SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS09410 AZOBR_RS09410 2-dehydro-3-deoxy-D-gluconate 5-dehydrogenase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4hp8B Crystal structure of a putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase from agrobacterium tumefaciens (target efi-506435) with bound NADP
43% identity, 98% coverage: 3:249/253 of query aligns to 4:244/246 of 4hp8B

query
sites
4hp8B
F
 
F
P
 
S
L
 
L
T
 
E
N
 
G
R
 
R
T
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
N
A
x
T
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
Q
H
 
A
F
 
I
A
 
A
G
 
V
V
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
V
A
 
V
L
 
C
A
 
A
A
 
A
R
|
R
R
|
R
-
 
A
-
 
P
R
 
D
E
 
E
S
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
I
A
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
I
E
 
A
A
 
K
A
 
D
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
A
 
A
I
 
S
A
 
A
V
 
L
P
 
L
L
 
I
D
|
D
V
x
F
T
 
A
D
 
D
A
 
P
A
 
L
S
 
A
V
 
A
R
 
K
N
 
D
G
 
S
V
 
F
R
 
T
E
 
D
A
 
A
A
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
x
I
T
 
I
V
 
R
A
 
R
K
 
A
P
 
D
A
 
S
L
 
V
D
 
E
Y
 
F
A
 
S
E
 
E
E
 
L
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
E
V
 
V
I
 
M
D
 
D
T
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
F
T
 
T
A
 
T
Q
 
Q
E
 
A
T
 
F
A
 
A
R
 
K
V
 
E
M
 
L
R
 
L
E
 
A
Q
 
K
G
 
G
R
 
R
G
 
S
G
 
G
S
 
K
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
I
 
L
L
 
L
G
 
S
L
 
F
R
 
Q
V
 
G
A
 
G
G
 
I
H
 
R
V
|
V
V
 
P
A
 
S
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
A
Q
 
G
M
 
L
T
 
T
Q
 
K
A
 
L
V
 
L
A
 
A
L
 
N
E
 
E
W
 
W
A
 
A
R
 
A
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
M
x
I
E
 
E
T
|
T
D
 
N
L
 
-
N
|
N
R
x
T
D
 
E
F
 
A
L
 
L
A
 
R
T
 
A
D
 
D
A
 
A
-
 
A
-
 
R
G
 
N
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
I
 
L
R
 
E
R
 
R
V
 
I
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
W
G
 
G
R
 
H
L
 
S
A
 
E
D
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
G
P
 
A
L
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
S
 
A
A
 
D
Y
 
Y
M
 
V
T
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
L
P
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
W
L
 
L

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 5:251/253 of query aligns to 3:254/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
L
 
L
T
 
I
N
 
D
R
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
A
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
H
 
A
F
 
A
A
 
A
G
 
R
V
 
E
L
 
C
A
 
A
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
V
L
 
I
-
 
G
-
 
H
-
x
S
-
 
G
A
 
S
A
 
D
R
 
E
R
 
G
R
 
R
E
 
A
S
 
G
L
 
A
D
 
L
A
 
S
A
 
L
V
 
A
A
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
A
 
L
A
 
D
S
 
S
V
 
G
R
 
E
N
 
K
G
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
T
 
C
V
 
P
A
x
F
K
 
H
P
 
S
A
 
F
L
 
L
D
 
D
Y
 
M
A
 
P
E
 
R
E
 
E
E
 
L
W
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
I
 
V
D
 
G
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
L
 
F
T
 
T
A
 
V
Q
 
Q
E
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
R
M
 
M
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
I
x
V
A
x
S
S
|
S
I
 
I
L
x
S
G
 
A
L
 
L
R
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
H
 
M
V
x
Q
V
 
T
A
 
H
Y
|
Y
T
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
M
 
L
T
 
M
Q
 
Q
A
 
S
V
 
C
A
 
A
L
 
I
E
 
A
W
 
L
A
 
G
R
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
Y
 
T
M
x
I
E
 
A
T
|
T
D
 
D
L
x
I
N
|
N
R
 
K
D
 
E
F
 
D
L
 
L
A
 
S
T
 
D
-
 
L
D
 
E
A
 
K
G
 
R
Q
 
E
A
 
R
L
 
M
I
 
T
R
 
S
R
 
R
V
 
V
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
I
L
 
V
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
|
D
A
x
M
S
 
A
A
x
R
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
V
 
L
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
L
L
 
F
V
 
V
S
 
N

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 5:251/253 of query aligns to 3:254/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
L
 
L
T
 
I
N
 
D
R
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
A
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
H
 
A
F
 
A
A
 
A
G
 
R
V
 
E
L
 
C
A
 
A
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
V
L
 
I
-
 
G
-
 
H
-
 
S
-
 
G
A
 
S
A
 
D
R
 
E
R
 
G
R
 
R
E
 
A
S
 
G
L
 
A
D
 
L
A
 
S
A
 
L
V
 
A
A
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
A
 
L
A
 
D
S
 
S
V
 
G
R
 
E
N
 
K
G
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
T
 
C
V
 
P
A
 
F
K
 
H
P
 
S
A
 
F
L
 
L
D
 
D
Y
 
M
A
 
P
E
 
R
E
 
E
E
 
L
W
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
I
 
V
D
 
G
T
|
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
L
 
F
T
 
T
A
 
V
Q
 
Q
E
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
R
M
 
M
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
I
x
V
A
 
S
S
|
S
I
 
I
L
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
H
 
M
V
 
Q
V
 
T
A
 
H
Y
|
Y
T
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
M
 
L
T
 
M
Q
 
Q
A
 
S
V
 
C
A
 
A
L
 
I
E
 
A
W
 
L
A
 
G
R
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
Y
 
T
M
x
I
E
 
A
T
|
T
D
 
D
L
x
I
N
 
N
R
 
K
D
 
E
F
 
D
L
 
L
A
 
S
T
 
D
-
 
L
D
 
E
A
 
K
G
 
R
Q
 
E
A
 
R
L
 
M
I
 
T
R
 
S
R
 
R
V
 
V
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
I
L
 
V
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
A
A
 
R
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
V
 
L
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
L
L
 
F
V
 
V
S
 
N

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:249/253 of query aligns to 5:245/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
T
 
S
F
 
F
P
 
D
L
 
L
T
 
Q
N
 
G
R
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
S
x
D
A
 
T
G
 
G
L
|
L
G
 
G
R
 
Q
H
 
G
F
 
M
A
 
A
G
 
I
V
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
D
V
 
I
A
 
-
L
 
V
A
 
G
A
 
V
R
 
N
R
x
I
R
 
V
E
 
E
S
 
P
L
 
K
D
 
D
A
 
T
A
 
-
V
 
I
A
 
E
E
 
K
I
 
V
E
 
T
A
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
R
Q
 
R
A
 
F
I
 
L
A
 
S
V
 
L
P
 
T
L
 
A
D
|
D
V
x
M
T
 
S
D
 
N
A
 
V
A
 
S
S
 
G
V
 
H
R
 
A
N
 
E
G
 
L
V
 
V
R
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
V
G
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
H
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
T
 
I
V
 
R
A
 
R
K
 
E
P
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
E
Y
 
F
A
 
S
E
 
E
E
 
K
E
 
N
W
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
M
D
 
N
T
x
L
N
 
N
L
 
I
K
 
K
G
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
F
T
 
M
A
 
S
Q
 
Q
E
 
T
T
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
Q
M
 
F
R
 
I
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
A
S
|
S
I
 
M
L
 
L
G
 
S
L
 
F
R
 
Q
V
 
G
A
 
G
G
 
I
H
 
R
V
 
V
V
 
P
A
 
S
Y
|
Y
T
 
T
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
S
G
 
A
L
 
V
V
 
M
Q
 
G
M
 
V
T
 
T
Q
 
R
A
 
L
V
 
M
A
 
A
L
 
N
E
 
E
W
 
W
A
 
A
R
 
K
Y
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
Y
 
Y
M
|
M
E
 
A
T
|
T
D
 
N
L
x
N
N
 
T
R
 
Q
D
 
-
F
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
E
A
 
R
G
 
S
Q
 
K
A
 
E
L
 
I
I
 
L
R
 
D
R
 
R
V
 
I
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
W
G
 
G
R
 
L
L
 
P
A
 
Q
D
 
D
L
 
L
D
 
M
G
 
G
P
 
P
L
 
S
L
 
V
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
A
S
 
S
A
 
D
Y
 
Y
M
 
I
T
 
N
G
 
G
A
 
Y
V
 
T
V
 
I
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
W
L
 
L

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
39% identity, 95% coverage: 8:247/253 of query aligns to 5:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
R
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
H
 
S
F
 
I
A
 
A
G
 
L
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
N
-
 
Y
A
 
A
R
 
G
R
 
S
R
 
K
E
 
E
S
 
K
L
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
Q
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
V
 
I
P
 
Q
L
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
R
 
K
N
 
A
G
 
M
V
 
I
R
 
K
E
 
E
A
 
V
A
 
V
G
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
T
 
T
V
 
R
A
 
D
K
 
N
P
 
L
A
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
A
 
K
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
N
T
 
C
A
 
I
Q
 
Q
E
 
K
-
 
A
T
 
T
A
 
P
R
 
Q
V
 
M
M
 
L
R
 
R
E
 
Q
Q
 
-
G
 
-
R
 
R
G
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
V
V
 
G
A
 
N
G
 
P
H
 
G
V
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
Q
 
G
M
 
L
T
 
T
Q
 
K
A
 
S
V
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
M
 
I
E
 
V
T
 
S
D
 
D
L
 
M
N
 
T
R
 
-
D
 
D
F
 
A
L
 
L
A
 
S
T
 
D
D
 
E
A
 
L
G
 
K
Q
 
E
A
 
Q
L
 
M
I
 
L
R
 
T
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
L
 
D
A
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
N
P
 
T
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
S
 
A
A
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
T
V
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
38% identity, 95% coverage: 8:247/253 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
A
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
H
 
S
F
 
I
A
 
A
G
 
L
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
A
 
A
L
 
V
A
x
N
-
x
Y
A
|
A
R
x
G
R
x
S
R
 
K
E
 
E
S
 
K
L
 
A
D
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
G
 
V
Q
 
D
A
 
S
I
 
F
A
 
A
V
 
I
P
 
Q
L
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
R
 
K
N
 
A
G
 
M
V
 
I
R
 
K
E
 
E
A
 
V
A
 
V
G
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
 
I
T
 
T
V
 
R
A
 
D
K
 
N
P
 
L
A
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
A
 
K
E
 
E
E
 
Q
E
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
N
T
 
C
A
 
I
Q
 
Q
E
 
K
-
 
A
T
 
T
A
 
P
R
 
Q
V
 
M
M
 
L
R
 
R
E
 
Q
Q
 
-
G
 
-
R
 
R
G
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
S
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
V
V
 
G
A
 
N
G
 
P
H
 
G
V
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
Q
 
G
M
 
L
T
 
T
Q
 
K
A
 
S
V
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
M
 
I
E
 
V
T
 
S
D
 
D
L
 
M
N
 
T
R
 
D
D
 
E
F
 
L
L
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
K
Q
 
E
A
 
Q
L
 
M
I
 
L
R
 
T
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
R
 
Q
L
 
D
A
 
T
D
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
N
P
 
T
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
S
 
A
A
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
T
V
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:251/253 of query aligns to 3:245/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
L
 
L
T
 
I
N
 
D
R
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
A
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
H
 
A
F
 
A
A
 
A
G
 
R
V
 
E
L
 
C
A
 
A
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
V
L
 
I
-
 
G
-
x
H
-
x
S
-
 
G
A
 
S
A
 
D
R
 
E
R
x
G
R
 
R
E
 
A
S
 
G
L
 
A
D
 
L
A
 
S
A
 
L
V
 
A
A
 
E
E
 
E
I
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
D
 
D
A
 
L
A
 
D
S
 
S
V
 
G
R
 
E
N
 
K
G
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
T
 
C
V
 
P
A
 
F
K
 
H
P
 
S
A
 
F
L
 
L
D
 
D
Y
 
M
A
 
P
E
 
R
E
 
E
E
 
L
W
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
I
 
V
D
 
G
T
|
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
A
 
A
F
 
Y
L
 
F
T
 
T
A
 
V
Q
 
Q
E
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
R
V
 
R
M
 
M
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
I
 
V
A
 
S
S
|
S
I
 
I
L
 
S
G
 
A
L
 
L
R
 
V
V
 
G
A
 
G
G
 
A
H
 
M
V
 
Q
V
 
T
A
 
H
Y
|
Y
T
 
T
A
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
L
Q
 
S
M
 
L
T
 
M
Q
 
Q
A
 
S
V
 
C
A
 
A
L
 
I
E
 
A
W
 
L
A
 
G
R
 
P
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
Y
 
T
M
x
I
E
 
-
T
 
A
D
 
D
L
 
L
N
 
E
R
 
K
D
 
R
F
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
E
A
 
R
L
 
M
I
 
T
R
 
S
R
 
R
V
 
V
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
L
D
 
A
G
 
G
P
 
P
L
 
I
L
 
V
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
M
S
 
A
A
 
R
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
V
 
S
V
 
L
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
L
L
 
F
V
 
V
S
 
N

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
34% identity, 98% coverage: 1:248/253 of query aligns to 1:252/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
T
 
I
F
 
M
P
 
N
L
 
L
T
 
T
N
 
D
R
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
A
A
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
-
H
 
-
F
 
Y
A
 
A
G
 
A
V
 
V
L
 
Q
A
 
A
A
 
F
A
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
Q
V
 
A
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
R
 
-
E
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
N
A
 
V
A
 
V
V
 
V
A
 
A
E
x
D
I
|
I
E
 
D
A
 
E
A
 
A
G
 
Q
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
M
A
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
H
-
 
F
V
 
V
P
 
Q
L
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
A
 
E
A
 
A
S
 
A
V
 
C
R
 
Q
N
 
H
G
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
S
A
 
A
A
 
V
G
 
H
A
 
T
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
I
T
 
E
V
 
I
A
 
V
K
 
A
P
 
P
A
 
I
L
 
H
D
 
E
Y
 
M
A
 
E
E
 
L
E
 
S
E
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
I
 
L
D
 
Q
T
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
M
F
 
F
L
 
L
T
 
M
A
 
S
Q
 
K
E
 
H
T
 
A
A
 
L
R
 
K
V
 
H
M
 
M
R
 
L
E
 
A
Q
 
A
G
 
G
R
 
K
G
 
-
G
 
G
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
A
 
C
S
|
S
I
 
V
L
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
V
V
 
A
A
 
W
G
 
P
H
 
D
V
 
I
V
 
P
A
 
A
Y
|
Y
T
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
L
Q
 
Q
M
 
L
T
 
T
Q
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
W
 
Y
A
 
A
R
 
K
Y
 
H
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
x
I
M
x
I
E
 
D
T
 
T
D
 
P
L
 
L
N
 
N
-
 
E
R
 
K
D
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
E
T
 
N
D
 
N
A
 
E
G
 
G
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
Q
 
K
A
 
E
L
 
K
I
 
A
R
 
K
R
 
V
V
 
N
P
 
P
Q
 
L
R
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
L
 
P
A
 
E
D
 
E
L
 
I
D
 
A
G
 
N
P
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
L
S
 
S
A
 
S
Y
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
A
V
 
I
P
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
Y

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:250/253 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
F
 
M
P
 
K
L
 
L
T
 
A
N
 
S
R
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
A
A
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
F
H
 
G
F
 
I
A
 
A
G
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
I
L
 
I
A
 
A
A
x
D
R
|
R
R
 
D
R
 
A
E
 
H
S
 
G
L
 
-
D
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
S
I
 
L
E
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
A
 
F
V
 
I
P
 
S
L
x
C
D
 
N
V
x
I
T
 
A
D
 
E
A
 
K
A
 
T
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
N
 
A
G
 
L
V
 
F
R
 
S
E
 
Q
A
 
A
A
 
E
G
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
x
I
T
 
N
V
 
R
A
 
D
K
 
A
P
 
M
A
 
L
L
 
H
D
 
K
Y
 
L
A
 
T
E
 
E
E
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
A
 
M
Q
 
Q
E
 
Q
T
 
A
A
 
A
R
 
I
V
 
R
M
 
M
R
 
R
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
R
 
-
G
 
A
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
A
L
 
S
G
 
W
L
 
L
R
 
G
V
 
N
A
 
V
G
 
G
H
 
Q
V
 
-
V
 
T
A
 
N
Y
|
Y
T
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
Q
 
G
M
 
M
T
 
T
Q
 
K
A
 
T
V
 
A
A
 
C
L
 
R
E
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
M
x
I
E
 
D
T
|
T
D
 
D
L
 
M
N
x
T
R
 
R
D
 
G
F
 
-
L
 
V
A
 
P
T
 
E
D
 
N
A
 
V
G
 
W
Q
 
Q
A
 
I
L
 
M
I
 
V
R
 
S
R
 
K
V
 
I
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
R
 
E
L
 
A
A
 
K
D
 
D
L
 
V
D
 
G
G
 
E
P
 
C
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
G
S
 
A
A
 
R
Y
 
Y
M
 
I
T
 
N
G
 
G
A
 
E
V
 
V
V
 
I
P
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
H
 
M
L
 
V
V
 
L

8jfgA Crystal structure of 3-oxoacyl-acp reductase fabg in complex with NADP+ and 3-keto-octanoyl-acp from helicobacter pylori (see paper)
36% identity, 97% coverage: 2:247/253 of query aligns to 1:245/248 of 8jfgA

query
sites
8jfgA
T
 
S
F
 
M
P
 
Q
L
 
F
T
 
T
N
 
G
R
 
K
T
 
N
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
A
x
K
G
 
G
L
x
I
G
 
G
R
 
A
H
 
E
F
 
I
A
 
A
G
 
R
V
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
M
G
 
G
A
 
L
R
 
K
V
 
V
A
 
W
L
 
I
A
 
N
A
 
Y
R
|
R
R
 
S
R
 
N
-
 
A
E
 
E
S
 
V
L
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
L
V
 
K
A
 
N
E
 
E
I
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
K
G
 
G
G
 
Y
Q
 
K
A
 
A
I
 
A
A
 
V
V
 
I
P
 
K
L
 
F
D
 
D
V
x
A
T
 
A
D
 
S
A
 
E
A
 
S
S
 
D
V
 
F
R
 
V
N
 
E
G
 
A
V
 
I
R
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
V
G
 
Q
A
 
S
L
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
S
I
 
Y
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
V
T
 
V
V
 
R
A
x
D
K
 
K
P
 
L
A
 
A
L
 
I
D
 
K
Y
 
M
A
 
K
E
 
T
E
 
E
E
 
D
W
 
F
D
 
H
R
 
H
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
N
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
I
T
 
G
A
 
C
Q
 
R
E
 
E
T
 
A
A
 
L
R
 
K
V
 
V
M
 
M
R
 
-
E
 
S
Q
 
K
G
 
S
R
 
R
G
 
F
G
 
G
S
 
S
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
|
A
S
|
S
I
 
I
L
x
I
G
 
G
L
 
E
R
 
R
V
 
G
A
 
N
G
x
M
H
x
G
V
x
Q
V
 
T
A
 
N
Y
|
Y
T
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
M
V
 
I
Q
 
A
M
 
M
T
 
S
Q
 
K
A
 
S
V
 
F
A
 
A
L
 
Y
E
 
E
W
 
G
A
 
A
R
 
L
Y
 
R
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
F
N
 
N
A
 
S
L
 
V
A
 
T
P
|
P
G
|
G
Y
x
F
M
x
I
E
 
E
T
|
T
D
 
D
L
x
M
N
|
N
-
 
A
-
 
N
-
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
E
L
 
L
A
 
K
T
 
A
D
 
D
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
-
L
x
Y
I
 
V
R
 
K
R
 
N
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
A
A
 
K
D
 
E
L
 
V
D
 
A
G
 
E
P
 
A
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
H
S
 
S
A
 
S
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
V
 
T
V
 
L
P
 
K
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
36% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 11:255/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
T
 
K
N
 
D
R
 
K
T
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
A
x
T
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
H
 
A
F
 
M
A
 
A
G
 
V
V
 
R
L
 
F
A
 
G
A
 
Q
A
 
E
G
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
I
A
 
N
A
 
Y
-
x
Y
-
 
N
R
 
N
R
 
E
R
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
K
V
 
-
A
 
K
E
 
E
I
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
I
V
 
V
P
 
Q
L
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
A
 
E
A
 
E
S
 
D
V
 
V
R
 
V
N
 
N
G
 
L
V
 
V
R
 
Q
E
 
T
A
 
A
A
 
I
G
 
K
A
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
T
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
V
T
x
E
V
 
N
A
 
P
K
 
V
P
 
P
A
 
S
L
 
H
D
 
E
Y
 
L
A
 
S
E
 
L
E
 
D
E
 
N
W
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
G
A
 
S
Q
 
R
E
 
E
T
 
A
A
 
I
R
 
K
V
 
Y
M
 
F
R
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
D
R
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
A
 
S
S
|
S
I
 
V
L
x
H
G
 
E
L
 
M
R
 
I
V
 
P
A
x
W
G
 
P
H
 
L
V
 
F
V
 
V
A
 
H
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
M
V
 
K
Q
 
L
M
 
M
T
 
T
Q
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
Y
A
 
A
R
 
P
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
L
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
M
|
M
E
 
N
T
|
T
D
x
P
L
x
I
N
|
N
R
 
A
D
 
E
F
x
K
L
 
F
A
 
A
T
 
D
D
 
P
A
 
V
G
 
Q
Q
 
R
A
 
A
L
 
D
I
 
V
R
 
E
R
 
S
-
 
M
V
 
I
P
 
P
Q
 
M
R
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
K
L
 
P
A
 
E
D
 
E
L
 
V
D
 
A
G
 
A
P
 
V
L
 
A
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
Q
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
I
V
 
T
V
 
L
P
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
38% identity, 97% coverage: 5:250/253 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
T
 
Q
N
 
G
R
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
A
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
H
 
D
F
 
I
A
 
A
G
 
I
V
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
A
 
F
L
 
F
A
x
N
A
x
Y
R
x
N
R
x
G
R
x
S
E
 
P
S
 
E
L
 
A
D
 
A
A
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
K
I
 
L
E
 
V
A
 
A
A
 
E
G
 
H
G
 
G
Q
 
V
A
 
E
I
 
V
-
 
E
A
 
A
V
 
M
P
 
K
L
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
I
A
 
A
A
 
E
S
 
D
V
 
V
R
 
D
N
 
A
G
 
F
V
 
F
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
A
 
I
G
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
A
x
I
T
 
T
V
 
R
A
 
D
K
 
N
P
 
L
A
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
A
 
K
E
 
E
E
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
T
x
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
A
 
T
Q
 
K
E
 
A
T
 
V
A
 
S
R
 
R
V
 
T
M
 
M
R
 
M
E
 
K
Q
 
Q
G
 
-
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
I
V
 
G
A
 
N
G
 
A
H
 
G
V
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
Q
 
G
M
 
L
T
 
T
Q
 
K
A
 
T
V
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
F
M
x
I
E
 
T
T
|
T
D
 
D
L
 
M
N
 
T
R
 
-
D
 
D
F
 
K
L
 
L
A
 
D
T
 
E
D
 
K
A
 
T
G
 
K
Q
 
E
A
 
A
L
 
M
I
 
L
R
 
A
R
 
Q
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
T
L
 
T
A
 
E
D
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
N
P
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
S
 
S
A
 
K
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
T
V
 
L
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
M
L
 
V
V
 
M

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:250/253 of query aligns to 4:246/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
T
 
T
N
 
A
R
 
Q
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
|
A
S
 
S
A
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
K
H
 
A
F
 
T
A
 
A
G
 
L
V
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
T
G
 
G
A
 
M
R
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
A
 
N
-
 
Y
A
 
A
R
 
Q
R
 
S
R
 
S
E
 
T
S
 
A
L
 
A
D
 
D
A
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
E
I
 
I
E
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
P
 
Q
L
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
N
A
 
A
A
 
D
S
 
E
V
 
V
R
 
D
N
 
Q
G
 
L
V
 
I
R
 
K
E
 
T
A
 
T
A
 
L
G
 
D
A
 
K
L
 
F
G
 
S
G
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
T
 
T
V
 
R
A
 
D
K
 
T
P
 
L
A
 
L
L
 
L
D
 
R
Y
 
M
A
 
K
E
 
L
E
 
E
E
 
D
W
 
W
D
 
Q
R
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
C
A
 
T
Q
 
K
E
 
A
T
 
V
A
 
S
R
 
K
V
 
L
M
 
M
R
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
-
R
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
A
 
T
S
 
S
I
 
V
L
 
A
G
 
G
L
 
M
R
 
M
V
 
G
A
 
N
G
x
P
H
 
G
V
 
Q
V
 
A
A
 
N
Y
 
Y
T
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
I
Q
 
G
M
 
F
T
 
T
Q
 
K
A
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
x
F
M
 
I
E
 
A
T
 
T
D
 
D
L
 
M
N
 
T
R
 
E
D
 
N
F
 
L
L
x
N
A
 
A
T
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
E
A
 
P
L
 
I
I
 
L
R
 
Q
R
 
F
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
R
 
Q
L
 
P
A
 
E
D
 
E
L
 
V
D
 
A
G
 
G
P
 
T
L
 
I
L
 
R
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
T
D
 
D
-
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
T
V
 
F
P
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
M
L
 
V
V
 
M

1vl8B Crystal structure of gluconate 5-dehydrogenase (tm0441) from thermotoga maritima at 2.07 a resolution
37% identity, 97% coverage: 3:247/253 of query aligns to 2:248/252 of 1vl8B

query
sites
1vl8B
F
 
F
P
 
D
L
 
L
T
 
R
N
 
G
R
 
R
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
S
A
x
R
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
F
H
 
G
F
 
I
A
 
A
G
 
Q
V
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
S
V
 
V
A
 
V
L
 
V
A
 
A
A
x
S
R
|
R
R
 
N
-
 
L
R
 
E
E
 
E
S
 
A
L
 
S
D
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
Q
A
 
K
E
 
L
I
 
T
E
 
E
A
 
K
A
 
Y
G
 
G
G
 
V
Q
 
E
A
 
T
I
 
M
A
 
A
V
 
F
P
 
R
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
N
A
 
Y
A
 
E
S
 
E
V
 
V
R
 
K
N
 
K
G
 
L
V
 
L
R
 
E
E
 
A
A
 
V
A
 
K
G
 
E
A
 
K
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
L
D
 
D
I
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
A
x
I
T
 
N
V
 
R
A
 
R
K
 
H
P
 
P
A
 
A
L
 
E
D
 
E
Y
 
F
A
 
P
E
 
L
E
 
D
E
 
E
W
 
F
D
 
R
R
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
E
T
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
F
G
 
G
A
 
T
F
 
Y
L
 
Y
T
 
V
A
 
C
Q
 
R
E
 
E
T
 
A
A
 
F
R
 
S
V
 
L
M
 
L
R
 
R
E
 
E
Q
 
S
G
 
D
R
 
-
G
 
N
G
 
P
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
A
 
G
S
|
S
I
 
L
L
 
T
G
 
V
L
 
E
R
 
E
V
 
V
A
 
T
-
 
M
G
 
P
H
 
N
V
x
I
V
 
S
A
 
A
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
V
V
 
A
Q
 
S
M
 
L
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
W
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
V
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
W
M
x
Y
E
 
R
T
|
T
D
 
K
L
x
M
N
x
T
R
 
E
D
 
A
-
 
V
F
 
F
L
 
S
A
 
D
T
 
P
D
 
E
A
 
K
G
 
L
Q
 
D
A
 
Y
L
 
M
I
 
L
R
 
K
R
 
R
V
 
I
P
 
P
Q
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
T
G
 
G
R
 
V
L
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
L
D
 
K
G
 
G
P
 
V
L
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
E
A
 
E
S
 
A
A
 
K
Y
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
I
V
 
I
P
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
35% identity, 96% coverage: 5:248/253 of query aligns to 11:263/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
L
 
F
T
 
T
N
 
D
R
 
R
T
 
V
A
 
V
L
|
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
S
x
G
A
x
S
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
H
x
A
F
x
T
A
|
A
G
x
V
V
x
R
L
|
L
A
|
A
A
|
A
A
x
E
G
|
G
A
|
A
R
x
K
V
x
L
A
x
S
L
|
L
A
 
V
A
 
D
R
 
V
R
 
S
R
 
S
E
 
E
S
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
S
V
 
K
A
 
A
E
 
A
I
 
V
-
 
L
-
 
E
E
 
T
A
 
A
A
 
P
G
 
D
G
 
A
Q
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
T
V
 
T
P
 
V
L
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
N
 
A
G
 
Y
V
 
V
R
 
T
E
 
A
A
 
T
A
 
T
G
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
T
x
E
-
 
G
V
 
K
A
 
Q
K
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
E
D
 
S
Y
 
F
A
 
T
E
 
A
E
 
A
E
 
E
W
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
S
T
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
G
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
T
 
V
A
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
S
G
 
G
G
 
-
S
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
V
L
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
G
A
 
I
G
 
G
H
 
N
V
 
Q
V
 
S
A
 
G
Y
 
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
V
Q
 
G
M
 
L
T
 
T
Q
 
R
A
 
N
V
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
W
 
Y
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
A
M
 
I
E
 
W
T
 
T
D
 
P
L
 
M
N
 
V
R
 
E
D
 
N
F
 
S
L
 
M
A
 
K
T
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
R
D
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
F
I
 
I
R
 
Q
R
 
V
V
 
N
P
 
P
Q
 
S
R
 
K
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
R
 
E
L
 
A
A
 
P
D
 
E
L
 
I
D
 
A
G
 
A
P
 
V
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
D
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
A
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
Q

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
35% identity, 96% coverage: 5:248/253 of query aligns to 2:254/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
L
 
F
T
 
T
N
 
D
R
 
R
T
 
V
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
 
G
A
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
R
H
 
A
F
 
T
A
 
A
G
 
V
V
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
V
A
x
D
R
x
V
R
 
S
R
 
S
E
 
E
S
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
A
 
S
V
 
K
A
 
A
E
 
A
I
 
V
-
 
L
-
 
E
E
 
T
A
 
A
A
 
P
G
 
D
G
 
A
Q
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
T
V
 
T
P
 
V
L
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
A
 
E
A
 
A
S
 
Q
V
 
V
R
 
E
N
 
A
G
 
Y
V
 
V
R
 
T
E
 
A
A
 
T
A
 
T
G
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
x
I
T
 
E
-
 
G
V
 
K
A
 
Q
K
 
N
P
 
P
A
 
T
L
 
E
D
 
S
Y
 
F
A
 
T
E
 
A
E
 
A
E
 
E
W
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
S
T
 
I
N
 
N
L
 
L
K
 
R
G
 
G
A
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
G
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
T
 
V
A
 
L
R
 
K
V
 
I
M
 
M
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
S
G
 
G
G
 
-
S
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
T
A
 
A
S
|
S
I
 
V
L
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
G
A
 
I
G
 
G
H
 
N
V
x
Q
V
 
S
A
 
G
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
L
 
V
V
 
V
Q
 
G
M
 
L
T
 
T
Q
 
R
A
 
N
V
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
W
 
Y
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
M
 
I
E
 
W
T
|
T
D
x
P
L
x
M
N
 
V
R
 
E
D
 
N
F
 
S
L
 
M
A
 
K
T
 
Q
-
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
R
D
 
K
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
A
 
E
L
 
F
I
 
I
R
 
Q
R
 
V
V
 
N
P
 
P
Q
 
S
R
 
K
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
R
 
E
L
 
A
A
 
P
D
 
E
L
 
I
D
 
A
G
 
A
P
 
V
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
L
S
 
S
D
 
D
A
 
D
S
 
A
A
 
S
Y
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
A
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
Q

2ekpA Structure of tt0495 protein from thermus thermophilus (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:249/253 of query aligns to 1:236/238 of 2ekpA

query
sites
2ekpA
N
 
E
R
 
R
T
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
S
|
S
A
 
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
H
 
A
F
 
I
A
 
A
G
 
E
V
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
Y
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
x
S
R
 
R
R
 
N
R
 
P
E
 
E
S
 
E
L
 
A
D
 
A
A
 
Q
A
 
S
V
 
L
A
 
G
E
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
A
 
A
I
 
V
A
 
P
V
 
L
P
 
P
L
x
T
D
|
D
V
x
L
T
 
-
D
 
E
A
 
K
A
 
D
S
 
D
V
 
P
R
 
K
N
 
G
G
 
L
V
 
V
R
 
K
E
 
R
A
 
A
A
 
L
G
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
H
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
H
N
x
A
A
 
A
G
x
A
A
 
V
T
 
N
V
 
V
A
 
R
K
 
K
P
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
E
Y
 
L
A
 
S
E
 
Y
E
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
R
R
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
Y
T
 
L
N
 
H
L
 
L
K
 
D
G
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
P
V
 
H
M
 
M
R
 
A
E
 
E
Q
 
A
G
 
G
R
 
-
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
V
V
 
L
N
 
F
I
|
I
A
x
G
S
|
S
I
 
V
L
 
T
G
 
T
L
 
F
R
 
T
V
 
A
A
 
G
G
 
G
H
 
P
V
 
V
-
 
P
-
 
I
V
 
P
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
A
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
T
G
 
A
L
 
L
V
 
L
Q
 
G
M
 
L
T
 
T
Q
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
W
A
 
A
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
M
x
V
E
 
E
T
|
T
D
 
E
L
x
F
N
x
T
R
 
L
D
 
P
F
 
L
L
 
R
A
 
Q
T
 
N
-
 
P
D
 
E
A
 
L
G
 
Y
Q
 
E
A
 
P
L
 
I
I
 
T
R
 
A
R
 
R
V
 
I
P
 
P
Q
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
W
G
 
A
R
 
R
L
 
P
A
 
E
D
 
E
L
 
I
D
 
A
G
 
R
P
 
V
L
 
A
L
 
A
L
 
V
L
 
L
C
 
C
S
 
G
D
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
E
Y
 
Y
M
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
A
V
 
V
P
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
F
L
 
L

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
38% identity, 95% coverage: 8:247/253 of query aligns to 6:240/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
R
 
K
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
S
|
S
A
x
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
H
 
A
F
 
I
A
 
A
G
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
-
L
 
I
A
 
G
A
 
T
R
 
A
R
x
T
R
 
S
E
 
E
S
 
N
L
 
G
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
I
 
Y
E
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
G
I
 
L
A
 
M
V
 
-
P
 
-
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
R
 
E
N
 
S
G
 
V
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
I
A
 
R
G
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
T
 
T
V
 
R
A
 
D
K
 
N
P
 
L
A
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
A
 
K
E
 
D
E
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
L
A
 
S
Q
 
K
E
 
A
T
 
V
A
 
M
R
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
-
R
 
R
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
 
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
V
 
G
A
 
N
G
 
G
H
 
G
V
 
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
x
A
A
|
A
S
x
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
Q
 
G
M
 
F
T
 
S
Q
 
K
A
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
M
x
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
L
 
M
N
 
T
R
 
R
D
 
A
F
 
-
L
 
L
A
 
S
T
 
D
D
 
D
A
 
Q
G
 
R
Q
 
A
A
 
G
L
 
I
I
 
L
R
 
A
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
A
A
 
Q
D
 
E
L
 
I
D
 
A
G
 
N
P
 
A
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
V
 
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 95% coverage: 8:247/253 of query aligns to 5:239/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
R
 
K
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
A
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
H
 
A
F
 
I
A
 
A
G
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
-
L
 
I
A
 
G
A
 
T
R
 
A
R
x
T
R
 
S
E
 
E
S
 
N
L
 
G
D
 
A
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
I
 
Y
E
 
L
A
 
G
A
 
A
G
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
G
I
 
L
A
 
M
V
 
-
P
 
-
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
D
 
D
A
 
P
A
 
A
S
 
S
V
 
I
R
 
E
N
 
S
G
 
V
V
 
L
R
 
E
E
 
K
A
 
I
A
 
R
G
 
A
A
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
T
 
T
V
 
R
A
 
D
K
 
N
P
 
L
A
 
L
L
 
M
D
 
R
Y
 
M
A
 
K
E
 
D
E
 
E
E
|
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
S
G
 
S
A
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
L
A
 
S
Q
 
K
E
 
A
T
 
V
A
 
M
R
 
R
V
 
A
M
 
M
R
 
M
E
 
K
Q
 
K
G
 
-
R
 
R
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
A
 
G
S
|
S
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
V
 
G
A
 
N
G
 
G
H
 
G
V
x
Q
V
 
A
A
 
N
Y
|
Y
T
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
I
Q
 
G
M
 
F
T
 
S
Q
 
K
A
 
S
V
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
V
L
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
M
x
I
E
 
E
T
 
T
D
 
D
L
 
M
N
 
T
R
 
R
D
 
A
F
 
-
L
 
L
A
 
S
T
 
D
D
 
D
A
 
Q
G
 
R
Q
 
A
A
 
G
L
 
I
I
 
L
R
 
A
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
Q
 
A
R
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
A
A
 
Q
D
 
E
L
 
I
D
 
A
G
 
N
P
 
A
L
 
V
L
 
A
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
A
Y
 
Y
M
 
I
T
 
T
G
 
G
A
x
E
V
x
T
V
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
40% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
L
 
I
T
 
Q
N
 
N
R
 
R
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
S
 
A
A
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
K
H
 
Q
F
 
T
A
 
A
G
 
L
V
 
R
L
 
F
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
I
A
 
N
A
x
D
R
 
I
R
 
D
R
 
A
E
 
E
S
 
K
L
 
V
D
 
R
A
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
D
E
 
E
I
 
F
E
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
G
 
H
Q
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
G
V
 
A
P
 
V
L
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
G
D
 
N
A
 
K
A
 
A
S
 
A
V
 
V
R
 
D
N
 
G
G
 
M
V
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
T
A
 
I
G
 
D
A
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
M
T
 
E
V
 
R
A
 
A
K
 
G
P
 
A
A
 
L
L
 
R
D
 
K
Y
 
L
A
 
S
E
 
E
E
 
A
E
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
T
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
A
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
A
 
T
Q
 
Q
E
 
A
T
 
V
A
 
H
R
 
G
V
 
H
M
 
M
R
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
-
R
 
K
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
A
 
A
S
 
S
I
 
R
L
 
A
G
 
W
L
 
L
R
 
G
V
 
G
A
 
A
G
 
G
H
 
Q
V
 
-
V
 
T
A
 
P
Y
|
Y
T
 
S
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
V
 
V
Q
 
G
M
 
M
T
 
T
Q
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
W
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
L
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
M
 
I
E
 
H
T
 
T
D
 
P
L
 
M
N
 
-
R
 
W
D
 
D
F
 
E
L
 
L
A
 
P
T
 
E
D
 
K
A
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
A
 
F
L
 
L
I
 
L
R
 
S
R
 
R
V
 
Q
P
 
P
Q
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
G
 
G
R
 
E
L
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
I
D
 
A
G
 
N
P
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
D
D
 
D
A
 
D
S
 
S
A
 
G
Y
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
V
 
V
V
 
L
P
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS09410 AZOBR_RS09410 2-dehydro-3-deoxy-D-gluconate 5-dehydrogenase
MTFPLTNRTALVTGASAGLGRHFAGVLAAAGARVALAARRRESLDAAVAEIEAAGGQAIA
VPLDVTDAASVRNGVREAAGALGGLDILVNNAGATVAKPALDYAEEEWDRVIDTNLKGAF
LTAQETARVMREQGRGGSIVNIASILGLRVAGHVVAYTASKAGLVQMTQAVALEWARYGI
RVNALAPGYMETDLNRDFLATDAGQALIRRVPQRRLGRLADLDGPLLLLCSDASAYMTGA
VVPVDGGHLVSTL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory