SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS05730 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS05730 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

7qh2C Cryo-em structure of ldh-etfab complex from acetobacterium woodii (see paper)
29% identity, 45% coverage: 6:193/417 of query aligns to 49:228/467 of 7qh2C

query
sites
7qh2C
V
 
I
K
 
K
P
 
V
D
 
T
S
 
S
A
 
T
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
A
 
S
D
 
K
A
 
I
V
 
M
R
 
K
W
 
Y
A
 
A
L
 
Y
S
 
E
E
 
H
G
 
N
T
 
I
P
 
P
L
 
V
D
 
V
V
|
V
A
 
R
G
|
G
S
|
S
G
|
G
S
x
T
K
x
G
R
x
L
-
 
V
G
 
G
L
x
A
G
x
C
R
 
V
P
 
P
I
 
L
Q
 
F
T
 
G
A
 
G
Y
 
I
T
 
M
L
 
L
D
 
E
L
 
T
S
 
T
G
 
L
L
 
M
S
 
N
G
 
N
V
 
I
V
 
L
A
 
E
Y
 
L
E
 
D
A
 
T
E
 
E
E
 
N
L
 
L
V
 
T
L
 
V
T
 
T
A
 
V
R
 
E
A
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
L
M
 
L
A
 
M
E
 
E
I
 
L
L
 
S
P
 
K
M
 
F
L
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
N
R
 
D
Q
 
-
Q
 
-
F
 
-
A
 
L
F
 
F
E
 
Y
P
 
P
Q
 
P
D
 
D
L
x
P
G
|
G
P
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
|
E
G
 
K
Q
 
S
G
x
A
T
|
T
L
 
I
G
 
A
G
|
G
V
x
N
I
 
I
S
|
S
C
x
T
G
 
N
L
x
A
A
x
G
G
 
G
P
 
M
R
 
R
R
 
A
I
 
V
S
 
K
A
 
Y
G
 
G
S
 
V
A
 
T
R
 
R
D
 
D
H
 
Y
T
 
V
L
 
R
G
 
G
I
 
L
E
 
T
G
 
V
V
 
V
N
 
L
G
 
A
R
 
N
G
 
G
D
 
E
L
 
I
Y
 
I
K
 
E
G
 
L
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
I
V
 
V
K
 
K
N
 
N
V
 
S
T
 
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
S
V
 
L
P
 
K
K
 
D
L
 
L
M
 
V
A
 
I
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
T
 
C
V
 
V
L
x
I
T
 
T
E
 
K
L
 
A
T
 
I
V
 
L
K
 
K
V
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
S
 
P
E
 
K
D
 
M
V
 
T
R
 
L
T
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P9WIT1 Uncharacterized FAD-linked oxidoreductase Rv2280; EC 1.-.-.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
26% identity, 42% coverage: 7:183/417 of query aligns to 45:213/459 of P9WIT1

query
sites
P9WIT1
K
 
K
P
 
P
D
 
A
S
 
T
A
 
P
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
D
 
Q
A
 
L
V
 
L
R
 
K
W
 
A
A
 
A
L
 
S
S
 
E
E
 
N
G
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
V
D
 
T
V
 
A
A
 
R
G
 
G
S
 
S
G
 
G
S
 
C
-
 
G
K
 
L
R
 
S
G
 
G
L
 
A
G
 
A
R
 
R
P
 
P
I
 
V
Q
 
E
T
 
G
A
 
G
Y
 
L
T
 
L
L
 
I
D
 
S
L
 
F
S
 
D
G
 
R
L
 
M
S
 
N
G
 
K
V
 
V
V
 
L
A
 
E
Y
 
V
E
 
D
A
 
T
E
 
A
E
 
N
L
 
Q
V
 
V
L
 
A
T
 
V
A
 
V
R
 
Q
A
 
P
G
 
G
T
 
V
P
 
A
M
 
L
A
 
T
E
 
D
I
 
L
L
 
D
P
 
A
M
 
A
L
 
T
A
 
A
E
 
D
R
 
T
R
 
G
Q
 
L
Q
 
R
F
 
Y
A
 
T
F
 
V
E
 
Y
P
 
P
Q
 
G
D
 
E
L
 
L
G
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
Q
 
S
G
 
S
T
 
S
L
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
N
I
 
V
S
 
G
C
 
T
G
 
N
L
 
A
A
 
G
G
 
G
P
 
M
R
 
R
R
 
A
I
 
V
S
 
K
A
 
Y
G
 
G
S
 
V
A
 
A
R
 
R
D
 
H
H
 
N
T
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
Q
G
 
A
V
 
V
N
 
L
G
 
P
R
 
T
G
 
G
D
 
E
L
 
I
Y
 
I
K
 
R
G
 
T
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
M
V
 
A
K
 
K
N
 
V
V
 
S
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
T
K
 
Q
L
 
L
M
 
I
A
 
I
G
 
G
S
 
S
F
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
L
T
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
E
 
E
L
 
V
T
 
I
V
 
V
K
 
K
V
 
L
L
 
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3pm9A Crystal structure of a putative dehydrogenase (rpa1076) from rhodopseudomonas palustris cga009 at 2.57 a resolution
32% identity, 32% coverage: 82:216/417 of query aligns to 114:262/465 of 3pm9A

query
sites
3pm9A
L
 
I
A
 
L
E
 
Q
R
 
R
R
 
V
Q
 
Q
Q
 
E
F
 
K
A
 
A
F
 
A
E
 
E
P
 
V
Q
 
D
D
 
R
L
 
L
G
 
F
P
 
P
L
 
L
F
 
S
G
x
L
R
x
G
P
x
A
E
 
Q
G
 
G
Q
 
S
G
x
C
T
|
T
L
 
I
G
|
G
G
|
G
V
 
N
I
 
L
S
|
S
C
x
T
G
 
N
L
x
A
A
x
G
G
 
G
P
 
T
R
 
A
R
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
Y
G
 
G
S
x
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
H
 
M
T
 
A
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
E
G
 
V
V
 
V
N
 
L
G
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
R
L
 
V
Y
 
M
K
 
N
G
 
L
G
 
L
G
 
S
K
 
K
V
 
L
V
 
K
K
 
K
N
 
D
V
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
R
K
 
D
L
 
L
M
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
A
F
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
T
 
G
V
x
I
L
x
I
T
 
T
E
 
A
L
 
A
T
 
T
V
 
L
K
 
K
V
 
L
L
 
F
P
 
P
A
 
K
S
 
P
E
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
E
T
 
T
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
Q
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
L
L
 
L
L
 
G
L
 
I
A
 
A
G
 
Q
R
 
G
E
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
N
V
 
L
A
 
T
A
 
S
L
 
F
T
 
E
A
 
L
A
 
I
L
 
A
Q
 
E
S
 
T
P
 
P
Y
 
L
D
 
D
V
 
F
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Q8N465 D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial; EC 1.1.99.39 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
24% identity, 45% coverage: 6:193/417 of query aligns to 104:284/521 of Q8N465

query
sites
Q8N465
V
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
R
S
 
T
A
x
S
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
A
 
S
D
 
H
A
 
I
V
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
C
L
 
H
S
 
E
E
 
R
G
 
N
T
 
L
P
 
A
L
 
V
D
x
N
V
 
P
A
 
Q
G
 
G
S
x
G
G
 
N
S
 
T
K
 
G
R
 
M
-
 
V
G
 
G
L
 
G
G
 
S
R
 
V
P
 
P
I
 
V
Q
 
F
T
 
D
A
 
E
Y
 
I
T
x
I
L
 
L
D
 
S
L
 
T
S
 
A
G
 
R
L
x
M
S
 
N
G
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
S
Y
 
F
E
 
H
A
 
S
E
 
V
E
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
C
R
x
Q
A
|
A
G
|
G
T
x
C
P
x
V
M
x
L
A
x
E
E
|
E
I
x
L
L
x
S
P
x
R
M
x
Y
L
x
V
A
x
E
E
|
E
R
|
R
R
 
-
Q
 
-
Q
x
D
F
|
F
A
x
I
F
x
M
E
 
-
P
|
P
Q
x
L
D
|
D
L
|
L
G
|
G
P
x
A
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
x
K
G
|
G
Q
x
S
G
x
C
T
x
H
L
x
I
G
|
G
G
|
G
V
x
N
I
x
V
S
x
A
C
x
T
G
x
N
L
x
A
A
x
G
G
|
G
P
x
L
R
|
R
R
x
F
I
x
L
S
x
R
A
x
Y
G
|
G
S
|
S
A
x
L
R
x
H
D
x
G
H
x
T
T
x
V
L
|
L
G
|
G
I
x
L
E
|
E
G
x
V
V
|
V
N
x
L
G
x
A
R
x
D
G
|
G
D
x
T
L
x
V
Y
x
L
K
x
D
G
x
C
G
x
L
G
x
T
K
x
S
V
x
L
V
x
R
K
|
K
N
x
D
V
x
N
T
|
T
G
|
G
Y
|
Y
D
|
D
V
x
L
P
x
K
K
x
Q
L
|
L
M
x
F
A
x
I
G
|
G
S
|
S
F
x
E
G
|
G
T
|
T
L
|
L
T
x
G
V
x
I
L
x
I
T
|
T
E
x
T
L
x
V
T
x
S
V
x
I
K
x
L
V
x
C
L
x
P
P
|
P
A
x
K
S
x
P
E
x
R
D
x
A
V
|
V
R
x
N
T
x
V
L
x
A
L
x
F
L
|
L

Sites not aligning to the query:

6lpnB Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in apo form (see paper)
24% identity, 45% coverage: 6:193/417 of query aligns to 52:232/467 of 6lpnB

query
sites
6lpnB
V
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
R
S
 
T
A
 
S
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
A
 
S
D
 
H
A
 
I
V
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
C
L
 
H
S
 
E
E
 
R
G
 
N
T
 
L
P
 
A
L
 
V
D
 
N
V
x
P
A
 
Q
G
|
G
S
x
G
G
x
N
S
x
T
K
x
G
R
x
M
-
 
V
G
 
G
L
x
G
G
x
S
R
 
V
P
 
P
I
 
V
Q
 
F
T
 
D
A
 
E
Y
 
I
T
 
I
L
 
L
D
 
S
L
 
T
S
 
A
G
 
R
L
 
M
S
 
N
G
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
S
Y
 
F
E
 
H
A
 
S
E
 
V
E
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
C
P
 
V
M
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
S
P
 
R
M
 
Y
L
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
-
Q
 
-
Q
 
D
F
 
F
A
 
I
F
 
M
E
 
-
P
 
P
Q
 
L
D
 
D
L
|
L
G
 
G
P
x
A
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
K
G
 
G
Q
 
S
G
x
C
T
x
H
L
 
I
G
 
G
G
|
G
V
x
N
I
 
V
S
x
A
C
x
T
G
 
N
L
 
A
A
 
G
G
 
G
P
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
L
S
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
D
 
G
H
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
E
G
 
V
V
 
V
N
 
L
G
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
V
Y
 
L
K
 
D
G
 
C
G
 
L
G
 
T
K
 
S
V
 
L
V
 
R
K
 
K
N
 
D
V
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
K
K
 
Q
L
 
L
M
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
S
F
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
T
 
G
V
x
I
L
x
I
T
 
T
E
 
T
L
 
V
T
 
S
V
 
I
K
 
L
V
 
C
L
 
P
P
 
P
A
 
K
S
 
P
E
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
N
T
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6lpxA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with 2-oxoglutarate (2-og) (see paper)
24% identity, 45% coverage: 6:193/417 of query aligns to 51:231/466 of 6lpxA

query
sites
6lpxA
V
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
R
S
 
T
A
 
S
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
A
 
S
D
 
H
A
 
I
V
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
C
L
 
H
S
 
E
E
 
R
G
 
N
T
 
L
P
 
A
L
 
V
D
 
N
V
x
P
A
x
Q
G
|
G
S
x
G
G
x
N
S
x
T
K
x
G
R
x
M
-
 
V
G
 
G
L
x
G
G
x
S
R
 
V
P
 
P
I
 
V
Q
 
F
T
 
D
A
 
E
Y
 
I
T
 
I
L
 
L
D
 
S
L
 
T
S
 
A
G
 
R
L
 
M
S
 
N
G
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
S
Y
 
F
E
 
H
A
 
S
E
 
V
E
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
C
P
 
V
M
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
S
P
 
R
M
 
Y
L
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
-
Q
 
-
Q
 
D
F
 
F
A
 
I
F
 
M
E
 
-
P
 
P
Q
 
L
D
 
D
L
|
L
G
|
G
P
x
A
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
K
G
 
G
Q
 
S
G
x
C
T
 
H
L
 
I
G
 
G
G
|
G
V
x
N
I
 
V
S
x
A
C
x
T
G
 
N
L
 
A
A
 
G
G
|
G
P
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
L
S
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
D
 
G
H
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
E
G
 
V
V
 
V
N
 
L
G
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
V
Y
 
L
K
 
D
G
 
C
G
 
L
G
 
T
K
 
S
V
 
L
V
 
R
K
 
K
N
 
D
V
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
K
K
 
Q
L
 
L
M
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
S
F
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
T
 
G
V
 
I
L
x
I
T
 
T
E
 
T
L
 
V
T
 
S
V
 
I
K
 
L
V
 
C
L
 
P
P
 
P
A
 
K
S
 
P
E
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
N
T
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6lpuA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with l-2-hydroxyglutarate (l-2-hg) (see paper)
24% identity, 45% coverage: 6:193/417 of query aligns to 51:231/466 of 6lpuA

query
sites
6lpuA
V
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
R
S
 
T
A
 
S
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
A
 
S
D
 
H
A
 
I
V
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
C
L
 
H
S
 
E
E
 
R
G
 
N
T
 
L
P
 
A
L
 
V
D
 
N
V
x
P
A
 
Q
G
|
G
S
x
G
G
x
N
S
x
T
K
x
G
R
 
M
-
 
V
G
 
G
L
x
G
G
x
S
R
 
V
P
 
P
I
 
V
Q
 
F
T
 
D
A
 
E
Y
 
I
T
 
I
L
 
L
D
 
S
L
 
T
S
 
A
G
 
R
L
 
M
S
 
N
G
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
S
Y
 
F
E
 
H
A
 
S
E
 
V
E
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
C
P
 
V
M
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
S
P
 
R
M
 
Y
L
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
-
Q
 
-
Q
 
D
F
 
F
A
 
I
F
 
M
E
 
-
P
 
P
Q
 
L
D
 
D
L
|
L
G
|
G
P
x
A
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
K
G
 
G
Q
 
S
G
x
C
T
x
H
L
 
I
G
|
G
G
|
G
V
x
N
I
 
V
S
x
A
C
x
T
G
 
N
L
x
A
A
 
G
G
 
G
P
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
L
S
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
D
 
G
H
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
E
G
 
V
V
 
V
N
 
L
G
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
V
Y
 
L
K
 
D
G
 
C
G
 
L
G
 
T
K
 
S
V
 
L
V
 
R
K
 
K
N
 
D
V
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
K
K
 
Q
L
 
L
M
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
T
 
G
V
x
I
L
x
I
T
 
T
E
 
T
L
 
V
T
 
S
V
 
I
K
 
L
V
 
C
L
 
P
P
 
P
A
 
K
S
 
P
E
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
N
T
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6lpqA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with d-malate (d-mal) (see paper)
24% identity, 45% coverage: 6:193/417 of query aligns to 51:231/466 of 6lpqA

query
sites
6lpqA
V
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
R
S
 
T
A
 
S
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
A
 
S
D
 
H
A
 
I
V
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
C
L
 
H
S
 
E
E
 
R
G
 
N
T
 
L
P
 
A
L
 
V
D
 
N
V
x
P
A
 
Q
G
|
G
S
x
G
G
x
N
S
x
T
K
x
G
R
x
M
-
 
V
G
 
G
L
x
G
G
x
S
R
 
V
P
 
P
I
 
V
Q
 
F
T
 
D
A
 
E
Y
 
I
T
 
I
L
 
L
D
 
S
L
 
T
S
 
A
G
 
R
L
 
M
S
 
N
G
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
S
Y
 
F
E
 
H
A
 
S
E
 
V
E
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
C
P
 
V
M
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
S
P
 
R
M
 
Y
L
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
-
Q
 
-
Q
 
D
F
 
F
A
 
I
F
 
M
E
 
-
P
 
P
Q
 
L
D
 
D
L
|
L
G
|
G
P
x
A
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
K
G
 
G
Q
 
S
G
x
C
T
x
H
L
 
I
G
 
G
G
|
G
V
x
N
I
 
V
S
x
A
C
x
T
G
 
N
L
x
A
A
 
G
G
|
G
P
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
L
S
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
D
 
G
H
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
E
G
 
V
V
 
V
N
 
L
G
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
V
Y
 
L
K
 
D
G
 
C
G
 
L
G
 
T
K
 
S
V
 
L
V
 
R
K
 
K
N
 
D
V
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
K
K
 
Q
L
 
L
M
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
S
F
x
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
T
 
G
V
x
I
L
x
I
T
 
T
E
 
T
L
 
V
T
 
S
V
 
I
K
 
L
V
 
C
L
 
P
P
 
P
A
 
K
S
 
P
E
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
N
T
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6lppA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with d-2-hydroxyglutarate (d-2-hg) (see paper)
24% identity, 45% coverage: 6:193/417 of query aligns to 51:231/466 of 6lppA

query
sites
6lppA
V
 
L
K
 
R
P
 
P
D
 
R
S
 
T
A
 
S
A
 
E
Q
 
E
A
 
V
A
 
S
D
 
H
A
 
I
V
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
C
L
 
H
S
 
E
E
 
R
G
 
N
T
 
L
P
 
A
L
 
V
D
 
N
V
x
P
A
 
Q
G
|
G
S
x
G
G
x
N
S
x
T
K
x
G
R
x
M
-
 
V
G
 
G
L
x
G
G
x
S
R
 
V
P
 
P
I
 
V
Q
 
F
T
 
D
A
 
E
Y
 
I
T
 
I
L
 
L
D
 
S
L
 
T
S
 
A
G
 
R
L
 
M
S
 
N
G
 
R
V
 
V
V
 
L
A
 
S
Y
 
F
E
 
H
A
 
S
E
 
V
E
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
T
 
V
A
 
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
T
 
C
P
 
V
M
 
L
A
 
E
E
 
E
I
 
L
L
 
S
P
 
R
M
 
Y
L
 
V
A
 
E
E
 
E
R
 
R
R
 
-
Q
 
-
Q
 
D
F
 
F
A
 
I
F
 
M
E
 
-
P
 
P
Q
 
L
D
 
D
L
|
L
G
|
G
P
x
A
L
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
K
G
 
G
Q
 
S
G
x
C
T
 
H
L
 
I
G
 
G
G
|
G
V
x
N
I
 
V
S
x
A
C
x
T
G
 
N
L
x
A
A
 
G
G
|
G
P
 
L
R
 
R
R
 
F
I
 
L
S
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
D
 
G
H
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
E
G
 
V
V
 
V
N
 
L
G
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
V
Y
 
L
K
 
D
G
 
C
G
 
L
G
 
T
K
 
S
V
 
L
V
 
R
K
 
K
N
 
D
V
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
K
K
 
Q
L
 
L
M
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
S
F
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
T
 
G
V
 
I
L
x
I
T
 
T
E
 
T
L
 
V
T
 
S
V
 
I
K
 
L
V
 
C
L
 
P
P
 
P
A
 
K
S
 
P
E
 
R
D
 
A
V
 
V
R
 
N
T
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P39976 D-2-hydroxyglutarate--pyruvate transhydrogenase DLD3; D-2HG--pyruvate transhydrogenase DLD3; (R)-2-hydroxyglutarate--pyruvate transhydrogenase; D-lactate dehydrogenase [cytochrome] 3; D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase; D-LCR; EC 1.1.99.40; EC 1.1.2.4 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
25% identity, 36% coverage: 63:211/417 of query aligns to 112:269/496 of P39976

query
sites
P39976
E
 
D
E
 
E
L
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
S
A
 
L
R
 
R
A
 
N
G
 
M
T
 
N
P
 
K
M
 
V
A
 
R
E
 
D
I
 
F
L
 
D
P
 
P
M
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
C
-
 
D
-
 
A
-
 
G
-
 
V
L
 
V
A
 
M
E
 
R
R
 
D
R
 
A
Q
 
H
Q
 
Q
F
 
F
A
 
L
F
 
H
E
 
D
P
 
H
Q
 
D
D
 
H
L
 
I
G
 
F
P
 
P
L
 
L
F
 
D
G
 
L
R
 
P
P
 
S
E
 
R
G
 
N
Q
 
N
G
 
C
T
 
Q
L
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
V
S
 
S
C
 
T
G
 
N
L
 
A
A
 
G
G
 
G
P
 
L
R
 
N
R
 
F
I
 
L
S
 
R
A
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
D
 
G
H
 
N
T
 
V
L
 
L
G
 
G
I
 
L
E
 
E
G
 
V
V
 
V
N
 
L
G
 
P
R
 
N
G
 
G
D
 
E
L
 
I
Y
 
I
K
 
S
G
 
N
G
 
I
G
 
N
K
 
A
V
 
L
V
 
R
K
 
K
N
 
D
V
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
L
P
 
K
K
 
Q
L
 
L
M
 
F
A
 
I
G
 
G
S
 
A
F
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
I
T
 
G
V
 
V
L
 
V
T
 
T
E
 
G
L
 
V
T
 
S
V
 
I
K
 
-
V
 
V
L
 
A
P
 
A
A
 
A
S
 
K
E
 
P
D
 
K
V
 
A
R
 
L
T
 
N
L
 
A
L
 
V
L
 
F
A
 
F
G
 
G
R
 
I
E
 
E
D
 
N
A
 
F
G
 
D
A
 
T
V
 
V
A
 
Q
A
 
K
L
 
L
T
 
F
A
 
V
A
 
K
L
 
A
Q
 
K
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS05730 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS05730
MTVTTVKPDSAAQAADAVRWALSEGTPLDVAGSGSKRGLGRPIQTAYTLDLSGLSGVVAY
EAEELVLTARAGTPMAEILPMLAERRQQFAFEPQDLGPLFGRPEGQGTLGGVISCGLAGP
RRISAGSARDHTLGIEGVNGRGDLYKGGGKVVKNVTGYDVPKLMAGSFGTLTVLTELTVK
VLPASEDVRTLLLAGREDAGAVAALTAALQSPYDVSGAAHLPAAVAARSHVRAVAAVGGA
VTLVRVEGFGPSVIARVAALKEELGADAVLDRDESLAVWKEVRDVAYFGPTPSPASAGEG
WGGGEDSRHIWKISVQPSEGPRVAESIRWALDAELYFDWGGGLIWAAVAPTPDAASAIRG
ALGTAGHATLVRAPEDVRTTTEVFHPLPDPVKALSRRVKESFDPCGILNPGRMYAGV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory