SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_29165 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_29165 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

3b59A Crystal structure of the mn(ii)-bound glyoxalase from novosphingobium aromaticivorans
26% identity, 85% coverage: 11:276/312 of query aligns to 12:256/301 of 3b59A

query
sites
3b59A
F
 
Y
G
 
G
V
 
V
D
 
K
D
 
D
I
 
F
Q
 
D
A
 
A
C
 
E
T
 
K
H
 
A
C
 
F
L
 
Y
R
 
A
D
 
D
-
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
H
 
E
P
 
P
V
 
V
D
 
G
V
 
E
D
 
D
S
 
A
E
 
N
G
 
N
G
 
A
R
 
W
F
 
F
E
 
K
A
 
A
L
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
D
D
 
E
G
 
H
T
 
H
A
 
V
V
 
V
I
 
Q
I
 
L
R
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
D
 
E
A
 
N
R
 
R
L
 
I
P
 
D
A
 
V
A
 
-
I
 
I
G
 
A
P
 
L
A
 
A
P
 
A
S
 
D
I
 
S
R
 
R
E
 
S
T
 
D
V
 
V
Y
 
D
G
 
A
V
 
L
A
 
R
S
 
-
V
 
-
A
 
A
D
 
S
L
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
G
D
 
C
E
 
K
L
 
V
G
 
A
H
 
S
D
 
E
R
 
P
L
 
A
V
 
V
T
 
L
R
 
A
G
 
T
A
 
P
D
 
G
G
 
G
S
 
G
V
 
-
H
 
-
S
 
-
V
 
-
D
 
-
D
 
-
M
 
Y
G
 
G
F
 
F
-
 
R
-
 
F
-
 
F
-
 
S
-
 
P
-
 
D
A
 
G
I
 
L
G
 
L
F
 
F
Q
 
E
I
 
V
S
 
S
V
 
S
R
 
D
R
 
V
P
 
A
Y
 
K
S
 
G
A
 
A
P
 
K
A
 
R
D
 
D
L
 
L
T
 
A
N
 
R
A
 
W
P
 
E
G
 
G
H
 
-
A
 
-
P
 
-
Q
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
-
N
 
-
Q
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
-
M
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
V
P
 
P
R
 
V
T
 
K
L
 
I
S
 
S
H
|
H
V
 
I
V
 
V
Y
 
L
F
 
H
V
 
S
P
 
P
D
 
N
A
 
H
A
 
Q
K
 
D
A
 
M
E
 
V
A
 
K
F
 
F
Y
 
F
K
 
T
R
 
D
-
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
K
T
 
V
T
 
S
D
 
D
T
 
W
F
 
L
V
 
G
G
 
D
A
 
F
G
 
M
P
 
C
F
 
F
M
 
L
R
 
R
P
 
C
A
 
N
G
 
S
S
 
A
D
 
-
D
 
-
H
 
H
H
|
H
C
 
R
L
 
I
F
 
A
M
 
I
I
 
L
Q
 
P
T
 
G
P
 
P
P
 
P
H
 
C
M
 
L
K
 
N
G
 
-
C
 
-
E
 
-
H
|
H
F
 
V
T
 
A
F
 
Y
H
 
D
M
 
M
G
 
L
S
 
S
G
 
V
T
 
D
E
 
D
V
 
M
L
 
M
L
 
R
A
 
G
G
 
A
R
 
H
R
 
R
F
 
L
E
 
K
Q
 
V
Q
 
K
G
 
G
W
 
I
T
 
D
S
 
I
F
 
G
W
 
W
G
 
G
P
 
P
G
 
G
R
 
R
H
|
H
L
 
T
F
 
A
G
 
G
S
 
N
N
 
N
W
 
T
F
 
F
W
 
S
Y
|
Y
F
 
F
N
 
V
S
 
T
P
 
P
L
 
G
G
 
G
C
 
F
H
 
V
I
 
T
E
|
E
Y
 
Y
D
 
T
A
 
S
D
 
E
M
 
L
D
 
E
K
 
E
H
 
V
D
 
D

1knfA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase complexed with 3-methyl catechol under anaerobic condition (see paper)
26% identity, 71% coverage: 57:279/312 of query aligns to 48:271/288 of 1knfA

query
sites
1knfA
R
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
V
A
 
Q
I
 
Q
G
 
G
P
 
E
A
 
V
P
 
D
S
 
D
I
 
L
R
 
A
E
 
F
T
 
A
V
 
G
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
D
V
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
G
 
K
H
 
Q
D
 
A
R
 
G
L
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
T
G
 
T
A
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
S
V
 
L
H
 
A
S
 
R
V
 
R
D
 
R
D
 
G
M
 
V
G
 
T
F
 
G
A
 
L
I
 
I
G
 
T
F
 
F
Q
 
A
I
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
D
P
 
P
Y
 
F
S
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
L
D
 
E
L
 
I
T
 
Y
N
 
Y
A
 
G
P
 
A
G
 
S
H
 
E
A
 
V
P
 
F
Q
 
E
R
 
K
P
 
P
V
 
F
N
 
L
Q
 
P
P
 
G
G
 
A
I
 
A
N
 
V
P
 
S
D
 
G
M
 
F
Q
 
L
A
 
T
L
 
G
P
 
E
R
 
Q
T
 
G
L
 
L
S
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
Y
 
R
F
 
C
V
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
D
K
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
K
 
T
R
 
D
-
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
x
Q
T
 
L
T
 
S
D
 
D
T
 
V
F
 
I
-
 
D
V
 
M
G
 
K
A
 
M
G
 
G
P
 
P
-
 
D
F
 
V
M
 
T
R
 
V
P
 
P
A
 
A
-
 
Y
-
x
F
-
 
L
-
x
H
G
 
C
S
 
N
D
 
E
D
 
R
H
 
H
H
 
H
C
 
T
L
 
L
F
 
-
M
 
A
I
 
I
Q
 
A
T
 
A
P
 
F
P
 
P
H
 
L
M
 
P
K
 
K
G
 
R
C
 
I
E
 
H
H
|
H
F
 
F
T
 
M
F
 
L
H
 
E
M
 
V
G
 
A
S
 
S
G
 
L
T
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
F
R
 
D
R
 
R
F
 
V
E
 
D
Q
 
A
Q
 
D
G
 
G
W
 
L
T
 
I
S
 
T
F
 
S
W
 
-
G
 
T
P
 
L
G
 
G
R
 
R
H
|
H
L
 
T
F
x
N
G
 
D
S
 
H
N
 
M
W
 
V
F
 
S
W
 
F
Y
|
Y
F
 
A
N
 
S
S
 
T
P
 
P
L
 
S
G
 
G
C
 
V
H
 
E
I
 
V
E
|
E
Y
 
Y
D
 
G
A
 
W
D
 
S
M
 
A
D
 
R
K
 
T
H
 
V
D
 
D
D
 
R
A
 
S
W
 
W

1kndA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase complexed with catechol under anaerobic condition (see paper)
26% identity, 71% coverage: 57:279/312 of query aligns to 48:271/288 of 1kndA

query
sites
1kndA
R
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
V
A
 
Q
I
 
Q
G
 
G
P
 
E
A
 
V
P
 
D
S
 
D
I
 
L
R
 
A
E
 
F
T
 
A
V
 
G
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
D
V
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
G
 
K
H
 
Q
D
 
A
R
 
G
L
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
T
G
 
T
A
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
S
V
 
L
H
 
A
S
 
R
V
 
R
D
 
R
D
 
G
M
 
V
G
 
T
F
 
G
A
 
L
I
 
I
G
 
T
F
 
F
Q
 
A
I
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
D
P
 
P
Y
 
F
S
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
L
D
 
E
L
 
I
T
 
Y
N
 
Y
A
 
G
P
 
A
G
 
S
H
 
E
A
 
V
P
 
F
Q
 
E
R
 
K
P
 
P
V
 
F
N
 
L
Q
 
P
P
 
G
G
 
A
I
 
A
N
 
V
P
 
S
D
 
G
M
 
F
Q
 
L
A
 
T
L
 
G
P
 
E
R
 
Q
T
 
G
L
 
L
S
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
Y
 
R
F
 
C
V
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
D
K
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
K
 
T
R
 
D
-
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
x
Q
T
 
L
T
 
S
D
 
D
T
 
V
F
 
I
-
 
D
V
 
M
G
 
K
A
 
M
G
 
G
P
 
P
-
 
D
F
 
V
M
 
T
R
 
V
P
 
P
A
 
A
-
 
Y
-
x
F
-
 
L
-
x
H
G
 
C
S
 
N
D
 
E
D
 
R
H
 
H
H
|
H
C
 
T
L
 
L
F
 
-
M
 
A
I
 
I
Q
 
A
T
 
A
P
 
F
P
 
P
H
 
L
M
 
P
K
 
K
G
 
R
C
 
I
E
 
H
H
|
H
F
 
F
T
 
M
F
 
L
H
 
E
M
 
V
G
 
A
S
 
S
G
 
L
T
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
F
R
 
D
R
 
R
F
 
V
E
 
D
Q
 
A
Q
 
D
G
 
G
W
 
L
T
 
I
S
 
T
F
 
S
W
 
-
G
 
T
P
 
L
G
 
G
R
 
R
H
|
H
L
 
T
F
x
N
G
 
D
S
 
H
N
 
M
W
 
V
F
 
S
W
 
F
Y
|
Y
F
 
A
N
 
S
S
 
T
P
 
P
L
 
S
G
 
G
C
 
V
H
 
E
I
 
V
E
|
E
Y
 
Y
D
 
G
A
 
W
D
 
S
M
 
A
D
 
R
K
 
T
H
 
V
D
 
D
D
 
R
A
 
S
W
 
W

1kmyA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase complexed with 2,3-dihydroxybiphenyl under anaerobic condition (see paper)
26% identity, 71% coverage: 57:279/312 of query aligns to 48:271/288 of 1kmyA

query
sites
1kmyA
R
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
V
A
 
Q
I
 
Q
G
 
G
P
 
E
A
 
V
P
 
D
S
 
D
I
 
L
R
 
A
E
 
F
T
 
A
V
 
G
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
D
V
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
G
 
K
H
 
Q
D
 
A
R
 
G
L
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
T
G
 
T
A
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
S
V
 
L
H
 
A
S
 
R
V
 
R
D
 
R
D
 
G
M
 
V
G
 
T
F
 
G
A
 
L
I
 
I
G
 
T
F
 
F
Q
 
A
I
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
D
P
 
P
Y
 
F
S
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
L
D
 
E
L
 
I
T
 
Y
N
 
Y
A
 
G
P
 
A
G
 
S
H
 
E
A
 
V
P
 
F
Q
 
E
R
 
K
P
 
P
V
 
F
N
 
L
Q
 
P
P
 
G
G
 
A
I
 
A
N
 
V
P
 
S
D
 
G
M
 
F
Q
 
L
A
 
T
L
 
G
P
 
E
R
 
Q
T
 
G
L
 
L
S
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
Y
 
R
F
 
C
V
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
D
K
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
K
 
T
R
 
D
-
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
 
Q
T
 
L
T
 
S
D
 
D
T
 
V
F
 
I
-
 
D
V
 
M
G
 
K
A
 
M
G
 
G
P
 
P
-
 
D
F
 
V
M
 
T
R
 
V
P
 
P
A
 
A
-
 
Y
-
x
F
-
 
L
-
 
H
G
 
C
S
 
N
D
 
E
D
 
R
H
 
H
H
|
H
C
 
T
L
 
L
F
 
-
M
 
A
I
 
I
Q
 
A
T
 
A
P
 
F
P
 
P
H
 
L
M
 
P
K
 
K
G
 
R
C
 
I
E
 
H
H
|
H
F
 
F
T
 
M
F
 
L
H
 
E
M
 
V
G
 
A
S
 
S
G
 
L
T
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
F
R
 
D
R
 
R
F
 
V
E
 
D
Q
 
A
Q
 
D
G
 
G
W
 
L
T
 
I
S
 
T
F
 
S
W
 
-
G
 
T
P
 
L
G
 
G
R
 
R
H
|
H
L
 
T
F
x
N
G
 
D
S
 
H
N
 
M
W
 
V
F
 
S
W
 
F
Y
|
Y
F
 
A
N
 
S
S
 
T
P
 
P
L
 
S
G
 
G
C
 
V
H
 
E
I
 
V
E
|
E
Y
 
Y
D
 
G
A
 
W
D
 
S
M
 
A
D
 
R
K
 
T
H
 
V
D
 
D
D
 
R
A
 
S
W
 
W

1lkdA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase (dhbd) complexed with 2',6'-dicl dihydroxybiphenyl (dhb) (see paper)
26% identity, 71% coverage: 57:279/312 of query aligns to 48:271/287 of 1lkdA

query
sites
1lkdA
R
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
V
A
 
Q
I
 
Q
G
 
G
P
 
E
A
 
V
P
 
D
S
 
D
I
 
L
R
 
A
E
 
F
T
 
A
V
 
G
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
D
V
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
G
 
K
H
 
Q
D
 
A
R
 
G
L
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
T
G
 
T
A
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
S
V
 
L
H
 
A
S
 
R
V
 
R
D
 
R
D
 
G
M
 
V
G
 
T
F
 
G
A
 
L
I
 
I
G
 
T
F
 
F
Q
 
A
I
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
D
P
 
P
Y
 
F
S
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
L
D
 
E
L
 
I
T
 
Y
N
 
Y
A
 
G
P
 
A
G
 
S
H
 
E
A
 
V
P
 
F
Q
 
E
R
 
K
P
 
P
V
 
F
N
 
L
Q
 
P
P
 
G
G
 
A
I
 
A
N
 
V
P
 
S
D
 
G
M
 
F
Q
 
L
A
 
T
L
 
G
P
 
E
R
 
Q
T
 
G
L
 
L
S
 
G
H
|
H
V
 
F
V
|
V
Y
 
R
F
 
C
V
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
D
K
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
K
 
T
R
 
D
-
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
x
Q
T
 
L
T
 
S
D
 
D
T
 
V
F
 
I
-
 
D
V
x
M
G
 
K
A
 
M
G
 
G
P
 
P
-
 
D
F
 
V
M
 
T
R
 
V
P
 
P
A
 
A
-
 
Y
-
x
F
-
 
L
-
x
H
G
 
C
S
 
N
D
 
E
D
 
R
H
 
H
H
|
H
C
 
T
L
 
L
F
 
-
M
 
A
I
 
I
Q
 
A
T
 
A
P
x
F
P
 
P
H
x
L
M
x
P
K
|
K
G
 
R
C
 
I
E
 
H
H
|
H
F
 
F
T
 
M
F
 
L
H
 
E
M
 
V
G
 
A
S
 
S
G
 
L
T
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
F
R
 
D
R
 
R
F
 
V
E
 
D
Q
 
A
Q
 
D
G
 
G
W
 
L
T
 
I
S
 
T
F
 
S
W
 
-
G
 
T
P
 
L
G
 
G
R
 
R
H
|
H
L
 
T
F
x
N
G
 
D
S
 
H
N
 
M
W
 
V
F
 
S
W
 
F
Y
|
Y
F
 
A
N
 
S
S
 
T
P
 
P
L
x
S
G
|
G
C
 
V
H
x
E
I
 
V
E
|
E
Y
 
Y
D
 
G
A
 
W
D
 
S
M
 
A
D
 
R
K
 
T
H
 
V
D
 
D
D
 
R
A
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

1lgtA Crystal structure of 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase (dhbd) complexed with 2'-cl dihydroxybiphenyl (dhb) (see paper)
26% identity, 71% coverage: 57:279/312 of query aligns to 48:271/287 of 1lgtA

query
sites
1lgtA
R
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
V
A
 
Q
I
 
Q
G
 
G
P
 
E
A
 
V
P
 
D
S
 
D
I
 
L
R
 
A
E
 
F
T
 
A
V
 
G
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
D
V
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
G
 
K
H
 
Q
D
 
A
R
 
G
L
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
T
G
 
T
A
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
S
V
 
L
H
 
A
S
 
R
V
 
R
D
 
R
D
 
G
M
 
V
G
 
T
F
 
G
A
 
L
I
 
I
G
 
T
F
 
F
Q
 
A
I
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
D
P
 
P
Y
 
F
S
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
L
D
 
E
L
 
I
T
 
Y
N
 
Y
A
 
G
P
 
A
G
 
S
H
 
E
A
 
V
P
 
F
Q
 
E
R
 
K
P
 
P
V
 
F
N
 
L
Q
 
P
P
 
G
G
 
A
I
 
A
N
 
V
P
 
S
D
 
G
M
 
F
Q
 
L
A
 
T
L
 
G
P
 
E
R
 
Q
T
 
G
L
 
L
S
 
G
H
|
H
V
 
F
V
|
V
Y
 
R
F
 
C
V
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
D
K
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
K
 
T
R
 
D
-
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
x
Q
T
 
L
T
 
S
D
 
D
T
 
V
F
 
I
-
 
D
V
x
M
G
 
K
A
 
M
G
 
G
P
 
P
-
 
D
F
 
V
M
 
T
R
 
V
P
 
P
A
 
A
-
 
Y
-
x
F
-
 
L
-
x
H
G
 
C
S
 
N
D
 
E
D
 
R
H
 
H
H
|
H
C
 
T
L
 
L
F
 
-
M
 
A
I
 
I
Q
 
A
T
 
A
P
x
F
P
 
P
H
x
L
M
x
P
K
|
K
G
 
R
C
 
I
E
 
H
H
|
H
F
 
F
T
 
M
F
 
L
H
 
E
M
 
V
G
 
A
S
 
S
G
 
L
T
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
F
R
 
D
R
 
R
F
 
V
E
 
D
Q
 
A
Q
 
D
G
 
G
W
 
L
T
 
I
S
 
T
F
 
S
W
 
-
G
 
T
P
 
L
G
 
G
R
 
R
H
|
H
L
 
T
F
x
N
G
 
D
S
 
H
N
 
M
W
 
V
F
 
S
W
 
F
Y
|
Y
F
 
A
N
 
S
S
 
T
P
 
P
L
 
S
G
|
G
C
 
V
H
x
E
I
 
V
E
|
E
Y
 
Y
D
 
G
A
 
W
D
 
S
M
 
A
D
 
R
K
 
T
H
 
V
D
 
D
D
 
R
A
 
S
W
 
W

1hanA Crystal structure of the biphenyl-cleaving extradiol dioxygenase from a pcb-degrading pseudomonad (see paper)
26% identity, 71% coverage: 57:279/312 of query aligns to 48:271/287 of 1hanA

query
sites
1hanA
R
 
R
L
 
I
P
 
A
A
 
V
A
 
Q
I
 
Q
G
 
G
P
 
E
A
 
V
P
 
D
S
 
D
I
 
L
R
 
A
E
 
F
T
 
A
V
 
G
Y
 
Y
G
 
E
V
 
V
A
 
A
S
 
D
V
 
A
A
 
A
D
 
G
L
 
L
E
 
A
A
 
Q
I
 
M
A
 
A
D
 
D
E
 
K
L
 
L
G
 
K
H
 
Q
D
 
A
R
 
G
L
 
I
V
 
A
T
 
V
R
 
T
G
 
T
A
 
G
D
 
D
G
 
A
S
 
S
V
 
L
H
 
A
S
 
R
V
 
R
D
 
R
D
 
G
M
 
V
G
 
T
F
 
G
A
 
L
I
 
I
G
 
T
F
 
F
Q
 
A
I
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
D
P
 
P
Y
 
F
S
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
L
D
 
E
L
 
I
T
 
Y
N
 
Y
A
 
G
P
 
A
G
 
S
H
 
E
A
 
V
P
 
F
Q
 
E
R
 
K
P
 
P
V
 
F
N
 
L
Q
 
P
P
 
G
G
 
A
I
 
A
N
 
V
P
 
S
D
 
G
M
 
F
Q
 
L
A
 
T
L
 
G
P
 
E
R
 
Q
T
 
G
L
 
L
S
 
G
H
|
H
V
 
F
V
 
V
Y
 
R
F
 
C
V
 
V
P
 
P
D
 
D
A
 
S
A
 
D
K
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
K
 
T
R
 
D
-
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F
V
x
Q
T
 
L
T
 
S
D
 
D
T
 
V
F
 
I
-
 
D
V
 
M
G
 
K
A
 
M
G
 
G
P
 
P
-
 
D
F
 
V
M
 
T
R
 
V
P
 
P
A
 
A
-
 
Y
-
 
F
-
 
L
-
x
H
G
 
C
S
 
N
D
 
E
D
 
R
H
 
H
H
 
H
C
 
T
L
 
L
F
 
-
M
 
A
I
 
I
Q
 
A
T
 
A
P
 
F
P
 
P
H
 
L
M
 
P
K
 
K
G
 
R
C
 
I
E
 
H
H
|
H
F
 
F
T
 
M
F
 
L
H
 
E
M
 
V
G
 
A
S
 
S
G
 
L
T
 
D
E
 
D
V
 
V
L
 
G
L
 
F
A
 
A
G
 
F
R
 
D
R
 
R
F
 
V
E
 
D
Q
 
A
Q
 
D
G
 
G
W
 
L
T
 
I
S
 
T
F
 
S
W
 
-
G
 
T
P
 
L
G
 
G
R
 
R
H
 
H
L
 
T
F
 
N
G
 
D
S
 
H
N
 
M
W
 
V
F
 
S
W
 
F
Y
 
Y
F
 
A
N
 
S
S
 
T
P
 
P
L
 
S
G
 
G
C
 
V
H
 
E
I
 
V
E
|
E
Y
 
Y
D
 
G
A
 
W
D
 
S
M
 
A
D
 
R
K
 
T
H
 
V
D
 
D
D
 
R
A
 
S
W
 
W

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AO356_29165 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_29165
MNIIGLDALIFGVDDIQACTHCLRDYGLHPVDVDSEGGRFEALDGTAVIIRRADDARLPA
AIGPAPSIRETVYGVASVADLEAIADELGHDRLVTRGADGSVHSVDDMGFAIGFQISVRR
PYSAPADLTNAPGHAPQRPVNQPGINPDMQALPRTLSHVVYFVPDAAKAEAFYKRLGFVT
TDTFVGAGPFMRPAGSDDHHCLFMIQTPPHMKGCEHFTFHMGSGTEVLLAGRRFEQQGWT
SFWGPGRHLFGSNWFWYFNSPLGCHIEYDADMDKHDDAWQARQAPLSADNSQLFLFTSRE
KWFPSGPPPKQA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory