SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS29980 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS29980 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

3abiA Crystal structure of l-lysine dehydrogenase from hyperthermophilic archaeon pyrococcus horikoshii (see paper)
30% identity, 65% coverage: 4:246/375 of query aligns to 4:238/349 of 3abiA

query
sites
3abiA
I
 
V
L
 
L
L
 
I
M
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
K
 
N
I
|
I
G
 
G
E
 
R
T
 
A
I
 
I
G
 
A
D
 
W
F
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
-
T
 
-
G
 
D
D
 
E
Y
 
F
R
 
D
V
 
V
T
 
Y
V
 
I
A
 
G
D
|
D
R
x
V
S
 
N
A
 
N
E
 
E
A
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
K
L
 
V
P
 
K
T
 
E
H
 
F
P
 
A
R
 
T
M
 
-
E
 
-
T
 
P
R
 
L
V
 
K
V
|
V
D
|
D
A
 
A
A
 
S
D
 
N
P
 
F
A
 
D
E
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
E
A
 
V
M
 
M
R
 
K
G
 
E
K
 
F
F
 
E
A
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
G
A
|
A
L
|
L
P
|
P
Y
 
G
H
 
F
L
|
L
T
 
G
V
 
F
G
 
K
V
 
S
A
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
I
D
 
K
A
 
S
G
 
K
T
 
V
H
 
D
Y
 
M
L
 
V
D
 
D
L
x
V
T
x
S
E
x
F
D
 
M
V
 
P
A
 
E
S
 
N
T
 
P
R
 
L
R
 
E
V
 
L
K
 
R
E
 
D
L
 
E
A
 
A
D
 
E
G
 
K
A
 
A
P
 
Q
C
 
V
A
 
T
F
 
I
I
 
V
P
 
F
Q
 
D
C
 
A
G
 
G
L
x
F
A
|
A
P
|
P
G
 
G
F
 
L
I
 
S
S
 
N
I
 
I
V
 
L
A
 
M
N
 
G
D
 
R
V
 
I
A
 
F
S
 
Q
R
 
E
F
 
L
D
 
D
T
 
-
L
 
L
D
 
K
T
 
E
V
 
G
R
 
Y
M
 
I
R
 
Y
V
 
V
G
|
G
A
x
G
L
 
L
P
 
P
K
 
K
Y
 
D
P
 
P
S
 
K
N
 
P
A
 
P
L
 
L
N
 
Y
Y
 
Y
N
 
K
L
 
I
T
 
T
W
|
W
S
|
S
T
 
P
E
 
R
G
x
D
V
 
L
I
 
I
N
 
E
E
|
E
Y
 
Y
L
 
T
E
 
R
P
 
P
C
 
A
E
 
R
A
 
V
I
 
I
V
 
R
E
 
N
G
 
G
R
 
K
L
 
V
V
 
S
S
 
K
V
 
V
P
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
V
E
 
K
E
 
K
F
 
V
S
 
K
L
 
I
D
 
G
G
 
K
V
 
F
L
 
E
Y
 
F
E
 
E
A
 
A
F
 
F
N
 
-
T
 
I
S
 
S
G
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
R
T
 
S
L
 
M
C
 
L
E
 
E
T
 
T
L
 
I
A
 
N
G
 
S
K
 
E
V
 
-
R
 
-
T
 
R
L
 
L
N
 
E
Y
 
E
R
 
W
S
x
T
V
 
L
R
|
R
Y
 
W
P
 
P
G
 
G
H
 
H
R
 
L
D
 
E
L
 
K
M
 
I
K
 
K
A
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9UDR5 Alpha-aminoadipic semialdehyde synthase, mitochondrial; LKR/SDH; EC 1.5.1.8; EC 1.5.1.9 from Homo sapiens (Human)
22% identity, 89% coverage: 2:333/375 of query aligns to 481:810/926 of Q9UDR5

query
sites
Q9UDR5
R
 
R
D
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
V
M
 
L
G
 
G
G
x
S
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
G
 
S
E
 
E
T
 
P
I
 
V
G
 
L
D
 
E
F
 
Y
L
 
L
K
 
S
A
 
R
T
 
D
G
 
G
D
 
N
Y
 
I
R
 
E
V
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
G
D
 
S
R
x
D
S
 
M
A
 
K
E
 
N
A
x
Q
L
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
P
 
G
T
 
K
H
 
K
P
 
Y
R
 
N
M
 
I
E
 
N
T
 
P
R
 
V
V
 
S
V
 
M
D
 
D
A
x
I
A
 
C
D
 
K
P
 
Q
A
 
E
E
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
F
A
 
L
M
 
V
R
 
A
G
 
K
K
 
Q
F
 
D
A
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
L
L
|
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
V
L
 
L
T
 
H
V
 
P
G
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
C
R
 
I
D
 
T
A
 
N
G
 
K
T
 
V
H
 
N
Y
 
M
L
 
V
D
 
T
L
x
A
T
x
S
E
 
Y
D
 
I
V
 
T
A
 
P
S
 
A
T
 
L
R
 
K
R
 
E
V
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
S
A
 
V
D
 
E
G
 
D
A
 
A
P
 
G
C
 
I
A
 
T
F
 
I
I
 
I
P
 
G
Q
 
E
C
 
L
G
 
G
L
|
L
A
x
D
P
|
P
G
 
G
F
 
L
I
 
D
S
 
H
I
 
M
V
 
L
A
 
A
N
 
M
D
 
E
V
 
T
A
 
I
S
 
D
R
 
K
F
 
A
D
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
T
 
S
V
 
Y
R
 
I
M
 
S
R
 
Y
V
 
C
G
 
G
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
E
Y
 
H
P
 
S
S
 
N
N
 
N
A
 
P
L
 
L
N
 
R
Y
 
Y
N
 
K
L
 
F
T
 
S
W
 
W
S
 
S
T
 
P
E
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
L
N
 
M
E
 
N
Y
 
V
L
 
M
E
 
Q
P
 
S
C
 
A
E
 
T
A
 
Y
I
 
L
V
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
V
V
 
V
S
 
N
V
 
V
P
 
A
P
 
G
L
 
G
E
 
I
E
 
S
R
 
F
E
 
L
E
 
D
F
 
A
S
 
V
L
 
T
D
 
S
G
 
M
V
 
D
L
 
F
Y
 
F
E
 
P
A
 
G
F
 
L
N
 
N
T
 
L
S
 
E
G
 
G
G
 
Y
L
 
P
G
 
N
T
 
R
L
 
D
C
 
S
E
 
T
T
 
K
L
 
Y
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
G
 
S
K
 
S
V
 
A
R
 
H
T
 
T
L
 
L
N
 
L
Y
 
R
R
 
G
S
 
T
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
H
 
Y
R
 
-
D
 
-
L
 
-
M
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
N
H
 
G
D
 
F
L
 
V
R
 
K
L
 
L
G
 
G
-
 
L
S
 
I
R
 
N
R
 
R
E
 
E
L
 
A
L
 
L
K
 
P
D
 
A
I
 
F
L
 
R
E
 
P
H
 
E
S
 
A
I
 
N
P
 
P
A
 
L
T
 
T
L
 
W
Q
 
K
D
 
Q
V
 
L
V
 
L
L
 
C
I
 
D
F
 
L
V
 
V
T
 
G
V
 
I
T
 
S
G
 
P
T
 
S
K
 
S
R
 
E
G
 
H
R
 
D
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
E
 
E
T
 
A
Y
 
V
A
 
L
N
 
K
K
 
K
I
 
L
Y
 
G
G
 
G
R
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
F
 
-
Y
 
-
N
 
D
G
 
N
I
 
T
Q
 
Q
I
 
L
T
 
E
T
 
A
A
 
A
S
 
E
G
 
W
M
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
L
D
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
G
D
 
D
G
 
E
T
 
Q
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q

5l78A Crystal structure of human aminoadipate semialdehyde synthase, saccharopine dehydrogenase domain (in NAD+ bound form)
23% identity, 50% coverage: 2:190/375 of query aligns to 1:196/436 of 5l78A

query
sites
5l78A
R
 
R
D
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
V
M
 
L
G
|
G
G
x
S
G
|
G
K
 
Y
I
|
I
G
 
S
E
 
E
T
 
P
I
 
V
G
 
L
D
 
E
F
 
Y
L
 
L
K
 
S
A
 
R
T
 
D
G
 
G
D
 
N
Y
 
I
R
 
E
V
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
G
D
x
S
R
x
D
S
x
M
A
 
K
E
 
N
A
x
Q
L
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
P
 
G
T
 
K
H
 
K
P
 
Y
R
 
N
M
 
I
E
 
N
T
 
P
R
 
V
V
 
S
V
 
M
D
 
D
A
x
I
A
 
C
D
 
K
P
 
Q
A
 
E
E
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
F
A
 
L
M
 
V
R
 
A
G
 
K
K
 
Q
F
 
D
A
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
x
L
L
|
L
P
|
P
Y
 
Y
H
 
V
L
|
L
T
 
H
V
 
P
G
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
C
R
 
I
D
 
T
A
 
N
G
 
K
T
 
V
H
 
N
Y
 
M
L
 
V
D
 
T
L
x
A
T
x
S
E
 
Y
D
 
I
V
 
T
A
 
P
S
 
A
T
 
L
R
 
K
R
 
E
V
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
S
A
 
V
D
 
E
G
 
D
A
 
A
P
 
G
C
 
I
A
 
T
F
 
I
I
 
I
P
 
G
Q
 
E
C
 
L
G
 
G
L
|
L
A
x
D
P
|
P
G
 
G
F
 
L
I
 
D
S
 
H
I
 
M
V
 
L
A
 
A
N
 
M
D
 
E
V
 
T
A
 
I
S
 
D
R
 
K
F
 
A
D
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
T
 
S
V
 
Y
R
 
I
M
 
S
R
 
Y
V
 
C
G
 
G
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
E
Y
 
H
P
 
S
S
 
N
N
 
N
A
 
P
L
 
L
N
 
R
Y
 
Y
N
 
K
L
 
F
T
 
S
W
|
W
S
 
S
T
 
P
E
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
L
N
 
M
E
 
N
Y
 
V
L
 
M
E
 
Q
P
 
S
C
 
A
E
 
T
A
 
Y
I
 
L
V
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
V
V
 
V
S
 
N
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5o1oA Crystal structure of human aminoadipate semialdehyde synthase, saccharopine dehydrogenase domain with proline bound.
23% identity, 50% coverage: 2:190/375 of query aligns to 1:196/439 of 5o1oA

query
sites
5o1oA
R
 
R
D
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
V
M
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
G
 
S
E
 
E
T
 
P
I
 
V
G
 
L
D
 
E
F
 
Y
L
 
L
K
 
S
A
 
R
T
 
D
G
 
G
D
 
N
Y
 
I
R
 
E
V
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
G
D
 
S
R
 
D
S
 
M
A
 
K
E
 
N
A
 
Q
L
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
P
 
G
T
 
K
H
 
K
P
 
Y
R
 
N
M
 
I
E
 
N
T
 
P
R
 
V
V
 
S
V
 
M
D
 
D
A
 
I
A
 
C
D
 
K
P
 
Q
A
 
E
E
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
F
A
 
L
M
 
V
R
 
A
G
 
K
K
 
Q
F
 
D
A
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
L
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
V
L
 
L
T
 
H
V
 
P
G
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
C
R
 
I
D
 
T
A
 
N
G
 
K
T
 
V
H
 
N
Y
 
M
L
 
V
D
 
T
L
 
A
T
 
S
E
 
Y
D
 
I
V
 
T
A
 
P
S
 
A
T
 
L
R
 
K
R
 
E
V
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
S
A
 
V
D
 
E
G
 
D
A
 
A
P
 
G
C
 
I
A
 
T
F
 
I
I
 
I
P
 
G
Q
 
E
C
 
L
G
 
G
L
 
L
A
x
D
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
D
S
 
H
I
 
M
V
 
L
A
 
A
N
 
M
D
 
E
V
 
S
A
 
I
S
 
D
R
 
K
F
 
A
D
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
T
 
S
V
 
Y
R
 
I
M
 
S
R
 
Y
V
 
C
G
 
G
A
 
G
L
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
E
Y
 
H
P
 
S
S
 
N
N
 
N
A
 
P
L
 
L
N
 
R
Y
 
Y
N
 
K
L
 
F
T
 
S
W
 
W
S
 
S
T
 
P
E
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
L
N
 
M
E
 
N
Y
 
V
L
 
M
E
 
Q
P
 
S
C
 
A
E
 
T
A
 
Y
I
 
L
V
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
V
V
 
V
S
 
N
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5o1nA Crystal structure of human aminoadipate semialdehyde synthase, saccharopine dehydrogenase domain with n-[(2s)-2-pyrrolidinylmethyl]- trifluoromethanesulfonamide bound
23% identity, 50% coverage: 2:190/375 of query aligns to 1:196/442 of 5o1nA

query
sites
5o1nA
R
 
R
D
 
K
I
 
V
L
 
L
L
 
V
M
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
G
 
S
E
 
E
T
 
P
I
 
V
G
 
L
D
 
E
F
 
Y
L
 
L
K
 
S
A
 
R
T
 
D
G
 
G
D
 
N
Y
 
I
R
 
E
V
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
G
D
 
S
R
 
D
S
 
M
A
 
K
E
 
N
A
 
Q
L
 
I
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
P
 
G
T
 
K
H
 
K
P
 
Y
R
 
N
M
 
I
E
 
N
T
 
P
R
 
V
V
 
S
V
 
M
D
 
D
A
 
I
A
 
C
D
 
K
P
 
Q
A
 
E
E
 
E
-
 
K
L
 
L
A
 
G
E
 
F
A
 
L
M
 
V
R
 
A
G
 
K
K
 
Q
F
 
D
A
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
L
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
V
L
 
L
T
 
H
V
 
P
G
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
K
A
 
A
A
 
C
R
 
I
D
 
T
A
 
N
G
 
K
T
 
V
H
 
N
Y
 
M
L
 
V
D
 
T
L
 
A
T
 
S
E
 
Y
D
 
I
V
 
T
A
 
P
S
 
A
T
 
L
R
 
K
R
 
E
V
 
L
K
 
E
E
 
K
L
 
S
A
 
V
D
 
E
G
 
D
A
 
A
P
 
G
C
 
I
A
 
T
F
 
I
I
 
I
P
 
G
Q
 
E
C
 
L
G
 
G
L
 
L
A
x
D
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
D
S
 
H
I
 
M
V
 
L
A
 
A
N
 
M
D
 
E
V
 
S
A
 
I
S
 
D
R
 
K
F
 
A
D
 
K
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
A
T
 
T
L
 
I
D
 
E
T
 
S
V
 
Y
R
 
I
M
 
S
R
 
Y
V
 
C
G
 
G
A
x
G
L
 
L
P
 
P
-
 
A
-
 
P
K
 
E
Y
 
H
P
 
S
S
 
N
N
 
N
A
 
P
L
 
L
N
 
R
Y
 
Y
N
 
K
L
 
F
T
 
S
W
 
W
S
 
S
T
 
P
E
 
V
G
 
G
V
 
V
I
 
L
N
 
M
E
 
N
Y
 
V
L
 
M
E
 
Q
P
 
S
C
 
A
E
 
T
A
 
Y
I
 
L
V
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
K
L
 
V
V
 
V
S
 
N
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1e5qA Ternary complex of saccharopine reductase from magnaporthe grisea, NADPH and saccharopine (see paper)
25% identity, 46% coverage: 2:172/375 of query aligns to 3:179/449 of 1e5qA

query
sites
1e5qA
R
 
K
D
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
M
M
 
L
G
 
G
G
x
S
G
|
G
K
x
F
I
x
V
G
 
T
E
 
R
T
 
P
I
 
T
G
 
L
D
 
D
F
 
V
L
 
L
K
 
T
A
 
D
T
 
S
G
 
G
D
 
-
Y
 
I
R
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
D
x
C
R
|
R
S
 
T
A
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
T
 
A
H
 
G
P
 
V
R
 
Q
M
 
H
E
 
S
T
 
T
R
 
P
V
 
I
-
 
S
V
 
L
D
|
D
A
x
V
A
 
N
D
 
D
P
 
D
A
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
A
A
 
E
M
 
V
R
 
A
G
 
K
K
 
H
F
 
D
A
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
x
L
L
x
I
P
|
P
Y
|
Y
H
 
T
L
x
F
T
 
H
V
 
A
G
 
T
V
 
V
A
 
I
E
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
I
D
 
R
A
 
Q
G
 
K
T
 
K
H
 
H
Y
 
V
L
 
V
D
 
T
L
x
T
T
x
S
E
x
Y
D
 
V
V
 
S
A
 
P
S
 
A
T
 
M
R
 
M
R
 
E
V
 
L
K
 
D
E
 
Q
L
 
A
A
 
A
D
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
G
C
 
I
A
 
T
F
 
V
I
 
M
P
 
N
Q
 
E
C
 
I
G
 
G
L
|
L
A
x
D
P
|
P
G
 
G
F
 
I
I
 
D
S
 
H
I
 
L
V
 
Y
A
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
I
N
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
H
S
 
A
R
 
A
F
 
G
D
 
G
T
 
K
L
 
I
D
 
K
T
 
T
V
 
F
R
 
L
M
 
S
R
 
Y
V
x
C
G
|
G
A
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
A
Y
 
P
P
 
E
S
 
S
-
 
S
-
 
D
N
 
N
A
 
P
L
 
L
N
 
G
Y
 
Y
N
 
K
L
 
F
T
 
S
W
|
W
S
|
S
T
 
S
E
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Q9P4R4 Saccharopine dehydrogenase [NADP(+), L-glutamate-forming]; Saccharopine reductase; EC 1.5.1.10 from Pyricularia oryzae (strain 70-15 / ATCC MYA-4617 / FGSC 8958) (Rice blast fungus) (Magnaporthe oryzae) (see paper)
25% identity, 46% coverage: 2:172/375 of query aligns to 4:180/450 of Q9P4R4

query
sites
Q9P4R4
R
 
K
D
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
M
M
 
L
G
 
G
G
x
S
G
|
G
K
x
F
I
x
V
G
 
T
E
 
R
T
 
P
I
 
T
G
 
L
D
 
D
F
 
V
L
 
L
K
 
T
A
 
D
T
 
S
G
 
G
D
 
-
Y
 
I
R
 
K
V
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
A
D
x
C
R
|
R
S
x
T
A
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
A
E
 
K
R
 
K
L
 
L
P
 
S
T
 
A
H
 
G
P
 
V
R
 
Q
M
 
H
E
 
S
T
 
T
R
 
P
V
 
I
-
 
S
V
 
L
D
|
D
A
x
V
A
 
N
D
 
D
P
 
D
A
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
D
E
 
A
A
 
E
M
 
V
R
 
A
G
 
K
K
 
H
F
 
D
A
 
L
V
 
V
L
 
I
S
 
S
A
 
L
L
x
I
P
 
P
Y
 
Y
H
 
T
L
 
F
T
 
H
V
 
A
G
 
T
V
 
V
A
 
I
E
 
K
A
 
S
A
 
A
R
 
I
D
 
R
A
 
Q
G
 
K
T
 
K
H
 
H
Y
 
V
L
 
V
D
 
T
L
x
T
T
x
S
E
x
Y
D
 
V
V
 
S
A
 
P
S
 
A
T
 
M
R
 
M
R
 
E
V
 
L
K
 
D
E
 
Q
L
 
A
A
 
A
D
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
G
C
 
I
A
 
T
F
 
V
I
 
M
P
 
N
Q
 
E
C
 
I
G
 
G
L
|
L
A
x
D
P
|
P
G
 
G
F
 
I
I
 
D
S
 
H
I
 
L
V
 
Y
A
 
A
-
 
I
-
 
K
-
 
T
-
 
I
N
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
H
S
 
A
R
 
A
F
 
G
D
 
G
T
 
K
L
 
I
D
 
K
T
 
T
V
 
F
R
 
L
M
 
S
R
 
Y
V
 
C
G
 
G
A
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
A
Y
 
P
P
 
E
S
 
S
-
 
S
-
 
D
N
 
N
A
 
P
L
 
L
N
 
G
Y
 
Y
N
 
K
L
 
F
T
 
S
W
 
W
S
|
S
T
 
S
E
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AZOBR_RS29980 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS29980
MRDILLMGGGKIGETIGDFLKATGDYRVTVADRSAEALERLPTHPRMETRVVDAADPAEL
AEAMRGKFAVLSALPYHLTVGVAEAARDAGTHYLDLTEDVASTRRVKELADGAPCAFIPQ
CGLAPGFISIVANDVASRFDTLDTVRMRVGALPKYPSNALNYNLTWSTEGVINEYLEPCE
AIVEGRLVSVPPLEEREEFSLDGVLYEAFNTSGGLGTLCETLAGKVRTLNYRSVRYPGHR
DLMKALLHDLRLGSRRELLKDILEHSIPATLQDVVLIFVTVTGTKRGRLLQETYANKIYG
REIGGTFYNGIQITTASGMCAVLDLLADGTLPQRGFVKQEEVRYADFIANRFGRNYAMTD
AAPQQGAQQGVGRAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory