPKLKLLVTGGMRNAAIDLKAAAALGIQVCGTDSYKQAAPELTWTLIMALT
RNLLAEANALRAGHWQQGLGGDLYGKTLGILGLGSIGKRIAEFGQVFGMRVIAWSENLTA
ERAAEAGVTFVSKRELFEQADVLSIHLVLSERSRGLVDEQALGWMKPSALLINTARGPIV
DEAALIQALEQNRLKGAALDVFEREPLAADHPFRTLPNVLATPHVGYVSEQNYRLFFSQM
IEDIQAWTTGHSIRLLN

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory