SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_20865 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_20865 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6t4vC Crystal structure of 2-methylisocitrate lyase (prpb) from pseudomonas aeruginosa in apo form.
88% identity, 97% coverage: 5:290/294 of query aligns to 3:277/277 of 6t4vC

query
sites
6t4vC
T
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
F
 
F
R
 
R
D
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
T
E
 
E
H
 
H
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
A
N
 
N
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
V
R
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
|
D
V
 
V
D
|
D
T
 
T
G
 
G
F
|
F
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
S
M
 
M
I
 
I
K
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
M
H
|
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
C
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
E
I
 
I
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
Q
E
 
E
M
 
M
V
 
V
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
S
D
 
D
D
 
D
S
 
S
F
 
F
V
 
V
I
 
I
M
 
M
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
S
 
A
A
 
A
L
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
A
C
 
C
I
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
M
I
 
I
F
 
F
P
 
P
E
|
E
A
 
A
I
 
M
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
A
M
 
M
Y
 
Y
K
 
K
L
 
E
F
 
F
A
 
A
S
 
A
R
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
V
P
 
P
I
 
V
L
 
L
A
 
A
N
|
N
I
 
I
T
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
|
T
P
 
P
L
|
L
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
S
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
F
 
F
R
 
R
A
 
A
M
 
M
N
 
N
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
D
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
M
 
M
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
R
 
R
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
H
 
H
T
 
S
F
 
F
E
 
E
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
F

Q56062 2-methylisocitrate lyase; 2-MIC; MICL; (2R,3S)-2-methylisocitrate lyase; EC 4.1.3.30 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 2 papers)
76% identity, 100% coverage: 1:294/294 of query aligns to 1:294/295 of Q56062

query
sites
Q56062
M
 
M
S
 
S
N
 
L
S
 
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
S
 
K
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
A
N
 
N
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
S
G
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
D
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
|
D
V
 
A
D
 
D
T
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
S
M
 
I
I
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
H
 
H
I
 
I
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
|
K
R
|
R
C
|
C
G
 
G
H
|
H
R
 
R
P
 
P
N
 
N
K
 
K
E
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
S
Q
 
K
Q
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
V
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
D
 
D
D
 
P
S
 
N
F
 
F
V
 
V
I
 
I
M
 
M
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
C
 
Y
I
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
M
I
 
L
F
 
F
P
 
P
E
 
E
A
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
S
M
 
M
Y
 
Y
K
 
R
L
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
D
R
 
V
V
 
A
K
 
Q
A
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
A
N
 
N
I
 
I
T
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
R
G
 
S
A
 
A
D
 
H
V
 
V
S
 
A
L
 
M
V
 
A
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
F
 
F
R
 
R
A
 
A
M
 
M
N
 
N
K
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
K
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
A
 
V
I
 
L
R
 
R
R
 
Q
D
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
I
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
M
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
R
 
S
I
 
I
D
 
N
Y
 
Y
H
 
Y
T
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
F
 
Y
A
 
R
A
 
N
K
 
K
K
 
K

P77541 2-methylisocitrate lyase; 2-MIC; MICL; (2R,3S)-2-methylisocitrate lyase; EC 4.1.3.30 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
75% identity, 99% coverage: 1:291/294 of query aligns to 1:291/296 of P77541

query
sites
P77541
M
|
M
S
 
S
N
 
L
S
 
H
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
R
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
T
S
 
K
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
A
N
 
N
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
S
G
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
D
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
|
D
V
 
A
D
|
D
T
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
S
M
 
M
I
 
I
K
 
K
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
G
I
 
L
H
 
H
I
 
I
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
R
C
|
C
G
|
G
H
 
H
R
 
R
P
 
P
N
 
N
K
 
K
E
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
S
Q
 
K
Q
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
V
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
D
 
D
D
 
P
S
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
M
 
M
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
D
S
 
A
A
 
A
L
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
C
 
Y
I
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
E
M
 
M
I
 
L
F
 
F
P
 
P
E
|
E
A
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
A
M
 
M
Y
 
Y
K
 
R
L
 
Q
F
 
F
A
 
A
S
 
D
R
 
A
V
 
V
K
 
Q
A
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
A
N
|
N
I
|
I
T
|
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
R
G
 
S
A
 
A
D
 
H
V
 
V
S
 
A
L
 
M
V
 
A
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
F
 
F
R
|
R
A
 
A
M
 
M
N
 
N
K
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
H
V
 
V
Y
 
Y
T
 
N
A
 
V
I
 
L
R
 
R
R
 
Q
D
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
K
N
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
R
|
R
M
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
R
 
S
I
 
I
D
 
N
Y
 
Y
H
 
Y
T
 
Q
F
 
Y
E
 
E
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A

1mumA Structure of the 2-methylisocitrate lyase (prpb) from escherichia coli (see paper)
75% identity, 98% coverage: 5:291/294 of query aligns to 3:289/289 of 1mumA

query
sites
1mumA
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
K
R
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
T
S
 
K
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
I
 
I
N
 
N
A
 
A
N
 
N
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
S
G
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
D
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
|
D
V
 
A
D
|
D
T
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
S
M
 
M
I
 
I
K
 
K
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
G
I
 
L
H
|
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
A
 
A
K
|
K
R
 
R
C
|
C
G
|
G
H
|
H
R
 
R
P
 
P
N
 
N
K
 
K
E
 
A
I
 
I
V
 
V
S
 
S
Q
 
K
Q
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
V
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
K
T
 
T
D
 
D
D
 
P
S
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
M
 
M
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
D
S
 
A
A
 
A
L
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
C
 
Y
I
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
E
M
 
M
I
 
L
F
 
F
P
 
P
E
|
E
A
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
A
M
 
M
Y
 
Y
K
 
R
L
 
Q
F
 
F
A
 
A
S
 
D
R
 
A
V
 
V
K
 
Q
A
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
A
N
|
N
I
 
I
T
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
|
T
P
 
P
L
|
L
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
R
G
 
S
A
 
A
D
 
H
V
 
V
S
 
A
L
 
M
V
 
A
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
F
 
F
R
 
R
A
 
A
M
 
M
N
 
N
K
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
H
V
 
V
Y
 
Y
T
 
N
A
 
V
I
 
L
R
 
R
R
 
Q
D
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
K
N
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
M
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
R
 
S
I
 
I
D
 
N
Y
 
Y
H
 
Y
T
 
Q
F
 
Y
E
 
E
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
N
L
 
L
F
 
F
A
 
A

1o5qA Crystal structure of pyruvate and mg2+ bound 2-methylisocitrate lyase (prpb) from salmonella typhimurium (see paper)
73% identity, 96% coverage: 5:286/294 of query aligns to 1:271/271 of 1o5qA

query
sites
1o5qA
T
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
F
 
F
R
 
R
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
S
 
K
E
 
E
H
 
N
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
V
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
A
I
 
I
N
 
N
A
 
A
N
 
N
H
 
H
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
Y
|
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
S
G
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
I
R
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
C
 
C
D
 
P
L
 
L
P
 
P
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
|
D
V
 
A
D
|
D
T
 
I
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
S
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
S
M
 
I
I
 
A
K
 
K
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
L
H
|
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
A
A
 
-
K
 
-
R
 
-
C
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
-
I
 
I
V
 
V
S
 
S
Q
 
K
Q
 
E
E
 
E
M
 
M
V
 
V
D
 
D
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
R
T
 
T
D
 
D
D
 
P
S
 
N
F
 
F
V
 
V
I
 
I
M
 
M
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
C
 
Y
I
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
M
I
 
L
F
 
F
P
 
P
E
|
E
A
 
A
I
 
I
T
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
S
M
 
M
Y
 
Y
K
 
R
L
 
R
F
 
F
A
 
A
S
 
D
R
 
V
V
 
A
K
 
Q
A
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
L
A
 
A
N
|
N
I
 
I
T
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
A
T
|
T
P
 
P
L
|
L
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
A
 
R
G
 
S
A
 
A
D
 
H
V
 
V
S
 
A
L
 
M
V
 
A
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
F
 
F
R
 
R
A
 
A
M
 
M
N
 
N
K
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
K
V
 
V
Y
 
Y
T
 
T
A
 
V
I
 
L
R
 
R
R
 
Q
D
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
Q
 
K
N
 
N
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
I
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
M
 
N
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
R
 
S
I
 
I
D
 
N
Y
 
Y
H
 
Y
T
 
Q
F
 
F
E
 
E
Q
 
E
K
 
K
L
 
L

4iqdA Crystal structure of carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase from bacillus anthracis
47% identity, 94% coverage: 9:284/294 of query aligns to 12:283/290 of 4iqdA

query
sites
4iqdA
R
 
R
F
 
F
R
 
R
D
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
E
S
 
A
E
 
N
H
 
E
P
 
I
L
 
L
Q
 
Q
V
 
I
V
 
P
G
 
G
T
 
A
I
 
H
N
 
D
A
 
A
N
 
M
H
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
K
 
R
R
 
N
A
 
T
G
 
G
F
 
F
K
 
L
A
 
A
I
 
L
Y
|
Y
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
x
A
G
 
A
V
 
Y
A
 
T
A
 
A
G
 
-
S
 
S
L
 
K
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
V
G
 
T
L
 
S
D
 
T
D
 
E
V
 
V
L
 
A
T
x
E
D
x
R
V
 
A
R
 
R
R
x
D
I
 
L
T
 
V
D
 
R
V
 
A
C
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
V
L
 
L
V
 
V
D
|
D
V
 
I
D
|
D
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
G
S
 
-
A
 
V
F
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
A
K
 
V
S
 
E
M
 
M
I
 
V
K
 
E
F
 
A
G
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
V
H
x
Q
I
 
I
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
Q
G
 
L
A
 
P
K
|
K
R
 
K
C
|
C
G
|
G
H
|
H
R
 
L
P
 
N
N
 
G
K
 
K
E
 
K
I
 
L
V
 
V
S
 
T
Q
 
T
Q
 
E
E
 
E
M
 
L
V
 
V
D
 
Q
R
 
K
I
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
I
V
 
K
D
 
E
A
 
V
R
 
A
T
 
P
D
 
-
D
 
-
S
 
S
F
 
L
V
 
Y
I
 
I
M
 
V
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
G
V
 
V
E
 
E
G
|
G
L
|
L
E
 
D
S
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
N
A
 
A
C
 
Y
I
 
V
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
A
I
 
I
F
 
F
P
 
P
E
|
E
A
 
A
I
 
L
T
 
Q
E
 
S
L
 
E
E
 
E
M
 
E
Y
 
F
K
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
N
S
 
S
R
 
K
V
 
V
K
 
N
A
 
A
P
 
P
I
 
L
L
 
L
A
 
A
N
|
N
I
 
M
T
 
T
E
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
K
T
 
T
P
 
P
L
x
Y
Y
|
Y
T
 
S
T
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
F
A
 
A
G
 
N
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
Q
L
 
M
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
P
L
 
V
S
 
T
A
 
S
F
 
L
R
 
R
A
 
V
M
 
A
N
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
V
Y
 
F
T
 
T
A
 
L
I
 
I
R
 
K
R
 
E
D
 
T
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
Q
 
K
N
 
D
V
 
A
I
 
L
D
 
S
T
 
N
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
R
 
R
M
 
S
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
D
 
E
R
 
T
I
 
I
D
 
S
Y
 
Y
H
 
H
T
 
D
F
 
F
E
 
E
Q
 
E

1zlpB Petal death protein psr132 with cysteine-linked glutaraldehyde forming a thiohemiacetal adduct (see paper)
34% identity, 88% coverage: 24:282/294 of query aligns to 18:276/285 of 1zlpB

query
sites
1zlpB
G
 
G
T
 
V
I
 
Q
N
 
D
A
 
A
N
 
L
H
 
S
A
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
V
K
 
E
R
 
K
A
 
T
G
 
G
F
 
F
K
 
H
A
 
A
I
 
A
Y
x
F
L
 
V
S
|
S
G
|
G
G
x
Y
G
 
S
V
 
V
A
 
S
A
 
A
G
 
A
S
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
|
D
L
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
L
G
 
T
L
 
T
D
 
T
D
 
E
V
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
A
V
 
T
R
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
A
V
 
A
C
 
A
D
 
P
L
 
N
P
 
L
L
 
C
L
 
V
V
 
V
D
 
V
V
x
D
D
 
G
T
x
D
G
 
T
F
 
G
G
 
G
S
 
G
S
 
G
A
 
P
F
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
Q
R
 
R
T
 
F
V
 
I
K
 
R
S
 
E
M
 
L
I
 
I
K
 
S
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
K
A
 
G
I
 
V
H
x
F
I
 
L
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
W
A
 
P
K
|
K
R
 
K
C
|
C
G
|
G
H
|
H
R
 
M
P
 
R
N
 
G
K
 
K
E
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
P
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
M
 
H
V
 
A
D
 
L
R
 
K
I
 
I
K
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
R
D
 
E
A
 
A
R
 
I
T
 
G
D
 
D
D
 
S
S
 
D
F
 
F
V
 
F
I
 
L
M
 
V
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
A
V
 
P
E
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
E
A
 
G
L
 
I
D
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
N
A
 
L
C
 
Y
I
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
A
I
 
T
F
 
F
P
 
V
E
|
E
A
 
A
I
 
P
T
 
A
E
 
N
L
 
V
E
 
D
M
 
E
Y
 
L
K
 
K
L
 
E
F
 
V
A
 
S
S
 
A
R
 
K
V
 
T
K
 
K
A
 
G
P
 
L
I
 
R
L
 
I
A
 
A
N
|
N
I
 
M
T
x
I
E
 
E
F
 
G
G
 
G
A
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
Y
 
H
T
 
T
T
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
F
A
 
K
G
 
E
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
H
L
 
L
V
 
I
L
 
A
Y
 
H
P
 
S
L
 
L
S
 
T
A
 
A
F
 
V
R
 
Y
A
 
A
M
 
T
N
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
V
N
 
N
V
 
I
Y
 
M
T
 
K
A
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
D
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
T
Q
 
R
N
 
D
V
 
D
I
 
L
D
 
D
T
 
Q
M
 
M
Q
 
A
T
 
T
R
 
F
M
 
S
E
 
E
L
 
F
Y
 
N
D
 
E
R
 
L
I
 
I
D
 
S
Y
 
L
H
 
E
T
 
S
F
 
W

1zlpA Petal death protein psr132 with cysteine-linked glutaraldehyde forming a thiohemiacetal adduct (see paper)
34% identity, 88% coverage: 24:282/294 of query aligns to 18:276/284 of 1zlpA

query
sites
1zlpA
G
 
G
T
 
V
I
 
Q
N
 
D
A
 
A
N
 
L
H
 
S
A
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
V
K
 
E
R
 
K
A
 
T
G
 
G
F
 
F
K
 
H
A
 
A
I
 
A
Y
x
F
L
 
V
S
|
S
G
|
G
G
x
Y
G
 
S
V
 
V
A
 
S
A
 
A
G
 
A
S
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
|
D
L
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
L
G
 
T
L
 
T
D
 
T
D
 
E
V
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
A
V
 
T
R
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
A
V
 
A
C
 
A
D
 
P
L
 
N
P
 
L
L
 
C
L
 
V
V
 
V
D
 
V
V
x
D
D
 
G
T
x
D
G
 
T
F
 
G
G
 
G
S
 
G
S
 
G
A
 
P
F
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
Q
R
 
R
T
 
F
V
 
I
K
 
R
S
 
E
M
 
L
I
 
I
K
 
S
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
K
A
 
G
I
 
V
H
x
F
I
 
L
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
W
A
 
P
K
|
K
R
 
K
C
|
C
G
|
G
H
|
H
R
 
M
P
 
R
N
 
G
K
 
K
E
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
P
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
M
 
H
V
 
A
D
 
L
R
 
K
I
 
I
K
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
R
D
 
E
A
 
A
R
 
I
T
 
G
D
 
D
D
 
S
S
 
D
F
 
F
V
 
F
I
 
L
M
 
V
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
A
V
 
P
E
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
E
A
 
G
L
 
I
D
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
N
A
 
L
C
 
Y
I
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
A
I
 
T
F
 
F
P
 
V
E
|
E
A
 
A
I
 
P
T
 
A
E
 
N
L
 
V
E
 
D
M
 
E
Y
 
L
K
 
K
L
 
E
F
 
V
A
 
S
S
 
A
R
 
K
V
 
T
K
 
K
A
 
G
P
 
L
I
 
R
L
 
I
A
 
A
N
|
N
I
 
M
T
x
I
E
 
E
F
 
G
G
 
G
A
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
Y
 
H
T
 
T
T
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
F
A
 
K
G
 
E
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
H
L
 
L
V
 
I
L
 
A
Y
 
H
P
 
S
L
 
L
S
 
T
A
 
A
F
 
V
R
 
Y
A
 
A
M
 
T
N
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
V
N
 
N
V
 
I
Y
 
M
T
 
K
A
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
D
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
T
Q
 
R
N
 
D
V
 
D
I
 
L
D
 
D
T
 
Q
M
 
M
Q
 
A
T
 
T
R
 
F
M
 
S
E
 
E
L
 
F
Y
 
N
D
 
E
R
 
L
I
 
I
D
 
S
Y
 
L
H
 
E
T
 
S
F
 
W

Q05957 Petal death protein; (R)-2-methylmalate lyase; D-citramalate lyase; Oxalacetic hydrolase; PSR132; EC 3.7.1.1; EC 4.1.3.- from Dianthus caryophyllus (Carnation) (Clove pink) (see 2 papers)
34% identity, 88% coverage: 24:282/294 of query aligns to 45:303/318 of Q05957

query
sites
Q05957
G
 
G
T
 
V
I
 
Q
N
 
D
A
 
A
N
 
L
H
 
S
A
 
A
L
 
A
L
 
V
A
 
V
K
 
E
R
 
K
A
 
T
G
 
G
F
 
F
K
 
H
A
 
A
I
 
A
Y
 
F
L
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
Y
G
 
S
V
 
V
A
 
S
A
 
A
G
 
A
S
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
P
D
|
D
L
 
F
G
 
G
I
 
L
T
 
L
G
 
T
L
 
T
D
 
T
D
 
E
V
 
V
L
 
V
T
 
E
D
 
A
V
 
T
R
 
R
R
 
R
I
 
I
T
 
T
D
 
A
V
 
A
C
 
A
D
 
P
L
 
N
P
 
L
L
 
C
L
 
V
V
 
V
D
 
V
V
x
D
D
 
G
T
x
D
G
 
T
F
 
G
G
 
G
S
 
G
S
 
G
A
 
P
F
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
Q
R
 
R
T
 
F
V
 
I
K
 
R
S
 
E
M
 
L
I
 
I
K
 
S
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
K
A
 
G
I
 
V
H
 
F
I
 
L
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
W
A
 
P
K
|
K
R
 
K
C
|
C
G
 
G
H
 
H
R
 
M
P
 
R
N
 
G
K
 
K
E
 
A
I
 
V
V
 
V
S
 
P
Q
 
A
Q
 
E
E
 
E
M
 
H
V
 
A
D
 
L
R
 
K
I
 
I
K
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
R
D
 
E
A
 
A
R
 
I
T
 
G
D
 
D
D
 
S
S
 
D
F
 
F
V
 
F
I
 
L
M
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
R
A
 
A
V
 
P
E
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
E
S
 
E
A
 
G
L
 
I
D
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
N
A
 
L
C
 
Y
I
 
K
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
A
I
 
T
F
 
F
P
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
P
T
 
A
E
 
N
L
 
V
E
 
D
M
 
E
Y
 
L
K
 
K
L
 
E
F
 
V
A
 
S
S
 
A
R
 
K
V
 
T
K
 
K
A
 
G
P
 
L
I
 
R
L
 
I
A
 
A
N
 
N
I
 
M
T
 
I
E
 
E
F
 
G
G
 
G
A
 
K
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
H
T
 
T
T
 
P
E
 
E
Q
 
E
L
 
F
A
 
K
G
 
E
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
H
L
 
L
V
 
I
L
 
A
Y
 
H
P
 
S
L
 
L
S
 
T
A
 
A
F
 
V
R
 
Y
A
 
A
M
 
T
N
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
V
N
 
N
V
 
I
Y
 
M
T
 
K
A
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
D
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
T
Q
 
R
N
 
D
V
 
D
I
 
L
D
 
D
T
 
Q
M
 
M
Q
 
A
T
 
T
R
 
F
M
 
S
E
 
E
L
 
F
Y
 
N
D
 
E
R
 
L
I
 
I
D
 
S
Y
 
L
H
 
E
T
 
S
F
 
W

Sites not aligning to the query:

3fa3B Crystal structure of 2,3-dimethylmalate lyase, a pep mutase/isocitrate lyase superfamily member, trigonal crystal form (see paper)
37% identity, 80% coverage: 24:258/294 of query aligns to 24:261/302 of 3fa3B

query
sites
3fa3B
G
 
G
T
 
V
I
 
Y
N
 
D
A
 
G
N
 
L
H
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
L
R
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
D
A
 
A
I
 
L
Y
|
Y
L
 
M
S
x
T
G
|
G
G
x
A
G
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
S
S
 
V
L
 
H
G
 
G
V
 
Q
P
 
A
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
C
G
 
T
L
 
L
D
 
N
D
 
D
V
 
M
L
 
R
T
 
A
D
 
N
V
 
A
R
 
E
R
 
M
I
 
I
T
 
S
D
 
N
V
 
I
C
 
S
-
 
P
D
 
S
L
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
 
A
D
|
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
S
 
G
S
 
P
A
 
I
F
 
M
N
 
-
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
T
K
 
E
S
 
Q
M
 
Y
I
 
S
K
 
R
F
 
S
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
F
H
|
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
Q
A
 
T
K
|
K
R
 
R
C
|
C
G
|
G
H
|
H
R
 
L
P
 
A
N
 
G
K
 
K
E
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
D
Q
 
T
Q
 
D
E
 
T
M
 
Y
V
 
V
D
 
T
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
A
 
A
R
 
R
T
 
Q
-
 
R
-
 
I
D
 
G
D
 
S
S
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
V
M
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
T
E
 
H
G
 
G
L
 
Y
E
 
E
S
 
E
A
 
S
L
 
V
D
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
R
A
 
A
C
 
A
I
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
G
F
 
F
P
 
L
E
|
E
A
 
G
I
 
I
T
 
T
E
 
S
L
 
R
E
 
E
M
 
M
Y
 
A
K
 
R
-
 
Q
L
 
V
F
 
I
A
 
Q
S
 
D
R
 
L
V
 
A
K
 
G
A
 
W
P
 
P
I
 
L
L
 
L
A
 
L
N
|
N
I
 
M
T
 
V
E
 
E
F
 
H
G
 
G
A
 
A
T
|
T
P
 
P
L
x
S
Y
 
I
T
 
S
T
 
A
E
 
A
Q
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
E
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
R
L
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
F
P
|
P
L
 
F
S
 
A
A
 
A
F
 
L
R
 
G
A
 
P
M
 
A
N
 
V
K
 
A
A
 
A
A
 
M
E
 
R
N
 
E
V
 
A
Y
 
M
T
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G

3m0jA Structure of oxaloacetate acetylhydrolase in complex with the inhibitor 3,3-difluorooxalacetate (see paper)
34% identity, 80% coverage: 24:258/294 of query aligns to 25:263/297 of 3m0jA

query
sites
3m0jA
G
 
G
T
 
V
I
 
Y
N
 
D
A
 
G
N
 
L
H
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
T
A
 
A
K
 
M
R
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
S
I
 
L
Y
|
Y
L
 
M
S
x
T
G
|
G
G
x
A
G
 
G
V
 
T
A
 
T
A
 
A
G
 
S
S
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
A
I
 
I
T
 
A
G
 
Q
L
 
L
D
 
H
D
 
D
V
 
M
L
 
R
T
 
D
D
 
N
V
 
A
R
 
D
R
 
M
I
 
I
T
 
A
D
 
N
V
 
L
C
 
D
D
 
P
L
 
F
-
 
G
-
 
P
P
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
 
M
D
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
S
 
G
S
 
P
A
 
I
F
 
M
N
 
-
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
V
K
 
E
S
 
H
M
 
Y
I
 
I
K
 
R
F
 
S
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
A
H
 
H
I
 
L
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
I
G
 
L
A
 
T
K
 
K
R
 
R
C
 
C
G
|
G
H
 
H
R
 
L
P
 
S
N
 
G
K
 
K
E
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
Q
 
D
E
 
E
M
 
Y
V
 
L
D
 
V
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
-
 
A
-
 
T
D
 
K
A
 
R
R
 
R
T
 
L
D
 
R
D
 
S
S
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
L
M
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
S
E
 
L
G
 
G
L
 
Y
E
 
E
S
 
E
A
 
C
L
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
L
A
 
R
A
 
A
C
 
A
I
 
R
E
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
G
F
 
L
P
 
L
E
|
E
A
 
G
I
 
F
T
 
R
E
 
S
L
 
K
E
 
E
M
 
Q
Y
 
A
K
 
A
L
 
A
F
 
A
A
 
V
S
 
A
R
 
A
V
 
L
K
 
A
A
 
P
-
 
W
P
 
P
I
 
L
L
 
L
A
 
L
N
|
N
I
 
S
T
 
V
E
|
E
F
x
N
G
 
G
A
 
H
T
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
I
T
 
T
T
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
A
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
R
L
 
I
V
 
M
L
 
I
Y
 
F
P
x
S
L
 
F
S
 
A
A
 
T
F
 
L
R
 
A
A
 
P
M
 
A
N
 
Y
K
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
R
N
 
E
V
 
T
Y
 
L
T
 
V
A
 
R
I
 
L
R
 
R
R
 
D
D
 
H
G
 
G

3fa4A Crystal structure of 2,3-dimethylmalate lyase, a pep mutase/isocitrate lyase superfamily member, triclinic crystal form (see paper)
35% identity, 80% coverage: 24:258/294 of query aligns to 24:254/284 of 3fa4A

query
sites
3fa4A
G
 
G
T
 
V
I
 
Y
N
 
D
A
 
G
N
 
L
H
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
L
R
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
D
A
 
A
I
 
L
Y
|
Y
L
 
M
S
x
T
G
|
G
G
x
A
G
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
S
S
 
V
L
 
H
G
 
G
V
 
Q
P
 
A
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
C
G
 
T
L
 
L
D
 
N
D
 
D
V
 
M
L
 
R
T
 
A
D
 
N
V
 
A
R
 
E
R
 
M
I
 
I
T
 
S
D
 
N
V
 
I
C
 
S
-
 
P
D
 
S
L
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
 
A
D
|
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
S
 
G
S
 
P
A
 
I
F
 
M
N
 
-
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
T
K
 
E
S
 
Q
M
 
Y
I
 
S
K
 
R
F
 
S
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
F
H
|
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
C
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
Q
P
 
T
N
 
G
K
 
K
E
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
D
Q
 
T
Q
 
D
E
 
T
M
 
Y
V
 
V
D
 
T
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
A
 
A
R
 
R
T
 
Q
-
 
R
-
 
I
D
 
G
D
 
S
S
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
V
M
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
T
E
 
H
G
 
G
L
 
Y
E
 
E
S
 
E
A
 
S
L
 
V
D
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
R
A
 
A
C
 
A
I
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
G
F
 
F
P
 
L
E
|
E
A
 
G
I
 
I
T
 
T
E
 
S
L
 
R
E
 
E
M
 
M
Y
 
A
K
 
R
-
 
Q
L
 
V
F
 
I
A
 
Q
S
 
D
R
 
L
V
 
A
K
 
G
A
 
W
P
 
P
I
 
L
L
 
L
A
 
L
N
|
N
I
 
M
T
 
V
E
 
E
F
 
H
G
 
G
A
 
A
T
|
T
P
 
P
L
x
S
Y
 
I
T
 
S
T
 
A
E
 
A
Q
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
E
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
R
L
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
F
P
 
P
L
 
F
S
 
A
A
 
A
F
 
L
R
 
G
A
 
P
M
 
A
N
 
V
K
 
A
A
 
A
A
 
M
E
 
R
N
 
E
V
 
A
Y
 
M
T
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G

3fa3J Crystal structure of 2,3-dimethylmalate lyase, a pep mutase/isocitrate lyase superfamily member, trigonal crystal form (see paper)
35% identity, 80% coverage: 24:258/294 of query aligns to 23:252/292 of 3fa3J

query
sites
3fa3J
G
 
G
T
 
V
I
 
Y
N
 
D
A
 
G
N
 
L
H
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
V
A
 
A
K
 
L
R
 
S
A
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
D
A
 
A
I
 
L
Y
|
Y
L
 
M
S
x
T
G
|
G
G
x
A
G
 
G
V
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
S
S
 
V
L
 
H
G
 
G
V
 
Q
P
 
A
D
|
D
L
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
C
G
 
T
L
 
L
D
 
N
D
 
D
V
 
M
L
 
R
T
 
A
D
 
N
V
 
A
R
 
E
R
 
M
I
 
I
T
 
S
D
 
N
V
 
I
C
 
S
-
 
P
D
 
S
L
 
T
P
 
P
L
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
 
A
D
|
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
S
 
G
S
 
P
A
 
I
F
 
M
N
 
-
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
T
K
 
E
S
 
Q
M
 
Y
I
 
S
K
 
R
F
 
S
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
F
H
|
H
I
 
I
E
|
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
G
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
C
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
-
P
 
Q
N
 
T
K
 
K
E
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
D
Q
 
T
Q
 
D
E
 
T
M
 
Y
V
 
V
D
 
T
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
A
 
A
R
 
R
T
 
Q
-
 
R
-
 
I
D
 
G
D
 
S
S
 
D
F
 
I
V
 
V
I
 
V
M
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
T
E
 
H
G
 
G
L
 
Y
E
 
E
S
 
E
A
 
S
L
 
V
D
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
R
A
 
A
C
 
A
I
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
G
F
 
F
P
 
L
E
|
E
A
 
G
I
 
I
T
 
T
E
 
S
L
 
R
E
 
E
M
 
M
Y
 
A
K
 
R
-
 
Q
L
 
V
F
 
I
A
 
Q
S
 
D
R
 
L
V
 
A
K
 
G
A
 
W
P
 
P
I
 
L
L
 
L
A
 
L
N
|
N
I
 
M
T
 
V
E
 
E
F
 
H
G
 
G
A
 
A
T
|
T
P
 
P
L
x
S
Y
 
I
T
 
S
T
 
A
E
 
A
Q
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
E
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
R
L
 
I
V
 
I
L
 
I
Y
 
F
P
 
P
L
 
F
S
 
A
A
 
A
F
 
L
R
 
G
A
 
P
M
 
A
N
 
V
K
 
A
A
 
A
A
 
M
E
 
R
N
 
E
V
 
A
Y
 
M
T
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
K
R
 
R
D
 
D
G
 
G

3m0kA Structure of oxaloacetate acetylhydrolase in complex with the product oxalate (see paper)
33% identity, 80% coverage: 24:258/294 of query aligns to 25:258/289 of 3m0kA

query
sites
3m0kA
G
 
G
T
 
V
I
 
Y
N
 
D
A
 
G
N
 
L
H
 
S
A
 
A
L
 
R
L
 
T
A
 
A
K
 
M
R
 
E
A
 
L
G
 
G
F
 
F
K
 
K
A
 
S
I
 
L
Y
|
Y
L
 
M
S
x
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
V
 
T
A
 
T
A
 
A
G
 
S
S
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
A
I
 
I
T
 
A
G
 
Q
L
 
L
D
 
H
D
 
D
V
 
M
L
 
R
T
 
D
D
 
N
V
 
A
R
 
D
R
 
M
I
 
I
T
 
A
D
 
N
V
 
L
C
 
D
D
 
P
L
 
F
-
 
G
-
 
P
P
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
A
D
 
D
V
 
M
D
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
S
 
G
S
 
P
A
 
I
F
 
M
N
 
-
V
 
V
A
 
A
R
 
R
T
 
T
V
 
V
K
 
E
S
 
H
M
 
Y
I
 
I
K
 
R
F
 
S
G
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
A
H
 
H
I
 
L
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
V
 
I
G
 
L
A
 
T
K
 
K
R
 
R
C
 
C
G
 
-
H
 
-
R
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
K
E
 
K
I
 
V
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
Q
 
D
E
 
E
M
 
Y
V
 
L
D
 
V
R
 
R
I
 
I
K
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
-
 
A
-
 
T
D
 
K
A
 
R
R
 
R
T
 
L
D
 
R
D
 
S
S
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
L
M
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
T
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
V
 
S
E
 
L
G
 
G
L
 
Y
E
 
E
S
 
E
A
 
C
L
 
I
D
 
E
R
 
R
A
 
L
A
 
R
A
 
A
C
 
A
I
 
R
E
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
V
I
 
G
F
 
L
P
 
L
E
 
E
A
 
G
I
 
F
T
 
R
E
 
S
L
 
K
E
 
E
M
 
Q
Y
 
A
K
 
A
L
 
A
F
 
A
A
 
V
S
 
A
R
 
A
V
 
L
K
 
A
A
 
P
-
 
W
P
 
P
I
 
L
L
 
L
A
 
L
N
 
N
I
 
S
T
 
V
E
|
E
F
x
N
G
 
G
A
 
H
T
 
S
P
 
P
L
 
L
Y
 
I
T
 
T
T
 
V
E
 
E
Q
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
A
A
 
M
D
 
G
V
 
F
S
 
R
L
 
I
V
 
M
L
 
I
Y
 
F
P
x
S
L
 
F
S
 
A
A
 
T
F
 
L
R
 
A
A
 
P
M
 
A
N
 
Y
K
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
R
N
 
E
V
 
T
Y
 
L
T
 
V
A
 
R
I
 
L
R
 
R
R
 
D
D
 
H
G
 
G

Q84G06 Phosphonopyruvate hydrolase; PPH; EC 3.11.1.3 from Variovorax sp. (strain Pal2) (see paper)
36% identity, 88% coverage: 5:263/294 of query aligns to 2:262/290 of Q84G06

query
sites
Q84G06
T
 
T
P
 
K
G
 
N
Q
 
Q
R
 
A
F
 
L
R
 
R
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
D
S
 
S
E
 
G
H
 
R
P
 
L
L
 
F
Q
 
T
V
 
A
V
 
M
G
 
A
T
 
A
I
 
H
N
 
N
A
 
P
N
 
L
H
 
V
A
 
A
L
 
K
L
 
L
A
 
A
K
 
E
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
G
A
 
G
I
 
I
Y
 
W
L
 
G
S
 
S
G
 
G
G
 
F
G
 
E
V
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
-
S
 
S
L
 
Y
G
 
A
V
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
L
G
 
S
L
 
M
D
 
S
D
 
T
V
 
H
L
 
L
T
 
E
D
 
M
V
 
M
R
 
R
R
 
A
I
 
I
T
 
A
D
 
S
V
 
T
C
 
V
D
 
S
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
 
I
D
 
D
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
-
S
 
N
A
 
A
F
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
H
R
 
Y
T
 
V
V
 
V
K
 
P
S
 
Q
M
 
Y
I
 
E
K
 
A
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
I
H
 
V
I
 
M
E
 
E
D
 
D
Q
 
K
V
 
T
G
 
F
A
 
P
K
 
K
R
 
D
C
 
T
G
 
S
H
 
L
R
 
R
P
 
T
N
 
D
-
 
G
-
 
R
K
 
Q
E
 
E
I
 
L
V
 
V
S
 
R
Q
 
I
Q
 
E
E
 
E
M
 
F
V
 
Q
D
 
G
R
 
K
I
 
I
K
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
T
D
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
A
D
 
D
D
 
R
S
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
V
M
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
I
A
 
A
V
 
G
E
 
L
G
 
G
L
 
Q
E
 
Q
S
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
R
R
 
R
A
 
G
A
 
Q
A
 
A
C
 
Y
I
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
A
I
 
I
F
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
Y
 
-
K
 
-
L
 
L
F
 
I
A
 
H
S
 
S
R
|
R
V
 
Q
K
 
K
A
 
T
P
 
P
-
 
D
-
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
A
N
 
F
I
 
V
T
 
K
E
 
S
F
 
W
-
 
P
G
 
G
A
 
K
T
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
V
T
 
L
T
 
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
Y
E
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
E
A
 
A
D
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
K
V
 
V
S
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
G
L
 
N
S
 
H
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
A
M
 
A
N
 
V
K
 
G
A
 
A
A
 
V
E
 
R
N
 
E
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
R
I
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
D
G
 
G
T
 
G
Q
 
I
Q
 
R
N
 
E
V
 
V

2hjpA Crystal structure of phosphonopyruvate hydrolase complex with phosphonopyruvate and mg++ (see paper)
36% identity, 88% coverage: 5:263/294 of query aligns to 2:255/283 of 2hjpA

query
sites
2hjpA
T
 
T
P
 
K
G
 
N
Q
 
Q
R
 
A
F
 
L
R
 
R
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
D
S
 
S
E
 
G
H
 
R
P
 
L
L
 
F
Q
 
T
V
 
A
V
 
M
G
 
A
T
 
A
I
 
H
N
 
N
A
 
P
N
 
L
H
 
V
A
 
A
L
 
K
L
 
L
A
 
A
K
x
E
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
F
 
F
K
 
G
A
 
G
I
 
I
Y
x
W
L
 
G
S
|
S
G
|
G
G
x
F
G
 
E
V
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
-
S
 
S
L
 
Y
G
 
A
V
 
V
P
 
P
D
|
D
L
 
A
G
 
N
I
 
I
T
 
L
G
 
S
L
 
M
D
 
S
D
 
T
V
 
H
L
 
L
T
 
E
D
 
M
V
 
M
R
 
R
R
 
A
I
 
I
T
 
A
D
 
S
V
 
T
C
 
V
D
x
S
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
A
D
|
D
V
 
I
D
|
D
T
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
S
 
-
S
 
N
A
 
A
F
 
V
N
 
N
V
 
V
A
 
H
R
 
Y
T
 
V
V
 
V
K
 
P
S
 
Q
M
 
Y
I
 
E
K
 
A
F
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
A
 
A
I
 
I
H
x
V
I
 
M
E
|
E
D
 
D
Q
 
K
V
 
T
G
 
F
A
 
P
K
|
K
R
 
D
C
x
T
G
 
-
H
 
-
R
 
-
P
 
-
N
 
-
K
 
Q
E
 
E
I
 
L
V
 
V
S
 
R
Q
 
I
Q
 
E
E
 
E
M
 
F
V
 
Q
D
 
G
R
 
K
I
 
I
K
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
T
D
 
A
A
 
A
R
 
R
T
 
A
D
 
D
D
 
R
S
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
V
M
 
I
A
 
A
R
|
R
T
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
I
A
 
A
V
 
G
E
 
L
G
 
G
L
 
Q
E
 
Q
S
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
R
R
 
R
A
 
G
A
 
Q
A
 
A
C
 
Y
I
 
E
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
A
I
 
I
F
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
M
 
-
Y
 
-
K
 
-
L
 
L
F
 
I
A
x
H
S
 
S
R
|
R
V
 
Q
K
 
K
A
 
T
P
 
P
-
 
D
-
 
E
I
 
I
L
 
L
A
 
A
N
 
F
I
 
V
T
 
K
E
 
S
F
 
W
-
 
P
G
 
G
A
 
K
T
 
V
P
 
P
L
 
L
Y
 
V
T
 
L
T
x
V
-
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
Y
E
 
P
Q
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
E
A
 
A
D
 
D
-
 
I
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
K
V
 
V
S
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
P
 
G
L
 
N
S
 
H
A
 
A
F
 
I
R
 
R
A
 
A
M
 
A
N
 
V
K
 
G
A
 
A
A
 
V
E
 
R
N
 
E
V
 
V
Y
 
F
T
 
A
A
 
R
I
 
I
R
 
R
R
 
R
D
 
D
G
 
G
T
 
G
Q
 
I
Q
 
R
N
 
E
V
 
V

2duaA Crystal structure of phosphonopyruvate hydrolase complex with oxalate and mg++ (see paper)
36% identity, 88% coverage: 5:263/294 of query aligns to 2:255/283 of 2duaA

query
sites
2duaA
T
 
T
P
 
K
G
 
N
Q
 
Q
R
 
A
F
 
L
R
 
R
D
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
D
S
 
S
E
 
G
H
 
R
P
 
L
L
 
F
Q
 
T
V
 
A
V
 
M
G
 
A
T
 
A
I
 
H
N
 
N
A
 
P
N
 
L
H
 
V
A
 
A
L
 
K
L
 
L
A
 
A
K