SitesBLAST

SitesBLAST – Find functional sites

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS29690 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS29690 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1t3qB Crystal structure of quinoline 2-oxidoreductase from pseudomonas putida 86 (see paper)
37% identity, 97% coverage: 15:782/789 of query aligns to 14:782/786 of 1t3qB

query
sites
1t3qB

V

I

G

G

A

T

R

S

V

V

R

L

R

R

K

R

E

E

D

D

D

T

R

R

L

L

L

L

R

T

G

G

R

R

G

G

R

R

F

Y

V

I

G

A

D

D

I

L

A

V

L

L

V

S

G

G

M

M

K

L

E

H

L

V

A

A

F

S

V

L

R

R

S

S

P

P

V

F

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

V

G

S

I

I

E

D

I

V

P

A

E

D

E

A

H

Q

R

A

-

L

-

P

G

G

A

V

V

E

F

L

T

V

W

W

-

C

-

G

-

A

-

D

-

V

A

A

D

E

L

L

A

S

A

Q

G

G

G

-

V

-

K

-

P

-

I

I

R

V

A

A

V

T

S

M

G

Q

L

V

P

E

G

G

F

F

K

Q

V

T

S

T

E

I

Q

Q

P

P

A

L

L

L

A

A

D

N

G

G

K

V

V

T

R

R

F

F

V

V

G

G

E

E

P

I

V

V

A

A

V

V

C

V

V

V

A

A

A

S

T

S

R

R

A

A

E

I

A

A

E

E

D

D

I

A

A

A

A

Q

S

L

V

I

F

Q

V

V

D

E

Y

Y

A

E

E

E

L

L

P

P

V

A

N

V

S

T

D

G

M

-

L

I

E

E

A

A

V

A

A

L

P

E

G

G

A

E

P

A

K

R

V

A

H

N

D

D

H

T

W

L

P

A

D

G

N

N

V

V

F

V

L

S

E

R

T

T

N

S

V

R

G

A

G

R

N

D

-

E

I

L

A

A

E

P

I

I

A

F

A

A

T

S

A

S

P

A

V

G

K

V

V

V

S

R

R

G

T

Q

I

F

R

S

T

C

A

G

R

R

Q

V

C

S

M

A

V

C

P

P

L

M

E

E

G

T

K

R

G

G

V

A

V

V

A

A

H

Q

W

Y

D

E

R

W

H

T

V

T

E

Q

Q

Q

L

L

V

I

L

L

T

W

T

T

S

A

T

T

Q
|
Q

M

M

P

P

H

S

I

F

V

V

R

R

A

T

G

M

L

V

S

A

E

M

C

F

L

C

D

A

L

I

D

P

Q

E

G

H

L

L

I

I

R

E

V

V

V

R

A

V

P

P

D

D

V

V

G

G

G

G

G
|
G

F
|
F

G

G

W

Q

K

K

G
x
A

L

H

L

L

Q

H

P

P

E

E

E

E

I

L

V

L

A

V

A

C

W

L

I

L

A

S

M

R

R

A

L

L

D

G

R

R

P

P

V

V

R

R

W

W

T

I

E

E

D

D

R

R

R

Q

E

E

H

N

L

F

V

L

A

G

A

A

A

T

N

H

A

A

R

K

E

Q

H

Q

H

R

Y

N

E

E

I

M

T

G

A

L

Y

A

A

F

D

D

A

G

R

D

G

G

R

R

L

F

L

L

G

A

I

L

E

E

A

N

D

R

A

S

W

I

V

T

D

D

A

G

G

G

A

A

Y

Y

S

N

V

N

Y

L

P

P

F

W

S

T

A

Q

C

L

L

V

E
|
E

A

S

A

H

Q

V

V

G

G

N

S

A

I
x
V

L

I

P

L

G

G

P

V

Y

Y

D

K

F

V

A

P

H

A

Y

V

R

S

C

E

R

E

T

S

F

I

S

A

V

V

C

A

T

T

N

N

K

K

P

C

P

P

I

I

V

G

P

A

Y

Y

R
|
R

G

G

V

V

A

G

R

F

T

T

G

A

V

G

C

Q

F

I

A

A

M

R

E

E

Q

T

M

L

I

I

D

D

A

R

V

A

A

A

D

R

A

Q

V

L

G

G

R

L

E

S

P

P

W

F

Q

E

V

I

R

R

L

R

E

R

N

N

L

V

V

V

P

M

P

P

E

E

K

D

M

F

P

P

F

F

D

T

N

N

V

R

T

L

K

G

K

Q

H

T

F

H

D

R

S

E

G

G

D

T

Y

Y

P

L

E

Q

S

T

V

I

R

N

R

L

A

L

V

E

A

E

A

M

I

V

E

N

L

P

E

E

G

A

W

F

R

R

A

Q

R

R

Q

Q

K

A

A

E

G

A

E

R

A

A

D

R

G

G

R

K

L

Y

I

L

G

G

V

L

G

G

F

V

A

S

T

V

Y

F

C

N

E

E

Q

V

S

T

A

G

H

T

G

G

T

T

A

R

V

T

Y

L

H

S

G

F

W

L

G

G

I

T

P

P

M

T

V

T

P

T

G

-

H

H

E

D

Q

S

A

A

Q

T

A

V

R

R

I

I

T

D

P

P

D

T

G

G

G

K

L

V

E

T

L

V

R

T

V

T

G

S

V

L

Q

A

S

S

H
x
S

G
|
G

Q
|
Q

S

G

M
x
H

E

E

T

T

T
|
T

F

L

A

A

Q

Q

V

I

A

A

H

A

E

D

V

V

L

L

G

G

I

V

P

P

L

A

E

S

K

D

I

V

K

V

L

I

V

Q

H

A

G

G

D

S

T

T

G

K

L

N

T

T

P

-

Y

Y

S

G

T

F

G

G

T

A

W
x
Y

G

A

S
|
S

R

R

S
x
G

M
x
A

V

V

M

I

A

G

G

A

G

G

A

S

V

I

A

G

T

R

A

A

C

A

R

S

T

I

L

V

A

R

E

E

R

R

L

V

R

K

K

Q

I

L

G

A

A

G

H

H

L

L

M

L

Q

E

A

A

G

A

P

S

D

E

G

D

V

I

V

V

L

I

K

E

D

D

G

G

A

L

V

V

-

H

T

V

A

A

G

G

P

V

A

P

A

A

-

K

-

G

V

M

T

P

I

F

R

A

E

E

I

V

A

V

H

G

T

A

W

A

Y

Y

R

F

A

A

P

D

Q

A

L

T

L

H

P

P

A

P

D

G

V

F

D

D

R

-

G

A

G

T

L

L

E

E

V

A

T

T

A

A

G

T

Y

Y

K

D

P

P

G

-

S

S

D

D

H

L

G

-

T

V

F

L

S

A

Y

N

A

G

T

G

H

H

A

A

V

A

A

I

V

V

A

E

V

I

D

D

P

A

E

S

I

T

G

Y

Q

A

V

T

E

R

I

V

L

T

D

D

Y

F

V

F

V

A

V

V

E

E

D

D

A
x
C

G

G

T

T

M

M

V
x
I

N

N

P

P

M

M

V
x
I

V
|
V

D

E

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

R

G

G

G

G

V

I

A

A

Q

Q

G

A

V

I

G

G

T

Q

A

T

L

L

Y

L

E

E

R

E

M

V

P

I

Y

Y

D

D

A

D

E

F

G

G

Q

Q

P

L

L

V

A

T

S

T

T

T

F

L

A

M

D

D

Y

Y

L

L

I

I

P

P

G

T

F

T

T

L

E

D

V

V

P

P

H

D

V

I

R

R

I

I

I

R

H

H

M

L

L

E

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

L

T

V

E

P

F

G

G

G

V

I

K
|
K

G
|
G

I
x
M

G
|
G

E
|
E

G
x
S

G

A

A

M

I

I

A

S

P

A

P

P

A

A

A

A

I

V

C

V

N

A

A

A

I

V

N

N

D

D

A

A

L

L

K

A

P

H

L

L

G

E

V

V

I

V

V

I

T

E

N

T

A

V

P

P

M

I

T

T

P

P

E

E

V

R

I

I

L

F

T

R

A

S

I

I

active site: Q224 (= Q222), A259 (≠ G257), E336 (= E334), V343 (≠ I341), R371 (= R369), E743 (= E743), S744 (≠ G744)
binding pterin cytosine dinucleotide: G254 (= G252), F255 (= F253), R371 (= R369), S506 (≠ H505), G507 (= G506), Q508 (= Q507), H510 (≠ M509), T513 (= T512), Y545 (≠ W545), S547 (= S547), G549 (≠ S549), A550 (≠ M550), C666 (≠ A666), I670 (≠ V670), I674 (≠ V674), V675 (= V675), Q678 (= Q678), K739 (= K739), G740 (= G740), M741 (≠ I741), G742 (= G742)

1ffvB Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava (see paper)
32% identity, 97% coverage: 11:774/789 of query aligns to 8:782/797 of 1ffvB

query
sites
1ffvB

A

A

G

L

S

A

G

G

V

M

G

G

A

A

R

S

V

R

R

L

R

R

K

K

E

E

D

D

D

A

R

R

L

F

L

I

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

I

A

K

L

M

V

P

G

G

M

M

K

L

E

H

L

M

A

D

F

I

V

V

R

R

S

A

P

P

V

I

A

A

H

H

A

G

T

R

I

I

T

K

G

K

I

I

E

-

I

-

P

-

E

-

E

-

H

H

R

K

G

D

A

A

V

A

F

L

T

A

W

M

-

P

-

G

-

V

-

H

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

E

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

K

A

-

V

L

S

H

G

W

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

A

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

H

F

F

V

Q

G

M

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

I

C

V

V

I

A

A

A

D

T

D

R

R

A

Y

E

I

A

A

E

A

D

D

I

A

A

V

A

E

S

A

V

V

F

K

V

V

D

E

Y

Y

A

D

E

E

L

L

P

P

V

V

N

V

S

I

D

D

M

P

L

I

E

D

A

A

V

L

A

K

P

P

G

D

A

A

P

P

K

V

V

L

H

R

D

E

-

D

-

L

-

A

-

G

-

K

-

T

-

S

-

G

-

A

H

H

W

G

P

P

-

R

-

E

-

H

D

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

T

T

W

N

G

V

A

G

G

G

D

N

K

I

A

A

A

E

T

-

D

-

A

I

V

A

F

A

A

T

N

A

A

P

P

V

V

K

T

V

V

S

S

R

Q

T

H

I

M

R

Y

T

Y

A

P

R

R

Q

V

C

H

M

P

V

C

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

G

V

C

V

V

A

A

H

S

W

F

D

D

R

P

H

I

V

K

E

G

Q

D

L

L

V

T

L

T

T

Y

T

I

S

T

T

S

Q
|
Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

V

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

M

C

L

L

S

D

G

L

I

D

P

Q

E

G

S

L

K

I

V

R

R

V

I

V

V

A

S

P

P

D

D

V

I

G

G

G
|
G

G
|
G

F
|
F

G
|
G

W

N

K

K

G
x
V

L

G

L

I

Q

Y

P

P

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

I

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

R

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

V

E

E

H

N

L

I

V

S

A

T

A

T

A

A

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

D

I

G

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

P

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

G

I

L

E

R

A

V

D

N

A

V

W

V

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

T

Q

K

-

F

-
x
P

-

A

-

G

V

L

G

F

S

H

I
|
I

L

C

P

S

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

I

A

P

H

R

Y

A

R

H

C

C

R

S

T

V

F

K

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

P

I

G

-

G

V

V

P
x
A

Y

Y

R
|
R

G
x
C

V

S

A

F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

L

M

I

E

E

Q

R

M

M

I

V

D

D

A

V

V

L

A

A

D

Q

A

K

V

L

G

N

R

M

E

D

P

K

W

A

Q

E

V

I

R

R

L

A

E

K

N

N

L

F

V

I

P

R

P

K

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

T

N

T

V

Q

T

F

K

G

K

F

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

D

Y

Y

P

H

E

T

S

A

V

L

R

K

R

K

A

V

V

L

A

D

A

A

I

V

E

D

L

Y

E

P

G

A

W

L

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

A

A

A

G

R

E

R

A

A

D

D

G

P

R

N

-

S

-

P

-

T

L

L

I

M

G

G

V

I

G

G

F

L

A

V

T

T

Y

F

C

T

E

E

Q

V

S

V

A

G

H

A

G

G

-

P

T

S

A

K

V

M

Y

C

H

D

G

I

W

L

G

G

I

V

P

G

M

M

V

F

P

-

G

-

H

-

E

D

Q

S

A

C

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

A

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

I

S

T

H
x
Q

G
|
G

Q
|
Q

S

G

M
x
H

E

Q

T

T

T
|
T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

S

E

E

K

V

I

I

K

Q

L

V

V

E

H

E

G

G

D

D

T

T

G

S

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T

T

W
x
Y

G
|
G

S
|
S

R

R

S
|
S

M
x
T

V

P

M

V

A

A

G

G

G

A

A

A

V

I

A

A

T

L

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

H

E

A

R

K

L

A

R

R

K

K

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

N

P

E

D

N

G

D

V

L

V

D

L

W

K

E

D

V

G

D

A

R

V

F

T

K

A

V

G

K

P

G

A

D

A

D

V

S

T

K

I

F

R

K

E

T

I

M

A

A

H

D

T

I

W

A

Y

W

R

Q

A

A

P

Y

Q

H

L

Q

L

P

P

P

A

A

D

G

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

H

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

F

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

I

H

Y

A

L

V

C

A

V

V

V

A

D

V

I

D

D

P

R

E

A

I

T

G

G

Q

E

V

T

E

K

I

V

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A
x
C

G

G

T

T

M

R

V
x
I

N

N

P

P

M

M

V

I

V
x
I

D

E

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

G

V

Y

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

Q

M

M

P

P

Y

F

D

D

A

A

E

Q

G

G

Q

N

P

L

L

L

A

G

S

N

T

T

F

L

A

M

D

D

Y

Y

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

H

V

W

R

E

I

T

I

D

H

H

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K
|
K

G
|
G

I
x
V

G
x
A

E
|
E

G
x
S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

S

P

I

A

P

A

T

I

F

C

T

N

A

A

A

I

V

N

V

D

D

A

A

L

F

K

A

P

H

L

V

G

G

V

V

I

T

V

H

T

L

N

D

A

M

P

P

M

H

T

T

active site: Q231 (= Q222), V266 (≠ G257), P343 (vs. gap), I349 (= I341), R378 (= R369), C379 (≠ G370), E751 (= E743), S752 (≠ G744)
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): G260 (= G251), G261 (= G252), F262 (= F253), G263 (= G254), A376 (≠ P367), R378 (= R369), C379 (≠ G370), Q516 (≠ H505), G517 (= G506), Q518 (= Q507), H520 (≠ M509), T523 (= T512), Y556 (≠ W545), G557 (= G546), S558 (= S547), S560 (= S549), T561 (≠ M550), C674 (≠ A666), I678 (≠ V670), I683 (≠ V675), Q686 (= Q678), K747 (= K739), G748 (= G740), V749 (≠ I741), A750 (≠ G742), E751 (= E743)

1ffuB Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
32% identity, 97% coverage: 11:774/789 of query aligns to 8:782/797 of 1ffuB

query
sites
1ffuB

A

A

G

L

S

A

G

G

V

M

G

G

A

A

R

S

V

R

R

L

R

R

K

K

E

E

D

D

D

A

R

R

L

F

L

I

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

I

A

K

L

M

V

P

G

G

M

M

K

L

E

H

L

M

A

D

F

I

V

V

R

R

S

A

P

P

V

I

A

A

H

H

A

G

T

R

I

I

T

K

G

K

I

I

E

-

I

-

P

-

E

-

E

-

H

H

R

K

G

D

A

A

V

A

F

L

T

A

W

M

-

P

-

G

-

V

-

H

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

E

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

K

A

-

V

L

S

H

G

W

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

A

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

H

F

F

V

Q

G

M

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

I

C

V

V

I

A

A

A

D

T

D

R

R

A

Y

E

I

A

A

E

A

D

D

I

A

A

V

A

E

S

A

V

V

F

K

V

V

D

E

Y

Y

A

D

E

E

L

L

P

P

V

V

N

V

S

I

D

D

M

P

L

I

E

D

A

A

V

L

A

K

P

P

G

D

A

A

P

P

K

V

V

L

H

R

D

E

-

D

-

L

-

A

-

G

-

K

-

T

-

S

-

G

-

A

H

H

W

G

P

P

-

R

-

E

-

H

D

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

T

T

W

N

G

V

A

G

G

G

D

N

K

I

A

A

A

E

T

-

D

-

A

I

V

A

F

A

A

T

N

A

A

P

P

V

V

K

T

V

V

S

S

R

Q

T

H

I

M

R

Y

T

Y

A

P

R

R

Q

V

C

H

M

P

V

C

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

G

V

C

V

V

A

A

H

S

W

F

D

D

R

P

H

I

V

K

E

G

Q

D

L

L

V

T

L

T

T

Y

T

I

S

T

T

S

Q
|
Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

V

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

M

C

L

L

S

D

G

L

I

D

P

Q

E

G

S

L

K

I

V

R

R

V

I

V

V

A

S

P

P

D

D

V

I

G

G

G

G

G

G

F

F

G

G

W

N

K

K

G
x
V

L

G

L

I

Q

Y

P

P

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

I

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

R

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

V

E

E

H

N

L

I

V

S

A

T

A

T

A

A

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

D

I

G

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

P

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

G

I

L

E

R

A

V

D

N

A

V

W

V

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

T

Q

K

-

F

-
x
P

-

A

-

G

V

L

G

F

S

H

I
|
I

L

C

P

S

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

I

A

P

H

R

Y

A

R

H

C

C

R

S

T

V

F

K

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

P

I

G

-

G

V

V

P

A

Y

Y

R
|
R

G
x
C

V

S

A

F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

L

M

I

E

E

Q

R

M

M

I

V

D

D

A

V

V

L

A

A

D

Q

A

K

V

L

G

N

R

M

E

D

P

K

W

A

Q

E

V

I

R

R

L

A

E

K

N

N

L

F

V

I

P

R

P

K

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

T

N

T

V

Q

T

F

K

G

K

F

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

D

Y

Y

P

H

E

T

S

A

V

L

R

K

R

K

A

V

V

L

A

D

A

A

I

V

E

D

L

Y

E

P

G

A

W

L

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

A

A

A

G

R

E

R

A

A

D

D

G

P

R

N

-

S

-

P

-

T

L

L

I

M

G

G

V

I

G

G

F

L

A

V

T

T

Y

F

C

T

E

E

Q

V

S

V

A

G

H

A

G

G

-

P

T

S

A

K

V

M

Y

C

H

D

G

I

W

L

G

G

I

V

P

G

M

M

V

F

P

-

G

-

H

-

E

D

Q

S

A

C

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

A

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

I

S

T

H

Q

G

G

Q
|
Q

S

G

M
x
H

E

Q

T

T

T
|
T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

S

E

E

K

V

I

I

K

Q

L

V

V

E

H

E

G

G

D

D

T

T

G

S

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T

T

W

Y

G

G

S
|
S

R

R

S
|
S

M
x
T

V

P

M

V

A

A

G

G

G

A

A

A

V

I

A

A

T

L

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

H

E

A

R

K

L

A

R

R

K

K

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

N

P

E

D

N

G

D

V

L

V

D

L

W

K

E

D

V

G

D

A

R

V

F

T

K

A

V

G

K

P

G

A

D

A

D

V

S

T

K

I

F

R

K

E

T

I

M

A

A

H

D

T

I

W

A

Y

W

R

Q

A

A

P

Y

Q

H

L

Q

L

P

P

P

A

A

D

G

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

H

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

F

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

I

H

Y

A

L

V

C

A

V

V

V

A

D

V

I

D

D

P

R

E

A

I

T

G

G

Q

E

V

T

E

K

I

V

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A
x
C

G

G

T
|
T

M

R

V
x
I

N

N

P

P

M

M

V

I

V
x
I

D

E

G

G

Q

Q

I

I

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

G

V

Y

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

Q

M

M

P

P

Y

F

D

D

A

A

E

Q

G

G

Q

N

P

L

L

L

A

G

S

N

T

T

F

L

A

M

D

D

Y

Y

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

H

V

W

R

E

I

T

I

D

H

H

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K
|
K

G
|
G

I
x
V

G
x
A

E
|
E

G
x
S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

S

P

I

A

P

A

T

I

F

C

T

N

A

A

A

I

V

N

V

D

D

A

A

L

F

K

A

P

H

L

V

G

G

V

V

I

T

V

H

T

L

N

D

A

M

P

P

M

H

T

T

active site: Q231 (= Q222), V266 (≠ G257), P343 (vs. gap), I349 (= I341), R378 (= R369), C379 (≠ G370), E751 (= E743), S752 (≠ G744)
binding cytidine-5'-diphosphate: Q518 (= Q507), H520 (≠ M509), T523 (= T512), S558 (= S547), S560 (= S549), T561 (≠ M550), C674 (≠ A666), T676 (= T668), I678 (≠ V670), I683 (≠ V675), K747 (= K739), G748 (= G740), V749 (≠ I741), A750 (≠ G742)

P19913 Carbon monoxide dehydrogenase large chain; CO dehydrogenase subunit L; CO-DH L; EC 1.2.5.3 from Hydrogenophaga pseudoflava (Pseudomonas carboxydoflava) (see paper)
32% identity, 97% coverage: 11:774/789 of query aligns to 14:788/803 of P19913

query
sites
P19913

A

A

G

L

S

A

G

G

V

M

G

R

A

P

R

R

V

A

R

C

R

A

K

K

E

E

D

D

D

A

R

R

L

F

L

I

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

I

A

K

L

M

V

P

G

G

M

M

K

L

E

H

L

M

A

D

F

I

V

V

R

R

S

A

P

P

V

I

A

A

H

H

A

G

T

R

I

I

T

K

G

K

I

I

E

-

I

-

P

-

E

-

E

-

H

H

R

K

G

D

A

A

V

A

F

L

T

A

W

M

-

P

-

G

-

V

-

H

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

E

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

K

A

-

V

L

S

H

G

W

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

A

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

H

F

F

V

Q

G

M

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

I

C

V

V

I

A

A

A

D

T

D

R

R

A

Y

E

I

A

A

E

A

D

D

I

A

A

V

A

E

S

A

V

V

F

K

V

V

D

E

Y

Y

A

D

E

E

L

L

P

P

V

V

N

V

S

I

D

D

M

P

L

I

E

D

A

A

V

L

A

K

P

P

G

D

A

A

P

P

K

V

V

L

H

R

D

E

-

D

-

L

-

A

-

G

-

K

-

T

-

S

-

G

-

A

H

H

W

G

P

P

-

R

-

E

-

H

D

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

T

T

W

N

G

V

A

G

G

G

D

N

K

I

A

A

A

E

T

-

D

-

A

I

V

A

F

A

A

T

N

A

A

P

P

V

V

K

T

V

V

S

S

R

Q

T

H

I

M

R

Y

T

Y

A

P

R

R

Q

V

C

H

M

P

V

C

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

G

V

C

V

V

A

A

H

S

W

F

D

D

R

P

H

I

V

K

E

G

Q

D

L

L

V

T

L

T

T

Y

T

I

S

T

T

S

Q

Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

V

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

M

C

L

L

S

D

G

L

I

D

P

Q

E

G

S

L

K

I

V

R

R

V

I

V

V

A

S

P

P

D

D

V

I

G

G

G

G

G

G

F

F

G

G

W

N

K

K

G

V

L

G

L

I

Q

Y

P

P

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

I

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

R

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

V

E

E

H

N

L

I

V

S

A

T

A

T

A

A

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

D

I

G

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

P

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

G

I

L

E

R

A

V

D

N

A

V

W

V

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

T

Q

K

-

F

-

P

-

A

-

G

V

L

G

F

S

H

I

I

L

C

P

S

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

I

A

P

H

R

Y

A

R

H

C

C

R

S

T

V

F

K

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

P

I

G

-

G

V

V

P

A

Y

Y

R
|
R

G

C

V

S

A

F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

L

M

I

E

E

Q

R

M

M

I

V

D

D

A

V

V

L

A

A

D

Q

A

K

V

L

G

N

R

M

E

D

P

K

W

A

Q

E

V

I

R

R

L

A

E

K

N

N

L

F

V

I

P

R

P

K

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

T

N

T

V

Q

T

F

K

G

K

F

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

D

Y

Y

P

H

E

T

S

A

V

L

R

K

R

K

A

V

V

L

A

D

A

A

I

V

E

D

L

Y

E

P

G

A

W

W

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

A

A

A

G

R

E

R

A

A

D

D

G

P

R

N

-

S

-

P

-

T

L

L

I

M

G

G

V

I

G

G

F

L

A

V

T

T

Y

F

C

T

E

E

Q

V

S

V

A

G

H

A

G

G

-

P

T

S

A

K

V

M

Y

C

H

D

G

I

W

L

G

G

I

V

P

G

M

M

V

F

P

-

G

-

H

-

E

D

Q

S

A

C

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

A

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

I

S

T

H

Q

G

G

Q

Q

S

G

M

H

E

Q

T

T

T

T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

S

E

E

K

V

I

I

K

Q

L

V

V

E

H

E

G

G

D

D

T

T

G

S

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T

T

W

Y

G

G

S

S

R

R

S

S

M

T

V

P

M

V

A

A

G

G

G

A

A

A

V

I

A

A

T

L

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

H

E

A

R

K

L

A

R

R

K

K

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

N

P

E

D

N

G

D

V

L

V

D

L

W

K

E

D

V

G

D

A

R

V

F

T

K

A

V

G

K

P

G

A

D

A

D

V

S

T

K

I

F

R

K

E

T

I

M

A

A

H

D

T

I

W

A

Y

W

R

Q

A

A

P

Y

Q

H

L

Q

L

P

P

P

A

A

D

G

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

H

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

F

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

I

H

Y

A

L

V

C

A

V

V

V

A

D

V

I

D

D

P

R

E

A

I

T

G

G

Q

E

V

T

E

K

I

V

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A

C

G

G

T

T

M

R

V

I

N

N

P

P

M

M

V

I

V

I

D

E

G

G

Q

Q

I

I

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

G

V

Y

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

Q

M

M

P

P

Y

F

D

D

A

A

E

Q

G

G

Q

N

P

L

L

L

A

G

S

N

T

T

F

L

A

M

D

D

Y

Y

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

H

V

W

R

E

I

T

I

D

H

H

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K

K

G

G

I

V

G

A

E

E

G

S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

S

P

I

A

P

A

T

I

F

C

T

N

A

A

A

I

V

N

V

D

D

A

A

L

F

K

A

P

H

L

V

G

G

V

V

I

T

V

H

T

L

N

D

A

M

P

P

M

H

T

T

R384 (= R369) modified: 4-hydroxyarginine

7dqxD Crystal structure of xanthine dehydrogenase family protein
32% identity, 98% coverage: 15:784/789 of query aligns to 6:768/770 of 7dqxD

query
sites
7dqxD

V

I

G

G

A

Q

R

E

V

V

R

L

R

R

K

R

E

E

D

D

D

R

R

R

L

L

L

L

R

T

G

G

R

T

G

A

R

T

F

F

V

A

G

G

D

D

I

L

A

G

L

V

V

P

G

G

M

Q

K

L

E

H

L

M

A

R

F

I

V

V

R

R

S

S

P

T

V

Q

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

V

G

S

I

I

E

D

I

A

P

T

E

E

-

A

-

E

-

K

-

T

-

P

-

G

-

V

-

R

-

M

-

V

-

I

-

T

-

S

-

E

-

H

-

T

E

R

H

H

R

L

G

G

A

S

V

V

F

L

T

-

W

-

A

-

D

-

L

L

A

E

A

E

G

L

G

G

V

Y

K

H

P

E

I

I

R

-

A

-

V

Y

S

E

G

N

L

I

P

E

G

D

F

F

K

S

V

-

S

-

E

-

Q

H

P

P

A

V

L

L

A

A

D

V

G

D

K

K

V

V

R

L

F

Y

V

V

G

G

E

Q

P

P

V

V

A

V

V

A

C

V

V

L

A

A

A

V

T

D

R

P

A

Y

E

L

A

A

E

E

D

D

I

A

A

A

A

E

S

L

V

V

F

S

V

I

D

E

Y

Y

A

E

E

P

L

L

P

P

V

V

N

L

S

L

D

D

M

P

L

E

E

E

A

A

V

L

A

T

P

-

G

G

A

K

P

V

K

E

V

L

H

F

D

P

H

G

W

R

P

G

D

N

N

E

V

G

F

A

L

R

E

I

T

K

N

K

V

A

G

Y

G

G

N

D

I

I

A

D

E

R

I

A

A

F

A

A

T

E

A

A

P

E

V

H

K

V

V

I

S

R

R

H

T

K

I

Y

R

V

T

T

A

N

R

R

Q

H

C

S

M

G

V

V

P

P

L

M

E

E

G

P

K

R

G

A

V

V

V

V

A

V

H

Q

W

P

D

D

R

P

H

A

V

R

E

D

Q

T

L

L

V

F

L

I

T

W

T

G

S

T

T

V

Q

H

M

V

P

-

H

H

I

D

V

N

R

R

A

R

G

I

L

I

S

A

E

K

C

M

L

L

D

N

L

L

D

P

Q

E

G

V

L

N

I

V

R

R

V

M

V

K

A

H

P

V

D

E

V

I

G

G

G
|
G

G
x
S

F
|
F

G

G

W

V

K

K

G

G

L

G

L

V

Q

F

P

P

E

E

E

N

I

V

V

V

A

A

A

A

W

W

I

A

A

A

M

R

R

T

L

L

D

G

R

V

P

P

V

I

R

K

W

W

T

T

E

E

D

D

R

R

R

V

E

E

H

H

L

M

V

T

A

S

A

T

A

S

N

H

A

A

R

R

E

E

H

M

H

V

Y

H

E

K

I

L

T

E

A

L

Y

A

A

L

D

D

A

A

R

E

G

G

R

R

L

I

L

L

G

G

I

M

E

K

A

D

D

E

A

I

W

F

V

H

D

N

A

H

G

G

A

A

Y

Y

S

-

V

-

Y

F

P

R

F

Q

S

A

A

E

C

P

L

L

E

V

A

S

A

D

Q

I

V

T

G

A

S

G

I

I

L

V

P

F

G

G

P

P

Y

Y

D

R

F

V

A

P

H

A

Y

Y

R

D

C

A

R

T

T

L

F

H

S

A

V

V

C

F

T

T

N

N

K

K

P

T

P

P

I

V

V

G

P

A

Y

Y

R
|
R

G

A

V

P

A

G

R

R

T

Y

G

E

V

S

C

T

F

F

A

A

M

R

E

E

Q

R

M

I

I

F

D

D

A

L

V

A

A

C

D

A

A

E

V

I

G

G

R

L

E

S

P

K

W

T

Q

E

V

F

R

R

L

R

E

R

N

N

L

L

V

L

P

T

P

A

E

E

K

D

M

L

P

P

-

W

-

T

-

P

-

G

F

L

D

D

N

I

V

V

T

H

K

E

-

P

K

Y

H

H

F

F

D

D

S

S

G

G

D

D

Y

V

P

V

E

K

S

H

V

F

R

N

R

E

A

A

V

L

A

E

A

A

I

A

E

N

L

F

E

S

G

E

W

W

R

L

A

E

R

E

Q

S

K

K

A

R

G

L

E

R

A

A

D

D

G

G

R

R

L

K

I

V

G

G

V

V

G

G

F

L

A

G

T

V

Y

L

C

M

E

D

Q

K

S

A

A

-

H

-

G

-

T

-

A

-

V

-

Y

-

H

-

G

G

W

L

G

G

I

L

P

F

M

E

V

T

P

G

G

G

H

V

E

E

Q

V

A

S

Q

R

A

A

R

-

I

-

T

-

P

-

D

-

G

G

G

R

L

V

E

T

L

V

R

K

V

T

G

G

V

G

Q

S

S

S

H
x
V

G
|
G

Q
|
Q

S
x
G

M

I

E

E

T

T

T
x
V

F

L

A

A

Q

Q

V

I

A

V

H

A

E

E

V

E

L

L

G

Q

I

I

P

A

L

P

E

E

K

N

I

I

K

D

L

I

V

V

H

H

G

S

D

D

T

T

G

E

L

L

T

I

P

P

Y

D

S

G

T

V

G

G

T
x
S

W
|
W

G
x
S

S
|
S

R
|
R

S
|
S

M
x
T

V

V

M

L

A

A

G

G

G

G

A

A

V

A

A

R

T

K

A

A

C

A

R

L

T

A

L

V

A

V

E

E

R

K

L

A

R

R

K

R

I

L

G

A

A

S

H

E

L

M

M

L

Q

E

A

A

G

D

P

P

D

D

G

D

V

L

V

E

L

L

K

T

D

A

G

G

A

S

-

F

-

K

V

V

T

K

A

G

G

T

P

D

A

Q

A

Q

V

I

T

S

I

L

R

Y

E

E

I

I

A

A

H

A

T

A

W

-

Y

-

R

R

A

D

P

P

Q

F

L

T

L

A

P

R

A

A

D

D

V

N

D

D

R

E

G

P

G

G

L

L

E

A

V

A

T

D

A

A

G

V

Y

Y

K

M

P

-

G

-

S

N

D

N

H

A

G

M

T

N

F

Y

S

P

Y

Y

A

G

T

V

H

T

A

L

V

V

A

Q

V

I

A

E

V

L

D

D

P

P

E

D

I

T

G

G

Q

G

V

H

E

R

I

I

L

L

D

R

Y

F

V

S

V

T

V

S

E

T

D

E

A

A

G

G

T

R

M

V

V

I

N

N

P

P

M

L

V
x
T

V
x
T

D

R

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

I

G

G

G

A

V

A

A

V

Q

Q

G

G

V

I

G

G

T

G

A

A

L

L

Y

Y

E

E

R

E

M

F

P

L

Y

Y

D

E

A

E

E

D

G

G

Q

Q

P

P

L

I

A

T

S

T

T

S

F

F

A

M

D

D

Y

Y

L

L

I

L

P

P

G

S

F

A

T

Q

E

E

V

M

P

P

H

N

V

V

R

D

-

C

I

F

I

V

H

T

M

E

L

D

T

A

P

K

S

S

P

P

Y

D

T

N

E

P

F

F

G

G

V

A

K

K

G
|
G

I
x
L

G
|
G

E
|
E

G

I

G

G

A

I

I

I

A

A

P

-

P

A

A

G

A

A

I

A

C

I

N

A

A

S

I

A

N

I

D

D

A

D

L

A

K

I

P

A

L

D

G

G

V

V

I

H

V

T

T

D

N

R

A

L

P

P

M

V

T

T

P

P

E

E

V

Q

I

I

L

F

T

S

A

R

I

C

A

Q

G

G

binding pterin cytosine dinucleotide: G247 (= G251), S248 (≠ G252), F249 (= F253), R363 (= R369), V491 (≠ H505), G492 (= G506), Q493 (= Q507), G494 (≠ S508), V498 (≠ T512), S530 (≠ T544), W531 (= W545), S532 (≠ G546), S533 (= S547), R534 (= R548), S535 (= S549), T536 (≠ M550), T658 (≠ V674), T659 (≠ V675), Q662 (= Q678), G725 (= G740), L726 (≠ I741), G727 (= G742), E728 (= E743)

4zohA Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
32% identity, 95% coverage: 15:762/789 of query aligns to 3:687/701 of 4zohA

query
sites
4zohA

V

I

G

G

A

K

R

P

V

I

R

K

R

R

K

I

E

E

D

D

D

L

R

R

L

L

L

I

R

T

G

G

R

K

G

G

R

A

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

I

A

E

L

L

V

P

G

G

M

T

K

L

E

F

L

V

A

A

F

F

V

V

R

R

S

S

P

K

V

Y

A

P

H

H

A

A

T

R

I

I

T

-

G

-

I

-

E

K

I

V

P

K

E

K

E

E

H

E

R

-

G

-

A

G

V

I

F

F

T

T

W

G

A

E

D

D

L

I

A

N

A

P

G

G

G

K

V

D

K

F

P

P

I

I

R

-

A

-

V

-

S

-

G

-

L

-

P

-

G

-

F

-

K

-

V

-

S

-

E

-

Q

-

P

-

A

-

L

-

A

A

D

T

G

K

K

E

V

T

R

T

F

Y

V

V

G

G

E

Q

P

P

V

I

A

A

V

I

C

V

V

I

A

A

A

K

T

D

R

R

A

Y

E

E

A

A

E

Y

D

D

I

L

A

I

A

E

S

S

V

V

F

E

V

V

D

E

Y

Y

A

E

E

E

L

L

P

D

V

Y

N

V

S

L

D

D

M

P

L

E

E

K

A

A

V

L

A

E

P

D

G

K

A

V

P

-

K

K

V

V

H

H

D

S

H

G

W

L

P

S

D

S

N

N

V

I

F

Y

L

Y

-

H

E

E

T

R

N

W

V

K

G

G

G

G

N

D

I

V

A

E

E

K

I

A

A

F

A

K

T

E

A

A

P

D

V

L

K

T

V

I

S

S

R

D

T

T

I

L

R

I

T

N

A

Q

R

R

Q

V

C

I

M

A

V

S

P

P

L

L

E

E

G

T

K

R

G

G

V

A

V

L

A

A

H

Y

W

F

D

D

R

G

H

N

V

-

E

-

Q

K

L

L

V

T

L

F

T

Y

T

S

S

S

T

T

Q
|
Q

M

S

P

A

H

H

I

Y

V

L

R

R

A

R

G

N

L

L

S

V

E

D

C

F

L

L

D

G

L

F

D

E

Q

N

G

-

L

-

I

I

R

R

V

V

V

I

A

Q

P

P

D

D

V

V

G

G

G
|
G

G
x
A

F
|
F

G

G

W

S

K

K

G
x
I

L

I

L

A

Q

H

P

P

E

E

E

E

I

Y

V

A

A

L

A

A

W

K

I

L

A

A

M

L

R

M

L

L

D

R

R

K

P

P

V

L

R

K

W

W

T

V

E

P

D

T

R

R

R

T

E

E

H

E

L

F

V

I

A

S

A

A

A

G

N

H

A

G

R

R

E

D

H

K

H

K

Y

L

E

K

I

F

T

E

A

V

Y

A

A

V

D

K

A

K

R

D

G

G

R

T

L

I

L

L

G

G

I

I

E

R

A

G

D

T

A

L

W

I

V

A

D

N

A

L

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

P

Y

Y

P

P

F

D

S

A

A

N

C

D

L

D

E

E

A

S

A

G

Q

N

V
|
V

G

K

S
|
S

-

T

-

V

-

R

I
x
M

L

L

P

P

G

G

P

I

Y

Y

D

K

F

I

A

I

H

G

Y

A

R

D

C

I

R

D

T

A

F

Y

S

A

V

V

C

H

T

T

N

N

K

I

P

T

P

P

I

T

V

Q

P

S

Y

Y

R
|
R

G

G

V

A

A

G

R

R

T

P

G

E

V

G

C

I

F

Y

A

F

M

I

E

E

Q

R

M

I

I

V

D

N

A

I

V

V

A

A

D

D

A

E

V

L

G

G

R

I

E

D

P

Q

W

Y

Q

E

V

I

R

R

L

L

E

K

N

N

L

A

V

I

P

-

P

-

E

D

K

T

M

L

P

P

F

Y

D

T

N

N

V

I

T

F

K

G

K

V

H

T

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

N

Y

-

P

-

E

-

S

-

V

V

R

K

R

K

A

L

V

L

A

E

A

I

I

-

E

-

L

-

E

-

G

G

W

K

R

K

A

Y

R

Y

Q

D

K

E

A

L

G

K

E

K

A

E

D

D

G

G

R

-

L

-

I

-

G

C

V

V

G

G

F

V

A

S

T

S

Y

Y

C

I

E

E

Q

I

S

T

A

A

H

F

G

G

T

P

A

-

V

-

Y

-

H

-

G

-

W

W

G

-

I

-

P

-

M

-

V

-

P

-

G

-

H

-

E

E

Q

V

A

A

Q

R

A

I

R

S

I

V

T

K

P

Y

D

D

G

G

G

K

L

I

E

T

L

L

R

V

V

T

G

G

V

T

Q

G

S

P

H
|
H

G
|
G

Q
|
Q

S

G

M
x
D

E

A

T

T

T

A

F

F

A

A

Q

Q

V

I

A

A

H

A

E

D

V

V

L

L

G

E

I

L

P

P

L

I

E

E

K

K

I

I

K

E

L

V

V

R

H

W

G

G

D

D

T

T

G

E

L

I

T

I

P

E

Y

D

S

G

T

I

G

G

T

T

W
|
W

G

G

S
|
S

R

R

S
x
T

M
x
V

V

T

M

I

A

G

G

G

G

S

A

A

V

V

A

L

T

L

A

A

C

S

R

Q

T

K

L

L

A

K

E

D

R

K

L

L

R

I

K

E

I

I

G

G

A

A

H

K

L

I

M

L

Q

N

A

A

G

D

P

E

D

-

G

-

V

-

V

-

L

Y

K

K

D

E

G

G

A

N

V

V

T

T

-

H

-

K

A

K

G

N

P

G

A

N

A

K

V

V

T

T

I

F

R

N

E

E

I

I

A

V

H

K

T

N

W

A

Y

F

R

K

A

M

P

G

Q

E

L

-

L

-

P

-

A

-

D

-

V

-

D

-

R

-

G

-

G

S

L

L

E

D

V

T

T

T

A

A

G

I

Y

Y

K

N

P

V

G

K

S

Q

D

P

H

P

G

T

T

T

F

-

S

P

Y

Y

A

G

T

V

H

H

A

L

V

A

A

L

V

V

A

K

V

V

D

D

P

G

E

-

I

T

G

G

Q

K

V

V

E

F

I

V

L

K

D

K

Y

Y

V

V

V

A

V

V

E

D

D

D

A

V

G

G

T

T

M

V

V
x
I

N
|
N

P

P

M

L

V
x
L

V

A

D

E

G

G

Q
|
Q

I

A

Y

I

G

G

G

G

V

I

A

V

Q

Q

G

G

V

M

G

A

T

Q

A

A

L

L

Y

L

E

E

R

G

M

A

P

F

Y

F

D

D

A

E

E

N

G

G

Q

Q

P

L

L

L

A

T

S

T

T

N

F

F

A

Q

D

D

Y

Y

L

P

I

I

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

I

P

P

H

E

V

-

R

K

I

I

-

D

-

W

-

Y

I

Y

H

E

M

I

L

L

T

G

P

K

S

S

P

P

Y

H

T

P

E

T

F

-

G

G

V

S

K
|
K

G
|
G

I
|
I

G
|
G

E
|
E

G
x
A

G

G

A

A

I

I

A

A

P

A

P

T

A

P

A

T

I

I

C

I

N

N

A

A

I

V

N

E

D

Q

A

C

L

I

K

K

active site: Q186 (= Q222), I219 (≠ G257), V298 (= V338), S300 (= S340), M304 (≠ I341), R332 (= R369), E668 (= E743), A669 (≠ G744)
binding pterin cytosine dinucleotide: G213 (= G251), A214 (≠ G252), F215 (= F253), R332 (= R369), H442 (= H505), G443 (= G506), Q444 (= Q507), D446 (≠ M509), W482 (= W545), S484 (= S547), T486 (≠ S549), V487 (≠ M550), I594 (≠ V670), N595 (= N671), L598 (≠ V674), Q602 (= Q678), K664 (= K739), G665 (= G740), I666 (= I741), G667 (= G742), E668 (= E743)

P19919 Carbon monoxide dehydrogenase large chain; CO dehydrogenase subunit L; CO-DH L; EC 1.2.5.3 from Afipia carboxidovorans (strain ATCC 49405 / DSM 1227 / KCTC 32145 / OM5) (Oligotropha carboxidovorans) (see 2 papers)
31% identity, 95% coverage: 13:765/789 of query aligns to 19:785/809 of P19919

query
sites
P19919

S

Q

G

G

V

M

G

G

A

C

R

K

V

R

R

K

R

R

K

V

E

E

D

D

D

I

R

R

L

F

L

T

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

V

A

K

L

L

V

P

G

G

M

M

K

L

E

F

L

G

A

D

F

F

V

V

R

R

S

S

P

S

V

H

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

K

G

S

I

I

E

D

I

T

P

S

E

K

E

A

H

-

R

K

G

A

A

L

V

P

F

G

T

V

W

F

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

A

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

N

A

-

V

L

S

H

G

Y

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

Q

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

L

F

F

V

Q

G

N

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

F

C

V

V

V

A

A

A

K

T

D

R

R

A

Y

E

V

A

A

E

A

D

D

I

A

A

I

A

E

S

L

V

V

F

E

V

V

D

D

Y

Y

A

E

E

P

L

L

P

P

V

V

N

L

S

V

D

D

M

P

L

F

E

K

A

A

V

M

A

E

P

P

G

D

A

A

P

P

K

L

V

L

H

R

D

E

H

D

W

I

P

K

D

D

-

K

-

M

-

T

-

G

-

A

-

H

-

G

-

A

-

R

-

K

-

H

-

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

R

T

W

N

E

V

I

G

G

G

D

N

K

I

E

A

G

E

T

I

D

A

A

A

T

T

F

A

A

P

K

V

A

K

E

V

V

-

V

S

S

R

K

T

D

I

M

R

F

T

T

A

Y

R

H

Q

R

C

V

M

H

-

P

V

S

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

Q

V

C

V

V

A

A

H

S

W

M

D

D

R

K

H

I

V

K

E

G

Q

E

L

L

V

T

L

L

T

W

T

G

S

T

T

F

Q

Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

I

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

L

C

I

L

S

D

G

L

L

D

P

Q

E

G

H

L

K

I

I

R

H

V

V

V

I

A

A

P

P

D

D

V

I

G

G

G

G

G

G

F

F

G

G

W

N

K

K

G

V

L

G

L

A

Q

Y

P

S

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

V

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

V

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

M

E

E

H

N

L

L

V

S

A

T

A

T

A

S

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

T

I

T

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

K

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

A

I

M

E

R

A

C

D

H

A

V

W

L

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

S

Q

K

-

W

-

P

-

A

-

G

V

F

G

M

S

N

I

I

L

C

P

T

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

M

A

P

H

V

Y

A

R

H

C

L

R

A

T

V

F

D

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

S

I

G

-

G

V

V

P

A

Y

Y

R

R

G
x
C

V

S

A

F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

A

M

I

E

E

Q

R

M

A

I

I

D

E

A

T

V

L

A

A

D

Q

A

R

V

L

G

E

R

M

E

D

P

S

W

A

Q

D

V

L

R

R

L

I

E

K

N

N

L

F

V

I

P

Q

P

P

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

M

N

A

V

P

T

L

K

G

K

W

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

N

Y

Y

P

P

E

L

S

A

V

M

R

K

R

K

A

A

V

M

A

D

A

T

I

V

E

G

L

Y

E

H

G

Q

W

L

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

K

A

A

G

K

-

Q

E

E

A

A

D

F

G

K

R

R

-

G

-

E

-

T

-

R

-

E

L

I

I

M

G

G

V

I

G

G

F

I

A

S

T

F

Y

F

C

T

E

E

Q

I

S

V

A

G

H

A

G

G

T

P

A

S

V

-

Y

-

H

K

G

N

W

C

G

D

I

I

P

L

M

G

V

V

P

S

G

M

H

F

E

D

Q

S

A

A

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

V

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

K

S

S

H

Q

G

G

Q

Q

S

G

M

H

E

E

T

T

T

T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

A

E

D

K

D

I

I

K

M

L

I

V

E

H

E

G

G

D

N

T

T

G

D

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T

T

W

Y

G

G

S

S

R

R

S

S

M

T

V

P

M

T

A

A

G

G

G

A

A

A

V

T

A

A

T

V

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

K

E

A

R

K

L

A

R

Q

K

M

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

H

P

E

D

G

G

D

V

L

V

E

-

W

-

D

L

V

K

D

D

R

G

F

A

R

V

V

T

K

A

G

G

L

P

P

A

E

A

K

V

F

-

K

T

T

I

M

R

K

E

E

I

L

A

A

H

W

T

A

W

S

Y

Y

R

N

A

S

P

P

Q

-

L

-

L

-

P

P

A

P

D

N

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

N

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

M

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

A

H

Y

A

F

V

C

A

I

V

M

A

D

V

I

D

D

P

V

E

D

I

T

G

G

Q

V

V

A

E

K

I

T

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A

C

G

G

T

T

M

R

V

I

N

N

P

P

M

M

V

I

V

I

D

E

G

G

Q

Q

I

V

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

A

V

F

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

E

M

I

P

R

Y

Y

D

D

A

E

E

Q

G

G

Q

N

P

V

L

L

A

G

S

A

T

S

F

F

A

M

D

D

Y

F

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

K

V

W

R

E

I

T

I

D

H

Y

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K

K

G

G

I

V

G

G

E
|
E

G

S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

G

P

V

A

P

A

C

I

F

C

S

N

N

A

A

I

V

N

N

D

D

A

A

L

Y

K

A

P

F

L

L

G

N

C388 (≠ G370) binding
E763 (= E743) binding

1zxiB Reconstituted co dehydrogenase from oligotropha carboxidovorans (see paper)
31% identity, 95% coverage: 13:765/789 of query aligns to 14:780/804 of 1zxiB

query
sites
1zxiB

S

Q

G

G

V

M

G

G

A

C

R

K

V

R

R

K

R

R

K

V

E

E

D

D

D

I

R

R

L

F

L

T

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

V

A

K

L

L

V

P

G

G

M

M

K

L

E

F

L

G

A

D

F

F

V

V

R

R

S

S

P

S

V

H

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

K

G

S

I

I

E

D

I

T

P

S

E

K

E

A

H

-

R

K

G

A

A

L

V

P

F

G

T

V

W

F

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

A

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

N

A

-

V

L

S

H

G

Y

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

Q

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

L

F

F

V

Q

G

N

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

F

C

V

V

V

A

A

A

K

T

D

R

R

A

Y

E

V

A

A

E

A

D

D

I

A

A

I

A

E

S

L

V

V

F

E

V

V

D

D

Y

Y

A

E

E

P

L

L

P

P

V

V

N

L

S

V

D

D

M

P

L

F

E

K

A

A

V

M

A

E

P

P

G

D

A

A

P

P

K

L

V

L

H

R

D

E

H

D

W

I

P

K

D

D

-

K

-

M

-

T

-

G

-

A

-

H

-

G

-

A

-

R

-

K

-

H

-

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

R

T

W

N

E

V

I

G

G

G

D

N

K

I

E

A

G

E

T

I

D

A

A

A

T

T

F

A

A

P

K

V

A

K

E

V

V

-

V

S

S

R

K

T

D

I

M

R

F

T

T

A

Y

R

H

Q

R

C

V

M

H

-

P

V

S

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

Q

V

C

V

V

A

A

H

S

W

M

D

D

R

K

H

I

V

K

E

G

Q

E

L

L

V

T

L

L

T

W

T

G

S

T

T

F

Q
|
Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

I

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

L

C

I

L

S

D

G

L

L

D

P

Q

E

G

H

L

K

I

I

R

H

V

V

V

I

A

A

P

P

D

D

V

I

G

G

G

G

G
|
G

F
|
F

G
|
G

W

N

K

K

G
x
V

L

G

L

A

Q

Y

P

S

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

V

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

V

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

M

E

E

H

N

L

L

V

S

A

T

A

T

A

S

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

T

I

T

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

K

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

A

I

M

E

R

A

C

D

H

A

V

W

L

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

S

Q

K

-

W

-
x
P

-

A

-

G

V

F

G

M

S

N

I
|
I

L

C

P

T

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

M

A

P

H

V

Y

A

R

H

C

L

R

A

T

V

F

D

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

S

I

G

-

G

V

V

P
x
A

Y
|
Y

R
|
R

G
x
C

V
x
S

A

F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

A

M

I

E

E

Q

R

M

A

I

I

D

E

A

T

V

L

A

A

D

Q

A

R

V

L

G

E

R

M

E

D

P

S

W

A

Q

D

V

L

R

R

L

I

E

K

N

N

L

F

V

I

P

Q

P

P

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

M

N

A

V

P

T

L

K

G

K

W

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

N

Y

Y

P

P

E

L

S

A

V

M

R

K

R

K

A

A

V

M

A

D

A

T

I

V

E

G

L

Y

E

H

G

Q

W

L

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

K

A

A

G

K

-

Q

E

E

A

A

D

F

G

K

R

R

-

G

-

E

-

T

-

R

-

E

L

I

I

M

G

G

V

I

G

G

F

I

A

S

T

F

Y

F

C

T

E

E

Q

I

S

V

A

G

H

A

G

G

T

P

A

S

V

-

Y

-

H

K

G

N

W

C

G

D

I

I

P

L

M

G

V

V

P

S

G

M

H

F

E

D

Q

S

A

A

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

V

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

K

S

S

H
x
Q

G
|
G

Q
|
Q

S

G

M
x
H

E

E

T

T

T
|
T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

A

E

D

K

D

I

I

K

M

L

I

V

E

H

E

G

G

D

N

T

T

G

D

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T
|
T

W
x
Y

G
|
G

S
|
S

R

R

S
|
S

M
x
T

V

P

M

T

A

A

G

G

G

A

A

A

V

T

A

A

T

V

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

K

E

A

R

K

L

A

R

Q

K

M

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

H

P

E

D

G

G

D

V

L

V

E

-

W

-

D

L

V

K

D

D

R

G

F

A

R

V

V

T

K

A

G

G

L

P

P

A

E

A

K

V

F

-

K

T

T

I

M

R

K

E

E

I

L

A

A

H

W

T

A

W

S

Y

Y

R

N

A

S

P

P

Q

-

L

-

L

-

P

P

A

P

D

N

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

N

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

M

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

A

H

Y

A

F

V

C

A

I

V

M

A

D

V

I

D

D

P

I

E

D

I

T

G

G

Q

V

V

A

E

K

I

T

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A
x
C

G

G

T

T

M

R

V
x
I

N

N

P

P

M

M

V
x
I

V
x
I

D

E

G

G

Q
|
Q

I

V

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

A

V

F

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

E

M

I

P

R

Y

Y

D

D

A

E

E

Q

G

G

Q

N

P

V

L

L

A

G

S

A

T

S

F

F

A

M

D

D

Y

F

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

K

V

W

R

E

I

T

I

D

H

Y

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K
|
K

G
|
G

I
x
V

G

G

E
|
E

G
x
S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

G

P

V

A

P

A

C

I

F

C

S

N

N

A

A

I

V

N

N

D

D

A

A

L

Y

K

A

P

F

L

L

G

N

active site: Q235 (= Q222), V270 (≠ G257), P347 (vs. gap), I353 (= I341), R382 (= R369), C383 (≠ G370), E758 (= E743), S759 (≠ G744)
binding copper (ii) ion: C383 (≠ G370), S384 (≠ V371), E758 (= E743)
binding cu(i)-s-mo(vi)(=o)oh cluster: F266 (= F253), G267 (= G254), A380 (≠ P367), Y381 (= Y368), R382 (= R369), C383 (≠ G370), Y563 (≠ W545), G564 (= G546), E758 (= E743)
binding pterin cytosine dinucleotide: G265 (= G252), F266 (= F253), R382 (= R369), Q523 (≠ H505), G524 (= G506), Q525 (= Q507), H527 (≠ M509), T530 (= T512), T562 (= T544), Y563 (≠ W545), S565 (= S547), S567 (= S549), T568 (≠ M550), C681 (≠ A666), I685 (≠ V670), I689 (≠ V674), I690 (≠ V675), Q693 (= Q678), K754 (= K739), G755 (= G740), V756 (≠ I741), E758 (= E743)

1n62B Crystal structure of the mo,cu-co dehydrogenase (codh), n- butylisocyanide-bound state (see paper)
31% identity, 95% coverage: 13:765/789 of query aligns to 14:780/804 of 1n62B

query
sites
1n62B

S

Q

G

G

V

M

G

G

A

C

R

K

V

R

R

K

R

R

K

V

E

E

D

D

D

I

R

R

L

F

L

T

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

V

A

K

L

L

V

P

G

G

M

M

K

L

E

F

L

G

A

D

F

F

V

V

R

R

S

S

P

S

V

H

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

K

G

S

I

I

E

D

I

T

P

S

E

K

E

A

H

-

R

K

G

A

A

L

V

P

F

G

T

V

W

F

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

A

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

N

A

-

V

L

S

H

G

Y

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

Q

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

L

F

F

V

Q

G

N

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

F

C

V

V

V

A

A

A

K

T

D

R

R

A

Y

E

V

A

A

E

A

D

D

I

A

A

I

A

E

S

L

V

V

F

E

V

V

D

D

Y

Y

A

E

E

P

L

L

P

P

V

V

N

L

S

V

D

D

M

P

L

F

E

K

A

A

V

M

A

E

P

P

G

D

A

A

P

P

K

L

V

L

H

R

D

E

H

D

W

I

P

K

D

D

-

K

-

M

-

T

-

G

-

A

-

H

-

G

-

A

-

R

-

K

-

H

-

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

R

T

W

N

E

V

I

G

G

G

D

N

K

I

E

A

G

E

T

I

D

A

A

A

T

T

F

A

A

P

K

V

A

K

E

V

V

-

V

S

S

R

K

T

D

I

M

R

F

T

T

A

Y

R

H

Q

R

C

V

M

H

-

P

V

S

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

Q

V

C

V

V

A

A

H

S

W

M

D

D

R

K

H

I

V

K

E

G

Q

E

L

L

V

T

L

L

T

W

T

G

S

T

T

F

Q
|
Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

I

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

L

C

I

L

S

D

G

L

L

D

P

Q

E

G

H

L

K

I

I

R

H

V

V

V

I

A

A

P

P

D

D

V

I

G

G

G

G

G
|
G

F
|
F

G
|
G

W

N

K

K

G
x
V

L

G

L

A

Q

Y

P

S

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

V

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

V

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

M

E

E

H

N

L

L

V

S

A

T

A

T

A

S

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

T

I

T

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

K

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

A

I

M

E

R

A

C

D

H

A

V

W

L

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

S

Q

K

-

W

-
x
P

-

A

-

G

V

F

G

M

S

N

I
|
I

L

C

P

T

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

M

A

P

H

V

Y

A

R

H

C

L

R

A

T

V

F

D

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

S

I

G

-

G

V
|
V

P
x
A

Y

Y

R
|
R

G
x
C

V

S

A
x
F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

A

M

I

E

E

Q

R

M

A

I

I

D

E

A

T

V

L

A

A

D

Q

A

R

V

L

G

E

R

M

E

D

P

S

W

A

Q

D

V

L

R

R

L

I

E

K

N

N

L

F

V

I

P

Q

P

P

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

M

N

A

V

P

T

L

K

G

K

W

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

N

Y

Y

P

P

E

L

S

A

V

M

R

K

R

K

A

A

V

M

A

D

A

T

I

V

E

G

L

Y

E

H

G

Q

W

L

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

K

A

A

G

K

-

Q

E

E

A

A

D

F

G

K

R

R

-

G

-

E

-

T

-

R

-

E

L

I

I

M

G

G

V

I

G

G

F

I

A

S

T

F

Y

F

C

T

E

E

Q

I

S

V

A

G

H

A

G

G

T

P

A

S

V

-

Y

-

H

K

G

N

W

C

G

D

I

I

P

L

M

G

V

V

P

S

G

M

H

F

E

D

Q

S

A

A

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

V

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

K

S

S

H
x
Q

G
|
G

Q
|
Q

S

G

M
x
H

E

E

T

T

T
|
T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

A

E

D

K

D

I

I

K

M

L

I

V

E

H

E

G

G

D

N

T

T

G

D

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T
|
T

W
x
Y

G
|
G

S
|
S

R

R

S
|
S

M
x
T

V

P

M

T

A

A

G

G

G

A

A

A

V

T

A

A

T

V

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

K

E

A

R

K

L

A

R

Q

K

M

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

H

P

E

D

G

G

D

V

L

V

E

-

W

-

D

L

V

K

D

D

R

G

F

A

R

V

V

T

K

A

G

G

L

P

P

A

E

A

K

V

F

-

K

T

T

I

M

R

K

E

E

I

L

A

A

H

W

T

A

W

S

Y

Y

R

N

A

S

P

P

Q

-

L

-

L

-

P

P

A

P

D

N

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

N

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

M

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

A

H

Y

A

F

V

C

A

I

V

M

A

D

V

I

D

D

P

V

E

D

I

T

G

G

Q

V

V

A

E

K

I

T

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A
x
C

G

G

T

T

M

R

V
x
I

N

N

P

P

M

M

V
x
I

V
x
I

D

E

G

G

Q
|
Q

I

V

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

A

V

F

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

E

M

I

P

R

Y

Y

D

D

A

E

E

Q

G

G

Q

N

P

V

L

L

A

G

S

A

T

S

F

F

A

M

D

D

Y

F

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

K

V

W

R

E

I

T

I

D

H

Y

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K
|
K

G
|
G

I
x
V

G
|
G

E
|
E

G
x
S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

G

P

V

A

P

A

C

I

F

C

S

N

N

A

A

I

V

N

N

D

D

A

A

L

Y

K

A

P

F

L

L

G

N

active site: Q235 (= Q222), V270 (≠ G257), P347 (vs. gap), I353 (= I341), R382 (= R369), C383 (≠ G370), E758 (= E743), S759 (≠ G744)
binding cu(i)-s-mo(iv)(=o)o-nbic cluster: G267 (= G254), V379 (= V366), A380 (≠ P367), R382 (= R369), C383 (≠ G370), F385 (≠ A372), Y563 (≠ W545), G564 (= G546), E758 (= E743)
binding pterin cytosine dinucleotide: G265 (= G252), F266 (= F253), R382 (= R369), Q523 (≠ H505), G524 (= G506), Q525 (= Q507), H527 (≠ M509), T530 (= T512), T562 (= T544), Y563 (≠ W545), G564 (= G546), S565 (= S547), S567 (= S549), T568 (≠ M550), C681 (≠ A666), I685 (≠ V670), I689 (≠ V674), I690 (≠ V675), Q693 (= Q678), K754 (= K739), G755 (= G740), V756 (≠ I741), G757 (= G742), E758 (= E743)

1n5wB Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); oxidized form (see paper)
31% identity, 95% coverage: 13:765/789 of query aligns to 14:780/804 of 1n5wB

query
sites
1n5wB

S

Q

G

G

V

M

G

G

A

C

R

K

V

R

R

K

R

R

K

V

E

E

D

D

D

I

R

R

L

F

L

T

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

V

A

K

L

L

V

P

G

G

M

M

K

L

E

F

L

G

A

D

F

F

V

V

R

R

S

S

P

S

V

H

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

K

G

S

I

I

E

D

I

T

P

S

E

K

E

A

H

-

R

K

G

A

A

L

V

P

F

G

T

V

W

F

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

A

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

N

A

-

V

L

S

H

G

Y

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

Q

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

L

F

F

V

Q

G

N

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

F

C

V

V

V

A

A

A

K

T

D

R

R

A

Y

E

V

A

A

E

A

D

D

I

A

A

I

A

E

S

L

V

V

F

E

V

V

D

D

Y

Y

A

E

E

P

L

L

P

P

V

V

N

L

S

V

D

D

M

P

L

F

E

K

A

A

V

M

A

E

P

P

G

D

A

A

P

P

K

L

V

L

H

R

D

E

H

D

W

I

P

K

D

D

-

K

-

M

-

T

-

G

-

A

-

H

-

G

-

A

-

R

-

K

-

H

-

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

R

T

W

N

E

V

I

G

G

G

D

N

K

I

E

A

G

E

T

I

D

A

A

A

T

T

F

A

A

P

K

V

A

K

E

V

V

-

V

S

S

R

K

T

D

I

M

R

F

T

T

A

Y

R

H

Q

R

C

V

M

H

-

P

V

S

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

Q

V

C

V

V

A

A

H

S

W

M

D

D

R

K

H

I

V

K

E

G

Q

E

L

L

V

T

L

L

T

W

T

G

S

T

T

F

Q
|
Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

I

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

L

C

I

L

S

D

G

L

L

D

P

Q

E

G

H

L

K

I

I

R

H

V

V

V

I

A

A

P

P

D

D

V

I

G

G

G

G

G
|
G

F
|
F

G
|
G

W

N

K

K

G
x
V

L

G

L

A

Q

Y

P

S

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

V

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

V

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

M

E

E

H

N

L

L

V

S

A

T

A

T

A

S

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

T

I

T

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

K

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

A

I

M

E

R

A

C

D

H

A

V

W

L

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

S

Q

K

-

W

-
x
P

-

A

-

G

V

F

G

M

S

N

I
|
I

L

C

P

T

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

M

A

P

H

V

Y

A

R

H

C

L

R

A

T

V

F

D

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

S

I

G

-

G

V

V

P
x
A

Y

Y

R
|
R

G
x
C

V

S

A

F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

A

M

I

E

E

Q

R

M

A

I

I

D

E

A

T

V

L

A

A

D

Q

A

R

V

L

G

E

R

M

E

D

P

S

W

A

Q

D

V

L

R

R

L

I

E

K

N

N

L

F

V

I

P

Q

P

P

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

M

N

A

V

P

T

L

K

G

K

W

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

N

Y

Y

P

P

E

L

S

A

V

M

R

K

R

K

A

A

V

M

A

D

A

T

I

V

E

G

L

Y

E

H

G

Q

W

L

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

K

A

A

G

K

-

Q

E

E

A

A

D

F

G

K

R

R

-

G

-

E

-

T

-

R

-

E

L

I

I

M

G

G

V

I

G

G

F

I

A

S

T

F

Y

F

C

T

E

E

Q

I

S

V

A

G

H

A

G

G

T

P

A

S

V

-

Y

-

H

K

G

N

W

C

G

D

I

I

P

L

M

G

V

V

P

S

G

M

H

F

E

D

Q

S

A

A

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

V

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

K

S

S

H
x
Q

G
|
G

Q
|
Q

S

G

M
x
H

E

E

T

T

T
|
T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

A

E

D

K

D

I

I

K

M

L

I

V

E

H

E

G

G

D

N

T

T

G

D

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T
|
T

W
x
Y

G
|
G

S
|
S

R

R

S
|
S

M
x
T

V

P

M

T

A

A

G

G

G

A

A

A

V

T

A

A

T

V

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

K

E

A

R

K

L

A

R

Q

K

M

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

H

P

E

D

G

G

D

V

L

V

E

-

W

-

D

L

V

K

D

D

R

G

F

A

R

V

V

T

K

A

G

G

L

P

P

A

E

A

K

V

F

-

K

T

T

I

M

R

K

E

E

I

L

A

A

H

W

T

A

W

S

Y

Y

R

N

A

S

P

P

Q

-

L

-

L

-

P

P

A

P

D

N

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

N

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

M

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

A

H

Y

A

F

V

C

A

I

V

M

A

D

V

I

D

D

P

V

E

D

I

T

G

G

Q

V

V

A

E

K

I

T

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A
x
C

G

G

T

T

M

R

V
x
I

N

N

P

P

M

M

V
x
I

V
x
I

D

E

G

G

Q
|
Q

I

V

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

A

V

F

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

E

M

I

P

R

Y

Y

D

D

A

E

E

Q

G

G

Q

N

P

V

L

L

A

G

S

A

T

S

F

F

A

M

D

D

Y

F

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

K

V

W

R

E

I

T

I

D

H

Y

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K
|
K

G
|
G

I
x
V

G

G

E
|
E

G
x
S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

G

P

V

A

P

A

C

I

F

C

S

N

N

A

A

I

V

N

N

D

D

A

A

L

Y

K

A

P

F

L

L

G

N

active site: Q235 (= Q222), V270 (≠ G257), P347 (vs. gap), I353 (= I341), R382 (= R369), C383 (≠ G370), E758 (= E743), S759 (≠ G744)
binding cu(i)-s-mo(vi)(=o)oh cluster: G267 (= G254), A380 (≠ P367), R382 (= R369), C383 (≠ G370), Y563 (≠ W545), G564 (= G546), E758 (= E743)
binding pterin cytosine dinucleotide: G265 (= G252), F266 (= F253), R382 (= R369), Q523 (≠ H505), G524 (= G506), Q525 (= Q507), H527 (≠ M509), T530 (= T512), T562 (= T544), Y563 (≠ W545), S565 (= S547), S567 (= S549), T568 (≠ M550), C681 (≠ A666), I685 (≠ V670), I689 (≠ V674), I690 (≠ V675), Q693 (= Q678), K754 (= K739), G755 (= G740), V756 (≠ I741), E758 (= E743)

1n63B Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); carbon monoxide reduced state (see paper)
31% identity, 95% coverage: 13:765/789 of query aligns to 15:781/805 of 1n63B

query
sites
1n63B

S

Q

G

G

V

M

G

G

A

C

R

K

V

R

R

K

R

R

K

V

E

E

D

D

D

I

R

R

L

F

L

T

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

V

A

K

L

L

V

P

G

G

M

M

K

L

E

F

L

G

A

D

F

F

V

V

R

R

S

S

P

S

V

H

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

K

G

S

I

I

E

D

I

T

P

S

E

K

E

A

H

-

R

K

G

A

A

L

V

P

F

G

T

V

W

F

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

A

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

N

A

-

V

L

S

H

G

Y

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

Q

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

L

F

F

V

Q

G

N

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

F

C

V

V

V

A

A

A

K

T

D

R

R

A

Y

E

V

A

A

E

A

D

D

I

A

A

I

A

E

S

L

V

V

F

E

V

V

D

D

Y

Y

A

E

E

P

L

L

P

P

V

V

N

L

S

V

D

D

M

P

L

F

E

K

A

A

V

M

A

E

P

P

G

D

A

A

P

P

K

L

V

L

H

R

D

E

H

D

W

I

P

K

D

D

-

K

-

M

-

T

-

G

-

A

-

H

-

G

-

A

-

R

-

K

-

H

-

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

R

T

W

N

E

V

I

G

G

G

D

N

K

I

E

A

G

E

T

I

D

A

A

A

T

T

F

A

A

P

K

V

A

K

E

V

V

-

V

S

S

R

K

T

D

I

M

R

F

T

T

A

Y

R

H

Q

R

C

V

M

H

-

P

V

S

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

Q

V

C

V

V

A

A

H

S

W

M

D

D

R

K

H

I

V

K

E

G

Q

E

L

L

V

T

L

L

T

W

T

G

S

T

T

F

Q
|
Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

I

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

L

C

I

L

S

D

G

L

L

D

P

Q

E

G

H

L

K

I

I

R

H

V

V

V

I

A

A

P

P

D

D

V

I

G

G

G

G

G
|
G

F
|
F

G
|
G

W

N

K

K

G
x
V

L

G

L

A

Q

Y

P

S

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

V

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

V

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

M

E

E

H

N

L

L

V

S

A

T

A

T

A

S

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

T

I

T

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

K

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

A

I

M

E

R

A

C

D

H

A

V

W

L

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

S

Q

K

-

W

-
x
P

-

A

-

G

V

F

G

M

S

N

I
|
I

L

C

P

T

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

M

A

P

H

V

Y

A

R

H

C

L

R

A

T

V

F

D

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

S

I

G

-

G

V

V

P
x
A

Y

Y

R
|
R

G
x
C

V

S

A

F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

A

M

I

E

E

Q

R

M

A

I

I

D

E

A

T

V

L

A

A

D

Q

A

R

V

L

G

E

R

M

E

D

P

S

W

A

Q

D

V

L

R

R

L

I

E

K

N

N

L

F

V

I

P

Q

P

P

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

M

N

A

V

P

T

L

K

G

K

W

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

N

Y

Y

P

P

E

L

S

A

V

M

R

K

R

K

A

A

V

M

A

D

A

T

I

V

E

G

L

Y

E

H

G

Q

W

L

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

K

A

A

G

K

-

Q

E

E

A

A

D

F

G

K

R

R

-

G

-

E

-

T

-

R

-

E

L

I

I

M

G

G

V

I

G

G

F

I

A

S

T

F

Y

F

C

T

E

E

Q

I

S

V

A

G

H

A

G

G

T

P

A

S

V

-

Y

-

H

K

G

N

W

C

G

D

I

I

P

L

M

G

V

V

P

S

G

M

H

F

E

D

Q

S

A

A

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

V

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

K

S

S

H
x
Q

G
|
G

Q
|
Q

S

G

M
x
H

E

E

T

T

T
|
T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

A

E

D

K

D

I

I

K

M

L

I

V

E

H

E

G

G

D

N

T

T

G

D

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T
|
T

W
x
Y

G
|
G

S
|
S

R

R

S
|
S

M
x
T

V

P

M

T

A

A

G

G

G

A

A

A

V

T

A

A

T

V

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

K

E

A

R

K

L

A

R

Q

K

M

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

H

P

E

D

G

G

D

V

L

V

E

-

W

-

D

L

V

K

D

D

R

G

F

A

R

V

V

T

K

A

G

G

L

P

P

A

E

A

K

V

F

-

K

T

T

I

M

R

K

E

E

I

L

A

A

H

W

T

A

W

S

Y

Y

R

N

A

S

P

P

Q

-

L

-

L

-

P

P

A

P

D

N

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

N

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

M

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

A

H

Y

A

F

V

C

A

I

V

M

A

D

V

I

D

D

P

V

E

D

I

T

G

G

Q

V

V

A

E

K

I

T

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A
x
C

G

G

T

T

M

R

V
x
I

N

N

P

P

M

M

V
x
I

V
x
I

D

E

G

G

Q
|
Q

I

V

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

A

V

F

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

E

M

I

P

R

Y

Y

D

D

A

E

E

Q

G

G

Q

N

P

V

L

L

A

G

S

A

T

S

F

F

A

M

D

D

Y

F

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

K

V

W

R

E

I

T

I

D

H

Y

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K
|
K

G
|
G

I
x
V

G

G

E
|
E

G
x
S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

G

P

V

A

P

A

C

I

F

C

S

N

N

A

A

I

V

N

N

D

D

A

A

L

Y

K

A

P

F

L

L

G

N

active site: Q236 (= Q222), V271 (≠ G257), P348 (vs. gap), I354 (= I341), R383 (= R369), C384 (≠ G370), E759 (= E743), S760 (≠ G744)
binding cu(i)-s-mo(iv)(=o)oh cluster: G268 (= G254), A381 (≠ P367), R383 (= R369), C384 (≠ G370), Y564 (≠ W545), G565 (= G546), E759 (= E743)
binding pterin cytosine dinucleotide: G266 (= G252), F267 (= F253), R383 (= R369), Q524 (≠ H505), G525 (= G506), Q526 (= Q507), H528 (≠ M509), T531 (= T512), T563 (= T544), Y564 (≠ W545), S566 (= S547), S568 (= S549), T569 (≠ M550), C682 (≠ A666), I686 (≠ V670), I690 (≠ V674), I691 (≠ V675), Q694 (= Q678), K755 (= K739), G756 (= G740), V757 (≠ I741), E759 (= E743)

1n60B Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); cyanide- inactivated form (see paper)
31% identity, 95% coverage: 13:765/789 of query aligns to 13:779/803 of 1n60B

query
sites
1n60B

S

Q

G

G

V

M

G

G

A

C

R

K

V

R

R

K

R

R

K

V

E

E

D

D

D

I

R

R

L

F

L

T

R

Q

G

G

R

K

G

G

R

N

F

Y

V

V

G

D

D

D

I

V

A

K

L

L

V

P

G

G

M

M

K

L

E

F

L

G

A

D

F

F

V

V

R

R

S

S

P

S

V

H

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

K

G

S

I

I

E

D

I

T

P

S

E

K

E

A

H

-

R

K

G

A

A

L

V

P

F

G

T

V

W

F

A

A

D

V

L

L

A

T

A

A

G

A

G

D

V

L

K

K

P

P

I

L

R

N

A

-

V

L

S

H

G

Y

L

M

P

P

G

T

F

L

K

A

V

G

S

D

E

V

Q

Q

P

A

A

V

L

L

A

A

D

D

G

E

K

K

V

V

R

L

F

F

V

Q

G

N

E

Q

P

E

V

V

A

A

V

F

C

V

V

V

A

A

A

K

T

D

R

R

A

Y

E

V

A

A

E

A

D

D

I

A

A

I

A

E

S

L

V

V

F

E

V

V

D

D

Y

Y

A

E

E

P

L

L

P

P

V

V

N

L

S

V

D

D

M

P

L

F

E

K

A

A

V

M

A

E

P

P

G

D

A

A

P

P

K

L

V

L

H

R

D

E

H

D

W

I

P

K

D

D

-

K

-

M

-

T

-

G

-

A

-

H

-

G

-

A

-

R

-

K

-

H

-

H

N

N

V

H

F

I

L

F

E

R

T

W

N

E

V

I

G

G

G

D

N

K

I

E

A

G

E

T

I

D

A

A

A

T

T

F

A

A

P

K

V

A

K

E

V

V

-

V

S

S

R

K

T

D

I

M

R

F

T

T

A

Y

R

H

Q

R

C

V

M

H

-

P

V

S

P

P

L

L

E

E

G

T

K

C

G

Q

V

C

V

V

A

A

H

S

W

M

D

D

R

K

H

I

V

K

E

G

Q

E

L

L

V

T

L

L

T

W

T

G

S

T

T

F

Q
|
Q

M

A

P

P

H

H

I

V

V

I

R

R

A

T

G

V

L

V

S

S

E

L

C

I

L

S

D

G

L

L

D

P

Q

E

G

H

L

K

I

I

R

H

V

V

V

I

A

A

P

P

D

D

V

I

G

G

G

G

G
|
G

F
|
F

G
|
G

W

N

K

K

G
x
V

L

G

L

A

Q

Y

P

S

E

G

E

Y

I

V

V

C

A

A

A

V

W

V

I

A

A

S

M

I

R

V

L

L

D

G

R

V

P

P

V

V

R

K

W

W

T

V

E

E

D

D

R

R

R

M

E

E

H

N

L

L

V

S

A

T

A

T

A

S

N

F

A

A

R

R

E

D

H

Y

H

H

Y

M

E

T

I

T

T

E

A

L

Y

A

A

A

D

T

A

K

R

D

G

G

R

K

L

I

L

L

G

A

I

M

E

R

A

C

D

H

A

V

W

L

V

A

D

D

A

H

G

G

A

A

Y

-

S

-

V

-

Y

-

P

-

F

F

S

D

A

A

C

C

L

A

E

D

A

P

A

S

Q

K

-

W

-
x
P

-

A

-

G

V

F

G

M

S

N

I
|
I

L

C

P

T

G

G

P

S

Y

Y

D

D

F

M

A

P

H

V

Y

A

R

H

C

L

R

A

T

V

F

D

S

G

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

K

P

A

P

S

I

G

-

G

V

V

P

A

Y

Y

R
|
R

G
x
C

V

S

A

F

R

R

-

V

T

T

G

E

V

A

C

V

F

Y

A

A

M

I

E

E

Q

R

M

A

I

I

D

E

A

T

V

L

A

A

D

Q

A

R

V

L

G

E

R

M

E

D

P

S

W

A

Q

D

V

L

R

R

L

I

E

K

N

N

L

F

V

I

P

Q

P

P

E

E

K

Q

M

F

P

P

F

Y

D

M

N

A

V

P

T

L

K

G

K

W

H

E

F

Y

D

D

S

S

G

G

D

N

Y

Y

P

P

E

L

S

A

V

M

R

K

R

K

A

A

V

M

A

D

A

T

I

V

E

G

L

Y

E

H

G

Q

W

L

R

R

A

A

R

E

Q

Q

K

K

A

A

G

K

-

Q

E

E

A

A

D

F

G

K

R

R

-

G

-

E

-

T

-

R

-

E

L

I

I

M

G

G

V

I

G

G

F

I

A

S

T

F

Y

F

C

T

E

E

Q

I

S

V

A

G

H

A

G

G

T

P

A

S

V

-

Y

-

H

K

G

N

W

C

G

D

I

I

P

L

M

G

V

V

P

S

G

M

H

F

E

D

Q

S

A

A

Q

E

A

I

R

R

I

I

T

H

P

P

D

T

G

G

G

S

L

V

E

I

L

A

R

R

V

M

G

G

V

T

Q

K

S

S

H
x
Q

G
|
G

Q
|
Q

S

G

M
x
H

E

E

T

T

T
|
T

F

Y

A

A

Q

Q

V

I

A

I

H

A

E

T

V

E

L

L

G

G

I

I

P

P

L

A

E

D

K

D

I

I

K

M

L

I

V

E

H

E

G

G

D

N

T

T

G

D

L

T

T

A

P

P

Y

Y

S

G

T

L

G

G

T
|
T

W
x
Y

G
|
G

S
|
S

R

R

S
|
S

M
x
T

V

P

M

T

A

A

G

G

G

A

A

A

V

T

A

A

T

V

A

A

C

A

R

R

T

K

L

I

A

K

E

A

R

K

L

A

R

Q

K

M

I

I

G

A

A

A

H

H

L

M

M

L

Q

E

A

V

G

H

P

E

D

G

G

D

V

L

V

E

-

W

-

D

L

V

K

D

D

R

G

F

A

R

V

V

T

K

A

G

G

L

P

P

A

E

A

K

V

F

-

K

T

T

I

M

R

K

E

E

I

L

A

A

H

W

T

A

W

S

Y

Y

R

N

A

S

P

P

Q

-

L

-

L

-

P

P

A

P

D

N

V

L

D

E

R

P

G

G

G

-

L

L

E

E

V

A

T

V

A

N

G

Y

Y

Y

K

D

P

P

G

P

S

N

D

-

H

-

G

M

T

T

F

Y

S

P

Y

F

A

G

T

A

H

Y

A

F

V

C

A

I

V

M

A

D

V

I

D

D

P

V

E

D

I

T

G

G

Q

V

V

A

E

K

I

T

L

R

D

R

Y

F

V

Y

V

A

V

L

E

D

D

D

A
x
C

G

G

T

T

M

R

V
x
I

N

N

P

P

M

M

V
x
I

V
x
I

D

E

G

G

Q
|
Q

I

V

Y

H

G

G

G

G

V

L

A

T

Q

E

G

A

V

F

G

A

T

V

A

A

L

M

Y

G

E

Q

R

E

M

I

P

R

Y

Y

D

D

A

E

E

Q

G

G

Q

N

P

V

L

L

A

G

S

A

T

S

F

F

A

M

D

D

Y

F

L

F

I

L

P

P

G

T

F

A

T

V

E

E

V

T

P

P

H

K

V

W

R

E

I

T

I

D

H

Y

M

T

L

V

T

T

P

P

S

S

P

P

Y

H

T

H

E

P

F

I

G

G

V

A

K
|
K

G
|
G

I
x
V

G

G

E
|
E

G
x
S

G

P

A

H

I

V

A

G

P

G

P

V

A

P

A

C

I

F

C

S

N

N

A

A

I

V

N

N

D

D

A

A

L

Y

K

A

P

F

L

L

G

N

active site: Q234 (= Q222), V269 (≠ G257), P346 (vs. gap), I352 (= I341), R381 (= R369), C382 (≠ G370), E757 (= E743), S758 (≠ G744)
binding pterin cytosine dinucleotide: G264 (= G252), F265 (= F253), R381 (= R369), Q522 (≠ H505), G523 (= G506), Q524 (= Q507), H526 (≠ M509), T529 (= T512), T561 (= T544), Y562 (≠ W545), G563 (= G546), S564 (= S547), S566 (= S549), T567 (≠ M550), C680 (≠ A666), I684 (≠ V670), I688 (≠ V674), I689 (≠ V675), Q692 (= Q678), K753 (= K739), G754 (= G740), V755 (≠ I741), E757 (= E743)
binding mo(vi)(=o)(oh)2 cluster: F265 (= F253), G266 (= G254), Y562 (≠ W545), G563 (= G546), E757 (= E743)

1rm6A Structure of 4-hydroxybenzoyl-coa reductase from thauera aromatica (see paper)
29% identity, 98% coverage: 15:789/789 of query aligns to 3:761/761 of 1rm6A

query
sites
1rm6A

V

V

G

G

A

V

R

R

V

T

R

P

R

L

K

V

E

D

D

G

D

V

R

E

L

K

L

V

R

T

G

G

R

K

G

A

R

K

F

Y

V

T

G

A

D

D

I

I

A

A

-

A

-

P

-

D

-

A

L

L

V

V

G

G

M

R

K

-

E

-

L

-

A

-

F

I

V

L

R

R

S

S

P

P

V

H

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

L

G

A

I

I

E

D

I

T

P

S

-

A

-

A

E

E

E

A

H

L

R

E

G

G

-

V

-

I

A

A

V

V

F

C

T

T

W

G

A

A

D

E

L

T

A

P

A

V

-

P

G

F

G

G

V

V

K

L

P

P

I

I

R

A

A

E

V

-

S

-

G

-

L

-

P

-

G

-

F

-

K

-

V

-

S

N

E

E

Q

Y

P

P

A

-

L

L

A

A

D

R

G

D

K

K

V

V

R

R

F

Y

V

R

G

G

E

D

P

P

V

V

A

A

V

A

C

V

V

A

A

A

A

I

T

D

R

E

A

V

E

T

A

A

E

E

D

K

I

A

A

L

A

A

S

L

V

I

F

K

V

V

D

D

Y

Y

A

E

E

V

L

L

P

P

V

A

N

Y

S

M

D

T

M

P

L

K

E

A

A

A

V

M

A

K

P

A

G

G

A

A

P

I

K

A

V

L

H

H

D

D

H

D

W

K

P

P

D

N

N

N

V

I

F

L

L

R

E

E

T

V

N

H

V

A

G

E

-

F

G

G

N

D

I

V

A

A

E

A

I

A

A

F

A

A

T

E

A

A

P

D

V

L

K

I

V

R

S

E

R

K

T

T

I

Y

R

T

T

F

A

A

R

E

Q

V

C

N

M

H

V

V

P

H

L

M

E

E

G

L

K

N

G

A

V

T

V

L

A

A

H

E

W

Y

D

D

R

P

H

V

V

R

E

D

Q

M

L

L

V

T

L

L

T

N

T

T

S

T

T

T

Q
|
Q

M

V

P

P

H

Y

I

Y

V

V

R

H

A

L

G

K

L

V

S

A

E

A

C

C

L

L

D

Q

L

M

D

D

Q

S

G

A

L

R

I

I

R

R

V

V

V

I

A

K

P

P

D

F

V

L

G

G

G
|
G

G
|
G

F
|
F

G
|
G

W

A

K

R

G
x
T

L

E

L

A

Q

L

P

H

E

F

E

E

I

I

V

I

A

A

A

G

W

L

I

L

A

A

M

R

R

K

L

A

D

K

R

G

P

T

V

V

R

R

W

L

T

L

E

Q

D

T

R

R

R

E

E

E

H

T

L

F

V

I

A

A

A

H

A

R

N

G

A

R

R

P

E

W

H

T

H

E

Y

V

E

K

I

M

T

K

A

I

Y

G

A

L

D

K

A

K

R

D

G

G

R

K

L

I

L

A

G

A

I

L

E

A

A

L

D

E

A

A

W

T

V

Q

D

A

A

G

G

G

A

A

Y

Y

S

A

V

G

Y

Y

P

G

F

I

S

I

A

T

C

I

L

L

E

-

A

-

A

-

Q
x
Y

V

T

G

G

S

A

I
x
L

L

M

P

H

G

G

P

L

Y

Y

D

H

F

I

A

P

H

A

Y

I

R

K

C

H

R

D

T

A

F

W

S

R

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

T

P

P

P

P

I

C

V

G

P

A

Y

M

R
|
R

G

G

V

H

A

G

R

T

T

V

G

D

V

T

C

R

F

A

A

A

M

F

E

E

Q

A

M

L

I

L

D

T

A

E

V

M

A

G

D

E

A

E

V

L

G

G

R

I

E

D

P

S

W

L

Q

K

V

I

R

R

L

Q

E

I

N

N

L

M

V

L

P

P

P

-

E

-

K

Q

M

I

P

P

F

Y

D

V

N

T

V

M

T

Y

K

A

K

Q

H

R

F

V

D

M

S

S

G

Y

D

G

Y

V

P

P

E

E

S

C

V

L

R

E

R

K

A

V

V

K

A

A

A

A

I

-

E

-

L

-

E

S

G

G

W

W

R

E

A

E

R

R

Q

-

K

K

A

G

G

K

E

L

A

P

D

K

G

G

R

R

L

G

I

L

G

G

V

I

G

A

F

L

A

S

T

H

Y

F

C

V

E

S

Q

-

S

-

A

-

H

-

G

G

T

T

A

S

V

T

Y

P

H

K

G

H

W

W

-

T

G

G

I

E

P

P

M

-

V

-

P

-

G

-

H

H

E

A

Q

T

A

V

Q

N

A

L

R

K

I

L

T

D

P

F

D

D

G

G

G

G

L

I

E

T

L

L

R

L

V

T

G

G

V

A

Q

A

S

D

H
x
I

G
|
G

Q
|
Q

S
x
G

M

S

E

N

T

T

T

M

F

A

A

S

Q

Q

V

V

A

A

H

A

E

E

V

V

L

L

G

G

I

V

P

R

L

L

E

S

K

R

I

I

K

R

L

V

V

I

H

S

G

A

D

D

T

S

G

A

L

L

T

T

P

P

Y

K

S

D

T

N

G

G

T

S

W
x
Y

G
x
S

S
|
S

R

R

S
x
V

M
x
T

V

F

M

M

A

V

G

G

G

N

A

A

V

S

A

I

T

S

A

A

C

A

R

E

T

E

L

L

A

K

E

G

R

V

L

L

R

V

K

K

I

A

G

A

A

A

H

K

L

K

M

L

Q

D

A

A

G

R

P

E

D

E

G

D

V

I

-

E

V

V

L

I

K

D

D

E

G

M

A

F

V

M

T

V

A

S

G

G

P

S

A

Q

-

D

-

P

A

G

V

L

T

S

I

F

R

Q

E

E

I

V

A

V

H

K

T

A

W

-

Y

-

R

-

A

-

P

-

Q

-

L

-

L

-

P

-

A

A

D

M

V

V

D

D

R

S

G

G

G

T

L

I

E

T

V

V

T

K

A

G

G

T

Y

Y

K

T

-

C

P

P

G

T

S

E

D

F

H

Q

G

G

T

D

-

K

-

K

-

I

-

R

-

G

-

S

-

A

-

I

-

G

-

A

-

T

-

M

-

G

F

F

S

C

Y

Y

A

A

T

A

H

Q

A

V

V

V

A

E

V

A

A

S

V

V

D

D

P

E

E

I

I

T

G

G

Q

K

V

V

E

T

I

A

L

H

D

K

Y

V

V

W

V

V

V

A

E

V

D

D

A

V

G

G

T

K

M

A

V
x
L

N
|
N

P

P

M

L

V

A

V
|
V

D

E

G

G

Q
|
Q

I

T

Y

Q

G

G

G

G

V

V

A

W

Q

M

G

G

V

M

G

G

T

Q

A

A

L

L

Y

S

E

E

R

E

M

T

P

V

Y

Y

D

D

A

-

E

N

G

G

Q

R

P

M

L

V

A

H

S

G

T

N

F

I

A

L

D

D

Y

Y

L

R

I

V

P

P

G

T

F

I

T

V

E

E

V

S

P

P

H

D

V

I

R

E

I

V

I

I

H

I

M

V

L

E

T

S

P

M

S

D

P

P

Y

N

T

G

E

P

F

F

G

G

V

A

K
|
K

G
x
E

I
x
A

G
x
S

E
|
E

G
|
G

G

M

A

L

I

A

A

G

P

F

P

L

A

P

A

A

I

I

C

H

N

E

A

A

I

V

N

Y

D

E

A

A

L

-

K

-

P

-

L

V

G

G

V

V

I

R

V

A

T

T

N

D

A

F

P

P

M

L

T

S

P

P

E

D

V

R

I

I

L

T

T

E

A

L

I

L

A

D

G

A

E

K

R

E

G

A

A

A

A

A

active site: Q206 (= Q222), T241 (≠ G257), Y318 (≠ Q337), L322 (≠ I341), R350 (= R369), E718 (= E743), G719 (= G744)
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): G235 (= G251), G236 (= G252), F237 (= F253), G238 (= G254), R350 (= R369), I473 (≠ H505), G474 (= G506), Q475 (= Q507), G476 (≠ S508), Y513 (≠ W545), S514 (≠ G546), S515 (= S547), V517 (≠ S549), T518 (≠ M550), L646 (≠ V670), N647 (= N671), V651 (= V675), Q654 (= Q678), K714 (= K739), E715 (≠ G740), A716 (≠ I741), S717 (≠ G742), E718 (= E743)

O33819 4-hydroxybenzoyl-CoA reductase subunit alpha; 4-HBCR subunit alpha; EC 1.1.7.1 from Thauera aromatica (see paper)
29% identity, 98% coverage: 15:789/789 of query aligns to 11:769/769 of O33819

query
sites
O33819

V

V

G

G

A

V

R

R

V

T

R

P

R

L

K

V

E

D

D

G

D

V

R

E

L

K

L

V

R

T

G

G

R

K

G

A

R

K

F

Y

V

T

G

A

D

D

I

I

A

A

-

A

-

P

-

D

-

A

L

L

V

V

G

G

M

R

K

-

E

-

L

-

A

-

F

I

V

L

R

R

S

S

P

P

V

H

A

A

H

H

A

A

T

R

I

I

T

L

G

A

I

I

E

D

I

T

P

S

-

A

-

A

E

E

E

A

H

L

R

E

G

G

-

V

-

I

A

A

V

V

F

C

T

T

W

G

A

A

D

E

L

T

A

P

A

V

-

P

G

F

G

G

V

V

K

L

P

P

I

I

R

A

A

E

V

-

S

-

G

-

L

-

P

-

G

-

F

-

K

-

V

-

S

N

E

E

Q

Y

P

P

A

-

L

L

A

A

D

R

G

D

K

K

V

V

R

R

F

Y

V

R

G

G

E

D

P

P

V

V

A

A

V

A

C

V

V

A

A

A

A

I

T

D

R

E

A

V

E

T

A

A

E

E

D

K

I

A

A

L

A

A

S

L

V

I

F

K

V

V

D

D

Y

Y

A

E

E

V

L

L

P

P

V

A

N

Y

S

M

D

T

M

P

L

K

E

A

A

A

V

M

A

K

P

A

G

G

A

A

P

I

K

A

V

L

H

H

D

D

H

D

W

K

P

P

D

N

N

N

V

I

F

L

L

R

E

E

T

V

N

H

V

A

G

E

-

F

G

G

N

D

I

V

A

A

E

A

I

A

A

F

A

A

T

E

A

A

P

D

V

L

K

I

V

R

S

E

R

K

T

T

I

Y

R

T

T

F

A

A

R

E

Q

V

C

N

M

H

V

V

P

H

L

M

E

E

G

L

K

N

G

A

V

T

V

L

A

A

H

E

W

Y

D

D

R

P

H

V

V

R

E

D

Q

M

L

L

V

T

L

L

T

N

T

T

S

T

T

T

Q
|
Q

M

V

P

P

H

Y

I

Y

V

V

R

H

A

L

G

K

L

V

S

A

E

A

C

C

L

L

D

Q

L

M

D

D

Q

S

G

A

L

R

I

I

R

R

V

V

V

I

A

K

P

P

D

F

V

L

G

G

G

G

G
|
G

F
|
F

G

G

W

A

K

R

G

T

L

E

L

G

Q

L

P

H

E

F

E

E

I

I

V

I

A

A

A

G

W

L

I

L

A

A

M

R

R

K

L

A

D

K

R

G

P

T

V

V

R

R

W

L

T

L

E

Q

D

T

R

R

R

E

E

E

H

T

L

F

V

I

A

A

A

H

A

R

N

G

A

R

R

P

E

W

H

T

H

E

Y

V

E

K

I

M

T

K

A

I

Y

G

A

L

D

K

A

K

R

D

G

G

R

K

L

I

L

A

G

A

I

L

E

A

A

L

D

E

A

A

W

T

V

Q

D

A

A

G

G

G

A

A

Y

Y

S

A

V

G

Y

Y

P

G

F

I

S

I

A

T

C

I

L

L

E

-

A

-

A

-

Q

Y

V

T

G

G

S

A

I

L

L

M

P

H

G

G

P

L

Y

Y

D

H

F

I

A

P

H

A

Y

I

R

K

C

H

R

D

T

A

F

W

S

R

V

V

C

Y

T

T

N

N

K

T

P

P

P

P

I

C

V

G

P

A

Y

M

R

R

G

G

V

H

A

G

R

T

T

V

G

D

V

T

C

R

F

A

A

A

M

F

E

E

Q

A

M

L

I

L

D

T

A

E

V

M

A

G

D

E

A

E

V

L

G

G

R

I

E

D

P

S

W

L

Q

K

V

I

R

R

L

Q

E

I

N

N

L

M

V

L

P

P

P

-

E

-

K

Q

M

I

P

P

F

Y

D

V

N

T

V

M

T

Y

K

A

K

Q

H

R

F

V

D

M

S

S

G

Y

D

G

Y

V

P

P

E

E

S

C

V

L

R

E

R

K

A

V

V

K

A

A

A

A

I

-

E

-

L

-

E

S

G

G

W

W

R

E

A

E

R

R

Q

-

K

K

A

G

G

K

E

L

A

P

D

K

G

G

R

R

L

G

I

L

G

G

V

I

G

A

F

L

A

S

T

H

Y

F

C

V

E

S

Q

-

S

-

A

-

H

-

G

G

T

T

A

S

V

T

Y

P

H

K

G

H

W

W

-

T

G

G

I

E

P

P

M

-

V

-

P

-

G

-

H

H

E

A

Q

T

A

V

Q

N

A

L

R

K

I

L

T

D

P

F

D

D

G

G

G

G

L

I

E

T

L

L

R

L

V

T

G

G

V

A

Q

A

S

D

H

I

G

G

Q

Q

S

G

M

S

E

N

T

T

T

M

F

A

A

S

Q

Q

V

V

A

A

H

A

E

E

V

V

L

L

G

G

I

V

P

R

L

L

E

S

K

R

I

I

K

R

L

V

V

I

H

S

G

A

D

D

T

S

G

A

L

L

T

T

P

P

Y

K

S

D

T

N

G

G

T

S

W

Y

G
x
S

S
|
S

R
|
R

S
x
V

M
x
T

V

F

M

M

A

V

G

G

G

N

A

A

V

S

A

I

T

S

A

A

C

A

R

E

T

E

L

L

A

K

E

G

R

V

L

L

R

V

K

K

I

A

G

A

A

A

H

K

L

K

M

L

Q

D

A

A

G

R

P

E

D

E

G

D

V

I

-

E

V

V

L

I

K

D

D

E

G

M

A

F

V

M

T

V

A

S

G

G

P

S

A

Q

-

D

-

P

A

G

V

L

T

S

I

F

R

Q

E

E

I

V

A

V

H

K

T

A

W

-

Y

-

R

-

A

-

P

-

Q

-

L

-

L

-

P

-

A

A

D

M

V

V

D

D

R

S

G

G

G

T

L

I

E

T

V

V

T

K

A

G

G

T

Y

Y

K

T

-

C

P

P

G

T

S

E

D

F

H

Q

G

G

T

D

-

K

-

K

-

I

-

R

-

G

-

S

-

A

-

I

-

G

-

A

-

T

-

M

-

G

F

F

S

C

Y

Y

A

A

T

A

H

Q

A

V

V

V

A

E

V

A

A

S

V

V

D

D

P

E

E

I

I

T

G

G

Q

K

V

V

E

T

I

A

L

H

D

K

Y

V

V

W

V

V

V

A

E

V

D

D

A
x
V

G
|
G

T
x
K

M
x
A

V
x
L

N
|
N

P

P

M

L

V

A

V

V

D

E

G

G

Q

Q

I

T

Y

Q

G

G

G

G

V

V

A

W

Q

M

G

G

V

M

G

G

T

Q

A

A

L

L

Y

S

E

E

R

E

M

T

P

V

Y

Y

D

D

A

-

E

N

G

G

Q

R

P

M

L

V

A

H

S

G

T

N

F

I

A

L

D

D

Y

Y

L

R

I

V

P

P

G

T

F

I

T

V

E

E

V

S

P

P

H

D

V

I

R

E

I

V

I

I

H

I

M

V

L

E

T

S

P

M

S

D

P

P

Y

N

T

G

E

P

F

F

G

G

V

A

K
|
K

G
x
E

I
x
A

G
x
S

E

E

G

G

G

M

A

L

I

A

A

G

P

F

P

L

A

P

A

A

I

I

C

H

N

E

A

A

I

V

N

Y

D

E

A

A

L

-

K

-

P

-

L

V

G

G

V

V

I

R

V

A

T

T

N

D

A

F

P

P

M

L

T

S

P

P

E

D

V

R

I

I

L

T

T

E

A

L

I

L

A

D

G

A

E

K

R

E

G

A

A

A

A

A

Q214 (= Q222) binding
GF 244:245 (= GF 252:253) binding
SSRVT 522:526 (≠ GSRSM 546:550) binding
VGKALN 650:655 (≠ AGTMVN 666:671) binding
KEAS 722:725 (≠ KGIG 739:742) binding

1dgjA Crystal structure of the aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio desulfuricans atcc 27774 (see paper)
28% identity, 93% coverage: 46:782/789 of query aligns to 210:905/906 of 1dgjA

query
sites
1dgjA

L

L

A

A

F

L

V

A

R

Q

S

A

P

K

V

V

A

S

H

H

A

A

T

L

I

I

T

K

G

G

I

I

E

D

I

T

P

S

E

E

E

A

H

E

R

K

G

-

A

M

V

P

F

G

T

V

W

Y

A

K

D

V

L

L

A

T

A

H

G

K

G

D

V

V

K

K

P

G

I

K

R

N

A

R

V

I

S

T

G

G

L

L

P

I

G

T

F

F

K

P

V

T

S

N

-

K

-

G

-

D

-

G

-

W

E

E

Q

R

P

P

A

I

L

L

A

N

D

D

G

S

K

K

V

I

R

F

F

Q

V

Y

G

G

E

D

P

A

V

L

A

A

V

I

C

V

V

C

A

A

A

D

T

S

R

E

A

A

E

N

A

A

E

R

D

A

I

A

A

A

A

E

S

K

V

V

F

K

V

F

D

D

Y

L

A

E

E

L

L

L

P

P

V

E

N

Y

S

M

D

S

M

A

L

P

E

E

A

A

V

M

A

A

P

P

G

D

A

A

P

I

K

E

V

I

H

H

D

P

H

G

W

T

P

P

D

N

N

V

V

Y

F

Y

-

D

-

Q

L

L

E

E

T

E

N

K

V

G

G

E

G

D

N

T

I

V

A

P

E

F

I

F

A

N

A

D

T

P

A

A

P

N

V

V

K

V

V

A

S

E

R

G

T

S

I

Y

R

Y

T

T

A

Q

R

R

Q

Q

C

P

M

H

V

L

P

P

L

I

E

E

-

P

-

D

-

V

G

G

K

Y

G

G

V

Y

V

I

A

N

H

E

W

Q

D

G

R

-

H

-

V

-

E

-

Q

Q

L

V

V

V

L

I

T

H

T

S

S

K

T

S

Q
x
V

M

A

P

I

H

H

I

L

-

H

-

A

-

L

-

M

V

I

R

A

A

P

G

G

L

L

S

G

E

-

C

-

L

L

D

E

L

F

D

P

Q

K

G

D

L

L

I

V

R

-

V

L

V

V

A

Q

P

N

D

T

V

T

G

G

G

G

G

T

F
|
F

G
|
G

W

Y

K

K

G
x
F

L

S

L

P

Q

T

P

M

E

E

E

A

I

L

V

V

A

G

A

V

W

A

I

V

A

-

M

M

R

A

L

T

D

G

R

R

P

P

-

C

-

H

V

L

R

R

W

Y

T

N

E

Y

D

E

R

Q

R

Q

E

Q

H

N

L

Y

V

T

A

G

A

K

A

-

N

-

A

-

R

R

E

S

H

P

H

F

Y

W

E

T

I

T

T

M

A

R

Y

Y

A

A

-

A

D

D

A

R

R

Q

G

G

R

K

L

I

L

L

G

A

I

M

E

E

A

T

D

D

A

W

W

S

V

V

D

D

A

H

G

G

A

P

Y

Y

S

S

V

E

Y

F

P

G

F

D

S

L

A

L

C

T

L

L

E
x
R

A

G

A

A

Q

Q

V
x
Y

G

-

S

-

I

-

L

I

P

G

G

A

P

G

Y

Y

D

G

F

I

A

A

H

N

Y

I

R

R

C

G

R

T

T

G

F

R

S

T

V

V

C

A

T

T

N

N

K

H

P

C

P

W

I

G

V

A

P

A

Y

F

R
|
R

G

G

V

Y

A

G

R

A

T

P

G

E

V

S

C

E

F

F

A

P

M

S

E

E

Q

V

M

L

I

M

D

D

A

E

V

L

A

A

D

E

A

K

V

L

G

G

R

M

E

D

P

P

W

F

Q

E

V

L

R

R

L

A

E

L

N

N

L

C

V

Y

P

-

P

-

E

-

K

-

M

R

P

E

F

G

D

D

N

T

V

T

T

S

K

S

K

G

H

Q

F

I

-

P

D

E

S

V

G

M

D

S

Y

L

P

P

E

E

S

M

V

F

R

D

R

K

A

M

V

R

A

P

A

Y

I

Y

E

E

L

E

E

S

G

K

W

K

R

R

A

V

R

K

Q

E

K

R

A

S

G

T

E

A

A

E

D

I

G

K

R

R

L

G

I

V

G

G

V

V

G

A

F

L

A

G

T

V

Y

Y

C

-

E

-

Q

-

S

-

A

-

H

-

G

-

T

-

A

-

V

-

Y

-

H

-

G

G

W

A

G

G

I

L

P

D

M

G

V

-

P

P

G

D

H

T

E

S

Q

E

A

A

Q

W

A

V

R

E

I

L

T

N

P

D

D

D

G

G

G

S

L

V

E

T

L

L

R

G

V

N

G

S

V
x
W

Q

E

S

D

H
|
H

G
|
G

Q
|
Q

S
x
G

M

A

E

D

T

A

T

G

F

S

A

L

Q

G

V

T

A

A

H

H

E

E

V

A

L

L

-

R

-

P

-

L

G

G

I

I

P

T

L

P

E

E

K

N

I

I

K

H

L

L

V

V

H

M

G

N

D

D

T

T

G

S

L

K

T

T

P

P

Y

N

S

S

T

G

G

P

T
x
A

W
x
G

G

G

S
|
S

R

R

S
|
S

M
x
Q

V

V

M

V

A

T

G

G

G

N

A

A

V

I

A

R

T

V

A

A

C

C

R

E

T

M

L

L

A

I

E

E

R

G

L

M

R

R

K

K

I

P

G

G

A

G

H

G

L

F

M

F

-

T

-

P

-

A

Q

E

A

M

G

K

P

A

D

E

G

G

V

R

V

P

L

M

K

R

-

Y

D

D

G

G

A

K

V

W

T

T

A

A

G

-

P

P

A

A

A

-

V

-

T

-

I

-

R

-

E

-

I

-

A

-

H

-

T

-

W

-

Y

-

R

-

A

-

P

-

Q

-

L

-

L

-

P

-

A

K

D

D

V

C

D

D

R

A

G

K

G

G

L

-

E

-

V

-

T

-

A

-

G

-

Y

-

K

-

P

Q

G

G

S

S

D

P

H

F

G

A

T

C

F

Y

S

M

Y

Y

A

G

T

L

H

F

A

L

V

T

A

E

V

V

A

A

V

V

D

E

P

V

E

A

I

T

G

G

Q

K

V

A

E

T

I

V

L

E

D

K

Y

M

V

V

V

C

V

V

E

A

D

D

A

I

G

G

T

K

M

I

V
x
C

N
|
N

P

K

M

L

V
|
V

V
|
V

D

D

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

Y

G

G

G

G

V

L

A

A

Q

Q

G

G

V

V

G

G

T

L

A

A

L

L

Y

S

E

E

R

-

M

-

P

-

Y

-

D

D

A

Y

E

E

G

D

Q

L

P

K

L

K

A

H

S

S

T

T

F

M

A

G

D

G

Y

A

L

G

I

I

P

P

G

S

F

I

T

K

E

M

V

I

P

P

-

D

H

D

V

I

R

E

I

I

I

V

H

Y

M

V

L

E

T

T

P

P

S

R

P

K

Y

D

T

G

E

P

F

F

G

G

V

A

K
x
S

G
|
G

I
x
V

G
|
G

E
|
E

G
x
M

G

P

A

L

I

T

A

A

P

P

P

H

A

A

A

A

I

I

C

I

N

N

A

G

I

I

N

Y

D

N

A

A

L

-

K

-

P

-

L

C

G

G

V

A

I

R

V

V

T

R

N

H

A

L

P

P

M

A

T

R

P

P

E

E

V

K

I

V

L

L

T

E

A

A

I

M

active site: V391 (≠ Q222), F427 (≠ G257), R503 (≠ E334), Y507 (≠ V338), R535 (= R369), E869 (= E743), M870 (≠ G744)
binding molybdenum (iv)oxide: G424 (= G254), R535 (= R369), G698 (≠ W545), E869 (= E743)
binding pterin cytosine dinucleotide: F423 (= F253), G424 (= G254), R535 (= R369), W652 (≠ V502), H655 (= H505), G656 (= G506), Q657 (= Q507), G658 (≠ S508), A697 (≠ T544), G698 (≠ W545), S700 (= S547), S702 (= S549), Q703 (≠ M550), C799 (≠ V670), N800 (= N671), V803 (= V674), V804 (= V675), Q807 (= Q678), S865 (≠ K739), G866 (= G740), V867 (≠ I741), G868 (= G742), E869 (= E743)

Sites not aligning to the query:

binding fe2/s2 (inorganic) cluster: 38, 39, 40, 41, 43, 44, 45, 46, 48, 58, 60, 100, 101, 103, 137, 139
binding pterin cytosine dinucleotide: 99, 139

4usaA Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with trans-cinnamaldehyde (see paper)
27% identity, 94% coverage: 42:782/789 of query aligns to 206:905/907 of 4usaA

query
sites
4usaA

G

G

M

T

K

L

E

H

L

L

A

A

F

M

V

V

R

Q

S

A

P

K

V

V

A

S

H

H

A

A

T

N

I

I

T

K

G

G

I

I

E

D

I

T

P

S

E

E

E

A

H

L

R

T

-

M

-

P

-

G

-

V

G

H

A

S

V

V

F

I

T

T

W

H

A

K

D

D

L

-

A

-

A

-

G

-

G

-

V

V

K

K

P

G

I

K

R

N

A

R

V

I

S

T

G

G

L

L

P
x
I

G

T

F

F

K

P

V

T

S

N

-

K

-

G

-

D

-

G

-

W

E

D

Q

R

P

P

A

I

L

L

A

C

D

D

G

E

K

K

V

V

R

F

F

Q

V

Y

G

G

E

D

P

C

V

I

A

A

V

L

C

V

V

C

A

A

A

D

T

S

R

E

A

A

E

N

A

A

E

R

D

A

I

A

A

A

A

E

S

K

V

V

F

K

V

V

D

D

Y

L

A

E

E

E

L

L

P

P

V

A

N

Y

S

M

D

S

M

G

L

P

E

A

A

A

V

A

A

A

P

E

G

D

A

A

P

I

K

E

V

I

H

H

D

P

H

G

W

T

P

P

D

-

N

N

V

V

F

Y

L

F

E

E

T

Q

N

P

V

I

-

V

-

K

G

G

G

E

N

D

I

T

A

G

E

P

I

I

A

F

A

A

T

S

A

A

P

D

V

V

K

T

V

V

S

E

R

G

T

D

I

F

R

Y

T

V

A

G

R

R

Q

Q

C

P

M

H

V

M

P

P

L

I

E

E

G

P

K

D

G

V

V

A

V

F

A

A

H

Y

W

M

D

G

R

D

H

D

V

G

E

K

Q

C

L

Y

V

I

L

H

T

S

T

K

S

S

T
x
I

Q

G

M

V

P

-

H

H

I

L

V

H

R

L

A

Y

G

M

L

I

S

A

E

P

C

G

L

V

D

G

L

L

D

E

Q

P

G

D

L

Q

I

L

R

V

V

L

V

V

A

A

P

N

D

P

V

M

G

G

G

G

G
x
T

F
|
F

G
|
G

W

Y

K

K

G
x
F

L

S

L

P

Q

T

P

S

E

E

E

A

I

L

V

V

A

A

A

V

W

-

I

A

A

A

M

M

R

A

L

T

D

G

R

R

P

P

V

V

R

H

W

L

T

R

E

Y

D

N

R

Y

R

Q

E

Q

H

Q

L

Q

V

Q

A

Y

A

T

A

G

N

K

A
x
R

R

S

E

P

H

W

H

E

Y

M

E

N

I

V

T

K

A

F

Y

A

A

A

D

K

A

K

R

D

G

G

R

T

L

L

L

L

G

A

I

M

E

E

A

S

D

D

A

W

W

L

V

V

D

D

A

H

G

G

A

P

Y

Y

S

S

V

E

Y
x
F

P

G

F

D

S
x
L

A

L

C

T

L

L

E
x
R

A

G

A

A

Q

Q

V

-

G

-

S

-

I
x
F

L

I

P

G

G

A

P

G

Y

Y

D

N

F

I

A

P

H

N

Y

I

R

R

C

G

R

L

T

G

F

R

S

T

V

V

C

A

T

T

N

N

K

H

P

V

P

W

I

G

V

S

P
x
A

Y
x
F

R
|
R

G

G

V
x
Y

A

G

R

A

T

P

G
x
Q

V

S

C

M

F

F

A

A

M

S

E

E

Q

C

M

L

I

M

D

D

A

M

V

L

A

A

D

E

A

K

V

L

G

G

R

M

E

D

P

P

W

L

Q

E

V

L

R

R

L

Y

E

K

N

N

L

A

V

Y

P

R

P

P

E

G

K

D

M

T

P

N

F

P

D

T

N

G

V

Q

T

E

K

P

K

E

H

V

F

F

D

S

S

L

G

P

D

D

Y

M

P

I

E

D

S

Q

V

L

R

R

-

P

R

K

A

Y

V

Q

A

A

A

A

I

L

E

E

L

-

E

-

G

-

W

-

R

K

A

A

R

Q

Q

K

K

E

A

S

G

T

E

A

A

T

D

H

G

K

R

K

L

G

I

V

G

G

V

I

G

S

F

I

A

G

T

V

Y

Y

C

-

E

-

Q

-

S

-

A

-

H

-

G

-

T

-

A

-

V

-

Y

-

H

-

G

G

W

S

G

G

I
x
L

P

D

M

G

V

-

P

P

G

D

H

A

E

S

Q

E

A

A

Q

W

A

A

R

E

I

L

T

N

P

A

D

D

G

G

G

T

L

I

E

T

L

V

R

H

V

T

G

A

V
x
W

Q

E

S

D

H
|
H

G
|
G

Q
|
Q

S
x
G

M

A

E

D

T

I

T

G

F

C

A

V

Q

G

V

T

A

A

H

H

E

E

V

A

L

L

-

R

-

P

-

M

G

G

I

V

P

A

L

P

E

E

K

K

I

I

K

K

L

F

V

T

H

W

G

P

D

N

T

T

G

A

L

T

T

T

P

P

Y

N

S

S

T

G

G

P

T
x
S

W
x
G

G
|
G

S

S

R

R

S
x
Q

M
x
Q

V

V

M

M

A

T

G

G

G

N

A

A

V

I

A

R

T

V

A

A

C

C

R

E

T

N

L

L

A

L

E

K

R

A

L

C

R

E

K

K

I

P

G

G

A

G

H

-

L

-

M

-

Q

-

A

-

G

-

P

-

D

-

G

G

V

Y

V

Y

L

T

K

Y

D

D

G

E

A

L

V

-

T

-

A

-

G

-

P

K

A

A

A

A

V

D

T

K

I

P

R

T

E

K

I

I

A

T

H

G

T

N

W

W

Y

T

R

A

A

S

P

-

Q

-

L

-

L

-

P

-

A

-

D

-

V

-

D

-

R

-

G

G

G

A

L

T

E

H

V

C

T

D

A

A

G

V

Y

T

K

G

P

L

G

G

S

K

D

P

H

F

G

V

T

V

F

Y

S

M

Y

Y

A

G

T

V

H

F

A

M

V

A

A

E

V

V

A

T

V

V

D

D

P

V

E

A

I

T

G

G

Q

Q

V

T

E

T

I

V

L

D

D

G

Y

M

V

T

V

L

V

M

E

A

D

D

A

L

G

G

T

S

M

L

V
x
C

N
|
N

P

Q

M

L

V

A

V
x
T

D

D

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

Y

G

G

G

G

V

L

A

A

Q

Q

G

G

V

I

G

G

T

L

A

A

L

L

Y

S

E

E

R

-

M

-

P

-

Y

-

D

D

A

F

E

E

G

D

Q

I

P

K

L

K

A

H

S

A

T

T

F

L

A

V

D

G

Y

A

L

G

I

F

P

P

G

F

F

I

T

K

E

Q

V

I

P

P

-

D

H

K

V

L

R

D

I

I

I

V

H

Y

M

V

L

N

T

H

P

P

S

R

P

P

Y

D

T

G

E

P

F

F

G

G

V

A

K
x
S

G
|
G

I
x
V

G
|
G

E
|
E

G
x
L

G

P

A

L

I

T

A

S

P

P

P

H

A

A

A

A

I

I

C

I

N

N

A

A

I

I

N

K

D

S

A

A

L

-

K

-

P

-

L

T

G

G

V

V

I

R

V

I

T

Y

N

R

A

L

P

P

M

A

T

Y

P

P

E
|
E

V

K

I

V

L

L

T
x
E

A

A

I

L

active site: I390 (≠ T221), F425 (≠ G257), R501 (≠ E334), F505 (≠ I341), R533 (= R369), E869 (= E743), L870 (≠ G744)
binding bicarbonate ion: R460 (≠ A293), A531 (≠ P367), F532 (≠ Y368), Y535 (≠ V371), Q539 (≠ G375)
binding hydrocinnamic acid: I255 (≠ P92), F425 (≠ G257), F494 (≠ Y327), L497 (≠ S330), Y535 (≠ V371), L626 (≠ I477)
binding magnesium ion: E899 (= E776), E903 (≠ T780)
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): T420 (≠ G252), F421 (= F253), G422 (= G254), R533 (= R369), W650 (≠ V502), H653 (= H505), G654 (= G506), Q655 (= Q507), G656 (≠ S508), S695 (≠ T544), G696 (≠ W545), G697 (= G546), Q700 (≠ S549), Q701 (≠ M550), C799 (≠ V670), N800 (= N671), T804 (≠ V675), Q807 (= Q678), S865 (≠ K739), G866 (= G740), V867 (≠ I741), G868 (= G742), E869 (= E743)

Sites not aligning to the query:

binding fe2/s2 (inorganic) cluster: 38, 40, 41, 43, 45, 46, 48, 58, 60, 100, 101, 103, 137, 139
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): 99, 139

4us9A Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with 3- phenylpropionaldehyde (see paper)
27% identity, 94% coverage: 42:782/789 of query aligns to 206:905/907 of 4us9A

query
sites
4us9A

G

G

M

T

K

L

E

H

L

L

A

A

F

M

V

V

R

Q

S

A

P

K

V

V

A

S

H

H

A

A

T

N

I

I

T

K

G

G

I

I

E

D

I

T

P

S

E

E

E

A

H

L

R

T

-

M

-

P

-

G

-

V

G

H

A

S

V

V

F

I

T

T

W

H

A

K

D

D

L

-

A

-

A

-

G

-

G

-

V

V

K

K

P

G

I

K

R

N

A

R

V

I

S

T

G

G

L

L

P
x
I

G

T

F
|
F

K
x
P

V

T

S

N

-

K

-

G

-

D

-

G

-

W

E

D

Q

R

P

P

A

I

L

L

A

C

D

D

G

E

K

K

V

V

R

F

F

Q

V

Y

G

G

E

D

P

C

V

I

A

A

V

L

C

V

V

C

A

A

A

D

T

S

R

E

A

A

E

N

A

A

E

R

D

A

I

A

A

A

A

E

S

K

V

V

F

K

V

V

D

D

Y

L

A

E

E

E

L

L

P

P

V

A

N

Y

S

M

D

S

M

G

L

P

E

A

A

A

V

A

A

A

P

E

G

D

A

A

P

I

K

E

V

I

H

H

D

P

H

G

W

T

P

P

D

-

N

N

V

V

F

Y

L

F

E

E

T

Q

N

P

V

I

-

V

-

K

G

G

G

E

N

D

I

T

A

G

E

P

I

I

A

F

A

A

T

S

A

A

P

D

V

V

K

T

V

V

S

E

R

G

T

D

I

F

R

Y

T

V

A

G

R

R

Q

Q

C

P

M

H

V

M

P

P

L

I

E

E

G

P

K

D

G

V

V

A

V

F

A

A

H

Y

W

M

D

G

R

D

H

D

V

G

E

K

Q

C

L

Y

V

I

L

H

T

S

T

K

S

S

T
x
I

Q

G

M

V

P

-

H

H

I

L

V

H

R

L

A

Y

G

M

L

I

S

A

E

P

C

G

L

V

D

G

L

L

D

E

Q

P

G

D

L

Q

I

L

R

V

V

L

V

V

A

A

P

N

D

P

V

M

G

G

G

G

G
x
T

F
|
F

G
|
G

W

Y

K

K

G
x
F

L

S

L

P

Q

T

P

S

E

E

E

A

I

L

V

V

A

A

A

V

W

-

I

A

A

A

M

M

R

A

L

T

D

G

R

R

P

P

V

V

R

H

W

L

T

R

E

Y

D

N

R

Y

R

Q

E

Q

H

Q

L

Q

V

Q

A

Y

A

T

A

G

N

K

A
x
R

R

S

E

P

H

W

H

E

Y

M

E

N

I

V

T

K

A

F

Y

A

A

A

D

K

A

K

R

D

G

G

R

T

L

L

L

L

G

A

I

M

E

E

A

S

D

D

A

W

W

L

V

V

D

D

A

H

G

G

A

P

Y

Y

S

S

V

E

Y

F

P

G

F

D

S

L

A
x
L

C

T

L

L

E
x
R

A

G

A

A

Q

Q

V

-

G

-

S

-

I
x
F

L

I

P

G

G

A

P

G

Y

Y

D

N

F

I

A

P

H

N

Y

I

R

R

C

G

R

L

T

G

F

R

S

T

V

V

C

A

T

T

N

N

K

H

P

V

P

W

I

G

V

S

P
x
A

Y
x
F

R
|
R

G

G

V
x
Y

A

G

R

A

T

P

G
x
Q

V

S

C

M

F

F

A

A

M

S

E

E

Q

C

M

L

I

M

D

D

A

M

V

L

A

A

D

E

A

K

V

L

G

G

R

M

E

D

P

P

W

L

Q

E

V

L

R

R

L

Y

E

K

N

N

L

A

V

Y

P

R

P

P

E

G

K

D

M

T

P

N

F

P

D

T

N

G

V

Q

T

E

K

P

K

E

H

V

F

F

D

S

S

L

G

P

D

D

Y

M

P

I

E

D

S

Q

V

L

R

R

-

P

R

K

A

Y

V

Q

A

A

A

A

I

L

E

E

L

-

E

-

G

-

W

-

R

K

A

A

R

Q

Q

K

K

E

A

S

G

T

E

A

A

T

D

H

G

K

R

K

L

G

I

V

G

G

V

I

G

S

F

I

A

G

T

V

Y

Y

C

-

E

-

Q

-

S

-

A

-

H

-

G

-

T

-

A

-

V

-

Y

-

H

-

G

G

W

S

G

G

I

L

P

D

M

G

V

-

P

P

G

D

H

A

E

S

Q

E

A

A

Q

W

A

A

R

E

I

L

T

N

P

A

D

D

G

G

G

T

L

I

E

T

L

V

R

H

V

T

G

A

V
x
W

Q

E

S

D

H
|
H

G
|
G

Q
|
Q

S
x
G

M

A

E

D

T

I

T

G

F

C

A

V

Q

G

V

T

A

A

H

H

E

E

V

A

L

L

-

R

-

P

-

M

G

G

I

V

P

A

L

P

E

E

K

K

I

I

K

K

L

F

V

T

H

W

G

P

D

N

T

T

G

A

L

T

T

T

P

P

Y

N

S

S

T

G

G

P

T
x
S

W
x
G

G
|
G

S

S

R

R

S
x
Q

M
x
Q

V

V

M

M

A

T

G

G

G

N

A

A

V

I

A

R

T

V

A

A

C

C

R

E

T

N

L

L

A

L

E

K

R

A

L

C

R

E

K

K

I

P

G

G

A

G

H

-

L

-

M

-

Q

-

A

-

G

-

P

-

D

-

G

G

V

Y

V

Y

L

T

K

Y

D

D

G

E

A

L

V

-

T

-

A

-

G

-

P

K

A

A

A

A

V

D

T

K

I

P

R

T

E

K

I

I

A

T

H

G

T

N

W

W

Y

T

R

A

A

S

P

-

Q

-

L

-

L

-

P

-

A

-

D

-

V

-

D

-

R

-

G

G

G

A

L

T

E
x
H

V

C

T

D

A

A

G

V

Y

T

K

G

P

L

G

G

S

K

D

P

H

F

G

V

T

V

F

Y

S

M

Y

Y

A

G

T

V

H

F

A

M

V

A

A

E

V

V

A

T

V

V

D

D

P

V

E

A

I

T

G

G

Q

Q

V

T

E

T

I

V

L

D

D

G

Y

M

V

T

V

L

V

M

E

A

D

D

A

L

G

G

T

S

M

L

V
x
C

N
|
N

P

Q

M

L

V

A

V
x
T

D

D

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

Y

G

G

G

G

V

L

A

A

Q

Q

G

G

V

I

G

G

T

L

A

A

L

L

Y

S

E

E

R

-

M

-

P

-

Y

-

D

D

A

F

E

E

G

D

Q

I

P

K

L

K

A

H

S

A

T

T

F

L

A

V

D

G

Y

A

L

G

I

F

P

P

G

F

F

I

T

K

E

Q

V

I

P

P

-

D

H

K

V

L

R

D

I

I

I

V

H

Y

M

V

L

N

T

H

P

P

S

R

P

P

Y

D

T

G

E

P

F

F

G

G

V

A

K
x
S

G
|
G

I
x
V

G
|
G

E
|
E

G
x
L

G

P

A

L

I

T

A

S

P

P

P

H

A

A

A

A

I

I

C

I

N

N

A

A

I

I

N

K

D

S

A

A

L

-

K

-

P

-

L

T

G

G

V

V

I
x
R

V

I

T
x
Y

N

R

A

L

P

P

M

A

T

Y

P

P

E
|
E

V

K

I

V

L

L

T
x
E

A

A

I

L

active site: I390 (≠ T221), F425 (≠ G257), R501 (≠ E334), F505 (≠ I341), R533 (= R369), E869 (= E743), L870 (≠ G744)
binding 3-phenylpropanal: I255 (≠ P92), F257 (= F94), P258 (≠ K95), H752 (≠ E623)
binding bicarbonate ion: R460 (≠ A293), L498 (≠ A331), A531 (≠ P367), F532 (≠ Y368), Y535 (≠ V371), Q539 (≠ G375), R890 (≠ I767), Y892 (≠ T769)
binding magnesium ion: E899 (= E776), E903 (≠ T780)
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): T420 (≠ G252), F421 (= F253), G422 (= G254), R533 (= R369), W650 (≠ V502), H653 (= H505), G654 (= G506), Q655 (= Q507), G656 (≠ S508), S695 (≠ T544), G696 (≠ W545), G697 (= G546), Q700 (≠ S549), Q701 (≠ M550), C799 (≠ V670), N800 (= N671), T804 (≠ V675), Q807 (= Q678), S865 (≠ K739), G866 (= G740), V867 (≠ I741), G868 (= G742), E869 (= E743)

Sites not aligning to the query:

binding fe2/s2 (inorganic) cluster: 38, 40, 41, 43, 45, 46, 48, 58, 60, 100, 101, 103, 137, 139
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): 99, 139

4us8A Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with benzaldehyde (see paper)
27% identity, 94% coverage: 42:782/789 of query aligns to 206:905/907 of 4us8A

query
sites
4us8A

G

G

M

T

K

L

E

H

L

L

A

A

F

M

V

V

R

Q

S

A

P

K

V

V

A

S

H

H

A

A

T

N

I

I

T

K

G

G

I

I

E

D

I

T

P

S

E

E

E

A

H

L

R

T

-

M

-

P

-

G

-

V

G

H

A

S

V

V

F

I

T

T

W

H

A

K

D

D

L

-

A

-

A

-

G

-

G

-

V

V

K

K

P

G

I

K

R

N

A

R

V

I

S

T

G

G

L

L

P
x
I

G

T

F

F

K

P

V

T

S

N

-

K

-

G

-

D

-

G

-

W

E

D

Q

R

P

P

A

I

L

L

A

C

D

D

G

E

K

K

V

V

R

F

F

Q

V

Y

G

G

E

D

P

C

V

I

A

A

V

L

C

V

V

C

A

A

A

D

T

S

R

E

A

A

E

N

A

A

E

R

D

A

I

A

A

A

A

E

S

K

V

V

F

K

V

V

D

D

Y

L

A

E

E

E

L

L

P

P

V

A

N

Y

S

M

D

S

M

G

L

P

E

A

A

A

V

A

A

A

P

E

G

D

A

A

P

I

K

E

V

I

H

H

D

P

H

G

W

T

P

P

D

-

N

N

V

V

F

Y

L

F

E

E

T

Q

N

P

V

I

-

V

-

K

G

G

G

E

N

D

I

T

A

G

E

P

I

I

A

F

A

A

T

S

A

A

P

D

V

V

K

T

V

V

S

E

R

G

T

D

I

F

R

Y

T

V

A

G

R

R

Q

Q

C

P

M

H

V

M

P

P

L

I

E

E

G

P

K

D

G

V

V

A

V

F

A

A

H

Y

W

M

D

G

R

D

H

D

V

G

E

K

Q

C

L

Y

V

I

L

H

T

S

T

K

S

S

T
x
I

Q

G

M

V

P

-

H

H

I
x
L

V

H

R

L

A

Y

G

M

L

I

S

A

E

P

C

G

L

V

D

G

L

L

D

E

Q

P

G

D

L

Q

I

L

R

V

V

L

V

V

A

A

P

N

D

P

V

M

G

G

G

G

G
x
T

F
|
F

G
|
G

W

Y

K

K

G
x
F

L

S

L

P

Q

T

P

S

E

E

E

A

I

L

V

V

A

A

A

V

W

-

I

A

A

A

M

M

R

A

L

T

D

G

R

R

P

P

V

V

R

H

W

L

T

R

E

Y

D

N

R

Y

R

Q

E

Q

H

Q

L

Q

V

Q

A

Y

A

T

A

G

N

K

A
x
R

R

S

E

P

H

W

H

E

Y

M

E

N

I

V

T

K

A

F

Y

A

A

A

D

K

A

K

R

D

G

G

R

T

L

L

L

L

G

A

I

M

E

E

A

S

D

D

A

W

W

L

V

V

D

D

A

H

G

G

A

P

Y

Y

S

S

V

E

Y

F

P

G

F

D

S
x
L

A
x
L

C

T

L

L

E
x
R

A

G

A

A

Q

Q

V

-

G

-

S

-

I
x
F

L

I

P

G

G

A

P

G

Y

Y

D

N

F

I

A

P

H

N

Y

I

R

R

C

G

R

L

T

G

F

R

S

T

V

V

C

A

T

T

N

N

K

H

P

V

P

W

I

G

V

S

P
x
A

Y
x
F

R
|
R

G

G

V
x
Y

A

G

R

A

T

P

G
x
Q

V

S

C

M

F

F

A

A

M

S

E

E

Q

C

M

L

I

M

D

D

A

M

V

L

A

A

D

E

A

K

V

L

G

G

R

M

E

D

P

P

W

L

Q

E

V

L

R

R

L

Y

E

K

N

N

L

A

V

Y

P

R

P

P

E

G

K

D

M

T

P

N

F

P

D

T

N

G

V

Q

T

E

K

P

K

E

H

V

F

F

D

S

S

L

G

P

D

D

Y

M

P

I

E

D

S

Q

V

L

R

R

-

P

R

K

A

Y

V

Q

A

A

A

A

I

L

E

E

L

-

E

-

G

-

W

-

R

K

A

A

R

Q

Q

K

K

E

A

S

G

T

E

A

A

T

D

H

G

K

R

K

L

G

I

V

G

G

V

I

G

S

F

I

A

G

T

V

Y

Y

C

-

E

-

Q

-

S

-

A

-

H

-

G

-

T

-

A

-

V

-

Y

-

H

-

G

G

W

S

G

G

I
x
L

P

D

M

G

V

-

P

P

G

D

H

A

E

S

Q

E

A

A

Q

W

A

A

R

E

I

L

T

N

P

A

D

D

G

G

G

T

L

I

E

T

L

V

R

H

V

T

G

A

V

W

Q

E

S

D

H
|
H

G
|
G

Q
|
Q

S
x
G

M

A

E

D

T

I

T

G

F

C

A

V

Q

G

V

T

A

A

H

H

E

E

V

A

L

L

-

R

-

P

-

M

G

G

I

V

P

A

L

P

E

E

K

K

I

I

K

K

L

F

V

T

H

W

G

P

D

N

T

T

G

A

L

T

T

T

P

P

Y

N

S

S

T

G

G
x
P

T
x
S

W
x
G

G
|
G

S

S

R

R

S
x
Q

M
x
Q

V

V

M

M

A

T

G

G

G

N

A

A

V

I

A

R

T

V

A

A

C

C

R

E

T

N

L

L

A

L

E

K

R

A

L

C

R

E

K

K

I

P

G

G

A

G

H

-

L

-

M

-

Q

-

A

-

G

-

P

-

D

-

G

G

V

Y

V

Y

L

T

K

Y

D

D

G

E

A

L

V

-

T

-

A

-

G

-

P

K

A

A

A

A

V

D

T

K

I

P

R

T

E

K

I

I

A

T

H

G

T

N

W

W

Y

T

R

A

A

S

P

-

Q

-

L

-

L

-

P

-

A

-

D

-

V

-

D

-

R

-

G

G

G

A

L

T

E

H

V

C

T

D

A

A

G

V

Y

T

K

G

P

L

G

G

S

K

D

P

H

F

G

V

T

V

F

Y

S

M

Y

Y

A

G

T

V

H

F

A

M

V

A

A

E

V

V

A

T

V

V

D

D

P

V

E

A

I

T

G

G

Q

Q

V

T

E

T

I

V

L

D

D

G

Y

M

V

T

V

L

V

M

E

A

D

D

A

L

G

G

T

S

M

L

V
x
C

N
|
N

P

Q

M

L

V

A

V
x
T

D

D

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

Y

G

G

G

G

V

L

A

A

Q

Q

G

G

V

I

G

G

T

L

A

A

L

L

Y

S

E

E

R

-

M

-

P

-

Y

-

D

D

A

F

E

E

G

D

Q

I

P

K

L

K

A

H

S

A

T

T

F

L

A

V

D

G

Y

A

L

G

I

F

P

P

G

F

F

I

T

K

E

Q

V

I

P

P

-

D

H

K

V

L

R

D

I

I

I

V

H

Y

M

V

L

N

T

H

P

P

S

R

P

P

Y

D

T

G

E

P

F

F

G

G

V

A

K
x
S

G
|
G

I
x
V

G
|
G

E
|
E

G
x
L

G

P

A

L

I

T

A

S

P

P

P

H

A

A

A

A

I

I

C

I

N

N

A

A

I

I

N

K

D

S

A

A

L

-

K

-

P

-

L

T

G

G

V

V

I

R

V

I

T

Y

N

R

A

L

P

P

M

A

T

Y

P

P

E

E

V

K

I

V

L

L

T

E

A

A

I

L

active site: I390 (≠ T221), F425 (≠ G257), R501 (≠ E334), F505 (≠ I341), R533 (= R369), E869 (= E743), L870 (≠ G744)
binding bicarbonate ion: R460 (≠ A293), L498 (≠ A331), A531 (≠ P367), F532 (≠ Y368), Y535 (≠ V371), Q539 (≠ G375)
binding benzaldehyde: I255 (≠ P92), I255 (≠ P92), L394 (≠ I226), F425 (≠ G257), F425 (≠ G257), F425 (≠ G257), F425 (≠ G257), L497 (≠ S330), L497 (≠ S330), R501 (≠ E334), A531 (≠ P367), Y535 (≠ V371), Y535 (≠ V371), L626 (≠ I477), L626 (≠ I477), L626 (≠ I477), P694 (≠ G543), G696 (≠ W545), G697 (= G546)
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): T420 (≠ G252), F421 (= F253), G422 (= G254), R533 (= R369), H653 (= H505), G654 (= G506), Q655 (= Q507), G656 (≠ S508), S695 (≠ T544), G696 (≠ W545), G697 (= G546), Q700 (≠ S549), Q701 (≠ M550), C799 (≠ V670), N800 (= N671), T804 (≠ V675), Q807 (= Q678), S865 (≠ K739), G866 (= G740), V867 (≠ I741), G868 (= G742), E869 (= E743)

Sites not aligning to the query:

binding fe2/s2 (inorganic) cluster: 38, 40, 41, 43, 45, 46, 48, 58, 60, 100, 101, 103, 137, 139
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): 99, 139

4c7yA Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with sodium dithionite and sodium sulfide (see paper)
27% identity, 94% coverage: 42:782/789 of query aligns to 206:905/907 of 4c7yA

query
sites
4c7yA

G

G

M

T

K

L

E

H

L

L

A

A

F

M

V

V

R

Q

S

A

P

K

V

V

A

S

H

H

A

A

T

N

I

I

T

K

G

G

I

I

E

D

I

T

P

S

E

E

E

A

H

L

R

T

-

M

-

P

-

G

-

V

G

H

A

S

V

V

F

I

T

T

W

H

A

K

D

D

L

-

A

-

A

-

G

-

G

-

V

V

K

K

P

G

I

K

R

N

A

R

V

I

S

T

G

G

L

L

P

I

G

T

F

F

K

P

V

T

S

N

-

K

-

G

-

D

-

G

-

W

E

D

Q

R

P

P

A

I

L

L

A

C

D

D

G

E

K

K

V

V

R

F

F

Q

V

Y

G

G

E

D

P

C

V

I

A

A

V

L

C

V

V

C

A

A

A

D

T

S

R

E

A

A

E

N

A

A

E

R

D

A

I

A

A

A

A

E

S

K

V

V

F

K

V

V

D

D

Y

L

A

E

E

E

L

L

P

P

V

A

N

Y

S

M

D

S

M

G

L

P

E

A

A

A

V

A

A

A

P

E

G

D

A

A

P

I

K

E

V

I

H

H

D

P

H

G

W

T

P

P

D

-

N

N

V

V

F

Y

L

F

E

E

T

Q

N

P

V

I

-

V

-

K

G

G

G

E

N

D

I

T

A

G

E

P

I

I

A

F

A

A

T

S

A

A

P

D

V

V

K

T

V

V

S

E

R

G

T

D

I

F

R

Y

T

V

A

G

R

R

Q

Q

C

P

M

H

V

M

P

P

L

I

E

E

G

P

K

D

G

V

V

A

V

F

A

A

H

Y

W

M

D

G

R

D

H

D

V

G

E

K

Q

C

L

Y

V

I

L

H

T

S

T

K

S

S

T
x
I

Q

G

M

V

P

-

H

H

I

L

V

H

R

L

A

Y

G

M

L

I

S

A

E

P

C

G

L

V

D

G

L

L

D

E

Q

P

G

D

L

Q

I

L

R

V

V

L

V

V

A

A

P

N

D

P

V

M

G

G

G

G

G
x
T

F
|
F

G
|
G

W

Y

K

K

G
x
F

L

S

L

P

Q

T

P

S

E

E

E

A

I

L

V

V

A

A

A

V

W

-

I

A

A

A

M

M

R

A

L

T

D

G

R

R

P

P

V

V

R

H

W

L

T

R

E

Y

D

N

R

Y

R

Q

E

Q

H

Q

L

Q

V

Q

A

Y

A

T

A

G

N

K

A
x
R

R

S

E

P

H

W

H

E

Y

M

E

N

I

V

T

K

A

F

Y

A

A

A

D

K

A

K

R

D

G

G

R

T

L

L

L

L

G

A

I

M

E

E

A

S

D

D

A

W

W

L

V

V

D

D

A

H

G

G

A

P

Y

Y

S

S

V

E

Y

F

P

G

F

D

S

L

A
x
L

C

T

L

L

E
x
R

A

G

A

A

Q

Q

V

-

G

-

S

-

I
x
F

L

I

P

G

G

A

P

G

Y

Y

D

N

F

I

A

P

H

N

Y

I

R

R

C

G

R

L

T

G

F

R

S

T

V

V

C

A

T

T

N

N

K

H

P

V

P

W

I

G

V

S

P
x
A

Y

F

R
|
R

G

G

V
x
Y

A

G

R

A

T

P

G
x
Q

V

S

C

M

F

F

A

A

M

S

E

E

Q

C

M

L

I

M

D

D

A

M

V

L

A

A

D

E

A

K

V

L

G

G

R

M

E

D

P

P

W

L

Q

E

V

L

R

R

L

Y

E

K

N

N

L

A

V

Y

P

R

P

P

E

G

K

D

M

T

P

N

F

P

D

T

N

G

V

Q

T

E

K

P

K

E

H

V

F

F

D

S

S

L

G

P

D

D

Y

M

P

I

E

D

S

Q

V

L

R

R

-

P

R

K

A

Y

V

Q

A

A

A

A

I

L

E

E

L

-

E

-

G

-

W

-

R

K

A

A

R

Q

Q

K

K

E

A

S

G

T

E

A

A

T

D

H

G

K

R

K

L

G

I

V

G

G

V

I

G

S

F

I

A

G

T

V

Y

Y

C

-

E

-

Q

-

S

-

A

-

H

-

G

-

T

-

A

-

V

-

Y

-

H

-

G

G

W

S

G

G

I

L

P

D

M

G

V

-

P

P

G

D

H

A

E

S

Q

E

A

A

Q

W

A

A

R

E

I

L

T

N

P

A

D

D

G

G

G

T

L

I

E

T

L

V

R

H

V

T

G

A

V
x
W

Q

E

S

D

H
|
H

G
|
G

Q
|
Q

S
x
G

M

A

E

D

T

I

T

G

F

C

A

V

Q

G

V

T

A

A

H

H

E

E

V

A

L

L

-

R

-

P

-

M

G

G

I

V

P

A

L

P

E

E

K

K

I

I

K

K

L

F

V

T

H

W

G

P

D

N

T

T

G

A

L

T

T

T

P

P

Y

N

S

S

T

G

G

P

T
x
S

W
x
G

G
|
G

S

S

R

R

S
x
Q

M
x
Q

V

V

M

M

A

T

G

G

G

N

A

A

V

I

A

R

T

V

A

A

C

C

R

E

T

N

L

L

A

L

E

K

R

A

L

C

R

E

K

K

I

P

G

G

A

G

H

-

L

-

M

-

Q

-

A

-

G

-

P

-

D

-

G

G

V

Y

V

Y

L

T

K

Y

D

D

G

E

A

L

V

-

T

-

A

-

G

-

P

K

A

A

A

A

V

D

T

K

I

P

R

T

E

K

I

I

A

T

H

G

T

N

W

W

Y

T

R

A

A

S

P

-

Q

-

L

-

L

-

P

-

A

-

D

-

V

-

D

-

R

-

G

G

G

A

L

T

E

H

V

C

T

D

A

A

G

V

Y

T

K

G

P

L

G

G

S

K

D

P

H

F

G

V

T

V

F

Y

S

M

Y

Y

A

G

T

V

H

F

A

M

V

A

A

E

V

V

A

T

V

V

D

D

P

V

E

A

I

T

G

G

Q

Q

V

T

E

T

I

V

L

D

D

G

Y

M

V

T

V

L

V

M

E

A

D

D

A

L

G

G

T

S

M

L

V
x
C

N
|
N

P

Q

M

L

V

A

V
x
T

D

D

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

Y

G

G

G

G

V

L

A

A

Q

Q

G

G

V

I

G

G

T

L

A

A

L

L

Y

S

E

E

R

-

M

-

P

-

Y

-

D

D

A

F

E

E

G

D

Q

I

P

K

L

K

A

H

S

A

T

T

F

L

A

V

D

G

Y

A

L

G

I

F

P

P

G

F

F

I

T

K

E

Q

V

I

P

P

-

D

H

K

V

L

R

D

I

I

I

V

H

Y

M

V

L

N

T

H

P

P

S

R

P

P

Y

D

T

G

E

P

F

F

G

G

V

A

K
x
S

G
|
G

I
x
V

G
|
G

E
|
E

G
x
L

G

P

A

L

I

T

A

S

P

P

P

H

A

A

A

A

I

I

C

I

N

N

A

A

I

I

N

K

D

S

A

A

L

-

K

-

P

-

L

T

G

G

V

V

I

R

V

I

T

Y

N

R

A

L

P

P

M

A

T

Y

P

P

E
|
E

V

K

I

V

L

L

T
x
E

A

A

I

L

active site: I390 (≠ T221), F425 (≠ G257), R501 (≠ E334), F505 (≠ I341), R533 (= R369), E869 (= E743), L870 (≠ G744)
binding bicarbonate ion: R460 (≠ A293), L498 (≠ A331), A531 (≠ P367), Y535 (≠ V371), Q539 (≠ G375)
binding magnesium ion: E899 (= E776), E903 (≠ T780)
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): T420 (≠ G252), F421 (= F253), G422 (= G254), R533 (= R369), W650 (≠ V502), H653 (= H505), G654 (= G506), Q655 (= Q507), G656 (≠ S508), S695 (≠ T544), G696 (≠ W545), Q700 (≠ S549), Q701 (≠ M550), C799 (≠ V670), N800 (= N671), T804 (≠ V675), Q807 (= Q678), S865 (≠ K739), G866 (= G740), V867 (≠ I741), G868 (= G742), E869 (= E743)
binding hydrogen peroxide: G696 (≠ W545), G697 (= G546), E869 (= E743)

Sites not aligning to the query:

binding fe2/s2 (inorganic) cluster: 40, 41, 43, 45, 46, 48, 58, 60, 100, 101, 103, 137, 139
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): 99, 139

3fc4A Ethylene glycol inhibited form of aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (see paper)
27% identity, 94% coverage: 42:782/789 of query aligns to 206:905/907 of 3fc4A

query
sites
3fc4A

G

G

M

T

K

L

E

H

L

L

A

A

F

M

V

V

R

Q

S

A

P

K

V

V

A

S

H

H

A

A

T

N

I

I

T

K

G

G

I

I

E

D

I

T

P

S

E

E

E

A

H

L

R

T

-

M

-

P

-

G

-

V

G

H

A

S

V

V

F

I

T

T

W

H

A

K

D

D

L

-

A

-

A

-

G

-

G

-

V

V

K

K

P

G

I

K

R

N

A

R

V

I

S

T

G

G

L

L

P

I

G

T

F

F

K

P

V

T

S

N

-

K

-

G

-

D

-

G

-

W

E

D

Q

R

P

P

A

I

L

L

A

C

D

D

G

E

K

K

V

V

R

F

F

Q

V

Y

G

G

E

D

P

C

V

I

A

A

V

L

C

V

V

C

A

A

A

D

T

S

R

E

A

A

E

N

A

A

E

R

D

A

I

A

A

A

A

E

S

K

V

V

F

K

V

V

D

D

Y

L

A

E

E

E

L

L

P

P

V

A

N

Y

S

M

D

S

M

G

L

P

E

A

A

A

V

A

A

A

P

E

G

D

A

A

P

I

K

E

V

I

H

H

D

P

H

G

W

T

P

P

D

-

N

N

V

V

F

Y

L

F

E

E

T

Q

N

P

V

I

-

V

-

K

G

G

G

E

N

D

I

T

A

G

E

P

I

I

A

F

A

A

T

S

A

A

P

D

V

V

K

T

V

V

S

E

R

G

T

D

I

F

R

Y

T

V

A

G

R

R

Q

Q

C

P

M

H

V

M

P

P

L

I

E

E

G

P

K

D

G

V

V

A

V

F

A

A

H

Y

W

M

D

G

R

D

H

D

V

G

E

K

Q

C

L

Y

V

I

L

H

T

S

T

K

S

S

T
x
I

Q

G

M

V

P

-

H

H

I

L

V

H

R

L

A

Y

G

M

L

I

S

A

E

P

C

G

L

V

D

G

L

L

D

E

Q

P

G

D

L

Q

I

L

R

V

V

L

V

V

A

A

P

N

D

P

V

M

G

G

G
|
G

G
x
T

F
|
F

G
|
G

W

Y

K

K

G
x
F

L

S

L

P

Q

T

P

S

E

E

E

A

I

L

V

V

A

A

A

V

W

-

I

A

A

A

M

M

R

A

L

T

D

G

R

R

P

P

V

V

R

H

W

L

T

R

E

Y

D

N

R

Y

R

Q

E

Q

H

Q

L

Q

V

Q

A

Y

A

T

A

G

N

K

A

R

R

S

E

P

H

W

H

E

Y

M

E

N

I

V

T

K

A

F

Y

A

A

A

D

K

A

K

R

D

G

G

R

T

L

L

L

L

G

A

I

M

E

E

A

S

D

D

A

W

W

L

V

V

D

D

A

H

G

G

A

P

Y

Y

S

S

V

E

Y

F

P

G

F

D

S

L

A

L

C

T

L

L

E
x
R

A

G

A

A

Q

Q

V

-

G

-

S

-

I
x
F

L

I

P

G

G

A

P

G

Y

Y

D

N

F

I

A

P

H

N

Y

I

R

R

C

G

R

L

T

G

F

R

S

T

V

V

C

A

T

T

N

N

K

H

P

V

P

W

I

G

V

S

P

A

Y

F

R
|
R

G

G

V
x
Y

A

G

R

A

T

P

G

Q

V

S

C

M

F

F

A

A

M

S

E

E

Q

C

M

L

I

M

D

D

A

M

V

L

A

A

D

E

A

K

V

L

G

G

R

M

E

D

P

P

W

L

Q

E

V

L

R

R

L

Y

E

K

N

N

L

A

V

Y

P

R

P

P

E

G

K

D

M

T

P

N

F

P

D

T

N

G

V

Q

T

E

K

P

K

E

H

V

F

F

D

S

S

L

G

P

D

D

Y

M

P

I

E

D

S

Q

V

L

R

R

-

P

R

K

A

Y

V

Q

A

A

A

A

I

L

E

E

L

-

E

-

G

-

W

-

R

K

A

A

R

Q

Q

K

K

E

A

S

G

T

E

A

A

T

D

H

G

K

R

K

L

G

I

V

G

G

V

I

G

S

F

I

A

G

T

V

Y
|
Y

C

-

E

-

Q

-

S

-

A

-

H

-

G

-

T

-

A

-

V

-

Y

-

H

-

G

G

W

S

G

G

I

L

P

D

M

G

V

-

P

P

G

D

H

A

E

S

Q

E

A

A

Q

W

A

A

R

E

I

L

T

N

P

A

D

D

G

G

G

T

L

I

E

T

L

V

R

H

V

T

G

A

V
x
W

Q

E

S

D

H
|
H

G
|
G

Q
|
Q

S
x
G

M

A

E

D

T

I

T

G

F

C

A

V

Q

G

V

T

A

A

H

H

E

E

V

A

L

L

-

R

-

P

-

M

G

G

I

V

P

A

L

P

E

E

K

K

I

I

K

K

L

F

V

T

H

W

G

P

D

N

T

T

G

A

L

T

T

T

P

P

Y

N

S

S

T

G

G

P

T
x
S

W
x
G

G
|
G

S

S

R

R

S
x
Q

M
x
Q

V

V

M

M

A

T

G

G

G

N

A

A

V

I

A

R

T

V

A

A

C

C

R

E

T

N

L

L

A

L

E

K

R

A

L

C

R

E

K

K

I

P

G

G

A

G

H

-

L

-

M

-

Q

-

A

-

G

-

P

-

D

-

G

G

V

Y

V

Y

L

T

K

Y

D

D

G

E

A

L

V

-

T

-

A

-

G

-

P

K

A

A

A

A

V

D

T

K

I

P

R

T

E

K

I

I

A

T

H

G

T

N

W

W

Y

T

R

A

A

S

P

-

Q

-

L

-

L

-

P

-

A

-

D

-

V

-

D

-

R

-

G

G

G

A

L

T

E

H

V

C

T

D

A

A

G

V

Y

T

K

G

P

L

G

G

S

K

D

P

H

F

G

V

T

V

F

Y

S

M

Y

Y

A

G

T

V

H

F

A

M

V

A

A

E

V

V

A

T

V

V

D

D

P

V

E

A

I

T

G

G

Q

Q

V

T

E

T

I

V

L

D

D

G

Y

M

V

T

V

L

V

M

E

A

D

D

A

L

G

G

T

S

M

L

V
x
C

N
|
N

P

Q

M

L

V

A

V
x
T

D

D

G

G

Q
|
Q

I

I

Y

Y

G

G

G

G

V

L

A

A

Q

Q

G

G

V

I

G

G

T

L

A

A

L

L

Y

S

E

E

R

-

M

-

P

-

Y

-

D

D

A

F

E

E

G

D

Q

I

P

K

L

K

A

H

S

A

T

T

F

L

A

V

D

G

Y

A

L

G

I

F

P

P

G

F

F

I

T

K

E

Q

V

I

P

P

-

D

H

K

V

L

R

D

I

I

I

V

H

Y

M

V

L

N

T

H

P

P

S

R

P

P

Y

D

T

G

E

P

F

F

G

G

V

A

K
x
S

G
|
G

I
x
V

G
|
G

E
|
E

G
x
L

G

P

A

L

I

T

A

S

P

P

P

H

A

A

A

A

I

I

C

I

N

N

A

A

I

I

N

K

D

S

A

A

L

-

K

-

P

-

L

T

G

G

V

V

I

R

V

I

T

Y

N

R

A

L

P

P

M

A

T

Y

P

P

E
|
E

V

K

I

V

L

L

T
x
E

A

A

I

L

active site: I390 (≠ T221), F425 (≠ G257), R501 (≠ E334), F505 (≠ I341), R533 (= R369), E869 (= E743), L870 (≠ G744)
binding 1,2-ethanediol: Y535 (≠ V371), Y622 (= Y461), G696 (≠ W545), G697 (= G546), E869 (= E743)
binding magnesium ion: E899 (= E776), E903 (≠ T780)
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): G419 (= G251), T420 (≠ G252), F421 (= F253), G422 (= G254), R533 (= R369), W650 (≠ V502), H653 (= H505), G654 (= G506), Q655 (= Q507), G656 (≠ S508), S695 (≠ T544), G696 (≠ W545), Q700 (≠ S549), Q701 (≠ M550), C799 (≠ V670), N800 (= N671), T804 (≠ V675), Q807 (= Q678), S865 (≠ K739), G866 (= G740), V867 (≠ I741), G868 (= G742), E869 (= E743)

Sites not aligning to the query:

binding fe2/s2 (inorganic) cluster: 38, 40, 41, 43, 45, 46, 48, 58, 60, 100, 101, 103, 137, 139
binding (molybdopterin-cytosine dinucleotide-s,s)-dioxo-aqua-molybdenum(v): 99, 139

Query Sequence

>AZOBR_RS29690 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS29690
MGEVSTAGSGAGSGVGARVRRKEDDRLLRGRGRFVGDIALVGMKELAFVRSPVAHATITG
IEIPEEHRGAVFTWADLAAGGVKPIRAVSGLPGFKVSEQPALADGKVRFVGEPVAVCVAA
TRAEAEDIAASVFVDYAELPVNSDMLEAVAPGAPKVHDHWPDNVFLETNVGGNIAEIAAT
APVKVSRTIRTARQCMVPLEGKGVVAHWDRHVEQLVLTTSTQMPHIVRAGLSECLDLDQG
LIRVVAPDVGGGFGWKGLLQPEEIVAAWIAMRLDRPVRWTEDRREHLVAAANAREHHYEI
TAYADARGRLLGIEADAWVDAGAYSVYPFSACLEAAQVGSILPGPYDFAHYRCRTFSVCT
NKPPIVPYRGVARTGVCFAMEQMIDAVADAVGREPWQVRLENLVPPEKMPFDNVTKKHFD
SGDYPESVRRAVAAIELEGWRARQKAGEADGRLIGVGFATYCEQSAHGTAVYHGWGIPMV
PGHEQAQARITPDGGLELRVGVQSHGQSMETTFAQVAHEVLGIPLEKIKLVHGDTGLTPY
STGTWGSRSMVMAGGAVATACRTLAERLRKIGAHLMQAGPDGVVLKDGAVTAGPAAVTIR
EIAHTWYRAPQLLPADVDRGGLEVTAGYKPGSDHGTFSYATHAVAVAVDPEIGQVEILDY
VVVEDAGTMVNPMVVDGQIYGGVAQGVGTALYERMPYDAEGQPLASTFADYLIPGFTEVP
HVRIIHMLTPSPYTEFGVKGIGEGGAIAPPAAICNAINDALKPLGVIVTNAPMTPEVILT
AIAGERGAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory