SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_01520 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_01520 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P76037 Putrescine importer PuuP from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
35% identity, 99% coverage: 1:445/449 of query aligns to 7:452/461 of P76037

query
sites
P76037
M
 
L
S
 
N
I
 
I
E
 
A
A
 
A
F
 
Q
G
 
P
Y
 
G
K
 
K
Q
 
T
E
 
R
L
 
L
K
 
R
R
 
K
G
 
S
L
 
L
S
 
K
L
 
L
T
 
W
D
 
Q
L
 
V
V
 
V
V
 
M
Y
 
M
G
 
G
M
 
L
I
 
A
F
 
Y
M
 
L
I
 
T
P
 
P
I
 
M
A
 
T
P
 
V
F
 
F
G
 
D
V
 
T
Y
 
F
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
N
 
S
A
 
G
E
 
I
A
 
S
P
 
D
G
 
G
M
 
H
V
 
V
P
 
P
L
 
A
A
 
S
Y
 
Y
I
 
L
I
 
L
G
 
A
M
 
L
V
 
A
A
 
G
M
 
V
L
 
L
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
I
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
S
 
K
M
 
L
A
 
V
R
 
R
A
 
Q
F
 
F
P
 
P
V
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
A
Y
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
G
 
S
L
 
I
N
 
N
P
 
P
H
 
H
V
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
M
A
 
V
G
 
G
W
 
W
L
 
S
M
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
Y
|
Y
L
 
L
L
 
F
I
 
L
P
 
P
P
 
M
L
 
I
L
 
N
Y
 
V
V
 
L
Y
 
L
A
 
A
A
 
K
M
 
I
A
 
Y
L
 
L
N
 
S
H
 
A
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
D
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
P
V
 
W
G
 
V
F
 
W
I
 
V
L
 
V
A
 
T
F
 
F
L
 
V
V
 
A
S
 
I
A
 
L
T
 
T
F
 
A
V
 
A
N
 
N
L
 
L
R
 
K
G
 
S
I
 
V
T
 
N
F
 
L
T
 
V
A
 
A
R
 
N
M
 
F
N
 
N
I
 
T
I
 
L
F
 
F
L
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
Q
L
 
I
V
 
S
V
 
I
L
 
M
G
 
V
I
 
V
F
 
F
L
 
I
F
 
F
Y
 
L
A
 
V
W
 
V
N
 
Q
A
 
G
L
 
L
H
 
H
G
 
K
G
 
G
A
 
E
G
 
G
H
 
V
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
-
 
W
T
 
S
L
 
L
A
 
Q
P
 
P
L
 
F
Y
 
I
S
 
S
P
 
-
E
 
E
H
 
N
F
 
A
N
 
H
F
 
L
A
 
I
L
 
P
L
 
I
M
 
I
Q
 
T
A
 
G
V
 
A
S
 
T
I
 
I
A
 
V
V
 
C
L
 
F
S
 
S
F
 
F
L
 
L
G
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
V
S
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
E
E
 
E
I
 
T
K
 
P
G
 
-
D
 
D
P
 
A
G
 
A
R
 
R
S
 
V
V
 
I
G
 
P
K
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
F
V
 
L
T
 
T
L
 
A
L
 
V
V
 
Y
M
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
F
 
F
V
 
I
V
 
A
Q
 
A
T
 
S
W
 
F
I
 
F
A
 
M
T
 
Q
D
 
L
L
 
F
A
 
F
A
 
P
G
 
D
M
 
I
G
 
S
-
 
R
F
 
F
K
 
K
S
 
D
A
 
P
D
 
D
T
 
A
A
 
A
F
 
L
Y
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
L
L
 
Y
A
 
V
A
 
G
G
 
G
S
 
K
W
 
L
L
 
F
A
 
Q
T
 
S
L
 
I
-
 
F
-
 
L
-
 
C
T
 
T
A
 
T
V
 
F
A
 
V
T
 
N
A
 
T
L
 
L
A
 
A
W
 
S
G
 
G
V
 
L
A
 
A
V
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
S
 
S
Q
 
H
A
 
A
A
 
S
V
 
V
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
L
F
 
Y
G
 
V
M
 
M
A
 
G
R
 
R
D
 
D
G
 
N
Q
 
V
L
 
F
P
 
P
-
 
E
K
 
R
V
 
V
L
 
F
A
 
G
K
 
Y
V
 
V
H
 
H
P
 
P
K
 
K
H
 
W
N
 
R
T
 
T
P
 
P
Y
 
A
M
 
L
S
 
N
I
 
V
Y
 
I
L
 
M
V
 
V
A
 
G
V
 
I
L
 
V
S
 
A
L
 
L
L
 
-
I
 
-
C
 
S
Y
 
A
L
 
L
F
 
F
I
 
F
N
 
D
A
 
L
V
 
V
D
 
-
T
 
T
L
 
A
T
 
T
S
 
A
L
 
L
V
 
I
N
 
N
F
 
F
G
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
V
G
 
A
F
 
F
M
 
T
L
 
F
L
 
V
H
 
N
I
 
L
T
 
S
V
 
V
I
 
F
N
 
N
H
 
H
Y
 
F
W
 
W
R
 
R
R
 
R
Q
 
K
R
 
G
S
 
M
G
 
N
Q
 
K
L
 
S
I
 
W
R
 
K
-
 
D
-
 
H
-
 
F
-
 
H
H
 
Y
V
 
L
I
 
L
C
 
M
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
F
 
A
V
 
L
I
 
T
V
 
V
A
 
G
A
 
V
I
 
L
M
 
W
Y
 
V
N
 
N
M
 
L
G
 
E
V
 
S
A
 
T
A
 
S
Q
 
L
K
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
V
W
 
W
I
 
A
A
 
S
A
 
L
G
 
G
V
 
G
V
 
A
Y
 
Y
L
 
L
C
 
W
L
 
Y
L
 
L
N
 
I
K
 
R
F
 
R
G
 
Y
S
 
R
R
 
K
T
 
V
A
 
P
L
 
L
P
 
Y
D
 
D

6f34A Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue bound to arginine. (see paper)
25% identity, 92% coverage: 11:424/449 of query aligns to 22:434/458 of 6f34A

query
sites
6f34A
E
 
S
L
 
L
K
 
R
R
 
K
G
 
E
L
 
L
S
x
G
L
 
A
T
x
F
D
|
D
L
 
L
V
 
T
V
x
M
Y
 
L
G
 
G
M
 
I
I
 
G
F
 
A
M
x
I
I
 
I
P
x
G
I
x
T
A
x
G
P
 
I
F
 
F
G
 
V
V
 
L
Y
 
T
G
 
G
Y
 
V
V
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
E
-
 
H
-
 
A
A
 
G
P
 
P
G
 
A
M
 
L
V
 
V
P
 
-
L
 
L
A
 
S
Y
 
F
I
 
I
I
 
L
G
 
S
M
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
C
L
 
V
F
 
F
T
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
C
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
M
 
F
A
 
A
R
 
S
A
 
T
F
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
S
V
 
A
Y
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
A
 
S
Q
 
Y
R
 
A
G
 
T
L
 
F
N
 
G
P
 
E
H
 
L
V
 
I
G
 
A
F
 
W
I
 
I
A
 
L
G
 
G
W
 
W
L
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
L
D
x
E
Y
|
Y
L
 
G
L
 
V
I
x
A
P
 
S
P
 
S
L
 
A
L
 
V
Y
 
A
V
 
V
-
 
G
Y
 
W
A
 
S
A
 
G
M
 
Y
A
 
F
L
 
Q
N
 
G
H
 
L
L
 
L
Y
 
S
P
 
G
D
 
E
I
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
A
G
 
L
F
 
T
I
 
S
L
 
A
A
 
Y
F
 
D
L
 
P
V
 
A
S
 
K
A
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
I
N
 
D
L
 
L
R
 
P
G
 
A
I
 
I
T
 
I
F
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
I
 
I
I
 
V
F
 
L
L
 
F
L
 
I
A
 
T
Q
 
F
L
 
L
V
 
L
V
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
A
F
 
K
L
 
K
F
 
S
Y
x
A
A
x
R
W
 
F
N
 
N
A
 
A
L
 
V
H
 
I
G
 
V
G
x
A
A
x
I
G
 
K
H
 
V
G
x
A
Q
 
V
-
 
V
-
 
L
-
x
L
-
 
F
L
 
L
T
 
A
L
 
V
A
 
G
P
 
V
L
x
W
Y
|
Y
-
 
V
S
 
K
P
 
P
E
 
E
H
 
N
-
 
W
-
 
T
-
 
P
-
 
F
-
 
M
-
 
P
F
 
Y
N
 
G
F
 
F
A
 
S
L
 
G
L
 
V
M
 
A
Q
 
T
A
 
G
V
 
A
S
 
A
I
 
T
A
 
V
V
 
F
L
x
F
S
x
A
F
 
Y
L
x
I
G
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
V
S
 
S
T
 
T
L
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
K
 
R
G
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
Q
R
 
R
S
 
D
V
 
M
G
 
P
K
 
I
A
 
G
A
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
V
M
 
C
G
 
T
A
 
L
I
 
L
F
 
Y
V
 
I
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
W
 
L
I
 
V
A
 
L
T
 
T
D
 
G
L
 
I
A
 
V
A
 
P
G
 
Y
M
 
E
G
 
Q
F
 
L
K
 
N
S
 
V
A
 
K
D
 
N
T
 
P
A
 
V
F
 
A
Y
 
F
E
 
A
I
 
L
A
 
N
E
 
Y
L
 
I
A
 
H
A
x
Q
G
 
-
S
 
D
W
 
W
L
x
V
A
 
A
T
 
G
L
 
F
T
 
I
A
 
S
V
 
L
A
 
G
T
 
-
A
 
A
L
 
I
A
 
A
W
 
G
G
 
I
V
 
T
A
 
T
V
|
V
A
 
L
I
 
L
T
 
V
S
 
S
Q
 
M
A
 
Y
A
 
G
V
 
Q
S
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
Y
G
 
A
M
 
I
A
 
S
R
 
R
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
F
A
 
A
K
 
R
V
 
I
H
 
S
P
 
P
K
 
T
H
 
R
N
 
Q
T
 
V
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
S
 
N
I
 
T
Y
 
W
L
 
L
V
 
T
A
 
G
V
 
-
L
 
-
S
 
A
L
 
A
L
 
V
I
 
A
C
 
V
Y
 
F
L
 
A
F
 
G
I
 
I
N
 
I
A
 
P
V
 
L
D
 
N
T
 
K
L
 
L
T
 
A
S
 
E
L
 
L
V
 
T
N
 
N
F
 
I
G
 
G
A
 
T
L
 
L
S
 
F
G
 
A
F
 
F
M
 
I
L
 
T
L
 
V
H
 
S
I
 
I
T
 
G
V
 
V
I
 
L
N
 
V
H
 
-
Y
 
-
W
 
-
R
 
L
R
 
R
Q
 
K
R
 
T
S
 
Q
G
 
P
Q
 
D
L
 
L
I
 
K
R
 
R
H
 
A
V
 
F
I
 
R
C
 
V
P
 
P
L
 
F
V
 
V
G
 
P
F
 
V
V
 
V
I
 
P
V
 
I
A
 
L
A
 
A
I
 
V
M
 
L
Y
 
F
N
 
C
M
 
G
G
 
Y
V
 
L
A
 
V
A
 
L
Q
 
Q
K
 
L
L
 
P
G
 
A
L
 
M
I
 
T
W
 
W
I
 
I

5oqtA Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue (see paper)
24% identity, 92% coverage: 11:424/449 of query aligns to 20:432/456 of 5oqtA

query
sites
5oqtA
E
 
S
L
 
L
K
 
R
R
 
K
G
x
E
L
 
L
S
x
G
L
 
A
T
x
F
D
|
D
L
 
L
V
 
T
V
x
M
Y
 
L
G
 
G
M
 
I
I
 
G
F
 
A
M
x
I
I
 
I
P
x
G
I
x
T
A
x
G
P
 
I
F
 
F
G
 
V
V
 
L
Y
 
T
G
 
G
Y
 
V
V
 
A
N
 
A
A
 
A
E
 
E
-
 
H
-
 
A
A
 
G
P
 
P
G
 
A
M
 
L
V
 
V
P
 
-
L
 
L
A
 
S
Y
 
F
I
 
I
I
 
L
G
 
S
M
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
C
L
 
V
F
 
F
T
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
C
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
M
 
F
A
 
A
R
 
S
A
 
T
F
 
V
P
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
S
V
 
A
Y
 
Y
S
 
T
Y
 
Y
A
 
S
Q
 
Y
R
 
A
G
 
T
L
 
F
N
 
G
P
 
E
H
 
L
V
 
I
G
 
A
F
 
W
I
 
I
A
 
L
G
 
G
W
 
W
L
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
E
Y
 
Y
L
 
G
L
 
V
I
 
A
P
 
S
P
 
S
L
 
A
L
 
V
Y
 
A
V
 
V
-
 
G
Y
 
W
A
 
S
A
 
G
M
 
Y
A
 
F
L
 
Q
N
 
G
H
 
L
L
 
L
Y
 
S
P
 
G
D
 
E
I
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
A
G
 
L
F
 
T
I
 
S
L
 
A
A
 
Y
F
 
D
L
 
P
V
 
A
S
 
K
A
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
I
N
 
D
L
 
L
R
 
P
G
 
A
I
 
I
T
 
I
F
 
-
T
 
-
A
 
-
R
 
-
M
 
-
N
 
-
I
 
I
I
 
V
F
 
L
L
 
F
L
 
I
A
 
T
Q
 
F
L
 
L
V
 
L
V
 
N
L
 
L
G
 
G
I
 
A
F
 
K
L
 
K
F
 
S
Y
x
A
A
x
R
W
 
F
N
 
N
A
 
A
L
 
V
H
 
I
G
 
V
G
x
A
A
 
I
G
 
K
H
 
V
G
x
A
Q
 
V
-
 
V
-
 
L
-
x
L
-
 
F
L
 
L
T
 
A
L
 
V
A
 
G
P
 
V
L
 
W
Y
 
Y
-
 
V
S
 
K
P
 
P
E
 
E
H
 
N
-
 
W
-
 
T
-
 
P
-
 
F
-
 
M
-
 
P
F
 
Y
N
 
G
F
 
F
A
 
S
L
 
G
L
 
V
M
 
A
Q
 
T
A
 
G
V
 
A
S
 
A
I
 
T
A
 
V
V
 
F
L
x
F
S
x
A
F
 
Y
L
x
I
G
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
A
I
 
V
S
 
S
T
 
T
L
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
K
 
R
G
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
Q
R
 
R
S
 
D
V
 
M
G
 
P
K
 
I
A
 
G
A
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
V
M
 
C
G
 
T
A
 
L
I
 
L
F
 
Y
V
 
I
V
 
A
Q
 
V
T
 
S
W
 
L
I
 
V
A
 
L
T
 
T
D
 
G
L
 
I
A
 
V
A
 
P
G
 
Y
M
 
E
G
 
Q
F
 
L
K
 
N
S
 
V
A
 
K
D
 
N
T
 
P
A
 
V
F
 
A
Y
 
F
E
 
A
I
 
L
A
 
N
E
 
Y
L
 
I
A
 
H
A
x
Q
G
 
-
S
 
D
W
 
W
L
x
V
A
 
A
T
 
G
L
 
F
T
 
I
A
 
S
V
 
L
A
 
G
T
 
-
A
 
A
L
 
I
A
 
A
W
 
G
G
 
I
V
 
T
A
 
T
V
 
V
A
 
L
I
 
L
T
 
V
S
 
M
Q
 
M
A
 
Y
A
 
G
V
 
Q
S
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
Y
G
 
A
M
 
I
A
 
S
R
 
R
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
F
A
 
A
K
 
R
V
 
I
H
 
S
P
 
P
K
 
T
H
 
R
N
 
Q
T
 
V
P
 
P
Y
 
Y
M
 
V
S
 
N
I
 
T
Y
 
W
L
 
L
V
 
T
A
 
G
V
 
-
L
 
-
S
 
A
L
 
A
L
 
V
I
 
A
C
 
V
Y
 
F
L
 
A
F
 
G
I
 
I
N
 
I
A
 
P
V
 
L
D
 
N
T
 
K
L
 
L
T
 
A
S
 
E
L
 
L
V
 
T
N
 
N
F
 
I
G
 
G
A
 
T
L
 
L
S
 
F
G
 
A
F
 
F
M
 
I
L
 
T
L
 
V
H
 
S
I
 
I
T
 
G
V
 
V
I
 
L
N
 
V
H
 
-
Y
 
-
W
 
-
R
 
L
R
 
R
Q
 
K
R
 
T
S
 
Q
G
 
P
Q
 
D
L
 
L
I
 
K
R
 
R
H
 
A
V
 
F
I
 
R
C
 
V
P
 
P
L
 
F
V
 
V
G
 
P
F
 
V
V
 
V
I
 
P
V
 
I
A
 
L
A
 
A
I
 
V
M
 
L
Y
 
F
N
 
C
M
 
G
G
 
Y
V
 
L
A
 
V
A
 
L
Q
 
Q
K
 
L
L
 
P
G
 
A
L
 
M
I
 
T
W
 
W
I
 
I

P15993 Aromatic amino acid transport protein AroP; Aromatic amino acid:H(+) symporter AroP; General aromatic amino acid permease; General aromatic transport system from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
25% identity, 78% coverage: 3:351/449 of query aligns to 2:353/457 of P15993

query
sites
P15993
I
 
M
E
 
E
A
 
G
F
 
Q
G
 
Q
Y
 
H
K
 
G
Q
 
E
E
 
Q
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
K
L
 
N
T
 
R
D
 
H
L
 
I
V
 
Q
V
 
L
Y
 
I
G
 
A
M
 
L
I
 
G
F
 
G
M
 
A
I
 
I
P
 
G
I
 
T
A
 
G
P
 
L
F
 
F
-
 
L
G
 
G
V
 
S
Y
 
A
G
 
S
Y
 
V
V
 
I
N
 
Q
A
 
S
E
 
A
A
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
I
V
 
I
P
 
L
L
 
G
A
 
Y
Y
 
A
I
 
I
I
 
A
G
 
G
M
 
F
V
 
I
A
 
A
M
 
F
L
 
L
F
 
I
T
 
M
A
 
R
L
 
-
S
 
Q
Y
 
L
G
 
G
S
 
E
M
 
M
A
 
V
R
 
V
A
 
E
F
 
E
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
F
Y
 
S
S
 
H
Y
 
F
A
 
A
Q
 
Y
R
 
K
G
 
Y
L
 
W
N
 
G
P
 
S
H
 
F
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
A
A
 
S
G
 
G
W
 
W
L
 
N
M
 
Y
L
 
W
L
 
V
D
 
L
Y
|
Y
L
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
A
P
 
M
L
 
A
L
 
E
Y
 
L
V
 
T
Y
 
A
A
 
V
A
 
G
M
 
K
A
 
Y
L
 
I
N
 
Q
H
 
F
L
 
W
Y
 
Y
P
 
P
D
 
E
I
 
I
P
 
P
K
 
T
V
 
W
G
 
V
F
 
S
I
 
A
L
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
F
V
 
V
S
 
V
A
 
I
T
 
N
F
 
A
V
 
I
N
 
N
L
 
L
R
 
T
G
 
N
I
 
V
T
 
K
F
 
V
T
 
F
A
 
G
R
 
E
M
 
M
N
 
E
I
 
F
I
 
W
F
 
F
L
 
A
L
 
I
A
 
I
Q
 
K
L
 
V
V
 
I
-
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
A
I
 
M
F
 
I
L
 
I
F
 
F
Y
 
G
A
 
G
W
 
W
N
 
-
A
 
L
L
 
L
H
 
F
G
 
S
G
 
G
A
 
N
G
 
G
H
 
G
G
 
P
Q
 
Q
L
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
S
P
 
N
L
 
L
Y
 
W
S
 
D
P
 
Q
E
 
G
H
 
G
F
 
F
-
 
L
-
 
P
-
 
H
N
 
G
F
 
F
A
 
T
L
 
G
L
 
L
M
 
V
Q
 
M
A
 
M
V
 
M
S
 
A
I
 
I
A
 
I
V
 
M
L
 
F
S
 
S
F
 
F
L
 
G
G
 
G
F
 
L
D
 
E
A
 
L
I
 
V
S
 
G
T
 
I
L
 
T
A
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
-
K
 
A
G
 
D
D
 
N
P
 
P
G
 
E
R
 
Q
S
 
S
V
 
I
G
 
P
K
 
K
A
 
A
A
 
T
-
 
N
-
 
Q
-
 
V
-
 
I
-
 
Y
L
 
R
V
 
I
T
 
L
L
 
I
L
 
F
V
 
Y
M
 
I
G
 
G
A
 
S
I
 
L
F
 
A
V
 
V
V
 
L
Q
 
L
T
 
S
W
 
L
I
 
M
A
 
P
T
 
W
D
 
T
L
 
R
A
 
V
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
S
 
T
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
S
-
 
P
-
 
F
-
 
V
-
 
L
-
 
I
F
 
F
Y
 
H
E
 
E
I
 
L
A
 
G
E
 
D
L
 
T
A
 
F
A
 
V
G
 
A
S
 
N
W
 
A
L
 
L
A
 
N
T
 
I
L
 
V
T
 
V
A
 
L
V
 
T
A
 
A
T
 
A
A
 
L
L
 
S
A
 
V
W
 
Y
G
 
N
V
 
S
A
 
C
V
 
V
A
 
Y
I
 
C
T
 
N
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
S
R
 
R
L
 
M
L
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
Q
D
 
Q
G
 
G
Q
 
N
L
 
A
P
 
P
K
 
K
V
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
S
V
 
V
H
 
D
P
 
-
K
 
K
H
 
R
N
 
G
T
 
V
P
 
P
Y
 
V
M
 
N
S
 
T
I
 
I
Y
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
V
 
A
L
 
L
S
 
C
L
 
V
L
 
L
I
 
I
C
 
N
Y
 
Y
L
 
L

Q9FFL1 Polyamine transporter RMV1; Protein RESISTANT TO METHYL VIOLOGEN 1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
24% identity, 71% coverage: 34:351/449 of query aligns to 70:381/490 of Q9FFL1

query
sites
Q9FFL1
P
 
P
F
 
F
G
 
G
V
 
I
Y
 
E
G
 
D
Y
 
S
V
 
V
N
 
K
A
 
A
E
 
A
A
 
G
P
 
P
G
 
-
M
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
A
 
L
Y
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
M
 
F
V
 
I
A
 
V
M
 
F
L
 
P
F
 
F
-
 
I
-
 
W
-
 
S
-
 
I
-
 
P
T
 
E
A
 
A
L
 
L
S
 
I
Y
 
T
G
 
A
S
 
E
M
 
M
A
 
G
R
 
T
A
 
M
F
 
F
P
 
P
V
 
E
A
 
N
G
 
G
S
 
G
V
 
Y
Y
 
V
S
 
V
Y
 
W
A
 
V
Q
 
T
R
 
L
G
 
A
L
 
M
N
 
G
P
 
P
H
 
Y
V
 
W
G
 
G
F
 
F
I
 
Q
A
 
Q
G
 
G
W
 
W
L
 
V
M
 
K
L
 
W
L
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
V
-
 
I
D
 
D
Y
 
N
L
 
A
L
 
L
I
 
Y
P
 
P
P
 
I
L
 
L
L
 
F
Y
 
L
V
 
D
Y
 
Y
A
 
L
A
 
K
M
 
S
A
 
G
L
 
I
N
 
P
H
 
I
L
 
L
Y
 
G
P
 
S
D
 
G
I
 
I
P
 
P
K
 
R
V
 
V
G
 
A
F
 
A
I
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
L
L
 
T
V
 
V
S
 
A
A
 
L
T
 
T
F
 
Y
V
 
L
N
 
N
L
 
Y
R
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
S
F
 
I
T
 
V
A
 
G
R
 
V
M
 
A
N
 
A
I
 
V
I
 
L
F
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
L
V
 
G
V
 
V
L
 
F
G
 
S
I
 
I
F
 
L
L
 
P
F
 
F
Y
 
V
A
 
V
W
 
M
N
 
S
A
 
F
L
 
M
H
 
S
G
 
I
G
 
P
A
 
K
G
 
L
H
 
K
G
 
P
Q
 
S
L
 
R
T
 
W
L
 
L
A
 
V
P
 
V
L
 
S
Y
 
K
S
 
K
P
 
M
E
 
K
H
 
G
F
 
V
N
 
N
F
 
W
A
 
S
L
 
L
L
 
Y
M
 
L
Q
 
N
A
 
T
V
 
L
S
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
F
L
 
W
S
 
N
F
 
L
L
 
N
G
 
Y
F
 
W
D
 
D
A
 
S
I
 
V
S
 
S
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
G
E
 
E
I
 
V
K
 
E
G
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
S
R
 
K
S
 
T
V
 
L
G
 
P
K
 
R
A
 
A
A
 
L
L
 
F
V
 
Y
T
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
L
M
 
V
G
 
V
A
 
F
I
 
S
F
 
Y
V
 
I
V
 
F
Q
 
P
T
 
V
W
 
L
I
 
T
A
 
G
T
 
T
D
 
G
L
 
A
A
 
I
A
 
A
G
 
L
M
 
D
G
 
Q
F
 
K
K
 
L
S
 
W
A
 
T
D
 
D
T
 
G
A
 
Y
F
 
F
Y
 
A
E
 
D
I
 
I
A
 
G
E
 
K
L
 
V
A
 
I
A
 
G
G
 
G
S
 
V
W
 
W
L
 
L
A
 
G
T
 
W
L
 
W
T
 
I
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
T
A
 
S
W
 
-
G
 
N
V
 
M
A
 
G
V
 
M
A
 
F
I
 
L
T
 
A
S
 
E
Q
 
M
A
 
S
A
 
S
V
 
D
S
 
S
R
 
F
L
 
Q
L
 
L
F
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
A
R
 
E
D
 
R
G
 
G
Q
 
M
L
 
L
P
 
P
K
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
A
K
 
K
V
 
-
H
 
R
P
 
S
K
 
R
H
 
Y
N
 
R
T
 
T
P
 
P
Y
 
W
M
 
V
S
 
G
I
 
I
Y
 
L
L
 
F
V
 
S
A
 
A
V
 
S
L
 
G
S
 
V
L
 
I
L
x
I
I
 
L
C
 
S
Y
 
W
L
 
L

P24207 Phenylalanine-specific permease; Phenylalanine:H(+) symporter PheP from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
26% identity, 63% coverage: 68:351/449 of query aligns to 75:361/458 of P24207

query
sites
P24207
G
 
G
S
 
E
M
 
M
A
 
V
R
 
V
A
 
E
F
 
E
P
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
S
V
x
F
Y
 
A
S
 
H
Y
x
F
A
 
A
Q
x
Y
R
 
K
G
x
Y
L
x
W
N
 
G
P
 
P
H
x
F
V
 
A
G
 
G
F
|
F
I
 
L
A
 
S
G
 
G
W
|
W
L
 
N
M
x
Y
L
x
W
L
 
V
D
 
M
Y
x
F
L
 
V
L
 
L
I
 
V
P
 
G
P
 
M
L
 
A
L
x
E
Y
 
L
V
 
T
Y
 
A
A
 
A
A
 
G
M
 
I
A
 
Y
L
 
M
N
 
Q
H
 
Y
L
 
W
Y
 
F
P
 
P
D
 
D
I
 
V
P
 
P
K
 
T
V
 
W
G
 
I
F
 
W
I
 
A
L
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
F
V
 
I
S
 
I
A
 
I
T
 
N
F
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
V
G
 
N
I
 
V
T
 
R
F
 
L
T
 
Y
A
 
G
R
 
E
M
 
T
N
 
E
I
 
F
I
 
W
F
 
F
-
 
A
L
 
L
L
 
I
A
x
K
Q
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
I
L
 
I
G
 
G
I
 
M
F
 
I
L
 
G
F
 
F
Y
 
G
A
 
L
W
 
W
N
 
-
A
 
L
L
 
L
H
 
F
G
 
S
G
 
G
A
 
H
G
 
G
H
 
G
G
 
E
Q
 
K
L
 
A
T
 
S
L
 
I
A
 
D
P
 
N
L
 
L
Y
 
W
S
 
R
P
 
Y
E
 
G
H
 
G
F
 
F
-
 
F
-
 
A
-
 
T
N
 
G
F
 
W
A
 
N
L
 
G
L
 
L
M
 
I
Q
 
L
A
 
S
V
 
L
S
 
A
I
 
V
A
 
I
V
 
M
L
 
F
S
 
S
F
 
F
L
 
G
G
 
G
F
 
L
D
x
E
A
 
L
I
 
I
S
 
G
T
 
I
L
 
T
A
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
A
K
 
R
G
 
-
D
 
D
P
 
P
G
 
E
R
 
K
S
 
S
V
 
I
G
 
P
K
 
K
A
 
A
A
 
V
-
 
N
-
 
Q
-
 
V
-
 
V
-
 
Y
L
x
R
V
 
I
T
 
L
L
 
L
L
 
F
V
 
Y
M
 
I
G
 
G
A
 
S
I
 
L
F
 
V
V
 
V
V
 
L
Q
 
L
T
 
A
-
 
L
-
 
Y
-
 
P
W
 
W
I
 
V
A
 
E
T
 
V
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
K
S
 
S
A
 
N
D
 
S
T
 
S
A
 
P
F
 
F
Y
 
V
E
 
M
I
 
I
A
 
F
E
 
H
L
 
N
A
 
L
A
 
D
G
 
S
S
 
N
W
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
V
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
N
W
 
F
G
 
V
V
 
I
A
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
S
T
 
L
S
 
S
-
 
V
-
 
Y
Q
 
N
A
 
S
A
 
G
V
 
V
-
 
Y
-
 
S
-
 
N
S
 
S
R
 
R
L
 
M
L
 
L
F
 
F
G
 
G
M
 
L
A
 
S
R
 
V
D
 
Q
G
 
G
Q
 
N
L
 
A
P
 
P
K
 
K
V
 
F
L
 
L
A
 
T
K
 
R
V
 
V
H
 
S
P
 
-
K
 
R
H
 
R
N
 
G
T
 
V
P
|
P
Y
 
I
M
 
N
S
 
S
I
 
L
Y
 
M
L
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
A
V
 
I
A
 
T
V
 
S
L
 
L
S
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
I
C
 
N
Y
 
Y
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P30825 High affinity cationic amino acid transporter 1; CAT-1; CAT1; Ecotropic retroviral leukemia receptor homolog; Ecotropic retrovirus receptor homolog; Solute carrier family 7 member 1; System Y+ basic amino acid transporter from Homo sapiens (Human) (see paper)
22% identity, 84% coverage: 3:379/449 of query aligns to 19:428/629 of P30825

query
sites
P30825
I
 
V
E
 
D
A
 
C
F
 
S
G
 
R
Y
 
E
K
 
E
Q
 
T
E
 
R
L
 
L
K
 
S
R
 
R
G
 
C
L
 
L
S
 
N
L
 
T
T
 
F
D
 
D
L
 
L
V
 
V
V
 
A
Y
 
L
G
 
G
M
 
V
I
 
G
F
 
S
M
 
T
I
 
L
P
 
G
I
 
A
A
 
G
P
 
V
F
 
Y
G
 
V
V
 
L
Y
 
A
G
 
G
Y
 
A
V
 
V
N
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
N
P
 
A
G
 
G
-
 
P
M
 
A
V
 
I
P
 
V
L
 
I
A
 
S
Y
 
F
I
 
L
I
 
I
G
 
A
M
 
A
V
 
L
A
 
A
M
 
S
L
 
V
F
 
L
T
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
C
Y
 
Y
G
 
G
S
 
E
M
 
F
A
 
G
R
 
A
A
 
R
F
 
V
P
 
P
V
 
K
A
 
T
G
 
G
S
 
S
V
 
A
Y
 
Y
S
 
L
Y
 
Y
A
 
S
Q
 
Y
R
 
V
G
 
T
L
 
V
N
 
G
P
 
E
H
 
L
V
 
W
G
 
A
F
 
F
I
 
I
A
 
T
G
 
G
W
 
W
L
 
N
M
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
S
Y
 
Y
L
 
I
L
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
S
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
W
-
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
G
I
 
R
P
 
P
P
 
I
L
 
G
L
 
E
Y
 
F
V
 
S
Y
 
R
A
 
T
A
 
H
M
 
M
A
 
T
L
 
L
N
 
N
H
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
L
-
 
A
L
 
E
Y
 
N
P
 
P
D
 
D
I
 
I
P
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
F
 
F
I
 
A
L
 
V
A
 
I
F
 
I
L
 
I
V
 
L
S
 
I
A
 
L
T
 
T
F
 
G
V
 
L
N
 
L
L
 
T
R
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
K
F
 
E
T
 
S
A
 
A
R
 
M
M
 
V
N
 
N
I
 
K
I
 
I
F
 
F
L
 
T
L
 
C
A
 
I
Q
 
N
L
 
V
V
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
F
F
 
I
L
 
M
F
 
V
Y
 
S
A
 
G
-
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
N
W
 
W
N
 
Q
A
 
L
L
 
T
H
 
E
G
 
E
G
 
D
A
 
F
G
 
G
H
x
N
-
 
T
-
 
S
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
T
 
C
L
 
L
A
 
N
P
 
N
L
 
D
Y
 
T
S
 
K
P
 
E
E
 
G
H
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
M
-
 
P
F
 
F
N
 
G
F
 
F
A
 
S
L
 
G
L
 
V
M
 
L
Q
 
S
A
 
G
V
 
A
S
 
A
I
 
T
A
 
C
V
 
F
L
 
Y
S
 
A
F
 
F
L
 
V
G
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
C
I
 
I
S
 
A
T
 
T
L
 
T
A
 
G
E
 
E
E
 
E
I
 
V
K
 
K
G
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
Q
R
 
K
S
 
A
V
 
I
G
 
P
K
 
V
A
 
G
A
 
I
L
 
V
V
 
A
T
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
I
M
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
C
F
 
F
V
 
I
V
 
A
Q
 
Y
T
 
F
W
 
G
I
 
V
A
 
S
T
 
A
D
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
L
G
 
M
M
 
M
G
 
P
F
 
Y
K
 
F
S
 
C
A
 
L
D
 
D
T
 
N
A
 
N
F
 
S
Y
 
P
E
 
L
I
 
P
A
 
D
E
 
A
L
 
F
A
 
K
A
 
H
G
 
V
S
 
G
W
 
W
L
 
E
A
 
G
T
 
A
L
 
K
T
 
Y
A
 
A
V
 
V
A
 
A
T
 
V
-
 
G
A
 
S
L
 
L
A
 
C
W
 
A
G
 
L
V
 
S
A
 
A
V
 
S
A
 
L
I
 
L
T
 
G
S
 
S
Q
 
M
A
 
F
A
 
P
V
 
M
S
 
P
R
 
R
L
 
V
L
 
I
F
 
Y
G
 
A
M
 
M
A
 
A
R
 
E
D
 
D
G
 
G
Q
 
L
L
 
L
P
 
F
K
 
K
V
 
F
L
 
L
A
 
A
K
 
N
V
 
V
H
 
N
P
 
D
K
 
R
H
 
T
N
 
K
T
 
T
P
 
P
Y
 
I
M
 
I
S
 
A
I
 
T
Y
 
L
L
 
A
V
 
S
A
 
G
V
 
A
L
 
V
S
 
A
L
 
A
L
 
V
I
 
M
C
 
A
Y
 
F
L
 
L
F
 
F
I
 
-
N
 
-
A
 
D
V
 
L
D
 
K
T
 
D
L
 
L
T
 
V
S
 
D
L
 
L
V
 
M
N
 
S
F
 
I
G
 
G
A
 
T
L
 
L
S
 
L
G
 
A
F
 
Y
M
 
S
L
 
L
L
 
V
H
 
A
I
 
A
T
 
C
V
 
V
I
 
L

Q9URZ4 Cationic amino acid transporter 1 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
24% identity, 74% coverage: 45:376/449 of query aligns to 114:463/587 of Q9URZ4

query
sites
Q9URZ4
A
 
G
P
 
P
G
 
A
M
 
S
V
 
V
P
 
I
L
 
I
A
 
N
Y
 
Y
I
 
S
I
 
L
G
 
I
M
 
G
V
 
I
A
 
M
M
 
M
L
 
F
F
 
F
T
 
I
A
 
V
L
 
Y
S
 
A
Y
 
L
G
 
G
S
 
E
M
 
M
A
 
A
R
 
V
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
G
V
 
F
Y
 
N
S
 
T
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
T
R
 
R
G
 
F
L
 
I
N
 
D
P
 
P
H
 
A
V
 
W
G
 
G
F
 
F
I
 
A
A
 
V
G
 
S
W
 
W
L
 
N
M
 
Y
L
 
F
L
 
I
D
 
N
Y
 
Y
L
 
F
L
 
V
I
 
T
P
 
F
P
 
P
L
 
L
L
 
E
Y
 
L
V
 
T
Y
 
T
A
 
C
A
 
A
M
 
I
A
 
T
L
 
F
N
 
R
H
 
Y
L
 
-
Y
 
W
P
 
T
D
 
D
I
 
I
P
 
N
K
 
S
V
 
A
G
 
A
F
 
W
I
 
I
L
 
S
A
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
S
 
V
A
 
I
T
 
I
F
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
F
G
 
G
I
 
V
T
 
-
F
 
-
T
 
R
A
 
A
R
 
Y
M
 
G
N
 
E
I
 
V
I
 
E
F
 
F
L
 
I
L
 
L
A
 
S
Q
 
T
L
 
V
V
 
K
V
 
V
L
 
V
G
 
A
I
 
T
F
 
F
L
 
G
F
 
F
Y
 
I
A
 
I
W
 
L
N
 
A
A
 
I
L
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
D
H
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
Y
G
 
I
H
 
G
G
 
G
Q
 
S
L
 
I
T
 
I
L
 
-
A
 
-
P
 
-
L
 
K
Y
 
H
S
 
K
P
 
P
E
 
F
H
 
R
F
 
H
N
 
G
F
 
F
A
 
K
L
 
G
L
 
F
M
 
C
Q
 
S
A
 
V
V
 
F
S
 
T
I
 
T
A
 
A
V
 
A
L
 
F
S
 
S
F
 
F
L
 
S
G
 
G
F
 
T
D
 
E
A
 
V
I
 
I
S
 
G
T
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
V
K
 
D
G
 
-
D
 
N
P
 
P
G
 
Q
R
 
K
S
 
A
V
 
L
G
 
P
K
 
H
A
 
A
A
 
V
L
 
K
V
 
Q
T
 
V
L
 
F
L
 
W
V
 
R
M
 
I
G
 
A
A
 
I
I
 
F
F
 
Y
V
 
V
V
 
V
Q
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
L
-
 
I
-
 
G
T
 
L
W
 
L
I
 
I
A
 
S
T
 
P
D
 
D
L
 
D
A
 
P
A
 
N
G
 
L
M
 
M
G
 
G
F
 
N
K
 
G
S
 
S
A
 
T
D
 
S
T
 
V
A
 
S
F
 
P
Y
 
F
E
 
V
I
 
L
A
 
A
E
 
I
L
 
K
A
 
E
A
 
A
G
 
N
S
 
-
W
 
-
L
 
I
A
 
K
T
 
G
L
 
L
T
 
P
A
 
S
V
 
V
A
 
F
T
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
I
W
 
I
G
 
I
V
 
S
A
 
V
V
 
V
A
 
S
I
 
V
T
 
T
S
 
N
Q
 
S
A
 
S
A
 
T
V
 
Y
S
 
T
-
 
A
-
 
G
R
 
R
L
 
T
L
 
L
F
 
H
G
 
G
M
 
M
A
 
A
R
 
N
D
 
L
G
 
K
Q
 
Q
L
 
A
P
 
P
K
 
S
V
 
F
L
 
F
A
 
-
K
 
K
V
 
Y
H
 
T
P
 
D
K
 
R
H
 
L
N
 
G
T
 
R
P
 
P
Y
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
M
Y
 
I
L
 
V
V
 
V
A
 
L
V
 
L
L
 
F
S
 
G
L
 
F
L
 
-
I
 
-
C
 
-
Y
 
F
L
 
A
F
 
Y
I
 
I
N
 
N
A
 
E
V
 
A
D
 
D
T
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
V
-
 
S
-
 
D
-
 
T
-
 
V
-
 
F
-
 
N
-
 
W
-
 
L
-
 
L
-
 
A
L
 
L
T
 
S
S
 
G
L
 
L
V
 
S
N
 
N
F
 
F
G
 
F
A
 
T
L
 
W
S
 
G
G
 
S
F
 
I
M
 
C
L
 
L
L
 
C
H
 
H
I
 
I

Sites not aligning to the query:

7cmiB The lat2-4f2hc complex in complex with leucine (see paper)
22% identity, 78% coverage: 44:395/449 of query aligns to 27:380/458 of 7cmiB

query
sites
7cmiB
E
 
E
A
 
N
P
 
A
G
 
G
M
 
S
V
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
W
M
 
I
V
 
V
A
 
T
M
 
G
L
 
F
F
 
I
T
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
C
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
M
 
L
A
 
G
R
 
V
A
 
T
F
 
I
P
 
P
V
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
G
V
 
D
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
K
R
 
D
G
 
I
L
 
F
N
 
G
P
 
G
H
 
L
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
R
G
 
L
W
 
W
L
 
I
M
 
A
L
 
V
L
 
L
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
L
 
V
I
 
I
P
 
Y
P
 
P
-
 
T
-
x
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
L
 
I
L
 
A
Y
 
L
V
 
T
Y
 
F
A
 
S
A
 
N
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
N
 
Q
H
 
P
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
D
 
T
I
 
C
-
 
F
-
 
P
P
 
P
K
 
E
V
 
S
G
 
G
F
 
L
I
 
R
L
 
L
A
 
L
F
 
A
L
 
A
V
 
I
S
 
C
A
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
L
T
 
T
F
 
W
V
 
V
N
 
N
L
 
C
R
 
S
G
 
S
I
 
V
T
 
R
F
 
W
T
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
V
N
 
Q
I
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
I
Y
 
M
A
 
G
W
 
I
N
 
V
A
 
Q
L
 
I
H
 
C
G
 
K
G
 
G
A
 
E
G
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
Y
L
 
F
T
 
W
L
 
L
A
 
E
P
 
P
L
 
K
Y
 
N
S
 
A
P
 
F
E
 
E
H
 
N
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
P
N
 
D
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
A
Q
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
I
 
Q
A
 
G
V
 
S
L
x
F
S
 
A
F
 
Y
L
x
G
G
 
G
F
 
W
D
 
N
A
 
F
I
 
L
S
 
N
T
 
Y
L
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
K
 
V
G
 
-
D
 
D
P
 
P
G
 
Y
R
 
K
S
 
N
V
 
L
G
 
P
K
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
I
L
 
P
V
 
L
M
 
V
G
 
T
A
 
F
I
 
V
F
 
Y
V
 
V
V
 
F
Q
 
A
T
 
N
W
 
V
I
 
A
A
 
Y
T
 
V
D
 
T
L
 
A
A
 
M
A
 
S
G
 
P
M
 
Q
G
 
E
F
 
L
K
 
L
S
 
A
A
 
S
D
 
N
T
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
V
E
 
T
I
 
F
A
 
G
E
 
E
-
 
K
-
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
V
G
 
M
S
 
A
W
 
W
L
 
I
A
 
M
T
 
P
L
 
I
T
 
S
A
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
T
A
 
F
W
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
N
V
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
F
S
 
T
Q
 
S
A
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
F
G
 
A
M
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
M
V
 
I
H
 
H
P
 
V
K
 
K
H
 
R
N
 
C
T
 
T
P
 
P
Y
 
I
M
 
P
S
 
A
I
 
L
Y
 
L
L
 
F
V
 
T
A
 
C
V
 
I
L
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
M
C
 
L
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
V
V
 
T
D
 
S
T
 
D
L
 
M
T
 
Y
S
 
T
L
 
L
V
 
I
N
 
N
F
 
Y
G
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
I
G
 
N
F
 
Y
M
 
L
L
 
F
L
 
Y
H
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
A
N
 
G
H
 
Q
Y
 
I
W
 
V
R
 
L
R
 
R
Q
 
W
R
 
K
S
 
K
G
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
P
R
 
R
H
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7cmhB The lat2-4f2hc complex in complex with tryptophan (see paper)
22% identity, 78% coverage: 44:395/449 of query aligns to 27:380/458 of 7cmhB

query
sites
7cmhB
E
 
E
A
 
N
P
 
A
G
 
G
M
 
S
V
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
W
M
 
I
V
 
V
A
 
T
M
 
G
L
 
F
F
 
I
T
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
C
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
M
 
L
A
 
G
R
 
V
A
 
T
F
 
I
P
 
P
V
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
G
V
 
D
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
K
R
 
D
G
 
I
L
 
F
N
 
G
P
 
G
H
 
L
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
R
G
 
L
W
 
W
L
 
I
M
 
A
L
 
V
L
 
L
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
L
 
V
I
 
I
P
 
Y
P
 
P
-
 
T
-
x
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
L
 
I
L
 
A
Y
 
L
V
 
T
Y
 
F
A
 
S
A
 
N
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
N
 
Q
H
 
P
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
D
 
T
I
 
C
-
 
F
-
 
P
P
 
P
K
 
E
V
 
S
G
 
G
F
 
L
I
 
R
L
 
L
A
 
L
F
 
A
L
 
A
V
 
I
S
 
C
A
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
L
T
 
T
F
 
W
V
 
V
N
 
N
L
 
C
R
 
S
G
 
S
I
 
V
T
 
R
F
 
W
T
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
V
N
 
Q
I
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
I
Y
 
M
A
 
G
W
 
I
N
 
V
A
 
Q
L
 
I
H
 
C
G
 
K
G
 
G
A
 
E
G
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
Y
L
 
F
T
 
W
L
 
L
A
 
E
P
 
P
L
 
K
Y
 
N
S
 
A
P
 
F
E
 
E
H
 
N
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
P
N
 
D
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
A
Q
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
I
 
Q
A
 
G
V
 
S
L
x
F
S
x
A
F
 
Y
L
x
G
G
 
G
F
 
W
D
 
N
A
 
F
I
 
L
S
 
N
T
 
Y
L
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
K
 
V
G
 
-
D
 
D
P
 
P
G
 
Y
R
 
K
S
 
N
V
 
L
G
 
P
K
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
I
L
 
P
V
 
L
M
 
V
G
 
T
A
 
F
I
 
V
F
 
Y
V
 
V
V
 
F
Q
 
A
T
 
N
W
 
V
I
 
A
A
 
Y
T
 
V
D
 
T
L
 
A
A
 
M
A
 
S
G
 
P
M
 
Q
G
 
E
F
 
L
K
 
L
S
 
A
A
 
S
D
 
N
T
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
V
E
 
T
I
 
F
A
 
G
E
 
E
-
 
K
-
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
V
G
 
M
S
 
A
W
 
W
L
 
I
A
 
M
T
 
P
L
 
I
T
 
S
A
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
T
A
 
F
W
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
N
V
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
F
S
 
T
Q
 
S
A
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
F
G
 
A
M
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
M
V
 
I
H
 
H
P
 
V
K
 
K
H
 
R
N
 
C
T
 
T
P
 
P
Y
 
I
M
 
P
S
 
A
I
 
L
Y
 
L
L
 
F
V
 
T
A
 
C
V
 
I
L
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
M
C
 
L
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
V
V
 
T
D
 
S
T
 
D
L
 
M
T
 
Y
S
 
T
L
 
L
V
 
I
N
 
N
F
 
Y
G
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
I
G
x
N
F
 
Y
M
 
L
L
 
F
L
 
Y
H
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
A
N
 
G
H
 
Q
Y
 
I
W
 
V
R
 
L
R
 
R
Q
 
W
R
 
K
S
 
K
G
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
P
R
 
R
H
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7b00A Human lat2-4f2hc complex in the apo-state (see paper)
22% identity, 78% coverage: 44:395/449 of query aligns to 27:380/457 of 7b00A

query
sites
7b00A
E
 
E
A
 
N
P
 
A
G
 
G
M
 
S
V
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
W
M
 
I
V
 
V
A
 
T
M
 
G
L
 
F
F
 
I
T
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
C
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
M
 
L
A
 
G
R
 
V
A
 
T
F
 
I
P
 
P
V
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
G
V
 
D
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
K
R
 
D
G
 
I
L
 
F
N
 
G
P
 
G
H
 
L
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
R
G
 
L
W
 
W
L
 
I
M
 
A
L
 
V
L
 
L
D
 
-
Y
 
-
L
 
-
L
 
V
I
 
I
P
 
Y
P
 
P
-
 
T
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
L
 
I
L
 
A
Y
 
L
V
 
T
Y
 
F
A
 
S
A
 
N
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
N
 
Q
H
 
P
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
D
 
T
I
 
C
-
 
F
-
 
P
P
 
P
K
 
E
V
 
S
G
 
G
F
 
L
I
 
R
L
 
L
A
 
L
F
 
A
L
 
A
V
 
I
S
 
C
A
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
L
T
 
T
F
 
W
V
 
V
N
 
N
L
 
C
R
 
S
G
 
S
I
 
V
T
 
R
F
 
W
T
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
V
N
 
Q
I
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
I
Y
 
M
A
 
G
W
 
I
N
 
V
A
 
Q
L
 
I
H
 
C
G
 
K
G
 
G
A
 
E
G
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
Y
L
 
F
T
 
W
L
 
L
A
 
E
P
 
P
L
 
K
Y
 
N
S
 
A
P
 
F
E
 
E
H
 
N
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
P
N
 
D
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
A
Q
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
I
 
Q
A
 
G
V
 
S
L
 
F
S
 
A
F
 
Y
L
 
G
G
 
G
F
 
W
D
 
N
A
 
F
I
 
L
S
 
N
T
 
Y
L
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
K
 
V
G
 
-
D
 
D
P
 
P
G
 
Y
R
 
K
S
 
N
V
 
L
G
 
P
K
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
I
L
 
P
V
 
L
M
 
V
G
 
T
A
 
F
I
 
V
F
 
Y
V
 
V
V
 
F
Q
 
A
T
 
N
W
 
V
I
 
A
A
 
Y
T
 
V
D
 
T
L
 
A
A
 
M
A
 
S
G
 
P
M
 
Q
G
 
E
F
 
L
K
 
L
S
 
A
A
 
S
D
 
N
T
 
A
A
 
V
F
 
A
Y
 
V
E
 
T
I
 
F
A
 
G
E
 
E
-
 
K
-
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
V
G
 
M
S
 
A
W
 
W
L
 
I
A
 
M
T
 
P
L
 
I
T
 
S
A
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
T
A
 
F
W
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
N
V
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
F
S
 
T
Q
 
S
A
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
F
G
 
A
M
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
M
V
 
I
H
 
H
P
 
V
K
 
K
H
 
R
N
 
C
T
 
T
P
 
P
Y
 
I
M
 
P
S
 
A
I
 
L
Y
 
L
L
 
F
V
 
T
A
 
C
V
 
I
L
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
I
x
M
C
 
L
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
V
V
 
T
D
 
S
T
 
D
L
 
M
T
 
Y
S
 
T
L
 
L
V
 
I
N
 
N
F
x
Y
G
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
I
G
 
N
F
 
Y
M
 
L
L
 
F
L
 
Y
H
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
A
N
 
G
H
 
Q
Y
 
I
W
 
V
R
 
L
R
 
R
Q
 
W
R
 
K
S
 
K
G
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
P
R
 
R
H
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Q9UHI5 Large neutral amino acids transporter small subunit 2; L-type amino acid transporter 2; hLAT2; Solute carrier family 7 member 8 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
22% identity, 78% coverage: 44:395/449 of query aligns to 67:420/535 of Q9UHI5

query
sites
Q9UHI5
E
 
E
A
 
N
P
 
A
G
 
G
M
 
S
V
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
W
M
 
I
V
 
V
A
 
T
M
 
G
L
 
F
F
 
I
T
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
G
A
 
A
L
 
L
S
 
C
Y
|
Y
G
 
A
S
 
E
M
 
L
A
 
G
R
 
V
A
 
T
F
 
I
P
 
P
V
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
G
V
 
D
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
K
R
 
D
G
 
I
L
 
F
N
 
G
P
 
G
H
 
L
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
R
G
 
L
W
 
W
L
 
I
M
 
A
L
 
V
L
 
L
D
 
-
Y
 
-
L
 
V
L
 
I
I
 
Y
P
 
P
P
 
T
-
x
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
L
 
I
L
 
A
Y
 
L
V
 
T
Y
 
F
A
 
S
A
 
N
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
N
 
Q
H
 
P
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
D
 
T
I
x
C
-
 
F
-
 
P
P
 
P
K
 
E
V
 
S
G
 
G
F
 
L
I
 
R
L
 
L
A
 
L
F
 
A
L
 
A
V
 
I
S
 
C
A
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
L
T
 
T
F
x
W
V
 
V
N
 
N
L
 
C
R
 
S
G
 
S
I
 
V
T
 
R
F
 
W
T
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
V
N
 
Q
I
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
I
Y
 
M
A
 
G
W
 
I
N
 
V
A
 
Q
L
 
I
H
 
C
G
 
K
G
 
G
A
 
E
G
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
Y
L
 
F
T
 
W
L
 
L
A
 
E
P
 
P
L
 
K
Y
 
N
S
 
A
P
 
F
E
 
E
H
 
N
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
P
N
 
D
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
A
Q
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
I
 
Q
A
 
G
V
 
S
L
x
F
S
 
A
F
 
Y
L
x
G
G
 
G
F
 
W
D
 
N
A
 
F
I
 
L
S
 
N
T
 
Y
L
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
K
 
V
G
 
-
D
 
D
P
 
P
G
 
Y
R
 
K
S
 
N
V
 
L
G
 
P
K
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
I
L
 
P
V
 
L
M
 
V
G
 
T
A
 
F
I
 
V
F
 
Y
V
 
V
V
 
F
Q
 
A
T
 
N
W
 
V
I
 
A
A
 
Y
T
 
V
D
 
T
L
 
A
A
 
M
A
 
S
G
 
P
M
 
Q
G
 
E
F
 
L
K
 
L
S
 
A
A
 
S
D
 
N
T
 
A
A
x
V
F
 
A
Y
 
V
E
 
T
I
 
F
A
 
G
E
 
E
-
 
K
-
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
V
G
 
M
S
 
A
W
 
W
L
 
I
A
 
M
T
 
P
L
 
I
T
 
S
A
 
-
V
 
V
A
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
T
A
 
F
W
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
N
V
 
G
A
 
S
I
 
L
T
 
F
S
 
T
Q
 
S
A
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
F
G
 
A
M
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
M
V
 
I
H
 
H
P
 
V
K
 
K
H
 
R
N
 
C
T
 
T
P
 
P
Y
 
I
M
 
P
S
 
A
I
 
L
Y
 
L
L
 
F
V
 
T
A
 
C
V
 
I
L
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
M
C
 
L
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
V
V
 
T
D
 
S
T
 
D
L
 
M
T
 
Y
S
 
T
L
 
L
V
 
I
N
 
N
F
 
Y
G
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
I
G
x
N
F
x
Y
M
 
L
L
 
F
L
 
Y
H
 
G
I
 
V
T
|
T
V
 
V
I
 
A
N
 
G
H
 
Q
Y
 
I
W
 
V
R
 
L
R
 
R
Q
 
W
R
 
K
S
 
K
G
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
P
R
|
R
H
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

P25737 Lysine-specific permease LysP; Lysine transporter LysP; Trigger transporter LysP from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
24% identity, 89% coverage: 2:399/449 of query aligns to 7:410/489 of P25737

query
sites
P25737
S
 
T
I
 
T
E
 
E
A
 
A
F
 
P
G
 
G
Y
 
L
K
 
R
Q
 
R
E
 
E
L
 
L
K
 
K
R
 
-
G
 
A
L
 
R
S
 
H
L
 
L
T
 
T
D
 
M
L
 
I
V
 
A
V
 
I
Y
 
G
G
 
G
M
 
S
I
 
I
F
 
G
M
 
T
I
 
G
P
 
L
I
 
F
A
 
V
P
 
A
F
 
S
G
 
G
V
 
A
Y
 
T
G
 
-
Y
 
-
V
 
I
N
 
S
A
 
Q
E
 
A
A
 
G
P
 
P
G
 
G
M
 
G
V
 
A
P
 
L
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
I
 
M
I
 
L
G
 
I
M
 
G
V
 
L
A
 
M
M
 
V
L
 
Y
F
 
F
T
 
L
A
 
M
L
 
T
S
 
S
Y
 
L
G
 
G
S
 
E
M
 
L
A
 
A
R
 
A
A
 
Y
F
 
M
P
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
S
V
 
F
Y
 
A
S
 
T
Y
 
Y
A
 
G
Q
 
Q
R
 
N
G
 
Y
L
 
V
N
 
E
P
 
E
H
 
G
V
 
F
G
 
G
F
 
F
I
 
A
A
 
L
G
 
G
W
 
W
L
 
N
M
x
Y
L
 
W
L
 
Y
D
 
N
Y
x
W
L
 
A
L
 
V
I
 
T
P
 
I
P
 
A
L
 
V
L
 
D
Y
 
L
V
 
V
Y
 
A
A
 
A
A
 
Q
M
 
L
A
 
V
L
 
M
N
 
S
H
 
W
L
 
W
Y
 
F
P
 
P
D
 
D
I
 
T
P
 
P
K
 
G
-
 
W
-
 
I
-
 
W
V
 
S
G
 
A
F
 
L
I
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
V
L
 
I
V
 
F
S
 
L
A
 
L
T
 
N
F
 
Y
V
 
I
N
 
S
L
 
V
R
 
R
G
 
G
I
 
F
T
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
Y
-
 
W
-
 
F
-
 
S
-
 
L
F
 
I
T
x
K
A
 
V
R
 
T
M
 
T
N
 
V
I
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
I
L
 
I
A
 
V
Q
 
G
-
 
V
L
 
L
V
 
M
V
 
I
L
 
I
G
 
G
I
 
I
F
 
F
L
 
K
F
 
-
Y
 
-
A
 
-
W
 
-
N
 
G
A
 
A
L
 
Q
H
 
P
G
 
A
G
 
G
A
 
W
G
 
S
H
 
N
G
 
W
Q
 
T
L
 
I
T
 
G
L
 
E
A
 
A
P
 
P
L
 
F
Y
 
A
S
 
G
P
 
-
E
 
-
H
 
-
F
 
-
N
 
G
F
 
F
A
 
A
L
 
A
L
 
M
M
 
I
Q
 
G
A
 
V
V
 
A
S
 
M
I
 
I
A
 
V
V
 
G
L
x
F
S
 
S
F
 
F
L
 
Q
G
 
G
F
 
T
D
x
E
A
 
L
I
 
I
S
 
G
T
 
I
L
 
A
A
 
A
E
 
G
E
|
E
I
 
S
K
 
E
G
 
-
D
 
D
P
 
P
G
 
A
R
 
K
S
 
N
V
 
I
G
 
P
K
 
R
A
 
A
A
 
V
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
F
-
 
W
L
 
R
V
 
I
T
 
L
L
 
L
L
 
F
V
 
Y
M
 
V
G
 
F
A
 
A
I
 
I
F
 
L
V
 
I
V
 
I
Q
 
S
T
 
L
W
 
I
I
 
I
A
 
P
T
 
Y
D
 
T
L
 
D
A
 
P
A
 
S
G
 
L
M
 
L
G
 
R
F
 
N
K
x
D
S
 
V
A
 
K
D
|
D
T
 
I
A
 
S
F
 
V
Y
 
S
E
 
P
I
 
F
A
 
T
E
 
L
L
 
V
A
 
F
A
 
Q
G
 
H
S
 
A
W
 
G
L
 
L
A
 
L
T
 
S
L
 
A
T
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
M
T
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
-
W
 
-
G
 
-
V
 
I
A
 
L
V
 
T
A
 
A
I
 
V
T
 
L
S
 
S
Q
 
A
A
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
G
-
 
M
-
 
Y
A
 
A
V
 
S
S
 
T
R
 
R
L
 
M
L
 
L
F
 
Y
G
 
T
M
 
L
A
 
A
R
 
C
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
L
 
A
P
 
P
K
 
R
V
 
I
L
 
F
A
 
A
K
 
K
V
 
L
H
 
S
P
 
-
K
 
R
H
 
G
N
 
G
T
 
V
P
 
P
Y
 
R
M
 
N
S
 
A
I
 
L
Y
 
Y
L
 
A
V
 
T
A
 
T
V
 
V
L
 
I
S
 
A
L
 
G
L
 
L
I
 
-
C
 
C
Y
 
F
L
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
M
F
 
F
I
 
G
N
 
N
A
 
Q
V
 
T
D
 
V
T
 
Y
L
 
L
T
 
W
S
 
-
L
 
L
V
 
L
N
 
N
F
 
T
G
 
S
A
 
G
L
 
M
S
 
T
G
 
G
F
 
F
M
 
I
L
 
A
L
 
W
H
 
L
I
 
G
T
 
I
V
 
A
I
 
I
N
 
S
H
 
H
Y
 
Y
W
 
-
R
 
R
R
 
F
Q
 
R
R
 
R
S
 
G
G
 
Y
Q
 
V
L
 
L
I
 
Q
R
 
G
H
 
H
V
 
D
I
 
I
C
 
N
P
 
D
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9QXW9 Large neutral amino acids transporter small subunit 2; L-type amino acid transporter 2; mLAT2; Solute carrier family 7 member 8 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
22% identity, 78% coverage: 44:395/449 of query aligns to 66:419/531 of Q9QXW9

query
sites
Q9QXW9
E
 
E
A
 
N
P
 
A
G
 
G
M
 
S
V
 
V
P
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
L
I
 
I
I
 
V
G
 
W
M
 
I
V
 
V
A
 
T
M
 
G
L
 
I
F
 
I
T
 
T
A
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
A
L
 
L
S
 
C
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
M
 
L
A
 
G
R
 
V
A
 
T
F
 
I
P
 
P
V
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
G
V
 
D
Y
 
Y
S
 
S
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
K
R
 
D
G
 
I
L
 
F
N
 
G
P
 
G
H
 
L
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
A
 
R
G
 
L
W
 
W
L
 
I
M
 
A
L
 
V
L
 
L
D
 
-
Y
 
-
L
 
V
L
 
I
I
x
Y
P
 
P
P
 
T
-
x
N
-
 
Q
-
 
A
-
 
V
L
 
I
L
 
A
Y
 
L
V
 
T
Y
 
F
A
 
S
A
 
N
M
 
Y
A
 
V
L
 
L
N
 
Q
H
 
P
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
D
 
T
I
 
C
-
 
F
-
 
P
P
 
P
K
 
E
V
 
S
G
 
G
F
 
L
I
 
R
L
 
L
A
 
L
F
 
A
L
 
A
V
 
I
S
 
C
A
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
L
T
 
T
F
 
W
V
 
V
N
 
N
L
 
C
R
 
S
G
 
S
I
 
V
T
 
R
F
 
W
T
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
V
N
 
Q
I
 
D
I
 
I
F
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
G
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
A
I
 
L
F
 
I
L
 
I
F
 
I
Y
 
M
A
 
G
W
 
I
N
 
V
A
 
Q
L
 
I
H
 
C
G
 
K
G
 
G
A
 
E
G
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
F
L
 
F
T
 
W
L
 
L
A
 
E
P
 
P
L
 
K
Y
 
N
S
 
A
P
 
F
E
 
E
H
 
N
F
 
F
-
 
Q
-
 
E
-
 
P
N
 
D
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
V
M
 
A
Q
 
L
A
 
A
V
 
F
S
 
L
I
 
Q
A
 
G
V
 
S
L
x
F
S
 
A
F
 
Y
L
 
G
G
 
G
F
 
W
D
 
N
A
 
F
I
 
L
S
 
N
T
 
Y
L
 
V
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
L
K
 
V
G
 
-
D
 
D
P
 
P
G
 
Y
R
 
K
S
 
N
V
 
L
G
 
P
K
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
I
L
 
P
V
 
L
M
 
V
G
 
T
A
 
F
I
 
V
F
 
Y
V
 
V
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
W
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
-
S
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
F
Y
 
A
E
 
N
I
 
I
A
 
A
E
 
Y
L
 
V
A
 
T
A
 
A
G
 
M
S
 
S
W
 
P
L
 
Q
A
 
E
T
 
L
L
 
L
T
 
A
A
 
S
V
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
T
W
 
F
G
 
G
-
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
M
-
 
A
-
 
W
-
 
I
-
 
M
-
 
P
V
 
I
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
T
 
S
S
 
T
Q
 
F
A
 
G
A
 
G
V
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
F
-
 
T
-
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
F
G
 
A
M
 
G
A
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
A
K
 
M
V
 
I
H
 
H
P
 
V
K
 
K
H
 
R
N
 
C
T
 
T
P
 
P
Y
 
I
M
 
P
S
 
A
I
 
L
Y
 
L
L
 
F
V
 
T
A
 
C
V
 
L
L
 
S
S
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
M
C
 
L
Y
 
-
L
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
V
V
 
T
D
 
S
T
 
D
L
 
M
T
 
Y
S
 
T
L
 
L
V
 
I
N
 
N
F
 
Y
G
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
I
G
 
N
F
 
Y
M
 
L
L
 
F
L
 
Y
H
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
V
I
 
A
N
 
G
H
 
Q
Y
 
I
W
 
V
R
 
L
R
 
R
Q
 
W
R
 
K
S
 
K
G
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
P
R
 
R
H
 
P
V
 
I

P46349 Gamma-aminobutyric acid permease; GABA permease; 4-aminobutyrate permease; Gamma-aminobutyrate permease; Proline transporter GabP from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
23% identity, 73% coverage: 1:330/449 of query aligns to 1:328/469 of P46349

query
sites
P46349
M
 
M
S
 
N
I
 
Q
E
 
S
A
 
Q
F
 
S
G
 
G
Y
 
L
K
 
K
Q
 
K
E
 
E
L
 
L
K
 
K
-
 
T
R
 
R
G
 
H
L
 
M
S
 
T
L
 
M
T
 
I
D
 
S
L
 
I
-
 
A
-
 
G
V
 
V
V
 
I
Y
 
G
G
 
A
M
 
G
I
 
L
F
 
F
M
 
V
I
 
-
P
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
F
 
-
G
|
G
V
 
S
Y
 
G
G
 
S
Y
 
V
V
 
I
N
 
H
A
 
S
E
 
T
A
x
G
P
 
P
G
 
G
M
 
A
V
 
V
P
 
-
L
 
V
A
 
S
Y
 
Y
I
 
A
I
 
L
G
 
A
M
 
G
V
 
L
A
 
L
M
 
V
L
 
I
F
 
F
T
 
I
A
 
M
L
 
R
S
 
M
Y
 
L
G
 
G
S
 
E
M
 
M
A
 
S
R
 
A
A
 
V
F
 
N
P
 
P
V
 
T
A
 
S
G
 
G
S
 
S
V
 
F
Y
 
S
S
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
Q
 
H
R
 
D
G
 
A
L
 
I
N
 
G
P
 
P
H
 
W
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
T
A
 
I
G
 
G
W
 
W
L
 
L
M
 
Y
L
 
W
L
 
F
D
 
F
Y
 
W
L
 
V
L
 
I
I
 
V
P
 
I
P
 
A
L
 
I
L
 
E
Y
 
A
V
 
I
Y
 
A
A
 
G
A
 
A
M
 
G
A
 
I
L
 
I
N
 
Q
H
 
Y
L
 
W
Y
 
F
P
 
H
D
 
D
I
 
I
P
 
P
K
 
L
V
 
W
G
 
L
F
 
T
I
 
S
L
 
L
A
 
I
F
 
L
L
 
T
V
 
I
S
 
V
A
 
L
T
 
T
F
 
L
V
 
T
N
 
N
L
 
V
R
 
Y
G
 
S
I
 
V
T
 
K
F
 
S
T
 
F
A
 
G
R
 
E
M
 
F
N
 
E
I
 
Y
I
 
W
F
 
F
L
 
S
L
 
L
A
 
I
Q
 
K
L
 
V
V
 
V
V
 
T
L
 
I
G
 
I
I
 
A
F
 
F
L
 
L
F
 
I
Y
 
V
A
 
G
W
 
F
N
 
A
A
 
F
L
 
I
H
 
F
G
 
G
G
 
F
A
 
A
-
 
P
-
 
G
-
 
S
-
 
E
-
 
P
-
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
S
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
L
 
G
A
 
K
P
 
G
L
 
G
Y
 
F
S
 
F
P
 
P
E
 
E
H
 
G
F
 
I
N
 
S
F
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
L
M
 
-
Q
 
-
A
 
G
V
 
I
S
 
V
I
 
V
A
 
V
V
 
I
L
 
F
S
 
S
F
 
F
L
 
M
G
 
G
F
 
T
D
 
E
A
 
I
I
 
V
S
 
A
T
 
I
L
 
A
A
 
A
E
 
G
E
 
E
I
 
-
K
 
T
G
 
S
D
 
N
P
 
P
G
 
I
R
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
T
-
 
R
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
W
L
 
R
V
 
I
T
 
I
L
 
V
L
 
F
V
 
Y
M
 
V
G
 
G
A
 
S
I
 
I
F
 
A
V
 
I
V
 
V
Q
 
V
T
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
P
W
 
W
I
 
N
A
 
S
T
 
A
D
 
N
L
 
I
A
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
F
 
L
K
 
E
S
 
S
A
 
P
D
 
F
T
 
V
A
 
A
F
 
V
Y
 
L
E
 
E
I
 
H
A
 
I
E
 
G
L
 
V
A
 
P
A
 
A
G
 
A
S
 
A
W
 
Q
L
 
I
A
 
M
T
 
N
-
 
F
-
 
I
-
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
L
T
 
S
A
 
C
L
 
L
A
 
N
W
 
S
G
|
G
V
 
L
A
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
Y
A
 
T
V
 
T
S
 
S
R
 
R
L
 
M
L
 
L
F
 
Y
G
 
S
M
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
R
G
 
N
Q
 
E
L
 
A
P
 
P
K
 
R
V
 
R
L
 
F
A
 
M
K
 
K
V
 
L
H
 
S
P
 
K
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6s3kB Kima from bacillus subtilis in inward-facing, occluded state (see paper)
26% identity, 57% coverage: 66:323/449 of query aligns to 54:312/573 of 6s3kB

query
sites
6s3kB
S
 
S
Y
 
Y
G
 
R
S
 
Q
M
 
I
A
 
I
R
 
Y
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
V
 
Q
A
 
G
G
 
G
S
 
G
V
 
A
Y
 
Y
S
 
I
Y
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
G
P
 
E
H
 
K
V
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
W
 
G
L
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
V
D
|
D
Y
|
Y
L
 
I
L
 
L
I
x
T
P
 
V
P
 
A
L
 
V
L
x
S
Y
 
I
V
 
S
Y
 
A
A
 
G
A
 
T
M
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
T
H
 
S
L
 
A
Y
 
F
P
 
P
D
 
A
I
 
L
P
 
H
K
 
D
V
 
Y
G
 
H
F
 
V
I
 
P
L
 
I
A
 
A
-
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
S
 
L
A
 
V
T
 
I
F
 
M
V
 
I
-
 
L
N
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
S
F
 
E
T
 
S
A
 
A
R
 
S
M
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
P
N
 
V
I
 
Y
I
 
L
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
L
L
 
I
G
 
A
I
 
V
F
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
K
A
 
L
W
 
M
N
 
T
A
 
G
L
 
Q
H
 
I
G
 
D
G
 
Q
A
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
H
Q
 
T
L
 
S
T
 
L
L
 
G
A
 
T
P
 
P
L
 
V
Y
 
A
S
 
G
P
 
I
E
 
T
H
 
L
F
 
F
N
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
M
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
F
S
 
S
I
 
S
A
 
G
V
 
C
L
 
S
S
 
A
F
 
L
L
x
T
G
 
G
F
 
V
D
x
E
A
|
A
I
 
I
S
 
S
T
 
N
L
 
A
A
 
I
E
 
P
E
 
A
I
 
F
K
 
K
G
 
N
D
 
P
P
 
P
G
 
A
R
 
R
S
 
N
V
 
A
G
 
A
K
 
R
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
T
L
 
L
L
 
A
V
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
I
I
 
L
F
 
L
V
 
A
V
 
I
Q
 
L
T
 
F
W
 
S
I
 
G
A
 
I
T
 
T
D
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
M
 
Y
G
 
G
F
 
T
-
 
A
-
 
P
K
 
K
S
 
P
A
 
D
D
 
E
T
 
T
A
 
V
F
 
V
Y
 
S
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
S
L
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
G
S
 
R
W
 
N
L
 
V
A
 
F
T
 
Y
L
 
Y
T
 
V
A
 
I
V
 
Q
A
 
G
T
 
V
A
 
T
L
 
S
A
 
L
W
 
I
G
 
L
V
 
V
A
 
L
V
x
A
A
 
A
I
 
N
T
 
T
S
 
G
Q
 
F
A
 
S
A
 
A
V
 
F
S
 
P
R
 
Q
L
 
L
L
 
A
F
 
F
G
 
N
M
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Y
L
 
M
P
 
P
K
 
R
V
 
M

Sites not aligning to the query:

P96589 Potassium transporter KimA; K(+) importer A; Potassium-proton symporter KimA from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
26% identity, 57% coverage: 66:323/449 of query aligns to 80:338/607 of P96589

query
sites
P96589
S
 
S
Y
 
Y
G
 
R
S
 
Q
M
 
I
A
 
I
R
 
Y
A
 
A
F
 
Y
P
 
P
V
 
Q
A
 
G
G
 
G
S
 
G
V
 
A
Y
 
Y
S
 
I
Y
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
E
G
 
N
L
 
L
N
 
G
P
 
E
H
 
K
V
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
W
 
G
L
 
S
M
 
L
L
 
L
L
 
V
D
|
D
Y
 
Y
L
 
I
L
 
L
I
x
T
P
 
V
P
 
A
L
 
V
L
x
S
Y
 
I
V
 
S
Y
 
A
A
 
G
A
 
T
M
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
T
H
 
S
L
 
A
Y
 
F
P
 
P
D
 
A
I
 
L
P
 
H
K
 
D
V
 
Y
G
 
H
F
 
V
I
 
P
L
 
I
A
 
A
-
 
I
F
 
F
L
 
L
V
 
V
S
 
L
A
 
V
T
 
I
F
 
M
V
 
I
-
 
L
N
 
N
L
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
S
F
 
E
T
 
S
A
 
A
R
 
S
M
 
I
-
 
L
-
 
A
-
 
Y
-
 
P
N
 
V
I
 
Y
I
 
L
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
L
L
 
I
G
 
A
I
 
V
F
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
K
A
 
L
W
 
M
N
 
T
A
 
G
L
 
Q
H
 
I
G
 
D
G
 
Q
A
 
P
G
 
A
H
 
H
G
 
H
Q
 
T
L
 
S
T
 
L
L
 
G
A
 
T
P
 
P
L
 
V
Y
 
A
S
 
G
P
 
I
E
 
T
H
 
L
F
 
F
N
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
M
 
L
Q
 
K
A
 
A
V
 
F
S
 
S
I
 
S
A
 
G
V
 
C
L
 
S
S
 
A
F
 
L
L
 
T
G
 
G
F
 
V
D
x
E
A
 
A
I
 
I
S
 
S
T
 
N
L
 
A
A
 
I
E
 
P
E
 
A
I
 
F
K
 
K
G
 
N
D
 
P
P
 
P
G
 
A
R
 
R
S
 
N
V
 
A
G
 
A
K
 
R
A
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
T
 
T
L
 
L
L
 
A
V
 
M
M
 
M
G
 
G
A
 
I
I
 
L
F
 
L
V
 
A
V
 
I
Q
 
L
T
 
F
W
 
S
I
 
G
A
 
I
T
 
T
D
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
G
 
G
M
 
Y
G
 
G
F
 
T
-
 
A
-
 
P
K
 
K
S
 
P
A
 
D
D
 
E
T
 
T
A
 
V
F
 
V
Y
 
S
E
 
Q
I
 
I
A
 
A
E
 
S
L
 
E
A
 
T
A
 
F
G
 
G
S
 
R
W
 
N
L
 
V
A
 
F
T
 
Y
L
 
Y
T
 
V
A
 
I
V
 
Q
A
 
G
T
 
V
A
 
T
L
 
S
A
 
L
W
 
I
G
 
L
V
 
V
A
 
L
V
 
A
A
 
A
I
 
N
T
 
T
S
 
G
Q
 
F
A
 
S
A
 
A
V
 
F
S
 
P
R
 
Q
L
 
L
L
 
A
F
 
F
G
 
N
M
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Y
L
 
M
P
 
P
K
 
R
V
 
M

Sites not aligning to the query:

Q01650 Large neutral amino acids transporter small subunit 1; 4F2 light chain; 4F2 LC; 4F2LC; CD98 light chain; Integral membrane protein E16; E16; L-type amino acid transporter 1; hLAT1; Solute carrier family 7 member 5; y+ system cationic amino acid transporter from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
30% identity, 20% coverage: 308:395/449 of query aligns to 347:429/507 of Q01650

query
sites
Q01650
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
F
G
 
V
M
 
G
A
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
S
K
 
M
V
 
I
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
H
 
L
N
 
L
T
 
T
P
 
P
Y
 
V
M
x
P
S
 
S
I
 
L
Y
 
V
L
 
F
V
 
T
A
 
C
V
 
V
L
 
M
S
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
Y
C
 
A
Y
 
F
L
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
S
D
 
K
T
 
D
L
 
I
T
 
F
S
 
S
L
 
V
V
 
I
N
 
N
F
 
F
G
 
F
A
 
S
L
 
F
S
 
F
G
 
N
F
 
W
M
 
L
L
 
C
L
 
V
H
 
A
I
 
L
T
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
M
Y
 
I
W
 
W
R
 
L
R
 
R
Q
 
H
R
 
R
S
 
K
G
 
P
Q
 
E
L
 
L
I
 
E
R
 
R
H
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

6irtB Human lat1-4f2hc complex bound with bch (see paper)
30% identity, 20% coverage: 308:395/449 of query aligns to 297:379/457 of 6irtB

query
sites
6irtB
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
F
G
 
V
M
 
G
A
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
S
K
 
M
V
 
I
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
H
 
L
N
 
L
T
 
T
P
 
P
Y
 
V
M
 
P
S
 
S
I
 
L
Y
 
V
L
 
F
V
 
T
A
 
C
V
 
V
L
 
M
S
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
Y
C
 
A
Y
 
F
L
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
S
D
 
K
T
 
D
L
 
I
T
 
F
S
 
S
L
 
V
V
 
I
N
 
N
F
 
F
G
 
F
A
 
S
L
 
F
S
 
F
G
 
N
F
 
W
M
 
L
L
 
C
L
 
V
H
 
A
I
 
L
T
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
M
Y
 
I
W
 
W
R
 
L
R
 
R
Q
 
H
R
 
R
S
 
K
G
 
P
Q
 
E
L
 
L
I
 
E
R
 
R
H
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7dsqB Overall structure of the lat1-4f2hc bound with 3,5-diiodo-l-tyrosine (see paper)
30% identity, 20% coverage: 308:395/449 of query aligns to 304:386/464 of 7dsqB

query
sites
7dsqB
S
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
F
F
 
F
G
 
V
M
 
G
A
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
Q
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
S
K
 
M
V
 
I
H
 
H
P
 
P
K
 
Q
H
 
L
N
 
L
T
 
T
P
 
P
Y
 
V
M
 
P
S
 
S
I
 
L
Y
 
V
L
 
F
V
 
T
A
 
C
V
 
V
L
 
M
S
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
Y
C
 
A
Y
 
F
L
 
-
F
 
-
I
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
S
D
 
K
T
 
D
L
 
I
T
 
F
S
 
S
L
 
V
V
 
I
N
 
N
F
 
F
G
x
F
A
 
S
L
 
F
S
 
F
G
x
N
F
 
W
M
 
L
L
 
C
L
 
V
H
 
A
I
 
L
T
 
A
V
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
M
Y
 
I
W
 
W
R
 
L
R
 
R
Q
 
H
R
 
R
S
 
K
G
 
P
Q
 
E
L
 
L
I
 
E
R
 
R
H
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AO356_01520 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_01520
MSIEAFGYKQELKRGLSLTDLVVYGMIFMIPIAPFGVYGYVNAEAPGMVPLAYIIGMVAM
LFTALSYGSMARAFPVAGSVYSYAQRGLNPHVGFIAGWLMLLDYLLIPPLLYVYAAMALN
HLYPDIPKVGFILAFLVSATFVNLRGITFTARMNIIFLLAQLVVLGIFLFYAWNALHGGA
GHGQLTLAPLYSPEHFNFALLMQAVSIAVLSFLGFDAISTLAEEIKGDPGRSVGKAALVT
LLVMGAIFVVQTWIATDLAAGMGFKSADTAFYEIAELAAGSWLATLTAVATALAWGVAVA
ITSQAAVSRLLFGMARDGQLPKVLAKVHPKHNTPYMSIYLVAVLSLLICYLFINAVDTLT
SLVNFGALSGFMLLHITVINHYWRRQRSGQLIRHVICPLVGFVIVAAIMYNMGVAAQKLG
LIWIAAGVVYLCLLNKFGSRTALPDPAGQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory