SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS26680 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS26680 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
31% identity, 93% coverage: 10:293/306 of query aligns to 8:292/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
I
 
V
L
 
L
P
 
T
A
 
A
T
 
M
P
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
K
A
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
S
I
 
V
D
 
N
V
 
Y
A
 
A
A
 
V
S
 
A
K
 
A
A
 
E
L
 
L
F
 
A
S
 
A
W
 
H
L
 
L
N
 
V
R
 
D
Q
 
N
G
 
G
I
 
T
D
 
D
G
 
T
V
 
L
V
 
V
P
 
V
L
 
C
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
x
S
G
 
P
A
 
T
L
|
L
A
 
S
R
 
W
A
 
D
E
 
E
R
x
E
N
 
Y
R
 
N
F
 
L
A
 
F
A
 
V
L
x
E
T
 
V
V
 
L
E
x
Q
A
 
T
M
 
V
D
 
A
G
 
G
K
 
K
K
 
A
P
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
C
L
 
G
D
 
S
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
T
R
 
Q
D
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
H
G
 
G
L
 
T
L
 
L
V
 
Q
L
 
V
T
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
F
L
 
Q
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
Q
E
 
A
S
 
C
P
 
P
-
 
D
V
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
L
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
Q
A
 
N
V
 
L
D
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
V
H
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
E
H
 
I
E
 
D
R
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
V
K
|
K
A
 
E
C
 
A
N
 
S
T
 
G
D
 
N
M
 
L
Y
 
D
H
 
Q
F
 
A
L
 
G
R
 
E
T
 
I
M
 
R
A
 
R
G
 
S
L
 
T
D
 
P
P
 
K
S
 
E
F
 
F
A
 
Q
M
 
I
L
 
Y
S
 
A
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
S
L
 
L
-
 
T
F
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
-
V
 
L
A
 
A
A
 
I
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
V
I
x
V
V
 
S
V
 
V
T
 
A
A
 
S
N
 
H
L
 
L
L
 
V
P
 
G
R
 
N
A
 
Q
W
 
L
R
 
Q
L
 
Q
V
 
M
F
 
I
D
 
Q
L
 
A
A
 
F
S
 
N
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
T
 
V
A
 
T
E
 
V
A
 
A
L
 
S
E
 
D
V
 
I
H
 
H
R
 
L
T
 
R
L
 
L
I
 
L
P
 
P
M
 
L
M
 
F
N
 
K
L
 
A
A
 
L
F
 
F
A
 
I
E
 
T
T
 
T
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
I
K
 
K
S
 
Q
V
 
A
M
 
L
G
 
K
L
 
L
I
 
Q
G
 
G
V
 
W
N
 
E
A
 
V
P
 
G
A
 
S
M
 
T
L
 
R
P
 
P
P
 
P
L
 
L
R
 
S
E
 
D
P
 
A
R
 
D
P
 
A
E
 
E
L
 
V
R
 
S
E
 
Q
A
 
K
L
 
L
K
 
E
S
 
A
E
 
V
L
 
M
S
 
K
R
 
H
L
 
L

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
31% identity, 88% coverage: 7:275/306 of query aligns to 2:273/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
L
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
G
P
 
T
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
-
A
 
K
D
 
N
G
 
G
T
 
E
I
 
L
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
S
S
 
Y
K
 
E
A
 
R
L
 
L
F
 
V
S
 
R
W
 
Y
L
 
Q
N
 
L
R
 
E
Q
 
N
G
 
G
I
 
V
D
 
N
G
 
A
V
 
L
V
 
I
P
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
 
P
A
 
T
L
 
V
A
 
N
R
 
E
A
 
D
E
 
E
R
 
R
N
 
E
R
 
K
F
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
I
M
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
K
K
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
G
D
 
T
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
E
D
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
L
G
 
V
R
 
K
D
 
Q
F
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
Y
Y
 
I
A
 
S
D
 
E
E
 
R
S
 
T
P
 
D
V
 
L
P
 
G
I
 
I
L
 
V
I
 
V
Y
 
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
N
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
A
H
 
A
E
 
R
L
 
I
S
 
A
R
 
A
H
 
D
-
 
L
E
 
K
R
 
N
I
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
 
K
A
 
E
C
 
A
N
 
N
T
 
P
D
|
D
M
x
I
Y
x
D
H
 
Q
F
 
I
L
 
D
R
 
R
T
 
T
M
 
V
A
 
S
G
 
L
L
 
T
D
 
K
P
 
Q
S
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
D
F
 
F
A
 
M
M
 
V
L
 
W
S
 
S
G
 
G
E
 
N
D
 
D
T
 
D
L
 
R
F
 
T
P
 
F
L
 
Y
H
 
L
V
 
L
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
D
G
 
G
G
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
V
T
 
V
A
 
S
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
Q
W
 
M
R
 
V
L
 
E
V
 
L
F
 
C
D
 
A
L
 
E
A
 
Y
S
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
N
T
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
S
L
 
R
E
 
E
V
 
V
H
 
H
R
 
R
T
 
K
L
 
L
I
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
M
N
 
K
L
 
A
A
 
L
F
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
T
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
A
M
 
L
G
 
N
L
 
L
I
 
M
G
 
G
V
 
F
N
 
I
A
 
E
P
 
N
A
 
E
M
 
L
L
 
R
P
 
L
P
 
P
L
 
L

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
35% identity, 80% coverage: 7:251/306 of query aligns to 2:247/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
L
 
F
R
 
K
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
A
T
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
T
A
 
D
D
 
N
G
 
G
T
 
S
I
 
V
D
 
D
V
 
E
A
 
K
A
 
A
S
 
F
K
 
A
A
 
A
L
 
H
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
Q
N
 
I
R
 
A
Q
 
E
G
 
G
I
 
S
D
 
N
G
 
G
V
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
G
 
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
x
P
A
 
T
L
 
L
A
 
S
R
 
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
N
 
K
R
 
R
F
 
V
A
 
V
A
 
E
L
 
L
T
 
C
V
 
I
E
 
E
A
 
V
M
 
A
D
 
A
G
 
K
K
 
R
K
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
G
D
 
S
T
x
N
G
 
N
Y
 
T
H
 
D
D
x
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
L
G
 
A
R
 
L
D
 
H
F
 
A
A
 
Q
A
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
F
D
 
A
Y
 
H
F
 
F
L
 
S
R
 
A
Y
 
V
A
 
A
D
 
E
E
 
A
S
 
V
P
 
K
V
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
V
I
 
I
Y
 
Y
E
 
N
I
 
I
P
 
P
Y
 
P
R
 
R
T
 
S
R
 
V
I
 
V
A
 
D
V
 
M
D
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
M
H
 
G
E
 
A
L
 
L
S
 
V
R
 
K
-
 
A
H
 
H
E
 
K
R
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
V
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
K
M
 
L
Y
 
D
H
 
R
F
 
V
L
 
S
R
 
E
T
 
Q
M
 
R
A
 
I
G
 
S
L
 
C
D
 
G
P
 
K
S
 
D
F
 
F
A
 
V
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
G
L
 
T
F
 
A
P
 
L
L
 
G
H
 
F
V
 
N
A
 
A
A
 
H
G
 
G
A
 
G
K
 
V
G
 
G
G
 
C
I
 
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
L
W
 
C
R
 
S
L
 
E
V
 
F
F
 
Q
D
 
A
L
 
A
A
 
M
S
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
D
T
 
Y
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
H
 
Q
R
 
D
T
 
R
L
 
L
I
 
M
P
 
P
M
 
L
M
 
H
N
 
R
L
 
A
A
 
I
F
 
F
A
 
M
E
 
E

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
31% identity, 88% coverage: 7:275/306 of query aligns to 3:274/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
L
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
V
L
 
G
P
 
T
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
-
A
 
K
D
 
N
G
 
G
T
 
E
I
 
L
D
 
D
V
 
L
A
 
E
A
 
S
S
 
Y
K
 
E
A
 
R
L
 
L
F
 
V
S
 
R
W
 
Y
L
 
Q
N
 
L
R
 
E
Q
 
N
G
 
G
I
 
V
D
 
N
G
 
A
V
 
L
V
 
I
P
 
V
L
 
L
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
 
P
A
 
T
L
 
V
A
 
N
R
 
E
A
 
D
E
 
E
R
 
R
N
 
E
R
 
K
F
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
L
E
|
E
A
 
I
M
 
V
D
|
D
G
 
G
K
 
K
K
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
V
G
 
G
V
 
A
L
 
G
D
 
T
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
E
D
 
K
A
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
L
G
 
V
R
 
K
D
 
Q
F
 
A
A
 
E
A
 
K
A
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
Y
Y
 
I
A
 
S
D
 
E
E
 
R
S
 
T
P
 
D
V
 
L
P
 
G
I
 
I
L
 
V
I
 
V
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
N
V
 
V
D
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
A
H
 
A
E
 
R
L
 
I
S
 
A
R
 
A
H
 
D
-
 
L
E
 
K
R
 
N
I
 
V
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
E
C
 
A
N
 
N
T
 
P
D
 
D
M
 
I
Y
 
D
H
 
Q
F
 
I
L
 
D
R
 
R
T
 
T
M
 
V
A
 
S
G
 
L
L
 
T
D
 
K
P
 
Q
S
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
D
F
 
F
A
 
M
M
 
V
L
 
W
S
 
S
G
 
G
E
 
N
D
 
D
T
 
D
L
 
R
F
 
T
P
 
F
L
 
Y
H
 
L
V
 
L
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
D
G
 
G
G
 
V
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
V
A
 
S
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
Q
W
 
M
R
 
V
L
 
E
V
 
L
F
 
C
D
 
A
L
 
E
A
 
Y
S
 
F
S
 
S
G
 
G
K
 
N
T
 
L
A
 
E
E
 
K
A
 
S
L
 
R
E
 
E
V
 
V
H
 
H
R
 
R
T
 
K
L
 
L
I
 
R
P
 
P
M
 
L
M
 
M
N
 
K
L
 
A
A
 
L
F
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
T
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
A
V
 
A
M
 
L
G
 
N
L
 
L
I
 
M
G
 
G
V
 
F
N
 
I
A
 
E
P
 
N
A
 
E
M
 
L
L
 
R
P
 
L
P
 
P
L
 
L

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
35% identity, 80% coverage: 7:251/306 of query aligns to 2:247/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
L
 
F
R
 
K
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
A
T
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
T
A
 
D
D
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
V
D
 
D
V
 
E
A
 
Q
A
 
A
S
 
F
K
 
A
A
 
A
L
 
H
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
Q
N
 
I
R
 
A
Q
 
E
G
 
G
I
 
S
D
 
N
G
 
G
V
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
x
S
G
x
P
A
 
T
L
|
L
A
 
S
R
 
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
N
 
K
R
 
R
F
 
V
A
 
V
A
 
E
L
 
L
T
 
C
V
 
I
E
 
E
A
 
V
M
 
A
D
 
A
G
 
K
K
 
R
K
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
G
D
 
S
T
x
N
G
 
N
Y
 
T
H
 
D
D
x
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
L
G
 
A
R
 
L
D
 
H
F
 
A
A
 
Q
A
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
I
 
L
R
 
F
D
 
A
Y
 
H
F
 
F
L
 
S
R
 
A
Y
 
V
A
 
A
D
 
E
E
 
A
S
 
V
P
 
K
V
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
V
I
 
I
Y
|
Y
E
 
N
I
 
I
P
 
P
Y
 
P
R
|
R
T
 
S
R
 
V
I
 
V
A
 
D
V
 
M
D
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
M
H
 
G
E
 
A
L
 
L
S
 
V
R
 
K
-
 
A
H
 
H
E
 
K
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
V
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
K
M
 
L
Y
 
D
H
 
R
F
 
V
L
 
S
R
 
E
T
 
Q
M
 
R
A
 
I
G
 
S
L
 
C
D
 
G
P
 
K
S
 
D
F
 
F
A
 
I
M
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
S
L
 
T
F
 
A
P
 
L
L
 
G
H
 
F
V
 
N
A
 
A
A
 
H
G
 
G
A
 
G
K
 
V
G
 
G
G
 
C
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
S
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
R
A
 
L
W
 
C
R
 
S
L
 
E
V
 
F
F
 
Q
D
 
A
L
 
A
A
 
M
S
 
L
S
 
A
G
 
G
K
 
D
T
 
Y
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
Y
H
 
Q
R
 
D
T
 
R
L
 
L
I
 
M
P
 
P
M
 
L
M
 
H
N
 
R
L
 
A
A
 
I
F
 
F
A
 
M
E
 
E

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
30% identity, 91% coverage: 9:287/306 of query aligns to 4:287/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
D
A
 
E
D
 
K
G
 
G
T
 
N
I
 
V
D
 
C
V
 
R
A
 
A
A
 
S
S
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
F
 
I
S
 
D
W
 
Y
L
 
H
N
 
V
R
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
 
T
D
 
S
G
 
A
V
 
I
V
 
V
P
 
S
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
x
A
A
 
T
L
|
L
A
 
N
R
x
H
A
 
D
E
 
E
R
x
H
N
 
A
R
 
D
F
 
V
A
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
T
V
 
L
E
 
D
A
 
L
M
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
x
N
G
 
A
Y
 
T
H
 
A
D
x
E
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
L
G
 
T
R
 
Q
D
 
R
F
 
F
A
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
V
G
 
G
L
 
C
L
 
L
V
 
T
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
F
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
H
S
 
T
P
 
D
V
 
L
P
 
P
I
 
Q
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
S
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
C
A
 
D
V
 
L
D
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
V
H
 
G
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
K
H
 
V
E
 
K
R
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
E
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
N
M
 
L
Y
 
T
H
 
R
F
 
V
L
 
N
R
 
Q
T
 
I
M
 
K
A
 
E
G
 
L
L
 
V
D
 
S
P
 
D
S
 
D
F
 
F
A
 
V
M
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
A
L
 
S
F
 
A
P
 
L
L
 
D
H
 
F
V
 
M
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
G
 
V
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
A
R
 
R
A
 
D
W
 
M
R
 
A
L
 
Q
V
 
M
F
 
C
D
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
H
T
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
V
V
 
I
H
 
N
R
 
Q
T
 
R
L
 
L
I
 
M
P
 
P
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
K
A
 
L
F
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
M
 
C
G
 
K
L
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
L
N
 
V
A
 
A
P
 
T
A
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
P
M
 
M
L
 
T
P
 
P
P
 
I
L
 
T
R
 
D
E
 
S
P
 
G
R
 
R
P
 
E
E
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
30% identity, 91% coverage: 9:287/306 of query aligns to 4:287/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
D
A
 
E
D
 
K
G
 
G
T
 
N
I
 
V
D
 
C
V
 
R
A
 
A
A
 
S
S
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
F
 
I
S
 
D
W
 
Y
L
 
H
N
 
V
R
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
 
T
D
 
S
G
 
A
V
 
I
V
 
V
P
 
S
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
N
R
 
H
A
 
D
E
 
E
R
 
H
N
 
A
R
 
D
F
 
V
A
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
T
V
 
L
E
 
D
A
 
L
M
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
 
N
G
 
A
Y
 
T
H
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
L
G
 
T
R
 
Q
D
 
R
F
 
F
A
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
V
G
 
G
L
 
C
L
 
L
V
 
T
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
F
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
H
S
 
T
P
 
D
V
 
L
P
 
P
I
 
Q
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
S
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
C
A
 
D
V
 
L
D
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
V
H
 
G
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
K
H
 
V
E
 
K
R
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
E
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
N
M
 
L
Y
 
T
H
 
R
F
 
V
L
 
N
R
 
Q
T
 
I
M
 
K
A
 
E
G
 
L
L
 
V
D
 
S
P
 
D
S
 
D
F
 
F
A
 
V
M
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
A
L
 
S
F
 
A
P
 
L
L
 
D
H
 
F
V
 
M
A
 
Q
A
x
L
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
G
 
V
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
A
R
 
R
A
 
D
W
 
M
R
 
A
L
 
Q
V
 
M
F
 
C
D
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
H
T
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
V
V
 
I
H
 
N
R
 
Q
T
 
R
L
 
L
I
 
M
P
 
P
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
K
A
 
L
F
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
M
 
C
G
 
K
L
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
L
N
 
V
A
 
A
P
 
T
A
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
P
M
 
M
L
 
T
P
 
P
P
 
I
L
 
T
R
 
D
E
 
S
P
 
G
R
 
R
P
 
E
E
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K

5t25A Kinetic, spectral and structural characterization of the slow binding inhibitor acetopyruvate with dihydrodipicolinate synthase from escherichia coli.
30% identity, 91% coverage: 9:287/306 of query aligns to 5:288/293 of 5t25A

query
sites
5t25A
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
D
A
 
E
D
 
K
G
 
G
T
 
N
I
 
V
D
 
C
V
 
R
A
 
A
A
 
S
S
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
F
 
I
S
 
D
W
 
Y
L
 
H
N
 
V
R
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
 
T
D
 
S
G
 
A
V
 
I
V
 
V
P
 
S
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
x
A
A
 
T
L
|
L
A
 
N
R
x
H
A
 
D
E
 
E
R
 
H
N
 
A
R
 
D
F
 
V
A
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
T
V
 
L
E
 
D
A
 
L
M
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
x
N
G
 
A
Y
 
T
H
 
A
D
x
E
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
L
G
 
T
R
 
Q
D
 
R
F
 
F
A
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
V
G
 
G
L
 
C
L
 
L
V
 
T
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
F
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
H
S
 
T
P
 
D
V
 
L
P
 
P
I
 
Q
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
S
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
C
A
 
D
V
 
L
D
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
V
H
 
G
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
K
H
 
V
E
 
K
R
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
E
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
N
M
 
L
Y
 
T
H
 
R
F
 
V
L
 
N
R
 
Q
T
 
I
M
 
K
A
 
E
G
 
L
L
 
V
D
 
S
P
 
D
S
 
D
F
 
F
A
 
V
M
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
A
L
 
S
F
 
A
P
 
L
L
 
D
H
 
F
V
 
M
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
G
 
V
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
A
R
 
R
A
 
D
W
 
M
R
 
A
L
 
Q
V
 
M
F
 
C
D
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
H
T
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
V
V
 
I
H
 
N
R
 
Q
T
 
R
L
 
L
I
 
M
P
 
P
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
K
A
 
L
F
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
M
 
C
G
 
K
L
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
L
N
 
V
A
 
A
P
 
T
A
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
P
M
 
M
L
 
T
P
 
P
P
 
I
L
 
T
R
 
D
E
 
S
P
 
G
R
 
R
P
 
E
E
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K

3i7sA Dihydrodipicolinate synthase mutant - k161a - with the substrate pyruvate bound in the active site. (see paper)
30% identity, 91% coverage: 9:287/306 of query aligns to 4:287/292 of 3i7sA

query
sites
3i7sA
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
|
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
D
A
 
E
D
 
K
G
 
G
T
 
N
I
 
V
D
 
C
V
 
R
A
 
A
A
 
S
S
 
L
K
 
K
A
 
K
L
 
L
F
 
I
S
 
D
W
 
Y
L
 
H
N
 
V
R
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
 
T
D
 
S
G
 
A
V
 
I
V
 
V
P
 
S
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
N
R
 
H
A
 
D
E
 
E
R
 
H
N
 
A
R
 
D
F
 
V
A
 
V
A
 
M
L
 
M
T
 
T
V
 
L
E
 
D
A
 
L
M
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
 
N
G
 
A
Y
 
T
H
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
S
A
 
L
G
 
T
R
 
Q
D
 
R
F
 
F
A
 
N
A
 
D
A
 
S
G
 
G
V
 
I
D
 
V
G
 
G
L
 
C
L
 
L
V
 
T
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
R
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
F
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
H
S
 
T
P
 
D
V
 
L
P
 
P
I
 
Q
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
S
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
C
A
 
D
V
 
L
D
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
T
L
 
V
H
 
G
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
K
H
 
V
E
 
K
R
 
N
I
 
I
V
 
I
G
 
G
M
 
I
K
x
R
A
 
E
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
N
M
 
L
Y
 
T
H
 
R
F
 
V
L
 
N
R
 
Q
T
 
I
M
 
K
A
 
E
G
 
L
L
 
V
D
 
S
P
 
D
S
 
D
F
 
F
A
 
V
M
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
A
L
 
S
F
 
A
P
 
L
L
 
D
H
 
F
V
 
M
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
G
 
V
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
A
R
 
R
A
 
D
W
 
M
R
 
A
L
 
Q
V
 
M
F
 
C
D
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
A
S
 
E
G
 
G
K
 
H
T
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
R
E
 
V
V
 
I
H
 
N
R
 
Q
T
 
R
L
 
L
I
 
M
P
 
P
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
K
A
 
L
F
 
F
A
 
V
E
 
E
T
 
P
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
M
 
C
G
 
K
L
 
E
I
 
L
G
 
G
V
 
L
N
 
V
A
 
A
P
 
T
A
 
D
-
 
T
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
P
M
 
M
L
 
T
P
 
P
P
 
I
L
 
T
R
 
D
E
 
S
P
 
G
R
 
R
P
 
E
E
 
T
L
 
V
R
 
R
E
 
A
A
 
A
L
 
L
K
 
K

1xxxA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
35% identity, 79% coverage: 4:246/306 of query aligns to 5:245/296 of 1xxxA

query
sites
1xxxA
A
 
A
T
 
A
K
 
R
L
 
L
R
 
G
G
 
T
I
 
L
L
 
L
P
 
T
A
 
A
T
 
M
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
T
A
 
A
A
 
T
S
 
A
K
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
A
S
 
N
W
 
H
L
 
L
N
 
V
R
 
D
Q
 
Q
G
 
G
I
 
C
D
 
D
G
 
G
V
 
L
V
 
V
P
 
V
L
 
S
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
 
P
A
 
T
L
 
T
A
 
T
R
 
D
A
 
G
E
 
E
R
 
K
N
 
I
R
 
E
F
 
L
A
 
L
A
 
R
L
 
A
T
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
V
D
 
G
G
 
D
K
 
R
K
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
T
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
G
 
A
Y
 
H
H
 
S
D
 
I
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
-
G
 
-
R
 
K
D
 
A
F
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
S
N
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
D
 
A
Y
 
H
F
 
F
L
 
T
R
 
A
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
A
S
 
T
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
M
L
 
L
I
 
L
Y
|
Y
E
 
D
I
 
I
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
S
R
 
A
I
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
E
P
 
P
E
 
D
V
 
T
L
 
I
H
 
R
E
 
A
L
 
L
S
x
A
R
 
S
H
|
H
E
 
P
R
 
N
I
|
I
V
 
V
G
 
G
M
 
V
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
K
T
 
A
D
 
D
M
 
L
Y
 
H
H
 
S
F
 
G
L
 
A
R
 
Q
T
 
I
M
 
M
A
 
A
G
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
T
S
 
G
F
 
L
A
 
A
M
 
Y
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
A
L
 
L
F
 
N
P
 
L
L
 
P
H
 
W
V
 
L
A
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
T
G
 
G
G
 
F
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
I
A
 
A
N
 
H
L
 
L
L
 
A
P
 
A
R
 
G
A
 
Q
W
 
L
R
 
R
L
 
E
V
 
L
F
 
L
D
 
S
L
 
A
A
 
F
S
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
D
T
 
I
A
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
K
V
 
I
H
 
N
R
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
A
P
 
P
M
 
L
M
 
C
N
 
N

5j5dA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with alpha-ketopimelic acid (see paper)
35% identity, 79% coverage: 4:246/306 of query aligns to 6:246/297 of 5j5dA

query
sites
5j5dA
A
 
A
T
 
A
K
 
R
L
 
L
R
 
G
G
 
T
I
 
L
L
 
L
P
 
T
A
|
A
T
 
M
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
T
A
 
A
A
 
T
S
 
A
K
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
A
S
 
N
W
 
H
L
 
L
N
 
V
R
 
D
Q
 
Q
G
 
G
I
 
C
D
 
D
G
 
G
V
 
L
V
 
V
P
 
V
L
 
S
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
 
P
A
 
T
L
 
T
A
 
T
R
 
D
A
 
G
E
 
E
R
 
K
N
 
I
R
 
E
F
 
L
A
 
L
A
 
R
L
 
A
T
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
V
D
 
G
G
 
D
K
 
R
K
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
T
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
G
 
A
Y
 
H
H
 
S
D
 
I
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
-
G
 
-
R
 
K
D
 
A
F
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
S
N
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
D
 
A
Y
 
H
F
 
F
L
 
T
R
 
A
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
A
S
 
T
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
M
L
 
L
I
 
L
Y
|
Y
E
 
D
I
 
I
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
S
R
 
A
I
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
E
P
 
P
E
 
D
V
 
T
L
 
I
H
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
S
H
 
H
E
 
P
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
V
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
K
T
 
A
D
 
D
M
 
L
Y
 
H
H
 
S
F
 
G
L
 
A
R
 
Q
T
 
I
M
 
M
A
 
A
G
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
T
S
 
G
F
 
L
A
 
A
M
 
Y
L
 
Y
S
 
S
G
|
G
E
 
D
D
 
D
T
 
A
L
 
L
F
 
N
P
 
L
L
 
P
H
 
W
V
 
L
A
 
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
T
G
 
G
G
 
F
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
I
A
 
A
N
 
H
L
 
L
L
 
A
P
 
A
R
 
G
A
 
Q
W
 
L
R
 
R
L
 
E
V
 
L
F
 
L
D
 
S
L
 
A
A
 
F
S
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
D
T
 
I
A
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
K
V
 
I
H
 
N
R
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
A
P
 
P
M
 
L
M
 
C
N
 
N

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
32% identity, 93% coverage: 7:290/306 of query aligns to 2:285/292 of Q07607

query
sites
Q07607
L
 
F
R
 
E
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
T
A
 
A
T
 
L
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
-
A
 
A
D
 
D
G
 
D
T
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
E
A
 
V
A
 
A
S
 
L
K
 
H
A
 
D
L
 
L
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
Q
N
 
I
R
 
E
Q
 
E
G
 
G
I
 
S
D
 
F
G
 
G
V
 
L
V
 
V
P
 
P
L
 
C
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
 
P
A
 
T
L
 
L
A
 
S
R
 
K
A
 
S
E
 
E
R
 
H
N
 
E
R
 
Q
F
 
V
A
 
V
A
 
E
L
 
I
T
 
T
V
 
I
E
 
K
A
 
T
M
 
A
D
 
N
G
 
G
K
 
R
K
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
G
D
 
S
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
F
G
 
V
R
 
R
D
 
H
F
 
A
A
 
Q
A
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
V
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
F
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
D
D
 
A
E
 
A
S
 
S
P
 
T
V
 
I
P
 
P
I
 
I
L
 
I
I
 
V
Y
 
Y
E
 
N
I
 
I
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
S
R
 
A
I
 
I
A
 
E
V
 
I
D
 
H
P
 
V
E
 
E
V
 
T
L
 
L
H
 
A
E
 
R
L
 
I
S
 
F
R
 
E
H
 
D
-
 
C
E
 
P
R
 
N
I
 
V
V
 
K
G
 
G
M
 
V
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
N
M
 
L
Y
 
L
H
 
R
-
 
P
-
 
S
F
 
L
L
 
E
R
 
R
T
 
M
M
 
A
A
 
C
G
 
G
L
 
E
D
 
D
P
 
-
S
 
-
F
 
F
A
 
N
M
 
L
L
 
L
S
 
T
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
G
L
 
T
F
 
A
P
 
L
L
 
G
H
 
Y
V
 
M
A
 
A
A
 
H
G
 
G
A
 
G
K
 
H
G
 
G
G
 
C
I
 
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
V
L
 
A
P
 
P
R
 
A
A
 
L
W
 
C
R
 
A
L
 
D
V
 
F
F
 
Q
D
 
Q
L
 
A
A
 
C
S
 
L
S
 
N
G
 
G
K
 
D
T
 
F
A
 
A
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
L
H
 
Q
R
 
D
T
 
R
L
 
L
I
 
M
P
 
P
M
 
L
M
 
H
N
 
R
L
 
A
A
 
L
F
 
F
A
 
L
E
 
E
T
 
T
N
 
N
P
 
P
G
 
A
P
 
G
M
 
A
K
 
K
S
 
Y
V
 
A
M
 
L
G
 
Q
L
 
R
I
 
L
G
 
G
V
 
R
N
 
M
A
 
R
P
 
G
A
 
D
M
 
L
L
 
R
P
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
V
E
 
T
P
 
I
R
 
S
P
 
P
E
 
S
L
 
F
R
 
Q
E
 
E
A
 
E
L
 
I
K
 
D
S
 
D
E
 
A
L
 
M

P9WP25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
35% identity, 79% coverage: 4:246/306 of query aligns to 9:249/300 of P9WP25

query
sites
P9WP25
A
 
A
T
 
A
K
 
R
L
 
L
R
 
G
G
 
T
I
 
L
L
 
L
P
 
T
A
 
A
T
 
M
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
S
A
 
G
D
 
D
G
 
G
T
 
S
I
 
L
D
 
D
V
 
T
A
 
A
A
 
T
S
 
A
K
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
A
S
 
N
W
 
H
L
 
L
N
 
V
R
 
D
Q
 
Q
G
 
G
I
 
C
D
 
D
G
 
G
V
 
L
V
 
V
P
 
V
L
 
S
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
S
G
 
P
A
 
T
L
 
T
A
 
T
R
 
D
A
 
G
E
 
E
R
 
K
N
 
I
R
 
E
F
 
L
A
 
L
A
 
R
L
 
A
T
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
V
D
 
G
G
 
D
K
 
R
K
 
A
P
 
R
V
 
V
I
 
I
A
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
G
V
 
T
L
 
Y
D
 
D
T
 
T
G
 
A
Y
 
H
H
 
S
D
 
I
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
-
G
 
-
R
 
K
D
 
A
F
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
T
 
S
N
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
D
 
A
Y
 
H
F
 
F
L
 
T
R
 
A
Y
 
V
A
 
A
D
 
D
E
 
A
S
 
T
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
M
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
E
 
D
I
 
I
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
S
R
 
A
I
 
V
A
 
P
V
 
I
D
 
E
P
 
P
E
 
D
V
 
T
L
 
I
H
 
R
E
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
S
H
 
H
E
 
P
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
V
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
K
T
 
A
D
 
D
M
 
L
Y
 
H
H
 
S
F
 
G
L
 
A
R
 
Q
T
 
I
M
 
M
A
 
A
G
 
-
L
 
-
D
 
D
P
 
T
S
 
G
F
 
L
A
 
A
M
 
Y
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
A
L
 
L
F
 
N
P
 
L
L
 
P
H
 
W
V
 
L
A
|
A
A
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
T
G
 
G
G
 
F
I
 
I
V
 
S
V
 
V
T
 
I
A
 
A
N
 
H
L
 
L
L
 
A
P
 
A
R
 
G
A
 
Q
W
 
L
R
 
R
L
 
E
V
 
L
F
 
L
D
 
S
L
 
A
A
 
F
S
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
D
T
 
I
A
 
A
E
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
K
V
 
I
H
 
N
R
 
I
T
 
A
L
 
V
I
 
A
P
 
P
M
 
L
M
 
C
N
 
N

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
30% identity, 92% coverage: 7:287/306 of query aligns to 2:286/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
W
A
 
K
A
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
H
N
 
I
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
T
D
 
N
G
 
S
V
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
G
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
S
R
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
N
 
T
R
 
Q
F
 
V
A
 
I
A
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
M
 
A
D
 
N
G
 
K
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
L
G
 
T
R
 
K
D
 
A
F
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
L
 
V
T
|
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
A
S
 
V
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
x
N
I
x
V
P
|
P
Y
 
G
R
|
R
T
|
T
R
 
G
I
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
S
P
 
N
E
 
D
V
 
T
L
 
A
H
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
E
H
 
I
E
 
P
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
D
M
 
V
Y
 
P
H
 
R
F
 
G
L
 
K
R
 
A
T
 
L
M
 
I
A
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
G
S
 
K
F
 
M
A
 
A
M
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
E
L
 
T
F
 
A
P
 
W
L
 
E
H
 
L
V
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
N
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
A
W
 
M
R
 
S
L
 
E
V
 
V
F
 
C
D
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
I
S
 
A
G
 
K
K
 
D
T
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
K
E
 
T
V
 
L
H
 
N
R
 
N
T
 
K
L
 
I
I
 
A
P
 
N
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
I
A
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
T
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
V
 
T
N
 
G
A
 
I
P
 
R
A
 
L
M
 
P
L
 
L
P
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
R
 
R
P
 
E
E
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
K

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
30% identity, 92% coverage: 7:287/306 of query aligns to 2:286/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
|
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
W
A
 
K
A
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
H
N
 
I
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
T
D
 
N
G
 
S
V
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
V
G
|
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
G
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
S
R
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
N
 
T
R
 
Q
F
 
V
A
 
I
A
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
M
 
A
D
 
N
G
 
K
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
L
G
 
T
R
 
K
D
 
A
F
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
|
L
V
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
A
S
 
V
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
S
P
 
N
E
 
D
V
 
T
L
 
A
H
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
E
H
 
I
E
 
P
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
D
M
 
V
Y
 
P
H
 
R
F
 
G
L
 
K
R
 
A
T
 
L
M
 
I
A
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
G
S
 
K
F
 
M
A
 
A
M
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
E
L
 
T
F
 
A
P
 
W
L
 
E
H
 
L
V
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
N
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
A
W
 
M
R
 
S
L
 
E
V
 
V
F
 
C
D
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
I
S
 
A
G
 
K
K
 
D
T
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
K
E
 
T
V
 
L
H
 
N
R
 
N
T
 
K
L
 
I
I
 
A
P
 
N
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
I
A
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
T
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
V
 
T
N
 
G
A
 
I
P
 
R
A
 
L
M
 
P
L
 
L
P
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
R
 
R
P
 
E
E
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
K

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
30% identity, 92% coverage: 7:287/306 of query aligns to 2:286/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
|
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
W
A
 
K
A
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
H
N
 
I
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
T
D
 
N
G
 
S
V
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
G
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
S
R
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
N
 
T
R
 
Q
F
 
V
A
 
I
A
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
M
 
A
D
 
N
G
 
K
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
L
G
 
T
R
 
K
D
 
A
F
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
A
S
 
V
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
S
P
 
N
E
 
D
V
 
T
L
 
A
H
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
E
H
 
I
E
 
P
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
D
M
 
V
Y
 
P
H
 
R
F
 
G
L
 
K
R
 
A
T
 
L
M
 
I
A
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
G
S
 
K
F
 
M
A
 
A
M
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
E
L
 
T
F
 
A
P
 
W
L
 
E
H
 
L
V
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
N
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
A
W
 
M
R
 
S
L
 
E
V
 
V
F
 
C
D
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
I
S
 
A
G
 
K
K
 
D
T
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
K
E
 
T
V
 
L
H
 
N
R
 
N
T
 
K
L
 
I
I
 
A
P
 
N
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
I
A
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
T
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
V
 
T
N
 
G
A
 
I
P
 
R
A
 
L
M
 
P
L
 
L
P
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
R
 
R
P
 
E
E
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
K

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
30% identity, 92% coverage: 7:287/306 of query aligns to 2:286/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
W
A
 
K
A
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
H
N
 
I
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
T
D
 
N
G
 
S
V
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
G
x
S
A
 
T
L
|
L
A
 
S
R
 
M
A
 
E
E
 
E
R
x
H
N
 
T
R
 
Q
F
 
V
A
 
I
A
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
M
 
A
D
 
N
G
 
K
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
L
G
 
T
R
 
K
D
 
A
F
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
A
S
 
V
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
S
P
 
N
E
 
D
V
 
T
L
 
A
H
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
E
H
 
I
E
 
P
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
D
M
 
V
Y
 
P
H
 
R
F
 
G
L
 
K
R
 
A
T
 
L
M
 
I
A
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
G
S
 
K
F
 
M
A
 
A
M
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
E
L
 
T
F
 
A
P
 
W
L
 
E
H
 
L
V
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
N
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
A
W
 
M
R
 
S
L
 
E
V
 
V
F
 
C
D
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
I
S
 
A
G
 
K
K
 
D
T
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
K
E
 
T
V
 
L
H
 
N
R
 
N
T
 
K
L
 
I
I
 
A
P
 
N
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
I
A
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
T
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
V
 
T
N
 
G
A
 
I
P
 
R
A
 
L
M
 
P
L
 
L
P
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
R
 
R
P
 
E
E
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
K

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
30% identity, 92% coverage: 7:287/306 of query aligns to 2:286/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
W
A
 
K
A
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
H
N
 
I
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
T
D
 
N
G
 
S
V
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
G
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
S
R
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
N
 
T
R
 
Q
F
 
V
A
 
I
A
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
M
 
A
D
 
N
G
 
K
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
L
G
 
T
R
 
K
D
 
A
F
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
A
S
 
V
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
S
P
 
N
E
 
D
V
 
T
L
 
A
H
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
E
H
 
I
E
 
P
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
D
M
 
V
Y
 
P
H
 
R
F
 
G
L
 
K
R
 
A
T
 
L
M
 
I
A
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
G
S
 
K
F
 
M
A
 
A
M
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
|
G
E
 
D
D
 
D
T
 
E
L
 
T
F
 
A
P
 
W
L
 
E
H
 
L
V
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
N
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
A
W
 
M
R
 
S
L
 
E
V
 
V
F
 
C
D
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
I
S
 
A
G
 
K
K
 
D
T
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
K
E
 
T
V
 
L
H
 
N
R
 
N
T
 
K
L
 
I
I
 
A
P
 
N
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
I
A
 
L
F
|
F
A
 
C
E
 
E
T
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
V
 
T
N
 
G
A
 
I
P
 
R
A
 
L
M
 
P
L
 
L
P
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
R
 
R
P
 
E
E
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
K

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
30% identity, 92% coverage: 7:287/306 of query aligns to 2:286/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
L
 
I
R
 
Q
G
 
G
I
 
S
L
 
I
P
 
V
A
 
A
T
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
V
 
M
T
 
L
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
W
A
 
K
A
 
S
S
 
L
K
 
E
A
 
K
L
 
L
F
 
V
S
 
E
W
 
W
L
 
H
N
 
I
R
 
E
Q
 
Q
G
 
G
I
 
T
D
 
N
G
 
S
V
 
I
V
 
V
P
 
A
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
 
A
G
 
S
A
 
T
L
 
L
A
 
S
R
 
M
A
 
E
E
 
E
R
 
H
N
 
T
R
 
Q
F
 
V
A
 
I
A
 
K
L
 
E
T
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
M
 
A
D
 
N
G
 
K
K
 
R
K
 
I
P
 
P
V
 
I
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
T
L
 
G
D
 
A
T
 
N
G
 
S
Y
 
T
H
 
R
D
 
E
A
 
A
L
 
I
A
 
E
A
 
L
G
 
T
R
 
K
D
 
A
F
 
A
A
 
K
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
Q
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
E
E
 
A
S
 
V
P
 
E
V
 
L
P
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
L
Y
|
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
|
R
T
 
T
R
 
G
I
 
V
A
 
D
V
 
L
D
 
S
P
 
N
E
 
D
V
 
T
L
 
A
H
 
V
E
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
E
H
 
I
E
 
P
R
 
N
I
 
I
V
 
V
G
 
G
M
 
I
K
|
K
A
 
D
C
 
A
N
 
T
T
 
G
D
 
D
M
 
V
Y
 
P
H
 
R
F
 
G
L
 
K
R
 
A
T
 
L
M
 
I
A
 
D
G
 
A
L
 
L
D
 
N
P
 
G
S
 
K
F
 
M
A
 
A
M
 
V
L
 
Y
S
 
S
G
 
G
E
 
D
D
 
D
T
 
E
L
 
T
F
 
A
P
 
W
L
 
E
H
 
L
V
 
M
A
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
D
G
 
G
G
 
N
I
|
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
L
 
I
L
 
A
P
 
P
R
 
K
A
 
A
W
 
M
R
 
S
L
 
E
V
 
V
F
 
C
D
 
A
L
 
V
A
 
A
S
 
I
S
 
A
G
 
K
K
 
D
T
 
E
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
K
E
 
T
V
 
L
H
 
N
R
 
N
T
 
K
L
 
I
I
 
A
P
 
N
M
 
L
M
 
H
N
 
N
L
 
I
A
 
L
F
|
F
A
 
C
E
 
E
T
 
S
N
|
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
V
K
 
K
S
 
W
V
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
E
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
G
 
D
V
 
T
N
 
G
A
 
I
P
 
R
A
 
L
M
 
P
L
 
L
P
 
T
P
 
P
L
 
L
R
 
A
E
 
E
P
 
Q
-
 
Y
R
 
R
P
 
E
E
 
P
L
 
L
R
 
R
E
 
N
A
 
A
L
 
L
K
 
K

7kkdB Dihydrodipicolinate synthase (dhdps) from c.Jejuni, n84a mutant with pyruvate bound in the active site and r,r-bislysine bound at the allosteric site
31% identity, 92% coverage: 2:281/306 of query aligns to 9:289/306 of 7kkdB

query
sites
7kkdB
L
 
M
D
 
D
A
 
K
T
 
N
K
 
I
L
 
I
R
 
I
G
 
G
I
 
A
L
 
M
P
 
T
A
 
A
T
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
V
 
F
T
 
K
A
 
-
D
 
N
G
 
G
T
 
K
I
 
V
D
 
D
V
 
E
A
 
Q
A
 
S
S
 
Y
K
 
A
A
 
R
L
 
L
F
 
I
S
 
K
W
 
R
L
 
Q
N
 
I
R
 
E
Q
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
G
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
L
 
V
G
 
G
G
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
Y
x
S
G
 
A
A
 
T
L
|
L
A
 
T
R
 
H
A
 
E
E
 
E
R
x
H
N
 
R
R
 
T
F
 
C
A
 
I
A
 
E
L
 
I
T
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
T
M
 
C
D
 
K
G
 
G
K
 
T
K
 
K
-
 
V
P
 
K
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
L
 
G
D
 
S
T
 
A
G
 
A
Y
 
T
H
 
H
D
x
E
A
 
A
L
 
V
A
 
G
A
 
L
G
 
A
R
 
K
D
 
F
F
 
A
A
 
K
A
 
E
A
 
H
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
L
V
 
S
L
 
V
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
T
 
N
N
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
I
 
L
R
 
Y
D
 
E
Y
 
H
F
 
Y
L
 
K
R
 
A
Y
 
I
A
 
A
D
 
Q
E
 
S
S
 
V
P
 
D
V
 
I
P
 
P
I
 
V
L
 
L
I
 
L
Y
 
Y
E
 
N
I
 
V
P
 
P
Y
 
G
R
 
R
T
 
T
R
 
G
I
 
C
A
 
E
V
 
I
D
 
S
P
 
T
E
 
D
V
 
T
L
 
I
H
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
F
R
 
R
H
 
D
-
 
C
E
 
E
R
 
N
I
 
I
V
 
Y
G
 
G
M
 
V
K
 
K
A
 
E
C
 
A
N
 
S
T
 
G
D
 
N
M
 
I
Y
 
D
H
 
K
F
 
C
L
 
V
R
 
D
T
 
L
M
 
L
A
 
A
G
 
H
L
 
-
D
 
E
P
 
P
S
 
R
F
 
M
A
 
M
M
 
L
L
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
A
L
 
I
-
 
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
I
H
 
-
V
 
L
A
 
S
A
 
N
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
V
I
 
I
V
 
S
V
 
V
T
 
T
A
 
S
N
 
N
L
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
D
A
 
M
W
 
I
R
 
S
L
 
A
V
 
L
F
 
T
D
 
H
L
 
F
A
 
A
S
 
L
S
 
D
G
 
E
K
 
N
T
 
Y
A
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
K
V
 
I
H
 
N
R
 
D
T
 
E
L
 
L
I
 
Y
P
 
N
M
 
I
M
 
N
N
 
K
L
 
I
A
 
L
F
 
F
A
 
C
E
 
E
T
 
S
N
 
N
P
 
P
G
 
I
P
 
P
M
 
I
K
 
K
S
 
T
V
 
A
M
 
M
G
 
Y
L
 
L
I
 
A
G
 
G
-
 
L
V
 
I
N
 
E
A
 
S
P
 
L
A
 
E
M
 
F
L
 
R
P
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
C
E
 
S
P
 
P
R
 
S
P
 
K
E
 
E

Query Sequence

>AZOBR_RS26680 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS26680
MLDATKLRGILPATPTPVTADGTIDVAASKALFSWLNRQGIDGVVPLGGTGEYGALARAE
RNRFAALTVEAMDGKKPVIAGVLDTGYHDALAAGRDFAAAGVDGLLVLTPYYTNPTQAGI
RDYFLRYADESPVPILIYEIPYRTRIAVDPEVLHELSRHERIVGMKACNTDMYHFLRTMA
GLDPSFAMLSGEDTLFPLHVAAGAKGGIVVTANLLPRAWRLVFDLASSGKTAEALEVHRT
LIPMMNLAFAETNPGPMKSVMGLIGVNAPAMLPPLREPRPELREALKSELSRLLTTYEGL
PAAAVA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory