SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS27005 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS27005 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:257/259 of query aligns to 2:258/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
K
N
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
T
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
T
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
H
 
D
V
 
I
M
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
R
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
E
R
 
K
L
 
V
C
 
R
T
 
A
E
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
S
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
V
V
 
L
Y
 
Y
S
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
|
L
S
 
S
R
 
K
P
 
G
E
 
E
E
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
G
M
 
L
M
 
V
A
 
D
D
 
N
A
 
A
A
 
V
A
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
P
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
A
 
L
V
 
I
H
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
D
 
T
D
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
L
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
R
 
K
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
L
x
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
S
P
 
A
H
 
N
K
|
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
G
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
x
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
I
 
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
A
 
S
Q
 
A
Q
x
L
A
 
A
Q
 
E
V
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
V
P
 
D
E
 
Q
E
 
E
R
 
T
V
 
A
L
 
A
Q
 
R
A
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
S
D
 
E
R
 
K
M
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
T
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
V
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W
T
 
T

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:257/259 of query aligns to 2:258/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
K
N
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
T
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
T
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
H
 
D
V
 
I
M
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
G
D
 
D
R
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
E
R
 
K
L
 
V
C
 
R
T
 
A
E
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
S
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
V
V
 
L
Y
 
Y
S
 
D
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
K
P
 
G
E
 
E
E
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
G
M
 
L
M
 
V
A
 
D
D
 
N
A
 
A
A
 
V
A
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
P
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
A
 
L
V
 
I
H
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
D
 
T
D
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
L
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
R
 
K
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
L
 
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
S
P
 
A
H
 
N
K
 
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
G
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
 
W
V
 
V
L
 
R
T
 
T
P
 
P
I
 
L
I
 
V
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
A
 
S
Q
 
A
Q
x
L
A
 
A
Q
 
E
V
 
K
T
 
N
G
 
G
L
 
V
P
 
D
E
 
Q
E
 
E
R
 
T
V
 
A
L
 
A
Q
 
R
A
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
S
D
 
E
R
 
K
M
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
T
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
V
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
x
W
T
 
T

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
49% identity, 99% coverage: 1:257/259 of query aligns to 2:258/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
K
N
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
T
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
M
A
 
A
R
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
H
 
D
V
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
R
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
E
C
 
R
T
 
S
E
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
Q
 
K
S
 
F
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
A
V
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
P
 
A
E
 
Q
E
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
F
M
 
I
A
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
A
 
P
V
 
I
H
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
V
D
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
L
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
L
x
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
S
P
 
V
H
 
N
K
|
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
N
A
 
A
E
 
G
H
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
I
x
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
A
 
E
Q
 
A
Q
x
I
A
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
I
P
 
D
E
 
I
E
 
E
R
 
A
V
 
A
L
 
A
Q
 
R
A
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
A
D
 
E
R
 
K
M
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
S
 
Q
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
L
P
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W
T
 
T

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
49% identity, 99% coverage: 1:257/259 of query aligns to 2:258/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
K
N
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
M
A
 
A
R
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
H
 
D
V
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
R
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
E
C
 
R
T
 
S
E
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
Q
 
K
S
 
F
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
A
V
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
G
 
N
A
|
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
P
 
A
E
 
Q
E
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
F
M
 
I
A
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
A
 
P
V
 
I
H
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
V
D
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
L
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
L
x
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
S
P
 
V
H
 
N
K
|
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
N
A
 
A
E
 
G
H
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
I
x
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
A
 
E
Q
 
A
Q
x
I
A
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
I
P
 
D
E
 
I
E
 
E
R
 
A
V
 
A
L
 
A
Q
 
R
A
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
A
D
 
E
R
 
K
M
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
S
 
Q
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
L
P
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
x
W
T
 
T

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
49% identity, 99% coverage: 1:257/259 of query aligns to 2:258/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
K
N
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
T
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
M
A
 
A
R
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
H
 
D
V
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
R
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
E
C
 
R
T
 
S
E
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
Q
 
K
S
 
F
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
A
V
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
P
 
A
E
 
Q
E
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
F
M
 
I
A
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
A
 
P
V
 
I
H
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
V
D
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
L
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
L
x
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
S
P
 
V
H
 
N
K
|
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
N
A
 
A
E
 
G
H
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
I
x
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
A
 
E
Q
 
A
Q
x
I
A
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
I
P
 
D
E
 
I
E
 
E
R
 
A
V
 
A
L
 
A
Q
 
R
A
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
A
D
 
E
R
 
K
M
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
S
 
Q
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
L
P
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
x
W
T
 
T

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
49% identity, 99% coverage: 1:257/259 of query aligns to 2:258/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
K
N
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
T
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
M
A
 
A
R
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
H
 
D
V
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
Q
R
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
R
L
 
E
C
 
R
T
 
S
E
 
T
I
 
L
A
 
E
A
 
S
Q
 
K
S
 
F
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
A
V
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
G
 
N
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
P
 
A
E
 
Q
E
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
D
M
 
F
M
 
I
A
 
A
D
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
Q
|
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
A
 
P
V
 
I
H
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
V
D
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
L
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
L
x
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
S
P
 
V
H
 
N
K
|
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
N
A
 
A
E
 
G
H
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
I
x
L
I
x
V
E
 
E
K
 
K
Q
|
Q
I
 
I
A
 
E
Q
 
A
Q
x
I
A
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
T
 
K
G
 
G
L
 
I
P
 
D
E
 
I
E
 
E
R
 
A
V
 
A
L
 
A
Q
 
R
A
 
E
V
 
L
F
 
L
L
 
A
D
 
E
R
 
K
M
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
A
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
D
S
 
Q
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
L
P
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W
T
 
T

1x1tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas fragi complexed with NAD+ (see paper)
48% identity, 99% coverage: 1:257/259 of query aligns to 2:234/236 of 1x1tA

query
sites
1x1tA
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
K
N
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
T
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
H
 
D
V
 
I
M
 
V
L
 
L
N
 
N
G
|
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
R
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
I
D
 
E
R
 
K
L
 
V
C
 
R
T
 
A
E
 
G
I
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
S
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
V
V
 
L
Y
 
Y
S
 
D
G
 
G
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
K
P
 
G
E
 
E
E
 
A
A
 
V
R
 
R
A
 
G
M
 
L
M
 
V
A
 
D
D
 
N
A
 
A
A
 
V
A
 
R
A
 
Q
L
 
M
G
 
G
P
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
T
A
 
A
A
 
L
V
 
I
H
 
E
E
 
D
F
 
F
P
 
P
D
 
T
D
 
E
K
 
K
W
 
W
D
 
D
L
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
K
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
M
 
M
R
 
K
E
 
K
R
 
Q
R
 
G
W
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
L
x
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
S
P
 
A
H
 
N
K
 
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
G
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
A
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
T
x
W
V
|
V
L
 
R
T
|
T
P
 
L
I
 
L
I
 
S
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
-
P
 
P
T
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
G
A
 
T
I
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
T
A
 
T
I
 
V
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
x
W
T
 
T

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
47% identity, 99% coverage: 1:256/259 of query aligns to 2:252/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
M
 
L
R
 
T
N
 
G
R
 
K
N
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
E
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
H
 
T
V
 
L
M
 
I
L
 
L
N
 
N
G
|
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
R
 
-
A
 
-
E
 
-
I
 
V
D
 
D
R
 
A
L
 
-
C
 
A
T
 
K
E
 
D
I
 
A
A
 
V
A
 
A
Q
 
Q
S
 
Y
G
 
G
T
 
K
T
 
T
I
 
P
V
 
G
Y
 
Y
S
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
P
 
E
E
 
A
E
 
Q
A
 
I
R
 
A
A
 
D
M
 
M
M
 
M
A
 
R
D
 
Y
A
 
A
A
 
E
A
 
S
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
V
A
 
S
A
 
P
V
 
I
H
 
E
E
 
T
F
 
F
P
 
P
D
 
V
D
 
D
K
 
K
W
 
W
D
 
N
L
 
A
L
 
I
L
 
I
A
 
A
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
S
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
T
I
 
T
K
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
R
 
R
E
 
A
R
 
R
R
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
I
A
|
A
S
 
S
V
 
V
L
 
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
A
A
 
S
P
 
K
H
 
E
K
 
K
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
V
 
I
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
Q
H
 
T
G
 
E
I
 
I
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
 
W
V
|
V
L
 
L
T
|
T
P
 
P
I
 
L
I
 
V
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
I
 
I
A
 
D
Q
 
K
Q
 
R
A
 
I
Q
 
-
V
 
A
T
 
E
G
 
G
L
 
A
P
 
E
E
 
P
E
 
E
R
 
A
V
 
A
L
 
R
Q
 
D
A
 
A
V
 
L
F
 
L
L
 
A
D
 
E
R
 
K
M
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
R
R
 
E
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
A
 
N
A
 
L
I
 
A
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
D
A
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
I
 
V
T
 
R
G
 
G
T
 
V
A
 
A
I
 
W
P
 
N
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
48% identity, 99% coverage: 1:256/259 of query aligns to 2:252/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
M
 
L
R
 
K
N
 
G
R
 
K
N
 
T
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
|
T
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
G
T
 
I
A
 
A
R
 
Q
E
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
H
 
N
V
 
I
M
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
F
|
F
G
 
G
D
 
D
R
 
P
A
 
A
E
 
P
I
 
A
D
 
-
R
 
-
L
 
-
C
 
L
T
 
A
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
-
Q
 
R
S
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
K
I
 
A
V
 
V
Y
 
H
S
 
H
G
 
P
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
S
R
 
D
P
 
V
E
 
A
E
 
Q
A
 
I
R
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
F
A
 
A
D
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
R
A
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
P
V
 
V
H
 
E
E
 
Q
F
 
F
P
 
P
D
 
L
D
 
E
K
 
S
W
 
W
D
 
D
L
 
K
L
 
I
L
 
I
A
 
A
V
x
L
N
 
N
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
V
F
 
F
H
 
H
T
 
G
I
 
T
K
 
R
A
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
G
M
 
M
R
 
R
E
 
A
R
 
R
R
 
N
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
L
 
H
G
 
G
M
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
S
P
 
T
H
 
G
K
 
K
P
 
A
A
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
T
H
 
S
G
 
N
I
 
V
T
 
T
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
W
V
|
V
L
 
L
T
|
T
P
 
P
I
x
L
I
x
V
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
I
 
I
A
 
D
Q
 
D
Q
x
R
A
 
A
Q
 
A
V
 
N
T
 
G
G
 
G
L
 
D
P
 
P
E
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
D
V
 
L
F
 
L
L
 
A
D
 
E
R
 
K
M
 
Q
P
 
P
T
 
S
G
 
L
R
 
A
L
 
F
I
 
V
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
H
V
 
L
A
 
G
A
 
E
A
 
L
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
A
A
 
G
A
 
S
S
 
Q
I
 
V
T
 
R
G
 
G
T
 
A
A
 
A
I
 
W
P
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
W

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:259/259 of query aligns to 5:261/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
M
 
L
R
 
D
N
 
G
R
 
K
N
 
V
A
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
K
E
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
G
 
G
C
 
A
H
 
K
V
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
S
G
x
D
F
x
M
G
 
N
D
 
A
R
 
E
A
 
K
E
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
C
 
C
T
 
Q
E
 
E
I
 
T
A
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
L
A
 
K
Q
 
E
S
 
Q
G
 
G
T
 
F
T
 
D
I
 
A
V
 
L
Y
 
S
S
 
A
G
 
P
A
 
C
D
|
D
L
x
V
S
 
T
R
 
D
P
 
E
E
 
D
E
 
A
A
 
Y
R
 
K
A
 
Q
M
 
A
M
 
I
A
 
E
D
 
L
A
 
T
A
 
Q
A
 
K
A
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
F
Q
|
Q
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
P
V
 
I
H
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
T
D
 
A
K
 
V
W
 
F
D
 
Q
L
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
I
T
 
G
I
 
I
K
 
K
A
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
R
 
K
E
 
A
R
 
Q
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
L
x
N
G
 
G
M
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
F
P
 
A
H
 
G
K
|
K
P
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
C
A
 
A
E
 
R
H
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
 
Y
V
|
V
L
 
D
T
|
T
P
 
P
I
x
L
I
 
V
E
 
R
K
 
G
Q
|
Q
I
 
I
A
 
A
Q
 
D
Q
 
L
A
 
A
Q
 
K
V
 
T
T
 
R
G
 
N
L
 
V
P
 
S
E
 
L
E
 
D
R
 
S
V
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
D
V
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
A
R
 
M
M
 
V
P
 
P
T
 
Q
G
 
K
R
 
R
L
 
L
I
 
L
P
 
S
P
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
Y
I
 
A
A
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
S
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
H
 
Q

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
38% identity, 100% coverage: 1:259/259 of query aligns to 4:260/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
M
 
L
R
 
D
N
 
G
R
 
K
N
 
V
A
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
S
 
S
T
 
A
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
K
E
 
K
L
 
F
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
G
 
G
C
 
A
H
 
K
V
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
S
G
x
D
F
x
M
G
 
N
D
 
A
R
 
E
A
 
K
E
 
-
I
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
-
C
 
C
T
 
Q
E
 
E
I
 
T
A
 
A
-
 
N
-
 
S
-
 
L
A
 
K
Q
 
E
S
 
Q
G
 
G
T
 
F
T
 
D
I
 
A
V
 
L
Y
 
S
S
 
A
G
 
P
A
 
C
D
|
D
L
x
V
S
 
T
R
 
D
P
 
E
E
 
D
E
 
A
A
 
Y
R
 
K
A
 
Q
M
 
A
M
 
I
A
 
E
D
 
L
A
 
T
A
 
Q
A
 
K
A
 
T
L
 
F
G
 
G
P
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
F
Q
|
Q
H
 
H
V
 
V
A
 
A
A
 
P
V
 
I
H
 
E
E
 
E
F
 
F
P
 
P
D
 
T
D
 
A
K
 
V
W
 
F
D
 
Q
L
 
K
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
A
F
 
F
H
 
I
T
 
G
I
 
I
K
 
K
A
 
H
A
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
I
M
 
M
R
 
K
E
 
A
R
 
Q
R
 
K
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
L
 
N
G
 
G
M
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
F
P
 
A
H
 
G
K
|
K
P
 
A
A
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
V
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
C
A
 
A
E
 
R
H
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
T
x
Y
V
|
V
L
 
D
T
|
T
P
 
P
I
 
L
I
 
V
E
 
R
K
 
G
Q
|
Q
I
 
I
A
 
A
Q
 
D
Q
 
L
A
 
A
Q
 
K
V
 
T
T
 
R
G
 
N
L
 
V
P
 
S
E
 
L
E
 
D
R
 
S
V
 
A
L
 
L
Q
 
E
A
 
D
V
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
A
R
 
M
M
 
V
P
 
P
T
 
Q
G
 
K
R
 
R
L
 
L
I
 
L
P
 
S
P
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
Y
I
 
A
A
 
I
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
G
S
 
G
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
I
 
V
P
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T
T
 
A
H
 
Q

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
37% identity, 97% coverage: 4:255/259 of query aligns to 5:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
R
 
K
N
 
S
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
S
 
A
T
 
S
T
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
R
 
L
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
Q
 
E
G
 
G
C
 
Y
H
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
V
N
 
N
G
 
Y
F
 
A
G
 
G
D
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
K
I
 
A
D
 
E
R
 
A
L
 
V
C
 
V
T
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
S
 
-
G
 
G
T
 
V
T
 
D
I
 
S
V
 
F
Y
 
A
S
 
I
G
 
Q
A
 
A
D
 
N
L
 
V
S
 
A
R
 
D
P
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
V
R
 
K
A
 
A
M
 
M
M
 
I
A
 
K
D
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
T
H
 
R
V
 
D
A
 
N
A
 
L
V
 
L
H
 
M
E
 
R
F
 
M
P
 
K
D
 
E
D
 
Q
K
 
E
W
 
W
D
 
D
L
 
D
L
 
V
L
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
N
T
 
C
I
 
I
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
Q
M
 
M
R
 
L
E
 
R
R
 
Q
R
 
R
W
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
M
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
P
H
 
G
K
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
F
V
 
I
L
 
V
T
 
S
P
 
D
I
 
M
I
 
T
E
 
D
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
A
L
 
L
P
 
S
E
 
D
E
 
E
R
 
-
V
 
-
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
V
 
Q
F
 
M
L
 
L
D
 
T
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
I
 
G
P
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
A
 
A
A
 
K
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
I
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
36% identity, 97% coverage: 4:255/259 of query aligns to 2:236/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
R
 
K
N
 
S
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
T
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
T
 
I
A
 
A
R
 
L
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
Q
 
E
G
 
G
C
 
Y
H
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
V
N
|
N
G
x
Y
F
x
A
G
|
G
D
x
S
R
 
K
A
 
E
E
 
K
I
 
A
D
 
E
R
 
A
L
 
V
C
 
V
T
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
K
A
 
A
Q
 
K
S
 
-
G
 
G
T
 
V
T
 
D
I
 
S
V
 
F
Y
 
A
S
 
I
G
 
Q
A
|
A
D
x
N
L
x
V
S
 
A
R
 
D
P
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
V
R
 
K
A
 
A
M
 
M
M
 
I
A
 
K
D
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
S
A
 
Q
L
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
T
H
 
R
V
 
D
A
 
N
A
 
L
V
 
L
H
 
M
E
 
R
F
 
M
P
 
K
D
 
E
D
 
Q
K
 
E
W
 
W
D
 
D
L
 
D
L
 
V
L
 
I
A
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
N
T
 
C
I
 
I
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
Q
M
 
M
R
 
L
E
 
R
R
 
Q
R
 
R
W
 
S
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
L
A
 
S
S
|
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
M
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
P
H
 
G
K
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
|
G
T
 
F
V
 
I
L
 
V
T
 
S
P
 
D
I
 
M
I
 
T
E
 
D
K
 
E
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
L
Q
 
K
A
 
E
V
 
Q
F
 
M
L
 
L
D
 
T
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
I
 
G
P
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
K
A
 
A
A
 
K
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
I
 
I
P
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3sjuA Hedamycin polyketide ketoreductase bound to NADPH (see paper)
40% identity, 99% coverage: 4:259/259 of query aligns to 1:255/255 of 3sjuA

query
sites
3sjuA
R
 
Q
N
 
T
A
 
A
V
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
V
T
 
S
T
x
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
A
Q
 
R
G
 
G
C
 
-
H
 
-
V
 
I
M
 
A
L
 
V
N
 
Y
G
 
G
F
 
C
G
x
A
D
x
R
R
x
D
A
 
A
E
 
K
I
 
N
D
 
V
R
 
S
L
 
A
C
 
A
T
 
V
E
 
D
I
 
G
A
 
L
A
 
R
Q
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
H
T
 
D
I
 
V
V
 
D
Y
 
G
S
 
S
G
 
S
A
x
C
D
|
D
L
x
V
S
 
T
R
 
S
P
 
T
E
 
D
E
 
E
A
 
V
R
 
H
A
 
A
M
 
A
M
 
V
A
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
P
I
 
I
D
 
G
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
S
A
|
A
G
|
G
V
 
R
Q
 
N
H
 
G
V
 
G
A
 
G
A
 
E
V
 
T
H
 
A
E
 
D
F
 
L
P
 
D
D
 
D
D
 
A
K
 
L
W
 
W
D
 
A
L
 
D
L
 
V
L
 
L
A
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
R
T
 
V
I
 
T
K
 
R
A
 
E
A
 
V
L
 
L
P
 
R
A
 
A
-
 
G
-
 
G
M
 
M
R
 
R
E
 
E
R
 
A
R
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
T
L
 
G
G
 
G
M
 
K
V
 
Q
G
 
G
A
 
V
P
 
M
H
 
Y
K
 
A
P
 
A
A
 
P
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
V
A
 
G
I
 
F
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
K
H
 
T
G
 
G
I
 
I
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
x
Y
V
|
V
L
 
E
T
|
T
P
 
P
I
x
M
I
 
A
E
 
E
K
 
R
Q
 
V
I
 
R
A
 
E
Q
 
G
Q
x
Y
A
 
A
Q
 
R
V
 
H
T
 
W
G
 
G
L
 
V
P
 
T
E
 
E
E
 
Q
R
 
E
V
 
V
L
 
H
Q
 
E
A
 
R
V
 
-
F
 
F
L
 
N
D
 
A
R
 
K
M
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
I
 
S
P
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
L
I
 
V
A
 
G
F
 
Y
L
 
L
C
 
V
S
 
T
D
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
I
 
I
T
 
T
G
 
A
T
 
Q
A
 
A
I
 
L
P
 
N
V
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
L
T
 
G
T
 
N
H
 
Y

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:257/259 of query aligns to 3:246/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
M
 
L
R
 
D
N
 
N
R
 
K
N
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
G
T
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
R
 
H
E
 
S
L
 
Y
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
C
 
A
H
 
K
V
 
V
M
 
I
L
 
V
N
 
S
G
x
D
F
x
I
G
 
-
D
 
N
R
 
E
A
 
D
E
 
H
I
 
G
D
 
N
R
 
K
L
 
A
C
 
V
T
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
K
A
 
A
Q
 
Q
S
 
G
G
 
G
T
 
E
T
 
A
I
 
-
V
 
S
Y
 
F
S
 
V
G
 
K
A
|
A
D
|
D
L
x
T
S
 
S
R
 
N
P
 
P
E
 
E
E
 
E
A
 
V
R
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
V
A
 
K
D
 
R
A
 
T
A
 
V
A
 
E
A
 
I
L
 
Y
G
 
G
P
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
G
H
 
G
V
 
E
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
-
 
A
H
 
G
E
 
D
F
 
Y
P
 
G
D
 
L
D
 
D
K
 
S
W
 
W
D
 
R
L
 
K
L
 
V
L
 
L
A
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
S
 
D
A
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
Y
T
 
G
I
 
C
K
 
K
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
Q
M
 
M
R
 
E
E
 
K
R
 
N
R
 
G
W
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
x
M
A
 
A
S
|
S
V
 
I
L
 
H
G
 
G
M
 
I
V
 
V
G
 
A
A
 
A
P
 
P
H
 
L
K
 
S
P
 
S
A
 
A
Y
|
Y
V
 
T
A
 
S
T
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
N
V
 
I
A
 
G
I
 
A
E
 
E
V
 
Y
A
 
G
E
 
Q
H
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
G
P
|
P
G
x
A
T
x
Y
V
x
I
L
 
E
T
 
T
P
 
P
I
x
L
I
 
L
E
 
E
K
 
S
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
T
E
 
K
E
 
E
R
 
-
V
 
-
L
 
M
Q
 
K
A
 
E
V
 
A
F
 
L
L
 
I
D
 
S
R
 
K
M
 
H
P
 
P
T
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
L
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
D
 
E
A
 
K
A
 
S
A
 
S
S
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
G
A
 
Y
I
 
Y
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
T
 
T

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
35% identity, 98% coverage: 1:255/259 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
L
R
 
Q
N
 
G
R
 
K
N
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
x
S
T
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
T
 
I
A
 
A
R
 
I
E
 
N
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
E
G
 
G
C
 
A
H
 
N
V
 
I
M
 
F
L
 
F
N
|
N
G
 
-
F
x
Y
G
x
N
D
x
G
R
x
S
A
 
P
E
 
E
I
 
A
D
 
A
R
 
E
L
 
E
C
 
T
T
 
A
E
 
K
I
 
L
A
 
V
A
 
A
Q
 
E
S
 
H
G
 
G
T
 
V
T
 
E
I
 
V
V
 
E
Y
 
A
S
 
M
G
 
K
A
 
A
D
x
N
L
x
V
S
 
A
R
 
I
P
 
A
E
 
E
E
 
D
A
 
V
R
 
D
A
 
A
M
 
F
M
 
F
A
 
K
D
 
Q
A
 
A
A
 
I
A
 
E
A
 
R
L
 
F
G
 
G
P
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
x
I
Q
 
T
H
 
R
V
 
D
A
 
N
A
 
L
V
 
L
H
 
M
E
 
R
F
 
M
P
 
K
D
 
E
D
 
D
K
 
E
W
 
W
D
 
D
L
 
D
L
 
V
L
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
S
 
K
A
 
G
A
 
T
F
 
F
H
 
L
T
 
C
I
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
S
P
 
R
A
 
T
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
Q
R
 
R
W
 
A
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
M
A
 
A
S
|
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
M
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
A
H
 
G
K
x
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
V
 
T
A
 
A
I
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
T
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
T
 
F
V
x
I
L
 
T
T
|
T
P
 
D
I
 
M
I
 
T
E
 
D
K
 
K
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
K
V
 
T
L
 
K
Q
 
E
A
 
A
V
 
M
F
 
-
L
 
L
D
 
A
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
I
 
G
P
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
S
A
 
K
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
T
I
 
L
P
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4k6fB X-ray crystal structure of a putative acetoacetyl-coa reductase from burkholderia cenocepacia bound to the co-factor NADP
36% identity, 99% coverage: 4:259/259 of query aligns to 2:245/245 of 4k6fB

query
sites
4k6fB
R
 
R
N
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
G
T
 
M
T
 
G
G
|
G
I
 
L
G
 
G
L
 
E
A
 
A
T
 
V
A
 
S
R
 
I
E
 
R
L
 
L
A
 
N
R
 
D
Q
 
A
G
 
G
C
 
H
H
 
R
V
 
V
M
 
V
L
 
V
N
 
T
G
x
Y
F
x
S
G
 
P
D
 
N
R
x
N
A
 
T
E
 
G
I
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
W
C
 
L
T
 
T
E
 
E
I
 
M
A
 
H
A
 
A
Q
 
A
S
 
G
G
 
R
T
 
E
T
 
F
I
 
H
V
 
A
Y
 
Y
S
 
P
G
 
-
A
x
V
D
|
D
L
x
V
S
 
A
R
 
D
P
 
H
E
 
D
E
 
S
A
 
C
R
 
Q
A
 
Q
M
 
C
M
 
I
A
 
E
D
 
K
A
 
I
A
 
V
A
 
R
A
 
D
L
 
V
G
 
G
P
 
P
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
T
H
 
R
V
 
D
A
 
M
A
 
T
V
 
L
H
 
R
E
 
K
F
 
L
P
 
D
D
 
K
D
 
V
K
x
N
W
 
W
D
 
D
L
 
A
L
 
V
L
 
I
A
 
R
V
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
D
A
 
S
A
 
V
F
 
F
H
 
N
T
 
M
I
 
T
K
 
K
A
 
P
A
 
V
L
 
C
P
 
D
A
 
G
M
 
M
R
 
V
E
 
E
R
 
R
R
 
G
W
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
T
 
I
A
 
S
S
|
S
V
 
V
L
 
N
G
 
G
M
 
S
V
 
K
G
 
G
A
 
S
P
 
V
H
 
G
K
 
Q
P
 
T
A
 
N
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
M
I
 
H
G
 
G
L
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
V
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
C
 
S
P
 
P
G
 
G
T
 
Y
V
 
L
L
 
A
T
 
T
P
 
K
I
 
M
I
 
-
E
 
-
K
 
-
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
V
T
 
T
G
 
A
L
 
I
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
R
 
-
V
 
I
L
 
L
Q
 
D
A
 
T
V
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
P
R
 
Q
M
 
I
P
 
P
T
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
G
P
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
L
I
 
V
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
S
 
S
D
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
G
S
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
S
A
 
N
I
 
I
P
 
A
V
 
I
D
 
N
G
 
G
G
 
G
Y
 
Q
T
 
H
T
 
M
H
 
H

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
36% identity, 96% coverage: 7:255/259 of query aligns to 5:241/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
T
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
T
 
I
A
 
A
R
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
G
R
 
K
Q
 
A
G
 
G
C
 
C
H
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
V
N
|
N
G
x
Y
F
x
A
G
x
R
D
x
S
R
 
A
A
 
K
E
 
A
I
 
A
D
 
E
R
 
E
L
 
V
C
 
S
T
 
K
E
 
Q
I
 
I
A
 
E
A
 
A
Q
 
Y
S
 
G
G
 
G
T
 
Q
T
 
A
I
 
I
V
 
T
Y
 
F
S
 
-
G
 
G
A
 
G
D
|
D
L
x
V
S
 
S
R
 
K
P
 
E
E
 
A
E
 
D
A
 
V
R
 
E
A
 
A
M
 
M
M
 
M
A
 
K
D
 
T
A
 
A
A
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
W
G
 
G
P
 
T
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
Q
 
T
H
 
R
V
 
D
A
 
T
A
 
L
V
 
L
H
 
I
E
 
R
F
 
M
P
 
K
D
 
K
D
 
S
K
 
Q
W
 
W
D
 
D
L
 
E
L
 
V
L
 
I
A
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
G
A
 
V
F
 
F
H
 
L
T
 
C
I
 
T
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
T
P
 
K
A
 
I
M
 
M
R
 
M
E
 
K
R
 
K
R
 
R
W
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
T
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
V
L
 
V
G
 
G
M
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
N
P
 
I
H
 
G
K
 
Q
P
 
A
A
 
N
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
L
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
T
V
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
E
V
 
G
A
 
A
E
 
S
H
 
R
G
 
N
I
 
I
T
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
T
 
F
V
x
I
L
 
A
T
x
S
P
 
D
I
x
M
I
 
T
E
 
A
K
 
K
Q
 
-
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
G
E
 
E
E
 
D
R
 
-
V
 
-
L
 
M
Q
 
E
A
 
K
V
 
K
F
 
I
L
 
L
D
 
G
R
 
T
M
 
I
P
 
P
T
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
I
 
G
P
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
L
I
 
V
A
 
E
F
 
F
L
 
L
C
 
A
-
 
L
S
 
S
D
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
S
S
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
I
 
F
P
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:255/259 of query aligns to 5:250/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
N
 
D
R
 
K
N
 
T
A
 
V
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
 
S
T
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
H
 
R
V
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
G
G
 
H
F
x
S
G
 
G
D
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
G
I
 
A
D
 
L
R
 
S
L
 
L
C
 
A
T
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
F
S
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
A
I
 
I
V
 
A
Y
 
V
S
 
-
G
 
G
A
 
A
D
|
D
L
x
A
S
 
A
R
 
D
P
 
L
E
 
D
E
 
S
A
 
G
R
 
E
A
 
K
M
 
L
M
 
V
A
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
C
H
 
P
V
x
F
A
 
H
A
 
S
V
 
F
H
 
L
E
 
D
F
 
M
P
 
P
D
 
R
D
 
E
K
 
L
W
 
Y
D
 
L
L
 
K
L
 
T
L
 
V
A
 
G
V
 
T
N
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
G
A
 
A
F
 
Y
H
 
F
T
 
T
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
A
P
 
R
A
 
R
M
 
M
R
 
K
E
 
E
R
 
Q
-
 
G
R
 
R
W
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
T
x
V
A
x
S
S
|
S
V
 
I
L
x
S
G
 
A
M
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
G
P
 
A
H
 
M
K
x
Q
P
 
T
A
 
H
Y
|
Y
V
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
S
L
 
L
T
 
M
K
 
Q
S
 
S
V
 
C
A
 
A
I
 
I
E
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
T
 
T
V
x
I
L
 
A
T
|
T
P
 
D
I
|
I
I
x
N
E
 
K
K
 
E
Q
 
D
I
 
L
A
 
S
Q
 
D
Q
 
L
A
 
E
Q
 
K
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
R
E
 
E
R
 
R
V
 
M
L
 
T
Q
 
S
A
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
V
P
 
P
T
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
G
P
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
P
I
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
|
D
A
x
M
A
 
A
A
x
R
S
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
A
 
S
I
 
L
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:255/259 of query aligns to 5:250/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
N
 
D
R
 
K
N
 
T
A
 
V
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
S
 
A
T
x
S
T
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
C
A
 
A
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
C
 
A
H
 
R
V
 
V
M
 
V
L
 
I
N
 
G
G
 
H
F
 
S
G
 
G
D
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
G
R
 
R
A
 
A
E
 
G
I
 
A
D
 
L
R
 
S
L
 
L
C
 
A
T
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
A
 
A
Q
 
F
S
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
A
I
 
I
V
 
A
Y
 
V
S
 
-
G
 
G
A
 
A
D
|
D
L
x
A
S
 
A
R
 
D
P
 
L
E
 
D
E
 
S
A
 
G
R
 
E
A
 
K
M
 
L
M
 
V
A
 
A
D
 
A
A
 
A
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
F
G
 
G
P
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
Q
 
C
H
 
P
V
 
F
A
 
H
A
 
S
V
 
F
H
 
L
E
 
D
F
 
M
P
 
P
D
 
R
D
 
E
K
 
L
W
 
Y
D
 
L
L
 
K
L
 
T
L
 
V
A
 
G
V
x
T
N
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
G
A
 
A
F
 
Y
H
 
F
T
 
T
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
A
P
 
R
A
 
R
M
 
M
R
 
K
E
 
E
R
 
Q
-
 
G
R
 
R
W
 
G
G
 
G
R
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
A
T
x
V
A
 
S
S
|
S
V
 
I
L
 
S
G
 
A
M
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
G
P
 
A
H
 
M
K
 
Q
P
 
T
A
 
H
Y
|
Y
V
 
T
A
 
P
T
 
T
K
|
K
H
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
S
L
 
L
T
 
M
K
 
Q
S
 
S
V
 
C
A
 
A
I
 
I
E
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
P
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
T
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
C
 
L
P
|
P
G
|
G
T
 
T
V
x
I
L
 
A
T
|
T
P
 
D
I
|
I
I
 
N
E
 
K
K
 
E
Q
 
D
I
 
L
A
 
S
Q
 
D
Q
 
L
A
 
E
Q
 
K
V
 
-
T
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
R
E
 
E
R
 
R
V
 
M
L
 
T
Q
 
S
A
 
-
V
 
-
F
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
V
P
 
P
T
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
G
P
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
P
I
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
M
A
 
A
A
 
R
S
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
A
A
 
S
I
 
L
P
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>AZOBR_RS27005 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS27005
MRNRNAVVTGSTTGIGLATARELARQGCHVMLNGFGDRAEIDRLCTEIAAQSGTTIVYSG
ADLSRPEEARAMMADAAAALGPIDILVNNAGVQHVAAVHEFPDDKWDLLLAVNLSAAFHT
IKAALPAMRERRWGRIVNTASVLGMVGAPHKPAYVATKHGIIGLTKSVAIEVAEHGITCN
AVCPGTVLTPIIEKQIAQQAQVTGLPEERVLQAVFLDRMPTGRLIPPEEVAAAIAFLCSD
AAASITGTAIPVDGGYTTH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory