SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS04230 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS04230 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2q5qA X-ray structure of phenylpyruvate decarboxylase in complex with 3- deaza-thdp and 5-phenyl-2-oxo-valeric acid (see paper)
99% identity, 98% coverage: 1:535/545 of query aligns to 3:533/533 of 2q5qA

query
sites
2q5qA
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
F
|
F
A
|
A
L
 
L
P
 
P
F
 
F
F
 
F
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
|
E
P
 
P
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
|
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
E
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
Q
 
Q
G
|
G
R
|
R
T
|
T
L
|
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
K
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
Q
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
R
|
R
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
L
 
L
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
E
 
E
V
 
V
R
|
R
R
|
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
F
 
F
M
|
M
G
 
G
R
|
R
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
V
|
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
S
D
|
D
T
|
T
N
|
N
F
 
F
A
 
A
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
P
S
 
S
D
 
D
R
 
-
T
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
G
K
 
K
E
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
M
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
|
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
M
|
M
G
 
G
D
|
D
C
 
C
L
 
L
F
 
F
T
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
M
I
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
L
|
L
M
|
M
A
|
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
G
 
G
M
|
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
C
 
C
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
L
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
W
|
W
E
|
E
M
|
M
L
|
L
R
 
R
T
 
T
F
|
F
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
I
 
I
P
 
P
R
|
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
|
F
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G

2q5lA X-ray structure of phenylpyruvate decarboxylase in complex with 2-(1- hydroxyethyl)-3-deaza-thdp (see paper)
99% identity, 99% coverage: 1:537/545 of query aligns to 7:538/538 of 2q5lA

query
sites
2q5lA
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
F
|
F
A
|
A
L
 
L
P
 
P
F
 
F
F
 
F
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
|
E
P
 
P
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
E
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
-
H
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
T
|
T
L
|
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
K
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
Q
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
R
|
R
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
L
 
L
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
E
 
E
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
F
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
V
|
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
N
|
N
F
 
F
A
 
A
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
P
S
 
S
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
K
 
K
E
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
M
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
M
|
M
G
 
G
D
|
D
C
 
C
L
 
L
F
 
F
T
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
M
I
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
G
 
G
M
|
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
C
 
C
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
L
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
W
|
W
E
|
E
M
|
M
L
|
L
R
 
R
T
 
T
F
|
F
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
I
 
I
P
 
P
R
|
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K

2q5oA X-ray structure of phenylpyruvate decarboxylase in complex with 3- deaza-thdp and phenylpyruvate (see paper)
98% identity, 98% coverage: 1:536/545 of query aligns to 2:529/529 of 2q5oA

query
sites
2q5oA
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
F
|
F
A
|
A
L
 
L
P
 
P
F
 
F
F
 
F
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
|
E
P
 
P
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
|
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
E
G
 
G
N
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
Q
 
Q
G
|
G
R
|
R
T
|
T
L
|
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
K
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
Q
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
R
|
R
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
L
 
L
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
E
 
E
V
 
V
R
|
R
R
|
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
F
 
F
M
|
M
G
 
G
R
 
R
G
|
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
V
|
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
|
T
N
|
N
F
 
F
A
 
A
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
P
S
 
S
D
 
-
R
 
-
T
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
-
E
 
-
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
M
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
M
|
M
G
 
G
D
|
D
C
 
C
L
 
L
F
 
F
T
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
M
I
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
L
|
L
M
|
M
A
|
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
G
 
G
M
|
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
C
 
C
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
L
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
W
|
W
E
|
E
M
|
M
L
|
L
R
 
R
T
 
T
F
|
F
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
I
 
I
P
 
P
R
|
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
|
F
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q

2nxwA Crystal structure of phenylpyruvate decarboxylase of azospirillum brasilense (see paper)
98% identity, 99% coverage: 1:539/545 of query aligns to 8:537/537 of 2nxwA

query
sites
2nxwA
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
F
|
F
A
|
A
L
 
L
P
 
P
F
 
F
F
 
F
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
|
E
P
 
P
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
E
G
 
G
N
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
-
H
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
K
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
Q
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
R
|
R
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
L
 
L
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
E
 
E
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
F
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
V
|
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
N
|
N
F
 
F
A
 
A
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
P
S
 
S
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
K
 
K
E
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
M
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
M
|
M
G
 
G
D
|
D
C
 
C
L
 
L
F
 
F
T
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
M
I
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
G
 
G
M
|
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
C
 
C
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
L
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
W
|
W
E
|
E
M
|
M
L
|
L
R
 
R
T
 
T
F
|
F
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
I
 
I
P
 
P
R
|
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R
L
 
L

2q5jA X-ray structure of phenylpyruvate decarboxylase in complex with 3- deaza-thdp (see paper)
97% identity, 99% coverage: 1:538/545 of query aligns to 1:523/523 of 2q5jA

query
sites
2q5jA
M
 
M
K
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
M
 
M
F
 
F
G
 
G
I
|
I
P
|
P
G
|
G
D
|
D
F
|
F
A
|
A
L
 
L
P
 
P
F
 
F
F
 
F
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
T
 
T
L
 
L
S
 
S
H
 
H
E
|
E
P
 
P
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
S
 
S
S
 
S
T
 
T
L
 
L
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
V
T
|
T
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
K
 
K
S
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
T
E
 
E
G
 
-
N
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
H
 
-
H
 
-
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
T
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
K
 
K
E
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
K
 
K
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
Q
S
 
S
R
 
R
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
I
 
I
P
 
P
R
|
R
N
 
N
M
 
M
V
 
V
N
 
N
A
 
A
E
 
E
V
 
V
E
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
D
 
D
D
 
D
P
 
P
A
 
A
W
 
W
P
 
P
V
 
V
D
 
D
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
M
R
 
R
S
 
S
A
 
A
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
L
 
L
M
 
M
V
 
V
C
 
C
V
 
V
E
 
E
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
K
V
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
V
T
 
T
T
 
T
F
 
F
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
T
 
T
P
 
P
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
I
 
I
G
 
G
V
|
V
A
 
A
G
 
G
D
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
E
E
 
E
S
 
S
D
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
N
|
N
F
 
F
A
 
A
V
 
V
S
 
S
Q
 
Q
R
 
R
K
 
K
I
 
I
D
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
K
T
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
F
D
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
D
 
D
I
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
P
 
P
P
 
P
S
 
S
D
 
D
R
 
R
T
 
T
T
 
T
R
 
R
G
 
G
K
 
K
E
 
E
P
 
P
H
 
H
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
M
D
 
D
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
V
N
 
N
D
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
M
|
M
G
|
G
D
|
D
C
 
C
L
 
L
F
 
F
T
 
T
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
M
I
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
M
 
M
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
A
|
A
G
|
G
M
|
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
C
 
C
V
 
V
S
 
S
G
 
G
G
 
G
K
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
L
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
F
Q
 
Q
M
 
M
T
 
T
G
 
G
W
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
G
N
 
N
C
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
D
P
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
L
 
L
F
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
S
|
S
W
|
W
E
|
E
M
|
M
L
|
L
R
 
R
T
 
T
F
|
F
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
A
F
 
F
N
 
N
D
 
D
L
 
L
D
 
D
D
 
D
W
 
W
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
D
M
 
M
A
 
A
A
 
A
G
 
G
M
 
M
G
 
G
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
R
 
R
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
G
 
G
R
 
R
F
 
F
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
I
 
I
P
 
P
R
|
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
S
 
S
D
 
D
T
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
R
 
R

5npuA Inferred ancestral pyruvate decarboxylase (see paper)
28% identity, 94% coverage: 11:522/545 of query aligns to 12:522/547 of 5npuA

query
sites
5npuA
L
 
L
K
 
A
D
 
Q
R
 
I
G
 
G
A
 
L
Q
 
K
A
 
H
M
 
H
F
 
F
G
 
A
I
 
V
P
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
Y
A
 
N
L
 
L
P
 
V
F
 
L
F
 
L
K
 
D
V
 
Q
A
 
L
E
 
L
E
 
K
T
 
N
Q
 
K
I
 
D
L
 
L
P
 
E
L
 
Q
H
 
V
T
 
Y
L
 
C
S
 
C
H
 
N
E
 
E
P
 
L
A
 
N
V
 
C
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
A
D
 
E
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
R
 
R
Y
 
-
S
 
A
S
 
N
T
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
A
A
 
A
A
 
V
V
 
V
T
 
T
Y
 
F
G
 
S
A
 
V
G
 
G
A
 
A
F
 
L
N
 
S
M
 
A
V
 
F
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
G
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
K
 
N
S
 
L
P
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
L
I
 
I
S
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
N
T
 
T
T
 
N
E
 
D
G
 
H
N
 
G
A
 
S
G
 
G
L
 
H
L
 
I
L
 
L
H
 
H
H
 
H
Q
 
T
G
 
I
R
 
G
T
 
T
L
 
T
D
 
D
-
 
Y
-
 
G
T
 
Y
Q
 
Q
F
 
L
Q
 
E
V
 
M
F
 
A
K
 
K
E
 
Q
I
 
I
T
 
T
V
 
C
A
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
S
L
 
I
D
 
T
D
 
H
P
 
A
A
 
E
K
 
D
A
 
A
P
 
P
A
 
A
E
 
L
I
 
I
A
 
D
R
 
H
V
 
A
L
 
I
G
 
R
A
 
T
A
 
A
R
 
L
A
 
R
L
 
E
S
 
K
R
 
K
P
 
P
V
 
A
Y
 
Y
L
 
I
E
 
E
I
 
I
P
 
A
R
 
C
N
 
N
M
 
V
V
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
P
N
 
C
A
 
A
E
 
R
V
 
P
E
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
S
-
 
A
-
 
L
-
 
L
D
 
N
D
 
E
P
 
P
A
 
T
W
 
-
P
 
-
V
 
S
D
 
D
R
 
E
D
 
E
A
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
A
C
 
A
A
 
V
D
 
E
E
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
F
M
 
I
R
 
E
S
 
K
A
 
R
T
 
E
S
 
K
P
 
P
V
 
V
L
 
L
M
 
L
V
 
V
C
 
G
V
 
G
E
 
K
V
 
L
R
 
R
R
 
A
Y
 
A
G
 
G
L
 
A
E
 
E
A
 
E
K
 
A
V
 
V
A
 
V
E
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
D
R
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
C
P
 
A
V
 
V
V
 
A
T
 
T
T
 
M
F
 
A
M
 
A
G
 
A
R
 
K
G
 
S
L
 
F
L
 
F
A
 
P
D
 
E
A
 
D
P
 
H
T
 
P
P
 
G
P
 
Y
L
 
V
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
I
 
W
G
 
G
V
 
E
A
 
V
G
 
S
D
 
S
A
 
P
E
 
G
I
 
V
T
 
E
R
 
E
L
 
I
V
 
V
E
 
D
E
 
W
S
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
F
 
I
L
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
L
 
F
S
 
N
D
 
D
T
 
Y
N
 
S
F
 
T
A
 
V
V
 
G
S
 
W
Q
 
T
R
 
A
K
 
W
I
 
P
D
 
K
L
 
G
R
 
E
K
 
N
T
 
V
I
 
V
H
 
L
A
 
V
F
 
D
D
 
P
R
 
H
A
 
H
V
 
I
T
 
T
L
 
V
G
 
G
Y
 
G
H
 
E
T
 
E
Y
 
F
A
 
T
D
 
G
I
 
I
P
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
D
L
 
F
V
 
L
D
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
T
E
 
E
R
 
R
L
 
V
P
 
P
P
 
K
S
 
K
D
 
D
R
 
A
T
 
T
T
 
L
R
 
D
G
 
A
K
 
A
E
 
D
P
 
P
H
 
N
A
 
A
Y
 
-
P
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
P
I
 
L
A
 
T
P
 
R
M
 
A
D
 
E
I
 
L
A
 
C
R
 
R
A
 
Q
V
 
I
N
 
Q
D
 
G
R
 
L
V
 
L
R
 
N
A
 
P
G
 
N
Q
 
T
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
T
I
 
L
A
 
I
A
 
A
D
 
E
M
 
T
G
 
G
D
|
D
C
 
S
L
 
W
F
 
F
T
 
N
A
 
A
M
 
M
D
 
R
M
 
M
I
 
K
-
 
L
-
 
P
-
 
H
D
 
G
A
 
A
G
 
R
L
 
V
M
 
E
A
 
L
P
 
E
G
 
M
Y
 
Q
Y
 
W
A
x
G
G
x
H
M
x
I
G
 
G
F
 
W
G
 
S
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
T
I
 
F
G
 
G
A
 
Y
Q
 
A
C
 
V
V
 
A
S
 
E
G
 
P
G
 
E
K
 
R
R
 
R
I
 
N
L
 
V
T
 
L
V
 
M
V
 
V
G
|
G
D
|
D
G
 
G
A
x
S
F
 
F
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
A
W
 
Q
E
 
E
L
 
V
G
 
A
N
 
Q
C
 
M
R
 
V
R
 
R
L
 
R
G
 
K
I
 
L
D
 
P
P
 
I
I
 
I
V
 
I
I
 
F
L
 
L
F
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
R
S
x
G
W
x
Y
E
x
T
M
x
I
L
x
E
R
 
V
T
 
K
F
 
I
Q
 
H
P
 
-
E
 
D
S
 
G
A
 
P
F
 
Y
N
 
N
D
 
N
L
 
I
D
 
K
D
 
N
W
 
W
R
 
D
F
 
Y
A
 
A
D
 
G
M
 
L
-
 
M
-
 
E
-
 
V
-
 
F
-
 
N
A
 
A
A
 
E
G
 
D
M
 
G
G
 
K
G
 
G
D
 
L
G
 
G
V
 
L
R
 
K
V
 
A
R
 
T
T
 
T
R
 
G
A
 
G
E
 
E
L
 
L
K
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
I
D
 
K
K
 
K
A
 
A
F
 
L
A
 
A
T
 
H
R
 
R
G
 
E
R
 
G
F
 
P
Q
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
C
M
 
V
I
 
I
P
 
D
R
 
R

P23234 Indole-3-pyruvate decarboxylase; Indolepyruvate decarboxylase; EC 4.1.1.74 from Enterobacter cloacae (see paper)
29% identity, 95% coverage: 3:522/545 of query aligns to 7:532/552 of P23234

query
sites
P23234
L
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
R
 
D
A
 
R
L
 
L
K
 
T
D
 
D
R
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
H
M
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
V
P
 
P
G
 
G
D
 
D
F
 
Y
A
 
N
L
 
L
P
 
Q
F
 
F
F
 
L
K
 
D
V
 
H
A
 
V
E
 
I
E
 
D
T
 
S
Q
 
P
I
 
D
L
 
I
P
 
C
L
 
W
H
 
V
T
 
G
L
 
C
S
 
A
H
 
N
E
|
E
P
 
L
A
 
N
V
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
R
 
R
Y
 
C
S
 
K
S
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
L
-
 
L
-
 
T
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
A
 
V
G
 
G
A
 
E
F
 
L
N
 
S
M
 
A
V
 
M
N
 
N
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
K
 
H
S
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
A
E
 
A
G
 
Q
N
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
E
L
 
L
L
 
L
H
 
H
H
 
H
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
T
L
 
L
-
 
G
D
 
D
T
 
G
Q
 
E
F
 
F
Q
 
R
V
 
H
F
 
F
K
 
Y
E
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
E
-
 
P
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
V
L
 
L
D
 
T
D
 
E
P
 
-
A
 
Q
K
 
N
A
 
A
P
 
C
A
 
Y
E
 
E
I
 
I
A
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
T
A
 
T
A
 
M
R
 
L
A
 
R
L
 
E
S
 
R
R
 
R
P
 
P
V
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
M
I
 
L
P
 
P
R
 
A
N
 
D
M
 
V
V
 
A
-
 
K
N
 
K
A
 
A
E
 
A
V
 
T
E
 
P
P
 
P
V
 
V
G
 
N
-
 
A
-
 
L
D
 
T
D
 
H
P
 
K
A
 
Q
W
 
A
P
 
H
V
 
A
D
 
D
R
 
S
D
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
K
A
 
A
C
 
F
A
 
R
D
 
D
E
 
A
V
 
A
L
 
E
A
 
N
A
 
K
M
 
L
R
 
A
S
 
M
A
 
S
T
 
K
S
 
R
P
 
T
V
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
A
C
 
D
V
 
F
E
 
L
V
 
V
R
 
L
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
K
A
 
H
K
 
A
V
 
L
A
 
Q
E
 
K
L
 
W
A
 
V
Q
 
K
R
 
E
L
 
V
G
 
P
V
 
M
P
 
A
V
 
H
V
 
A
T
 
T
T
 
M
F
 
L
M
 
M
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
I
L
 
F
A
 
D
D
 
E
A
 
R
P
 
Q
T
 
A
P
 
G
P
 
F
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
I
 
S
G
 
G
V
 
S
A
 
A
G
 
S
D
 
T
A
 
G
E
 
A
I
 
V
T
 
K
R
 
E
L
 
A
V
 
I
E
 
E
E
 
G
S
 
A
D
 
D
G
 
T
L
 
V
F
 
L
L
 
C
L
 
V
G
 
G
A
 
T
I
 
R
L
 
F
S
 
T
D
 
D
T
 
T
N
 
L
F
 
T
A
 
A
V
 
G
S
 
F
Q
 
T
R
 
H
K
 
Q
I
 
L
D
 
T
L
 
P
R
 
A
K
 
Q
T
 
T
I
 
I
H
 
E
A
 
V
F
 
Q
D
 
P
R
 
H
A
 
A
V
 
A
T
 
R
L
 
V
G
 
G
Y
 
D
H
 
V
T
 
W
Y
 
F
A
 
T
D
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
M
A
 
N
G
 
Q
L
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
L
L
 
C
P
 
K
P
 
Q
S
 
H
D
 
V
R
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
M
-
 
S
T
 
S
T
 
S
R
 
S
G
 
G
K
 
A
E
 
I
P
 
P
H
 
F
A
 
P
Y
 
Q
P
 
P
T
 
D
G
 
G
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
S
I
 
L
A
 
T
P
 
Q
M
 
E
D
 
N
I
 
F
A
 
W
R
 
R
A
 
T
V
 
L
N
 
Q
D
 
T
R
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
P
G
 
G
Q
 
D
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
I
I
 
I
A
 
L
A
 
A
D
 
D
M
 
Q
G
 
G
D
 
T
C
 
S
L
 
A
F
 
F
T
 
G
A
 
A
M
 
I
D
 
D
M
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
P
I
 
A
D
 
D
A
 
V
G
 
N
L
 
F
M
 
I
A
 
V
P
 
Q
G
 
P
Y
 
L
Y
 
W
A
 
G
G
 
S
M
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
T
V
 
L
P
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
C
 
T
V
 
A
S
 
C
G
 
P
G
 
N
K
 
R
R
 
R
I
 
V
L
 
I
T
 
V
V
 
L
V
 
T
G
 
G
D
|
D
G
 
G
A
 
A
F
 
A
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
I
W
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
G
N
 
S
C
 
M
R
 
L
R
 
R
L
 
D
G
 
K
I
 
Q
D
 
H
P
 
P
I
 
I
V
 
I
I
 
L
L
 
V
F
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
E
S
 
G
W
 
Y
E
 
T
M
 
V
L
 
E
R
 
R
T
 
A
F
 
I
Q
 
H
-
 
G
P
 
A
E
 
E
S
 
Q
A
 
R
F
 
Y
N
 
N
D
 
D
L
 
I
D
 
A
D
 
L
W
 
W
R
 
N
F
 
W
A
 
T
D
 
H
M
 
I
A
 
P
A
 
Q
G
 
A
M
 
L
G
 
S
G
 
L
D
 
D
-
 
P
-
 
Q
-
 
S
-
 
E
G
 
C
V
 
W
R
 
R
V
 
V
R
 
S
T
 
E
R
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
D
A
 
V
L
 
L
D
 
E
K
 
K
A
 
V
F
 
-
A
 
A
T
 
H
R
 
H
G
 
E
R
 
R
F
 
L
Q
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
V
M
 
M
I
 
L
P
 
P
R
 
K

1ovmA Crystal structure of indolepyruvate decarboxylase from enterobacter cloacae (see paper)
29% identity, 95% coverage: 3:522/545 of query aligns to 5:516/535 of 1ovmA

query
sites
1ovmA
L
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
Y
L
 
L
L
 
L
R
 
D
A
 
R
L
 
L
K
 
T
D
 
D
R
 
C
G
 
G
A
 
A
Q
 
D
A
 
H
M
 
L
F
 
F
G
 
G
I
 
V
P
|
P
G
|
G
D
|
D
F
x
Y
A
x
N
L
 
L
P
 
Q
F
 
F
F
 
L
K
 
D
V
 
H
A
 
V
E
 
I
E
 
D
T
 
S
Q
 
P
I
 
D
L
 
I
P
 
C
L
 
W
H
 
V
T
 
G
L
 
C
S
 
A
H
 
N
E
|
E
P
 
L
A
 
N
V
 
A
G
 
S
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
A
 
G
A
 
Y
A
 
A
R
 
R
Y
 
C
S
 
K
S
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
F
A
 
A
A
 
A
V
 
L
-
 
L
-
 
T
T
|
T
Y
 
F
G
 
G
A
x
V
G
 
G
A
 
E
F
 
L
N
 
S
M
 
A
V
 
M
N
 
N
A
 
G
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
K
 
H
S
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
L
V
 
H
I
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
T
 
A
E
 
A
G
 
Q
N
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
E
L
 
L
L
 
L
H
|
H
H
|
H
Q
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
T
L
|
L
-
x
G
D
 
D
T
 
G
Q
 
E
F
 
F
Q
 
R
V
 
H
F
 
F
K
 
Y
E
 
H
-
 
M
-
 
S
-
 
E
-
 
P
I
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
R
 
V
L
 
L
D
 
T
D
 
E
P
 
-
A
 
Q
K
 
N
A
 
A
P
 
C
A
 
Y
E
 
E
I
 
I
A
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
T
A
 
T
A
 
M
R
 
L
A
 
R
L
 
E
S
 
R
R
 
R
P
 
P
V
 
G
Y
 
Y
L
 
L
E
 
M
I
 
L
P
 
P
R
x
A
N
 
D
M
 
V
V
 
A
-
 
K
N
 
K
A
 
A
E
 
A
V
 
T
E
 
P
P
 
P
V
 
V
G
 
N
-
 
A
-
 
L
D
 
T
D
 
H
P
 
K
A
 
Q
W
 
A
P
 
H
V
 
A
D
 
D
R
 
S
D
 
A
A
 
C
L
 
L
A
 
K
A
 
A
C
 
F
A
 
R
D
 
D
E
 
A
V
 
A
L
 
E
A
 
N
A
 
K
M
 
L
R
 
A
S
 
M
A
 
S
T
 
K
S
 
R
P
 
T
V
 
A
L
 
L
M
 
L
V
 
A
C
 
D
V
 
F
E
 
L
V
 
V
R
 
L
R
 
R
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
E
 
K
A
 
H
K
 
A
V
 
L
A
 
Q
E
 
K
L
 
W
A
 
V
Q
 
K
R
 
E
L
 
V
G
 
P
V
 
M
P
 
A
V
 
H
V
 
A
T
 
T
T
 
M
F
 
L
M
 
M
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
I
L
 
F
A
 
D
D
 
E
A
 
R
P
 
Q
T
 
A
P
 
G
P
 
F
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
I
 
S
G
 
G
V
x
S
A
 
A
G
 
S
D
 
T
A
 
G
E
 
A
I
 
V
T
 
K
R
 
E
L
 
A
V
 
I
E
 
E
E
 
G
S
 
A
D
 
D
G
 
T
L
 
V
F
 
L
L
 
C
L
 
V
G
 
G
A
 
T
I
 
R
L
 
F
S
 
T
D
 
D
T
 
T
N
x
L
F
 
T
A
 
A
V
 
G
S
 
F
Q
 
T
R
 
H
K
 
Q
I
 
L
D
 
T
L
 
P
R
 
A
K
 
Q
T
 
T
I
 
I
H
 
E
A
 
V
F
 
Q
D
 
P
R
 
H
A
 
A
V
 
A
T
 
R
L
 
V
G
 
G
Y
 
D
H
 
V
T
 
W
Y
 
F
A
 
T
D
 
G
I
 
I
P
 
P
L
 
M
A
 
N
G
 
Q
L
 
A
V
 
I
D
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
E
R
 
L
L
 
C
P
 
K
P
 
-
S
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
Q
E
 
H
P
 
V
H
 
H
A
 
A
Y
 
-
P
 
P
T
 
D
G
 
G
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
S
I
 
L
A
 
T
P
 
Q
M
 
E
D
 
N
I
 
F
A
 
W
R
 
R
A
 
T
V
 
L
N
 
Q
D
 
T
R
 
F
V
 
I
R
 
R
A
 
P
G
 
G
Q
 
D
E
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
I
I
 
I
A
 
L
A
 
A
D
 
D
M
x
Q
G
 
G
D
x
T
C
 
S
L
 
A
F
 
F
T
 
G
A
 
A
M
 
I
D
 
D
M
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
P
I
 
A
D
 
D
A
 
V
G
 
N
L
 
F
M
 
I
A
 
V
P
 
Q
G
 
P
Y
 
L
Y
 
W
A
x
G
G
x
S
M
x
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
T
V
 
L
P
 
A
A
 
A
G
 
A
I
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
C
 
T
V
 
A
S
 
C
G
 
P
G
 
N
K
 
R
R
 
R
I
 
V
L
 
I
T
 
V
V
 
L
V
 
T
G
|
G
D
|
D
G
|
G
A
|
A
F
 
A
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
G
 
I
W
 
Q
E
 
E
L
 
L
G
 
G
N