SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_16925 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_16925 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
49% identity, 88% coverage: 41:323/323 of query aligns to 41:327/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
E
 
E
A
 
K
L
 
V
P
 
K
H
 
D
V
 
V
H
 
D
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
T
-
x
M
V
x
L
G
 
S
R
 
E
K
 
R
L
 
I
G
 
D
R
 
Q
E
 
E
Q
 
V
L
 
F
Q
 
E
S
 
N
A
 
A
T
 
P
N
 
R
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
x
Y
S
x
A
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
E
Y
 
E
F
 
A
N
 
T
E
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
N
S
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
L
 
H
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
G
D
 
D
A
 
K
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
-
 
R
-
 
K
-
 
G
A
 
I
T
 
A
V
 
W
G
 
H
P
 
P
Q
 
K
L
 
W
F
 
F
-
 
L
G
 
G
S
 
Y
D
 
E
V
 
L
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
N
M
 
M
P
 
R
I
 
I
I
 
L
Y
 
Y
S
 
Y
G
x
S
N
x
R
S
 
T
R
 
R
K
 
K
T
 
S
E
 
Q
L
 
A
E
 
E
N
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
F
 
Y
R
 
R
E
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
L
 
V
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
I
L
 
L
V
x
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
E
 
K
K
 
E
T
|
T
R
 
M
H
 
Y
L
 
M
I
 
I
G
 
N
Q
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
N
 
G
R
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
E
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
S
L
 
L
K
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
N
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
L
R
 
I
S
 
A
A
 
F
L
 
K
L
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
I
P
 
P
Q
 
P
N
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
K
Q
 
E
V
 
V
W
 
I
K
 
K

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
51% identity, 83% coverage: 55:323/323 of query aligns to 55:326/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
K
 
K
L
 
I
G
 
D
R
 
R
E
 
E
Q
 
V
L
 
F
Q
 
D
S
 
A
A
 
A
T
 
P
N
 
R
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
Y
S
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
E
Y
 
E
F
 
A
N
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
S
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
W
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
G
D
 
D
A
 
K
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
-
 
R
-
 
R
-
 
G
A
 
I
T
 
A
V
 
W
G
 
H
P
 
P
Q
 
K
L
 
M
F
 
F
-
 
L
G
 
G
S
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
G
M
 
M
P
 
R
I
 
I
I
 
L
Y
 
Y
S
 
T
G
x
A
N
x
R
S
|
S
R
 
R
K
|
K
T
 
P
E
 
E
L
 
A
E
 
E
N
 
K
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
K
E
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
V
L
 
L
V
 
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
E
 
K
K
x
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
M
I
 
I
G
 
N
Q
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
R
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
V
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
A
 
A
L
 
L
I
 
I
E
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
N
 
G
R
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
E
 
D
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
A
L
 
L
K
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
N
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
I
S
 
A
A
 
F
L
 
K
L
 
N
G
 
G
E
 
E
R
 
V
P
 
P
Q
 
P
N
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
R
Q
 
E
V
 
V
W
 
L
K
 
K

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:323/323 of query aligns to 1:327/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
M
 
M
K
 
K
K
 
P
T
 
K
V
 
V
L
 
F
A
 
I
F
 
T
S
 
R
R
 
E
I
 
I
T
 
P
P
 
E
P
 
V
M
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
M
L
 
L
R
 
E
Q
 
D
D
 
E
F
 
F
E
 
E
V
 
V
I
 
E
V
 
V
P
 
W
N
 
G
P
 
D
S
 
E
H
 
K
G
 
E
D
 
I
I
 
P
N
 
R
A
 
E
Q
 
I
F
 
L
N
 
L
E
 
K
A
 
K
L
 
V
P
 
K
H
 
E
V
 
V
H
 
D
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
T
-
 
M
V
 
L
G
 
S
R
 
E
K
 
R
L
 
I
G
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
V
L
 
F
Q
 
E
S
 
N
A
 
A
T
 
P
N
 
K
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
Y
S
 
A
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
E
Y
 
E
F
 
A
N
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
S
 
A
T
|
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
G
D
 
D
A
 
R
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
A
 
V
T
 
A
V
 
W
G
 
H
P
 
P
Q
 
K
L
 
W
F
 
F
-
 
L
G
 
G
S
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
N
M
 
M
P
 
R
I
 
I
I
 
L
Y
 
Y
S
 
Y
G
x
S
N
x
R
S
x
T
R
 
R
K
 
K
T
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
E
N
 
R
Q
 
E
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
K
E
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
V
L
 
L
V
x
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
S
 
T
E
 
R
K
 
E
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
G
 
N
Q
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
N
 
G
R
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
E
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
L
 
L
K
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
N
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
I
S
 
A
A
 
F
L
 
K
L
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
I
P
 
P
Q
 
P
N
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
R
Q
 
E
V
 
V
W
 
I
K
 
K

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
45% identity, 100% coverage: 1:323/323 of query aligns to 1:327/334 of O58320

query
sites
O58320
M
 
M
K
 
K
K
 
P
T
 
K
V
 
V
L
 
F
A
 
I
F
 
T
S
 
R
R
 
E
I
 
I
T
 
P
P
 
E
P
 
V
M
 
G
I
 
I
E
 
K
R
 
M
L
 
L
R
 
E
Q
 
D
D
 
E
F
 
F
E
 
E
V
 
V
I
 
E
V
 
V
P
 
W
N
 
G
P
 
D
S
 
E
H
 
K
G
 
E
D
 
I
I
 
P
N
 
R
A
 
E
Q
 
I
F
 
L
N
 
L
E
 
K
A
 
K
L
 
V
P
 
K
H
 
E
V
 
V
H
 
D
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
T
-
 
M
V
 
L
G
 
S
R
 
E
K
 
R
L
 
I
G
 
D
R
 
K
E
 
E
Q
 
V
L
 
F
Q
 
E
S
 
N
A
 
A
T
 
P
N
 
K
L
 
L
Q
 
R
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
Y
S
 
A
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
E
Y
 
E
F
 
A
N
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
Y
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
S
 
A
T
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
R
R
 
H
V
 
V
A
 
V
E
 
K
L
 
G
D
 
D
A
 
R
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
K
-
 
K
-
 
R
-
 
G
A
 
V
T
 
A
V
 
W
G
 
H
P
 
P
Q
 
K
L
 
W
F
 
F
-
 
L
G
 
G
S
 
Y
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
R
G
 
A
R
 
K
L
 
-
G
 
G
F
 
F
N
 
N
M
 
M
P
 
R
I
 
I
I
 
L
Y
 
Y
S
 
Y
G
x
S
N
x
R
S
x
T
R
 
R
K
 
K
T
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
E
N
 
R
Q
 
E
L
 
L
G
 
N
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
K
E
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
R
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
V
L
 
L
V
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
R
K
 
E
T
 
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
G
 
N
Q
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
x
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
N
 
G
R
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
Y
E
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
F
 
F
Q
 
K
L
 
L
K
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
N
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
A
D
 
K
N
 
N
L
 
L
R
 
I
S
 
A
A
 
F
L
 
K
L
 
R
G
 
G
E
 
E
R
 
I
P
 
P
Q
 
P
N
 
T
L
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
R
Q
 
E
V
 
V
W
 
I
K
 
K

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
41% identity, 78% coverage: 59:311/323 of query aligns to 58:304/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
E
 
E
Q
 
L
L
 
I
Q
 
D
S
 
A
A
 
L
T
 
P
N
 
K
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
F
S
 
S
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
K
Y
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
I
Y
 
K
F
 
C
N
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
M
 
R
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
S
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
M
 
L
S
 
A
S
 
V
A
 
L
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
C
E
 
E
L
 
C
D
 
D
A
 
K
W
 
Y
T
 
V
K
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
Q
 
K
A
 
-
T
 
-
V
 
F
G
 
G
P
 
D
Q
 
F
L
 
K
F
 
L
G
 
T
S
 
T
D
 
K
V
 
F
H
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
A
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
D
M
 
C
P
 
P
I
 
I
I
 
S
Y
 
Y
S
 
F
G
x
S
N
x
R
S
|
S
R
 
K
K
 
K
T
 
P
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
N
Q
 
T
L
 
N
G
 
Y
A
 
T
Q
 
Y
F
 
Y
R
 
G
E
 
S
L
 
V
D
 
V
Q
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
S
E
 
N
A
 
S
D
 
D
F
 
I
V
 
L
C
 
V
L
 
V
V
 
A
V
x
C
P
|
P
L
 
L
S
 
T
E
 
P
K
 
E
T
|
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
G
 
N
Q
 
R
R
 
E
E
 
V
L
 
I
G
 
D
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
N
 
E
N
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
E
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
K
L
 
L
F
 
F
Q
 
G
L
 
L
K
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
|
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
H
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
E
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
N
 
D
L
 
L
A
 
V
V
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
S
 
A
A
 
H
L
 
F
L
 
S
G
 
G
E
 
K

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
41% identity, 78% coverage: 59:311/323 of query aligns to 60:306/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
E
 
E
Q
 
L
L
 
I
Q
 
D
S
 
A
A
 
L
T
 
P
N
 
K
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
S
S
 
S
V
 
F
S
 
S
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
K
Y
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
I
Y
 
K
F
 
C
N
 
E
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
M
 
R
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
S
 
D
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
I
M
 
L
S
 
A
S
 
V
A
 
L
R
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
C
E
 
E
L
 
C
D
 
D
A
 
K
W
 
Y
T
 
V
K
 
R
A
 
R
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
Q
 
K
A
 
-
T
 
-
V
 
F
G
 
G
P
 
D
Q
 
F
L
 
K
F
 
L
G
 
T
S
 
T
D
 
K
V
 
F
H
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
R
 
R
G
 
A
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
D
M
 
C
P
 
P
I
 
I
I
 
S
Y
 
Y
S
 
F
G
x
S
N
x
R
S
|
S
R
 
K
K
 
K
T
 
P
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
N
Q
 
T
L
 
N
G
 
Y
A
 
T
Q
 
Y
F
 
Y
R
 
G
E
 
S
L
 
V
D
 
V
Q
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
S
E
 
N
A
 
S
D
 
D
F
 
I
V
 
L
C
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
C
P
 
P
L
 
L
S
 
T
E
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
T
H
 
H
L
 
I
I
 
I
G
 
N
Q
 
R
R
 
E
E
 
V
L
 
I
G
 
D
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
G
R
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
V
E
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
V
N
 
E
N
 
G
R
 
R
I
 
L
R
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
E
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
K
L
 
L
F
 
F
Q
 
G
L
 
L
K
 
E
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
 
H
I
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
H
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
E
 
K
A
 
V
M
 
M
A
 
A
N
 
D
L
 
L
A
 
V
V
 
V
D
 
G
N
 
N
L
 
L
R
 
E
S
 
A
A
 
H
L
 
F
L
 
S
G
 
G
E
 
K

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
41% identity, 77% coverage: 63:311/323 of query aligns to 71:320/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
S
 
A
A
 
G
T
 
A
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
S
S
 
T
V
 
M
S
 
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
N
 
H
Y
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
D
Y
 
E
F
 
I
N
 
K
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
R
L
 
V
T
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
 
D
S
 
T
T
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
T
S
 
T
A
 
C
R
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
A
D
 
I
A
 
E
W
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
N
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
Q
 
T
A
 
S
T
 
W
V
 
K
G
 
P
P
 
L
Q
 
W
L
 
L
F
 
C
G
 
G
S
 
Y
D
 
G
V
 
L
H
 
T
G
 
Q
K
 
S
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
K
L
 
P
G
 
F
F
 
G
N
 
V
M
 
Q
P
 
R
I
 
F
I
 
L
Y
 
Y
S
 
T
G
 
G
N
x
R
S
x
Q
R
x
P
K
x
R
T
 
P
E
 
E
L
 
E
E
 
A
N
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
Q
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
V
E
 
S
L
 
T
D
 
P
Q
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
V
L
 
V
V
 
A
V
 
C
P
x
S
L
 
L
S
 
T
E
 
P
K
 
A
T
 
T
R
 
E
H
 
G
L
 
L
I
 
C
G
 
N
Q
 
K
R
 
D
E
 
F
L
 
F
G
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
N
 
S
N
 
G
R
 
K
I
 
I
R
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
T
E
 
S
K
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
L
-
 
P
A
 
T
E
 
N
S
 
H
P
 
P
L
 
L
F
 
L
Q
 
T
L
 
L
K
 
K
N
 
N
A
 
C
V
 
V
T
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
|
I
G
|
G
S
|
S
A
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
N
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
A
D
 
N
N
 
N
L
 
L
R
 
L
S
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
R
G
 
G
E
 
E

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
41% identity, 77% coverage: 63:311/323 of query aligns to 67:316/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
S
 
A
A
 
G
T
 
A
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
S
S
 
T
V
 
M
S
|
S
V
|
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
N
 
H
Y
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
D
Y
 
E
F
 
I
N
 
K
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
R
L
 
V
T
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
D
S
 
T
T
|
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
S
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
T
S
 
T
A
 
C
R
 
R
R
 
R
V
 
L
A
 
P
E
 
E
L
 
A
D
 
I
A
 
E
W
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
N
G
 
G
Q
 
G
W
 
W
Q
 
T
A
 
S
T
 
W
V
 
K
G
 
P
P
 
L
Q
 
W
L
 
L
F
 
C
G
 
G
S
 
Y
D
 
G
V
 
L
H
 
T
G
 
Q
K
 
S
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
M
 
L
G
|
G
N
 
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
K
L
 
P
G
 
F
F
 
G
N
 
V
M
 
Q
P
 
R
I
 
F
I
 
L
Y
 
Y
S
 
T
G
|
G
N
x
R
S
 
Q
R
 
P
K
x
R
T
 
P
E
 
E
L
 
E
E
 
A
N
 
A
Q
 
E
L
 
F
G
 
Q
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
R
 
V
E
 
S
L
 
T
D
 
P
Q
 
E
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
V
L
 
V
V
 
A
V
x
C
P
x
S
L
 
L
S
 
T
E
 
P
K
 
A
T
|
T
R
 
E
H
 
G
L
 
L
I
 
C
G
 
N
Q
 
K
R
 
D
E
 
F
L
 
F
G
 
Q
L
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
E
S
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
A
 
D
L
 
L
I
 
Y
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
N
 
S
N
 
G
R
 
K
I
 
I
R
 
A
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
T
E
 
S
K
 
P
E
|
E
P
 
P
L
 
L
-
 
P
A
 
T
E
 
N
S
 
H
P
 
P
L
 
L
F
 
L
Q
 
T
L
 
L
K
 
K
N
 
N
A
 
C
V
 
V
T
 
I
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
T
M
 
M
A
 
S
N
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
A
D
 
N
N
 
N
L
 
L
R
 
L
S
 
A
A
 
G
L
 
L
L
 
R
G
 
G
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
36% identity, 94% coverage: 2:306/323 of query aligns to 1:297/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
K
 
R
K
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
P
S
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
N
P
 
P
P
 
R
M
 
V
I
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
P
Q
 
E
D
 
M
F
 
F
E
 
E
V
 
T
I
 
V
-
 
R
V
 
I
P
 
E
N
 
R
P
 
A
S
 
D
H
 
A
G
 
A
D
 
L
I
 
V
N
 
T
A
 
A
Q
 
D
F
 
M
N
 
R
E
 
D
A
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
V
H
 
S
G
 
G
L
 
-
I
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
P
R
 
V
E
 
P
Q
 
L
L
 
M
Q
 
D
S
 
A
A
 
F
T
 
P
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
F
S
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
S
Y
 
R
F
 
A
N
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
S
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
N
S
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
A
D
 
E
A
 
Q
W
 
W
T
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
Q
 
V
A
 
R
T
 
E
V
 
G
G
 
A
P
 
F
Q
 
P
L
 
L
F
 
S
G
 
P
S
 
L
D
 
S
V
 
L
H
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
V
P
 
S
I
 
I
I
 
A
Y
 
Y
S
 
H
G
x
T
N
x
R
S
 
T
R
 
P
K
 
R
T
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
E
Q
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
Q
 
T
F
 
Y
R
 
H
E
 
P
L
 
T
D
 
L
Q
 
V
L
 
G
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
D
 
D
F
 
T
V
 
L
C
 
I
L
 
V
V
 
I
V
 
V
P
|
P
L
 
G
S
 
T
E
 
A
K
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
A
R
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
 
V
S
 
G
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
N
 
G
R
 
T
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
S
L
 
F
K
 
P
N
 
N
A
 
V
V
 
S
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
N
 
D
L
 
L
A
 
V
V
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
A

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
36% identity, 94% coverage: 2:306/323 of query aligns to 1:297/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
K
 
R
K
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
P
S
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
N
P
 
P
P
 
R
M
 
V
I
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
P
Q
 
E
D
 
M
F
 
F
E
 
E
V
 
T
I
 
V
-
 
R
V
 
I
P
 
E
N
 
R
P
 
A
S
 
D
H
 
A
G
 
A
D
 
L
I
 
V
N
 
T
A
 
A
Q
 
D
F
 
M
N
 
R
E
 
D
A
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
V
H
 
S
G
 
G
L
 
-
I
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
P
R
 
V
E
 
P
Q
 
L
L
 
M
Q
 
D
S
 
A
A
 
F
T
 
P
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
F
S
x
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
S
Y
 
R
F
 
A
N
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
S
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
N
S
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
A
D
 
E
A
 
Q
W
 
W
T
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
Q
 
V
A
 
R
T
 
E
V
 
G
G
 
A
P
 
F
Q
 
P
L
 
L
F
 
S
G
 
P
S
 
L
D
 
S
V
 
L
H
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
V
P
 
S
I
 
I
I
 
A
Y
 
Y
S
 
H
G
x
T
N
x
R
S
 
T
R
 
P
K
 
R
T
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
E
Q
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
Q
 
T
F
 
Y
R
 
H
E
 
P
L
 
T
D
 
L
Q
 
V
L
 
G
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
D
 
D
F
 
T
V
 
L
C
 
I
L
 
V
V
 
I
V
|
V
P
|
P
L
 
G
S
 
T
E
 
A
K
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
A
R
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
N
 
G
R
 
T
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
S
L
 
F
K
 
P
N
 
N
A
 
V
V
 
S
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
N
 
D
L
 
L
A
 
V
V
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
A

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
36% identity, 94% coverage: 2:306/323 of query aligns to 2:298/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
K
 
R
K
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
P
S
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
N
P
 
P
P
 
R
M
 
V
I
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
P
Q
 
E
D
 
M
F
 
F
E
 
E
V
 
T
I
 
V
-
 
R
V
 
I
P
 
E
N
 
R
P
 
A
S
 
D
H
 
A
G
 
A
D
 
L
I
 
V
N
 
T
A
 
A
Q
 
D
F
 
M
N
 
R
E
 
D
A
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
V
H
 
S
G
 
G
L
 
-
I
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
P
R
 
V
E
 
P
Q
 
L
L
 
M
Q
 
D
S
 
A
A
 
F
T
 
P
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
F
S
x
G
V
|
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
S
Y
 
R
F
 
A
N
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
S
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
N
S
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
A
D
 
E
A
 
Q
W
 
W
T
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
Q
 
V
A
 
R
T
 
E
V
 
G
G
 
A
P
 
F
Q
 
P
L
 
L
F
 
S
G
 
P
S
 
L
D
 
S
V
 
L
H
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
 
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
V
P
 
S
I
 
I
I
 
A
Y
 
Y
S
 
H
G
x
T
N
x
R
S
 
T
R
 
P
K
 
R
T
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
E
Q
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
Q
 
T
F
 
Y
R
 
H
E
 
P
L
 
T
D
 
L
Q
 
V
L
 
G
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
D
 
D
F
 
T
V
 
L
C
 
I
L
 
V
V
 
I
V
|
V
P
|
P
L
 
G
S
 
T
E
 
A
K
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
A
R
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
N
 
G
R
 
T
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
S
L
 
F
K
 
P
N
 
N
A
 
V
V
 
S
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
|
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
|
R
E
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
N
 
D
L
 
L
A
 
V
V
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
A

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
36% identity, 94% coverage: 2:306/323 of query aligns to 3:299/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
K
 
R
K
 
P
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
V
F
 
P
S
 
G
R
 
K
I
 
I
T
 
N
P
 
P
P
 
R
M
 
V
I
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
R
 
P
Q
 
E
D
 
M
F
 
F
E
 
E
V
 
T
I
 
V
-
 
R
V
 
I
P
 
E
N
 
R
P
 
A
S
 
D
H
 
A
G
 
A
D
 
L
I
 
V
N
 
T
A
 
A
Q
 
D
F
 
M
N
 
R
E
 
D
A
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
-
V
 
V
H
 
S
G
 
G
L
 
-
I
 
I
G
 
A
V
 
V
G
 
S
R
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
P
R
 
V
E
 
P
Q
 
L
L
 
M
Q
 
D
S
 
A
A
 
F
T
 
P
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
N
V
 
F
S
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
N
 
G
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
S
Y
 
R
F
 
A
N
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
 
E
S
 
E
T
x
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
N
S
 
T
A
 
L
R
 
R
R
 
L
V
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
A
D
 
E
A
 
Q
W
 
W
T
 
L
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
Q
 
V
A
 
R
T
 
E
V
 
G
G
 
A
P
 
F
Q
 
P
L
 
L
F
 
S
G
 
P
S
 
L
D
 
S
V
 
L
H
 
R
G
 
G
K
 
R
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
V
x
F
G
 
G
M
x
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
L
R
 
E
L
 
-
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
V
P
 
S
I
 
I
I
 
A
Y
 
Y
S
 
H
G
x
T
N
x
R
S
 
T
R
 
P
K
 
R
T
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
E
Q
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
F
Q
 
T
F
 
Y
R
 
H
E
 
P
L
 
T
D
 
L
Q
 
V
L
 
G
L
 
M
A
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
D
 
D
F
 
T
V
 
L
C
 
I
L
 
V
V
 
I
V
|
V
P
|
P
L
 
G
S
 
T
E
 
A
K
x
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
L
 
A
I
 
V
G
 
N
Q
 
A
R
 
D
E
 
V
L
 
L
G
 
S
L
 
A
M
 
L
K
 
G
P
 
P
S
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
N
 
G
R
 
T
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
N
E
|
E
P
 
P
L
 
N
A
 
V
E
 
P
S
 
E
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
S
L
 
F
K
 
P
N
 
N
A
 
V
V
 
S
T
 
L
L
 
L
P
 
P
H
|
H
I
 
V
G
x
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
H
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
E
 
N
A
 
A
M
 
M
A
 
S
N
 
D
L
 
L
A
 
V
V
 
V
D
 
D
N
 
N
L
 
L
R
 
K
S
 
A

4e5pA Thermostable phosphite dehydrogenase a176r variant in complex with nad (see paper)
36% identity, 80% coverage: 61:318/323 of query aligns to 62:326/332 of 4e5pA

query
sites
4e5pA
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
A
 
C
T
 
P
N
 
E
L
 
L
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
S
 
G
S
 
C
V
 
A
S
 
L
V
x
K
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
A
 
D
Y
 
A
F
 
C
N
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
M
 
W
L
 
L
T
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
L
L
|
L
T
 
T
E
 
V
S
 
P
T
|
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
A
M
 
V
S
 
G
S
 
L
A
 
G
R
 
R
R
 
H
V
 
L
A
 
R
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
-
 
F
-
 
R
-
 
G
W
 
W
Q
 
Q
A
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
P
Q
 
R
L
 
F
F
 
Y
G
 
G
S
 
T
D
 
G
V
 
L
H
 
D
G
 
N
K
 
A
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
F
V
 
L
G
 
G
M
 
M
G
|
G
N
x
A
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
G
 
L
R
 
Q
L
 
-
G
 
G
F
 
W
N
 
G
M
 
A
P
 
T
I
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
S
 
H
G
x
A
-
x
R
N
 
K
S
 
A
R
 
L
K
 
D
T
 
T
E
 
Q
L
 
T
E
 
E
N
 
Q
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
F
 
Q
R
 
V
E
 
A
L
 
C
D
 
S
Q
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
L
L
 
L
V
 
A
V
x
L
P
|
P
L
 
L
S
 
N
E
 
A
K
 
D
T
|
T
R
 
L
H
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
N
Q
 
A
R
 
E
E
 
L
L
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
V
K
 
R
P
 
P
S
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
P
S
x
C
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
N
 
R
N
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
M
E
|
E
P
 
D
L
 
W
A
 
A
E
 
R
S
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
P
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
A
L
 
H
K
 
P
N
 
N
A
 
T
V
 
L
T
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
 
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
H
 
R
E
 
A
T
 
V
R
 
R
E
 
L
A
 
E
M
 
I
A
 
E
N
 
R
L
 
C
A
 
A
V
 
A
D
 
Q
N
 
N
L
 
I
R
 
L
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
I
N
 
N
L
 
A
V
 
V
N
 
N

4e5mA Thermostable phosphite dehydrogenase e175a/a176r in complex with NADP (see paper)
36% identity, 80% coverage: 61:318/323 of query aligns to 62:326/329 of 4e5mA

query
sites
4e5mA
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
A
 
C
T
 
P
N
 
E
L
 
L
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
S
 
G
S
 
C
V
 
A
S
 
L
V
x
K
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
A
 
D
Y
 
A
F
 
C
N
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
M
 
W
L
 
L
T
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
L
L
|
L
T
 
T
E
 
V
S
 
P
T
|
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
A
M
 
V
S
 
G
S
 
L
A
 
G
R
 
R
R
 
H
V
 
L
A
 
R
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
-
 
F
-
 
R
-
 
G
W
 
W
Q
 
Q
A
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
P
Q
 
R
L
 
F
F
 
Y
G
 
G
S
 
T
D
 
G
V
 
L
H
 
D
G
 
N
K
 
A
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
F
V
 
L
G
 
G
M
 
M
G
|
G
N
x
A
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
G
 
L
R
 
Q
L
 
-
G
 
G
F
 
W
N
 
G
M
 
A
P
 
T
I
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
S
 
H
G
 
A
-
x
R
N
 
K
S
 
A
R
 
L
K
 
D
T
 
T
E
 
Q
L
 
T
E
 
E
N
 
Q
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
F
 
Q
R
 
V
E
 
A
L
 
C
D
 
S
Q
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
L
L
 
L
V
 
A
V
x
L
P
|
P
L
 
L
S
 
N
E
 
A
K
 
D
T
|
T
R
 
L
H
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
N
Q
 
A
R
 
E
E
 
L
L
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
V
K
 
R
P
 
P
S
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
P
S
x
C
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
N
 
R
N
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
M
E
|
E
P
 
D
L
 
W
A
 
A
E
 
R
S
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
P
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
A
L
 
H
K
 
P
N
 
N
A
 
T
V
 
L
T
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
H
 
R
E
 
A
T
 
V
R
 
R
E
 
L
A
 
E
M
 
I
A
 
E
N
 
R
L
 
C
A
 
A
V
 
A
D
 
Q
N
 
N
L
 
I
R
 
L
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
I
N
 
N
L
 
A
V
 
V
N
 
N

8wpiA Anabaena mcyi with prebound NAD and soaked NADP
33% identity, 88% coverage: 38:322/323 of query aligns to 33:318/318 of 8wpiA

query
sites
8wpiA
Q
 
Q
F
 
I
N
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
H
 
D
V
 
V
H
 
S
G
 
G
L
 
V
-
 
F
I
 
V
G
 
R
V
x
Y
G
 
P
R
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
D
R
 
A
E
 
Q
Q
 
A
L
 
I
Q
 
G
S
 
L
A
 
A
T
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
S
S
 
T
V
x
S
S
x
G
V
x
F
G
|
G
Y
 
T
D
 
D
N
 
A
Y
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
A
Y
 
A
F
 
A
N
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
N
P
 
P
D
 
G
V
 
L
L
 
S
T
 
T
E
 
T
S
 
A
T
x
V
A
 
T
D
 
E
L
 
H
A
 
T
F
 
L
A
 
S
L
 
M
L
 
I
M
 
L
S
 
A
S
x
L
A
 
A
R
 
K
R
x
K
V
 
L
A
 
T
E
x
F
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
W
 
C
T
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
N
W
 
Y
Q
 
-
A
 
-
T
 
L
V
 
I
G
 
R
P
 
N
Q
 
Q
L
 
V
F
 
Q
G
 
P
S
 
I
D
 
Q
V
 
L
H
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
M
 
L
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
S
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
K
R
 
I
G
 
C
R
 
S
L
 
T
G
 
A
F
 
L
N
 
Q
M
 
M
P
 
R
I
 
V
I
 
L
-
 
A
Y
|
Y
S
x
D
G
x
P
N
x
Y
S
 
V
R
 
P
K
 
S
T
 
G
E
 
K
L
 
A
E
 
D
N
 
T
Q
 
V
L
 
R
G
 
A
A
 
T
Q
 
L
F
 
V
R
 
Q
E
 
D
L
 
L
D
 
D
Q
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
T
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
S
L
 
L
V
x
H
V
x
P
P
x
E
L
 
L
S
 
T
E
 
D
K
x
E
T
|
T
R
 
C
H
 
E
L
 
M
I
 
F
G
 
D
Q
 
L
R
 
E
E
 
A
L
 
F
G
 
K
L
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
I
x
F
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
R
E
 
Q
P
 
P
A
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
I
Q
 
R
N
 
E
N
 
K
R
 
L
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
P
A
 
A
-
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Q
 
E
L
 
F
K
x
D
N
|
N
A
 
V
V
 
I
T
 
F
L
 
S
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
A
S
 
G
A
x
V
T
|
T
H
 
P
E
 
E
T
 
A
R
x
G
E
 
M
A
 
A
M
 
A
A
 
A
N
 
L
L
 
S
A
 
A
V
 
A
D
 
N
N
 
Q
L
 
I
R
 
L
S
 
Q
A
 
V
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
P
 
P
Q
 
P
N
 
Y
L
 
I
V
 
I
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
W
 
W

Sites not aligning to the query:

4e5kA Thermostable phosphite dehydrogenase in complex with NAD and sulfite (see paper)
36% identity, 80% coverage: 61:318/323 of query aligns to 62:326/329 of 4e5kA

query
sites
4e5kA
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
A
 
C
T
 
P
N
 
E
L
 
L
Q
 
R
V
 
V
V
 
I
S
 
G
S
 
C
V
 
A
S
x
L
V
x
K
G
|
G
Y
 
F
D
 
D
N
 
N
Y
 
F
D
 
D
L
 
V
A
 
D
Y
 
A
F
 
C
N
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
M
 
W
L
 
L
T
 
T
N
 
F
T
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
L
L
|
L
T
 
T
E
 
V
S
 
P
T
|
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
A
M
 
V
S
 
G
S
 
L
A
 
G
R
 
R
R
 
H
V
 
L
A
 
R
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
F
T
 
V
K
 
R
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
-
 
F
-
 
R
-
 
G
W
 
W
Q
 
Q
A
 
-
T
 
-
V
 
-
G
 
-
P
 
P
Q
 
R
L
 
F
F
 
Y
G
 
G
S
 
T
D
 
G
V
 
L
H
 
D
G
 
N
K
 
A
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
F
V
 
L
G
|
G
M
 
M
G
|
G
N
x
A
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
A
I
 
M
A
 
A
R
 
D
R
 
R
G
 
L
R
 
Q
L
 
-
G
 
G
F
 
W
N
 
G
M
 
A
P
 
T
I
 
L
I
 
Q
Y
 
Y
-
x
H
S
x
E
G
x
A
N
 
K
S
 
A
R
 
L
K
 
D
T
 
T
E
 
Q
L
 
T
E
 
E
N
 
Q
Q
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
L
Q
 
R
F
 
Q
R
 
V
E
 
A
L
 
C
D
 
S
Q
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
L
L
 
L
V
x
A
V
x
L
P
|
P
L
 
L
S
 
N
E
 
A
K
 
D
T
 
T
R
 
L
H
 
H
L
 
L
I
 
V
G
 
N
Q
 
A
R
 
E
E
 
L
L
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
V
K
 
R
P
 
P
S
 
G
A
 
A
I
 
L
L
 
L
V
 
V
N
 
N
I
x
P
S
x
C
R
|
R
G
 
G
P
 
S
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
L
E
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
N
 
R
N
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
G
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
A
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
M
E
|
E
P
 
D
L
 
W
A
 
A
E
 
R
S
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
P
P
 
A
L
 
L
F
 
L
Q
 
A
L
 
H
K
 
P
N
 
N
A
 
T
V
 
L
T
 
F
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
S
A
 
A
T
 
V
H
 
R
E
 
A
T
 
V
R
 
R
E
 
L
A
 
E
M
 
I
A
 
E
N
 
R
L
 
C
A
 
A
V
 
A
D
 
Q
N
 
N
L
 
I
R
 
L
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
I
N
 
N
L
 
A
V
 
V
N
 
N

Sites not aligning to the query:

8wprA Anabaena mcyi r166a with prebound NAD and malate
33% identity, 88% coverage: 38:322/323 of query aligns to 35:320/320 of 8wprA

query
sites
8wprA
Q
 
Q
F
 
I
N
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
I
P
 
Q
H
 
D
V
 
V
H
 
S
G
 
G
L
 
V
-
 
F
I
 
V
G
 
R
V
 
Y
G
 
P
R
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
D
R
 
A
E
 
Q
Q
 
A
L
 
I
Q
 
G
S
 
L
A
 
A
T
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
S
S
 
T
V
 
S
S
 
G
V
 
F
G
 
G
Y
 
T
D
 
D
N
 
A
Y
 
I
D
 
D
L
 
I
A
 
A
Y
 
A
F
 
A
N
 
T
E
 
K
R
 
R
G
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
N
P
 
P
D
 
G
V
 
L
L
x
S
T
 
T
E
 
T
S
 
A
T
x
V
A
 
T
D
 
E
L
 
H
A
 
T
F
 
L
A
 
S
L
 
M
L
 
I
M
 
L
S
 
A
S
 
L
A
 
A
R
 
K
R
 
K
V
 
L
A
 
T
E
 
F
L
 
L
D
 
N
A
 
Q
W
 
C
T
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
N
W
 
Y
Q
 
-
A
 
-
T
 
L
V
 
I
G
 
R
P
 
N
Q
 
Q
L
 
V
F
 
Q
G
 
P
S
 
I
D
 
Q
V
 
L
H
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
L
G
|
G
N
x
A
I
|
I
G
 
G
A
 
S
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
K
R
 
I
G
 
C
R
 
S
L
 
T
G
 
A
F
 
L
N
 
Q
M
 
M
P
 
R
I
 
V
I
 
L
-
 
A
Y
|
Y
S
x
D
G
x
P
N
x
Y
S
 
V
R
 
P
K
 
S
T
 
G
E
 
K
L
 
A
E
 
D
N
 
T
Q
 
V
L
 
R
G
 
A
A
 
T
Q
 
L
F
 
V
R
 
Q
E
 
D
L
 
L
D
 
D
Q
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
T
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
C
 
S
L
 
L
V
 
H
V
x
P
P
x
E
L
 
L
S
 
T
E
 
D
K
x
E
T
|
T
R
 
C
H
 
E
L
 
M
I
 
F
G
 
D
Q
 
L
R
 
E
E
 
A
L
 
F
G
 
K
L
 
K
M
 
M
K
 
K
P
 
P
S
 
S
A
 
A
I
 
F
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
P
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
R
E
 
Q
P
 
P
A
 
D
L
 
L
I
 
V
E
 
T
A
 
A
L
 
I
Q
 
R
N
 
E
N
 
K
R
 
L
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
I
D
 
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
P
E
 
E
P
 
P
L
 
P
A
 
A
-
 
I
E
 
N
S
 
N
P
 
P
L
 
L
F
 
Y
Q
 
E
L
 
F
K
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
I
T
 
F
L
 
S
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
A
S
x
G
A
 
V
T
 
T
H
 
P
E
 
E
T
 
A
R
 
G
E
 
M
A
 
A
M
 
A
A
 
A
N
 
L
L
 
S
A
 
A
V
 
A
D
 
N
N
 
Q
L
 
I
R
 
L
S
 
Q
A
 
V
L
 
L
L
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
K
P
 
P
Q
 
P
N
 
Y
L
 
I
V
 
I
N
 
N
P
 
P
Q
 
K
V
 
V
W
 
W

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
41% identity, 74% coverage: 55:294/323 of query aligns to 52:288/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
K
 
K
L
 
V
G
 
T
R
 
R
E
 
R
Q
 
V
L
 
I
Q
 
E
S
 
S
A
 
A
T
 
P
N
 
K
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
A
S
 
R
V
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
E
Y
 
A
F
 
A
N
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
I
M
 
E
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
A
V
 
A
L
x
S
T
 
S
E
 
R
S
 
S
T
x
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
F
 
V
A
 
G
L
 
L
L
 
M
M
 
F
S
 
S
S
 
V
A
 
A
R
 
R
R
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
F
L
 
A
D
 
D
A
 
R
W
 
K
T
 
M
K
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
V
W
 
W
Q
 
A
A
 
K
T
 
K
V
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
E
L
 
A
F
 
M
G
 
G
S
 
I
D
 
E
V
 
L
H
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
M
x
F
G
|
G
N
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
R
 
K
R
 
I
G
 
A
R
 
N
-
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
M
N
 
N
M
 
I
P
 
-
I
 
L
I
 
L
Y
|
Y
S
x
D
G
x
P
N
 
Y
S
 
P
R
 
N
K
 
E
T
 
-
E
 
E
L
 
R
E
 
A
N
 
K
Q
 
E
L
 
V
G
 
N
A
 
G
Q
 
K
F
 
F
R
 
V
E
 
D
L
 
L
D
 
E
Q
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
V
V
 
V
C
 
T
L
 
I
V
 
H
V
|
V
P
|
P
L
 
L
S
 
V
E
 
E
K
 
S
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
G
 
N
Q
 
E
R
 
E
E
 
R
L
 
L
G
 
K
L
 
L
M
 
M
K
 
K
P
 
K
S
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
|
S
R
|
R
G
 
G
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
A
 
A
L
 
L
I
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
N
 
E
N
 
G
R
 
W
I
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
E
K
 
E
E
|
E
P
 
P
L
 
L
-
 
P
A
 
K
E
 
D
S
 
H
P
 
P
L
 
L
F
 
T
Q
 
K
L
 
F
K
 
D
N
 
N
A
 
V
V
 
V
T
 
L
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
G
|
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
V
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
E
 
E

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:318/323 of query aligns to 4:311/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
V
 
V
L
 
L
A
 
I
F
 
A
S
 
D
R
 
K
I
 
L
T
 
A
P
 
P
P
 
S
M
 
T
I
 
V
E
 
A
R
 
A
L
 
L
R
 
G
Q
 
D
D
 
Q
F
 
V
E
 
E
V
 
V
-
 
R
I
 
W
V
 
V
P
 
D
N
 
G
P
 
P
S
 
D
H
 
R
G
 
D
D
 
K
I
 
L
N
 
L
A
 
A
Q
 
A
F
 
V
N
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
D
P
 
A
H
 
L
V
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
L
I
 
V
G
 
R
V
 
S
G
 
A
R
 
T
K
 
T
L
 
V
G
 
D
R
 
A
E
 
E
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
P
N
 
K
L
 
L
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
 
R
V
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
D
Y
 
A
F
 
A
N
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
M
 
L
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
T
V
 
S
L
x
N
T
 
I
E
 
H
S
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
H
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
S
T
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
H
Q
 
T
W
 
W
Q
 
K
A
 
R
T
 
S
V
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
S
L
 
F
F
 
S
G
 
G
S
 
T
D
 
E
V
 
I
H
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
G
 
-
R
 
I
L
 
A
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
A
P
 
Y
I
 
V
I
 
V
Y
 
A
S
 
Y
G
 
D
N
 
P
S
 
Y
R
 
V
K
 
S
T
 
P
E
 
A
L
 
R
E
 
A
N
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
I
Q
 
E
F
 
L
R
 
L
E
 
S
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
S
L
 
V
V
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
S
 
T
E
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
Q
 
K
R
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
S
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
N
 
G
N
 
G
R
 
H
I
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
A
K
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
A
 
T
E
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
K
 
A
N
 
Q
A
 
V
V
 
V
T
 
V
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
H
 
A
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
E
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
N
 
T
L
 
D
A
 
V
V
 
A
D
 
E
N
 
S
L
 
V
R
 
R
S
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
F
P
 
V
Q
 
P
N
 
D
L
 
A
V
 
V
N
 
N

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:318/323 of query aligns to 5:312/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
V
 
V
L
 
L
A
 
I
F
 
A
S
 
D
R
 
K
I
 
L
T
 
A
P
 
P
P
 
S
M
 
T
I
 
V
E
 
A
R
 
A
L
 
L
R
 
G
Q
 
D
D
 
Q
F
 
V
E
 
E
V
 
V
-
 
R
I
 
W
V
 
V
P
 
D
N
 
G
P
 
P
S
 
D
H
 
R
G
 
D
D
 
K
I
 
L
N
 
L
A
 
A
Q
 
A
F
 
V
N
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
D
P
 
A
H
 
L
V
 
-
H
 
-
G
 
-
L
 
L
I
 
V
G
 
R
V
 
S
G
 
A
R
 
T
K
 
T
L
 
V
G
 
D
R
 
A
E
 
E
Q
 
V
L
 
L
Q
 
A
S
 
A
A
 
A
T
 
P
N
 
K
L
 
L
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
S
 
A
S
x
R
V
 
A
S
 
G
V
|
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
Y
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
D
Y
 
A
F
 
A
N
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
G
I
 
V
M
 
L
L
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
T
V
 
S
L
x
N
T
 
I
E
 
H
S
 
S
T
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
H
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
L
S
 
A
S
 
A
A
 
S
R
 
R
R
 
Q
V
 
I
A
 
P
E
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
W
 
S
T
 
L
K
 
R
A
 
E
G
 
H
Q
 
T
W
 
W
Q
 
K
A
 
R
T
 
S
V
 
-
G
 
-
P
 
-
Q
 
S
L
 
F
F
 
S
G
 
G
S
 
T
D
 
E
V
 
I
H
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
L
G
 
G
N
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
G
 
-
R
 
I
L
 
A
G
 
A
F
 
F
N
 
G
M
 
A
P
 
Y
I
 
V
I
 
V
Y
 
A
S
 
Y
G
 
D
N
 
P
S
 
Y
R
 
V
K
 
S
T
 
P
E
 
A
L
 
R
E
 
A
N
 
A
Q
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
I
Q
 
E
F
 
L
R
 
L
E
 
S
L
 
L
D
 
D
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
C
 
S
L
 
V
V
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
S
 
T
E
 
P
K
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
Q
 
K
R
 
E
E
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
K
M
 
T
K
 
K
P
 
P
S
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
A
S
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
A
 
A
L
 
L
I
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
Q
 
T
N
 
G
N
 
G
R
 
H
I
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
Y
 
F
E
 
A
K
 
T
E
|
E
P
 
P
L
 
C
A
 
T
E
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
F
 
F
Q
 
E
L
 
L
K
 
A
N
 
Q
A
 
V
V
 
V
T
 
V
L
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
G
 
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
H
 
A
E
 
E
T
 
A
R
x
Q
E
 
D
A
 
R
M
 
A
A
 
G
N
 
T
L
 
D
A
 
V
V
 
A
D
 
E
N
 
S
L
 
V
R
 
R
S
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
A
G
 
G
E
 
E
R
 
F
P
 
V
Q
 
P
N
 
D
L
 
A
V
 
V
N
 
N

Query Sequence

>AO356_16925 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_16925
MKKTVLAFSRITPPMIERLRQDFEVIVPNPSHGDINAQFNEALPHVHGLIGVGRKLGREQ
LQSATNLQVVSSVSVGYDNYDLAYFNERGIMLTNTPDVLTESTADLAFALLMSSARRVAE
LDAWTKAGQWQATVGPQLFGSDVHGKTLGIVGMGNIGAAIARRGRLGFNMPIIYSGNSRK
TELENQLGAQFRELDQLLAEADFVCLVVPLSEKTRHLIGQRELGLMKPSAILVNISRGPV
VDEPALIEALQNNRIRGAGLDVYEKEPLAESPLFQLKNAVTLPHIGSATHETREAMANLA
VDNLRSALLGERPQNLVNPQVWK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory