SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS00395 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS00395 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

O33341 Putative glutamine amidotransferase Rv2859c; EC 2.4.2.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
35% identity, 93% coverage: 9:229/237 of query aligns to 65:299/308 of O33341

query
sites
O33341
R
 
R
P
 
P
L
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
Y
V
 
L
H
 
E
G
 
Q
S
 
V
R
 
R
I
 
T
A
 
G
W
 
V
W
 
W
-
 
D
-
 
I
-
 
P
A
 
A
N
 
G
R
 
Y
L
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
Y
-
 
F
-
 
E
A
 
G
L
 
I
R
 
T
R
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
G
R
 
V
A
 
A
V
 
V
R
 
L
I
 
L
T
 
P
A
 
P
R
 
Q
D
 
P
P
 
V
F
 
D
P
 
P
-
 
E
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
C
-
 
V
I
 
L
E
 
D
R
 
S
L
 
L
D
 
H
G
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
Y
D
 
D
I
 
L
D
 
D
A
 
P
A
 
A
L
 
A
Y
 
Y
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
A
 
P
L
 
H
P
 
P
K
 
A
M
 
T
-
 
D
R
 
H
I
 
P
D
 
R
P
 
P
E
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
A
L
 
W
E
 
E
L
 
F
C
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
R
G
 
G
A
 
A
A
 
L
A
 
Q
R
 
R
R
 
G
L
 
M
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
 
C
R
 
R
G
 
G
S
 
T
Q
 
Q
M
 
V
I
 
L
N
 
N
V
 
V
H
 
A
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
T
L
 
L
-
 
H
-
 
Q
-
 
H
L
 
L
T
 
P
D
 
D
I
 
I
-
 
L
-
 
G
H
 
H
E
 
S
V
 
G
Y
 
H
E
 
R
E
 
A
A
 
G
P
 
N
R
 
G
L
 
V
R
 
F
T
 
T
V
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
-
K
 
-
R
 
-
I
 
V
R
 
H
I
 
T
D
 
A
P
 
S
R
 
G
S
 
T
H
 
R
L
 
L
Y
 
A
R
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
I
 
-
A
 
E
E
 
S
C
 
A
R
 
D
V
 
V
N
 
P
A
 
C
L
 
Y
H
 
H
H
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
D
 
D
R
 
Q
L
 
V
G
 
G
D
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
V
V
 
V
V
 
S
A
 
A
R
 
V
E
 
D
T
 
V
V
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
I
Q
 
E
G
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
L
V
 
P
H
 
G
H
 
D
P
 
T
F
 
F
L
 
V
I
 
L
G
 
A
V
 
V
Q
 
Q
W
 
W
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
K
L
 
S
V
 
L
A
 
D
D
 
D
Q
 
L
R
 
R
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
F
 
F
R
x
K
T
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
S
G
 
G
T
 
Y
A
 
A

3fijA Crystal structure of a uncharacterized protein lin1909
31% identity, 93% coverage: 9:228/237 of query aligns to 2:223/224 of 3fijA

query
sites
3fijA
R
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
G
S
 
Q
V
 
Q
H
 
R
G
 
Y
S
 
V
R
 
D
I
 
-
A
 
-
W
 
-
W
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
I
R
 
Q
R
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
G
R
 
F
A
 
P
V
 
I
R
 
A
I
 
L
T
 
P
A
 
I
R
 
D
D
 
D
P
 
P
F
 
S
P
 
T
-
 
A
-
 
V
-
 
Q
-
 
A
I
 
I
E
 
S
R
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
L
G
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
Q
D
 
D
I
 
I
D
 
T
A
 
P
A
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
G
 
L
E
 
E
T
 
E
A
 
-
L
 
-
P
 
P
K
 
S
M
 
Q
R
 
E
I
 
I
D
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
F
P
 
P
E
 
P
R
 
R
D
 
D
R
 
S
L
 
Y
E
 
E
L
 
I
C
 
A
A
 
L
L
 
V
D
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
D
R
 
A
R
 
G
L
 
K
P
 
P
V
 
I
L
 
F
G
 
A
I
 
I
C
 
C
R
 
R
G
 
G
S
 
M
Q
 
Q
M
 
L
I
 
V
N
 
N
V
 
V
H
 
A
R
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
T
L
 
L
L
 
Y
T
 
Q
D
 
D
I
 
I
H
 
S
E
 
Q
V
 
V
Y
 
E
E
 
T
E
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
Q
-
x
H
-
 
L
P
 
Q
R
 
R
L
 
V
R
 
D
T
 
E
V
 
Q
L
 
L
P
 
G
R
 
S
K
x
H
R
 
T
I
 
I
R
 
D
I
 
I
D
 
E
P
 
P
R
 
T
S
 
S
H
 
E
L
 
L
Y
 
A
R
 
K
I
 
H
L
 
H
G
 
P
I
 
N
A
 
K
E
 
K
C
 
L
R
 
-
V
 
V
N
 
N
A
x
S
L
 
L
H
|
H
H
 
H
Q
 
Q
A
 
F
V
 
I
D
 
K
R
 
K
L
 
L
G
 
A
D
 
P
G
 
S
L
 
F
R
 
K
V
 
V
V
 
T
A
 
A
R
 
R
E
 
T
T
 
A
V
 
D
G
 
G
I
 
M
V
 
I
Q
x
E
G
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
G
V
 
D
H
 
N
H
 
L
P
 
P
-
 
S
F
 
W
L
 
Y
I
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
W
 
W
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
L
L
 
M
V
 
F
-
 
Q
A
 
T
D
 
D
Q
 
P
R
 
E
Q
 
S
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
F
 
F
R
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
D
T
 
E
A
 
S
A
 
K
G
 
K
T
 
T

P76038 Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase PuuD; Gamma-Glu-GABA hydrolase; EC 3.5.1.94 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 73% coverage: 50:221/237 of query aligns to 59:236/254 of P76038

query
sites
P76038
I
 
L
E
 
P
R
 
K
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
I
V
 
Y
V
 
L
G
 
P
G
 
G
G
 
S
-
 
P
D
 
S
D
 
N
I
 
V
D
 
Q
A
 
P
A
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
N
A
 
G
L
 
-
P
 
D
K
 
E
M
 
P
R
 
D
I
 
A
D
 
D
P
 
P
E
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
L
L
 
L
E
 
S
L
 
M
C
 
A
A
 
I
L
 
I
D
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
F
G
 
A
I
 
I
C
|
C
R
 
R
G
 
G
S
 
L
Q
 
Q
M
 
E
I
 
L
N
 
V
V
 
V
H
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
K
L
 
L
T
 
C
D
 
E
I
 
Q
H
 
P
E
 
E
V
 
L
Y
 
L
E
 
E
-
 
H
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
P
E
 
E
A
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
E
R
 
Q
T
 
Q
V
 
Y
L
 
A
P
 
P
R
 
S
K
 
H
R
 
E
I
 
V
R
 
Q
I
 
V
D
 
E
P
 
E
R
 
G
S
 
G
H
 
L
L
 
L
Y
 
S
R
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
-
I
 
-
A
 
P
E
 
E
C
 
C
R
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
W
V
 
V
N
 
N
A
 
S
L
 
L
H
 
H
H
 
G
Q
 
Q
A
 
G
V
 
A
D
 
K
R
 
V
L
 
V
G
 
S
D
 
P
G
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
S
T
 
P
V
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
 
E
G
 
A
I
 
V
E
 
S
A
 
V
V
 
I
H
 
N
H
 
H
P
 
P
F
 
F
L
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
W
 
W
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
N
Q
 
S
R
 
S
Q
 
E
Q
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
S
R
 
R
T
 
I
L
 
L

6vtvB Crystal structure of puud gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase from e. Coli
34% identity, 73% coverage: 50:221/237 of query aligns to 57:234/252 of 6vtvB

query
sites
6vtvB
I
 
L
E
 
P
R
 
K
L
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
I
V
 
Y
V
 
L
G
 
P
G
 
G
G
 
S
-
 
P
D
 
S
D
 
N
I
 
V
D
 
Q
A
 
P
A
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
N
A
 
G
L
 
-
P
 
D
K
 
E
M
 
P
R
 
D
I
 
A
D
 
D
P
 
P
E
 
G
R
 
R
D
 
D
R
 
L
L
 
L
E
 
S
L
 
M
C
 
A
A
 
I
L
 
I
D
 
N
G
 
A
A
 
A
A
 
L
A
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
I
P
 
P
V
 
I
L
 
F
G
 
A
I
 
I
C
 
C
R
 
R
G
 
G
S
 
L
Q
 
Q
M
 
E
I
 
L
N
 
V
V
 
V
H
 
A
R
 
T
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
-
 
H
-
 
R
-
 
K
L
 
L
T
 
C
D
 
E
I
 
Q
H
 
P
E
 
E
V
 
L
Y
 
L
E
 
E
-
x
H
-
 
R
-
 
E
-
 
D
-
 
P
E
 
E
A
 
L
P
 
P
R
 
V
L
 
E
R
 
Q
T
 
Q
V
 
Y
L
 
A
P
 
P
R
 
S
K
x
H
R
 
E
I
 
V
R
 
Q
I
 
V
D
 
E
P
 
E
R
 
G
S
 
G
H
 
L
L
 
L
Y
 
S
R
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
-
I
 
-
A
 
P
E
 
E
C
 
C
R
 
S
-
 
N
-
 
F
-
 
W
V
 
V
N
 
N
A
x
S
L
 
L
H
|
H
H
 
G
Q
 
Q
A
 
G
V
 
A
D
 
K
R
 
V
L
 
V
G
 
S
D
 
P
G
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
S
T
 
P
V
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
x
E
G
 
A
I
 
V
E
 
S
A
 
V
V
 
I
H
 
N
H
 
H
P
 
P
F
 
F
L
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
W
 
W
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
-
V
 
-
A
 
-
D
 
N
Q
 
S
R
 
S
Q
 
E
Q
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
S
R
 
R
T
 
I
L
 
L

7d50B Spua mutant - h221n with glutamyl-thioester (see paper)
34% identity, 73% coverage: 50:222/237 of query aligns to 61:245/255 of 7d50B

query
sites
7d50B
I
 
L
E
 
D
R
 
S
L
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
F
G
 
T
G
 
G
G
 
S
-
 
P
D
 
S
D
 
N
I
 
V
D
 
E
A
 
P
A
 
R
L
 
H
Y
 
Y
-
 
S
G
 
G
E
 
P
T
 
A
A
 
S
L
 
E
P
 
P
K
 
G
M
 
T
R
 
L
I
 
H
D
 
D
P
 
S
E
 
D
R
 
R
D
 
D
R
 
A
L
 
T
E
 
T
L
 
L
C
 
P
A
 
L
L
 
V
D
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
D
R
 
A
R
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
 
C
R
 
R
G
 
G
S
 
F
Q
 
Q
M
 
E
I
 
M
N
 
N
V
 
V
H
 
A
R
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
H
T
 
Q
D
 
K
I
 
V
H
 
H
E
 
E
V
 
V
Y
 
G
E
 
T
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
x
H
-
 
R
-
 
E
-
 
P
-
 
A
E
 
D
A
 
Q
P
 
P
R
 
L
L
 
E
R
 
V
T
 
Q
V
 
Y
L
 
A
P
 
P
R
 
R
K
x
H
R
 
A
I
 
M
R
 
H
I
 
V
D
 
Q
P
 
P
R
 
G
S
 
G
H
 
V
L
 
L
Y
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
G
G
 
L
I
 
P
A
 
S
E
 
E
C
 
F
R
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
x
S
L
 
I
H
|
H
H
 
G
Q
 
Q
A
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
L
G
 
A
D
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
A
T
 
P
V
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
x
E
G
 
A
I
 
I
E
 
S
A
 
V
V
 
E
H
 
G
-
 
A
H
 
K
P
 
A
F
 
F
L
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
W
 
W
H
 
N
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
Q
V
 
V
-
 
L
A
 
T
D
 
N
Q
 
P
R
 
N
Q
 
Y
Q
 
L
A
 
A
L
 
I
F
 
F
R
 
Q
T
 
A
L
 
F
A
 
G

7d53A Spua mutant - h221n with glu (see paper)
34% identity, 73% coverage: 50:222/237 of query aligns to 55:239/249 of 7d53A

query
sites
7d53A
I
 
L
E
 
D
R
 
S
L
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
L
V
 
F
G
 
T
G
|
G
G
x
S
-
x
P
D
x
S
D
x
N
I
 
V
D
 
E
A
 
P
A
 
R
L
 
H
Y
 
Y
-
 
S
G
 
G
E
 
P
T
 
A
A
 
S
L
 
E
P
 
P
K
 
G
M
 
T
R
 
L
I
 
H
D
 
D
P
 
S
E
 
D
R
 
R
D
 
D
R
 
A
L
 
T
E
 
T
L
 
L
C
 
P
A
 
L
L
 
V
D
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
D
R
 
A
R
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
R
|
R
G
 
G
S
 
F
Q
|
Q
M
 
E
I
 
M
N
 
N
V
 
V
H
 
A
R
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
H
T
 
Q
D
 
K
I
 
V
H
 
H
E
 
E
V
 
V
Y
 
G
E
 
T
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
x
H
-
 
R
-
 
E
-
 
P
-
 
A
E
 
D
A
 
Q
P
 
P
R
 
L
L
 
E
R
 
V
T
 
Q
V
 
Y
L
 
A
P
 
P
R
 
R
K
x
H
R
 
A
I
 
M
R
 
H
I
 
V
D
 
Q
P
 
P
R
 
G
S
 
G
H
 
V
L
 
L
Y
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
G
G
 
L
I
 
P
A
 
S
E
 
E
C
 
F
R
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
x
S
L
x
I
H
|
H
H
x
G
Q
|
Q
A
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
L
G
 
A
D
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
A
T
 
P
V
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
x
E
G
 
A
I
 
I
E
 
S
A
 
V
V
 
E
H
 
G
-
 
A
H
 
K
P
 
A
F
 
F
L
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
W
 
W
H
 
N
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
Q
V
 
V
-
 
L
A
 
T
D
 
N
Q
 
P
R
 
N
Q
 
Y
Q
 
L
A
 
A
L
 
I
F
 
F
R
 
Q
T
 
A
L
 
F
A
 
G

7d4rB Spua native structure (see paper)
38% identity, 54% coverage: 99:226/237 of query aligns to 74:211/215 of 7d4rB

query
sites
7d4rB
L
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
 
C
R
 
R
G
 
G
S
 
F
Q
 
Q
M
 
E
I
 
M
N
 
N
V
 
V
H
 
A
R
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
L
 
H
T
 
Q
D
 
K
I
 
V
H
 
H
E
 
E
V
 
V
Y
 
G
E
 
T
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
x
H
-
 
R
-
 
E
-
 
P
-
 
A
E
 
D
A
 
Q
P
 
P
R
 
L
L
 
E
R
 
V
T
 
Q
V
 
Y
L
 
A
P
 
P
R
 
R
K
x
H
R
 
A
I
 
M
R
 
H
I
 
V
D
 
Q
P
 
P
R
 
G
S
 
G
H
 
V
L
 
L
Y
 
A
R
 
G
I
 
I
L
 
G
G
 
L
I
 
P
A
 
S
E
 
E
C
 
F
R
 
Q
V
 
V
N
 
N
A
x
S
L
 
I
H
|
H
H
 
G
Q
 
Q
A
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
R
L
 
L
G
 
A
D
 
P
G
 
G
L
 
L
R
 
R
V
 
V
V
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
A
T
 
P
V
 
D
G
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
x
E
G
 
A
I
 
I
E
 
S
A
 
V
V
 
E
H
 
G
-
 
A
H
 
K
P
 
A
F
 
F
L
 
A
I
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
W
 
W
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
W
L
 
Q
V
 
V
-
 
L
A
 
T
D
 
N
Q
 
P
R
 
N
Q
 
Y
Q
 
L
A
 
A
L
 
I
F
 
F
R
 
Q
T
 
A
L
 
F
A
 
G
A
 
K
T
 
A
A
 
C
A
 
S

2vxoB Human gmp synthetase in complex with xmp (see paper)
33% identity, 57% coverage: 100:233/237 of query aligns to 77:196/658 of 2vxoB

query
sites
2vxoB
P
 
P
V
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
R
x
Y
G
 
G
S
 
M
Q
 
Q
M
 
M
I
 
M
N
 
N
V
 
K
H
 
V
R
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
T
L
 
V
L
 
H
T
 
K
D
 
K
I
 
S
H
 
D
E
 
G
V
 
V
Y
 
F
E
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
K
 
-
R
 
N
I
 
I
R
 
S
I
 
V
D
 
D
P
 
N
R
 
T
S
 
C
H
 
S
L
 
L
Y
 
F
R
 
R
I
 
G
L
 
L
G
 
Q
I
 
K
A
 
E
E
 
E
C
 
V
R
 
-
V
 
V
N
 
L
A
 
L
L
 
T
H
 
H
H
 
G
Q
 
D
A
 
S
V
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
G
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
F
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
-
T
 
S
V
 
G
G
 
N
I
 
I
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
-
A
 
A
V
 
N
H
 
E
H
 
S
P
 
K
F
 
K
L
 
L
I
 
Y
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
W
 
F
H
|
H
P
 
P
E
|
E
Y
 
V
L
 
G
V
 
L
A
 
T
D
 
E
Q
 
N
R
 
G
Q
 
K
Q
 
V
A
 
I
L
 
L
-
 
K
-
 
N
F
 
F
R
 
L
T
 
Y
L
 
D
A
 
I
A
 
A
T
 
G
A
 
C
A
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
F
S
 
T
L
 
V
E
 
Q
D
 
N

Sites not aligning to the query:

1vcnA Crystal structure of t.Th. Hb8 ctp synthetase complex with sulfate anion (see paper)
33% identity, 48% coverage: 94:207/237 of query aligns to 353:484/506 of 1vcnA

query
sites
1vcnA
A
 
A
A
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
 
C
R
 
L
G
 
G
S
 
L
Q
 
Q
M
 
I
-
 
A
-
 
V
I
 
I
N
 
E
V
 
F
H
 
A
R
 
R
G
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
A
G
 
N
S
 
S
L
 
T
L
 
E
T
 
F
D
 
D
I
 
P
H
 
H
E
 
T
V
 
P
Y
 
H
E
 
P
E
 
V
A
 
I
P
 
D
R
 
L
L
 
M
R
 
T
T
 
M
V
 
R
L
 
L
P
 
G
R
 
D
K
 
W
R
 
P
I
 
M
R
 
R
I
 
I
D
 
K
P
 
P
R
 
G
S
 
T
H
 
L
L
 
L
Y
 
H
R
 
R
I
 
L
L
 
Y
G
 
G
I
 
K
A
 
E
E
 
E
C
 
V
R
 
L
V
 
E
N
 
R
A
 
H
L
 
R
H
 
H
H
 
R
Q
 
Y
A
 
E
V
 
V
D
 
N
R
 
P
L
 
L
G
 
Y
-
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
S
R
 
A
E
 
T
T
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
M
-
 
G
V
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
 
E
G
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
L
V
 
K
H
 
D
H
 
H
P
 
P
F
 
F
L
 
F
I
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
W
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

1vcoA Crystal structure of t.Th. Hb8 ctp synthetase complex with glutamine (see paper)
32% identity, 48% coverage: 94:207/237 of query aligns to 366:508/531 of 1vcoA

query
sites
1vcoA
A
 
A
A
 
R
A
 
E
R
 
R
R
 
K
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
I
C
|
C
R
x
L
G
 
G
S
 
L
Q
|
Q
M
 
I
-
 
A
-
 
V
I
 
I
N
 
E
V
 
F
H
 
A
R
 
R
G
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
K
G
 
G
S
 
A
L
 
N
L
 
S
T
 
T
D
x
E
I
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
H
-
 
T
-
 
P
H
 
H
E
 
P
V
 
V
Y
 
I
E
 
D
E
 
L
A
 
M
P
 
P
R
 
E
L
 
Q
R
 
L
T
 
E
V
 
V
L
 
G
P
 
G
R
 
T
K
 
M
R
 
R
I
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
W
-
 
P
-
 
M
R
 
R
I
 
I
D
 
K
P
 
P
R
 
G
S
 
T
H
 
L
L
 
L
Y
 
H
R
 
R
I
 
L
L
 
Y
G
 
G
I
 
K
A
 
E
E
 
E
C
 
V
R
 
L
V
 
E
N
 
R
A
 
H
L
 
R
H
|
H
H
x
R
Q
x
Y
A
 
E
V
 
V
D
 
N
R
 
P
L
 
L
G
 
Y
-
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
R
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
S
R
 
A
E
 
T
T
 
T
-
 
P
-
 
G
-
 
M
-
 
R
-
 
G
-
 
R
-
 
G
V
 
A
G
 
G
I
 
L
V
 
V
Q
 
E
G
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
L
V
 
K
H
 
D
H
 
H
P
 
P
F
 
F
L
 
F
I
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
Q
W
 
S
H
 
H
P
 
P
E
 
E
Y
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS00395 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS00395
MAAFIARGRPLIGVTASVHGSRIAWWANRLALRRAGARAVRITARDPFPIERLDGLVVGG
GDDIDAALYGETALPKMRIDPERDRLELCALDGAAARRLPVLGICRGSQMINVHRGGSLL
TDIHEVYEEAPRLRTVLPRKRIRIDPRSHLYRILGIAECRVNALHHQAVDRLGDGLRVVA
RETVGIVQGIEAVHHPFLIGVQWHPEYLVADQRQQALFRTLAATAAGTASLEDATAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory