SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS20525 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS20525 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 11 hits to proteins with known functional sites (download)

P77324 Aldehyde oxidoreductase FAD-binding subunit PaoB; EC 1.2.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
53% identity, 97% coverage: 1:323/332 of query aligns to 1:314/318 of P77324

query
sites
P77324
M
 
M
R
 
K
S
 
A
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
A
 
E
R
 
R
A
 
V
D
 
N
S
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
A
 
A
-
 
A
I
 
L
G
 
S
R
 
A
A
 
Q
G
 
R
A
 
V
S
 
P
G
 
G
T
 
A
A
x
K
F
|
F
V
x
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
|
N
L
|
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
M
K
 
K
A
 
L
D
 
E
V
 
I
L
 
E
R
 
T
P
 
P
E
 
T
G
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
D
I
 
V
S
 
N
R
 
G
L
 
L
P
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
I
E
 
E
E
 
V
T
 
T
A
 
D
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
T
D
 
D
T
 
L
A
 
A
Y
 
A
D
 
H
E
 
E
R
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
R
R
 
D
Y
 
Y
P
 
A
M
 
V
L
 
L
S
 
S
K
 
R
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
N
 
N
M
 
Q
A
 
A
T
|
T
N
 
T
G
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
|
C
Y
 
P
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
N
T
 
Q
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
K
R
 
R
E
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
|
C
G
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
F
N
 
S
R
 
R
I
 
Q
H
 
H
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
V
S
 
S
D
 
E
Q
 
A
C
|
C
I
 
I
A
 
A
V
 
T
H
 
H
P
 
P
S
 
S
D
|
D
L
 
M
C
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
V
 
T
T
 
I
G
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
K
-
 
T
R
 
R
S
 
S
I
 
I
P
 
T
F
 
L
G
 
A
E
 
D
F
 
F
H
 
Y
R
 
H
L
 
P
P
 
P
G
 
G
D
 
K
R
 
T
P
 
P
E
 
H
I
 
I
D
 
E
T
 
T
V
 
A
L
 
L
R
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
|
I
T
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
P
K
 
P
G
 
L
F
 
G
A
 
G
E
 
K
H
 
H
S
 
-
T
 
I
Y
 
Y
L
 
R
K
|
K
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
I
L
 
I
E
 
Q
M
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
S
A
 
G
R
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
H
K
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
R
D
 
I
P
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
I
 
S
-
 
Q
G
 
G
K
 
A
P
 
Q
A
 
A
T
 
V
P
 
Y
D
 
D
R
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
A
D
 
S
A
 
A
K
 
H
G
 
P
H
 
T
E
 
A
H
 
E
N
 
N
S
 
T
F
 
F
K
 
K
I
 
L
E
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
T
I
 
L
V
 
A
R
 
S
A
 
V
L
 
L
T
 
A
E
 
E
A
 
A

5g5gB Escherichia coli periplasmic aldehyde oxidase (see paper)
53% identity, 97% coverage: 1:323/332 of query aligns to 1:314/316 of 5g5gB

query
sites
5g5gB
M
 
M
R
 
K
S
 
A
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
A
 
E
R
 
R
A
 
V
D
 
N
S
 
T
A
 
P
A
 
A
D
 
E
A
 
A
-
 
A
I
 
L
G
 
S
R
 
A
A
 
Q
G
 
R
A
 
V
S
 
P
G
 
G
T
 
A
A
x
K
F
|
F
V
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
|
N
L
|
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
M
K
 
K
A
 
L
D
 
E
V
 
I
L
 
E
R
 
T
P
 
P
E
 
T
G
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
D
I
 
V
S
 
N
R
 
G
L
 
L
P
 
G
L
 
L
D
 
D
R
 
K
I
 
I
E
 
E
E
 
V
T
 
T
A
 
D
E
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
V
R
 
R
N
 
N
A
 
T
D
 
D
T
 
L
A
 
A
Y
 
A
D
 
H
E
 
E
R
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
R
R
 
D
Y
 
Y
P
 
A
M
 
V
L
 
L
S
 
S
K
 
R
A
 
A
I
 
L
L
 
L
A
 
A
G
|
G
A
|
A
S
 
S
A
 
G
Q
 
Q
L
|
L
R
 
R
N
 
N
M
 
Q
A
|
A
T
|
T
N
 
T
G
x
A
G
|
G
N
|
N
L
 
L
L
|
L
Q
|
Q
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
|
C
Y
 
P
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
N
T
 
Q
P
 
P
C
|
C
N
|
N
K
|
K
R
 
R
E
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
|
C
G
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
F
N
 
S
R
 
R
I
 
Q
H
|
H
A
 
A
I
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
V
S
 
S
D
 
E
Q
 
A
C
|
C
I
|
I
A
|
A
V
 
T
H
 
H
P
 
P
S
|
S
D
|
D
L
 
M
C
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
M
A
 
R
A
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
Q
 
E
V
 
T
T
 
I
G
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
K
-
 
T
R
 
R
S
 
S
I
 
I
P
 
T
F
 
L
G
 
A
E
 
D
F
 
F
H
 
Y
R
 
H
L
 
P
P
 
P
G
 
G
D
 
K
R
 
T
P
 
P
E
 
H
I
 
I
D
 
E
T
 
T
V
 
A
L
 
L
R
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
E
L
|
L
I
|
I
T
 
V
A
 
A
I
 
V
D
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
P
K
 
P
G
 
L
F
 
G
A
 
G
E
 
K
H
 
H
S
 
-
T
 
I
Y
 
Y
L
 
R
K
 
K
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
F
|
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
I
L
 
I
E
 
Q
M
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
-
T
 
-
V
 
-
R
 
-
E
 
S
A
 
G
R
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
H
K
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
R
D
 
I
P
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
I
 
S
-
 
Q
G
 
G
K
 
A
P
 
Q
A
 
A
T
 
V
P
 
Y
D
 
D
R
 
-
F
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
T
L
 
L
L
 
F
R
 
A
D
 
S
A
 
A
K
 
H
G
 
P
H
 
T
E
 
A
H
 
E
N
 
N
S
 
T
F
 
F
K
 
K
I
 
L
E
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
K
R
 
R
A
 
T
I
 
L
V
 
A
R
 
S
A
 
V
L
 
L
T
 
A
E
 
E
A
 
A

5y6qB Crystal structure of an aldehyde oxidase from methylobacillus sp. Ky4400 (see paper)
46% identity, 98% coverage: 1:325/332 of query aligns to 1:328/330 of 5y6qB

query
sites
5y6qB
M
 
M
R
 
N
S
 
P
F
 
F
T
 
H
Y
 
W
A
 
K
R
 
V
A
 
A
D
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
S
D
 
E
A
 
A
I
 
A
G
 
A
R
 
L
A
 
K
G
 
Q
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
S
A
 
Q
F
x
I
V
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
x
T
L
x
Q
L
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
M
K
 
K
A
 
C
D
 
G
V
 
V
L
 
F
R
 
N
P
 
P
E
 
P
G
 
Q
L
 
L
V
 
I
D
 
G
I
 
I
S
 
N
R
 
G
L
 
L
P
 
S
L
 
E
D
 
L
R
 
R
I
 
S
E
 
L
E
 
S
T
 
F
A
 
D
E
 
N
G
 
D
G
 
K
L
 
I
R
 
S
L
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
I
R
 
T
N
 
M
A
 
S
D
 
Q
T
 
L
A
 
A
Y
 
D
D
 
H
E
 
P
R
 
D
V
 
C
Q
 
Q
T
 
Q
R
 
H
Y
 
A
P
 
P
M
 
A
L
 
I
S
 
Y
K
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
W
A
 
Q
G
x
A
A
|
A
S
 
S
A
 
P
Q
 
Q
L
x
I
R
 
R
N
 
N
M
 
M
A
|
A
T
|
T
N
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
L
x
R
Q
|
Q
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
|
C
Y
 
A
Y
 
Y
F
x
Y
Y
 
R
D
 
D
T
 
P
A
 
A
T
 
T
-
 
F
-
 
S
P
 
A
C
|
C
N
|
N
K
 
K
R
 
R
E
 
N
P
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
|
C
G
 
A
A
|
A
I
 
R
G
 
Q
G
 
G
V
 
V
N
 
N
R
 
S
I
 
N
H
 
H
A
 
A
I
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
D
 
D
Q
 
S
C
|
C
I
|
I
A
|
A
V
 
V
H
 
Y
P
 
P
S
x
G
D
|
D
L
 
L
C
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
F
E
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
Q
 
I
V
 
V
T
 
Q
G
 
N
P
 
P
E
 
Q
G
 
G
E
 
E
-
 
T
R
 
R
S
 
R
I
 
I
P
 
A
F
 
I
G
 
D
E
 
D
F
 
F
H
 
F
R
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
E
R
 
T
P
 
P
E
 
D
I
 
Q
D
 
E
T
 
H
V
 
D
L
 
L
R
 
R
P
 
D
G
 
D
D
 
E
L
x
I
I
|
I
T
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
Q
K
 
T
G
 
A
F
 
S
A
 
L
E
 
Q
H
 
R
S
 
S
T
 
H
Y
 
Y
L
 
L
K
|
K
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
A
 
E
F
|
F
A
 
A
L
 
A
V
 
A
S
 
S
V
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
E
 
T
M
 
L
D
 
E
G
 
N
G
 
G
T
 
V
V
 
M
R
 
R
E
 
Q
A
 
V
R
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
H
 
T
K
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
R
D
 
A
P
 
T
E
 
R
A
 
V
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
E
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
F
T
 
N
P
 
E
D
 
E
R
 
T
F
 
V
R
 
F
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
E
V
 
L
L
 
I
L
 
N
R
 
Q
D
 
E
A
 
T
K
 
Q
G
 
A
H
 
L
E
 
E
H
 
H
N
 
N
S
 
A
F
 
Y
K
 
K
I
 
V
E
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
P
R
 
R
A
 
V
I
 
I
V
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
T
 
M
E
 
A
A
 
A
A
 
G
E
 
E

1rm6B Structure of 4-hydroxybenzoyl-coa reductase from thauera aromatica (see paper)
32% identity, 82% coverage: 1:272/332 of query aligns to 4:267/323 of 1rm6B

query
sites
1rm6B
M
 
L
R
 
T
S
 
D
F
 
F
T
 
R
Y
 
T
A
 
H
R
 
R
A
 
P
D
 
A
S
 
T
A
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
V
G
 
N
R
 
A
A
 
L
G
 
A
A
 
A
S
 
E
G
 
A
T
 
T
A
 
L
F
x
P
V
 
L
A
x
G
G
x
A
G
|
G
T
|
T
N
x
D
L
|
L
L
 
L
D
 
P
L
 
N
M
 
L
K
 
R
A
 
R
D
 
G
V
 
L
L
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
A
G
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
x
L
S
 
T
R
 
G
L
 
I
P
 
D
-
 
G
L
 
L
D
 
A
R
 
T
I
 
I
E
 
S
E
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
G
A
 
A
R
 
T
N
 
L
A
 
E
D
 
A
T
 
I
A
 
A
Y
 
E
D
 
H
E
 
D
R
 
A
V
 
I
Q
 
R
T
 
T
R
 
T
Y
 
W
P
 
P
M
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
Q
A
 
A
I
 
A
L
 
E
A
 
S
G
x
V
A
|
A
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
L
 
H
R
 
R
N
 
A
M
 
A
A
|
A
T
|
T
N
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
L
x
C
Q
|
Q
R
 
D
T
 
T
R
 
R
C
|
C
Y
 
T
Y
x
F
F
 
Y
Y
 
N
D
 
Q
T
 
S
A
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
E
K
 
W
R
 
W
E
 
R
P
 
S
G
 
G
S
 
N
G
 
G
-
 
Y
C
|
C
G
 
L
A
 
K
I
 
Y
G
 
K
G
 
G
V
 
-
N
 
D
R
 
K
I
x
C
H
|
H
A
x
V
I
 
I
L
 
V
G
 
-
A
 
K
S
 
S
D
 
D
Q
 
R
C
|
C
I
x
Y
A
|
A
V
 
T
H
 
Y
P
 
H
S
 
G
D
|
D
L
 
V
C
 
A
V
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
R
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
T
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
R
S
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
V
G
 
A
E
 
Q
F
 
L
H
 
F
R
 
R
L
 
E
P
 
S
G
 
G
D
 
A
R
 
E
P
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
H
T
 
L
V
 
T
L
 
L
R
 
E
P
 
K
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
x
L
T
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
P
K
 
T
G
 
G
F
 
-
A
 
A
E
 
W
H
 
S
S
 
A
T
 
A
Y
 
Y
L
 
S
K
 
K
V
 
V
R
 
R
D
 
I
R
 
R
A
 
D
S
 
A
Y
x
V
A
x
D
F
|
F
A
 
P
L
 
L
V
 
A
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
D
T
 
R
V
 
I
R
 
A
E
 
G
A
 
L
R
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
N
H
 
S
K
 
A
P
 
P
W
 
L
R
 
M
D
 
V
P
 
P

O33820 4-hydroxybenzoyl-CoA reductase subunit beta; 4-HBCR subunit beta; EC 1.1.7.1 from Thauera aromatica (see paper)
32% identity, 82% coverage: 1:272/332 of query aligns to 4:267/324 of O33820

query
sites
O33820
M
 
L
R
 
T
S
 
D
F
 
F
T
 
R
Y
 
T
A
 
H
R
 
R
A
 
P
D
 
A
S
 
T
A
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
V
G
 
N
R
 
A
A
 
L
G
 
A
A
 
A
S
 
E
G
 
A
T
 
T
A
 
L
F
x
P
V
x
L
A
x
G
G
x
A
G
|
G
T
|
T
N
x
D
L
|
L
L
 
L
D
 
P
L
 
N
M
 
L
K
 
R
A
 
R
D
 
G
V
 
L
L
 
G
R
 
H
P
 
P
E
 
A
G
 
A
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
L
S
 
T
R
 
G
L
 
I
P
 
D
-
 
G
L
 
L
D
 
A
R
 
T
I
 
I
E
 
S
E
 
T
T
 
L
A
 
A
E
 
D
G
 
G
G
 
S
L
 
L
R
 
R
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
G
A
 
A
R
 
T
N
 
L
A
 
E
D
 
A
T
 
I
A
 
A
Y
 
E
D
 
H
E
 
D
R
 
A
V
 
I
Q
 
R
T
 
T
R
 
T
Y
 
W
P
 
P
M
 
A
L
 
L
S
 
A
K
 
Q
A
 
A
I
 
A
L
 
E
A
 
S
G
 
V
A
 
A
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
L
 
H
R
 
R
N
 
A
M
 
A
A
 
A
T
|
T
N
 
L
G
 
G
G
 
G
N
|
N
L
 
L
L
 
C
Q
|
Q
R
 
D
T
 
T
R
 
R
C
 
C
Y
 
T
Y
 
F
F
 
Y
Y
 
N
D
 
Q
T
 
S
A
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
E
K
 
W
R
 
W
E
 
R
P
 
S
G
 
G
S
 
N
G
 
G
-
 
Y
C
 
C
G
 
L
A
 
K
I
 
Y
G
 
K
G
 
G
V
 
-
N
 
D
R
 
K
I
 
C
H
 
H
A
 
V
I
 
I
L
 
V
G
 
-
A
 
K
S
 
S
D
 
D
Q
 
R
C
 
C
I
 
Y
A
 
A
V
 
T
H
 
Y
P
 
H
S
 
G
D
|
D
L
 
V
C
 
A
V
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
M
A
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
R
V
 
A
Q
 
E
V
 
I
T
 
V
G
 
G
P
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
R
S
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
V
G
 
A
E
 
Q
F
 
L
H
 
F
R
 
R
L
 
E
P
 
S
G
 
G
D
 
A
R
 
E
P
 
-
E
 
-
I
 
-
D
 
H
T
 
L
V
 
T
L
 
L
R
 
E
P
 
K
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
L
T
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
P
K
 
T
G
 
G
F
 
-
A
 
A
E
 
W
H
 
S
S
 
A
T
 
A
Y
 
Y
L
 
S
K
|
K
V
 
V
R
 
R
D
 
I
R
 
R
A
 
D
S
 
A
Y
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
P
L
 
L
V
 
A
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
D
T
 
R
V
 
I
R
 
A
E
 
G
A
 
L
R
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
N
H
 
S
K
 
A
P
 
P
W
 
L
R
 
M
D
 
V
P
 
P

4zohB Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
27% identity, 89% coverage: 27:320/332 of query aligns to 30:273/274 of 4zohB

query
sites
4zohB
V
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
N
x
S
L
|
L
L
 
I
D
 
P
L
 
M
M
 
L
K
 
K
A
 
L
D
 
R
V
 
L
L
 
I
R
 
R
P
 
P
E
 
S
G
 
Y
L
 
I
V
 
V
D
 
E
I
 
I
S
 
R
R
 
R
L
 
F
P
 
S
-
 
N
L
 
L
D
 
S
R
 
Y
I
 
I
E
 
-
E
 
-
T
 
T
A
 
K
E
 
D
G
 
G
G
 
N
L
 
L
-
 
Y
R
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
T
N
x
H
A
 
Y
D
 
N
T
 
I
A
 
S
Y
 
-
D
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
Q
 
K
T
 
S
R
 
S
Y
 
I
P
 
P
M
 
L
L
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
T
I
 
A
L
 
S
A
 
N
G
x
I
A
x
G
S
 
D
A
 
P
Q
 
Q
L
x
V
R
 
R
N
 
N
M
 
M
A
 
G
T
|
T
N
 
I
G
 
G
G
|
G
N
x
S
L
 
I
L
x
S
Q
 
H
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
L
H
 
D
P
 
P
S
 
S
-
x
A
D
|
D
L
 
Y
C
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
L
 
M
E
 
D
A
 
A
V
 
K
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
T
 
T
G
 
S
P
 
R
E
 
K
G
 
G
E
 
D
R
 
R
S
 
V
I
 
V
P
 
N
F
 
F
G
 
K
E
 
S
F
 
F
H
 
A
R
 
K
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
D
R
 
M
P
 
F
E
 
T
I
 
P
D
 
D
T
 
-
V
 
-
L
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
E
L
|
L
I
x
V
T
 
T
A
 
E
I
 
I
D
 
Q
L
 
V
P
 
P
A
 
T
-
 
F
K
 
E
G
 
G
F
 
Y
A
 
-
E
 
-
H
 
K
S
 
F
T
 
S
Y
 
Y
L
 
Q
K
 
K
V
 
L
R
 
E
D
 
R
R
 
R
A
 
A
S
 
G
Y
 
-
A
x
D
F
|
F
A
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
L
G
 
L
L
 
L
E
 
K
M
 
L
D
 
S
G
 
G
G
 
D
T
 
V
V
 
I
R
 
E
E
 
D
A
 
V
R
 
R
L
 
I
A
 
G
L
 
L
G
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
N
H
 
N
K
 
V
P
 
A
W
 
V
R
 
R
D
 
A
P
 
K
E
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
E
A
 
E
L
 
L
I
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
R
A
 
L
T
 
N
P
 
D
D
 
E
R
 
I
F
 
I
R
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
T
V
 
R
L
 
A
L
 
M
R
 
E
D
 
S
A
 
A
K
 
N
-
 
P
-
 
T
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
A
G
 
E
H
x
Y
E
 
K
H
 
K
N
 
K
S
 
M
F
 
V
K
 
K
I
 
V
E
 
-
L
 
L
A
 
T
E
 
K
R
 
R
A
 
A
I
 
I
V
 
I
R
 
T
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1ffuC Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
27% identity, 79% coverage: 4:265/332 of query aligns to 6:220/287 of 1ffuC

query
sites
1ffuC
F
 
F
T
 
E
Y
 
Y
A
 
H
R
 
A
A
 
P
D
 
K
S
 
S
A
 
V
A
 
G
D
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
A
R
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
Q
S
 
L
G
 
G
T
 
S
-
 
D
-
 
A
A
x
K
F
x
L
V
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
N
x
S
L
|
L
L
 
L
D
 
P
L
 
M
M
 
M
K
 
K
A
 
L
D
 
R
V
 
F
L
 
A
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
G
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
D
I
|
I
S
 
N
R
 
R
L
 
I
P
 
P
L
 
E
D
 
L
R
 
R
I
 
G
E
 
I
E
 
R
T
 
E
A
 
E
E
 
G
G
 
S
G
 
T
L
 
V
R
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
T
R
 
V
N
 
E
A
 
N
D
 
D
T
 
L
A
 
I
Y
 
S
D
 
S
E
 
P
R
 
I
V
 
V
Q
 
Q
T
 
A
R
 
R
Y
 
L
P
 
P
M
 
L
L
 
L
S
 
A
K
 
E
A
 
A
I
 
A
L
 
K
A
 
L
G
x
I
A
|
A
S
 
D
A
 
P
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
N
 
N
M
 
R
A
x
G
T
|
T
N
 
I
G
 
G
G
|
G
N
x
D
L
 
I
L
x
A
Q
 
H
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
G
E
 
D
P
 
P
G
 
G
S
x
N
G
x
D
C
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
A
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
H
P
 
P
S
 
A
D
 
-
L
 
L
C
 
S
V
 
I
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
H
V
 
F
Q
 
V
V
 
L
T
 
E
G
 
G
P
 
P
E
 
N
G
 
G
E
 
R
R
 
R
S
 
T
I
 
V
P
 
P
F
 
A
G
 
D
E
 
G
F
 
F
H
 
F
R
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
L
P
 
G
E
 
T
I
 
Y
D
 
M
T
 
T
V
 
L
L
|
L
R
 
E
P
 
E
G
 
N
D
 
E
L
x
V
I
x
M
T
 
V
A
 
E
I
 
I
D
 
R
L
 
V
P
 
P
A
 
A
K
 
F
G
 
A
F
 
A
A
 
G
E
 
T
H
 
G
S
 
W
T
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
K
V
 
L
R
 
K
D
 
-
R
 
R
A
 
K
S
 
T
Y
 
G
A
 
D
F
x
W
A
 
A
L
 
T
V
 
A
S
 
G
V
 
C
A
 
A
A
 
V
G
 
V
L
 
M
E
 
R
M
 
K
D
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
T
V
 
V
R
 
S
E
 
H
A
 
I
R
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
T
G
 
N
V
 
V
A
 
A

7dqxE Crystal structure of xanthine dehydrogenase family protein
28% identity, 83% coverage: 3:279/332 of query aligns to 5:235/293 of 7dqxE

query
sites
7dqxE
S
 
S
F
 
F
T
 
D
Y
 
Y
A
 
V
R
 
V
A
 
A
D
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
E
D
 
H
A
 
A
I
 
L
G
 
R
R
 
L
A
 
L
-
 
A
-
 
D
G
 
G
A
 
G
S
 
D
G
 
D
T
 
A
A
x
K
F
x
I
V
x
I
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
x
Q
N
x
S
L
|
L
L
 
V
D
 
P
L
 
L
M
 
L
K
 
N
A
 
F
D
 
R
V
 
M
L
 
S
R
 
R
P
 
P
E
 
S
G
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
N
R
 
R
L
 
V
P
 
P
-
 
G
L
 
L
D
 
A
R
 
N
I
 
I
E
 
R
E
 
K
T
 
S
A
 
-
E
 
D
G
 
Q
G
 
T
L
 
I
R
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
R
N
x
H
A
 
A
D
 
K
T
 
L
A
 
T
Y
 
T
D
 
S
E
 
K
R
 
T
V
 
I
Q
 
S
T
 
Q
R
 
N
Y
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
L
S
 
S
K
 
E
A
 
A
I
 
A
L
 
A
A
 
W
G
x
I
A
|
A
S
 
H
A
 
P
Q
 
Q
L
x
I
R
 
R
N
 
N
M
 
R
A
x
G
T
|
T
N
 
I
G
|
G
G
|
G
N
x
S
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
R
 
-
I
x
A
H
 
H
A
 
A
I
 
D
L
 
A
G
 
A
A
|
A
S
 
-
D
 
-
Q
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
P
 
-
S
 
-
D
x
E
L
 
L
C
 
P
V
 
V
A
 
V
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
Y
V
 
V
Q
 
T
V
 
A
T
 
Q
G
 
S
P
 
L
E
 
Q
G
 
G
E
 
E
R
 
R
S
 
K
I
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
K
E
 
E
F
 
L
H
 
L
R
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
V
P
 
S
E
 
H
I
 
F
D
 
V
T
 
S
V
 
S
L
 
I
R
 
L
P
 
P
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
|
I
T
 
V
A
 
E
I
 
V
D
 
N
L
 
V
P
 
P
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
H
-
 
G
-
 
S
A
 
G
K
 
A
G
 
A
F
 
F
A
 
D
E
 
E
H
 
F
S
 
S
T
 
-
Y
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
-
R
 
R
D
 
R
R
 
H
A
 
G
S
 
D
Y
|
Y
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
G
V
 
A
S
 
A
V
 
S
A
 
L
A
 
V
G
 
T
L
 
L
E
 
D
M
 
E
D
 
Q
G
 
G
G
 
K
T
 
C
V
 
S
R
 
R
E
 
-
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
T
L
 
V
G
 
L
G
 
G
V
 
G
A
 
G
H
 
S
K
 
T
P
 
A
W
 
I
R
 
R
D
 
C
P
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
N
A
 
I
L
 
L
I
 
I

1n5wC Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); oxidized form (see paper)
26% identity, 98% coverage: 3:326/332 of query aligns to 5:285/287 of 1n5wC

query
sites
1n5wC
S
 
S
F
 
F
T
 
D
Y
 
Y
A
 
H
R
 
R
A
 
P
D
 
K
S
 
S
A
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
V
G
 
A
R
 
L
A
 
L
G
 
T
A
 
K
S
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
D
F
 
A
-
 
R
-
 
P
V
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
x
H
N
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
T
D
 
R
V
 
L
L
 
A
R
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
L
S
 
R
R
 
D
L
 
I
P
 
G
L
 
-
D
 
D
R
 
L
I
 
V
E
 
G
E
 
I
T
 
R
A
 
E
E
 
E
G
 
G
-
 
T
G
 
D
L
 
V
R
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
T
R
 
T
N
 
Q
A
 
H
D
 
A
T
 
L
A
 
I
Y
 
G
D
 
S
E
 
D
R
 
F
V
 
L
Q
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
I
S
 
R
K
 
E
A
 
T
I
 
S
L
 
L
A
 
L
G
x
I
A
|
A
S
 
D
A
 
P
Q
 
Q
L
 
I
R
 
R
N
 
Y
M
 
M
A
 
G
T
 
T
N
 
I
G
 
G
G
 
G
N
|
N
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
A
N
 
A
K
 
N
R
 
G
E
 
D
P
 
P
G
 
G
S
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
N
|
N
R
x
D
I
 
M
H
 
P
A
 
A
I
 
L
L
 
M
G
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
Q
C
 
C
I
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
G
A
 
A
V
 
A
V
 
Y
Q
 
E
V
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
A
R
 
R
S
 
I
I
 
V
P
 
A
F
 
A
G
 
R
E
 
D
F
 
Y
H
 
Y
R
 
Q
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
G
E
 
A
I
 
Y
D
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
I
R
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
L
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
R
L
 
I
P
 
P
A
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
T
-
 
G
K
 
H
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
E
 
Y
H
 
E
S
 
K
T
 
L
Y
 
K
L
 
R
K
 
K
V
 
I
R
 
G
D
 
D
R
x
Y
A
 
A
S
 
T
Y
 
A
A
 
A
F
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
E
 
T
M
 
M
D
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
K
V
 
C
R
 
V
E
 
T
A
 
A
R
 
S
L
 
I
A
 
G
L
 
L
G
 
T
G
 
N
V
 
V
A
 
A
H
 
N
K
 
T
P
 
P
W
 
L
R
 
W
D
 
A
P
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
G
A
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
D
K
 
K
P
 
P
A
 
A
T
 
L
P
 
D
D
 
K
R
 
A
F
 
V
R
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
A
V
 
I
L
 
T
L
 
A
R
 
P
D
 
A
A
 
S
K
 
D
G
 
G
H
 
R
E
 
G
H
 
P
N
 
A
S
 
E
F
 
Y
K
 
R
I
 
T
E
 
K
L
 
M
A
 
A
E
 
G
R
 
V
A
 
M
I
 
L
V
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
E
E
 
R
A
 
A
A
 
K
E
 
A
R
 
R

P19920 Carbon monoxide dehydrogenase medium chain; CO dehydrogenase subunit M; CO-DH M; EC 1.2.5.3 from Afipia carboxidovorans (strain ATCC 49405 / DSM 1227 / KCTC 32145 / OM5) (Oligotropha carboxidovorans) (see 2 papers)
26% identity, 98% coverage: 3:326/332 of query aligns to 5:285/288 of P19920

query
sites
P19920
S
 
S
F
 
F
T
 
D
Y
 
Y
A
 
H
R
 
R
A
 
P
D
 
K
S
 
S
A
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
V
G
 
A
R
 
L
A
 
L
G
 
T
A
 
K
S
 
L
G
 
G
T
 
E
A
 
D
F
 
A
-
 
R
-
 
P
V
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
N
x
S
L
 
L
L
 
I
D
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
K
A
 
T
D
 
R
V
 
L
L
 
A
R
 
T
P
 
P
E
 
E
G
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
L
S
 
R
R
 
D
L
 
I
P
 
G
L
 
-
D
 
D
R
 
L
I
 
V
E
 
G
E
 
I
T
 
R
A
 
E
E
 
E
G
 
G
-
 
T
G
 
D
L
 
V
R
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
T
R
 
T
N
 
Q
A
 
H
D
 
A
T
 
L
A
 
I
Y
 
G
D
 
S
E
 
D
R
 
F
V
 
L
Q
 
A
T
 
A
R
 
K
Y
 
L
P
 
P
M
 
I
L
 
I
S
 
R
K
 
E
A
 
T
I
 
S
L
 
L
A
 
L
G
 
I
A
 
A
S
 
D
A
 
P
Q
 
Q
L
 
I
R
 
R
N
 
Y
M
 
M
A
 
G
T
|
T
N
x
I
G
|
G
G
|
G
N
|
N
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
A
N
 
A
K
 
N
R
 
G
E
 
D
P
 
P
G
 
G
S
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
N
R
 
D
I
 
M
H
 
P
A
 
A
I
 
L
L
 
M
G
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
Q
 
Q
C
 
C
I
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
P
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
C
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
G
A
 
A
V
 
A
V
 
Y
Q
 
E
V
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
A
R
 
R
S
 
I
I
 
V
P
 
A
F
 
A
G
 
R
E
 
D
F
 
Y
H
 
Y
R
 
Q
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
G
E
 
A
I
 
Y
D
 
F
T
 
T
V
 
A
L
 
I
R
 
E
P
 
P
G
 
G
D
 
E
L
 
L
I
 
L
T
 
T
A
 
A
I
 
I
D
 
R
L
 
I
P
 
P
A
 
V
-
 
P
-
 
P
-
 
T
-
 
G
K
 
H
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
E
 
Y
H
 
E
S
 
K
T
 
L
Y
 
K
L
 
R
K
 
K
V
 
I
R
 
G
D
 
D
R
 
Y
A
 
A
S
 
T
Y
 
A
A
 
A
F
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
E
 
T
M
 
M
D
 
S
G
 
G
G
 
G
T
 
K
V
 
C
R
 
V
E
 
T
A
 
A
R
 
S
L
 
I
A
 
G
L
 
L
G
 
T
G
 
N
V
 
V
A
 
A
H
 
N
K
 
T
P
 
P
W
 
L
R
 
W
D
 
A
P
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
G
A
 
K
A
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
L
-
 
D
K
 
K
P
 
P
A
 
A
T
 
L
P
 
D
D
 
K
R
 
A
F
 
V
R
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
E
R
 
A
V
 
I
L
 
T
L
 
A
R
 
P
D
 
A
A
 
S
K
 
D
G
 
G
H
 
R
E
 
G
H
 
P
N
 
A
S
 
E
F
 
Y
K
 
R
I
 
T
E
 
K
L
 
M
A
 
A
E
 
G
R
 
V
A
 
M
I
 
L
V
 
R
R
 
R
A
 
A
L
 
V
T
 
E
E
 
R
A
 
A
A
 
K
E
 
A
R
 
R

1t3qC Crystal structure of quinoline 2-oxidoreductase from pseudomonas putida 86 (see paper)
26% identity, 77% coverage: 26:281/332 of query aligns to 29:233/285 of 1t3qC

query
sites
1t3qC
F
x
I
V
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
Q
N
x
S
L
|
L
L
 
L
D
 
P
L
 
L
M
 
L
K
 
A
A
 
F
D
 
R
V
 
L
L
 
V
R
 
Y
P
 
P
E
 
S
G
 
C
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
L
S
 
R
R
 
N
L
 
V
P
 
S
-
 
E
L
 
L
D
 
F
R
 
E
I
 
I
E
 
S
E
 
Q
T
 
S
A
 
A
E
 
-
G
 
G
G
 
I
L
 
L
R
 
S
L
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
V
R
 
T
N
 
H
A
 
F
D
 
R
T
 
N
A
 
K
Y
 
T
D
 
D
E
 
P
R
 
T
V
 
V
Q
 
A
T
 
K
R
 
C
Y
 
V
P
 
P
M
 
I
L
 
L
S
 
P
K
 
K
A
 
V
I
 
L
L
 
A
A
 
H
G
x
V
A
|
A
S
 
H
A
 
Q
Q
 
A
L
x
V
R
 
R
N
 
N
M
 
R
A
 
G
T
|
T
N
 
L
G
 
G
G
|
G
N
x
S
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
Y
 
-
Y
 
-
F
 
-
Y
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
N
 
-
R
 
-
I
x
A
H
 
H
A
 
A
I
 
D
L
 
A
G
 
G
A
|
A
S
 
-
D
 
-
Q
 
-
C
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
-
H
 
-
P
 
-
S
 
-
D
x
E
L
 
M
C
 
P
V
 
F
A
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
T
L
 
L
E
 
G
A
 
A
V
 
T
V
 
M
Q
 
Y
V
 
I
T
 
A
G
 
S
P
 
S
E
 
A
G
 
G
E
 
V
R
 
R
S
 
S
I
 
V
P
 
S
F
 
A
G
 
T
E
 
D
F
 
F
H
 
M
R
 
K
L
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
P
 
G
E
 
H
I
 
Y
D
 
F
T
 
T
V
 
D
L
 
L
R
 
E
P
 
A
G
 
G
D
 
E
L
 
V
I
x
L
T
 
V
A
 
R
I
 
V
D
 
E
L
 
I
P
 
P
A
 
I
K
 
P
G
 
A
F
 
L
-
 
H
A
 
W
E
 
E
H
 
F
S
 
D
T
 
E
Y
 
Y
L
 
-
K
 
-
V
 
A
R
 
R
D
 
R
R
 
K
A
 
G
S
 
D
Y
|
Y
A
 
A
F
 
-
A
 
-
L
 
L
V
 
V
S
 
M
V
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
S
M
 
M
D
 
Q
G
 
G
G
 
G
T
 
R
V
 
C
R
 
V
E
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
E
H
 
E
K
 
R
P
 
A
W
 
H
R
 
Q
D
 
A
P
 
I
E
 
R
A
 
A
E
 
N
A
 
D
A
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
K
 
K

Query Sequence

>AZOBR_RS20525 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS20525
MRSFTYARADSAADAIGRAGASGTAFVAGGTNLLDLMKADVLRPEGLVDISRLPLDRIEE
TAEGGLRLGALARNADTAYDERVQTRYPMLSKAILAGASAQLRNMATNGGNLLQRTRCYY
FYDTATPCNKREPGSGCGAIGGVNRIHAILGASDQCIAVHPSDLCVALAALEAVVQVTGP
EGERSIPFGEFHRLPGDRPEIDTVLRPGDLITAIDLPAKGFAEHSTYLKVRDRASYAFAL
VSVAAGLEMDGGTVREARLALGGVAHKPWRDPEAEAALIGKPATPDRFRAAARVLLRDAK
GHEHNSFKIELAERAIVRALTEAAERKGAPRP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory