SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS25420 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS25420 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5jc8D Crystal structure of a putative short-chain dehydrogenase/reductase from burkholderia xenovorans
49% identity, 97% coverage: 6:263/267 of query aligns to 1:258/262 of 5jc8D

query
sites
5jc8D
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
S
 
C
S
 
I
A
 
G
P
 
P
G
 
G
W
 
W
G
|
G
N
 
N
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
H
V
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
K
 
R
V
 
D
T
 
L
E
 
A
A
 
S
A
 
M
E
 
D
E
 
A
T
 
T
A
 
L
A
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
R
A
 
A
E
 
A
G
 
G
F
 
G
A
 
S
A
 
V
L
 
T
A
 
P
V
 
C
T
 
L
A
 
C
D
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
D
G
 
S
P
 
A
E
 
S
V
 
V
A
 
E
A
 
R
A
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
D
T
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
R
H
 
C
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
V
G
 
G
I
 
A
T
 
P
E
 
S
P
 
P
G
 
G
G
 
G
P
 
P
V
 
V
E
 
A
T
 
L
S
 
D
E
 
E
E
 
A
S
 
Q
W
 
W
R
 
A
R
 
M
V
 
Q
L
 
L
D
 
E
T
 
L
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
T
V
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
M
C
 
C
K
 
K
Q
 
Y
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
V
M
 
M
V
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
I
 
T
A
 
S
A
 
G
I
 
I
R
 
R
W
 
W
A
 
T
-
 
G
Y
 
A
P
 
A
Y
 
Q
I
 
V
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
M
N
 
I
Q
 
Q
F
 
M
T
 
G
V
 
R
A
 
V
V
 
V
A
 
A
R
 
V
Q
 
E
H
 
Y
A
 
A
R
 
A
D
 
K
G
 
N
I
 
V
R
 
R
A
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
V
M
 
V
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
 
L
D
 
H
T
 
T
P
|
P
M
|
M
A
 
V
R
 
D
S
 
T
Q
 
K
I
 
I
A
 
-
A
 
A
H
 
H
Y
 
N
K
 
G
D
 
D
A
 
V
G
 
E
E
 
L
M
 
L
R
 
L
R
 
R
A
 
K
R
 
R
D
 
Q
A
 
A
L
 
R
C
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
P
F
 
F
Q
 
M
G
 
G
T
 
D
A
 
G
W
 
R
D
 
D
I
 
T
A
 
A
A
 
N
A
 
A
S
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
T
C
 
E
L
 
I
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
S

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
42% identity, 95% coverage: 9:262/267 of query aligns to 3:241/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
I
F
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
S
|
S
S
 
E
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
R
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
E
A
 
I
Y
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
I
V
 
V
D
|
D
K
 
-
V
x
L
T
 
D
E
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
S
E
 
Q
T
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
K
I
 
A
A
 
L
A
 
G
E
 
E
G
 
G
F
 
H
A
 
M
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
-
T
 
-
A
|
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
N
G
 
E
P
 
E
E
 
Q
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
A
 
H
H
 
Y
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
E
 
Q
P
 
P
G
 
I
G
 
K
P
 
T
V
 
L
E
 
D
T
 
I
S
 
Q
E
 
R
E
 
S
S
 
D
W
 
Y
R
 
D
R
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
D
T
x
V
D
 
S
L
 
L
T
 
R
G
 
G
V
 
T
F
 
L
L
 
I
T
 
M
C
 
S
K
 
Q
Q
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
S
M
 
M
V
 
K
A
 
A
Q
 
N
R
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
S
A
 
A
I
 
Q
R
 
R
W
 
G
A
 
G
Y
 
G
P
 
I
Y
 
F
I
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
L
Q
 
G
F
 
L
T
 
A
V
 
K
A
 
A
V
 
M
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
F
A
 
G
R
 
G
D
 
D
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
L
M
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
I
|
I
D
 
Q
T
|
T
P
 
D
M
 
M
A
 
N
R
 
D
S
 
D
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
R
A
 
R
R
 
H
D
 
D
A
 
I
L
 
L
-
 
A
-
 
G
C
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
A
W
 
Q
D
 
D
I
 
V
A
 
A
A
 
N
A
 
A
S
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
S
R
 
A
Y
 
Y
I
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
C
 
T
L
 
L
P
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
40% identity, 96% coverage: 9:264/267 of query aligns to 3:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
F
 
T
G
|
G
A
 
-
G
 
G
S
|
S
S
x
R
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
N
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
V
 
I
V
 
F
-
 
F
A
x
N
V
x
Y
D
x
N
K
x
G
V
x
S
T
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
K
L
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
E
E
 
H
G
 
G
F
 
V
A
 
E
A
 
V
L
 
E
A
 
A
V
 
M
T
 
K
A
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
I
G
 
A
P
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
F
V
 
F
E
 
K
R
 
Q
T
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
E
 
R
P
 
D
G
 
N
G
 
L
P
 
L
V
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
D
S
 
E
W
 
W
R
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
N
T
x
I
D
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
T
 
C
C
 
T
K
 
K
Q
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
V
 
T
M
 
M
V
 
M
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
S
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
I
 
L
R
 
I
W
 
G
A
 
N
Y
 
A
P
 
G
Y
x
Q
I
 
A
G
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
T
V
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
P
D
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
F
I
|
I
D
 
T
T
|
T
P
 
D
M
 
M
A
 
T
R
 
D
S
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
K
 
K
D
 
L
A
 
D
G
 
E
E
 
K
M
 
T
R
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
M
D
 
L
A
 
A
L
 
Q
C
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
A
Q
 
Y
G
 
G
T
 
T
A
 
T
W
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
S
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
S
R
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
T
L
 
L
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
V
L
 
M

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
34% identity, 96% coverage: 9:263/267 of query aligns to 5:251/261 of P40288

query
sites
P40288
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
x
V
V
x
I
F
x
T
G
|
G
A
x
S
G
x
S
S
x
T
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
L
G
|
G
K
|
K
A
x
S
T
x
M
A
|
A
V
x
I
A
x
R
Y
x
F
A
|
A
R
x
T
E
|
E
G
x
K
A
|
A
R
x
K
V
|
V
V
|
V
A
 
-
V
 
V
D
 
N
K
 
Y
V
 
R
T
 
S
E
 
K
A
 
E
A
 
D
E
 
E
E
 
A
T
 
N
A
 
S
A
 
V
L
 
L
-
 
E
-
 
E
I
 
I
A
 
K
A
 
K
E
 
V
G
 
G
F
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
K
A
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
V
G
 
E
P
 
S
E
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
N
A
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
S
T
 
A
L
 
I
A
 
K
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
H
 
I
N
 
N
N
 
N
V
 
A
G
 
G
I
 
L
T
x
E
E
 
N
P
 
P
G
 
V
G
 
S
P
 
S
V
 
H
E
 
E
T
 
M
S
 
S
E
 
L
E
 
S
S
x
D
W
 
W
R
 
N
R
 
K
V
|
V
L
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
S
K
 
R
Q
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
V
 
Y
M
 
F
V
 
V
A
x
E
Q
 
N
R
 
D
-
 
I
S
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
S
S
 
S
I
 
V
-
 
H
A
 
E
A
 
K
I
 
I
R
 
P
W
 
W
A
 
P
Y
 
L
P
 
-
Y
 
F
I
 
V
G
 
H
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
K
A
 
G
G
 
G
V
 
M
N
 
K
Q
 
L
F
 
M
T
 
T
V
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
A
R
 
L
Q
 
E
H
 
Y
A
 
A
R
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
x
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
M
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
A
I
 
I
D
 
N
T
 
T
P
|
P
M
 
I
A
 
N
R
 
A
S
 
E
Q
 
K
I
 
F
A
 
A
A
 
D
H
 
P
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
E
M
 
Q
R
 
R
R
 
A
A
 
D
R
 
V
D
x
E
A
 
S
L
 
M
C
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
F
x
Y
Q
 
I
G
 
G
T
 
E
A
 
P
W
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
E
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
L
P
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

Sites not aligning to the query:

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
34% identity, 96% coverage: 9:263/267 of query aligns to 5:251/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
F
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
S
S
x
T
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
L
G
 
G
K
 
K
A
 
S
T
 
M
A
 
A
V
 
I
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
T
E
 
E
G
 
K
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
-
V
 
V
D
 
N
K
 
Y
V
x
R
T
 
S
E
 
K
A
 
E
A
 
D
E
 
E
E
 
A
T
 
N
A
 
S
A
 
V
L
 
L
-
 
E
-
 
E
I
 
I
A
 
K
A
 
K
E
 
V
G
 
G
F
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
K
A
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
V
G
 
E
P
 
S
E
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
N
A
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
S
T
 
A
L
 
I
A
 
K
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
 
L
T
 
A
E
 
N
P
 
P
G
 
V
G
 
S
P
 
S
V
 
H
E
 
E
T
 
M
S
 
S
E
 
L
E
 
S
S
 
D
W
 
W
R
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
S
K
 
R
Q
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
V
 
Y
M
 
F
V
 
V
A
 
E
Q
 
N
R
 
D
-
 
I
S
 
K
G
 
G
A
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
S
 
S
S
|
S
I
 
V
-
 
H
A
 
E
A
 
K
I
 
I
R
 
P
W
 
W
A
 
P
Y
 
L
P
 
-
Y
 
F
I
 
V
G
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
M
N
 
K
Q
 
L
F
 
M
T
 
T
V
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
A
R
 
L
Q
 
E
H
 
Y
A
 
A
R
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
M
 
G
P
|
P
G
|
G
L
 
A
I
|
I
D
 
N
T
|
T
P
 
P
M
 
I
A
 
N
R
 
A
S
 
E
Q
 
K
I
 
F
A
 
A
A
 
D
H
 
P
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
E
M
 
Q
R
 
R
R
 
A
A
 
D
R
 
V
D
 
E
A
 
S
L
 
M
C
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
F
 
Y
Q
 
I
G
 
G
T
 
E
A
 
P
W
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
A
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
E
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
L
P
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
37% identity, 96% coverage: 9:263/267 of query aligns to 5:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
F
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
S
|
S
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
K
A
 
K
Y
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
S
D
|
D
K
x
M
V
 
N
T
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
E
 
Q
E
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
N
L
 
S
I
 
L
A
 
K
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
A
T
 
P
A
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
G
 
E
P
 
D
E
 
A
V
 
Y
A
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
L
 
Q
A
 
K
A
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
 
F
T
x
Q
E
 
H
P
 
V
G
 
A
G
 
P
P
 
I
V
 
E
E
 
E
T
 
F
S
 
P
E
 
T
E
 
A
S
 
V
W
 
F
R
 
Q
R
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
Q
T
 
V
D
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
I
T
 
G
C
 
I
K
 
K
Q
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
M
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
S
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
S
x
A
S
|
S
I
 
I
A
x
N
A
 
G
I
 
L
R
 
I
W
 
G
A
 
F
Y
 
A
P
 
G
Y
x
K
I
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
V
V
 
A
A
 
A
R
 
L
Q
 
E
H
 
C
A
 
A
R
 
R
D
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
M
 
C
P
|
P
G
|
G
L
 
Y
I
x
V
D
 
D
T
|
T
P
 
P
M
x
L
A
 
V
R
 
R
S
 
G
Q
|
Q
I
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
L
A
 
A
H
 
K
Y
 
T
K
 
R
D
 
N
A
 
V
G
 
S
E
 
L
M
 
D
R
 
S
R
 
A
A
 
L
R
 
E
D
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
F
 
R
Q
 
L
G
 
L
T
 
S
A
 
V
W
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
Y
S
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
K
A
 
A
R
 
G
Y
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
A
L
 
V
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
S
 
T

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
36% identity, 96% coverage: 9:264/267 of query aligns to 5:253/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
L
 
L
A
 
K
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
V
F
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
K
A
 
K
Y
 
F
A
 
A
R
 
L
E
 
N
G
 
D
A
 
S
R
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
D
x
E
K
x
L
V
 
L
T
 
E
E
 
D
A
x
R
A
 
L
E
 
N
E
 
Q
T
 
I
A
 
V
A
 
Q
L
 
E
I
 
L
A
 
R
A
 
G
E
 
M
G
 
G
F
 
K
A
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
V
T
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
K
G
 
K
P
 
K
E
 
D
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
F
V
 
V
E
 
R
R
 
R
T
 
T
L
 
F
A
 
E
A
 
T
H
 
Y
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
C
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
M
E
 
D
P
 
G
G
 
V
G
 
T
P
 
P
V
 
V
-
 
A
E
 
E
T
 
V
S
 
S
E
 
D
E
 
E
S
 
L
W
 
W
R
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
L
D
 
A
T
 
V
D
 
N
L
 
L
T
 
Y
G
 
S
V
 
A
F
 
F
L
 
Y
T
 
S
C
 
S
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
V
 
I
M
 
M
V
 
L
A
 
K
Q
 
Q
R
 
G
S
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
I
 
I
A
 
A
A
 
G
I
 
I
R
 
R
W
 
G
A
 
G
Y
 
F
P
 
A
Y
 
G
I
 
A
G
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
V
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
L
N
 
I
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
A
Q
 
H
H
 
Y
A
 
G
R
 
D
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
A
N
 
V
A
 
A
V
 
V
M
 
L
P
|
P
G
 
G
L
 
T
I
x
V
D
 
K
T
|
T
P
x
N
M
x
I
A
 
G
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
I
 
L
A
 
G
A
 
S
H
 
S
Y
 
K
K
 
P
D
x
S
A
 
E
G
 
L
E
 
G
M
 
M
R
 
R
R
 
T
A
 
L
R
 
T
D
 
K
A
 
L
L
 
M
C
 
S
P
 
L
L
 
S
G
 
S
F
 
R
Q
 
L
G
 
A
T
 
E
A
 
P
W
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
V
S
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
S
Y
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
D
C
 
A
L
 
V
P
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
V

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
37% identity, 96% coverage: 9:263/267 of query aligns to 4:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
L
 
L
A
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
I
F
 
T
G
|
G
A
 
S
G
 
A
S
|
S
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
E
T
 
I
A
 
A
V
 
K
A
 
K
Y
 
F
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
I
V
 
S
D
|
D
K
x
M
V
 
N
T
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
C
E
 
Q
E
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
N
L
 
S
I
 
L
A
 
K
A
 
E
E
 
Q
G
 
G
F
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
A
T
 
P
A
 
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
D
G
 
E
P
 
D
E
 
A
V
 
Y
A
 
K
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
L
 
Q
A
 
K
A
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
 
F
T
x
Q
E
 
H
P
 
V
G
 
A
G
 
P
P
 
I
V
 
E
E
 
E
T
 
F
S
 
P
E
 
T
E
 
A
S
 
V
W
 
F
R
 
Q
R
 
K
V
 
L
L
 
V
D
 
Q
T
 
V
D
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
I
T
 
G
C
 
I
K
 
K
Q
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
M
V
 
K
A
 
A
Q
 
Q
R
 
K
S
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
M
S
x
A
S
|
S
I
 
I
A
 
N
A
 
G
I
 
L
R
 
I
W
 
G
A
 
F
Y
 
A
P
 
G
Y
x
K
I
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
V
V
 
A
A
 
A
R
 
L
Q
 
E
H
 
C
A
 
A
R
 
R
D
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
M
 
C
P
 
P
G
 
G
L
x
Y
I
x
V
D
 
D
T
|
T
P
 
P
M
 
L
A
 
V
R
 
R
S
 
G
Q
|
Q
I
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
L
A
 
A
H
 
K
Y
 
T
K
 
R
D
 
N
A
 
V
G
 
S
E
 
L
M
 
D
R
 
S
R
 
A
A
 
L
R
 
E
D
 
D
-
 
V
-
 
I
-
 
L
A
 
A
L
 
M
C
 
V
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
F
 
R
Q
 
L
G
 
L
T
 
S
A
 
V
W
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
Y
S
 
A
V
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
K
A
 
A
R
 
G
Y
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
A
L
 
V
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
S
 
T

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
37% identity, 96% coverage: 7:263/267 of query aligns to 1:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
G
 
G
R
 
I
L
 
L
A
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
S
|
S
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
V
 
H
A
 
S
Y
 
Y
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
V
V
 
S
D
|
D
K
x
I
V
 
N
T
 
E
E
 
D
A
 
H
A
 
G
E
 
N
E
 
K
T
 
A
A
 
V
A
 
E
L
 
D
I
 
I
A
 
K
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
F
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
S
A
 
F
V
 
V
T
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
R
 
N
G
 
P
P
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
V
E
 
K
R
 
R
T
 
T
L
 
V
A
 
E
A
 
I
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
H
 
C
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
 
I
T
 
G
-
 
G
E
 
E
P
 
Q
G
 
A
G
 
L
P
 
A
V
 
G
E
 
D
T
 
Y
S
 
G
E
 
L
E
 
D
S
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
V
 
V
L
 
L
D
 
S
T
 
I
D
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
Y
T
 
G
C
 
C
K
 
K
Q
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
E
V
 
Q
M
 
M
V
 
E
A
 
K
Q
 
N
R
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
S
 
A
S
|
S
I
 
I
A
 
H
A
 
G
I
 
I
R
 
V
W
 
A
A
 
A
Y
 
P
P
 
L
Y
 
S
I
 
S
G
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
V
 
V
N
 
V
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
N
V
 
I
A
 
G
R
 
A
Q
 
E
H
 
Y
A
 
G
R
 
Q
D
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
G
P
|
P
G
x
A
L
x
Y
I
|
I
D
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
A
 
L
R
 
E
S
 
S
Q
 
L
I
 
T
A
 
K
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
E
M
 
M
R
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
L
D
 
I
A
 
S
L
 
K
C
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
F
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
K
A
 
P
W
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
L
S
 
V
V
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
R
 
S
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
G
C
 
Y
L
 
Y
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
S
 
T

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
40% identity, 93% coverage: 12:260/267 of query aligns to 3:245/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
F
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
|
N
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
T
A
 
R
Y
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
A
A
 
A
V
 
L
D
|
D
K
x
L
V
 
S
T
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
L
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
R
L
 
T
I
 
H
-
 
W
A
 
H
A
 
A
E
 
Y
G
 
A
F
 
D
A
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
R
V
 
V
T
 
R
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
R
 
D
G
 
E
P
 
G
E
 
D
V
 
V
A
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
A
R
 
A
T
 
T
L
 
M
A
 
E
A
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
 
I
T
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
S
E
 
E
P
 
A
G
 
G
G
 
V
P
 
L
V
 
H
E
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
V
E
 
E
S
 
Q
W
 
F
R
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
V
D
 
N
L
 
V
T
 
R
G
 
G
V
 
I
F
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
C
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
H
M
 
M
V
 
L
A
 
L
Q
 
Q
R
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
A
A
 
S
I
 
L
R
 
-
W
 
V
A
 
A
Y
x
F
P
 
P
-
 
G
Y
x
R
I
 
S
G
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
T
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
N
 
L
Q
 
Q
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
V
Q
 
D
H
 
Y
A
 
A
R
 
G
D
 
S
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
M
I
|
I
D
 
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
A
x
T
R
 
Q
S
x
W
Q
x
R
I
 
L
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
D
A
 
Q
G
 
P
E
 
E
M
 
L
R
 
R
R
 
D
A
 
Q
R
 
V
D
 
L
A
 
A
L
 
R
C
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
F
 
E
Q
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
W
 
A
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
A
S
 
V
V
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
T
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
A
C
 
A
L
 
L
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
40% identity, 93% coverage: 12:260/267 of query aligns to 3:245/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
F
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
|
S
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
|
N
G
 
G
K
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
T
A
 
R
Y
 
F
A
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
A
A
 
A
V
 
L
D
|
D
K
 
L
V
 
S
T
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
L
E
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
R
L
 
T
I
 
H
-
 
W
A
 
H
A
 
A
E
 
Y
G
 
A
F
 
D
A
 
K
A
 
V
L
 
L
A
 
R
V
 
V
T
 
R
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
R
 
D
G
 
E
P
 
G
E
 
D
V
 
V
A
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
E
 
A
R
 
A
T
 
T
L
 
M
A
 
E
A
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
S
E
 
E
P
 
A
G
 
G
G
 
V
P
 
L
V
 
H
E
 
T
T
 
T
S
 
P
E
 
V
E
 
E
S
 
Q
W
 
F
R
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
M
D
 
A
T
 
V
D
 
N
L
 
V
T
 
R
G
 
G
V
 
I
F
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
C
K
 
R
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
V
 
H
M
 
M
V
 
L
A
 
L
Q
 
Q
R
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
A
A
 
S
I
 
L
R
 
-
W
 
V
A
 
A
Y
 
F
P
 
P
-
 
G
Y
x
R
I
 
S
G
 
A
Y
|
Y
A
 
T
A
 
T
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
N
 
L
Q
 
Q
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
S
V
 
V
A
 
A
R
 
V
Q
 
D
H
 
Y
A
 
A
R
 
G
D
 
S
G
 
G
I
 
I
R
|
R
A
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
M
I
|
I
D
x
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
A
 
T
R
 
Q
S
x
W
Q
x
R
I
 
L
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
D
A
 
Q
G
 
P
E
 
E
M
 
L
R
|
R
R
 
D
A
 
Q
R
 
V
D
 
L
A
 
A
L
x
R
C
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
F
 
E
Q
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
W
 
A
D
 
Q
I
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
A
S
 
V
V
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
T
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
A
C
 
A
L
 
L
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 95% coverage: 12:264/267 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
S
S
 
R
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
 
I
G
 
G
K
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
Y
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
-
 
A
V
 
V
A
 
N
V
 
Y
D
 
A
K
 
G
V
 
S
T
 
K
E
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
E
L
 
E
I
 
I
A
 
K
A
 
A
E
 
K
G
 
G
F
 
V
A
 
D
A
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
I
T
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
R
 
D
G
 
A
P
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
E
 
K
R
 
E
T
 
V
L
 
V
A
 
S
A
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
E
 
R
P
 
D
G
 
N
G
 
L
P
 
L
V
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
Q
S
 
E
W
 
W
R
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
T
 
C
C
 
I
K
 
Q
Q
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
V
 
Q
M
 
M
V
 
L
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
I
 
A
R
 
V
W
 
G
A
 
N
Y
 
P
P
 
G
Y
x
Q
I
 
A
G
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
S
V
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
P
 
D
M
 
M
A
 
T
R
 
D
S
 
A
Q
 
L
I
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
S
G
 
D
E
 
E
M
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
Q
R
 
M
D
 
L
A
 
T
L
 
Q
C
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
F
 
R
Q
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
W
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
T
S
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
T
L
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
Y
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
37% identity, 95% coverage: 12:264/267 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
Y
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
-
 
A
V
 
V
A
x
N
V
x
Y
D
x
A
K
x
G
V
x
S
T
 
K
E
 
E
A
 
K
A
 
A
E
 
E
E
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
E
L
 
E
I
 
I
A
 
K
A
 
A
E
 
K
G
 
G
F
 
V
A
 
D
A
 
S
L
 
F
A
 
A
V
 
I
T
 
Q
A
|
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
R
 
D
G
 
A
P
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
M
V
 
I
E
 
K
R
 
E
T
 
V
L
 
V
A
 
S
A
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
E
 
R
P
 
D
G
 
N
G
 
L
P
 
L
V
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
Q
S
 
E
W
 
W
R
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
|
T
D
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
T
 
C
C
 
I
K
 
Q
Q
 
K
V
 
A
L
 
T
P
 
P
V
 
Q
M
 
M
V
 
L
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
I
 
A
R
 
V
W
 
G
A
 
N
Y
 
P
P
 
G
Y
x
Q
I
 
A
G
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
S
V
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
P
 
D
M
 
M
A
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
T
G
 
D
E
 
E
M
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
Q
R
 
M
D
 
L
A
 
T
L
 
Q
C
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
F
 
R
Q
 
F
G
 
G
T
 
Q
A
 
D
W
 
T
D
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
T
S
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
R
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
T
L
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
Y
L
 
M

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:263/267 of query aligns to 10:264/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
R
 
R
L
 
F
A
 
T
G
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
V
L
|
L
V
x
I
F
x
T
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
|
S
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
L
G
|
G
K
x
R
A
|
A
T
|
T
A
|
A
V
|
V
A
x
R
Y
x
L
A
|
A
R
x
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
R
x
K
V
x
L
V
x
S
A
x
L
V
 
V
D
 
D
K
 
V
V
 
S
T
 
S
E
 
E
A
 
G
A
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
S
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
E
A
 
T
A
 
A
E
 
P
G
 
D
F
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
T
T
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
R
 
D
G
 
E
P
 
A
E
 
Q
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
Y
V
 
V
E
 
T
R
 
A
T
 
T
L
 
T
A
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
H
 
F
N
 
N
N
 
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
T
x
E
E
 
G
P
 
K
G
 
Q
G
 
N
P
 
P
V
 
T
E
 
E
T
 
S
-
 
F
S
 
T
E
 
A
E
 
A
S
 
E
W
 
F
R
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
S
T
 
I
D
 
N
L
 
L
T
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
L
K
 
E
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
V
 
I
M
 
M
V
 
R
A
 
E
Q
 
Q
R
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
 
S
I
 
V
A
 
G
A
 
G
I
 
I
R
 
R
W
 
G
A
 
I
Y
 
G
P
 
N
Y
 
Q
I
 
S
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
V
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
N
V
 
S
A
 
A
R
 
V
Q
 
E
H
 
Y
A
 
G
R
 
R
D
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
M
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
A
I
 
I
D
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
A
 
V
R
 
E
S
 
N
Q
 
S
I
 
M
A
 
-
A
 
-
H
 
K
Y
 
Q
K
 
L
D
 
D
A
 
P
G
 
E
E
 
N
M
 
P
R
 
R
R
 
K
A
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
E
L
 
F
C
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
N
P
 
P
L
 
S
G
 
K
F
 
R
Q
 
Y
G
 
G
T
 
E
A
 
A
W
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
V
S
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
A
V
 
T
C
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
S
 
S

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:263/267 of query aligns to 1:255/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
R
 
R
L
 
F
A
 
T
G
 
D
K
 
R
V
 
V
A
 
V
L
 
L
V
 
I
F
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
G
S
|
S
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
R
Y
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
L
V
 
S
A
 
L
V
 
V
D
|
D
K
x
V
V
 
S
T
 
S
E
 
E
A
 
G
A
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
S
E
 
K
T
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
E
A
 
T
A
 
A
E
 
P
G
 
D
F
 
A
A
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
T
T
 
V
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
G
 
E
P
 
A
E
 
Q
V
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
Y
V
 
V
E
 
T
R
 
A
T
 
T
L
 
T
A
 
E
A
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
H
 
F
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
|
G
I
|
I
T
 
E
E
 
G
P
 
K
G
 
Q
G
 
N
P
 
P
V
 
T
E
 
E
T
 
S
-
 
F
S
 
T
E
 
A
E
 
A
S
 
E
W
 
F
R
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
V
D
 
S
T
 
I
D
 
N
L
 
L
T
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
L
K
 
E
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
V
 
I
M
 
M
V
 
R
A
 
E
Q
 
Q
R
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
G
A
 
G
I
 
I
R
 
R
W
 
G
A
 
I
Y
 
G
P
 
N
Y
x
Q
I
 
S
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
V
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
N
V
 
S
A
 
A
R
 
V
Q
 
E
H
 
Y
A
 
G
R
 
R
D
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
M
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
A
I
 
I
D
 
W
T
|
T
P
|
P
M
|
M
A
 
V
R
 
E
S
 
N
Q
 
S
I
 
M
A
 
-
A
 
-
H
 
K
Y
 
Q
K
 
L
D
 
D
A
 
P
G
 
E
E
 
N
M
 
P
R
 
R
R
 
K
A
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
E
L
 
F
C
 
I
-
 
Q
-
 
V
-
 
N
P
 
P
L
 
S
G
 
K
F
 
R
Q
 
Y
G
 
G
T
 
E
A
 
A
W
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
V
S
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
A
V
 
T
C
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
S
 
S

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
32% identity, 96% coverage: 9:263/267 of query aligns to 11:257/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
A
 
K
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
F
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
S
S
x
T
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
L
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
R
Y
 
F
A
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
-
V
 
-
D
 
-
K
 
-
V
 
I
T
 
N
E
 
Y
A
x
Y
A
 
N
E
 
N
E
 
E
T
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
D
A
 
A
A
 
K
E
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
A
G
 
G
F
 
G
A
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
I
V
 
V
T
 
Q
A
 
G
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
G
 
E
P
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
V
A
 
N
A
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
T
T
 
A
L
 
I
A
 
K
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
M
H
 
I
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
I
x
V
T
x
E
E
 
N
P
 
P
G
 
V
G
 
P
P
 
S
V
 
H
E
 
E
T
 
L
S
 
S
E
 
L
E
 
D
S
 
N
W
 
W
R
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
T
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
G
C
 
S
K
 
R
Q
 
E
V
 
A
L
 
I
P
 
K
V
 
Y
M
 
F
V
 
V
A
 
E
Q
 
N
R
 
D
-
 
I
S
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
S
 
S
S
|
S
I
 
V
-
x
H
A
 
E
A
 
M
I
 
I
R
 
P
W
|
W
A
 
P
Y
 
L
P
 
-
Y
 
F
I
 
V
G
 
H
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
M
N
 
K
Q
 
L
F
 
M
T
 
T
V
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
A
R
 
L
Q
 
E
H
 
Y
A
 
A
R
 
P
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
M
 
G
P
|
P
G
|
G
L
 
A
I
x
M
D
 
N
T
|
T
P
|
P
M
x
I
A
x
N
R
 
A
S
 
E
Q
x
K
I
 
F
A
 
A
A
 
D
H
 
P
Y
 
V
K
 
Q
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
R
R
 
A
A
 
D
R
 
V
D
 
E
A
 
S
L
 
M
C
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
F
 
Y
Q
 
I
G
 
G
T
 
K
A
 
P
W
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
S
 
A
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
E
 
Q
A
 
A
R
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
I
C
 
T
L
 
L
P
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
T

4ag3A Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (fabg) from pseudomonas aeruginosa in complex with NADPH at 1.8a resolution (see paper)
38% identity, 96% coverage: 9:264/267 of query aligns to 10:253/254 of 4ag3A

query
sites
4ag3A
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
E
Y
 
L
A
 
G
R
 
R
E
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
T
D
 
A
K
x
T
V
 
S
T
 
A
E
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
E
E
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
E
L
 
T
I
 
L
A
 
K
A
 
A
E
 
N
G
 
G
F
 
V
A
 
E
A
 
G
L
 
A
A
 
G
V
 
L
T
 
V
A
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
S
G
 
D
P
 
E
E
 
S
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
T
V
 
L
E
 
E
R
 
H
T
 
I
L
 
Q
A
 
Q
A
 
H
H
 
L
G
 
G
R
 
Q
I
 
P
D
 
L
I
 
I
L
 
V
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
E
 
R
P
 
D
G
 
N
G
 
L
P
 
L
V
 
V
E
 
R
T
 
M
S
 
K
E
 
D
E
 
D
S
 
E
W
 
W
R
 
F
R
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
N
T
 
T
D
 
N
L
 
L
T
 
N
G
 
S
V
 
L
F
 
Y
L
 
R
T
 
L
C
 
S
K
 
K
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
V
 
G
M
 
M
V
 
T
A
 
K
Q
 
A
R
 
R
S
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
I
 
A
R
 
M
W
 
G
A
 
N
Y
 
A
P
 
G
Y
 
Q
I
 
T
G
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
N
 
E
Q
 
G
F
 
F
T
 
T
V
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
V
A
 
G
R
 
S
D
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
A
P
|
P
G
|
G
L
x
F
I
|
I
D
 
D
T
|
T
P
 
D
M
|
M
A
x
T
R
 
R
S
 
E
Q
 
L
I
 
P
A
 
E
A
 
A
H
 
Q
Y
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
R
R
 
E
A
 
A
R
 
L
D
 
L
A
 
G
L
 
Q
C
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
W
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
K
A
 
V
S
 
V
V
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
G
A
 
A
R
 
A
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
C
 
T
L
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
Y
L
 
M

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
41% identity, 95% coverage: 9:261/267 of query aligns to 3:247/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
L
 
L
A
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
T
G
|
G
A
 
G
G
 
A
S
 
A
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
|
G
N
x
I
G
 
G
K
 
R
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
Y
 
F
A
 
A
R
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
V
V
 
A
D
|
D
K
x
L
V
 
D
T
 
S
E
 
A
A
 
G
A
 
G
E
 
E
E
 
G
T
 
T
A
 
V
A
 
E
L
 
A
I
 
I
A
 
R
A
 
Q
E
 
A
G
 
G
F
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
F
V
 
I
T
 
R
A
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
R
G
 
D
P
 
A
E
 
E
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
G
T
 
C
L
 
A
A
 
A
A
 
A
H
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
Y
L
 
A
H
 
F
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
 
I
-
 
E
T
 
I
E
 
E
P
 
Q
G
 
G
G
 
K
P
 
L
V
 
A
E
 
D
T
 
G
S
 
N
E
 
E
E
 
A
S
 
E
W
 
F
R
 
D
R
 
A
V
 
I
L
 
M
D
 
A
T
 
V
D
 
N
L
 
V
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
W
L
 
L
T
 
C
C
 
M
K
 
K
Q
 
H
V
 
Q
L
 
I
P
 
P
V
 
L
M
 
M
V
 
L
A
 
A
Q
 
Q
R
 
G
S
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
I
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
L
R
 
G
W
 
A
A
 
A
Y
 
P
P
 
K
Y
 
M
I
 
S
G
 
I
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
H
G
 
A
V
 
V
N
 
I
Q
 
G
F
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
S
V
 
A
A
 
A
R
 
I
Q
 
E
H
 
Y
A
 
A
R
 
K
D
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
C
P
 
P
G
x
A
L
x
V
I
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
D
M
 
M
A
 
F
R
 
R
S
 
R
Q
 
A
I
 
Y
A
 
E
A
 
A
H
 
D
Y
 
P
K
 
R
D
 
K
A
 
A
G
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
E
A
 
F
R
 
A
D
 
A
A
 
A
L
 
M
C
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
F
 
R
Q
 
V
G
 
G
T
 
R
A
 
V
W
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
V
V
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
D
E
 
N
A
 
A
R
 
G
Y
 
F
I
 
T
T
 
T
G
 
G
V
 
I
C
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 9:264/267 of query aligns to 4:246/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
A
 
T
G
 
A
K
 
Q
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
T
G
 
G
A
|
A
G
 
S
S
 
R
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
G
N
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
A
V
 
L
A
 
A
Y
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
T
G
 
G
A
 
M
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
V
-
 
N
V
 
Y
D
 
A
K
 
Q
V
 
S
T
 
S
E
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
D
E
 
A
T
 
V
A
 
V
A
 
A
L
 
E
I
 
I
A
 
I
A
 
A
E
 
N
G
 
G
F
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
Q
A
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
R
 
N
G
 
A
P
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
D
A
 
Q
A
 
L
V
 
I
E
 
K
R
 
T
T
 
T
L
 
L
A
 
D
A
 
K
H
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
 
N
V
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
T
E
 
R
P
 
D
G
 
T
G
 
L
P
 
L
V
 
L
E
 
R
T
 
M
S
 
K
E
 
L
E
 
E
S
 
D
W
 
W
R
 
Q
R
 
A
V
 
V
L
 
I
D
 
D
T
 
L
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
T
 
C
C
 
T
K
 
K
Q
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
K
V
 
L
M
 
M
V
 
L
A
 
K
Q
 
Q
R
 
K
S
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
A
A
 
G
I
 
M
R
 
M
W
 
G
A
 
N
Y
x
P
P
 
G
Y
 
Q
I
 
A
G
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
G
F
 
F
T
 
T
V
 
K
A
 
T
V
 
V
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
H
 
L
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
M
 
A
P
 
P
G
 
G
L
x
F
I
 
I
D
 
A
T
 
T
P
 
D
M
 
M
A
 
T
R
 
E
S
 
N
Q
 
L
I
x
N
A
 
A
A
 
E
H
 
P
Y
 
I
K
 
L
D
 
Q
A
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
F
C
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
F
 
R
Q
 
Y
G
 
G
T
 
Q
A
 
P
W
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
T
S
 
I
V
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
T
D
 
D
E
 
P
-
 
A
A
 
A
R
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
C
 
T
L
 
F
P
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
V
L
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:264/267 of query aligns to 5:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
R
 
N
L
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
F
 
T
G
|
G
A
 
A
G
x
S
S
x
R
S
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
W
 
-
G
 
G
N
x
I
G
 
G
K
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
V
 
E
A
 
L
Y
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
T
D
 
A
K
x
T
V
 
S
T
 
E
E
 
S
A
 
G
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
T
 
I
A
 
S
A
 
D
L
 
Y
I
 
L
A
 
G
A
 
D
E
 
N
G
 
G
F
 
K
A
 
G
-
 
M
A
 
A
L
 
L
A
x
N
V
|
V
T
 
T
A
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
N
P
 
P
E
 
E
V
 
S
A
 
I
A
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
L
R
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
T
-
 
D
A
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
H
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
I
|
I
T
 
T
E
 
R
P
 
D
G
 
N
G
 
L
P
 
L
V
 
M
E
 
R
T
 
M
S
 
K
E
 
E
E
 
E
S
 
E
W
 
W
R
 
S
R
 
D
V
 
I
L
 
M
D
 
E
T
 
T
D
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
T
 
L
C
 
S
K
 
K
Q
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
R
V
 
G
M
 
M
V
 
M
A
 
K
Q
 
K
R
 
R
S
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
A
 
V
A
 
G
I
 
T
R
 
M
W
 
G
A
 
N
Y
 
A
P
 
G
Y
 
Q
I
 
A
G
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
I
Q
 
G
F
 
F
T
 
T
V
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
H
 
V
A
 
A
R
 
S
D
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
A
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
M
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
F
I
|
I
D
 
E
T
|
T
P
 
D
M
|
M
A
 
T
R
 
K
S
 
A
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
L
K
 
N
D
 
D
A
 
-
G
 
-
E
 
E
M
 
Q
R
 
R
R
 
T
A
 
A
R
 
T
D
 
L
A
 
A
L
 
Q
C
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
F
 
R
Q
 
L
G
 
G
T
 
D
A
 
P
W
 
R
D
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
A
S
 
V
V
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
E
A
 
A
R
 
A
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
C
 
T
L
 
L
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
S
 
Y
L
 
M

Query Sequence

>AZOBR_RS25420 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS25420
MSEAKAGRLAGKVALVFGAGSSAPGWGNGKATAVAYAREGARVVAVDKVTEAAEETAALI
AAEGFAALAVTADVTRGPEVAAAVERTLAAHGRIDILHNNVGITEPGGPVETSEESWRRV
LDTDLTGVFLTCKQVLPVMVAQRSGAIVNISSIAAIRWAYPYIGYAAAKAGVNQFTVAVA
RQHARDGIRANAVMPGLIDTPMARSQIAAHYKDAGEMRRARDALCPLGFQGTAWDIAAAS
VFLASDEARYITGVCLPVDGGLSLGIG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory