SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS29695 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS29695 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ffuC Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
42% identity, 75% coverage: 6:207/270 of query aligns to 6:207/287 of 1ffuC

query
sites
1ffuC
F
 
F
D
 
E
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
A
P
 
P
A
 
K
T
 
S
L
 
V
D
 
G
A
 
E
A
 
A
L
 
V
E
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
G
R
 
Q
E
 
L
D
 
G
V
 
S
M
 
D
V
 
A
R
x
K
P
x
L
V
 
L
A
|
A
G
|
G
S
x
G
Q
x
H
S
|
S
L
|
L
G
 
L
P
 
P
M
 
M
L
 
M
N
 
K
L
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
H
L
 
L
V
 
I
D
 
D
I
|
I
T
 
N
R
 
R
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
R
T
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
S
R
 
T
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
M
V
 
T
T
 
V
H
 
E
A
 
N
R
 
D
L
 
L
E
 
I
D
 
S
G
 
S
D
 
P
Y
 
I
P
 
V
D
 
Q
V
 
A
T
 
R
R
 
L
G
 
P
V
 
L
L
 
L
P
 
A
S
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
K
V
 
L
I
|
I
A
|
A
Y
 
D
R
 
P
A
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
N
R
 
R
G
|
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
D
L
 
I
A
|
A
H
 
H
A
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
A
x
N
D
|
D
W
 
H
V
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
V
G
 
E
A
 
A
D
 
H
V
 
F
V
 
V
I
 
L
V
 
E
G
 
G
Q
 
P
G
 
N
G
 
G
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
P
M
 
A
T
 
D
D
 
G
F
 
F
I
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
T
F
 
Y
E
 
M
T
 
T
A
 
L
L
|
L
Q
 
E
P
 
E
G
 
N
E
 
E
I
x
V
V
x
M
A
 
V
E
 
E
I
 
I
H
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
F
S
 
A
E
 
A
R
 
G
A
 
T
R
 
G
W
 
W
G
 
A
Y
 
Y
Y
 
E
K
 
K
V
 
L
C
 
K
R
 
R
K
 
K
T
 
T
G
 
G
E
 
D
F
x
W
S
 
A
H
 
T
A
 
A
T
 
G
G
 
C
A
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
M
D
 
R
P
 
K
A
 
S
R
 
G
G
 
G

7dqxE Crystal structure of xanthine dehydrogenase family protein
38% identity, 75% coverage: 1:202/270 of query aligns to 1:202/293 of 7dqxE

query
sites
7dqxE
M
 
M
K
 
K
A
 
P
V
 
P
D
 
S
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
V
P
 
A
A
 
D
T
 
S
L
 
V
D
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
L
E
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
A
R
 
D
E
 
G
D
 
G
V
 
D
M
 
D
V
 
A
R
x
K
P
x
I
V
x
I
A
 
A
G
|
G
S
x
G
Q
|
Q
S
|
S
L
|
L
G
 
V
P
 
P
M
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
F
R
 
R
L
 
M
A
 
S
Q
 
R
P
 
P
E
 
S
L
 
L
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
I
T
 
N
R
 
R
I
 
V
A
 
P
E
 
G
L
 
L
R
 
A
T
 
N
I
 
I
R
 
R
R
 
K
E
 
S
G
 
D
D
 
Q
R
 
T
L
 
I
V
 
A
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
L
V
 
T
T
 
R
H
|
H
A
 
A
R
 
K
L
 
L
E
 
T
D
 
T
G
 
S
D
 
K
Y
 
T
P
 
I
D
 
S
V
 
Q
T
 
N
R
 
L
G
 
P
V
 
I
L
 
L
P
 
S
S
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
W
I
|
I
A
|
A
Y
 
H
R
 
P
A
 
Q
V
x
I
R
 
R
N
 
N
R
 
R
G
|
G
T
|
T
I
 
I
G
|
G
G
|
G
S
|
S
L
 
L
A
|
A
H
 
H
A
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
A
A
|
A
D
x
E
W
 
L
V
 
P
N
 
V
V
 
V
L
 
L
T
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
A
D
 
Y
V
 
V
V
 
T
I
 
A
V
 
Q
G
 
S
Q
 
L
G
 
Q
G
 
G
R
 
E
R
 
R
S
 
K
V
 
I
P
 
P
M
 
L
T
 
K
D
 
E
F
 
L
I
 
L
L
 
V
G
 
S
V
 
H
F
 
F
E
 
V
T
 
S
A
 
S
L
 
I
Q
 
L
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
x
I
A
 
V
E
 
E
I
 
V
H
 
N
V
 
V
P
 
P
A
 
Q
L
 
L
S
 
P
E
 
H
R
 
G
A
 
S
R
 
G
W
 
A
G
 
A
Y
 
F
Y
 
D
K
 
E
V
 
F
C
 
S
R
 
R
K
 
R
T
 
H
G
 
G
E
 
D
F
x
Y
S
 
A
H
 
I
A
 
G
T
 
G
G
 
A
A
 
A
V
 
S
L
 
L
I
 
V

1t3qC Crystal structure of quinoline 2-oxidoreductase from pseudomonas putida 86 (see paper)
40% identity, 79% coverage: 1:213/270 of query aligns to 1:208/285 of 1t3qC

query
sites
1t3qC
M
 
M
K
 
K
A
 
F
V
 
P
D
 
A
F
 
F
D
 
S
Y
 
Y
A
 
R
Q
 
A
P
 
P
A
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
Q
A
 
E
A
 
V
L
 
I
E
 
Q
L
 
V
L
 
L
S
 
A
R
 
-
E
 
D
D
 
D
V
 
P
M
 
D
V
 
A
R
 
R
P
x
I
V
 
I
A
|
A
G
|
G
S
x
G
Q
|
Q
S
|
S
L
|
L
G
 
L
P
 
P
M
 
L
L
 
L
N
 
A
L
 
F
R
 
R
L
 
L
A
 
V
Q
 
Y
P
 
P
E
 
S
L
 
C
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
L
T
 
R
R
 
N
I
 
V
A
 
S
E
 
E
L
 
L
R
 
F
T
 
E
I
 
I
R
 
S
R
 
Q
E
 
S
G
 
A
D
 
G
R
 
I
L
 
L
V
 
S
I
 
V
G
 
G
A
 
A
C
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
A
 
F
R
 
R
L
 
-
E
 
-
D
 
N
G
 
K
D
 
T
Y
 
D
P
 
P
D
 
T
V
 
V
T
 
A
R
 
K
G
 
C
V
 
V
-
 
P
-
 
I
L
 
L
P
 
P
S
 
K
V
 
V
A
 
L
A
 
A
V
 
H
I
x
V
A
|
A
Y
 
H
R
 
Q
A
 
A
V
|
V
R
 
R
N
 
N
R
 
R
G
 
G
T
|
T
I
 
L
G
 
G
G
|
G
S
|
S
L
 
L
A
|
A
H
 
H
A
 
A
D
 
D
P
 
A
A
 
G
A
|
A
D
x
E
W
 
M
V
 
P
N
 
F
V
 
L
L
 
M
T
 
A
A
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
T
V
 
M
V
 
Y
I
 
I
V
 
A
G
 
S
Q
 
S
G
 
A
G
 
G
R
 
V
R
 
R
S
 
S
V
 
V
P
 
S
M
 
A
T
 
T
D
 
D
F
 
F
I
 
M
L
 
K
G
 
G
V
 
H
F
 
Y
E
 
F
T
 
T
A
 
D
L
 
L
Q
 
E
P
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
V
V
x
L
-
 
V
-
 
R
A
 
V
E
 
E
I
 
I
H
 
P
V
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
S
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
H
W
 
W
G
 
E
Y
 
F
Y
 
D
K
 
E
V
 
Y
C
 
A
R
 
R
K
 
R
T
 
K
G
 
G
E
 
D
F
x
Y
S
 
A
H
 
L
A
 
V
T
 
M
G
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
G
I
 
L
D
 
S
P
 
M
A
 
Q
R
 
G
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
R
 
R
C
 
C
V
 
V
A
 
A

4zohB Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
40% identity, 73% coverage: 6:202/270 of query aligns to 6:195/274 of 4zohB

query
sites
4zohB
F
 
F
D
 
G
Y
 
Y
A
 
V
Q
 
I
P
 
P
A
 
D
T
 
N
L
 
L
D
 
N
A
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
F
L
 
L
S
 
E
R
 
-
E
 
E
D
 
H
V
 
Q
M
 
D
V
 
A
R
|
R
P
|
P
V
 
L
A
|
A
G
|
G
S
x
G
Q
x
H
S
|
S
L
|
L
G
 
I
P
 
P
M
 
M
L
 
L
N
 
K
L
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
I
Q
 
R
P
 
P
E
 
S
L
 
Y
L
 
I
V
 
V
D
 
E
I
 
I
T
 
R
R
 
R
I
 
F
A
 
S
E
 
N
L
 
L
R
 
S
T
 
Y
I
 
I
R
 
T
R
 
K
E
 
D
G
 
G
D
 
N
R
 
L
L
 
Y
V
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
L
V
 
T
T
 
T
H
|
H
A
 
Y
R
 
N
L
 
I
E
 
S
D
 
K
G
 
S
D
 
S
Y
 
I
P
 
P
D
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
L
L
 
L
P
 
S
S
 
E
V
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
N
I
|
I
A
x
G
Y
 
D
R
 
P
A
 
Q
V
|
V
R
 
R
N
 
N
R
 
M
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
|
S
L
 
I
A
x
S
H
 
H
A
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
S
A
|
A
D
|
D
W
 
Y
V
 
P
N
 
A
V
 
A
L
 
L
T
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
D
A
 
A
D
 
K
V
 
V
V
 
K
I
 
I
V
 
T
G
 
S
Q
 
R
G
 
K
G
 
G
R
 
D
R
 
R
S
 
V
V
 
V
P
 
N
M
 
F
T
 
K
D
 
S
F
 
F
I
 
A
L
 
K
G
 
D
V
 
M
F
 
F
E
 
T
T
 
P
A
 
D
L
 
L
Q
 
N
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
x
L
V
|
V
A
 
T
E
 
E
I
 
I
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
A
 
T
L
 
F
S
 
-
E
 
E
R
 
G
A
 
Y
R
 
K
W
 
F
G
 
S
Y
 
Y
Y
 
Q
K
 
K
V
 
L
C
 
E
R
 
R
K
 
R
T
 
A
G
 
G
E
x
D
F
|
F
S
 
A
H
 
I
A
 
V
T
 
G
G
 
V
A
 
A
V
 
L
L
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

P19920 Carbon monoxide dehydrogenase medium chain; CO dehydrogenase subunit M; CO-DH M; EC 1.2.5.3 from Afipia carboxidovorans (strain ATCC 49405 / DSM 1227 / KCTC 32145 / OM5) (Oligotropha carboxidovorans) (see 2 papers)
33% identity, 96% coverage: 6:265/270 of query aligns to 6:279/288 of P19920

query
sites
P19920
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
R
P
 
P
A
 
K
T
 
S
L
 
I
D
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
V
E
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
T
R
 
K
E
 
L
D
 
G
V
 
E
M
 
D
V
 
A
R
 
R
P
 
P
V
 
L
A
|
A
G
|
G
S
x
G
Q
x
H
S
|
S
L
 
L
G
 
I
P
 
P
M
 
I
L
 
M
N
 
K
L
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
L
T
 
R
R
 
D
I
 
I
A
 
G
E
 
D
L
 
L
R
 
V
T
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
T
R
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
M
V
 
T
T
 
T
H
 
Q
A
 
H
R
 
A
L
 
L
E
 
I
D
 
G
G
 
S
D
 
D
Y
 
F
P
 
L
D
 
A
V
 
A
T
 
K
R
 
L
G
 
P
V
 
I
L
 
I
P
 
R
S
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
L
V
 
L
I
 
I
A
 
A
Y
 
D
R
 
P
A
 
Q
V
 
I
R
 
R
N
 
Y
R
 
M
G
 
G
T
|
T
I
|
I
G
|
G
G
|
G
S
x
N
L
 
A
A
 
A
H
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
A
 
N
D
 
D
W
 
M
V
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
M
T
 
Q
A
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
Y
V
 
E
I
 
L
V
 
T
G
 
G
Q
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
A
R
 
R
S
 
I
V
 
V
P
 
A
M
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
Y
I
 
Y
L
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
Y
E
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
T
E
 
A
I
 
I
H
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
P
S
 
P
E
 
T
R
 
G
A
 
H
R
 
G
W
 
Y
G
 
A
Y
 
Y
Y
 
E
K
 
K
V
 
L
C
 
K
R
 
R
K
 
K
T
 
I
G
 
G
E
 
D
F
 
Y
S
 
A
H
 
T
A
 
A
T
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
T
P
 
M
A
 
S
R
 
G
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
R
 
K
C
 
C
V
 
V
A
 
T
G
 
A
A
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
N
T
 
V
S
 
A
G
 
N
K
 
T
P
 
P
V
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
K
V
 
V
I
 
L
D
 
V
G
 
G
P
 
T
A
 
A
L
 
L
F
 
D
T
 
K
D
 
P
G
 
A
C
 
L
T
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
L
A
 
A
H
 
E
L
 
A
A
 
I
G
 
T
S
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
S
D
 
D
-
 
G
-
 
R
D
 
G
P
 
P
I
 
A
A
 
E
L
 
Y
R
 
R
T
 
T
H
 
K
T
 
M
-
 
A
-
 
G
V
 
V
A
 
M
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
V

1n5wC Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); oxidized form (see paper)
33% identity, 96% coverage: 6:265/270 of query aligns to 6:279/287 of 1n5wC

query
sites
1n5wC
F
 
F
D
 
D
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
R
P
 
P
A
 
K
T
 
S
L
 
I
D
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
V
E
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
T
R
 
K
E
 
L
D
 
G
V
 
E
M
 
D
V
 
A
R
 
R
P
 
P
V
 
L
A
 
A
G
 
G
S
 
G
Q
x
H
S
 
S
L
 
L
G
 
I
P
 
P
M
 
I
L
 
M
N
 
K
L
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
A
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
L
 
H
L
 
L
V
 
V
D
 
D
I
 
L
T
 
R
R
 
D
I
 
I
A
 
G
E
 
D
L
 
L
R
 
V
T
 
G
I
 
I
R
 
R
R
 
E
E
 
E
G
 
G
D
 
T
R
 
D
L
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
M
V
 
T
T
 
T
H
 
Q
A
 
H
R
 
A
L
 
L
E
 
I
D
 
G
G
 
S
D
 
D
Y
 
F
P
 
L
D
 
A
V
 
A
T
 
K
R
 
L
G
 
P
V
 
I
L
 
I
P
 
R
S
 
E
V
 
T
A
 
S
A
 
L
V
 
L
I
|
I
A
|
A
Y
 
D
R
 
P
A
 
Q
V
 
I
R
 
R
N
 
Y
R
 
M
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
G
 
G
S
x
N
L
 
A
A
 
A
H
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
G
A
x
N
D
|
D
W
 
M
V
 
P
N
 
A
V
 
L
L
 
M
T
 
Q
A
 
C
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
Y
V
 
E
I
 
L
V
 
T
G
 
G
Q
 
P
G
 
E
G
 
G
R
 
A
R
 
R
S
 
I
V
 
V
P
 
A
M
 
A
T
 
R
D
 
D
F
 
Y
I
 
Y
L
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
Y
E
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
I
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
L
V
 
L
A
 
T
E
 
A
I
 
I
H
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
V
L
 
P
S
 
P
E
 
T
R
 
G
A
 
H
R
 
G
W
 
Y
G
 
A
Y
 
Y
Y
 
E
K
 
K
V
 
L
C
 
K
R
 
R
K
 
K
T
 
I
G
 
G
E
 
D
F
x
Y
S
 
A
H
 
T
A
 
A
T
 
A
G
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
T
P
 
M
A
 
S
R
 
G
G
 
G
V
 
-
Q
 
-
R
 
K
C
 
C
V
 
V
A
 
T
G
 
A
A
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
N
T
 
V
S
 
A
G
 
N
K
 
T
P
 
P
V
 
L
-
 
W
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
K
V
 
V
I
 
L
D
 
V
G
 
G
P
 
T
A
 
A
L
 
L
F
 
D
T
 
K
D
 
P
G
 
A
C
 
L
T
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
V
L
 
A
A
 
L
A
 
A
H
 
E
L
 
A
A
 
I
G
 
T
S
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
S
D
 
D
-
 
G
-
 
R
D
 
G
P
 
P
I
 
A
A
 
E
L
 
Y
R
 
R
T
 
T
H
 
K
T
 
M
-
 
A
-
 
G
V
 
V
A
 
M
L
 
L
K
 
R
R
 
R
A
 
A
I
 
V

Q0QLF4 Nicotinate dehydrogenase FAD-subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase FAD-subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see paper)
32% identity, 69% coverage: 5:189/270 of query aligns to 3:191/296 of Q0QLF4

query
sites
Q0QLF4
D
 
D
F
 
F
D
 
E
Y
 
F
A
 
F
Q
 
A
P
 
P
A
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
H
R
 
Q
-
 
Y
E
 
K
D
 
D
V
 
V
M
 
P
V
 
P
R
 
A
P
x
I
V
x
I
A
|
A
G
|
G
S
x
G
Q
x
T
S
x
D
L
|
L
G
 
V
P
 
I
M
 
E
L
 
I
N
 
N
L
 
D
R
 
R
L
 
W
A
 
E
Q
 
K
P
 
P
E
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
I
T
 
K
R
 
K
I
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
R
 
V
E
 
E
G
 
E
D
 
N
R
 
T
L
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
L
V
 
S
T
 
T
H
 
F
A
 
T
R
 
Q
L
 
I
E
 
E
D
 
N
G
 
H
D
 
P
Y
 
F
P
 
I
D
 
R
V
 
S
T
 
H
R
 
V
G
 
R
V
 
A
L
 
L
P
 
Y
S
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
S
V
 
Q
I
 
V
A
x
G
Y
 
S
R
 
P
A
 
Q
V
 
I
R
 
R
N
 
N
R
 
L
G
 
G
T
|
T
I
|
I
G
|
G
G
|
G
S
x
N
L
 
L
A
 
S
H
 
T
A
 
S
D
 
S
P
 
V
A
 
A
A
 
G
D
|
D
W
 
G
V
 
V
N
 
S
V
 
A
L
 
M
T
 
T
A
 
T
L
 
L
G
 
D
A
 
A
D
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
E
G
 
S
Q
 
V
G
 
R
G
 
G
R
 
T
R
 
R
S
 
Q
V
 
M
P
 
K
M
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
F
I
 
F
L
 
D
G
 
G
V
 
E
-
 
G
F
 
F
E
 
K
-
 
R
-
x
R
T
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
P
 
A
G
 
D
E
 
E
I
 
I
V
x
M
A
 
T
E
 
E
I
 
V
H
 
I
V
 
I
P
 
D
A
 
R
L
 
P
S
 
D
E
 
A
R
 
H
A
 
S
R
 
A
W
 
S
G
 
A
Y
 
F
Y
 
Y
K
|
K
V
 
L
C
 
A
R
 
K
K
 
R

3hrdG Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
32% identity, 69% coverage: 5:189/270 of query aligns to 3:191/292 of 3hrdG

query
sites
3hrdG
D
 
D
F
 
F
D
 
E
Y
 
F
A
 
F
Q
 
A
P
 
P
A
 
K
T
 
T
L
 
L
D
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
K
E
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
H
R
 
Q
-
 
Y
E
 
K
D
 
D
V
 
V
M
 
P
V
 
P
R
 
A
P
x
I
V
 
I
A
|
A
G
|
G
S
x
G
Q
x
T
S
x
D
L
 
L
G
 
V
P
 
I
M
 
E
L
 
I
N
 
N
L
 
D
R
 
R
L
 
W
A
 
E
Q
 
K
P
 
P
E
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
D
 
D
I
 
I
T
 
K
R
 
K
I
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
R
 
E
T
 
Y
I
 
I
R
 
R
R
 
V
E
 
E
G
 
E
D
 
N
R
 
T
L
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
L
V
 
S
T
 
T
H
x
F
A
 
T
R
 
Q
L
 
I
E
 
E
D
 
N
G
 
H
D
 
P
Y
 
F
P
 
I
D
 
R
V
 
S
T
 
H
R
 
V
G
 
R
V
 
A
L
 
L
P
 
Y
S
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
S
V
 
Q
I
x
V
A
x
G
Y
 
S
R
 
P
A
 
Q
V
x
I
R
 
R
N
 
N
R
 
L
G
 
G
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
L
A
x
S
H
x
T
A
 
S
D
 
S
P
 
V
A
 
A
A
x
G
D
|
D
W
 
G
V
 
V
N
 
S
V
 
A
L
 
M
T
 
T
A
 
T
L
 
L
G
 
D
A
 
A
D
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
L
V
 
E
G
 
S
Q
 
V
G
 
R
G
 
G
R
 
T
R
 
R
S
 
Q
V
 
M
P
 
K
M
 
L
T
 
T
D
 
D
F
 
F
I
 
F
L
 
D
G
 
G
V
 
E
-
 
G
F
 
F
E
 
K
-
 
R
-
 
R
T
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
P
 
A
G
 
D
E
 
E
I
|
I
V
x
M
A
 
T
E
 
E
I
 
V
H
 
I
V
 
I
P
 
D
A
 
R
L
 
P
S
 
D
E
 
A
R
 
H
A
 
S
R
 
A
W
 
S
G
 
A
Y
 
F
Y
 
Y
K
 
K
V
 
L
C
 
A
R
 
K
K
 
R

2e3tA Crystal structure of rat xanthine oxidoreductase mutant (w335a and f336l) (see paper)
26% identity, 73% coverage: 8:205/270 of query aligns to 208:417/1291 of 2e3tA

query
sites
2e3tA
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
M
D
 
E
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
D
V
 
A
R
x
K
P
x
L
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
M
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
V
R
 
V
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
E
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
S
V
 
C
T
 
P
H
 
L
A
 
S
R
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
G
 
A
D
 
K
Y
 
L
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
M
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
 
A
V
 
-
I
x
L
A
 
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
x
A
T
x
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
x
I
H
x
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
x
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
R
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
G
V
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
|
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
K
E
 
E
R
 
G
A
 
E
R
 
F
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
 
K
-
 
Q
V
 
A
C
 
S
R
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
D
E
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
K
A
 
V
T
 
T
G
 
S
A
 
G
-
 
M
-
 
R
V
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
K
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

1jroA Crystal structure of xanthine dehydrogenase from rhodobacter capsulatus (see paper)
30% identity, 50% coverage: 54:189/270 of query aligns to 213:344/450 of 1jroA

query
sites
1jroA
I
 
L
T
 
S
R
 
H
I
 
C
A
 
K
E
 
D
L
 
L
R
 
A
T
 
Q
I
 
I
R
 
R
R
 
E
E
 
T
G
 
P
D
 
D
R
 
G
L
 
Y
V
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
L
E
 
R
D
 
A
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
F
T
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
P
L
 
H
P
 
P
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
-
 
R
-
 
R
-
x
F
A
|
A
Y
 
S
R
 
E
A
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
Q
R
 
V
G
 
A
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
|
A
H
 
N
A
 
G
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
x
G
D
|
D
W
 
G
V
 
P
N
 
P
V
 
A
L
 
L
T
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
S
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
R
G
 
R
Q
 
G
G
 
Q
G
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
R
V
 
M
P
 
P
M
 
L
T
 
E
D
 
D
F
 
F
I
 
F
L
 
L
G
 
E
V
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
Q
A
 
D
L
x
R
Q
 
R
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
V
|
V
A
 
E
E
 
S
I
 
V
H
 
T
V
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
S
S
 
A
E
 
P
R
 
G
A
 
L
R
 
R
W
 
C
G
 
-
Y
 
-
Y
 
Y
K
 
K
V
 
L
C
 
S
R
 
K
K
 
R

Sites not aligning to the query:

2w54A Crystal structure of xanthine dehydrogenase from rhodobacter capsulatus in complex with bound inhibitor pterin-6-aldehyde (see paper)
30% identity, 50% coverage: 54:189/270 of query aligns to 213:344/450 of 2w54A

query
sites
2w54A
I
x
L
T
 
S
R
 
H
I
 
C
A
 
K
E
 
D
L
 
L
R
 
A
T
 
Q
I
 
I
R
 
R
R
 
E
E
 
T
G
 
P
D
 
D
R
 
G
L
 
Y
V
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
C
 
G
V
 
V
T
 
T
H
 
I
A
 
A
R
 
A
L
 
L
E
 
R
D
 
A
G
 
-
D
 
-
Y
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
F
T
 
A
R
 
E
G
 
G
V
 
P
L
 
H
P
 
P
S
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
L
I
 
L
-
 
R
-
 
R
-
x
F
A
|
A
Y
 
S
R
 
E
A
 
Q
V
 
V
R
 
R
N
 
Q
R
 
V
G
x
A
T
|
T
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
|
A
H
x
N
A
 
G
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
x
G
D
|
D
W
 
G
V
 
P
N
 
P
V
 
A
L
 
L
T
 
I
A
 
A
L
 
M
G
 
G
A
 
A
D
 
S
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
R
G
 
R
Q
 
G
G
 
Q
G
 
E
R
 
R
R
 
R
S
 
R
V
 
M
P
 
P
M
 
L
T
 
E
D
 
D
F
 
F
I
 
F
L
 
L
G
 
E
V
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
Q
A
 
D
L
x
R
Q
 
R
P
 
P
G
 
G
E
 
E
I
 
F
V
|
V
A
 
E
E
 
S
I
 
V
H
 
T
V
 
L
P
 
P
A
 
K
L
 
S
S
 
A
E
 
P
R
 
G
A
 
L
R
 
R
W
 
-
G
 
-
Y
 
C
Y
 
Y
K
 
K
V
 
L
C
 
S
R
 
K
K
 
R

Sites not aligning to the query:

P47989 Xanthine dehydrogenase/oxidase; EC 1.17.1.4; EC 1.17.3.2 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
25% identity, 73% coverage: 8:205/270 of query aligns to 236:445/1333 of P47989

query
sites
P47989
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
K
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
D
V
 
A
R
 
K
P
x
L
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
M
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
M
L
 
I
V
 
V
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
V
R
 
E
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
D
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
C
T
 
P
H
 
L
A
 
S
R
 
I
L
 
V
E
 
E
D
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
P
G
 
A
D
 
Q
Y
 
K
P
 
T
D
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
 
W
V
 
-
I
x
F
A
 
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
 
A
T
x
S
I
x
V
G
|
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
 
I
H
 
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
 
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
Q
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
G
V
 
Y
F
 
R
E
x
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
R
E
 
E
R
 
G
A
 
E
R
 
Y
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
|
K
-
 
Q
V
 
A
C
 
S
R
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
D
E
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
K
A
 
V
T
 
T
G
 
S
A
 
G
-
 
M
-
 
R
V
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
K
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

2e1qA Crystal structure of human xanthine oxidoreductase mutant, glu803val (see paper)
25% identity, 73% coverage: 8:205/270 of query aligns to 210:419/1307 of 2e1qA

query
sites
2e1qA
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
K
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
D
V
 
A
R
x
K
P
x
L
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
M
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
M
L
 
I
V
 
V
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
V
R
 
E
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
D
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
C
T
 
P
H
 
L
A
 
S
R
 
I
L
 
V
E
 
E
D
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
P
G
 
A
D
 
Q
Y
 
K
P
 
T
D
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
 
W
V
 
-
I
x
F
A
|
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
|
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
x
A
T
x
S
I
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
x
I
H
x
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
x
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
Q
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
G
V
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
|
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
R
E
 
E
R
 
G
A
 
E
R
 
Y
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
 
K
-
 
Q
V
 
A
C
 
S
R
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
D
E
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
K
A
 
V
T
 
T
G
 
S
A
 
G
-
 
M
-
 
R
V
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
K
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

2ckjA Human milk xanthine oxidoreductase
25% identity, 73% coverage: 8:205/270 of query aligns to 207:412/1264 of 2ckjA

query
sites
2ckjA
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
K
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
D
V
 
A
R
 
K
P
x
L
V
 
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
 
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
M
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
M
L
 
I
V
 
V
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
V
R
 
E
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
D
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
C
T
 
P
H
 
L
A
 
S
R
 
I
L
 
V
E
 
E
D
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
P
G
 
A
D
 
Q
Y
 
K
P
 
T
D
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
 
W
V
 
-
I
x
F
A
|
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
x
A
T
x
S
I
 
V
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
x
I
H
x
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
 
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
Q
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
G
V
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
S
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
 
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
R
E
 
E
R
 
G
A
 
E
R
 
-
W
 
-
G
 
-
Y
 
Y
Y
 
F
K
 
S
V
 
A
C
 
F
R
 
K
K
 
Q
T
 
A
G
 
S
E
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
K
A
 
V
T
 
T
G
 
S
A
 
G
-
 
M
-
 
R
V
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
K
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

6a7xA Rat xanthine oxidoreductase, d428a variant, NAD bound form
25% identity, 73% coverage: 8:205/270 of query aligns to 208:417/1295 of 6a7xA

query
sites
6a7xA
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
M
D
 
E
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
D
V
 
A
R
x
K
P
x
L
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
M
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
V
R
 
V
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
E
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
S
V
 
C
T
 
P
H
 
L
A
 
S
R
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
G
 
A
D
 
K
Y
 
L
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
M
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
 
W
V
 
-
I
x
F
A
 
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
|
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
 
A
T
x
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
x
I
H
x
T
A
 
A
D
 
S
P
|
P
A
 
I
A
 
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
R
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
G
V
x
Y
F
x
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
 
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
K
E
 
E
R
 
G
A
 
E
R
 
F
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
 
K
-
 
Q
V
 
A
C
 
S
R
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
A
E
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
K
A
 
V
T
 
T
G
 
S
A
 
G
-
 
M
-
 
R
V
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
K
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

6a7xB Rat xanthine oxidoreductase, d428a variant, NAD bound form
25% identity, 73% coverage: 8:205/270 of query aligns to 206:415/1291 of 6a7xB

query
sites
6a7xB
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
M
D
 
E
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
D
V
 
A
R
 
K
P
x
L
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
M
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
V
R
 
V
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
E
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
S
V
 
C
T
 
P
H
 
L
A
 
S
R
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
G
 
A
D
 
K
Y
 
L
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
M
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
 
W
V
 
-
I
x
F
A
 
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
|
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
 
A
T
x
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
x
I
H
x
T
A
 
A
D
 
S
P
|
P
A
 
I
A
 
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
R
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
G
V
x
Y
F
x
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
|
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
K
E
 
E
R
 
G
A
 
E
R
 
F
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
 
K
-
 
Q
V
 
A
C
 
S
R
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
A
E
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
K
A
 
V
T
 
T
G
 
S
A
 
G
-
 
M
-
 
R
V
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
K
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

P22985 Xanthine dehydrogenase/oxidase; EC 1.17.1.4; EC 1.17.3.2 from Rattus norvegicus (Rat) (see 2 papers)
25% identity, 73% coverage: 8:205/270 of query aligns to 235:444/1331 of P22985

query
sites
P22985
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
M
D
 
E
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
D
V
 
A
R
 
K
P
x
L
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
M
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
V
R
 
V
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
E
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
S
V
 
C
T
 
P
H
 
L
A
 
S
R
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
G
 
A
D
 
K
Y
 
L
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
M
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
x
W
V
 
-
I
x
F
A
 
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
 
A
T
x
S
I
|
I
G
|
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
 
I
H
 
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
 
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
R
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
G
V
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
 
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
K
E
 
E
R
 
G
A
 
E
R
 
F
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
 
K
-
 
Q
V
 
A
C
 
S
R
 
R
K
 
R
T
 
E
G
 
D
E
 
D
F
 
I
S
 
A
H
 
K
A
 
V
T
 
T
G
 
S
A
 
G
-
 
M
-
 
R
V
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
K
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

P80457 Xanthine dehydrogenase/oxidase; EC 1.17.1.4; EC 1.17.3.2 from Bos taurus (Bovine) (see 5 papers)
25% identity, 66% coverage: 8:185/270 of query aligns to 236:422/1332 of P80457

query
sites
P80457
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
K
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
E
V
 
A
R
 
K
P
x
L
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
Q
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
M
L
 
I
V
 
I
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
A
I
 
V
R
 
E
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
E
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
C
T
 
A
H
 
L
A
 
S
R
 
S
L
 
V
E
 
E
D
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
V
G
 
A
D
 
K
Y
 
L
P
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
D
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
x
R
A
x
W
V
 
-
I
x
F
A
 
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
 
A
T
x
S
I
x
L
G
|
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
 
I
H
 
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
 
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
T
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
I
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
P
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
S
V
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
G
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
 
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
R
E
 
E
R
 
D
A
 
E
R
 
F
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
|
K

Sites not aligning to the query:

1n5xA Xanthine dehydrogenase from bovine milk with inhibitor tei-6720 bound (see paper)
25% identity, 66% coverage: 8:185/270 of query aligns to 208:394/1290 of 1n5xA

query
sites
1n5xA
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
D
 
K
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
E
V
 
A
R
 
K
P
x
L
V
 
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
Q
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
M
L
 
I
V
 
I
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
A
I
 
V
R
 
E
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
E
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
A
V
 
C
T
 
A
H
 
L
A
 
S
R
 
S
L
 
V
E
 
E
D
 
K
-
 
T
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
V
G
 
A
D
 
K
Y
 
L
P
 
P
-
 
T
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
D
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
 
W
V
 
-
I
x
F
A
|
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
 
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
x
A
T
x
S
I
 
L
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
x
I
H
x
T
A
 
A
D
 
S
P
 
P
A
 
I
A
 
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
T
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
I
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
P
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
S
V
 
Y
F
 
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
G
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
 
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
R
E
 
E
R
 
D
A
 
E
R
 
F
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4yswA Structure of rat xanthine oxidoreductase, c-terminal deletion protein variant, nadh bound form (see paper)
25% identity, 73% coverage: 8:205/270 of query aligns to 206:415/1286 of 4yswA

query
sites
4yswA
Y
 
W
A
 
I
Q
 
Q
P
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
M
D
 
E
A
 
E
A
 
L
L
 
L
E
 
D
L
 
L
L
 
K
S
 
A
R
 
Q
E
 
H
D
 
P
V
 
-
M
 
D
V
 
A
R
x
K
P
x
L
V
|
V
A
x
V
G
|
G
S
x
N
Q
x
T
S
x
E
L
x
I
G
 
G
P
 
I
M
 
E
L
 
M
N
 
K
L
 
F
R
 
K
L
 
N
A
 
M
Q
 
L
P
 
F
E
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
V
D
 
C
I
 
P
T
 
A
R
 
W
I
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
N
T
 
S
I
 
V
R
 
V
R
 
H
E
 
G
G
 
P
D
 
E
R
 
G
L
 
I
V
 
S
I
 
F
G
 
G
A
 
A
C
 
S
V
 
C
T
 
P
H
 
L
A
 
S
R
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
S
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
I
G
 
A
D
 
K
Y
 
L
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
T
-
 
E
V
 
V
T
 
F
R
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
M
P
 
E
S
 
Q
V
 
L
A
 
R
A
 
W
V
 
-
I
x
F
A
|
A
Y
 
G
R
 
K
A
 
Q
V
|
V
R
 
K
N
 
S
R
 
V
G
x
A
T
x
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
S
x
N
L
 
I
A
x
I
H
x
T
A
 
A
D
x
S
P
|
P
A
x
I
A
x
S
D
|
D
W
 
L
V
 
N
N
 
P
V
 
V
L
 
F
T
 
M
A
 
A
L
 
S
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
L
V
 
T
I
 
L
V
 
V
G
 
S
Q
 
R
G
 
G
G
 
T
R
 
R
R
 
R
S
 
T
V
 
V
P
 
R
M
 
M
T
 
D
-
 
H
D
 
T
F
 
F
I
 
F
L
 
P
G
 
G
V
x
Y
F
x
R
E
 
K
T
 
T
A
 
L
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
G
 
E
E
 
E
I
|
I
V
x
L
A
 
L
E
 
S
I
 
I
H
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
S
S
 
K
E
 
E
R
 
G
A
 
E
R
 
F
W
 
F
G
 
S
Y
 
A
Y
 
F
K
 
K
-
 
Q
V
 
A
C
 
S
R
 
R
K
 
R
T
 
E
G
x
D
E
x
D
F
x
I
S
 
A
H
 
K
A
 
V
T
 
T
G
 
S
A
 
G
-
 
M
-
 
R
V
 
V
L
 
L
I
 
F
D
 
K
P
 
P
A
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS29695 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS29695
MKAVDFDYAQPATLDAALELLSREDVMVRPVAGSQSLGPMLNLRLAQPELLVDITRIAEL
RTIRREGDRLVIGACVTHARLEDGDYPDVTRGVLPSVAAVIAYRAVRNRGTIGGSLAHAD
PAADWVNVLTALGADVVIVGQGGRRSVPMTDFILGVFETALQPGEIVAEIHVPALSERAR
WGYYKVCRKTGEFSHATGAVLIDPARGVQRCVAGATSGKPVVIDGPALFTDGCTEAALAA
HLAGSPAADDPIALRTHTVALKRAIAQVMS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory