SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS27950 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS27950 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
30% identity, 96% coverage: 10:385/392 of query aligns to 3:389/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
I
 
I
R
 
K
R
 
Q
L
 
I
N
 
N
M
 
A
V
 
G
R
 
R
V
 
V
F
 
Y
H
 
K
A
 
L
L
 
I
R
 
D
E
 
Q
N
 
K
P
 
G
R
 
P
C
 
I
A
 
S
Q
 
R
R
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
K
L
 
E
T
 
S
G
 
E
L
 
L
D
 
A
K
 
P
A
 
A
T
 
S
T
 
I
S
 
T
A
 
K
I
 
I
V
 
T
A
 
R
Q
 
E
M
 
L
I
 
I
E
 
D
E
 
A
G
 
H
L
 
L
V
 
I
E
 
H
R
 
E
T
 
T
E
 
T
A
 
V
P
 
Q
R
 
E
A
 
A
R
 
I
R
 
S
I
 
R
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
A
T
 
V
A
 
G
L
 
L
G
 
Q
I
 
T
A
 
N
P
 
N
S
 
L
A
 
G
G
 
W
L
 
Q
L
 
F
V
 
L
G
 
S
A
 
M
R
 
R
L
 
L
E
 
G
P
 
R
G
 
G
T
 
Y
I
 
L
R
 
T
I
 
I
V
 
A
S
 
L
T
 
H
T
 
E
L
 
L
A
 
G
G
 
G
T
 
E
V
 
V
V
 
L
E
 
I
Q
 
D
S
 
T
Q
 
K
I
 
I
P
 
D
-
 
I
G
 
H
S
 
E
T
 
I
D
 
D
L
 
Q
A
 
D
T
 
D
A
 
V
L
 
L
R
 
A
H
 
R
L
 
L
H
 
L
E
 
F
G
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
E
V
 
F
V
 
F
A
 
Q
A
 
T
S
 
Y
R
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
G
 
A
A
 
A
A
 
Q
T
 
L
P
 
D
P
 
R
L
 
V
C
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
V
 
I
G
 
T
I
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
L
M
 
V
D
 
N
R
 
S
E
 
E
G
 
Q
R
 
G
L
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
-
 
M
P
 
P
N
 
H
L
 
Y
G
 
N
W
 
V
R
 
K
D
 
N
T
 
L
P
 
A
I
 
L
R
 
G
P
 
P
L
 
E
L
 
I
E
 
Y
E
 
K
A
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
F
V
 
V
D
 
A
N
 
N
D
 
D
T
 
T
K
 
R
A
 
A
A
 
W
A
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
K
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
H
C
 
S
R
 
Q
G
 
D
V
 
V
E
 
D
D
 
N
F
 
S
V
 
V
Y
 
L
L
 
I
T
 
S
G
 
I
H
 
H
S
 
H
G
 
G
V
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
I
F
 
V
F
 
L
G
 
D
G
 
G
R
 
R
L
 
V
Y
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
R
Q
 
H
G
 
G
F
 
N
A
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
I
T
 
Q
I
 
I
V
 
D
P
 
P
G
 
Q
G
 
G
R
 
K
A
 
R
C
|
C
G
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
N
R
 
Y
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
V
 
A
S
 
S
E
 
S
T
 
Q
S
 
A
I
 
I
L
 
R
A
 
D
Q
 
Q
A
 
V
A
 
T
E
 
A
R
 
R
G
 
I
R
 
Q
A
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
P
-
 
S
-
 
C
-
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
S
L
 
I
P
 
E
D
 
D
L
 
I
W
 
C
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
D
G
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
L
V
 
A
R
 
V
T
 
D
L
 
V
L
 
I
E
 
Q
E
 
Q
A
 
L
G
 
G
S
 
R
H
 
Y
L
 
L
G
 
G
F
 
A
A
 
A
L
 
I
S
 
A
H
 
I
L
 
V
V
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
E
L
 
K
V
 
I
V
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
V
L
 
I
A
 
N
I
 
Q
V
 
A
A
 
K
E
 
S
F
 
I
I
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
S
L
 
I
N
 
E
A
 
Q
A
 
C
L
 
I
G
 
R
E
 
E
H
 
Q
A
 
S
L
 
L
E
 
P
P
 
V
L
 
Y
R
 
H
R
 
Q
D
 
D
L
 
L
R
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
E
S
 
S
P
 
R
L
 
F
G
 
Y
P
 
K
D
 
Q
A
 
A
V
 
T
P
 
-
M
 
M
G
 
P
G
 
G
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
I
-
 
K
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
M
 
Y
D
 
D
G
 
G
F
 
L
L
 
L

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
28% identity, 96% coverage: 10:386/392 of query aligns to 13:396/406 of P50456

query
sites
P50456
I
 
I
R
 
K
R
 
Q
L
 
T
N
 
N
M
 
A
V
 
G
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
H
 
R
A
 
L
L
 
I
R
 
D
E
 
Q
N
 
L
P
 
G
R
 
P
C
 
V
A
 
S
Q
 
R
R
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
A
G
 
Q
L
 
L
D
 
A
K
 
P
A
 
A
T
 
S
T
 
I
S
 
T
A
 
K
I
 
I
V
 
V
A
x
R
Q
 
E
M
 
M
I
 
L
E
 
E
E
 
A
G
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
E
T
 
L
E
 
E
A
 
I
P
 
K
R
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
N
I
 
R
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
A
T
 
V
A
 
G
L
 
L
G
 
V
I
 
V
A
 
E
P
 
T
S
 
E
A
 
A
G
 
W
L
x
H
L
 
Y
V
 
L
G
 
S
A
 
L
R
 
R
L
 
I
E
 
S
P
 
R
G
 
G
T
 
E
I
 
I
R
 
F
I
 
L
V
 
A
S
 
L
T
 
R
T
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
S
T
 
K
-
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
S
 
S
Q
 
Q
I
 
E
P
 
L
G
 
A
S
 
L
T
 
K
D
 
D
L
 
D
A
 
L
T
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
D
H
 
R
L
 
I
H
 
I
E
 
S
G
 
H
I
 
I
D
 
D
A
 
Q
V
 
F
V
x
F
A
 
I
A
 
R
S
 
H
R
 
Q
P
 
K
E
 
K
G
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
L
P
 
E
P
 
R
L
 
L
C
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
V
 
I
G
 
T
I
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
I
M
 
I
D
 
D
R
 
T
E
 
E
G
 
N
R
 
G
L
 
I
V
 
V
-
 
H
-
 
R
L
 
M
A
 
P
P
 
F
N
 
Y
L
 
E
G
 
D
W
 
V
R
 
K
D
 
E
T
 
M
P
 
P
I
 
L
R
 
G
P
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
A
 
H
L
 
T
G
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
V
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
T
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
W
A
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
V
V
 
I
Y
 
Q
L
 
V
T
 
V
G
 
I
H
 
D
S
 
H
G
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
I
F
 
T
G
 
D
G
 
G
R
 
H
L
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
Q
 
S
G
 
S
F
 
S
A
 
L
G
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
L
 
T
T
 
Q
I
 
V
V
 
D
P
 
P
G
 
Y
G
 
G
R
 
K
A
 
R
C
|
C
G
 
Y
C
|
C
G
 
G
K
 
N
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
Y
 
I
V
 
A
S
 
S
E
 
V
T
 
D
S
 
S
I
 
I
L
 
L
A
 
E
Q
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
L
R
 
R
-
 
L
G
 
N
R
 
Q
A
 
S
L
 
M
P
 
S
D
 
S
L
 
M
W
 
L
-
 
H
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
D
A
 
S
A
 
L
A
 
C
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
L
D
x
R
G
 
G
D
 
D
P
 
L
V
x
L
V
 
A
R
 
K
T
 
D
L
 
I
L
 
I
E
 
T
E
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
H
 
H
L
 
V
G
 
G
F
 
R
A
 
I
L
 
L
S
 
A
H
 
I
L
 
M
V
 
V
N
 
N
L
 
L
A
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
Q
L
 
K
V
 
I
V
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
S
N
 
P
L
 
L
A
 
S
I
 
K
V
 
A
A
 
A
E
 
D
F
 
I
I
 
L
L
 
F
P
 
P
A
 
V
L
 
I
N
 
S
A
 
D
A
 
S
L
 
I
G
 
R
E
 
Q
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
P
P
 
A
L
 
Y
R
 
S
R
 
Q
D
 
H
L
 
I
R
 
S
L
 
V
L
 
E
V
 
S
S
 
T
P
 
Q
L
 
F
G
 
S
P
 
N
D
 
Q
A
 
G
V
 
T
P
 
-
M
 
M
G
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
K
D
 
D
G
 
A
F
 
M
L
 
Y
S
 
N

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
26% identity, 84% coverage: 1:331/392 of query aligns to 2:336/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
M
 
I
L
 
L
P
 
R
R
x
K
V
 
G
N
 
N
S
x
K
A
 
D
A
 
L
I
 
I
R
x
K
R
 
D
L
 
I
N
|
N
M
 
R
V
 
Y
R
 
T
V
 
V
F
 
L
H
 
N
A
 
L
L
 
I
R
 
R
E
 
E
N
 
K
P
 
G
R
 
E
C
 
I
A
 
T
Q
 
R
R
x
T
D
 
E
L
 
I
S
 
A
R
 
K
L
 
K
T
 
C
G
 
D
L
 
F
D
 
G
K
 
M
A
x
S
T
|
T
T
 
L
S
 
T
A
 
Y
I
 
I
V
 
L
A
 
D
Q
 
D
M
 
L
I
 
Q
E
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
I
V
 
I
E
 
L
R
 
E
T
 
G
E
 
-
A
 
A
P
 
E
R
 
T
A
 
S
R
 
S
R
x
T
I
x
G
G
|
G
R
|
R
P
x
R
E
x
A
T
x
K
A
 
L
L
 
V
G
 
R
I
 
F
A
 
N
P
 
K
S
 
D
A
 
Y
G
 
G
L
 
F
L
 
V
V
 
V
G
 
S
A
 
V
R
 
K
L
 
V
E
 
E
P
 
E
G
 
E
T
 
Q
I
 
L
R
 
L
I
 
F
V
 
A
S
 
L
T
 
T
T
 
D
L
 
L
A
 
N
G
 
A
T
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
N
S
 
T
Q
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
F
S
 
S
T
 
S
D
 
E
L
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
K
H
 
K
L
 
P
H
 
E
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
L
V
 
I
V
 
A
A
 
K
A
 
N
S
 
V
R
 
K
P
 
K
E
 
M
-
 
C
G
 
G
G
 
N
A
 
R
A
 
D
T
 
M
P
 
N
P
 
H
L
 
L
C
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
A
I
 
I
P
 
S
A
 
G
L
 
L
M
 
V
D
 
N
R
 
R
E
 
K
-
 
K
G
 
G
R
 
T
L
 
V
V
 
I
L
 
R
A
 
S
P
 
T
N
 
M
L
 
L
G
 
G
W
 
W
R
 
E
D
 
N
T
 
V
P
 
A
I
 
L
R
 
E
P
 
A
L
 
M
L
 
L
E
 
H
E
 
A
A
 
H
L
 
F
-
 
P
G
 
D
A
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
V
 
V
D
 
D
N
 
K
D
 
N
T
 
I
K
 
N
A
 
C
A
 
Y
A
 
T
M
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
W
F
 
L
G
 
G
A
 
E
C
 
G
R
 
K
G
 
Q
V
 
S
E
 
N
D
 
N
F
 
F
V
 
A
Y
 
T
L
 
V
T
 
S
G
 
V
H
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
G
 
L
G
 
S
L
 
V
F
 
V
F
 
I
G
 
N
G
 
R
R
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
F
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
L
 
T
T
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
A
 
K
C
|
C
G
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
Q
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
M
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
F
S
 
Y
I
 
F
L
 
R
A
 
N
Q
 
R
A
 
G
A
 
E
E
 
E
R
 
L
G
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
Y
P
 
P
-
 
T
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
F
D
 
H
L
 
F
W
 
D
A
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
M
V
 
A
R
 
T
T
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
G
E
 
K
A
 
M
G
 
G
S
 
E
H
 
Y
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
L
 
I
S
 
R
H
 
N
L
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
T
A
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
E
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
V
G
 
G

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
27% identity, 96% coverage: 10:386/392 of query aligns to 2:372/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
I
 
I
R
 
K
R
 
Q
L
 
T
N
 
N
M
 
A
V
 
G
R
 
A
V
 
V
F
 
Y
H
 
R
A
 
L
L
 
I
R
 
D
E
 
Q
N
 
L
P
 
G
R
 
P
C
 
V
A
 
S
Q
 
R
R
 
I
D
 
D
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
T
 
A
G
 
Q
L
 
L
D
 
A
K
 
P
A
 
A
T
 
S
T
 
I
S
 
T
A
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
H
Q
 
E
M
 
M
I
 
L
E
 
E
E
 
A
G
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
Q
R
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
E
T
 
L
A
 
G
L
 
L
G
 
V
I
 
V
A
 
E
P
 
T
S
 
E
A
 
A
G
 
W
L
 
H
L
 
Y
V
 
L
G
 
S
A
 
L
R
 
R
L
 
I
E
 
S
P
 
R
G
 
G
T
 
E
I
 
I
R
 
F
I
 
L
V
 
A
S
 
L
T
 
R
T
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
S
T
 
K
-
 
L
V
 
V
V
 
V
E
 
E
Q
 
E
S
 
S
Q
 
Q
I
 
E
P
 
L
G
 
A
S
 
L
T
 
K
D
 
D
L
 
D
A
 
L
T
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
D
H
 
R
L
 
I
H
 
I
E
 
S
G
 
H
I
 
I
D
 
D
A
 
Q
V
 
F
V
 
F
A
 
I
A
 
R
S
 
H
R
 
Q
P
 
K
E
 
K
G
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
T
 
L
P
 
E
P
 
R
L
 
L
C
 
T
G
 
S
I
 
I
G
 
A
V
 
I
G
 
T
I
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
I
M
 
I
D
 
D
R
 
T
E
 
E
G
 
N
R
 
G
L
 
I
V
 
V
-
 
H
-
 
R
L
 
M
A
 
P
P
 
F
N
 
Y
L
 
E
G
 
D
W
 
V
R
 
K
D
 
E
T
 
M
P
 
P
I
 
L
R
 
G
P
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
A
 
H
L
 
T
G
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
V
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
T
 
I
K
 
S
A
 
A
A
 
W
A
 
T
M
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
L
F
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
S
R
 
R
G
 
G
V
 
A
E
 
R
D
 
D
F
 
V
V
 
I
Y
 
Q
L
 
V
T
 
V
G
 
I
H
 
D
S
 
H
G
 
N
V
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
I
F
 
T
G
 
D
G
 
G
R
 
H
L
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
Q
 
S
G
 
S
F
 
S
A
 
L
G
 
V
E
 
E
I
 
I
G
 
G
H
|
H
L
 
T
T
 
Q
I
 
V
V
 
D
P
 
P
G
 
Y
G
 
G
R
 
K
A
 
R
C
|
C
G
 
Y
C
|
C
G
 
G
K
 
N
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
Y
 
I
V
 
A
S
 
S
E
 
V
T
 
D
S
 
S
I
 
I
L
 
L
A
 
E
Q
 
L
A
 
A
A
 
Q
E
 
L
R
 
R
-
 
L
G
 
N
R
 
Q
A
 
S
L
 
M
P
 
S
D
 
S
L
 
M
W
 
L
-
 
H
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
L
-
 
T
-
 
V
-
 
D
A
 
S
A
 
L
A
 
C
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
L
D
 
R
G
 
G
D
 
D
P
 
L
V
 
L
V
 
A
R
 
K
T
 
D
L
 
I
L
 
I
E
 
T
E
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
H
 
H
L
 
V
G
 
G
F
 
R
A
 
I
L
 
L
S
 
A
H
 
I
L
 
M
V
 
V
N
 
N
L
 
L
A
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
Q
L
 
K
V
 
I
V
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
S
N
 
P
L
 
L
A
 
S
I
 
K
V
 
A
A
 
A
E
 
D
F
 
I
I
 
L
L
 
F
P
 
P
A
 
V
L
 
I
N
 
S
A
 
D
A
 
S
L
 
I
G
 
R
E
 
Q
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
E
 
P
P
 
A
L
 
Y
R
 
S
R
 
Q
D
 
H
L
 
I
R
 
S
L
 
V
L
 
E
V
 
S
S
 
T
P
 
Q
L
 
F
G
 
S
P
 
N
D
 
Q
A
 
G
V
 
T
P
 
-
M
 
M
G
 
A
G
 
G
I
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
K
D
 
D
G
 
A
F
 
M
L
 
Y
S
 
N

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
29% identity, 64% coverage: 82:331/392 of query aligns to 1:252/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
G
 
G
L
 
F
L
 
V
V
 
V
G
 
S
A
 
V
R
x
K
L
 
V
E
 
E
P
x
E
G
 
E
T
 
Q
I
 
L
R
 
L
I
 
F
V
 
A
S
 
L
T
 
T
T
 
D
L
 
L
A
 
N
G
 
A
T
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
E
Q
 
N
S
 
T
Q
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
F
S
 
S
T
 
S
D
 
E
L
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
K
H
 
K
L
 
P
H
 
E
E
 
E
G
 
A
I
 
I
D
 
E
A
 
L
V
 
I
V
 
A
A
 
K
A
 
N
S
 
V
R
 
K
P
 
K
E
 
M
-
 
C
G
 
G
G
 
N
A
 
R
A
 
D
T
 
M
P
 
N
P
 
H
L
 
L
C
 
L
G
 
G
I
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
A
I
 
I
P
 
S
A
x
G
L
 
L
M
 
V
D
 
N
R
 
R
E
 
K
-
 
K
G
 
G
R
 
T
L
 
V
V
 
I
L
 
R
A
 
S
P
 
T
N
 
M
L
 
L
G
 
G
W
 
W
R
 
E
D
 
N
T
 
V
P
 
A
I
 
L
R
 
E
P
 
A
L
 
M
L
 
L
E
 
H
E
 
A
A
 
H
L
 
F
-
 
P
G
 
D
A
 
I
P
 
P
V
 
V
H
 
Y
V
 
V
D
 
D
N
 
K
D
x
N
T
 
I
K
 
N
A
 
C
A
 
Y
A
 
T
M
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
L
L
 
W
F
 
L
G
 
G
A
 
E
C
 
G
R
 
K
G
 
Q
V
 
S
E
 
N
D
 
N
F
 
F
V
 
A
Y
 
T
L
 
V
T
x
S
G
x
V
H
 
G
S
 
A
G
|
G
V
x
L
G
|
G
G
 
L
G
 
S
L
 
V
F
 
V
F
 
I
G
 
N
G
 
R
R
 
Q
L
 
I
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
F
 
G
A
 
A
G
 
G
E
|
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
L
 
T
T
 
T
I
 
I
V
 
Q
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
A
 
K
C
|
C
G
 
H
C
|
C
G
 
G
K
 
Q
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
|
E
T
 
M
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
F
S
 
Y
I
 
F
L
 
R
A
 
N
Q
 
R
A
 
G
A
 
E
E
 
E
R
 
L
G
 
K
R
 
E
A
 
A
L
 
Y
P
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
D
-
 
F
D
 
H
L
 
F
W
 
D
A
 
K
A
 
V
A
 
A
A
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
R
D
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
M
V
 
A
R
 
T
T
 
E
L
 
L
L
 
M
E
 
G
E
 
K
A
 
M
G
 
G
S
 
E
H
 
Y
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
A
 
G
L
 
I
S
 
R
H
 
N
L
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
T
A
 
F
N
 
N
P
 
P
G
 
E
L
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
31% identity, 76% coverage: 84:381/392 of query aligns to 8:320/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
L
 
I
V
 
I
G
 
G
A
 
I
R
 
D
L
 
L
E
 
G
P
 
G
G
 
T
T
 
T
I
 
I
R
 
K
I
 
F
V
 
A
S
 
I
T
 
L
T
 
T
L
 
T
A
 
D
G
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
Q
E
 
Q
Q
 
K
S
 
W
Q
 
S
I
 
I
P
 
E
G
 
-
S
 
-
T
 
T
D
 
N
L
 
I
A
 
L
T
 
E
A
 
D
L
 
G
R
 
K
H
 
H
L
 
I
H
 
V
E
 
P
G
 
S
I
 
I
D
 
I
A
 
E
V
 
S
V
 
I
A
 
R
A
 
H
S
 
R
R
 
I
P
 
D
E
 
L
G
 
Y
G
 
N
A
 
M
A
 
K
T
 
K
P
 
E
P
 
D
L
 
F
C
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
M
G
 
G
I
 
T
P
 
P
A
 
G
L
 
S
M
 
V
D
 
D
R
 
I
E
 
E
-
 
K
G
 
G
R
 
T
L
 
V
V
 
V
L
 
G
A
 
A
P
 
Y
N
 
N
L
 
L
G
 
N
W
 
W
R
 
T
D
 
T
T
 
V
-
 
Q
P
 
P
I
 
V
R
 
K
P
 
E
L
 
Q
L
 
I
E
 
E
E
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
I
P
 
P
V
 
F
H
 
A
V
 
L
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
A
K
x
N
A
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
G
E
 
E
R
 
R
L
 
W
F
 
K
G
 
G
A
 
A
C
 
G
R
 
E
G
 
N
V
 
N
E
 
P
D
 
D
F
 
V
V
 
I
Y
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
L
H
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
F
 
A
G
 
A
G
 
G
R
 
K
L
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
G
A
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
C
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
G
 
G
H
|
H
L
 
V
T
 
T
I
 
V
V
 
D
P
 
P
G
 
N
G
 
G
R
 
F
A
 
D
C
|
C
G
 
T
C
|
C
G
 
G
K
 
K
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
V
 
S
S
 
S
E
 
A
T
 
T
S
 
G
I
 
V
-
 
V
-
 
R
-
 
V
-
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
E
L
 
F
A
 
A
Q
 
G
A
 
D
A
 
S
E
 
E
R
 
L
G
 
K
R
 
Q
A
 
A
L
 
I
P
 
D
D
 
D
L
 
G
W
 
Q
A
 
D
A
 
V
A
 
S
A
 
S
A
 
K
-
 
D
-
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
F
A
 
A
R
 
E
D
 
K
G
 
G
D
 
D
P
 
H
V
 
F
V
 
A
R
 
L
T
 
M
L
 
V
L
 
V
E
 
D
E
 
R
A
 
V
G
 
C
S
 
F
H
 
Y
L
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
A
L
 
T
S
 
G
H
 
N
L
 
L
V
 
G
N
 
N
L
 
T
A
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
D
L
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
N
 
G
L
 
V
A
 
S
I
 
A
V
 
A
A
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
R
P
 
S
A
 
R
L
 
V
N
 
E
A
 
K
A
 
Y
L
 
F
G
 
Q
E
 
E
H
 
F
A
 
T
L
 
F
E
 
P
P
 
Q
L
 
V
R
 
R
R
 
N
D
 
S
L
 
T
R
 
K
L
 
I
L
 
K
V
 
L
S
 
A
P
 
E
L
 
L
G
 
G
P
 
N
D
 
E
A
 
A
V
 
G
P
 
V
M
 
I
G
 
G
G
 
A
I
 
A
A
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
L

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
33% identity, 66% coverage: 102:361/392 of query aligns to 15:277/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
A
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
D
E
 
E
Q
 
E
S
 
G
Q
 
R
I
 
I
P
 
L
G
 
S
S
 
T
T
 
F
D
 
K
L
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
L
 
-
R
 
-
H
 
P
L
 
T
H
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
-
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
C
A
 
A
A
 
A
S
 
V
R
 
-
P
 
-
E
 
A
G
 
G
G
 
A
A
 
S
A
 
E
T
 
G
P
 
H
P
 
D
L
 
V
C
 
E
G
 
A
I
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
A
P
 
A
A
x
G
L
 
Y
M
 
V
D
 
D
-
 
D
R
 
K
E
 
R
G
 
A
R
 
T
L
 
V
V
 
L
L
 
F
A
 
A
P
|
P
N
 
N
L
 
I
G
 
D
W
 
W
R
 
R
D
 
H
T
 
E
P
 
P
I
 
L
R
 
K
P
 
D
L
 
K
L
 
V
E
 
E
E
 
Q
A
 
R
L
 
V
G
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
V
V
 
V
D
 
E
N
|
N
D
|
D
T
 
A
K
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
W
A
 
G
E
 
E
R
 
Y
L
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
H
E
 
D
D
 
D
F
 
V
V
 
I
Y
 
C
L
 
I
T
 
T
G
 
L
H
x
G
S
x
T
G
 
G
V
x
L
G
|
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
F
 
I
G
 
G
G
 
N
R
 
K
L
 
L
Y
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
Q
 
F
G
 
G
F
 
V
A
 
A
G
 
A
E
|
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
L
 
I
T
 
R
I
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
G
R
 
L
A
 
L
C
|
C
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
|
E
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
x
G
T
 
R
S
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
R
Q
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
R
 
R
G
 
A
R
 
N
A
 
A
L
 
T
P
 
P
D
 
E
L
 
N
W
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
x
G
-
 
K
-
 
H
-
 
I
A
x
S
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
Q
G
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
A
R
 
V
T
 
D
L
 
S
L
 
F
E
 
R
E
 
E
A
 
L
G
 
A
S
 
R
H
 
W
L
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
A
N
 
S
L
 
L
A
 
F
N
 
D
P
 
P
G
 
S
L
 
A
V
 
F
V
 
I
L
 
V
G
 
G
G
 
G
N
x
G
L
x
V
A
 
S
I
 
D
V
x
E
A
 
G
E
 
E
F
 
L
I
 
V
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
D
P
 
P
L
 
I
R
 
R
R
 
K
D
 
S
L
 
F
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
33% identity, 66% coverage: 102:361/392 of query aligns to 15:277/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
A
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
V
V
 
D
E
 
E
Q
 
E
S
 
G
Q
 
R
I
 
I
P
 
L
G
 
S
S
 
T
T
 
F
D
 
K
L
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
P
L
 
-
R
 
-
H
 
P
L
 
T
H
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
-
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
V
 
C
A
 
A
A
 
A
S
 
V
R
 
-
P
 
-
E
 
A
G
 
G
G
 
A
A
 
S
A
 
E
T
 
G
P
 
H
P
 
D
L
 
V
C
 
E
G
 
A
I
 
V
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
A
P
 
A
A
 
G
L
 
Y
M
 
V
D
 
D
-
 
D
R
 
K
E
 
R
G
 
A
R
 
T
L
 
V
V
 
L
L
 
F
A
 
A
P
 
P
N
 
N
L
 
I
G
 
D
W
 
W
R
 
R
D
 
H
T
 
E
P
 
P
I
 
L
R
 
K
P
 
D
L
 
K
L
 
V
E
 
E
E
 
Q
A
 
R
L
 
V
G
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
V
V
 
V
D
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
K
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
W
A
 
G
E
 
E
R
 
Y
L
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
H
E
 
D
D
 
D
F
 
V
V
 
I
Y
 
C
L
 
I
T
 
T
G
 
L
H
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
F
 
I
G
 
G
G
 
N
R
 
K
L
 
L
Y
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
Q
 
F
G
 
G
F
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
E
I
 
F
G
 
G
H
|
H
L
 
I
T
 
R
I
 
V
V
 
V
P
 
P
G
 
D
G
 
G
R
 
L
A
 
L
C
|
C
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
Q
G
 
G
C
|
C
L
 
W
E
 
E
T
 
Q
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
 
G
T
 
R
S
 
A
I
 
L
L
 
V
A
 
R
Q
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
R
 
R
G
 
A
R
 
N
A
 
A
L
 
T
P
 
P
D
 
E
L
 
N
W
 
A
A
 
A
A
 
V
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
H
-
 
I
A
 
S
A
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
R
D
 
Q
G
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
V
V
 
A
R
 
V
T
 
D
L
 
S
L
 
F
E
 
R
E
 
E
A
 
L
G
 
A
S
 
R
H
 
W
L
 
A
G
 
G
F
 
A
A
 
G
L
 
L
S
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
A
N
 
S
L
 
L
A
 
F
N
 
D
P
 
P
G
 
S
L
 
A
V
 
F
V
 
I
L
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
G
L
 
V
A
 
S
I
 
D
V
 
E
A
 
G
E
 
E
F
 
L
I
 
V
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
A
 
-
L
 
L
E
 
D
P
 
P
L
 
I
R
 
R
R
 
K
D
 
S
L
 
F
R
 
R

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
42% identity, 54% coverage: 149:358/392 of query aligns to 61:275/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
I
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
G
I
 
T
P
 
P
A
 
G
L
 
P
M
 
L
D
 
D
R
 
F
E
 
R
G
 
-
R
 
R
L
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
R
P
 
P
N
 
N
L
 
I
-
 
P
G
 
G
W
 
V
R
 
Q
D
 
D
T
 
F
P
 
P
I
 
I
R
 
R
P
 
R
L
 
I
L
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
R
P
 
P
V
 
V
H
 
F
V
 
L
D
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
K
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
H
L
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
A
C
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
E
E
 
E
D
 
S
F
 
S
V
 
L
Y
 
Y
L
 
L
T
 
T
G
 
V
H
 
S
S
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
V
F
 
V
F
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
L
 
V
Y
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
F
 
Q
A
 
G
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
T
I
 
L
V
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
R
 
P
A
 
A
C
|
C
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
L
R
 
E
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
E
T
 
A
Y
 
L
V
 
A
S
 
A
E
 
G
T
 
R
S
 
A
I
 
L
L
 
E
A
 
R
Q
 
D
A
 
A
A
 
T
E
 
Y
R
 
A
G
 
F
R
 
Q
A
 
R
L
 
P
P
 
V
D
 
D
L
 
T
W
 
R
A
 
E
A
 
L
A
 
F
A
 
R
A
 
L
A
 
F
R
 
Q
D
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
K
V
 
A
R
 
E
T
 
R
L
 
L
L
 
V
E
 
L
E
 
Q
A
 
A
G
 
A
S
 
R
H
 
Y
L
 
V
G
 
G
F
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
A
H
 
S
L
 
L
V
 
V
N
 
K
L
 
A
A
 
F
N
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
G
L
 
V
A
 
A
I
 
L
V
 
N
A
 
A
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
W
E
 
E
F
 
A
I
 
L
L
 
L
P
 
E
A
 
A
L
 
Y
N
 
R
A
 
R
A
 
Y
L
 
L
G
 
Q
E
 
G
H
 
W
A
 
E
L
 
A
E
 
P
P
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
R

Q9Y223 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 18 papers)
31% identity, 62% coverage: 93:334/392 of query aligns to 418:672/722 of Q9Y223

query
sites
Q9Y223
T
x
N
I
 
L
R
|
R
I
 
V
V
 
A
S
 
I
T
 
V
T
 
S
L
 
M
A
 
K
G
 
G
T
 
E
V
 
I
V
 
V
E
 
K
Q
 
K
-
 
Y
S
 
T
Q
 
Q
I
 
F
P
 
N
G
 
P
S
 
K
T
 
T
D
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
Y
H
 
E
E
 
E
G
 
R
I
 
I
D
 
N
A
 
L
V
 
I
V
 
L
A
 
Q
A
 
M
S
 
C
R
 
V
P
 
E
E
 
A
G
 
A
G
 
A
A
 
E
A
 
A
T
 
V
P
 
K
P
 
L
L
 
N
C
 
C
G
 
R
I
 
I
-
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
|
I
P
 
S
A
 
T
-
 
G
-
x
G
-
x
R
L
 
V
M
 
N
D
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
I
L
 
V
V
 
L
L
 
H
A
 
S
P
x
T
N
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
G
 
E
W
 
W
R
 
N
D
 
S
T
 
V
P
 
D
I
 
L
R
 
R
P
 
T
L
 
P
L
 
L
E
 
S
E
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
W
V
 
V
D
 
D
N
|
N
D
|
D
T
 
G
K
x
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
|
A
E
 
E
R
 
R
L
 
K
F
|
F
G
 
G
A
 
Q
C
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
D
 
N
F
 
F
V
 
V
Y
 
T
L
 
L
T
 
I
G
 
T
H
 
G
S
 
T
G
|
G
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
F
 
H
G
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
 
A
E
|
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
V
I
x
V
V
 
S
P
 
L
G
 
D
G
|
G
R
 
P
A
 
D
C
|
C
G
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
T
 
A
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
 
G
T
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
Q
A
 
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
V
R
 
E
G
 
G
R
 
M
A
 
S
L
 
V
P
 
P
D
 
K
L
 
D
W
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
I
-
 
Q
A
|
A
A
|
A
R
 
K
D
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
V
 
A
R
 
Q
T
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
R
E
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
H
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
G
L
 
V
S
 
V
H
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
L
 
T
A
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
S
G
 
G
N
 
V
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
35% identity, 47% coverage: 149:334/392 of query aligns to 468:672/722 of O35826

query
sites
O35826
I
x
L
G
|
G
V
|
V
G
|
G
I
|
I
P
x
S
A
x
T
-
x
G
-
x
G
-
x
R
L
x
V
M
x
N
D
x
P
R
x
Q
E
|
E
G
|
G
R
x
V
L
x
V
V
x
L
L
x
H
A
x
S
P
x
T
N
x
K
L
|
L
-
x
I
-
x
Q
G
x
E
W
|
W
R
x
N
D
x
S
T
x
V
P
x
D
I
x
L
R
|
R
P
x
T
L
x
P
L
|
L
E
x
S
E
x
D
A
x
T
L
|
L
G
x
H
A
x
L
P
|
P
V
|
V
H
x
W
V
|
V
D
|
D
N
|
N
D
|
D
T
x
G
K
x
N
A
x
C
A
|
A
A
|
A
M
|
M
A
|
A
E
|
E
R
|
R
L
x
K
F
|
F
G
|
G
A
x
Q
C
x
G
R
x
K
G
|
G
V
x
Q
E
|
E
D
x
N
F
|
F
V
|
V
Y
x
T
L
|
L
T
x
I
G
x
T
H
x
G
S
x
T
G
|
G
V
x
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
L
x
I
F
x
I
F
x
H
G
x
Q
G
x
H
R
x
E
L
|
L
Y
x
I
R
x
H
G
|
G
A
x
S
Q
x
S
G
x
F
F
x
C
A
|
A
G
x
A
E
|
E
I
x
L
G
|
G
H
|
H
L
|
L
T
x
V
I
x
V
V
x
S
P
x
L
G
x
D
G
|
G
R
x
P
A
x
D
C
|
C
G
x
S
C
|
C
G
|
G
K
x
S
R
x
H
G
|
G
C
|
C
L
x
I
E
|
E
T
x
A
Y
|
Y
V
x
A
S
|
S
E
x
G
T
x
M
S
x
A
I
x
L
L
x
Q
A
x
R
Q
x
E
A
|
A
A
x
K
E
x
K
-
x
L
-
x
H
-
x
D
-
x
E
-
x
D
-
x
L
-
x
L
-
x
L
-
x
V
R
x
E
G
|
G
R
x
M
A
x
S
L
x
V
P
|
P
D
x
K
L
x
D
W
x
E
A
|
A
A
x
V
A
x
G
A
|
A
-
x
L
-
x
H
-
x
L
-
x
I
-
x
Q
A
|
A
A
|
A
R
x
K
D
x
L
G
|
G
D
x
N
P
x
V
V
x
K
V
x
A
R
x
Q
T
x
S
L
x
I
L
|
L
E
x
R
E
x
T
A
|
A
G
|
G
S
x
T
H
x
A
L
|
L
G
|
G
F
x
L
A
x
G
L
x
V
S
x
V
H
x
N
L
x
I
V
x
L
N
x
H
L
x
T
A
x
M
N
|
N
P
|
P
G
x
S
L
|
L
V
|
V
V
x
I
L
|
L
G
x
S
G
|
G
N
x
V
L
|
L
A
|
A

Sites not aligning to the query:

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
34% identity, 47% coverage: 149:334/392 of query aligns to 64:263/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
I
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
P
 
S
A
 
T
-
x
G
-
x
G
-
x
R
L
 
V
M
 
N
D
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
I
L
 
V
V
 
L
L
 
H
A
x
S
P
x
T
N
 
K
L
|
L
-
 
I
-
 
Q
G
 
E
W
 
W
R
 
N
D
 
S
T
 
V
P
 
D
I
 
L
R
 
R
P
 
T
L
 
P
L
 
L
E
 
S
E
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
W
V
 
V
D
 
D
N
|
N
D
|
D
T
 
G
K
x
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
C
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
D
 
N
F
 
F
V
 
V
Y
 
T
L
 
L
T
 
I
G
 
T
H
x
G
S
x
T
G
|
G
V
x
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
F
 
H
G
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
x
A
E
|
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
V
I
 
V
V
 
S
P
 
L
G
 
D
G
 
G
R
 
P
A
 
D
C
|
C
G
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
|
E
T
 
A
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
x
G
T
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
Q
A
 
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
V
R
 
E
G
 
G
R
 
M
A
 
S
L
 
A
P
 
V
D
 
G
L
 
A
W
x
L
A
 
H
A
 
L
A
 
I
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
V
 
A
R
 
Q
T
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
R
E
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
H
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
G
L
 
V
S
 
V
H
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
L
 
T
A
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
S
G
 
G
N
x
V
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
34% identity, 47% coverage: 149:334/392 of query aligns to 64:263/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
I
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
P
 
S
A
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
R
L
 
V
M
 
N
D
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
I
L
 
V
V
 
L
L
 
H
A
 
S
P
 
T
N
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
G
 
E
W
 
W
R
 
N
D
 
S
T
 
V
P
 
D
I
 
L
R
 
R
P
 
T
L
 
P
L
 
L
E
 
S
E
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
W
V
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
G
K
x
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
C
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
D
 
N
F
 
F
V
 
V
Y
 
T
L
 
L
T
 
I
G
 
T
H
 
G
S
x
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
F
 
H
G
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
x
A
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
V
I
 
V
V
 
S
P
 
L
G
 
D
G
 
G
R
 
P
A
 
D
C
|
C
G
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
T
 
A
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
x
G
T
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
Q
A
 
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
V
R
 
E
G
 
G
R
 
M
A
 
S
L
 
A
P
 
V
D
 
G
L
 
A
W
x
L
A
 
H
A
 
L
A
 
I
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
V
 
A
R
 
Q
T
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
R
E
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
H
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
G
L
 
V
S
 
V
H
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
L
 
T
A
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
S
G
 
G
N
x
V
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
34% identity, 47% coverage: 149:334/392 of query aligns to 64:264/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
I
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
P
 
S
A
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
R
L
 
V
M
 
N
D
 
P
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
I
L
 
V
V
 
L
L
 
H
A
 
S
P
 
T
N
 
K
L
 
L
-
 
I
-
 
Q
G
 
E
W
 
W
R
 
N
D
 
S
T
 
V
P
 
D
I
 
L
R
 
R
P
 
T
L
 
P
L
 
L
E
 
S
E
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
W
V
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
T
 
G
K
x
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
C
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
D
 
N
F
 
F
V
 
V
Y
 
T
L
 
L
T
 
I
G
 
T
H
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
F
 
H
G
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
x
A
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
V
I
 
V
V
 
S
P
 
L
G
 
N
G
 
G
R
 
P
A
 
D
C
|
C
G
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
T
 
A
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
 
G
T
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
Q
A
 
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
H
E
 
D
R
 
E
G
 
D
R
 
L
A
 
L
L
 
L
P
 
V
D
 
E
L
 
G
W
 
M
A
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
I
-
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
V
 
A
R
 
Q
T
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
R
E
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
H
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
G
L
 
V
S
 
V
H
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
L
 
T
A
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
S
G
 
G
N
 
V
L
 
L
A
 
A

3eo3A Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein (see paper)
36% identity, 41% coverage: 174:334/392 of query aligns to 69:243/288 of 3eo3A

query
sites
3eo3A
T
 
T
P
 
D
I
 
L
R
 
R
P
 
T
L
 
P
L
 
L
E
 
S
E
 
D
A
 
T
L
 
L
G
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
H
 
W
V
 
V
D
 
D
N
 
N
D
 
D
T
 
G
K
 
N
A
 
C
A
 
A
A
 
A
M
 
L
A
 
A
E
 
E
R
 
R
L
 
K
F
 
F
G
 
G
A
 
Q
C
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
L
E
 
E
D
 
N
F
 
F
V
 
V
Y
 
T
L
 
L
T
 
I
G
 
T
H
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
F
 
H
G
 
Q
G
 
H
R
 
E
L
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
Q
 
S
G
 
F
F
 
C
A
 
A
G
 
A
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
L
T
 
V
I
 
V
V
 
S
P
 
L
G
 
D
G
 
G
R
 
P
A
 
D
C
|
C
G
 
S
C
|
C
G
 
G
K
 
S
R
 
H
G
 
G
C
|
C
L
 
I
E
 
E
T
 
A
Y
 
Y
V
 
A
S
 
S
E
 
G
T
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
Q
A
 
R
Q
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
K
-
 
L
-
 
H
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
V
R
 
E
G
 
G
R
 
M
A
 
S
L
 
V
P
 
P
D
 
K
L
 
D
W
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
G
A
 
A
-
 
L
-
 
H
-
 
L
-
 
I
-
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
K
D
 
L
G
 
G
D
 
N
P
 
A
V
 
K
V
 
A
R
 
Q
T
 
S
L
 
I
L
 
L
E
 
R
E
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
H
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
G
L
 
V
S
 
V
H
 
N
L
 
I
V
 
L
N
 
H
L
 
T
A
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
S
L
 
L
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
S
G
 
G
N
 
V
L
 
L
A
 
A

6jdcA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac from haemophilus influenzae
33% identity, 38% coverage: 170:318/392 of query aligns to 81:229/269 of 6jdcA

query
sites
6jdcA
G
 
G
W
 
L
R
 
A
D
 
E
T
 
F
P
 
P
I
 
L
R
 
K
P
 
A
L
 
S
L
 
I
E
 
A
E
 
K
A
 
H
L
 
T
G
 
D
A
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
G
V
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
T
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
E
 
E
R
 
Y
L
 
Q
F
 
L
G
 
Q
A
 
N
C
 
F
R
 
E
G
 
Q
V
 
V
E
 
S
D
 
N
F
 
F
V
 
V
Y
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
V
H
 
S
S
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
F
 
L
G
 
N
G
 
Q
R
 
I
L
 
L
Y
 
Q
R
 
T
G
 
G
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
F
 
I
A
 
A
G
 
G
E
 
H
I
 
I
G
 
G
H
|
H
L
 
T
T
 
L
I
 
A
V
 
D
P
 
P
G
 
N
G
 
G
R
 
A
A
 
I
C
|
C
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
R
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
 
E
T
 
A
Y
 
I
V
 
A
S
 
S
E
 
G
T
 
R
S
 
A
I
 
I
L
 
-
A
 
-
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
S
R
 
S
G
 
A
R
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
V
D
 
E
L
 
R
W
 
S
A
 
A
A
 
K
A
 
A
A
 
I
A
 
A
A
 
N
R
 
L
D
 
I
G
 
A
D
 
D
P
 
L
V
 
V
V
 
I
R
 
S
T
 
L
L
 
D
L
 
I
E
 
Q
E
 
K
-
 
I
-
 
A
A
 
I
G
 
G
S
 
G
H
 
S
L
 
V
G
 
G
F
 
L
A
 
A
L
 
E
S
 
G
H
 
Y
L
 
L

4db3A 1.95 angstrom resolution crystal structure of n-acetyl-d-glucosamine kinase from vibrio vulnificus.
29% identity, 47% coverage: 149:334/392 of query aligns to 68:264/311 of 4db3A

query
sites
4db3A
I
 
I
G
 
G
V
 
L
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
M
M
 
E
D
 
D
R
 
A
E
 
D
G
 
D
R
 
A
L
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
T
P
 
V
N
 
N
L
 
V
-
 
P
G
 
A
W
 
A
R
 
K
D
 
G
T
 
K
P
 
P
I
 
L
R
 
R
P
 
A
L
 
D
L
 
L
E
 
E
E
 
A
A
 
K
L
 
I
G
 
G
A
 
R
P
 
S
V
 
V
H
 
K
V
 
I
D
 
E
N
 
N
D
 
D
T
 
A
K
 
N
A
 
C
A
 
F
A
 
A
M
 
L
A
 
S
E
 
E
R
 
A
L
 
W
F
 
D
G
 
E
A
 
E
C
 
L
R
 
Q
G
 
D
V
 
A
E
 
P
D
 
S
F
 
V
V
 
M
Y
 
G
L
 
L
T
 
I
G
 
L
H
 
G
S
 
T
G
 
G
V
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
I
F
 
Y
G
 
E
G
 
G
R
 
K
L
 
V
Y
 
F
R
 
S
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
G
 
N
F
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
|
H
L
 
M
T
 
R
I
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
W
-
 
F
V
 
H
P
 
L
G
 
G
G
 
D
R
 
N
A
 
A
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
G
C
|
C
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
K
R
 
K
G
 
G
C
|
C
L
 
L
E
 
D
T
 
S
Y
 
Y
V
 
L
S
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
F
E
 
E
T
 
L
S
 
L
I
 
Y
L
 
A
A
 
H
Q
 
Y
A
 
Y
A
 
G
E
 
E
R
 
E
G
 
K
R
 
K
A
 
A
L
 
I
P
 
D
D
 
I
L
 
I
W
 
K
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
K
V
 
A
R
 
A
T
 
E
L
 
H
L
 
V
E
 
E
E
 
R
A
 
F
G
 
M
S
 
E
H
 
L
L
 
L
G
 
A
F
 
I
A
 
C
L
 
F
S
 
G
H
 
N
L
 
I
V
 
F
N
 
T
L
 
A
A
 
N
N
 
D
P
 
P
G
 
H
L
 
V
V
 
V
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
G
L
 
L
A
 
S

6jdbA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac-6p and adp from haemophilus influenzae
36% identity, 28% coverage: 170:278/392 of query aligns to 80:188/290 of 6jdbA

query
sites
6jdbA
G
 
G
W
 
L
R
 
A
D
 
E
T
 
F
P
 
P
I
 
L
R
 
K
P
 
A
L
 
S
L
 
I
E
 
A
E
 
K
A
 
H
L
 
T
G
 
D
A
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
G
V
 
L
D
 
L
N
|
N
D
|
D
T
 
A
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
T
M
 
Y
A
 
A
E
 
E
R
 
Y
L
 
Q
F
 
L
G
 
Q
A
 
N
C
 
F
R
 
E
G
 
Q
V
 
V
E
 
S
D
 
N
F
 
F
V
 
V
Y
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
V
H
x
S
S
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
V
F
 
L
G
 
N
G
 
Q
R
 
I
L
 
L
Y
 
Q
R
 
T
G
 
G
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
F
 
I
A
 
A
G
 
G
E
x
H
I
 
I
G
 
G
H
|
H
L
 
T
T
 
L
I
 
A
V
 
D
P
 
P
G
 
N
G
 
G
R
 
A
A
 
I
C
|
C
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
 
R
R
 
R
G
 
G
C
|
C
L
 
V
E
|
E
T
 
A
Y
 
I
V
 
A
S
 
S
E
 
G
T
 
R
S
 
A
I
 
I
L
 
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
S
A
 
S
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

P32718 D-allose kinase; Allokinase; EC 2.7.1.55 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
30% identity, 53% coverage: 148:356/392 of query aligns to 66:271/309 of P32718

query
sites
P32718
G
 
G
I
 
L
G
 
V
V
 
M
G
 
G
I
 
F
P
 
P
A
|
A
L
 
L
M
 
V
D
 
S
R
 
K
E
 
D
G
 
K
R
 
R
L
 
T
V
 
I
L
 
I
A
 
S
-
 
T
P
 
P
N
 
N
L
 
L
G
 
P
W
 
L
R
 
T
D
 
A
T
 
A
P
 
D
I
 
L
R
 
Y
P
 
D
L
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
K
L
 
L
E
 
E
E
 
N
A
 
T
L
 
L
G
 
N
A
 
C
P
 
P
V
 
V
H
 
E
V
 
F
D
 
S
N
 
R
D
 
D
T
 
V
K
 
N
A
 
L
A
 
Q
A
 
L
M
 
S
A
 
W
E
 
D
R
 
V
L
 
V
F
 
E
G
 
N
A
 
-
C
 
-
R
 
R
G
 
L
V
 
T
E
 
Q
D
 
Q
F
 
L
V
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
L
 
L
T
 
G
G
 
-
H
 
-
S
 
T
G
 
G
V
 
M
G
 
G
G
x
F
G
 
A
L
 
V
F
 
W
F
 
M
G
 
N
G
 
G
R
 
A
L
 
P
Y
 
W
R
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
H
G
 
G
F
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
L
G
 
G
H
 
H
L
 
I
T
 
P
I
 
L
V
 
G
P
 
D
G
 
M
G
 
T
R
 
Q
A
 
H
C
 
C
G
 
A
C
 
C
G
 
G
K
 
N
R
 
P
G
 
G
C
 
C
L
 
L
E
 
E
T
 
T
Y
 
N
V
 
C
S
 
S
E
 
G
T
 
M
S
 
A
I
 
L
L
 
R
A
 
R
Q
 
W
A
 
Y
A
 
E
E
 
Q
R
 
Q
G
 
P
R
 
R
A
 
N
L
 
Y
P
 
P
-
 
L
-
 
R
D
 
D
L
 
L
W
 
F
A
 
V
A
 
H
A
 
A
A
 
E
A
 
N
A
 
A
R
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
P
 
P
V
 
F
V
 
V
R
 
Q
T
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
E
 
N
A
 
A
G
 
A
S
 
R
H
 
-
L
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
I
S
 
A
H
 
T
L
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
A
 
F
N
 
D
P
 
P
G
 
D
L
 
A
V
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
G
L
 
V
A
 
M
I
 
D
V
 
M
A
 
P
E
 
A
F
 
F
I
 
P
L
 
R
P
 
E
A
 
T
L
 
L
N
 
V
A
 
A
A
 
M
L
 
T
G
 
Q
E
 
K
H
 
Y
A
 
L
L
 
R
E
 
R
P
 
P
L
 
L

6jdoA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase with amp-pnp from pasteurella multocida
28% identity, 66% coverage: 89:348/392 of query aligns to 6:257/293 of 6jdoA

query
sites
6jdoA
L
 
L
E
 
D
P
 
I
G
 
G
T
 
G
I
 
T
R
 
K
I
 
I
V
 
A
S
 
S
T
 
A
T
 
I
L
 
V
A
 
T
G
 
D
T
 
G
V
 
K
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
S
 
R
Q
 
Q
I
 
Q
P
 
I
G
 
A
S
 
T
-
 
P
-
 
Q
T
 
A
D
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
N
A
 
A
L
 
M
R
 
H
H
 
D
L
 
T
H
 
L
E
 
A
G
 
N
I
 
I
D
 
L
A
 
A
V
 
L
V
 
Y
A
 
A
A
 
G
S
 
Q
R
 
F
P
 
D
E
 
Y
G
 
V
G
 
A
A
 
V
A
 
A
T
 
S
P
 
T
P
 
G
L
 
I
C
 
I
G
 
N
I
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
-
I
 
L
P
 
T
A
 
A
L
 
L
M
 
N
D
 
P
R
 
K
E
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
N
L
 
L
G
 
G
-
 
G
W
 
L
R
 
A
D
 
E
T
 
F
P
 
P
I
 
L
R
 
K
P
 
E
L
 
S
L
 
I
E
 
A
E
 
R
A
 
H
L
 
T
G
 
D
A
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
G
V
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
T
 
V
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
M
 
C
A
 
A
E
 
E
R
 
Y
L
 
K
F
 
D
G
 
E
A
 
D
C
 
K
R
 
N
G
 
A
V
 
V
E
 
Q
D
 
N
F
 
F
V
 
V
Y
 
F
L
 
I
T
 
T
G
 
V
H
x
S
S
x
T
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
I
F
 
I
F
 
L
G
 
E
G
 
R
R
 
R
L
 
L
Y
 
L
R
 
T
G
 
E
A
 
P
Q
 
N
G
 
G
F
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
H
I
 
I
G
 
G
H
|
H
L
 
T
T
 
L
I
 
A
V
 
D
P
 
P
G
 
N
G
 
G
R
 
P
A
 
V
C
|
C
G
 
G
C
|
C
G
 
G
K
x
R
R
 
V
G
 
G
C
 
C
L
 
V
E
 
E
T
 
A
Y
 
V
V
 
A
S
 
A
E
x
G
T
 
R
S
 
A
I
 
I
L
 
E
A
 
A
Q
 
V
A
 
S
A
 
S
E
 
Q
R
 
W
G
 
N
-
 
P
R
 
P
A
 
C
L
 
T
P
|
P
D
 
K
L
 
-
W
 
-
A
 
Q
A
 
A
A
x
F
A
 
E
A
 
L
A
 
F
R
 
R
D
 
K
G
 
N
D
 
D
P
 
E
V
 
K
V
 
A
R
 
T
T
 
A
L
 
L
L
 
I
E
 
Q
E
 
R
A
 
S
G
 
A
S
 
S
H
 
A
L
 
I
G
 
A
F
 
N
A
 
L
L
 
I
S
 
A
H
 
D
L
 
L
V
 
V
N
 
I
L
 
G
A
 
L
N
 
D
P
 
V
G
 
Q
L
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
N
x
S
L
 
V
A
 
G
I
 
L
V
 
-
A
 
A
E
 
E
F
 
G
I
 
Y
L
 
L
P
 
P
A
 
L
L
 
V
N
 
K
A
 
Q
A
 
Y
L
 
L

Query Sequence

>AZOBR_RS27950 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS27950
MLPRVNSAAIRRLNMVRVFHALRENPRCAQRDLSRLTGLDKATTSAIVAQMIEEGLVERT
EAPRARRIGRPETALGIAPSAGLLVGARLEPGTIRIVSTTLAGTVVEQSQIPGSTDLATA
LRHLHEGIDAVVAASRPEGGAATPPLCGIGVGIPALMDREGRLVLAPNLGWRDTPIRPLL
EEALGAPVHVDNDTKAAAMAERLFGACRGVEDFVYLTGHSGVGGGLFFGGRLYRGAQGFA
GEIGHLTIVPGGRACGCGKRGCLETYVSETSILAQAAERGRALPDLWAAAAAARDGDPVV
RTLLEEAGSHLGFALSHLVNLANPGLVVLGGNLAIVAEFILPALNAALGEHALEPLRRDL
RLLVSPLGPDAVPMGGIALAMDGFLSVPSPIL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory