SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS29850 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS29850 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

1euaA Schiff base intermediate in kdpg aldolase from escherichia coli (see paper)
48% identity, 86% coverage: 25:205/211 of query aligns to 27:207/213 of 1euaA

query
sites
1euaA
D
 
E
T
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
P
L
 
M
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
R
T
 
V
L
 
L
E
|
E
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
P
 
E
A
 
C
A
 
A
L
 
V
A
 
D
C
 
A
A
 
I
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
A
G
|
G
T
|
T
L
 
V
I
 
L
R
 
N
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
V
 
A
V
x
I
S
|
S
P
|
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
E
R
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
E
A
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
P
Y
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
M
I
 
L
A
 
G
M
 
M
E
 
D
H
 
Y
G
 
G
F
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
F
K
|
K
F
 
F
F
|
F
P
 
P
A
 
A
M
 
E
L
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
V
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
A
M
 
I
A
 
A
P
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
S
E
 
Q
I
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
K
 
S
A
 
P
E
 
A
H
 
N
V
 
Y
K
 
R
E
 
D
I
 
Y
L
 
L
S
 
A
L
 
L
P
 
K
N
 
S
V
 
V
F
 
L
A
 
C
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
S
W
 
W
L
 
L
T
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
E
E
 
A
R
 
G
R
 
D
W
 
Y
S
 
D
E
 
R
I
 
I
E
 
T
R
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P0A955 KHG/KDPG aldolase; EC 4.1.3.16; EC 4.1.2.14 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
48% identity, 86% coverage: 25:205/211 of query aligns to 27:207/213 of P0A955

query
sites
P0A955
D
 
E
T
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
P
L
 
M
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
R
T
 
V
L
 
L
E
|
E
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
P
 
E
A
 
C
A
 
A
L
 
V
A
 
D
C
 
A
A
 
I
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
I
 
L
R
 
N
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
V
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
E
R
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
E
A
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
P
Y
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
M
I
 
L
A
 
G
M
 
M
E
 
D
H
 
Y
G
 
G
F
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
F
K
|
K
F
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
M
 
E
L
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
V
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
A
M
 
I
A
 
A
P
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
S
E
 
Q
I
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
|
T
G
 
G
G
|
G
L
 
I
K
 
S
A
 
P
E
 
A
H
x
N
V
 
Y
K
 
R
E
 
D
I
 
Y
L
 
L
S
 
A
L
 
L
P
 
K
N
 
S
V
 
V
F
 
L
A
 
C
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
x
S
W
 
W
L
 
L
T
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
E
E
 
A
R
 
G
R
 
D
W
 
Y
S
 
D
E
 
R
I
 
I
E
 
T
R
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A

1wauA Structure of kdpg aldolase e45n mutant (see paper)
48% identity, 86% coverage: 25:205/211 of query aligns to 27:207/213 of 1wauA

query
sites
1wauA
D
 
E
T
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
P
L
 
M
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
R
T
 
V
L
 
L
E
x
N
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
P
 
E
A
 
C
A
 
A
L
 
V
A
 
D
C
 
A
A
 
I
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
L
R
 
N
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
V
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
E
R
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
E
A
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
P
Y
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
M
I
 
L
A
 
G
M
 
M
E
 
D
H
 
Y
G
 
G
F
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
F
K
|
K
F
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
M
 
E
L
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
V
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
A
M
 
I
A
 
A
P
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
S
E
 
Q
I
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
|
G
G
|
G
L
x
I
K
 
S
A
 
P
E
 
A
H
 
N
V
 
Y
K
 
R
E
 
D
I
 
Y
L
 
L
S
 
A
L
 
L
P
 
K
N
 
S
V
 
V
F
 
L
A
 
C
L
 
I
G
 
G
G
 
G
T
x
S
W
 
W
L
 
L
T
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
E
E
 
A
R
 
G
R
 
D
W
 
Y
S
 
D
E
 
R
I
 
I
E
 
T
R
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A

2c0aB Mechanism of the class i kdpg aldolase (see paper)
48% identity, 86% coverage: 25:205/211 of query aligns to 28:208/214 of 2c0aB

query
sites
2c0aB
D
 
E
T
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
P
L
 
M
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
R
T
 
V
L
 
L
E
x
N
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
P
 
E
A
 
C
A
 
A
L
 
V
A
 
D
C
 
A
A
 
I
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
K
R
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
L
R
 
N
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
V
 
A
V
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
E
R
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
T
T
 
E
A
 
G
G
 
T
L
 
I
P
 
P
Y
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
M
I
 
L
A
 
G
M
 
M
E
 
D
H
 
Y
G
 
G
F
 
L
R
x
K
E
|
E
L
 
F
K
|
K
F
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
M
 
E
L
 
A
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
V
P
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
G
 
A
M
 
I
A
 
A
P
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
S
E
 
Q
I
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
|
G
G
|
G
L
 
I
K
 
S
A
 
P
E
 
A
H
 
N
V
 
Y
K
 
R
E
 
D
I
 
Y
L
 
L
S
 
A
L
 
L
P
 
K
N
 
S
V
 
V
F
 
L
A
 
C
L
 
I
G
 
G
G
|
G
T
x
S
W
 
W
L
 
L
T
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
L
K
 
E
E
 
A
R
 
G
R
 
D
W
 
Y
S
 
D
E
 
R
I
 
I
E
 
T
R
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6oviA Crystal structure of kdpg aldolase from legionella pneumophila with pyruvate captured at low ph as a covalent carbinolamine intermediate
43% identity, 91% coverage: 15:207/211 of query aligns to 14:206/210 of 6oviA

query
sites
6oviA
I
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
V
L
 
I
D
 
K
E
 
E
P
 
L
D
 
E
T
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
F
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
H
T
 
V
L
 
L
E
|
E
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
P
 
P
A
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
K
C
 
A
A
 
L
E
 
E
A
 
L
I
 
L
A
 
I
A
 
N
R
 
T
V
 
F
P
 
P
G
 
D
A
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
A
G
|
G
T
|
T
L
 
V
I
 
I
R
 
T
P
 
P
E
 
G
Q
 
Q
F
 
F
A
 
H
Q
 
D
A
 
V
R
 
V
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
A
V
x
I
S
|
S
P
|
P
G
 
G
L
 
Q
T
 
T
D
 
R
R
 
E
L
 
L
A
 
L
E
 
I
A
 
A
A
 
G
K
 
Q
T
 
K
A
 
S
G
 
E
L
 
I
P
 
P
Y
 
L
L
 
I
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
S
V
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
L
L
 
M
I
 
E
A
 
G
M
 
L
E
 
G
H
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
N
E
 
H
L
 
F
K
|
K
F
 
F
F
|
F
P
 
P
A
 
A
M
 
A
L
 
A
N
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
I
P
 
P
A
 
M
L
 
L
R
 
K
G
 
A
M
 
I
A
 
S
P
 
G
L
 
V
M
 
F
P
 
P
E
 
Q
I
 
V
R
 
K
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
|
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
K
 
N
A
 
S
E
 
K
H
 
N
V
 
Y
K
 
E
E
 
E
I
 
Y
L
 
L
S
 
C
L
 
L
P
 
P
N
 
N
V
 
V
F
 
A
A
 
C
L
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
S
W
 
W
L
 
I
T
 
V
P
 
P
A
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
I
K
 
K
E
 
N
R
 
H
R
 
N
W
 
W
S
 
S
E
 
L
I
 
I
E
 
T
R
 
E
L
 
L
A
 
C
R
 
M
E
 
A
A
 
V
S
 
S
A
 
S

3vcrA Crystal structure of a putative kdpg (2-keto-3-deoxy-6- phosphogluconate) aldolase from oleispira antarctica (see paper)
45% identity, 98% coverage: 5:210/211 of query aligns to 3:215/216 of 3vcrA

query
sites
3vcrA
R
 
Q
L
 
L
E
 
D
P
 
T
S
 
W
L
 
L
S
 
A
G
 
N
P
 
T
R
 
K
-
 
P
I
 
L
V
 
I
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
V
L
 
I
D
 
D
E
 
D
P
 
L
D
 
V
T
 
H
A
 
A
V
 
I
A
 
P
L
 
M
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
H
T
 
L
L
 
L
E
|
E
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
T
P
 
E
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
A
C
 
A
A
 
I
E
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
K
A
 
K
R
 
A
V
 
V
P
 
P
G
 
E
A
 
A
L
 
I
V
 
V
G
 
G
L
 
A
G
|
G
T
|
T
L
 
V
I
 
C
R
 
T
P
 
A
E
 
D
Q
 
D
F
 
F
A
 
Q
Q
 
K
A
 
A
R
 
I
D
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
V
 
I
V
|
V
S
|
S
P
|
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
P
R
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
A
K
 
K
T
 
Q
A
 
V
G
 
K
L
 
L
P
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
W
-
 
Q
-
 
G
-
 
V
Y
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
S
E
 
E
A
 
V
L
 
M
I
 
I
A
 
A
M
 
A
E
 
Q
H
 
A
G
 
G
F
 
I
R
 
T
E
 
Q
L
 
L
K
|
K
F
 
C
F
|
F
P
 
P
A
 
A
M
 
S
L
 
A
N
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
K
A
 
L
L
 
L
R
 
K
G
 
A
M
 
W
A
 
S
P
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
P
E
 
D
I
 
I
R
 
Q
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
K
 
S
A
 
K
E
 
D
H
 
N
V
 
Y
K
 
K
E
 
E
I
 
Y
L
 
L
S
 
G
L
 
L
P
 
P
N
 
N
V
 
V
F
 
I
A
 
C
L
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
S
W
 
W
L
 
L
T
 
T
P
 
E
A
 
S
D
 
K
A
 
L
V
 
L
K
 
I
E
 
E
R
 
G
R
 
D
W
 
W
S
 
N
E
 
E
I
 
V
E
 
T
R
 
R
L
 
R
A
 
A
R
 
S
E
 
E
A
 
I
S
 
V
A
 
K
L
 
L
A
 
S
Q
 
D

5xsfA Crystal structure of the 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase of zymomonas mobilis zm4 with 3-phosphoglycerate
44% identity, 92% coverage: 15:208/211 of query aligns to 14:203/209 of 5xsfA

query
sites
5xsfA
I
 
V
V
 
M
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
|
V
L
x
I
D
x
E
E
x
D
P
 
I
D
 
A
T
x
D
A
 
A
V
 
K
A
 
P
L
x
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
N
T
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
T
P
 
P
A
 
C
A
 
A
L
 
L
A
 
E
C
 
-
A
 
A
E
 
I
A
 
K
I
 
I
A
 
M
A
 
K
R
 
E
V
 
V
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
L
R
 
N
P
 
A
E
 
K
Q
 
M
F
 
L
A
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
Q
D
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
C
R
 
E
F
 
F
V
 
F
V
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
A
R
 
D
L
 
L
A
 
G
E
 
K
A
 
H
A
 
A
K
 
V
T
 
A
A
 
Q
G
 
K
L
 
A
P
 
A
Y
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
A
T
 
N
V
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
M
I
 
L
A
 
G
M
 
L
E
 
D
H
 
L
G
 
G
F
 
L
R
 
D
E
 
R
L
 
F
K
 
K
F
 
F
F
 
F
P
 
P
A
 
A
M
 
E
L
 
N
N
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
R
 
K
G
 
S
M
 
M
A
 
A
P
 
S
L
 
V
M
 
F
P
 
R
E
 
Q
I
 
V
R
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
I
K
 
T
A
 
P
E
 
T
H
 
S
V
 
A
K
 
P
E
 
K
I
 
Y
L
 
L
S
 
E
L
 
N
P
 
P
N
 
S
V
 
I
F
 
L
A
 
C
L
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
S
W
 
W
L
 
V
T
x
V
P
 
P
A
 
A
D
x
G
A
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
K
R
 
P
R
 
D
W
 
V
S
 
A
E
 
K
I
 
I
E
 
T
R
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
F

1mxsA Crystal structure of 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate (kdpg) aldolase from pseudomonas putida. (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:208/211 of query aligns to 9:212/216 of 1mxsA

query
sites
1mxsA
R
 
R
L
 
I
E
 
D
P
 
A
S
 
I
L
 
C
S
 
E
G
 
K
P
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
T
L
 
I
D
 
A
E
 
R
P
 
E
D
 
E
T
 
D
A
 
I
V
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
R
T
 
T
L
 
L
E
|
E
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
T
 
S
P
 
Q
A
 
H
A
 
G
L
 
L
A
 
K
C
 
A
A
 
I
E
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
R
A
 
E
R
 
Q
V
 
R
P
 
P
G
 
E
A
 
L
L
 
C
V
 
V
G
 
G
L
 
A
G
|
G
T
|
T
L
 
V
I
 
L
R
 
D
P
 
R
E
 
S
Q
 
M
F
 
F
A
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
V
 
V
V
|
V
S
x
T
P
|
P
G
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
E
R
 
D
L
 
I
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
K
 
V
T
 
D
A
 
S
G
 
E
L
 
I
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
P
A
 
S
E
 
E
A
 
I
L
 
M
I
 
M
A
 
G
M
 
Y
E
 
A
H
 
L
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
E
 
R
L
 
F
K
|
K
F
 
L
F
 
F
P
 
P
A
 
A
M
 
E
L
 
I
N
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
V
P
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
K
G
 
A
M
 
F
A
 
G
P
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
G
E
 
D
I
 
I
R
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
|
G
G
|
G
L
 
V
K
 
N
A
 
P
E
 
A
H
 
N
V
 
V
K
 
R
E
 
N
I
 
Y
L
 
M
S
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
N
V
 
V
F
 
M
A
 
C
L
 
V
G
 
G
G
x
T
T
|
T
W
 
W
L
 
M
T
 
L
P
 
D
A
 
S
D
 
S
A
 
W
V
 
I
K
 
K
E
 
N
R
 
G
R
 
D
W
 
W
S
 
A
E
 
R
I
 
I
E
 
E
R
 
A
L
 
C
A
 
S
R
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
I
A
 
A
L
 
L

P00885 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase; KDPG-aldolase; Phospho-2-dehydro-3-deoxygluconate aldolase; Phospho-2-keto-3-deoxygluconate aldolase; EC 4.1.2.14 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
38% identity, 97% coverage: 5:208/211 of query aligns to 19:222/226 of P00885

query
sites
P00885
R
 
R
L
 
I
E
 
D
P
 
A
S
 
I
L
 
C
S
 
E
G
 
K
P
 
A
R
 
R
I
 
I
V
 
L
P
 
P
V
 
V
L
 
I
V
 
T
L
 
I
D
 
A
E
 
R
P
 
E
D
 
E
T
 
D
A
 
I
V
 
L
A
 
P
L
 
L
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
R
T
 
T
L
 
L
E
 
E
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
S
P
 
Q
A
 
H
A
 
G
L
 
L
A
 
K
C
 
A
A
 
I
E
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
R
A
 
E
R
 
Q
V
 
R
P
 
P
G
 
E
A
 
L
L
 
C
V
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
I
 
L
R
 
D
P
 
R
E
 
S
Q
 
M
F
 
F
A
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
E
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
V
 
V
V
 
V
S
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
E
R
 
D
L
 
I
A
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
G
K
 
V
T
 
D
A
 
S
G
 
E
L
 
I
P
 
P
Y
 
L
L
 
L
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
S
T
 
T
V
 
P
A
 
S
E
 
E
A
 
I
L
 
M
I
 
M
A
 
G
M
 
Y
E
 
A
H
 
L
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
E
 
R
L
 
F
K
|
K
F
 
L
F
 
F
P
 
P
A
 
A
M
 
E
L
 
I
N
 
S
G
 
G
G
 
G
A
 
V
P
 
A
A
 
A
L
 
I
R
 
K
G
 
A
M
 
F
A
 
G
P
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
G
E
 
D
I
 
I
R
 
R
F
 
F
C
 
C
P
 
P
T
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
V
K
 
N
A
 
P
E
 
A
H
 
N
V
 
V
K
 
R
E
 
N
I
 
Y
L
 
M
S
 
A
L
 
L
P
 
P
N
 
N
V
 
V
F
 
M
A
 
C
L
 
V
G
 
G
G
 
T
T
 
G
W
 
W
L
 
M
T
 
L
P
 
D
A
 
S
D
 
S
A
 
W
V
 
I
K
 
K
E
 
N
R
 
G
R
 
D
W
 
W
S
 
A
E
 
R
I
 
I
E
 
E
R
 
A
L
 
C
A
 
S
R
 
A
E
 
E
A
 
A
S
 
I
A
 
A
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1wa3D Mechanism of the class i kdpg aldolase (see paper)
31% identity, 93% coverage: 5:201/211 of query aligns to 1:199/203 of 1wa3D

query
sites
1wa3D
R
 
K
L
 
M
E
 
E
P
 
E
S
 
L
L
 
F
S
 
K
G
 
K
P
 
H
R
 
K
I
 
I
V
 
V
P
 
A
V
 
V
L
 
L
V
x
R
L
 
A
D
 
N
E
 
S
P
 
V
D
 
E
T
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
E
L
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
F
A
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
V
T
 
H
T
 
L
L
 
I
E
|
E
V
 
I
T
 
T
L
 
F
R
x
T
T
 
V
P
 
P
A
 
D
A
 
A
L
 
D
A
 
T
C
 
V
A
 
I
E
 
K
A
 
E
I
 
L
A
 
S
A
 
F
-
 
L
R
 
K
V
 
E
P
 
K
G
 
G
A
 
A
L
 
I
V
 
I
G
 
G
L
 
A
G
|
G
T
|
T
L
 
V
I
 
T
R
 
S
P
 
V
E
 
E
Q
 
Q
F
 
C
A
 
R
Q
 
K
A
 
A
R
 
V
D
 
E
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
E
F
 
F
V
 
I
V
|
V
S
|
S
P
|
P
G
 
H
L
 
L
T
 
D
D
 
E
R
 
E
L
 
I
A
 
S
E
 
Q
A
 
F
A
 
C
K
 
K
T
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
F
Y
 
Y
L
 
M
P
 
P
G
 
G
I
 
V
A
 
M
T
 
T
V
 
P
A
 
T
E
 
E
A
 
L
L
 
V
I
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
K
H
 
L
G
 
G
F
 
H
R
 
T
E
 
I
L
 
L
K
|
K
F
 
L
F
|
F
P
 
P
A
 
G
M
 
E
L
 
V
N
 
V
G
 
-
G
 
G
A
 
P
P
 
Q
A
 
F
L
 
V
R
 
K
G
 
A
M
 
M
A
 
K
P
 
G
L
 
P
M
 
F
P
 
P
E
 
N
I
 
V
R
 
K
F
 
F
C
 
V
P
 
P
T
 
T
G
|
G
G
|
G
L
 
V
K
 
N
A
 
L
E
 
D
H
 
N
V
 
V
K
 
C
E
 
E
I
 
W
L
 
F
S
 
K
L
 
-
P
 
A
N
 
G
V
 
V
F
 
L
A
 
A
L
 
V
G
 
G
-
 
V
G
|
G
T
x
S
W
 
A
L
 
L
T
 
V
P
 
K
A
 
G
-
 
T
-
 
P
D
 
D
A
 
E
V
 
V
K
 
R
E
 
E
R
 
K
R
 
A
W
 
K
S
 
A
E
 
F
I
 
V
E
 
E
R
 
K
L
 
I

Q6BF16 2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase; 2-oxo-3-deoxygalactonate 6-phosphate aldolase; 6-phospho-2-dehydro-3-deoxygalactonate aldolase; 6-phospho-2-keto-3-deoxygalactonate aldolase; KDPGal; EC 4.1.2.21 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
28% identity, 89% coverage: 24:210/211 of query aligns to 18:198/205 of Q6BF16

query
sites
Q6BF16
P
 
P
D
 
D
T
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
H
A
 
V
E
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
A
G
 
G
L
 
F
T
 
D
T
 
A
L
 
V
E
|
E
V
 
I
T
 
P
L
 
L
R
 
N
T
 
S
P
 
P
A
 
Q
A
 
W
L
 
E
A
 
Q
C
 
S
A
 
I
E
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
-
 
D
A
 
A
R
 
Y
V
 
G
P
 
D
G
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
|
T
L
 
V
I
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
F
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
L
R
 
A
D
 
R
A
 
M
G
 
G
A
 
C
R
 
Q
F
 
L
V
 
I
V
 
V
S
 
T
P
 
P
G
 
N
L
 
I
T
 
H
D
 
S
R
 
E
L
 
V
A
 
I
E
 
R
A
 
R
A
 
A
K
 
V
T
 
G
A
 
Y
G
 
G
L
 
M
P
 
T
Y
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
I
 
C
A
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
F
I
 
T
A
 
A
M
 
L
E
 
E
H
 
A
G
 
G
F
 
A
R
 
Q
E
 
A
L
 
L
K
|
K
F
 
I
F
 
F
P
 
P
A
 
S
M
 
S
L
 
A
N
 
F
G
 
-
G
 
G
A
 
P
P
 
Q
A
 
Y
L
 
I
R
 
K
G
 
A
M
 
L
A
 
K
P
 
A
L
 
V
M
 
L
P
 
P
-
 
S
E
 
D
I
 
I
R
 
A
F
 
V
C
 
F
P
 
A
T
x
V
G
 
G
G
 
G
L
 
V
K
 
T
A
 
P
E
 
E
H
 
N
V
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
W
L
 
I
S
 
D
L
 
A
P
 
G
N
 
C
V
 
A
F
 
G
A
 
A
L
 
G
G
 
L
G
 
G
T
 
S
W
 
D
L
 
L
T
 
Y
P
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
R
R
 
A
W
 
G
S
 
Q
E
 
S
I
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
S
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
V
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

2v82A Kdpgal complexed to kdpgal (see paper)
28% identity, 89% coverage: 24:210/211 of query aligns to 17:197/205 of 2v82A

query
sites
2v82A
P
 
P
D
 
D
T
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
H
A
 
V
E
 
G
A
 
A
L
 
V
V
 
I
A
 
D
G
 
A
G
 
G
L
 
F
T
 
D
T
 
A
L
 
V
E
|
E
V
 
I
T
 
P
L
 
L
R
x
N
T
 
S
P
 
P
A
 
Q
A
 
W
L
 
E
A
 
Q
C
 
S
A
 
I
E
 
P
A
 
A
I
 
I
A
 
V
-
 
D
A
 
A
R
 
Y
V
 
G
P
 
D
G
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
I
G
 
G
L
 
A
G
|
G
T
|
T
L
 
V
I
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
F
 
V
A
 
D
Q
 
A
A
 
L
R
 
A
D
 
R
A
 
M
G
 
G
A
 
C
R
 
Q
F
 
L
V
 
I
V
|
V
S
x
T
P
|
P
G
 
N
L
 
I
T
 
H
D
 
S
R
 
E
L
 
V
A
 
I
E
 
R
A
 
R
A
 
A
K
 
V
T
 
G
A
 
Y
G
 
G
L
 
M
P
 
T
Y
 
V
L
 
C
P
 
P
G
 
G
I
 
C
A
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
F
I
 
T
A
 
A
M
 
L
E
 
E
H
 
A
G
 
G
F
 
A
R
 
Q
E
 
A
L
 
L
K
|
K
F
 
I
F
|
F
P
 
P
A
 
S
M
 
S
L
 
A
N
 
F
G
 
-
G
 
G
A
 
P
P
 
Q
A
 
Y
L
 
I
R
 
K
G
 
A
M
 
L
A
 
K
P
 
A
L
 
V
M
 
L
P
 
P
-
 
S
E
 
D
I
 
I
R
 
A
F
 
V
C
 
F
P
 
A
T
x
V
G
|
G
G
|
G
L
 
V
K
 
T
A
 
P
E
 
E
H
 
N
V
 
L
K
 
A
E
 
Q
I
 
W
L
 
I
S
 
D
L
 
A
P
 
G
N
 
C
V
 
A
F
 
G
A
 
A
L
 
G
G
 
L
G
|
G
T
x
S
W
 
D
L
 
L
T
 
Y
P
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
V
 
-
K
 
-
E
 
-
R
 
R
R
 
A
W
 
G
S
 
Q
E
 
S
I
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
T
A
 
A
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
S
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
V
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS29850 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS29850
MTHPRLEPSLSGPRIVPVLVLDEPDTAVALAEALVAGGLTTLEVTLRTPAALACAEAIAA
RVPGALVGLGTLIRPEQFAQARDAGARFVVSPGLTDRLAEAAKTAGLPYLPGIATVAEAL
IAMEHGFRELKFFPAMLNGGAPALRGMAPLMPEIRFCPTGGLKAEHVKEILSLPNVFALG
GTWLTPADAVKERRWSEIERLAREASALAQG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory