SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO356_29975 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_29975 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8sutA Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with reaction product 4-hydroxy-2-oxoglutaric acid (see paper)
42% identity, 83% coverage: 44:279/283 of query aligns to 54:301/303 of 8sutA

query
sites
8sutA
L
 
F
V
 
V
Q
 
A
E
 
H
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
I
 
L
V
 
A
E
 
E
T
 
W
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
D
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
M
Y
 
Y
S
 
S
F
 
L
S
 
S
S
 
E
I
 
V
Q
 
K
L
 
L
E
 
H
A
 
A
V
 
P
I
 
I
P
 
P
N
 
K
P
 
P
G
 
S
K
 
K
-
 
N
V
 
I
I
 
I
C
 
C
V
x
I
G
|
G
I
x
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
R
A
 
D
H
|
H
A
 
A
E
 
I
E
 
E
A
 
M
G
 
G
R
 
S
K
 
E
-
 
A
-
 
D
V
 
I
G
 
P
E
 
E
F
 
H
P
 
P
V
 
M
I
 
V
F
|
F
Q
 
T
R
 
K
F
 
S
A
 
P
E
 
V
T
 
T
L
 
V
L
 
T
P
 
G
H
 
H
G
 
G
E
 
D
P
 
I
L
 
V
-
 
K
V
 
S
R
 
H
P
 
E
K
 
E
V
 
V
S
 
T
E
 
S
Q
 
Q
F
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
S
G
 
G
A
 
T
H
 
R
I
 
I
D
 
S
P
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
A
M
 
Y
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
C
 
I
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
I
S
 
T
V
 
A
R
|
R
D
 
D
W
 
L
Q
|
Q
F
 
K
H
 
R
T
 
H
H
 
K
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
F
M
 
I
G
 
G
K
|
K
T
 
S
F
 
L
R
 
D
K
 
T
T
 
T
G
 
C
A
 
P
L
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
L
I
 
V
P
 
H
A
 
K
S
 
S
E
 
S
I
 
I
S
 
Q
D
 
E
Y
 
P
R
 
E
T
 
R
L
 
L
V
 
K
V
 
V
R
 
E
G
 
T
I
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
A
S
 
S
E
 
D
L
 
M
A
 
I
F
 
F
D
 
S
I
 
I
P
 
P
H
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
E
Y
 
T
V
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
G
L
 
M
P
 
T
W
 
L
N
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
K
K
 
G
R
 
F
K
 
T
P
 
P
P
 
P
I
 
K
F
 
F
L
 
L
K
 
R
P
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
F
 
I
E
 
D
V
 
I
V
 
T
I
 
I
T
 
D
E
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
N
 
N
G
 
Q
V
 
I

8skyB Crystal structure of yisk from bacillus subtilis in complex with oxalate (see paper)
42% identity, 83% coverage: 44:279/283 of query aligns to 53:300/303 of 8skyB

query
sites
8skyB
L
 
F
V
 
V
Q
 
A
E
 
H
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
I
 
L
V
 
A
E
 
E
T
 
W
A
 
A
Q
 
K
A
 
K
D
 
P
-
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
M
Y
 
Y
S
 
S
F
 
L
S
 
S
S
 
E
I
 
V
Q
 
K
L
 
L
E
 
H
A
 
A
V
 
P
I
 
I
P
 
P
N
 
K
P
 
P
G
 
S
K
 
K
-
 
N
V
 
I
I
 
I
C
 
C
V
x
I
G
|
G
I
 
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
R
A
 
D
H
|
H
A
 
A
E
 
I
E
 
E
A
 
M
G
 
G
R
 
S
K
 
E
-
 
A
-
 
D
V
 
I
G
 
P
E
 
E
F
 
H
P
 
P
V
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
T
R
 
K
F
 
S
A
 
P
E
 
V
T
 
T
L
 
V
L
 
T
P
 
G
H
 
H
G
 
G
E
 
D
P
 
I
L
 
V
-
 
K
V
 
S
R
 
H
P
 
E
K
 
E
V
 
V
S
 
T
E
 
S
Q
 
Q
F
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
S
G
 
G
A
 
T
H
 
R
I
 
I
D
 
S
P
 
K
A
 
E
D
 
D
A
 
A
M
 
Y
D
 
D
H
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
C
 
I
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
I
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
F
 
K
H
 
R
T
 
H
H
 
K
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
F
M
 
I
G
 
G
K
|
K
T
 
S
F
 
L
R
 
D
K
 
T
T
 
T
G
 
C
A
 
P
L
 
M
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
L
I
 
V
P
 
H
A
 
K
S
 
S
E
 
S
I
 
I
S
 
Q
D
 
E
Y
 
P
R
 
E
T
 
R
L
 
L
V
 
K
V
 
V
R
 
E
G
 
T
I
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
A
S
 
S
E
 
D
L
 
M
A
 
I
F
 
F
D
 
S
I
 
I
P
 
P
H
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
E
Y
 
T
V
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
G
L
 
M
P
 
T
W
 
L
N
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
K
K
 
G
R
 
F
K
 
T
P
 
P
P
 
P
I
 
K
F
 
F
L
 
L
K
 
R
P
 
S
G
 
G
D
 
D
V
 
K
F
 
I
E
 
D
V
 
I
V
 
T
I
 
I
T
 
D
E
 
P
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
S
N
 
N
G
 
Q
V
 
I

6j5xB Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
31% identity, 100% coverage: 1:282/283 of query aligns to 1:279/280 of 6j5xB

query
sites
6j5xB
M
 
M
K
 
R
L
 
L
I
 
A
S
 
T
Y
 
I
R
 
R
K
 
T
E
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
T
H
 
I
F
 
A
G
 
A
V
 
R
V
 
V
S
 
E
G
 
S
D
 
E
G
 
N
V
 
T
V
 
A
E
 
T
L
 
T
T
 
I
R
 
E
R
 
G
F
 
F
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
P
 
G
D
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
Q
V
 
E
Q
 
S
E
 
N
A
 
W
R
 
R
K
 
E
I
 
L
V
 
A
E
 
E
T
 
N
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
D
 
E
-
 
A
Y
 
V
S
 
T
F
 
F
S
 
E
S
 
N
I
 
K
Q
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
V
P
 
P
N
 
A
P
 
P
G
 
K
K
 
K
V
 
I
I
 
V
C
 
C
V
|
V
G
|
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
N
H
|
H
A
 
I
E
 
K
E
 
E
A
 
M
G
 
G
R
 
R
K
 
D
V
 
L
G
 
P
E
 
D
F
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
L
F
|
F
Q
 
V
R
 
K
F
 
F
A
 
P
E
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
I
-
 
G
P
 
P
H
 
F
G
 
D
E
 
D
P
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
P
P
 
E
K
 
W
V
 
A
S
 
N
E
 
K
Q
 
A
F
 
L
D
 
D
F
 
W
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
R
G
 
A
A
 
R
H
 
R
I
 
V
D
 
K
P
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
A
D
 
E
H
 
Y
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
C
 
V
F
 
M
N
 
N
D
|
D
A
 
Y
S
 
T
V
 
T
R
 
R
D
 
D
W
 
F
Q
 
Q
F
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
A
H
 
K
T
 
T
H
 
P
Q
 
Q
Y
x
W
G
 
H
M
 
Q
G
 
G
K
|
K
T
 
S
F
 
L
R
 
E
K
 
K
T
 
S
G
 
A
A
 
G
L
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
M
I
 
T
-
 
T
P
 
P
A
 
D
S
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
F
-
 
G
-
 
G
E
 
E
I
 
L
S
 
A
D
 
T
Y
 
Y
R
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
V
Q
 
Q
E
 
S
G
 
T
S
 
P
L
 
T
S
 
N
E
 
D
L
 
L
A
 
V
F
 
F
D
 
S
I
 
P
P
 
E
H
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
E
Y
 
Y
V
 
I
S
 
T
K
 
H
A
 
I
L
 
Y
P
 
P
W
 
L
N
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
T
G
|
G
T
|
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
H
K
 
A
R
 
R
K
 
N
P
 
P
P
 
Q
I
 
R
F
 
Y
L
 
I
K
 
G
P
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
T
F
 
V
E
 
K
V
 
V
V
 
E
I
 
I
T
 
A
E
 
G
I
 
L
G
 
G
T
 
F
L
 
I
S
 
E
N
 
N
G
 
K
V
 
T
I
 
V
D
 
F
E
 
E

6j5xA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from corynebacterium glutamicum in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
31% identity, 100% coverage: 1:282/283 of query aligns to 1:279/280 of 6j5xA

query
sites
6j5xA
M
 
M
K
 
R
L
 
L
I
 
A
S
 
T
Y
 
I
R
 
R
K
 
T
E
 
N
G
 
G
R
 
T
A
 
T
H
 
I
F
 
A
G
 
A
V
 
R
V
 
V
S
 
E
G
 
S
D
 
E
G
 
N
V
 
T
V
 
A
E
 
T
L
 
T
T
 
I
R
 
E
R
 
G
F
 
F
A
 
A
Q
 
N
V
 
V
P
 
G
D
 
E
L
 
L
A
 
-
T
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
L
L
 
Q
V
 
E
Q
 
S
E
 
N
A
 
W
R
 
R
K
 
E
I
 
L
V
 
A
E
 
E
T
 
N
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
D
 
E
-
 
A
Y
 
V
S
 
T
F
 
F
S
 
E
S
 
N
I
 
K
Q
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
V
P
 
P
N
 
A
P
 
P
G
 
K
K
 
K
V
 
I
I
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
N
H
 
H
A
 
I
E
 
K
E
 
E
A
 
M
G
 
G
R
 
R
K
 
D
V
 
L
G
 
P
E
 
D
F
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
L
F
 
F
Q
 
V
R
 
K
F
 
F
A
 
P
E
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
I
-
 
G
P
 
P
H
 
F
G
 
D
E
 
D
P
 
V
L
 
V
V
 
V
R
 
P
P
 
E
K
 
W
V
 
A
S
 
N
E
 
K
Q
 
A
F
 
L
D
 
D
F
 
W
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
R
G
 
A
A
 
R
H
 
R
I
 
V
D
 
K
P
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
A
D
 
E
H
 
Y
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
C
 
V
F
 
M
N
 
N
D
|
D
A
 
Y
S
 
T
V
 
T
R
 
R
D
 
D
W
 
F
Q
 
Q
F
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
A
H
 
K
T
 
T
H
 
P
Q
 
Q
Y
 
W
G
 
H
M
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
S
F
 
L
R
 
E
K
 
K
T
 
S
G
 
A
A
 
G
L
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
M
I
 
T
-
 
T
P
 
P
A
 
D
S
 
S
-
 
F
-
 
E
-
 
F
-
 
G
-
 
G
E
 
E
I
 
L
S
 
A
D
 
T
Y
 
Y
R
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
I
 
-
L
 
L
N
 
E
G
 
G
E
 
E
Q
 
K
L
 
V
Q
 
Q
E
 
S
G
 
T
S
 
P
L
 
T
S
 
N
E
 
D
L
 
L
A
 
V
F
 
F
D
 
S
I
 
P
P
 
E
H
 
K
L
 
L
I
 
I
S
 
E
Y
 
Y
V
 
I
S
 
T
K
 
H
A
 
I
L
 
Y
P
 
P
W
 
L
N
 
D
P
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
H
K
 
A
R
 
R
K
 
N
P
 
P
P
 
Q
I
 
R
F
 
Y
L
 
I
K
 
G
P
 
D
G
 
G
D
 
E
V
 
T
F
 
V
E
 
K
V
 
V
V
 
E
I
 
I
T
 
A
E
 
G
I
 
L
G
 
G
T
 
F
L
 
I
S
 
E
N
 
N
G
 
K
V
 
T
I
 
V
D
 
F
E
 
E

6iymA Fumarylacetoacetate hydrolase (eafah) from psychrophilic exiguobacterium antarcticum (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:279/283 of query aligns to 2:274/277 of 6iymA

query
sites
6iymA
M
 
M
K
 
K
L
 
W
I
 
F
S
 
R
Y
 
F
R
 
E
K
 
Q
E
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
A
H
 
R
F
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
E
S
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
E
L
 
A
T
 
G
R
 
H
R
 
R
F
 
Y
A
 
D
Q
 
V
V
 
T
P
 
P
D
 
Q
L
 
V
A
 
Y
T
 
T
F
 
D
L
 
S
A
 
L
N
 
L
R
 
E
L
 
V
L
 
I
V
 
V
Q
 
R
E
 
G
A
 
F
R
 
E
K
 
M
I
 
D
V
 
V
E
 
D
T
 
L
A
 
D
Q
 
V
A
 
A
D
 
P
Y
 
R
S
 
L
F
 
T
S
 
D
S
 
H
I
 
V
Q
 
R
L
 
L
E
 
L
A
 
A
V
 
P
I
 
Y
P
 
L
N
 
P
P
 
P
G
 
R
K
 
N
V
 
V
I
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
 
H
A
 
I
E
 
K
E
 
E
A
 
M
G
 
D
R
 
T
K
 
A
-
 
G
V
 
A
G
 
G
E
 
K
F
 
F
P
 
-
V
 
V
I
 
L
F
 
F
Q
 
T
R
 
K
F
 
A
A
 
P
E
 
S
T
 
S
L
 
I
L
 
V
P
 
G
H
 
P
G
 
F
E
 
D
P
 
P
L
 
I
V
 
E
R
 
R
-
 
H
P
 
A
K
 
D
V
 
L
S
 
T
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
T
G
 
T
G
 
G
A
 
R
H
 
D
I
 
L
D
 
T
P
 
P
A
 
E
D
 
N
A
 
A
M
 
L
D
 
E
H
 
H
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
S
C
 
I
F
 
I
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
F
 
K
H
 
E
T
 
H
H
 
V
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
F
M
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
S
F
 
L
R
 
D
K
 
G
T
 
F
G
 
C
A
 
P
L
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
-
A
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
A
S
 
F
D
 
D
Y
 
P
R
 
A
T
 
D
L
 
V
V
 
L
V
 
V
R
 
E
G
 
T
I
 
R
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
T
S
 
K
E
 
L
L
 
M
A
 
L
F
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
V
H
 
T
L
 
I
I
 
L
S
 
T
Y
 
E
V
 
V
S
 
S
K
 
R
A
 
G
L
 
M
P
 
T
W
 
L
N
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
H
K
 
G
R
 
M
K
 
K
P
 
P
P
 
P
I
 
V
F
 
Y
L
 
L
K
 
Q
P
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
D
V
 
V
V
 
S
I
 
I
T
 
E
E
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
H
L
 
L
S
 
Q
N
 
N
G
 
Q
V
 
V

6v77B Crystal structure of a putative hpce protein from mycobacterium smegmatis
34% identity, 98% coverage: 1:277/283 of query aligns to 1:273/279 of 6v77B

query
sites
6v77B
M
 
M
K
 
R
L
 
L
I
 
I
S
 
N
Y
 
L
R
 
-
K
 
-
E
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
I
H
 
H
F
 
-
G
 
-
V
 
L
V
 
V
S
 
T
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
E
 
D
L
 
V
T
 
A
R
 
K
R
 
A
F
 
S
A
 
E
Q
 
Q
V
 
R
-
 
F
-
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
P
A
 
Q
T
 
D
F
 
L
L
 
Y
A
 
Q
N
 
H
R
 
W
L
 
D
L
 
A
V
 
F
Q
 
Q
E
 
E
A
 
W
R
 
A
K
 
R
I
 
T
V
 
A
E
 
A
T
 
L
A
 
P
Q
 
A
A
 
P
D
 
S
Y
 
A
S
 
R
F
 
V
S
 
G
S
 
T
I
 
I
Q
 
G
L
 
S
E
 
P
A
 
A
V
 
-
I
 
-
P
 
P
N
 
L
P
 
P
G
 
R
K
 
Q
V
 
V
I
 
F
C
 
A
V
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
D
A
 
D
H
 
H
A
 
A
E
 
T
E
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
L
K
 
S
V
 
K
G
 
P
E
 
E
F
 
H
P
 
P
V
 
V
I
 
I
F
 
F
Q
 
T
R
 
K
F
 
F
A
 
V
E
 
S
T
 
S
L
 
I
L
 
T
P
 
G
H
 
P
G
 
V
E
 
E
P
 
T
L
 
V
V
 
Q
R
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
G
S
 
S
E
 
-
Q
 
-
F
 
V
D
 
D
F
 
W
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
R
H
 
N
I
 
I
D
 
P
P
 
E
A
 
D
D
 
R
A
 
A
M
 
W
D
 
E
H
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
T
 
S
C
 
V
F
 
G
N
 
Q
D
|
D
A
 
L
S
 
S
V
 
E
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
F
 
L
H
 
A
-
 
G
-
 
P
T
 
A
H
 
P
Q
 
Q
Y
 
F
G
 
S
M
 
L
G
 
A
K
 
K
T
 
S
F
 
H
R
 
A
K
 
G
T
 
F
G
 
S
A
 
P
L
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
E
I
 
L
I
 
V
P
 
T
A
 
V
S
 
D
E
 
E
I
 
L
S
 
P
D
 
D
Y
 
P
R
 
D
T
 
D
L
 
L
V
 
E
V
 
L
R
 
G
G
 
A
I
 
E
L
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
L
 
V
Q
 
Q
E
 
H
G
 
S
S
 
R
L
 
T
S
 
S
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
F
 
F
D
 
P
I
 
V
P
 
S
H
 
N
L
 
L
I
 
I
S
 
A
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
K
 
D
A
 
T
L
 
V
P
 
E
W
 
L
N
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
S
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
M
K
 
G
R
 
R
K
 
N
P
 
P
P
 
K
I
 
R
F
 
F
L
 
L
K
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
E
F
 
L
E
 
R
V
 
T
V
 
Y
I
 
I
T
 
T
E
 
G
I
 
V
G
 
G
T
 
E
L
 
F
S
 
T
N
 
Q

8gstC Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Pyruvate bound-form) (see paper)
37% identity, 71% coverage: 74:274/283 of query aligns to 71:273/290 of 8gstC

query
sites
8gstC
G
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
V
C
 
A
V
x
I
G
|
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
E
A
 
D
H
|
H
A
 
A
E
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
N
R
 
L
K
 
P
V
 
I
G
 
P
E
 
T
F
 
E
P
 
P
V
 
M
I
 
M
F
 
F
Q
 
M
R
 
K
F
 
A
A
 
L
E
 
S
T
 
S
L
 
L
L
 
N
P
 
G
H
 
P
G
 
N
E
 
D
P
 
E
L
 
V
V
 
V
R
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
N
S
 
S
E
 
T
Q
 
H
F
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
G
 
T
G
 
C
A
 
R
H
 
F
I
 
V
D
 
S
P
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
D
 
S
H
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
C
 
L
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
V
 
E
R
 
R
-
 
F
D
 
N
W
 
Q
Q
 
K
F
 
Q
H
 
R
T
 
G
H
 
T
Q
 
Q
Y
 
W
G
 
S
M
 
K
G
 
G
K
|
K
T
 
G
F
 
H
R
 
D
K
 
T
T
 
F
G
 
C
A
 
P
L
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
L
I
 
V
P
 
T
A
 
P
S
 
D
E
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
Y
 
P
R
 
Q
T
 
D
L
 
L
V
 
D
V
 
V
R
 
H
G
 
L
I
 
D
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
L
 
M
Q
 
Q
E
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
T
S
 
K
E
 
T
L
 
M
A
 
I
F
 
F
D
 
N
I
 
V
P
 
A
H
 
Q
L
 
L
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
K
 
E
A
 
Y
L
 
I
P
 
T
W
 
L
N
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
M
A
 
I
T
 
T
G
|
G
T
 
T
P
 
P
S
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
E
K
 
G
R
 
K
K
 
K
P
 
P
-
 
Q
P
 
A
I
 
I
F
 
Y
L
 
L
K
 
K
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
M
E
 
E
V
 
L
V
 
G
I
 
I
T
 
E
E
 
K
I
 
L
G
 
G
T
 
T

8gsrA Crystal structure of l-2,4-diketo-3-deoxyrhamnonate hydrolase from sphingomonas sp. (Apo-form) (see paper)
37% identity, 71% coverage: 74:274/283 of query aligns to 71:273/290 of 8gsrA

query
sites
8gsrA
G
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
V
C
 
A
V
 
I
G
 
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
E
A
 
D
H
 
H
A
 
A
E
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
N
R
 
L
K
 
P
V
 
I
G
 
P
E
 
T
F
 
E
P
 
P
V
 
M
I
 
M
F
 
F
Q
 
M
R
 
K
F
 
A
A
 
L
E
 
S
T
 
S
L
 
L
L
 
N
P
 
G
H
 
P
G
 
N
E
 
D
P
 
E
L
 
V
V
 
V
R
 
L
P
 
P
K
 
K
V
 
N
S
 
S
E
 
T
Q
 
H
F
 
G
D
 
D
F
 
W
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
E
G
 
T
G
 
C
A
 
R
H
 
F
I
 
V
D
 
S
P
 
E
A
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
L
D
 
S
H
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
V
C
 
L
F
 
V
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
V
 
E
R
 
R
-
 
F
D
 
N
W
 
Q
Q
 
K
F
 
Q
H
 
R
T
 
G
H
 
T
Q
 
Q
Y
 
W
G
 
S
M
 
K
G
 
G
K
 
K
T
 
G
F
 
H
R
 
D
K
 
T
T
 
F
G
 
C
A
 
P
L
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
L
I
 
V
P
 
T
A
 
P
S
 
D
E
 
E
I
 
V
S
 
G
D
 
D
Y
 
P
R
 
Q
T
 
D
L
 
L
V
 
D
V
 
V
R
 
H
G
 
L
I
 
D
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
L
 
M
Q
 
Q
E
 
T
G
 
G
S
 
N
L
 
T
S
 
K
E
 
T
L
 
M
A
 
I
F
 
F
D
 
N
I
 
V
P
 
A
H
 
Q
L
 
L
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
K
 
E
A
 
Y
L
 
I
P
 
T
W
 
L
N
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
M
A
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
P
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
E
K
 
G
R
 
K
K
 
K
P
 
P
-
 
Q
P
 
A
I
 
I
F
 
Y
L
 
L
K
 
K
P
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
M
E
 
E
V
 
L
V
 
G
I
 
I
T
 
E
E
 
K
I
 
L
G
 
G
T
 
T

3r6oA Crystal structure of a probable 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1, 7- dioateisomerase from mycobacterium abscessus (see paper)
34% identity, 78% coverage: 61:282/283 of query aligns to 50:263/265 of 3r6oA

query
sites
3r6oA
F
 
L
S
 
D
S
 
S
I
 
V
Q
 
A
L
 
L
E
 
G
A
 
A
V
 
P
I
 
I
P
 
P
N
 
E
P
 
P
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
I
 
I
C
 
A
V
 
L
G
 
G
I
 
F
N
 
N
Y
 
Y
V
 
P
A
 
T
H
 
H
A
 
D
E
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
P
 
P
V
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
M
R
 
K
F
 
S
A
 
P
E
 
T
T
 
S
L
 
I
L
 
S
P
 
G
H
 
P
G
 
R
E
 
D
P
 
A
L
 
V
V
 
I
R
 
A
P
 
P
K
 
R
V
 
T
S
 
S
E
 
H
Q
 
A
F
 
L
D
 
D
F
 
Y
E
|
E
A
 
I
E
|
E
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
P
G
 
G
A
 
Y
H
 
R
I
 
I
D
 
E
P
 
R
A
 
S
D
 
Q
A
 
A
M
 
I
D
 
K
H
 
H
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
M
C
 
L
F
 
A
N
 
N
D
|
D
A
 
I
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
-
 
V
-
 
A
W
 
L
Q
 
P
F
 
F
H
 
G
T
 
Q
H
 
A
Q
 
Q
Y
 
V
G
 
V
M
 
R
G
 
G
K
 
K
T
 
G
F
 
Y
R
 
P
K
 
T
T
 
F
G
 
C
A
 
P
L
 
T
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
L
I
 
F
P
 
T
A
 
T
S
 
G
E
 
S
I
 
D
S
 
T
D
 
T
Y
 
F
R
 
E
T
 
T
L
 
F
V
 
D
V
 
F
R
 
E
G
 
L
I
 
R
L
 
I
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
T
S
 
V
E
 
D
L
 
M
A
 
T
F
 
L
D
 
G
I
 
F
P
 
A
H
 
E
L
 
V
I
 
V
S
 
E
Y
 
T
V
 
V
S
 
S
K
 
A
A
 
T
L
 
I
P
 
A
W
 
L
N
 
R
P
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
G
G
 
G
I
 
C
G
 
G
F
 
F
K
 
Q
R
 
F
K
 
D
P
 
P
P
 
P
I
 
R
F
 
Y
L
 
L
K
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
I
E
 
E
V
 
A
V
 
H
I
 
S
T
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
G
T
 
K
L
 
M
S
 
R
N
 
L
G
 
P
V
 
V
I
 
H
D
 
D
E
 
E

1gttA Crystal structure of hpce (see paper)
38% identity, 64% coverage: 69:250/283 of query aligns to 217:392/421 of 1gttA

query
sites
1gttA
V
 
T
I
 
L
P
 
P
N
 
H
P
 
P
-
 
H
G
 
G
K
 
T
V
 
L
I
 
F
C
 
A
V
 
L
G
 
G
I
 
L
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
 
H
A
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
P
 
P
V
 
L
I
 
V
F
 
F
Q
 
L
R
 
K
F
 
A
A
 
P
E
 
N
T
 
T
L
 
L
L
 
T
P
 
G
H
 
D
G
 
N
E
 
Q
P
 
T
L
 
S
V
 
V
R
 
R
P
 
P
K
 
N
V
 
N
S
 
I
E
 
E
Q
 
Y
F
 
M
D
 
H
F
 
Y
E
|
E
A
 
A
E
|
E
L
 
L
A
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
Q
G
 
A
A
 
R
H
 
N
I
 
V
D
 
S
P
 
E
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
C
 
V
F
 
C
N
 
N
D
|
D
A
 
Y
S
 
A
V
 
I
R
 
R
D
 
D
W
 
Y
Q
 
L
F
 
E
H
 
N
T
 
Y
H
 
Y
Q
 
R
Y
 
P
G
 
N
M
 
L
G
 
R
K
 
V
T
 
K
F
 
S
R
 
R
K
 
D
T
 
-
G
 
-
A
 
G
L
 
L
G
 
T
P
 
P
W
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
T
I
 
I
I
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
E
E
 
A
I
 
I
S
 
P
D
 
D
Y
 
P
R
 
H
T
 
N
L
 
L
V
 
T
V
 
L
R
 
R
G
 
T
I
 
F
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
S
 
T
L
 
T
S
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
I
F
 
F
D
 
S
I
 
V
P
 
P
H
 
F
L
 
L
I
 
I
S
 
A
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
F
L
 
M
P
 
T
W
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
M
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
 
L
G
 
S

6sbiA X-ray structure of murine fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate (see paper)
37% identity, 62% coverage: 76:250/283 of query aligns to 14:191/216 of 6sbiA

query
sites
6sbiA
V
 
I
I
 
V
C
 
C
V
 
V
G
|
G
I
x
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
|
H
A
 
V
E
 
K
E
 
E
A
 
M
G
 
R
R
 
S
K
 
T
V
 
V
G
 
L
E
 
S
F
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
L
F
 
F
Q
 
L
R
 
K
F
 
P
A
x
S
E
 
T
T
 
A
L
 
Y
L
 
A
P
 
P
H
 
E
G
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
V
V
 
L
R
 
M
P
 
P
K
 
A
V
 
Y
S
 
C
E
 
R
Q
 
N
F
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
A
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
L
I
 
L
G
 
G
K
 
K
G
 
R
G
 
G
A
 
E
H
 
A
I
 
I
D
 
P
P
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
C
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
V
Q
 
Q
F
 
E
H
 
E
T
 
C
H
 
K
Q
 
K
Y
 
K
G
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
W
-
 
T
M
 
L
G
 
A
K
|
K
T
 
S
F
 
F
R
 
T
K
 
S
T
 
S
G
 
C
A
 
P
L
 
V
G
 
S
P
 
A
W
 
F
I
 
-
I
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
E
E
 
K
I
 
I
S
 
P
D
 
D
Y
 
P
R
 
H
T
 
A
L
 
L
V
 
R
V
 
L
R
 
W
G
 
L
I
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
K
L
 
T
S
 
S
E
 
S
L
 
M
A
 
I
F
 
F
D
 
S
I
 
I
P
 
P
H
 
Y
L
 
I
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
I
L
 
I
P
x
T
W
 
L
N
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
x
V
G
 
G

Q6P587 Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial; Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 1; FAH domain-containing protein 1; Oxaloacetate decarboxylase; OAA decarboxylase; YisK-like protein; EC 3.7.1.5; EC 4.1.1.112 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
38% identity, 62% coverage: 76:250/283 of query aligns to 17:194/221 of Q6P587

query
sites
Q6P587
V
 
I
I
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
|
H
A
 
V
E
 
R
E
|
E
A
 
M
G
 
R
R
 
S
K
 
A
V
 
V
G
 
L
E
 
S
F
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
L
F
 
F
Q
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
S
E
 
T
T
 
A
L
 
Y
L
 
A
P
 
P
H
 
E
G
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
L
R
 
M
P
 
P
K
 
A
V
 
Y
S
 
T
E
 
R
Q
 
N
F
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
A
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
K
G
 
R
G
 
C
A
 
R
H
 
A
I
 
V
D
 
P
P
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
C
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
T
V
 
A
R
|
R
D
 
D
W
 
V
Q
 
Q
F
 
D
H
 
E
T
 
C
H
 
K
Q
 
K
Y
 
K
G
 
G
M
 
L
G
 
P
K
 
W
T
 
T
F
 
L
R
 
A
K
 
K
T
 
S
-
 
F
G
 
T
A
 
A
L
 
S
G
 
C
P
 
P
-
 
V
-
 
S
W
 
A
I
 
F
I
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
E
E
 
K
I
 
I
S
 
P
D
 
D
Y
 
P
R
 
H
T
 
K
L
 
L
V
 
K
V
 
L
R
 
W
G
 
L
I
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
E
L
 
T
S
 
S
E
 
S
L
 
M
A
 
I
F
 
F
D
 
S
I
 
I
P
 
P
H
 
Y
L
 
I
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
I
L
 
I
P
 
T
W
 
L
N
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
 
V
G
 
G

6fogA X-ray structure of homo sapiens fumarylacetoacetate hydrolase domain containing protein 1 (fahd1) in complex with inhibitor oxalate at 1.94a resolution. (see paper)
38% identity, 62% coverage: 76:250/283 of query aligns to 15:192/218 of 6fogA

query
sites
6fogA
V
 
I
I
 
V
C
 
C
V
 
V
G
|
G
I
 
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
 
H
A
 
V
E
 
R
E
 
E
A
 
M
G
 
R
R
 
S
K
 
A
V
 
V
G
 
L
E
 
S
F
 
E
P
 
P
V
 
V
I
 
L
F
 
F
Q
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
S
E
 
T
T
 
A
L
 
Y
L
 
A
P
 
P
H
 
E
G
 
G
E
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
L
R
 
M
P
 
P
K
 
A
V
 
Y
S
 
T
E
 
R
Q
 
N
F
 
L
D
 
H
F
 
H
E
|
E
A
 
L
E
|
E
L
 
L
A
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
M
G
 
G
K
 
K
G
 
R
G
 
C
A
 
R
H
 
A
I
 
V
D
 
P
P
 
E
A
 
A
D
 
A
A
 
A
M
 
M
D
 
D
H
 
Y
V
 
V
A
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
C
 
L
F
 
C
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
V
Q
 
Q
F
 
D
H
 
E
T
 
C
H
 
K
Q
 
K
Y
 
K
G
 
G
M
 
L
G
 
P
K
 
W
T
 
T
F
 
L
R
 
A
K
 
K
T
 
S
-
 
F
G
 
T
A
 
A
L
 
S
G
 
C
P
 
P
-
 
V
-
 
S
W
 
A
I
 
F
I
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
E
E
 
K
I
 
I
S
 
P
D
 
D
Y
 
P
R
 
H
T
 
K
L
 
L
V
 
K
V
 
L
R
 
W
G
 
L
I
 
K
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
E
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
S
 
E
L
 
T
S
 
S
E
 
S
L
 
M
A
 
I
F
 
F
D
 
S
I
 
I
P
 
P
H
 
Y
L
 
I
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
K
 
K
A
 
I
L
 
I
P
 
T
W
 
L
N
 
E
P
 
E
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
K
G
 
G
I
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6jvwB Crystal structure of maleylpyruvate hydrolase from sphingobium sp. Syk-6 in complex with manganese (ii) ion and pyruvate (see paper)
30% identity, 95% coverage: 13:280/283 of query aligns to 10:261/264 of 6jvwB

query
sites
6jvwB
H
 
R
F
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
V
S
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
V
 
I
V
 
A
E
 
D
L
 
I
T
 
T
R
 
A
R
 
L
F
 
T
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
P
A
 
A
Q
 
Q
V
 
W
P
 
P
D
 
D
L
 
M
A
 
N
T
 
M
F
 
I
L
 
R
A
 
L
N
 
I
R
 
R
L
 
D
L
 
F
V
 
-
Q
 
E
E
 
G
A
 
L
R
 
R
K
 
G
I
 
A
V
 
I
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Q
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
L
A
 
A
D
 
R
Y
 
I
S
 
P
F
 
L
S
 
A
S
 
Q
I
 
V
Q
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
T
V
 
P
I
 
V
P
 
P
N
 
W
P
 
P
G
 
N
K
 
K
V
 
I
I
 
I
C
 
A
V
 
Y
G
 
P
I
x
V
N
 
N
Y
 
Y
V
 
H
A
 
A
H
 
H
A
 
G
E
 
N
E
 
Q
A
 
G
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
P
 
-
V
 
-
I
 
F
F
|
F
Q
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
G
E
 
S
T
 
A
L
 
L
L
 
S
P
 
G
H
 
P
G
 
T
E
 
D
P
 
P
L
 
V
V
 
V
R
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
V
-
 
P
S
 
G
E
 
R
Q
 
E
F
 
V
D
 
H
F
 
H
E
|
E
A
 
S
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
T
G
 
C
A
 
R
H
 
S
I
 
V
D
 
A
P
 
R
A
 
E
D
 
D
A
 
W
M
 
K
D
 
D
H
 
V
V
 
V
A
 
F
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
C
 
C
F
 
L
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
V
V
 
V
R
 
R
D
 
-
W
 
-
Q
 
-
F
 
-
H
 
-
T
 
-
H
 
-
Q
 
-
Y
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
G
K
 
R
T
 
V
F
 
F
R
 
R
K
|
K
T
 
A
-
 
Y
-
 
D
-
 
T
-
 
F
G
 
C
A
 
P
L
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
I
I
 
T
P
 
T
A
 
A
S
 
D
E
 
A
I
 
V
S
 
N
D
 
D
Y
 
P
R
 
A
T
 
T
L
 
L
V
 
D
V
 
M
R
 
K
G
 
L
I
 
W
L
 
V
N
 
N
G
 
D
E
 
D
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
K
G
 
A
S
 
N
L
 
T
S
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
V
F
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
H
 
G
L
 
M
I
 
I
S
 
A
Y
 
T
V
 
A
S
 
S
K
 
A
A
 
V
L
 
M
P
 
T
W
 
L
N
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
-
K
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
P
 
P
I
 
V
F
 
V
L
 
-
K
 
-
P
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
R
F
 
I
E
 
R
V
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
D
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
T
 
E
L
 
M
S
 
A
N
 
V
G
 
D
V
 
V
I
 
V

3qdfA Crystal structure of 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase from mycobacterium marinum (see paper)
33% identity, 73% coverage: 75:280/283 of query aligns to 63:248/252 of 3qdfA

query
sites
3qdfA
K
 
K
V
 
V
I
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
K
N
 
N
Y
 
Y
V
 
T
A
 
P
H
 
A
A
 
D
E
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
P
 
P
V
 
V
I
 
I
F
 
F
Q
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
N
E
 
T
T
 
A
L
 
I
L
 
V
P
 
G
H
 
P
G
 
N
E
 
V
P
 
P
L
 
I
V
 
R
R
 
L
P
 
P
K
 
A
V
 
N
S
 
A
E
 
S
Q
 
P
F
 
V
D
 
H
F
 
F
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
G
 
P
G
 
C
A
 
K
H
 
D
I
 
V
D
 
S
P
 
A
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
M
 
V
D
 
D
H
 
N
V
 
I
A
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
C
 
I
F
 
G
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
Q
Q
 
Q
F
 
K
H
 
S
T
 
D
H
 
G
Q
 
Q
Y
 
W
G
 
T
M
 
R
G
 
A
K
 
K
T
 
G
F
 
H
R
 
D
K
 
T
T
 
F
G
 
C
A
 
P
L
 
V
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
I
I
 
V
P
 
T
A
 
D
S
 
V
E
 
D
I
 
P
S
 
A
D
 
D
Y
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
L
V
x
E
V
 
L
R
 
R
G
 
T
I
 
E
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
A
Q
 
V
L
 
K
Q
 
Q
E
x
H
G
 
A
S
 
R
L
 
T
S
 
S
E
 
L
L
 
M
A
 
I
F
 
H
D
 
D
I
 
V
P
 
G
H
 
A
L
 
I
I
 
V
S
 
E
Y
 
W
V
 
I
S
 
S
K
 
A
A
 
V
L
 
M
P
 
T
W
 
L
N
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
I
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
-
K
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
P
 
P
I
 
I
F
 
-
L
 
-
K
 
E
P
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
T
F
 
V
E
 
S
V
 
I
V
 
T
I
 
I
T
 
E
E
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L
S
 
T
N
 
N
G
 
P
V
 
V
I
 
V

4dbhA Crystal structure of cg1458 with inhibitor (see paper)
33% identity, 74% coverage: 73:281/283 of query aligns to 61:268/269 of 4dbhA

query
sites
4dbhA
P
 
P
G
 
S
K
 
K
V
 
V
I
 
V
C
 
A
V
 
I
G
|
G
I
x
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
D
H
|
H
A
 
V
E
 
A
E
 
E
A
 
V
G
 
F
R
 
K
K
 
K
V
 
S
G
 
A
E
 
E
F
 
S
-
 
L
-
 
P
P
 
P
V
 
T
I
 
L
F
|
F
Q
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
P
E
 
T
T
 
A
L
 
V
L
 
T
P
 
G
H
 
P
G
 
E
E
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
R
R
 
I
P
 
P
K
 
S
V
 
F
S
 
A
E
 
T
Q
 
K
F
 
V
D
 
E
F
 
F
E
|
E
A
 
G
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
P
G
 
C
A
 
K
H
 
N
I
 
V
D
 
K
P
 
A
A
 
D
D
 
D
A
 
W
M
 
K
D
 
S
H
 
V
V
 
V
A
 
L
G
 
G
Y
 
F
T
 
T
C
 
I
F
 
I
N
 
N
D
|
D
A
 
V
S
 
S
V
 
S
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
F
 
F
H
 
A
T
 
D
H
 
G
Q
 
Q
Y
 
W
G
 
A
M
 
R
G
 
A
K
|
K
T
 
G
F
 
I
R
 
D
K
 
T
T
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
W
I
 
I
I
 
E
P
 
T
A
 
D
S
 
I
E
 
N
I
 
S
S
 
I
D
 
D
Y
 
L
R
 
D
T
 
N
L
 
L
V
 
P
V
 
I
R
 
K
G
 
A
I
 
R
L
 
L
-
 
T
-
 
H
N
 
D
G
 
G
E
 
E
-
 
T
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
K
E
 
Q
G
 
D
S
 
S
L
 
N
S
 
S
-
 
N
E
 
Q
L
 
M
A
 
I
F
 
M
D
 
K
I
 
M
P
 
G
H
 
E
L
 
I
I
 
I
S
 
E
Y
 
F
V
 
I
S
 
T
K
 
A
A
 
S
L
 
M
P
 
T
W
 
L
N
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
T
x
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
E
F
 
-
K
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
P
 
-
I
 
-
F
 
A
L
 
M
K
 
V
P
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
Y
F
 
I
E
 
E
V
 
I
V
 
E
I
 
I
T
 
P
E
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
K
L
 
L
S
 
G
N
 
N
G
 
P
V
 
V
I
 
V
D
 
D

6j5yA Crystal structure of fumarylpyruvate hydrolase from pseudomonas aeruginosa in complex with mn2+ and pyruvate (see paper)
34% identity, 62% coverage: 75:250/283 of query aligns to 25:208/233 of 6j5yA

query
sites
6j5yA
K
 
R
V
 
V
I
 
Y
C
 
C
V
 
V
G
|
G
I
x
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
H
|
H
A
 
A
E
 
R
E
 
E
A
 
M
G
 
G
-
 
F
R
 
D
K
 
P
V
 
E
G
 
R
E
 
E
F
 
P
P
 
P
V
 
F
I
 
F
F
|
F
Q
 
C
R
 
K
F
 
P
A
 
A
E
 
D
T
 
A
L
 
V
L
 
V
P
 
P
H
 
V
G
 
A
E
 
A
-
 
G
-
 
S
-
 
T
-
 
L
P
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
Y
P
 
P
K
 
S
V
 
Q
S
 
T
E
 
G
Q
 
N
F
 
Y
D
 
H
F
 
Y
E
|
E
A
 
I
E
|
E
L
 
L
A
 
V
V
 
A
V
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
A
 
C
H
 
D
I
 
I
D
 
P
P
 
L
A
 
E
D
 
Q
A
 
A
M
 
E
D
 
E
H
 
H
V
 
V
A
 
W
G
 
G
Y
 
Y
T
 
A
C
 
V
F
 
G
N
 
L
D
|
D
A
 
M
S
 
T
V
 
R
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
Q
F
 
M
H
 
R
T
 
M
H
 
R
Q
 
E
Y
 
M
G
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
W
-
 
E
M
 
I
G
 
G
K
|
K
T
 
A
F
 
F
R
 
D
K
 
R
T
 
S
G
 
A
A
 
P
L
 
I
G
 
G
P
 
P
W
 
-
I
 
L
I
 
Y
P
 
P
A
 
A
S
 
S
E
 
Q
I
 
V
S
 
G
D
 
H
Y
 
P
R
 
R
T
 
H
L
 
A
V
 
A
V
 
I
R
 
S
G
 
L
I
 
Q
L
 
V
N
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
D
L
 
R
Q
 
Q
E
 
R
G
 
S
S
 
D
L
 
I
S
 
D
E
 
Q
L
 
L
A
 
I
F
 
W
D
 
S
I
 
V
P
 
A
H
 
E
L
 
T
I
 
V
S
 
S
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
K
 
R
A
 
F
L
 
F
P
 
E
W
 
L
N
 
R
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
L
L
 
V
A
 
F
T
 
T
G
 
G
T
|
T
P
 
P
S
 
E
G
 
G
I
 
V
G
 
G

3v77A Crystal structure of a putative fumarylacetoacetate isomerase/hydrolase from oleispira antarctica (see paper)
30% identity, 63% coverage: 74:250/283 of query aligns to 16:197/224 of 3v77A

query
sites
3v77A
G
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
V
C
 
C
V
 
V
G
 
G
I
 
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
A
E
 
K
E
 
E
A
 
L
G
 
N
R
 
N
K
 
P
V
 
I
G
 
P
E
 
S
F
 
S
P
 
P
V
 
I
I
 
L
F
 
F
Q
 
I
R
 
K
F
 
P
A
 
A
E
 
S
T
 
S
L
 
A
L
 
V
P
 
P
H
 
F
G
 
G
E
 
P
P
 
V
L
 
F
V
 
S
R
 
I
P
 
P
K
 
K
V
 
D
S
 
Q
E
 
G
Q
 
S
F
 
V
D
 
H
F
 
H
E
 
E
A
 
L
E
|
E
L
 
I
A
 
A
V
 
I
V
 
L
I
 
I
G
 
G
K
 
K
G
 
A
G
 
L
A
 
S
H
 
R
I
 
A
D
 
S
P
 
T
A
 
E
D
 
Q
A
 
V
M
 
A
D
 
E
H
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Y
 
I
T
 
G
C
 
L
F
 
G
N
 
L
D
|
D
A
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
R
D
 
D
W
 
V
Q
 
Q
F
 
D
H
 
Q
T
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
G
H
 
H
Q
 
P
Y
 
W
G
 
E
M
 
R
G
 
A
K
 
K
T
 
S
F
 
F
R
 
D
K
 
G
T
 
A
G
 
C
A
 
P
L
 
L
G
 
T
P
 
E
W
 
F
I
 
V
-
 
A
I
 
V
P
 
N
A
 
L
S
 
A
E
 
S
I
 
E
S
 
D
D
 
E
Y
 
W
R
 
Q
T
 
A
L
 
I
V
 
G
V
 
L
R
 
T
G
 
L
I
 
E
L
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
Q
Q
 
F
L
 
Q
Q
 
Q
E
 
Q
G
 
G
S
 
S
L
 
S
S
 
A
E
 
E
L
 
M
A
 
L
F
 
F
D
 
P
I
 
I
P
 
L
H
 
P
L
 
L
I
 
I
S
 
A
Y
x
H
V
 
M
S
 
S
K
 
E
A
x
H
L
 
F
P
 
S
W
 
L
N
 
Q
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
V
L
 
I
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G

1nkqA Crystal structure of yeast ynq8, a fumarylacetoacetate hydrolase family protein
24% identity, 67% coverage: 75:263/283 of query aligns to 10:216/247 of 1nkqA

query
sites
1nkqA
K
 
K
V
 
I
I
 
I
C
 
C
V
 
I
G
 
G
I
 
R
N
 
N
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
I
E
 
K
E
 
E
A
 
L
G
 
N
R
 
N
K
 
Q
V
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
P
 
P
V
 
F
I
 
F
F
 
F
Q
 
L
R
 
K
F
 
P
A
 
T
E
 
S
T
 
S
L
 
I
L
 
V
P
 
-
H
 
-
G
 
-
E
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
S
R
 
S
P
 
S
K
 
P
V
 
A
S
 
N
E
 
S
Q
 
T
F
 
F
D
 
N
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
T
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
I
-
 
F
-
 
I
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
H
F
 
H
E
|
E
A
 
I
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
L
V
 
I
I
 
V
G
 
S
K
 
K
G
 
H
G
 
L
A
 
S
H
 
N
I
 
V
-
 
T
-
 
K
-
 
M
D
 
K
P
 
P
A
 
E
D
 
E
A
 
V
M
 
Y
D
 
D
H
 
S
V
 
I
A
 
S
G
 
G
Y
 
V
T
 
A
C
 
L
F
 
A
N
 
L
D
|
D
A
 
L
S
 
T
V
 
A
R
 
R
D
 
N
W
 
V
Q
 
Q
F
 
D
H
 
E
T
 
A
H
 
K
Q
 
K
Y
 
K
G
 
G
M
 
L
G
 
P
K
 
W
T
 
T
F
 
I
R
 
S
K
 
K
-
 
G
-
 
F
-
 
D
T
 
T
G
 
F
A
 
M
L
 
P
G
 
I
P
 
S
W
 
A
I
 
I
I
 
V
P
 
S
A
 
R
S
 
E
E
 
K
I
 
F
S
 
S
D
 
S
Y
 
Y
R
 
K
T
 
S
L
 
N
V
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
R
V
 
V
R
 
K
G
 
C
I
 
S
L
 
V
N
 
N
G
 
G
E
 
Q
Q
 
L
L
 
R
Q
 
Q
E
 
D
G
 
G
S
 
G
L
 
T
S
 
N
E
 
L
L
 
M
A
 
L
F
 
H
D
 
P
I
 
L
P
 
H
H
 
K
L
 
I
I
 
L
S
 
Q
Y
 
H
V
 
I
S
 
S
K
 
T
A
 
M
L
 
I
P
 
S
W
 
L
N
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
L
 
I
A
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
P
S
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
G
F
 
-
K
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
P
 
-
I
 
-
F
 
E
L
 
L
K
 
K
P
 
P
G
 
G
D
 
D

3bqbX Hexagonal kristal form of 2-keto-3-deoxyarabinonate dehydratase (see paper)
29% identity, 63% coverage: 99:275/283 of query aligns to 115:282/291 of 3bqbX

query
sites
3bqbX
V
 
I
I
 
F
F
 
F
Q
 
K
R
 
A
F
 
T
A
 
P
E
 
N
T
 
R
L
 
C
L
 
V
P
 
G
H
 
H
G
 
G
E
 
E
P
 
A
L
 
I
V
 
A
R
 
V
P
 
R
K
 
S
V
 
D
S
 
S
E
 
E
Q
 
W
F
 
T
D
 
L
F
 
P
E
 
E
A
 
P
E
|
E
L
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
D
K
 
S
G
 
N
G
 
G
A
 
-
H
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
M
 
-
D
 
-
H
 
K
V
 
I
A
 
L
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
C
 
I
F
 
M
N
 
D
D
|
D
A
 
V
S
 
S
V
 
A
R
 
R
D
 
D
W
 
L
Q
 
E
F
 
A
H
 
E
T
 
N
H
 
P
Q
 
L
Y
 
Y
-
 
L
G
 
P
M
 
Q
G
 
S
K
 
K
T
 
I
F
 
Y
R
 
A
K
 
G
T
 
C
G
 
C
A
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
P
W
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
T
A
 
S
S
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
K
D
 
N
Y
 
P
R
 
Y
T
 
S
L
 
L
-
 
D
-
 
I
V
 
T
V
 
L
R
 
K
G
 
I
I
 
V
L
 
R
N
 
E
G
 
G
E
 
R
Q
 
V
L
 
F
Q
 
F
E
 
E
G
 
G
S
 
S
L
 
V
-
 
N
-
 
T
S
 
N
E
 
K
L
 
M
A
 
R
F
 
R
D
 
K
I
 
I
P
 
E
H
 
E
L
 
Q
I
 
I
S
 
Q
Y
 
Y
V
 
L
S
 
I
K
 
R
A
 
D
L
 
N
P
 
P
W
 
I
N
 
P
P
 
D
G
 
G
D
 
T
I
 
I
L
 
L
A
 
T
T
 
T
G
 
G
T
 
T
P
 
A
S
 
I
G
 
V
I
 
P
G
 
G
F
 
R
K
 
D
R
 
K
K
 
G
P
 
-
P
 
-
I
 
-
F
 
-
L
 
L
K
 
K
P
 
D
G
 
E
D
 
D
V
 
I
F
 
V
E
 
E
V
 
I
V
 
T
I
 
I
T
 
S
E
 
N
I
 
I
G
 
G
T
 
T
L
 
L

Query Sequence

>AO356_29975 FitnessBrowser__pseudo5_N2C3_1:AO356_29975
MKLISYRKEGRAHFGVVSGDGVVELTRRFAQVPDLATFLANRLLVQEARKIVETAQADYS
FSSIQLEAVIPNPGKVICVGINYVAHAEEAGRKVGEFPVIFQRFAETLLPHGEPLVRPKV
SEQFDFEAELAVVIGKGGAHIDPADAMDHVAGYTCFNDASVRDWQFHTHQYGMGKTFRKT
GALGPWIIPASEISDYRTLVVRGILNGEQLQEGSLSELAFDIPHLISYVSKALPWNPGDI
LATGTPSGIGFKRKPPIFLKPGDVFEVVITEIGTLSNGVIDEA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory