SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_14875 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_14875 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6wjaA Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-galnac (see paper)
67% identity, 97% coverage: 6:306/309 of query aligns to 3:303/307 of 6wjaA

query
sites
6wjaA
V
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
L
D
|
D
D
|
D
L
 
L
S
|
S
T
|
T
G
|
G
K
 
K
R
 
V
S
 
G
N
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
M
D
 
G
N
 
D
P
 
A
A
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
V
G
 
G
D
 
D
V
x
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
A
M
 
V
A
 
Q
G
 
G
C
 
C
S
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
|
V
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
V
 
V
D
 
E
D
 
D
P
 
P
V
 
V
R
 
A
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
|
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
G
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
R
V
 
L
C
 
C
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
K
 
R
R
 
R
V
 
V
L
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
x
A
A
|
A
A
|
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
N
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
T
S
 
P
I
 
I
D
 
A
E
 
E
E
 
D
T
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
Y
x
F
A
 
A
S
 
A
D
 
D
K
|
K
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
Y
 
Y
F
 
L
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
A
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
I
F
 
L
R
 
R
F
|
F
F
|
F
N
|
N
I
|
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
G
|
G
V
|
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
F
|
F
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
G
 
G
L
 
R
P
 
P
I
 
I
T
|
T
V
 
L
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
G
Q
 
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
E
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
G
I
 
L
E
 
E
K
 
S
P
 
P
E
 
A
V
 
P
E
 
A
V
 
A
G
 
D
A
 
A
V
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
W
 
L
N
 
G
Q
 
G
A
 
V
T
 
T
T
 
T
L
|
L
K
 
N
Q
 
D
M
 
L
L
 
I
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
A
 
Q
V
 
I
V
 
S
G
 
G
D
 
K
L
 
P
P
 
L
P
 
Q
I
 
V
S
 
S
Y
 
H
G
 
G
P
 
A
A
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
|
D
I
 
I
R
 
R
H
 
H
S
 
S
R
 
K
A
 
A
D
 
D
N
 
N
H
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
D
F
 
L
P
 
G
P
 
T
Q
 
P
T
 
S
P
 
S
M
 
L
S
 
A
V
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
E
R
 
R
L
 
L

6wj9B Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-glcnac (see paper)
67% identity, 97% coverage: 6:306/309 of query aligns to 4:304/308 of 6wj9B

query
sites
6wj9B
V
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
G
 
G
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
L
D
|
D
D
|
D
L
 
L
S
|
S
T
|
T
G
|
G
K
 
K
R
 
V
S
 
G
N
 
N
L
 
L
P
 
P
L
 
M
D
 
G
N
 
D
P
 
A
A
 
G
V
 
L
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
V
G
 
G
D
|
D
V
x
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
A
M
 
V
A
 
Q
G
 
G
C
 
C
S
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
V
A
 
A
S
 
S
V
|
V
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
V
 
V
D
 
E
D
 
D
P
 
P
V
 
V
R
 
A
T
 
T
H
 
H
Q
 
Q
S
|
S
N
 
N
F
 
F
I
 
I
G
 
A
T
 
T
L
 
L
N
 
R
V
 
L
C
 
C
E
 
E
A
 
A
M
 
M
R
 
T
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
K
 
R
R
 
R
V
 
V
L
 
V
F
 
F
A
|
A
S
 
S
S
x
A
A
|
A
A
|
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
N
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
G
E
 
T
S
 
P
I
 
I
D
 
A
E
 
E
E
 
D
T
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
S
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
Y
x
F
A
 
A
S
 
A
D
 
D
K
|
K
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
F
 
Y
Y
 
Y
F
 
L
D
 
D
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
A
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
P
V
 
V
V
 
I
F
 
L
R
 
R
F
|
F
F
|
F
N
|
N
I
|
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
G
|
G
V
|
V
I
 
I
S
 
S
I
 
I
F
|
F
S
 
S
E
 
E
R
 
R
A
 
A
Q
 
K
K
 
A
G
 
G
L
 
R
P
 
P
I
 
I
T
|
T
V
x
L
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
G
Q
 
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
E
 
A
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
K
L
 
I
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
G
I
 
L
E
 
E
K
 
S
P
 
P
E
 
A
V
 
P
E
 
A
V
 
A
G
 
D
A
 
A
V
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
W
 
L
N
 
G
Q
 
G
A
 
V
T
 
T
T
 
T
L
|
L
K
 
N
Q
 
D
M
 
L
L
 
I
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
A
 
Q
V
 
I
V
 
S
G
 
G
D
 
K
L
 
P
P
 
L
P
 
Q
I
 
V
S
 
S
Y
 
H
G
 
G
P
 
A
A
 
T
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
|
D
I
 
I
R
 
R
H
 
H
S
 
S
R
 
K
A
 
A
D
 
D
N
 
N
H
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
S
 
D
F
 
L
P
 
G
P
 
T
Q
 
P
T
 
S
P
 
S
M
 
L
S
 
A
V
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
E
R
 
R
L
 
L

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
39% identity, 96% coverage: 6:303/309 of query aligns to 3:297/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
V
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
V
T
 
V
D
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
E
K
 
N
G
 
G
H
 
Y
A
 
G
V
 
V
R
 
I
I
 
V
L
 
V
D
|
D
D
x
N
L
 
L
S
|
S
T
x
S
G
|
G
K
 
K
R
 
V
S
 
E
N
 
N
L
 
L
P
 
-
L
 
-
D
 
-
N
 
N
P
 
R
A
 
N
V
 
A
E
 
L
L
 
F
I
 
Y
E
 
E
G
 
Q
D
x
S
V
x
I
A
 
E
D
 
D
A
 
E
A
 
E
L
 
M
V
 
M
A
 
E
R
 
R
-
 
I
-
 
F
A
 
S
M
 
L
A
 
H
G
 
R
C
 
P
S
 
E
A
 
Y
V
 
V
A
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
Q
A
 
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
A
A
 
I
S
 
S
V
 
V
D
 
R
D
 
E
P
 
P
V
 
A
R
 
R
T
 
D
H
 
A
Q
 
K
S
x
T
N
 
N
F
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
S
L
 
L
N
 
V
V
 
L
C
 
L
E
 
E
A
 
K
M
 
S
R
 
I
Q
 
K
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
K
R
 
K
V
 
F
L
 
I
F
 
F
A
x
S
S
|
S
S
x
T
A
 
G
-
x
G
A
|
A
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
N
 
N
G
 
V
E
 
K
G
 
V
E
 
F
S
 
P
I
 
T
D
 
P
E
 
E
E
 
T
T
 
E
P
 
I
K
 
P
A
 
H
P
 
P
L
 
I
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
G
S
 
I
D
 
A
K
|
K
L
 
Y
A
 
S
S
 
T
E
 
E
F
 
M
Y
 
Y
F
 
L
D
 
E
F
 
F
Y
 
F
R
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
E
 
K
P
 
Y
V
 
T
V
 
V
F
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
A
N
|
N
I
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
Y
S
 
G
P
 
E
Y
 
-
S
 
A
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
T
E
 
E
R
 
R
A
 
M
Q
 
L
K
 
R
G
 
G
L
 
E
P
 
E
I
 
V
T
x
H
V
 
I
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
x
Y
T
 
V
R
|
R
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
L
 
A
L
 
N
V
 
L
Q
 
L
A
 
A
I
 
M
E
 
E
K
 
K
P
 
G
E
 
D
V
 
N
E
 
E
V
 
V
G
 
-
A
 
-
V
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
W
 
T
N
 
G
Q
 
R
A
 
G
T
 
T
T
 
T
L
x
V
K
 
N
Q
 
Q
M
 
L
L
 
F
Q
 
K
A
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
T
G
 
G
-
 
Y
D
 
D
L
 
K
P
 
E
P
 
P
I
 
V
S
 
-
Y
 
Y
G
 
K
P
 
P
A
 
P
R
|
R
S
 
K
G
 
G
D
|
D
I
 
V
R
 
R
H
 
K
S
 
S
R
 
I
A
 
L
D
 
D
N
 
Y
H
 
T
R
 
K
L
 
A
L
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
L
S
 
G
F
 
W
P
 
E
P
 
P
Q
 
K
T
 
V
P
 
S
M
 
L
S
 
E
V
 
E
G
 
G
L
 
L

6dntA Udp-n-acetylglucosamine 4-epimerase from methanobrevibacter ruminantium m1 in complex with udp-n-acetylmuramic acid (see paper)
37% identity, 95% coverage: 1:295/309 of query aligns to 1:290/310 of 6dntA

query
sites
6dntA
M
 
M
A
 
K
E
 
D
G
 
K
P
 
N
V
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
L
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
I
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
-
K
 
D
G
 
D
H
 
N
A
 
K
V
 
V
R
 
T
I
 
I
L
 
I
D
|
D
D
x
N
L
|
L
S
|
S
T
x
S
G
|
G
K
 
K
R
 
M
S
 
E
N
 
N
L
 
L
P
 
-
L
 
-
D
 
N
N
 
N
P
 
P
A
 
N
V
 
H
E
 
E
-
 
N
-
 
L
-
 
T
L
 
I
I
 
I
E
 
K
G
 
E
D
|
D
V
x
L
A
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
D
L
 
L
V
 
-
A
 
E
R
 
K
A
 
I
M
 
L
A
 
K
G
 
D
C
 
K
S
 
D
A
 
Y
V
 
V
A
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
L
A
|
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
A
 
G
S
 
S
V
 
V
D
 
A
D
 
E
P
 
P
V
 
L
R
 
R
T
 
Y
H
 
N
Q
 
Q
S
 
N
N
 
N
F
 
I
I
 
D
G
 
A
T
 
S
L
 
L
N
 
K
V
 
L
C
 
F
E
 
I
A
 
A
M
 
C
R
 
K
Q
 
N
A
 
N
G
 
N
V
 
I
K
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
I
F
 
F
A
x
S
S
|
S
S
|
S
A
x
S
A
|
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
N
 
N
G
 
-
E
 
P
G
 
N
E
 
M
S
 
P
I
 
L
D
 
K
E
 
E
E
 
S
T
 
E
P
 
N
K
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
C
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
Q
K
|
K
L
 
A
A
 
S
S
 
C
E
 
E
F
 
L
Y
 
Y
F
 
L
D
 
K
F
 
S
Y
 
F
R
 
H
R
 
E
Q
 
S
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
E
 
D
P
 
Y
V
 
V
V
 
A
F
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
N
|
N
I
x
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
S
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
I
x
K
F
 
F
S
 
I
E
 
S
R
 
A
A
 
I
Q
 
L
K
 
N
G
 
G
L
 
E
P
 
S
I
 
P
T
x
V
V
x
I
F
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
|
E
Q
|
Q
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
I
Y
 
Y
V
 
V
E
 
K
D
 
E
L
 
I
V
 
A
D
 
K
L
 
A
L
 
N
V
 
I
Q
 
L
A
 
S
I
 
A
E
 
E
K
 
S
P
 
D
E
 
-
V
 
-
E
 
Y
V
 
N
G
 
G
A
 
V
V
 
I
N
 
N
V
 
V
G
 
A
W
 
L
N
 
G
Q
 
K
A
 
S
T
 
M
T
 
T
L
x
I
K
 
N
Q
 
R
M
 
L
L
 
F
Q
 
E
A
 
I
L
 
I
A
 
S
A
 
D
V
 
V
V
 
L
G
 
E
D
 
S
L
 
D
P
 
I
P
 
D
I
 
V
S
 
K
Y
 
Y
G
 
L
P
 
D
A
 
E
R
|
R
S
 
P
G
 
G
D
|
D
I
 
I
R
 
K
H
|
H
S
 
S
R
 
L
A
 
A
D
 
D
N
 
I
H
 
S
R
 
N
L
 
-
L
 
L
E
 
D
R
 
K
F
 
I
S
 
S
F
 
F
P
 
K
P
 
P

2p5uA Crystal structure of thermus thermophilus hb8 udp-glucose 4-epimerase complex with NAD
43% identity, 89% coverage: 6:280/309 of query aligns to 3:278/311 of 2p5uA

query
sites
2p5uA
V
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
I
T
 
V
D
 
E
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
R
G
 
G
H
 
L
A
 
E
V
 
V
R
 
A
I
 
V
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
|
L
S
x
A
T
|
T
G
|
G
K
 
K
R
 
R
S
 
E
N
 
N
L
 
V
P
 
P
L
 
K
D
 
G
N
 
V
P
 
P
A
 
F
V
 
F
E
 
R
L
 
V
I
 
-
E
 
-
G
 
-
D
|
D
V
x
L
A
 
R
D
 
D
A
 
K
A
 
E
L
 
G
V
 
V
A
 
E
R
 
R
A
 
A
M
 
F
A
 
R
G
 
E
C
 
F
-
 
R
-
 
P
S
 
T
A
 
H
V
 
V
A
 
S
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
V
 
Q
A
|
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
K
A
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
E
D
 
D
P
 
P
V
 
V
R
 
L
T
 
D
H
 
F
Q
 
E
S
 
V
N
 
N
F
 
L
I
 
L
G
 
G
T
 
G
L
 
L
N
 
N
V
 
L
C
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
C
R
 
R
Q
 
Q
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
K
 
E
R
 
K
V
 
L
L
 
V
F
 
F
A
 
A
S
|
S
S
x
T
A
 
G
-
x
G
A
|
A
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
N
 
V
G
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
R
I
 
A
D
 
E
E
 
E
E
 
T
T
 
W
P
 
P
K
 
P
A
 
R
P
 
P
L
 
K
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
S
K
|
K
L
 
A
A
 
A
S
 
F
E
 
E
F
 
H
Y
 
Y
F
 
L
D
 
S
F
 
V
Y
 
Y
R
 
G
R
 
Q
Q
 
S
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
E
 
K
P
 
W
V
 
V
V
 
S
F
 
L
R
 
R
F
 
Y
F
 
G
N
 
N
I
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
H
S
 
G
P
 
E
Y
 
-
S
 
A
G
|
G
V
 
V
I
 
V
S
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
V
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
T
 
T
V
 
L
F
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
E
E
 
G
Q
 
C
T
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
E
 
G
D
 
D
L
 
V
V
 
A
D
 
E
L
 
A
L
 
H
V
 
A
Q
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
F
K
 
S
P
 
L
E
 
E
V
 
-
E
 
-
V
 
-
G
 
G
A
 
I
V
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
G
W
 
T
N
 
G
Q
 
E
A
 
G
T
 
H
T
 
T
L
 
T
K
 
R
Q
 
E
M
 
V
L
 
L
Q
 
M
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
E
V
 
A
V
 
A
G
 
G
D
 
K
L
 
A
P
 
P
P
 
E
I
 
V
S
 
Q
Y
 
P
G
 
A
P
 
P
A
 
P
R
 
R
S
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
R
 
E
H
 
R
S
 
S

3ruhA Alternative analogs as viable substrates of udp-hexose 4-epimerases
34% identity, 96% coverage: 7:303/309 of query aligns to 20:324/336 of 3ruhA

query
sites
3ruhA
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
K
 
L
G
 
N
H
 
Q
A
 
V
V
 
V
R
 
I
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
 
F
S
|
S
T
|
T
G
|
G
K
 
H
R
 
Q
S
 
Y
N
 
N
L
 
L
P
 
D
L
 
E
D
 
V
N
 
K
P
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
S
-
 
T
-
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
C
L
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
D
A
 
L
A
 
T
L
 
T
V
 
C
A
 
E
R
 
Q
A
 
V
M
 
M
A
 
K
G
 
G
C
 
V
S
 
D
A
 
H
V
 
V
A
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
V
 
L
A
x
G
S
|
S
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
I
R
 
T
T
 
T
H
 
N
Q
 
A
S
x
T
N
 
N
F
 
I
I
 
T
G
 
G
T
 
F
L
 
L
N
 
N
V
 
I
C
 
L
E
 
H
A
 
A
M
 
A
R
 
K
Q
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
K
 
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
N
 
H
G
 
P
E
 
A
G
 
L
E
 
P
S
 
K
I
 
V
D
 
-
E
 
E
E
 
E
T
 
N
P
 
I
K
 
G
A
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
V
D
 
T
K
|
K
L
 
Y
A
 
V
S
 
N
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
F
 
A
D
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
Q
 
T
H
 
Y
A
 
G
L
 
F
E
 
K
P
 
T
V
 
I
V
 
G
F
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
I
x
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
I
x
K
F
x
W
S
 
T
E
 
A
R
 
A
A
 
M
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
D
P
 
D
I
 
V
T
x
Y
V
x
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
E
 
D
D
 
N
L
 
V
V
 
I
D
 
Q
L
 
M
-
 
N
L
 
I
V
 
L
Q
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
A
K
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
A
E
 
K
V
 
D
G
 
N
A
 
I
V
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
A
W
 
V
N
 
G
Q
 
D
A
 
R
T
 
T
T
 
T
L
|
L
K
 
N
Q
 
E
M
 
L
L
 
S
Q
 
G
A
 
Y
L
 
I
A
 
Y
A
 
D
V
 
E
V
 
L
G
 
N
D
 
L
L
 
I
P
 
H
P
 
H
I
 
I
S
 
K
Y
 
Y
G
 
R
P
 
E
A
 
F
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
|
D
I
x
V
R
 
R
H
 
H
S
|
S
R
 
Q
A
 
A
D
 
D
N
 
V
H
 
T
R
 
K
L
 
A
L
 
I
E
 
D
R
 
L
F
 
L
S
 
K
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
Q
 
N
T
 
I
P
 
K
M
 
I
S
 
R
V
 
E
G
 
G
L
 
L

3rufA Alternative analogs as viable substrates of udp-hexose 4-epimerases
34% identity, 96% coverage: 7:303/309 of query aligns to 20:324/336 of 3rufA

query
sites
3rufA
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
K
 
L
G
 
N
H
 
Q
A
 
V
V
 
V
R
 
I
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
 
F
S
|
S
T
|
T
G
|
G
K
 
H
R
 
Q
S
 
Y
N
 
N
L
 
L
P
 
D
L
 
E
D
 
V
N
 
K
P
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
S
-
 
T
-
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
C
L
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
D
A
 
L
A
 
T
L
 
T
V
 
C
A
 
E
R
 
Q
A
 
V
M
 
M
A
 
K
G
 
G
C
 
V
S
 
D
A
 
H
V
 
V
A
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
V
 
L
A
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
I
R
 
T
T
 
T
H
 
N
Q
 
A
S
x
T
N
 
N
F
 
I
I
 
T
G
 
G
T
 
F
L
 
L
N
 
N
V
 
I
C
 
L
E
 
H
A
 
A
M
 
A
R
 
K
Q
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
K
 
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
 
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
N
 
H
G
 
P
E
 
A
G
 
L
E
 
P
S
 
K
I
 
V
D
 
-
E
 
E
E
 
E
T
 
N
P
 
I
K
 
G
A
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
V
D
 
T
K
|
K
L
 
Y
A
 
V
S
 
N
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
F
 
A
D
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
Q
 
T
H
 
Y
A
 
G
L
 
F
E
 
K
P
 
T
V
 
I
V
 
G
F
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
I
x
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
I
x
K
F
x
W
S
 
T
E
 
A
R
 
A
A
 
M
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
D
P
 
D
I
 
V
T
x
Y
V
x
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
E
 
D
D
 
N
L
 
V
V
 
I
D
 
Q
L
 
M
-
 
N
L
 
I
V
 
L
Q
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
A
K
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
A
E
 
K
V
 
D
G
 
N
A
 
I
V
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
A
W
 
V
N
 
G
Q
 
D
A
 
R
T
 
T
T
 
T
L
|
L
K
 
N
Q
 
E
M
 
L
L
 
S
Q
 
G
A
 
Y
L
 
I
A
 
Y
A
 
D
V
 
E
V
 
L
G
 
N
D
 
L
L
 
I
P
 
H
P
 
H
I
 
I
S
 
K
Y
 
Y
G
 
R
P
 
E
A
 
F
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
|
D
I
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
R
 
Q
A
 
A
D
 
D
N
 
V
H
 
T
R
 
K
L
 
A
L
 
I
E
 
D
R
 
L
F
 
L
S
 
K
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
Q
 
N
T
 
I
P
 
K
M
 
I
S
 
R
V
 
E
G
 
G
L
 
L

3lu1A Crystal structure analysis of wbgu: a udp-galnac 4-epimerase (see paper)
34% identity, 96% coverage: 7:303/309 of query aligns to 20:324/336 of 3lu1A

query
sites
3lu1A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
K
 
L
G
 
N
H
 
Q
A
 
V
V
 
V
R
 
I
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
 
F
S
|
S
T
|
T
G
|
G
K
 
H
R
 
Q
S
 
Y
N
 
N
L
 
L
P
 
D
L
 
E
D
 
V
N
 
K
P
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
S
-
 
T
-
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
C
L
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
D
A
 
L
A
 
T
L
 
T
V
 
C
A
 
E
R
 
Q
A
 
V
M
 
M
A
 
K
G
 
G
C
 
V
S
 
D
A
 
H
V
 
V
A
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
V
 
L
A
 
G
S
|
S
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
I
R
 
T
T
 
T
H
 
N
Q
 
A
S
 
T
N
 
N
F
 
I
I
 
T
G
 
G
T
 
F
L
 
L
N
 
N
V
 
I
C
 
L
E
 
H
A
 
A
M
 
A
R
 
K
Q
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
K
x
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
N
 
H
G
 
P
E
 
A
G
 
L
E
 
P
S
 
K
I
 
V
D
 
-
E
 
E
E
 
E
T
 
N
P
 
I
K
 
G
A
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
V
D
 
T
K
|
K
L
 
Y
A
 
V
S
 
N
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
F
 
A
D
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
Q
 
T
H
 
Y
A
 
G
L
 
F
E
x
K
P
 
T
V
 
I
V
 
G
F
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
I
 
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
I
 
K
F
x
W
S
 
T
E
 
A
R
 
A
A
 
M
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
D
P
 
D
I
 
V
T
x
Y
V
x
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
E
 
D
D
 
N
L
 
V
V
 
I
D
 
Q
L
 
M
-
 
N
L
 
I
V
 
L
Q
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
A
K
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
A
E
 
K
V
 
D
G
 
N
A
 
I
V
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
A
W
 
V
N
 
G
Q
 
D
A
 
R
T
 
T
T
 
T
L
|
L
K
 
N
Q
 
E
M
 
L
L
 
S
Q
 
G
A
 
Y
L
 
I
A
 
Y
A
 
D
V
 
E
V
 
L
G
 
N
D
 
L
L
 
I
P
 
H
P
 
H
I
 
I
S
 
K
Y
 
Y
G
 
R
P
 
E
A
 
F
R
|
R
S
 
S
G
 
G
D
|
D
I
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
R
 
Q
A
 
A
D
 
D
N
 
V
H
 
T
R
 
K
L
 
A
L
 
I
E
 
D
R
 
L
F
 
L
S
 
K
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
Q
 
N
T
 
I
P
 
K
M
 
I
S
 
R
V
 
E
G
 
G
L
 
L

Q7BJX9 UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase; UDP-GalNAc 4-epimerase; EC 5.1.3.7 from Plesiomonas shigelloides (Aeromonas shigelloides) (see 2 papers)
34% identity, 96% coverage: 7:303/309 of query aligns to 23:332/345 of Q7BJX9

query
sites
Q7BJX9
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
x
V
A
|
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
K
 
L
G
 
N
H
 
Q
A
 
V
V
 
V
R
 
I
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
x
F
S
|
S
T
|
T
G
|
G
K
 
H
R
 
Q
S
 
Y
N
 
N
L
 
L
P
 
D
L
 
E
D
 
V
N
 
K
P
 
T
A
 
L
V
 
V
E
 
S
-
 
T
-
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
C
L
 
F
I
 
I
E
 
E
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
D
A
 
L
A
 
T
L
 
T
V
 
C
A
 
E
R
 
Q
A
 
V
M
 
M
A
 
K
G
 
G
C
 
V
S
 
D
A
 
H
V
 
V
A
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
V
 
L
A
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
I
R
 
T
T
 
T
H
 
N
Q
 
A
S
x
T
N
 
N
F
 
I
I
 
T
G
 
G
T
 
F
L
 
L
N
 
N
V
 
I
C
 
L
E
 
H
A
 
A
M
 
A
R
 
K
Q
 
N
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
K
 
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
N
 
H
G
 
P
E
 
A
G
 
L
E
 
P
S
 
K
I
 
V
D
 
-
E
 
E
E
 
E
T
 
N
P
 
I
K
 
G
A
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
V
D
 
T
K
|
K
L
 
Y
A
 
V
S
 
N
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
F
 
A
D
 
Q
F
 
V
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
Q
 
T
H
 
Y
A
 
G
L
 
F
E
 
K
P
 
T
V
 
I
V
 
G
F
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
N
|
N
I
x
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
V
|
V
I
|
I
S
x
P
I
x
K
F
 
W
S
 
T
E
 
A
R
 
A
A
 
M
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
L
 
D
P
 
D
I
 
V
T
x
Y
V
x
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
x
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
E
 
D
D
 
N
L
 
V
V
 
I
D
 
Q
L
 
M
-
 
N
L
 
I
V
 
L
Q
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
A
K
 
K
P
 
D
E
 
S
V
 
A
E
 
K
V
 
D
G
 
N
A
 
I
V
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
A
W
 
V
N
 
G
Q
 
D
A
x
R
T
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
N
Q
 
E
M
 
L
L
 
S
Q
 
G
A
 
Y
L
 
I
A
 
Y
A
 
D
V
 
E
V
 
L
G
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
H
-
 
H
-
 
I
D
 
D
L
 
K
P
 
L
P
 
S
I
 
I
S
 
K
Y
 
Y
G
 
R
P
 
E
A
 
F
R
|
R
S
|
S
G
|
G
D
|
D
I
 
V
R
|
R
H
|
H
S
|
S
R
 
Q
A
 
A
D
 
D
N
 
V
H
 
T
R
 
K
L
 
A
L
 
I
E
 
D
R
 
L
F
 
L
S
 
K
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
Q
 
N
T
 
I
P
 
K
M
 
I
S
 
R
V
 
E
G
 
G
L
 
L

1sb9A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-n-acetylglucosamine 4- epimerase complexed with udp-glucose (see paper)
34% identity, 96% coverage: 7:304/309 of query aligns to 19:329/340 of 1sb9A

query
sites
1sb9A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
K
 
L
G
 
D
H
 
Q
A
 
K
V
 
V
R
 
V
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
x
F
S
 
A
T
|
T
G
|
G
K
 
H
R
 
Q
S
 
R
N
 
N
L
 
L
P
 
D
L
 
E
D
 
V
N
 
R
P
 
S
A
 
L
V
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
N
-
 
F
E
 
K
L
 
F
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
N
A
 
L
A
 
D
L
 
D
V
 
C
A
 
N
R
 
N
A
 
A
M
 
C
A
 
A
G
 
G
C
 
V
S
 
D
A
 
Y
V
 
V
A
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
 
A
A
|
A
V
 
L
A
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
I
R
 
T
T
 
S
H
 
N
Q
 
A
S
x
T
N
 
N
F
 
I
I
 
D
G
 
G
T
 
F
L
 
L
N
 
N
V
 
M
C
 
L
E
 
I
A
 
A
M
 
A
R
 
R
Q
 
D
A
 
A
G
 
K
V
 
V
K
 
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
N
 
H
G
 
-
E
 
P
G
 
G
E
 
L
S
 
P
I
 
K
D
 
V
E
 
E
E
 
D
T
 
T
P
 
I
K
 
G
A
 
K
P
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
V
D
 
T
K
|
K
L
 
Y
A
 
V
S
 
N
E
 
E
F
 
L
Y
 
Y
F
 
A
D
 
D
F
 
V
Y
 
F
R
 
S
R
 
R
Q
 
C
H
 
Y
A
 
G
L
 
F
E
 
S
P
 
T
V
 
I
V
 
G
F
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
I
x
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
I
 
K
F
x
W
S
 
T
E
 
S
R
 
S
A
 
M
Q
 
I
K
 
Q
G
 
G
L
 
D
P
 
D
I
 
V
T
x
Y
V
x
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
D
 
N
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
L
 
A
-
 
N
L
 
L
V
 
L
Q
 
A
A
 
A
I
 
T
E
 
A
K
 
G
P
 
L
E
 
D
V
 
A
E
 
R
V
 
N
G
 
Q
A
 
V
V
 
Y
N
 
N
V
 
I
G
 
A
W
 
V
N
 
G
Q
 
G
A
 
R
T
 
T
T
 
S
L
|
L
K
 
N
Q
 
Q
M
 
L
L
 
F
Q
 
F
A
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
E
A
 
N
A
 
G
V
 
V
V
 
S
G
 
Y
D
 
H
L
 
R
P
 
E
P
 
P
I
 
V
S
 
-
Y
 
Y
G
 
R
P
 
D
A
 
F
R
|
R
S
 
E
G
 
G
D
|
D
I
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
R
 
L
A
 
A
D
 
D
N
 
I
H
 
S
R
 
K
L
 
A
L
 
A
E
 
K
R
 
L
F
 
L
S
 
G
F
 
Y
P
 
A
P
 
P
Q
 
K
T
 
Y
P
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A

1sb8A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-n-acetylglucosamine 4- epimerase complexed with udp-n-acetylgalactosamine (see paper)
34% identity, 96% coverage: 7:304/309 of query aligns to 20:330/341 of 1sb8A

query
sites
1sb8A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
K
 
L
G
 
D
H
 
Q
A
 
K
V
 
V
R
 
V
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
x
F
S
 
A
T
|
T
G
|
G
K
 
H
R
 
Q
S
 
R
N
 
N
L
 
L
P
 
D
L
 
E
D
 
V
N
 
R
P
 
S
A
 
L
V
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
N
-
 
F
E
 
K
L
 
F
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
N
A
 
L
A
 
D
L
 
D
V
 
C
A
 
N
R
 
N
A
 
A
M
 
C
A
 
A
G
 
G
C
 
V
S
 
D
A
 
Y
V
 
V
A
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
 
A
A
|
A
V
 
L
A
 
G
S
|
S
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
I
R
 
T
T
 
S
H
 
N
Q
 
A
S
x
T
N
 
N
F
 
I
I
 
D
G
 
G
T
 
F
L
 
L
N
 
N
V
 
M
C
 
L
E
 
I
A
 
A
M
 
A
R
 
R
Q
 
D
A
 
A
G
 
K
V
 
V
K
 
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
N
 
H
G
 
-
E
 
P
G
 
G
E
 
L
S
 
P
I
 
K
D
 
V
E
 
E
E
 
D
T
 
T
P
 
I
K
 
G
A
 
K
P
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
V
D
 
T
K
|
K
L
 
Y
A
 
V
S
 
N
E
 
E
F
 
L
Y
 
Y
F
 
A
D
 
D
F
 
V
Y
 
F
R
 
S
R
 
R
Q
 
C
H
 
Y
A
 
G
L
 
F
E
 
S
P
 
T
V
 
I
V
 
G
F
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
I
x
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
I
 
K
F
x
W
S
 
T
E
 
S
R
 
S
A
 
M
Q
 
I
K
 
Q
G
 
G
L
 
D
P
 
D
I
 
V
T
x
Y
V
x
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
D
 
N
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
L
 
A
-
 
N
L
 
L
V
 
L
Q
 
A
A
 
A
I
 
T
E
 
A
K
 
G
P
 
L
E
 
D
V
 
A
E
 
R
V
 
N
G
 
Q
A
 
V
V
 
Y
N
 
N
V
 
I
G
 
A
W
 
V
N
 
G
Q
 
G
A
 
R
T
 
T
T
 
S
L
|
L
K
 
N
Q
 
Q
M
 
L
L
 
F
Q
 
F
A
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
E
A
 
N
A
 
G
V
 
V
V
 
S
G
 
Y
D
 
H
L
 
R
P
 
E
P
 
P
I
 
V
S
 
-
Y
 
Y
G
 
R
P
 
D
A
 
F
R
|
R
S
 
E
G
 
G
D
|
D
I
 
V
R
 
R
H
 
H
S
|
S
R
 
L
A
 
A
D
 
D
N
 
I
H
 
S
R
 
K
L
 
A
L
 
A
E
 
K
R
 
L
F
 
L
S
 
G
F
 
Y
P
 
A
P
 
P
Q
 
K
T
 
Y
P
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A

Q8KN66 UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosaminouronate 4-epimerase; UDP-GlcNAcA 4-epimerase; UDP-N-acetylglucosamine C4 epimerase; UDP-GlcNAc C4 epimerase; EC 5.1.3.45; EC 5.1.3.7 from Pseudomonas aeruginosa (see 2 papers)
34% identity, 96% coverage: 7:304/309 of query aligns to 20:330/341 of Q8KN66

query
sites
Q8KN66
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
V
A
 
A
G
 
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
T
 
L
D
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
K
 
L
G
 
D
H
 
Q
A
 
K
V
 
V
R
 
V
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
 
N
L
 
F
S
x
A
T
|
T
G
|
G
K
 
H
R
 
Q
S
 
R
N
 
N
L
 
L
P
 
D
L
 
E
D
 
V
N
 
R
P
 
S
A
 
L
V
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
N
-
 
F
E
 
K
L
 
F
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
R
D
 
N
A
 
L
A
 
D
L
 
D
V
 
C
A
 
N
R
 
N
A
 
A
M
 
C
A
 
A
G
 
G
C
 
V
S
 
D
A
 
Y
V
 
V
A
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
x
G
S
|
S
V
 
V
Q
 
P
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
N
D
 
D
P
 
P
V
 
I
R
 
T
T
 
S
H
 
N
Q
 
A
S
x
T
N
 
N
F
 
I
I
 
D
G
 
G
T
 
F
L
 
L
N
 
N
V
 
M
C
 
L
E
 
I
A
 
A
M
 
A
R
 
R
Q
 
D
A
 
A
G
 
K
V
 
V
K
 
Q
R
 
S
V
 
F
L
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
V
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
N
 
H
G
 
-
E
 
P
G
 
G
E
 
L
S
 
P
I
 
K
D
 
V
E
 
E
E
 
D
T
 
T
P
 
I
K
 
G
A
 
K
P
 
P
L
 
L
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
V
D
 
T
K
|
K
L
 
Y
A
 
V
S
 
N
E
 
E
F
 
L
Y
 
Y
F
 
A
D
 
D
F
 
V
Y
 
F
R
 
S
R
 
R
Q
 
C
H
 
Y
A
 
G
L
 
F
E
 
S
P
 
T
V
 
I
V
 
G
F
 
L
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
|
N
I
x
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
R
 
R
Q
|
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
I
 
K
F
 
W
S
 
T
E
 
S
R
 
S
A
 
M
Q
 
I
K
 
Q
G
 
G
L
 
D
P
 
D
I
 
V
T
x
Y
V
 
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
D
 
N
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
L
 
A
-
 
N
L
 
L
V
 
L
Q
 
A
A
 
A
I
 
T
E
 
A
K
 
G
P
 
L
E
 
D
V
 
A
E
 
R
V
 
N
G
 
Q
A
 
V
V
 
Y
N
 
N
V
 
I
G
 
A
W
 
V
N
 
G
Q
 
G
A
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
K
 
N
Q
 
Q
M
 
L
L
 
F
Q
 
F
A
 
A
L
 
L
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
E
A
 
N
A
 
G
V
 
V
V
 
S
G
 
Y
D
 
H
L
 
R
P
 
E
P
 
P
I
 
V
S
 
-
Y
 
Y
G
 
R
P
 
D
A
 
F
R
|
R
S
 
E
G
 
G
D
|
D
I
 
V
R
 
R
H
 
H
S
|
S
R
 
L
A
 
A
D
 
D
N
 
I
H
 
S
R
 
K
L
 
A
L
 
A
E
 
K
R
 
L
F
 
L
S
 
G
F
 
Y
P
 
A
P
 
P
Q
 
K
T
 
Y
P
 
D
M
 
V
S
 
S
V
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A

8vr2B Crystal structure of the pcryo_0617 oxidoreductase/decarboxylase from psychrobacter cryohalolentis k5 in the presence of NAD and udp
35% identity, 97% coverage: 5:305/309 of query aligns to 9:306/321 of 8vr2B

query
sites
8vr2B
P
 
K
V
 
I
L
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
L
 
L
T
 
I
D
 
G
A
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
E
K
 
N
G
 
N
H
 
E
A
 
M
V
 
I
R
 
-
I
 
V
L
 
Y
D
|
D
D
x
N
L
 
L
S
x
E
T
x
R
G
 
N
K
 
T
R
 
L
S
 
K
N
 
S
L
 
Q
P
 
P
L
 
F
D
 
A
N
 
N
-
 
H
P
 
K
A
 
N
V
 
L
E
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
D
x
N
V
|
V
A
 
L
D
 
D
A
 
Q
A
 
E
L
 
K
V
 
I
A
 
I
R
 
E
A
 
A
M
 
A
A
 
K
G
 
G
C
 
S
S
 
E
A
 
I
V
 
F
A
 
I
H
 
H
L
x
A
A
|
A
A
|
A
V
 
I
A
 
A
S
 
G
V
 
I
Q
 
D
A
 
N
S
 
T
V
 
V
D
 
K
D
 
S
P
 
P
V
 
V
R
 
R
T
 
T
H
 
M
Q
 
T
S
 
V
N
 
N
F
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
A
N
 
N
V
 
A
C
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
A
R
 
H
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
-
 
T
V
 
V
K
 
Q
R
 
R
V
 
F
L
 
L
F
 
E
A
x
F
S
 
S
S
 
T
A
 
S
A
 
E
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
N
 
S
N
 
-
G
 
-
E
 
R
G
 
A
E
 
Y
S
 
R
I
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
T
-
 
G
-
 
A
T
 
V
P
 
G
K
 
E
A
 
A
P
x
R
L
 
W
T
 
T
P
 
-
Y
 
Y
A
 
A
S
 
V
D
 
S
K
|
K
L
 
L
A
 
A
S
 
G
E
 
E
F
 
H
Y
 
L
F
 
T
D
 
H
F
 
A
Y
 
Y
R
 
N
R
 
R
Q
 
E
H
 
H
A
 
G
L
 
L
E
 
P
P
 
T
V
 
V
V
 
T
F
 
F
R
 
R
F
x
P
F
 
F
N
|
N
I
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
G
Q
 
Q
D
 
I
P
 
G
S
 
-
S
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
E
G
|
G
V
x
A
I
 
I
S
 
S
I
 
I
F
x
M
S
 
I
E
 
R
R
 
K
A
 
A
Q
 
L
K
 
N
G
 
N
L
 
E
P
 
D
I
 
I
T
x
Y
V
x
I
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
S
Q
 
Q
T
 
I
R
|
R
D
 
A
F
 
W
V
 
C
Y
 
Y
V
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
M
V
 
I
D
 
D
L
 
A
L
 
L
V
 
M
Q
 
K
A
 
A
I
 
L
E
 
S
K
 
V
P
 
P
E
 
Q
V
 
A
E
 
I
V
 
G
G
 
E
A
 
S
V
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
W
 
N
N
 
A
Q
 
R
A
 
A
-
 
I
T
 
T
T
 
T
L
x
I
K
 
Y
Q
 
G
M
 
L
L
 
A
Q
 
Q
A
 
T
L
 
I
A
 
C
A
 
R
V
 
V
V
 
L
G
 
N
D
 
S
L
 
K
P
 
S
P
 
E
I
 
I
S
 
I
Y
 
F
G
 
R
P
 
E
A
 
A
R
 
L
S
 
S
G
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
E
H
 
L
S
 
R
R
 
I
A
 
P
D
 
N
N
 
V
H
 
D
R
 
K
L
 
S
L
 
E
E
 
E
R
 
L
F
 
L
S
 
G
F
 
F
P
 
K
P
 
A
Q
 
Q
T
 
V
P
 
D
M
 
L
S
 
E
V
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
I
R
 
R

7ys9A Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chaina from mycobacterium tuberculosis
37% identity, 97% coverage: 7:307/309 of query aligns to 4:305/310 of 7ys9A

query
sites
7ys9A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
L
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
D
G
 
G
H
 
H
A
 
S
V
 
V
R
 
V
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
 
F
S
x
A
T
|
T
G
|
G
K
 
R
R
 
A
S
 
T
N
 
N
L
 
L
P
 
E
-
 
H
-
 
L
L
 
A
D
 
D
N
 
N
P
 
S
A
 
A
V
 
H
E
 
V
L
 
F
I
 
V
E
 
E
G
 
A
D
|
D
V
x
I
A
 
V
D
 
T
A
 
A
A
 
D
L
 
L
V
 
H
A
 
A
-
 
I
R
 
L
A
 
E
M
 
Q
A
 
H
G
 
R
C
 
P
S
 
E
A
 
V
V
 
V
A
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
Q
A
x
I
S
 
D
V
 
V
Q
x
R
A
 
R
S
 
S
V
 
V
D
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
Q
R
 
F
T
 
D
H
 
A
Q
 
A
S
 
V
N
 
N
F
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
V
N
 
R
V
 
L
C
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
K
V
 
I
L
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
S
|
S
-
 
G
A
x
G
A
 
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
T
N
 
P
G
 
P
E
 
E
G
 
-
E
 
Y
S
 
P
I
 
T
D
 
P
E
 
E
E
 
T
T
 
A
P
 
P
K
 
T
A
 
D
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
G
K
|
K
L
 
V
A
 
A
S
 
G
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
F
 
L
D
 
N
F
 
T
Y
 
F
R
 
R
R
 
H
Q
 
L
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
E
 
D
P
 
C
V
 
S
V
 
H
F
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
N
|
N
I
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
H
S
 
G
P
 
E
Y
 
-
S
x
A
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
I
 
I
F
|
F
S
 
A
E
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
L
K
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
T
T
x
R
V
 
V
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
x
N
T
 
T
R
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
Y
x
R
V
 
D
E
 
Y
D
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
D
L
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
F
E
 
V
K
 
R
P
 
V
E
 
S
V
 
A
E
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
R
V
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
W
 
T
N
 
G
Q
 
K
A
 
E
T
 
T
T
 
S
L
x
D
K
 
R
Q
 
Q
M
 
L
L
 
H
Q
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
G
L
 
P
P
 
D
P
 
D
I
 
P
S
 
E
Y
 
F
G
 
H
P
 
P
A
 
P
R
|
R
S
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
L
R
 
K
H
 
R
S
 
S
R
 
C
A
 
L
D
 
D
N
 
I
H
 
G
R
 
L
L
 
A
L
 
E
E
 
R
R
 
V
F
 
L
S
 
G
F
 
W
P
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
I
P
 
E
M
 
L
S
 
A
V
 
D
G
 
G
L
 
V
A
 
R
R
 
R
L
 
T
L
 
V

7ysmA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) co-crystallized with udp-n-acetylglucosamine from mycobacterium tuberculosis
37% identity, 97% coverage: 7:307/309 of query aligns to 4:305/311 of 7ysmA

query
sites
7ysmA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
L
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
D
G
 
G
H
 
H
A
 
S
V
 
V
R
 
V
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
 
F
S
 
A
T
|
T
G
|
G
K
 
R
R
 
A
S
 
T
N
 
N
L
 
L
P
 
E
-
 
H
-
 
L
L
 
A
D
 
D
N
 
N
P
 
S
A
 
A
V
 
H
E
 
V
L
 
F
I
 
V
E
 
E
G
 
A
D
|
D
V
x
I
A
 
V
D
 
T
A
 
A
A
 
D
L
 
L
V
 
H
A
 
A
-
 
I
R
 
L
A
 
E
M
 
Q
A
 
H
G
 
R
C
 
P
S
 
E
A
 
V
V
 
V
A
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
Q
A
x
I
S
 
D
V
 
V
Q
x
R
A
 
R
S
 
S
V
 
V
D
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
Q
R
 
F
T
 
D
H
 
A
Q
 
A
S
 
V
N
 
N
F
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
V
N
 
R
V
 
L
C
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
K
V
 
I
L
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
S
|
S
-
 
G
A
x
G
A
x
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
T
N
 
P
G
 
P
E
 
E
G
 
-
E
 
Y
S
 
P
I
 
T
D
 
P
E
 
E
E
 
T
T
 
A
P
 
P
K
 
T
A
 
D
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
G
K
|
K
L
 
V
A
 
A
S
 
G
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
F
 
L
D
 
N
F
 
T
Y
 
F
R
 
R
R
 
H
Q
 
L
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
E
 
D
P
 
C
V
 
S
V
 
H
F
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
N
|
N
I
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
H
S
 
G
P
 
E
Y
 
-
S
 
A
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
I
 
I
F
|
F
S
 
A
E
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
L
K
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
T
T
x
R
V
|
V
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
x
N
T
 
T
R
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
Y
x
R
V
 
D
E
 
Y
D
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
D
L
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
F
E
 
V
K
 
R
P
 
V
E
 
S
V
 
A
E
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
R
V
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
W
 
T
N
 
G
Q
 
K
A
 
E
T
 
T
T
 
S
L
x
D
K
 
R
Q
 
Q
M
 
L
L
 
H
Q
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
G
L
 
P
P
 
D
P
 
D
I
 
P
S
 
E
Y
 
F
G
 
H
P
 
P
A
 
P
R
|
R
S
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
L
R
 
K
H
 
R
S
 
S
R
 
C
A
 
L
D
 
D
N
 
I
H
 
G
R
 
L
L
 
A
L
 
E
E
 
R
R
 
V
F
 
L
S
 
G
F
 
W
P
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
I
P
 
E
M
 
L
S
 
A
V
 
D
G
 
G
L
 
V
A
 
R
R
 
R
L
 
T
L
 
V

7ystA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chain b from mycobacterium tuberculosis
37% identity, 97% coverage: 7:307/309 of query aligns to 4:305/312 of 7ystA

query
sites
7ystA
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
L
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
D
G
 
G
H
 
H
A
 
S
V
 
V
R
 
V
I
 
G
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
 
F
S
 
A
T
|
T
G
|
G
K
 
R
R
 
A
S
 
T
N
 
N
L
 
L
P
 
E
-
 
H
-
 
L
L
 
A
D
 
D
N
 
N
P
 
S
A
 
A
V
 
H
E
 
V
L
 
F
I
 
V
E
 
E
G
 
A
D
|
D
V
x
I
A
 
V
D
 
T
A
 
A
A
 
D
L
 
L
V
 
H
A
 
A
-
 
I
R
 
L
A
 
E
M
 
Q
A
 
H
G
 
R
C
 
P
S
 
E
A
 
V
V
 
V
A
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
Q
A
x
I
S
 
D
V
 
V
Q
x
R
A
 
R
S
 
S
V
 
V
D
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
Q
R
 
F
T
 
D
H
 
A
Q
 
A
S
x
V
N
 
N
F
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
V
N
 
R
V
 
L
C
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
A
R
 
R
Q
 
Q
A
 
T
G
 
G
V
 
V
K
 
R
R
 
K
V
 
I
L
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
S
|
S
-
 
G
A
x
G
A
 
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
T
N
 
P
G
 
P
E
 
E
G
 
-
E
 
Y
S
 
P
I
 
T
D
 
P
E
 
E
E
 
T
T
 
A
P
 
P
K
 
T
A
 
D
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
G
K
|
K
L
 
V
A
 
A
S
 
G
E
 
E
F
 
I
Y
 
Y
F
 
L
D
 
N
F
 
T
Y
 
F
R
 
R
R
 
H
Q
 
L
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
E
 
D
P
 
C
V
 
S
V
 
H
F
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
N
|
N
I
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
H
S
 
G
P
 
E
Y
 
-
S
x
A
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
I
 
I
F
|
F
S
 
A
E
 
Q
R
 
A
A
 
L
Q
 
L
K
 
S
G
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
T
T
x
R
V
|
V
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
 
N
T
 
T
R
 
-
D
 
-
F
 
-
V
 
-
Y
x
R
V
 
D
E
 
Y
D
 
V
L
 
F
V
 
V
D
 
D
L
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
F
E
 
V
K
 
R
P
 
V
E
 
S
V
 
A
E
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
R
V
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
W
 
T
N
 
G
Q
 
K
A
 
E
T
 
T
T
 
S
L
x
D
K
 
R
Q
 
Q
M
 
L
L
 
H
Q
 
S
A
 
A
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
G
L
 
P
P
 
D
P
 
D
I
 
P
S
 
E
Y
 
F
G
 
H
P
 
P
A
 
P
R
|
R
S
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
L
R
 
K
H
 
R
S
 
S
R
 
C
A
 
L
D
 
D
N
 
I
H
 
G
R
 
L
L
 
A
L
 
E
E
 
R
R
 
V
F
 
L
S
 
G
F
 
W
P
 
R
P
 
P
Q
 
Q
T
 
I
P
 
E
M
 
L
S
 
A
V
 
D
G
 
G
L
 
V
A
 
R
R
 
R
L
 
T
L
 
V

6bwlA X-ray structure of pal from bacillus thuringiensis (see paper)
36% identity, 82% coverage: 6:258/309 of query aligns to 3:258/313 of 6bwlA

query
sites
6bwlA
V
 
I
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
R
H
 
W
L
 
V
T
 
V
D
 
K
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
Q
K
 
D
G
 
K
H
 
H
A
 
E
V
 
V
R
 
W
I
 
I
L
 
L
D
|
D
D
x
N
L
|
L
S
 
A
T
x
N
G
x
S
K
 
T
R
 
T
S
 
A
N
 
N
L
 
I
P
 
T
-
 
E
-
 
F
-
 
A
L
 
H
D
 
D
N
 
L
P
 
N
A
 
L
V
 
K
E
 
Q
L
 
C
I
 
I
E
 
Q
G
 
G
D
|
D
V
x
I
A
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
Q
A
 
L
M
 
F
A
 
E
G
 
N
C
 
N
S
 
S
-
 
F
-
 
D
A
 
L
V
 
C
A
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
S
A
x
I
S
 
N
V
 
V
Q
 
Q
A
 
D
S
 
S
V
 
I
D
 
D
D
 
D
P
 
A
V
 
R
R
 
A
T
 
T
H
 
F
Q
 
E
S
 
N
N
 
D
F
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
F
N
 
N
V
 
L
C
 
L
E
 
E
A
 
Q
M
 
C
R
 
L
Q
 
N
A
 
Y
G
 
D
V
 
V
K
 
K
R
 
M
V
 
V
L
 
-
F
 
F
A
x
M
S
 
S
S
x
T
A
x
C
A
x
M
V
 
V
Y
 
Y
G
 
D
N
 
K
N
 
A
G
 
T
E
 
N
G
 
I
E
 
Q
S
 
G
I
 
I
D
 
S
E
 
E
E
 
L
T
 
D
P
 
P
K
 
I
A
 
K
P
 
P
L
 
A
T
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
S
 
G
D
 
S
K
|
K
L
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
E
F
 
N
Y
 
M
F
 
V
D
 
L
F
 
S
Y
 
Y
R
 
Y
R
 
Y
Q
 
A
H
 
Y
A
 
K
L
 
L
E
 
P
P
 
V
V
 
V
V
 
V
F
 
I
R
 
R
F
 
P
F
 
F
N
|
N
I
x
T
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
R
 
F
Q
 
Q
D
 
K
P
 
T
S
 
G
S
 
G
P
 
E
Y
 
-
S
 
G
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
I
 
I
F
 
F
S
 
I
E
 
N
R
 
N
A
 
K
Q
 
L
K
 
D
G
 
N
L
 
V
P
 
P
I
 
L
T
x
N
V
x
I
F
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
K
Q
|
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
L
V
 
L
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
C
V
 
A
D
 
D
L
 
F
L
 
V
V
 
V
Q
 
A
A
 
A
I
 
G
E
 
Y
K
 
S
P
 
A
E
 
K
V
 
A
E
 
N
V
 
G
G
 
H
A
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
A
G
 
G
W
 
T
N
 
G
Q
 
Q
A
 
D
T
 
I
T
 
S
L
x
I
K
 
N
Q
 
K
M
 
L
L
 
A
Q
 
E
A
 
L
L
 
I
A
 
S

Sites not aligning to the query:

8rdhA Crystal structure of udp-galactose 4-epimerase from pyrococcus horikoshii with bound NAD and gdp-l-fucose
32% identity, 88% coverage: 6:278/309 of query aligns to 3:282/319 of 8rdhA

query
sites
8rdhA
V
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
M
A
 
E
K
 
E
G
 
G
H
 
Y
A
 
K
V
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
L
D
|
D
D
|
D
L
 
L
S
|
S
T
x
A
G
|
G
K
 
S
R
 
L
S
 
K
N
 
N
L
 
I
P
 
E
-
 
G
-
 
W
L
 
L
D
 
G
N
 
N
P
 
E
A
 
N
V
 
F
E
 
E
L
 
F
I
 
I
E
 
K
G
 
G
D
 
D
V
x
M
A
 
R
D
 
D
A
 
V
A
 
E
L
 
I
V
 
V
A
 
S
R
 
K
A
 
A
M
 
V
A
 
K
G
 
D
C
 
V
S
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
V
 
N
A
x
P
S
 
E
V
 
V
Q
x
R
A
 
I
S
 
G
V
 
S
D
 
Q
D
 
S
P
 
P
V
 
E
R
 
L
T
 
L
H
 
Y
Q
 
E
S
 
T
N
 
N
F
 
V
I
 
L
G
 
I
T
 
T
L
 
Y
N
 
N
V
 
L
C
 
L
E
 
N
A
 
A
M
 
V
R
 
R
Q
 
N
A
 
S
G
 
G
V
 
V
K
 
K
R
 
Y
V
 
L
L
 
V
F
 
F
A
x
T
S
 
S
S
|
S
A
 
S
A
 
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
N
 
A
G
 
K
E
 
V
G
 
I
E
 
P
S
 
T
I
 
P
D
 
E
E
 
D
E
 
Y
T
 
A
P
 
P
K
 
L
A
 
E
P
 
P
L
 
I
T
 
S
P
 
V
Y
|
Y
A
 
G
S
 
A
D
 
A
K
|
K
L
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
E
F
 
A
Y
 
L
F
 
I
D
 
S
F
 
G
Y
 
Y
R
 
A
R
 
H
Q
 
T
H
 
F
A
 
D
L
 
F
E
 
R
P
 
A
V
 
L
V
 
I
F
 
I
R
 
R
F
x
L
F
x
A
N
|
N
I
|
I
Y
 
I
G
 
G
P
 
K
R
 
R
Q
 
S
D
 
N
P
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
x
H
G
|
G
V
|
V
I
 
I
S
 
Y
I
x
D
F
|
F
S
 
I
E
 
N
R
x
K
A
 
L
Q
 
K
K
 
A
G
 
N
-
 
P
L
 
N
P
 
E
I
 
L
T
 
E
V
 
I
F
x
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
|
Q
T
 
R
R
x
K
D
 
S
F
 
Y
V
 
L
Y
 
H
V
 
I
E
 
S
D
 
D
L
 
T
V
 
I
D
 
D
L
 
G
L
 
I
V
 
M
Q
 
K
A
 
L
I
 
F
E
 
E
-
 
H
-
 
F
-
 
L
K
 
N
P
 
G
E
 
E
V
 
E
E
 
R
V
 
V
G
 
D
A
 
F
V
 
Y
N
 
N
V
 
L
G
 
G
W
 
N
N
 
E
Q
 
D
A
 
W
T
 
I
T
 
T
L
x
V
K
 
K
Q
 
E
M
 
I
L
 
A
Q
 
E
A
 
I
L
 
V
A
 
S
A
 
E
V
 
E
V
 
M
G
 
N
D
 
L
L
 
N
P
 
P
P
 
R
I
 
F
S
 
K
Y
 
F
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
G
G
 
G
P
 
R
A
 
G
R
x
W
S
 
K
G
 
G
D
|
D
I
 
V
R
 
K

2b69A Crystal structure of human udp-glucoronic acid decarboxylase
33% identity, 97% coverage: 6:305/309 of query aligns to 4:299/312 of 2b69A

query
sites
2b69A
V
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
x
V
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
M
A
 
M
K
 
D
G
 
G
H
 
H
A
 
E
V
 
V
R
 
T
I
 
V
L
 
V
D
|
D
D
x
N
L
 
F
S
 
F
T
|
T
G
|
G
K
 
R
R
 
K
S
 
R
N
 
N
L
 
V
P
 
E
-
 
H
-
 
W
L
 
I
D
 
G
N
 
H
P
 
E
A
 
N
V
 
F
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
G
 
H
D
|
D
V
|
V
A
 
V
D
 
E
A
x
P
A
x
L
L
x
Y
V
 
I
A
 
E
R
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
C
 
V
S
 
D
A
 
Q
V
 
I
A
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
S
V
 
P
A
|
A
S
 
S
V
x
P
Q
 
P
A
 
N
S
 
Y
V
 
M
D
 
Y
D
 
N
P
 
P
V
 
I
R
 
K
T
 
T
H
 
L
Q
 
K
S
x
T
N
 
N
F
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
N
|
N
V
 
M
C
 
L
E
x
G
A
x
L
M
 
A
R
x
K
Q
x
R
A
 
V
G
 
G
V
 
A
K
 
-
R
 
R
V
 
L
L
 
L
F
 
L
A
 
A
S
 
S
S
x
T
A
x
S
A
x
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
-
 
P
N
 
E
G
 
V
E
 
H
G
 
P
E
 
Q
S
 
S
I
 
E
D
 
D
-
 
Y
-
 
W
-
 
G
E
 
H
E
 
V
T
 
N
P
 
P
K
 
I
A
 
G
P
 
P
L
 
R
T
 
A
P
 
C
Y
|
Y
A
 
D
S
 
E
D
 
G
K
|
K
L
 
R
A
 
V
S
 
A
E
 
E
F
 
T
Y
 
M
F
 
C
D
 
Y
F
 
A
Y
|
Y
R
 
M
R
 
K
Q
 
Q
H
 
E
A
 
G
L
 
V
E
 
E
P
 
V
V
 
R
V
 
V
F
 
A
R
 
R
F
x
I
F
 
F
N
|
N
I
 
T
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
M
D
 
H
P
 
M
S
 
N
S
 
D
P
 
-
Y
 
-
S
 
G
G
x
R
V
|
V
I
 
V
S
 
S
I
x
N
F
 
F
S
 
I
E
 
L
R
 
Q
A
 
A
Q
 
L
K
 
Q
G
 
G
L
 
E
P
 
P
I
 
L
T
|
T
V
 
V
F
x
Y
G
 
G
D
 
S
G
 
G
E
 
S
Q
|
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
A
F
 
F
V
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
E
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
N
L
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
-
A
 
A
I
 
L
E
 
M
K
 
N
P
 
S
E
 
N
V
 
V
E
 
S
V
 
-
G
 
S
A
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
L
G
 
G
W
 
N
N
 
P
Q
 
E
A
 
E
T
 
H
T
 
T
L
x
I
K
 
L
Q
 
E
M
 
F
L
 
A
Q
 
Q
A
 
L
L
 
I
A
 
K
A
 
N
V
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
S
L
 
G
P
 
S
P
 
E
I
 
I
S
 
Q
Y
 
F
G
 
L
P
 
S
A
 
E
R
 
A
S
 
Q
G
 
D
D
|
D
I
 
P
R
 
Q
H
 
K
S
 
R
R
 
K
A
 
P
D
 
D
N
 
I
H
 
K
R
 
K
L
 
A
L
 
K
E
 
L
R
 
M
F
 
L
S
 
G
F
 
W
P
 
E
P
 
P
Q
 
V
T
 
V
P
 
P
M
 
L
S
 
E
V
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
N
R
 
K

Q8NBZ7 UDP-glucuronic acid decarboxylase 1; UDP-glucuronate decarboxylase 1; UGD; UXS-1; hUXS; hUXS1; EC 4.1.1.35 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
33% identity, 97% coverage: 6:305/309 of query aligns to 91:386/420 of Q8NBZ7

query
sites
Q8NBZ7
V
 
I
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
x
V
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
M
A
 
M
K
 
D
G
 
G
H
 
H
A
 
E
V
 
V
R
 
T
I
 
V
L
 
V
D
|
D
D
x
N
L
 
F
S
x
F
T
|
T
G
|
G
K
 
R
R
 
K
S
 
R
N
 
N
L
 
V
P
 
E
-
 
H
-
 
W
L
 
I
D
 
G
N
 
H
P
 
E
A
 
N
V
 
F
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
N
G
 
H
D
|
D
V
|
V
A
 
V
D
 
E
A
 
P
A
x
L
L
x
Y
V
 
I
A
 
E
R
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
C
 
V
S
 
D
A
 
Q
V
 
I
A
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
 
A
A
x
S
V
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
P
Q
 
P
A
 
N
S
 
Y
V
 
M
D
 
Y
D
 
N
P
 
P
V
 
I
R
 
K
T
 
T
H
 
L
Q
x
K
S
x
T
N
 
N
F
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
N
|
N
V
 
M
C
 
L
E
x
G
A
 
L
M
 
A
R
x
K
Q
x
R
A
 
V
G
 
G
V
 
A
K
 
-
R
 
R
V
 
L
L
 
L
F
 
L
A
|
A
S
 
S
S
 
T
A
 
S
A
x
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
-
 
P
N
 
E
G
 
V
E
 
H
G
 
P
E
 
Q
S
 
S
I
 
E
D
 
D
-
 
Y
-
 
W
-
 
G
E
 
H
E
 
V
T
 
N
P
 
P
K
 
I
A
 
G
P
 
P
L
 
R
T
 
A
P
 
C
Y
|
Y
A
 
D
S
 
E
D
 
G
K
|
K
L
x
R
A
 
V
S
 
A
E
 
E
F
 
T
Y
 
M
F
 
C
D
 
Y
F
 
A
Y
|
Y
R
 
M
R
 
K
Q
|
Q
H
x
E
A
 
G
L
 
V
E
 
E
P
 
V
V
 
R
V
 
V
F
 
A
R
 
R
F
 
I
F
 
F
N
 
N
I
x
T
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
R
 
R
Q
 
M
D
x
H
P
 
M
S
 
N
S
 
D
P
 
-
Y
 
-
S
 
G
G
x
R
V
 
V
I
 
V
S
 
S
I
 
N
F
 
F
S
 
I
E
 
L
R
 
Q
A
 
A
Q
 
L
K
 
Q
G
 
G
L
 
E
P
 
P
I
 
L
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
G
 
G
D
 
S
G
 
G
E
 
S
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
D
 
A
F
 
F
V
 
Q
Y
 
Y
V
 
V
E
 
S
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
N
L
 
G
L
 
L
V
 
V
Q
 
-
A
 
A
I
 
L
E
 
M
K
 
N
P
 
S
E
 
N
V
 
V
E
 
S
V
 
-
G
 
S
A
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
L
G
 
G
W
 
N
N
 
P
Q
 
E
A
 
E
T
 
H
T
 
T
L
 
I
K
 
L
Q
 
E
M
 
F
L
 
A
Q
 
Q
A
 
L
L
 
I
A
 
K
A
 
N
V
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
S
L
 
G
P
 
S
P
 
E
I
 
I
S
 
Q
Y
 
F
G
 
L
P
 
S
A
 
E
R
 
A
S
 
Q
G
 
D
D
 
D
I
 
P
R
 
Q
H
 
K
S
x
R
R
 
K
A
 
P
D
 
D
N
 
I
H
 
K
R
 
K
L
 
A
L
 
K
E
 
L
R
 
M
F
 
L
S
 
G
F
 
W
P
 
E
P
 
P
Q
 
V
T
 
V
P
 
P
M
 
L
S
 
E
V
 
E
G
 
G
L
 
L
A
 
N
R
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AO356_14875 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_14875
MAEGPVLITGGAGFIGSHLTDALLAKGHAVRILDDLSTGKRSNLPLDNPAVELIEGDVAD
AALVARAMAGCSAVAHLAAVASVQASVDDPVRTHQSNFIGTLNVCEAMRQAGVKRVLFAS
SAAVYGNNGEGESIDEETPKAPLTPYASDKLASEFYFDFYRRQHALEPVVFRFFNIYGPR
QDPSSPYSGVISIFSERAQKGLPITVFGDGEQTRDFVYVEDLVDLLVQAIEKPEVEVGAV
NVGWNQATTLKQMLQALAAVVGDLPPISYGPARSGDIRHSRADNHRLLERFSFPPQTPMS
VGLARLLGR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory