SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_21080 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_21080 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
44% identity, 99% coverage: 1:263/266 of query aligns to 1:257/261 of P40288

query
sites
P40288
M
 
M
Q
 
Y
I
 
K
S
 
D
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
L
x
V
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
S
S
|
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
A
x
K
G
x
S
S
x
M
A
|
A
R
x
I
A
x
R
L
x
F
A
|
A
D
x
T
A
x
E
G
x
K
A
|
A
A
x
K
V
|
V
V
|
V
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
H
 
R
S
 
S
S
 
K
A
 
E
G
 
D
P
 
E
A
 
A
Q
 
N
D
 
S
L
 
V
A
 
L
R
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
K
A
 
K
N
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
K
A
 
G
D
 
D
V
 
V
S
 
T
K
 
V
E
 
E
H
 
S
E
 
D
V
 
V
E
 
I
Q
 
N
L
 
L
F
 
V
A
 
Q
Q
 
S
T
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
E
F
 
F
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
A
 
N
N
 
N
S
 
A
G
 
G
L
 
L
Q
x
E
K
 
N
D
 
P
A
 
V
A
 
S
A
 
S
V
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
S
L
 
L
A
 
S
D
|
D
W
 
W
N
 
N
T
 
K
V
|
V
I
 
I
G
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
G
A
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
V
 
Y
F
 
F
N
 
V
R
x
E
Q
 
N
G
 
D
I
 
I
R
 
K
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
K
 
T
I
 
V
I
 
I
H
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
H
 
H
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
P
 
P
W
 
W
A
 
P
G
 
L
H
 
F
V
 
V
N
 
H
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
D
 
K
L
 
L
L
 
M
M
 
T
Q
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
T
 
Y
S
 
A
H
 
P
Q
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
R
I
x
V
N
 
N
S
 
N
I
 
I
A
 
G
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
I
R
 
N
T
 
T
A
x
P
I
 
I
N
 
N
R
 
A
E
 
E
A
 
K
-
 
F
T
 
A
E
 
D
G
 
P
E
 
E
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
A
K
 
D
L
 
V
L
x
E
A
 
S
L
 
M
I
 
I
P
 
P
Y
 
M
G
 
G
R
x
Y
V
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
A
A
 
V
V
 
A
V
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
L
 
E
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
F
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
T
L
x
Q
Y
|
Y
P
 
P
G
 
S
F
 
F
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
44% identity, 99% coverage: 1:263/266 of query aligns to 1:257/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
M
 
M
Q
 
Y
I
 
K
S
 
D
L
 
L
A
 
E
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
K
G
 
S
S
 
M
A
 
A
R
 
I
A
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
T
A
 
E
G
 
K
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
H
x
R
S
 
S
S
 
K
A
 
E
G
 
D
P
 
E
A
 
A
Q
 
N
D
 
S
L
 
V
A
 
L
R
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
K
A
 
K
N
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
K
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
K
 
V
E
 
E
H
 
S
E
 
D
V
 
V
E
 
I
Q
 
N
L
 
L
F
 
V
A
 
Q
Q
 
S
T
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
E
F
 
F
G
 
G
T
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
|
G
L
 
L
Q
 
A
K
 
N
D
 
P
A
 
V
A
 
S
A
 
S
V
 
H
D
 
E
M
 
M
S
 
S
L
 
L
A
 
S
D
 
D
W
 
W
N
 
N
T
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
G
A
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
V
 
Y
F
 
F
N
 
V
R
 
E
Q
 
N
G
 
D
I
 
I
R
 
K
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
K
 
T
I
 
V
I
 
I
H
 
N
M
|
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
H
Q
 
E
R
 
K
I
 
I
P
 
P
W
 
W
A
 
P
G
 
L
H
 
F
V
 
V
N
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
D
 
K
L
 
L
L
 
M
M
 
T
Q
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
T
 
Y
S
 
A
H
 
P
Q
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N
 
N
S
 
N
I
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
A
 
A
I
|
I
R
 
N
T
|
T
A
 
P
I
 
I
N
 
N
R
 
A
E
 
E
A
 
K
-
 
F
T
 
A
E
 
D
G
 
P
E
 
E
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
A
K
 
D
L
 
V
L
 
E
A
 
S
L
 
M
I
 
I
P
 
P
Y
 
M
G
 
G
R
 
Y
V
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
A
A
 
V
V
 
A
V
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
L
 
E
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
F
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
G
 
S
F
 
F
R
 
Q

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
41% identity, 99% coverage: 1:263/266 of query aligns to 7:263/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
M
 
M
Q
 
Y
I
 
T
S
 
D
L
 
L
A
 
K
R
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
A
 
R
G
 
A
S
 
M
A
 
A
R
 
V
A
 
R
L
 
F
A
 
G
D
 
Q
A
 
E
G
 
E
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
Y
 
Y
H
x
Y
S
 
N
S
 
N
A
 
E
G
 
E
P
 
E
A
 
A
Q
 
L
D
 
D
L
 
A
A
 
K
R
 
K
E
 
E
I
 
V
N
 
E
A
 
E
N
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
I
V
 
V
G
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
K
 
K
E
 
E
H
 
E
E
 
D
V
 
V
E
 
V
Q
 
N
L
 
L
F
 
V
A
 
Q
Q
 
T
T
 
A
L
 
I
E
 
K
A
 
E
F
 
F
G
 
G
T
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
|
G
L
x
V
Q
x
E
K
 
N
D
 
P
A
 
V
A
 
P
A
 
S
V
 
H
D
 
E
M
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
N
W
 
W
N
 
N
T
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
G
A
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
K
V
 
Y
F
 
F
N
 
V
R
 
E
Q
 
N
G
 
D
I
 
I
R
 
K
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
K
 
N
I
 
V
I
 
I
H
 
N
M
|
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
|
H
Q
 
E
R
 
M
I
 
I
P
 
P
W
|
W
A
 
P
G
 
L
H
 
F
V
 
V
N
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
G
V
 
M
D
 
K
L
 
L
L
 
M
M
 
T
Q
 
E
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
T
 
Y
S
 
A
H
 
P
Q
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N
 
N
S
 
N
I
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
A
 
A
I
x
M
R
 
N
T
|
T
A
x
P
I
|
I
N
|
N
R
 
A
E
 
E
A
x
K
-
 
F
T
 
A
E
 
D
G
 
P
E
 
V
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
A
K
 
D
L
 
V
L
 
E
A
 
S
L
 
M
I
 
I
P
 
P
Y
 
M
G
 
G
R
 
Y
V
 
I
G
 
G
D
 
K
V
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
A
A
 
V
V
 
A
V
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
L
 
Q
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
F
 
F
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
T
L
 
K
Y
 
Y
P
 
P
G
 
S
F
 
F
R
 
Q

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
41% identity, 96% coverage: 3:258/266 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
I
 
M
S
 
T
L
 
L
A
 
Q
R
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
D
S
 
I
A
 
A
R
 
I
A
 
N
L
 
L
A
 
A
D
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
N
V
 
I
V
 
F
L
 
F
N
|
N
Y
|
Y
H
x
N
S
x
G
S
|
S
A
 
P
G
 
E
P
 
A
A
 
A
Q
 
E
D
 
E
L
 
T
A
 
A
R
 
K
E
 
L
I
 
V
N
 
A
A
 
E
N
 
H
G
 
G
G
 
V
R
 
E
A
 
V
I
 
E
A
 
A
V
 
M
G
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
K
 
I
E
 
A
H
 
E
E
 
D
V
 
V
E
 
D
Q
 
A
L
 
F
F
 
F
A
 
K
Q
 
Q
T
 
A
L
 
I
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
T
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
L
x
I
Q
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
A
 
L
A
 
L
V
 
M
D
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
E
A
 
D
D
 
E
W
 
W
N
 
D
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
N
T
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
S
R
 
R
V
 
T
F
 
M
N
 
M
R
 
K
Q
 
Q
G
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
R
A
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
V
Q
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
G
W
 
N
A
 
A
G
 
G
H
x
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
T
Q
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
T
 
L
S
 
A
H
 
P
Q
 
R
R
 
G
I
 
I
R
 
N
I
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
 
F
I
|
I
R
 
T
T
|
T
A
 
D
I
 
M
N
 
T
R
 
D
E
 
K
A
 
L
T
 
D
E
 
E
G
 
K
E
 
T
Q
 
K
E
 
E
Q
 
A
K
 
-
L
 
M
L
 
L
A
 
A
L
 
Q
I
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
A
V
 
Y
G
 
G
D
 
T
V
 
T
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
F
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
M

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 4:259/266 of query aligns to 3:247/247 of P73574

query
sites
P73574
S
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
A
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
G
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
M
A
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
H
 
A
S
 
Q
S
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
A
A
 
A
Q
 
D
D
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
A
E
 
E
I
 
I
N
 
I
A
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
N
E
 
A
H
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
D
Q
 
Q
L
 
L
F
 
I
A
 
K
Q
 
T
T
 
T
L
 
L
E
 
D
A
 
K
F
 
F
G
 
S
T
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
 
N
S
 
A
G
 
G
L
 
I
Q
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
T
A
 
L
A
 
L
V
 
L
D
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
L
A
 
E
D
 
D
W
 
W
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
S
R
 
K
V
 
L
F
 
M
N
 
L
R
 
K
Q
 
Q
G
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
K
A
 
S
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
 
I
S
 
T
S
 
S
V
 
V
H
 
A
Q
 
G
R
 
M
I
 
M
P
 
G
W
 
N
A
x
P
G
 
G
H
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
F
M
 
T
Q
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
T
 
L
S
 
A
H
 
S
Q
 
R
R
 
G
I
 
V
R
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
x
F
I
 
I
R
 
A
T
 
T
A
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
D
A
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
N
E
 
L
Q
x
N
E
 
A
Q
 
E
K
 
P
L
 
I
L
 
L
A
 
Q
L
 
F
I
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
A
R
 
R
V
 
Y
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
T
V
 
I
V
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
D
-
 
P
L
 
A
S
 
A
D
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
F
F
 
N
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
M
Y
 
F

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
39% identity, 94% coverage: 9:258/266 of query aligns to 3:244/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
G
 
A
S
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
G
D
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
C
A
 
K
V
 
V
V
 
L
L
 
V
N
|
N
Y
|
Y
H
x
A
S
x
R
S
|
S
A
 
A
G
 
K
P
 
A
A
 
A
Q
 
E
D
 
E
L
 
V
A
 
S
R
 
K
E
 
Q
I
 
I
N
 
E
A
 
A
N
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
F
G
 
G
A
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
K
E
 
E
H
 
A
E
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
A
L
 
M
F
 
M
A
 
K
Q
 
T
T
 
A
L
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
W
G
 
G
T
 
T
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
L
 
I
Q
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
T
A
 
L
A
 
L
V
 
I
D
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
K
A
 
S
D
 
Q
W
 
W
N
 
D
T
 
E
V
 
V
I
 
I
G
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
T
R
 
K
V
 
I
F
 
M
N
 
M
R
 
K
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
K
A
 
R
A
 
K
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
V
Q
 
G
R
 
L
I
 
I
P
 
G
W
 
N
A
 
I
G
 
G
H
 
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
F
M
 
S
Q
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
T
 
G
S
 
A
H
 
S
Q
 
R
R
 
N
I
 
I
R
 
N
I
 
V
N
 
N
S
 
V
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
A
 
F
I
|
I
R
 
A
T
x
S
A
 
D
I
x
M
N
 
T
R
 
A
E
 
K
A
 
L
T
 
G
E
 
E
G
 
-
E
 
D
Q
 
M
E
 
E
Q
 
K
K
 
K
L
 
I
L
 
L
A
 
G
L
 
T
I
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
T
G
 
G
D
 
Q
V
 
P
E
 
E
D
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
L
V
 
V
V
 
E
W
 
F
L
 
L
A
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
P
L
 
A
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
A
L
 
F
F
 
T
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
S
 
A
L
 
I

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
42% identity, 94% coverage: 7:255/266 of query aligns to 4:249/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
R
 
R
Q
 
N
V
 
V
A
 
M
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
A
G
 
A
S
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
L
L
 
A
A
 
A
D
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
Y
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
L
N
 
N
Y
 
Y
H
x
L
S
x
R
S
x
N
A
 
R
G
 
E
P
 
A
A
 
A
Q
 
E
D
 
A
L
 
L
A
 
R
R
 
Q
E
 
R
I
 
I
N
 
E
A
 
R
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
A
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
K
 
E
E
 
E
H
 
G
E
 
D
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
S
T
 
I
L
 
D
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
T
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
|
G
-
 
M
L
 
L
Q
 
E
K
 
A
D
 
Q
A
 
T
A
 
R
A
 
L
V
 
E
D
 
N
M
 
I
S
 
D
L
 
A
A
 
A
D
 
R
W
 
L
N
 
H
T
 
R
V
 
V
I
 
F
G
 
A
T
|
T
N
 
N
L
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
K
R
 
R
V
 
L
F
 
S
N
 
T
R
 
R
Q
 
H
G
 
G
I
 
G
R
 
R
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
G
G
 
G
K
 
S
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
x
V
S
 
S
S
|
S
V
 
M
H
 
A
Q
 
S
R
 
R
I
 
L
P
 
G
W
 
S
A
 
P
G
 
N
-
 
E
H
 
Y
V
 
I
N
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
M
M
 
T
Q
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
T
 
V
S
 
A
H
 
A
Q
 
E
R
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
R
P
|
P
G
|
G
A
 
L
I
|
I
R
 
D
T
|
T
A
 
E
I
|
I
N
x
H
R
 
A
E
 
S
A
 
G
T
 
G
E
 
E
G
 
P
E
 
G
Q
 
R
E
 
I
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
K
A
 
G
L
 
G
I
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
G
G
 
G
D
 
T
V
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
R
A
 
A
V
 
I
V
 
L
W
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
E
S
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
S
V
 
T
G
 
G
T
 
T
T
 
F
L
 
I
F
 
D
I
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 5:256/266 of query aligns to 3:251/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
L
 
L
A
 
I
R
 
D
Q
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
C
A
 
A
D
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
G
Y
 
H
H
x
S
S
 
G
S
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
R
A
 
A
G
 
G
P
 
-
A
 
A
Q
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
A
A
 
A
N
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
A
K
 
D
E
 
L
H
 
D
E
 
S
V
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
F
 
V
A
 
A
Q
 
A
T
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
|
G
L
x
I
Q
 
C
K
 
P
D
x
F
A
 
H
A
 
S
A
 
F
V
 
L
D
 
D
M
 
M
S
 
P
L
 
R
A
 
E
D
 
L
W
 
Y
N
 
L
T
 
K
V
 
T
I
 
V
G
 
G
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
F
 
Y
L
 
F
C
 
T
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
A
R
 
R
V
 
R
F
 
M
N
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
R
A
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
H
 
A
M
x
V
S
|
S
S
|
S
V
 
I
H
x
S
Q
 
A
R
 
L
I
 
V
P
 
G
W
 
G
A
 
A
G
 
M
H
x
Q
V
 
T
N
 
H
Y
|
Y
A
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
D
 
L
L
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
S
 
S
L
 
C
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
T
 
L
S
 
G
H
 
P
Q
 
Y
R
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
C
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
T
I
|
I
R
 
A
T
|
T
A
 
D
I
|
I
N
|
N
R
 
K
E
 
E
-
 
D
A
 
L
T
 
S
E
 
D
G
 
L
E
 
E
Q
 
K
E
 
R
Q
 
E
K
 
R
L
 
M
L
 
T
A
 
S
L
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
D
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
P
V
 
I
V
 
V
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
|
D
L
x
M
S
 
A
D
x
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
F
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
39% identity, 95% coverage: 5:256/266 of query aligns to 3:251/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
L
 
L
A
 
I
R
 
D
Q
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
C
A
 
A
D
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
G
Y
 
H
H
 
S
S
 
G
S
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
R
A
 
A
G
 
G
P
 
-
A
 
A
Q
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
A
A
 
A
N
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
A
K
 
D
E
 
L
H
 
D
E
 
S
V
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
F
 
V
A
 
A
Q
 
A
T
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
|
G
L
x
I
Q
 
C
K
 
P
D
 
F
A
 
H
A
 
S
A
 
F
V
 
L
D
 
D
M
 
M
S
 
P
L
 
R
A
 
E
D
 
L
W
 
Y
N
 
L
T
 
K
V
 
T
I
 
V
G
 
G
T
|
T
N
 
N
L
 
L
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
F
 
Y
L
 
F
C
 
T
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
A
R
 
R
V
 
R
F
 
M
N
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
R
A
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
H
 
A
M
x
V
S
 
S
S
|
S
V
 
I
H
 
S
Q
 
A
R
 
L
I
 
V
P
 
G
W
 
G
A
 
A
G
 
M
H
 
Q
V
 
T
N
 
H
Y
|
Y
A
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
D
 
L
L
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
S
 
S
L
 
C
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
T
 
L
S
 
G
H
 
P
Q
 
Y
R
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
C
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
T
I
|
I
R
 
A
T
|
T
A
 
D
I
|
I
N
 
N
R
 
K
E
 
E
-
 
D
A
 
L
T
 
S
E
 
D
G
 
L
E
 
E
Q
 
K
E
 
R
Q
 
E
K
 
R
L
 
M
L
 
T
A
 
S
L
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
D
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
P
V
 
I
V
 
V
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
F
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
42% identity, 96% coverage: 3:258/266 of query aligns to 1:239/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
I
 
L
S
 
P
L
 
L
A
 
T
R
 
D
Q
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
S
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
H
x
A
S
|
S
S
|
S
A
 
A
G
 
G
P
 
A
A
 
A
Q
 
D
D
 
E
L
 
V
A
 
V
R
 
A
E
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
N
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
F
A
 
A
V
 
V
G
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
Q
E
 
E
H
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
A
T
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
R
F
 
W
G
 
G
T
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
L
 
I
Q
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
T
A
 
L
A
 
L
V
 
L
D
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
R
A
 
D
D
 
D
W
 
W
N
 
Q
T
 
S
V
 
V
I
 
L
G
 
D
T
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
A
R
 
K
V
 
I
F
 
M
N
 
L
R
 
K
Q
 
Q
G
 
-
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
H
 
V
Q
 
G
R
 
E
I
 
M
P
 
G
W
 
N
A
 
P
G
 
G
H
x
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
T
Q
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
T
 
L
S
 
A
H
 
S
Q
 
R
R
 
G
I
 
I
R
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
F
I
|
I
R
 
A
T
|
T
A
 
D
I
x
M
N
 
T
R
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
E
L
 
V
I
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
Y
G
 
G
D
 
E
V
 
A
E
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
G
A
 
V
V
 
V
V
 
R
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
-
 
P
L
 
A
S
 
A
D
 
A
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
I
F
 
N
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
S
 
V
L
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
38% identity, 94% coverage: 10:258/266 of query aligns to 7:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
G
 
S
S
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
A
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
N
 
N
Y
 
Y
H
 
A
S
 
G
S
 
S
A
 
K
G
 
E
P
 
K
A
 
A
Q
 
E
D
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
K
A
 
A
N
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
D
E
 
A
H
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
Q
 
A
L
 
M
F
 
I
A
 
K
Q
 
E
T
 
V
L
 
V
E
 
S
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
T
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
 
A
G
 
G
L
 
I
Q
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
A
 
L
A
 
L
V
 
M
D
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
E
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
N
 
D
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
A
 
I
R
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
-
R
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
T
R
 
P
Q
 
Q
G
 
M
I
 
L
R
 
R
Q
 
Q
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
V
Q
 
G
R
 
A
I
 
V
P
 
G
W
 
N
A
 
P
G
 
G
H
x
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
T
Q
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
T
 
L
S
 
A
H
 
S
Q
 
R
R
 
G
I
 
I
R
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
F
I
 
I
R
 
V
T
 
S
A
 
D
I
 
M
N
 
T
R
 
-
E
 
D
A
 
A
T
 
L
E
 
S
G
 
D
E
 
E
Q
 
L
E
 
K
Q
 
E
K
 
Q
L
 
M
L
 
L
A
 
T
L
 
Q
I
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
A
R
 
R
V
 
F
G
 
G
D
 
Q
V
 
D
E
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
K
S
 
A
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
F
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
38% identity, 94% coverage: 10:258/266 of query aligns to 4:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
S
S
 
I
A
 
A
R
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
A
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
N
|
N
Y
|
Y
H
x
A
S
x
G
S
|
S
A
 
K
G
 
E
P
 
K
A
 
A
Q
 
E
D
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
K
A
 
A
N
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
V
 
I
G
 
Q
A
|
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
K
 
D
E
 
A
H
 
D
E
 
E
V
 
V
E
 
K
Q
 
A
L
 
M
F
 
I
A
 
K
Q
 
E
T
 
V
L
 
V
E
 
S
A
 
Q
F
 
F
G
 
G
T
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
 
G
L
 
I
Q
 
T
K
 
R
D
 
D
A
 
N
A
 
L
A
 
L
V
 
M
D
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
E
A
 
Q
D
 
E
W
 
W
N
 
D
T
 
D
V
 
V
I
 
I
G
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
A
 
I
R
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
-
R
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
T
R
 
P
Q
 
Q
G
 
M
I
 
L
R
 
R
Q
 
Q
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
R
A
 
S
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
V
Q
 
G
R
 
A
I
 
V
P
 
G
W
 
N
A
 
P
G
 
G
H
x
Q
V
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
L
M
 
T
Q
 
K
S
 
S
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
E
T
 
L
S
 
A
H
 
S
Q
 
R
R
 
G
I
 
I
R
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
F
I
 
I
R
 
V
T
 
S
A
 
D
I
 
M
N
 
T
R
 
D
E
 
E
A
 
L
T
 
K
E
 
E
G
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
-
K
 
Q
L
 
M
L
 
L
A
 
T
L
 
Q
I
 
I
P
 
P
Y
 
L
G
 
A
R
 
R
V
 
F
G
 
G
D
 
Q
V
 
D
E
 
T
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
T
V
 
V
V
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
K
S
 
A
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
F
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
Y
L
 
M

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
38% identity, 95% coverage: 5:258/266 of query aligns to 5:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
A
 
Q
R
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
G
 
E
S
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
V
L
 
F
A
 
M
D
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
A
N
x
D
Y
x
F
H
 
N
S
 
E
S
 
A
A
 
A
G
 
G
P
 
K
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
E
E
 
A
I
 
V
N
 
E
A
 
A
N
 
N
G
 
P
G
 
G
R
 
-
A
 
V
I
 
V
A
 
F
V
 
I
G
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
D
E
 
R
H
 
E
E
 
S
V
 
V
E
 
H
Q
 
R
L
 
L
F
 
V
A
 
E
Q
 
N
T
 
V
L
 
A
E
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
T
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
|
G
L
x
I
Q
 
T
K
 
R
D
|
D
A
 
S
A
 
M
A
 
L
V
 
S
D
x
K
M
 
M
S
 
T
L
 
V
A
 
D
D
 
Q
W
 
F
N
 
Q
T
 
Q
V
 
V
I
 
I
G
 
N
T
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
Q
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
R
 
P
V
 
Y
F
 
M
N
 
A
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
H
 
T
Q
 
G
R
 
T
I
 
Y
P
 
G
W
x
N
A
x
V
G
 
G
H
x
Q
V
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
I
L
 
G
L
 
M
M
 
T
Q
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
T
 
L
S
 
A
H
 
R
Q
 
K
R
 
G
I
 
I
R
 
N
I
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
x
F
I
x
T
R
 
E
T
|
T
A
 
A
I
x
M
N
 
V
R
 
A
E
 
E
A
 
V
T
 
P
E
 
E
G
 
K
E
 
V
Q
 
I
E
 
E
Q
 
-
K
|
K
L
 
M
L
 
K
A
 
A
L
 
Q
I
 
V
P
 
P
Y
 
M
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
D
 
K
V
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
Y
V
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
L
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
N
G
 
G
T
 
H
T
 
V
L
 
L
F
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
S
 
M
L
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
38% identity, 96% coverage: 3:258/266 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
I
 
M
S
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Q
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
F
G
 
G
S
 
I
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
I
L
 
I
N
 
A
Y
x
D
H
x
R
S
 
D
S
 
A
A
 
H
G
 
G
P
 
E
A
 
A
Q
 
A
D
 
-
L
 
-
A
 
A
R
 
A
E
 
S
I
 
L
N
 
R
A
 
E
N
 
S
G
 
G
G
 
A
R
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
F
V
 
I
G
 
S
A
x
C
D
 
N
V
x
I
S
 
A
K
 
E
E
 
K
H
 
T
E
 
Q
V
 
V
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
S
Q
 
Q
T
 
A
L
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
 
A
G
|
G
L
x
I
Q
 
N
K
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
M
A
 
L
V
 
H
D
 
K
M
 
L
S
 
T
L
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
N
 
D
T
 
T
V
 
V
I
 
I
G
 
D
T
x
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
M
-
 
Q
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
R
V
 
-
F
 
-
N
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
 
M
R
 
R
Q
 
E
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
R
A
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
H
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
H
 
S
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
P
 
-
W
 
W
A
 
L
G
 
G
H
 
N
V
 
V
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
V
L
 
G
L
 
M
M
 
T
Q
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
C
Q
 
R
E
 
E
T
 
L
S
 
A
H
 
K
Q
 
K
R
 
G
I
 
V
R
 
T
I
 
V
N
 
N
S
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
A
 
F
I
|
I
R
 
D
T
|
T
A
 
D
I
 
M
N
x
T
R
 
R
E
 
G
A
 
V
T
 
P
E
 
E
G
 
N
E
 
V
Q
 
W
E
 
-
Q
 
Q
K
 
I
L
 
M
L
 
V
A
 
S
L
 
K
I
 
I
P
 
P
Y
 
A
G
 
G
R
 
Y
V
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
A
E
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
G
N
 
E
A
 
C
V
 
V
V
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
G
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
I
V
 
N
G
 
G
T
 
E
T
 
V
L
 
I
F
 
N
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
V
L
 
L

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
38% identity, 95% coverage: 5:256/266 of query aligns to 3:242/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
L
 
L
A
 
I
R
 
D
Q
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
G
 
A
S
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
L
 
C
A
 
A
D
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
G
Y
x
H
H
x
S
S
 
G
S
 
S
-
 
D
-
 
E
-
x
G
-
 
R
A
 
A
G
 
G
P
 
-
A
 
A
Q
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
A
A
 
A
N
 
F
G
 
G
G
 
G
R
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
D
|
D
V
x
A
S
 
A
K
 
D
E
 
L
H
 
D
E
 
S
V
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
L
F
 
V
A
 
A
Q
 
A
T
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
x
A
G
|
G
L
x
I
Q
 
C
K
 
P
D
 
F
A
 
H
A
 
S
A
 
F
V
 
L
D
 
D
M
 
M
S
 
P
L
 
R
A
 
E
D
 
L
W
 
Y
N
 
L
T
 
K
V
 
T
I
 
V
G
 
G
T
|
T
N
 
N
L
 
L
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
F
 
Y
L
 
F
C
 
T
A
 
V
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
A
R
 
R
V
 
R
F
 
M
N
 
K
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
R
A
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
H
 
A
M
 
V
S
 
S
S
|
S
V
 
I
H
 
S
Q
 
A
R
 
L
I
 
V
P
 
G
W
 
G
A
 
A
G
 
M
H
 
Q
V
 
T
N
 
H
Y
|
Y
A
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
L
D
 
L
L
 
S
L
 
L
M
 
M
Q
 
Q
S
 
S
L
 
C
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
T
 
L
S
 
G
H
 
P
Q
 
Y
R
 
G
I
 
I
R
 
R
I
 
C
N
 
N
S
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
T
I
|
I
R
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
A
E
 
D
G
 
L
E
 
E
Q
 
K
E
 
R
Q
 
E
K
 
R
L
 
M
L
 
T
A
 
S
L
 
R
I
 
V
P
 
P
Y
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
L
G
 
G
D
 
E
V
 
P
E
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
N
 
G
A
 
P
V
 
I
V
 
V
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
L
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
S
L
 
L
F
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
36% identity, 97% coverage: 3:261/266 of query aligns to 1:248/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
I
x
M
S
 
G
L
 
I
A
 
Q
R
 
N
Q
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
A
 
K
G
 
Q
S
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
Y
 
-
H
x
D
S
 
I
S
 
D
A
 
A
G
 
E
P
 
K
A
 
V
Q
 
R
D
 
A
L
 
T
A
 
V
R
 
D
E
 
E
I
 
F
N
 
S
A
 
A
N
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
G
V
 
A
G
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
G
K
 
N
E
 
K
H
 
A
E
 
A
V
 
V
E
 
D
Q
 
G
L
 
M
F
 
V
A
 
K
Q
 
Q
T
 
T
L
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
G
 
G
T
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
N
N
|
N
S
 
A
G
 
G
L
 
M
Q
 
E
K
 
R
D
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
L
V
 
R
D
 
K
M
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
W
N
 
D
T
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
N
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
-
R
 
-
V
 
-
F
 
-
N
 
-
R
 
-
Q
 
H
G
 
G
I
 
-
R
 
-
Q
 
H
G
 
M
V
 
V
S
 
E
R
 
N
A
 
K
A
 
H
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
V
H
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
-
H
 
R
Q
 
A
R
 
W
I
 
L
P
 
G
W
 
G
A
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
T
N
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
V
L
 
G
L
 
M
M
 
T
Q
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
I
E