SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS15705 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS15705 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 3 hits to proteins with known functional sites (download)

2eb5A Crystal structure of hpcg complexed with oxalate (see paper)
27% identity, 91% coverage: 17:248/254 of query aligns to 14:253/259 of 2eb5A

query
sites
2eb5A
L
 
L
I
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
E
K
 
K
N
 
Q
R
 
R
D
 
E
W
 
Q
L
 
I
S
 
R
A
 
A
-
 
I
-
 
S
L
 
L
P
 
D
T
 
Y
R
 
P
P
 
E
T
 
I
S
 
T
E
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
D
 
R
A
 
E
V
 
W
A
 
V
R
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
H
R
x
K
L
 
I
G
|
G
P
 
-
V
x
L
V
 
T
A
 
S
W
 
K
K
 
A
V
 
M
G
 
Q
A
 
A
R
 
S
T
 
S
P
 
Q
D
 
I
T
 
S
E
 
E
P
 
P
F
 
D
R
 
Y
A
 
G
P
 
A
I
 
L
H
 
L
A
 
D
D
 
D
T
 
M
L
 
F
F
 
F
F
 
H
D
 
D
T
 
G
T
 
S
T
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
T
A
 
D
D
 
R
Y
 
F
Q
 
I
V
 
V
I
 
P
G
 
R
M
 
I
E
|
E
A
 
V
E
|
E
I
 
L
A
 
A
Y
 
F
K
 
V
F
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
-
L
 
-
P
 
P
P
 
L
R
 
R
A
 
G
E
 
P
P
 
N
Y
 
C
S
 
T
R
 
L
E
 
F
E
 
D
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
A
 
A
V
 
T
E
 
D
S
 
Y
V
 
V
H
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
T
 
A
R
 
R
F
 
C
A
 
H
G
 
N
F
 
I
G
 
K
S
 
V
Q
 
F
D
 
D
G
 
T
L
 
I
S
 
S
H
 
D
M
 
N
A
 
A
D
 
A
Q
 
-
F
 
-
N
 
N
H
 
A
G
 
G
A
 
V
L
 
I
V
 
L
V
 
G
G
 
G
P
 
R
A
 
P
I
 
I
A
 
K
-
 
P
-
 
D
-
 
E
-
 
L
D
 
D
W
 
L
R
 
R
S
 
W
L
 
I
E
 
S
P
 
A
L
 
L
K
 
M
E
 
Y
R
 
R
V
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
N
G
 
G
E
 
V
T
 
I
K
 
E
A
 
E
D
 
T
T
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
N
 
G
S
 
V
A
 
L
G
 
N
E
 
H
P
 
P
V
 
A
R
 
N
L
 
G
L
 
V
V
 
A
W
 
W
M
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
K
G
 
L
A
 
A
V
 
P
S
 
Y
L
 
D
G
 
V
G
 
Q
L
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
V
 
I
T
 
L
T
 
G
G
|
G
S
|
S
H
 
F
V
 
T
G
 
R
T
 
P
V
 
V
M
 
P
V
 
A
P
 
R
A
 
K
G
 
G
S
 
D
T
 
T
S
 
F
V
 
H
A
 
V
V
 
D
Y
 
Y
G
 
G
T
 
N
M
 
M
G
 
G
T
 
S

2eb6A Crystal structure of hpcg complexed with mg ion (see paper)
25% identity, 91% coverage: 17:248/254 of query aligns to 14:261/267 of 2eb6A

query
sites
2eb6A
L
 
L
I
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
E
K
 
K
N
 
Q
R
 
R
D
 
E
W
 
Q
L
 
I
S
 
R
A
 
A
-
 
I
-
 
S
L
 
L
P
 
D
T
 
Y
R
 
P
P
 
E
T
 
I
S
 
T
E
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
D
 
R
A
 
E
V
 
W
A
 
V
R
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
H
R
 
K
L
 
I
G
 
G
P
 
-
V
 
L
V
 
T
A
 
S
W
 
K
K
 
A
V
 
M
G
 
Q
A
 
A
R
 
S
T
 
S
P
 
Q
D
 
I
T
 
S
E
 
E
P
 
P
F
 
D
R
 
Y
A
 
G
P
 
A
I
 
L
H
 
L
A
 
D
D
 
D
T
 
M
L
 
F
F
 
F
F
 
H
D
 
D
T
 
G
T
 
S
T
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
T
A
 
D
D
 
R
Y
 
F
Q
 
I
V
 
V
I
 
P
G
 
R
M
 
I
E
|
E
A
 
V
E
|
E
I
 
L
A
 
A
Y
 
F
K
 
V
F
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
-
L
 
-
P
 
P
P
 
L
R
 
R
A
 
G
E
 
P
P
 
N
Y
 
C
S
 
T
R
 
L
E
 
F
E
 
D
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
A
 
A
V
 
T
E
 
D
S
 
Y
V
 
V
H
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
T
 
A
R
 
R
F
 
C
A
 
H
G
 
N
F
 
I
G
 
D
S
 
P
Q
 
E
D
 
T
G
 
Q
-
 
R
-
 
P
-
 
R
-
 
K
-
 
V
L
 
F
S
 
D
H
 
T
M
 
I
A
 
S
D
 
D
Q
 
N
F
 
A
N
 
A
H
 
N
G
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
I
V
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
K
P
 
P
A
 
D
I
 
E
A
 
L
D
 
D
W
 
L
R
 
R
S
 
W
L
 
I
E
 
S
P
 
A
L
 
L
K
 
M
E
 
Y
R
 
R
V
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
N
G
 
G
E
 
V
T
 
I
K
 
E
A
 
E
D
 
T
T
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
N
 
G
S
 
V
A
 
L
G
 
N
E
 
H
P
 
P
V
 
A
R
 
N
L
 
G
L
 
V
V
 
A
W
 
W
M
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
K
G
 
L
A
 
A
V
 
P
S
 
Y
L
 
D
G
 
V
G
 
Q
L
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
V
 
I
T
 
L
T
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
F
V
 
T
G
 
R
T
 
P
V
 
V
M
 
P
V
 
A
P
 
R
A
 
K
G
 
G
S
 
D
T
 
T
S
 
F
V
 
H
A
 
V
V
 
D
Y
 
Y
G
 
G
T
 
N
M
 
M
G
 
G
T
 
S

P42270 2-oxo-hept-4-ene-1,7-dioate hydratase; OHED hydratase; EC 4.2.1.163 from Escherichia coli (see paper)
25% identity, 91% coverage: 17:248/254 of query aligns to 14:261/267 of P42270

query
sites
P42270
L
 
L
I
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
E
K
 
K
N
 
Q
R
 
R
D
 
E
W
 
Q
L
 
I
S
 
R
A
 
A
-
 
I
-
 
S
L
 
L
P
 
D
T
 
Y
R
 
P
P
 
E
T
 
I
S
 
T
E
 
I
A
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
D
 
R
A
 
E
V
 
W
A
 
V
R
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
H
R
 
K
L
 
I
G
 
G
P
 
-
V
 
L
V
 
T
A
 
S
W
 
K
K
 
A
V
 
M
G
 
Q
A
 
A
R
 
S
T
 
S
P
 
Q
D
 
I
T
 
S
E
 
E
P
 
P
F
 
D
R
 
Y
A
 
G
P
 
A
I
 
L
H
 
L
A
 
D
D
 
D
T
 
M
L
 
F
F
 
F
F
 
H
D
 
D
T
 
G
T
 
S
T
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
T
A
 
D
D
 
R
Y
 
F
Q
 
I
V
 
V
I
 
P
G
 
R
M
 
I
E
|
E
A
 
V
E
|
E
I
 
L
A
 
A
Y
 
F
K
 
V
F
 
L
A
 
A
K
 
K
D
 
-
L
 
-
P
 
P
P
 
L
R
 
R
A
 
G
E
 
P
P
 
N
Y
 
C
S
 
T
R
 
L
E
 
F
E
 
D
V
 
V
L
 
Y
D
 
N
A
 
A
V
 
T
E
 
D
S
 
Y
V
 
V
H
 
I
P
 
P
A
 
A
F
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
T
 
A
R
 
R
F
 
C
A
 
H
G
 
N
F
 
I
G
 
D
S
 
P
Q
 
E
D
 
T
G
 
Q
-
 
R
-
 
P
-
 
R
-
 
K
-
 
V
L
 
F
S
 
D
H
 
T
M
 
I
A
 
S
D
 
D
Q
 
N
F
 
A
N
 
A
H
 
N
G
 
A
A
 
G
L
 
V
V
 
I
V
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
I
-
 
K
P
 
P
A
 
D
I
 
E
A
 
L
D
 
D
W
 
L
R
 
R
S
 
W
L
 
I
E
 
S
P
 
A
L
 
L
K
 
M
E
 
Y
R
 
R
V
 
-
A
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
N
G
 
G
E
 
V
T
 
I
K
 
E
A
 
E
D
 
T
T
 
G
V
 
V
A
 
A
G
 
A
N
 
G
S
 
V
A
 
L
G
 
N
E
 
H
P
 
P
V
 
A
R
 
N
L
 
G
L
 
V
V
 
A
W
 
W
M
 
L
A
 
A
N
 
N
T
 
K
G
 
L
A
 
A
V
 
P
S
 
Y
L
 
D
G
 
V
G
 
Q
L
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
V
 
I
T
 
L
T
 
G
G
 
G
S
 
S
H
 
F
V
 
T
G
 
R
T
 
P
V
 
V
M
 
P
V
 
A
P
 
R
A
 
K
G
 
G
S
 
D
T
 
T
S
 
F
V
 
H
A
 
V
V
 
D
Y
 
Y
G
 
G
T
 
N
M
 
M
G
 
G
T
 
S

Query Sequence

>AZOBR_RS15705 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS15705
MPDEMNNAAFSDSVDALIQARKNRDWLSALPTRPTSEAEAYAIQDAVARRLGPVVAWKVG
ARTPDTEPFRAPIHADTLFFDTTTLPAADYQVIGMEAEIAYKFAKDLPPRAEPYSREEVL
DAVESVHPAFEIVDTRFAGFGSQDGLSHMADQFNHGALVVGPAIADWRSLEPLKERVALV
VDGETKADTVAGNSAGEPVRLLVWMANTGAVSLGGLKAGDVVTTGSHVGTVMVPAGSTSV
AVYGTMGTYELTVK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory