SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_28545 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_28545 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ilkA Crystal structure of short chain alcohol dehydrogenase (rspb) from e. Coli cft073 (efi target efi-506413) complexed with cofactor nadh
46% identity, 99% coverage: 1:338/343 of query aligns to 4:337/337 of 4ilkA

query
sites
4ilkA
M
 
M
K
 
K
A
 
S
F
 
I
Q
 
L
V
 
I
R
 
E
A
 
K
P
 
P
F
 
N
E
 
Q
F
 
L
G
 
S
L
 
I
A
 
I
Q
 
E
V
 
R
D
 
E
Q
 
I
P
 
P
Q
 
T
V
 
P
A
 
S
H
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
D
 
K
V
 
V
A
 
K
Y
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
S
H
|
H
I
 
I
I
 
Y
H
 
R
G
 
G
Q
 
H
N
 
N
A
 
P
F
 
Y
V
 
-
R
 
-
F
 
-
P
 
P
R
 
R
V
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
F
G
 
G
V
 
V
I
 
I
R
 
D
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
E
H
 
S
L
 
A
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
D
 
E
R
 
R
V
 
V
C
 
A
I
 
V
D
 
D
P
 
P
V
 
V
I
 
V
S
 
S
C
|
C
G
 
G
T
 
H
C
|
C
Y
 
Y
P
 
P
C
|
C
R
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
P
N
 
N
V
 
V
C
|
C
T
 
T
R
 
T
L
 
L
Q
x
A
V
 
V
I
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
H
R
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
S
E
 
E
Q
 
Y
V
 
A
C
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
K
N
 
N
A
 
A
H
 
W
R
 
K
L
 
I
P
 
P
D
 
E
A
 
A
M
 
V
S
 
A
L
 
D
S
 
Q
H
 
Y
G
 
A
A
 
V
L
 
M
V
 
I
E
|
E
P
|
P
Y
 
F
S
 
T
I
 
I
A
|
A
L
 
A
N
 
N
V
 
V
L
 
T
D
 
G
R
 
H
M
 
G
Q
 
Q
P
 
P
H
 
T
P
 
E
G
 
N
D
 
D
S
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
V
Y
 
Y
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
P
I
|
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
L
 
I
V
 
V
Q
 
Q
M
 
V
A
 
L
R
 
K
A
 
G
L
 
V
-
 
Y
G
 
N
L
 
V
T
 
K
D
 
N
I
 
V
T
 
I
V
 
V
T
 
A
D
|
D
V
x
R
I
 
I
D
 
D
S
 
E
R
|
R
L
 
L
E
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
K
A
 
E
L
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
W
T
 
A
L
 
I
N
 
N
G
x
N
Q
 
S
Q
 
Q
V
 
T
D
 
P
V
 
L
E
 
G
A
 
E
V
 
S
M
 
F
R
 
A
E
 
E
L
 
-
T
 
-
Q
 
K
G
 
G
E
 
I
G
 
K
V
 
P
P
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
I
D
 
D
A
|
A
A
|
A
C
|
C
I
 
H
P
 
P
A
 
S
L
x
I
M
 
L
P
 
K
Q
 
E
M
 
A
V
 
V
R
 
T
L
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
A
G
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
V
L
 
L
L
x
M
G
 
G
F
|
F
N
 
S
A
 
S
T
 
E
P
 
P
S
 
S
D
 
E
L
 
V
V
 
I
Q
 
Q
L
 
Q
E
 
G
M
 
I
I
 
T
K
 
G
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
S
L
 
I
V
 
F
G
 
S
S
 
S
R
 
R
L
 
L
N
 
N
N
 
A
R
 
N
K
 
K
F
 
F
P
 
P
R
 
V
V
 
V
I
 
I
E
 
D
L
 
W
I
 
L
A
 
S
S
 
K
G
 
G
K
 
L
L
 
I
Q
 
K
V
 
P
Q
 
E
D
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
T
V
 
F
S
 
D
F
 
F
D
 
Q
E
 
H
M
 
V
P
 
A
G
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
S
L
 
L
I
 
F
E
 
E
K
 
L
H
 
D
P
 
Q
E
 
K
Q
 
H
T
 
C
R
 
C
K
|
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L
E
 
T
L
 
F

4ej6A Crystal structure of a putative zinc-binding dehydrogenase (target psi-012003) from sinorhizobium meliloti 1021
35% identity, 94% coverage: 1:322/343 of query aligns to 4:328/343 of 4ej6A

query
sites
4ej6A
M
 
M
K
 
K
A
 
A
F
 
V
Q
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
S
P
 
V
F
 
G
E
 
N
F
 
I
G
 
S
L
 
V
A
 
R
Q
 
N
V
 
V
D
 
G
Q
 
I
P
 
P
Q
 
E
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
D
E
 
D
V
 
L
Q
 
L
V
 
V
D
 
K
V
 
V
A
 
E
Y
 
A
A
 
C
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
R
H
|
H
I
 
L
I
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
E
N
 
-
A
 
-
F
 
F
V
 
P
R
 
S
F
 
T
P
 
P
R
 
P
V
 
V
T
 
T
-
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
C
G
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
V
Q
 
E
V
 
A
G
 
G
E
 
S
G
 
A
V
 
V
E
 
R
H
 
D
L
 
I
Q
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
A
R
 
R
V
 
I
C
 
T
I
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
N
I
 
I
S
 
S
C
|
C
G
 
G
T
 
R
C
|
C
Y
 
P
P
 
Q
C
|
C
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
V
N
 
N
V
 
L
C
|
C
T
 
R
R
 
N
L
 
L
Q
x
R
V
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
I
H
 
H
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
V
C
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
R
E
 
K
N
 
Q
A
 
A
H
 
F
R
 
E
L
 
I
P
 
P
D
 
L
A
 
T
M
 
L
S
 
D
L
 
P
S
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
C
E
 
E
P
|
P
Y
 
L
S
 
A
I
 
C
A
x
C
L
 
L
N
 
H
V
 
G
L
 
V
D
 
D
R
 
L
M
 
S
Q
 
G
P
 
I
H
 
K
P
 
A
G
 
G
D
 
S
S
 
T
V
 
V
L
 
A
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
T
V
 
V
Q
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
T
D
 
T
I
 
V
T
 
I
V
 
L
T
 
S
D
 
T
V
 
R
I
 
Q
D
 
A
S
 
T
R
 
K
L
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
A
T
 
T
L
 
V
N
 
D
G
 
P
Q
 
S
Q
 
A
V
 
G
D
 
D
-
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
I
M
 
A
R
 
G
E
 
P
-
 
V
-
 
G
L
 
L
T
 
V
Q
 
P
G
 
G
E
 
-
G
 
G
V
 
V
P
 
D
L
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
E
A
 
C
A
 
A
C
 
G
I
 
V
P
 
A
A
 
E
L
 
T
M
 
V
P
 
K
Q
 
Q
M
 
S
V
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
K
P
 
A
A
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
V
G
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
V
-
 
L
-
 
P
N
 
Q
A
 
G
T
 
E
P
 
K
S
 
V
D
 
E
L
 
I
V
 
E
Q
 
P
L
 
F
E
 
D
M
 
I
I
 
L
K
 
F
K
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
R
L
 
V
V
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
F
L
 
I
N
 
N
N
 
P
R
 
F
K
 
V
F
 
H
P
 
R
R
 
R
V
 
A
I
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
A
L
 
I
Q
 
E
V
 
I
Q
 
D
D
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
S
H
 
R
R
 
R
V
 
I
S
 
S
F
 
L
D
 
D
E
 
E
M
 
A
P
 
P
G
 
D
A
 
V
I
 
I
D
 
S

Sites not aligning to the query:

4ejmA Crystal structure of a putative zinc-binding dehydrogenase (target psi-012003) from sinorhizobium meliloti 1021 bound to NADP
35% identity, 94% coverage: 1:322/343 of query aligns to 4:328/342 of 4ejmA

query
sites
4ejmA
M
 
M
K
 
K
A
 
A
F
 
V
Q
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
S
P
 
V
F
 
G
E
 
N
F
 
I
G
 
S
L
 
V
A
 
R
Q
 
N
V
 
V
D
 
G
Q
 
I
P
 
P
Q
 
E
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
D
E
 
D
V
 
L
Q
 
L
V
 
V
D
 
K
V
 
V
A
 
E
Y
 
A
A
 
C
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
R
H
|
H
I
 
L
I
 
L
H
 
H
G
 
G
Q
 
E
N
 
-
A
 
-
F
 
F
V
 
P
R
 
S
F
 
T
P
 
P
R
 
P
V
 
V
T
 
T
-
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
C
G
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
V
Q
 
E
V
 
A
G
 
G
E
 
S
G
 
A
V
 
V
E
 
R
H
 
D
L
 
I
Q
 
A
V
 
P
G
 
G
D
 
A
R
 
R
V
 
I
C
 
T
I
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
N
I
 
I
S
 
S
C
|
C
G
 
G
T
 
R
C
|
C
Y
 
P
P
 
Q
C
|
C
R
 
Q
I
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
V
N
 
N
V
 
L
C
|
C
T
 
R
R
 
N
L
 
L
Q
x
R
V
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
I
H
 
H
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
V
C
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
R
E
 
K
N
 
Q
A
 
A
H
 
F
R
 
E
L
 
I
P
 
P
D
 
L
A
 
T
M
 
L
S
 
D
L
 
P
S
 
V
H
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
C
E
 
E
P
|
P
Y
 
L
S
 
A
I
 
C
A
x
C
L
 
L
N
 
H
V
 
G
L
 
V
D
 
D
R
 
L
M
 
S
Q
 
G
P
 
I
H
 
K
P
 
A
G
 
G
D
 
S
S
 
T
V
 
V
L
 
A
I
 
I
Y
 
L
G
|
G
A
 
G
G
|
G
V
|
V
I
|
I
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
T
V
 
V
Q
 
Q
M
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
L
L
 
A
G
 
G
L
 
A
T
 
T
D
 
T
I
 
V
T
 
I
V
 
L
T
 
S
D
x
T
V
x
R
I
x
Q
D
 
A
S
 
T
R
x
K
L
 
R
E
 
R
T
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
A
T
 
T
L
 
V
N
 
D
G
 
P
Q
 
S
Q
 
A
V
 
G
D
 
D
-
 
V
V
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
I
M
 
A
R
 
G
E
 
P
-
 
V
-
 
G
L
 
L
T
 
V
Q
 
P
G
 
G
E
 
-
G
 
G
V
 
V
P
 
D
L
 
V
I
 
V
V
 
I
D
 
E
A
x
C
A
 
A
C
 
G
I
 
V
P
 
A
A
x
E
L
x
T
M
 
V
P
 
K
Q
 
Q
M
 
S
V
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
K
P
 
A
A
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
V
G
 
V
L
 
I
L
|
L
G
 
G
F
x
V
-
 
L
-
 
P
N
 
Q
A
 
G
T
 
E
P
 
K
S
 
V
D
 
E
L
 
I
V
 
E
Q
 
P
L
 
F
E
 
D
M
 
I
I
 
L
K
 
F
K
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
R
L
 
V
V
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
F
L
x
I
N
 
N
N
 
P
R
 
F
K
 
V
F
 
H
P
 
R
R
 
R
V
 
A
I
 
A
E
 
D
L
 
L
I
 
V
A
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
A
L
 
I
Q
 
E
V
 
I
Q
 
D
D
 
R
L
 
M
I
 
I
S
 
S
H
 
R
R
 
R
V
 
I
S
 
S
F
 
L
D
 
D
E
 
E
M
 
A
P
 
P
G
 
D
A
 
V
I
 
I
D
 
S

Sites not aligning to the query:

4uejA Closed state of galactitol-1-phosphate 5-dehydrogenase from e. Coli in complex with glycerol. (see paper)
33% identity, 92% coverage: 20:336/343 of query aligns to 20:345/346 of 4uejA

query
sites
4uejA
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
A
 
K
H
 
H
-
 
Q
G
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
D
 
K
V
 
I
A
 
A
Y
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
L
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
L
H
x
P
I
 
R
I
 
I
H
 
F
G
 
-
Q
 
K
N
 
N
A
 
G
F
 
A
V
 
H
R
 
Y
F
 
Y
P
 
P
R
 
I
V
 
T
T
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
Y
I
 
I
R
 
D
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
D
H
 
D
L
 
L
Q
 
H
V
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
A
V
 
V
C
 
A
I
 
C
D
 
V
P
 
P
V
 
L
I
 
L
S
 
P
C
|
C
G
 
F
T
 
T
C
|
C
Y
 
P
P
 
E
C
|
C
R
 
L
I
 
K
G
 
G
R
 
F
P
 
Y
N
 
S
V
 
Q
C
|
C
T
 
A
R
 
K
L
 
Y
Q
x
D
V
 
F
I
 
I
G
 
G
V
 
S
H
 
R
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
I
C
 
V
V
 
V
P
 
K
A
 
R
E
 
K
N
 
N
A
 
V
H
 
F
R
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
T
A
 
D
M
 
M
S
 
P
L
 
I
S
 
E
H
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
I
E
|
E
P
|
P
Y
 
I
S
 
T
I
 
V
A
x
G
L
 
L
N
 
H
V
 
A
L
 
F
D
 
H
R
 
L
M
 
A
Q
 
Q
P
 
G
H
 
C
P
 
E
G
 
N
D
 
K
S
 
N
V
 
V
L
 
I
I
 
I
Y
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
A
V
 
I
Q
 
Q
M
 
C
A
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
K
D
 
S
I
 
V
T
 
T
V
 
A
T
 
I
D
 
D
V
 
I
I
 
S
D
 
S
S
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
A
T
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
S
L
 
F
G
 
G
A
 
A
S
 
M
R
 
Q
T
 
T
L
 
F
N
 
N
G
 
S
Q
 
S
Q
 
E
V
 
M
D
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
V
 
M
E
 
Q
A
 
S
V
 
V
M
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
F
G
 
N
E
 
Q
G
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
E
A
 
T
A
 
A
C
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
L
 
T
M
 
V
P
 
E
Q
 
L
M
 
A
V
 
V
R
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
G
P
 
P
A
 
H
G
 
A
R
 
Q
I
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
F
 
T
N
 
L
A
 
H
T
 
Q
P
 
D
S
 
L
D
 
H
L
 
L
V
 
T
Q
 
S
L
 
A
-
 
T
-
 
F
-
 
G
E
 
K
M
 
I
I
 
L
K
 
R
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
S
R
 
W
L
 
M
N
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
W
-
 
P
N
 
G
R
 
Q
K
 
E
F
 
W
P
 
E
R
 
T
V
 
A
I
 
S
E
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
R
K
 
K
L
 
L
Q
 
S
V
 
L
Q
 
E
D
 
P
L
 
L
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
E
E
 
S
M
 
F
P
 
A
G
 
Q
A
 
A
I
 
V
D
 
R
L
 
D
I
 
I
E
 
A
K
 
R
H
 
N
P
 
A
E
 
M
Q
 
P
T
 
G
R
x
K
K
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
I

4a2cA Crystal structure of galactitol-1-phosphate dehydrogenase from escherichia coli (see paper)
33% identity, 92% coverage: 20:336/343 of query aligns to 20:345/346 of 4a2cA

query
sites
4a2cA
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
A
 
K
H
 
H
-
 
Q
G
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
R
V
 
V
D
 
K
V
 
I
A
 
A
Y
 
S
A
 
S
G
 
G
I
 
L
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
L
H
x
P
I
 
R
I
 
I
H
 
F
G
 
-
Q
 
K
N
 
N
A
 
G
F
 
A
V
 
H
R
 
Y
F
 
Y
P
 
P
R
 
I
V
 
T
T
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
Y
I
 
I
R
 
D
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
E
 
D
H
 
D
L
 
L
Q
 
H
V
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
A
V
 
V
C
 
A
I
 
C
D
 
V
P
 
P
V
 
L
I
 
L
S
 
P
C
|
C
G
 
F
T
 
T
C
|
C
Y
 
P
P
 
E
C
|
C
R
 
L
I
 
K
G
 
G
R
 
F
P
 
Y
N
 
S
V
 
Q
C
|
C
T
 
A
R
 
K
L
 
Y
Q
x
D
V
 
F
I
 
I
G
 
G
V
 
S
H
 
R
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
I
C
 
V
V
 
V
P
 
K
A
 
R
E
 
K
N
 
N
A
 
V
H
 
F
R
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
T
A
 
D
M
 
M
S
 
P
L
 
I
S
 
E
H
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
F
V
 
I
E
 
E
P
|
P
Y
 
I
S
 
T
I
 
V
A
x
G
L
 
L
N
 
H
V
 
A
L
 
F
D
 
H
R
 
L
M
 
A
Q
 
Q
P
 
G
H
 
C
P
 
E
G
 
N
D
 
K
S
 
N
V
 
V
L
 
I
I
 
I
Y
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
T
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
A
V
 
I
Q
 
Q
M
 
C
A
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
K
D
 
S
I
 
V
T
 
T
V
 
A
T
 
I
D
 
D
V
 
I
I
 
S
D
 
S
S
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
A
T
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
S
L
 
F
G
 
G
A
 
A
S
 
M
R
 
Q
T
 
T
L
 
F
N
 
N
G
 
S
Q
 
S
Q
 
E
V
 
M
D
 
S
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
V
 
M
E
 
Q
A
 
S
V
 
V
M
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
R
Q
 
F
G
 
N
E
 
Q
G
 
-
V
 
-
P
 
-
L
 
L
I
 
I
V
 
L
D
 
E
A
 
T
A
 
A
C
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
L
 
T
M
 
V
P
 
E
Q
 
L
M
 
A
V
 
V
R
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
G
P
 
P
A
 
H
G
 
A
R
 
Q
I
 
L
G
 
A
L
 
L
L
 
V
G
 
G
F
 
T
N
 
L
A
 
H
T
 
Q
P
 
D
S
 
L
D
 
H
L
 
L
V
 
T
Q
 
S
L
 
A
-
 
T
-
 
F
-
 
G
E
 
K
M
 
I
I
 
L
K
 
R
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
V
V
 
I
G
 
G
S
 
S
R
 
W
L
 
M
N
 
N
-
 
Y
-
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
W
-
 
P
N
 
G
R
 
Q
K
 
E
F
 
W
P
 
E
R
 
T
V
 
A
I
 
S
E
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
T
S
 
E
G
 
R
K
 
K
L
 
L
Q
 
S
V
 
L
Q
 
E
D
 
P
L
 
L
I
 
I
S
 
A
H
 
H
R
 
R
V
 
G
S
 
S
F
 
F
D
 
E
E
 
S
M
 
F
P
 
A
G
 
Q
A
 
A
I
 
V
D
 
R
L
 
D
I
 
I
E
 
A
K
 
R
H
 
N
P
 
A
E
 
M
Q
 
P
T
 
G
R
x
K
K
 
V
V
 
L
L
 
L
V
 
I

2dfvA Hyperthermophilic threonine dehydrogenase from pyrococcus horikoshii (see paper)
34% identity, 91% coverage: 14:324/343 of query aligns to 17:333/346 of 2dfvA

query
sites
2dfvA
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
V
 
I
D
 
K
V
 
V
A
 
L
Y
 
A
A
 
T
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
H
|
H
I
 
I
I
 
Y
H
 
E
G
 
W
Q
 
N
N
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
Q
A
 
S
F
 
R
V
 
I
R
 
K
F
 
P
P
 
P
R
 
Q
V
 
I
T
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
E
I
 
V
R
 
V
Q
 
E
V
 
I
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
E
H
 
G
L
 
I
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
C
 
S
I
 
V
D
 
E
P
 
T
V
 
H
I
 
I
S
 
V
C
|
C
G
 
G
T
 
K
C
|
C
Y
 
Y
P
 
A
C
|
C
R
 
R
I
 
R
G
 
G
R
 
Q
P
 
Y
N
 
H
V
 
V
C
|
C
T
 
Q
R
 
N
L
 
T
Q
x
K
V
 
I
I
 
F
G
 
G
V
 
V
H
 
D
R
 
T
D
 
D
G
 
G
G
 
V
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
A
C
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
Q
N
 
N
A
 
I
H
 
W
R
 
K
L
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
S
M
 
I
S
 
P
L
 
P
S
 
E
H
 
Y
G
 
A
A
 
T
L
 
L
V
 
Q
E
 
E
P
|
P
Y
 
L
S
 
G
I
 
N
A
|
A
L
 
V
N
 
D
V
 
T
L
 
V
D
 
-
R
 
L
M
 
A
Q
 
G
P
 
P
H
 
I
P
 
S
G
 
G
D
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
V
x
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
G
V
 
I
Q
 
A
M
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
A
T
 
Y
D
 
P
I
 
V
T
 
I
V
 
V
T
 
S
D
x
E
V
x
P
I
 
S
D
 
D
S
 
F
R
|
R
L
 
R
E
 
E
T
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
Y
T
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
P
Q
 
F
Q
 
E
V
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
V
A
 
K
V
 
E
M
 
V
R
 
M
E
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
E
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
D
L
 
V
I
 
F
V
 
L
D
 
E
A
x
F
A
x
S
C
 
G
I
x
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
M
 
L
P
 
E
Q
 
Q
M
 
G
V
 
L
R
 
Q
L
 
A
A
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
S
L
 
L
L
|
L
G
|
G
F
x
L
-
 
Y
-
 
P
N
 
G
A
 
K
T
 
V
P
 
T
S
 
I
D
 
D
L
 
F
V
 
N
Q
 
N
L
 
L
E
 
-
M
 
I
I
 
I
K
 
F
K
 
K
E
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
I
V
 
Y
G
 
G
-
x
I
-
x
T
S
 
G
R
 
R
L
 
H
N
 
L
N
 
W
R
 
E
K
 
T
F
 
W
P
 
Y
R
 
T
V
 
V
I
 
S
E
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Q
 
N
V
 
L
Q
 
D
D
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
K
V
 
Y
S
 
K
-
 
G
F
 
F
D
 
D
E
 
K
M
 
Y
P
 
E
G
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
E
L
 
L
I
 
M

Sites not aligning to the query:

O58389 L-threonine 3-dehydrogenase; L-ThrDH; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see 2 papers)
34% identity, 91% coverage: 14:324/343 of query aligns to 19:335/348 of O58389

query
sites
O58389
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
V
 
I
D
 
K
V
 
V
A
 
L
Y
 
A
A
 
T
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
H
 
H
I
 
I
I
 
Y
H
 
E
G
 
W
Q
 
N
N
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
Q
A
 
S
F
 
R
V
 
I
R
 
K
F
 
P
P
 
P
R
 
Q
V
 
I
T
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
E
I
 
V
R
 
V
Q
 
E
V
 
I
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
E
H
 
G
L
 
I
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
C
 
S
I
 
V
D
 
E
P
 
T
V
 
H
I
 
I
S
 
V
C
|
C
G
 
G
T
 
K
C
|
C
Y
 
Y
P
 
A
C
|
C
R
 
R
I
 
R
G
 
G
R
 
Q
P
 
Y
N
 
H
V
 
V
C
|
C
T
 
Q
R
 
N
L
 
T
Q
 
K
V
 
I
I
 
F
G
 
G
V
 
V
H
 
D
R
 
T
D
 
D
G
 
G
G
 
V
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
A
C
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
Q
N
 
N
A
 
I
H
 
W
R
 
K
L
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
S
M
 
I
S
 
P
L
 
P
S
 
E
H
 
Y
G
 
A
A
 
T
L
 
L
V
 
Q
E
|
E
P
 
P
Y
 
L
S
 
G
I
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
D
V
 
T
L
 
V
D
 
-
R
 
L
M
 
A
Q
 
G
P
 
P
H
 
I
P
 
S
G
 
G
D
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
G
V
 
I
Q
 
A
M
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
A
T
 
Y
D
 
P
I
 
V
T
 
I
V
 
V
T
 
S
D
x
E
V
 
P
I
 
S
D
 
D
S
 
F
R
|
R
L
 
R
E
 
E
T
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
Y
T
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
P
Q
 
F
Q
 
E
V
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
V
A
 
K
V
 
E
M
 
V
R
 
M
E
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
E
 
N
G
 
G
V
 
V
P
 
D
L
 
V
I
 
F
V
 
L
D
 
E
A
 
F
A
 
S
C
 
G
I
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
M
 
L
P
 
E
Q
 
Q
M
 
G
V
 
L
R
 
Q
L
 
A
A
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
S
L
 
L
L
|
L
G
|
G
F
x
L
-
 
Y
-
 
P
N
 
G
A
 
K
T
 
V
P
 
T
S
 
I
D
 
D
L
 
F
V
 
N
Q
 
N
L
 
L
E
 
-
M
 
I
I
 
I
K
 
F
K
 
K
E
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
I
V
 
Y
G
 
G
-
x
I
-
x
T
S
 
G
R
|
R
L
 
H
N
 
L
N
 
W
R
 
E
K
 
T
F
 
W
P
 
Y
R
 
T
V
 
V
I
 
S
E
 
R
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Q
 
N
V
 
L
Q
 
D
D
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
K
V
 
Y
S
 
K
-
 
G
F
 
F
D
 
D
E
 
K
M
 
Y
P
 
E
G
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
E
L
 
L
I
 
M

3gfbA L-threonine dehydrogenase (tktdh) from the hyperthermophilic archaeon thermococcus kodakaraensis (see paper)
33% identity, 91% coverage: 14:324/343 of query aligns to 17:333/347 of 3gfbA

query
sites
3gfbA
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
V
 
I
D
 
K
V
 
V
A
 
L
Y
 
A
A
 
T
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
H
|
H
I
 
I
I
 
Y
H
 
E
G
 
W
Q
 
N
N
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
Q
A
 
S
F
 
R
V
 
I
R
 
K
F
 
P
P
 
P
R
 
Q
V
 
I
T
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
E
I
 
V
R
 
V
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
E
H
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
C
 
S
I
 
V
D
 
E
P
 
T
V
 
H
I
 
I
S
 
V
C
|
C
G
 
G
T
 
K
C
|
C
Y
 
Y
P
 
A
C
|
C
R
 
K
I
 
H
G
 
N
R
 
R
P
 
Y
N
 
H
V
 
V
C
|
C
T
 
Q
R
 
N
L
 
T
Q
x
K
V
 
I
I
 
F
G
 
G
V
 
V
H
 
D
R
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
V
F
 
F
S
 
A
E
 
H
Q
 
Y
V
 
A
C
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
K
N
 
N
A
 
A
H
 
W
R
 
K
L
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
D
M
 
M
S
 
P
L
 
P
S
 
E
H
 
Y
G
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
E
 
E
P
|
P
Y
 
L
S
 
G
I
 
N
A
|
A
L
 
V
N
 
D
V
 
T
L
 
V
D
 
-
R
 
L
M
 
A
Q
 
G
P
 
P
H
 
I
P
 
A
G
 
G
D
 
R
S
 
S
V
 
T
L
 
L
I
 
I
Y
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
G
V
 
I
Q
 
A
M
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
A
T
 
Y
D
 
P
I
 
V
T
 
I
V
 
V
T
x
S
D
x
E
V
x
P
I
 
S
D
 
E
S
 
F
R
|
R
L
 
R
E
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
Y
T
 
V
L
 
V
N
 
N
G
 
P
Q
 
F
Q
 
E
V
 
E
D
 
D
V
 
P
E
 
V
A
 
K
V
 
F
M
 
V
R
 
M
E
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
E
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
E
L
 
V
I
 
F
V
 
L
D
 
E
A
x
F
A
x
S
C
 
G
I
x
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
M
 
L
P
 
E
Q
 
Q
M
 
G
V
 
L
R
 
K
L
 
A
A
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
S
L
 
L
L
|
L
G
|
G
F
x
L
-
 
F
-
 
P
N
 
R
A
 
E
T
 
V
P
 
T
S
 
I
D
 
D
L
 
F
V
 
N
Q
 
N
L
 
L
E
 
I
M
 
I
I
 
F
K
 
K
K
 
A
-
 
L
E
 
E
L
 
V
T
 
H
L
 
G
V
x
I
G
x
T
S
 
G
R
 
R
L
 
H
N
 
L
N
 
W
R
 
E
K
 
T
F
 
W
P
 
Y
R
 
T
V
 
V
I
 
S
E
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Q
 
N
V
 
L
Q
 
D
D
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
K
V
 
Y
S
 
K
-
 
G
F
 
F
D
 
D
E
 
K
M
 
F
P
 
E
G
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
E
L
 
L
I
 
M

Sites not aligning to the query:

Q5JI69 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) (Pyrococcus kodakaraensis (strain KOD1)) (see paper)
33% identity, 91% coverage: 14:324/343 of query aligns to 19:335/350 of Q5JI69

query
sites
Q5JI69
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
Q
 
V
P
 
P
Q
 
K
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
V
 
I
D
 
K
V
 
V
A
 
L
Y
 
A
A
 
T
G
 
S
I
 
I
C
 
C
G
 
G
S
 
T
D
 
D
M
 
L
H
 
H
I
 
I
I
 
Y
H
 
E
G
 
W
Q
 
N
N
 
E
-
 
W
-
 
A
-
 
Q
A
 
S
F
 
R
V
 
I
R
 
K
F
 
P
P
 
P
R
 
Q
V
 
I
T
 
M
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
V
S
 
A
G
 
G
V
 
E
I
 
V
R
 
V
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
E
H
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
C
 
S
I
 
V
D
 
E
P
 
T
V
 
H
I
 
I
S
 
V
C
 
C
G
 
G
T
 
K
C
 
C
Y
 
Y
P
 
A
C
 
C
R
 
K
I
 
H
G
 
N
R
 
R
P
 
Y
N
 
H
V
 
V
C
 
C
T
 
Q
R
 
N
L
 
T
Q
 
K
V
 
I
I
 
F
G
 
G
V
 
V
H
 
D
R
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
V
F
 
F
S
 
A
E
 
H
Q
 
Y
V
 
A
C
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
K
N
 
N
A
 
A
H
 
W
R
 
K
L
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
D
M
 
M
S
 
P
L
 
P
S
 
E
H
 
Y
G
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
Q
E
 
E
P
 
P
Y
 
L
S
 
G
I
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
D
V
 
T
L
 
V
D
 
-
R
 
L
M
 
A
Q
 
G
P
 
P
H
 
I
P
 
A
G
 
G
D
 
R
S
 
S
V
 
T
L
 
L
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
P
I
x
L
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
G
V
 
I
Q
 
A
M
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
A
T
 
Y
D
 
P
I
 
V
T
 
I
V
 
V
T
 
S
D
x
E
V
 
P
I
 
S
D
 
E
S
 
F
R
|
R
L
 
R
E
 
K
T
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
Y
T
 
V
L
 
V
N
 
N
G
 
P
Q
 
F
Q
 
E
V
 
E
D
 
D
V
 
P
E
 
V
A
 
K
V
 
F
M
 
V
R
 
M
E
 
D
L
 
I
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
E
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
E
L
 
V
I
 
F
V
 
L
D
 
E
A
 
F
A
 
S
C
 
G
I
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
M
 
L
P
 
E
Q
 
Q
M
 
G
V
 
L
R
 
K
L
 
A
A
 
V
S
 
T
P
 
P
A
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
S
L
 
L
L
|
L
G
|
G
F
x
L
-
 
F
-
 
P
N
 
R
A
 
E
T
 
V
P
 
T
S
 
I
D
 
D
L
 
F
V
 
N
Q
 
N
L
 
L
E
 
I
M
 
I
I
 
F
K
 
K
K
 
A
-
 
L
E
 
E
L
 
V
T
 
H
L
 
G
V
x
I
G
x
T
S
 
G
R
 
R
L
 
H
N
 
L
N
 
W
R
 
E
K
 
T
F
 
W
P
 
Y
R
 
T
V
 
V
I
 
S
E
 
S
L
 
L
I
 
I
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
K
L
 
L
Q
 
N
V
 
L
Q
 
D
D
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
K
V
 
Y
S
 
K
-
 
G
F
 
F
D
 
D
E
 
K
M
 
F
P
 
E
G
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
E
L
 
L
I
 
M

2ejvA Crystal structure of threonine 3-dehydrogenase complexed with NAD+
36% identity, 98% coverage: 1:337/343 of query aligns to 1:340/343 of 2ejvA

query
sites
2ejvA
M
 
M
K
 
R
A
 
A
F
 
L
Q
 
A
V
 
K
R
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
E
E
 
E
F
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
T
Q
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
R
P
 
P
-
 
V
-
 
P
Q
 
E
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Q
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
V
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
H
|
H
I
 
I
I
 
W
H
 
K
G
 
-
Q
 
W
N
 
D
A
 
A
F
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
R
V
 
I
R
 
R
F
 
P
P
 
P
R
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
V
R
 
E
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
R
H
 
R
L
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
C
 
S
I
 
L
D
 
E
P
 
S
V
 
H
I
 
I
S
 
V
C
|
C
G
 
H
T
 
A
C
|
C
Y
 
P
P
 
A
C
|
C
R
 
R
I
 
T
G
 
G
R
 
N
P
 
Y
N
 
H
V
 
V
C
|
C
T
 
L
R
 
N
L
 
T
Q
|
Q
V
 
I
I
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
V
C
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
H
 
W
R
 
V
L
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
D
M
 
L
S
 
P
L
 
F
S
 
E
H
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
L
E
 
E
P
|
P
Y
 
F
S
 
G
I
 
N
A
|
A
L
 
V
N
 
H
V
 
T
L
 
V
D
 
Y
R
 
A
M
 
G
Q
 
S
P
 
G
H
 
V
P
 
S
G
 
G
D
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
Y
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
P
I
|
I
G
 
G
L
 
L
T
 
M
L
 
A
V
 
A
Q
 
M
M
 
V
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
A
T
 
G
D
 
P
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
x
S
D
|
D
V
x
P
I
 
N
D
 
P
S
 
Y
R
|
R
L
 
L
E
 
A
T
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
P
L
 
Y
G
 
-
A
 
A
S
 
D
R
 
R
T
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
P
Q
 
L
Q
 
E
V
 
E
D
 
D
V
 
L
E
 
L
A
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
E
 
R
L
 
V
T
 
T
Q
 
-
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
E
L
 
V
I
 
L
V
 
L
D
 
E
A
x
F
A
x
S
C
 
G
I
x
N
P
 
E
A
 
A
L
x
A
M
 
I
P
 
H
Q
 
Q
M
 
G
V
 
L
R
 
M
L
 
A
A
 
L
S
 
I
P
 
P
A
 
G
G
 
G
R
 
E
I
 
A
G
 
R
L
 
I
L
|
L
G
|
G
F
x
I
N
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
S
 
S
D
 
D
L
 
P
V
 
I
Q
 
R
L
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
V
K
 
M
K
 
R
E
 
G
L
 
I
T
 
T
L
 
A
V
 
F
G
 
G
-
 
I
-
 
A
S
 
G
R
 
R
L
 
R
N
 
L
N
 
W
R
 
Q
K
 
T
F
 
W
P
 
M
R
 
Q
V
 
G
I
 
T
E
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
Y
S
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
V
Q
 
D
V
 
L
Q
 
S
D
 
P
L
 
L
I
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
L
S
 
P
F
 
L
D
 
S
E
 
R
M
 
Y
P
 
R
G
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
G
L
 
L
I
 
L
E
 
A
K
 
S
H
 
G
P
 
-
E
 
-
Q
 
Q
T
 
A
R
 
V
K
|
K
V
 
V
L
 
I
V
 
L
E
 
D

2dq4A Crystal structure of threonine 3-dehydrogenase
36% identity, 98% coverage: 1:337/343 of query aligns to 1:340/343 of 2dq4A

query
sites
2dq4A
M
 
M
K
 
R
A
 
A
F
 
L
Q
 
A
V
 
K
R
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
E
E
 
E
F
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
T
Q
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
R
P
 
P
-
 
V
-
 
P
Q
 
E
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Q
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
V
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
H
|
H
I
 
I
I
 
W
H
 
K
G
 
-
Q
 
W
N
 
D
A
 
A
F
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
R
V
 
I
R
 
R
F
 
P
P
 
P
R
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
V
R
 
E
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
R
H
 
R
L
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
C
 
S
I
 
L
D
 
E
P
 
S
V
 
H
I
 
I
S
 
V
C
|
C
G
 
H
T
 
A
C
|
C
Y
 
P
P
 
A
C
|
C
R
 
R
I
 
T
G
 
G
R
 
N
P
 
Y
N
 
H
V
 
V
C
|
C
T
 
L
R
 
N
L
 
T
Q
|
Q
V
 
I
I
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
V
C
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
H
 
W
R
 
V
L
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
D
M
 
L
S
 
P
L
 
F
S
 
E
H
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
L
E
 
E
P
|
P
Y
 
F
S
 
G
I
 
N
A
|
A
L
 
V
N
 
H
V
 
T
L
 
V
D
 
Y
R
 
A
M
 
G
Q
 
S
P
 
G
H
 
V
P
 
S
G
 
G
D
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
M
L
 
A
V
 
A
Q
 
M
M
 
V
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
A
T
 
G
D
 
P
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
S
D
 
D
V
 
P
I
 
N
D
 
P
S
 
Y
R
 
R
L
 
L
E
 
A
T
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
P
L
 
Y
G
 
-
A
 
A
S
 
D
R
 
R
T
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
P
Q
 
L
Q
 
E
V
 
E
D
 
D
V
 
L
E
 
L
A
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
E
 
R
L
 
V
T
 
T
Q
 
-
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
E
L
 
V
I
 
L
V
 
L
D
 
E
A
 
F
A
 
S
C
 
G
I
 
N
P
 
E
A
 
A
L
 
A
M
 
I
P
 
H
Q
 
Q
M
 
G
V
 
L
R
 
M
L
 
A
A
 
L
S
 
I
P
 
P
A
 
G
G
 
G
R
 
E
I
 
A
G
 
R
L
 
I
L
 
L
G
 
G
F
 
I
N
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
S
 
S
D
 
D
L
 
P
V
 
I
Q
 
R
L
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
V
K
 
M
K
 
R
E
 
G
L
 
I
T
 
T
L
 
A
V
 
F
G
 
G
-
 
I
-
 
A
S
 
G
R
 
R
L
 
R
N
 
L
N
 
W
R
 
Q
K
 
T
F
 
W
P
 
M
R
 
Q
V
 
G
I
 
T
E
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
Y
S
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
V
Q
 
D
V
 
L
Q
 
S
D
 
P
L
 
L
I
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
L
S
 
P
F
 
L
D
 
S
E
 
R
M
 
Y
P
 
R
G
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
G
L
 
L
I
 
L
E
 
A
K
 
S
H
 
G
P
 
-
E
 
-
Q
 
Q
T
 
A
R
 
V
K
|
K
V
 
V
L
 
I
V
 
L
E
 
D

Q5SKS4 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; EC 1.1.1.103 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
36% identity, 98% coverage: 1:337/343 of query aligns to 1:340/343 of Q5SKS4

query
sites
Q5SKS4
M
 
M
K
 
R
A
 
A
F
 
L
Q
 
A
V
 
K
R
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
E
E
 
E
F
 
-
G
 
G
L
 
L
A
 
T
Q
 
L
V
 
V
D
 
D
Q
 
R
P
 
P
-
 
V
-
 
P
Q
 
E
V
 
P
A
 
G
H
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
I
Q
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
V
A
 
E
Y
 
A
A
 
A
G
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
T
D
 
D
M
 
L
H
 
H
I
 
I
I
 
W
H
 
K
G
 
-
Q
 
W
N
 
D
A
 
A
F
 
W
-
 
A
-
 
R
-
 
G
-
 
R
V
 
I
R
 
R
F
 
P
P
 
P
R
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
V
I
 
V
R
 
E
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
R
H
 
R
L
 
P
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
C
 
S
I
 
L
D
 
E
P
 
S
V
 
H
I
 
I
S
 
V
C
|
C
G
 
H
T
 
A
C
|
C
Y
 
P
P
 
A
C
|
C
R
 
R
I
 
T
G
 
G
R
 
N
P
 
Y
N
 
H
V
 
V
C
|
C
T
 
L
R
 
N
L
 
T
Q
 
Q
V
 
I
I
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
V
C
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
N
 
N
A
 
A
H
 
W
R
 
V
L
 
N
P
 
P
D
 
K
A
 
D
M
 
L
S
 
P
L
 
F
S
 
E
H
 
V
G
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
L
E
 
E
P
 
P
Y
 
F
S
 
G
I
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
H
V
 
T
L
 
V
D
 
Y
R
 
A
M
 
G
Q
 
S
P
 
G
H
 
V
P
 
S
G
 
G
D
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
P
I
|
I
G
 
G
L
 
L
T
 
M
L
 
A
V
 
A
Q
 
M
M
 
V
A
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
S
G
 
G
L
 
A
T
 
G
D
 
P
I
 
I
T
 
L
V
 
V
T
 
S
D
|
D
V
 
P
I
 
N
D
 
P
S
 
Y
R
|
R
L
 
L
E
 
A
T
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
P
L
 
Y
G
 
-
A
 
A
S
 
D
R
 
R
T
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
P
Q
 
L
Q
 
E
V
 
E
D
 
D
V
 
L
E
 
L
A
 
E
V
 
V
M
 
V
R
 
R
E
 
R
L
 
V
T
 
T
Q
 
-
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
E
L
 
V
I
 
L
V
 
L
D
 
E
A
 
F
A
 
S
C
 
G
I
 
N
P
 
E
A
 
A
L
 
A
M
 
I
P
 
H
Q
 
Q
M
 
G
V
 
L
R
 
M
L
 
A
A
 
L
S
 
I
P
 
P
A
 
G
G
 
G
R
 
E
I
 
A
G
 
R
L
 
I
L
|
L
G
|
G
F
x
I
N
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
P
S
 
S
D
 
D
L
 
P
V
 
I
Q
 
R
L
 
F
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
G
E
 
E
M
 
L
I
 
V
K
 
M
K
 
R
E
 
G
L
 
I
T
 
T
L
 
A
V
 
F
G
 
G
-
x
I
-
x
A
S
x
G
R
 
R
L
 
R
N
 
L
N
 
W
R
 
Q
K
 
T
F
 
W
P
 
M
R
 
Q
V
 
G
I
 
T
E
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
Y
S
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
V
Q
 
D
V
 
L
Q
 
S
D
 
P
L
 
L
I
 
L
S
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
L
S
 
P
F
 
L
D
 
S
E
 
R
M
 
Y
P
 
R
G
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
G
L
 
L
I
 
L
E
 
A
K
 
S
H
 
G
P
 
-
E
 
-
Q
 
Q
T
 
A
R
 
V
K
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
L
E
 
D

P07913 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:338/343 of query aligns to 1:340/341 of P07913

query
sites
P07913
M
 
M
K
 
K
A
 
A
F
 
L
-
 
S
Q
 
K
V
 
L
R
 
K
A
 
A
P
 
E
F
 
E
E
 
G
F
 
I
G
 
W
L
 
M
A
 
T
Q
 
D
V
 
V
D
 
P
Q
 
V
P
 
P
Q
 
E
V
 
L
A
 
G
H
 
H
G
 
N
E
 
D
V
 
L
Q
 
L
V
 
I
D
 
K
V
 
I
A
 
R
Y
 
K
A
 
T
G
 
A
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
T
D
 
D
M
 
V
H
 
H
I
 
I
I
 
Y
H
 
N
G
 
W
-
 
D
-
 
E
-
 
W
Q
 
S
N
 
Q
A
 
K
F
 
T
V
 
I
R
 
P
F
 
V
P
 
P
R
 
M
V
 
V
T
 
V
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
Y
S
 
V
G
 
G
V
 
E
I
 
V
R
 
V
Q
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
Q
G
 
E
V
 
V
E
 
K
H
 
G
L
 
F
Q
 
K
V
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
C
 
S
I
 
G
D
 
E
P
 
G
V
 
H
I
 
I
S
 
T
C
 
C
G
 
G
T
 
H
C
 
C
Y
 
R
P
 
N
C
 
C
R
 
R
I
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
T
N
 
H
V
 
L
C
 
C
T
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
 
I
V
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
V
H
 
N
R
 
R
D
 
P
G
 
G
G
 
C
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
L
C
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
F
N
 
N
A
 
A
H
 
F
R
 
K
L
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
N
M
 
I
S
 
S
L
 
D
S
 
D
H
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
F
E
 
D
P
 
P
Y
 
F
S
 
G
I
 
N
A
 
A
L
 
V
N
 
H
V
 
T
L
 
A
D
 
L
R
 
S
M
 
F
Q
 
D
P
 
L
H
 
-
P
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
Y
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
I
T
 
M
L
 
A
V
 
A
Q
 
A
M
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
H
L
 
V
G
 
G
L
 
A
T
 
R
D
 
N
I
 
V
T
 
V
V
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
I
 
N
D
 
E
S
 
Y
R
 
R
L
 
L
E
 
E
T
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
K
L
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
T
R
 
R
T
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
V
Q
 
A
Q
 
K
V
 
E
D
 
N
V
 
L
E
 
N
A
 
D
V
 
V
M
 
M
R
 
A
E
 
E
L
 
L
T
 
G
Q
 
M
G
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
F
P
 
D
L
 
V
I
 
G
V
 
L
D
 
E
A
 
M
A
 
S
C
 
G
I
 
A
P
 
P
A
 
P
L
 
A
M
 
F
P
 
R
Q
 
T
M
 
M
V
 
L
R
 
D
L
 
T
A
 
M
S
 
N
P
 
H
A
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
A
L
 
M
L
 
L
G
 
G
F
 
I
N
 
P
A
 
P
T
 
S
P
 
D
S
 
M
D
 
S
L
 
I
V
 
D
Q
 
W
L
 
T
E
 
K
M
 
V
I
 
I
K
 
F
K
 
K
E
 
G
L
 
L
T
 
F
L
 
I
V
 
K
G
 
G
-
 
I
-
 
Y
S
 
G
R
 
R
L
 
E
N
 
M
N
 
F
R
 
E
K
 
T
F
 
W
P
 
Y
R
 
K
V
 
M
I
 
A
E
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
-
L
 
L
Q
 
D
V
 
L
Q
 
S
D
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
F
S
 
S
F
 
I
D
 
D
E
 
D
M
 
F
P
 
Q
G
 
K
A
 
G
I
 
F
D
 
D
L
 
A
I
 
M
E
 
R
K
 
S
H
 
G
P
 
-
E
 
-
Q
 
Q
T
 
S
R
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
L
E
 
S
L
 
W

5kiaA Crystal structure of l-threonine 3-dehydrogenase from burkholderia thailandensis
30% identity, 92% coverage: 1:316/343 of query aligns to 2:318/339 of 5kiaA

query
sites
5kiaA
M
 
M
K
 
K
A
 
A
F
 
L
Q
 
A
V
 
K
R
 
L
A
 
E
P
 
P
F
 
-
E
 
G
F
 
L
G
 
T
L
 
L
A
 
T
Q
 
R
V
 
V
D
 
K
Q
 
K
P
 
P
Q
 
E
V
 
V
A
 
G
H
 
H
G
 
N
E
 
D
V
 
V
Q
 
L
V
 
I
D
 
K
V
 
I
A
 
R
Y
 
R
A
 
T
G
 
A
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
D
 
D
M
 
I
H
|
H
I
 
I
I
 
W
H
 
K
G
 
W
Q
 
D
N
 
D
A
 
W
F
 
A
V
 
Q
R
 
K
F
 
T
P
 
I
R
 
P
V
 
V
-
 
M
-
 
H
T
 
V
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
Y
S
 
V
G
 
G
V
 
E
I
 
I
R
 
V
Q
 
E
V
 
M
G
 
G
E
 
Q
G
 
E
V
 
V
E
 
R
H
 
G
L
 
F
Q
 
S
V
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
C
 
S
I
 
G
D
 
E
P
 
G
V
 
H
I
 
I
S
 
T
C
|
C
G
 
G
T
 
F
C
|
C
Y
 
R
P
 
N
C
|
C
R
 
R
I
 
A
G
 
G
R
 
R
P
 
R
N
 
H
V
 
L
C
|
C
T
 
R
R
 
N
L
 
T
Q
x
V
V
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
V
H
 
N
R
 
R
D
 
E
G
 
G
G
 
A
F
 
F
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
L
C
 
A
V
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
F
N
 
N
A
 
A
H
 
F
R
 
K
L
 
I
P
 
P
D
 
P
A
 
E
M
 
I
S
 
S
L
 
D
S
 
D
H
 
L
G
 
A
A
 
A
L
 
I
V
 
F
E
x
D
P
|
P
Y
 
F
S
 
G
I
x
N
A
|
A
L
 
T
N
 
H
V
 
T
L
 
A
D
 
L
R
 
S
M
 
F
Q
 
N
P
 
L
H
 
-
P
 
V
G
 
G
D
 
E
S
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
V
T
 
M
L
 
A
V
 
V
Q
 
A
M
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
H
L
 
V
G
 
G
L
 
A
T
 
R
D
 
N
I
 
V
T
 
V
V
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
I
I
 
N
D
 
D
S
 
Y
R
 
R
L
 
L
E
 
D
T
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
R
L
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
R
T
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
V
Q
 
S
Q
 
R
V
 
E
D
 
S
V
 
L
E
 
R
A
 
D
V
 
V
M
 
M
R
 
A
E
 
D
L
 
L
T
 
H
Q
 
M
G
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
F
P
 
D
L
 
V
I
 
G
V
 
L
D
 
E
A
 
M
A
 
S
C
 
G
I
 
V
P
 
P
A
 
S
L
 
A
M
 
F
P
 
T
Q
 
S
M
 
L
V
 
L
R
 
E
L
 
S
A
 
M
S
 
N
P
 
H
A
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
I
N
 
P
A
 
P
T
 
A
P
 
Q
S
 
T
D
 
A
L
 
I
V
 
D
Q
 
W
L
 
N
E
 
Q
M
 
V
I
 
I
K
 
F
K
 
K
E
 
G
L
 
L
T
 
E
L
 
I
V
 
K
G
 
G
-
 
I
-
 
Y
S
 
G
R
 
R
L
x
E
N
 
M
N
 
F
R
 
E
K
 
T
F
 
W
P
 
Y
R
 
K
V
 
M
I
 
V
E
 
A
L
 
M
I
 
L
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
-
L
 
L
Q
 
D
V
 
L
Q
 
S
D
 
P
L
 
I
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
F
S
 
A
F
 
V
D
 
D
E
 
D

Sites not aligning to the query:

5vm2A Crystal structure of eck1772, an oxidoreductase/dehydrogenase of unknown specificity involved in membrane biogenesis from escherichia coli
29% identity, 92% coverage: 6:322/343 of query aligns to 8:329/347 of 5vm2A

query
sites
5vm2A
V
 
L
R
 
Q
A
 
V
P
 
P
F
 
G
E
 
T
F
 
M
G
 
K
L
 
I
A
 
I
Q
 
S
V
 
A
D
 
E
Q
 
I
P
 
P
Q
 
V
V
 
P
A
 
K
H
 
E
G
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
V
 
I
D
 
K
V
 
V
A
 
E
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
V
H
|
H
I
 
-
I
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
-
N
 
-
A
 
G
F
 
F
V
 
E
R
 
S
F
 
G
P
 
P
R
 
F
V
 
I
-
 
P
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
E
-
 
I
-
 
G
T
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
C
S
 
A
G
 
G
V
 
T
I
 
V
R
 
V
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
S
G
 
R
V
 
V
E
 
R
H
 
K
L
 
F
Q
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
C
 
N
I
 
I
D
 
E
P
 
P
V
 
G
I
 
V
S
 
P
C
|
C
G
 
G
T
 
H
C
|
C
Y
 
R
P
 
Y
C
|
C
R
 
L
I
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
Y
N
 
N
V
 
I
C
|
C
T
 
P
R
 
D
L
 
V
Q
x
D
V
 
F
I
 
M
G
 
A
V
 
T
H
 
Q
R
 
P
D
 
N
-
 
Y
-
 
R
G
 
G
G
 
A
F
 
L
S
 
T
E
 
H
Q
 
Y
V
 
L
C
 
C
V
 
H
P
 
P
A
 
E
E
 
S
N
 
F
A
 
T
H
 
Y
R
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
N
M
 
M
S
 
D
L
 
T
S
 
M
H
 
E
G
 
G
A
 
T
L
 
L
V
 
V
E
|
E
P
|
P
Y
 
A
S
 
A
I
 
V
A
x
G
L
 
M
N
 
H
V
 
A
L
 
A
D
 
M
R
 
L
M
 
A
Q
 
D
P
 
V
H
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
K
S
 
K
V
 
I
L
 
I
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
C
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
M
L
 
T
V
 
L
Q
 
Q
M
 
A
A
 
C
R
 
K
A
 
C
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
T
D
 
E
I
 
I
T
 
A
V
 
V
T
 
V
D
 
D
V
 
V
I
 
L
D
 
E
S
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
A
T
 
M
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
V
T
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
A
Q
 
K
V
 
E
D
 
D
V
 
T
E
 
I
A
 
A
V
 
R
M
 
C
R
 
Q
E
 
Q
L
 
F
T
 
T
Q
 
E
G
 
D
E
 
M
G
 
G
V
 
A
P
 
D
L
 
I
I
 
V
V
 
F
D
 
E
A
 
T
A
 
A
C
 
G
I
 
S
P
 
A
A
 
V
L
 
T
M
 
V
P
 
K
Q
 
Q
M
 
A
V
 
P
R
 
Y
L
 
L
A
 
V
S
 
M
P
 
R
A
 
G
G
 
G
R
 
K
I
 
I
G
 
M
L
 
I
L
 
V
G
 
G
F
 
-
N
 
T
A
 
V
T
 
P
P
 
G
S
 
A
D
 
S
L
 
A
V
 
I
Q
 
N
L
 
F
E
 
L
M
 
K
I
 
I
K
 
N
K
 
R
E
 
E
L
 
V
T
 
T
L
 
I
V
 
Q
G
 
T
S
 
V
R
 
F
L
 
R
N
 
Y
N
 
A
R
 
N
K
 
R
F
 
Y
P
 
P
R
 
V
V
 
T
I
 
I
E
 
E
L
 
A
I
 
I
A
 
S
S
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
F
Q
 
D
V
 
V
Q
 
K
D
 
S
L
 
M
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
I
V
 
Y
S
 
D
F
 
Y
D
 
R
E
 
D
M
 
V
P
 
Q
G
 
Q
A
 
A
I
 
F
D
 
E

Sites not aligning to the query:

1e3jA Ketose reductase (sorbitol dehydrogenase) from silverleaf whitefly (see paper)
30% identity, 95% coverage: 11:336/343 of query aligns to 12:344/348 of 1e3jA

query
sites
1e3jA
E
 
D
F
 
L
G
 
R
L
 
L
A
 
E
Q
 
Q
V
 
R
D
 
P
Q
 
I
P
 
P
Q
 
E
V
 
P
A
 
K
H
 
E
G
 
D
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
V
 
L
D
 
Q
V
 
M
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
V
H
|
H
I
 
Y
I
 
Y
-
 
E
H
 
H
G
 
G
Q
 
R
N
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
F
F
 
I
V
 
V
R
 
K
F
 
D
P
 
P
R
 
M
V
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
A
S
 
S
G
 
G
V
 
T
I
 
V
R
 
V
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
E
 
K
G
 
N
V
 
V
E
 
K
H
 
H
L
 
L
Q
 
K
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
C
 
A
I
 
V
D
 
E
P
 
P
V
 
G
I
 
V
S
 
P
C
|
C
G
 
R
T
 
R
C
|
C
Y
 
Q
P
 
F
C
|
C
R
 
K
I
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
Y
N
 
N
V
 
L
C
|
C
T
 
P
R
 
D
L
 
L
Q
x
T
V
 
F
I
 
C
G
 
A
V
 
T
-
 
P
H
 
P
R
 
D
D
 
D
G
 
G
G
 
N
F
 
L
S
 
A
E
 
R
Q
 
Y
V
 
Y
C
 
V
V
 
H
P
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
F
A
 
C
H
 
H
R
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
N
M
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
L
E
 
E
P
|
P
Y
 
L
S
 
S
I
 
V
A
x
G
L
 
V
N
 
H
V
 
A
L
 
C
D
 
R
R
 
R
M
 
A
Q
 
G
P
 
V
H
 
Q
P
 
L
G
 
G
D
 
T
S
 
T
V
 
V
L
 
L
I
 
V
Y
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
P
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
V
L
 
S
V
 
V
Q
 
L
M
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
Y
G
 
G
L
 
A
T
 
F
D
 
-
I
 
V
T
 
V
V
 
C
T
 
T
D
x
A
V
x
R
I
x
S
D
 
P
S
 
R
R
|
R
L
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
N
L
 
C
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
V
T
 
T
L
 
L
-
 
V
-
 
V
N
 
D
G
 
P
Q
 
A
Q
 
K
V
 
E
D
 
E
V
 
E
E
 
S
A
 
S
V
 
I
M
 
I
R
 
E
E
 
R
L
 
I
T
 
R
Q
 
S
G
 
A
E
 
I
G
 
G
-
 
D
V
 
L
P
 
P
-
 
N
L
 
V
I
 
T
V
 
I
D
 
D
A
 
C
A
 
S
C
 
G
I
 
N
P
 
E
A
 
K
L
 
C
M
 
I
P
 
T
Q
 
I
M
 
G
V
 
I
R
 
N
L
 
I
A
 
T
S
 
R
P
 
T
A
 
G
G
 
G
R
 
T
I
 
L
G
 
M
L
 
L
L
 
V
G
 
G
F
 
M
N
 
G
A
 
S
T
 
Q
P
 
M
S
 
V
D
 
T
L
 
V
V
 
P
Q
 
L
L
 
V
E
 
N
M
 
A
I
 
C
K
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
I
T
 
D
L
 
I
V
 
K
G
 
S
S
 
V
R
 
F
L
 
R
N
 
Y
N
 
C
R
 
N
K
 
D
F
 
Y
P
 
P
R
 
I
V
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
M
I
 
V
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
C
Q
 
N
V
 
V
Q
 
K
D
 
Q
L
 
L
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
S
V
 
F
S
 
K
F
 
L
D
 
E
E
 
Q
M
 
T
P
 
V
G
 
D
A
 
A
I
 
F
D
 
E
L
 
A
I
 
A
E
 
R
K
 
K
H
 
K
P
 
A
E
 
D
Q
 
N
T
 
T
R
 
I
K
|
K
V
 
V
L
 
M
V
 
I

4cpdA Alcohol dehydrogenase tadh from thermus sp. Atn1
33% identity, 98% coverage: 1:336/343 of query aligns to 1:343/346 of 4cpdA

query
sites
4cpdA
M
 
M
K
 
R
A
 
A
F
 
V
Q
 
V
V
 
F
R
 
E
A
 
N
P
 
K
F
 
E
E
 
R
F
 
V
G
 
A
L
 
V
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
D
 
N
Q
 
A
P
 
P
Q
 
R
V
 
L
A
 
Q
H
 
H
G
 
P
-
 
L
E
 
D
V
 
A
Q
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
V
A
 
H
Y
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
|
S
D
 
D
M
 
L
H
|
H
I
 
L
I
 
Y
H
 
H
G
 
G
Q
 
K
N
 
I
A
 
P
F
 
V
V
 
L
R
 
P
F
 
G
P
 
-
R
 
S
V
 
V
T
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
F
S
 
V
G
 
G
V
 
Q
I
 
V
R
 
E
Q
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
I
E
 
Q
H
 
D
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
W
V
 
V
C
 
V
I
 
G
D
 
P
P
 
F
V
 
H
I
 
I
S
 
A
C
|
C
G
 
G
T
 
T
C
|
C
Y
 
P
P
 
Y
C
|
C
R
 
R
I
 
R
G
 
H
R
 
Q
P
 
Y
N
 
N
V
 
L
C
|
C
T
 
E
R
 
R
L
 
G
Q
x
G
V
 
V
I
 
Y
G
 
G
V
 
Y
-
 
G
-
 
P
-
 
M
-
 
F
-
 
G
H
 
N
R
 
L
D
 
Q
G
 
G
G
 
A
F
 
Q
S
 
A
E
 
E
Q
 
I
V
 
L
C
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
F
E
 
S
N
 
N
A
 
V
H
 
N
-
 
L
-
 
R
R
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
P
A
 
N
M
 
L
S
 
S
L
 
P
S
 
E
H
 
R
G
 
A
A
 
I
L
 
F
V
 
A
-
 
G
E
x
D
P
 
I
Y
 
L
S
 
S
I
x
T
A
 
A
L
 
Y
N
 
G
V
 
G
L
 
L
D
 
I
R
 
Q
M
 
G
Q
 
Q
P
 
L
H
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
L
 
A
I
 
V
Y
 
I
G
 
G
A
 
A
G
|
G
V
x
P
I
x
V
G
 
G
L
 
L
T
 
M
L
 
A
V
 
I
Q
 
E
M
 
V
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
A
T
 
S
D
 
K
I
 
I
T
 
L
V
 
A
T
 
I
D
|
D
V
x
R
I
 
I
D
 
P
S
 
E
R
|
R
L
 
L
E
 
E
T
 
R
A
 
A
R
 
A
A
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
I
R
 
-
T
 
P
L
 
I
N
 
N
G
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
E
D
 
N
V
 
P
E
 
V
A
 
R
V
 
R
M
 
V
R
 
R
E
 
S
L
 
E
T
 
T
Q
 
N
G
 
D
E
 
E
G
 
G
V
 
P
P
 
D
L
 
L
I
 
V
V
 
L
D
 
E
A
|
A
A
x
V
C
 
G
I
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
T
M
 
L
P
 
S
Q
 
L
M
 
A
V
 
L
R
 
E
L
 
M
A
 
V
S
 
R
P
 
P
A
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
V
G
 
S
L
 
A
L
x
V
G
 
G
F
x
V
N
 
D
A
 
N
T
 
A
P
 
P
S
 
S
D
 
F
L
 
P
V
 
F
Q
 
P
L
 
L
E
 
A
M
 
S
-
 
G
I
 
L
K
 
V
K
 
K
E
 
D
L
 
L
T
 
T
L
 
F
-
 
R
V
 
I
G
 
G
S
x
L
R
x
A
L
 
N
N
 
V
N
 
H
R
 
L
K
 
Y
F
 
I
P
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
A
S
 
S
G
 
G
K
 
R
L
 
L
Q
 
Q
V
 
P
Q
 
E
D
 
R
L
 
I
I
 
V
S
 
S
H
 
H
R
 
Y
V
 
L
S
 
P
F
 
L
D
 
E
E
 
E
M
 
A
P
 
P
G
 
R
A
 
G
I
 
Y
D
 
E
L
 
L
I
x
F
E
 
D
K
 
R
H
 
-
P
 
-
E
 
K
Q
 
E
T
 
A
R
 
L
K
|
K
V
 
V
L
 
L
V
 
L

7y9pA Xylitol dehydrogenase s96c/s99c/y102c mutant(thermostabilized form) from pichia stipitis (see paper)
31% identity, 90% coverage: 18:324/343 of query aligns to 20:343/357 of 7y9pA

query
sites
7y9pA
D
 
D
Q
 
A
P
 
P
Q
 
E
V
 
I
A
 
S
H
 
E
-
 
P
G
 
T
E
 
D
V
 
V
Q
 
L
V
 
V
D
 
Q
V
 
V
A
 
K
Y
 
K
A
 
T
G
 
G
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
 
S
D
 
D
M
 
I
H
 
H
I
 
F
I
 
Y
-
 
A
H
 
H
G
 
G
Q
 
R
-
 
I
-
 
G
N
 
N
A
 
F
F
 
V
V
 
L
R
 
T
F
 
K
P
 
P
R
 
M
V
 
V
T
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
F
 
S
S
 
A
G
 
G
V
 
T
I
 
V
R
 
V
Q
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
T
H
 
S
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
N
V
 
V
C
 
A
I
 
I
D
 
E
P
 
P
V
 
G
I
 
I
S
 
P
C
|
C
G
 
R
T
 
F
C
|
C
Y
 
D
P
 
E
C
|
C
R
 
K
I
 
S
G
 
G
R
 
H
P
 
Y
N
 
N
V
 
L
C
|
C
T
 
P
R
 
H
L
 
M
Q
 
A
V
 
F
I
 
A
G
 
A
V
 
T
H
 
P
R
 
N
D
 
E
-
 
P
-
 
N
-
 
P
-
 
P
G
 
G
G
 
T
F
 
L
S
 
C
E
 
K
Q
 
Y
V
 
F
C
 
K
V
 
S
P
 
P
A
 
E
E
 
D
N
 
F
A
 
L
H
 
V
R
 
K
L
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
H
M
 
V
S
 
S
L
 
L
S
 
E
H
 
L
G
 
G
A
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
L
S
 
S
I
 
V
A
 
G
L
 
V
N
 
H
V
 
A
L
 
S
D
 
K
R
 
L
M
 
G
Q
 
S
P
 
V
H
 
A
P
 
F
G
 
G
D
 
D
S
 
Y
V
 
V
L
 
A
I
 
V
Y
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
L
L
 
A
V
 
A
Q
 
A
M
 
V
A
 
A
R
 
K
A
 
T
L
 
F
G
 
G
L
 
A
T
 
K
D
 
G
I
 
V
T
 
I
V
 
V
T
 
V
D
 
D
V
 
I
I
 
F
D
 
D
S
 
N
R
 
K
L
 
L
E
 
K
T
 
M
A
 
A
R
 
K
A
 
D
L
 
I
G
 
G
-
 
A
A
 
A
S
 
T
R
 
H
T
 
T
L
 
F
N
 
N
G
 
S
Q
 
K
Q
 
T
V
 
G
D
 
G
V
 
S
E
 
E
A
 
E
V
 
L
M
 
I
R
 
K
E
 
A
L
 
F
T
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
G
G
 
N
V
 
V
P
 
P
-
 
N
L
 
V
I
 
V
V
 
L
D
 
E
A
 
C
A
 
T
C
 
G
I
 
A
P
 
E
A
 
P
L
 
C
M
 
I
P
 
K
Q
 
L
M
 
G
V
 
V
R
 
D
L
 
A
A
 
I
S
 
A
P
 
P
A
 
G
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
V
L
 
Q
L
 
V
G
 
G
F
 
N
N
 
A
A
 
A
T
 
G
P
 
P
S
 
V
D
 
S
L
 
F
V
 
P
Q
 
I
L
 
T
E
 
V
M
 
F
I
 
A
K
 
M
K
 
K
E
 
E
L
 
L
T
 
T
L
 
L
V
 
F
G
 
G
S
 
S
-
 
F
R
 
R
L
 
Y
N
 
G
N
 
F
R
 
N
K
 
D
F
 
Y
P
 
K
R
 
T
V
 
A
I
 
V
E
 
G
L
 
I
I
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
N
-
 
Y
-
 
Q
-
 
N
-
 
G
-
 
R
A
 
E
S
 
N
G
 
A
K
 
P
L
 
I
Q
 
D
V
 
F
Q
 
E
D
 
Q
L
 
L
I
 
I
S
 
T
H
 
H
R
 
R
V
 
Y
S
 
K
F
 
F
D
 
K
E
 
D
M
 
A
P
 
I
G
 
E
A
 
A
I
 
Y
D
 
D
L
 
L
I
 
V

5ylnA Zinc dependent alcohol dehydrogenase 2 from streptococcus pneumonia - apo form
28% identity, 98% coverage: 1:337/343 of query aligns to 5:342/348 of 5ylnA

query
sites
5ylnA
M
 
M
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
Q
 
T
V
 
Y
R
 
V
A
 
K
P
 
P
F
 
G
E
 
L
F
 
A
G
 
S
L
 
F
A
 
V
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
Q
 
K
P
 
P
Q
 
V
V
 
I
A
 
R
H
 
K
G
 
P
E
 
T
V
 
A
Q
 
I
V
 
V
D
 
R
V
 
I
A
 
V
Y
 
K
A
 
T
G
 
T
I
 
I
C
|
C
G
 
G
S
x
T
D
 
D
M
 
L
H
|
H
I
 
I
I
 
I
H
 
K
G
 
G
Q
 
D
N
 
V
A
 
P
F
 
T
V
 
C
R
 
Q
F
 
S
P
 
G
R
 
T
V
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
E
 
E
F
 
G
S
 
I
G
 
G
V
 
I
I
 
V
R
 
E
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
E
 
S
H
 
N
L
 
F
Q
 
K
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
V
C
 
L
I
 
I
D
 
S
P
 
C
V
 
V
I
 
C
S
 
A
C
|
C
G
 
G
T
 
K
C
|
C
Y
 
Y
P
 
Y
C
|
C
R
 
K
I
 
K
G
 
G
R
 
I
P
 
Y
N
 
A
V
 
H
C
|
C
T
 
E
R
 
D
L
 
-
Q
 
E
V
 
G
I
 
G
G
 
W
V
 
I
H
 
F
R
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
M
F
 
Q
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
L
C
 
R
V
 
V
P
 
P
-
 
H
A
 
A
E
 
D
N
 
N
A
 
T
-
 
L
H
 
Y
R
 
H
L
 
T
P
 
P
D
 
E
A
 
D
M
 
L
S
 
S
L
 
D
S
 
E
H
 
A
G
 
L
A
 
V
L
 
M
V
 
L
E
 
L
P
 
P
Y
 
T
S
 
G
I
 
Y
A
 
E
L
 
I
N
 
G
V
 
V
L
 
L
D
 
-
R
 
K
M
 
G
Q
 
K
P
 
V
H
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
C
S
 
S
V
 
V
L
 
A
I
 
I
Y
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
G
V
 
P
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
A
L
 
A
V
 
L
Q
 
L
M
 
T
A
 
A
R
 
Q
A
 
F
L
 
Y
G
 
S
L
 
P
T
 
A
D
 
K
I
 
L
T
 
I
V
 
M
T
 
V
D
 
D
V
 
L
I
 
D
D
 
D
S
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
S
L
 
F
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
H
T
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
S
Q
 
S
Q
 
-
V
 
-
D
 
D
V
 
P
E
 
E
A
 
K
V
 
A
M
 
I
R
 
K
E
 
E
-
 
I
-
 
Y
-
 
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
D
G
 
G
E
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
D
L
 
V
I
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
V
C
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
T
M
 
F
P
 
D
Q
 
F
M
 
C
V
 
Q
R
 
K
L
 
I
A
 
I
S
 
G
P
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
V
G
 
A
L
 
N
L
 
C
G
 
G
F
 
V
N
 
H
A
 
G
T
 
K
P
 
P
S
 
V
D
 
E
L
 
F
V
 
D
Q
 
L
L
 
D
E
 
K
M
 
L
I
 
W
K
 
I
K
 
R
E
 
N
L
 
I
T
 
N
L
 
V
V
 
T
G
 
T
S
 
G
R
 
L
L
 
V
N
 
S
N
 
T
R
 
N
K
 
T
F
 
T
P
 
P
R
 
Q
V
 
L
I
 
L
E
 
K
L
 
A
I
 
L
A
 
E
S
 
S
G
 
H
K
 
K
L
 
I
Q
 
E
V
 
P
Q
 
E
D
 
K
L
 
L
I
 
V
S
 
T
H
 
H
R
 
Y
V
 
F
S
 
K
F
 
L
D
 
S
E
 
E
M
 
I
P
 
E
G
 
K
A
 
A
I
 
Y
D
 
E
L
 
V
I
 
F
E
 
S
K
 
K
H
 
A
P
 
A
E
 
D
Q
 
H
T
 
H
R
 
A
K
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
I
E
 
E

P12311 Alcohol dehydrogenase; ADH-T; EC 1.1.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
31% identity, 91% coverage: 5:317/343 of query aligns to 8:323/337 of P12311

query
sites
P12311
Q
 
Q
V
 
F
R
 
K
A
 
K
P
 
P
F
 
L
E
 
Q
F
 
-
G
 
-
L
 
V
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
D
 
E
Q
 
K
P
 
P
Q
 
K
V
 
I
A
 
S
H
 
Y
G
 
G
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
V
 
V
D
 
R
V
 
I
A
 
K
Y
 
A
A
 
C
G
 
G
I
 
V
C
|
C
G
 
H
S
x
T
D
 
D
M
 
L
H
|
H
I
 
A
I
 
A
H
 
H
G
 
G
Q
 
D
N
 
W
A
 
P
F
 
V
V
 
K
-
 
P
R
 
K
F
 
L
P
 
P
R
 
L
V
 
I
T
 
P
G
 
G
H
 
H
E
 
E
F
 
G
S
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
I
R
 
E
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
E
 
T
H
 
H
L
 
L
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
C
 
G
I
 
I
D
 
P
P
 
W
V
 
L
I
 
Y
S
 
S
-
 
A
C
 
C
G
 
G
T
 
H
C
 
C
Y
 
D
P
 
Y
C
 
C
R
 
L
I
 
S
G
 
G
R
 
Q
P
 
E
N
 
T
V
 
L
C
 
C
T
 
E
R
 
R
L
 
Q
Q
 
Q
V
 
N
I
 
A
G
 
G
V
 
Y
H
 
S
R
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
F
 
Y
S
 
A
E
 
E
Q
 
Y
V
 
C
C
 
R
V
 
A
P
 
A
A
 
A
E
 
D
N
 
Y
A
 
V
H
 
V
R
 
K
L
 
I
P
 
P
D
 
D
A
 
N
M
 
L
S
 
S
L
 
F
S
 
E
H
 
E
G
 
A
A
 
A
L
 
P
V
 
I
E
 
F
P
 
C
Y
 
A
S
 
G
I
 
V
-
 
T
A
 
T
L
 
Y
N
 
K
V
 
A
L
 
L
D
 
K
R
 
V
M
 
T
Q
 
G
P
 
A
H
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
E
S
 
W
V
 
V
L
 
A
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
I
G
 
G
V
 
G
I
 
L
G
 
G
L
 
H
T
 
V
L
 
A
V
 
V
Q
 
Q
M
 
Y
A
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
G
 
G
L
 
L
T
 
-
D
 
N
I
 
V
T
 
V
V
 
A
T
 
V
D
 
D
V
 
L
I
 
G
D
 
D
S
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
E
T
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
L
T
 
V
L
 
V
N
 
N
G
 
P
Q
 
K
Q
 
H
V
 
D
D
 
D
V
 
A
E
 
A
A
 
Q
V
 
W
M
 
I
R
 
K
E
 
E
L
 
K
T
 
V
Q
 
G
G
 
-
E
 
-
G
 
G
V
 
V
P
 
H
L
 
A
I
 
T
V
 
V
D
 
V
A
 
T
A
 
A
C
 
V
I
 
S
P
 
K
A
 
A
L
 
A
M
 
F
P
 
E
Q
 
S
M
 
A
V
 
Y
R
 
K
L
 
S
A
 
I
S
 
R
P
 
R
A
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
C
G
 
V
L
 
L
L
 
V
G
 
G
F
 
L
N
 
P
A
 
P
T
 
E
P
 
E
S
 
I
D
 
P
L
 
I
V
 
P
Q
 
I
L
 
F
E
 
D
M
 
T
I
 
V
K
 
L
K
 
N
E
 
G
L
 
V
T
 
K
L
 
I
V
 
I
G
 
G
S
 
S
R
 
I
L
 
V
N
 
G
N
 
T
R
 
R
K
 
K
-
 
D
F
 
L
P
 
Q
R
 
E
V
 
A
I
 
L
E
 
Q
L
 
F
I
 
A
A
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
T
-
 
I
L
 
V
Q
 
E
V
 
V
Q
 
Q
D
 
P
L
 
L
I
 
E
S
 
N
H
 
I
R
 
N
V
 
D
S
 
V
F
 
F
D
 
D
E
 
R
M
 
M

Query Sequence

>AO356_28545 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_28545
MKAFQVRAPFEFGLAQVDQPQVAHGEVQVDVAYAGICGSDMHIIHGQNAFVRFPRVTGHE
FSGVIRQVGEGVEHLQVGDRVCIDPVISCGTCYPCRIGRPNVCTRLQVIGVHRDGGFSEQ
VCVPAENAHRLPDAMSLSHGALVEPYSIALNVLDRMQPHPGDSVLIYGAGVIGLTLVQMA
RALGLTDITVTDVIDSRLETARALGASRTLNGQQVDVEAVMRELTQGEGVPLIVDAACIP
ALMPQMVRLASPAGRIGLLGFNATPSDLVQLEMIKKELTLVGSRLNNRKFPRVIELIASG
KLQVQDLISHRVSFDEMPGAIDLIEKHPEQTRKVLVELTNAHH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory