SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AZOBR_RS31075 FitnessBrowser__azobra:AZOBR_RS31075 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ux8G Crystal structure of sphingomonas elodea atcc 31461 glucose-1- phosphate uridylyltransferase in complex with glucose-1-phosphate. (see paper)
63% identity, 97% coverage: 3:282/289 of query aligns to 3:280/288 of 2ux8G

query
sites
2ux8G
K
 
K
P
 
P
V
 
L
R
 
R
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
I
 
M
P
 
P
K
 
K
E
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
F
 
M
V
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
I
D
 
A
T
 
Y
E
 
E
L
 
L
N
 
E
R
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
Q
 
-
D
 
-
A
 
S
L
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
L
R
 
D
D
 
G
S
 
T
E
 
R
I
 
L
A
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
N
C
 
I
F
 
A
Y
 
Y
T
 
V
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
E
P
 
P
L
 
M
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
W
 
W
C
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
D
D
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
D
F
 
F
V
 
M
Q
 
F
G
 
G
D
 
Q
T
 
P
P
 
G
C
 
C
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
M
 
M
V
 
V
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
E
 
K
V
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
C
V
 
A
V
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
P
R
 
D
E
 
D
R
 
Q
T
 
T
S
 
H
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
I
 
I
L
 
I
D
 
T
V
 
P
E
 
G
K
 
T
D
 
Q
D
 
D
G
 
G
R
 
V
L
 
L
A
 
T
T
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
G
L
 
L
V
 
V
E
|
E
K
 
K
P
 
P
K
 
A
P
 
P
E
 
G
E
 
T
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
N
L
 
L
S
 
S
I
x
V
I
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
|
Y
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
V
 
V
F
 
M
D
 
R
H
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
N
Q
 
Q
Q
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
G
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
T
|
T
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
Q
K
 
R
L
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
D
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
H
 
H
G
 
G
L
 
V
R
 
T
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
S
R
 
R
P
 
P
D
 
D
M
 
L
A
 
E
D
 
P
K
 
A
V
 
V
R
 
R

2ux8A Crystal structure of sphingomonas elodea atcc 31461 glucose-1- phosphate uridylyltransferase in complex with glucose-1-phosphate. (see paper)
56% identity, 97% coverage: 3:282/289 of query aligns to 3:247/255 of 2ux8A

query
sites
2ux8A
K
 
K
P
 
P
V
 
L
R
 
R
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
F
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
I
 
M
P
 
P
K
 
K
E
 
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
L
L
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
F
 
M
V
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
K
R
 
S
A
 
A
I
 
L
E
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
I
D
 
A
T
 
Y
E
 
E
L
 
L
N
 
E
R
 
A
T
 
T
L
 
M
E
 
A
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
Q
 
-
D
 
-
A
 
S
L
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
L
R
 
D
D
 
G
S
 
T
E
 
R
I
 
L
A
 
K
P
 
P
G
 
G
R
 
N
C
 
I
F
 
A
Y
 
Y
T
 
V
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
V
 
E
P
 
P
L
 
M
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
 
A
V
 
V
W
 
W
C
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
V
 
I
I
 
V
G
 
G
N
 
D
D
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
|
L
P
 
P
D
 
D
D
|
D
F
 
F
V
 
M
Q
 
F
G
 
G
D
 
Q
T
 
P
P
 
G
C
 
C
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
M
 
M
V
 
V
E
 
D
A
 
A
Y
 
Y
N
 
N
E
 
K
V
 
V
G
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
C
V
 
A
V
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
S
 
-
S
 
-
Y
 
-
G
 
E
I
 
I
L
 
I
D
 
T
V
 
P
E
 
G
K
 
T
D
 
Q
D
 
D
G
 
G
R
 
V
L
 
L
A
 
T
T
 
E
V
 
V
R
 
-
G
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
S
 
-
T
 
N
L
 
L
S
 
S
I
x
V
I
|
I
G
|
G
R
 
R
Y
|
Y
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
V
 
V
F
 
M
D
 
R
H
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
N
Q
 
Q
Q
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
-
I
 
-
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
Q
K
 
R
L
 
M
I
 
I
G
 
G
T
 
D
Q
 
Q
P
 
P
F
 
F
H
 
H
G
 
G
L
 
V
R
 
T
F
 
F
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
V
A
 
A
L
 
L
R
 
S
R
 
R
P
 
P
D
 
D
M
 
L
A
 
E
D
 
P
K
 
A
V
 
V
R
 
R

5i1fA Crystal structure of utp-glucose-1-phosphate uridylyltransferase from burkholderia vietnamiensis in complex with uridine-5'-diphosphate- glucose
50% identity, 95% coverage: 5:278/289 of query aligns to 5:278/290 of 5i1fA

query
sites
5i1fA
V
 
V
R
 
T
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
F
P
|
P
V
|
V
A
|
A
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
I
 
S
P
 
P
K
|
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
I
A
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
T
D
 
E
F
 
M
V
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
K
 
K
R
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
K
D
 
S
T
 
Y
E
 
E
L
 
I
N
 
E
R
 
A
T
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
Q
 
E
D
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
S
V
 
L
V
 
V
R
 
R
D
 
S
S
 
I
E
 
K
I
 
P
A
 
S
P
 
H
G
 
V
R
 
D
C
 
C
F
 
F
Y
 
Y
T
 
V
R
 
R
Q
|
Q
Q
 
A
V
 
E
P
x
A
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
W
 
L
C
 
C
A
 
A
R
 
E
A
 
K
V
 
L
I
 
V
G
 
G
N
 
D
D
 
N
P
 
P
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
I
L
|
L
P
 
A
D
|
D
D
|
D
F
 
L
V
 
L
Q
 
D
G
 
G
D
 
P
T
 
T
P
 
P
C
 
V
L
 
L
K
 
R
Q
 
Q
M
 
M
V
 
I
E
 
D
A
 
V
Y
 
F
N
 
D
E
 
H
V
 
Y
G
 
H
G
 
A
N
 
S
I
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
V
V
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
A
R
 
P
E
 
A
R
 
D
T
 
S
S
 
K
S
 
S
Y
|
Y
G
|
G
I
 
V
L
 
I
D
 
D
V
 
G
E
 
K
K
 
R
D
 
W
D
 
E
G
 
D
R
 
D
L
 
L
A
 
F
T
 
K
V
 
L
R
 
S
G
 
G
L
 
I
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
E
P
 
P
E
 
A
E
 
Q
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
N
L
 
F
S
 
G
I
x
V
I
x
V
G
|
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
E
 
K
V
 
I
F
 
F
D
 
K
H
 
H
L
 
L
E
 
R
K
 
G
Q
 
L
Q
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
|
T
D
 
D
A
 
A
M
 
I
A
 
Q
K
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
T
T
 
D
Q
 
E
P
 
Q
F
 
V
H
 
L
G
 
A
L
 
Y
R
 
R
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
S
K
 
K
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
E
H
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
H
P
 
P
D
 
E
M
 
V
A
 
A

5ve7A Crystal structure of utp-glucose-1-phosphate uridylyltransferase from burkholderia ambifaria in complex with utp
50% identity, 98% coverage: 5:286/289 of query aligns to 3:280/282 of 5ve7A

query
sites
5ve7A
V
 
V
R
 
N
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
F
P
|
P
V
|
V
A
|
A
G
|
G
L
|
L
G
|
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
A
I
 
S
P
 
P
K
|
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
T
D
 
E
F
 
M
V
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
S
K
 
K
R
 
R
A
 
A
I
 
I
E
 
E
D
 
D
H
 
H
F
 
F
D
 
D
T
 
K
D
 
S
T
 
Y
E
 
E
L
 
V
N
 
E
R
 
A
T
 
E
L
 
L
E
 
E
E
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
Q
 
A
D
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
E
V
 
L
V
 
V
R
 
R
D
 
S
S
 
I
E
 
K
I
 
P
A
 
S
P
 
H
G
 
V
R
 
D
C
 
C
F
 
F
Y
 
Y
T
 
V
R
 
R
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
E
P
x
A
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
W
 
L
C
 
C
A
 
A
R
 
E
A
 
K
V
 
L
I
 
V
G
 
A
N
 
D
D
 
N
P
 
P
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
I
L
|
L
P
 
A
D
|
D
D
 
D
F
 
L
V
 
L
Q
 
D
G
 
G
D
 
N
T
 
P
P
 
P
C
 
V
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
M
 
M
V
 
V
E
 
D
A
 
V
Y
 
F
N
 
D
E
 
H
V
 
Y
G
 
H
G
 
S
N
 
S
I
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
V
V
 
E
D
 
E
V
 
I
P
 
P
R
 
P
E
 
S
R
 
E
T
 
T
S
 
K
S
 
S
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
V
D
 
D
V
 
G
E
 
K
K
 
E
D
 
W
D
 
E
G
 
E
R
 
S
L
 
I
A
 
V
T
 
K
V
 
M
R
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
A
P
 
P
E
 
E
E
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
N
L
 
L
S
 
G
I
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
P
 
P
E
 
R
V
 
I
F
 
F
D
 
E
H
 
H
L
 
L
E
 
-
K
 
-
Q
 
-
Q
 
-
R
 
R
G
 
A
A
 
L
G
 
K
N
 
P
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
I
A
 
Q
K
 
A
L
 
L
I
 
L
G
 
A
T
 
D
Q
 
E
P
 
Q
F
 
V
H
 
L
G
 
A
L
 
Y
R
 
K
F
 
Y
E
 
Q
G
 
G
T
 
T
R
 
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
S
K
 
K
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
E
H
 
F
A
 
A
L
 
L
R
 
R
R
 
H
P
 
P
D
 
E
M
 
V
A
 
G
D
 
T
K
 
E
V
 
F
R
 
D
D
 
A
M
 
Y
L
 
L
R
 
R

6knlA Uridine and triphosphate-bound ugpase from acinetobacter baumannii
43% identity, 97% coverage: 5:285/289 of query aligns to 2:286/290 of 6knlA

query
sites
6knlA
V
 
I
R
 
K
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
L
P
|
P
V
|
V
A
|
A
G
|
G
L
|
L
G
|
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
S
I
 
I
P
 
P
K
|
K
E
 
E
M
 
M
L
 
V
P
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
A
L
 
I
Q
 
E
H
 
Y
A
 
V
V
 
V
E
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
F
 
I
V
 
I
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
S
S
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
N
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
T
 
R
D
 
N
T
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
E
R
 
T
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
R
x
K
G
 
K
K
|
K
Q
 
F
D
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
A
V
 
E
V
 
I
R
 
-
D
 
-
S
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
E
R
 
H
-
 
V
-
 
S
C
 
V
F
 
I
Y
 
S
T
 
V
R
 
R
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
Q
P
|
P
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
W
 
L
C
 
C
A
 
A
R
 
K
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
N
 
E
D
 
D
P
 
D
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
 
L
P
|
P
D
|
D
D
 
V
F
 
L
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
D
 
G
T
 
S
P
 
G
C
 
Q
-
 
N
-
 
D
L
 
L
K
 
S
Q
 
R
M
 
M
V
 
I
E
 
S
A
 
R
Y
 
Y
N
 
N
E
 
S
V
 
S
G
 
Q
G
 
A
N
 
A
I
 
Q
V
 
I
A
 
M
V
 
V
V
 
E
D
 
A
V
 
V
P
 
P
R
 
D
E
 
H
R
 
L
T
 
V
S
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
A
K
 
Q
-
 
S
-
 
P
D
 
N
D
 
E
G
 
G
R
 
E
L
 
S
A
 
I
T
 
A
V
 
M
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
P
P
 
V
E
 
G
E
 
A
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
N
L
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
L
Q
 
P
P
 
A
E
 
K
V
 
I
F
 
M
D
 
Q
H
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
N
Q
 
T
Q
 
P
R
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
Q
G
 
D
T
 
T
Q
 
D
P
 
T
F
 
V
H
 
E
G
 
A
L
 
Y
R
 
R
F
 
M
E
 
Q
G
 
G
T
 
Q
R
 
T
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
S
K
 
K
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
H
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
R
 
E
R
 
H
P
 
P
D
 
K
M
 
L
A
 
G
D
 
M
K
 
E
V
 
F
R
 
K
D
 
Q
M
 
L
L
 
I

6k8dA Udp-glucose pyrophosphorylase with upg from acinetobacter baumanii
43% identity, 97% coverage: 5:285/289 of query aligns to 2:286/290 of 6k8dA

query
sites
6k8dA
V
 
I
R
 
K
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
L
P
|
P
V
|
V
A
|
A
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
S
I
 
I
P
 
P
K
 
K
E
 
E
M
 
M
L
 
V
P
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
A
L
 
I
Q
 
E
H
 
Y
A
 
V
V
 
V
E
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
F
 
I
V
 
I
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
S
S
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
N
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
T
 
R
D
 
N
T
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
E
R
 
T
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
R
 
K
G
 
K
K
 
K
Q
 
F
D
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
A
V
 
E
V
 
I
R
 
-
D
 
-
S
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
E
R
 
H
-
 
V
-
 
S
C
 
V
F
 
I
Y
 
S
T
 
V
R
 
R
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
Q
P
|
P
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
W
 
L
C
 
C
A
 
A
R
 
K
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
N
 
E
D
 
D
P
 
D
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
|
L
P
|
P
D
|
D
D
 
V
F
 
L
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
D
 
G
T
 
S
P
 
G
C
 
Q
-
 
N
-
 
D
L
 
L
K
 
S
Q
 
R
M
 
M
V
 
I
E
 
S
A
 
R
Y
 
Y
N
 
N
E
 
S
V
 
S
G
 
Q
G
 
A
N
 
A
I
 
Q
V
 
I
A
 
M
V
 
V
V
 
E
D
 
A
V
 
V
P
 
P
R
 
D
E
 
H
R
 
L
T
 
V
S
 
D
S
 
Q
Y
|
Y
G
|
G
I
 
I
L
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
A
K
 
Q
-
 
S
-
 
P
D
 
N
D
 
E
G
 
G
R
 
E
L
 
S
A
 
I
T
 
A
V
 
M
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
V
 
V
E
|
E
K
 
K
P
 
P
K
 
P
P
 
V
E
 
G
E
 
A
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
N
L
 
L
S
 
S
I
x
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
|
Y
I
 
V
L
 
L
Q
 
P
P
 
A
E
 
K
V
 
I
F
 
M
D
 
Q
H
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
N
Q
 
T
Q
 
P
R
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
Q
G
 
D
T
 
T
Q
 
D
P
 
T
F
 
V
H
 
E
G
 
A
L
 
Y
R
 
R
F
 
M
E
 
Q
G
 
G
T
 
Q
R
 
T
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
S
K
 
K
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
H
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
R
 
E
R
 
H
P
 
P
D
 
K
M
 
L
A
 
G
D
 
M
K
 
E
V
 
F
R
 
K
D
 
Q
M
 
L
L
 
I

3jukD The crystal structure of udp-glucose pyrophosphorylase complexed with udp-glucose (see paper)
45% identity, 93% coverage: 5:274/289 of query aligns to 2:264/264 of 3jukD

query
sites
3jukD
V
 
I
R
 
K
K
 
K
V
 
C
V
 
L
F
 
F
P
|
P
V
x
A
A
|
A
G
|
G
L
 
Y
G
 
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
I
T
 
T
K
 
K
A
 
T
I
 
I
P
 
P
K
|
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
M
A
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
C
E
 
E
D
 
V
F
 
M
V
 
A
F
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
K
 
K
R
 
R
A
 
S
I
 
L
E
 
E
D
 
D
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
T
 
T
D
 
S
T
 
Y
E
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
T
G
 
N
K
 
K
Q
 
E
D
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
S
V
 
I
R
 
R
D
 
N
S
 
-
E
 
-
I
 
I
A
 
I
P
 
E
G
 
K
R
 
C
C
 
C
F
 
F
-
 
S
Y
 
Y
T
 
V
R
 
R
Q
|
Q
Q
 
K
V
 
Q
P
x
M
L
 
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
I
W
 
L
C
 
T
A
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
I
L
|
L
P
 
A
D
|
D
D
|
D
F
 
L
-
 
C
V
 
I
Q
 
S
G
 
H
D
 
D
T
 
H
P
 
P
C
 
S
-
 
V
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
M
 
M
V
 
T
E
 
S
A
 
L
Y
 
Y
N
 
Q
E
 
K
V
 
Y
G
 
Q
G
 
C
N
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
A
R
 
L
E
 
E
R
 
E
T
 
V
S
 
S
S
 
K
Y
|
Y
G
|
G
I
 
V
L
 
I
D
 
R
V
 
G
E
 
E
K
 
W
D
 
L
D
 
E
G
 
E
R
 
G
L
 
V
A
 
Y
T
 
E
V
 
I
R
 
K
G
 
D
L
 
M
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
N
P
 
Q
E
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
N
L
 
L
S
 
A
I
x
V
I
 
I
G
|
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
Q
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
I
F
 
F
D
 
E
H
 
I
L
 
L
E
 
S
K
 
E
Q
 
T
Q
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
K
G
 
N
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
I
T
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
L
A
 
R
K
 
T
L
 
Q
I
 
A
G
 
K
T
 
R
Q
 
K
P
 
R
F
 
I
H
 
I
G
 
A
L
 
Y
R
 
Q
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
K
R
|
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
S
K
 
V
V
 
E
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
A
T
 
S
L
 
N
A
 
A
H
 
Y
A
 
Y
L
 
K
R
 
K
R
 
R

3jukA The crystal structure of udp-glucose pyrophosphorylase complexed with udp-glucose (see paper)
45% identity, 93% coverage: 5:274/289 of query aligns to 2:264/265 of 3jukA

query
sites
3jukA
V
 
I
R
 
K
K
 
K
V
 
C
V
 
L
F
 
F
P
|
P
V
x
A
A
|
A
G
|
G
L
 
Y
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
I
T
 
T
K
 
K
A
 
T
I
 
I
P
 
P
K
|
K
E
|
E
M
 
M
L
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
I
Q
 
Q
H
 
Y
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
M
A
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
C
E
 
E
D
 
V
F
 
M
V
 
A
F
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
N
K
 
K
R
 
R
A
 
S
I
 
L
E
 
E
D
 
D
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
T
 
T
D
 
S
T
 
Y
E
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
R
 
T
G
 
N
K
 
K
Q
 
E
D
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
K
V
 
S
V
 
I
R
 
R
D
 
N
S
 
-
E
 
-
I
 
I
A
 
I
P
 
E
G
 
K
R
 
C
C
 
C
F
 
F
-
 
S
Y
 
Y
T
 
V
R
 
R
Q
|
Q
Q
 
K
V
 
Q
P
x
M
L
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
I
W
 
L
C
 
T
A
 
G
R
 
E
A
 
A
V
 
L
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
E
P
 
P
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
I
L
|
L
P
 
A
D
 
D
D
|
D
F
 
L
-
 
C
V
 
I
Q
 
S
G
 
H
D
 
D
T
 
H
P
 
P
C
 
S
-
 
V
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
M
 
M
V
 
T
E
 
S
A
 
L
Y
 
Y
N
 
Q
E
 
K
V
 
Y
G
 
Q
G
 
C
N
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
E
D
 
E
V
 
V
P
 
A
R
 
L
E
 
E
R
 
E
T
 
V
S
 
S
S
 
K
Y
|
Y
G
|
G
I
 
V
L
 
I
D
 
R
V
 
G
E
 
E
K
 
W
D
 
L
D
 
E
G
 
E
R
 
G
L
 
V
A
 
Y
T
 
E
V
 
I
R
 
K
G
 
D
L
 
M
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
N
P
 
Q
E
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
N
L
 
L
S
 
A
I
x
V
I
 
I
G
|
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
L
Q
 
T
P
 
P
E
 
D
V
 
I
F
 
F
D
 
E
H
 
I
L
 
L
E
 
S
K
 
E
Q
 
T
Q
 
K
R
 
P
G
 
G
A
 
K
G
 
N
N
 
N
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
I
T
|
T
D
 
D
A
 
A
M
 
L
A
 
R
K
 
T
L
 
Q
I
 
A
G
 
K
T
 
R
Q
 
K
P
 
R
F
 
I
H
 
I
G
 
A
L
 
Y
R
 
Q
F
 
F
E
 
K
G
 
G
T
 
K
R
|
R
Y
 
Y
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
S
K
 
V
V
 
E
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
A
T
 
S
L
 
N
A
 
A
H
 
Y
A
 
Y
L
 
K
R
 
K
R
 
R

6ikzB Udp-glucose pyrophosphorylase from acinetobacter baumanii
42% identity, 97% coverage: 5:285/289 of query aligns to 2:281/285 of 6ikzB

query
sites
6ikzB
V
 
I
R
 
K
K
 
K
V
 
A
V
 
V
F
 
L
P
|
P
V
|
V
A
|
A
G
|
G
L
|
L
G
|
G
T
|
T
R
|
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
S
I
 
I
P
 
P
K
|
K
E
 
E
M
 
M
L
 
V
P
 
T
L
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
R
P
 
P
L
 
A
L
 
I
Q
 
E
H
 
Y
A
 
V
V
 
V
E
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
E
D
 
Q
F
 
I
V
 
I
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
H
R
 
S
S
 
S
K
 
K
R
 
A
A
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
N
H
 
Y
F
 
F
D
 
D
T
 
R
D
 
N
T
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
E
R
 
T
T
 
T
L
 
L
E
 
E
E
 
Q
R
 
K
G
 
K
K
 
K
Q
 
F
D
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
A
V
 
E
V
 
I
R
 
-
D
 
-
S
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
V
P
 
P
G
 
E
R
 
H
-
 
V
-
 
S
C
 
V
F
 
I
Y
 
S
T
 
V
R
 
R
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
Q
P
|
P
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
W
 
L
C
 
C
A
 
A
R
 
K
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
G
N
 
E
D
 
D
P
 
D
F
 
F
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
 
L
P
|
P
D
|
D
D
 
V
F
 
L
V
 
V
Q
 
K
G
 
D
D
 
G
T
 
S
P
 
G
C
 
Q
-
 
N
-
 
D
L
 
L
K
 
S
Q
 
R
M
 
M
V
 
I
E
 
S
A
 
R
Y
 
Y
N
 
N
E
 
S
V
 
S
G
 
Q
G
 
A
N
 
A
I
 
Q
V
 
I
A
 
M
V
 
V
V
 
E
D
 
A
V
 
V
P
 
P
R
 
D
E
 
H
R
 
L
T
 
V
S
 
D
S
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
V
D
 
D
V
 
V
E
 
A
K
 
Q
-
 
S
-
 
P
D
 
N
D
 
E
G
 
G
R
 
E
L
 
S
A
 
I
T
 
A
V
 
M
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
V
 
V
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
P
P
 
V
E
 
G
E
 
A
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
N
L
 
L
S
 
S
I
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
L
Q
 
P
P
 
A
E
 
K
V
 
I
F
 
M
D
 
Q
H
 
L
L
 
L
E
 
E
K
 
N
Q
 
T
Q
 
P
R
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
N
 
-
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
M
L
 
L
I
 
Q
G
 
D
T
 
T
Q
 
D
P
 
T
F
 
V
H
 
E
G
 
A
L
 
Y
R
 
R
F
 
M
E
 
Q
G
 
G
T
 
Q
R
 
T
Y
 
F
D
 
D
C
 
C
G
 
G
D
 
S
K
 
K
V
 
L
G
 
G
F
 
Y
I
 
L
E
 
K
A
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
H
H
 
Y
A
 
G
L
 
L
R
 
E
R
 
H
P
 
P
D
 
K
M
 
L
A
 
G
D
 
M
K
 
E
V
 
F
R
 
K
D
 
Q
M
 
L
L
 
I

2pa4B Crystal structure of udp-glucose pyrophosphorylase from corynebacteria glutamicum in complex with magnesium and udp-glucose (see paper)
40% identity, 98% coverage: 5:287/289 of query aligns to 3:288/299 of 2pa4B

query
sites
2pa4B
V
 
V
R
 
K
K
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
V
P
|
P
V
x
A
A
|
A
G
|
G
L
 
L
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
K
A
 
T
I
 
V
P
 
P
K
|
K
E
|
E
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
V
D
 
D
R
 
T
P
 
P
L
 
G
L
 
I
Q
 
E
H
 
L
A
 
I
V
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
A
A
 
E
A
 
L
G
 
G
I
 
A
E
 
T
D
 
R
F
 
L
V
 
A
F
 
I
V
 
I
T
 
T
G
 
A
R
 
P
S
 
N
K
 
K
R
 
A
A
 
G
I
 
V
E
 
L
D
 
A
H
 
H
F
 
F
D
 
E
T
 
R
D
 
S
T
 
S
E
 
E
L
 
L
N
 
E
R
 
E
T
 
T
L
 
L
E
 
M
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
K
Q
 
T
D
 
D
A
 
Q
L
 
V
E
 
E
V
 
I
V
 
I
R
 
R
D
 
R
S
 
A
E
 
A
I
 
D
A
 
L
P
 
I
G
 
-
R
 
K
C
 
A
F
 
V
Y
 
P
T
 
V
R
 
T
Q
|
Q
Q
 
D
V
 
K
P
|
P
L
|
L
G
|
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
A
|
A
V
 
V
W
 
G
C
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
S
V
 
V
I
 
L
G
 
D
N
 
D
D
 
D
P
 
E
-
 
D
-
 
V
F
 
V
A
 
A
I
 
V
V
 
M
L
|
L
P
|
P
D
|
D
D
|
D
F
 
L
V
 
V
Q
 
L
G
 
-
D
 
P
T
 
T
P
 
G
C
 
V
L
 
M
K
 
E
Q
 
R
M
 
M
V
 
A
E
 
Q
A
 
V
Y
 
R
N
 
A
E
 
E
V
 
F
G
 
G
G
 
G
N
 
S
I
 
V
V
 
L
A
 
C
V
 
A
V
 
V
D
 
E
V
 
V
P
 
S
R
 
E
E
 
A
R
 
D
T
 
V
S
 
S
S
 
K
Y
|
Y
G
|
G
I
 
I
L
 
F
D
 
E
V
 
I
E
 
E
K
 
A
D
 
D
-
 
T
-
 
K
D
 
D
G
 
S
R
 
D
L
 
V
A
 
K
T
 
K
V
 
V
R
 
K
G
 
G
L
 
M
V
 
V
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
A
P
 
I
E
 
E
E
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
T
 
R
L
 
L
S
 
A
I
x
A
I
x
T
G
|
G
R
 
R
Y
 
Y
I
 
L
L
 
L
Q
 
D
P
 
R
E
 
K
V
 
I
F
 
F
D
 
D
H
 
A
L
 
L
E
 
R
K
 
R
Q
 
I
Q
 
T
R
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
N
 
G
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
D
A
 
A
M
 
I
A
 
D
K
 
L
L
 
L
I
 
I
G
 
D
T
 
E
-
 
G
Q
 
H
P
 
P
F
 
V
H
 
H
G
 
I
L
 
V
R
 
I
F
 
H
E
 
Q
G
 
G
T
 
K
R
|
R
Y
 
H
D
 
D
C
 
L
G
 
G
D
 
N
K
 
P
V
 
G
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
E
 
P
A
 
A
T
 
C
L
 
V
A
 
D
H
 
F
A
 
G
L
 
L
R
 
S
R
 
H
P
 
P
D
 
V
M
 
Y
A
 
G
D
 
A
K
 
Q
V
 
L
R
 
K
D
 
D
M
 
A
L
 
I
R
 
K
K
 
Q

6n0uA Crystal structure of a glucose-1-phosphate thymidylyltransferase from burkholderia phymatum bound to 2'-deoxy-thymidine-b-l-rhamnose
25% identity, 90% coverage: 6:266/289 of query aligns to 4:236/295 of 6n0uA

query
sites
6n0uA
R
 
R
K
 
K
V
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
x
A
A
x
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
I
T
 
T
K
 
H
A
 
V
I
 
V
P
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
Y
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
M
L
 
I
Q
 
Y
H
 
Y
A
 
P
V
 
L
E
 
S
E
 
T
A
 
L
R
 
M
A
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
R
D
 
D
F
 
V
V
 
L
F
 
I
V
 
I
T
 
S
G
 
T
R
 
P
S
 
Q
K
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
R
N
 
F
R
 
E
T
 
A
L
 
M
E
 
L
E
 
G
R
 
D
G
 
G
K
 
S
Q
 
Q
D
 
W
A
 
G
L
 
M
E
 
N
V
 
I
V
 
Q
R
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
C
 
-
F
 
-
Y
 
Y
T
 
A
R
 
V
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
S
P
|
P
L
x
D
G
|
G
L
|
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
W
 
I
C
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
E
V
 
F
I
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
D
P
 
P
F
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
I
L
|
L
P
 
G
D
|
D
D
 
N
F
 
I
V
 
F
Q
 
Y
G
 
G
D
 
H
T
 
D
P
 
-
C
 
L
L
 
A
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
V
 
E
E
 
R
A
 
A
Y
 
N
N
 
A
E
 
R
V
 
T
G
 
D
G
 
G
N
 
A
I
 
T
V
 
V
A
 
F
V
 
A
V
 
Y
D
 
H
V
 
V
P
 
-
R
 
-
E
 
H
R
 
D
T
 
P
S
 
E
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
I
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
F
E
 
D
K
 
K
D
 
D
D
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
F
R
 
R
G
 
A
L
 
L
V
 
S
E
 
I
K
 
E
P
x
E
K
|
K
P
 
P
E
 
A
E
 
K
A
 
P
P
 
R
S
 
S
T
 
N
L
 
Y
S
 
A
I
x
V
I
x
T
G
|
G
R
 
L
Y
|
Y
I
 
F
L
 
Y
Q
 
D
P
 
N
E
 
Q
V
 
V
F
 
C
D
 
D
H
 
I
L
 
A
E
 
A
K
 
D
Q
 
I
Q
 
K
R
 
P
G
 
S
A
 
A
G
x
R
N
 
G
E
|
E
I
 
L
Q
 
E
L
x
I
T
 
T
D
 
D
A
 
V
M
 
N
A
 
S
K
 
R
L
 
Y
I
 
L
G
 
-
T
 
S
Q
 
Q
P
 
K
F
 
T
H
 
L
G
 
D
L
 
V
R
 
E
F
 
I
E
 
M
G
 
G
T
 
R
R
 
G
Y
 
Y
-
 
A
-
x
W
-
 
L
D
 
D
C
 
T
G
 
G
D
 
T
K
 
H
V
 
D
G
 
S
F
 
L
I
 
I
E
 
E
A
 
A

5ifyA Crystal structure of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase from burkholderia vietnamiensis in complex with 2 -deoxyuridine-5'- monophosphate and 2'-deoxy-thymidine-b-l-rhamnose
24% identity, 81% coverage: 6:240/289 of query aligns to 2:206/293 of 5ifyA

query
sites
5ifyA
R
 
R
K
 
K
V
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
x
A
A
x
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
I
T
 
T
K
 
H
A
 
A
I
 
V
P
 
S
K
|
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
Y
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
M
L
 
I
Q
 
Y
H
 
Y
A
 
P
V
 
L
E
 
S
E
 
T
A
 
L
R
 
M
A
x
I
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
R
D
 
D
F
 
V
V
 
L
F
 
I
V
 
I
T
 
S
G
 
T
R
 
-
S
 
-
K
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
P
T
 
Q
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
R
N
 
F
R
 
E
T
 
S
L
 
M
E
 
L
E
 
G
R
 
D
G
 
G
K
 
S
Q
 
Q
D
 
W
A
 
G
L
 
M
E
 
N
V
 
I
V
 
Q
R
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
C
 
-
F
 
-
Y
 
Y
T
 
A
R
 
T
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
S
P
|
P
L
x
D
G
|
G
L
|
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
W
 
V
C
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
D
V
 
F
I
 
V
G
 
G
N
 
N
D
 
E
P
 
P
F
 
S
A
 
A
I
 
L
V
 
I
L
|
L
P
 
G
D
|
D
D
 
N
F
 
I
V
 
F
Q
x
Y
G
|
G
D
x
H
T
x
D
P
 
-
C
x
L
L
 
A
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
V
 
E
E
 
R
A
 
A
Y
 
S
N
 
A
E
 
K
V
 
D
G
 
T
G
 
G
N
 
A
I
 
T
V
 
V
A
 
F
V
 
A
V
 
Y
D
 
H
V
 
V
P
 
-
R
 
-
E
 
Q
R
 
D
T
 
P
S
 
E
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
I
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
F
E
 
D
K
 
R
D
 
E
D
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
F
R
 
R
G
 
A
L
 
I
V
 
S
E
 
I
K
 
E
P
x
E
K
|
K
P
 
P
E
 
A
E
 
K
A
 
P
P
 
R
S
 
S
T
 
S
L
 
Y
S
 
A
I
x
V
I
x
T
G
|
G
R
 
L
Y
|
Y
I
 
F
L
 
Y
Q
 
D
P
 
R
E
 
Q
V
 
V
F
 
C
D
 
D
H
 
I
L
 
A
E
 
A
K
 
D
Q
 
I
Q
 
K
R
 
P
G
 
S
A
 
A
G
x
R
N
 
G
E
|
E
I
 
L
Q
 
E
L
x
I
T
 
T
D
 
D
A
 
V
M
 
N
A
 
S
K
 
R
L
 
Y
I
 
L

Sites not aligning to the query:

1h5tA Thymidylyltransferase complexed with thymidylyldiphosphate-glucose (see paper)
28% identity, 80% coverage: 5:234/289 of query aligns to 2:201/290 of 1h5tA

query
sites
1h5tA
V
 
M
R
 
R
K
 
K
V
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
x
A
A
x
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
I
 
V
P
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
M
L
 
I
Q
 
Y
H
 
Y
A
 
P
V
 
L
E
 
S
E
 
T
A
 
L
R
 
M
A
x
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
R
D
 
D
F
 
I
V
 
L
F
 
I
V
 
I
T
 
S
G
 
T
R
 
P
S
 
Q
K
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
R
N
 
F
R
 
Q
T
 
Q
L
 
L
E
 
L
E
 
G
R
 
D
G
 
G
K
 
S
Q
 
Q
D
 
W
A
 
G
L
 
L
E
 
N
V
 
L
V
 
Q
R
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
C
 
-
F
 
-
Y
 
Y
T
 
K
R
 
V
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
S
P
|
P
L
x
D
G
|
G
L
|
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
W
 
I
C
 
I
A
 
G
R
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
G
D
 
D
P
 
D
F
 
C
A
 
A
I
 
L
V
 
V
L
|
L
P
 
G
D
|
D
D
 
N
F
 
I
V
 
F
Q
x
Y
G
|
G
-
x
H
D
|
D
T
x
L
P
|
P
C
 
-
L
 
-
K
 
K
Q
 
L
M
 
M
V
 
E
E
 
A
A
 
A
Y
 
V
N
 
N
E
 
K
V
 
E
G
 
S
G
 
G
N
 
A
I
 
T
V
 
V
A
 
F
V
 
A
V
 
Y
D
 
H
V
 
V
P
 
-
R
 
-
E
 
N
R
 
D
T
 
P
S
 
E
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
I
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
F
E
 
D
K
 
K
D
 
N
D
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
G
T
 
T
V
 
A
R
 
I
G
 
S
L
 
L
V
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
P
 
-
E
 
-
E
 
E
A
 
P
P
 
K
S
 
S
T
 
N
L
 
Y
S
 
A
I
x
V
I
 
T
G
 
G
R
 
L
Y
|
Y
I
 
F
L
 
Y
Q
 
D
P
 
N
E
 
D
V
 
V
F
 
V
D
 
Q
H
 
M
L
 
A
E
 
K
K
 
N
Q
 
L
Q
 
K
R
 
P
G
 
S
A
 
A
G
x
R
N
 
G
E
|
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1h5rA Thymidylyltransferase complexed with thimidine and glucose-1-phospate (see paper)
28% identity, 80% coverage: 5:234/289 of query aligns to 2:201/290 of 1h5rA

query
sites
1h5rA
V
 
M
R
 
R
K
 
K
V
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
x
A
A
x
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
I
 
V
P
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
M
L
 
I
Q
 
Y
H
 
Y
A
 
P
V
 
L
E
 
S
E
 
T
A
 
L
R
 
M
A
x
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
R
D
 
D
F
 
I
V
 
L
F
 
I
V
 
I
T
 
S
G
 
T
R
 
P
S
 
Q
K
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
R
N
 
F
R
 
Q
T
 
Q
L
 
L
E
 
L
E
 
G
R
 
D
G
 
G
K
 
S
Q
 
Q
D
 
W
A
 
G
L
 
L
E
 
N
V
 
L
V
 
Q
R
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
C
 
-
F
 
-
Y
 
Y
T
 
K
R
 
V
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
S
P
|
P
L
x
D
G
|
G
L
|
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
W
 
I
C
 
I
A
 
G
R
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
G
D
 
D
P
 
D
F
 
C
A
 
A
I
 
L
V
 
V
L
|
L
P
 
G
D
|
D
D
 
N
F
 
I
V
 
F
Q
x
Y
G
|
G
-
 
H
D
 
D
T
x
L
P
 
P
C
 
-
L
 
-
K
 
K
Q
 
L
M
 
M
V
 
E
E
 
A
A
 
A
Y
 
V
N
 
N
E
 
K
V
 
E
G
 
S
G
 
G
N
 
A
I
 
T
V
 
V
A
 
F
V
 
A
V
 
Y
D
 
H
V
 
V
P
 
-
R
 
-
E
 
N
R
 
D
T
 
P
S
 
E
S
 
R
Y
|
Y
G
|
G
I
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
F
E
 
D
K
 
K
D
 
N
D
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
G
T
 
T
V
 
A
R
 
I
G
 
S
L
 
L
V
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
P
 
-
E
 
-
E
 
E
A
 
P
P
 
K
S
 
S
T
 
N
L
 
Y
S
 
A
I
x
V
I
x
T
G
|
G
R
 
L
Y
|
Y
I
 
F
L
 
Y
Q
 
D
P
 
N
E
 
D
V
 
V
F
 
V
D
 
Q
H
 
M
L
 
A
E
 
K
K
 
N
Q
 
L
Q
 
K
R
 
P
G
 
S
A
 
A
G
 
R
N
 
G
E
|
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1h5sB Thymidylyltransferase complexed with tmp (see paper)
28% identity, 80% coverage: 5:234/289 of query aligns to 3:202/291 of 1h5sB

query
sites
1h5sB
V
 
M
R
 
R
K
 
K
V
 
G
V
 
I
F
 
I
P
x
L
V
 
A
A
x
G
G
|
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
I
 
V
P
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
M
L
 
I
Q
 
Y
H
 
Y
A
 
P
V
 
L
E
 
S
E
 
T
A
 
L
R
 
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
R
D
 
D
F
 
I
V
 
L
F
 
I
V
 
I
T
 
S
G
 
T
R
 
P
S
 
Q
K
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
R
N
 
F
R
 
Q
T
 
Q
L
 
L
E
 
L
E
 
G
R
 
D
G
 
G
K
 
S
Q
 
Q
D
 
W
A
 
G
L
 
L
E
 
N
V
 
L
V
 
Q
R
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
C
 
-
F
 
-
Y
 
Y
T
 
K
R
 
V
Q
|
Q
Q
 
P
V
 
S
P
|
P
L
x
D
G
|
G
L
|
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
W
 
I
C
 
I
A
 
G
R
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
G
D
 
D
P
 
D
F
 
C
A
 
A
I
 
L
V
 
V
L
 
L
P
 
G
D
|
D
D
 
N
F
 
I
V
 
F
Q
x
Y
G
|
G
-
x
H
D
|
D
T
 
L
P
 
P
C
 
-
L
 
-
K
 
K
Q
 
L
M
 
M
V
 
E
E
 
A
A
 
A
Y
 
V
N
 
N
E
 
K
V
 
E
G
 
S
G
 
G
N
 
A
I
 
T
V
 
V
A
 
F
V
 
A
V
 
Y
D
 
H
V
 
V
P
 
-
R
 
-
E
 
N
R
 
D
T
 
P
S
 
E
S
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
F
E
 
D
K
 
K
D
 
N
D
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
G
T
 
T
V
 
A
R
 
I
G
 
S
L
 
L
V
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
P
 
-
E
 
-
E
 
E
A
 
P
P
 
K
S
 
S
T
 
N
L
 
Y
S
 
A
I
 
V
I
 
T
G
 
G
R
 
L
Y
 
Y
I
 
F
L
 
Y
Q
 
D
P
 
N
E
 
D
V
 
V
F
 
V
D
 
Q
H
 
M
L
 
A
E
 
K
K
 
N
Q
 
L
Q
 
K
R
 
P
G
 
S
A
 
A
G
 
R
N
 
G
E
|
E
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
T
 
T
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P26393 Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase; dTDP-glucose pyrophosphorylase; Ep; dTDP-glucose synthase; EC 2.7.7.24 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
27% identity, 80% coverage: 5:234/289 of query aligns to 3:202/292 of P26393

query
sites
P26393
V
 
T
R
 
R
K
 
K
V
 
G
V
 
I
F
 
I
P
 
L
V
 
A
A
 
G
G
 
G
L
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
P
 
P
A
 
V
T
 
T
K
 
M
A
 
A
I
 
V
P
 
S
K
 
K
E
 
Q
M
 
L
L
 
L
P
 
P
L
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
 
K
P
 
P
L
 
M
L
 
I
Q
 
Y
H
 
Y
A
 
P
V
 
L
E
 
S
E
 
T
A
 
L
R
 
M
A
 
L
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
R
D
 
D
F
 
I
V
 
L
F
 
I
V
 
I
T
 
S
G
 
T
R
 
P
S
 
Q
K
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
H
 
-
F
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
R
N
 
F
R
 
Q
T
 
Q
L
 
L
E
 
L
E
 
G
R
 
D
G
 
G
K
 
S
Q
 
Q
D
 
W
A
 
G
L
 
L
E
 
N
V
 
L
V
 
Q
R
 
-
D
 
-
S
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
C
 
-
F
 
-
Y
 
Y
T
 
K
R
 
V
Q
 
Q
Q
 
P
V
 
S
P
 
P
L
 
D
G
 
G
L
 
L
G
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
F
W
 
I
C
 
I
A
 
G
R
 
E
A
 
E
V
 
F
I
 
I
G
 
G
N
 
H
D
 
D
P
 
D
F
 
C
A
 
A
I
 
L
V
 
V
L
 
L
P
 
G
D
 
D
D
 
N
F
 
I
V
 
F
Q
 
Y
G
 
G
-
 
H
D
 
D
T
 
L
P
 
P
C
 
-
L
 
-
K
 
K
Q
 
L
M
 
M
V
 
E
E
 
A
A
 
A
Y
 
V
N
 
N
E
 
K
V
 
E
G
 
S
G
 
G
N
 
A
I
 
T
V
 
V
A
 
F
V
 
A
V
 
Y
D
 
H
V
 
V
P
 
-
R
 
-
E
 
N
R
 
D
T
 
P
S
 
E
S
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
F
E
 
D
K
 
Q
D
 
K
D
 
-
G
 
-