SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_23595 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_23595 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8w0oA Gdh-105 crystal structure
39% identity, 95% coverage: 11:251/254 of query aligns to 4:252/259 of 8w0oA

query
sites
8w0oA
E
 
D
V
 
L
Q
 
K
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
A
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
R
L
 
F
H
 
G
V
 
K
R
 
E
G
 
Q
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
x
Y
-
 
S
-
 
N
A
 
K
E
x
Q
D
 
D
I
 
P
N
 
N
P
 
E
A
 
V
V
 
K
H
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
I
R
 
K
P
 
A
G
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
A
V
 
V
P
 
V
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
K
D
 
E
G
 
E
A
 
D
A
 
V
E
 
K
R
 
N
A
 
I
V
 
V
G
 
Q
L
 
T
A
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
I
 
E
I
 
N
N
 
P
K
 
V
L
 
P
V
 
S
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
P
R
 
L
Q
 
K
D
 
D
W
 
W
E
 
D
R
 
K
I
 
V
Q
 
I
A
 
G
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
Y
M
 
F
M
 
V
P
 
E
N
 
N
K
 
D
-
 
I
A
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
 
S
Y
 
V
A
 
H
S
 
E
Y
 
V
F
 
I
A
 
P
F
 
W
P
 
P
T
 
L
I
 
F
A
 
V
A
 
H
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
M
A
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
I
 
A
E
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
G
 
G
V
x
P
G
|
G
D
 
A
V
x
I
V
 
N
T
|
T
N
 
T
I
 
I
L
 
N
N
 
A
D
 
E
V
 
K
V
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
-
P
 
P
A
 
K
F
 
Q
L
 
K
A
 
A
Q
 
D
H
 
V
G
 
E
E
 
S
A
 
M
A
 
I
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
Y
A
 
I
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
K
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
I
V
 
T
V
 
L
M
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
V
 
L

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
36% identity, 95% coverage: 10:250/254 of query aligns to 3:251/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
H
 
K
E
 
D
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
K
A
 
S
I
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
R
L
 
F
H
 
A
V
 
T
R
 
E
G
 
K
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
x
R
-
 
S
-
 
K
-
 
E
E
 
D
D
 
E
I
 
A
N
 
N
P
 
S
A
 
V
V
 
L
H
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
K
R
 
K
P
 
V
G
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
A
V
 
I
P
 
A
L
 
V
E
 
K
A
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
V
D
 
E
G
 
S
A
 
D
A
 
V
E
 
I
R
 
N
A
 
L
V
 
V
G
 
Q
L
 
S
A
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
L
I
 
A
I
 
N
N
 
P
K
 
V
L
 
S
V
 
S
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
S
R
 
L
Q
 
S
D
 
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
 
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
Y
M
 
F
M
 
V
P
 
E
N
 
N
K
 
D
-
 
I
A
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
Y
 
V
A
 
H
S
 
E
Y
 
K
F
 
I
A
 
P
F
 
W
P
 
P
T
 
L
I
 
F
A
 
V
A
 
H
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
M
A
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
I
 
A
E
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
G
 
G
V
x
P
G
|
G
D
 
A
V
x
I
V
 
N
T
|
T
N
 
P
I
 
I
L
 
N
N
 
A
D
 
E
V
 
K
V
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
-
P
 
P
A
 
E
F
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
D
H
 
V
G
 
E
E
 
S
A
 
M
A
 
I
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
Y
A
 
I
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
I
V
 
T
V
 
L
M
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
38% identity, 96% coverage: 8:250/254 of query aligns to 4:251/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
I
 
L
P
 
T
H
 
Q
E
 
R
V
 
L
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
T
A
 
G
L
 
R
L
 
R
L
 
L
H
 
R
V
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
G
D
|
D
I
|
I
N
 
D
P
 
P
A
 
T
V
 
T
H
 
G
E
 
K
L
 
A
A
 
A
R
 
A
P
 
D
G
 
E
L
 
L
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
F
V
 
V
P
 
P
L
x
V
E
 
-
A
 
-
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
E
D
 
Q
G
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
D
R
 
N
A
 
L
V
 
F
G
 
D
L
 
T
A
 
A
V
 
A
E
 
S
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
S
I
 
P
-
 
P
-
 
E
N
 
D
K
 
D
L
 
L
V
 
I
I
 
E
D
 
N
M
 
T
T
 
D
R
 
L
Q
 
P
D
 
A
W
 
W
E
 
Q
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
A
 
D
V
 
I
N
 
N
A
 
L
T
 
K
A
 
S
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
H
 
S
S
 
C
R
 
R
E
 
A
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
H
M
 
M
M
 
V
P
 
P
N
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
Y
 
F
A
 
V
S
 
A
Y
 
V
F
 
M
A
 
G
F
 
S
P
 
A
T
 
T
I
 
S
A
x
Q
-
 
I
A
 
S
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
V
A
 
L
Q
 
A
L
 
M
T
 
S
R
 
R
T
 
E
L
 
L
A
 
G
L
 
V
E
 
Q
V
 
Y
I
 
A
E
 
R
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
G
 
C
V
x
P
G
 
G
D
x
P
V
|
V
V
 
N
T
 
T
N
 
P
I
 
L
L
 
L
N
 
Q
D
 
E
V
 
L
V
 
F
E
 
A
D
 
K
G
 
D
P
 
P
A
 
E
F
 
R
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
H
 
R
G
 
L
E
 
V
A
 
H
A
 
I
P
 
P
I
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
F
A
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
F
M
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
I
T
 
S

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
36% identity, 95% coverage: 10:250/254 of query aligns to 3:251/261 of P40288

query
sites
P40288
H
 
K
E
 
D
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
x
V
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
S
A
x
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
K
|
K
A
x
S
I
x
M
A
|
A
L
x
I
L
x
R
L
x
F
H
x
A
V
x
T
R
x
E
G
x
K
A
|
A
K
|
K
V
|
V
I
x
V
A
 
V
-
 
N
-
 
Y
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
E
E
 
D
D
 
E
I
 
A
N
 
N
P
 
S
A
 
V
V
 
L
H
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
K
R
 
K
P
 
V
G
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
A
V
 
I
P
 
A
L
 
V
E
 
K
A
 
G
D
 
D
I
 
V
T
 
T
A
 
V
D
 
E
G
 
S
A
 
D
A
 
V
E
 
I
R
 
N
A
 
L
V
 
V
G
 
Q
L
 
S
A
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
x
E
I
 
N
N
 
P
K
 
V
L
 
S
V
 
S
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
S
R
 
L
Q
 
S
D
|
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
x
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
Y
M
 
F
M
 
V
P
x
E
N
 
N
K
 
D
-
 
I
A
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
S
S
 
S
Y
 
V
A
 
H
S
 
E
Y
 
K
F
 
I
A
 
P
F
 
W
P
 
P
T
 
L
I
 
F
A
 
V
A
 
H
Y
 
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
G
L
 
M
A
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
I
 
A
E
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
G
 
G
V
 
P
G
 
G
D
 
A
V
 
I
V
 
N
T
 
T
N
x
P
I
 
I
L
 
N
N
 
A
D
 
E
V
 
K
V
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
-
P
 
P
A
 
E
F
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
D
H
 
V
G
x
E
E
 
S
A
 
M
A
 
I
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
x
Y
A
 
I
A
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
I
V
 
T
V
 
L
M
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
38% identity, 93% coverage: 15:250/254 of query aligns to 8:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
L
 
Q
L
 
A
L
 
F
H
 
L
V
 
G
R
 
Q
G
 
Q
A
 
A
K
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
D
P
 
E
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
M
V
 
V
H
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
N
R
 
N
P
 
D
G
 
R
L
 
L
V
 
H
P
 
F
L
 
V
E
 
Q
A
x
T
D
 
D
I
|
I
T
 
T
A
 
D
D
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
R
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
E
L
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
H
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
I
 
E
I
 
I
N
 
V
K
 
A
L
 
P
V
 
I
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
E
R
 
L
Q
 
S
D
 
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
 
V
Q
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
M
F
 
F
L
 
L
H
 
M
S
 
S
R
 
K
E
 
H
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
H
M
 
M
M
 
L
P
 
A
N
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
Y
 
V
A
 
G
S
 
G
Y
 
L
F
 
V
A
 
A
F
 
W
P
 
P
T
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
V
 
Y
I
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
G
 
C
V
x
P
G
|
G
D
 
-
V
x
I
V
x
I
T
 
D
N
 
T
I
 
P
L
 
L
N
 
N
D
 
E
-
 
K
-
 
S
V
 
F
V
 
L
E
 
E
D
 
N
G
 
N
P
 
E
A
 
G
F
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
A
 
K
Q
 
E
H
 
K
G
 
A
E
 
K
A
 
V
A
 
N
P
 
P
I
 
L
G
 
L
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
A
V
 
I
M
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

8y83A Crystal structure of a ketoreductase from sphingobacterium siyangense sy1 with co-enzyme (see paper)
40% identity, 93% coverage: 15:250/254 of query aligns to 7:247/249 of 8y83A

query
sites
8y83A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
Y
H
 
G
V
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
I
E
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
P
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
E
A
 
T
V
 
V
H
 
K
E
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
S
P
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
A
V
 
V
P
 
F
L
 
F
E
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
S
T
 
S
A
 
S
D
 
P
G
 
A
A
 
D
A
 
N
E
 
E
R
 
A
A
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
K
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
G
I
 
G
N
 
E
K
 
A
-
 
A
L
 
L
V
 
T
I
 
G
D
 
D
M
 
Y
T
 
S
R
 
L
Q
 
D
D
 
G
W
 
W
E
 
K
R
 
K
I
 
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
I
N
 
N
A
 
F
T
 
N
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
Y
H
 
G
S
 
C
R
 
K
E
 
Y
A
 
Q
V
 
I
K
 
E
A
 
A
M
 
M
M
 
E
P
 
R
N
 
N
K
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
 
S
Y
 
I
A
 
H
S
 
G
Y
 
T
F
 
V
A
 
A
F
 
A
P
 
P
T
 
M
I
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
N
L
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
V
 
Y
I
 
G
E
 
Q
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
G
V
x
P
G
|
G
D
x
Y
V
x
I
V
 
D
T
 
T
N
 
P
I
x
L
L
 
L
N
 
A
D
 
K
V
 
L
-
 
D
V
 
K
E
 
E
D
 
H
G
 
I
P
 
N
A
 
A
F
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
K
H
 
H
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
D
R
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
V
 
M
V
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
V
 
Y
M
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
38% identity, 93% coverage: 15:250/254 of query aligns to 8:225/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
L
 
Q
L
 
A
L
 
F
H
 
L
V
 
G
R
 
Q
G
 
Q
A
 
A
K
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
A
D
|
D
I
|
I
N
 
D
P
 
E
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
M
V
 
V
H
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
N
R
 
N
P
 
D
G
 
R
L
 
L
V
 
H
P
 
F
L
 
V
E
 
Q
A
x
T
D
|
D
I
|
I
T
 
T
A
 
D
D
 
E
G
 
A
A
 
A
A
 
C
E
 
Q
R
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
E
L
 
S
A
 
A
V
 
V
E
 
H
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
E
I
 
I
N
 
V
K
 
A
L
 
P
V
 
I
I
 
H
D
 
E
M
 
M
T
 
E
R
 
L
Q
 
S
D
 
D
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
 
V
Q
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
M
F
 
F
L
 
L
H
 
M
S
 
S
R
 
K
E
 
H
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
H
M
 
M
M
 
L
P
 
A
N
 
A
K
 
G
A
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
Y
 
V
A
 
G
S
 
G
Y
 
L
F
 
V
A
 
A
F
 
W
P
 
P
T
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
V
 
Y
I
 
A
E
 
K
H
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
G
 
C
V
x
P
G
|
G
D
 
I
V
x
I
V
 
D
T
 
T
N
 
L
I
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
L
A
 
S
S
 
S
F
 
Y
V
 
M
V
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
A
V
 
I
M
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

8zaxA Crystal structure of a short-chain dehydrogenase from lactobacillus fermentum with NADPH
39% identity, 94% coverage: 11:250/254 of query aligns to 2:244/246 of 8zaxA

query
sites
8zaxA
E
 
Q
V
 
F
Q
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
T
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
L
L
 
F
H
 
L
V
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
G
I
 
V
A
 
A
-
 
F
-
 
T
-
x
G
-
x
R
-
x
H
E
 
E
D
 
D
I
 
E
N
 
G
P
 
K
A
 
A
V
 
V
H
 
Q
E
 
E
L
 
R
A
 
L
R
 
G
P
 
E
G
 
R
L
 
S
V
 
L
P
 
F
L
 
I
E
 
T
A
x
Q
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
K
D
 
E
G
 
E
A
 
D
A
 
W
E
 
Q
R
 
N
A
 
A
V
 
T
G
 
K
L
 
A
A
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
D
 
D
I
 
A
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
G
I
 
T
N
 
P
K
 
L
L
 
G
V
 
I
I
 
E
D
 
E
M
 
M
T
 
T
R
 
L
Q
 
D
D
 
H
W
 
W
E
 
N
R
 
R
I
 
E
Q
 
I
A
 
A
V
x
I
N
 
D
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
T
F
 
M
L
 
L
H
 
G
S
 
C
R
 
K
E
 
Y
A
 
G
V
 
V
K
 
K
A
 
A
M
 
M
M
 
K
P
 
E
N
 
H
K
 
-
A
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
S
S
|
S
Y
 
I
A
 
E
S
 
G
Y
 
M
F
 
I
A
 
G
F
 
D
P
 
P
T
 
T
I
 
V
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
V
A
 
R
Q
 
L
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
C
I
 
A
E
 
E
H
 
K
G
 
G
-
 
Y
-
 
A
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
I
G
 
Y
V
x
P
G
 
G
D
 
V
V
x
I
V
 
A
T
 
T
N
 
P
I
 
L
L
 
I
N
 
-
D
 
D
V
 
H
V
 
L
E
 
D
D
 
D
G
 
A
P
 
T
A
 
K
-
 
Q
-
 
F
F
 
Y
L
 
I
A
 
D
Q
 
K
H
 
H
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
K
V
 
M
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
V
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
S
V
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
E
V
 
F
M
 
V
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
37% identity, 94% coverage: 10:249/254 of query aligns to 1:237/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
H
 
K
E
 
K
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
Y
H
 
A
V
 
E
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
E
 
G
D
|
D
I
x
L
N
 
G
P
 
D
A
 
L
V
 
T
H
 
Y
E
 
-
L
 
-
A
 
S
R
 
H
P
 
P
G
 
N
L
 
V
V
 
E
P
 
G
L
 
M
E
 
Y
A
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
D
 
V
G
 
T
A
 
G
A
 
V
E
 
E
R
 
K
A
 
F
V
 
Y
G
 
Q
L
 
S
A
 
V
V
 
I
E
 
D
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
I
 
T
I
 
K
N
 
D
K
 
A
L
 
M
V
 
T
I
 
R
D
 
K
M
 
M
T
 
T
R
 
E
Q
 
A
D
 
Q
W
 
W
E
 
D
R
 
A
I
 
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
K
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
N
H
 
L
S
 
T
R
 
R
E
 
L
A
 
V
V
 
G
K
 
P
A
 
Q
M
 
M
M
 
Q
P
 
T
N
 
N
K
 
G
A
 
Y
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
V
F
 
F
A
 
G
F
 
N
P
 
I
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
M
T
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
F
I
 
A
E
 
L
H
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
Y
V
x
I
V
 
M
T
|
T
N
 
D
I
 
I
L
 
L
N
 
K
D
 
T
V
 
V
V
 
P
E
 
Q
D
 
D
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
L
L
 
L
A
 
D
Q
 
K
H
 
F
G
 
A
E
 
A
A
 
L
A
 
T
P
 
M
I
 
L
G
 
N
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
K
V
 
V
V
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
T
V
 
I
M
 
N
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
36% identity, 94% coverage: 11:250/254 of query aligns to 10:257/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
E
 
D
V
 
L
Q
 
K
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
R
L
 
F
H
 
G
V
 
Q
R
 
E
G
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
x
Y
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
E
A
 
A
E
 
L
D
 
D
I
 
A
N
 
K
P
 
K
A
 
E
V
 
V
H
 
E
E
 
E
L
 
A
A
 
G
R
 
G
P
 
Q
G
 
A
L
 
I
V
 
I
P
 
-
L
 
V
E
 
Q
A
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
T
A
 
K
D
 
E
G
 
E
A
 
D
A
 
V
E
 
V
R
 
N
A
 
L
V
 
V
G
 
Q
L
 
T
A
 
A
V
 
I
E
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
I
x
E
I
 
N
N
 
P
K
 
V
L
 
P
V
 
S
I
 
H
D
 
E
M
 
L
T
 
S
R
 
L
Q
 
D
D
 
N
W
 
W
E
 
N
R
 
K
I
 
V
Q
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
G
S
 
S
R
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
A
 
Y
M
 
F
M
 
V
P
 
E
N
 
N
K
 
D
-
 
I
A
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
Y
 
V
A
x
H
S
 
E
Y
 
M
F
 
I
A
 
P
F
x
W
P
 
P
T
 
L
I
 
F
A
 
V
A
 
H
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
M
A
 
K
Q
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
T
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
I
 
A
E
 
P
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
I
 
I
G
 
G
V
x
P
G
|
G
D
 
A
V
x
M
V
 
N
T
|
T
N
x
P
I
|
I
L
x
N
N
 
A
D
 
E
V
x
K
V
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
-
P
 
P
A
 
V
F
 
Q
L
 
R
A
 
A
Q
 
D
H
 
V
G
 
E
E
 
S
A
 
M
A
 
I
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
Y
A
 
I
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
A
V
 
V
V
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
R
 
Q
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
I
V
 
T
V
 
L
M
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
38% identity, 93% coverage: 15:250/254 of query aligns to 6:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
L
 
H
L
 
S
L
 
Y
H
 
A
V
 
K
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
V
E
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
N
P
 
K
A
 
A
V
 
V
H
 
E
E
 
D
L
 
I
A
 
K
R
 
A
P
 
Q
G
 
G
-
 
G
-
 
E
L
 
A
V
 
S
P
 
F
L
 
V
E
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
T
T
 
S
A
 
N
D
 
P
G
 
E
A
 
E
A
 
V
E
 
E
R
 
A
A
 
L
V
 
V
G
 
K
L
 
R
A
 
T
V
 
V
E
 
E
Q
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
G
I
 
G
N
 
E
K
 
Q
-
 
A
L
 
L
V
 
A
I
 
G
D
 
D
M
 
Y
T
 
G
R
 
L
Q
 
D
D
 
S
W
 
W
E
 
R
R
 
K
I
 
V
Q
 
L
A
 
S
V
 
I
N
 
N
A
 
L
T
 
D
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
Y
H
 
G
S
 
C
R
 
K
E
 
Y
A
 
E
V
 
L
K
 
E
A
 
Q
M
 
M
M
 
E
P
 
K
N
 
N
K
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
A
 
A
S
|
S
Y
 
I
A
 
H
S
 
G
Y
 
I
F
 
V
A
 
A
F
 
A
P
 
P
T
 
L
I
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
L
 
V
A
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
N
L
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
V
 
Y
I
 
G
E
 
Q
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
G
V
x
P
G
x
A
D
x
Y
V
x
I
V
 
E
T
 
T
N
 
P
I
x
L
L
 
L
N
 
E
D
 
S
V
 
L
V
 
T
E
 
K
D
 
E
-
 
M
G
 
K
P
 
E
A
 
A
F
 
L
L
 
I
A
 
S
Q
 
K
H
 
H
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
P
I
 
M
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
R
 
K
A
 
S
S
 
S
F
 
F
V
 
M
V
 
T
G
 
G
A
 
G
V
 
Y
V
 
Y
M
 
L
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
T
 
T

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 94% coverage: 12:249/254 of query aligns to 6:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
L
L
 
L
H
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
S
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
D
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
M
E
 
A
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
N
D
 
P
G
 
E
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
A
A
 
V
V
 
L
G
 
K
L
 
A
A
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
E
Q
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
S
R
 
D
I
 
I
Q
 
M
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
I
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
R
A
 
G
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
A
 
G
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
A
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
F
V
x
I
V
 
E
T
|
T
N
 
D
I
x
M
-
 
T
-
 
K
-
 
A
L
 
L
N
 
N
D
 
D
V
 
-
V
 
-
E
 
E
D
 
Q
G
 
R
P
 
T
A
 
A
F
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
38% identity, 94% coverage: 12:249/254 of query aligns to 6:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
L
L
 
L
H
 
A
V
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
S
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
D
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
M
E
 
A
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
N
D
 
P
G
 
E
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
A
A
 
V
V
 
L
G
 
K
L
 
A
A
 
I
V
 
T
E
 
D
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
E
Q
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
S
R
 
D
I
 
I
Q
 
M
A
 
E
V
 
T
N
|
N
A
 
L
T
 
T
A
 
S
A
 
I
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
L
K
 
R
A
 
G
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
V
A
x
G
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
A
T
 
G
I
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
T
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
F
V
 
I
V
 
E
T
|
T
N
 
D
I
 
-
L
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
-
V
 
-
E
 
E
D
 
Q
G
 
R
P
 
T
A
 
A
F
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
R
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
36% identity, 93% coverage: 15:251/254 of query aligns to 6:239/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
E
L
 
L
H
 
A
V
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
A
A
 
V
E
 
N
D
 
Y
I
x
A
N
x
S
P
x
S
A
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
V
-
 
A
V
 
A
H
 
I
E
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
G
P
 
G
G
 
E
L
 
A
V
 
F
P
 
A
L
 
V
E
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
A
 
Q
D
 
E
G
 
S
A
 
E
A
 
V
E
 
E
R
 
A
A
 
L
V
 
F
G
 
A
L
 
A
A
 
V
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
F
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
T
L
 
L
V
 
L
I
 
L
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
R
Q
 
D
D
 
D
W
 
W
E
 
Q
R
 
S
I
 
V
Q
 
L
A
 
D
V
x
L
N
 
N
A
 
L
T
 
G
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
H
 
C
S
 
S
R
 
R
E
 
A
A
 
A
V
 
A
K
 
K
A
 
I
M
 
M
M
 
L
P
 
K
N
 
Q
K
 
R
A
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
E
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
P
T
 
G
I
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
V
A
 
I
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
V
 
L
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
F
V
x
I
V
 
A
T
|
T
N
 
D
I
x
M
L
 
T
N
 
S
D
 
L
V
 
L
V
 
-
E
 
-
D
 
-
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
V
A
 
I
P
 
P
I
 
L
G
 
G
R
 
R
A
 
Y
A
 
G
Q
 
E
P
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
-
 
P
R
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
V
V
 
I
M
 
N
A
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
T
 
V
V
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 93% coverage: 13:249/254 of query aligns to 4:241/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
H
 
A
V
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
N
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
L
E
 
M
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
D
 
P
G
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
E
L
 
K
A
 
I
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
D
Q
 
E
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
I
 
I
Q
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
G
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
x
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
G
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
F
V
x
I
V
 
E
T
 
T
N
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
S
E
 
D
D
 
D
G
 
Q
P
 
R
A
 
A
-
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
x
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
39% identity, 94% coverage: 14:252/254 of query aligns to 5:239/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
G
 
G
K
 
K
V
 
G
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
Q
L
 
A
L
 
F
H
 
A
V
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
I
 
A
A
 
L
E
 
C
D
|
D
I
x
L
N
x
R
P
 
P
A
 
E
V
 
G
H
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
E
P
 
A
-
 
I
G
 
G
L
 
G
V
 
A
P
 
F
L
 
F
E
 
Q
A
x
V
D
|
D
I
x
L
T
 
E
A
 
D
D
 
E
G
 
R
A
 
E
A
 
R
E
 
V
R
 
R
A
 
F
V
 
V
G
 
E
L
 
E
A
 
A
V
 
A
E
 
Y
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
I
 
A
I
 
A
N
 
P
K
 
G
L
 
S
V
 
A
I
 
L
D
 
T
M
 
V
T
 
R
R
 
L
Q
 
P
D
 
E
W
 
W
E
 
R
R
 
R
I
 
V
Q
 
L
A
 
E
V
 
V
N
 
N
A
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
P
F
 
M
L
 
H
H
 
L
S
 
S
R
 
A
E
 
L
A
 
A
V
 
A
K
 
R
A
 
E
M
 
M
M
 
R
P
 
K
N
 
V
K
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
A
 
A
S
|
S
Y
 
V
A
 
Q
S
 
G
Y
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
E
P
 
Q
T
 
E
I
x
N
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
G
L
 
L
A
 
V
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
D
V
 
L
I
 
A
E
 
P
H
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
A
V
x
I
V
 
A
T
|
T
N
 
E
I
x
A
L
x
V
N
 
L
D
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
A
D
 
R
G
 
-
P
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
R
Q
 
D
H
 
W
G
 
E
E
 
D
A
 
L
A
 
H
P
 
A
I
 
L
G
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
E
R
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
L
M
 
P
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
V
 
A
T
 
S

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 93% coverage: 13:249/254 of query aligns to 3:240/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
H
 
A
V
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
N
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
L
E
 
M
A
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
D
 
P
G
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
E
L
 
K
A
 
I
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
D
Q
 
E
D
x
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
I
 
I
Q
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
G
T
 
G
I
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
G
 
A
V
x
P
G
|
G
D
 
F
V
x
I
V
 
E
T
 
T
N
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
S
E
 
D
D
 
D
G
 
Q
P
 
R
A
 
A
-
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
x
E
V
x
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
37% identity, 93% coverage: 13:249/254 of query aligns to 4:241/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
H
 
V
V
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
x
T
A
 
S
E
 
E
D
 
S
I
 
G
N
 
A
P
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
L
E
 
M
A
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
A
 
D
D
 
P
G
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
E
L
 
N
A
 
V
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
D
Q
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
I
 
I
Q
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
M
K
 
R
A
 
A
M
 
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
A
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
G
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
F
V
 
I
V
 
E
T
 
T
N
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
T
E
 
D
D
 
E
G
 
Q
P
 
R
A
 
A
-
 
G
F
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
A
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
T
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
37% identity, 93% coverage: 13:249/254 of query aligns to 4:241/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
L
 
E
L
 
T
L
 
L
H
 
V
V
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
T
A
 
S
E
 
E
D
 
N
I
 
G
N
 
A
P
 
K
A
 
N
V
 
I
H
 
S
E
 
D
L
 
Y
A
 
L
R
 
G
P
 
A
G
 
N
L
 
G
V
 
K
P
 
G
L
 
L
E
 
M
A
 
L
D
 
N
I
 
V
T
 
T
A
 
D
D
 
P
G
 
A
A
 
S
A
 
I
E
 
E
R
 
S
A
 
V
V
 
L
G
 
E
L
 
N
A
 
I
V
 
R
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
I
 
T
I
 
R
N
 
D
K
 
N
L
 
L
V
 
L
I
 
M
D
 
R
M
 
M
T
 
K
R
 
D
Q
 
D
D
 
E
W
 
W
E
 
N
R
 
D
I
 
I
Q
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
H
 
L
S
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
V
 
M
K
 
R
A
 
A
M
|
M
M
 
M
P
 
K
N
 
K
K
 
R
A
 
C
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
Y
 
V
A
 
V
S
 
G
Y
 
T
F
 
M
A
 
G
F
 
N
P
 
A
T
 
G
I
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
 
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
I
Q
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
T
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
V
 
V
I
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
I
 
V
G
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
F
V
 
I
V
 
E
T
 
T
N
 
D
I
 
M
L
 
T
N
 
R
D
 
A
V
 
L
V
 
S
E
 
D
D
 
D
G
 
Q
P
 
R
A
 
A
-
 
G
F
 
I
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
V
P
 
P
I
 
A
G
 
G
R
 
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
G
P
 
A
E
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
E
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
D
 
D
R
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
V
 
I
V
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
M
 
H
A
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
M
 
M

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
36% identity, 93% coverage: 12:248/254 of query aligns to 3:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
V
 
L
Q
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
K
 
R
A
 
T
I
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
T
L
 
Y
H
 
A
V
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
V
E
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
S
P
 
D
A
 
-
V
 
-
H
 
-
E
 
E
L
 
W
A
 
G
R
 
R
P
 
E
G
 
T
L
 
L
V
 
A
P
 
L
L
 
I
E
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
F
-
 
Q
-
 
H
A
 
A
D
|
D
I
x
T
T
 
A
A
 
H
D
 
P
G
 
E
A
 
D
A
 
H
E
 
D
R
 
E
A
 
L
V
 
I
G
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
K
E
 
R
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
I
 
S
I
x
G
N
 
E
-
 
F
K
 
T
L
 
P
V
 
T
I
 
A
D
 
E
M
 
T
T
 
T
R
 
D
Q
 
A
D
 
Q
W
 
W
E
 
Q
R
|
R
I
 
V
Q
 
I
A
 
G
V
 
I
N
 
N
A
 
L
T
 
S
A
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
Y
H
 
G
S
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
Q
V
 
I
K
 
R
A
 
A
M
 
M
M
 
L
P
 
E
N
 
T
K
 
G
A
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
S
S
|
S
Y
 
I
A
 
A
S
 
G
Y
 
Q
F
 
I
A
 
G
F
 
I
P
 
E
T
 
G
I
|
I
A
 
T
A
 
P
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
G
L
 
V
A
 
V
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
E
V
 
Y
I
 
G
E
 
S
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
G
 
G
V
x
P
G
x
A
D
 
F
V
x
I
V
 
N
T
|
T
N
 
T
I
 
L
L
 
V
N
 
Q
D
 
N
V
 
V
V
 
P
E
 
L
D
 
E
G
 
T
P
 
R
A
 
R
F
 
Q
L
 
L
A
 
E
Q
 
Q
H
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
M
A
 
H
P
 
A
I
x
L
G
x
R
R
|
R
A
 
L
A
 
G
Q
 
E
P
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
E
 
N
V
 
L
V
 
V
A
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
S
S
|
S
D
 
D
R
 
K
A
 
A
S
 
S
F
 
F
V
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
Y
V
 
Y
M
 
A
A
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>AO356_23595 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_23595
MTDFQHSIPHEVQGKVALVTGAASGIGKAIALLLHVRGAKVIAEDINPAVHELARPGLVP
LEADITADGAAERAVGLAVEQFGRLDILVNNAGIIINKLVIDMTRQDWERIQAVNATAAF
LHSREAVKAMMPNKAGAIVNIASYASYFAFPTIAAYTASKGALAQLTRTLALEVIEHGIR
VNAIGVGDVVTNILNDVVEDGPAFLAQHGEAAPIGRAAQPEEIAEVVAFLASDRASFVVG
AVVMADGGMTVTAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory