SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS27480 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS27480 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

5y6qB Crystal structure of an aldehyde oxidase from methylobacillus sp. Ky4400 (see paper)
44% identity, 99% coverage: 1:329/333 of query aligns to 1:327/330 of 5y6qB

query
sites
5y6qB
M
 
M
K
 
N
P
 
P
L
 
F
S
 
H
Y
 
W
V
 
K
R
 
V
A
 
A
R
 
Q
T
 
S
A
 
A
R
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
A
V
 
L
A
 
K
A
 
Q
G
 
Q
E
 
S
S
 
G
A
 
S
R
 
Q
Y
x
I
I
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
x
T
L
x
Q
Y
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
M
K
 
K
L
 
C
G
 
G
I
 
V
E
 
F
K
 
N
P
 
P
A
 
P
H
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
G
I
 
I
A
 
N
D
 
G
L
 
L
D
 
S
G
 
E
A
 
L
N
 
R
R
 
S
I
 
L
D
 
S
T
 
F
D
 
D
G
 
N
D
 
D
R
 
K
L
 
I
F
 
S
F
 
A
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
I
L
 
T
M
 
M
A
 
S
D
 
Q
V
 
L
A
 
A
E
 
D
H
 
H
P
 
P
V
 
D
V
 
C
R
 
Q
D
 
Q
D
 
H
Y
 
A
P
 
P
V
 
A
L
 
I
A
 
Y
E
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
W
K
 
Q
A
|
A
A
|
A
S
 
S
Q
 
P
Q
 
Q
L
x
I
R
 
R
N
 
N
M
 
M
A
|
A
T
|
T
V
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
L
x
R
Q
|
Q
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
|
C
P
 
A
Y
 
Y
F
x
Y
R
 
R
N
 
D
G
 
P
A
 
A
N
 
T
G
 
F
A
 
S
Y
 
-
P
 
A
C
|
C
N
|
N
K
 
K
R
 
R
E
 
N
P
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
|
C
A
 
A
A
|
A
I
 
R
G
 
Q
G
 
G
L
 
V
D
 
N
R
 
S
S
 
N
Q
 
H
A
 
A
V
 
I
L
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
D
A
 
S
C
|
C
N
x
I
A
|
A
V
 
V
S
 
Y
P
 
P
G
|
G
D
|
D
W
 
L
P
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
L
M
 
V
A
 
A
M
 
F
D
 
D
A
 
A
A
 
V
I
 
V
E
 
I
L
 
V
Q
 
Q
G
 
N
L
 
P
D
 
Q
G
 
G
-
 
E
T
 
T
R
 
R
V
 
R
I
 
I
P
 
A
I
 
I
A
 
D
E
 
D
L
 
F
Y
 
F
R
 
L
P
 
L
P
 
P
S
 
G
R
 
E
T
 
T
P
 
P
H
 
D
L
 
Q
E
 
E
F
 
H
T
 
D
I
 
L
G
 
R
R
 
D
E
 
D
E
 
E
I
|
I
V
x
I
T
 
V
G
 
A
I
 
I
S
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
Q
T
 
T
T
 
A
A
 
S
G
 
L
R
 
Q
T
 
R
S
 
S
T
 
H
Y
 
Y
L
 
L
K
|
K
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
E
 
S
S
 
S
Y
 
Y
A
 
E
F
|
F
A
 
A
L
 
A
V
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
G
L
 
F
E
 
T
M
 
L
D
 
E
G
 
N
D
 
G
R
 
V
V
 
M
R
 
R
Q
 
Q
A
 
V
H
 
H
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
R
A
 
A
R
 
T
P
 
R
A
 
V
E
 
E
A
 
Q
L
 
A
L
 
L
R
 
E
G
 
G
E
 
Q
T
 
P
L
 
F
D
 
N
R
 
E
E
 
E
R
 
T
A
 
V
Q
 
F
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
L
A
 
I
F
 
N
A
 
Q
E
 
E
A
 
T
R
 
Q
A
 
A
G
 
L
R
 
E
H
 
H
N
 
N
A
 
A
F
 
Y
K
 
K
I
 
V
E
 
K
L
 
L
G
 
A
A
 
P
R
 
R
T
 
V
L
 
I
A
 
A
D
 
R
A
 
A
I
 
L
I
 
M
T
 
A
A
 
A
G
 
G

5g5gB Escherichia coli periplasmic aldehyde oxidase (see paper)
46% identity, 98% coverage: 1:325/333 of query aligns to 1:311/316 of 5g5gB

query
sites
5g5gB
M
 
M
K
 
K
P
 
A
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
V
 
E
R
 
R
A
 
V
R
 
N
T
 
T
A
 
P
R
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
A
I
 
L
E
 
S
A
 
A
F
 
Q
V
 
R
A
 
V
A
 
P
G
 
G
E
 
-
S
 
-
A
 
A
R
x
K
Y
x
F
I
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
|
N
L
|
L
Y
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
M
K
 
K
L
 
L
G
 
E
I
 
I
E
 
E
K
 
T
P
 
P
A
 
T
H
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
N
D
 
G
L
 
L
D
 
-
G
 
G
A
 
L
N
 
D
R
 
K
I
 
I
D
 
E
-
 
V
T
 
T
D
 
D
G
 
A
D
 
G
R
 
G
L
 
L
F
 
R
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
V
L
 
R
M
 
N
A
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
H
P
 
E
V
 
R
V
 
V
R
 
R
D
 
R
D
 
D
Y
 
Y
P
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
R
S
 
A
L
 
L
S
 
L
K
 
A
A
x
G
A
|
A
S
 
S
Q
 
G
Q
 
Q
L
|
L
R
 
R
N
 
N
M
 
Q
A
|
A
T
|
T
V
 
T
G
x
A
G
|
G
N
|
N
L
 
L
L
|
L
Q
|
Q
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
|
C
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Y
N
 
D
G
 
T
A
 
N
N
 
Q
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
P
C
|
C
N
|
N
K
|
K
R
 
R
E
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
|
C
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
E
G
 
G
L
 
F
D
 
S
R
 
R
S
 
Q
Q
x
H
A
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
V
S
 
S
A
 
E
A
 
A
C
|
C
N
x
I
A
|
A
V
 
T
S
 
H
P
 
P
G
x
S
D
|
D
W
 
M
P
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
M
M
 
R
A
 
L
M
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
V
I
 
V
E
 
E
L
 
T
Q
 
I
G
 
T
L
 
P
D
 
E
G
 
G
-
 
K
T
 
T
R
 
R
V
 
S
I
 
I
P
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
F
Y
 
Y
R
 
H
P
 
P
P
 
P
S
 
G
R
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
L
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
A
I
 
L
G
 
L
R
 
P
E
 
G
E
 
E
I
x
L
V
x
I
T
 
V
G
 
A
I
 
V
S
 
T
V
 
L
P
 
P
K
 
P
T
 
P
T
 
L
A
 
G
G
 
G
R
 
K
T
 
-
S
 
H
T
 
I
Y
 
Y
L
 
R
K
 
K
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
E
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
F
|
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
I
L
 
I
E
 
Q
M
 
P
D
 
D
G
 
G
D
 
S
R
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
G
H
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
H
V
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
R
A
 
I
R
 
E
P
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
R
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
S
E
 
Q
R
 
G
A
 
A
Q
 
Q
E
 
A
A
 
V
A
 
Y
R
 
D
A
 
T
A
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
A
R
 
H
A
 
P
G
 
T
R
 
A
H
 
E
N
 
N
A
 
T
F
 
F
K
 
K
I
 
L
E
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
K
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
S
A
 
V
I
 
L

P77324 Aldehyde oxidoreductase FAD-binding subunit PaoB; EC 1.2.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
46% identity, 98% coverage: 1:325/333 of query aligns to 1:311/318 of P77324

query
sites
P77324
M
 
M
K
 
K
P
 
A
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
V
 
E
R
 
R
A
 
V
R
 
N
T
 
T
A
 
P
R
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
A
I
 
L
E
 
S
A
 
A
F
 
Q
V
 
R
A
 
V
A
 
P
G
 
G
E
 
-
S
 
-
A
 
A
R
x
K
Y
x
F
I
|
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
|
N
L
|
L
Y
 
L
D
 
D
L
 
L
M
 
M
K
 
K
L
 
L
G
 
E
I
 
I
E
 
E
K
 
T
P
 
P
A
 
T
H
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
N
D
 
G
L
 
L
D
 
-
G
 
G
A
 
L
N
 
D
R
 
K
I
 
I
D
 
E
-
 
V
T
 
T
D
 
D
G
 
A
D
 
G
R
 
G
L
 
L
F
 
R
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
V
L
 
R
M
 
N
A
 
T
D
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
H
P
 
E
V
 
R
V
 
V
R
 
R
D
 
R
D
 
D
Y
 
Y
P
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
S
E
 
R
S
 
A
L
 
L
S
 
L
K
 
A
A
 
G
A
 
A
S
 
S
Q
 
G
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
N
 
N
M
 
Q
A
 
A
T
|
T
V
 
T
G
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
T
 
T
R
 
R
C
|
C
P
 
P
Y
 
Y
F
 
F
R
 
Y
N
 
D
G
 
T
A
 
N
N
 
Q
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
P
C
|
C
N
 
N
K
 
K
R
 
R
E
 
L
P
 
P
G
 
G
S
 
S
G
 
G
C
|
C
A
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
E
G
 
G
L
 
F
D
 
S
R
 
R
S
 
Q
Q
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
V
G
 
G
A
 
V
S
 
S
A
 
E
A
 
A
C
|
C
N
 
I
A
 
A
V
 
T
S
 
H
P
 
P
G
 
S
D
|
D
W
 
M
P
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
M
M
 
R
A
 
L
M
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
V
I
 
V
E
 
E
L
 
T
Q
 
I
G
 
T
L
 
P
D
 
E
G
 
G
-
 
K
T
 
T
R
 
R
V
 
S
I
 
I
P
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
F
Y
 
Y
R
 
H
P
 
P
P
 
P
S
 
G
R
 
K
T
 
T
P
 
P
H
 
H
L
 
I
E
 
E
F
 
T
T
 
A
I
 
L
G
 
L
R
 
P
E
 
G
E
 
E
I
 
L
V
x
I
T
 
V
G
 
A
I
 
V
S
 
T
V
 
L
P
 
P
K
 
P
T
 
P
T
 
L
A
 
G
G
 
G
R
 
K
T
 
-
S
 
H
T
 
I
Y
 
Y
L
 
R
K
|
K
V
 
V
R
 
R
D
 
D
R
 
R
E
 
A
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
V
S
 
S
A
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
I
L
 
I
E
 
Q
M
 
P
D
 
D
G
 
G
D
 
S
R
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
A
 
G
H
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
H
V
 
K
P
 
P
W
 
W
R
 
R
A
 
I
R
 
E
P
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
Q
L
 
L
R
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
S
E
 
Q
R
 
G
A
 
A
Q
 
Q
E
 
A
A
 
V
A
 
Y
R
 
D
A
 
T
A
 
L
F
 
F
A
 
A
E
 
S
A
 
A
R
 
H
A
 
P
G
 
T
R
 
A
H
 
E
N
 
N
A
 
T
F
 
F
K
 
K
I
 
L
E
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
K
R
 
R
T
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
S
A
 
V
I
 
L

1rm6B Structure of 4-hydroxybenzoyl-coa reductase from thauera aromatica (see paper)
35% identity, 85% coverage: 8:289/333 of query aligns to 11:278/323 of 1rm6B

query
sites
1rm6B
R
 
R
A
 
P
R
 
A
T
 
T
A
 
L
R
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
N
A
 
A
F
 
L
V
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
A
E
 
E
S
 
A
A
 
T
R
 
L
Y
x
P
I
 
L
A
x
G
G
x
A
G
|
G
T
|
T
N
x
D
L
|
L
Y
 
L
D
 
P
L
 
N
M
 
L
K
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
L
E
 
G
K
 
H
P
 
P
A
 
A
H
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
I
x
L
A
 
T
D
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
L
N
 
A
R
 
T
I
 
I
D
 
S
T
 
T
D
 
L
G
 
A
D
 
D
-
 
G
R
 
S
L
 
L
F
 
R
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
T
M
 
L
A
 
E
D
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
D
V
 
A
V
 
I
R
 
R
D
 
T
D
 
T
Y
 
W
P
 
P
V
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
L
 
A
S
 
E
K
 
S
A
x
V
A
|
A
S
 
G
Q
 
P
Q
 
T
L
 
H
R
 
R
N
 
A
M
 
A
A
|
A
T
|
T
V
 
L
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
L
x
C
Q
|
Q
R
 
D
T
 
T
R
 
R
C
|
C
P
 
T
Y
x
F
F
 
Y
R
 
N
N
 
Q
G
 
S
A
 
E
-
 
W
-
 
W
-
 
R
N
 
S
G
 
G
A
 
N
Y
 
G
P
 
Y
C
|
C
N
 
L
K
 
K
R
 
Y
E
 
K
P
 
-
G
 
G
S
 
D
G
 
K
C
|
C
A
x
H
A
x
V
I
 
I
G
 
V
G
 
K
L
 
S
D
 
D
R
 
R
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
C
|
C
N
x
Y
A
|
A
V
 
T
S
 
Y
P
 
H
G
 
G
D
|
D
W
 
V
P
 
A
V
 
P
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
V
M
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
R
I
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
V
G
 
G
L
 
P
D
 
A
G
 
G
T
 
K
R
 
R
V
 
T
I
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
Y
 
F
R
 
R
P
 
-
P
 
E
S
 
S
R
 
G
T
 
A
P
 
E
H
 
H
L
 
L
E
 
-
F
 
-
T
 
T
I
 
L
G
 
E
R
 
K
E
 
G
E
 
E
I
 
L
V
x
L
T
 
A
G
 
A
I
 
I
S
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
P
T
 
T
T
 
G
A
 
A
G
 
W
R
 
-
T
 
S
S
 
A
T
 
A
Y
 
Y
L
 
S
K
 
K
V
 
V
R
 
R
D
 
I
R
 
R
E
 
D
S
 
A
Y
x
V
A
x
D
F
|
F
A
 
P
L
 
L
V
 
A
S
 
G
A
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
R
D
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
R
 
A
Q
 
G
A
 
L
H
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
N
T
 
S
V
 
A
P
 
P
W
 
L
R
 
M
A
 
V
R
 
-
P
 
P
A
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
G
G
 
G
E
 
N
T
 
W
L
 
D
D
 
D

O33820 4-hydroxybenzoyl-CoA reductase subunit beta; 4-HBCR subunit beta; EC 1.1.7.1 from Thauera aromatica (see paper)
35% identity, 85% coverage: 8:289/333 of query aligns to 11:278/324 of O33820

query
sites
O33820
R
 
R
A
 
P
R
 
A
T
 
T
A
 
L
R
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
N
A
 
A
F
 
L
V
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
A
E
 
E
S
 
A
A
 
T
R
 
L
Y
x
P
I
x
L
A
x
G
G
x
A
G
|
G
T
|
T
N
x
D
L
|
L
Y
 
L
D
 
P
L
 
N
M
 
L
K
 
R
L
 
R
G
 
G
I
 
L
E
 
G
K
 
H
P
 
P
A
 
A
H
 
A
L
 
L
I
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
T
D
 
G
L
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
L
N
 
A
R
 
T
I
 
I
D
 
S
T
 
T
D
 
L
G
 
A
D
 
D
-
 
G
R
 
S
L
 
L
F
 
R
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
T
M
 
L
A
 
E
D
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
E
H
 
H
P
 
D
V
 
A
V
 
I
R
 
R
D
 
T
D
 
T
Y
 
W
P
 
P
V
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
S
 
A
L
 
A
S
 
E
K
 
S
A
 
V
A
 
A
S
 
G
Q
 
P
Q
 
T
L
 
H
R
 
R
N
 
A
M
 
A
A
 
A
T
|
T
V
 
L
G
 
G
G
 
G
N
|
N
L
 
L
L
 
C
Q
|
Q
R
 
D
T
 
T
R
 
R
C
 
C
P
 
T
Y
 
F
F
 
Y
R
 
N
N
 
Q
G
 
S
A
 
E
-
 
W
-
 
W
-
 
R
N
 
S
G
 
G
A
 
N
Y
 
G
P
 
Y
C
 
C
N
 
L
K
 
K
R
 
Y
E
 
K
P
 
-
G
 
G
S
 
D
G
 
K
C
 
C
A
 
H
A
 
V
I
 
I
G
 
V
G
 
K
L
 
S
D
 
D
R
 
R
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
C
N
 
Y
A
 
A
V
 
T
S
 
Y
P
 
H
G
 
G
D
|
D
W
 
V
P
 
A
V
 
P
A
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
V
M
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
R
I
 
A
E
 
E
L
 
I
Q
 
V
G
 
G
L
 
P
D
 
A
G
 
G
T
 
K
R
 
R
V
 
T
I
 
V
P
 
P
I
 
V
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
Y
 
F
R
 
R
P
 
-
P
 
E
S
 
S
R
 
G
T
 
A
P
 
E
H
 
H
L
 
L
E
 
-
F
 
-
T
 
T
I
 
L
G
 
E
R
 
K
E
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
A
G
 
A
I
 
I
S
 
E
V
 
V
P
 
P
K
 
P
T
 
T
T
 
G
A
 
A
G
 
W
R
 
-
T
 
S
S
 
A
T
 
A
Y
 
Y
L
 
S
K
|
K
V
 
V
R
 
R
D
 
I
R
 
R
E
 
D
S
 
A
Y
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
P
L
 
L
V
 
A
S
 
G
A
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
R
D
 
D
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
R
 
A
Q
 
G
A
 
L
H
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
T
G
 
G
V
 
S
A
 
N
T
 
S
V
 
A
P
 
P
W
 
L
R
 
M
A
 
V
R
 
-
P
 
P
A
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
R
 
G
G
 
G
E
 
N
T
 
W
L
 
D
D
 
D

4zohB Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
27% identity, 97% coverage: 6:328/333 of query aligns to 8:272/274 of 4zohB

query
sites
4zohB
Y
 
Y
V
 
V
R
 
I
A
 
P
R
 
D
T
 
N
A
 
L
R
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
-
F
 
F
V
 
L
A
 
E
A
 
E
G
 
H
E
 
Q
S
 
D
A
 
A
R
|
R
Y
x
P
I
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
N
x
S
L
|
L
Y
 
I
D
 
P
L
 
M
M
 
L
K
 
K
L
 
L
G
 
R
I
 
L
E
 
I
K
 
R
P
 
P
A
 
S
H
 
Y
L
 
I
I
 
V
D
 
E
I
 
I
A
 
R
D
 
R
L
 
F
D
 
S
G
 
N
A
 
L
N
 
S
R
 
Y
I
 
I
D
 
T
T
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
N
R
 
L
L
 
Y
F
 
K
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
T
L
 
T
M
x
H
A
 
Y
D
 
N
V
 
I
A
 
S
E
 
K
H
 
S
P
 
S
V
 
I
V
 
-
R
 
-
D
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
S
E
 
E
S
 
T
L
 
A
S
 
S
K
 
N
A
x
I
A
x
G
S
 
D
Q
 
P
Q
 
Q
L
x
V
R
 
R
N
 
N
M
 
M
A
 
G
T
|
T
V
 
I
G
 
G
G
|
G
N
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
x
S
I
 
I
G
x
S
G
 
H
L
 
L
D
 
D
R
 
P
S
 
S
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
G
x
A
D
|
D
W
 
Y
P
 
P
V
 
A
A
 
A
L
 
L
M
 
I
A
 
A
M
 
M
D
 
D
A
 
A
A
 
K
I
 
V
E
 
K
L
 
I
Q
 
T
G
 
S
L
 
R
D
 
K
G
 
G
T
 
D
R
 
R
V
 
V
I
 
V
P
 
N
I
 
F
A
 
K
E
 
S
L
 
F
Y
 
A
R
 
K
P
 
D
P
 
-
S
 
M
R
 
F
T
 
T
P
 
P
H
 
D
L
 
L
E
 
-
F
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
N
R
 
P
E
 
G
E
 
E
I
x
L
V
|
V
T
 
T
G
 
E
I
 
I
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
K
 
-
T
 
T
T
 
F
A
 
E
G
 
G
R
 
Y
T
 
K
S
 
F
T
 
S
Y
 
Y
L
 
Q
K
 
K
V
 
L
R
 
-
D
 
E
R
 
R
E
 
R
S
 
A
Y
 
G
A
x
D
F
|
F
A
 
A
L
 
I
V
 
V
S
 
G
A
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
L
L
 
L
E
 
K
M
 
L
D
 
S
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
I
R
 
E
Q
 
D
A
 
V
H
 
R
V
 
I
A
 
G
L
 
L
G
 
T
G
 
A
V
 
V
A
 
N
T
 
N
V
 
V
P
 
A
W
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
K
P
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
E
L
 
L
R
 
L
G
 
G
E
 
K
T
 
R
L
 
L
D
 
N
R
 
D
E
 
E
R
 
I
A
 
I
Q
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
T
A
 
R
A
 
A
F
 
M
A
 
E
E
 
S
A
 
A
R
 
N
A
 
P
G
 
T
R
 
S
H
 
G
N
 
S
A
 
A
-
 
E
F
x
Y
K
 
K
I
 
K
E
 
K
L
 
M
G
 
V
A
 
K
R
 
V
T
 
L
L
 
T
A
 
K
D
 
R
A
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
A
 
A

1n5wC Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); oxidized form (see paper)
26% identity, 99% coverage: 4:333/333 of query aligns to 6:287/287 of 1n5wC

query
sites
1n5wC
L
 
F
S
 
D
Y
 
Y
V
 
H
R
 
R
A
 
P
R
 
K
T
 
S
A
 
I
R
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
A
A
 
L
F
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
P
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
x
H
N
 
S
L
 
L
Y
 
I
D
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
K
L
 
T
G
 
R
I
 
L
E
 
A
K
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
L
I
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
R
D
 
D
L
 
I
D
 
G
G
 
D
A
 
L
N
 
V
R
 
G
I
 
I
D
 
R
T
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
T
R
 
D
L
 
V
F
 
V
F
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
A
D
 
M
V
 
T
A
 
T
E
 
Q
H
 
H
P
 
A
V
 
L
V
 
I
R
 
G
D
 
S
D
 
D
Y
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
R
E
 
E
S
 
T
L
 
S
S
 
L
K
 
L
A
x
I
A
|
A
S
 
D
Q
 
P
Q
 
Q
L
 
I
R
 
R
N
 
Y
M
 
M
A
 
G
T
 
T
V
 
I
G
 
G
G
 
G
N
|
N
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
A
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
D
P
 
P
G
 
G
S
x
N
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
D
|
D
W
 
M
P
 
P
V
 
A
A
 
L
L
 
M
M
 
Q
A
 
C
M
 
L
D
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
E
 
E
L
 
L
Q
 
T
G
 
G
L
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
R
V
 
I
I
 
V
P
 
A
I
 
A
A
 
R
E
 
D
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
Q
P
 
G
P
 
A
S
 
Y
R
 
F
T
 
T
P
 
-
H
 
-
L
 
-
E
 
-
F
 
-
T
 
A
I
 
I
G
 
E
R
 
P
E
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
T
G
 
A
I
 
I
S
 
R
V
 
I
P
 
P
K
 
V
T
 
P
T
 
P
A
 
T
G
 
G
R
 
H
T
 
G
S
 
Y
T
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
K
V
 
L
R
 
K
D
 
-
R
 
R
E
 
K
S
 
I
Y
 
G
A
 
D
F
x
Y
A
 
A
L
 
T
V
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
L
E
 
T
M
 
M
D
 
S
G
 
G
D
 
G
R
 
K
V
 
C
R
 
V
Q
 
T
A
 
A
H
 
S
V
 
I
A
 
G
L
 
L
G
 
T
G
 
N
V
 
V
A
 
A
T
 
N
V
 
T
P
 
P
W
 
L
R
 
W
A
 
A
R
 
E
P
 
E
A
 
A
E
 
G
A
 
K
L
 
V
L
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
L
E
 
D
R
 
K
A
 
A
Q
 
V
E
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
P
A
 
A
R
 
S
A
 
D
G
 
G
R
 
R
H
 
G
N
 
P
A
 
A
-
 
E
F
 
Y
K
 
R
I
 
T
E
 
K
L
 
M
G
 
A
A
 
G
R
 
V
T
 
M
L
 
L
A
 
R
D
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
E
T
 
R
A
 
A
G
 
K
S
 
A
K
 
R
S
 
A
K
 
K

P19920 Carbon monoxide dehydrogenase medium chain; CO dehydrogenase subunit M; CO-DH M; EC 1.2.5.3 from Afipia carboxidovorans (strain ATCC 49405 / DSM 1227 / KCTC 32145 / OM5) (Oligotropha carboxidovorans) (see 2 papers)
26% identity, 99% coverage: 4:333/333 of query aligns to 6:287/288 of P19920

query
sites
P19920
L
 
F
S
 
D
Y
 
Y
V
 
H
R
 
R
A
 
P
R
 
K
T
 
S
A
 
I
R
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
V
E
 
A
A
 
L
F
 
L
V
 
T
A
 
K
A
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
 
P
I
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
N
x
S
L
 
L
Y
 
I
D
 
P
L
 
I
M
 
M
K
 
K
L
 
T
G
 
R
I
 
L
E
 
A
K
 
T
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
L
I
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
R
D
 
D
L
 
I
D
 
G
G
 
D
A
 
L
N
 
V
R
 
G
I
 
I
D
 
R
T
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
T
R
 
D
L
 
V
F
 
V
F
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
M
 
-
A
 
A
D
 
M
V
 
T
A
 
T
E
 
Q
H
 
H
P
 
A
V
 
L
V
 
I
R
 
G
D
 
S
D
 
D
Y
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
I
A
 
R
E
 
E
S
 
T
L
 
S
S
 
L
K
 
L
A
 
I
A
 
A
S
 
D
Q
 
P
Q
 
Q
L
 
I
R
 
R
N
 
Y
M
 
M
A
 
G
T
|
T
V
x
I
G
|
G
G
|
G
N
|
N
L
 
-
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
A
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
D
P
 
P
G
 
G
S
 
N
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
D
W
 
M
P
 
P
V
 
A
A
 
L
L
 
M
M
 
Q
A
 
C
M
 
L
D
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
Y
E
 
E
L
 
L
Q
 
T
G
 
G
L
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
A
R
 
R
V
 
I
I
 
V
P
 
A
I
 
A
A
 
R
E
 
D
L
 
Y
Y
 
Y
R
 
Q
P
 
G
P
 
A
S
 
Y
R
 
F
T
 
T
P
 
-
H
 
-
L
 
-
E
 
-
F
 
-
T
 
A
I
 
I
G
 
E
R
 
P
E
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
T
 
T
G
 
A
I
 
I
S
 
R
V
 
I
P
 
P
K
 
V
T
 
P
T
 
P
A
 
T
G
 
G
R
 
H
T
 
G
S
 
Y
T
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
K
V
 
L
R
 
K
D
 
-
R
 
R
E
 
K
S
 
I
Y
 
G
A
 
D
F
 
Y
A
 
A
L
 
T
V
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
L
E
 
T
M
 
M
D
 
S
G
 
G
D
 
G
R
 
K
V
 
C
R
 
V
Q
 
T
A
 
A
H
 
S
V
 
I
A
 
G
L
 
L
G
 
T
G
 
N
V
 
V
A
 
A
T
 
N
V
 
T
P
 
P
W
 
L
R
 
W
A
 
A
R
 
E
P
 
E
A
 
A
E
 
G
A
 
K
L
 
V
L
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
T
T
 
A
L
 
L
D
 
D
R
 
K
-
 
P
-
 
A
-
 
L
E
 
D
R
 
K
A
 
A
Q
 
V
E
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
I
F
 
T
A
 
A
E
 
P
A
 
A
R
 
S
A
 
D
G
 
G
R
 
R
H
 
G
N
 
P
A
 
A
-
 
E
F
 
Y
K
 
R
I
 
T
E
 
K
L
 
M
G
 
A
A
 
G
R
 
V
T
 
M
L
 
L
A
 
R
D
 
R
A
 
A
I
 
V
I
 
E
T
 
R
A
 
A
G
 
K
S
 
A
K
 
R
S
 
A
K
 
K

7dqxE Crystal structure of xanthine dehydrogenase family protein
25% identity, 86% coverage: 1:288/333 of query aligns to 1:239/293 of 7dqxE

query
sites
7dqxE
M
 
M
K
 
K
P
 
P
L
 
P
S
 
S
-
 
F
-
 
D
Y
 
Y
V
 
V
R
 
V
A
 
A
R
 
D
T
 
S
A
 
V
R
 
E
E
 
H
A
 
A
I
 
L
E
 
R
A
 
L
F
 
L
V
 
A
A
 
D
A
 
G
G
 
G
E
 
D
S
 
D
A
 
A
R
x
K
Y
x
I
I
|
I
A
 
A
G
|
G
G
|
G
T
x
Q
N
x
S
L
|
L
Y
 
V
D
 
P
L
 
L
M
 
L
K
 
N
L
 
F
G
 
R
I
 
M
E
 
S
K
 
R
P
 
P
A
 
S
H
 
L
L
 
L
I
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
N
D
 
R
L
 
V
D
 
P
G
 
G
A
 
L
N
 
A
R
 
N
I
 
I
D
 
R
T
 
K
D
 
S
G
 
D
D
 
Q
R
 
T
L
 
I
F
 
A
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
T
L
 
R
M
x
H
A
 
A
D
 
K
V
 
L
A
 
T
E
 
T
H
 
S
P
 
K
V
 
T
V
 
I
R
 
S
D
 
Q
D
 
N
Y
 
L
P
 
P
V
 
I
L
 
L
A
 
S
E
 
E
S
 
A
L
 
A
S
 
A
K
 
W
A
x
I
A
|
A
S
 
H
Q
 
P
Q
 
Q
L
x
I
R
 
R
N
 
N
M
 
R
A
x
G
T
|
T
V
 
I
G
|
G
G
|
G
N
x
S
L
 
L
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
C
x
A
N
 
H
A
 
A
V
 
D
S
 
A
P
 
A
G
x
A
D
x
E
W
 
L
P
 
P
V
 
V
A
 
V
L
 
L
M
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
Y
I
 
V
E
 
T
L
 
A
Q
 
Q
G
 
S
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
T
 
E
R
 
R
V
 
K
I
 
I
P
 
P
I
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
Y
 
L
R
 
-
P
 
-
P
 
-
S
 
-
R
 
-
T
 
V
P
 
S
H
 
H
L
 
F
E
 
V
F
 
S
T
 
S
I
 
I
G
 
L
R
 
P
E
 
G
E
 
E
I
 
L
V
x
I
T
 
V
G
 
E
I
 
V
S
 
N
V
 
V
P
 
P
K
 
Q
T
 
L
T
 
P
A
 
H
G
 
G
R
 
S
T
 
G
S
 
A
T
 
A
Y
 
F
L
 
D
K
 
E
V
 
F
R
 
S
D
 
R
R
 
R
E
 
H
-
 
G
S
 
D
Y
|
Y
A
 
A
F
 
I
A
 
G
L
 
G
V
 
A
S
 
A
A
 
S
A
 
L
V
 
V
A
 
T
L
 
L
E
 
D
M
 
E
D
 
Q
G
 
G
D
 
K
R
 
C
V
 
S
R
 
R
Q
 
A
A
 
R
H
 
I
V
 
T
A
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
G
A
 
S
T
 
T
V
 
A
P
 
-
W
 
I
R
 
R
A
 
C
R
 
Q
P
 
E
A
 
A
E
 
E
A
 
N
L
 
I
L
 
L
R
 
I
G
 
D
E
 
S
T
 
T
L
 
L

1ffuC Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
25% identity, 80% coverage: 4:270/333 of query aligns to 6:220/287 of 1ffuC

query
sites
1ffuC
L
 
F
S
 
E
Y
 
Y
V
 
H
R
 
A
A
 
P
R
 
K
T
 
S
A
 
V
R
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
A
A
 
L
F
 
L
V
 
G
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
E
 
S
S
 
D
A
 
A
R
x
K
Y
x
L
I
 
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
H
N
x
S
L
|
L
Y
 
L
D
 
P
L
 
M
M
 
M
K
 
K
L
 
L
G
 
R
I
 
F
E
 
A
K
 
Q
P
 
P
A
 
E
H
 
H
L
 
L
I
 
I
D
 
D
I
|
I
A
 
N
D
 
R
L
 
I
D
 
P
G
 
E
A
 
L
N
 
R
R
 
G
I
 
I
D
 
R
T
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
S
R
 
T
L
 
V
F
 
V
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
T
L
 
V
M
 
E
A
 
N
D
 
D
V
 
L
A
 
I
E
 
S
H
 
S
P
 
P
V
 
I
V
 
V
R
 
Q
D
 
A
D
 
R
Y
 
L
P
 
P
V
 
L
L
 
L
A
 
A
E
 
E
S
 
A
L
 
A
S
 
K
K
 
L
A
x
I
A
|
A
S
 
D
Q
 
P
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
N
 
N
M
 
R
A
x
G
T
|
T
V
 
I
G
 
G
G
|
G
N
x
D
L
 
I
L
 
-
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
A
|
A
N
 
H
G
 
G
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
D
P
 
P
G
 
G
S
x
N
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
-
N
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
D
|
D
W
 
H
P
 
P
V
 
A
A
 
L
L
 
S
M
 
I
A
 
A
M
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
H
I
 
F
E
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
L
 
P
D
 
N
G
 
G
T
 
R
R
 
R
V
 
T
I
 
V
P
 
P
I
 
A
A
 
D
E
 
G
L
 
F
Y
 
F
R
 
L
P
 
G
P
 
T
S
 
Y
R
 
M
T
 
T
P
 
-
H
 
-
L
 
-
E
 
-
F
 
-
T
 
L
I
x
L
G
 
E
R
 
E
E
 
N
E
 
E
I
x
V
V
x
M
T
 
V
G
 
E
I
 
I
S
 
R
V
 
V
P
 
P
K
 
A
T
 
F
T
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
T
T
 
G
S
 
W
T
 
A
Y
 
Y
L
 
E
K
 
K
V
 
L
R
 
K
D
 
-
R
 
R
E
 
K
S
 
T
Y
 
G
A
 
D
F
x
W
A
 
A
L
 
T
V
 
A
S
 
G
A
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
V
L
 
M
E
 
R
M
 
K
D
 
S
G
 
G
D
 
G
R
 
T
V
 
V
R
 
S
Q
 
H
A
 
I
H
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
T
G
 
N
V
 
V
A
 
A

Q0QLF4 Nicotinate dehydrogenase FAD-subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase FAD-subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see paper)
24% identity, 80% coverage: 29:294/333 of query aligns to 30:248/296 of Q0QLF4

query
sites
Q0QLF4
I
|
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
x
D
L
|
L
Y
 
V
D
 
I
L
 
E
M
 
I
K
 
N
L
 
D
G
 
R
I
 
W
E
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
D
H
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
K
D
 
K
L
 
L
D
 
K
G
 
E
A
 
L
N
 
E
R
 
Y
I
 
I
D
 
R
T
 
V
D
 
E
G
 
E
D
 
N
R
 
T
L
 
I
F
 
H
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
T
M
 
F
A
 
T
D
 
Q
V
 
I
A
 
E
E
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
F
V
 
I
R
 
R
D
 
S
D
 
H
Y
 
V
P
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
Y
E
 
K
S
 
A
L
 
A
S
 
S
K
 
Q
A
 
V
A
x
G
S
 
S
Q
 
P
Q
 
Q
L
 
I
R
 
R
N
 
N
M
 
L
A
 
G
T
|
T
V
x
I
G
|
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
L
 
S
Q
 
T
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
A
C
 
G
N
x
D
A
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
M
M
 
T
A
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
T
I
 
V
E
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
S
L
 
V
D
 
R
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
Q
I
 
M
P
 
K
I
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
F
Y
 
F
R
 
D
P
 
G
P
 
E
-
 
G
-
 
F
S
 
K
R
 
R
T
x
R
P
 
N
H
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
I
V
x
M
T
 
T
G
 
E
I
 
V
S
 
I
V
 
I
P
 
D
K
 
R
T
 
P
T
 
D
A
 
A
G
 
H
R
 
S
T
 
A
S
 
S
T
 
A
Y
 
F
L
 
Y
K
|
K
V
 
L
R
 
A
D
 
K
R
 
R
E
 
K
S
 
S
Y
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
S
L
 
V
V
 
I
S
 
G
A
 
G
A
 
G
V
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
K
M
 
V
D
 
D
G
 
D
D
 
A
R
 
G
V
 
V
-
 
C
R
 
T
Q
 
W
A
 
A
H
 
S
V
 
M
A
 
R
L
 
G
G
 
G
G
 
C
V
 
I
A
 
G
T
 
R
V
 
Y
P
 
P
W
 
L
R
 
H
A
 
F
R
 
K
P
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
M
L
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
A
T
 
P
L
 
L
D
 
T
R
 
M
E
 
E
R
 
T
A
 
M
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

3hrdG Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
24% identity, 80% coverage: 29:294/333 of query aligns to 30:248/292 of 3hrdG

query
sites
3hrdG
I
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
|
T
N
x
D
L
 
L
Y
 
V
D
 
I
L
 
E
M
 
I
K
 
N
L
 
D
G
 
R
I
 
W
E
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
D
H
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
K
D
 
K
L
 
L
D
 
K
G
 
E
A
 
L
N
 
E
R
 
Y
I
 
I
D
 
R
T
 
V
D
 
E
G
 
E
D
 
N
R
 
T
L
 
I
F
 
H
F
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
S
L
 
T
M
x
F
A
 
T
D
 
Q
V
 
I
A
 
E
E
 
N
H
 
H
P
 
P
V
 
F
V
 
I
R
 
R
D
 
S
D
 
H
Y
 
V
P
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
Y
E
 
K
S
 
A
L
 
A
S
 
S
K
 
Q
A
x
V
A
x
G
S
 
S
Q
 
P
Q
 
Q
L
x
I
R
 
R
N
 
N
M
 
L
A
 
G
T
|
T
V
 
I
G
 
G
G
|
G
N
|
N
L
 
L
L
x
S
Q
x
T
R
 
-
T
 
-
R
 
-
C
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
-
R
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
A
 
-
Y
 
-
P
 
-
C
 
-
N
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
-
P
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
S
S
 
S
A
 
V
A
 
A
C
x
G
N
x
D
A
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
V
 
-
A
 
A
L
 
M
M
 
T
A
 
T
M
 
L
D
 
D
A
 
A
A
 
T
I
 
V
E
 
V
L
 
L
Q
 
E
G
 
S
L
 
V
D
 
R
G
 
G
T
 
T
R
 
R
V
 
Q
I
 
M
P
 
K
I
 
L
A
 
T
E
 
D
L
 
F
Y
 
F
R
 
D
P
 
G
P
 
E
-
 
G
-
 
F
S
 
K
R
 
R
T
 
R
P
 
N
H
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
A
E
 
D
E
 
E
I
|
I
V
x
M
T
 
T
G
 
E
I
 
V
S
 
I
V
 
I
P
 
D
K
 
R
T
 
P
T
 
D
A
 
A
G
 
H
R
 
S
T
 
A
S
 
S
T
 
A
Y
 
F
L
 
Y
K
 
K
V
 
L
R
 
A
D
 
K
R
 
R
E
 
K
S
 
S
Y
 
L
A
 
A
F
 
I
A
 
S
L
 
V
V
 
I
S
 
G
A
 
G
A
 
G
V
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
K
M
 
V
D
 
D
G
 
D
D
 
A
R
 
G
V
 
V
-
 
C
R
 
T
Q
 
W
A
 
A
H
 
S
V
 
M
A
 
R
L
 
G
G
 
G
G
 
C
V
 
I
A
 
G
T
 
R
V
 
Y
P
 
P
W
 
L
R
 
H
A
 
F
R
 
K
P
 
Q
A
 
A
E
 
E
A
 
E
L
 
M
L
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
A
T
 
P
L
 
L
D
 
T
R
 
M
E
 
E
R
 
T
A
 
M
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

1t3qC Crystal structure of quinoline 2-oxidoreductase from pseudomonas putida 86 (see paper)
29% identity, 33% coverage: 4:114/333 of query aligns to 6:115/285 of 1t3qC

query
sites
1t3qC
L
 
F
S
 
S
Y
 
Y
V
 
R
R
 
A
A
 
P
R
 
A
T
 
S
A
 
L
R
 
Q
E
 
E
A
 
V
I
 
I
E
 
Q
A
 
V
F
 
-
V
 
L
A
 
A
A
 
D
G
 
D
E
 
P
S
 
D
A
 
A
R
 
R
Y
x
I
I
 
I
A
|
A
G
|
G
G
|
G
T
x
Q
N
x
S
L
|
L
Y
 
L
D
 
P
L
 
L
M
 
L
K
 
A
L
 
F
G
 
R
I
 
L
E
 
V
K
 
Y
P
 
P
A
 
S
H
 
C
L
 
L
I
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
R
D
 
N
L
 
V
D
 
S
G
 
E
A
 
L
N
 
F
R
 
E
I
 
I
D
 
S
T
 
Q
D
 
S
G
 
A
D
 
G
R
 
I
L
 
L
F
 
S
F
 
V
G
 
G
G
 
A
A
 
M
A
 
V
L
 
T
M
 
H
A
 
F
D
 
R
V
 
N
A
 
K
E
 
T
H
 
D
P
 
P
V
 
T
V
 
V
R
 
A
D
 
K
D
 
C
Y
 
V
P
 
P
V
 
I
L
 
L
A
 
P
E
 
K
S
 
V
L
 
L
S
 
A
K
 
H
A
x
V
A
|
A
S
 
H
Q
 
Q
Q
 
A
L
x
V
R
 
R
N
 
N
M
 
R
A
 
G
T
|
T
V
 
L
G
 
G
G
|
G
N
x
S
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS27480 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS27480
MKPLSYVRARTAREAIEAFVAAGESARYIAGGTNLYDLMKLGIEKPAHLIDIADLDGANR
IDTDGDRLFFGGAALMADVAEHPVVRDDYPVLAESLSKAASQQLRNMATVGGNLLQRTRC
PYFRNGANGAYPCNKREPGSGCAAIGGLDRSQAVLGASAACNAVSPGDWPVALMAMDAAI
ELQGLDGTRVIPIAELYRPPSRTPHLEFTIGREEIVTGISVPKTTAGRTSTYLKVRDRES
YAFALVSAAVALEMDGDRVRQAHVALGGVATVPWRARPAEALLRGETLDRERAQEAARAA
FAEARAGRHNAFKIELGARTLADAIITAGSKSK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory