SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_10230 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_10230 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4d9fA D-cysteine desulfhydrase from salmonella typhimurium complexed with d- cycloserine (dcs) (see paper)
62% identity, 99% coverage: 1:327/330 of query aligns to 1:325/328 of 4d9fA

query
sites
4d9fA
M
 
M
I
 
P
K
 
L
E
 
H
Q
 
H
L
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
I
S
 
G
H
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
L
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
|
N
H
 
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
H
C
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
E
 
T
D
 
A
S
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
M
V
 
C
E
 
D
N
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
E
S
 
A
N
 
Q
G
 
G
K
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
K
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
-
I
 
V
E
 
G
F
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
|
S
A
|
A
G
 
G
T
|
T
H
 
H
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
E
E
 
H
S
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
E
 
V
E
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
K
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
H
L
 
L
W
 
W
D
 
D
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
G
Y
|
Y
G
 
G
E
 
V
P
 
P
N
 
N
A
 
D
G
 
A
T
 
G
L
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
D
 
K
R
 
R
F
 
F
-
 
N
D
 
D
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
N
 
H

4d9eA D-cysteine desulfhydrase from salmonella typhimurium complexed with l- cycloserine (lcs) (see paper)
62% identity, 99% coverage: 1:327/330 of query aligns to 1:325/328 of 4d9eA

query
sites
4d9eA
M
 
M
I
 
P
K
 
L
E
 
H
Q
 
H
L
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
I
S
 
G
H
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
|
N
H
 
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
H
C
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
E
 
T
D
 
A
S
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
M
V
 
C
E
 
D
N
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
E
S
 
A
N
 
Q
G
 
G
K
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
K
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
-
I
 
V
E
 
G
F
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
|
S
A
|
A
G
 
G
T
|
T
H
 
H
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
E
E
 
H
S
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
E
 
V
E
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
K
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
H
L
 
L
W
 
W
D
 
D
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
G
Y
|
Y
G
 
G
E
 
V
P
 
P
N
 
N
A
 
D
G
 
A
T
 
G
L
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
D
 
K
R
 
R
F
 
F
-
 
N
D
 
D
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
N
 
H

4d9bA Pyridoxamine 5' phosphate (pmp) bound form of salmonella typhimurium d-cysteine desulfhydrase obtained after co-crystallization with d- cycloserine (see paper)
62% identity, 99% coverage: 1:327/330 of query aligns to 1:325/328 of 4d9bA

query
sites
4d9bA
M
 
M
I
 
P
K
 
L
E
 
H
Q
 
H
L
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
I
S
 
G
H
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
|
N
H
 
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
H
C
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
E
 
T
D
 
A
S
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
M
V
 
C
E
 
D
N
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
E
S
 
A
N
 
Q
G
 
G
K
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
K
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
-
I
 
V
E
 
G
F
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
|
S
A
|
A
G
 
G
T
|
T
H
 
H
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
E
E
 
H
S
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
E
 
V
E
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
K
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
H
L
 
L
W
 
W
D
 
D
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
G
Y
|
Y
G
 
G
E
 
V
P
 
P
N
 
N
A
 
D
G
 
A
T
 
G
L
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
D
 
K
R
 
R
F
 
F
-
 
N
D
 
D
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
N
 
H

4d99A Salmonella typhimurium d-cysteine desulfhydrase with l-ser bound non- covalently at the active site (see paper)
62% identity, 99% coverage: 1:327/330 of query aligns to 1:325/328 of 4d99A

query
sites
4d99A
M
 
M
I
 
P
K
 
L
E
 
H
Q
 
H
L
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
I
S
 
G
H
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
|
K
L
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
G
A
|
A
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
 
N
H
|
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
H
C
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
E
 
T
D
 
A
S
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
M
V
 
C
E
 
D
N
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
E
S
 
A
N
 
Q
G
 
G
K
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
K
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
-
I
 
V
E
 
G
F
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
H
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
E
E
 
H
S
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
E
 
V
E
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
K
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
H
L
 
L
W
 
W
D
 
D
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
G
Y
|
Y
G
 
G
E
 
V
P
 
P
N
 
N
A
 
D
G
 
A
T
 
G
L
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
D
 
K
R
 
R
F
 
F
-
 
N
D
 
D
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
N
 
H

4d97A Salmonella typhimurium d-cysteine desulfhydrase with d-ser bound at active site (see paper)
62% identity, 99% coverage: 1:327/330 of query aligns to 1:325/328 of 4d97A

query
sites
4d97A
M
 
M
I
 
P
K
 
L
E
 
H
Q
 
H
L
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
I
S
 
G
H
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
|
K
L
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
|
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
H
C
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
E
 
T
D
 
A
S
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
M
V
 
C
E
 
D
N
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
E
S
 
A
N
 
Q
G
 
G
K
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
G
|
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
K
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
-
I
 
V
E
 
G
F
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
H
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
E
E
 
H
S
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
E
 
V
E
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
K
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
H
L
 
L
W
 
W
D
 
D
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
G
Y
|
Y
G
 
G
E
 
V
P
 
P
N
 
N
A
 
D
G
 
A
T
 
G
L
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
D
 
K
R
 
R
F
 
F
-
 
N
D
 
D
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
N
 
H

4d96A D-cysteine desulfhydrase from salmonella typhimurium complexed with 1- amino-1-carboxycyclopropane (acc) (see paper)
62% identity, 99% coverage: 1:327/330 of query aligns to 1:325/328 of 4d96A

query
sites
4d96A
M
 
M
I
 
P
K
 
L
E
 
H
Q
 
H
L
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
I
S
 
G
H
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
|
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
H
C
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
E
 
T
D
 
A
S
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
M
V
 
C
E
 
D
N
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
E
S
 
A
N
 
Q
G
 
G
K
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
K
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
-
I
 
V
E
 
G
F
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
|
G
S
|
S
A
|
A
G
 
G
T
|
T
H
 
H
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
E
E
 
H
S
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
E
 
V
E
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
K
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
H
L
 
L
W
 
W
D
 
D
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
G
Y
|
Y
G
 
G
E
 
V
P
 
P
N
 
N
A
 
D
G
 
A
T
 
G
L
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
D
 
K
R
 
R
F
 
F
-
 
N
D
 
D
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
N
 
H

4d8wA Salmonella typhimurium d-cysteine desulfhydrase soaked with d-cys shows pyruvate bound 4 a away from active site (see paper)
62% identity, 99% coverage: 1:327/330 of query aligns to 1:325/328 of 4d8wA

query
sites
4d8wA
M
 
M
I
 
P
K
 
L
E
 
H
Q
 
H
L
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
I
S
 
G
H
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
|
K
L
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
H
C
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
E
 
T
D
 
A
S
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
M
V
 
C
E
 
D
N
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
E
S
 
A
N
 
Q
G
 
G
K
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
K
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
-
I
 
V
E
 
G
F
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
|
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
H
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
E
E
 
H
S
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
R
|
R
S
 
S
E
 
V
E
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
K
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
H
L
 
L
W
 
W
D
 
D
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
G
Y
|
Y
G
 
G
E
 
V
P
 
P
N
 
N
A
 
D
G
 
A
T
 
G
L
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
D
 
K
R
 
R
F
 
F
-
 
N
D
 
D
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
N
 
H

4d8uH Crystal structure of d-cysteine desulfhydrase from salmonella typhimurium at 3.3 a in monoclinic space group with 8 subunits in the asymmetric unit (see paper)
62% identity, 99% coverage: 1:327/330 of query aligns to 4:328/331 of 4d8uH

query
sites
4d8uH
M
 
M
I
 
P
K
 
L
E
 
H
Q
 
H
L
 
L
S
 
T
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
F
L
 
I
S
 
G
H
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
L
E
 
E
K
 
Y
L
 
L
D
 
P
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
R
 
R
D
 
E
I
 
I
Y
 
Y
I
 
I
K
 
K
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
T
P
 
P
L
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
|
K
L
 
L
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
 
N
H
|
H
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
H
C
 
C
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
N
P
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
E
 
T
D
 
A
S
 
E
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
G
 
T
N
 
N
G
 
G
N
 
N
R
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
F
 
F
D
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
I
E
 
E
L
 
M
V
 
C
E
 
D
N
 
A
L
 
L
D
 
T
N
 
D
A
 
P
D
 
D
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
A
 
A
G
 
T
R
 
R
L
 
I
R
 
E
S
 
A
N
 
Q
G
 
G
K
 
F
K
 
R
P
 
P
Y
 
Y
L
 
V
V
 
I
P
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
G
S
 
S
N
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
C
K
 
E
D
 
E
T
 
V
G
 
-
I
 
V
E
 
G
F
 
L
A
 
S
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
H
S
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
G
L
 
L
S
 
E
E
 
H
S
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
D
L
 
V
P
 
E
V
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
S
 
S
E
 
V
E
 
A
D
 
E
Q
 
Q
F
 
K
P
 
P
K
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
R
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
-
L
 
-
E
 
Q
V
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
T
E
 
A
A
 
T
F
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
H
L
 
L
W
 
W
D
 
D
E
 
D
Y
 
Y
F
 
F
A
 
A
P
 
P
R
 
G
Y
|
Y
G
 
G
E
 
V
P
 
P
N
 
N
A
 
D
G
 
A
T
 
G
L
 
M
A
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
G
 
G
I
 
I
G
 
S
R
 
Q
D
 
K
R
 
R
F
 
F
-
 
N
D
 
D
E
 
D
G
 
G
P
 
P
I
 
I
I
 
L
F
 
F
L
 
I
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
N
 
H

1tzmA Crystal structure of acc deaminase complexed with substrate analog b- chloro-d-alanine (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:330/330 of query aligns to 3:328/331 of 1tzmA

query
sites
1tzmA
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
Y
D
 
P
L
 
L
L
 
T
S
 
F
H
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
K
 
P
L
 
L
D
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
K
W
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
G
D
 
K
I
 
V
-
 
H
-
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
C
T
 
N
P
 
S
-
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
A
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
A
 
I
G
|
G
A
 
G
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
x
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
V
A
 
L
L
 
V
L
 
Q
E
 
E
N
 
N
P
x
W
I
 
V
G
 
N
T
 
Y
E
 
S
D
 
D
S
 
A
N
 
V
Y
 
Y
L
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
I
L
 
Q
L
 
M
L
 
S
E
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
E
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
P
D
 
D
E
 
R
Q
 
S
L
 
W
Q
 
E
A
 
D
L
 
A
A
 
L
G
 
E
R
 
S
L
 
V
R
 
R
S
 
A
N
 
A
G
 
G
K
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
L
 
A
V
 
I
P
 
P
I
x
A
G
|
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
A
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
R
 
G
A
 
F
G
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
R
E
 
A
Q
 
Q
I
 
E
K
 
A
D
 
E
T
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
A
 
D
A
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
x
C
S
|
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
G
P
 
R
A
 
A
L
 
D
P
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
D
V
 
A
S
 
S
R
 
A
S
 
K
E
 
P
E
 
A
D
 
Q
Q
 
T
F
 
R
P
 
E
K
 
Q
V
 
I
Q
 
T
G
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
E
L
 
K
L
 
V
E
 
G
V
 
L
A
 
E
L
 
R
P
 
D
E
 
I
A
 
M
F
 
R
K
 
A
V
 
D
I
 
V
L
 
V
W
 
L
D
 
D
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
A
 
A
-
 
G
P
 
P
R
 
E
Y
|
Y
G
 
G
E
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
R
L
 
L
L
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
H
G
 
G
L
 
M
L
 
I
D
 
E
G
 
M
I
 
V
G
 
R
R
 
N
D
 
G
R
 
E
F
 
F
D
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
S
-
 
R
I
 
V
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
N
A
 
G
Y
 
Y
N
 
S
T
 
F
V
 
I
F
 
F

1tzkA Crystal structure of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate-deaminase complexed with alpha-keto-butyrate (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:330/330 of query aligns to 3:328/331 of 1tzkA

query
sites
1tzkA
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
Y
D
 
P
L
 
L
L
 
T
S
 
F
H
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
K
 
P
L
 
L
D
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
K
W
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
G
D
 
K
I
 
V
-
 
H
-
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
C
T
 
N
P
 
S
-
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
A
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
A
 
I
G
|
G
A
 
G
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
x
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
V
A
 
L
L
 
V
L
 
Q
E
 
E
N
 
N
P
 
W
I
 
V
G
 
N
T
 
Y
E
 
S
D
 
D
S
 
A
N
 
V
Y
 
Y
L
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
I
L
 
Q
L
 
M
L
 
S
E
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
E
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
P
D
 
D
E
 
R
Q
 
S
L
 
W
Q
 
E
A
 
D
L
 
A
A
 
L
G
 
E
R
 
S
L
 
V
R
 
R
S
 
A
N
 
A
G
 
G
K
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
L
 
A
V
 
I
P
 
P
I
x
A
G
|
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
A
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
R
 
G
A
 
F
G
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
R
E
 
A
Q
 
Q
I
 
E
K
 
A
D
 
E
T
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
A
 
D
A
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
x
C
S
|
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
G
P
 
R
A
 
A
L
 
D
P
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
D
V
 
A
S
 
S
R
 
A
S
 
K
E
 
P
E
 
A
D
 
Q
Q
 
T
F
 
R
P
 
E
K
 
Q
V
 
I
Q
 
T
G
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
E
L
 
K
L
 
V
E
 
G
V
 
L
A
 
E
L
 
R
P
 
D
E
 
I
A
 
M
F
 
R
K
 
A
V
 
D
I
 
V
L
 
V
W
 
L
D
 
D
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
A
 
A
-
 
G
P
 
P
R
 
E
Y
|
Y
G
 
G
E
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
R
L
 
L
L
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
H
G
 
G
L
 
M
L
 
I
D
 
E
G
 
M
I
 
V
G
 
R
R
 
N
D
 
G
R
 
E
F
 
F
D
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
S
-
 
R
I
 
V
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
N
A
 
G
Y
 
Y
N
 
S
T
 
F
V
 
I
F
 
F

1tzjA Crystal structure of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase complexed with d-vinyl glycine (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:330/330 of query aligns to 3:328/331 of 1tzjA

query
sites
1tzjA
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
Y
D
 
P
L
 
L
L
 
T
S
 
F
H
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
K
 
P
L
 
L
D
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
K
W
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
G
D
 
K
I
 
V
-
 
H
-
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
C
T
 
N
P
 
S
-
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
A
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
A
 
I
G
|
G
A
 
G
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
x
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
V
A
 
L
L
 
V
L
 
Q
E
 
E
N
 
N
P
 
W
I
 
V
G
 
N
T
 
Y
E
 
S
D
 
D
S
 
A
N
 
V
Y
 
Y
L
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
I
L
 
Q
L
 
M
L
 
S
E
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
E
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
P
D
 
D
E
 
R
Q
 
S
L
 
W
Q
 
E
A
 
D
L
 
A
A
 
L
G
 
E
R
 
S
L
 
V
R
 
R
S
 
A
N
 
A
G
 
G
K
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
L
 
A
V
 
I
P
 
P
I
x
A
G
|
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
A
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
R
 
G
A
 
F
G
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
R
E
 
A
Q
 
Q
I
 
E
K
 
A
D
 
E
T
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
A
 
D
A
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
x
C
S
|
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
G
P
 
R
A
 
A
L
 
D
P
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
D
V
 
A
S
 
S
R
 
A
S
 
K
E
 
P
E
 
A
D
 
Q
Q
 
T
F
 
R
P
 
E
K
 
Q
V
 
I
Q
 
T
G
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
E
L
 
K
L
 
V
E
 
G
V
 
L
A
 
E
L
 
R
P
 
D
E
 
I
A
 
M
F
 
R
K
 
A
V
 
D
I
 
V
L
 
V
W
 
L
D
 
D
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
A
 
A
-
 
G
P
 
P
R
 
E
Y
|
Y
G
 
G
E
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
R
L
 
L
L
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
H
G
 
G
L
 
M
L
 
I
D
 
E
G
 
M
I
 
V
G
 
R
R
 
N
D
 
G
R
 
E
F
 
F
D
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
S
-
 
R
I
 
V
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
N
A
 
G
Y
 
Y
N
 
S
T
 
F
V
 
I
F
 
F

1tz2A Crystal structure of 1-aminocyclopropane-1-carboyxlate deaminase complexed with acc (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:330/330 of query aligns to 3:328/331 of 1tz2A

query
sites
1tz2A
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
Y
D
 
P
L
 
L
L
 
T
S
 
F
H
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
K
 
P
L
 
L
D
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
K
W
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
G
D
 
K
I
 
V
-
 
H
-
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
C
T
 
N
P
 
S
-
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
A
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
A
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
 
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
V
A
 
L
L
 
V
L
 
Q
E
 
E
N
 
N
P
 
W
I
 
V
G
 
N
T
 
Y
E
 
S
D
 
D
S
 
A
N
 
V
Y
 
Y
L
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
I
L
 
Q
L
 
M
L
 
S
E
 
R
L
 
I
F
 
L
D
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
E
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
-
N
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
-
A
 
P
D
 
D
E
 
R
Q
 
S
L
 
W
Q
 
E
A
 
D
L
 
A
A
 
L
G
 
E
R
 
S
L
 
V
R
 
R
S
 
A
N
 
A
G
 
G
K
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
Y
L
 
A
V
 
I
P
 
P
I
 
A
G
 
G
G
 
C
S
 
S
N
 
D
-
 
H
A
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
R
 
G
A
 
F
G
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
R
E
 
A
Q
 
Q
I
 
E
K
 
A
D
 
E
T
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
A
 
D
A
 
Y
V
 
V
V
 
V
L
 
V
A
x
C
S
|
S
G
x
V
S
x
T
A
x
G
G
 
S
T
|
T
H
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
G
P
 
R
A
 
A
L
 
D
P
 
R
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
D
V
 
A
S
 
S
R
 
A
S
 
K
E
 
P
E
 
A
D
 
Q
Q
 
T
F
 
R
P
 
E
K
 
Q
V
 
I
Q
 
T
G
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
E
L
 
K
L
 
V
E
 
G
V
 
L
A
 
E
L
 
R
P
 
D
E
 
I
A
 
M
F
 
R
K
 
A
V
 
D
I
 
V
L
 
V
W
 
L
D
 
D
E
 
E
Y
 
R
F
 
F
A
 
A
-
 
G
P
 
P
R
 
E
Y
|
Y
G
 
G
E
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
R
L
 
L
L
 
C
A
 
A
S
 
R
L
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
T
x
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
H
G
 
G
L
 
M
L
 
I
D
 
E
G
 
M
I
 
V
G
 
R
R
 
N
D
 
G
R
 
E
F
 
F
D
 
P
E
 
E
G
 
G
P
 
S
-
 
R
I
 
V
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
x
L
G
|
G
G
|
G
A
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
N
A
 
G
Y
 
Y
N
 
S
T
 
F
V
 
I
F
 
F

Q5PWZ8 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase; ACC deaminase; ACCD; EC 3.5.99.7 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
39% identity, 99% coverage: 5:330/330 of query aligns to 2:335/338 of Q5PWZ8

query
sites
Q5PWZ8
Q
 
N
L
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
E
R
 
R
L
 
Y
D
 
P
L
 
L
L
 
T
S
 
F
H
 
G
P
 
P
T
 
S
P
 
P
L
 
I
E
 
T
K
 
P
L
 
L
D
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
E
W
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
G
-
 
K
-
 
V
D
 
E
I
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
C
T
 
N
P
 
S
-
x
G
L
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
N
K
 
K
L
 
T
R
 
R
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
A
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
A
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
V
A
 
L
L
 
V
L
 
Q
E
 
E
N
 
N
P
 
W
I
 
V
G
 
N
T
 
Y
E
 
S
D
 
D
S
 
A
N
 
V
Y
 
Y
L
 
D
G
 
R
N
 
V
G
 
G
N
 
N
R
 
I
L
 
E
L
 
M
L
 
S
E
 
R
L
 
I
F
 
M
D
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
E
 
R
L
 
L
-
 
D
V
 
A
E
 
A
N
 
G
L
 
F
D
 
D
-
 
I
N
 
G
A
 
I
D
 
R
E
 
P
Q
 
S
L
 
W
Q
 
E
A
 
K
L
 
A
A
 
M
G
 
S
R
 
D
L
 
V
R
 
V
S
 
E
N
 
R
G
 
G
K
 
G
K
 
K
P
 
P
Y
 
F
L
 
P
V
 
I
P
 
P
I
 
A
G
 
G
G
 
C
S
 
S
-
 
E
N
 
H
A
 
P
L
 
Y
G
 
G
A
 
G
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
R
 
G
A
 
F
G
 
A
L
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
R
E
 
Q
Q
 
Q
I
 
E
K
 
K
D
 
E
T
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
K
F
 
F
A
 
D
A
 
Y
V
 
I
V
 
V
L
 
V
A
 
C
S
 
S
G
 
V
S
 
T
A
 
G
G
 
S
T
 
T
H
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
M
A
 
V
L
 
V
A
 
G
L
 
F
S
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
G
P
 
R
A
 
S
L
 
K
P
 
N
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
T
 
D
V
 
A
S
 
S
R
 
A
S
 
K
E
 
P
E
 
E
D
 
Q
Q
 
T
F
 
K
P
 
A
K
 
Q
V
 
I
Q
 
L
G
 
R
L
 
I
A
 
A
E
 
R
R
 
H
T
 
T
A
 
A
A
 
E
L
 
L
L
 
V
E
 
E
V
 
L
A
 
G
L
 
R
P
 
E
E
 
I
A
 
T
F
 
E
K
 
E
V
 
D
I
 
V
L
 
V
W
 
L
D
 
D
E
 
T
Y
 
R
F
 
F
A
 
A
-
 
Y
P
 
P
R
 
E
Y
 
Y
G
 
G
E
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
A
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
R
L
 
L
L
 
C
A
 
G
S
 
S
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
V
L
 
L
L
 
T
D
 
D
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
T
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
H
G
 
G
L
 
M
L
 
I
D
 
E
G
 
M
I
 
V
G
 
R
R
 
R
D
 
G
R
 
E
F
 
F
D
 
P
E
 
D
G
 
G
P
 
S
-
 
K
I
 
V
I
 
L
F
 
Y
L
 
A
H
 
H
T
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
F
 
N
A
 
A
Y
 
Y
N
 
S
T
 
F
V
 
L
F
 
F

1rqxC Crystal structure of acc deaminase complexed with inhibitor (see paper)
39% identity, 98% coverage: 6:330/330 of query aligns to 3:335/338 of 1rqxC

query
sites
1rqxC
L
 
L
S
 
Q
R
 
R
F
 
F
N
 
P
R
 
R
L
 
Y
D
 
P
L
 
L
L
 
T
S
 
F
H
 
G
P
 
P
T
 
T
P
 
P
L
 
I
E
 
Q
K
 
P
L
 
L
D
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
N
 
K
W
 
H
L
 
L
G
 
G
R
 
G
D
 
K
I
 
V
-
 
H
-
 
L
Y
 
Y
I
 
A
K
 
K
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
C
T
 
N
P
 
S
-
 
G
L
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
N
|
N
K
|
K
L
 
T
R
 
R
K
|
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
A
 
I
A
 
P
D
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
T
 
T
L
 
L
I
 
V
T
 
S
A
 
I
G
 
G
A
 
G
I
 
I
Q
 
Q
S
|
S
N
|
N
H
x
Q
V
 
T
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
K
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
K
C
 
C
V
 
V
A
 
L
L
 
V
L
 
Q
E
 
E
N
 
N
P
 
W
I
 
V