SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_28740 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_28740 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8y46A SDR family oxidoreductase (see paper)
62% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 5:250/251 of 8y46A

query
sites
8y46A
L
 
L
Q
 
A
N
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
T
I
 
E
A
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
H
I
 
L
H
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
I
E
 
A
E
 
G
V
 
V
T
 
E
A
 
T
M
 
H
S
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
S
 
D
T
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
K
A
 
A
A
 
L
C
 
V
E
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
C
 
C
D
 
D
E
 
D
A
 
K
A
 
A
W
 
W
A
 
D
R
 
F
S
 
S
M
 
F
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
A
T
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
F
R
 
H
M
 
T
I
 
I
H
 
R
A
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
K
G
 
K
G
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
A
N
 
N
R
|
R
F
 
F
A
 
A
Y
|
Y
A
 
G
T
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
 
I
D
 
E
S
 
S
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
N
Q
 
Q
R
|
R
I
 
I
A
 
S
D
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
Q
 
T
G
 
G
V
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
V
 
V
Y
 
R
R
 
A
Q
 
A
F
 
F
L
 
V
D
 
A
R
|
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
K
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
S
A
 
N
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
I
H
 
H
V
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
x
W
S
 
S

8y46B SDR family oxidoreductase (see paper)
62% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 2:247/248 of 8y46B

query
sites
8y46B
L
 
L
Q
 
A
N
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
T
I
 
E
A
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
H
I
 
L
H
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
I
E
 
A
E
 
G
V
 
V
T
 
E
A
 
T
M
 
H
S
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
S
 
D
T
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
K
A
 
A
A
 
L
C
 
V
E
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
C
 
C
D
 
D
E
 
D
A
 
K
A
 
A
W
 
W
A
 
D
R
 
F
S
 
S
M
 
F
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
A
T
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
F
R
 
H
M
 
T
I
 
I
H
 
R
A
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
K
G
 
K
G
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
A
N
 
N
R
|
R
F
 
F
A
 
A
Y
|
Y
A
 
G
T
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
T
 
T
V
 
I
D
 
E
S
 
S
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
N
Q
 
Q
R
|
R
I
 
I
A
 
S
D
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
Q
 
T
G
 
G
V
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
V
 
V
Y
 
R
R
 
A
Q
 
A
F
 
F
L
 
V
D
 
A
R
|
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
K
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
S
A
 
N
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
I
H
 
H
V
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
S

8y4jA SDR family oxidoreductase (see paper)
62% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 3:248/249 of 8y4jA

query
sites
8y4jA
L
 
L
Q
 
A
N
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
T
I
 
E
A
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
H
I
 
L
H
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
I
E
 
A
E
 
G
V
 
V
T
 
E
A
 
T
M
 
H
S
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
S
 
D
T
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
K
A
 
A
A
 
L
C
 
V
E
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
C
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
C
 
C
D
 
D
E
 
D
A
 
K
A
 
A
W
 
W
A
 
D
R
 
F
S
 
S
M
 
F
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
A
T
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
F
R
 
H
M
 
T
I
 
I
H
 
R
A
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
K
G
 
K
G
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
A
N
 
N
R
|
R
F
 
F
A
 
A
Y
|
Y
A
 
G
T
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
T
 
T
V
 
I
D
 
E
S
 
S
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
N
Q
 
Q
R
|
R
I
 
I
A
 
S
D
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
Q
 
T
G
 
G
V
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
V
 
V
Y
 
R
R
 
A
Q
 
A
F
 
F
L
 
V
D
 
A
R
|
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
K
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
S
A
 
N
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
I
H
 
H
V
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
S

8y11A Crystal structure of l-2-keto-3-deoxyfuconate 4-dehydrogenase bound to NAD(h) and sulfate ion (see paper)
62% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 3:248/249 of 8y11A

query
sites
8y11A
L
 
L
Q
 
A
N
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
A
|
A
A
 
A
G
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
T
I
 
E
A
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
|
D
I
|
I
D
 
S
-
 
K
-
 
T
-
 
H
I
 
L
H
 
E
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
S
I
 
I
E
 
A
E
 
G
V
 
V
T
 
E
A
 
T
M
 
H
S
 
L
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
D
T
 
D
A
 
D
A
 
A
I
 
I
S
 
K
A
 
A
A
 
L
C
 
V
E
 
A
R
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
T
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
|
C
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
H
 
A
S
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
I
L
 
L
Q
 
E
C
 
C
D
 
D
E
 
D
A
 
K
A
 
A
W
 
W
A
 
D
R
 
F
S
 
S
M
 
F
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
A
T
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
F
R
 
H
M
 
T
I
 
I
H
 
R
A
 
A
F
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
K
G
 
K
G
 
A
G
 
G
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
A
N
 
N
R
 
R
F
 
F
A
 
A
Y
|
Y
A
 
G
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
|
T
V
x
I
D
 
E
S
|
S
P
|
P
S
|
S
L
 
L
R
 
N
Q
 
Q
R
|
R
I
 
I
A
 
S
D
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
K
Q
 
E
Q
 
T
G
 
G
V
 
K
D
 
S
E
 
E
A
 
D
Q
 
E
V
 
V
Y
 
R
R
 
A
Q
 
A
F
 
F
L
 
V
D
 
A
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
K
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
S
A
 
N
Y
 
F
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
I
H
 
H
V
 
M
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
S

D4A1J4 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
56% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 4:245/245 of D4A1J4

query
sites
D4A1J4
L
 
L
Q
 
E
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
N
I
 
E
H
 
A
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
I
 
L
E
 
E
E
 
N
V
 
Y
T
 
P
A
 
G
M
 
I
S
 
Q
-
 
T
-
 
R
-
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
S
 
K
T
 
K
A
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
A
 
Q
A
 
F
C
 
A
E
 
S
R
 
E
I
 
I
G
 
E
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
H
G
 
G
N
 
T
I
 
I
L
 
L
Q
 
D
C
 
C
D
 
E
E
 
E
A
 
K
A
 
D
W
 
W
A
 
D
R
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
R
A
 
S
M
 
M
Y
 
Y
R
 
L
M
 
M
I
 
I
H
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
E
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
A
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
Q
 
A
G
 
R
V
 
D
D
 
D
E
 
P
A
 
K
Q
 
E
V
 
A
Y
 
L
R
 
K
Q
 
A
F
 
F
L
 
L
D
 
N
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
S
 
S
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
A
 
C
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
P
H
 
V
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
S
I
 
L

Q8JZV9 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
55% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 4:245/245 of Q8JZV9

query
sites
Q8JZV9
L
 
L
Q
 
D
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
 
D
I
 
I
D
 
N
I
 
E
H
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
I
 
L
E
 
E
E
 
S
-
 
Y
-
 
R
-
 
G
V
 
I
T
 
Q
A
 
T
M
 
R
S
 
V
L
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
T
S
 
K
T
 
K
A
 
R
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
A
 
Q
A
 
F
C
 
A
E
 
S
R
 
E
I
 
I
G
 
E
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
H
G
 
G
N
 
T
I
 
I
L
 
L
Q
 
D
C
 
C
D
 
E
E
 
E
A
 
K
A
 
D
W
 
W
A
 
D
R
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
R
A
 
S
M
 
M
Y
 
F
R
 
L
M
 
M
I
 
I
H
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
I
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
E
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
A
 
S
T
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
 
V
D
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
Q
 
A
G
 
R
V
 
D
D
 
N
E
 
P
A
 
K
Q
 
E
V
 
A
Y
 
L
R
 
K
Q
 
T
F
 
F
L
 
L
D
 
N
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
S
 
S
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
L
L
 
L
A
 
C
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
N
I
 
P
H
 
V
V
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
S
I
 
L

Q9BUT1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 6; (R)-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase; 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2; 4-oxo-L-proline reductase; Oxidoreductase UCPA; Short chain dehydrogenase/reductase family 15C member 1; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.30; EC 1.1.1.104 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
55% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 4:245/245 of Q9BUT1

query
sites
Q9BUT1
L
 
L
Q
 
D
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
I
L
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
|
D
I
 
I
D
 
N
I
 
E
H
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
I
 
L
E
 
E
E
 
K
V
 
Y
T
 
P
A
 
G
M
 
I
S
 
Q
-
 
T
-
 
R
-
 
V
L
 
L
D
|
D
V
 
V
T
 
T
S
 
K
T
 
K
A
 
K
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
A
 
Q
A
 
F
C
 
A
E
x
N
R
 
E
I
 
V
G
 
E
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
H
G
 
G
N
 
T
I
 
V
L
 
L
Q
 
D
C
 
C
D
 
E
E
 
E
A
 
K
A
 
D
W
 
W
A
 
D
R
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
R
A
 
S
M
 
M
Y
 
Y
R
 
L
M
 
M
I
 
I
H
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
 
S
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
V
N
 
N
R
 
R
F
 
C
A
 
V
Y
 
Y
A
 
S
T
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
T
V
|
V
D
|
D
S
x
T
P
|
P
S
|
S
L
 
L
R
 
Q
Q
 
E
R
 
R
I
 
I
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
Q
 
A
G
 
R
V
 
G
D
 
N
E
 
P
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
Y
 
R
R
 
N
Q
 
D
F
 
F
L
 
L
D
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
S
 
T
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
M
L
 
L
A
 
C
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
N
I
 
P
H
 
V
V
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
S
I
 
L

2ag5A Crystal structure of human dhrs6 (see paper)
55% identity, 99% coverage: 3:246/246 of query aligns to 4:245/246 of 2ag5A

query
sites
2ag5A
L
 
L
Q
 
D
N
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
I
L
 
I
V
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
D
|
D
I
|
I
D
 
N
I
 
E
H
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
I
 
L
E
 
E
E
 
K
V
 
Y
T
 
P
A
 
G
M
 
I
S
 
Q
-
 
T
-
 
R
-
 
V
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
K
T
 
K
A
 
K
A
 
Q
I
 
I
S
 
D
A
 
Q
A
 
F
C
 
A
E
 
N
R
 
E
I
 
V
G
 
E
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
F
N
 
N
C
x
V
A
 
A
G
|
G
Y
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
H
G
 
G
N
 
T
I
 
V
L
 
L
Q
 
D
C
 
C
D
 
E
E
 
E
A
 
K
A
 
D
W
 
W
A
 
D
R
 
F
S
 
S
M
 
M
D
 
N
L
|
L
N
 
N
V
 
V
T
 
R
A
 
S
M
 
M
Y
 
Y
R
 
L
M
 
M
I
 
I
H
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
K
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
G
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
S
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
S
V
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
V
N
 
N
R
|
R
F
 
C
A
 
V
Y
|
Y
A
 
S
T
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
I
S
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
 
T
V
|
V
D
 
D
S
x
T
P
 
P
S
|
S
L
 
L
R
 
Q
Q
 
E
R
|
R
I
 
I
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
Q
Q
 
A
G
x
R
V
 
G
D
 
N
E
 
P
A
 
E
Q
 
E
V
 
A
Y
 
R
R
 
N
Q
 
D
F
|
F
L
 
L
D
 
K
R
|
R
Q
 
Q
P
 
K
M
 
T
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
A
S
 
T
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
M
L
 
L
A
 
C
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
S
A
 
A
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
N
I
 
P
H
 
V
V
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
S
I
 
L

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
39% identity, 89% coverage: 27:245/246 of query aligns to 27:246/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
x
L
D
 
D
I
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
A
E
 
E
V
 
R
T
 
S
A
 
A
M
 
A
S
 
M
L
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
T
A
 
S
A
 
A
C
 
E
E
 
Q
R
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
G
S
 
F
G
 
G
N
 
S
I
 
V
L
 
H
Q
 
D
C
 
A
D
 
D
E
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
A
 
D
R
 
R
S
 
I
M
 
M
D
 
A
L
x
V
N
|
N
V
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
T
Y
 
F
R
 
L
M
 
A
I
 
S
H
 
K
A
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
P
N
 
T
R
 
M
F
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
V
 
M
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
S
 
G
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
 
T
V
|
V
D
 
T
S
 
S
P
x
T
S
x
G
L
x
M
R
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
I
 
L
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
L
D
 
P
E
 
E
A
 
V
Q
 
Q
V
 
A
Y
 
R
R
 
R
Q
 
-
F
 
-
L
 
L
D
 
A
R
 
K
Q
 
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
G
S
 
T
T
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
A
A
 
V
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
Q
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
A
H
 
F
V
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
39% identity, 89% coverage: 27:245/246 of query aligns to 27:251/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
x
L
D
 
D
I
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
A
E
 
E
V
 
R
T
 
S
A
 
A
M
 
A
S
 
M
L
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
T
A
 
S
A
 
A
C
 
E
E
 
Q
R
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
G
S
 
F
G
 
G
N
 
S
I
 
V
L
 
H
Q
 
D
C
 
A
D
 
D
E
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
A
 
D
R
 
R
S
 
I
M
 
M
D
 
A
L
x
V
N
|
N
V
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
T
Y
 
F
R
 
L
M
 
A
I
 
S
H
 
K
A
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
P
N
 
T
R
 
M
F
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
V
 
M
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
S
 
G
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
|
T
V
|
V
D
 
T
S
 
S
P
x
T
S
 
G
L
x
M
R
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
I
 
L
A
 
L
D
 
G
Q
 
S
A
 
D
V
 
T
Q
 
S
Q
 
P
G
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
E
A
 
V
Q
 
Q
V
 
A
Y
 
R
R
|
R
Q
 
-
F
 
-
L
 
L
D
 
A
R
 
K
Q
x
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
G
S
 
T
T
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
A
A
 
V
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
Q
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
A
H
 
F
V
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
39% identity, 89% coverage: 27:245/246 of query aligns to 29:253/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
R
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
A
A
 
L
T
 
I
D
|
D
I
 
L
D
 
D
I
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
Q
G
 
G
I
 
L
E
 
A
E
 
E
V
 
R
T
 
S
A
 
A
M
 
A
S
 
M
L
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
T
A
 
S
A
 
A
C
 
E
E
 
Q
R
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
T
V
 
G
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
A
H
 
G
S
 
F
G
 
G
N
 
S
I
 
V
L
 
H
Q
 
D
C
 
A
D
 
D
E
 
A
A
 
A
A
 
A
W
 
W
A
 
D
R
 
R
S
 
I
M
 
M
D
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
T
Y
 
F
R
 
L
M
 
A
I
 
S
H
 
K
A
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
A
G
 
G
M
 
M
L
 
L
A
 
E
R
 
R
G
 
H
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
-
G
 
G
V
 
I
P
 
P
N
 
T
R
 
M
F
 
A
A
 
A
Y
|
Y
A
 
C
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
K
 
R
A
 
Q
V
 
M
A
 
A
I
 
A
D
 
D
F
 
Y
V
 
S
S
 
G
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
|
T
V
|
V
D
x
T
S
|
S
P
x
T
S
x
G
L
 
M
R
 
G
Q
 
Q
R
 
Q
I
 
L
A
 
L
D
 
G
Q
 
S
A
 
D
V
 
T
Q
 
S
Q
 
P
G
 
-
V
 
-
D
 
-
E
 
E
A
 
V
Q
 
Q
V
 
A
Y
 
R
R
|
R
Q
 
-
F
 
-
L
 
L
D
 
A
R
x
K
Q
x
Y
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
F
G
 
G
S
 
T
T
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
L
 
A
A
 
V
V
 
I
Y
 
F
L
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
Q
S
 
A
A
 
A
Y
 
F
T
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
I
 
A
H
 
F
V
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:245/246 of query aligns to 3:253/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
N
 
N
L
 
L
Q
 
T
N
 
D
K
 
K
R
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
A
x
G
A
 
G
G
 
A
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
Y
A
 
A
S
 
A
A
 
V
I
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
L
R
 
G
A
 
Q
G
 
Q
A
 
A
E
 
N
V
 
V
I
 
V
A
 
V
T
 
A
D
|
D
I
|
I
D
 
D
I
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
H
 
E
A
 
A
L
 
M
A
 
V
G
 
R
I
 
K
E
 
E
E
 
N
V
 
N
T
 
D
A
 
R
M
 
L
S
 
H
L
 
F
-
 
V
-
 
Q
-
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
S
 
D
T
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
C
-
 
Q
-
 
H
-
 
A
I
 
V
S
 
E
A
 
S
A
 
A
C
 
V
E
 
H
R
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
F
 
I
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
Y
 
I
V
 
E
H
 
I
S
 
V
G
 
A
N
 
P
I
 
I
L
 
H
Q
 
E
C
 
M
D
 
E
E
 
L
A
 
S
A
 
D
W
 
W
A
 
N
R
 
K
S
 
V
M
 
L
D
 
Q
L
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
T
A
 
G
M
 
M
Y
 
F
R
 
L
M
 
M
I
 
S
H
 
K
A
 
H
F
 
A
L
 
L
P
 
K
G
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
S
 
C
S
|
S
V
 
V
A
 
G
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
-
G
 
A
V
 
W
P
 
P
N
 
D
R
 
I
F
 
P
A
 
A
Y
|
Y
A
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
A
I
 
V
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
S
 
K
Q
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
I
V
x
I
D
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
L
L
 
N
R
 
E
Q
 
K
R
 
S
I
 
F
A
 
L
D
 
E
Q
 
N
A
 
-
V
 
-
Q
 
N
Q
 
E
G
 
G
V
 
T
D
 
L
E
 
E
A
 
-
Q
 
E
V
 
I
Y
 
K
R
 
K
Q
 
E
F
 
K
L
 
A
D
 
K
R
 
V
Q
 
N
P
 
P
M
 
L
G
 
L
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
K
T
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
N
L
 
V
A
 
M
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
S
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
A
H
 
I
V
 
T
I
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
S
 
T

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
35% identity, 100% coverage: 2:246/246 of query aligns to 4:247/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
N
 
D
L
 
L
Q
 
R
N
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
S
Q
 
M
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
S
 
I
A
 
A
I
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
V
R
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
S
E
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
-
T
 
-
D
 
D
I
 
L
D
 
S
I
 
I
H
 
H
A
 
D
L
 
-
A
 
P
G
 
G
I
 
E
E
 
A
E
 
K
V
 
Y
T
 
D
A
 
H
M
 
I
S
 
E
L
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
S
 
N
T
 
P
A
 
D
A
 
Q
I
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
S
C
 
I
E
 
D
R
 
H
I
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
 
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
E
H
 
S
S
 
Y
G
 
G
N
 
K
I
 
I
L
 
E
Q
 
S
C
 
M
D
 
S
E
 
M
A
 
G
A
 
E
W
 
W
A
 
R
R
 
R
S
 
I
M
 
I
D
 
D
L
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
F
A
 
G
M
 
Y
Y
 
Y
R
 
Y
M
 
A
I
 
S
H
 
K
A
 
F
F
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
L
 
I
A
 
R
R
 
S
G
 
R
G
 
D
G
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
 
I
S
 
S
S
|
S
V
|
V
A
x
Q
S
 
A
S
 
S
V
 
I
K
 
I
G
 
-
V
 
T
P
 
K
N
 
N
R
 
A
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
T
 
T
S
|
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
L
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
S
 
P
Q
 
L
G
 
-
I
 
L
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
G
x
A
T
|
T
V
 
I
D
 
D
S
 
T
P
 
P
S
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
K
R
 
A
I
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
A
A
 
E
V
 
L
Q
 
E
Q
 
V
G
 
G
V
 
S
D
 
D
E
 
P
A
 
M
Q
 
R
V
 
I
Y
 
E
R
 
K
Q
 
K
F
 
I
L
 
S
D
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
H
R
 
E
Q
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
K
T
 
P
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
S
L
 
A
A
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
R
A
 
E
S
 
A
A
 
S
Y
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
C
H
 
L
V
 
Y
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
S
 
S
I
 
I

2dteA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with nadh (see paper)
35% identity, 100% coverage: 2:246/246 of query aligns to 4:247/255 of 2dteA

query
sites
2dteA
N
 
D
L
 
L
Q
 
R
N
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
x
S
Q
x
M
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
S
 
I
A
 
A
I
 
E
A
 
R
F
 
F
A
 
V
R
 
D
A
 
E
G
 
G
A
 
S
E
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
-
T
 
-
D
 
D
I
 
L
D
x
S
I
|
I
H
 
H
A
 
D
L
 
-
A
 
P
G
 
G
I
 
E
E
 
A
E
 
K
V
 
Y
T
 
D
A
 
H
M
 
I
S
 
E
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
S
 
N
T
 
P
A
 
D
A
 
Q
I
 
V
S
 
K
A
 
A
A
 
S
C
 
I
E
 
D
R
 
H
I
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
S
V
 
V
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
I
V
 
E
H
 
S
S
 
Y
G
 
G
N
 
K
I
 
I
L
 
E
Q
 
S
C
 
M
D
 
S
E
 
M
A
 
G
A
 
E
W
 
W
A
 
R
R
 
R
S
 
I
M
 
I
D
 
D
L
 
V
N
 
N
V
 
L
T
 
F
A
 
G
M
 
Y
Y
 
Y
R
 
Y
M
 
A
I
 
S
H
 
K
A
 
F
F
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
Y
M
 
M
L
 
I
A
 
R
R
 
S
G
 
R
G
 
D
G
 
P
S
 
S
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
Q
S
 
A
S
 
S
V
 
I
K
 
I
G
 
-
V
 
T
P
 
K
N
 
N
R
 
A
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
T
 
T
S
|
S
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
L
D
 
D
F
 
Y
V
 
A
S
 
P
Q
 
L
G
 
-
I
 
L
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
|
P
G
x
A
T
|
T
V
x
I
D
 
D
S
x
T
P
|
P
S
x
L
L
x
V
R
 
R
Q
 
K
R
 
A
I
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
A
A
 
E
V
 
L
Q
 
E
Q
 
V
G
 
G
V
 
S
D
 
D
E
 
P
A
 
M
Q
 
R
V
 
I
Y
 
E
R
 
K
Q
 
K
F
 
I
L
 
S
D
 
E
-
 
W
-
 
G
-
 
H
R
 
E
Q
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
S
 
K
T
 
P
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
S
L
 
A
A
 
V
V
 
A
Y
 
F
L
 
L
G
 
A
S
 
S
D
 
R
A
 
E
S
 
A
A
 
S
Y
 
F
T
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
C
H
 
L
V
 
Y
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
L
S
 
S
I
 
I

8y83A Crystal structure of a ketoreductase from sphingobacterium siyangense sy1 with co-enzyme (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 4:247/249 of 8y83A

query
sites
8y83A
L
 
L
Q
 
A
N
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
S
G
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
A
F
 
Y
A
 
G
R
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
I
T
 
S
D
|
D
I
|
I
D
 
N
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
G
-
 
N
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
K
-
 
Q
I
 
I
H
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
G
G
 
G
I
 
-
E
 
-
E
 
E
V
 
A
T
 
V
A
 
F
M
 
F
S
 
K
L
x
A
D
|
D
V
x
S
T
 
S
S
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
N
T
 
E
A
 
A
A
 
L
I
 
V
S
 
G
A
 
Y
A
 
A
C
 
V
E
 
K
R
 
T
I
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
 
G
Y
 
-
V
 
I
H
 
G
S
 
G
G
 
E
N
 
A
I
 
A
L
 
L
Q
 
T
C
 
G
D
 
D
E
 
Y
A
 
S
-
 
L
-
 
D
A
 
G
W
 
W
A
 
K
R
 
K
S
 
V
M
 
I
D
 
D
L
 
I
N
 
N
V
 
F
T
 
N
A
 
G
M
 
V
Y
 
F
R
 
Y
M
 
G
I
 
C
H
 
K
A
 
Y
F
 
Q
L
 
I
P
 
E
G
 
A
M
 
M
L
 
E
A
 
R
R
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
|
M
S
 
A
S
 
S
V
 
I
A
 
H
S
 
G
S
 
T
V
 
V
K
 
-
G
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
M
R
 
S
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
T
T
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
N
V
 
I
A
 
G
I
 
A
D
 
E
F
 
Y
V
 
G
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
|
G
T
x
Y
V
x
I
D
 
D
S
 
T
P
 
P
S
x
L
L
 
L
R
 
A
Q
 
K
R
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
Q
 
-
Q
 
-
G
 
-
V
 
L
D
 
D
E
 
K
A
 
E
Q
 
H
V
 
I
Y
 
-
R
 
N
Q
 
A
F
 
L
L
 
I
D
 
S
R
 
K
Q
 
H
P
 
P
M
 
I
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
K
T
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
D
A
 
K
S
 
S
A
 
S
Y
 
F
T
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
G
I
 
Y
H
 
Y
V
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
S
 
T

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 2:258/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
L
 
L
Q
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
S
G
x
T
Q
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
M
A
 
A
I
 
T
A
 
E
F
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
I
 
L
H
 
E
A
 
S
L
 
K
A
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
K
E
 
A
V
 
Y
T
 
Y
A
 
-
M
 
L
S
 
N
L
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
S
 
D
T
 
A
A
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
D
-
 
F
I
 
I
S
 
A
A
 
K
A
 
A
C
 
A
E
 
E
R
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
 
A
G
|
G
Y
 
I
V
x
Q
H
 
H
S
 
T
G
 
A
N
 
P
I
 
I
L
 
E
Q
 
E
C
 
F
D
 
P
E
 
V
A
 
D
A
 
K
W
 
W
A
 
N
R
 
A
S
 
I
M
 
I
D
 
A
L
|
L
N
|
N
V
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
V
Y
 
F
R
 
H
M
 
G
I
 
T
H
 
A
A
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
L
 
Q
A
 
K
R
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
A
A
x
H
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
A
G
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
N
R
x
K
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
E
F
 
N
V
 
A
S
 
G
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
D
 
R
S
x
T
P
 
P
S
x
L
L
x
V
R
 
E
Q
 
K
R
x
Q
I
 
I
A
 
E
D
 
A
Q
x
I
A
 
S
V
 
Q
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
E
 
I
A
 
E
Q
 
A
V
 
A
Y
 
A
R
 
R
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
-
 
A
D
 
E
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
M
 
S
G
 
L
R
 
Q
I
 
F
G
 
V
S
 
T
T
 
P
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
G
Q
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
D
Y
 
Q
T
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
T
H
 
L
V
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
T

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
35% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 2:258/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
L
 
L
Q
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
S
G
x
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
M
A
 
A
I
 
T
A
 
E
F
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
I
 
L
H
 
E
A
 
S
L
 
K
A
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
K
E
 
A
V
 
Y
T
 
Y
A
 
-
M
 
L
S
 
N
L
x
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
S
 
D
T
 
A
A
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
D
-
 
F
I
 
I
S
 
A
A
 
K
A
 
A
C
 
A
E
 
E
R
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
I
V
x
Q
H
 
H
S
 
T
G
 
A
N
 
P
I
 
I
L
 
E
Q
 
E
C
 
F
D
 
P
E
 
V
A
 
D
A
 
K
W
 
W
A
 
N
R
 
A
S
 
I
M
 
I
D
 
A
L
|
L
N
|
N
V
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
V
Y
 
F
R
 
H
M
 
G
I
 
T
H
 
A
A
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
L
 
Q
A
 
K
R
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
A
A
x
H
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
A
G
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
N
R
x
K
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
E
F
 
N
V
 
A
S
 
G
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
D
 
R
S
x
T
P
 
P
S
x
L
L
x
V
R
 
E
Q
 
K
R
x
Q
I
 
I
A
 
E
D
 
A
Q
x
I
A
 
S
V
 
Q
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
E
 
I
A
 
E
Q
 
A
V
 
A
Y
 
A
R
 
R
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
-
 
A
D
 
E
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
M
 
S
G
 
L
R
 
Q
I
 
F
G
 
V
S
 
T
T
 
P
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
G
Q
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
D
Y
 
Q
T
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
T
H
 
L
V
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
x
W
S
 
T

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 2:258/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
L
 
L
Q
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
S
G
x
T
Q
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
M
A
 
A
I
 
T
A
 
E
F
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
I
 
L
H
 
E
A
 
S
L
 
K
A
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
K
E
 
A
V
 
Y
T
 
Y
A
 
-
M
 
L
S
 
N
L
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
S
 
D
T
 
A
A
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
D
-
 
F
I
 
I
S
 
A
A
 
K
A
 
A
C
 
A
E
 
E
R
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
I
V
x
Q
H
 
H
S
 
T
G
 
A
N
 
P
I
 
I
L
 
E
Q
 
E
C
 
F
D
 
P
E
 
V
A
 
D
A
 
K
W
 
W
A
 
N
R
 
A
S
 
I
M
 
I
D
 
A
L
|
L
N
|
N
V
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
V
Y
 
F
R
 
H
M
 
G
I
 
T
H
 
A
A
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
L
 
Q
A
 
K
R
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
A
A
x
H
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
A
G
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
N
R
x
K
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
E
F
 
N
V
 
A
S
 
G
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
D
 
R
S
x
T
P
 
P
S
x
L
L
x
V
R
 
E
Q
 
K
R
x
Q
I
 
I
A
 
E
D
 
A
Q
x
I
A
 
S
V
 
Q
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
E
 
I
A
 
E
Q
 
A
V
 
A
Y
 
A
R
 
R
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
-
 
A
D
 
E
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
M
 
S
G
 
L
R
 
Q
I
 
F
G
 
V
S
 
T
T
 
P
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
G
Q
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
D
Y
 
Q
T
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
T
H
 
L
V
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
x
W
S
 
T

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 2:258/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
L
 
L
Q
 
K
N
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
S
G
 
T
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
M
A
 
A
I
 
T
A
 
E
F
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
D
V
 
V
I
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
A
 
P
T
 
E
D
 
D
I
 
I
D
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
I
 
L
H
 
E
A
 
S
L
 
K
A
 
F
G
 
G
I
 
V
E
 
K
E
 
A
V
 
Y
T
 
Y
A
 
-
M
 
L
S
 
N
L
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
S
S
 
D
T
 
A
A
 
Q
A
 
A
-
 
T
-
 
R
-
 
D
-
 
F
I
 
I
S
 
A
A
 
K
A
 
A
C
 
A
E
 
E
R
 
A
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
F
 
V
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
|
G
Y
 
I
V
x
Q
H
 
H
S
 
T
G
 
A
N
 
P
I
 
I
L
 
E
Q
 
E
C
 
F
D
 
P
E
 
V
A
 
D
A
 
K
W
 
W
A
 
N
R
 
A
S
 
I
M
 
I
D
 
A
L
|
L
N
|
N
V
 
L
T
 
S
A
 
A
M
 
V
Y
 
F
R
 
H
M
 
G
I
 
T
H
 
A
A
 
A
F
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
I
M
 
M
L
 
Q
A
 
K
R
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
A
A
x
H
S
 
G
S
 
L
V
 
V
K
 
A
G
 
S
V
 
V
P
 
-
N
 
N
R
x
K
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
V
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
D
 
E
F
 
N
V
 
A
S
 
G
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
D
 
R
S
x
T
P
 
P
S
x
L
L
x
V
R
 
E
Q
 
K
R
x
Q
I
 
I
A
 
E
D
 
A
Q
x
I
A
 
S
V
 
Q
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
E
 
I
A
 
E
Q
 
A
V
 
A
Y
 
A
R
 
R
Q
 
E
F
 
L
L
 
L
-
 
A
D
 
E
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
M
 
S
G
 
L
R
 
Q
I
 
F
G
 
V
S
 
T
T
 
P
E
 
E
E
 
Q
I
 
L
A
 
G
Q
 
G
L
 
A
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
D
Y
 
Q
T
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
T
I
 
T
H
 
L
V
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
W
S
 
T

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:245/246 of query aligns to 3:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
Q
 
D
N
 
N
K
 
K
R
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
x
G
A
 
A
G
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
V
A
 
A
I
 
H
A
 
S
F
 
Y
A
 
A
R
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
V
T
 
S
D
|
D
I
|
I
-
 
N
D
 
E
I
 
D
H
 
H
A
 
G
L
 
N
A
 
K
G
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
D
V
 
I
T
 
K
A
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
F
M
 
V
S
 
K
L
x
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
S
 
N
T
 
P
A
 
E
A
 
E
I
 
V
S
 
E
A
 
A
A
 
L
C
 
V
E
 
K
R
 
R
I
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
Y
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
F
 
C
N
 
N
C
x
N
A
|
A
G
 
G
Y
 
-
V
 
I
H
 
G
S
 
G
G
 
E
N
 
Q
I
 
A
L
 
L
Q
 
A
C
 
G
D
 
D
E
 
Y
A
 
G
-
 
L
-
 
D
A
 
S
W
 
W
A
 
R
R
 
K
S
 
V
M
 
L
D
 
S
L
 
I
N
 
N
V
 
L
T
 
D
A
 
G
M
 
V
Y
 
F
R
 
Y
M
 
G
I
 
C
H
 
K
A
 
Y
F
 
E
L
 
L
P
 
E
G
 
Q
M
 
M
L
 
E
A
 
K
R
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
I
 
V
N
 
N
M
|
M
S
 
A
S
|
S
V
 
I
A
 
H
S
 
G
S
 
I
V
 
V
K
 
-
G
 
A
V
 
A
P
 
P
N
 
L
R
 
S
F
 
S
A
 
A
Y
|
Y
A
 
T
T
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
A
 
N
V
 
I
A
 
G
I
 
A
D
 
E
F
 
Y
V
 
G
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
T
x
Y
V
x
I
D
 
E
S
 
T
P
 
P
S
x
L
L
 
L
R
 
-
Q
 
-
R
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
E
A
 
S
V
 
L
Q
 
T
Q
 
K
G
 
E
V
 
M
D
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
V
 
-
Y
 
-
R
 
-
Q
 
-
F
 
L
L
 
I
D
 
S
R
 
K
Q
 
H
P
 
P
M
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
L
G
 
G
S
 
K
T
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
L
 
L
A
 
V
V
 
L
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
S
 
S
D
 
E
A
 
K
S
 
S
A
 
S
Y
 
F
T
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
G
I
 
Y
H
 
Y
V
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
M
 
Y
S
 
T

Query Sequence

>AO356_28740 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_28740
MNLQNKRVLVTAAGQGIGLASAIAFARAGAEVIATDIDIHALAGIEEVTAMSLDVTSTAA
ISAACERIGGLDVLFNCAGYVHSGNILQCDEAAWARSMDLNVTAMYRMIHAFLPGMLARG
GGSIINMSSVASSVKGVPNRFAYATSKAAVVGLTKAVAIDFVSQGIRCNAICPGTVDSPS
LRQRIADQAVQQGVDEAQVYRQFLDRQPMGRIGSTEEIAQLAVYLGSDASAYTTGAIHVI
DGGMSI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory