SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS12025 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS12025 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2cjfA Type ii dehydroquinase inhibitor complex (see paper)
57% identity, 94% coverage: 4:143/149 of query aligns to 5:145/149 of 2cjfA

query
sites
2cjfA
D
 
N
A
 
A
S
 
P
V
 
I
L
 
M
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
N
|
N
L
|
L
N
 
N
M
x
L
L
|
L
G
 
G
V
 
Q
R
|
R
E
 
Q
P
 
P
H
 
E
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
S
M
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
L
C
 
C
Q
 
V
E
 
K
R
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
L
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
D
W
 
W
I
 
I
Q
 
H
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
L
E
 
N
H
 
H
D
 
C
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
x
A
A
|
A
Y
 
Y
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
N
L
 
T
S
 
C
E
 
D
-
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
|
H
L
x
I
S
|
S
N
 
N
I
 
I
Y
 
H
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
F
R
|
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
V
S
 
S
A
 
Q
V
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
G
M
 
V
I
 
V
C
 
A
G
 
G
F
 
C
G
 
G
P
 
V
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
L
 
F
A
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
R
M
 
I
A
 
A

2bt4A Type ii dehydroquinase inhibitor complex (see paper)
57% identity, 94% coverage: 4:143/149 of query aligns to 5:145/149 of 2bt4A

query
sites
2bt4A
D
 
N
A
 
A
S
 
P
V
 
I
L
 
M
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
x
L
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
R
|
R
E
 
Q
P
 
P
H
 
E
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
S
M
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
L
C
 
C
Q
 
V
E
 
K
R
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
L
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
D
W
 
W
I
 
I
Q
 
H
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
L
E
 
N
H
 
H
D
 
C
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
x
A
A
|
A
Y
 
Y
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
N
L
 
T
S
 
C
E
 
D
-
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
|
H
L
x
I
S
|
S
N
 
N
I
 
I
Y
 
H
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
F
R
|
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
V
S
 
S
A
 
Q
V
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
G
M
 
V
I
 
V
C
 
A
G
 
G
F
 
C
G
 
G
P
 
V
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
L
 
F
A
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
R
M
 
I
A
 
A

1gu1A Crystal structure of type ii dehydroquinase from streptomyces coelicolor complexed with 2,3-anhydro-quinic acid (see paper)
57% identity, 94% coverage: 4:143/149 of query aligns to 5:145/149 of 1gu1A

query
sites
1gu1A
D
 
N
A
 
A
S
 
P
V
 
I
L
 
M
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
|
L
N
 
N
M
 
L
L
|
L
G
 
G
V
 
Q
R
|
R
E
 
Q
P
 
P
H
 
E
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
S
M
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
L
C
 
C
Q
 
V
E
 
K
R
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
L
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
D
W
 
W
I
 
I
Q
 
H
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
L
E
 
N
H
 
H
D
 
C
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
x
A
A
|
A
Y
 
Y
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
N
L
 
T
S
 
C
E
 
D
-
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
x
I
S
|
S
N
 
N
I
 
I
Y
 
H
K
 
Q
R
|
R
E
 
E
A
 
P
I
 
F
R
|
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
V
S
 
S
A
 
Q
V
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
G
M
 
V
I
 
V
C
 
A
G
 
G
F
 
C
G
 
G
P
 
V
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
L
 
F
A
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
R
M
 
I
A
 
A

1v1jA Crystal structure of type ii dehydroquintae dehydratase from streptomyces coelicolor in complex with 3-fluoro (see paper)
57% identity, 94% coverage: 4:143/149 of query aligns to 6:146/150 of 1v1jA

query
sites
1v1jA
D
 
N
A
 
A
S
 
P
V
 
I
L
 
M
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
R
|
R
E
 
Q
P
 
P
H
 
E
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
S
M
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
L
C
 
C
Q
 
V
E
 
K
R
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
L
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
D
W
 
W
I
 
I
Q
 
H
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
L
E
 
N
H
 
H
D
 
C
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
x
A
A
|
A
Y
 
Y
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
N
L
 
T
S
 
C
E
 
D
-
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
x
I
S
|
S
N
 
N
I
 
I
Y
 
H
K
 
Q
R
|
R
E
 
E
A
 
P
I
 
F
R
|
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
V
S
 
S
A
 
Q
V
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
G
M
 
V
I
 
V
C
 
A
G
 
G
F
 
C
G
 
G
P
 
V
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
L
 
F
A
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
R
M
 
I
A
 
A

P15474 3-dehydroquinate dehydratase; 3-dehydroquinase; Type II DHQase; EC 4.2.1.10 from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see 2 papers)
57% identity, 94% coverage: 4:143/149 of query aligns to 7:147/157 of P15474

query
sites
P15474
D
 
N
A
 
A
S
 
P
V
 
I
L
 
M
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
N
 
N
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
R
|
R
E
 
Q
P
 
P
H
 
E
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
M
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
L
C
 
C
Q
 
V
E
 
K
R
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
L
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
D
W
 
W
I
 
I
Q
 
H
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
L
E
 
N
H
 
H
D
 
C
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
I
N
 
N
A
 
P
G
 
A
A
 
A
Y
 
Y
S
 
S
H
 
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
N
L
 
T
S
 
C
E
 
D
-
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
I
S
 
S
N
 
N
I
 
I
Y
 
H
K
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
F
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
V
S
 
S
A
 
Q
V
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
G
M
 
V
I
 
V
C
 
A
G
 
G
F
 
C
G
 
G
P
 
V
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
L
 
F
A
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
R
M
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1gtzA Structure of streptomyces coelicolor type ii dehydroquinase r23a mutant in complex with dehydroshikimate (see paper)
56% identity, 94% coverage: 4:143/149 of query aligns to 5:145/149 of 1gtzA

query
sites
1gtzA
D
 
N
A
 
A
S
 
P
V
 
I
L
 
M
V
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
Q
R
x
A
E
 
Q
P
 
P
H
 
E
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
S
M
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
A
D
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
L
C
 
C
Q
 
V
E
 
K
R
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
A
L
 
H
G
 
G
L
 
G
A
 
T
I
 
V
D
 
D
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
V
S
 
D
W
 
W
I
 
I
Q
 
H
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
L
E
 
N
H
 
H
D
 
C
G
 
G
I
 
I
V
 
V
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
x
A
A
|
A
Y
 
Y
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
I
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
N
L
 
T
S
 
C
E
 
D
-
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
V
 
V
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
x
I
S
|
S
N
 
N
I
 
I
Y
 
H
K
 
Q
R
|
R
E
 
E
A
 
P
I
 
F
R
|
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
V
S
 
S
A
 
Q
V
 
R
A
 
A
K
 
D
G
 
G
M
 
V
I
 
V
C
 
A
G
 
G
F
 
C
G
 
G
P
 
V
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
V
L
 
F
A
 
G
L
 
V
D
 
E
A
 
R
M
 
I
A
 
A

8idrC Crystal structure of apo-form of dehydroquinate dehydratase from corynebacterium glutamicum (see paper)
53% identity, 94% coverage: 6:145/149 of query aligns to 3:142/147 of 8idrC

query
sites
8idrC
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
K
R
 
R
E
 
E
P
 
P
H
 
D
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
S
 
H
M
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
L
 
V
E
 
V
G
 
A
A
 
L
C
 
A
Q
 
T
E
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
A
Q
 
K
L
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
V
D
 
E
F
 
A
R
 
L
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
D
W
 
A
I
 
L
Q
 
H
Q
 
N
A
 
A
R
 
R
T
 
G
E
 
T
H
 
H
D
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
|
G
A
 
G
Y
 
L
S
 
T
H
 
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
K
L
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
T
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
|
H
L
x
I
S
|
S
N
 
N
I
 
P
Y
 
H
K
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
I
S
 
S
A
 
L
V
 
A
A
 
A
K
 
V
G
 
S
M
 
V
I
 
I
C
 
A
G
 
G
F
 
A
G
 
G
P
 
I
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
R
L
 
F
A
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
I
M
 
L
A
 
A
N
 
N
I
 
L

2c4wA Type ii dehydroquinase from h. Pylori in complex with ah9095 (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 11:154/168 of 2c4wA

query
sites
2c4wA
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
|
L
N
 
N
M
 
M
L
|
L
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
x
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
E
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
|
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
x
T
N
 
N
I
|
I
Y
 
Q
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

8iduA Crystal structure of substrate bound-form dehydroquinate dehydratase from corynebacterium glutamicum (see paper)
52% identity, 94% coverage: 6:145/149 of query aligns to 3:142/145 of 8iduA

query
sites
8iduA
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
K
R
 
A
E
 
E
P
 
P
H
 
D
I
 
I
Y
|
Y
G
 
G
S
 
H
M
 
D
T
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
L
 
V
E
 
V
G
 
A
A
 
L
C
 
A
Q
 
T
E
 
A
R
 
E
A
 
A
E
 
A
Q
 
K
L
 
H
G
 
G
L
 
L
A
 
E
I
 
V
D
 
E
F
 
A
R
 
L
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
L
V
 
I
S
 
D
W
 
A
I
 
L
Q
 
H
Q
 
N
A
 
A
R
 
R
T
 
G
E
 
T
H
 
H
D
 
I
G
 
G
I
 
C
V
 
V
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
|
G
A
x
G
Y
 
L
S
 
T
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
M
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
I
 
K
L
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
T
V
 
V
E
 
E
V
 
V
H
|
H
L
x
I
S
|
S
N
 
N
I
 
P
Y
 
H
K
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
I
S
 
S
A
 
L
V
 
A
A
 
A
K
 
V
G
 
S
M
 
V
I
 
I
C
 
A
G
 
G
F
 
A
G
 
G
P
 
I
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
R
L
 
F
A
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
I
M
 
L
A
 
A
N
 
N
I
 
L

Q48255 3-dehydroquinate dehydratase; 3-dehydroquinase; Type II DHQase; EC 4.2.1.10 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 2:145/167 of Q48255

query
sites
Q48255
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
 
P
N
 
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
H
R
 
R
E
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
 
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
 
E
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
 
T
N
 
N
I
 
I
Y
 
Q
K
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

4b6rA Structure of helicobacter pylori type ii dehydroquinase inhibited by (2s)-2-(4-methoxy)benzyl-3-dehydroquinic acid (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 2:145/157 of 4b6rA

query
sites
4b6rA
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
|
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
|
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
|
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
x
T
N
 
N
I
 
I
Y
 
Q
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

2xd9A Structure of helicobacter pylori type ii dehydroquinase in complex with inhibitor compound (4r,6r,7s)-4,6,7-trihydroxy-2-((e)-prop-1- enyl)-4,5,6,7-tetrahydrobenzo(b)thiophene-4-carboxylic acid (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 2:145/153 of 2xd9A

query
sites
2xd9A
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
|
L
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
|
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
x
T
N
 
N
I
 
I
Y
 
Q
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

2wksA Structure of helicobacter pylori type ii dehydroquinase with a new carbasugar-thiophene inhibitor. (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 2:145/153 of 2wksA

query
sites
2wksA
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
|
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
|
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
x
T
N
 
N
I
 
I
Y
 
Q
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

4b6sA Structure of helicobacter pylori type ii dehydroquinase inhibited by (2s)-2-perfluorobenzyl-3-dehydroquinic acid (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 2:145/158 of 4b6sA

query
sites
4b6sA
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
|
L
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
|
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
x
T
N
 
N
I
 
I
Y
 
Q
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

2xb9A Structure of helicobacter pylori type ii dehydroquinase in complex with inhibitor compound (2r)-2-(4-methoxybenzyl)-3-dehydroquinic acid (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 2:145/158 of 2xb9A

query
sites
2xb9A
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
 
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
x
T
N
 
N
I
 
I
Y
 
Q
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

1j2yA Crystal structure of the type ii 3-dehydroquinase (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 2:145/158 of 1j2yA

query
sites
1j2yA
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
|
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
x
T
N
 
N
I
 
I
Y
 
Q
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

2xdaA Structure of helicobacter pylori type ii dehydroquinase in complex with inhibitor compound (4r,6r,7s)-2-(2-cyclopropyl)ethyl-4,6,7- trihydroxy-4,5,6,7-tetrahydrobenzo(b)thiophene-4-carboxylic acid (see paper)
49% identity, 95% coverage: 6:146/149 of query aligns to 2:145/150 of 2xdaA

query
sites
2xdaA
S
 
K
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
Q
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
|
L
N
 
N
M
|
M
L
 
L
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
D
P
 
P
H
 
R
I
 
L
Y
|
Y
G
 
G
S
 
M
M
 
V
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
Q
L
 
I
E
 
H
G
 
E
A
 
I
C
 
M
Q
 
Q
E
 
T
R
 
F
A
 
V
E
 
K
Q
 
Q
-
 
G
-
 
N
L
 
L
G
 
D
L
 
V
A
 
E
I
 
L
D
 
E
F
 
F
R
 
F
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
H
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
V
 
I
S
 
D
W
 
K
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
E
A
 
S
-
 
V
R
 
G
T
 
S
E
 
D
H
 
Y
D
 
E
G
 
G
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
 
G
A
|
A
Y
 
F
S
 
S
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
I
A
 
A
I
 
I
M
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
I
 
M
L
 
L
S
 
A
E
 
G
L
 
K
P
 
P
I
 
V
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
x
T
N
 
N
I
 
I
Y
 
Q
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
K
H
 
N
S
 
S
H
 
Y
I
 
T
S
 
G
A
 
A
V
 
A
A
 
C
K
 
G
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
M
G
 
G
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
L
G
 
G
Y
 
Y
L
 
N
L
 
M
A
 
A
L
 
L
D
 
M
A
 
A
M
 
M
A
 
V
N
 
N
I
 
I
L
 
L

5ydbA Crystal structure of the complex of type ii dehydroquinate dehydratase from acinetobacter baumannii with dehydroquinic acid at 1.76 angstrom resolution
51% identity, 91% coverage: 5:140/149 of query aligns to 1:137/145 of 5ydbA

query
sites
5ydbA
A
 
S
S
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
H
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
K
R
|
R
E
 
E
P
 
P
H
 
E
I
 
V
Y
|
Y
G
 
G
S
 
H
M
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
N
L
 
I
E
 
N
G
 
R
A
 
Q
C
 
L
Q
 
I
E
 
A
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
A
G
 
S
L
 
I
A
 
T
I
 
L
D
 
D
F
 
T
R
 
F
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
W
E
 
E
G
 
G
E
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
D
W
 
R
I
 
I
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
A
R
 
Q
T
 
T
E
 
E
H
 
G
-
 
V
D
 
K
G
 
L
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
x
A
A
|
A
Y
 
L
S
 
T
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
M
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
G
S
 
V
E
 
A
L
 
I
P
 
P
I
 
F
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
|
S
N
 
N
I
 
V
Y
 
H
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
A
I
 
F
R
|
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
A
 
D
V
 
K
A
 
A
K
 
I
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
C
G
 
G
F
 
L
G
 
G
P
 
A
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
L
 
S
L
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D

5b6pB Structure of the dodecameric type-ii dehydrogenate dehydratase from acinetobacter baumannii at 2.00 a resolution (see paper)
51% identity, 91% coverage: 5:140/149 of query aligns to 1:137/145 of 5b6pB

query
sites
5b6pB
A
 
S
S
 
T
V
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
I
N
 
H
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
N
M
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
K
R
|
R
E
 
E
P
 
P
H
 
E
I
 
V
Y
|
Y
G
 
G
S
 
H
M
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
D
D
 
N
L
 
I
E
 
N
G
 
R
A
 
Q
C
 
L
Q
 
I
E
 
A
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
L
 
A
G
 
S
L
 
I
A
 
T
I
 
L
D
 
D
F
 
T
R
 
F
Q
 
Q
S
 
S
N
 
N
H
 
W
E
 
E
G
 
G
E
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
D
W
 
R
I
 
I
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
A
R
 
Q
T
 
T
E
 
E
H
 
G
-
 
V
D
 
K
G
 
L
I
 
I
V
 
I
I
 
I
N
|
N
A
 
P
G
 
A
A
|
A
Y
 
L
S
 
T
H
 
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
M
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
L
 
G
S
 
V
E
 
A
L
 
I
P
 
P
I
 
F
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
|
L
S
|
S
N
 
N
I
 
V
Y
 
H
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
A
I
 
F
R
 
R
H
 
H
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
A
 
D
V
 
K
A
 
A
K
 
I
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
C
G
 
G
F
 
L
G
 
G
P
 
A
H
 
K
G
 
G
Y
 
Y
L
 
S
L
 
F
A
 
A
L
 
L
D
 
D

4cl0A Structure of the mycobacterium tuberculosis type ii dehydroquinase inhibited by a 3-dehydroquinic acid derivative
47% identity, 91% coverage: 9:143/149 of query aligns to 5:139/140 of 4cl0A

query
sites
4cl0A
V
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
P
|
P
N
|
N
L
 
L
N
 
G
M
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
R
R
|
R
E
 
E
P
 
P
H
 
A
I
 
V
Y
|
Y
G
 
G
S
 
G
M
 
T
T
 
T
L
 
H
D
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
V
G
 
A
A
 
L
C
 
I
Q
 
E
E
 
R
R
 
E
A
 
A
E
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
K
I
 
A
D
 
V
F
 
V
R
 
R
Q
 
Q
S
 
S
N
 
D
H
 
S
E
 
E
G
 
A
E
 
Q
L
 
L
V
 
L
S
 
D
W
 
W
I
 
I
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
A
R
 
A
T
 
D
E
 
A
H
 
A
D
 
E
G
 
P
I
 
V
V
 
I
I
 
L
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
x
G
Y
 
L
S
 
T
H
|
H
T
 
T
S
 
S
V
 
V
A
 
A
I
 
L
M
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
C
I
 
A
L
 
E
S
 
L
E
 
S
L
 
A
P
 
P
I
 
L
V
 
I
E
|
E
V
 
V
H
|
H
L
x
I
S
|
S
N
 
N
I
 
V
Y
 
H
K
 
A
R
|
R
E
 
E
A
 
E
I
 
F
R
|
R
H
 
R
H
 
H
S
 
S
H
 
Y
I
 
L
S
 
S
A
 
P
V
 
I
A
 
A
K
 
T
G
 
G
M
 
V
I
 
I
C
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
P
 
I
H
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
A
L
 
L
D
 
R
A
 
Y
M
 
L
A
 
A

Query Sequence

>AZOBR_RS12025 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS12025
VAIDASVLVLNGPNLNMLGVREPHIYGSMTLDDLEGACQERAEQLGLAIDFRQSNHEGEL
VSWIQQARTEHDGIVINAGAYSHTSVAIMDALILSELPIVEVHLSNIYKREAIRHHSHIS
AVAKGMICGFGPHGYLLALDAMANILERD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory