SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS10010 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS10010 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ph4A Clostridium thermocellum ribose-5-phosphate isomerase b with d-allose (see paper)
52% identity, 98% coverage: 4:143/143 of query aligns to 3:141/148 of 3ph4A

query
sites
3ph4A
I
 
I
A
 
G
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
|
D
H
|
H
A
x
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
N
M
 
L
K
 
K
A
 
R
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
D
W
 
F
L
 
L
A
 
K
G
 
K
A
 
R
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
F
G
 
G
C
 
T
N
 
H
G
 
G
P
 
N
E
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
G
T
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
I
 
V
N
 
K
D
 
S
K
 
G
R
 
E
A
 
C
A
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
G
 
G
I
 
L
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
C
H
 
T
D
 
N
V
 
S
T
 
Y
T
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
E
R
|
R
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
L
E
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
L
D
 
D
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
T
F
 
W
L
 
L
T
 
K
T
 
A
D
 
E
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
-
R
|
R
H
|
H
S
 
A
R
 
T
R
|
R
I
 
V
A
 
G
K
 
K
M
 
I
G
 
G

3ph3A Clostridium thermocellum ribose-5-phosphate isomerase b with d-ribose (see paper)
52% identity, 98% coverage: 4:143/143 of query aligns to 3:141/148 of 3ph3A

query
sites
3ph3A
I
 
I
A
 
G
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
|
D
H
|
H
A
x
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
N
M
 
L
K
 
K
A
 
R
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
D
W
 
F
L
 
L
A
 
K
G
 
K
A
 
R
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
F
G
 
G
C
 
T
N
 
H
G
 
G
P
 
N
E
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
G
T
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
I
 
V
N
 
K
D
 
S
K
 
G
R
 
E
A
 
C
A
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
G
 
G
I
 
L
G
|
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
C
H
 
T
D
 
N
V
 
S
T
 
Y
T
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
E
R
|
R
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
L
E
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
L
D
 
D
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
T
F
 
W
L
 
L
T
 
K
T
 
A
D
 
E
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
-
R
 
R
H
|
H
S
 
A
R
 
T
R
|
R
I
 
V
A
 
G
K
 
K
M
 
I
G
 
G

3heeA Structural study of clostridium thermocellum ribose-5-phosphate isomerase b and ribose-5-phosphate (see paper)
52% identity, 98% coverage: 4:143/143 of query aligns to 3:141/148 of 3heeA

query
sites
3heeA
I
 
I
A
 
G
I
 
I
A
 
G
S
 
S
D
|
D
H
|
H
A
x
G
G
 
G
Y
 
Y
E
 
N
M
 
L
K
 
K
A
 
R
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
D
W
 
F
L
 
L
A
 
K
G
 
K
A
 
R
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
F
G
 
G
C
 
T
N
 
H
G
 
G
P
 
N
E
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
G
T
 
L
A
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
A
I
 
V
N
 
K
D
 
S
K
 
G
R
 
E
A
 
C
A
 
D
R
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
G
 
G
I
x
L
G
|
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
C
H
 
T
D
 
N
V
 
S
T
 
Y
T
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
E
R
|
R
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
L
E
 
D
I
 
L
A
 
A
K
 
L
D
 
D
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
T
F
 
W
L
 
L
T
 
K
T
 
A
D
 
E
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
G
 
G
E
 
-
R
|
R
H
|
H
S
 
A
R
 
T
R
|
R
I
 
V
A
 
G
K
 
K
M
 
I
G
 
G

3k8cA Complex of trypanosoma cruzi ribose 5-phosphate isomerase type b with 4-deoxy-4-phospho-d-erythronohydroxamic acid (see paper)
48% identity, 97% coverage: 4:142/143 of query aligns to 5:145/152 of 3k8cA

query
sites
3k8cA
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
S
 
T
D
|
D
H
|
H
A
x
P
G
 
A
Y
 
F
E
 
A
M
 
I
K
 
H
A
 
E
Q
 
N
I
 
L
A
 
I
S
 
L
W
 
Y
L
 
V
A
 
K
G
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
D
E
 
E
V
 
F
L
 
V
D
 
P
L
 
V
G
 
Y
C
 
C
N
 
-
G
 
G
P
 
P
-
 
K
-
 
T
-
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
S
A
 
R
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
M
I
 
V
N
 
A
D
 
R
K
 
K
R
 
E
A
 
V
A
 
E
R
 
F
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
A
C
|
C
G
|
G
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
|
G
I
 
M
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
C
H
 
H
D
 
D
V
 
H
T
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
I
H
|
H
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
G
A
 
E
R
 
R
I
 
T
I
 
T
G
 
G
A
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
I
K
 
R
D
 
E
C
 
I
V
 
I
D
 
I
A
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
Q
T
 
T
D
 
P
F
 
F
E
 
S
G
 
G
G
 
E
E
 
E
R
|
R
H
|
H
S
 
V
R
 
R
R
|
R
I
 
I
A
 
E
K
 
K
M
 
I

3k7sA Complex of trypanosoma cruzi ribose 5-phosphate isomerase type b with ribose 5-phosphate (see paper)
48% identity, 97% coverage: 4:142/143 of query aligns to 5:145/152 of 3k7sA

query
sites
3k7sA
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
S
 
T
D
|
D
H
|
H
A
x
P
G
 
A
Y
 
F
E
 
A
M
 
I
K
 
H
A
 
E
Q
 
N
I
 
L
A
 
I
S
 
L
W
 
Y
L
 
V
A
 
K
G
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
D
E
 
E
V
 
F
L
 
V
D
 
P
L
 
V
G
 
Y
C
 
C
N
 
-
G
 
G
P
 
P
-
 
K
-
 
T
-
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
S
A
 
R
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
M
I
 
V
N
 
A
D
 
R
K
 
K
R
 
E
A
 
V
A
 
E
R
 
F
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
A
C
|
C
G
|
G
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
|
G
I
 
M
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
C
H
 
H
D
 
D
V
 
H
T
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
I
H
|
H
N
|
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
G
A
 
E
R
 
R
I
 
T
I
 
T
G
 
G
A
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
I
K
 
R
D
 
E
C
 
I
V
 
I
D
 
I
A
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
Q
T
 
T
D
 
P
F
 
F
E
 
S
G
 
G
G
 
E
E
 
E
R
|
R
H
|
H
S
 
V
R
 
R
R
|
R
I
 
I
A
 
E
K
 
K
M
 
I

3k7pA Structure of mutant of ribose 5-phosphate isomerase type b from trypanosoma cruzi. (see paper)
47% identity, 97% coverage: 4:142/143 of query aligns to 5:145/153 of 3k7pA

query
sites
3k7pA
I
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
S
 
T
D
|
D
H
 
H
A
 
P
G
 
A
Y
 
F
E
 
A
M
 
I
K
 
H
A
 
E
Q
 
N
I
 
L
A
 
I
S
 
L
W
 
Y
L
 
V
A
 
K
G
 
E
A
 
A
G
 
G
Y
 
D
E
 
E
V
 
F
L
 
V
D
 
P
L
 
V
G
 
Y
C
 
C
N
 
-
G
 
G
P
 
P
-
 
K
-
 
T
-
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
S
A
 
R
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
M
I
 
V
N
 
A
D
 
R
K
 
K
R
 
E
A
 
V
A
 
E
R
 
F
G
 
G
V
 
V
L
 
L
I
 
A
C
x
A
G
 
G
S
|
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
C
H
 
H
D
 
D
V
 
H
T
 
Y
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
M
A
 
S
R
 
R
Q
 
I
H
|
H
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
N
V
 
I
V
 
V
A
 
C
L
 
V
G
 
G
A
 
E
R
 
R
I
 
T
I
 
T
G
 
G
A
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
I
K
 
R
D
 
E
C
 
I
V
 
I
D
 
I
A
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
Q
T
 
T
D
 
P
F
 
F
E
 
S
G
 
G
G
 
E
E
 
E
R
|
R
H
|
H
S
 
V
R
 
R
R
|
R
I
 
I
A
 
E
K
 
K
M
 
I

P37351 Ribose-5-phosphate isomerase B; Phosphoriboisomerase B; EC 5.3.1.6 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
46% identity, 97% coverage: 1:139/143 of query aligns to 1:138/149 of P37351

query
sites
P37351
M
 
M
T
 
K
T
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
F
A
 
G
S
 
C
D
 
D
H
 
H
A
 
V
G
 
G
Y
 
F
E
 
I
M
 
L
K
 
K
A
 
H
Q
 
E
I
 
I
A
 
V
S
 
A
W
 
H
L
 
L
A
 
V
G
 
E
A
 
R
G
 
G
Y
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
K
G
 
G
C
 
T
N
 
W
G
 
S
P
 
S
E
 
E
S
 
R
V
 
T
D
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
H
F
 
Y
A
 
A
T
 
S
A
 
Q
L
 
V
A
 
A
G
 
L
A
 
A
I
 
V
N
 
A
D
 
G
K
 
G
R
 
E
A
 
V
A
 
D
R
 
G
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
I
C
 
C
G
 
G
S
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
F
P
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
V
V
 
C
H
 
S
D
 
E
V
 
P
T
 
Y
T
 
S
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
S
R
 
R
Q
 
Q
H
|
H
N
 
N
D
 
D
A
 
T
N
 
N
V
 
V
V
 
L
A
 
A
L
 
F
G
 
G
A
 
S
R
 
R
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
L
E
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
M
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
W
L
 
L
T
 
G
T
 
A
D
 
Q
F
 
Y
E
 
E
G
 
G
G
 
G
E
 
-
R
 
R
H
 
H
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
I
 
V

6mu0A Crystal structure of ribose-5-phosphate isomerase b from mycoplasma genitalium with bound ribulose-5-phosphate
44% identity, 98% coverage: 3:142/143 of query aligns to 5:145/152 of 6mu0A

query
sites
6mu0A
T
 
N
I
 
I
A
 
F
I
 
I
A
 
A
S
 
S
D
|
D
H
|
H
A
x
T
G
 
G
Y
 
L
E
 
T
M
 
L
K
 
K
A
 
K
Q
 
I
I
 
I
A
 
S
S
 
E
W
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
T
A
 
K
G
 
Q
Y
 
F
E
 
N
V
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
C
 
P
N
 
N
G
 
Y
P
 
F
E
 
D
-
 
A
S
 
N
V
 
D
D
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
D
F
 
F
A
 
A
T
 
F
A
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
D
A
 
K
I
 
V
N
 
K
-
 
K
D
 
N
K
 
S
R
 
D
A
 
K
A
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
L
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
G
 
G
I
x
V
G
|
G
I
 
V
S
 
C
I
 
M
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
V
H
 
V
D
 
S
V
 
E
T
 
K
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
D
 
N
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
L
A
 
C
L
 
L
G
 
S
A
 
S
R
|
R
I
 
F
I
 
V
G
 
T
A
 
D
E
 
S
I
 
E
A
 
N
K
 
I
D
 
K
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
D
F
 
F
L
 
L
T
 
K
T
 
A
D
 
N
F
 
F
E
 
E
G
 
G
G
 
G
E
 
-
R
 
R
H
 
H
S
 
Q
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
D
K
 
K
M
 
I

4lfnB Crystal structure of d-galactose-6-phosphate isomerase in complex with d-ribulose (see paper)
37% identity, 97% coverage: 4:142/143 of query aligns to 3:141/172 of 4lfnB

query
sites
4lfnB
I
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
G
S
 
N
D
|
D
H
 
H
A
x
I
G
 
V
Y
 
T
E
 
M
M
 
Q
K
 
K
A
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
S
 
N
W
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
D
A
 
M
G
 
G
Y
 
Y
E
 
T
V
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
E
G
 
G
C
 
T
N
 
Y
G
 
D
P
 
T
E
 
H
S
 
R
V
 
T
D
 
H
Y
|
Y
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
A
 
G
T
 
K
A
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
D
I
 
V
N
 
A
D
 
D
K
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
M
C
|
C
G
|
G
S
x
T
G
 
G
I
|
I
G
|
G
I
 
I
S
 
S
I
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
D
R
 
K
H
 
N
P
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
M
V
 
C
H
 
D
D
 
D
V
 
V
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
Q
N
 
L
D
 
N
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
L
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
V
E
 
H
I
 
L
A
 
I
K
 
Q
D
 
D
C
 
I
V
 
V
D
 
K
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
T
 
D
T
 
A
D
 
T
F
 
Y
E
 
K
G
 
E
G
 
T
E
 
P
R
 
E
H
 
N
S
 
K
R
 
K
R
 
L
I
 
I
A
 
D
K
 
K
M
 
I

4lfmB Crystal structure of d-galactose-6-phosphate isomerase in complex with d-psicose (see paper)
37% identity, 97% coverage: 4:142/143 of query aligns to 3:141/172 of 4lfmB

query
sites
4lfmB
I
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
G
S
 
N
D
|
D
H
|
H
A
x
I
G
 
V
Y
 
T
E
 
M
M
 
Q
K
 
K
A
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
S
 
N
W
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
D
A
 
M
G
 
G
Y
 
Y
E
 
T
V
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
E
G
 
G
C
 
T
N
 
Y
G
 
D
P
 
T
E
 
H
S
 
R
V
 
T
D
 
H
Y
|
Y
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
A
 
G
T
 
K
A
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
D
I
 
V
N
 
A
D
 
D
K
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
M
C
|
C
G
|
G
S
x
T
G
 
G
I
|
I
G
|
G
I
 
I
S
 
S
I
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
D
R
 
K
H
 
N
P
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
M
V
 
C
H
 
D
D
 
D
V
 
V
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
Q
N
 
L
D
 
N
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
L
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
V
E
 
H
I
 
L
A
 
I
K
 
Q
D
 
D
C
 
I
V
 
V
D
 
K
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
T
 
D
T
 
A
D
 
T
F
 
Y
E
 
K
G
 
E
G
 
T
E
 
P
R
 
E
H
 
N
S
 
K
R
 
K
R
 
L
I
 
I
A
 
D
K
 
K
M
 
I

4lflB Crystal structure of d-galactose-6-phosphate isomerase in complex with d-tagatose-6-phosphate (see paper)
37% identity, 97% coverage: 4:142/143 of query aligns to 3:141/172 of 4lflB

query
sites
4lflB
I
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
G
S
 
N
D
|
D
H
|
H
A
x
I
G
 
V
Y
 
T
E
 
M
M
 
Q
K
 
K
A
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
S
 
N
W
 
M
L
 
L
A
 
K
G
 
D
A
 
M
G
 
G
Y
 
Y
E
 
T
V
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
E
G
 
G
C
 
T
N
 
Y
G
 
D
P
 
T
E
 
H
S
x
R
V
 
T
D
 
H
Y
|
Y
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
A
 
G
T
 
K
A
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
E
A
 
D
I
 
V
N
 
A
D
 
D
K
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
D
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
M
C
|
C
G
|
G
S
x
T
G
 
G
I
|
I
G
|
G
I
 
I
S
 
S
I
 
T
A
 
A
A
 
A
N
 
D
R
 
K
H
 
N
P
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
M
V
 
C
H
 
D
D
 
D
V
 
V
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
V
L
 
Y
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
Q
N
 
L
D
 
N
A
 
A
N
 
N
V
 
V
V
 
L
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
V
E
 
H
I
 
L
A
 
I
K
 
Q
D
 
D
C
 
I
V
 
V
D
 
K
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
T
 
D
T
 
A
D
 
T
F
 
Y
E
 
K
G
 
E
G
 
T
E
 
P
R
 
E
H
 
N
S
 
K
R
 
K
R
 
L
I
 
I
A
 
D
K
 
K
M
 
I

2vvpA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis ribose-5- phosphate isomerase b in complex with its substrates ribose 5-phosphate and ribulose 5-phosphate (see paper)
41% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 4:140/157 of 2vvpA

query
sites
2vvpA
I
 
V
A
 
Y
I
 
L
A
 
G
S
 
A
D
|
D
H
|
H
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
S
 
E
W
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
Y
 
H
E
 
E
V
 
P
L
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
G
C
 
A
N
 
L
G
 
R
P
 
Y
E
 
D
S
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
A
F
 
F
A
 
C
T
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
I
 
T
N
 
V
D
 
A
K
 
D
R
 
P
A
 
G
A
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
L
C
x
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
|
G
I
x
E
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
A
H
 
W
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
|
N
D
 
N
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
|
R
I
 
M
I
 
H
G
 
T
A
 
V
E
 
A
I
 
E
A
 
A
K
 
L
D
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
P
F
 
W
E
 
S
G
 
K
G
 
A
E
 
Q
R
|
R
H
|
H
S
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I

2betA Structure of mycobacterium tuberculosis ribose-5-phosphate isomerase, rpib, rv2465c, in complex with 4-phospho-d-erythronate. (see paper)
41% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 4:140/157 of 2betA

query
sites
2betA
I
 
V
A
 
Y
I
 
L
A
 
G
S
 
A
D
|
D
H
|
H
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
S
 
E
W
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
Y
 
H
E
 
E
V
 
P
L
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
G
C
 
A
N
 
L
G
 
R
P
 
Y
E
 
D
S
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
A
F
 
F
A
 
C
T
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
I
 
T
N
 
V
D
 
A
K
 
D
R
 
P
A
 
G
A
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
L
C
x
G
G
|
G
S
|
S
G
 
G
I
 
N
G
|
G
I
x
E
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
A
H
 
W
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
 
N
D
 
N
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
|
R
I
 
M
I
 
H
G
 
T
A
 
V
E
 
A
I
 
E
A
 
A
K
 
L
D
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
P
F
 
W
E
 
S
G
 
K
G
 
A
E
 
Q
R
|
R
H
|
H
S
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I

2besC Structure of mycobacterium tuberculosis ribose-5-phosphate isomerase, rpib, rv2465c, in complex with 4-phospho-d-erythronohydroxamic acid. (see paper)
41% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 4:140/158 of 2besC

query
sites
2besC
I
 
V
A
 
Y
I
 
L
A
 
G
S
 
A
D
|
D
H
|
H
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
S
 
E
W
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
Y
 
H
E
 
E
V
 
P
L
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
G
C
 
A
N
 
L
G
 
R
P
 
Y
E
 
D
S
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
F
 
F
A
 
C
T
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
I
 
T
N
 
V
D
 
A
K
 
D
R
 
P
A
 
G
A
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
L
C
x
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
|
G
I
x
E
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
A
H
 
W
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
|
N
D
 
N
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
|
R
I
 
M
I
 
H
G
 
T
A
 
V
E
 
A
I
 
E
A
 
A
K
 
L
D
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
P
F
 
W
E
 
S
G
 
K
G
 
A
E
 
Q
R
|
R
H
|
H
S
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I

P9WKD7 Ribose-5-phosphate isomerase B; Phosphoriboisomerase B; EC 5.3.1.6 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 3 papers)
41% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 6:142/162 of P9WKD7

query
sites
P9WKD7
I
 
V
A
 
Y
I
 
L
A
 
G
S
 
A
D
|
D
H
|
H
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
S
 
E
W
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
Y
 
H
E
 
E
V
 
P
L
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
G
C
 
A
N
 
L
G
 
R
P
 
Y
E
 
D
S
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
F
 
F
A
 
C
T
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
I
 
T
N
 
V
D
 
A
K
 
D
R
 
P
A
 
G
A
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
L
C
 
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
|
G
I
 
E
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
A
H
 
W
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
H
N
|
N
D
 
N
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
|
R
I
 
M
I
 
H
G
 
T
A
 
V
E
 
A
I
 
E
A
 
A
K
 
L
D
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
P
F
 
W
E
 
S
G
 
K
G
 
A
E
 
Q
R
|
R
H
 
H
S
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I

2vvqA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis ribose-5- phosphate isomerase b in complex with the inhibitor 5- deoxy-5-phospho-d-ribonate (see paper)
41% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 4:140/156 of 2vvqA

query
sites
2vvqA
I
 
V
A
 
Y
I
 
L
A
 
G
S
 
A
D
|
D
H
|
H
A
|
A
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
S
 
E
W
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
Y
 
H
E
 
E
V
 
P
L
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
G
C
 
A
N
 
L
G
 
R
P
 
Y
E
 
D
S
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
A
F
 
F
A
 
C
T
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
I
 
T
N
 
V
D
 
A
K
 
D
R
 
P
A
 
G
A
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
L
C
x
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
|
G
I
x
E
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
A
H
 
W
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
|
N
D
 
N
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
|
R
I
 
M
I
 
H
G
 
T
A
 
V
E
 
A
I
 
E
A
 
A
K
 
L
D
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
P
F
 
W
E
 
S
G
 
K
G
 
A
E
 
Q
R
|
R
H
|
H
S
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I

2vvoA Crystal structure of mycobacterium tuberculosis ribose-5-phosphate isomerase b in complex with alpha d-allose 6-phosphate (see paper)
41% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 4:140/156 of 2vvoA

query
sites
2vvoA
I
 
V
A
 
Y
I
 
L
A
 
G
S
 
A
D
|
D
H
|
H
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
S
 
E
W
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
Y
 
H
E
 
E
V
 
P
L
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
G
C
 
A
N
 
L
G
 
R
P
 
Y
E
 
D
S
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
D
Y
|
Y
P
 
P
D
 
A
F
 
F
A
 
C
T
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
I
 
T
N
 
V
D
 
A
K
 
D
R
 
P
A
 
G
A
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
L
C
x
G
G
|
G
S
|
S
G
 
G
I
x
N
G
|
G
I
x
E
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
A
H
 
W
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
|
N
D
 
N
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
|
R
I
 
M
I
 
H
G
 
T
A
 
V
E
 
A
I
 
E
A
 
A
K
 
L
D
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
P
F
 
W
E
 
S
G
 
K
G
 
A
E
 
Q
R
|
R
H
|
H
S
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I

1uslA Structure of mycobacterium tuberculosis ribose-5-phosphate isomerase, rpib, rv2465c, complexed with phosphate. (see paper)
41% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 4:140/156 of 1uslA

query
sites
1uslA
I
 
V
A
 
Y
I
 
L
A
 
G
S
 
A
D
|
D
H
 
H
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
E
 
E
M
 
L
K
 
K
A
 
Q
Q
 
R
I
 
I
A
 
I
S
 
E
W
 
H
L
 
L
A
 
K
G
 
Q
A
 
T
G
 
G
Y
 
H
E
 
E
V
 
P
L
 
I
D
 
D
L
 
C
G
 
G
C
 
A
N
 
L
G
 
R
P
 
Y
E
 
D
S
 
A
V
 
D
D
 
D
-
 
D
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
F
 
F
A
 
C
T
 
I
A
 
A
L
 
A
A
 
A
G
 
T
A
 
R
I
 
T
N
 
V
D
 
A
K
 
D
R
 
P
A
 
G
A
 
S
R
 
L
G
 
G
V
 
I
L
 
V
I
 
L
C
x
G
G
 
G
S
|
S
G
 
G
I
 
N
G
 
G
I
 
E
S
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
A
R
 
R
A
 
C
A
 
A
L
 
L
V
 
A
H
 
W
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
T
 
T
A
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
|
H
N
 
N
D
 
N
A
 
A
N
 
Q
V
 
L
V
 
I
A
 
G
L
 
I
G
 
G
A
 
G
R
 
R
I
 
M
I
 
H
G
 
T
A
 
V
E
 
A
I
 
E
A
 
A
K
 
L
D
 
A
C
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
T
 
T
D
 
P
F
 
W
E
 
S
G
 
K
G
 
A
E
 
Q
R
|
R
H
|
H
S
 
Q
R
 
R
R
|
R
I
 
I

3sgwA Crystal structure of ribose-5-phosphate isomerase b rpib from coccidioides immitis semi-covalently bound to malonic acid (see paper)
34% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 6:144/158 of 3sgwA

query
sites
3sgwA
I
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
C
D
|
D
H
 
D
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
E
 
S
M
 
Y
K
 
K
A
 
E
Q
 
A
I
 
L
A
 
K
S
 
A
W
 
H
L
 
L
A
 
S
G
 
D
A
 
N
G
 
P
Y
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
S
V
 
I
L
 
T
D
 
D
L
 
V
G
 
G
C
 
V
N
 
T
G
 
S
P
 
T
-
 
T
E
 
D
S
 
K
V
 
T
D
 
A
Y
|
Y
P
 
P
D
 
H
F
 
V
A
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
A
A
 
A
G
 
Q
A
 
L
I
 
I
N
 
K
D
 
D
K
 
G
R
 
K
A
 
V
A
 
D
R
 
R
G
 
A
V
 
L
L
 
M
I
 
I
C
|
C
G
|
G
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
I
 
V
S
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
T
V
 
A
H
 
H
D
 
D
V
 
T
T
 
F
T
 
S
A
 
V
R
 
E
L
 
R
A
 
A
R
 
I
Q
 
L
H
x
S
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
L
A
 
C
L
 
F
G
 
G
A
 
Q
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
R
C
 
L
V
 
A
D
 
G
A
 
E
F
 
W
L
 
L
T
 
T
T
 
Y
D
 
R
F
 
F
E
 
D
G
 
Q
G
 
K
E
 
S
R
 
A
H
x
S
S
 
A
R
 
Q
R
 
K
I
 
V

P0CL19 Putative ribose 5-phosphate isomerase; EC 5.3.1.- from Coccidioides immitis (strain RS) (Valley fever fungus) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 4:139/143 of query aligns to 11:149/163 of P0CL19

query
sites
P0CL19
I
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
S
 
C
D
|
D
H
x
D
A
 
A
G
 
G
Y
 
V
E
 
S
M
 
Y
K
 
K
A
 
E
Q
 
A
I
 
L
A
 
K
S
 
A
W
 
H
L
 
L
A
 
S
G
 
D
A
 
N
G
 
P
Y
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
S
V
 
I
L
 
T
D
 
D
L
 
V
G
 
G
C
 
V
N
 
T
G
 
S
P
 
T
-
 
T
E
 
D
S
 
K
V
 
T
D
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
H
F
 
V
A
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
A
A
 
A
G
 
Q
A
 
L
I
 
I
N
 
K
D
 
D
K
 
G
R
 
K
A
 
V
A
 
D
R
 
R
G
 
A
V
 
L
L
 
M
I
 
I
C
 
C
G
|
G
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
I
 
V
S
 
A
I
 
I
A
 
S
A
 
A
N
 
N
R
 
K
H
 
V
P
 
P
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
T
V
 
A
H
 
H
D
 
D
V
 
T
T
 
F
T
 
S
A
 
V
R
 
E
L
 
R
A
 
A
R
 
I
Q
 
L
H
 
S
N
 
N
D
 
D
A
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
L
A
 
C
L
 
F
G
 
G
A
 
Q
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
R
C
 
L
V
 
A
D
 
G
A
 
E
F
 
W
L
 
L
T
 
T
T
 
Y
D
 
R
F
 
F
E
 
D
G
 
Q
G
 
K
E
 
S
R
 
A
H
 
S
S
 
A
R
 
Q
R
 
K
I
 
V

Query Sequence

>AZOBR_RS10010 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS10010
MTTIAIASDHAGYEMKAQIASWLAGAGYEVLDLGCNGPESVDYPDFATALAGAINDKRAA
RGVLICGSGIGISIAANRHPGIRAALVHDVTTARLARQHNDANVVALGARIIGAEIAKDC
VDAFLTTDFEGGERHSRRIAKMG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory