SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_01240 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_01240 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P0AES2 Glucarate dehydratase; GDH; GlucD; D-glucarate dehydratase; EC 4.2.1.40 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
76% identity, 98% coverage: 10:447/447 of query aligns to 8:446/446 of P0AES2

query
sites
P0AES2
P
 
P
I
 
V
I
 
V
T
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
M
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
A
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
I
S
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
T
T
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
I
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
D
 
G
V
 
V
P
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
K
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
R
Q
 
K
Q
 
A
T
 
T
D
 
P
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
S
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
D
D
 
S
N
 
C
D
 
D
W
 
W
F
 
Y
R
 
R
V
 
L
R
 
R
H
 
H
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
N
D
 
D
F
 
F
K
 
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
A
E
 
E
A
 
S
V
 
I
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
L
 
I
C
 
G
R
 
K
D
 
Y
Q
 
L
H
 
K
K
 
G
V
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
|
E
N
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
E
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
N
 
H
E
 
E
W
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
|
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
-
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
E
P
 
P
L
 
F
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
G
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
T
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
A
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
K
M
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
M
A
 
G
M
 
M
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
N
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
L
 
M
V
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1ecqA E. Coli glucarate dehydratase bound to 4-deoxyglucarate (see paper)
76% identity, 98% coverage: 10:447/447 of query aligns to 6:444/444 of 1ecqA

query
sites
1ecqA
P
 
P
I
 
V
I
 
V
T
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
M
N
|
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
G
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
A
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
I
S
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
T
T
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
|
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
I
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
D
 
G
V
 
V
P
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
K
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
R
Q
 
K
Q
 
A
T
 
T
D
 
P
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
S
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
D
D
 
S
N
 
C
D
 
D
W
 
W
F
 
Y
R
 
R
V
 
L
R
 
R
H
 
H
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
N
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
A
E
 
E
A
 
S
V
 
I
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
L
 
I
C
 
G
R
 
K
D
 
Y
Q
 
L
H
 
K
K
 
G
V
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
E
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
N
 
H
E
 
E
W
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
|
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
-
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
E
P
 
P
L
 
F
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
G
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
T
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
A
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
K
M
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
M
A
 
G
M
 
M
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
N
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
L
 
M
V
 
V
R
 
R

1ec9D E. Coli glucarate dehydratase bound to xylarohydroxamate (see paper)
76% identity, 98% coverage: 10:447/447 of query aligns to 6:444/444 of 1ec9D

query
sites
1ec9D
P
 
P
I
 
V
I
 
V
T
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
M
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
G
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
A
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
I
S
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
T
T
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
|
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
I
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
D
 
G
V
 
V
P
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
K
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
R
Q
 
K
Q
 
A
T
 
T
D
 
P
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
S
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
D
D
 
S
N
 
C
D
 
D
W
 
W
F
 
Y
R
 
R
V
 
L
R
 
R
H
 
H
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
N
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
A
E
 
E
A
 
S
V
 
I
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
L
 
I
C
 
G
R
 
K
D
 
Y
Q
 
L
H
 
K
K
 
G
V
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
E
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
N
 
H
E
 
E
W
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
|
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
-
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
E
P
 
P
L
 
F
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
G
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
T
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
A
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
K
M
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
M
A
 
G
M
 
M
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
N
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
L
 
M
V
 
V
R
 
R

1ec8A E. Coli glucarate dehydratase bound to product 2,3-dihydroxy-5-oxo- hexanedioate (see paper)
76% identity, 98% coverage: 10:447/447 of query aligns to 4:442/442 of 1ec8A

query
sites
1ec8A
P
 
P
I
 
V
I
 
V
T
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
M
N
|
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
G
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
A
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
I
S
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
T
T
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
|
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
I
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
D
 
G
V
 
V
P
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
K
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
R
Q
 
K
Q
 
A
T
 
T
D
 
P
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
S
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
D
D
 
S
N
 
C
D
 
D
W
 
W
F
 
Y
R
 
R
V
 
L
R
 
R
H
 
H
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
N
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
A
E
 
E
A
 
S
V
 
I
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
L
 
I
C
 
G
R
 
K
D
 
Y
Q
 
L
H
 
K
K
 
G
V
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
E
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
N
 
H
E
 
E
W
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
|
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
-
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
E
P
 
P
L
 
F
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
G
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
T
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
A
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
K
M
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
M
A
 
G
M
 
M
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
N
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
L
 
M
V
 
V
R
 
R

1jctA Glucarate dehydratase, n341l mutant orthorhombic form (see paper)
76% identity, 98% coverage: 10:447/447 of query aligns to 5:443/443 of 1jctA

query
sites
1jctA
P
 
P
I
 
V
I
 
V
T
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
M
N
|
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
A
H
|
H
G
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
I
K
 
K
D
 
D
N
 
N
A
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
K
I
 
I
R
 
R
Q
 
K
T
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
I
S
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
K
P
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
N
I
 
V
L
 
L
N
 
T
T
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
T
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
T
|
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
I
 
T
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
M
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
D
 
G
V
 
V
P
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
D
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
D
 
S
E
 
E
V
 
V
K
 
E
M
 
M
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
Y
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
N
R
 
R
Q
 
K
Q
 
A
T
 
T
D
 
P
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
S
 
S
E
 
Q
P
 
P
D
 
D
A
 
D
D
 
S
N
 
C
D
 
D
W
 
W
F
 
Y
R
 
R
V
 
L
R
 
R
H
 
H
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
P
D
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
E
R
 
K
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
N
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
D
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
A
E
 
E
A
 
S
V
 
I
T
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
K
L
 
I
C
 
G
R
 
K
D
 
Y
Q
 
L
H
 
K
K
 
G
V
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
A
E
 
E
N
 
Q
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
|
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
E
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
T
I
 
L
T
 
S
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
M
C
 
C
N
 
H
E
 
E
W
 
F
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
|
S
N
x
L
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
K
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
|
I
D
 
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
-
 
N
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
E
P
 
P
L
 
F
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
G
 
G
G
 
G
C
 
L
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
I
D
 
D
T
 
M
D
 
D
Q
 
Q
L
 
V
A
 
M
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
K
 
Q
G
 
K
M
 
H
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
M
A
 
G
M
 
M
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
F
N
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
C
L
 
M
V
 
V
R
 
R

3p0wB Crystal structure of d-glucarate dehydratase from ralstonia solanacearum complexed with mg and d-glucarate
68% identity, 98% coverage: 10:445/447 of query aligns to 3:428/428 of 3p0wB

query
sites
3p0wB
P
 
P
I
 
R
I
 
V
T
 
T
S
 
E
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
R
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
C
G
 
G
A
 
A
H
|
H
G
 
A
P
 
P
F
 
F
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
L
K
 
K
D
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
G
H
 
R
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
G
I
 
I
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
R
A
 
V
R
 
I
S
 
P
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
Q
P
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
R
Y
 
T
Q
 
N
K
 
G
I
 
V
L
 
L
N
 
S
T
 
S
V
 
I
R
 
R
N
 
R
A
 
A
F
 
L
A
 
A
D
 
E
R
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
F
 
I
D
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
M
T
 
D
I
 
-
H
 
N
A
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
F
L
 
L
D
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
S
V
 
A
K
 
P
M
 
M
L
 
L
G
 
A
Y
|
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
Q
 
R
Q
 
K
T
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
L
S
 
E
E
 
G
P
 
A
D
 
N
A
 
G
D
 
A
N
 
D
D
 
D
W
 
W
F
 
L
R
 
R
V
 
L
R
 
R
H
 
H
E
 
E
K
 
A
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
P
D
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
T
A
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
A
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
M
Q
 
P
G
 
G
D
 
A
A
 
E
E
 
E
I
 
M
E
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
K
E
 
A
R
 
R
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
A
 
A
R
 
R
I
 
V
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
A
L
 
L
C
 
C
R
 
K
D
 
G
Q
 
Q
H
 
G
K
 
H
V
 
L
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
P
E
 
E
N
 
A
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
K
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
I
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
E
 
Q
M
 
M
G
 
G
H
 
H
A
 
A
I
 
V
T
 
Q
L
 
L
Q
 
H
S
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
C
 
C
N
 
D
E
 
E
W
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
N
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
A
Q
 
Q
-
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
E
P
 
P
L
 
L
Q
 
R
I
 
I
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
C
 
H
V
 
V
Q
 
A
V
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
I
D
 
D
T
 
M
D
 
D
Q
 
R
L
 
V
A
 
M
K
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
A
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
G
 
T
M
 
L
G
 
G
L
 
P
G
 
G
A
 
A
R
|
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
M
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
I
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
Y
N
 
D
N
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
S
L
 
L

3nxlC Crystal structure of glucarate dehydratase from burkholderia cepacia complexed with magnesium
68% identity, 98% coverage: 10:445/447 of query aligns to 3:424/425 of 3nxlC

query
sites
3nxlC
P
 
P
I
 
R
I
 
V
T
 
T
S
 
R
M
 
M
Q
 
Q
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
R
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
C
G
 
G
A
 
A
H
|
H
G
 
A
P
 
P
F
 
Y
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
L
V
 
V
I
 
I
L
 
L
K
 
D
D
 
D
N
 
S
A
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
G
I
 
I
R
 
R
Q
 
H
T
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
R
A
 
M
R
 
T
S
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
Q
P
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
A
I
 
T
L
 
L
N
 
N
T
 
A
V
 
V
R
 
R
N
 
A
A
 
A
F
 
L
A
 
S
D
 
R
R
 
L
D
 
D
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
-
F
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
I
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
N
A
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
D
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
A
V
 
V
K
 
P
M
 
M
L
 
L
G
 
A
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
R
Q
 
G
Q
 
R
T
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
R
S
 
D
E
 
E
P
 
A
D
 
Q
A
 
A
D
 
R
N
 
T
D
 
P
W
 
W
F
 
F
R
 
R
V
 
L
R
 
R
H
 
N
E
 
E
K
 
E
A
 
A
L
 
L
D
 
T
A
 
P
D
 
A
A
 
A
V
 
I
V
 
A
R
 
R
L
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
V
A
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
A
D
 
D
F
 
F
K
 
K
L
 
L
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
M
Q
 
A
G
 
G
D
 
A
A
 
D
E
 
E
I
 
M
E
 
E
A
 
A
V
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
K
E
 
A
R
 
C
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
I
 
A
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
A
L
 
L
C
 
C
R
 
R
D
 
G
Q
 
Q
H
 
G
K
 
H
V
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
P
E
 
E
N
 
G
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
A
T
 
T
G
 
G
L
 
I
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
W
R
 
R
E
 
Q
M
 
M
G
 
D
H
 
H
A
 
A
I
 
V
T
 
R
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
R
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
C
 
C
N
 
R
E
 
D
W
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
 
H
S
 
S
N
 
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
T
H
 
H
V
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
T
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
Q
 
D
-
 
A
R
 
R
L
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
E
P
 
P
L
 
L
Q
 
K
I
 
I
Q
 
V
G
 
G
G
 
G
C
 
Q
V
 
V
Q
 
A
V
 
V
P
 
P
K
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
D
T
 
M
D
 
A
Q
 
Q
L
 
V
A
 
E
K
 
A
A
 
A
H
 
H
E
 
A
L
 
L
Y
 
Y
K
 
K
G
 
E
M
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
T
A
 
A
R
 
R
D
 
D
D
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
A
M
 
M
Q
 
R
F
 
Y
L
 
L
I
 
V
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
T
F
 
Y
N
 
D
N
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
S
L
 
F

3n6hB Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing protein from actinobacillus succinogenes 130z complexed with magnesium/sulfate
63% identity, 98% coverage: 9:447/447 of query aligns to 3:430/432 of 3n6hB

query
sites
3n6hB
A
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
D
M
 
M
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
M
N
 
N
L
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
S
P
 
P
F
 
Y
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
L
K
 
T
D
 
D
N
 
N
A
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
A
R
 
T
I
 
I
R
 
E
Q
 
N
T
 
A
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
R
 
I
S
 
P
L
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
R
P
 
P
I
 
I
G
 
S
T
 
I
Y
 
L
Q
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
 
D
V
 
M
R
 
H
N
 
N
A
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
Y
Q
 
W
T
 
T
F
 
F
D
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
T
 
-
I
 
-
H
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
M
G
 
G
Q
 
Q
H
 
F
L
 
L
D
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
P
G
 
G
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
E
V
 
V
K
 
T
M
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
D
Q
 
K
Q
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
S
 
Q
E
 
P
P
 
V
D
 
T
A
 
G
D
 
K
N
 
H
D
 
E
W
 
W
F
 
Y
R
 
D
V
 
I
R
 
R
H
 
R
E
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
D
A
 
T
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
S
Q
 
K
A
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
G
 
G
D
 
S
A
 
K
E
 
E
I
 
I
E
 
D
A
 
T
V
 
V
T
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
K
R
 
H
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
C
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
C
 
C
R
 
K
D
 
G
Q
 
L
H
 
N
K
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
T
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
E
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
I
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
N
W
 
W
R
 
R
E
 
E
M
 
M
G
 
C
H
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
M
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
L
Q
 
T
G
 
G
S
 
A
V
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
C
 
C
N
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
C
H
|
H
S
 
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
N
I
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
Q
 
D
-
 
F
R
 
Y
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
N
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
G
 
D
G
 
G
C
 
K
V
 
I
Q
 
K
V
 
L
P
 
N
K
 
D
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
N
T
 
M
D
 
D
Q
 
N
L
 
V
A
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
H
K
 
K
G
 
K
M
 
L
G
 
P
L
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
P
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
L
 
Y
I
 
Y
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
K
F
 
F
N
 
D
N
 
R
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
A
L
 
M
V
 
V
R
 
R

3pfrA Crystal structure of d-glucarate dehydratase related protein from actinobacillus succinogenes complexed with d-glucarate
63% identity, 98% coverage: 9:447/447 of query aligns to 2:426/426 of 3pfrA

query
sites
3pfrA
A
 
V
P
 
P
I
 
V
I
 
I
T
 
T
S
 
D
M
 
M
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
H
D
 
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
L
 
M
N
|
N
L
 
V
S
 
G
G
 
G
A
 
A
H
|
H
G
 
S
P
 
P
F
 
Y
F
 
F
T
 
T
R
 
R
N
 
N
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
L
K
 
T
D
 
D
N
 
N
A
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
E
 
A
R
 
T
I
 
I
R
 
E
Q
 
N
T
 
A
L
 
L
E
 
T
D
 
E
A
 
A
R
 
I
S
 
P
L
 
H
V
 
V
V
 
V
G
 
G
S
 
R
P
 
P
I
 
I
G
 
S
T
 
I
Y
 
L
Q
 
N
K
 
K
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
 
D
V
 
M
R
 
H
N
 
N
A
 
-
F
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
T
 
T
F
 
F
D
 
E
L
 
L
R
 
R
I
 
V
T
 
-
I
 
-
H
 
N
A
 
A
V
 
V
T
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
M
G
 
G
Q
 
Q
H
 
F
L
 
L
D
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
P
G
 
G
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
E
V
 
V
K
 
T
M
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
L
 
L
F
|
F
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
D
Q
 
K
Q
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
Q
S
 
Q
E
 
P
P
 
V
D
 
T
A
 
G
D
 
K
N
 
H
D
 
E
W
 
W
F
 
Y
R
 
D
V
 
I
R
 
R
H
 
R
E
 
K
K
 
K
A
 
A
L
 
M
D
 
D
A
 
T
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
S
Q
 
K
A
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
F
Q
 
E
G
 
G
D
 
S
A
 
K
E
 
E
I
 
I
E
 
D
A
 
T
V
 
V
T
 
I
A
 
E
L
 
L
A
 
K
E
 
K
R
 
H
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
C
W
 
W
S
 
S
L
 
L
K
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
C
 
C
R
 
K
D
 
G
Q
 
L
H
 
N
K
 
D
V
 
V
L
 
L
A
 
T
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
 
D
P
 
P
C
 
C
G
 
I
A
 
G
E
 
E
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
I
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
R
R
 
R
A
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
I
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
N
W
 
W
R
 
R
E
 
E
M
 
M
G
 
C
H
 
H
A
 
A
I
 
I
T
 
M
L
 
L
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
P
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
L
Q
 
T
G
 
G
S
 
A
V
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
M
 
L
C
 
C
N
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
G
L
 
L
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
C
H
|
H
S
|
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
F
T
 
S
H
 
H
V
 
V
A
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
N
I
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
D
T
 
T
H
|
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
Q
 
D
-
 
F
R
 
Y
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
N
P
 
P
L
 
L
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
G
 
D
G
 
G
C
 
K
V
 
I
Q
 
K
V
 
L
P
 
N
K
 
D
K
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
N
T
 
M
D
 
D
Q
 
N
L
 
V
A
 
L
K
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
L
Y
 
H
K
 
K
G
 
K
M
 
L
G
 
P
L
 
N
G
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
I
A
 
P
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
L
 
Y
I
 
Y
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
K
F
 
F
N
 
D
N
 
R
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
A
L
 
M
V
 
V
R
 
R

3nfuA Crystal structure of probable glucarate dehydratase from chromohalobacter salexigens dsm 3043 complexed with magnesium
59% identity, 98% coverage: 10:446/447 of query aligns to 3:440/441 of 3nfuA

query
sites
3nfuA
P
 
P
I
 
K
I
 
I
T
 
T
S
 
K
M
 
M
Q
 
N
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
H
 
E
D
 
D
G
 
G
M
 
F
L
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
A
 
G
H
 
H
G
 
E
P
 
P
F
 
W
F
 
F
T
 
I
R
 
R
N
 
C
I
 
V
V
 
L
I
 
V
L
 
L
K
 
E
D
 
D
N
 
E
A
 
S
G
 
G
H
 
N
T
 
R
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
I
P
 
P
G
 
S
G
 
S
E
 
E
R
 
G
I
 
I
R
 
L
Q
 
N
T
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
K
A
 
C
R
 
R
S
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
E
G
 
G
S
 
A
P
 
R
I
 
V
G
 
N
T
 
E
Y
 
V
Q
 
K
K
 
Q
I
 
V
L
 
L
N
 
S
T
 
R
V
 
A
R
 
R
N
 
G
A
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
Q
R
 
G
D
 
G
A
 
P
G
 
E
G
 
E
R
 
R
G
 
G
L
 
R
Q
 
Q
T
 
T
F
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
R
I
 
V
T
 
A
I
 
V
H
 
H
A
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
H
 
A
L
 
L
D
 
G
V
 
M
P
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
-
 
Y
G
 
G
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
D
 
D
E
 
E
V
 
V
K
 
E
M
 
A
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
Y
 
L
V
 
L
G
 
G
D
 
D
R
 
P
Q
 
D
Q
 
K
T
 
T
D
 
D
L
 
L
A
 
P
Y
 
Y
R
 
P
S
 
R
E
 
V
P
 
A
D
 
D
A
 
P
D
 
V
N
 
D
D
 
A
W
 
W
F
 
D
R
 
E
V
 
V
R
 
R
H
 
Y
E
 
R
K
 
E
A
 
A
L
 
M
D
 
T
A
 
P
D
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
A
R
 
N
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
A
 
A
Q
 
Y
A
 
D
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
Q
 
K
D
 
D
F
 
F
K
|
K
L
 
L
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
D
 
E
A
 
E
E
 
E
I
 
A
E
 
D
A
 
C
V
 
I
T
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
H
E
 
E
R
 
A
F
 
F
P
 
P
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
L
T
 
A
L
 
L
D
|
D
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
W
 
W
S
 
K
L
 
L
K
 
D
E
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
R
L
 
V
C
 
L
R
 
E
D
 
P
Q
 
I
H
 
K
K
 
H
V
 
L
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
|
E
D
|
D
P
 
P
C
 
C
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
N
 
G
G
 
G
Y
 
F
S
 
S
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
E
F
 
F
R
 
K
R
 
K
A
 
R
T
 
T
G
 
G
L
 
L
K
 
P
T
 
T
A
 
A
T
 
T
N
|
N
M
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
W
 
Y
R
 
K
E
 
Q
M
 
L
G
 
Q
H
 
Y
A
 
A
I
 
V
T
 
Q
L
 
L
Q
 
N
S
 
S
V
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
D
|
D
P
 
C
H
 
H
F
 
F
W
 
W
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
V
 
V
R
 
A
V
 
V
A
 
G
Q
 
E
M
 
L
C
 
C
N
 
N
E
 
E
W
 
W
G
 
G
L
 
M
T
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
S
H
|
H
S
 
S
N
|
N
N
 
N
H
 
H
F
 
F
D
 
D
I
 
I
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
F
 
M
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
C
P
 
P
G
 
G
D
 
E
I
 
I
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
T
H
 
H
W
 
W
I
 
I
W
 
W
Q
 
Q
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
T
 
T
K
 
R
A
 
E
P
 
P
L
 
F
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
R
G
 
D
G
 
G
C
 
K
V
 
L
Q
 
T
V
 
V
P
 
P
K
 
K
K
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
D
 
D
T
 
D
D
 
D
Q
 
K
L
 
L
A
 
M
K
 
E
A
 
A
H
 
H
E
 
E
L
 
T
Y
 
Y
K
 
K
G
 
R
M
 
L
G
 
D
L
 
V
G
 
T
A
 
Q
R
 
R
D
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
M
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
F
 
Y
L
 
L
I
 
I
P
 
P
G
 
G
W
 
W
T
 
E
F
 
F
N
 
D
N
 
P
K
 
K
R
 
R
P
 
P
C
 
A
L
 
L
V
 
V

4it1D Crystal structure of enolase pfl01_3283 (target efi-502286) from pseudomonas fluorescens pf0-1 with bound magnesium, potassium and tartrate
38% identity, 95% coverage: 12:436/447 of query aligns to 6:420/427 of 4it1D

query
sites
4it1D
I
 
I
T
 
T
S
 
R
M
 
V
Q
 
T
V
 
V
V
 
T
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
F
H
 
R
D
 
D
G
 
P
M
 
P
L
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
I
H
 
H
G
 
E
P
 
P
F
 
F
F
 
A
T
 
L
R
 
R
N
 
S
I
 
I
V
 
I
I