SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS15695 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS15695 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
50% identity, 99% coverage: 5:312/312 of query aligns to 6:313/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
I
 
V
L
 
L
L
 
M
V
 
M
E
 
C
S
 
P
M
 
M
M
 
S
P
 
T
D
 
Y
I
 
L
E
 
E
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
K
G
 
R
Y
 
F
T
 
K
V
 
L
H
 
F
R
 
R
L
 
Y
A
 
W
G
 
T
A
 
Q
P
 
P
D
 
A
R
 
Q
D
 
R
Q
 
D
L
 
F
V
 
L
A
 
A
E
 
L
V
 
Q
G
 
A
P
 
E
R
 
S
V
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
G
G
 
N
G
 
S
G
 
N
T
 
A
G
 
G
V
 
A
S
 
D
N
 
A
A
 
E
I
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
C
 
L
P
 
P
N
 
K
L
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
I
 
S
N
 
F
G
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
L
D
 
D
A
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
I
H
 
K
A
 
C
A
 
E
G
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
I
I
 
L
A
 
A
G
 
V
S
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
I
M
 
C
V
 
E
G
 
C
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
A
 
R
G
 
G
R
 
A
W
 
W
P
 
K
G
 
F
G
 
G
G
 
D
L
 
F
P
 
K
L
 
L
A
 
T
R
 
T
K
 
K
V
 
F
T
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
D
 
P
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
T
 
F
N
x
S
R
|
R
K
x
S
P
 
K
R
 
K
S
 
P
D
 
N
V
 
T
P
 
N
Y
 
Y
R
 
T
F
 
Y
V
 
Y
A
 
G
S
 
S
P
 
V
V
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
E
 
N
S
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
C
S
 
P
A
 
L
G
 
T
P
 
P
D
 
E
A
 
T
R
 
T
N
 
H
M
 
I
V
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
A
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
R
E
 
E
P
 
P
H
 
E
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
L
P
 
P
H
 
H
Q
 
V
A
 
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
M
 
K
A
 
V
M
 
M
G
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
E
A
 
A
F
 
H
F
 
F
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
L
T
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
V

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
50% identity, 99% coverage: 5:312/312 of query aligns to 4:311/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
I
 
V
L
 
L
L
 
M
V
 
M
E
 
C
S
 
P
M
 
M
M
 
S
P
 
T
D
 
Y
I
 
L
E
 
E
A
 
Q
A
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
K
G
 
R
Y
 
F
T
 
K
V
 
L
H
 
F
R
 
R
L
 
Y
A
 
W
G
 
T
A
 
Q
P
 
P
D
 
A
R
 
Q
D
 
R
Q
 
D
L
 
F
V
 
L
A
 
A
E
 
L
V
 
Q
G
 
A
P
 
E
R
 
S
V
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
G
G
 
N
G
 
S
G
 
N
T
 
A
G
 
G
V
 
A
S
 
D
N
 
A
A
 
E
I
 
L
M
 
I
D
 
D
A
 
A
C
 
L
P
 
P
N
 
K
L
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
S
I
 
S
N
 
F
G
 
S
V
|
V
G
 
G
T
 
L
D
 
D
A
 
K
V
 
V
D
 
D
L
 
L
K
 
I
H
 
K
A
 
C
A
 
E
G
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
D
D
 
D
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
I
I
 
L
A
 
A
G
 
V
S
 
L
R
 
R
R
 
R
M
 
I
M
 
C
V
 
E
G
 
C
D
 
D
R
 
K
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
A
 
R
G
 
G
R
 
A
W
 
W
P
 
K
G
 
F
G
 
G
G
 
D
L
 
F
P
 
K
L
 
L
A
 
T
R
 
T
K
 
K
V
 
F
T
 
S
G
 
G
K
 
K
R
 
R
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
D
 
P
I
 
I
A
 
S
Y
 
Y
T
 
F
N
x
S
R
|
R
K
x
S
P
 
K
R
 
K
S
 
P
D
 
N
V
 
T
P
 
N
Y
 
Y
R
 
T
F
 
Y
V
 
Y
A
 
G
S
 
S
P
 
V
V
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
E
 
N
S
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
V
 
V
A
 
A
A
x
C
S
x
P
A
 
L
G
 
T
P
 
P
D
 
E
A
x
T
R
 
T
N
 
H
M
 
I
V
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
E
V
 
V
I
 
I
E
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
A
 
P
V
 
H
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
|
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
R
E
|
E
P
 
P
H
 
E
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
D
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
L
P
 
P
H
|
H
Q
 
V
A
x
G
S
 
S
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
E
T
 
T
R
 
R
M
 
K
A
 
V
M
 
M
G
 
A
N
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
E
A
 
A
F
 
H
F
 
F
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
L
 
L
P
 
L
T
 
T
A
 
P
V
 
V
V
 
V

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
43% identity, 89% coverage: 34:311/312 of query aligns to 36:321/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
R
 
R
D
 
E
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
E
E
 
K
V
 
V
G
 
K
P
 
D
R
 
-
V
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
x
M
G
x
L
G
 
S
T
 
E
G
 
R
V
 
I
S
 
D
N
 
Q
A
 
E
I
 
V
M
 
F
D
 
E
A
 
N
C
 
A
P
 
P
N
 
R
L
 
L
G
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
N
N
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
T
 
Y
D
 
D
A
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
K
 
E
H
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
R
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
N
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
H
A
 
A
I
 
F
G
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
T
S
 
A
R
 
R
R
 
H
M
 
V
M
 
V
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
P
 
K
G
 
R
G
 
K
G
 
G
L
 
I
P
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
W
-
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
Y
K
 
E
V
 
L
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
 
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
D
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
T
 
Y
N
x
S
R
|
R
K
 
T
P
 
R
R
 
K
S
 
S
D
 
Q
V
 
A
P
 
E
Y
 
K
R
 
E
F
 
L
V
 
G
A
 
A
S
 
E
-
 
Y
-
 
R
P
 
P
V
 
L
D
 
E
-
 
E
L
 
V
A
 
L
R
 
K
E
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
V
I
 
I
V
 
L
A
|
A
A
x
V
S
x
P
A
 
L
G
 
T
P
 
K
D
 
E
A
x
T
R
 
M
N
 
Y
M
 
M
V
 
I
N
 
N
R
 
E
A
 
E
V
 
R
I
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
H
 
Y
A
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
T
P
 
P
H
|
H
Q
 
I
A
x
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
V
 
F
E
 
E
T
 
A
R
 
R
M
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
A
N
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
R
N
 
N
L
 
L
S
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
P
 
I
L
 
P
P
 
P
T
 
T
A
 
L
V
 
V

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
49% identity, 78% coverage: 60:303/312 of query aligns to 57:302/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
I
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
A
C
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
N
N
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
T
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
S
H
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
N
G
 
T
S
 
L
R
 
R
R
 
L
M
 
L
M
 
P
V
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
W
 
W
-
 
V
P
 
R
G
 
E
G
 
G
G
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
S
-
 
P
R
 
L
K
 
S
V
 
L
T
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
T
 
H
N
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
R
 
R
S
 
E
D
 
G
V
 
L
P
 
G
Y
 
F
R
 
T
F
 
Y
V
 
H
A
 
P
S
 
T
P
 
L
V
 
V
D
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
E
 
A
S
 
V
D
 
D
I
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
A
x
V
S
x
P
A
 
G
G
 
T
P
 
A
D
x
S
A
x
T
R
 
L
N
 
K
M
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
D
V
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
E
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
H
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
L
G
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
Q
 
L
P
 
P
H
|
H
Q
 
V
A
|
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
V
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
M
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
S
N
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
A
 
S

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
49% identity, 78% coverage: 60:303/312 of query aligns to 55:300/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
I
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
A
C
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
N
N
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
T
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
S
H
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
N
G
 
T
S
 
L
R
 
R
R
 
L
M
 
L
M
 
P
V
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
W
 
W
-
 
V
P
 
R
G
 
E
G
 
G
G
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
S
-
 
P
R
 
L
K
 
S
V
 
L
T
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
T
 
H
N
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
R
 
R
S
 
E
D
 
G
V
 
L
P
 
G
Y
 
F
R
 
T
F
 
Y
V
 
H
A
 
P
S
 
T
P
 
L
V
 
V
D
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
E
 
A
S
 
V
D
 
D
I
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
A
x
V
S
x
P
A
 
G
G
 
T
P
 
A
D
x
S
A
x
T
R
 
L
N
 
K
M
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
D
V
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
E
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
H
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
L
G
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
Q
 
L
P
 
P
H
|
H
Q
 
V
A
|
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
V
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
M
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
S
N
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
A
 
S

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
49% identity, 78% coverage: 60:303/312 of query aligns to 56:301/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
I
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
A
C
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
N
N
 
F
G
|
G
V
|
V
G
|
G
T
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
S
H
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
E
D
 
E
V
|
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
N
G
 
T
S
 
L
R
 
R
R
 
L
M
 
L
M
 
P
V
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
W
 
W
-
 
V
P
 
R
G
 
E
G
 
G
G
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
S
-
 
P
R
 
L
K
 
S
V
 
L
T
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
T
 
H
N
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
R
 
R
S
 
E
D
 
G
V
 
L
P
 
G
Y
 
F
R
 
T
F
 
Y
V
 
H
A
 
P
S
 
T
P
 
L
V
 
V
D
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
E
 
A
S
 
V
D
 
D
I
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
A
x
V
S
x
P
A
 
G
G
 
T
P
 
A
D
x
S
A
x
T
R
 
L
N
 
K
M
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
D
V
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
|
V
A
x
G
R
|
R
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
E
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
H
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
L
G
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
Q
 
L
P
 
P
H
|
H
Q
 
V
A
|
A
S
|
S
A
 
A
T
 
S
V
 
V
E
 
V
T
 
T
R
|
R
M
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
S
N
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
A
 
S

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
49% identity, 78% coverage: 60:303/312 of query aligns to 55:300/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
I
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
A
C
 
F
P
 
P
N
 
S
L
 
L
G
 
E
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
N
N
 
F
G
 
G
V
|
V
G
 
G
T
 
Y
D
 
D
A
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
S
H
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
V
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
L
 
T
A
 
A
I
 
I
G
 
G
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
N
G
 
T
S
 
L
R
 
R
R
 
L
M
 
L
M
 
P
V
 
Q
G
 
A
D
 
E
R
 
Q
F
 
W
V
 
L
R
 
R
A
 
Q
G
 
G
R
 
R
W
 
W
-
 
V
P
 
R
G
 
E
G
 
G
G
 
A
L
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
S
-
 
P
R
 
L
K
 
S
V
 
L
T
 
R
G
 
G
K
 
R
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
E
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
S
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
T
 
H
N
x
T
R
|
R
K
 
T
P
 
P
R
 
R
S
 
E
D
 
G
V
 
L
P
 
G
Y
 
F
R
 
T
F
 
Y
V
 
H
A
 
P
S
 
T
P
 
L
V
 
V
D
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
E
E
 
A
S
 
V
D
 
D
I
 
T
L
 
L
I
 
I
V
 
V
A
 
I
A
 
V
S
x
P
A
 
G
G
 
T
P
 
A
D
x
S
A
x
T
R
 
L
N
 
K
M
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
D
V
 
V
I
 
L
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
K
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
G
R
|
R
G
 
G
A
 
S
V
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
E
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
D
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
N
E
|
E
P
 
P
H
 
N
A
 
V
P
 
P
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
L
G
 
S
L
 
F
D
 
P
N
 
N
V
 
V
V
 
S
L
 
L
Q
 
L
P
 
P
H
|
H
Q
 
V
A
 
A
S
 
S
A
 
A
T
 
S
V
 
V
E
 
V
T
 
T
R
 
R
M
 
N
A
 
A
M
 
M
G
 
S
N
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
V
A
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
A
F
 
W
F
 
F
A
 
S

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
46% identity, 86% coverage: 45:311/312 of query aligns to 45:320/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
V
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
M
G
 
L
G
 
S
T
 
E
G
 
K
V
 
I
S
 
D
N
 
R
A
 
E
I
 
V
M
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
A
P
 
P
N
 
R
L
 
L
G
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
N
N
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
T
 
Y
D
 
D
A
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
K
 
E
H
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
D
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
W
G
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
A
R
 
R
R
 
H
M
 
V
M
 
V
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
K
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
P
 
K
G
 
R
G
 
R
G
 
G
L
 
I
P
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
-
 
M
-
 
F
L
 
L
A
 
G
R
 
Y
K
 
D
V
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
V
G
|
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
D
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
T
 
T
-
x
A
-
x
R
N
x
S
R
 
R
K
|
K
P
 
P
R
 
E
S
 
A
D
 
E
V
 
K
P
 
E
Y
 
L
R
 
G
F
 
A
V
 
E
A
 
F
S
 
K
P
 
P
V
 
L
D
 
E
-
 
E
L
 
L
A
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
A
A
x
V
S
x
P
A
 
L
G
 
T
P
 
K
D
x
E
A
x
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
M
V
 
I
N
 
N
R
 
E
A
 
E
V
 
R
I
 
L
E
 
R
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
P
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
V
|
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
K
E
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
H
 
Y
A
 
Y
P
 
D
E
 
E
A
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
A
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
T
P
 
P
H
|
H
Q
 
I
A
x
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
V
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
M
 
E
A
 
G
M
 
M
G
 
A
N
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
P
 
V
L
 
P
P
 
P
T
 
T
A
 
L
V
 
V

2dbqA Crystal structure of glyoxylate reductase (ph0597) from pyrococcus horikoshii ot3, complexed with NADP (i41) (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:311/312 of query aligns to 1:321/333 of 2dbqA

query
sites
2dbqA
M
 
M
K
 
K
P
 
P
E
 
K
I
 
V
L
 
F
L
 
I
V
 
T
E
 
R
S
 
E
M
 
I
M
 
-
P
 
P
D
 
E
I
 
V
-
 
G
E
 
I
A
 
K
A
 
M
L
 
L
D
 
E
A
 
D
G
 
E
Y
 
F
T
 
E
V
 
V
H
 
E
R
 
V
L
 
W
A
 
G
G
 
D
A
 
E
P
 
K
D
 
E
-
 
I
-
 
P
R
 
R
D
 
E
Q
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
K
P
 
-
R
 
E
V
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
M
G
 
L
G
 
S
T
 
E
G
 
R
V
 
I
S
 
D
N
 
K
A
 
E
I
 
V
M
 
F
D
 
E
A
 
N
C
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
G
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
N
N
 
Y
G
 
A
V
|
V
G
 
G
T
 
Y
D
 
D
A
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
K
 
E
H
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
D
D
 
A
V
x
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
F
G
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
T
S
 
A
R
 
R
R
 
H
M
 
V
M
 
V
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
P
 
K
G
 
K
G
 
R
G
 
G
L
 
V
P
 
A
L
 
W
A
 
H
R
 
P
K
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
D
V
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
D
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
T
 
Y
N
x
S
R
|
R
K
x
T
P
 
R
R
 
K
S
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
E
Y
 
R
R
 
E
F
 
L
V
 
N
A
 
A
-
 
E
-
 
F
S
 
K
P
 
P
V
 
L
-
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
|
A
A
x
V
S
x
P
A
 
L
G
 
T
P
 
R
D
 
E
A
x
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
L
V
 
I
N
 
N
R
 
E
A
 
E
V
 
R
I
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
E
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
E
E
|
E
P
 
P
H
 
Y
A
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
K
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
T
P
 
P
H
|
H
Q
 
I
A
x
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
V
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
M
 
E
A
 
G
M
 
M
G
 
A
N
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
P
 
I
L
 
P
P
 
P
T
 
T
A
 
L
V
 
V

O58320 Glyoxylate reductase; EC 1.1.1.26 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3)
41% identity, 100% coverage: 1:311/312 of query aligns to 1:321/334 of O58320

query
sites
O58320
M
 
M
K
 
K
P
 
P
E
 
K
I
 
V
L
 
F
L
 
I
V
 
T
E
 
R
S
 
E
M
 
I
M
 
-
P
 
P
D
 
E
I
 
V
-
 
G
E
 
I
A
 
K
A
 
M
L
 
L
D
 
E
A
 
D
G
 
E
Y
 
F
T
 
E
V
 
V
H
 
E
R
 
V
L
 
W
A
 
G
G
 
D
A
 
E
P
 
K
D
 
E
-
 
I
-
 
P
R
 
R
D
 
E
Q
 
I
L
 
L
V
 
L
A
 
K
E
 
K
V
 
V
G
 
K
P
 
-
R
 
E
V
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
M
G
 
L
G
 
S
T
 
E
G
 
R
V
 
I
S
 
D
N
 
K
A
 
E
I
 
V
M
 
F
D
 
E
A
 
N
C
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
G
 
R
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
N
N
 
Y
G
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
Y
D
 
D
A
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
I
K
 
E
H
 
E
A
 
A
A
 
T
G
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
V
 
V
T
 
T
N
 
N
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
A
V
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
F
G
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
T
S
 
A
R
 
R
R
 
H
M
 
V
M
 
V
V
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
R
 
R
A
 
S
G
 
G
R
 
E
W
 
W
P
 
K
G
 
K
G
 
R
G
 
G
L
 
V
P
 
A
L
 
W
A
 
H
R
 
P
K
 
K
-
 
W
-
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
D
V
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
|
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
R
A
 
A
A
 
K
G
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
D
 
R
I
 
I
A
 
L
Y
 
Y
T
 
Y
N
x
S
R
|
R
K
x
T
P
 
R
R
 
K
S
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
E
Y
 
R
R
 
E
F
 
L
V
 
N
A
 
A
S
 
E
-
 
F
-
 
K
P
 
P
V
 
L
-
 
E
D
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
V
I
 
V
V
 
L
A
 
A
A
 
V
S
 
P
A
 
L
G
 
T
P
 
R
D
 
E
A
 
T
R
 
Y
N
 
H
M
 
L
V
 
I
N
 
N
R
 
E
A
 
E
V
 
R
I
 
L
E
 
K
A
 
L
L
 
M
G
 
K
P
 
K
D
 
T
G
 
A
L
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
A
 
K
V
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
T
P
 
N
E
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
D
 
E
G
 
G
R
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
E
N
 
E
E
 
E
P
 
P
H
 
Y
A
 
Y
P
 
N
E
 
E
A
 
E
L
 
L
F
 
F
G
 
K
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
L
Q
 
T
P
 
P
H
|
H
Q
x
I
A
x
G
S
 
S
A
 
A
T
 
S
V
 
F
E
 
G
T
 
A
R
 
R
M
 
E
A
 
G
M
 
M
G
 
A
N
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
A
A
 
K
N
 
N
L
 
L
S
 
I
A
 
A
F
 
F
F
 
K
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
P
 
I
L
 
P
P
 
P
T
 
T
A
 
L
V
 
V

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
37% identity, 82% coverage: 56:311/312 of query aligns to 59:322/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
V
 
V
S
 
D
N
 
K
A
 
R
I
 
I
M
 
L
D
 
D
A
 
A
C
 
A
-
 
G
P
 
A
N
 
N
L
 
L
G
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
S
I
 
T
N
 
M
G
x
S
V
|
V
G
|
G
T
 
I
D
 
D
A
 
H
V
 
L
D
 
A
L
 
L
K
 
D
H
 
E
A
 
I
A
 
K
G
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
|
L
T
 
T
D
 
D
D
 
T
V
x
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
S
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
T
G
 
T
S
 
C
R
 
R
R
 
R
M
 
L
M
 
P
V
 
E
G
 
A
D
 
I
R
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
N
G
 
G
R
 
G
W
 
W
P
 
T
G
 
S
G
 
W
G
 
K
L
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
W
-
 
L
-
 
C
A
 
G
R
 
Y
K
 
G
V
 
L
T
 
T
G
 
Q
K
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
 
L
G
|
G
R
 
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
K
G
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
Q
-
 
R
I
 
F
A
 
L
Y
 
Y
T
 
T
N
x
G
R
|
R
K
 
Q
P
 
P
R
|
R
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
A
S
 
A
D
 
E
V
 
F
P
 
Q
Y
 
A
R
 
E
F
 
F
V
 
V
A
 
S
S
 
T
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
Q
S
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
A
A
x
C
S
|
S
A
 
L
G
 
T
P
 
P
D
 
A
A
x
T
R
 
E
N
 
G
M
 
L
V
 
C
N
 
N
R
 
K
A
 
D
V
 
F
I
 
F
E
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
A
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
A
 
S
N
 
P
E
|
E
P
 
P
-
 
L
H
 
P
A
 
T
P
 
N
E
 
H
A
 
P
L
 
L
F
 
L
G
 
T
L
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
Q
 
L
P
 
P
H
|
H
Q
 
I
A
x
G
S
 
S
A
 
A
T
 
T
V
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
M
 
N
A
 
T
M
 
M
G
 
S
N
 
L
L
 
L
V
 
A
L
 
A
A
 
N
N
 
N
L
 
L
S
 
L
A
 
A
F
 
G
F
 
L
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
M
P
 
P
T
 
S
A
 
E
V
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
37% identity, 82% coverage: 56:311/312 of query aligns to 63:326/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
V
 
V
S
 
D
N
 
K
A
 
R
I
 
I
M
 
L
D
 
D
A
 
A
C
 
A
-
 
G
P
 
A
N
 
N
L
 
L
G
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
S
I
 
T
N
 
M
G
 
S
V
|
V
G
|
G
T
 
I
D
 
D
A
 
H
V
 
L
D
 
A
L
 
L
K
 
D
H
 
E
A
 
I
A
 
K
G
 
K
R
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
T
 
G
N
 
Y
T
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
D
 
D
D
 
T
V
 
T
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
S
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
T
G
 
T
S
 
C
R
 
R
R
 
R
M
 
L
M
 
P
V
 
E
G
 
A
D
 
I
R
 
E
F
 
E
V
 
V
R
 
K
A
 
N
G
 
G
R
 
G
W
 
W
P
 
T
G
 
S
G
 
W
G
 
K
L
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
W
-
 
L
-
 
C
A
 
G
R
 
Y
K
 
G
V
 
L
T
 
T
G
 
Q
K
 
S
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
 
G
L
 
L
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
L
A
 
K
G
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
D
 
Q
-
 
R
I
 
F
A
 
L
Y
 
Y
T
 
T
N
 
G
R
|
R
K
x
Q
P
|
P
R
|
R
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
A
S
 
A
D
 
E
V
 
F
P
 
Q
Y
 
A
R
 
E
F
 
F
V
 
V
A
 
S
S
 
T
P
 
P
V
 
-
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
Q
S
 
S
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
C
S
|
S
A
 
L
G
 
T
P
 
P
D
 
A
A
 
T
R
 
E
N
 
G
M
 
L
V
 
C
N
 
N
R
 
K
A
 
D
V
 
F
I
 
F
E
 
Q
A
 
K
L
 
M
G
 
K
P
 
E
D
 
T
G
 
A
L
 
V
L
 
F
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
A
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
P
 
D
E
 
D
L
 
L
V
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
T
A
 
S
N
 
P
E
 
E
P
 
P
-
 
L
H
 
P
A
 
T
P
 
N
E
 
H
A
 
P
L
 
L
F
 
L
G
 
T
L
 
L
D
 
K
N
 
N
V
 
C
V
 
V
L
 
I
Q
 
L
P
 
P
H
|
H
Q
x
I
A
x
G
S
|
S
A
 
A
T
 
T
V
 
H
E
 
R
T
 
T
R
 
R
M
 
N
A
 
T
M
 
M
G
 
S
N
 
L
L
 
L
V
 
A
L
 
A
A
 
N
N
 
N
L
 
L
S
 
L
A
 
A
F
 
G
F
 
L
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
M
P
 
P
T
 
S
A
 
E
V
 
L

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:311/312 of query aligns to 3:311/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
P
 
P
E
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
D
S
 
K
M
 
L
M
 
A
P
 
P
D
 
S
I
 
T
E
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
G
A
 
D
G
 
Q
Y
 
V
T
 
E
V
 
V
H
 
R
R
 
W
L
 
V
A
 
D
G
 
G
A
 
-
P
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
D
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
V
G
 
-
P
 
P
R
 
E
V
 
A
R
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
L
T
 
V
G
 
R
G
 
S
G
 
A
T
 
T
G
 
T
V
 
V
S
 
D
N
 
A
A
 
E
I
 
V
M
 
L
D
 
A
A
 
A
C
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
G
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
x
R
N
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
T
 
L
D
 
D
A
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
D
H
 
A
A
 
A
A
 
T
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
L
V
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
T
V
 
S
L
x
N
T
 
I
D
 
H
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
H
A
 
A
I
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
M
 
I
M
 
P
V
 
A
G
 
A
D
 
D
R
 
A
F
 
S
V
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
H
R
 
T
W
 
W
P
 
K
G
 
R
G
 
S
G
 
S
L
 
F
P
 
S
L
 
-
A
 
G
R
 
T
K
 
E
V
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
L
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
A
 
A
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
A
Y
 
Y
T
 
V
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
A
Y
 
Y
R
 
D
F
 
P
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
P
 
P
V
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
A
E
 
R
S
 
A
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
S
V
 
V
A
 
H
A
 
L
S
 
P
A
 
K
G
 
T
P
 
P
D
 
E
A
 
T
R
 
A
N
 
G
M
 
L
V
 
I
N
 
D
R
 
K
A
 
E
V
 
A
I
 
L
E
 
A
A
 
K
L
 
T
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
V
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
E
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
T
D
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
H
 
C
A
 
T
P
 
D
E
 
S
A
 
P
L
 
L
F
 
F
G
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
Q
 
T
P
 
P
H
|
H
Q
 
L
A
 
G
S
x
A
A
 
S
T
 
T
V
 
A
E
 
E
T
 
A
R
x
Q
M
 
D
A
 
R
M
 
A
G
 
G
N
 
T
L
 
D
V
 
V
L
 
A
A
 
E
N
 
S
L
 
V
S
 
R
A
 
L
F
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
F
L
 
V
P
 
P
T
 
D
A
 
A
V
 
V

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:311/312 of query aligns to 2:310/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
P
 
P
E
 
V
I
 
V
L
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
D
S
 
K
M
 
L
M
 
A
P
 
P
D
 
S
I
 
T
E
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
G
A
 
D
G
 
Q
Y
 
V
T
 
E
V
 
V
H
 
R
R
 
W
L
 
V
A
 
D
G
 
G
A
 
-
P
 
P
D
 
D
R
 
R
D
 
D
Q
 
K
L
 
L
V
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
V
G
 
-
P
 
P
R
 
E
V
 
A
R
 
D
A
 
A
V
 
L
V
 
L
T
 
V
G
 
R
G
 
S
G
 
A
T
 
T
G
 
T
V
 
V
S
 
D
N
 
A
A
 
E
I
 
V
M
 
L
D
 
A
A
 
A
C
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
G
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
R
N
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
L
D
 
D
A
 
N
V
 
V
D
 
D
L
 
V
K
 
D
H
 
A
A
 
A
A
 
T
G
 
A
R
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
L
V
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
T
V
 
S
L
x
N
T
 
I
D
 
H
D
 
S
V
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
H
A
 
A
I
 
L
G
 
A
L
 
L
M
 
L
I
 
L
A
 
A
G
 
A
S
 
S
R
 
R
R
 
Q
M
 
I
M
 
P
V
 
A
G
 
A
D
 
D
R
 
A
F
 
S
V
 
L
R
 
R
A
 
E
G
 
H
R
 
T
W
 
W
P
 
K
G
 
R
G
 
S
G
 
S
L
 
F
P
 
S
L
 
-
A
 
G
R
 
T
K
 
E
V
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
I
G
 
G
M
 
Q
A
 
L
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
A
 
I
A
 
A
G
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
A
Y
 
Y
T
 
V
N
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
R
 
-
S
 
-
D
 
-
V
 
V
P
 
A
Y
 
Y
R
 
D
F
 
P
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
P
 
P
V
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
L
R
 
A
E
 
R
S
 
A
D
 
D
I
 
F
L
 
I
I
 
S
V
 
V
A
 
H
A
 
L
S
 
P
A
 
K
G
 
T
P
 
P
D
 
E
A
 
T
R
 
A
N
 
G
M
 
L
V
 
I
N
 
D
R
 
K
A
 
E
V
 
A
I
 
L
E
 
A
A
 
K
L
 
T
G
 
K
P
 
P
D
 
G
G
 
V
L
 
I
L
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
A
 
G
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
E
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
T
D
 
G
G
 
G
R
 
H
L
 
V
G
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
N
 
T
E
|
E
P
 
P
H
 
C
A
 
T
P
 
D
E
 
S
A
 
P
L
 
L
F
 
F
G
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
V
 
V
L
 
V
Q
 
T
P
 
P
H
|
H
Q
 
L
A
 
G
S
 
A
A
 
S
T
 
T
V
 
A
E
 
E
T
 
A
R
 
Q
M
 
D
A
 
R
M
 
A
G
 
G
N
 
T
L
 
D
V
 
V
L
 
A
A
 
E
N
 
S
L
 
V
S
 
R
A
 
L
F
 
A
F
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
F
L
 
V
P
 
P
T
 
D
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
33% identity, 93% coverage: 15:304/312 of query aligns to 14:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
I
 
I
E
 
Q
A
 
V
A
 
L
L
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
G
Y
 
L
T
 
E
V
 
V
H
 
I
R
 
-
L
 
Y
A
 
E
G
 
E
A
 
Y
P
 
P
D
 
D
R
 
E
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
-
E
 
E
V
 
L
G
 
V
P
 
K
R
 
D
V
 
V
R
 
E
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
V
G
 
R
G
 
S
G
 
K
T
 
P
G
 
K
V
 
V
S
 
T
N
 
R
A
 
R
I
 
V
M
 
I
D
 
E
A
 
S
C
 
A
P
 
P
N
 
K
L
 
L
G
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
A
I
 
R
N
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
T
 
L
D
 
D
A
 
N
V
 
I
D
 
D
L
 
V
K
 
E
H
 
A
A
 
A
A
 
K
G
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
E
V
 
V
T
 
V
N
 
N
T
 
A
P
 
P
D
 
A
V
 
A
L
x
S
T
 
S
D
 
R
D
 
S
V
|
V
A
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
I
 
V
G
 
G
L
 
L
M
 
M
I
 
F
A
 
S
G
 
V
S
 
A
R
 
R
R
 
K
M
 
I
M
 
A
V
 
F
G
 
A
D
 
D
R
 
R
F
 
K
V
 
M
R
 
R
A
 
E
G
 
G
R
 
V
W
 
W
P
 
-
G
 
A
G
 
K
G
 
K
L
 
E
P
 
A
L
 
M
A
 
G
R
 
I
K
 
E
V
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
K
R
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
I
L
 
I
G
|
G
L
x
F
G
|
G
R
|
R
I
|
I
G
 
G
M
 
Y
A
 
Q
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
R
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
D
 
N
I
 
I
A
 
L
-
 
L
-
x
Y
-
x
D
-
x
P
Y
 
Y
T
 
P
N
 
N
R
 
E
K
 
E
P
 
R
R
 
A
S
 
K
D
 
E
V
 
V
P
 
N
Y
 
G
R
 
K
F
 
F
V
 
V
A
 
D
S
 
L
P
 
E
V
 
T
D
 
-
L
 
L
A
 
L
R
 
K
E
 
E
S
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
V
I
 
T
V
 
I
A
 
H