SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_23595 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_23595 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
36% identity, 95% coverage: 10:250/254 of query aligns to 3:251/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
H
 
K
E
 
D
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
K
A
 
S
I
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
R
L
 
F
H
 
A
V
 
T
R
 
E
G
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
x
R
-
 
S
-
 
K
-
 
E
E
 
D
D
 
E
I
 
A
N
 
N
P
 
S
A
 
V
V
 
L
H
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
K
R
 
K
P
 
V
G
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
A
V
 
I
P
 
A
L
 
V
E
 
K
A
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
V
D
 
E
G
 
S
A
 
D
A
 
V
E
 
I
R
 
N
A
 
L
V
 
V
G
 
Q
L
 
S
A
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
I
 
A
I
 
N
N
 
P
K
 
V
L
 
S
V
 
S
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
S
R
 
L
Q
 
S
D
 
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
 
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
Y
M
 
F
M
 
V
P
 
E
N
 
N
K
 
D
-
 
I
A
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
Y
 
V
A
 
H
S
 
E
Y
 
K
F
 
I
A
 
P
F
 
W
P
 
P
T
 
L
I
 
F
A
 
V
A
 
H
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
M
A
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
I
 
A
E
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
G
 
G
V
x
P
G
|
G
D
 
A
V
x
I
V
 
N
T
|
T
N
 
P
I
 
I
L
 
N
N
 
A
D
 
E
V
 
K
V
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
-
P
 
P
A
 
E
F
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
D
H
 
V
G
 
E
E
 
S
A
 
M
A
 
I
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
Y
A
 
I
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
I
V
 
T
V
 
L
M
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
38% identity, 96% coverage: 8:250/254 of query aligns to 4:251/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
I
 
L
P
 
T
H
 
Q
E
 
R
V
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
T
A
 
G
L
 
R
L
 
R
L
 
L
H
 
R
V
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
G
D
|
D
I
|
I
N
 
D
P
 
P
A
 
T
V
 
T
H
 
G
E
 
K
L
 
A
A
 
A
R
 
A
P
 
D
G
 
E
L
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
F
V
 
V
P
 
P
L
x
V
E
 
-
A
 
-
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
E
D
 
Q
G
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
R
 
N
A
 
L
V
 
F
G
 
D
L
 
T
A
 
A
V
 
A
E
 
S
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
S
I
 
P
-
 
P
-
 
E
N
 
D
K
 
D
L
 
L
V
 
I
I
 
E
D
 
N
M
 
T
T
 
D
R
 
L
Q
 
P
D
 
A
W
 
W
E
 
Q
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
A
 
D
V
 
I
N
 
N
A
 
L
T
 
K
A
 
S
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
H
 
S
S
 
C
R
 
R
E
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
H
M
 
M
M
 
V
P
 
P
N
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
Y
 
F
A
 
V
S
 
A
Y
 
V
F
 
M
A
 
G
F
 
S
P
 
A
T
 
T
I
 
S
A
x
Q
-
 
I
A
 
S
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
V
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
T
 
S
R
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
G
L
 
V
E
 
Q
V
 
Y
I
 
A
E
 
R
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
G
 
C
V
x
P
G
 
G
D
x
P
V
|
V
V
 
N
T
 
T
N
 
P
I
 
L
L
 
L
N
 
Q
D
 
E
V
 
L
V
 
F
E
 
A
D
 
K
G
 
D
P
 
P
A
 
E
F
 
R
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
H
 
R
G
 
L
E
 
V
A
 
H
A
 
I
P
 
P
I
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
F
A
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
F
M
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
T
 
S

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
36% identity, 95% coverage: 10:250/254 of query aligns to 3:251/261 of P40288

query
sites
P40288
H
 
K
E
 
D
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
x
V
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
S
A
x
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
K
|
K
A
x
S
I
x
M
A
|
A
L
x
I
L
x
R
L
x
F
H
x
A
V
x
T
R
x
E
G
x
K
A
|
A
K
|
K
V
|
V
I
x
V
A
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
E
E
 
D
D
 
E
I
 
A
N
 
N
P
 
S
A
 
V
V
 
L
H
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
K
R
 
K
P
 
V
G
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
A
V
 
I
P
 
A
L
 
V
E
 
K
A
 
G
D
 
D
I
 
V
T
 
T
A
 
V
D
 
E
G
 
S
A
 
D
A
 
V
E
 
I
R
 
N
A
 
L
V
 
V
G
 
Q
L
 
S
A
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
x
E
I
 
N
N
 
P
K
 
V
L
 
S
V
 
S
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
S
R
 
L
Q
 
S
D
|
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
x
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
Y
M
 
F
M
 
V
P
x
E
N
 
N
K
 
D
-
 
I
A
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
Y
 
V
A
 
H
S
 
E
Y
 
K
F
 
I
A
 
P
F
 
W
P
 
P
T
 
L
I
 
F
A
 
V
A
 
H
Y
 
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
G
L
 
M
A
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
I
 
A
E
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
P
G
 
G
D
 
A
V
 
I
V
 
N
T
 
T
N
x
P
I
 
I
L
 
N
N
 
A
D
 
E
V
 
K
V
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
-
P
 
P
A
 
E
F
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
D
H
 
V
G
x
E
E
 
S
A
 
M
A
 
I
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
x
Y
A
 
I
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
I
V
 
T
V
 
L
M
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
38% identity, 93% coverage: 15:250/254 of query aligns to 8:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
L
 
Q
L
 
A
L
 
F
H
 
L
V
 
G
R
 
Q
G
 
Q
A
 
A
K
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
D
P
 
E
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
M
V
 
V
H
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
N
R
 
N
P
 
D
G
 
R
L
 
L
V
 
H
P
 
F
L
 
V
E
 
Q
A
x
T
D
 
D
I
|
I
T
 
T
A
 
D
D
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
R
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
E
L
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
H
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
I
 
E
I
 
I
N
 
V
K
 
A
L
 
P
V
 
I
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
E
R
 
L
Q
 
S
D
 
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
 
V
Q
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
M
F
 
F
L
 
L
H
 
M
S
 
S
R
 
K
E
 
H
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
H
M
 
M
M
 
L
P
 
A
N
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
Y
 
V
A
 
G
S
 
G
Y
 
L
F
 
V
A
 
A
F
 
W
P
 
P
T
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
V
 
Y
I
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
G
 
C
V
x
P
G
|
G
D
 
-
V
x
I
V
x
I
T
 
D
N
 
T
I
 
P
L
 
L
N
 
N
D
 
E
-
 
K
-
 
S
V
 
F
V
 
L
E
 
E
D
 
N
G
 
N
P
 
E
A
 
G
F
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
A
 
K
Q
 
E
H
 
K
G
 
A
E
 
K
A
 
V
A
 
N
P
 
P
I
 
L
G
 
L
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
A
V
 
I
M
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
38% identity, 93% coverage: 15:250/254 of query aligns to 8:225/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
L
 
Q
L
 
A
L
 
F
H
 
L
V
 
G
R
 
Q
G
 
Q
A
 
A
K
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
D
P
 
E
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
M
V
 
V
H
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
N
R
 
N
P
 
D
G
 
R
L
 
L
V
 
H
P
 
F
L
 
V
E
 
Q
A
x
T
D
|
D
I
|
I
T
 
T
A
 
D
D
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
R
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
E
L
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
H
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
E
I
 
I
N
 
V
K
 
A
L
 
P
V
 
I
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
E
R
 
L
Q
 
S
D
 
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
 
V
Q
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
M
F
 
F
L
 
L
H
 
M
S
 
S
R
 
K
E
 
H
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
H
M
 
M
M
 
L
P
 
A
N
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
Y
 
V
A
 
G
S
 
G
Y
 
L
F
 
V
A
 
A
F
 
W
P
 
P
T
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
V
 
Y
I
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
G
 
C
V
x
P
G
|
G
D
 
I
V
x
I
V
 
D
T
 
T
N
 
L
I
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
A
V
 
I
M
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
37% identity, 94% coverage: 10:249/254 of query aligns to 1:237/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
H
 
K
E
 
K
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
Y
H
 
A
V
 
E
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
G
D
|
D
I
x
L
N
 
G
P
 
D
A
 
L
V
 
T
H
 
Y
E
 
-
L
 
-
A
 
S
R
 
H
P
 
P
G
 
N
L
 
V
V
 
E
P
 
G
L
 
M
E
 
Y
A
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
D
 
V
G
 
T
A
 
G
A
 
V
E
 
E
R
 
K
A
 
F
V
 
Y
G
 
Q
L
 
S
A
 
V
V
 
I
E
 
D
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
I
 
T
I
 
K
N
 
D
K
 
A
L
 
M
V
 
T
I
 
R
D
 
K
M
 
M
T
 
T
R
 
E
Q
 
A
D
 
Q
W
 
W
E
 
D
R
 
A
I
 
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
K
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
N
H
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
L
A
 
V
V
 
G
K
 
P
A
 
Q
M
 
M
M
 
Q
P
 
T
N
 
N
K
 
G
A
 
Y
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
V
F
 
F
A
 
G
F
 
N
P
 
I
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
M
T
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
F
I
 
A
E
 
L
H
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
Y
V
x
I
V
 
M
T
|
T
N
 
D
I
 
I
L
 
L
N
 
K
D
 
T
V
 
V
V
 
P
E
 
Q
D
 
D
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
L
L
 
L
A
 
D
Q
 
K
H
 
F
G
 
A
E
 
A
A
 
L
A
 
T
P
 
M
I
 
L
G
 
N
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
T
V
 
I
M
 
N
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
36% identity, 94% coverage: 11:250/254 of query aligns to 10:257/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
E
 
D
V
 
L
Q
 
K
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
F
H
 
G
V
 
Q
R
 
E
G
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
x
Y
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
E
A
 
A
E
 
L
D
 
D
I
 
A
N
 
K
P
 
K
A
 
E
V
 
V
H
 
E
E
 
E
L
 
A
A
 
G
R
 
G
P
 
Q
G
 
A
L
 
I
V
 
I
P
 
-
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
K
D
 
E
G
 
E
A
 
D
A
 
V
E
 
V
R
 
N
A
 
L
V
 
V
G
 
Q
L
 
T
A
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
I
x
E
I
 
N
N
 
P
K
 
V
L
 
P
V
 
S
I
 
H
D
 
E
M
 
L
T
 
S
R
 
L
Q
 
D
D
 
N
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
 
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
Y
M
 
F
M
 
V
P
 
E
N
 
N
K
 
D
-
 
I
A
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
Y
 
V
A
x
H
S
 
E
Y
 
M
F
 
I
A
 
P
F
x
W
P
 
P
T
 
L
I
 
F
A
 
V
A
 
H
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
M
A
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
I
 
A
E
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
G
 
G
V
x
P
G
|
G
D
 
A
V
x
M
V
 
N
T
|
T
N
x
P
I
|
I
L
x
N
N
 
A
D
 
E
V
x
K
V
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
-
P
 
P
A
 
V
F
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
D
H
 
V
G
 
E
E
 
S
A
 
M
A
 
I
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
Y
A
 
I
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
R
 
Q
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
I
V
 
T
V
 
L
M
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
38% identity, 93% coverage: 15:250/254 of query aligns to 6:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
H
L
 
S
L
 
Y
H
 
A
V
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
V
E
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
N
P
 
K
A
 
A
V
 
V
H
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
K
R
 
A
P
 
Q
G
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
A
V
 
S
P
 
F
L
 
V
E
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
T
T
 
S
A
 
N
D
 
P
G
 
E
A
 
E
A
 
V
E
 
E
R
 
A
A
 
L
V
 
V
G
 
K
L
 
R
A
 
T
V
 
V
E
 
E
Q
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
G
I
 
G
N
 
E
K
 
Q
-
 
A
L
 
L
V
 
A
I
 
G
D
 
D
M
 
Y
T
 
G
R
 
L
Q
 
D
D
 
S
W
 
W
E
 
R
R
 
K
I
 
V
Q
 
L
A
 
S
V
 
I
N
 
N
A
 
L
T
 
D
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
Y
H
 
G
S
 
C
R
 
K
E
 
Y
A
 
E
V
 
L
K
 
E
A
 
Q
M
 
M
M
 
E
P
 
K
N
 
N
K
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
Y
 
I
A
 
H
S
 
G
Y
 
I
F
 
V
A
 
A
F
 
A
P
 
P
T
 
L
I
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
N
L
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
V
 
Y
I
 
G
E
 
Q
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
G
V
x
P
G
x
A
D
x
Y
V
x
I
V
 
E
T
 
T
N
 
P
I
x
L
L
 
L
N
 
E
D
 
S
V
 
L
V
 
T
E
 
K
D
 
E
-
 
M
G
 
K
P
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
K
H
 
H
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
R
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
V
 
M
V
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
V
 
Y
M
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 94% coverage: 12:249/254 of query aligns to 6:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
L
L
 
L
H
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
S
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
D
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
M
E
 
A
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
N
D
 
P
G
 
E
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
A
A
 
V
V
 
L
G
 
K
L
 
A
A
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
E
Q
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
S
R
 
D
I
 
I
Q
 
M
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
I
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
R
A
 
G
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
A
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
F
V
x
I
V
 
E
T
|
T
N
 
D
I
x
M
-
 
T
-
 
K
-
 
A
L
 
L
N
 
N
D
 
D
V
 
-
V
 
-
E
 
E
D
 
Q
G
 
R
P
 
T
A
 
A
F
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
38% identity, 94% coverage: 12:249/254 of query aligns to 6:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
L
L
 
L
H
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
S
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
D
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
M
E
 
A
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
N
D
 
P
G
 
E
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
A
A
 
V
V
 
L
G
 
K
L
 
A
A
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
E
Q
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
S
R
 
D
I
 
I
Q
 
M
A
 
E
V
 
T
N
|
N
A
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
I
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
R
A
 
G
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
V
A
x
G
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
A
T
 
G
I
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
F
V
 
I
V
 
E
T
|
T
N
 
D
I
 
-
L
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
-
V
 
-
E
 
E
D
 
Q
G
 
R
P
 
T
A
 
A
F
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
36% identity, 93% coverage: 15:251/254 of query aligns to 6:239/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
E
L
 
L
H
 
A
V
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
A
A
 
V
E
 
N
D
 
Y
I
x
A
N
x
S
P
x
S
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
A
V
 
A
H
 
I
E
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
G
P
 
G
G
 
E
L
 
A
V
 
F
P
 
A
L
 
V
E
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
Q
D
 
E
G
 
S
A
 
E
A
 
V
E
 
E
R
 
A
A
 
L
V
 
F
G
 
A
L
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
T
L
 
L
V
 
L
I
 
L
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
R
Q
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
Q
R
 
S
I
 
V
Q
 
L
A
 
D
V
x
L
N
 
N
A
 
L
T
 
G
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
H
 
C
S
 
S
R
 
R
E
 
A
A
 
A
V
 
A
K
 
K
A
 
I
M
 
M
M
 
L
P
 
K
N
 
Q
K
 
R
A
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
E
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
P
T
 
G
I
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
L
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
F
V
x
I
V
 
A
T
|
T
N
 
D
I
x
M
L
 
T
N
 
S
D
 
L
V
 
L
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
V
A
 
I
P
 
P
I
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
Y
A
 
G
Q
 
E
P
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
-
 
P
R
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
V
V
 
I
M
 
N
A
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
T
 
V
V
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 93% coverage: 13:249/254 of query aligns to 4:241/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
H
 
A
V
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
N
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
L
E
 
M
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
D
 
P
G
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
E
L
 
K
A
 
I
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
D
Q
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
I
 
I
Q
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
G
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
x
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
G
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
F
V
x
I
V
 
E
T
 
T
N
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
S
E
 
D
D
 
D
G
 
Q
P
 
R
A
 
A
-
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
x
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
39% identity, 94% coverage: 14:252/254 of query aligns to 5:239/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
G
 
G
K
 
K
V
 
G
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
Q
L
 
A
L
 
F
H
 
A
V
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
L
E
 
C
D
|
D
I
x
L
N
x
R
P
 
P
A
 
E
V
 
G
H
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
E
P
 
A
-
 
I
G
 
G
L
 
G
V
 
A
P
 
F
L
 
F
E
 
Q
A
x
V
D
|
D
I
x
L
T
 
E
A
 
D
D
 
E
G
 
R
A
 
E
A
 
R
E
 
V
R
 
R
A
 
F
V
 
V
G
 
E
L
 
E
A
 
A
V
 
A
E
 
Y
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
I
 
A
I
 
A
N
 
P
K
 
G
L
 
S
V
 
A
I
 
L
D
 
T
M
 
V
T
 
R
R
 
L
Q
 
P
D
 
E
W
 
W
E
 
R
R
 
R
I
 
V
Q
 
L
A
 
E
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
P
F
 
M
L
 
H
H
 
L
S
 
S
R
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
A
K
 
R
A
 
E
M
 
M
M
 
R
P
 
K
N
 
V
K
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
Y
 
V
A
 
Q
S
 
G
Y
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
E
P
 
Q
T
 
E
I
x
N
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
L
A
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
L
I
 
A
E
 
P
H
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
A
V
x
I
V
 
A
T
|
T
N
 
E
I
x
A
L
x
V
N
 
L
D
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
A
D
 
R
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
R
Q
 
D
H
 
W
G
 
E
E
 
D
A
 
L
A
 
H
P
 
A
I
 
L
G
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
R
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
L
M
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
V
 
A
T
 
S

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 93% coverage: 13:249/254 of query aligns to 3:240/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
H
 
A
V
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
N
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
L
E
 
M
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
D
 
P
G
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
E
L
 
K
A
 
I
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
D
Q
 
E
D
x
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
I
 
I
Q
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
G
T
 
G
I
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
F
V
x
I
V
 
E
T
 
T
N
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
S
E
 
D
D
 
D
G
 
Q
P
 
R
A
 
A
-
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
x
E
V
x
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
37% identity, 93% coverage: 13:249/254 of query aligns to 4:241/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
H
 
V
V
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
S
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
L
E
 
M
A
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
D
 
P
G
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
E
L
 
N
A
 
V
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
D
Q
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
I
 
I
Q
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
A
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
G
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
F
V
 
I
V
 
E
T
 
T
N
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
T
E
 
D
D
 
E
G
 
Q
P
 
R
A
 
A
-
 
G
F
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
A
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
37% identity, 93% coverage: 13:249/254 of query aligns to 4:241/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
H
 
V
V
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
T
A
 
S
E
 
E
D
 
N
I
 
G
N
 
A
P
 
K
A
 
N
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
L
E
 
M
A
 
L
D
 
N
I
 
V
T
 
T
A
 
D
D
 
P
G
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
E
L
 
N
A
 
I
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
D
Q
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
I
 
I
Q
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
M
K
 
R
A
 
A
M
|
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
C
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
A
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
 
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
G
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
F
V
 
I
V
 
E
T
 
T
N
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
S
E
 
D
D
 
D
G
 
Q
P
 
R
A
 
A
-
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 93% coverage: 12:248/254 of query aligns to 3:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
T
L
 
Y
H
 
A
V
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
S
P
 
D
A
 
-
V
 
-
H
 
-
E
 
E
L
 
W
A
 
G
R
 
R
P
 
E
G
 
T
L
 
L
V
 
A
P
 
L
L
 
I
E
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
D
|
D
I
x
T
T
 
A
A
 
H
D
 
P
G
 
E
A
 
D
A
 
H
E
 
D
R
 
E
A
 
L
V
 
I
G
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
K
E
 
R
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
I
 
S
I
x
G
N
 
E
-
 
F
K
 
T
L
 
P
V
 
T
I
 
A
D
 
E
M
 
T
T
 
T
R
 
D
Q
 
A
D
 
Q
W
 
W
E
 
Q
R
|
R
I
 
V
Q
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
Y
H
 
G
S
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
Q
V
 
I
K
 
R
A
 
A
M
 
M
M