SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS27055 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS27055 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P20932 (S)-mandelate dehydrogenase; MDH; L(+)-mandelate dehydrogenase; EC 1.1.99.31 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 3 papers)
39% identity, 96% coverage: 7:376/384 of query aligns to 6:367/393 of P20932

query
sites
P20932
L
 
F
N
 
N
I
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
Y
R
 
R
Q
 
K
R
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
Y
E
 
D
Y
 
Y
I
 
L
D
 
E
R
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
T
 
Y
G
 
G
I
 
V
A
 
K
T
 
H
S
 
N
K
 
R
T
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
Q
S
 
Q
L
 
W
V
 
R
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
K
V
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
R
R
 
R
D
 
S
A
 
L
T
 
Q
T
 
A
R
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
K
D
 
R
Q
 
Q
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
T
|
T
A
x
G
V
 
L
A
 
N
G
 
G
L
 
A
V
 
L
W
 
W
Y
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
K
V
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
F
 
F
C
 
V
V
 
L
S
|
S
T
 
T
Q
 
A
S
 
S
I
 
N
T
 
M
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
R
E
 
Q
S
 
C
G
 
D
A
 
G
R
 
D
L
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
W
 
I
R
 
H
S
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
I
T
 
A
R
 
Q
E
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
L
R
 
H
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
E
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
 
D
T
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
N
P
 
G
N
 
Y
R
 
R
E
 
E
Y
 
R
N
 
D
V
 
L
R
 
H
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
M
K
 
S
P
 
Y
S
 
S
V
 
A
R
 
K
A
 
V
G
 
V
L
 
L
D
 
D
C
 
G
L
 
C
A
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
W
 
W
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
S
A
 
L
K
 
D
Y
 
F
L
 
V
R
 
R
N
 
H
G
 
-
G
 
G
V
 
M
P
 
P
T
 
Q
Y
 
L
A
 
A
H
 
N
Y
 
F
P
 
V
D
 
S
E
 
S
F
 
Q
R
 
T
T
 
S
A
 
S
L
 
L
G
 
E
R
 
M
V
 
Q
A
 
A
V
 
A
G
 
L
D
 
M
E
 
S
I
 
R
G
 
Q
L
 
M
A
 
D
Q
 
A
D
 
S
V
 
F
G
 
N
W
 
W
G
 
E
D
 
A
V
 
L
R
 
R
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
L
W
 
W
K
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
R
 
S
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
D
K
 
R
A
 
C
A
 
I
E
 
A
L
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
A
 
G
R
 
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
C
A
 
A
I
 
I
H
 
S
P
 
P
V
 
M
R
 
E
C
 
V
L
 
L
T
 
A
D
 
Q
I
 
S
A
 
V
E
 
A
R
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
K
R
 
-
V
 
-
T
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
V
x
F
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
D
V
 
I
A
 
V
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
T
M
 
L
I
 
L
R
 
K
R
 
A
E
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
R
T
 
T
M
 
L
G
 
A
F
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
C
P
 
P
T
 
D
V
 
I
A
 
T
D
 
S
I
 
L

6bfgA Crystal structure of monotopic membrane protein (s)-mandelate dehydrogenase (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:376/384 of query aligns to 4:365/373 of 6bfgA

query
sites
6bfgA
L
 
F
N
 
N
I
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
Y
R
 
R
Q
 
K
R
 
L
A
 
R
R
 
Q
A
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
 
L
D
 
E
R
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
T
 
Y
G
 
G
I
 
V
A
 
K
T
 
H
S
 
N
K
 
R
T
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
Q
S
 
Q
L
 
W
V
 
R
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
K
V
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
R
R
 
R
D
 
S
A
 
L
T
 
Q
T
 
A
R
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
K
D
 
R
Q
 
Q
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
T
|
T
A
x
G
V
 
L
A
 
N
G
 
G
L
 
A
V
 
L
W
 
W
Y
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
K
V
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
F
 
F
C
 
V
V
 
L
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
S
 
S
I
 
N
T
 
M
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
R
E
 
Q
S
 
C
G
 
D
A
 
G
R
 
D
L
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
W
 
I
R
 
H
S
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
I
T
 
A
R
 
Q
E
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
L
R
 
H
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
E
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
|
D
T
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
N
P
 
G
N
 
Y
R
 
R
E
 
E
Y
 
R
N
 
D
V
 
L
R
 
H
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
M
K
 
S
P
 
Y
S
 
S
V
 
A
R
 
K
A
 
V
G
 
V
L
 
L
D
 
D
C
 
G
L
 
C
A
 
L
H
 
H
P
 
P
R
 
R
W
 
W
F
 
S
A
 
L
G
 
D
V
 
-
F
 
F
A
 
V
K
 
R
Y
 
H
L
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
G
V
 
M
P
 
P
T
 
Q
Y
 
L
A
 
A
H
 
N
Y
 
F
P
 
V
D
 
S
E
 
S
F
 
Q
R
 
T
T
 
S
A
 
S
L
 
L
G
 
E
R
 
M
V
 
Q
A
 
A
V
 
A
G
 
L
D
 
M
E
 
S
I
 
R
G
 
Q
L
 
M
A
 
D
Q
 
A
D
 
S
V
 
F
G
 
N
W
 
W
G
 
E
D
 
A
V
 
L
R
 
R
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
L
W
 
W
K
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
R
 
S
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
D
K
 
R
A
 
C
A
 
I
E
 
A
L
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
G
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
C
A
 
A
I
 
I
H
 
S
P
 
P
V
 
M
R
 
E
C
 
V
L
 
L
T
 
A
D
 
Q
I
 
S
A
 
V
E
 
A
R
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
K
R
 
-
V
 
-
T
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
V
 
F
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
D
V
 
I
A
 
V
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
T
M
 
L
I
 
L
R
 
K
R
 
A
E
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
R
T
 
T
M
 
L
G
 
A
F
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
C
P
 
P
T
 
D
V
 
I
A
 
T
D
 
S
I
 
L

2a85A Crystal structure of the g81a mutant of the active chimera of (s)- mandelate dehydrogenase in complex with its substrate 2- hydroxyoctanoate (see paper)
37% identity, 96% coverage: 7:376/384 of query aligns to 3:345/353 of 2a85A

query
sites
2a85A
L
 
F
N
 
N
I
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
Y
R
 
R
Q
 
K
R
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
 
L
D
 
E
R
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
T
 
Y
G
 
G
I
 
V
A
 
K
T
 
H
S
 
N
K
 
R
T
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
Q
S
 
Q
L
 
W
V
 
R
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
K
V
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
R
R
 
R
D
 
S
A
 
L
T
 
Q
T
 
A
R
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
K
D
 
R
Q
 
Q
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
T
|
T
A
|
A
V
 
L
A
 
N
G
 
G
L
 
A
V
 
L
W
 
W
Y
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
K
V
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
F
 
F
C
 
V
V
 
L
S
|
S
T
 
T
Q
 
A
S
 
S
I
 
N
T
 
M
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
R
E
 
Q
S
 
C
G
 
D
A
 
G
R
 
D
L
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
W
 
I
R
 
H
S
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
I
T
 
A
R
 
Q
E
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
L
R
 
H
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
E
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
|
D
T
 
V
A
 
A
V
 
V
T
x
N
P
x
G
N
 
Y
R
|
R
E
 
E
Y
 
R
N
 
D
V
 
L
R
 
H
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
P
K
 
F
P
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
K
A
 
N
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
D
A
 
L
K
 
G
Y
 
K
L
 
M
R
 
D
N
 
K
G
 
A
G
 
N
V
 
L
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
E
F
 
M
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
M
R
 
S
V
 
R
A
 
Q
V
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
M
A
 
D
Q
 
A
D
 
S
V
 
F
G
 
N
W
 
W
G
 
E
D
 
A
V
 
L
R
 
R
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
L
W
 
W
K
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
R
 
S
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
D
K
 
R
A
 
C
A
 
I
E
 
A
L
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
G
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
C
A
 
A
I
 
I
H
 
S
P
 
P
V
 
M
R
 
E
C
 
V
L
 
L
T
 
A
D
 
Q
I
 
S
A
 
V
E
 
A
R
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
K
R
 
-
V
 
-
T
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
V
 
F
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
D
V
 
I
A
 
V
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
T
M
 
L
I
 
L
R
 
K
R
 
A
E
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
R
T
 
T
M
 
L
G
 
A
F
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
C
P
 
P
T
 
D
V
 
I
A
 
T
D
 
S
I
 
L

2a7pA Crystal structure of the g81a mutant of the active chimera of (s)- mandelate dehydrogenase in complex with its substrate 3-indolelactate (see paper)
37% identity, 96% coverage: 7:376/384 of query aligns to 3:345/353 of 2a7pA

query
sites
2a7pA
L
 
F
N
 
N
I
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
Y
R
 
R
Q
 
K
R
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
 
L
D
 
E
R
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
T
 
Y
G
 
G
I
 
V
A
 
K
T
 
H
S
 
N
K
 
R
T
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
Q
S
 
Q
L
 
W
V
 
R
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
K
V
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
R
R
 
R
D
 
S
A
 
L
T
 
Q
T
 
A
R
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
K
D
 
R
Q
 
Q
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
T
|
T
A
|
A
V
 
L
A
 
N
G
 
G
L
 
A
V
 
L
W
 
W
Y
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
K
V
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
F
 
F
C
 
V
V
 
L
S
|
S
T
 
T
Q
 
A
S
 
S
I
 
N
T
 
M
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
R
E
 
Q
S
 
C
G
 
D
A
 
G
R
 
D
L
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
W
 
I
R
 
H
S
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
I
T
 
A
R
 
Q
E
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
L
R
 
H
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
E
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
|
D
T
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
N
P
 
G
N
 
Y
R
|
R
E
 
E
Y
 
R
N
 
D
V
 
L
R
 
H
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
P
K
 
F
P
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
K
A
 
N
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
D
A
 
L
K
 
G
Y
 
K
L
 
M
R
 
D
N
 
K
G
 
A
G
 
N
V
 
L
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
E
F
 
M
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
M
R
 
S
V
 
R
A
 
Q
V
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
M
A
 
D
Q
 
A
D
 
S
V
 
F
G
 
N
W
 
W
G
 
E
D
 
A
V
 
L
R
 
R
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
L
W
 
W
K
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
R
 
S
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
D
K
 
R
A
 
C
A
 
I
E
 
A
L
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
G
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
C
A
 
A
I
 
I
H
 
S
P
 
P
V
 
M
R
 
E
C
 
V
L
 
L
T
 
A
D
 
Q
I
 
S
A
 
V
E
 
A
R
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
K
R
 
-
V
 
-
T
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
V
 
F
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
D
V
 
I
A
 
V
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
T
M
 
L
I
 
L
R
 
K
R
 
A
E
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
R
T
 
T
M
 
L
G
 
A
F
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
C
P
 
P
T
 
D
V
 
I
A
 
T
D
 
S
I
 
L

1huvA Crystal structure of a soluble mutant of the membrane-associated (s)- mandelate dehydrogenase from pseudomonas putida at 2.15a resolution (see paper)
37% identity, 96% coverage: 7:376/384 of query aligns to 3:341/349 of 1huvA

query
sites
1huvA
L
 
F
N
 
N
I
 
V
A
 
E
E
 
D
A
 
Y
R
 
R
Q
 
K
R
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
K
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
 
L
D
 
E
R
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
E
T
 
Y
G
 
G
I
 
V
A
 
K
T
 
H
S
 
N
K
 
R
T
 
D
A
 
V
L
 
F
D
 
Q
S
 
Q
L
 
W
V
 
R
F
 
F
K
 
K
P
 
P
R
 
K
V
 
R
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
R
R
 
R
D
 
S
A
 
L
T
 
Q
T
 
A
R
 
E
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
K
D
 
R
Q
 
Q
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
G
P
|
P
T
|
T
A
x
G
V
 
L
A
 
N
G
 
G
L
 
A
V
 
L
W
 
W
Y
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
K
V
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
F
 
F
C
 
V
V
 
L
S
|
S
T
 
T
Q
 
A
S
 
S
I
 
N
T
 
M
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
L
A
 
A
G
 
R
E
 
Q
S
 
C
G
 
D
A
 
G
R
 
D
L
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
W
 
I
R
 
H
S
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
I
T
 
A
R
 
Q
E
 
G
L
 
M
V
 
V
R
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
L
R
 
H
A
 
T
G
 
G
A
 
Y
E
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
V
 
T
D
|
D
T
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
N
P
 
G
N
 
Y
R
 
R
E
 
E
Y
 
R
N
 
D
V
 
L
R
 
H
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
P
K
 
F
P
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
K
A
 
N
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
D
A
 
L
K
 
G
Y
 
K
L
 
M
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
D
E
 
E
F
 
M
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
M
R
 
S
V
 
R
A
 
Q
V
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
M
A
 
D
Q
 
A
D
 
S
V
 
F
G
 
N
W
 
W
G
 
E
D
 
A
V
 
L
R
 
R
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
L
W
 
W
K
 
P
G
 
H
K
 
K
L
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
L
L
 
L
R
 
S
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
D
K
 
R
A
 
C
A
 
I
E
 
A
L
 
E
G
 
G
V
 
A
D
 
D
G
 
G
I
 
V
V
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
G
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
C
A
 
A
I
 
I
H
 
S
P
 
P
V
 
M
R
 
E
C
 
V
L
 
L
T
 
A
D
 
Q
I
 
S
A
 
V
E
 
A
R
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
K
R
 
-
V
 
-
T
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
V
 
F
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
S
H
 
D
V
 
I
A
 
V
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
R
G
 
G
A
 
E
A
 
T
G
 
G
A
 
V
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
T
M
 
L
I
 
L
R
 
K
R
 
A
E
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
R
T
 
T
M
 
L
G
 
A
F
 
Q
L
 
I
G
 
G
A
 
C
P
 
P
T
 
D
V
 
I
A
 
T
D
 
S
I
 
L

5zbmB Structure of glycolate oxidase containing fmn from nicotiana benthamiana (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:376/384 of query aligns to 4:343/353 of 5zbmB

query
sites
5zbmB
N
 
N
I
 
V
A
 
M
E
 
E
A
 
Y
R
 
E
Q
 
A
R
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
F
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
A
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
Q
T
 
W
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
N
K
 
R
T
 
N
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
I
V
 
L
F
 
F
K
 
R
P
 
P
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
K
R
 
I
D
 
D
A
 
M
T
 
S
T
 
T
R
 
T
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
F
D
 
K
Q
 
I
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
M
V
 
I
A
 
A
P
|
P
T
|
T
A
 
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
K
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
E
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
I
F
 
M
C
 
T
V
 
L
S
 
S
T
 
S
Q
x
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
E
 
T
S
 
G
G
 
P
A
 
G
R
 
I
L
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
N
R
 
V
T
 
V
R
 
A
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
F
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
T
|
T
V
 
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
V
 
R
T
 
L
P
 
G
N
 
R
R
 
R
E
 
E
Y
 
A
N
 
D
V
 
I
R
 
K
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
P
K
 
F
P
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
K
-
 
N
-
 
F
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
D
C
 
L
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
G
R
 
K
N
 
D
G
 
S
G
 
G
V
 
L
P
 
A
T
 
S
Y
 
Y
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
A
D
 
G
E
 
Q
I
 
I
G
 
D
L
 
-
A
 
-
Q
 
R
D
 
T
V
 
L
G
 
S
W
 
W
G
 
K
D
 
D
V
 
V
R
 
Q
S
 
W
L
 
L
R
 
Q
D
 
T
A
 
I
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
T
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
L
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
Y
A
 
V
I
 
P
H
 
S
P
 
T
V
 
I
R
 
M
C
 
A
L
 
L
T
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
K
R
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
R
 
R
V
 
I
T
 
P
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
F
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
V
 
I
L
 
F
L
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
I
Q
 
K
A
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
I
 
L
R
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
F
L
 
E
T
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
R
T
 
S
V
 
L
A
 
N
D
 
E
I
 
I

P05414 Glycolate oxidase; GAO; GOX; Short chain alpha-hydroxy acid oxidase; EC 1.1.3.15 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 4 papers)
34% identity, 96% coverage: 8:376/384 of query aligns to 5:349/369 of P05414

query
sites
P05414
N
 
N
I
 
V
A
 
N
E
 
E
A
 
Y
R
 
E
Q
 
A
R
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
R
 
K
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
 
Y
D
 
A
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
Q
T
 
W
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
N
K
 
R
T
 
N
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
I
V
 
L
F
 
F
K
 
R
P
 
P
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
T
K
 
N
R
 
I
D
 
D
A
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
T
L
 
I
F
 
L
G
 
G
V
 
F
D
 
K
Q
 
I
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
M
V
 
I
A
 
A
P
|
P
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
K
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
E
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
I
F
 
M
C
 
T
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
x
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
E
 
T
S
 
G
G
 
P
A
 
G
R
 
I
L
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
L
|
L
Y
|
Y
V
 
V
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
N
R
 
V
T
 
V
R
 
A
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
F
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
T
|
T
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
V
 
R
T
 
L
P
 
G
N
 
R
R
 
R
E
 
E
Y
 
A
N
 
D
V
 
I
R
 
K
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
P
K
 
F
P
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
K
A
 
N
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
Y
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
D
L
 
L
G
 
G
R
 
K
V
 
M
A
 
D
V
 
K
G
 
A
D
 
N
E
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
S
-
 
S
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
Q
 
R
D
 
S
V
 
L
G
 
S
W
 
W
G
 
K
D
 
D
V
 
V
R
 
A
S
 
W
L
 
L
R
 
Q
D
 
T
A
 
I
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
R
 
T
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
L
 
H
G
 
G
V
 
A
D
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
|
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
Y
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
M
C
 
A
L
 
L
T
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
K
R
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
R
 
R
V
 
I
T
 
P
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
V
|
V
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
F
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
L
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
I
 
M
R
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
F
L
 
E
T
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
R
T
 
S
V
 
L
A
 
K
D
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1al7A Three-dimensional structures of glycolate oxidase with bound active- site inhibitors (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:376/384 of query aligns to 5:340/350 of 1al7A

query
sites
1al7A
N
 
N
I
 
V
A
 
N
E
 
E
A
 
Y
R
 
E
Q
 
A
R
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
R
 
K
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
A
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
Q
T
 
W
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
N
K
 
R
T
 
N
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
I
V
 
L
F
 
F
K
 
R
P
 
P
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
T
K
 
N
R
 
I
D
 
D
A
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
T
L
 
I
F
 
L
G
 
G
V
 
F
D
 
K
Q
 
I
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
M
V
 
I
A
 
A
P
|
P
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
K
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
E
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
I
F
 
M
C
 
T
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
x
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
E
 
T
S
 
G
G
 
P
A
 
G
R
 
I
L
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
N
R
 
V
T
 
V
R
 
A
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
F
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
T
|
T
V
 
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
V
 
R
T
 
L
P
 
G
N
 
R
R
|
R
E
 
E
Y
 
A
N
 
D
V
 
I
R
 
K
N
 
N
G
 
R
F
|
F
G
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
P
K
 
F
P
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
K
A
 
N
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
D
G
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
S
T
 
S
Y
 
Y
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
A
D
 
G
E
 
Q
I
|
I
G
 
D
L
 
-
A
 
-
Q
 
R
D
 
S
V
 
L
G
 
S
W
 
W
G
 
K
D
 
D
V
 
V
R
 
A
S
 
W
L
 
L
R
 
Q
D
 
T
A
 
I
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
R
 
T
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
L
 
H
G
 
G
V
 
A
D
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
Y
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
M
C
 
A
L
 
L
T
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
K
R
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
R
 
R
V
 
I
T
 
P
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
F
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
L
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
I
 
M
R
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
F
L
 
E
T
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
R
T
 
S
V
 
L
A
 
K
D
 
E
I
 
I

5qigA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z1407672867
34% identity, 97% coverage: 9:382/384 of query aligns to 5:358/359 of 5qigA

query
sites
5qigA
I
 
I
A
 
N
E
 
D
A
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
S
L
 
I
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
R
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
D
 
D
E
 
E
T
 
E
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
N
K
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
W
V
 
K
F
 
L
K
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
E
R
 
T
D
 
D
A
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
S
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
Q
 
V
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
R
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
T
A
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
A
 
S
V
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
G
F
 
M
C
 
M
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
 
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
-
E
 
E
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
E
A
 
A
R
 
L
L
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
E
R
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
M
G
 
G
A
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
V
 
Y
T
 
L
P
 
G
N
 
N
R
 
R
E
 
L
Y
 
D
N
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
Q
V
 
L
R
 
R
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
M
R
 
K
N
 
N
G
 
F
G
 
E
V
 
T
P
 
S
T
 
T
Y
 
L
A
 
S
H
 
F
Y
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
N
V
 
F
G
 
G
D
 
D
E
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
P
D
 
S
V
 
I
G
 
S
W
 
W
G
 
E
D
 
D
V
 
I
R
 
K
S
 
W
L
 
L
R
|
R
D
 
R
A
 
L
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
H
G
|
G
V
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
D
C
 
V
L
 
L
T
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
V
 
V
R
|
R
R
 
K
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
x
F
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
x
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
A
x
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
R
T
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
Q
T
 
N
V
 
V
A
 
K
D
 
V
I
 
I
V
 
D
G
 
K
T
 
T
V
 
L
E
 
V
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5qifA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z31792168
34% identity, 97% coverage: 9:382/384 of query aligns to 5:358/359 of 5qifA

query
sites
5qifA
I
 
I
A
 
N
E
 
D
A
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
S
L
 
I
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
R
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
D
 
D
E
 
E
T
 
E
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
N
K
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
W
V
 
K
F
 
L
K
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
E
R
 
T
D
 
D
A
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
S
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
Q
 
V
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
R
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
T
A
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
A
 
S
V
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
G
F
 
M
C
 
M
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
 
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
-
E
 
E
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
E
A
 
A
R
 
L
L
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
E
R
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
M
G
 
G
A
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
V
 
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
V
 
Y
T
 
L
P
 
G
N
 
N
R
 
R
E
 
L
Y
 
D
N
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
Q
V
 
L
R
 
R
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
M
R
 
K
N
 
N
G
 
F
G
 
E
V
 
T
P
 
S
T
 
T
Y
 
L
A
 
S
H
 
F
Y
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
N
V
 
F
G
 
G
D
 
D
E
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
P
D
 
S
V
 
I
G
 
S
W
 
W
G
 
E
D
 
D
V
 
I
R
 
K
S
 
W
L
 
L
R
|
R
D
x
R
A
 
L
W
 
T
K
x
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
H
G
 
G
V
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
D
C
 
V
L
 
L
T
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
R
 
K
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
F
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
R
T
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
Q
T
 
N
V
 
V
A
 
K
D
 
V
I
 
I
V
 
D
G
 
K
T
 
T
V
 
L
E
 
V
R
 
R

2rdwA Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with sulfate (see paper)
34% identity, 97% coverage: 9:382/384 of query aligns to 5:358/359 of 2rdwA

query
sites
2rdwA
I
 
I
A
 
N
E
 
D
A
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
S
L
 
I
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
R
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
D
 
D
E
 
E
T
 
E
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
N
K
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
W
V
 
K
F
 
L
K
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
E
R
 
T
D
 
D
A
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
S
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
Q
 
V
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
R
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
T
A
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
A
 
S
V
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
G
F
 
M
C
 
M
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
x
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
-
E
 
E
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
E
A
 
A
R
 
L
L
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
E
R
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
M
G
 
G
A
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
V
 
Y
T
 
L
P
 
G
N
 
N
R
|
R
E
 
L
Y
 
D
N
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
Q
V
 
L
R
 
R
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
M
R
 
K
N
 
N
G
 
F
G
 
E
V
 
T
P
 
S
T
 
T
Y
 
L
A
 
S
H
 
F
Y
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
N
V
 
F
G
 
G
D
 
D
E
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
P
D
 
S
V
 
I
G
 
S
W
 
W
G
 
E
D
 
D
V
 
I
R
 
K
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
R
A
 
L
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
H
G
 
G
V
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
D
C
 
V
L
 
L
T
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
R
 
K
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
F
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
R
T
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
Q
T
 
N
V
 
V
A
 
K
D
 
V
I
 
I
V
 
D
G
 
K
T
 
T
V
 
L
E
 
V
R
 
R

Q9UJM8 2-Hydroxyacid oxidase 1; HAOX1; Glycolate oxidase; GO; GOX; Glyoxylate oxidase; EC 1.1.3.15; EC 1.2.3.5 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
34% identity, 97% coverage: 9:382/384 of query aligns to 8:361/370 of Q9UJM8

query
sites
Q9UJM8
I
 
I
A
 
N
E
 
D
A
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
S
L
 
I
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
 
Y
D
 
R
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
D
 
D
E
 
E
T
 
E
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
N
K
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
W
V
 
K
F
 
L
K
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
E
R
 
T
D
 
D
A
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
S
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
Q
 
V
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
R
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
T
A
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
A
 
S
V
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
G
F
 
M
C
 
M
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
 
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
-
E
 
E
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
E
A
 
A
R
 
L
L
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
E
R
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
M
G
 
G
A
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
P
V
 
Y
T
 
L
P
 
G
N
 
N
R
|
R
E
 
L
Y
 
D
N
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
Q
V
 
L
R
 
R
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
M
R
 
K
N
 
N
G
 
F
G
 
E
V
 
T
P
 
S
T
 
T
Y
 
L
A
 
S
H
 
F
Y
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
N
V
 
F
G
 
G
D
 
D
E
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
D
Q
 
P
D
 
S
V
 
I
G
 
S
W
 
W
G
 
E
D
 
D
V
 
I
R
 
K
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
R
A
 
L
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
H
G
 
G
V
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
|
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
D
C
 
V
L
 
L
T
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
V
|
V
R
|
R
R
 
K
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
F
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
R
T
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
Q
T
 
N
V
 
V
A
 
K
D
 
V
I
 
I
V
 
D
G
 
K
T
 
T
V
 
L
E
 
V
R
 
R

6gmbA Structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with fmn and glycolate
34% identity, 97% coverage: 9:382/384 of query aligns to 8:361/362 of 6gmbA

query
sites
6gmbA
I
 
I
A
 
N
E
 
D
A
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
S
L
 
I
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
R
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
D
 
D
E
 
E
T
 
E
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
N
K
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
W
V
 
K
F
 
L
K
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
E
R
 
T
D
 
D
A
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
S
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
Q
 
V
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
R
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
T
A
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
A
 
S
V
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
G
F
 
M
C
 
M
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
x
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
-
E
 
E
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
E
A
 
A
R
 
L
L
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
E
R
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
M
G
 
G
A
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
V
 
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
V
 
Y
T
 
L
P
 
G
N
 
N
R
|
R
E
 
L
Y
 
D
N
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
Q
V
 
L
R
 
R
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
M
R
 
K
N
 
N
G
 
F
G
 
E
V
 
T
P
 
S
T
 
T
Y
 
L
A
 
S
H
 
F
Y
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
N
V
 
F
G
 
G
D
 
D
E
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
P
D
 
S
V
 
I
G
 
S
W
 
W
G
 
E
D
 
D
V
 
I
R
 
K
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
R
A
 
L
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
H
G
 
G
V
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
D
C
 
V
L
 
L
T
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
V
 
V
R
|
R
R
 
K
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
F
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
R
T
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
Q
T
 
N
V
 
V
A
 
K
D
 
V
I
 
I
V
 
D
G
 
K
T
 
T
V
 
L
E
 
V
R
 
R

2rduA Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with glyoxylate (see paper)
34% identity, 97% coverage: 9:382/384 of query aligns to 6:359/360 of 2rduA

query
sites
2rduA
I
 
I
A
 
N
E
 
D
A
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
S
L
 
I
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
R
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
D
 
D
E
 
E
T
 
E
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
N
K
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
W
V
 
K
F
 
L
K
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
E
R
 
T
D
 
D
A
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
S
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
Q
 
V
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
R
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
T
A
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
A
 
S
V
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
G
F
 
M
C
 
M
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
x
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
-
E
 
E
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
E
A
 
A
R
 
L
L
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
E
R
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
M
G
 
G
A
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
V
 
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
V
 
Y
T
 
L
P
 
G
N
 
N
R
|
R
E
 
L
Y
 
D
N
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
Q
V
 
L
R
 
R
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
M
R
 
K
N
 
N
G
 
F
G
 
E
V
 
T
P
 
S
T
 
T
Y
 
L
A
 
S
H
 
F
Y
 
S
P
 
P
D
 
E
E
 
E
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
N
V
 
F
G
 
G
D
 
D
E
 
D
I
 
S
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
A
-
 
I
-
 
D
-
 
P
D
 
S
V
 
I
G
 
S
W
 
W
G
 
E
D
 
D
V
 
I
R
 
K
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
R
A
 
L
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
H
G
 
G
V
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
D
C
 
V
L
 
L
T
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
V
 
V
R
|
R
R
 
K
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
F
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
A
 
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
R
T
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
Q
T
 
N
V
 
V
A
 
K
D
 
V
I
 
I
V
 
D
G
 
K
T
 
T
V
 
L
E
 
V
R
 
R

5qieA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z2856434894
34% identity, 98% coverage: 7:382/384 of query aligns to 3:352/353 of 5qieA

query
sites
5qieA
L
x
I
N
 
C
I
 
I
A
 
N
E
 
D
A
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
R
 
H
A
 
A
R
 
K
A
 
S
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
S
L
 
I
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
R
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
N
D
 
D
E
 
E
T
 
E
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
D
S
 
N
K
 
I
T
 
A
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
W
V
 
K
F
 
L
K
 
Y
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
N
V
 
V
S
 
A
K
 
E
R
 
T
D
 
D
A
 
L
T
 
S
T
 
T
R
 
S
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
Q
 
V
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
C
V
 
V
A
 
G
P
x
A
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
R
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
T
A
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
A
 
S
V
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
G
F
 
M
C
 
M
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
 
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
-
E
 
E
S
 
A
G
 
G
-
 
P
-
 
E
A
 
A
R
 
L
L
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
E
R
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
K
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
Q
A
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
M
G
 
G
A
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
V
 
V
D
|
D
T
 
T
A
 
P
V
 
Y
T
 
L
P
 
G
N
 
N
R
 
R
E
 
L
Y
 
D
N
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
G
 
R
F
 
F
G
 
K
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
Q
V
 
L
R
 
R
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
M
R
 
K
N
 
N
G
 
F
G
 
E
V
 
T
P
 
S
T
 
T
Y
 
L
A
 
S
H
 
F
Y
 
S
P
 
P
D
 
D
E
 
S
F
 
G
R
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
Y
G
 
V
R
 
A
V
 
K
A
 
A
V
 
I
G
 
D
D
 
P
E
 
S
I
 
I
G
 
S
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
W
 
W
G
 
E
D
 
D
V
 
I
R
 
K
S
 
W
L
 
L
R
 
R
D
 
R
A
 
L
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
K
L
 
H
G
 
G
V
 
L
D
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
D
C
 
V
L
 
L
T
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
R
 
K
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
I
L
 
V
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
F
D
 
Q
G
 
G
A
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
V
Q
 
Q
A
x
D
V
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
I
I
 
L
R
 
K
R
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
R
T
 
L
T
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
Q
T
 
N
V
 
V
A
 
K
D
 
V
I
 
I
V
 
D
G
 
K
T
 
T
V
 
L
E
 
V
R
 
R

1al8A Three-dimensional structure of glycolate oxidase with bound active- site inhibitors (see paper)
34% identity, 96% coverage: 8:376/384 of query aligns to 5:334/344 of 1al8A

query
sites
1al8A
N
 
N
I
 
V
A
 
N
E
 
E
A
 
Y
R
 
E
Q
 
A
R
 
I
A
 
A
R
 
K
A
 
Q
R
 
K
L
 
L
P
 
P
R
 
K
G
 
M
L
 
V
F
 
Y
E
 
D
Y
|
Y
I
x
Y
D
 
A
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
D
 
D
E
 
Q
T
 
W
G
 
T
I
 
L
A
 
A
T
 
E
S
 
N
K
 
R
T
 
N
A
 
A
L
 
F
D
 
S
S
 
R
L
 
I
V
 
L
F
 
F
K
 
R
P
 
P
R
 
R
V
 
I
L
 
L
V
 
I
D
 
D
V
 
V
S
 
T
K
 
N
R
 
I
D
 
D
A
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
T
L
 
I
F
 
L
G
 
G
V
 
F
D
 
K
Q
 
I
P
 
S
M
 
M
P
 
P
L
 
I
V
 
M
V
 
I
A
 
A
P
|
P
T
|
T
A
|
A
V
 
M
A
 
Q
G
 
K
L
 
M
V
 
A
W
 
H
Y
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
E
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
A
V
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
I
F
 
M
C
 
T
V
 
L
S
|
S
T
 
S
Q
x
W
S
 
A
I
 
T
T
 
S
S
 
S
V
 
V
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
S
E
 
T
S
 
G
G
 
P
A
 
G
R
 
I
L
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
W
 
Y
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
N
R
 
V
T
 
V
R
 
A
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
F
E
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
T
|
T
V
 
V
D
|
D
T
 
-
A
 
-
V
 
-
T
 
T
P
 
P
N
 
R
R
 
L
E
 
-
Y
 
-
N
 
-
V
 
I
R
 
K
N
 
N
G
 
R
F
|
F
G
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
P
K
 
F
P
 
L
S
 
T
V
 
L
R
 
K
A
 
N
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
W
 
-
F
 
F
A
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
-
A
 
-
K
 
-
Y
 
-
L
 
-
R
 
-
N
 
D
G
 
L
G
 
G
V
 
L
P
 
S
T
 
S
Y
 
Y
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
V
G
 
A
D
 
G
E
 
Q
I
 
I
G
 
D
L
 
-
A
 
-
Q
 
R
D
 
S
V
 
L
G
 
S
W
 
W
G
 
K
D
 
D
V
 
V
R
 
A
S
 
W
L
 
L
R
 
Q
D
 
T
A
 
I
W
 
T
K
 
S
G
 
L
K
 
P
L
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
R
 
T
A
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
L
A
 
A
A
 
V
E
 
Q
L
 
H
G
 
G
V
 
A
D
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
A
 
A
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
Y
A
 
V
I
 
P
H
 
A
P
 
T
V
 
I
R
 
M
C
 
A
L
 
L
T
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
V
E
 
K
R
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
R
 
R
V
 
I
T
 
P
V
 
V
L
 
F
A
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
V
 
V
R
|
R
R
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
V
A
 
F
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
F
L
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
V
L
 
V
Y
 
F
G
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
E
G
 
G
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
I
 
M
R
 
R
R
 
D
E
 
E
L
 
F
L
 
E
T
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
S
G
 
G
A
 
C
P
 
R
T
 
S
V
 
L
A
 
K
D
 
E
I
 
I

Q8Z0C8 L-lactate oxidase; LOX; Glyoxylate oxidase; No-LOX; EC 1.1.3.-; EC 1.2.3.5 from Nostoc sp. (strain PCC 7120 / SAG 25.82 / UTEX 2576) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 2:376/384 of query aligns to 3:358/365 of Q8Z0C8

query
sites
Q8Z0C8
A
 
A
V
 
I
T
 
S
A
 
S
S
 
P
L
 
I
N
 
N
I
 
L
A
 
F
E
 
E
A
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
R
 
L
A
 
A
R
 
K
A
 
T
R
 
H
L
 
L
P
 
S
R
 
Q
G
 
M
L
 
A
F
 
F
E
 
D
Y
 
Y
I
 
Y
D
 
I
R
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
G
D
 
D
E
 
E
T
 
I
G
 
T
I
 
L
A
 
Q
T
 
E
S
 
N
K
 
R
T
 
A
A
 
V
L
 
F
D
 
E
S
 
R
L
 
I
V
 
K
F
 
L
K
 
R
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
V
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
Q
R
 
I
D
 
N
A
 
L
T
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
V
F
 
L
G
 
G
V
 
Q
D
 
P
Q
 
L
P
 
Q
M
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
L
V
 
I
A
 
A
P
 
P
T
x
M
A
 
A
V
 
F
A
 
Q
G
 
C
L
 
L
V
 
A
W
 
H
Y
 
T
D
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
S
V
 
A
G
 
G
I
 
T
P
 
G
F
 
M
C
 
V
V
 
L
S
 
S
T
 
T
Q
x
L
S
 
S
I
 
T
T
 
K
S
 
S
V
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
V
A
 
A
G
 
-
E
 
E
S
 
V
G
 
G
A
 
S
R
 
K
L
 
F
-
 
S
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
Q
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
V
 
I
W
 
H
R
 
K
S
 
D
R
 
R
E
 
G
R
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
V
 
V
R
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
Y
R
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
C
L
 
L
T
 
T
V
 
V
D
 
D
T
 
A
A
 
P
V
 
V
T
 
L
P
 
G
N
 
Q
R
 
R
E
 
E
Y
 
R
N
 
D
V
 
R
R
 
R
N
 
N
G
 
E
F
 
F
G
 
V
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
P
S
 
G
V
 
L
R
 
H
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
L
A
 
A
H
 
N
P
 
L
R
 
T
W
 
T
F
 
I
A
 
S
G
 
G
V
 
L
F
 
N
A
 
I
K
 
P
Y
 
H
L
 
-
R
 
A
N
 
P
G
 
G
G
 
E
V
 
S
P
 
G
T
 
L
Y
 
F
A
 
T
H
 
Y
Y
x
F
P
 
A
D
 
Q
E
 
Q
F
 
L
R
 
N
T
 
P
A
 
A
L
 
L
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
T
W
 
W
G
 
D
D
 
D
V
 
L
R
 
E
S
 
W
L
 
L
R
 
Q
D
 
S
A
 
L
W
 
S
K
 
P
G
 
L
K
 
P
L
 
L
I
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
R
A
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
L
 
Y
G
 
G
V
 
A
D
 
K
G
 
A
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
A
 
G
R
 
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
A
I
 
I
H
 
A
P
 
S
V
 
L
R
 
D
C
 
A
L
 
L
T
 
P
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
A
R
 
A
V
 
V
G
 
N
D
 
G
R
 
K
V
 
A
T
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
L
D
 
D
S
 
G
G
 
G
V
 
I
R
 
R
R
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
D
V
 
I
A
 
I
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
P
V
 
V
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
V
D
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
S
A
 
H
V
 
V
L
 
I
E
 
S
M
 
L
I
 
L
R
 
Q
R
 
K
E
 
E
L
 
L
L
 
N
T
 
V
T
 
A
M
 
M
G
 
A
F
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
C
P
 
S
T
 
Q
V
 
L
A
 
Q
D
 
D
I
 
I

P0DUR7 FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase qulF; Quinolactacin A2 biosynthesis cluster protein F; EC 1.13.12.- from Penicillium citrinum (see paper)
35% identity, 97% coverage: 2:375/384 of query aligns to 25:383/402 of P0DUR7

query
sites
P0DUR7
A
 
A
V
 
I
T
 
T
A
 
T
S
 
N
L
 
P
N
 
T
I
 
L
A
 
L
E
 
E
A
 
-
R
 
-
Q
 
K
R
 
H
A
 
A
R
 
R
A
 
E
R
 
V
L
 
L
P
 
S
R
 
S
G
 
R
L
 
A
F
 
Y
E
 
S
Y
 
Y
I
 
I
D
 
A
R
 
G
G
 
G
A
 
A
E
 
G
D
 
E
E
 
K
T
 
S
G
 
T
I
 
M
A
 
E
T
 
A
S
 
N
K
 
R
T
 
L
A
 
A
L
 
F
D
 
R
S
 
Q
L
 
W
V
 
K
F
 
L
K
 
V
P
 
P
R
 
R
V
 
V
L
 
M
V
 
R
D
 
P
V
 
M
S
 
D
K
 
D
R
 
Q
D
 
S
A
 
I
T
 
S
T
 
V
R
 
N
L
 
L
F
 
F
G
 
G
V
 
Q
D
 
E
Q
 
Y
P
 
K
M
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
I
V
 
V
A
 
G
P
 
P
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
V
 
F
W
 
H
Y
 
R
D
 
D
G
 
K
E
 
E
V
 
T
E
 
G
L
 
V
A
 
A
K
 
Q
A
 
V
A
 
C
A
 
S
A
 
E
V
 
L
G
 
D
I
 
V
P
 
P
F
 
Y
C
 
T
V
 
L
S
 
S
T
 
T
Q
 
A
S
 
S
I
 
S
T
 
S
S
 
S
V
 
I
E
 
E
R
 
D
I
 
V
A
 
A
-
 
A
-
 
A
G
 
N
E
 
Q
S
 
A
G
 
G
A
 
H
R
 
R
L
 
-
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
V
 
W
W
 
V
R
 
H
S
 
D
R
 
E
E
 
E
R
 
I
T
 
L
R
 
L
E
 
S
L
 
L
V
 
L
R
 
K
R
 
R
A
 
A
E
 
K
R
 
E
A
 
N
G
 
G
A
 
F
E
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
V
L
 
V
T
 
S
V
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
W
V
 
T
T
 
L
P
 
G
N
 
W
R
 
R
E
 
P
Y
 
T
N
 
D
V
 
L
R
 
D
N
 
Q
G
 
G
F
 
Y
G
 
-
I
 
F
P
 
P
I
 
F
K
 
Y
P
 
A
S
 
G
V
 
I
R
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
N
D
 
D
C
 
V
-
 
G
L
 
F
A
 
S
H
 
D
P
 
P
R
 
-
W
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
V
F
 
F
-
 
R
A
 
A
K
 
K
Y
 
H
L
 
E
R
 
K
N
 
K
G
 
G
G
 
G
V
 
K
P
 
I
T
 
E
Y
 
-
A
 
-
H
 
-
Y
 
-
P
 
D
D
 
D
E
 
I
F
 
I
R
 
G
T
 
A
A
 
A
L
 
N
G
 
A
R
 
W
V
 
V
A
 
S
V
 
E
G
 
L
D
 
D
E
 
D
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
R
D
 
P
V
 
H
G
 
T
W
 
W
G
 
E
D
 
Q
V
 
V
R
 
E
S
 
F
L
 
L
R
 
R
D
 
K
A
 
H
W
 
W
K
 
Q
G
 
G
K
 
P
L
 
I
I
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
L
 
Q
R
 
H
A
 
A
D
 
D
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
E
L
 
T
G
 
G
V
 
C
D
 
E
G
 
G
I
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
A
 
G
R
 
R
N
 
Q
L
 
V
D
 
D
H
 
G
A
 
A
I
 
I
H
 
G
P
 
S
V
 
L
R
 
D
C
 
A
L
 
L
T
 
P
D
 
D
I
 
I
A
 
V
E
 
D
R
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
K
V
 
M
T
 
T
V
 
V
L
 
M
A
 
F
D
 
D
S
 
S
G
 
G
V
 
V
R
 
R
R
 
T
G
 
G
S
 
A
H
 
D
V
 
V
A
 
I
G
 
K
Y
 
A
L
 
L
G
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
P
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
I
D
 
G
G
 
G
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
V
 
V
L
 
I
E
 
E
M
 
C
I
 
L
R
 
L
R
 
A
E
 
D
L
 
L
L
 
W
T
 
Q
T
 
G
M
 
M
G
 
G
F
 
L
L
 
A
G
 
G
A
 
M
P
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
D

5zzqA The crystal structure of mandelate oxidase with (s)-4-hydroxymandelic acid (see paper)
35% identity, 96% coverage: 7:373/384 of query aligns to 2:342/355 of 5zzqA

query
sites
5zzqA
L
 
V
N
 
S
I
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
L
R
 
E
Q
 
R
R
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
D
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
G
G
 
E
L
 
I
F
 
F
E
 
D
Y
 
F
I
 
L
D
 
A
R
 
G
G
 
G
A
 
S
E
 
G
D
 
T
E
 
E
T
 
A
G
 
S
I
 
L
A
 
V
T
 
A
S
 
N
K
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
S
 
R
L
 
V
V
 
F
F
 
V
K
 
I
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
D
V
 
L
S
 
T
K
 
D
R
 
V
D
 
T
A
 
T
T
 
E
T
 
I
R
 
D
L
 
I
F
 
F
G
 
G
V
 
R
D
 
R
Q
 
A
P
 
A
M
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
T
x
V
A
|
A
V
 
Y
A
 
Q
G
 
R
L
 
L
V
 
F
W
 
H
Y
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
D
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
F
 
Y
C
 
T
V
 
I
S
 
C
T
 
T
Q
x
L
S
 
S
I
 
S
T
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
A
E
 
-
S
 
V
G
 
G
A
 
G
R
 
R
L
 
P
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
W
W
 
L
R
 
R
S
 
D
R
 
E
E
 
K
R
 
R
T
 
S
R
 
L
E
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
R
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
T
 
V
A
 
P
V
 
W
T
x
M
P
 
G
N
 
R
R
|
R
E
 
L
Y
 
R
N
 
D
V
 
M
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
A
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
E
C
 
W
L
 
V
A
 
T
H
 
A
P
 
A
R
 
N
W
 
F
F
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
T
F
 
-
A
 
A
K
 
A
Y
 
H
L
 
R
R
 
R
N
 
T
G
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
S
T
 
A
Y
 
V
A
 
A
-
 
D
H
 
H
Y
x
T
P
 
A
D
 
R
E
 
E
F
|
F
R
 
A
T
 
P
A
 
A
L
 
T
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
W
 
W
G
 
E
D
 
S
V
 
V
R
 
E
S
 
A
L
 
V
R
 
R
D
 
A
A
 
H
W
 
T
K
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
I
 
V
L
 
L
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
A
A
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
A
 
G
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
A
I
 
V
H
 
P
P
 
G
V
 
I
R
 
E
C
 
M
L
 
L
T
 
G
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
A
R
 
A
V
 
V
G
 
S
D
 
G
R
 
G
V
 
C
T
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
V
D
|
D
S
 
G
G
|
G
V
 
I
R
|
R
R
 
S
G
 
G
S
 
G
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
T
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
V
L
 
M
Y
 
W
G
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
D
G
 
G
A
 
V
Q
 
R
A
 
Q
V
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
L
I
 
L
R
 
A
R
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
R
T
 
D
T
 
A
M
 
M
G
 
G
F
 
L
L
 
A
G
 
G
A
 
C
P
 
E
T
 
S
V
 
V

6a24A The crystal structure of mandelate oxidase with 3-fluoropyruvate (see paper)
35% identity, 96% coverage: 7:373/384 of query aligns to 2:342/354 of 6a24A

query
sites
6a24A
L
 
V
N
 
S
I
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
L
R
 
E
Q
 
R
R
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
D
R
 
V
L
 
L
P
 
P
R
 
G
G
 
E
L
 
I
F
 
F
E
 
D
Y
 
F
I
 
L
D
 
A
R
 
G
G
 
G
A
 
S
E
 
G
D
 
T
E
 
E
T
 
A
G
 
S
I
 
L
A
 
V
T
 
A
S
 
N
K
 
R
T
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
E
S
 
R
L
 
V
V
 
F
F
 
V
K
 
I
P
 
P
R
 
R
V
 
M
L
 
L
V
 
R
D
 
D
V
 
L
S
 
T
K
 
D
R
 
V
D
 
T
A
 
T
T
 
E
T
 
I
R
 
D
L
 
I
F
 
F
G
 
G
V
 
R
D
 
R
Q
 
A
P
 
A
M
 
L
P
 
P
L
 
M
V
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
T
x
V
A
|
A
V
 
Y
A
 
Q
G
 
R
L
 
L
V
 
F
W
 
H
Y
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
R
A
 
D
V
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
F
 
Y
C
 
T
V
 
I
S
 
C
T
 
T
Q
 
L
S
 
S
I
 
S
T
 
V
S
 
S
V
 
L
E
 
E
R
 
E
I
 
I
A
 
A
G
 
A
E
 
-
S
 
V
G
 
G
A
 
G
R
 
R
L
 
P
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
W
W
 
L
R
 
R
S
 
D
R
 
E
E
 
K
R
 
R
T
 
S
R
 
L
E
 
D
L
 
L
V
 
V
R
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
R
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
C
E
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
L
 
F
T
|
T
V
 
V
D
|
D
T
 
V
A
 
P
V
 
W
T
 
M
P
 
G
N
 
R
R
|
R
E
 
L
Y
 
R
N
 
D
V
 
M
R
 
R
N
 
N
G
 
G
F
 
F
G
 
A
I
 
L
P
 
P
I
 
-
K
 
-
P
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
E
C
 
W
L
 
V
A
 
T
H
 
A
P
 
A
R
 
N
W
 
F
F
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
T
F
 
-
A
 
A
K
 
A
Y
 
H
L
 
R
R
 
R
N
 
T
G
 
Q
G
 
G
V
 
V
P
 
S
T
 
A
Y
 
V
A
 
A
-
 
D
H
 
H
Y
 
T
P
 
A
D
 
R
E
 
E
F
 
F
R
 
A
T
 
P
A
 
A
L
 
T
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
V
 
-
G
 
-
W
 
W
G
 
E
D
 
S
V
 
V
R
 
E
S
 
A
L
 
V
R
 
R
D
 
A
A
 
H
W
 
T
K
 
D
G
 
L
K
 
P
L
 
V
I
 
V
L
 
L
K
|
K
G
 
G
V
 
I
L
 
L
R
 
A
A
 
V
D
 
E
D
 
D
A
 
A
E
 
R
K
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
A
 
G
R
|
R
N
 
Q
L
 
L
D
 
D
H
 
G
A
 
A
I
 
V
H
 
P
P
 
G
V
 
I
R
 
E
C
 
M
L
 
L
T
 
G
D
 
E
I
 
I
A
 
V
E
 
A
R
 
A
V
 
V
G
 
S
D
 
G
R
 
G
V
 
C
T
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
V
D
|
D
S
x
G
G
|
G
V
 
I
R
|
R
R
 
S
G
 
G
S
 
G
H
 
D
V
 
V
A
 
L
G
 
K
Y
 
A
L
 
T
G
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
S
G
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
V
 
V
L
 
M
Y
 
W
G
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
A
D
 
A
G
 
G
A
 
Q
A
 
D
G
 
G
A
 
V
Q
 
R
A
 
Q
V
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
L
I
 
L
R
 
A
R
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
R
T
 
D
T
 
A
M
 
M
G
 
G
F
 
L
L
 
A
G
 
G
A
 
C
P
 
E
T
 
S
V
 
V

Query Sequence

>AZOBR_RS27055 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS27055
MAVTASLNIAEARQRARARLPRGLFEYIDRGAEDETGIATSKTALDSLVFKPRVLVDVSK
RDATTRLFGVDQPMPLVVAPTAVAGLVWYDGEVELAKAAAAVGIPFCVSTQSITSVERIA
GESGARLWFQLYVWRSRERTRELVRRAERAGAEALVLTVDTAVTPNREYNVRNGFGIPIK
PSVRAGLDCLAHPRWFAGVFAKYLRNGGVPTYAHYPDEFRTALGRVAVGDEIGLAQDVGW
GDVRSLRDAWKGKLILKGVLRADDAEKAAELGVDGIVVSNHGARNLDHAIHPVRCLTDIA
ERVGDRVTVLADSGVRRGSHVAGYLGLGAQGVLLGRAVLYGLATDGAAGAQAVLEMIRRE
LLTTMGFLGAPTVADIVGTVERPR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory