SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS22710 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS22710 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 18 hits to proteins with known functional sites (download)

3g4hA Crystal structure of human senescence marker protein-30 (zinc bound) (see paper)
30% identity, 95% coverage: 1:280/296 of query aligns to 4:280/297 of 3g4hA

query
sites
3g4hA
L
 
I
E
 
E
A
 
C
V
 
V
F
 
L
D
 
P
P
 
E
D
 
N
L
 
C
R
 
R
N
 
-
G
 
-
T
 
C
G
 
G
E
|
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
A
 
E
E
 
V
R
 
S
G
 
N
S
 
S
W
 
L
T
 
L
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
R
 
K
T
 
K
I
 
V
H
 
C
R
 
R
L
 
W
D
 
D
P
 
S
S
 
F
S
 
T
G
 
K
A
 
Q
H
 
V
R
 
Q
R
 
R
W
 
V
T
 
T
L
 
M
P
 
D
E
 
A
M
 
P
I
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
 
Q
D
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
C
 
A
A
 
T
C
 
I
E
 
G
T
 
T
G
 
K
V
 
F
F
 
C
D
 
A
V
 
L
D
 
N
L
 
W
P
 
K
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
Q
V
 
S
V
 
A
T
 
V
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
V
R
 
D
F
 
N
P
 
D
K
 
K
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
L
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
M
V
 
A
M
 
E
D
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
I
 
V
S
 
L
K
 
E
G
 
R
D
 
H
S
 
Q
S
 
G
G
 
A
L
 
L
W
 
Y
H
 
S
R
 
L
F
 
F
T
 
-
R
 
-
A
 
P
D
 
D
G
 
H
L
 
H
T
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
Y
T
 
F
G
 
D
G
 
Q
Y
 
V
I
 
D
I
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
D
F
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
L
 
F
Y
 
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
R
 
S
D
 
-
V
 
-
R
 
Y
M
 
S
V
 
V
W
 
D
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
L
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
R
R
 
R
P
 
S
F
 
V
V
 
Y
D
 
K
M
 
L
R
 
E
A
 
K
M
 
E
V
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
I
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
C
L
 
Y
D
 
N
E
 
G
G
 
G
C
 
R
I
 
V
K
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
V
N
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
L
P
 
P
M
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
N
L
 
Y
R
 
S
T
 
E
M
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
S
 
R
R
 
D
G
 
G
-
 
M
-
 
D
P
 
P
A
 
E
D
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
R
D
 
Q
P
 
P
H
 
E
G
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
I
L
 
F

4gncA Human smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
30% identity, 95% coverage: 1:280/296 of query aligns to 5:281/298 of 4gncA

query
sites
4gncA
L
 
I
E
 
E
A
 
C
V
 
V
F
 
L
D
 
P
P
 
E
D
 
N
L
 
C
R
 
R
N
 
-
G
 
-
T
 
C
G
 
G
E
|
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
A
 
E
E
 
V
R
 
S
G
 
N
S
 
S
W
 
L
T
 
L
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
R
 
K
T
 
K
I
 
V
H
 
C
R
 
R
L
 
W
D
 
D
P
 
S
S
 
F
S
 
T
G
 
K
A
 
Q
H
 
V
R
 
Q
R
 
R
W
 
V
T
 
T
L
 
M
P
 
D
E
 
A
M
 
P
I
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
 
Q
D
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
C
 
A
A
 
T
C
 
I
E
 
G
T
 
T
G
 
K
V
 
F
F
 
C
D
 
A
V
 
L
D
 
N
L
 
W
P
 
K
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
Q
V
 
S
V
 
A
T
 
V
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
V
R
 
D
F
 
N
P
 
D
K
 
K
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
|
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
L
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
M
V
 
A
M
 
E
D
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
I
 
V
S
 
L
K
 
E
G
 
R
D
 
H
S
 
Q
S
 
G
G
 
A
L
 
L
W
 
Y
H
 
S
R
 
L
F
 
F
T
 
-
R
 
-
A
 
P
D
 
D
G
 
H
L
 
H
T
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
Y
T
 
F
G
 
D
G
 
Q
Y
 
V
I
 
D
I
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
D
F
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
L
 
F
Y
 
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
R
 
S
D
 
-
V
 
-
R
 
Y
M
 
S
V
 
V
W
 
D
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
L
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
R
R
 
R
P
 
S
F
 
V
V
 
Y
D
 
K
M
 
L
R
 
E
A
 
K
M
 
E
V
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
I
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
C
L
 
Y
D
 
N
E
 
G
G
 
G
C
 
R
I
 
V
K
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
V
N
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
L
P
 
P
M
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
T
T
|
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
D
x
N
L
x
Y
R
 
S
T
 
E
M
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
S
 
R
R
 
D
G
 
G
-
 
M
-
 
D
P
 
P
A
 
E
D
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
R
D
 
Q
P
 
P
H
 
E
G
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
I
L
 
F

Sites not aligning to the query:

Q15493 Regucalcin; RC; Gluconolactonase; GNL; Senescence marker protein 30; SMP-30; EC 3.1.1.17 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
30% identity, 95% coverage: 1:280/296 of query aligns to 6:282/299 of Q15493

query
sites
Q15493
L
 
I
E
 
E
A
 
C
V
 
V
F
 
L
D
 
P
P
 
E
D
 
N
L
 
C
R
 
R
N
 
-
G
 
-
T
 
C
G
 
G
E
|
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
A
 
E
E
 
V
R
 
S
G
 
N
S
 
S
W
 
L
T
 
L
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
R
 
K
T
 
K
I
 
V
H
 
C
R
 
R
L
 
W
D
 
D
P
 
S
S
 
F
S
 
T
G
 
K
A
 
Q
H
 
V
R
 
Q
R
 
R
W
 
V
T
 
T
L
 
M
P
 
D
E
 
A
M
 
P
I
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
 
Q
D
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
C
 
A
A
 
T
C
 
I
E
 
G
T
 
T
G
 
K
V
 
F
F
 
C
D
 
A
V
 
L
D
 
N
L
 
W
P
 
K
G
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
E
A
 
Q
V
 
S
V
 
A
T
 
V
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
T
H
 
V
R
 
D
F
 
N
P
 
D
K
 
K
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
L
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
M
V
 
A
M
 
E
D
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
I
 
V
S
 
L
K
 
E
G
 
R
D
 
H
S
 
Q
S
 
G
G
 
A
L
 
L
W
 
Y
H
 
S
R
 
L
F
 
F
T
 
-
R
 
-
A
 
P
D
 
D
G
 
H
L
 
H
T
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
Y
T
 
F
G
 
D
G
 
Q
Y
 
V
I
 
D
I
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
D
F
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
L
 
F
Y
 
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
R
 
S
D
 
-
V
 
-
R
 
Y
M
 
S
V
 
V
W
 
D
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
L
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
R
R
 
R
P
 
S
F
 
V
V
 
Y
D
 
K
M
 
L
R
 
E
A
 
K
M
 
E
V
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
I
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
C
L
 
Y
D
 
N
E
 
G
G
 
G
C
 
R
I
 
V
K
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
V
N
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
L
P
 
P
M
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
N
L
 
Y
R
 
S
T
 
E
M
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
S
 
R
R
 
D
G
 
G
-
 
M
-
 
D
P
 
P
A
 
E
D
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
R
D
 
Q
P
 
P
H
 
E
G
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
I
L
 
F

4gnaA Mouse smp30/gnl-xylitol complex (see paper)
29% identity, 95% coverage: 1:280/296 of query aligns to 4:280/297 of 4gnaA

query
sites
4gnaA
L
 
V
E
 
E
A
 
C
V
 
V
F
 
L
D
 
R
P
 
E
D
 
N
L
 
Y
R
 
R
N
 
-
G
 
-
T
 
C
G
 
G
E
|
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
A
 
E
E
 
A
R
 
S
G
 
Q
S
 
S
W
 
L
T
 
L
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
K
T
 
I
I
 
I
H
 
C
R
 
R
L
 
W
D
 
D
P
 
T
S
 
V
S
 
S
G
 
N
A
 
Q
H
 
V
R
 
Q
R
 
R
W
 
V
T
 
A
L
 
V
P
 
D
E
 
A
M
 
P
I
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
 
Q
D
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
C
 
A
A
 
T
C
 
I
E
 
G
T
 
T
G
 
K
V
 
F
F
 
C
D
 
A
V
 
L
D
 
N
L
 
W
P
 
E
G
 
N
E
 
Q
G
 
S
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
T
 
F
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
M
H
 
V
R
 
D
F
 
E
P
 
D
K
 
K
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
L
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
M
-
 
A
-
 
E
-
x
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
V
 
V
M
 
L
D
 
E
I
 
R
S
 
H
K
 
Q
G
 
G
D
 
S
S
 
L
S
 
Y
G
 
S
L
 
L
W
 
F
H
 
P
R
 
D
F
 
H
T
 
S
R
 
V
A
 
K
D
 
K
G
 
Y
L
 
F
T
 
D
E
 
Q
T
 
V
G
 
D
T
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
I
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
D
F
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
L
 
F
Y
 
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
R
 
S
D
 
-
V
 
-
R
 
Y
M
 
T
V
 
V
W
 
D
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
L
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
R
R
 
R
P
 
I
F
 
V
V
 
Y
D
 
K
M
 
M
R
 
E
A
 
K
M
 
D
V
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
I
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
C
L
x
Y
D
 
N
E
 
G
G
 
G
C
 
R
I
 
V
K
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
E
N
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
L
P
 
P
M
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
R
 
S
T
 
E
M
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
S
 
R
R
 
D
G
 
G
-
 
L
-
 
N
P
 
A
A
 
E
D
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
R
D
 
Q
P
 
P
H
 
D
G
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
I
L
 
F

4gn9A Mouse smp30/gnl-glucose complex (see paper)
29% identity, 95% coverage: 1:280/296 of query aligns to 4:280/297 of 4gn9A

query
sites
4gn9A
L
 
V
E
 
E
A
 
C
V
 
V
F
 
L
D
 
R
P
 
E
D
 
N
L
 
Y
R
 
R
N
 
-
G
 
-
T
 
C
G
 
G
E
|
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
A
 
E
E
 
A
R
 
S
G
 
Q
S
 
S
W
 
L
T
 
L
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
K
T
 
I
I
 
I
H
 
C
R
 
R
L
 
W
D
 
D
P
 
T
S
 
V
S
 
S
G
 
N
A
 
Q
H
 
V
R
 
Q
R
 
R
W
 
V
T
 
A
L
 
V
P
 
D
E
 
A
M
 
P
I
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
 
Q
D
 
L
G
 
G
G
|
G
V
 
Y
V
 
V
C
 
A
A
 
T
C
 
I
E
 
G
T
 
T
G
 
K
V
 
F
F
 
C
D
 
A
V
 
L
D
 
N
L
x
W
P
x
E
G
 
N
E
 
Q
G
 
S
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
T
 
F
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
M
H
 
V
R
x
D
F
x
E
P
 
D
K
 
K
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
L
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
M
-
 
A
-
 
E
-
x
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
V
 
V
M
 
L
D
 
E
I
 
R
S
 
H
K
 
Q
G
 
G
D
 
S
S
 
L
S
x
Y
G
 
S
L
 
L
W
 
F
H
 
P
R
 
D
F
 
H
T
 
S
R
 
V
A
 
K
D
x
K
G
 
Y
L
 
F
T
 
D
E
 
Q
T
 
V
G
 
D
T
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
I
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
D
F
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
L
 
F
Y
 
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
|
S
H
 
L
R
 
S
D
 
-
V
 
-
R
 
Y
M
 
T
V
 
V
W
 
D
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
L
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
R
R
 
R
P
 
I
F
 
V
V
 
Y
D
 
K
M
 
M
R
 
E
A
 
K
M
 
D
V
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
I
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
C
L
x
Y
D
 
N
E
 
G
G
 
G
C
 
R
I
 
V
K
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
E
N
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
L
P
 
P
M
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
R
 
S
T
 
E
M
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
S
 
R
R
 
D
G
 
G
-
 
L
-
 
N
P
 
A
A
 
E
D
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
R
D
 
Q
P
 
P
H
 
D
G
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
I
L
 
F

4gn8A Mouse smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
29% identity, 95% coverage: 1:280/296 of query aligns to 4:280/297 of 4gn8A

query
sites
4gn8A
L
 
V
E
 
E
A
 
C
V
 
V
F
 
L
D
 
R
P
 
E
D
 
N
L
 
Y
R
 
R
N
 
-
G
 
-
T
 
C
G
 
G
E
|
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
A
 
E
E
 
A
R
 
S
G
 
Q
S
 
S
W
 
L
T
 
L
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
K
T
 
I
I
 
I
H
 
C
R
 
R
L
 
W
D
 
D
P
 
T
S
 
V
S
 
S
G
 
N
A
 
Q
H
 
V
R
 
Q
R
 
R
W
 
V
T
 
A
L
 
V
P
 
D
E
 
A
M
 
P
I
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
x
Q
D
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
C
 
A
A
 
T
C
 
I
E
 
G
T
 
T
G
 
K
V
 
F
F
 
C
D
 
A
V
 
L
D
 
N
L
 
W
P
 
E
G
 
N
E
 
Q
G
 
S
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
T
 
F
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
M
H
 
V
R
 
D
F
 
E
P
 
D
K
 
K
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
x
A
G
|
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
L
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
M
-
 
A
-
 
E
-
x
E
-
 
T
-
 
A
-
x
P
-
 
A
V
 
V
M
 
L
D
 
E
I
 
R
S
 
H
K
 
Q
G
 
G
D
 
S
S
 
L
S
 
Y
G
 
S
L
 
L
W
 
F
H
 
P
R
 
D
F
 
H
T
 
S
R
 
V
A
 
K
D
 
K
G
 
Y
L
 
F
T
 
D
E
 
Q
T
 
V
G
 
D
T
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
I
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
D
F
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
L
 
F
Y
|
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
R
 
S
D
 
-
V
 
-
R
 
Y
M
 
T
V
 
V
W
 
D
A
|
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
|
D
T
 
L
D
x
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
R
R
|
R
P
 
I
F
x
V
V
 
Y
D
 
K
M
 
M
R
 
E
A
 
K
M
 
D
V
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
I
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
C
L
x
Y
D
 
N
E
 
G
G
 
G
C
 
R
I
 
V
K
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
|
P
-
 
E
N
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
L
P
 
P
M
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
R
 
S
T
 
E
M
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
S
 
R
R
 
D
G
 
G
-
 
L
-
 
N
P
 
A
A
 
E
D
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
R
D
 
Q
P
 
P
H
 
D
G
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
I
L
 
F

Sites not aligning to the query:

4gn7A Mouse smp30/gnl (see paper)
29% identity, 95% coverage: 1:280/296 of query aligns to 4:280/297 of 4gn7A

query
sites
4gn7A
L
 
V
E
 
E
A
 
C
V
 
V
F
 
L
D
 
R
P
 
E
D
 
N
L
 
Y
R
 
R
N
 
-
G
 
-
T
 
C
G
 
G
E
|
E
N
 
S
P
 
P
V
 
V
W
 
W
D
 
E
A
 
E
E
 
A
R
 
S
G
 
Q
S
 
S
W
 
L
T
 
L
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
S
R
 
K
T
 
I
I
 
I
H
 
C
R
 
R
L
 
W
D
 
D
P
 
T
S
 
V
S
 
S
G
 
N
A
 
Q
H
 
V
R
 
Q
R
 
R
W
 
V
T
 
A
L
 
V
P
 
D
E
 
A
M
 
P
I
 
V
G
 
S
S
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
P
 
Q
D
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
V
 
V
C
 
A
A
 
T
C
 
I
E
 
G
T
 
T
G
 
K
V
 
F
F
 
C
D
 
A
V
 
L
D
 
N
L
 
W
P
 
E
G
 
N
E
 
Q
G
 
S
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
T
 
F
A
 
V
L
 
L
A
 
A
T
 
M
H
 
V
R
 
D
F
 
E
P
 
D
K
 
K
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
V
D
 
D
R
 
P
Q
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
L
 
A
S
 
G
S
 
T
M
 
M
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
V
 
V
M
 
L
D
 
E
I
 
R
S
 
H
K
 
Q
G
 
G
D
 
S
S
 
L
S
 
Y
G
 
S
L
 
L
W
 
F
H
 
P
R
 
D
F
 
H
T
 
S
R
 
V
A
 
K
D
 
K
G
 
Y
L
 
F
T
 
D
E
 
Q
T
 
V
G
 
D
T
 
-
G
 
-
G
 
-
Y
 
-
I
 
-
I
 
I
P
 
S
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
D
F
 
W
S
 
S
P
 
L
D
 
D
G
 
H
R
 
K
T
 
I
L
 
F
Y
 
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
L
R
 
S
D
 
-
V
 
-
R
 
Y
M
 
T
V
 
V
W
 
D
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
L
D
 
Q
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
R
R
 
R
P
 
I
F
 
V
V
 
Y
D
 
K
M
 
M
R
 
E
A
 
K
M
 
D
V
 
E
G
 
Q
R
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
M
A
 
C
V
 
I
D
 
D
I
 
A
D
 
E
G
 
G
C
 
K
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
C
L
 
Y
D
 
N
E
 
G
G
 
G
C
 
R
I
 
V
K
 
I
R
 
R
F
 
L
T
 
D
P
 
P
-
 
E
N
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
R
D
 
L
R
 
Q
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
L
P
 
P
M
 
V
R
 
D
K
 
K
P
 
T
T
 
T
M
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
K
D
 
D
L
 
Y
R
 
S
T
 
E
M
 
M
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
C
L
 
A
S
 
R
R
 
D
G
 
G
-
 
L
-
 
N
P
 
A
A
 
E
D
 
G
L
 
L
A
 
L
E
 
R
D
 
Q
P
 
P
H
 
D
G
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
I
L
 
F

Q9A9Z1 D-xylonolactone lactonase; Xylono-1,5-lactonase; EC 3.1.1.110 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see paper)
30% identity, 96% coverage: 8:291/296 of query aligns to 10:283/289 of Q9A9Z1

query
sites
Q9A9Z1
D
 
D
L
 
L
R
 
K
N
 
A
G
 
T
T
 
L
G
 
G
E
|
E
N
 
G
P
 
P
V
 
I
W
 
W
D
 
H
A
 
G
E
 
D
R
 
-
G
 
-
S
 
T
W
 
L
T
 
W
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
K
A
 
Q
R
 
R
T
 
K
I
 
I
H
 
H
R
 
N
L
 
Y
D
 
H
P
 
P
S
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
E
H
 
R
R
 
F
R
 
S
W
 
F
T
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
D
M
 
Q
I
 
V
G
 
T
S
 
F
L
 
L
V
 
A
-
 
P
L
 
I
R
 
V
P
 
G
D
 
A
G
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
C
 
V
A
 
G
C
 
L
E
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
I
F
 
H
D
 
R
V
 
F
D
 
H
L
 
-
P
 
P
G
 
A
E
 
T
G
 
G
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
F
T
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
L
T
 
E
H
 
V
R
 
E
F
 
D
P
 
A
K
 
A
E
 
L
G
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
P
N
 
N
D
 
D
G
 
A
R
 
T
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
G
S
 
T
M
 
M
V
 
-
M
 
H
D
 
D
I
 
G
S
 
E
K
 
E
G
 
N
D
 
N
S
 
S
S
 
G
G
 
S
L
 
L
W
 
Y
H
 
R
R
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
M
T
 
D
E
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
A
-
 
R
-
 
M
-
 
D
-
 
R
G
 
D
Y
 
I
I
 
C
I
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
S
 
P
A
 
C
F
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
F
Y
 
Y
A
 
H
S
 
T
D
 
D
S
 
T
H
 
L
R
 
E
D
 
-
V
 
-
R
 
K
M
 
T
V
 
I
W
 
Y
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
A
T
 
E
D
 
D
T
 
-
G
 
G
T
 
L
A
 
L
D
 
S
N
 
N
R
 
K
R
 
R
P
 
V
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
M
 
F
R
 
-
A
 
-
M
 
A
V
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
S
D
 
E
G
 
G
C
 
Y
Y
 
L
W
 
W
I
 
T
C
 
A
C
 
L
L
 
W
D
 
G
E
 
G
G
 
F
C
 
G
I
 
A
K
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
S
P
 
P
N
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
A
D
 
V
R
 
T
R
 
R
I
 
I
E
 
E
V
 
L
P
 
P
M
 
A
R
 
P
K
 
N
P
 
V
T
 
T
M
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
K
T
 
T
M
 
L
L
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
L
 
A
S
 
R
R
 
K
G
 
G
P
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
D
 
Y
P
 
P
H
 
L
G
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
V
L
 
F
M
 
A
F
 
V
D
 
P
P
 
V
G
 
D
A
 
V
Q
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
E
 
Q

7pldB Caulobacter crescentus xylonolactonase with (r)-4-hydroxy-2- pyrrolidone (see paper)
30% identity, 96% coverage: 8:291/296 of query aligns to 10:283/289 of 7pldB

query
sites
7pldB
D
 
D
L
 
L
R
 
K
N
 
A
G
 
T
T
x
L
G
 
G
E
|
E
N
 
G
P
 
P
V
 
I
W
 
W
D
 
H
A
 
G
E
 
D
R
 
-
G
 
-
S
 
T
W
 
L
T
 
W
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
|
I
P
 
K
A
 
Q
R
 
R
T
 
K
I
 
I
H
 
H
R
 
N
L
 
Y
D
 
H
P
 
P
S
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
E
H
 
R
R
 
F
R
 
S
W
 
F
T
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
D
M
 
Q
I
 
V
G
 
T
S
 
F
L
 
L
V
 
A
-
 
P
L
 
I
R
 
V
P
 
G
D
x
A
G
 
T
G
|
G
V
x
F
V
 
V
C
 
V
A
 
G
C
 
L
E
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
I
F
 
H
D
 
R
V
 
F
D
 
H
L
 
-
P
|
P
G
 
A
E
 
T
G
 
G
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
F
T
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
L
T
 
E
H
 
V
R
 
E
F
 
D
P
 
A
K
 
A
E
 
L
G
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
R
 
T
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
G
S
 
T
M
 
M
V
 
-
M
 
H
D
 
D
I
 
G
S
x
E
K
 
E
G
 
N
D
 
N
S
 
S
S
 
G
G
 
S
L
 
L
W
 
Y
H
 
R
R
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
M
T
 
D
E
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
A
-
 
R
-
 
M
-
x
D
-
 
R
G
 
D
Y
 
I
I
 
C
I
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
S
 
P
A
 
C
F
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
F
Y
 
Y
A
 
H
S
 
T
D
 
D
S
 
T
H
 
L
R
 
E
D
 
-
V
 
-
R
 
K
M
 
T
V
 
I
W
 
Y
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
A
T
 
E
D
 
D
T
 
-
G
 
G
T
 
L
A
 
L
D
 
S
N
 
N
R
x
K
R
 
R
P
 
V
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
M
 
F
R
 
-
A
 
-
M
 
A
V
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
S
D
 
E
G
 
G
C
 
Y
Y
 
L
W
 
W
I
 
T
C
 
A
C
 
L
L
x
W
D
 
G
E
 
G
G
 
F
C
 
G
I
 
A
K
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
S
P
 
P
N
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
A
D
 
V
R
 
T
R
 
R
I
 
I
E
 
E
V
 
L
P
 
P
M
 
A
R
 
P
K
 
N
P
 
V
T
 
T
M
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
K
T
 
T
M
 
L
L
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
L
 
A
S
 
R
R
 
K
G
 
G
P
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
D
 
Y
P
 
P
H
 
L
G
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
V
L
 
F
M
 
A
F
 
V
D
 
P
P
 
V
G
 
D
A
 
V
Q
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
E
 
Q

7plbB Caulobacter crescentus xylonolactonase with d-xylose (see paper)
30% identity, 96% coverage: 8:291/296 of query aligns to 10:283/289 of 7plbB

query
sites
7plbB
D
 
D
L
 
L
R
 
K
N
 
A
G
 
T
T
x
L
G
 
G
E
|
E
N
 
G
P
 
P
V
 
I
W
 
W
D
 
H
A
 
G
E
 
D
R
 
-
G
 
-
S
 
T
W
 
L
T
 
W
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
K
A
 
Q
R
 
R
T
 
K
I
 
I
H
 
H
R
 
N
L
 
Y
D
 
H
P
 
P
S
 
A
S
 
T
G
 
G
A
 
E
H
 
R
R
 
F
R
 
S
W
 
F
T
 
D
L
 
A
P
 
P
E
 
D
M
 
Q
I
 
V
G
 
T
S
 
F
L
 
L
V
 
A
-
 
P
L
 
I
R
 
V
P
 
G
D
x
A
G
 
T
G
|
G
V
x
F
V
 
V
C
 
V
A
 
G
C
 
L
E
 
K
T
 
T
G
 
G
V
 
I
F
 
H
D
 
R
V
 
F
D
 
H
L
 
-
P
|
P
G
 
A
E
 
T
G
 
G
G
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
F
T
 
S
A
 
L
L
 
L
A
 
L
T
x
E
H
x
V
R
 
E
F
x
D
P
 
A
K
 
A
E
 
L
G
 
N
M
 
N
R
|
R
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
R
 
T
C
 
V
D
 
D
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
G
S
 
T
M
 
M
V
 
-
M
 
H
D
 
D
I
 
G
S
 
E
K
 
E
G
 
N
D
 
N
S
 
S
S
 
G
G
 
S
L
 
L
W
 
Y
H
 
R
R
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
M
T
x
D
E
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
G
 
A
-
 
R
-
 
M
-
 
D
-
 
R
G
 
D
Y
 
I
I
 
C
I
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
S
 
P
A
 
C
F
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
T
L
 
F
Y
 
Y
A
 
H
S
 
T
D
 
D
S
 
T
H
 
L
R
 
E
D
 
-
V
 
-
R
 
K
M
 
T
V
 
I
W
 
Y
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
A
T
 
E
D
|
D
T
 
-
G
 
G
T
 
L
A
 
L
D
 
S
N
 
N
R
 
K
R
 
R
P
 
V
F
 
F
V
 
V
D
 
Q
M
 
F
R
 
-
A
 
-
M
 
A
V
 
L
G
 
G
-
 
D
-
 
D
-
 
V
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
S
D
 
E
G
 
G
C
 
Y
Y
 
L
W
 
W
I
 
T
C
 
A
C
 
L
L
 
W
D
 
G
E
 
G
G
 
F
C
 
G
I
 
A
K
 
V
R
 
R
F
 
F
T
 
S
P
 
P
N
 
Q
G
 
G
D
 
D
L
 
A
D
 
V
R
 
T
R
 
R
I
 
I
E
 
E
V
 
L
P
 
P
M
 
A
R
 
P
K
 
N
P
 
V
T
 
T
M
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
K
T
 
T
M
 
L
L
 
Y
V
 
F
T
 
T
S
 
T
L
 
A
S
 
R
R
 
K
G
 
G
P
 
L
A
 
S
D
 
D
-
 
E
-
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
D
 
Y
P
 
P
H
 
L
G
 
A
G
 
G
R
 
G
V
 
V
L
 
F
M
 
A
F
 
V
D
 
P
P
 
V
G
 
D
A
 
V
Q
 
A
G
 
G
L
 
Q
P
 
P
E
 
Q

5gx1A Luciferin-regenerating enzyme collected with serial synchrotron rotational crystallography with accumulated dose of 1.1 mgy (1st measurement) (see paper)
27% identity, 84% coverage: 13:262/296 of query aligns to 15:270/307 of 5gx1A

query
sites
5gx1A
T
 
V
G
 
G
E
|
E
N
 
G
P
 
P
V
 
H
W
 
W
D
 
D
A
 
H
E
 
E
R
 
T
G
 
Q
S
 
T
W
 
L
T
 
Y
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
T
P
 
V
A
 
E
R
 
K
T
 
T
I
 
F
H
 
H
R
 
K
L
 
Y
D
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
Q
G
 
K
A
 
K
H
 
Y
R
 
T
R
 
F
W
x
C
T
 
K
L
 
V
P
 
D
E
 
K
M
 
L
I
 
V
G
 
S
S
 
F
L
 
I
V
 
I
-
 
P
-
 
L
L
 
A
R
 
G
P
 
S
D
 
P
G
 
G
G
 
R
V
 
F
V
 
V
C
 
V
A
 
S
C
 
L
E
 
E
T
 
R
G
 
E
V
 
I
F
 
A
D
 
I
V
x
L
D
 
T
L
x
W
P
 
D
G
 
G
-
 
V
E
 
S
G
 
A
G
 
A
E
 
P
A
 
T
V
 
S
V
 
I
T
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
N
H
 
V
R
 
E
F
 
P
P
 
H
K
 
I
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
A
D
 
D
R
 
P
Q
 
L
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
L
 
T
S
 
G
S
 
T
M
 
M
V
 
A
M
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
G
I
 
L
S
 
P
K
 
I
G
 
G
D
 
P
S
 
V
S
 
T
G
 
G
-
 
S
L
 
L
W
 
Y
H
 
H
R
 
-
F
 
-
T
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
K
T
 
V
E
 
K
T
 
M
G
 
H
T
 
E
G
 
S
G
 
N
Y
 
I
I
 
A
I
 
I
P
 
A
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
A
F
 
W
S
 
S
P
 
N
D
 
D
G
 
L
R
 
K
T
 
K
L
 
M
Y
 
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
G
R
 
K
D
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
R
V
 
V
W
 
D
A
 
E
W
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
A
D
 
S
T
 
T
G
 
L
T
 
S
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
F
 
L
-
 
F
-
 
T
V
 
F
D
 
E
M
 
K
R
 
H
A
 
E
M
 
V
V
 
P
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
D
 
D
I
 
E
D
 
E
G
 
G
C
 
N
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
V
L
 
F
D
 
Q
E
 
G
G
 
Q
C
 
R
I
 
I
K
 
I
R
 
K
F
 
I
T
 
S
-
 
T
-
 
Q
-
 
Q
P
 
P
N
 
E
G
 
V
D
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
-
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
I
P
 
P
M
 
D
R
 
P
K
 
Q
P
 
V
T
 
T
M
 
S
C
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
N
L
 
L
R
 
D
T
 
E
M
 
L
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
S

5d9bA Luciferin-regenerating enzyme solved by siras using xfel (refined against native data) (see paper)
27% identity, 84% coverage: 13:262/296 of query aligns to 15:270/307 of 5d9bA

query
sites
5d9bA
T
 
V
G
 
G
E
|
E
N
 
G
P
 
P
V
 
H
W
 
W
D
 
D
A
 
H
E
 
E
R
 
T
G
 
Q
S
 
T
W
 
L
T
 
Y
W
 
F
I
 
V
D
 
D
I
 
T
P
 
V
A
 
E
R
 
K
T
 
T
I
 
F
H
 
H
R
 
K
L
 
Y
D
 
V
P
 
P
S
 
S
S
 
Q
G
 
K
A
 
K
H
 
Y
R
 
T
R
 
F
W
 
C
T
 
K
L
 
V
P
 
D
E
 
K
M
 
L
I
 
V
G
 
S
S
 
F
L
 
I
V
 
I
-
 
P
-
 
L
L
 
A
R
 
G
P
 
S
D
 
P
G
 
G
G
 
R
V
 
F
V
 
V
C
 
V
A
 
S
C
 
L
E
 
E
T
 
R
G
 
E
V
 
I
F
 
A
D
 
I
V
 
L
D
 
T
L
 
W
P
 
D
G
 
G
-
 
V
E
 
S
G
 
A
G
 
A
E
 
P
A
 
T
V
 
S
V
 
I
T
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
V
T
 
N
H
 
V
R
 
E
F
 
P
P
 
H
K
 
I
E
 
K
G
 
N
M
 
N
R
 
R
F
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
K
C
 
A
D
 
D
R
 
P
Q
 
L
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
L
 
T
S
 
G
S
 
T
M
 
M
V
 
A
M
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
G
I
 
L
S
 
P
K
 
I
G
 
G
D
 
P
S
 
V
S
 
T
G
 
G
-
 
S
L
 
L
W
 
Y
H
 
H
R
 
-
F
 
-
T
 
L
R
 
G
A
 
A
D
 
D
G
 
K
L
 
K
T
 
V
E
 
K
T
 
M
G
 
H
T
 
E
G
 
S
G
 
N
Y
 
I
I
 
A
I
 
I
P
 
A
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
A
F
 
W
S
 
S
P
 
N
D
 
D
G
 
L
R
 
K
T
 
K
L
 
M
Y
 
Y
A
 
Y
S
 
I
D
 
D
S
 
S
H
 
G
R
 
K
D
 
-
V
 
-
R
 
R
M
 
R
V
 
V
W
 
D
A
 
E
W
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
T
 
A
D
 
S
T
 
T
G
 
L
T
 
S
A
 
I
D
 
S
N
 
N
R
 
Q
R
 
R
P
 
P
F
 
L
-
 
F
-
 
T
V
 
F
D
 
E
M
 
K
R
 
H
A
 
E
M
 
V
V
 
P
G
 
G
R
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
D
 
D
I
 
E
D
 
E
G
 
G
C
 
N
Y
 
L
W
 
W
I
 
V
C
 
A
C
 
V
L
 
F
D
 
Q
E
 
G
G
 
Q
C
 
R
I
 
I
K
 
I
R
 
K
F
 
I
T
 
S
-
 
T
-
 
Q
-
 
Q
P
 
P
N
 
E
G
 
V
D
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
-
R
 
T
I
 
V
E
 
K
V
 
I
P
 
P
M
 
D
R
 
P
K
 
Q
P
 
V
T
 
T
M
 
S
C
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
N
L
 
L
R
 
D
T
 
E
M
 
L
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
S
 
S

7rizA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound 2-hydroxyquinoline (see paper)
28% identity, 55% coverage: 104:266/296 of query aligns to 120:287/306 of 7rizA

query
sites
7rizA
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
T
S
 
D
M
 
L
V
 
G
M
 
K
D
 
R
I
 
R
S
 
A
K
 
R
G
 
D
D
 
M
S
 
D
S
 
V
G
 
G
L
 
A
W
 
A
H
 
Y
R
 
Y
F
 
I
T
 
K
R
 
-
A
 
-
D
 
P
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
I
-
 
T
-
 
E
G
 
Q
T
 
V
G
 
F
G
 
G
Y
 
T
I
 
L
I
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
S
 
I
A
 
G
F
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
R
 
T
D
 
G
V
 
-
R
 
-
M
 
R
V
 
L
W
 
W
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
S
G
 
G
T
 
P
A
 
G
D
 
E
N
 
V
R
 
K
R
 
P
P
 
R
F
 
D
V
 
V
D
 
I
M
 
Y
R
 
R
A
 
G
M
 
E
V
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
P
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
Q
-
 
M
-
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
C
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
S
G
 
G
C
 
C
I
 
I
K
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
N
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
R
 
Q
I
 
V
E
 
P
V
 
T
P
 
G
M
 
D
R
 
R
K
 
V
P
 
T
T
 
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
K
T
 
T
M
 
A
L
 
Y
V
 
I
T
 
T
S
 
L
L
 
S
S
 
G
R
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8dk0A Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound (s)gamma- valerolactone (see paper)
27% identity, 55% coverage: 104:266/296 of query aligns to 115:274/293 of 8dk0A

query
sites
8dk0A
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
T
S
 
D
M
 
L
V
 
G
M
 
K
D
 
R
I
 
R
S
 
A
K
 
R
G
 
D
D
 
M
S
 
D
S
 
V
G
 
G
L
 
A
W
 
A
H
 
Y
R
 
Y
F
 
I
T
 
K
R
 
-
A
 
-
D
 
P
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
I
-
 
T
-
 
E
G
 
Q
T
 
V
G
 
F
G
 
G
Y
 
T
I
 
L
I
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
S
 
I
A
 
G
F
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
R
 
T
D
 
G
V
 
-
R
 
-
M
 
R
V
 
L
W
 
W
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
S
T
 
G
D
 
P
T
 
G
G
 
E
T
 
V
A
 
K
D
 
P
N
 
K
R
 
G
R
 
K
P
 
P
F
 
I
V
 
C
D
 
G
M
 
L
R
 
G
A
 
G
M
 
Y
V
 
Q
G
 
-
R
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
C
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
S
G
 
G
C
 
C
I
 
I
K
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
N
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
R
 
Q
I
 
V
E
 
P
V
 
T
P
 
G
M
 
D
R
 
R
K
 
V
P
 
T
T
|
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
K
T
 
T
M
 
A
L
 
Y
V
 
I
T
 
T
S
 
L
L
 
S
S
 
G
R
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8djzA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound product (see paper)
27% identity, 55% coverage: 104:266/296 of query aligns to 115:274/293 of 8djzA

query
sites
8djzA
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
T
S
 
D
M
 
L
V
 
G
M
 
K
D
 
R
I
 
R
S
 
A
K
 
R
G
 
D
D
 
M
S
 
D
S
 
V
G
 
G
L
 
A
W
 
A
H
 
Y
R
 
Y
F
 
I
T
 
K
R
 
-
A
 
-
D
 
P
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
I
-
 
T
-
 
E
G
 
Q
T
 
V
G
 
F
G
 
G
Y
 
T
I
 
L
I
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
S
 
I
A
 
G
F
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
R
 
T
D
 
G
V
 
-
R
 
-
M
 
R
V
 
L
W
 
W
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
S
T
 
G
D
 
P
T
 
G
G
 
E
T
 
V
A
 
K
D
 
P
N
 
K
R
 
G
R
 
K
P
 
P
F
 
I
V
 
C
D
 
G
M
 
L
R
 
G
A
 
G
M
 
Y
V
 
Q
G
 
-
R
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
C
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
S
G
 
G
C
 
C
I
 
I
K
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
N
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
R
 
Q
I
 
V
E
 
P
V
 
T
P
 
G
M
 
D
R
 
R
K
 
V
P
 
T
T
 
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
K
T
 
T
M
 
A
L
 
Y
V
 
I
T
 
T
S
 
L
L
 
S
S
 
G
R
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8djfA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound tetrahedral intermediate (see paper)
27% identity, 55% coverage: 104:266/296 of query aligns to 115:274/293 of 8djfA

query
sites
8djfA
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
T
S
 
D
M
 
L
V
 
G
M
 
K
D
 
R
I
 
R
S
 
A
K
 
R
G
 
D
D
 
M
S
 
D
S
 
V
G
 
G
L
 
A
W
 
A
H
 
Y
R
 
Y
F
 
I
T
 
K
R
 
-
A
 
-
D
 
P
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
I
-
 
T
-
 
E
G
 
Q
T
 
V
G
 
F
G
 
G
Y
 
T
I
 
L
I
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
S
 
I
A
 
G
F
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
R
 
T
D
 
G
V
 
-
R
 
-
M
 
R
V
 
L
W
 
W
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
L
D
 
S
T
 
G
D
 
P
T
 
G
G
 
E
T
 
V
A
 
K
D
 
P
N
 
K
R
 
G
R
 
K
P
 
P
F
 
I
V
 
C
D
 
G
M
 
L
R
 
G
A
 
G
M
 
Y
V
 
Q
G
 
-
R
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
C
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
S
G
 
G
C
 
C
I
 
I
K
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
N
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
R
 
Q
I
 
V
E
 
P
V
 
T
P
 
G
M
 
D
R
 
R
K
 
V
P
 
T
T
 
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
K
T
 
T
M
 
A
L
 
Y
V
 
I
T
 
T
S
 
L
L
 
S
S
 
G
R
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7risA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound phosphate (see paper)
24% identity, 82% coverage: 24:266/296 of query aligns to 20:274/293 of 7risA

query
sites
7risA
G
 
G
S
 
S
W
 
V
T
 
V
W
 
L
I
 
V
D
 
E
I
 
I
P
 
R
A
 
A
R
 
Q
T
 
Q
I
 
L
H
 
T
R
 
R
L
 
V
D
 
W
P
 
P
S
 
D
S
 
G
G
 
R
A
 
K
H
 
E
R
 
V
R
 
V
W
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
P
E
 
G
M
 
G
I
 
P
G
 
N
S
 
G
L
 
A
V
 
A
L
 
L
R
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
G
 
K
V
 
M
V
 
Y
C
 
I
A
 
-
C
 
C
E
 
N
T
 
N
G
 
G
V
 
G
F
 
F
D
 
G
V
 
P
D
 
G
L
 
A
P
 
P
G
 
A
-
 
P
-
 
H
-
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
L
E
 
Q
G
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
V
V
 
E
V
 
T
T
 
L
A
 
F
L
 
D
A
 
K
T
 
C
H
 
G
R
 
E
F
 
H
P
 
P
K
 
L
E
 
K
G
 
G
M
 
P
R
 
-
F
 
-
N
|
N
D
 
D
G
 
L
R
 
V
C
 
F
D
 
D
R
 
K
Q
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
T
S
 
D
M
 
L
V
 
G
M
 
K
D
 
R
I
 
R
S
 
A
K
 
R
G
 
D
D
 
M
S
 
D
S
 
V
G
 
G
L
 
A
W
 
A
H
 
Y
R
 
Y
F
 
I
T
 
K
R
 
-
A
 
-
D
 
P
G
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
I
G
 
T
T
 
E
G
 
Q
-
 
V
-
 
F
G
 
G
Y
 
T
I
 
L
I
 
P
P
 
L
N
|
N
G
 
G
S
 
I
A
 
G
F
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
T
 
T
L
 
M
Y
 
Y
A
 
A
S
 
A
D
 
E
S
 
T
H
 
P
R
 
T
D
 
G
V
 
-
R
 
-
M
 
R
V
 
L
W
 
W
A
 
A
W
 
F
D
 
D
Y
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
P
-
 
G
D
 
E
T
 
V
D
 
K
T
 
P
G
 
R
T
 
D
A
 
G
D
 
E
N
 
K
R
 
G
R
 
K
P
 
P
F
 
I
V
 
C
D
 
G
M
 
L
R
 
G
A
 
G
M
 
Y
V
 
Q
G
 
-
R
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
I
 
A
D
 
S
G
 
G
C
 
N
Y
 
V
W
 
C
I
 
V
C
 
A
C
 
T
L
 
L
D
 
V
E
 
S
G
 
G
C
 
C
I
 
I
K
 
S
R
 
V
F
 
I
T
 
A
P
 
P
N
 
D
G
 
G
D
 
T
L
 
L
D
 
V
R
 
E
R
 
Q
I
 
V
E
 
P
V
 
T
P
 
G
M
 
D
R
 
R
K
 
V
P
 
T
T
|
T
M
 
N
C
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
K
T
 
T
M
 
A
L
 
Y
V
 
I
T
 
T
S
 
L
L
 
S
S
 
G
R
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3e5zA X-ray structure of the putative gluconolactonase in protein family pf08450. Northeast structural genomics consortium target drr130.
27% identity, 51% coverage: 112:261/296 of query aligns to 125:273/290 of 3e5zA

query
sites
3e5zA
G
 
G
R
 
S
F
 
L
W
 
W
L
 
F
S
 
S
S
 
D
M
 
P
V
 
T
M
 
Y
D
 
G
I
 
I
S
 
D
K
 
K
G
 
P
D
 
E
S
 
E
S
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
M
-
 
E
-
 
L
-
 
P
G
 
G
L
 
R
W
 
W
H
 
V
R
 
F
F
 
R
T
 
L
R
 
A
A
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
T
T
 
L
E
 
S
T
 
A
G
 
P
T
 
I
G
 
R
G
 
D
Y
 
R
I
 
V
I
 
K
P
 
P
N
|
N
G
 
G
S
 
L
A
 
A
F
 
F
S
 
L
P
 
P
D
 
S
G
 
G
R
 
-
T
 
N
L
 
L
Y
 
L
A
 
V
S
 
S
D
 
D
S
 
T
H
 
G
R
 
D
D
 
N
V
 
A
R
 
T
M
 
H
V
 
R
W
 
Y
A
 
C
W
 
L
D
 
N
Y
 
A
D
 
R
T
 
G
D
 
E
T
 
T
G
 
E
T
 
Y
A
 
Q
D
 
G
N
 
-
R
 
-
R
 
-
P
 
-
F
 
-
V
 
V
D
 
H
M
 
F
R
 
T
A
 
V
M
 
E
V
 
P
G
 
G
R
 
K
P
 
T
D
|
D
G
 
G
A
 
L
A
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
A
D
 
G
G
 
G
C
 
L
Y
 
I
W
 
W
I
 
A
C
 
S
C
 
A
L
 
G
D
 
D
E
 
-
G
 
-
C
 
G
I
 
V
K
 
H
R
 
V
F
 
L
T
 
T
P
 
P
N
 
D
G
 
G
D
 
D
L
 
E
D
 
L
R
 
G
R
 
R
I
 
V
E
 
L
V
 
T
P
 
P
M
 
Q
R
 
T
K
 
T
P
 
S
T
 
N
M
 
L
C
 
C
A
 
-
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
D
 
E
L
 
G
R
 
R
T
 
T
M
 
L
L
 
Y
V
 
M
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS22710 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS22710
LEAVFDPDLRNGTGENPVWDAERGSWTWIDIPARTIHRLDPSSGAHRRWTLPEMIGSLVL
RPDGGVVCACETGVFDVDLPGEGGEAVVTALATHRFPKEGMRFNDGRCDRQGRFWLSSMV
MDISKGDSSGLWHRFTRADGLTETGTGGYIIPNGSAFSPDGRTLYASDSHRDVRMVWAWD
YDTDTGTADNRRPFVDMRAMVGRPDGAAVDIDGCYWICCLDEGCIKRFTPNGDLDRRIEV
PMRKPTMCAFGGPDLRTMLVTSLSRGPADLAEDPHGGRVLMFDPGAQGLPEPRLAD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory