SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS04630 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS04630 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

1z2iA Crystal structure of agrobacterium tumefaciens malate dehydrogenase, new york structural genomics consortium
66% identity, 94% coverage: 14:354/361 of query aligns to 7:347/350 of 1z2iA

query
sites
1z2iA
D
 
D
A
 
E
L
 
L
D
 
E
S
 
R
F
 
F
C
 
C
R
 
R
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
A
 
T
D
 
D
E
 
E
A
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
A
T
 
T
R
 
R
A
 
A
M
 
M
M
 
M
H
 
H
G
 
G
S
 
T
R
 
R
L
 
L
G
 
G
V
|
V
D
 
D
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
A
H
 
H
Y
 
Y
V
 
V
A
 
T
T
 
A
M
 
L
T
 
E
Q
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
L
N
 
N
P
 
R
R
 
R
P
 
P
A
 
Q
P
 
I
R
 
S
I
 
R
L
 
V
S
 
S
E
 
G
F
 
F
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
E
T
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
A
D
 
D
N
 
H
A
 
A
H
 
H
G
 
G
A
 
A
L
 
R
G
 
A
A
 
T
Y
 
Y
R
 
A
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
K
 
N
A
 
A
V
 
M
E
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
E
R
 
K
F
 
F
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
N
N
 
S
S
 
S
H
|
H
F
|
F
G
|
G
P
|
P
A
|
A
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
C
 
Y
I
 
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
N
 
N
S
 
S
D
 
D
S
 
S
F
 
F
M
 
V
R
 
R
L
 
L
H
 
H
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
M
R
 
R
F
 
F
H
 
H
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
I
 
V
A
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
A
K
 
A
D
 
D
G
 
D
D
 
M
P
 
P
W
 
W
L
 
L
F
 
L
D
|
D
M
|
M
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
V
P
|
P
Y
 
Y
N
 
N
R
 
R
V
 
V
Q
 
L
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
Q
P
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
A
 
G
T
 
V
A
 
A
S
 
S
D
 
D
P
 
G
E
 
D
G
 
G
R
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
R
D
 
D
P
 
P
E
 
N
R
 
A
A
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
V
G
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
F
G
 
G
F
|
F
K
|
K
G
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
V
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
F
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
M
K
 
R
L
 
L
S
 
S
F
 
F
E
 
D
I
 
L
L
 
A
P
 
P
M
 
M
P
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
F
S
 
S
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
M
 
L
G
 
G
A
 
A
F
 
F
V
 
V
M
 
L
A
 
A
I
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
A
F
 
F
L
 
L
P
 
E
Q
 
R
E
 
D
N
 
V
F
 
F
Q
 
D
D
 
E
N
 
S
M
 
M
A
 
K
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
A
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
S
 
S
R
 
P
A
 
A
V
 
R
P
 
E
G
 
D
R
 
C
T
 
K
V
 
V
M
|
M
A
 
A
P
 
P
G
 
G
D
 
D
R
|
R
E
|
E
W
 
W
A
 
A
E
 
V
A
 
A
E
 
A
R
 
K
R
 
R
R
 
E
S
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
A
P
 
P
I
 
V
D
 
D
Q
 
P
T
 
V
T
 
T
V
 
R
D
 
A
S
 
A
F
 
F
N
 
S
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
K
Y
 
F
G
 
S
V
 
V
P
 
S
A
 
P
P
 
P

3i0pA Crystal structure of malate dehydrogenase from entamoeba histolytica
30% identity, 96% coverage: 8:354/361 of query aligns to 2:360/361 of 3i0pA

query
sites
3i0pA
T
 
T
A
 
K
R
 
N
Y
 
V
G
 
S
A
 
I
D
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
K
S
 
E
F
 
F
C
 
M
R
 
Y
A
 
Q
V
 
V
F
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
E
T
 
N
A
 
A
D
 
R
A
 
M
A
 
V
T
 
R
R
 
D
A
 
T
M
 
L
M
 
I
H
 
A
G
 
A
S
 
D
R
 
L
L
 
R
G
 
G
V
x
M
D
 
D
S
 
T
H
|
H
G
 
G
V
 
I
-
 
Q
R
 
R
L
 
F
L
 
K
G
 
T
H
 
V
Y
 
Y
V
 
I
A
 
D
T
 
R
M
 
I
T
 
K
Q
 
K
G
 
G
R
 
M
V
 
I
N
 
N
P
 
P
R
 
T
P
 
A
A
 
K
P
 
P
R
 
S
I
 
I
L
 
I
S
 
R
E
 
E
F
 
T
G
 
S
A
 
T
V
 
T
A
 
C
T
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
N
N
 
N
A
 
G
H
 
F
G
 
G
A
 
H
L
 
V
G
 
N
A
 
G
Y
 
T
R
 
I
A
 
G
Q
 
M
E
 
K
K
 
M
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
K
A
 
A
G
 
K
R
 
K
F
 
Y
G
 
G
I
 
M
G
 
G
A
 
M
V
 
V
A
 
V
I
 
V
R
 
R
N
 
N
N
 
S
S
 
T
H
|
H
F
 
F
G
 
G
P
x
I
A
|
A
G
 
G
A
 
Y
F
 
Y
A
 
S
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
C
 
C
I
 
I
G
 
G
M
 
I
A
 
C
F
 
G
C
 
T
N
 
N
S
 
A
D
 
R
S
 
S
F
 
S
M
 
V
R
 
A
L
 
A
H
 
T
D
 
F
G
 
G
A
 
D
E
 
E
R
 
P
F
 
I
H
 
L
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
G
V
 
I
P
 
P
V
 
S
K
 
D
D
 
E
G
 
A
D
 
F
P
 
P
W
 
Y
L
 
C
F
|
F
D
|
D
M
x
G
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
I
I
 
S
P
|
P
Y
 
T
N
 
G
R
|
R
V
 
F
Q
 
E
L
 
K
Y
 
Y
R
 
V
S
 
R
L
 
M
G
 
G
I
 
K
P
 
T
L
 
V
P
 
D
E
 
K
A
 
S
T
 
W
A
 
A
S
 
S
D
 
M
P
 
K
E
 
G
G
 
G
R
 
K
D
 
P
T
 
I
T
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
K
R
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
P
-
 
K
-
 
G
A
 
K
E
 
A
M
 
Y
L
 
L
A
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
S
F
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
S
-
 
G
G
 
S
F
 
H
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
G
 
C
L
 
L
A
 
S
G
 
E
F
 
F
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
M
S
 
S
A
 
S
V
 
C
L
 
L
T
 
S
G
 
I
M
 
A
K
 
N
L
 
F
S
 
L
F
 
N
E
 
H
I
 
I
L
 
-
P
 
-
M
 
E
P
 
E
G
 
E
P
 
K
D
 
E
L
 
K
S
 
S
T
 
G
P
 
K
R
 
F
G
 
S
M
 
L
G
 
G
A
 
H
F
 
F
V
 
F
M
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
N
P
 
V
E
 
E
A
 
C
F
 
F
L
 
R
P
 
D
Q
 
L
E
 
N
N
 
E
F
 
F
Q
 
K
D
 
K
N
 
N
M
 
V
A
 
G
R
 
D
Y
 
I
L
 
N
A
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
G
 
N
S
 
T
R
 
D
A
 
K
V
 
L
P
 
P
G
 
G
R
 
H
T
 
D
-
 
R
V
 
I
M
x
Y
A
 
T
P
x
A
G
|
G
D
 
E
R
x
K
E
|
E
W
 
Y
A
 
E
E
 
T
A
 
E
E
 
Q
R
 
K
R
 
R
R
 
R
S
 
K
L
 
F
G
 
G
I
 
D
P
 
D
I
 
L
D
 
P
Q
 
L
T
 
V
T
 
T
V
 
I
D
 
N
S
 
E
F
 
M
N
 
K
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
Q
 
S
A
 
F
Y
 
Y
G
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
L
P
 
P

1vbiA Crystal structure of type 2 malate/lactate dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
37% identity, 95% coverage: 10:352/361 of query aligns to 2:339/340 of 1vbiA

query
sites
1vbiA
R
 
R
Y
 
W
G
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
F
L
 
L
D
 
S
S
 
A
F
 
W
C
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
L
F
 
L
L
 
R
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
S
A
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
V
T
 
A
R
 
W
A
 
A
M
 
L
M
 
V
H
 
E
G
 
A
S
 
D
R
 
L
L
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
G
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
L
R
 
L
L
 
R
L
 
L
G
 
P
H
 
V
Y
 
Y
V
 
V
A
 
R
T
 
R
M
 
L
T
 
E
Q
 
A
G
 
G
R
 
L
V
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
S
P
 
P
A
 
T
P
 
-
R
 
L
I
 
P
L
 
L
S
 
E
E
 
E
F
 
R
G
 
G
A
 
P
V
 
V
A
 
A
T
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
E
N
 
H
A
 
G
H
 
F
G
 
G
A
 
P
L
 
R
G
 
V
A
 
A
Y
 
L
R
 
K
A
 
A
Q
 
V
E
 
E
K
 
A
A
 
A
V
 
Q
E
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
R
R
 
R
F
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
V
A
 
G
I
 
V
R
 
R
N
 
R
N
 
S
S
 
T
H
|
H
F
 
F
G
|
G
P
 
M
A
|
A
G
 
G
A
 
L
F
 
Y
A
 
A
L
 
E
A
 
K
A
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
E
G
 
G
C
 
F
I
 
V
G
 
A
M
 
W
A
 
V
F
 
T
C
 
T
N
 
N
S
 
A
D
 
E
S
 
P
F
 
D
M
 
V
R
 
V
L
 
P
H
 
F
D
 
G
G
 
G
A
 
R
E
 
E
R
 
K
F
 
A
H
 
L
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
L
A
 
A
I
 
F
A
 
A
V
 
A
P
 
P
V
 
A
K
 
P
D
 
Q
G
 
G
D
 
I
P
 
-
W
 
L
L
 
V
F
x
A
D
|
D
M
x
L
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
E
I
 
S
P
 
A
Y
 
M
N
 
G
R
 
K
V
 
V
Q
 
F
L
 
L
Y
 
A
R
 
R
S
 
E
L
 
K
G
 
G
I
 
E
P
 
R
L
 
I
P
 
P
E
 
P
A
 
S
T
 
W
A
 
G
S
 
V
D
 
D
P
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
S
D
 
P
T
 
T
T
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
H
R
 
R
A
 
V
E
 
Y
M
 
A
L
 
L
A
 
R
P
 
P
L
 
L
G
 
G
G
 
G
E
 
P
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
L
F
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
A
K
 
G
L
 
V
S
 
A
F
 
H
E
 
G
I
 
I
L
 
G
P
 
R
M
 
M
P
 
Y
G
 
D
P
 
-
D
 
E
L
 
W
S
 
D
T
 
R
P
 
P
R
 
Q
G
 
D
M
 
V
G
 
G
A
 
H
F
 
F
V
 
L
M
 
L
A
 
A
I
 
L
R
 
D
P
 
P
E
 
G
A
 
R
F
 
F
L
 
V
P
 
G
Q
 
K
E
 
E
N
 
A
F
 
F
Q
 
L
D
 
E
N
 
R
M
 
M
A
 
G
R
 
A
Y
 
L
L
 
W
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
A
S
 
T
R
 
P
A
 
P
V
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
H
-
 
E
T
 
E
V
 
V
M
x
F
A
 
L
P
|
P
G
 
G
D
 
E
R
x
L
E
|
E
W
 
A
A
 
R
E
 
R
A
 
R
E
 
E
R
 
R
R
 
A
R
 
L
S
 
A
L
 
E
G
 
G
I
 
M
P
 
A
I
 
L
D
 
P
Q
 
E
T
 
R
T
 
V
V
 
V
D
 
A
S
 
E
F
 
L
N
 
K
Q
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
P
 
P

1v9nA Structure of malate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
33% identity, 95% coverage: 10:351/361 of query aligns to 13:345/348 of 1v9nA

query
sites
1v9nA
R
 
R
Y
 
V
G
 
P
A
 
K
D
 
D
A
 
R
L
 
L
D
 
F
S
 
S
F
 
F
C
 
I
R
 
V
A
 
R
V
 
V
F
 
L
L
 
T
A
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
V
D
 
P
E
 
E
A
 
E
T
 
D
A
 
A
D
 
K
A
 
I
A
 
V
T
 
A
R
 
D
A
 
N
M
 
L
M
 
V
H
 
M
G
 
A
S
 
D
R
 
L
L
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
E
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
R
L
 
L
G
 
K
H
 
R
Y
 
Y
V
 
V
A
 
D
T
 
G
M
 
I
T
 
I
Q
 
S
G
 
G
R
 
G
V
 
V
N
 
N
P
 
L
R
 
H
P
 
P
A
 
K
P
 
I
R
 
R
I
 
V
L
 
I
S
 
R
E
 
E
F
 
G
G
 
P
A
 
S
V
 
Y
A
 
A
T
 
L
L
 
I
D
 
D
A
 
G
D
 
D
N
 
E
A
 
G
H
 
L
G
 
G
A
 
Q
L
 
V
G
 
V
A
 
G
Y
 
Y
R
 
R
A
 
S
Q
 
M
E
 
K
K
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
K
L
 
K
A
 
A
G
 
K
R
 
D
F
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
I
V
 
V
A
 
I
I
 
A
R
 
R
N
 
N
N
 
S
S
 
N
H
|
H
F
 
Y
G
|
G
P
x
I
A
|
A
G
 
G
A
 
Y
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
E
G
 
G
C
 
M
I
 
I
G
 
G
M
 
I
A
 
S
F
 
M
C
 
T
N
 
N
S
 
S
D
 
R
S
 
P
F
 
L
M
 
V
R
 
A
L
 
P
H
 
T
D
 
G
G
 
G
A
 
I
E
 
E
R
 
R
F
 
I
H
 
L
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
P
V
 
T
K
 
K
D
 
D
G
 
-
D
 
K
P
 
P
W
 
F
L
 
L
F
x
L
D
|
D
M
|
M
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
V
I
 
V
P
|
P
Y
 
I
N
 
G
R
 
K
V
 
L
Q
 
E
L
 
W
Y
 
-
R
 
-
S
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
A
S
 
I
D
 
N
P
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
N
D
 
I
T
 
T
T
 
T
D
 
K
P
 
V
E
 
E
R
 
E
A
 
V
-
 
F
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
L
E
 
P
M
 
L
L
 
G
A
 
G
P
 
F
L
 
G
G
 
E
G
 
L
E
 
L
F
 
G
G
 
G
F
 
H
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
S
G
 
L
F
 
M
V
 
V
E
 
D
I
 
I
L
 
L
S
 
S
A
 
G
V
 
I
L
 
L
T
 
S
G
 
G
M
 
G
K
 
T
L
 
W
S
 
S
F
 
K
E
 
Y
I
 
V
L
 
K
P
 
N
M
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
S
 
T
T
 
S
P
 
E
R
 
K
G
 
G
M
 
S
G
 
N
A
 
V
-
 
C
-
 
H
F
 
F
V
 
F
M
 
M
A
 
V
I
 
I
R
 
D
P
 
I
E
 
E
A
 
H
F
 
F
L
 
I
P
 
P
Q
 
L
E
 
E
N
 
E
F
 
F
Q
 
K
D
 
E
N
 
K
M
 
I
A
 
S
R
 
Q
Y
 
M
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
I
R
 
K
G
 
S
S
 
S
R
 
R
A
 
K
V
 
H
P
 
P
G
 
E
-
 
F
R
 
E
T
 
R
V
 
I
M
x
W
A
 
I
P
x
H
G
|
G
D
 
E
R
x
K
E
x
G
W
 
F
A
 
L
E
 
T
A
 
M
E
 
E
R
 
T
R
 
R
R
 
L
S
 
K
L
 
L
G
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
I
D
 
Y
Q
 
R
T
 
K
T
 
V
V
 
L
D
 
E
S
 
E
F
 
L
N
 
N
Q
 
E
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
A
 
R
Y
 
V
G
 
G
V
 
V

Sites not aligning to the query:

2x06A Sulfolactate dehydrogenase from methanocaldococcus jannaschii (see paper)
30% identity, 91% coverage: 23:351/361 of query aligns to 15:337/344 of 2x06A

query
sites
2x06A
V
 
V
F
 
L
L
 
K
A
 
K
A
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
P
E
 
E
A
 
E
T
 
D
A
 
A
D
 
K
A
 
I
A
 
T
T
 
A
R
 
D
A
 
V
M
 
F
M
 
V
H
 
D
G
 
A
S
 
D
R
 
L
L
 
K
G
 
G
V
x
F
D
 
T
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
R
 
G
L
 
R
L
 
F
G
 
P
H
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
A
 
T
T
 
A
M
 
L
T
 
K
Q
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
N
 
N
P
 
P
R
 
K
P
 
P
A
 
D
P
 
I
R
 
K
I
 
I
L
 
V
S
 
K
E
 
E
F
 
S
G
 
P
A
 
A
V
 
T
A
 
A
T
 
V
L
 
I
D
 
D
A
 
G
D
 
D
N
 
L
A
 
G
H
 
L
G
 
G
A
 
Q
L
 
V
G
 
V
A
 
G
Y
 
K
R
 
K
A
 
A
Q
 
M
E
 
E
K
 
L
A
 
A
V
 
I
E
 
K
L
 
K
A
 
A
G
 
K
R
 
N
F
 
V
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
T
R
 
R
N
 
N
N
 
A
S
 
N
H
|
H
F
|
F
G
|
G
P
x
I
A
|
A
G
 
G
A
 
Y
F
 
Y
A
 
S
L
 
E
A
 
L
A
 
A
A
 
M
E
 
N
A
 
Q
G
 
D
C
 
M
I
 
I
G
 
G
M
 
I
A
 
T
F
 
I
C
 
T
N
 
N
S
 
T
D
 
E
S
 
P
F
 
A
M
 
M
R
 
A
L
 
P
H
 
F
D
 
G
G
 
G
A
 
K
E
 
E
R
 
K
F
 
I
H
 
L
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
F
P
 
K
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
G
D
 
N
P
 
K
W
 
Y
L
 
K
F
 
F
-
 
S
-
 
L
D
|
D
M
|
M
A
|
A
T
 
T
S
 
A
A
 
S
I
 
I
P
 
A
Y
 
R
N
 
G
R
 
K
V
 
I
Q
 
L
L
 
E
Y
 
A
R
 
L
S
 
R
L
 
K
G
 
K
I
 
I
P
 
K
L
 
I
P
 
P
E
 
E
A
 
G
T
 
C
A
 
A
S
 
V
D
 
D
P
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
D
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
A
R
 
K
A
 
A
E
 
L
-
 
E
-
 
G
M
 
C
L
 
I
A
 
L
P
 
P
L
 
F
G
 
G
G
 
G
E
 
P
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
L
F
 
A
V
 
I
E
 
E
I
 
M
L
 
L
S
 
S
A
 
A
V
 
I
L
 
-
T
 
G
G
 
G
M
 
A
K
 
E
L
 
V
S
 
G
F
 
T
E
 
K
I
 
V
L
 
K
P
 
G
M
 
T
P
 
A
G
 
N
P
 
P
D
 
E
L
 
E
S
 
R
T
 
C
P
 
T
R
 
K
G
 
-
M
 
-
G
 
G
A
 
D
F
 
L
V
 
F
M
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
N
P
 
P
E
 
E
A
 
F
F
 
F
L
 
M
P
 
G
Q
 
K
E
 
E
N
 
E
F
 
F
Q
 
K
D
 
R
N
 
K
M
 
V
A
 
D
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
E
L
 
I
R
 
K
G
 
N
S
 
S
R
 
E
A
 
P
V
 
A
P
 
E
G
 
G
R
 
F
T
 
E
V
 
I
M
x
L
A
 
I
P
 
P
G
 
G
D
 
E
R
x
I
E
|
E
W
 
E
A
 
R
E
 
N
A
 
K
E
 
M
R
 
K
R
 
R
R
 
K
S
 
D
L
 
-
G
 
G
I
 
F
P
 
E
I
 
I
D
 
D
Q
 
K
T
 
N
T
 
L
V
 
Y
D
 
N
S
 
Q
F
 
L
N
 
K
Q
 
E
L
 
I
A
 
C
Q
 
N
A
 
E
Y
 
L
G
 
G
V
 
L

P30178 Hydroxycarboxylate dehydrogenase B; 2-oxoglutarate reductase; Hydroxyphenylpyruvate reductase; Phenylpyruvate reductase; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.237 from Escherichia coli (strain K12)
31% identity, 95% coverage: 10:352/361 of query aligns to 6:348/361 of P30178

query
sites
P30178
R
 
R
Y
 
F
G
 
D
A
 
A
D
 
Q
A
 
T
L
 
L
D
 
H
S
 
S
F
 
F
C
 
I
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
R
A
 
Q
A
 
M
G
 
G
A
 
S
D
 
E
E
 
E
A
 
Q
T
 
E
A
 
A
D
 
K
A
 
L
A
 
V
T
 
A
R
 
D
A
 
H
M
 
L
M
 
I
H
 
A
G
 
A
S
 
N
R
 
L
L
 
A
G
 
G
V
 
H
D
 
D
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
R
 
G
L
 
M
L
 
I
G
 
P
H
 
S
Y
 
Y
V
 
V
A
 
R
T
 
S
M
 
W
T
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
N
 
Q
P
 
I
R
 
N
P
 
H
A
 
H
P
 
A
R
 
K
I
 
T
L
 
V
S
 
K
E
 
E
F
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
D
N
 
R
A
 
A
H
 
F
G
 
G
A
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Y
 
H
R
 
E
A
 
A
Q
 
M
E
 
A
K
 
L
A
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
K
A
 
A
G
 
H
R
 
Q
F
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
L
R
 
H
N
 
N
N
 
S
S
 
H
H
 
H
F
 
I
G
|
G
P
x
R
A
x
I
G
 
G
A
 
Y
F
 
W
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
A
 
C
A
 
A
E
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
F
I
 
V
G
 
S
M
 
I
A
 
H
F
 
F
C
 
V
N
 
S
S
 
V
D
 
V
S
 
G
F
 
I
M
 
P
R
 
M
L
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
F
H
 
H
D
 
G
G
 
R
A
 
D
E
 
S
R
 
R
F
 
F
H
 
-
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
F
A
 
C
I
 
V
A
 
V
V
 
F
P
 
P
V
 
R
K
 
K
D
 
D
G
 
N
D
 
F
P
 
P
W
 
L
L
|
L
F
x
L
D
|
D
M
x
Y
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
P
 
A
Y
 
F
N
 
G
R
 
K
V
 
T
Q
 
R
L
 
V
Y
 
A
R
 
W
S
 
H
L
 
K
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
V
P
 
P
E
 
P
A
 
G
T
 
C
A
 
L
S
 
I
D
 
D
P
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
V
D
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
P
 
P
E
 
A
R
 
V
A
 
M
E
 
Q
M
 
E
L
 
-
A
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
G
G
 
S
E
 
L
F
 
L
G
 
T
F
 
F
-
 
A
-
 
E
-
x
H
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
F
 
M
V
 
C
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
A
L
 
L
T
 
S
G
 
G
M
 
G
K
 
K
L
 
T
S
 
T
F
 
H
E
 
Q
I
 
E
L
 
T
P
 
L
M
 
Q
P
 
T
G
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
-
S
 
A
T
 
I
P
 
L
R
x
N
G
 
C
M
 
M
G
 
T
A
 
T
F
 
I
V
 
I
M
 
-
A
 
-
I
 
I
R
 
N
P
 
P
E
 
E
A
 
L
F
 
F
-
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
D
E
 
C
N
 
N
F
 
A
Q
 
Q
D
 
T
N
 
E
M
 
A
A
 
-
R
 
-
Y
 
F
L
 
A
A
 
E
A
 
W
L
 
V
R
 
K
G
 
A
S
 
S
R
 
P
A
 
H
V
 
D
P
 
D
G
 
D
R
 
K
T
 
P
V
 
I
M
 
L
A
 
L
P
 
P
G
|
G
D
x
E
R
x
W
E
|
E
W
 
V
A
 
N
E
 
T
A
 
R
E
 
R
R
 
E
R
 
R
R
 
Q
S
 
K
L
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
L
D
 
D
Q
 
A
T
 
G
T
 
S
V
 
W
D
 
Q
S
 
A
F
 
I
N
 
C
Q
 
D
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
Y
 
I
G
 
G
V
 
M
P
 
P

2g8yA The structure of a putative malate/lactate dehydrogenase from e. Coli.
31% identity, 95% coverage: 10:352/361 of query aligns to 4:346/359 of 2g8yA

query
sites
2g8yA
R
 
R
Y
 
F
G
 
D
A
 
A
D
 
Q
A
 
T
L
 
L
D
 
H
S
 
S
F
 
F
C
 
I
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
R
A
 
Q
A
 
M
G
 
G
A
 
S
D
 
E
E
 
E
A
 
Q
T
 
E
A
 
A
D
 
K
A
 
L
A
 
V
T
 
A
R
 
D
A
 
H
M
 
L
M
 
I
H
 
A
G
 
A
S
 
N
R
 
L
L
 
A
G
 
G
V
x
H
D
 
D
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
R
 
G
L
 
M
L
 
F
G
 
P
H
 
S
Y
 
Y
V
 
V
A
 
R
T
 
S
M
 
W
T
 
S
Q
 
Q
G
 
G
R
 
H
V
 
L
N
 
Q
P
 
I
R
 
N
P
 
H
A
 
H
P
 
A
R
 
K
I
 
T
L
 
V
S
 
K
E
 
E
F
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
G
D
 
D
N
 
R
A
 
A
H
 
F
G
 
G
A
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Y
 
H
R
 
E
A
 
A
Q
 
M
E
 
A
K
 
L
A
 
G
V
 
I
E
 
E
L
 
K
A
 
A
G
 
H
R
 
Q
F
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
I
 
L
R
 
H
N
 
N
N
 
S
S
 
H
H
 
H
F
 
I
G
|
G
P
 
R
A
x
I
G
 
G
A
 
Y
F
 
W
A
 
A
L
 
E
A
 
Q
A
 
C
A
 
A
E
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
F
I
 
V
G
 
S
M
 
I
A
 
H
F
 
F
C
 
V
N
 
S
S
 
V
D
 
V
S
 
G
F
 
I
M
 
P
R
 
M
L
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
F
H
 
H
D
 
G
G
 
R
A
 
D
E
 
S
R
 
R
F
 
F
H
 
-
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
F
A
 
C
I
 
V
A
 
V
V
 
F
P
 
P
V
 
R
K
 
K
D
 
D
G
 
N
D
 
F
P
 
P
W
 
L
L
|
L
F
x
L
D
|
D
M
x
Y
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
P
 
A
Y
 
F
N
 
G
R
 
K
V
 
T
Q
 
R
L
 
V
Y
 
A
R
 
W
S
 
H
L
 
K
G
 
G
I
 
V
P
 
P
L
 
V
P
 
P
E
 
P
A
 
G
T
 
C
A
 
L
S
 
I
D
 
D
P
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
V
D
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
N
P
 
P
E
 
A
R
 
V
A
 
M
E
 
Q
M
 
E
L
 
-
A
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
G
G
 
S
E
 
L
F
 
L
G
 
T
F
 
F
-
 
A
-
 
E
-
x
H
K
 
K
G
 
G
A
x
Y
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
F
 
M
V
 
C
E
 
E
I
 
I
L
 
L
S
 
G
A
 
G
V
 
A
L
 
L
T
 
S
G
 
G
M
 
G
K
 
K
L
 
T
S
 
T
F
 
H
E
 
Q
I
 
E
L
 
T
P
 
L
M
 
Q
P
 
T
G
 
S
P
 
P
D
 
D
L
 
-
S
 
A
T
 
I
P
 
L
R
x
N
G
 
C
M
 
M
G
 
T
A
 
T
F
 
I
V
 
I
M
 
-
A
 
-
I
 
I
R
 
N
P
 
P
E
 
E
A
 
L
F
 
F
-
 
G
L
 
A
P
 
P
Q
 
D
E
 
C
N
 
N
F
 
A
Q
 
Q
D
 
T
N
 
E
M
 
A
A
 
-
R
 
-
Y
 
F
L
 
A
A
 
E
A
 
W
L
 
V
R
 
K
G
 
A
S
 
S
R
 
P
A
 
H
V
 
D
P
 
D
G
 
D
R
 
K
T
 
P
V
 
I
M
 
L
A
 
L
P
 
P
G
|
G
D
 
E
R
 
W
E
|
E
W
 
V
A
 
N
E
 
T
A
 
R
E
 
R
R
 
E
R
 
R
R
 
Q
S
 
K
L
 
Q
G
 
G
I
 
I
P
 
P
I
 
L
D
 
D
Q
 
A
T
 
G
T
 
S
V
 
W
D
 
Q
S
 
A
F
 
I
N
 
C
Q
 
D
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
A
 
Q
Y
 
I
G
 
G
V
 
M
P
 
P

P77555 Ureidoglycolate dehydrogenase (NAD(+)); EC 1.1.1.350 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 89% coverage: 14:334/361 of query aligns to 6:323/349 of P77555

query
sites
P77555
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
H
S
 
Q
F
 
L
C
 
I
R
 
E
A
 
N
V
 
K
F
 
L
L
 
C
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
L
D
 
K
E
 
R
A
 
E
T
 
H
A
 
A
D
 
A
A
 
T
A
 
V
T
 
A
R
 
E
A
 
V
M
 
L
M
 
V
H
 
Y
G
 
A
S
 
D
R
 
A
L
 
R
G
 
G
V
 
I
D
 
H
S
|
S
H
|
H
G
 
G
V
 
A
R
 
V
L
x
R
L
 
V
G
 
E
H
 
Y
Y
|
Y
V
 
A
A
 
E
T
 
R
M
 
I
T
 
S
Q
 
K
G
 
G
R
 
G
V
 
T
N
 
N
P
 
R
R
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
F
R
 
R
I
 
L
L
 
E
S
 
E
E
 
T
F
 
G
G
 
P
A
 
C
V
 
S
A
 
A
T
 
I
L
 
L
D
 
H
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
H
 
A
G
 
G
A
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Y
 
K
R
 
M
A
 
G
Q
 
M
E
 
E
K
 
H
A
 
A
V
 
I
E
 
K
L
 
T
A
 
A
G
 
Q
R
 
Q
F
 
N
G
 
G
I
 
V
G
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
R
 
S
N
 
R
N
 
M
S
 
G
H
|
H
F
 
S
G
 
G
P
 
A
A
 
I
G
 
S
A
 
Y
F
 
F
A
 
V
L
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
C
 
F
I
 
I
G
 
G
M
 
I
A
 
S
F
 
M
C
 
C
N
 
Q
S
|
S
D
|
D
S
 
P
F
 
M
M
 
V
R
 
V
L
 
P
H
 
F
D
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
I
F
 
Y
H
 
Y
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
L
A
 
A
I
 
F
A
 
A
V
 
A
P
 
P
V
 
G
K
 
E
D
 
G
G
 
D
D
 
E
P
 
I
W
 
L
L
 
T
F
 
F
D
 
D
M
 
M
A
 
A
T
 
T
S
 
T
A
 
V
I
 
Q
P
 
A
Y
 
W
N
 
G
R
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
D
Y
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
R
G
 
N
I
 
M
P
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
D
A
 
T
T
 
W
A
 
A
S
 
V
D
 
D
P
 
K
E
 
N
G
 
G
R
 
V
D
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
F
R
 
A
A
 
V
E
 
H
M
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
P
L
 
A
G
 
A
G
 
G
E
 
P
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
M
G
 
M
F
 
M
V
 
I
E
 
D
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
L
G
 
G
M
 
L
K
 
P
L
 
F
S
 
G
F
 
R
E
 
Q
I
 
V
L
 
S
P
 
S
M
|
M
P
 
Y
G
 
-
P
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
H
T
 
A
P
 
G
R
|
R
G
 
N
M
 
L
G
 
G
A
 
Q
F
 
L
V
 
H
M
 
I
A
 
V
I
 
I
R
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
F
F
 
F
L
 
S
P
 
S
Q
 
S
E
 
E
N
 
L
F
 
F
Q
 
R
D
 
Q
N
 
H
M
 
L
A
 
S
R
 
Q
Y
 
T
L
 
M
A
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
A
S
 
I
R
 
T
A
 
P
V
 
A
P
 
P
G
 
G
-
 
F
R
 
N
T
 
Q
V
 
V
M
 
Y
A
 
Y
P
 
P
G
 
G
D
 
Q
R
 
D
E
 
Q
W
 
D
A
 
I
E
 
K
A
 
Q
E
 
R
R
 
K
R
 
A
R
 
A
S
 
V
L
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
E
I
 
I

4fjuA Crystal structure of ureidoglycolate dehydrogenase in ternary complex with nadh and glyoxylate (see paper)
30% identity, 89% coverage: 14:334/361 of query aligns to 6:323/338 of 4fjuA

query
sites
4fjuA
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
H
S
 
Q
F
 
L
C
 
I
R
 
E
A
 
N
V
 
K
F
 
L
L
 
C
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
L
D
 
K
E
 
R
A
 
E
T
 
H
A
 
A
D
 
A
A
 
T
A
 
V
T
 
A
R
 
E
A
 
V
M
 
L
M
 
V
H
 
Y
G
 
A
S
 
D
R
 
A
L
 
R
G
 
G
V
x
I
D
 
H
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
A
R
 
V
L
x
R
L
 
V
G
 
E
H
 
Y
Y
 
Y
V
 
A
A
 
E
T
 
R
M
 
I
T
 
S
Q
 
K
G
 
G
R
 
G
V
 
T
N
 
N
P
 
R
R
 
E
P
 
P
A
 
E
P
 
F
R
 
R
I
 
L
L
 
E
S
 
E
E
 
T
F
 
G
G
 
P
A
 
C
V
 
S
A
 
A
T
 
I
L
 
L
D
 
H
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
H
 
A
G
 
G
A
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
A
Y
 
K
R
 
M
A
 
G
Q
 
M
E
 
E
K
 
H
A
 
A
V
 
I
E
 
K
L
 
T
A
 
A
G
 
Q
R
 
Q
F
 
N
G
 
G
I
 
V
G
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
R
 
S
N
 
R
N
 
M
S
 
G
H
|
H
F
 
S
G
|
G
P
 
A
A
x
I
G
 
S
A
 
Y
F
 
F
A
 
V
L
 
Q
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
C
 
F
I
 
I
G
 
G
M
 
I
A
 
S
F
 
M
C
 
C
N
 
Q
S
|
S
D
|
D
S
 
P
F
 
M
M
 
V
R
 
V
L
 
P
H
x
F
D
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
R
 
I
F
 
Y
H
 
Y
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
L
A
 
A
I
 
F
A
 
A
V
 
A
P
 
P
V
 
G
K
 
E
D
 
G
G
 
D
D
 
E
P
 
I
W
 
L
L
 
T
F
|
F
D
|
D
M
|
M
A
|
A
T
 
T
S
 
T
A
 
V
I
 
Q
P
 
A
Y
 
W
N
 
G
R
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
D
Y
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
R
G
 
N
I
 
M
P
 
S
L
 
I
P
 
P
E
 
D
A
 
T
T
 
W
A
 
A
S
 
V
D
 
D
P
 
K
E
 
N
G
 
G
R
 
V
D
 
P
T
 
T
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
F
R
 
A
A
 
V
E
 
H
M
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
P
L
 
A
G
 
A
G
 
G
E
x
P
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
|
K
G
 
G
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
M
G
 
M
F
 
M
V
 
I
E
 
D
I
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
L
G
 
G
M
 
L
K
 
P
L
 
F
S
 
G
F
 
R
E
 
Q
I
 
V
L
 
S
P
 
S
M
 
M
P
 
Y
G
 
-
P
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
H
T
 
A
P
 
G
R
 
R
G
 
N
M
 
L
G
 
G
A
 
Q
F
 
L
V
 
H
M
 
I
A
 
V
I
 
I
R
 
N
P
 
P
E
 
N
A
 
F
F
 
F
L
 
S
P
 
S
Q
 
S
E
 
E
N
 
L
F
 
F
Q
 
R
D
 
Q
N
 
H
M
 
L
A
 
S
R
 
Q
Y
 
T
L
 
M
A
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
N
G
 
A
S
 
I
R
 
T
A
 
P
V
 
A
P
 
P
G
 
G
-
 
F
R
 
N
T
 
Q
V
 
V
M
x
Y
A
 
Y
P
 
P
G
|
G
D
 
Q
R
x
D
E
x
Q
W
 
D
A
 
I
E
 
K
A
 
Q
E
 
R
R
 
K
R
 
A
R
 
A
S
 
V
L
 
E
G
 
G
I
 
I
P
 
E
I
 
I

2cwfB Crystal structure of delta1-piperideine-2-carboxylate reductase from pseudomonas syringae complexed with NADPH (see paper)
30% identity, 94% coverage: 6:346/361 of query aligns to 2:335/337 of 2cwfB

query
sites
2cwfB
Q
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
R
 
T
Y
 
V
G
 
S
A
 
Y
D
 
P
A
 
Q
L
 
L
D
 
I
S
 
D
F
 
L
C
 
L
R
 
R
A
 
R
V
 
I
F
 
F
L
 
V
A
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
T
D
 
S
E
 
P
A
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
L
T
 
A
R
 
E
A
 
N
M
 
C
M
 
A
H
 
S
G
 
A
S
 
Q
R
 
R
L
 
D
G
 
G
V
 
S
D
 
H
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
R
 
F
L
 
R
L
 
I
G
 
P
H
 
G
Y
 
Y
V
 
L
A
 
S
T
 
S
M
 
L
T
 
A
Q
 
S
G
 
G
R
 
W
V
 
V
N
 
D
P
 
G
R
 
K
P
 
A
A
 
V
P
 
P
R
 
V
I
 
V
L
 
E
S
 
D
E
 
V
F
 
G
G
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
V
T
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
C
N
 
N
A
 
G
H
 
F
G
 
A
A
 
Q
L
 
P
G
 
A
A
 
L
Y
 
A
R
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
S
K
 
L
A
 
L
V
 
I
E
 
D
L
 
K
A
 
A
G
 
R
R
 
S
F
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
A
A
 
I
V
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
G
N
 
S
S
 
H
H
|
H
F
 
F
G
x
A
P
x
A
A
x
L
G
 
W
A
 
P
F
 
D
A
 
V
L
 
E
A
 
P
A
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
C
 
L
I
 
V
G
 
A
M
 
L
A
 
S
F
 
M
C
 
V
N
 
N
S
 
S
D
 
M
S
 
T
F
 
C
M
 
V
R
 
V
L
 
P
H
 
H
D
 
G
G
 
A
A
 
R
E
 
Q
R
 
P
F
 
L
H
 
F
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
I
 
F
A
 
G
V
 
A
P
 
P
V
 
R
K
 
A
D
 
G
G
 
G
D
 
E
P
 
P
W
 
I
L
 
V
F
|
F
D
|
D
M
x
L
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
P
 
A
Y
 
H
N
 
G
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
I
Y
 
A
R
 
A
S
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
R
P
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
G
T
 
M
A
 
G
S
 
V
D
 
D
P
 
R
E
 
D
G
 
G
R
 
L
D
 
P
T
 
T
T
 
Q
D
 
E
P
 
P
E
 
-
R
 
R
A
 
A
E
 
I
M
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
P
L
 
F
G
 
G
G
 
G
E
x
H
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
|
K
G
 
G
A
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
S
G
 
M
F
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
G
K
 
N
L
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
F
L
 
D
P
 
W
M
 
S
P
 
K
G
 
H
P
 
P
D
 
G
L
 
A
S
 
Q
T
 
T
P
 
P
R
 
W
G
 
-
M
 
T
G
 
G
A
 
Q
F
 
L
V
 
L
M
 
I
A
 
V
I
 
I
R
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
K
F
 
G
L
 
A
P
 
G
Q
 
Q
E
 
H
N
 
F
F
 
A
Q
 
Q
-
 
R
-
 
S
D
 
E
N
 
E
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
Q
L
 
L
A
 
H
A
 
G
L
 
V
R
 
G
G
 
Q
S
 
E
R
|
R
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
M
 
-
A
 
L
P
 
P
G
|
G
D
 
D
R
|
R
E
x
R
W
 
Y
A
 
L
E
 
E
A
 
R
E
 
A
R
 
R
R
 
S
R
 
M
S
 
A
L
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
V
I
 
I
D
 
A
Q
 
Q
T
 
A
T
 
D
V
 
L
D
 
E
S
 
R
F
 
L
N
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
 
A

Q4U331 Delta(1)-pyrroline-2-carboxylate/Delta(1)-piperideine-2-carboxylate reductase; Pyr2C/Pip2C reductase; N-methyl-L-amino acid dehydrogenase; EC 1.5.1.21; EC 1.4.1.17 from Pseudomonas syringae pv. tomato (see paper)
30% identity, 94% coverage: 6:346/361 of query aligns to 8:341/343 of Q4U331

query
sites
Q4U331
Q
 
Q
P
 
P
T
 
T
A
 
Q
R
 
T
Y
 
V
G
 
S
A
 
Y
D
 
P
A
 
Q
L
 
L
D
 
I
S
 
D
F
 
L
C
 
L
R
 
R
A
 
R
V
 
I
F
 
F
L
 
V
A
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
T
D
 
S
E
 
P
A
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
L
T
 
A
R
 
E
A
 
N
M
 
C
M
 
A
H
 
S
G
 
A
S
 
Q
R
 
R
L
 
D
G
 
G
V
 
S
D
 
H
S
 
S
H
 
H
G
 
G
V
 
I
R
 
F
L
 
R
L
 
I
G
 
P
H
 
G
Y
 
Y
V
 
L
A
 
S
T
 
S
M
 
L
T
 
A
Q
 
S
G
 
G
R
 
W
V
 
V
N
 
D
P
 
G
R
 
K
P
 
A
A
 
V
P
 
P
R
 
V
I
 
V
L
 
E
S
 
D
E
 
V
F
 
G
G
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
V
T
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
C
N
 
N
A
 
G
H
 
F
G
 
A
A
 
Q
L
 
P
G
 
A
A
 
L
Y
 
A
R
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
S
K
 
L
A
 
L
V
 
I
E
 
D
L
 
K
A
 
A
G
 
R
R
 
S
F
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
A
A
 
I
V
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
G
N
 
S
S
 
H
H
|
H
F
|
F
G
x
A
P
x
A
A
x
L
G
 
W
A
 
P
F
 
D
A
 
V
L
 
E
A
 
P
A
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
C
 
L
I
 
V
G
 
A
M
 
L
A
 
S
F
 
M
C
 
V
N
 
N
S
 
S
D
 
M
S
 
T
F
 
C
M
 
V
R
 
V
L
 
P
H
 
H
D
 
G
G
 
A
A
 
R
E
 
Q
R
 
P
F
 
L
H
 
F
G
 
G
T
 
T
N
 
N
P
 
P
I
 
I
A
 
A
I
 
F
A
 
G
V
 
A
P
 
P
V
 
R
K
 
A
D
 
G
G
 
G
D
 
E
P
 
P
W
 
I
L
 
V
F
 
F
D
|
D
M
x
L
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
P
 
A
Y
 
H
N
 
G
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
I
Y
 
A
R
 
A
S
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
R
P
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
G
T
 
M
A
 
G
S
 
V
D
 
D
P
 
R
E
 
D
G
 
G
R
 
L
D
 
P
T
 
T
T
 
Q
D
 
E
P
 
P
E
 
-
R
 
R
A
 
A
E
 
I
M
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
P
L
 
F
G
 
G
G
 
G
E
x
H
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
|
K
G
 
G
A
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
S
G
 
M
F
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
G
K
 
N
L
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
F
L
 
D
P
 
W
M
 
S
P
 
K
G
 
H
P
 
P
D
 
G
L
 
A
S
 
Q
T
 
T
P
 
P
R
 
W
G
 
-
M
 
T
G
 
G
A
 
Q
F
 
L
V
 
L
M
 
I
A
 
V
I
 
I
R
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
K
F
 
G
L
 
A
P
 
G
Q
 
Q
E
 
H
N
 
F
F
 
A
Q
 
Q
-
 
R
-
 
S
D
 
E
N
 
E
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
Q
L
 
L
A
 
H
A
 
G
L
 
V
R
 
G
G
 
Q
S
 
E
R
|
R
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
M
 
-
A
x
L
P
|
P
G
|
G
D
|
D
R
|
R
E
x
R
W
 
Y
A
 
L
E
 
E
A
 
R
E
 
A
R
 
R
R
 
S
R
 
M
S
 
A
L
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
V
I
 
I
D
 
A
Q
 
Q
T
 
A
T
 
D
V
 
L
D
 
E
S
 
R
F
 
L
N
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
 
A

1s20G A novel NAD binding protein revealed by the crystal structure of e. Coli 2,3-diketogulonate reductase (yiak) northeast structural genomics consortium target er82 (see paper)
28% identity, 88% coverage: 23:338/361 of query aligns to 15:325/335 of 1s20G

query
sites
1s20G
V
 
V
F
 
L
L
 
I
A
 
S
A
 
R
G
 
G
A
 
V
D
 
D
E
 
S
A
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
C
T
 
A
R
 
E
A
 
M
M
 
F
M
 
A
H
 
R
G
 
T
S
 
T
R
 
E
L
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
Y
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
V
R
 
N
L
 
R
L
 
F
G
 
P
H
 
R
Y
 
F
V
 
I
A
 
Q
T
 
Q
M
 
L
T
 
E
Q
 
N
G
 
G
R
 
D
V
 
I
N
 
I
P
 
P
R
 
D
P
 
A
A
 
Q
P
 
P
R
 
K
I
 
R
L
 
I
S
 
T
E
 
S
F
 
L
G
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
E
T
 
Q
L
 
W
D
 
D
A
 
A
D
 
Q
N
 
R
A
 
S
H
 
I
G
 
G
A
 
N
L
 
L
G
 
T
A
 
A
Y
 
K
R
 
K
A
 
M
Q
 
M
E
 
D
K
 
R
A
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
A
R
 
D
F
 
H
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
L
R
 
R
N
 
N
N
 
A
S
 
N
H
|
H
F
 
W
G
 
M
P
 
R
A
 
G
G
 
G
A
 
S
F
 
Y
A
 
G
L
 
W
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
K
G
 
G
C
 
Y
I
 
I
G
 
G
M
 
I
A
 
C
F
 
W
C
 
T
N
 
N
S
 
S
D
 
I
S
 
A
F
 
V
M
 
M
R
 
P
L
 
P
H
x
W
D
 
G
G
 
A
A
 
K
E
 
E
R
 
C
F
 
R
H
 
I
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
L
A
 
I
I
 
V
A
 
A
V
 
I
P
 
P
V
 
S
K
 
T
D
 
P
G
 
I
D
 
T
P
 
-
W
 
-
L
 
M
F
 
V
D
|
D
M
|
M
A
x
S
T
 
M
S
 
S
A
 
M
I
 
F
P
 
S
Y
 
Y
N
 
G
R
 
M
V
 
L
Q
 
E
L
 
V
Y
 
N
R
 
R
S
 
L
L
 
A
G
 
G
I
 
R
P
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
V
A
 
D
T
 
G
A
 
G
S
 
F
D
 
D
P
 
D
E
 
E
G
 
G
R
 
N
D
 
L
T
 
T
T
 
K
D
 
E
P
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
N
E
 
R
M
 
R
L
 
I
A
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
G
G
 
-
E
 
-
F
 
-
G
 
Y
F
x
W
K
|
K
G
 
G
A
 
S
G
 
G
L
 
M
A
 
S
G
 
I
F
 
V
V
 
L
E
 
D
I
 
M
L
 
I
S
 
A
A
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
S
G
 
D
M
 
G
K
 
A
L
 
S
S
 
V
F
 
A
E
 
E
I
 
V
L
 
T
P
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
Q
D
 
D
L
 
N
S
 
S
T
 
D
P
 
E
R
 
Y
G
 
G
M
 
I
G
 
S
A
 
Q
F
 
I
V
 
F
M
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
E
P
 
V
E
 
D
A
 
K
F
 
L
L
 
I
P
 
D
Q
 
G
E
 
P
N
 
T
F
 
R
Q
 
D
D
 
A
N
 
K
M
 
L
A
 
Q
R
 
R
Y
 
I
L
 
M
A
 
D
A
 
Y
L
 
V
R
 
T
G
 
S
S
 
A
-
 
E
R
 
R
A
 
A
V
 
D
P
 
E
G
 
N
R
 
Q
T
 
A
V
 
I
M
x
R
A
 
L
P
 
P
G
|
G
D
 
-
R
 
H
E
|
E
W
 
F
A
 
T
E
 
T
-
 
L
-
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
N
R
 
R
R
 
R
S
 
N
L
 
-
G
 
G
I
 
I
P
 
T
I
 
V
D
 
D
Q
 
D
T
 
S
T
 
V

2cwhA Crystal structure of delta1-piperideine-2-carboxylate reductase from pseudomonas syringae complexed with NADPH and pyrrole-2-carboxylate (see paper)
30% identity, 92% coverage: 16:346/361 of query aligns to 9:332/332 of 2cwhA

query
sites
2cwhA
L
 
L
D
 
I
S
 
D
F
 
L
C
 
L
R
 
R
A
 
R
V
 
I
F
 
F
L
 
V
A
 
V
A
 
H
G
 
G
A
 
T
D
 
S
E
 
P
A
 
E
T
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
V
A
 
L
T
 
A
R
 
E
A
 
N
M
 
C
M
 
A
H
 
S
G
 
A
S
 
Q
R
 
R
L
 
D
G
 
G
V
 
S
D
 
H
S
 
S
H
|
H
G
 
G
V
 
I
R
 
F
L
x
R
L
 
I
G
 
P
H
 
G
Y
 
Y
V
 
L
A
 
S
T
 
S
M
 
L
T
 
A
Q
 
S
G
 
G
R
 
W
V
 
V
N
 
D
P
 
G
R
 
K
P
 
A
A
 
V
P
 
P
R
 
V
I
 
V
L
 
E
S
 
D
E
 
V
F
 
G
G
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
V
T
 
R
L
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
C
N
 
N
A
 
G
H
 
F
G
 
A
A
 
Q
L
 
P
G
 
A
A
 
L
Y
 
A
R
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
S
K
 
L
A
 
L
V
 
I
E
 
D
L
 
K
A
 
A
G
 
R
R
 
S
F
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
A
A
 
I
V
 
L
A
 
A
I
 
I
R
 
R
N
 
G
N
 
S
S
 
H
H
 
H
F
 
F
G
x
A
P
x
A
A
x
L
G
 
W
A
 
P
F
 
D
A
 
V
L
 
E
A
 
P
A
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
G
 
G
C
 
L
I
 
V
G
 
A
M
 
L
A
 
S
F
 
M
C
 
V
N
 
N
S
 
S
D
x
M
S
 
T
F
 
C
M
 
V
R
 
V
L
 
P
H
|
H
D
 
G
G
 
A
A
 
R
E
 
Q
R
 
P
F
 
L
H
 
F
G
 
G
T
|
T
N
 
N
P
|
P
I
 
I
A
 
A
I
 
F
A
 
G
V
 
A
P
 
P
V
 
R
K
 
A
D
 
G
G
 
G
D
 
E
P
 
P
W
 
I
L
 
V
F
|
F
D
|
D
M
x
L
A
|
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
I
 
I
P
 
A
Y
x
H
N
x
G
R
 
D
V
 
V
Q
 
Q
L
 
I
Y
 
A
R
 
A
S
 
R
L
 
E
G
 
G
I
 
R
P
 
L
L
 
L
P
 
P
E
 
A
A
 
G
T
 
M
A
 
G
S
 
V
D
 
D
P
 
R
E
 
D
G
 
G
R
 
L
D
 
P
T
 
T
T
 
Q
D
 
E
P
 
P
E
 
-
R
 
R
A
 
A
E
 
I
M
 
L
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
P
L
 
F
G
 
G
G
 
G
E
x
H
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
|
K
G
 
G
A
 
S
G
 
A
L
 
L
A
 
S
G
 
M
F
 
M
V
 
V
E
 
E
I
 
L
L
 
L
S
 
A
A
 
A
V
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
M
 
G
K
 
N
L
 
F
S
 
S
F
 
F
E
 
E
I
 
F
L
 
D
P
 
W
M
 
S
P
 
K
G
 
H
P
 
P
D
 
G
L
 
A
S
 
Q
T
 
T
P
 
P
R
 
W
G
 
-
M
 
T
G
 
G
A
 
Q
F
 
L
V
 
L
M
 
I
A
 
V
I
 
I
R
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
K
F
 
G
L
 
A
P
 
G
Q
 
Q
E
 
H
N
 
F
F
 
A
Q
 
Q
-
 
R
-
 
S
D
 
E
N
 
E
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
Q
L
 
L
A
 
H
A
 
G
L
 
V
R
 
G
G
 
Q
S
 
E
R
|
R
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
M
 
-
A
 
L
P
 
P
G
|
G
D
 
D
R
|
R
E
x
R
W
 
Y
A
 
L
E
 
E
A
 
R
E
 
A
R
 
R
R
 
S
R
 
M
S
 
A
L
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
V
I
 
I
D
 
A
Q
 
Q
T
 
A
T
 
D
V
 
L
D
 
E
S
 
R
F
 
L
N
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
 
A

Query Sequence

>AZOBR_RS04630 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS04630
VTGPAQPTARYGADALDSFCRAVFLAAGADEATADAATRAMMHGSRLGVDSHGVRLLGHY
VATMTQGRVNPRPAPRILSEFGAVATLDADNAHGALGAYRAQEKAVELAGRFGIGAVAIR
NNSHFGPAGAFALAAAEAGCIGMAFCNSDSFMRLHDGAERFHGTNPIAIAVPVKDGDPWL
FDMATSAIPYNRVQLYRSLGIPLPEATASDPEGRDTTDPERAEMLAPLGGEFGFKGAGLA
GFVEILSAVLTGMKLSFEILPMPGPDLSTPRGMGAFVMAIRPEAFLPQENFQDNMARYLA
ALRGSRAVPGRTVMAPGDREWAEAERRRSLGIPIDQTTVDSFNQLAQAYGVPAPAPAASP
S

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory