SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS29790 AZOBR_RS29790 3-ketoacyl-ACP reductase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6b9uA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from brucella melitensis complexed with nadh
47% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 2:244/244 of 6b9uA

query
sites
6b9uA
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
L
x
F
G
 
G
L
 
E
A
 
G
M
 
M
A
 
A
E
 
K
T
 
R
F
 
F
V
 
A
R
 
K
E
 
G
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
V
D
|
D
I
x
R
N
 
D
G
 
K
D
 
A
A
 
G
A
 
A
K
 
E
A
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
G
R
 
E
L
 
I
G
 
G
E
 
D
S
 
A
A
 
A
I
 
L
G
 
A
I
 
V
A
 
A
A
|
A
N
x
D
V
x
I
T
 
S
R
 
K
M
 
E
A
 
A
D
 
D
V
 
V
E
 
D
M
 
A
T
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
T
 
A
V
 
L
E
 
S
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
S
 
I
T
 
G
H
 
H
A
 
K
N
 
P
G
 
Q
P
 
N
F
 
A
E
 
E
N
 
L
V
 
V
T
 
E
E
 
P
E
 
E
E
 
E
F
 
F
D
 
D
R
 
R
V
 
I
F
 
V
A
 
G
L
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
R
S
 
G
I
 
V
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
M
S
 
T
K
 
R
A
 
K
V
 
L
V
 
I
A
 
P
T
 
H
M
 
F
R
 
K
A
 
E
Q
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
K
-
 
G
K
 
Q
S
 
E
G
 
C
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
N
L
x
V
G
 
A
S
|
S
T
 
T
A
 
G
G
 
A
L
 
G
R
 
R
P
 
P
R
 
R
P
 
P
G
 
N
L
|
L
V
 
A
W
 
W
Y
|
Y
N
 
N
A
 
A
T
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
W
V
 
V
H
 
V
N
 
S
I
 
V
T
 
T
K
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
A
N
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
N
P
 
P
V
 
V
A
|
A
T
x
G
E
 
E
T
|
T
P
|
P
L
|
L
L
 
L
A
 
T
T
 
T
F
|
F
M
 
M
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
-
R
 
R
A
 
K
R
 
K
M
 
F
M
 
R
G
 
D
I
 
S
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
L
Q
 
K
P
 
P
T
 
D
D
 
D
V
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
F
 
M
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
A
L
 
L
E
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
R
C
 
S
V
 
I

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
37% identity, 98% coverage: 5:250/250 of query aligns to 3:243/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
-
x
S
-
 
E
Q
 
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
E
 
E
T
 
I
F
 
F
V
 
A
R
 
Q
E
 
Q
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
I
V
 
V
D
|
D
I
x
L
N
 
D
G
 
L
D
 
A
A
 
Q
A
 
S
K
 
Q
A
 
N
V
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
S
 
G
A
 
H
I
 
M
G
 
G
I
 
L
A
 
A
A
|
A
N
|
N
V
|
V
T
 
A
R
 
N
M
 
E
A
 
E
D
 
Q
V
 
V
E
 
K
M
 
A
T
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
Q
T
 
A
V
 
L
E
 
Q
K
 
H
F
 
Y
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
 
I
T
 
T
H
 
Q
A
 
-
N
 
-
G
 
-
P
 
P
F
 
I
E
 
K
-
 
T
-
 
L
N
 
D
V
 
I
T
 
Q
E
 
R
E
 
S
E
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
R
V
 
V
F
 
L
A
 
D
L
x
V
N
 
S
V
 
L
K
 
R
S
 
G
I
 
T
Y
 
L
L
 
I
Y
 
M
S
 
S
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
P
T
 
S
M
 
M
R
 
K
A
 
A
Q
 
N
K
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
C
L
 
L
G
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
S
G
 
A
L
 
-
R
 
-
P
 
Q
R
 
R
P
 
G
G
 
G
L
 
G
V
 
I
W
 
F
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
H
Y
|
Y
N
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
H
 
L
N
 
G
I
 
L
T
 
A
K
 
K
S
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
F
A
 
G
P
 
G
D
 
D
N
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
S
L
 
L
A
 
T
P
 
P
V
 
G
A
 
L
T
x
I
E
 
Q
T
|
T
P
 
D
L
 
M
L
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
N
P
 
D
E
 
D
K
 
R
R
 
R
A
 
H
R
 
D
M
 
I
M
 
L
G
 
A
I
 
G
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
A
T
 
Q
D
 
D
V
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
S
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
L
E
 
D
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
M
C
 
L
V
 
I

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 98% coverage: 4:247/250 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
D
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
M
 
A
A
 
A
E
 
R
T
 
V
F
 
F
V
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
V
 
I
V
 
A
D
|
D
I
x
F
N
 
N
G
 
E
D
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
K
A
 
E
V
 
A
A
 
V
E
 
E
R
 
-
L
 
A
G
 
N
E
 
P
S
 
G
A
 
V
I
 
V
G
 
F
I
 
I
A
 
R
A
x
V
N
x
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
M
 
R
A
 
E
D
 
S
V
 
V
E
 
H
M
 
R
T
 
L
I
 
V
A
 
E
A
 
N
T
 
V
V
 
A
E
 
E
K
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
S
x
I
T
 
T
H
 
R
A
 
-
N
x
D
G
 
S
P
 
M
F
 
L
E
 
S
N
x
K
V
 
M
T
 
T
E
 
V
E
 
D
E
 
Q
F
 
F
D
 
Q
R
 
Q
V
 
V
F
 
I
A
 
N
L
 
V
N
|
N
V
 
L
K
 
T
S
 
G
I
 
V
Y
 
F
L
 
H
Y
 
C
S
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
P
T
 
Y
M
 
M
R
 
A
A
 
E
Q
 
Q
K
 
G
S
 
K
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
L
x
T
G
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
T
R
 
Y
P
 
G
R
x
N
P
x
V
G
 
G
L
x
Q
V
 
T
W
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
H
 
I
N
 
G
I
 
M
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
D
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
C
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
V
 
G
A
x
F
T
|
T
E
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
L
 
V
A
 
A
T
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
E
T
 
V
P
 
P
E
 
E
K
 
K
R
 
V
-
 
I
A
 
E
R
x
K
M
 
M
M
 
K
G
 
A
I
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
T
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
L
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
H
V
 
V
L
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 6:243/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
L
F
 
L
V
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
V
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
G
 
E
D
 
S
A
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
D
S
 
N
A
 
G
I
 
K
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
R
 
N
M
 
P
A
 
E
D
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
A
T
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
V
 
T
E
 
D
K
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
S
x
I
T
 
T
H
 
R
A
 
D
N
 
N
G
 
-
P
 
L
F
 
L
E
 
M
N
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
E
E
 
E
F
 
W
D
 
S
R
 
D
V
 
I
F
 
M
A
 
E
L
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
T
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
L
 
R
Y
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
R
T
 
G
M
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
K
 
R
S
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
L
x
V
G
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
P
 
G
R
 
N
P
 
A
G
 
G
L
 
Q
V
 
A
W
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
H
 
I
N
 
G
I
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
T
L
 
V
A
 
A
P
|
P
V
x
G
A
 
F
T
x
I
E
 
E
T
|
T
P
 
D
L
x
M
L
 
T
A
 
K
T
 
A
F
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
N
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
R
 
R
A
 
T
R
 
A
M
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
T
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
T
L
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 6:239/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
L
F
 
L
V
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
V
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
G
 
E
D
 
S
A
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
D
S
 
N
A
 
G
I
 
K
G
 
G
I
 
M
A
 
A
A
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
R
 
N
M
 
P
A
 
E
D
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
A
T
 
V
I
 
L
A
 
K
A
 
A
T
 
I
V
 
T
E
 
D
K
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
S
 
I
T
 
T
H
 
R
A
 
D
N
 
N
G
 
-
P
 
L
F
 
L
E
 
M
N
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
E
E
 
E
F
 
W
D
 
S
R
 
D
V
 
I
F
 
M
A
 
E
L
 
T
N
|
N
V
 
L
K
 
T
S
 
S
I
 
I
Y
 
F
L
 
R
Y
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
R
T
 
G
M
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
K
 
R
S
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
L
 
V
G
|
G
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
P
 
G
R
 
N
P
 
A
G
 
G
L
x
Q
V
 
A
W
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
H
 
I
N
 
G
I
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
M
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
T
L
 
V
A
 
A
P
|
P
V
x
G
A
 
F
T
 
I
E
 
E
T
|
T
P
 
D
L
 
M
L
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
N
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
R
 
R
A
 
T
R
 
A
M
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
P
T
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
T
L
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
40% identity, 98% coverage: 4:247/250 of query aligns to 2:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
L
 
L
D
 
A
G
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
|
Q
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
I
M
 
Y
A
 
A
E
 
E
T
 
R
F
 
F
V
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
A
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
A
D
|
D
I
 
I
N
 
N
G
 
E
D
 
P
A
 
K
A
 
A
K
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
S
R
 
S
-
 
I
-
 
T
-
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
G
S
 
R
A
 
A
I
 
I
G
 
A
I
 
A
A
 
A
A
 
V
N
 
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
M
 
V
A
 
E
D
 
S
V
 
V
E
 
N
M
 
R
T
 
M
I
 
V
A
 
D
A
 
S
T
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
-
 
I
-
 
F
S
|
S
T
 
T
H
 
L
A
 
K
N
 
M
G
 
K
P
 
P
F
 
F
E
 
E
N
 
E
V
 
I
T
 
S
E
 
G
E
 
D
E
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
K
V
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
A
K
 
K
S
 
G
I
 
T
Y
 
F
L
 
L
Y
 
C
S
 
C
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
V
 
S
A
 
P
T
 
V
M
 
M
R
 
R
A
 
K
Q
 
N
K
 
Q
S
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
L
x
I
G
x
S
S
|
S
T
 
S
A
 
V
G
 
V
L
 
V
R
 
T
P
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
N
L
 
Y
V
 
A
W
 
H
Y
|
Y
N
 
I
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
H
 
W
N
 
A
I
 
L
T
 
T
K
 
H
S
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
T
E
 
E
L
 
M
A
 
G
P
 
T
D
 
D
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
T
L
 
V
A
 
S
P
|
P
-
x
H
-
 
G
V
x
I
A
 
I
T
 
T
E
 
E
T
x
I
P
 
P
L
 
R
L
 
E
A
 
T
T
 
I
F
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
S
P
 
E
E
 
E
K
 
G
R
 
W
A
 
R
R
 
R
M
 
N
M
 
L
G
 
E
I
 
E
V
 
Q
P
 
A
L
 
L
G
 
K
R
 
R
L
 
K
G
 
G
Q
 
D
P
 
A
T
 
S
D
 
D
V
 
L
A
 
V
N
 
G
A
 
I
A
 
L
L
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
A
 
K
F
 
F
L
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
V
 
T
L
 
V
E
 
A
I
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
38% identity, 96% coverage: 8:246/250 of query aligns to 3:245/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
Q
x
S
G
|
G
L
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
T
T
 
R
F
 
F
V
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
L
D
|
D
I
x
L
N
 
S
G
 
A
D
 
E
A
 
T
A
 
L
K
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
W
E
 
H
R
 
A
L
 
Y
G
 
A
E
 
D
S
 
K
A
 
V
I
 
L
G
 
R
I
 
V
A
 
R
A
|
A
N
x
D
V
|
V
T
 
A
R
 
D
M
 
E
A
 
G
D
 
D
V
 
V
E
 
N
M
 
A
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
M
E
 
E
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
S
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
N
N
 
S
-
 
E
-
 
A
G
 
G
P
 
V
F
 
L
E
 
H
N
 
T
V
 
T
T
 
P
E
 
V
E
 
E
E
 
Q
F
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
V
F
 
M
A
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
R
S
 
G
I
 
I
Y
 
F
L
 
L
Y
 
G
S
 
C
K
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
P
T
 
H
M
 
M
R
 
L
A
 
L
Q
 
Q
K
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
L
x
I
G
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
S
L
 
L
R
 
V
P
 
A
R
x
F
P
 
P
G
 
G
L
x
R
V
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
T
A
 
T
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
H
 
L
N
 
Q
I
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
G
D
 
S
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
C
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
|
P
V
x
G
A
x
M
T
x
I
E
 
E
T
|
T
P
|
P
L
x
M
L
x
T
A
 
Q
T
x
W
F
x
R
M
 
L
G
 
-
G
 
-
D
 
D
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
K
 
L
R
 
R
A
 
D
R
 
Q
M
 
V
M
 
L
G
 
A
I
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
E
L
 
I
G
 
G
Q
 
T
P
 
A
T
 
A
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
T
F
 
Y
L
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
A
V
 
A
L
 
L
E
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
38% identity, 96% coverage: 8:246/250 of query aligns to 3:245/250 of Q56840

query
sites
Q56840
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
x
S
G
|
G
L
x
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
T
T
 
R
F
 
F
V
 
L
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
D
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
L
D
|
D
I
 
L
N
 
S
G
 
A
D
 
E
A
 
T
A
 
L
K
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
-
 
R
-
 
T
-
 
H
-
 
W
E
 
H
R
 
A
L
 
Y
G
 
A
E
 
D
S
 
K
A
 
V
I
 
L
G
 
R
I
 
V
A
 
R
A
 
A
N
x
D
V
|
V
T
 
A
R
 
D
M
 
E
A
 
G
D
 
D
V
 
V
E
 
N
M
 
A
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
M
E
 
E
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
 
I
T
 
T
H
 
G
A
 
N
N
 
S
-
 
E
-
 
A
G
 
G
P
 
V
F
 
L
E
 
H
N
 
T
V
 
T
T
 
P
E
 
V
E
 
E
E
 
Q
F
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
V
F
 
M
A
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
R
S
 
G
I
 
I
Y
 
F
L
 
L
Y
 
G
S
 
C
K
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
A
 
P
T
 
H
M
 
M
R
 
L
A
 
L
Q
 
Q
K
 
G
S
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
S
L
 
L
R
 
V
P
 
A
R
 
F
P
 
P
G
 
G
L
x
R
V
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
T
A
 
T
T
 
S
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
H
 
L
N
 
Q
I
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
S
L
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
G
D
 
S
N
 
G
I
 
I
R
|
R
V
 
C
C
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
V
 
G
A
 
M
T
x
I
E
|
E
T
|
T
P
|
P
L
x
M
L
 
T
A
 
Q
T
x
W
F
x
R
M
 
L
G
 
-
G
 
-
D
 
D
T
 
Q
P
 
P
E
 
E
K
 
L
R
|
R
A
 
D
R
 
Q
M
 
V
M
 
L
G
 
A
I
x
R
V
 
I
P
 
P
L
 
Q
G
 
K
R
 
E
L
 
I
G
 
G
Q
 
T
P
 
A
T
 
A
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
M
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
A
 
T
F
 
Y
L
 
V
T
 
N
G
 
G
V
 
A
V
 
A
L
 
L
E
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
37% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 3:240/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
L
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
V
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
G
 
E
D
 
S
A
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
A
S
 
N
A
 
G
I
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
M
A
x
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
M
 
P
A
 
A
D
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
S
T
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
V
V
 
R
E
 
A
K
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
S
x
I
T
 
T
H
 
R
A
 
D
N
 
N
G
 
-
P
 
L
F
 
L
E
 
M
N
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
D
E
 
D
E
 
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
F
 
I
A
 
E
L
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
S
S
 
S
I
 
V
Y
 
F
L
 
R
Y
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
R
T
 
A
M
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
K
 
R
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
L
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
P
 
G
R
 
N
P
 
A
G
 
G
L
 
Q
V
 
A
W
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
G
 
A
A
 
G
V
 
L
H
 
I
N
 
G
I
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
V
L
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
G
A
 
F
T
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
T
 
A
F
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
D
E
 
E
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
R
 
G
M
 
T
M
 
L
G
 
A
I
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
T
 
N
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
T
L
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
39% identity, 98% coverage: 3:247/250 of query aligns to 2:253/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
K
 
K
R
 
R
L
 
L
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
Q
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
F
A
 
A
E
 
E
T
 
A
F
 
Y
V
 
V
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
A
D
 
D
I
 
I
N
 
D
G
 
I
D
 
E
A
 
R
A
 
A
K
 
R
A
 
Q
V
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
E
L
 
I
G
 
G
E
 
P
S
 
A
A
 
A
I
 
Y
G
 
A
I
 
V
A
 
Q
A
 
M
N
 
D
V
 
V
T
 
T
R
 
R
M
 
Q
A
 
D
D
 
S
V
 
I
E
 
D
M
 
A
T
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
E
K
 
H
F
 
A
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
-
S
 
A
T
 
L
H
 
F
A
 
D
N
 
L
G
 
A
P
 
P
F
 
I
E
 
V
N
 
E
V
 
I
T
 
T
E
 
R
E
 
E
E
 
S
F
 
Y
D
 
E
R
 
K
V
 
L
F
 
F
A
 
A
L
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
A
S
 
G
I
 
T
Y
 
L
L
 
F
Y
 
T
S
 
L
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
A
A
 
R
T
 
Q
M
 
M
R
 
I
A
 
A
Q
 
Q
-
 
G
K
 
R
S
 
G
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
L
 
M
G
 
A
S
|
S
T
x
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
R
R
 
R
P
 
G
R
x
E
P
 
A
G
 
L
L
 
V
V
 
A
W
 
I
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
T
 
T
K
 
K
G
 
A
A
 
A
V
 
V
H
 
I
N
 
S
I
 
L
T
 
T
K
 
Q
S
 
S
L
 
A
A
 
G
L
 
L
E
 
D
L
 
L
A
 
I
P
 
K
D
 
H
N
 
R
I
 
I
R
 
N
V
 
V
C
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
 
P
V
 
G
A
 
V
T
 
V
E
 
D
-
 
G
-
 
E
-
x
H
-
x
W
-
 
D
-
 
G
-
 
V
T
 
D
P
 
A
L
 
L
L
x
F
A
 
A
T
 
R
F
 
Y
M
 
E
G
 
N
G
 
R
D
 
P
T
 
R
P
 
G
E
 
E
K
 
K
R
 
K
A
 
-
R
 
R
M
 
L
M
 
V
G
 
G
-
 
E
I
 
A
V
 
V
P
 
P
L
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
M
G
 
G
Q
 
T
P
 
A
T
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
T
N
 
G
A
 
M
A
 
A
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
A
 
S
A
 
D
F
 
Y
L
 
I
T
 
V
G
 
S
V
 
Q
V
 
T
L
 
Y
E
 
N
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7v0hG Crystal structure of putative glucose 1-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia in complex with NADP and a potential reaction product
39% identity, 98% coverage: 3:247/250 of query aligns to 7:251/253 of 7v0hG

query
sites
7v0hG
K
 
S
R
 
K
L
 
L
D
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
K
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
K
T
 
A
F
 
L
V
 
A
R
 
D
E
 
E
G
 
G
G
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
A
V
 
A
V
 
V
D
 
V
I
 
V
N
 
N
G
 
Y
D
x
A
A
x
S
A
x
S
K
 
K
A
 
A
V
 
G
A
 
A
E
 
D
R
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
S
-
 
A
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
A
G
 
G
E
 
G
S
 
R
A
 
A
I
 
V
G
 
A
I
 
V
A
 
G
A
x
G
N
x
D
V
|
V
T
 
S
R
 
K
M
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
A
E
 
Q
M
 
R
T
 
I
I
 
V
A
 
D
A
 
T
T
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
T
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
x
S
G
|
G
S
 
-
T
 
V
H
x
Y
A
 
E
N
 
F
G
 
A
P
 
P
F
 
I
E
 
E
N
 
A
V
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
H
F
 
Y
D
 
R
R
 
R
V
 
Q
F
 
F
A
 
D
L
 
T
N
 
N
V
 
V
K
 
F
S
 
G
I
 
V
Y
 
L
L
 
L
Y
 
T
S
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
K
T
 
H
M
 
L
R
 
G
A
 
E
Q
 
G
K
 
A
S
 
S
G
 
-
V
 
-
I
 
I
L
 
I
N
 
N
L
x
I
G
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
T
L
 
S
R
 
I
P
 
T
R
 
P
P
 
P
G
 
A
L
 
S
V
 
A
W
 
V
Y
|
Y
N
 
S
A
 
G
T
 
T
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
V
H
 
D
N
 
A
I
 
I
T
 
T
K
 
G
S
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
D
 
R
N
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
N
P
|
P
-
x
G
-
x
M
V
x
I
A
 
V
T
|
T
E
 
E
T
x
G
P
x
T
L
 
H
L
 
S
A
 
A
T
 
G
F
x
I
M
 
I
G
 
G
G
 
S
D
 
D
T
 
L
P
 
-
E
 
-
K
 
-
R
 
E
A
 
A
R
 
Q
M
 
V
M
 
L
G
 
G
I
 
Q
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
T
 
N
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
A
 
R
F
 
W
L
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
H
L
 
L
E
 
V
I
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 3:240/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
L
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
|
A
A
x
S
Q
x
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
L
V
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
V
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
G
 
E
D
 
N
A
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
A
S
 
N
A
 
G
I
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
M
A
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
M
 
P
A
 
A
D
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
S
T
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
V
 
R
E
 
A
K
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
 
I
T
 
T
H
 
R
A
 
D
N
 
N
G
 
-
P
 
L
F
 
L
E
 
M
N
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
D
E
 
E
E
 
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
F
 
I
A
 
E
L
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
S
S
 
S
I
 
V
Y
 
F
L
 
R
Y
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
R
T
 
A
M
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
K
 
R
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
L
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
P
 
G
R
 
N
P
 
G
G
 
G
L
 
Q
V
 
A
W
 
N
Y
|
Y
N
x
A
A
|
A
T
x
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
L
H
 
I
N
 
G
I
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
V
L
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
G
A
 
F
T
x
I
E
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
T
 
A
F
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
R
 
G
M
 
I
M
 
L
G
 
A
I
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
T
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
x
E
V
 
T
L
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 2:239/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
L
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
L
V
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
V
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
G
 
E
D
 
N
A
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
A
S
 
N
A
 
G
I
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
M
A
 
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
M
 
P
A
 
A
D
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
S
T
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
V
 
R
E
 
A
K
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
S
x
I
T
 
T
H
 
R
A
 
D
N
 
N
G
 
-
P
 
L
F
 
L
E
 
M
N
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
D
E
 
E
E
|
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
F
 
I
A
 
E
L
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
S
S
 
S
I
 
V
Y
 
F
L
 
R
Y
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
R
T
 
A
M
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
K
 
R
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
L
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
P
 
G
R
 
N
P
 
G
G
 
G
L
x
Q
V
 
A
W
 
N
Y
|
Y
N
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
L
H
 
I
N
 
G
I
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
V
L
 
V
A
 
A
P
|
P
V
x
G
A
 
F
T
x
I
E
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
T
 
A
F
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
R
 
G
M
 
I
M
 
L
G
 
A
I
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
T
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
x
E
V
x
T
L
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 3:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
M
 
I
A
 
A
E
 
I
T
 
N
F
 
L
V
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
N
V
 
I
A
 
-
V
 
F
V
 
F
D
x
N
I
x
Y
N
|
N
G
|
G
-
x
S
-
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
K
R
 
L
L
 
V
G
 
A
E
 
E
S
 
H
A
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
V
-
 
E
G
 
A
I
 
M
A
 
K
A
 
A
N
|
N
V
|
V
T
 
A
R
 
I
M
 
A
A
 
E
D
 
D
V
 
V
E
 
D
M
 
A
T
 
F
I
 
F
A
 
K
A
 
Q
T
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
S
x
I
T
 
T
H
 
R
A
 
D
N
 
N
G
 
-
P
 
L
F
 
L
E
 
M
N
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
E
E
 
D
E
 
E
F
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
F
 
I
A
 
N
L
x
I
N
 
N
V
 
L
K
 
K
S
 
G
I
 
T
Y
 
F
L
 
L
Y
 
C
S
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
S
A
 
R
T
 
T
M
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
Q
K
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
L
 
M
G
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
I
P
 
G
R
 
N
P
 
A
G
 
G
L
x
Q
V
 
A
W
 
N
Y
|
Y
N
 
V
A
 
A
T
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
V
H
 
I
N
 
G
I
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
P
D
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
C
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
A
P
|
P
V
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
G
L
 
F
L
x
I
A
 
T
T
|
T
F
 
D
M
 
M
G
 
T
G
 
D
D
 
K
T
 
L
P
 
D
E
 
E
K
 
K
-
 
T
R
 
K
A
 
E
R
 
A
M
 
M
M
 
L
G
 
A
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
Q
 
T
P
 
T
T
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
S
A
 
K
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
Q
V
 
T
L
 
L
E
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
37% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 2:239/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
L
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
L
V
 
A
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
V
 
T
D
x
A
I
x
T
N
 
S
G
 
E
D
 
N
A
 
G
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
E
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
A
S
 
N
A
 
G
I
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
M
A
x
L
N
|
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
M
 
P
A
 
A
D
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
S
T
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
K
T
 
I
V
 
R
E
 
A
K
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
S
x
I
T
 
T
H
 
R
A
 
D
N
 
N
G
 
-
P
 
L
F
 
L
E
 
M
N
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
D
E
 
E
E
 
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
F
 
I
A
 
E
L
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
S
S
 
S
I
 
V
Y
 
F
L
 
R
Y
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
R
T
 
A
M
 
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
K
 
R
S
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
L
 
I
G
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
P
 
G
R
 
N
P
 
G
G
 
G
L
x
Q
V
 
A
W
 
N
Y
x
F
N
 
A
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
A
A
 
G
V
 
L
H
 
I
N
 
G
I
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
V
L
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
G
A
 
F
T
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
T
 
A
F
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
R
 
G
M
 
I
M
 
L
G
 
A
I
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
T
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
T
L
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 3:244/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
D
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
V
A
 
A
E
 
H
T
 
S
F
 
Y
V
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
V
V
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
G
 
E
D
 
D
A
 
H
A
 
G
K
 
N
A
 
K
V
 
A
A
 
V
E
 
E
R
 
D
L
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
G
 
G
E
 
G
S
 
E
A
 
A
I
 
S
G
 
F
I
 
V
A
 
K
A
|
A
N
x
D
V
x
T
T
 
S
R
 
N
M
 
P
A
 
E
D
 
E
V
 
V
E
 
E
M
 
A
T
 
L
I
 
V
A
 
K
A
 
R
T
 
T
V
 
V
E
 
E
K
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
S
 
I
T
 
G
H
 
G
A
 
E
N
 
Q
G
 
A
P
 
L
F
 
A
E
 
G
N
 
D
V
 
Y
T
 
G
E
 
L
E
 
D
E
 
S
F
 
W
D
 
R
R
 
K
V
 
V
F
 
L
A
 
S
L
 
I
N
 
N
V
 
L
K
 
D
S
 
G
I
 
V
Y
 
F
L
 
Y
Y
 
G
S
 
C
K
 
K
A
 
Y
V
 
E
V
 
L
A
 
E
T
 
Q
M
 
M
R
 
E
A
 
K
Q
 
N
K
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
L
x
M
G
 
A
S
|
S
T
 
I
A
 
H
G
 
G
L
 
I
R
 
V
P
 
A
R
 
A
P
 
P
G
 
L
L
 
S
V
 
S
W
 
A
Y
|
Y
N
 
T
A
 
S
T
 
A
K
|
K
G
 
H
A
 
A
V
 
V
H
 
V
N
 
G
I
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
N
L
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
D
 
K
N
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
C
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
G
P
|
P
V
x
A
A
x
Y
T
x
I
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
|
L
L
 
L
A
 
E
T
 
S
F
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
K
E
 
E
K
 
M
R
 
K
A
 
E
R
 
A
M
 
L
M
 
I
G
 
S
I
 
K
V
 
H
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
T
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
L
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
A
 
S
F
 
F
L
 
M
T
 
T
G
 
G
V
 
G
V
 
Y
L
 
Y
E
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
36% identity, 97% coverage: 5:247/250 of query aligns to 3:240/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
L
 
F
D
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
T
 
T
F
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
R
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
I
V
 
G
V
 
T
D
 
A
I
 
T
N
 
S
G
 
E
D
 
N
A
 
G
A
 
A
K
 
K
A
 
N
V
 
I
A
 
S
E
 
D
R
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
A
S
 
N
A
 
G
I
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
M
A
 
L
N
 
N
V
 
V
T
 
T
R
 
D
M
 
P
A
 
A
D
 
S
V
 
I
E
 
E
M
 
S
T
 
V
I
 
L
A
 
E
A
 
N
T
 
I
V
 
R
E
 
A
K
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
S
 
I
T
 
T
H
 
R
A
 
D
N
 
N
G
 
-
P
 
L
F
 
L
E
 
M
N
 
R
V
 
M
T
 
K
E
 
D
E
 
D
E
 
E
F
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
F
 
I
A
 
E
L
 
T
N
 
N
V
 
L
K
 
S
S
 
S
I
 
V
Y
 
F
L
 
R
Y
 
L
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
R
T
 
A
M
|
M
R
 
M
A
 
K
Q
 
K
K
 
R
S
 
C
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
T
L
 
I
G
 
G
S
 
S
T
 
V
A
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
M
P
 
G
R
 
N
P
 
A
G
 
G
L
 
Q
V
 
A
W
 
N
Y
 
Y
N
 
A
A
 
A
T
 
A
K
 
K
G
 
A
A
 
G
V
 
L
H
 
I
N
 
G
I
 
F
T
 
S
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
P
 
S
D
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
V
L
 
V
A
 
A
P
 
P
V
 
G
A
 
F
T
 
I
E
 
E
T
 
T
P
 
D
L
 
M
L
 
T
A
 
R
T
 
A
F
 
L
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
S
P
 
D
E
 
D
K
 
Q
R
 
R
A
 
A
R
 
G
M
 
I
M
 
L
G
 
A
I
 
Q
V
 
V
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
T
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
N
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
A
Y
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
I
T
 
T
G
 
G
V
 
E
V
 
T
L
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

8hsaA Brucella melitensis 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase mutant: 1-53 truncation/m196i/i258m/k262t-NAD+
40% identity, 98% coverage: 4:247/250 of query aligns to 4:245/248 of 8hsaA

query
sites
8hsaA
R
 
H
L
 
L
D
 
N
G
 
D
K
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
G
T
 
T
F
 
F
V
 
A
R
 
K
E
 
A
G
 
G
G
 
A
R
 
S
V
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
T
D
|
D
I
x
L
N
 
K
G
 
S
D
 
E
A
 
G
A
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
I
E
 
R
R
 
Q
L
 
A
G
 
G
E
 
G
S
 
K
A
 
A
I
 
I
G
 
G
I
 
L
A
 
E
A
x
C
N
|
N
V
|
V
T
 
T
R
 
D
M
 
E
A
 
Q
D
 
H
V
 
R
E
 
E
M
 
A
T
 
V
I
 
I
A
 
K
A
 
A
T
 
A
V
 
L
E
 
D
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
T
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
S
 
G
T
 
G
H
 
G
A
 
P
N
 
K
G
 
-
P
 
P
F
 
F
E
 
D
N
 
-
V
 
M
T
 
P
E
 
M
E
 
S
E
 
D
F
 
F
D
 
E
R
 
W
V
 
A
F
 
F
A
 
K
L
 
L
N
 
N
V
 
L
K
 
F
S
 
S
I
 
L
Y
 
F
L
 
R
Y
 
L
S
 
S
K
 
Q
A
 
L
V
 
A
V
 
A
A
 
P
T
 
H
M
 
M
R
 
Q
A
 
K
Q
 
A
K
 
G
S
 
G
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
L
N
 
N
L
x
I
G
x
S
S
 
S
T
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
E
R
 
N
P
 
T
R
 
N
P
 
V
G
 
R
L
 
M
V
 
A
W
 
S
Y
|
Y
N
 
G
A
 
S
T
 
S
K
|
K
G
 
A
A
 
A
V
 
V
H
 
N
N
 
H
I
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
N
L
 
I
A
 
A
L
 
F
E
 
D
L
 
V
A
 
G
P
 
P
D
 
M
N
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
P
|
P
V
x
G
A
 
A
T
 
M
E
 
K
T
 
T
P
 
D
L
 
A
L
 
L
A
 
A
T
 
T
F
 
V
M
 
L
G
 
-
G
 
-
D
 
-
T
 
T
P
 
P
E
 
E
K
 
I
R
 
E
A
 
R
R
 
A
M
 
M
M
 
L
G
 
K
I
 
H
V
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
P
 
A
T
 
Q
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
D
 
P
E
 
A
A
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
I
T
 
S
G
 
G
V
 
Q
V
 
V
L
 
L
E
 
T
I
 
V
D
 
S
G
 
G
G
 
G

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
39% identity, 99% coverage: 1:247/250 of query aligns to 1:251/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
M
 
M
T
 
S
K
 
N
R
 
R
L
 
L
D
 
K
G
 
N
K
 
E
V
 
V
A
 
I
L
 
A
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
G
Q
 
A
G
 
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
S
T
 
A
F
 
A
V
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
I
D
|
D
I
 
L
N
 
D
G
 
Q
D
 
G
A
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
R
V
 
S
A
 
A
E
 
A
R
 
M
L
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
G
G
 
G
E
 
A
S
 
V
A
 
A
I
 
K
G
 
G
I
 
F
A
 
G
A
 
A
N
x
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
M
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
I
E
 
T
M
 
A
T
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
S
T
 
A
V
 
E
E
 
Q
K
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
S
L
 
L
D
 
T
I
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
 
-
T
 
I
H
 
A
A
 
G
N
 
F
G
 
G
P
 
S
F
 
V
E
 
H
N
 
D
V
 
A
T
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
A
F
 
W
D
 
D
R
 
R
V
 
I
F
 
M
A
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
T
S
 
G
I
 
T
Y
 
F
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
G
M
 
M
R
 
L
A
 
E
Q
 
R
K
 
H
S
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
L
 
F
G
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
V
P
 
G
R
 
I
P
 
P
G
 
T
L
 
M
V
 
A
W
 
A
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
H
 
V
N
 
N
I
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
D
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
 
P
-
 
G
V
x
T
A
x
V
T
|
T
E
x
S
T
|
T
P
x
G
L
 
M
L
 
G
A
 
Q
T
 
Q
F
 
L
M
 
L
G
 
G
G
 
S
D
 
D
T
 
T
-
 
S
P
 
P
E
 
E
K
 
V
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
x
R
M
 
L
G
 
A
I
x
K
V
x
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
T
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
V
 
A
L
 
F
E
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
39% identity, 88% coverage: 28:247/250 of query aligns to 26:249/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
V
 
L
R
 
R
E
 
E
G
 
G
G
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
I
D
|
D
I
x
L
N
 
D
G
 
Q
D
 
G
A
 
L
A
 
A
K
 
E
A
 
R
V
 
S
A
 
A
E
 
A
R
 
M
L
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
G
G
 
G
E
 
A
S
 
V
A
 
A
I
 
K
G
 
G
I
 
F
A
 
G
A
 
A
N
x
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
M
 
A
A
 
A
D
 
D
V
 
I
E
 
T
M
 
A
T
 
A
I
 
I
A
 
T
A
 
S
T
 
A
V
 
E
E
 
Q
K
 
T
F
 
I
G
 
G
R
 
S
L
 
L
D
 
T
I
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
S
 
-
T
 
I
H
 
A
A
 
G
N
 
F
G
 
G
P
 
S
F
 
V
E
 
H
N
 
D
V
 
A
T
 
D
E
 
A
E
 
A
E
 
A
F
 
W
D
 
D
R
 
R
V
 
I
F
 
M
A
 
A
L
x
V
N
|
N
V
 
V
K
 
T
S
 
G
I
 
T
Y
 
F
L
 
L
Y
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
A
V
 
L
A
 
A
T
 
G
M
 
M
R
 
L
A
 
E
Q
 
R
K
 
H
S
 
K
G
 
G
V
 
T
I
 
I
L
 
V
N
 
N
L
x
F
G
 
G
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
R
 
V
P
 
G
R
 
I
P
 
P
G
 
T
L
 
M
V
 
A
W
 
A
Y
|
Y
N
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
G
 
G
A
 
A
V
 
I
H
 
V
N
 
N
I
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
A
E
 
D
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
D
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
A
L
 
V
A
 
C
P
|
P
-
 
G
V
x
T
A
x
V
T
 
T
E
 
S
T
|
T
P
 
G
L
x
M
L
 
G
A
 
Q
T
 
Q
F
 
L
M
 
L
G
 
G
G
 
S
D
 
D
T
 
T
-
 
S
P
 
P
E
 
E
K
 
V
R
 
Q
A
 
A
R
 
R
M
x
R
M
 
L
G
 
A
I
 
K
V
x
Y
P
 
P
L
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
T
P
 
P
T
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
N
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
I
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
V
T
 
T
G
 
G
V
 
A
V
 
A
L
 
F
E
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS29790 AZOBR_RS29790 3-ketoacyl-ACP reductase
MTKRLDGKVALITGAAQGLGLAMAETFVREGGRVAVVDINGDAAKAVAERLGESAIGIAA
NVTRMADVEMTIAATVEKFGRLDILVNNAGSTHANGPFENVTEEEFDRVFALNVKSIYLY
SKAVVATMRAQKSGVILNLGSTAGLRPRPGLVWYNATKGAVHNITKSLALELAPDNIRVC
ALAPVATETPLLATFMGGDTPEKRARMMGIVPLGRLGQPTDVANAALYLASDEAAFLTGV
VLEIDGGRCV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory