SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_138 Gluconolactonase to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8dk0A Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound (s)gamma- valerolactone (see paper)
31% identity, 85% coverage: 42:302/307 of query aligns to 11:289/293 of 8dk0A

query
sites
8dk0A
S
 
A
F
|
F
L
 
P
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
V
D
 
M
G
 
P
V
 
D
G
 
G
N
 
S
L
 
V
Y
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
E
I
 
I
P
 
R
W
 
A
G
 
Q
R
 
Q
I
 
L
F
 
T
R
 
R
I
 
V
D
 
W
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
A
 
R
W
 
K
T
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
V
D
 
P
G
 
G
E
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
M
 
A
K
 
A
F
 
L
M
 
G
D
 
P
A
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
T
 
C
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
W
-
 
M
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
H
D
 
E
Y
 
Y
K
 
I
N
 
G
G
 
G
-
 
S
L
 
I
M
 
Q
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
G
 
E
V
 
V
T
 
E
P
 
T
Y
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
K
R
 
C
N
 
G
S
 
E
E
 
H
R
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
K
D
 
H
G
 
G
N
 
G
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
Q
 
K
S
 
R
G
 
R
L
 
A
H
 
R
D
 
D
P
 
M
S
 
D
-
 
V
G
 
G
R
 
A
L
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
I
R
 
K
P
 
P
N
 
G
G
 
M
Q
 
T
-
 
E
-
 
I
L
 
T
D
 
E
L
 
Q
L
 
V
L
 
F
A
 
G
N
 
T
V
 
L
P
 
P
S
 
L
P
 
-
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
V
 
T
L
 
M
Y
 
Y
L
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
T
R
 
P
G
 
T
N
 
G
C
 
R
V
 
L
W
 
W
R
 
A
V
 
F
P
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
G
D
 
P
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
K
K
 
P
V
 
K
G
 
G
Q
 
K
F
 
P
F
 
I
T
 
C
S
 
G
H
 
L
G
 
G
P
 
G
S
 
Y
G
 
Q
P
 
M
-
 
F
D
|
D
G
x
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
N
L
 
V
L
 
C
V
 
V
A
 
A
N
 
T
P
 
L
G
 
V
L
 
S
G
 
G
Y
 
C
V
 
I
W
 
S
V
 
V
L
 
I
N
 
-
H
 
-
R
 
A
A
 
P
E
 
D
P
 
G
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
E
R
 
Q
G
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
A
 
D
S
 
R
-
 
V
T
 
T
T
|
T
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
D
G
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
D
 
L
S
 
S
T
 
G
H
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
I
C
 
A
A
 
M
R
 
D
L
 
W
D
 
S
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
N

8djzA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound product (see paper)
31% identity, 85% coverage: 42:302/307 of query aligns to 11:289/293 of 8djzA

query
sites
8djzA
S
 
A
F
 
F
L
 
P
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
V
D
 
M
G
 
P
V
 
D
G
 
G
N
 
S
L
 
V
Y
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
E
I
 
I
P
 
R
W
 
A
G
 
Q
R
 
Q
I
 
L
F
 
T
R
 
R
I
 
V
D
 
W
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
A
 
R
W
 
K
T
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
V
D
 
P
G
 
G
E
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
M
 
A
K
 
A
F
 
L
M
 
G
D
 
P
A
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
T
 
C
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
W
-
 
M
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
H
D
 
E
Y
 
Y
K
 
I
N
 
G
G
 
G
-
 
S
L
 
I
M
 
Q
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
G
 
E
V
 
V
T
 
E
P
 
T
Y
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
K
R
 
C
N
 
G
S
 
E
E
 
H
R
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
K
D
 
H
G
 
G
N
 
G
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
Q
 
K
S
 
R
G
 
R
L
 
A
H
 
R
D
 
D
P
 
M
S
 
D
-
 
V
G
 
G
R
 
A
L
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
I
R
 
K
P
 
P
N
 
G
G
 
M
Q
 
T
-
 
E
-
 
I
L
 
T
D
 
E
L
 
Q
L
 
V
L
 
F
A
 
G
N
 
T
V
 
L
P
 
P
S
 
L
P
 
-
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
V
 
T
L
 
M
Y
 
Y
L
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
T
R
 
P
G
 
T
N
 
G
C
 
R
V
 
L
W
 
W
R
 
A
V
 
F
P
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
G
D
 
P
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
K
K
 
P
V
 
K
G
 
G
Q
 
K
F
 
P
F
 
I
T
 
C
S
 
G
H
 
L
G
 
G
P
 
G
S
 
Y
G
 
Q
P
 
M
-
 
F
D
|
D
G
x
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
N
L
 
V
L
 
C
V
 
V
A
 
A
N
 
T
P
 
L
G
 
V
L
 
S
G
 
G
Y
 
C
V
 
I
W
 
S
V
 
V
L
 
I
N
 
-
H
 
-
R
 
A
A
 
P
E
 
D
P
 
G
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
E
R
 
Q
G
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
A
 
D
S
 
R
-
 
V
T
 
T
T
 
T
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
D
G
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
D
 
L
S
 
S
T
 
G
H
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
I
C
 
A
A
 
M
R
 
D
L
 
W
D
 
S
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
N

8djfA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound tetrahedral intermediate (see paper)
31% identity, 85% coverage: 42:302/307 of query aligns to 11:289/293 of 8djfA

query
sites
8djfA
S
 
A
F
 
F
L
 
P
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
V
D
 
M
G
 
P
V
 
D
G
 
G
N
 
S
L
 
V
Y
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
E
I
 
I
P
 
R
W
 
A
G
 
Q
R
 
Q
I
 
L
F
 
T
R
 
R
I
 
V
D
 
W
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
A
 
R
W
 
K
T
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
V
D
 
P
G
 
G
E
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
M
 
A
K
 
A
F
 
L
M
 
G
D
 
P
A
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
T
 
C
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
W
-
 
M
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
H
D
 
E
Y
 
Y
K
 
I
N
 
G
G
 
G
-
 
S
L
 
I
M
 
Q
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
G
 
E
V
 
V
T
 
E
P
 
T
Y
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
K
R
 
C
N
 
G
S
 
E
E
 
H
R
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
K
D
 
H
G
 
G
N
 
G
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
Q
 
K
S
 
R
G
 
R
L
 
A
H
 
R
D
 
D
P
 
M
S
 
D
-
 
V
G
 
G
R
 
A
L
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
I
R
 
K
P
 
P
N
 
G
G
 
M
Q
 
T
-
 
E
-
 
I
L
 
T
D
 
E
L
 
Q
L
 
V
L
 
F
A
 
G
N
 
T
V
 
L
P
 
P
S
 
L
P
 
-
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
V
 
T
L
 
M
Y
 
Y
L
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
T
R
 
P
G
 
T
N
 
G
C
 
R
V
 
L
W
 
W
R
 
A
V
 
F
P
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
G
D
 
P
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
K
K
 
P
V
 
K
G
 
G
Q
 
K
F
 
P
F
 
I
T
 
C
S
 
G
H
 
L
G
 
G
P
 
G
S
 
Y
G
 
Q
P
 
M
-
 
F
D
|
D
G
x
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
N
L
 
V
L
 
C
V
 
V
A
 
A
N
 
T
P
 
L
G
 
V
L
 
S
G
 
G
Y
 
C
V
 
I
W
 
S
V
 
V
L
 
I
N
 
-
H
 
-
R
 
A
A
 
P
E
 
D
P
 
G
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
E
R
 
Q
G
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
A
 
D
S
 
R
-
 
V
T
 
T
T
 
T
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
D
G
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
D
 
L
S
 
S
T
 
G
H
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
I
C
 
A
A
 
M
R
 
D
L
 
W
D
 
S
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
N

7risA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound phosphate (see paper)
31% identity, 85% coverage: 42:302/307 of query aligns to 9:289/293 of 7risA

query
sites
7risA
S
 
A
F
 
F
L
 
P
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
V
D
 
M
G
 
P
V
 
D
G
 
G
N
 
S
L
 
V
Y
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
E
I
 
I
P
 
R
W
 
A
G
 
Q
R
 
Q
I
 
L
F
 
T
R
 
R
I
 
V
D
 
W
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
A
 
R
W
 
K
T
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
V
D
 
P
G
 
G
E
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
M
 
A
K
 
A
F
 
L
M
 
G
D
 
P
A
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
T
 
C
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
H
D
 
E
Y
 
Y
K
 
I
N
 
G
G
 
G
-
 
S
L
 
I
M
 
Q
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
G
 
E
V
 
V
T
 
E
P
 
T
Y
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
K
R
 
C
N
 
G
S
 
E
E
 
H
R
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
K
D
 
H
G
 
G
N
 
G
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
Q
 
K
S
 
R
G
 
R
L
 
A
H
 
R
D
 
D
P
 
M
S
 
D
-
 
V
G
 
G
R
 
A
L
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
I
R
 
K
P
 
P
N
 
G
G
 
M
Q
 
T
-
 
E
-
 
I
L
 
T
D
 
E
L
 
Q
L
 
V
L
 
F
A
 
G
N
 
T
V
 
L
P
 
P
S
 
L
P
 
-
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
V
 
T
L
 
M
Y
 
Y
L
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
T
R
 
P
G
 
T
N
 
G
C
 
R
V
 
L
W
 
W
R
 
A
V
 
F
P
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
G
D
 
P
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
K
-
 
P
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
E
K
 
K
V
 
G
G
 
K
Q
 
P
F
 
I
F
 
C
T
 
G
S
 
L
H
 
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
Q
G
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
N
L
 
V
L
 
C
V
 
V
A
 
A
N
 
T
P
 
L
G
 
V
L
 
S
G
 
G
Y
 
C
V
 
I
W
 
S
V
 
V
L
 
I
N
 
-
H
 
-
R
 
A
A
 
P
E
 
D
P
 
G
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
E
R
 
Q
G
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
A
 
D
S
 
R
-
 
V
T
 
T
T
|
T
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
D
G
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
D
 
L
S
 
S
T
 
G
H
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
I
C
 
A
A
 
M
R
 
D
L
 
W
D
 
S
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
N

2dsoC Crystal structure of d138n mutant of drp35, a 35kda drug responsive protein from staphylococcus aureus (see paper)
29% identity, 74% coverage: 30:255/307 of query aligns to 34:263/323 of 2dsoC

query
sites
2dsoC
W
 
W
A
 
L
D
 
E
A
 
I
N
 
S
R
 
K
G
 
K
G
 
G
T
 
L
V
 
Q
T
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
L
E
|
E
G
 
G
P
 
L
V
 
N
F
 
F
D
 
D
G
 
R
V
 
Q
G
 
G
N
 
Q
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
T
 
L
D
 
D
I
 
V
P
 
F
W
 
E
G
 
G
R
 
N
I
 
I
F
 
F
R
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
G
 
T
A
 
K
W
 
E
T
 
I
L
 
K
-
 
R
-
 
P
V
 
F
A
 
V
E
 
S
Y
 
H
D
 
K
G
 
A
E
 
N
P
 
P
N
 
A
G
 
A
M
 
I
K
 
K
F
 
I
M
 
H
D
 
K
A
 
D
G
 
G
T
 
R
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
C
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
K
N
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
-
A
x
S
T
|
T
G
|
G
G
 
G
V
 
I
T
 
-
P
 
-
Y
 
F
L
 
A
E
 
A
R
 
T
R
 
E
N
 
N
S
 
G
E
 
D
R
 
N
F
 
L
K
 
Q
G
 
D
V
 
I
-
 
I
-
 
E
-
x
D
-
 
L
-
 
S
-
x
T
-
x
A
-
x
Y
-
 
C
-
 
I
N
|
N
D
 
D
L
 
M
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
S
D
 
K
G
 
G
N
 
G
L
 
F
Y
 
Y
F
 
F
T
 
T
D
 
D
-
 
F
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Y
S
 
S
G
 
T
L
 
-
H
 
-
D
 
N
P
 
P
S
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
V
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
V
R
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
F
Q
 
R
-
 
T
L
 
V
D
 
T
L
 
P
L
 
I
L
 
I
A
 
Q
N
 
N
V
 
I
P
 
S
S
 
V
P
 
A
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
T
D
 
D
G
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
L
Y
 
W
L
 
V
A
 
T
A
 
E
T
 
T
R
 
T
G
 
A
N
 
N
C
 
R
V
 
L
W
 
H
R
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
L
 
E
P
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
V
V
 
T
-
 
I
-
 
Q
-
 
P
-
 
F
-
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
I
G
 
P
Q
 
Y
F
 
Y
F
 
F
T
 
T
S
 
G
H
 
H
G
 
-
P
 
-
S
 
E
G
 
G
P
 
P
D
|
D
G
x
S
L
 
C
A
 
C
V
 
I
D
 
D
T
 
S
S
 
D
G
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
M
P
 
Y
G
 
G
L
 
Q
G
 
G
Y
 
R
V
 
V
W
 
L
V
 
V
L
 
F
N
 
N
H
 
K
R
 
R
A
 
G
E
 
Y
P
 
P
V
 
I

7rizA Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound 2-hydroxyquinoline (see paper)
29% identity, 85% coverage: 42:302/307 of query aligns to 9:302/306 of 7rizA

query
sites
7rizA
S
 
A
F
 
F
L
 
P
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
V
D
 
M
G
 
P
V
 
D
G
 
G
N
 
S
L
 
V
Y
 
V
V
 
L
T
 
V
D
 
E
I
 
I
P
 
R
W
 
A
G
 
Q
R
 
Q
I
 
L
F
 
T
R
 
R
I
 
V
D
 
W
P
 
P
Q
 
D
G
 
G
A
 
R
W
 
K
T
 
E
L
 
V
V
 
V
A
 
A
E
 
K
Y
 
V
D
 
P
G
 
G
E
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
M
 
A
K
 
A
F
 
L
M
 
G
D
 
P
A
 
D
G
 
G
T
 
K
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
T
 
C
-
 
N
-
 
N
-
 
G
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
W
-
 
F
-
 
P
-
 
S
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
M
-
 
M
-
x
P
-
 
G
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
H
D
 
E
Y
 
Y
K
 
I
N
 
G
G
 
G
-
 
S
L
 
I
M
 
Q
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
L
A
 
Q
T
 
S
G
 
G
G
 
E
V
 
V
T
 
E
P
 
T
Y
 
L
L
 
F
E
 
D
R
 
K
R
 
C
N
 
G
S
 
E
E
 
H
R
 
P
F
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
K
D
 
H
G
 
G
N
 
G
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Q
 
L
G
 
G
Q
 
K
S
 
R
G
 
R
L
 
A
H
 
R
D
 
D
P
 
M
S
 
D
-
 
V
G
 
G
R
 
A
L
 
A
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
I
R
 
K
P
 
P
N
 
G
G
 
M
Q
 
T
-
 
E
-
 
I
L
 
T
D
 
E
L
 
Q
L
 
V
L
 
F
A
 
G
N
 
T
V
 
L
P
 
P
S
 
L
P
 
-
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
G
L
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
A
V
 
T
L
 
M
Y
 
Y
L
 
A
A
 
A
A
 
E
T
 
T
R
 
P
G
 
T
N
 
G
C
 
R
V
 
L
W
 
W
R
 
A
V
 
F
P
 
D
L
 
L
L
 
S
P
 
G
D
 
P
G
 
G
S
 
E
V
 
V
A
 
K
K
 
P
V
 
R
G
 
D
Q
 
V
F
 
I
F
 
Y
T
 
R
S
 
G
H
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
C
-
 
G
-
 
L
-
 
G
G
 
G
P
 
Y
S
 
Q
G
 
M
P
 
F
D
|
D
G
x
S
L
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
E
T
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
N
L
 
V
L
 
C
V
 
V
A
 
A
N
 
T
P
 
L
G
 
V
L
 
S
G
 
G
Y
 
C
V
 
I
W
 
S
V
 
V
L
 
I
N
 
-
H
 
-
R
 
A
A
 
P
E
 
D
P
 
G
V
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
E
R
 
Q
G
 
V
P
 
P
A
 
T
G
 
G
A
 
D
S
 
R
-
 
V
T
 
T
T
 
T
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
D
G
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
A
F
 
Y
V
 
I
T
 
T
D
 
L
S
 
S
T
 
G
H
 
K
G
 
G
H
 
E
I
 
L
L
 
I
C
 
A
A
 
M
R
 
D
L
 
W
D
 
S
A
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
N

Q99QV3 Lactonase drp35; EC 3.1.1.- from Staphylococcus aureus (strain Mu50 / ATCC 700699) (see paper)
29% identity, 74% coverage: 30:255/307 of query aligns to 36:265/324 of Q99QV3

query
sites
Q99QV3
W
 
W
A
 
L
D
 
E
A
 
I
N
 
S
R
 
K
G
 
K
G
 
G
T
 
L
V
 
Q
T
 
-
D
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
L
E
|
E
G
 
G
P
 
L
V
 
N
F
 
F
D
 
D
G
 
R
V
 
Q
G
 
G
N
 
Q
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
T
 
L
D
 
D
I
 
V
P
x
F
W
 
E
G
 
G
R
 
N
I
 
I
F
 
F
R
 
K
I
 
I
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
G
 
T
A
 
K
W
 
E
T
 
I
L
 
K
-
 
R
-
 
P
V
 
F
A
 
V
E
 
S
Y
 
H
D
 
K
G
 
A
E
 
N
P
 
P
N
 
A
G
 
A
M
 
I
K
|
K
F
 
I
M
 
H
D
 
K
A
 
D
G
 
G
T
 
R
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
C
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
D
 
D
Y
 
F
K
 
K
N
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
I
 
-
A
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
I
T
 
-
P
 
-
Y
 
F
L
 
A
E
 
A
R
 
T
R
 
E
N
 
N
S
 
G
E
 
D
R
 
N
F
 
L
K
 
Q
G
 
D
V
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
Y
-
 
C
-
 
I
N
x
D
D
|
D
L
 
M
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
S
D
 
K
G
 
G
N
 
G
L
 
F
Y
 
Y
F
 
F
T
 
T
D
|
D
-
 
F
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Y
S
 
S
G
 
T
L
 
-
H
 
-
D
 
N
P
 
P
S
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
V
Y
 
Y
R
 
Y
L
 
V
R
 
S
P
 
P
N
 
D
G
 
F
Q
 
R
-
 
T
L
 
V
D
 
T
L
 
P
L
 
I
L
 
I
A
 
Q
N
 
N
V
 
I
P
 
S
S
 
V
P
 
A
N
|
N
G
|
G
V
 
I
A
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
T
D
 
D
G
 
E
R
 
K
V
 
V
L
 
L
Y
 
W
L
 
V
A
 
T
A
 
E
T
 
T
R
 
T
G
 
A
N
 
N
C
 
R
V
 
L
W
 
H
R
 
R
V
 
I
P
 
A
L
 
L
L
 
E
P
 
D
D
 
D
G
 
G
S
 
V
V
 
T
-
 
I
-
 
Q
-
 
P
-
 
F
-
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
I
G
 
P
Q
 
Y
F
 
Y
F
 
F
T
 
T
S
 
G
H
 
H
G
 
-
P
 
-
S
 
E
G
 
G
P
 
P
D
|
D
G
x
S
L
x
C
A
 
C
V
 
I
D
 
D
T
 
S
S
 
D
G
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
Y
V
 
V
A
 
A
N
 
M
P
 
Y
G
 
G
L
 
Q
G
 
G
Y
 
R
V
 
V
W
 
L
V
 
V
L
 
F
N
 
N
H
 
K
R
 
R
A
 
G
E
 
Y
P
 
P
V
 
I

Sites not aligning to the query:

2gvvA Structure of diisopropyl fluorophosphatase (dfpase) in complex with dicyclopentylphosphoroamidate (dcppa) (see paper)
30% identity, 85% coverage: 45:306/307 of query aligns to 19:307/309 of 2gvvA

query
sites
2gvvA
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
F
D
 
D
G
 
K
V
 
N
G
 
G
N
 
D
L
 
F
Y
 
Y
-
 
I
-
 
V
-
 
A
-
x
P
-
x
E
-
 
V
-
 
E
V
 
V
T
 
N
D
 
G
I
 
K
P
 
P
W
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
I
F
 
L
R
 
R
I
 
I
D
 
D
-
 
L
P
 
K
Q
 
T
G
 
G
A
 
K
W
 
K
T
 
T
L
 
V
V
 
I
A
 
C
E
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
G
Y
 
Y
D
 
G
G
 
G
E
 
I
P
 
P
N
 
A
G
 
G
M
 
C
K
 
Q
F
 
C
-
 
D
M
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
N
T
 
Q
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
M
K
 
R
N
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
-
R
 
-
L
 
L
D
 
V
I
 
V
A
 
Q
T
 
T
G
 
D
G
 
G
V
 
T
T
 
F
P
 
E
Y
 
E
L
 
I
E
 
A
R
 
K
R
 
K
N
 
D
S
 
S
E
 
E
-
 
G
-
 
R
R
 
R
F
 
M
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
N
|
N
D
 
D
L
 
C
I
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
Y
D
 
E
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
W
F
 
I
T
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
A
D
 
D
Q
 
Y
G
 
T
Q
 
R
S
 
S
G
 
-
L
 
M
H
 
Q
D
 
E
P
 
K
S
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
I
Y
 
Y
R
 
C
L
 
F
R
 
T
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
Q
L
 
M
D
 
I
L
 
Q
L
 
V
L
 
D
A
 
T
N
 
A
V
 
F
P
 
Q
S
 
F
P
 
P
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
V
S
 
R
P
 
H
-
 
M
-
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
R
-
 
P
-
 
Y
V
 
Q
L
 
L
Y
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
 
T
R
 
P
G
 
T
N
 
K
C
 
K
V
 
L
W
 
W
R
 
S
V
 
Y
P
 
D
L
 
I
L
 
K
P
 
G
D
 
P
G
 
A
S
 
K
V
 
I
-
 
E
-
 
N
A
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
W
Q
 
G
F
 
H
F
 
I
T
 
P
S
 
G
H
 
T
G
 
H
P
 
E
S
 
G
G
 
G
P
 
A
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
x
D
V
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
D
G
 
N
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
P
x
W
G
 
G
L
 
S
G
 
S
Y
 
H
V
 
I
W
 
E
V
 
V
L
 
F
N
 
G
-
 
P
H
 
D
R
 
G
A
 
G
E
 
Q
P
 
P
V
 
K
L
 
M
V
 
R
L
 
I
R
 
R
G
 
C
P
 
P
A
 
F
G
 
-
A
 
E
S
 
K
T
 
P
T
 
S
N
 
N
L
|
L
A
x
H
F
 
F
G
 
K
G
 
P
Q
 
Q
G
 
-
G
 
T
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
D
 
E
S
x
H
T
 
E
H
 
N
G
 
N
H
 
A
I
 
V
L
 
W
C
 
K
A
 
F
R
 
E
L
 
W
D
 
Q
A
 
R
P
 
N
G
 
G
L
 
K
P
 
K
L
 
Q
H
 
Y
C
 
C
S
 
E
T
 
T
L
 
L

3o4pA Dfpase at 0.85 angstrom resolution (h atoms included) (see paper)
30% identity, 85% coverage: 45:306/307 of query aligns to 21:309/314 of 3o4pA

query
sites
3o4pA
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
F
D
 
D
G
 
K
V
 
N
G
 
G
N
 
D
L
 
F
Y
 
Y
-
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
x
E
-
 
V
-
 
E
V
 
V
T
 
N
D
 
G
I
 
K
P
 
P
W
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
I
F
 
L
R
 
R
I
 
I
D
 
D
-
 
L
P
 
K
Q
 
T
G
 
G
A
 
K
W
 
K
T
 
T
L
 
V
V
 
I
A
 
C
E
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
G
Y
 
Y
D
 
G
G
 
G
E
 
I
P
 
P
N
 
A
G
 
G
M
 
C
K
 
Q
F
 
C
-
 
D
M
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
N
T
 
Q
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
M
K
 
R
N
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
-
R
 
-
L
 
L
D
 
V
I
 
V
A
 
Q
T
 
T
G
 
D
G
 
G
V
 
T
T
 
F
P
 
E
Y
 
E
L
 
I
E
 
A
R
 
K
R
 
K
N
 
D
S
 
S
E
 
E
-
 
G
-
 
R
R
 
R
F
 
M
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
N
|
N
D
 
D
L
 
C
I
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
Y
D
 
E
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
W
F
 
I
T
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
A
D
 
D
Q
 
Y
G
 
T
Q
 
R
S
 
S
G
 
-
L
 
M
H
 
Q
D
 
E
P
x
K
S
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
I
Y
 
Y
R
 
C
L
 
F
R
 
T
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
Q
L
 
M
D
 
I
L
 
Q
L
 
V
L
 
D
A
 
T
N
x
A
V
x
F
P
 
Q
S
 
F
P
 
P
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
V
S
 
R
P
 
H
-
 
M
-
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
R
-
 
P
-
 
Y
V
 
Q
L
 
L
Y
 
I
L
 
V
A
 
A
A
x
E
T
 
T
R
 
P
G
 
T
N
 
K
C
 
K
V
 
L
W
 
W
R
 
S
V
 
Y
P
 
D
L
 
I
L
 
K
P
 
G
D
 
P
G
 
A
S
 
K
V
 
I
-
 
E
-
 
N
A
x
K
K
 
K
V
 
V
G
 
W
Q
 
G
F
 
H
F
 
I
T
 
P
S
 
G
H
 
T
G
 
H
P
 
E
S
 
G
G
 
G
P
 
A
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
x
D
V
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
D
G
 
N
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
P
x
W
G
 
G
L
 
S
G
 
S
Y
 
H
V
 
I
W
 
E
V
 
V
L
 
F
N
 
G
-
 
P
H
 
D
R
 
G
A
 
G
E
 
Q
P
 
P
V
 
K
L
 
M
V
 
R
L
 
I
R
 
R
G
 
C
P
 
P
A
 
F
G
 
-
A
 
E
S
x
K
T
 
P
T
 
S
N
 
N
L
|
L
A
x
H
F
 
F
G
 
K
G
 
P
Q
 
Q
G
 
-
G
 
T
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
D
 
E
S
x
H
T
 
E
H
 
N
G
 
N
H
 
A
I
 
V
L
 
W
C
 
K
A
 
F
R
x
E
L
x
W
D
 
Q
A
 
R
P
 
N
G
 
G
L
 
K
P
 
K
L
 
Q
H
 
Y
C
 
C
S
 
E
T
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q7SIG4 Diisopropyl-fluorophosphatase; DFPase; EC 3.1.8.2 from Loligo vulgaris (Common European squid) (see 4 papers)
30% identity, 85% coverage: 45:306/307 of query aligns to 21:309/314 of Q7SIG4

query
sites
Q7SIG4
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
F
D
 
D
G
 
K
V
 
N
G
 
G
N
 
D
L
 
F
Y
 
Y
-
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
x
E
-
 
V
-
 
E
V
 
V
T
 
N
D
 
G
I
 
K
P
 
P
W
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
I
F
 
L
R
 
R
I
 
I
D
 
D
-
 
L
P
 
K
Q
 
T
G
 
G
A
 
K
W
 
K
T
 
T
L
 
V
V
 
I
A
 
C
E
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
G
Y
 
Y
D
 
G
G
 
G
E
 
I
P
 
P
N
 
A
G
 
G
M
 
C
K
x
Q
F
 
C
-
 
D
M
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
N
T
 
Q
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
M
K
 
R
N
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
-
R
 
-
L
 
L
D
 
V
I
 
V
A
 
Q
T
 
T
G
 
D
G
 
G
V
 
T
T
 
F
P
 
E
Y
 
E
L
 
I
E
 
A
R
 
K
R
 
K
N
 
D
S
 
S
E
 
E
-
 
G
-
 
R
R
 
R
F
 
M
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
N
|
N
D
|
D
L
 
C
I
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
Y
D
 
E
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
W
F
 
I
T
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
A
D
 
D
Q
x
Y
G
 
T
Q
x
R
S
 
S
G
 
-
L
x
M
H
 
Q
D
 
E
P
 
K
S
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
I
Y
 
Y
R
 
C
L
 
F
R
 
T
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
Q
L
 
M
D
 
I
L
 
Q
L
 
V
L
 
D
A
 
T
N
 
A
V
 
F
P
 
Q
S
x
F
P
 
P
N
|
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
V
S
 
R
P
x
H
-
 
M
-
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
R
-
 
P
-
 
Y
V
 
Q
L
 
L
Y
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
|
T
R
 
P
G
 
T
N
 
K
C
 
K
V
 
L
W
 
W
R
 
S
V
 
Y
P
 
D
L
 
I
L
 
K
P
 
G
D
 
P
G
 
A
S
 
K
V
 
I
-
 
E
-
 
N
A
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
W
Q
 
G
F
x
H
F
 
I
T
 
P
S
 
G
H
 
T
G
x
H
P
 
E
S
 
G
G
 
G
P
 
A
D
|
D
G
 
G
L
 
M
A
x
D
V
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
D
G
x
N
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
P
x
W
G
 
G
L
 
S
G
 
S
Y
x
H
V
 
I
W
 
E
V
 
V
L
 
F
N
 
G
-
 
P
H
 
D
R
 
G
A
 
G
E
 
Q
P
 
P
V
 
K
L
 
M
V
 
R
L
 
I
R
 
R
G
 
C
P
 
P
A
 
F
G
 
-
A
 
E
S
 
K
T
 
P
T
x
S
N
|
N
L
|
L
A
x
H
F
 
F
G
 
K
G
 
P
Q
 
Q
G
 
-
G
 
T
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
D
 
E
S
x
H
T
 
E
H
 
N
G
 
N
H
 
A
I
 
V
L
 
W
C
 
K
A
 
F
R
 
E
L
 
W
D
 
Q
A
 
R
P
 
N
G
 
G
L
 
K
P
 
K
L
x
Q
H
 
Y
C
 
C
S
 
E
T
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7zp7A Crystal structure of evolved photoenzyme ent1.3 (truncated) with bound product (see paper)
27% identity, 85% coverage: 46:305/307 of query aligns to 20:306/306 of 7zp7A

query
sites
7zp7A
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
F
D
 
D
G
 
K
V
 
N
G
 
G
N
 
D
L
 
F
Y
 
Y
-
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
x
Y
-
 
V
-
 
E
V
 
V
T
 
N
D
 
G
I
 
K
P
 
P
W
 
A
G
 
G
R
 
E
I
 
I
F
 
L
R
 
R
I
 
I
D
 
D
-
 
L
P
 
K
Q
 
T
G
 
G
A
 
K
W
 
K
T
 
T
L
 
V
V
 
I
A
 
C
E
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
V
-
 
N
-
 
G
Y
 
Y
D
 
G
G
 
G
E
 
I
P
 
P
N
 
A
G
 
G
M
 
C
K
 
Q
F
 
C
-
 
D
M
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
N
T
 
Q
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
A
K
 
R
N
 
L
G
 
G
L
 
L
M
 
-
R
 
-
L
 
L
D
 
V
I
 
V
A
 
Q
T
 
T
G
 
D
G
 
G
V
 
T
T
 
F
P
 
E
Y
 
E
L
 
I
E
 
A
R
 
K
R
 
K
N
 
D
S
 
S
E
 
E
-
 
G
-
 
R
R
 
R
F
 
M
K
 
Q
G
 
G
V
 
C
N
 
A
D
x
Y
L
 
C
I
 
A
F
 
F
D
 
D
A
 
Y
D
 
E
G
 
G
N
 
N
L
 
L
Y
 
W
F
 
I
T
 
T
D
 
A
Q
 
P
G
 
A
Q
 
G
S
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
F
-
 
T
-
 
I
G
 
S
L
 
L
H
 
D
D
 
E
P
 
K
S
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
I
Y
 
Y
R
 
C
L
 
F
R
 
T
P
 
T
N
 
D
G
 
G
Q
 
Q
L
 
M
D
 
I
L
 
Q
L
 
V
L
 
D
A
 
T
N
 
A
V
 
F
P
 
Q
S
x
F
P
 
P
N
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
V
S
 
R
P
 
H
-
 
M
-
 
N
D
 
D
G
 
G
R
 
R
-
 
P
-
 
Y
V
 
Q
L
 
L
Y
 
I
L
 
V
A
 
A
A
 
E
T
x
Q
R
 
R
G
 
T
N
 
K
C
 
K
V
 
L
W
 
W
R
 
S
V
 
Y
P
 
D
L
 
I
L
 
K
P
 
G
D
 
P
G
 
A
S
 
K
V
 
I
-
 
E
-
 
N
A
 
K
K
 
K
V
 
V
G
 
W
Q
 
G
F
 
H
F
 
I
T
 
P
S
 
G
H
 
T
G
 
H
P
 
E
S
 
G
G
 
G
P
 
A
D
x
S
G
 
G
L
 
M
A
 
D
V
 
F
D
 
D
T
 
E
S
 
D
G
 
N
R
 
N
L
 
L
L
 
L
V
 
V
A
 
A
N
 
N
P
x
W
G
 
G
L
 
S
G
 
S
Y
 
H
V
 
I
W
 
E
V
 
V
L
 
F
N
 
G
-
 
P
H
 
D
R
 
G
A
 
G
E
 
Q
P
 
P
V
 
K
L
 
M
V
 
R
L
 
I
R
 
R
G
 
C
P
 
P
A
 
F
G
 
-
A
 
E
S
 
K
T
 
P
T
 
S
N
 
A
L
 
L
A
 
H
F
 
F
G
 
K
G
 
P
Q
 
Q
G
 
-
G
 
T
Q
 
K
T
 
T
V
 
I
F
 
F
V
 
V
T
 
T
D
 
E
S
x
H
T
 
E
H
 
N
G
 
N
H
 
A
I
 
V
L
 
W
C
 
K
A
 
F
R
 
E
L
 
W
D
 
Q
A
 
R
P
 
N
G
 
G
L
 
K
P
 
K
L
 
Q
H
 
Y
C
 
C
S
 
E
T
 
T

3e5zA X-ray structure of the putative gluconolactonase in protein family pf08450. Northeast structural genomics consortium target drr130.
28% identity, 80% coverage: 42:286/307 of query aligns to 27:277/290 of 3e5zA

query
sites
3e5zA
S
 
T
F
 
W
L
 
T
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
-
 
V
D
 
P
G
 
A
V
 
R
G
 
S
N
 
A
L
 
V
Y
 
I
V
 
F
T
 
S
D
 
D
I
 
V
P
 
R
W
 
Q
G
 
N
R
 
R
I
 
T
F
 
W
R
 
A
I
 
W
D
 
S
P
 
D
Q
 
D
G
 
G
A
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
P
V
 
E
A
 
M
E
 
H
Y
 
P
D
 
S
G
 
H
E
 
H
P
 
Q
N
 
N
G
 
G
M
 
H
K
 
C
F
 
L
M
 
N
D
 
K
A
 
Q
G
 
G
T
 
H
L
 
L
L
 
I
I
 
A
T
 
C
D
 
S
Y
 
H
K
 
-
N
 
-
G
 
G
L
 
L
M
 
R
R
 
R
L
 
L
D
 
E
I
 
R
A
 
Q
T
 
R
-
 
E
-
 
P
-
 
G
G
 
G
G
 
E
V
 
W
T
 
E
P
 
S
Y
 
I
L
 
A
E
 
D
R
 
S
R
 
F
N
 
E
S
 
G
E
 
K
R
 
K
F
 
L
K
 
N
G
 
S
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
V
I
 
C
F
 
L
D
 
A
A
 
P
D
 
D
G
 
G
N
 
S
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
S
D
 
D
-
 
P
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
K
-
 
P
-
 
E
Q
 
E
G
 
G
Q
 
Y
S
 
G
G
 
G
L
 
E
H
 
M
D
 
E
P
 
L
S
 
P
G
 
G
R
 
R
-
 
W
L
 
V
Y
 
F
R
 
R
L
 
L
R
 
A
P
 
P
N
 
D
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
D
 
S
L
 
A
L
 
P
L
 
I
A
 
R
N
 
D
V
 
R
P
 
V
S
 
K
P
 
P
N
|
N
G
 
G
V
 
L
A
 
A
L
 
F
S
 
L
P
 
P
D
 
S
G
 
G
R
 
N
V
 
L
L
 
L
Y
 
-
L
 
V
A
 
S
A
 
D
T
 
T
R
 
G
G
 
D
N
 
N
C
 
A
V
 
T
W
 
H
R
 
R
V
 
Y
P
 
C
L
 
L
L
 
N
P
 
A
D
 
R
G
 
G
S
 
E
V
 
T
A
 
E
K
 
Y
V
 
Q
G
 
G
Q
 
V
F
 
H
F
 
F
T
 
T
S
 
V
H
 
E
G
 
-
P
 
P
S
 
G
G
 
K
P
 
T
D
|
D
G
 
G
L
 
L
A
 
R
V
 
V
D
 
D
T
 
A
S
 
G
G
 
G
R
 
-
L
 
L
L
 
I
V
 
W
A
 
A
N
 
S
P
 
A
G
 
G
L
 
D
G
 
G
Y
 
-
V
 
V
W
 
H
V
 
V
L
 
L
N
 
T
H
 
P
R
 
D
A
 
G
E
 
D
P
 
E
V
 
L
L
 
G
V
 
R
L
 
V
R
 
L
G
 
T
P
 
P
A
 
-
G
 
-
A
 
Q
S
 
T
T
 
T
T
 
S
N
 
N
L
 
L
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
E
G
 
G
Q
 
R
T
 
T
V
 
L
F
 
Y
V
 
M
T
 
T
D
 
V
S
 
S
T
 
T
H
 
E

7pldB Caulobacter crescentus xylonolactonase with (r)-4-hydroxy-2- pyrrolidone (see paper)
26% identity, 79% coverage: 45:287/307 of query aligns to 17:256/289 of 7pldB

query
sites
7pldB
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
I
F
 
W
D
 
H
G
 
G
V
 
-
G
 
D
N
 
T
L
 
L
Y
 
W
V
 
F
T
 
V
D
 
D
I
|
I
P
 
K
W
 
Q
G
 
R
R
 
K
I
 
I
F
 
H
R
 
N
I
 
Y
D
 
H
P
 
P
Q
 
A
G
 
T
A
 
G
W
 
E
T
 
R
L
 
F
V
 
S
A
 
F
E
 
D
Y
 
A
D
 
P
G
 
D
E
 
Q
P
 
V
N
 
T
G
 
F
M
 
L
K
 
A
F
 
P
M
 
I
D
 
V
A
 
G
G
x
A
T
 
T
L
x
G
L
x
F
I
 
V
T
 
V
D
 
G
Y
 
L
K
 
K
N
 
T
G
 
G
L
 
I
M
 
H
R
 
R
L
 
F
D
 
H
I
x
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
-
V
 
F
T
 
S
P
 
L
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
V
R
 
E
N
 
D
S
 
A
E
 
A
R
 
L
F
 
N
K
 
N
G
x
R
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
A
I
 
T
F
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
Q
G
 
G
N
 
R
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
G
D
 
T
Q
 
M
G
 
-
Q
 
H
S
 
D
G
 
G
L
x
E
H
 
E
D
 
N
P
 
N
S
 
S
G
 
G
R
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
L
 
M
R
 
D
P
 
L
N
 
T
G
 
G
Q
 
-
L
 
V
D
 
A
L
 
R
L
 
M
L
x
D
A
 
R
N
 
D
V
 
I
P
 
C
S
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
V
 
P
A
 
C
L
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
V
 
T
L
 
F
Y
 
Y
L
 
H
A
 
T
A
 
D
T
 
T
R
 
L
G
 
E
N
 
K
C
 
T
V
 
I
W
 
Y
R
 
A
V
 
F
P
 
D
L
 
L
L
 
A
P
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
L
V
 
L
A
 
S
K
 
N
V
x
K
G
 
R
Q
 
V
F
 
F
-
 
V
-
 
Q
F
 
F
T
 
A
S
 
L
H
 
G
G
 
D
P
 
D
S
 
V
G
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
E
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
L
 
W
V
 
T
A
 
A
N
 
L
P
x
W
G
 
G
L
 
G
G
 
F
Y
 
G
V
 
A
W
 
V
V
 
R
L
 
F
N
 
S
H
 
P
R
 
Q
A
 
G
E
 
D
P
 
A
V
 
V
L
 
T
V
 
R
L
 
I
R
 
E
G
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
-
A
 
P
S
 
N
T
 
V
T
 
T
N
 
K
L
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
D
G
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
L
F
 
Y
V
 
F
T
 
T
D
 
T
S
 
A
T
 
R
H
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7plbB Caulobacter crescentus xylonolactonase with d-xylose (see paper)
26% identity, 79% coverage: 45:287/307 of query aligns to 17:256/289 of 7plbB

query
sites
7plbB
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
I
F
 
W
D
 
H
G
 
G
V
 
-
G
 
D
N
 
T
L
 
L
Y
 
W
V
 
F
T
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
K
W
 
Q
G
 
R
R
 
K
I
 
I
F
 
H
R
 
N
I
 
Y
D
 
H
P
 
P
Q
 
A
G
 
T
A
 
G
W
 
E
T
 
R
L
 
F
V
 
S
A
 
F
E
 
D
Y
 
A
D
 
P
G
 
D
E
 
Q
P
 
V
N
 
T
G
 
F
M
 
L
K
 
A
F
 
P
M
 
I
D
 
V
A
 
G
G
x
A
T
 
T
L
x
G
L
x
F
I
 
V
T
 
V
D
 
G
Y
 
L
K
 
K
N
 
T
G
 
G
L
 
I
M
 
H
R
 
R
L
 
F
D
 
H
I
x
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
-
V
 
F
T
 
S
P
 
L
Y
 
L
L
 
L
E
|
E
R
x
V
R
 
E
N
x
D
S
 
A
E
 
A
R
 
L
F
 
N
K
 
N
G
x
R
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
A
I
 
T
F
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
Q
G
 
G
N
x
R
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
G
D
 
T
Q
 
M
G
 
-
Q
 
H
S
 
D
G
 
G
L
 
E
H
 
E
D
 
N
P
 
N
S
 
S
G
 
G
R
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
L
 
M
R
x
D
P
 
L
N
 
T
G
 
G
Q
 
-
L
 
V
D
 
A
L
 
R
L
 
M
L
 
D
A
 
R
N
 
D
V
 
I
P
 
C
S
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
V
 
P
A
 
C
L
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
V
 
T
L
 
F
Y
 
Y
L
 
H
A
 
T
A
 
D
T
 
T
R
 
L
G
 
E
N
 
K
C
 
T
V
 
I
W
 
Y
R
 
A
V
 
F
P
 
D
L
 
L
L
 
A
P
 
E
D
|
D
G
 
G
S
 
L
V
 
L
A
 
S
K
 
N
V
 
K
G
 
R
Q
 
V
F
 
F
-
 
V
-
 
Q
F
 
F
T
 
A
S
 
L
H
 
G
G
 
D
P
 
D
S
 
V
G
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
E
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
L
 
W
V
 
T
A
 
A
N
 
L
P
 
W
G
 
G
L
 
G
G
 
F
Y
 
G
V
 
A
W
 
V
V
 
R
L
 
F
N
 
S
H
 
P
R
 
Q
A
 
G
E
 
D
P
 
A
V
 
V
L
 
T
V
 
R
L
 
I
R
 
E
G
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
-
A
 
P
S
 
N
T
 
V
T
 
T
N
 
K
L
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
D
G
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
L
F
 
Y
V
 
F
T
 
T
D
 
T
S
 
A
T
 
R
H
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q9A9Z1 D-xylonolactone lactonase; Xylono-1,5-lactonase; EC 3.1.1.110 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CB15) (Caulobacter crescentus) (see paper)
26% identity, 79% coverage: 45:287/307 of query aligns to 17:256/289 of Q9A9Z1

query
sites
Q9A9Z1
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
I
F
 
W
D
 
H
G
 
G
V
 
-
G
 
D
N
 
T
L
 
L
Y
 
W
V
 
F
T
 
V
D
 
D
I
 
I
P
 
K
W
 
Q
G
 
R
R
 
K
I
 
I
F
 
H
R
 
N
I
 
Y
D
 
H
P
 
P
Q
 
A
G
 
T
A
 
G
W
 
E
T
 
R
L
 
F
V
 
S
A
 
F
E
 
D
Y
 
A
D
 
P
G
 
D
E
 
Q
P
 
V
N
 
T
G
 
F
M
 
L
K
 
A
F
 
P
M
 
I
D
 
V
A
 
G
G
 
A
T
 
T
L
 
G
L
 
F
I
 
V
T
 
V
D
 
G
Y
 
L
K
 
K
N
 
T
G
 
G
L
 
I
M
 
H
R
 
R
L
 
F
D
 
H
I
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
-
V
 
F
T
 
S
P
 
L
Y
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
V
R
 
E
N
 
D
S
 
A
E
 
A
R
 
L
F
 
N
K
 
N
G
 
R
V
 
P
N
 
N
D
 
D
L
 
A
I
 
T
F
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
Q
G
 
G
N
 
R
L
 
L
Y
 
W
F
 
F
T
 
G
D
 
T
Q
 
M
G
 
-
Q
 
H
S
 
D
G
 
G
L
 
E
H
 
E
D
 
N
P
 
N
S
 
S
G
 
G
R
 
S
L
 
L
Y
 
Y
R
 
R
L
 
M
R
 
D
P
 
L
N
 
T
G
 
G
Q
 
-
L
 
V
D
 
A
L
 
R
L
 
M
L
 
D
A
 
R
N
 
D
V
 
I
P
 
C
S
 
I
P
 
T
N
|
N
G
 
G
V
 
P
A
 
C
L
 
V
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
R
 
K
V
 
T
L
 
F
Y
 
Y
L
 
H
A
 
T
A
 
D
T
 
T
R
 
L
G
 
E
N
 
K
C
 
T
V
 
I
W
 
Y
R
 
A
V
 
F
P
 
D
L
 
L
L
 
A
P
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
L
V
 
L
A
 
S
K
 
N
V
 
K
G
 
R
Q
 
V
F
 
F
-
 
V
-
 
Q
F
 
F
T
 
A
S
 
L
H
 
G
G
 
D
P
 
D
S
 
V
G
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
E
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
L
 
W
V
 
T
A
 
A
N
 
L
P
 
W
G
 
G
L
 
G
G
 
F
Y
 
G
V
 
A
W
 
V
V
 
R
L
 
F
N
 
S
H
 
P
R
 
Q
A
 
G
E
 
D
P
 
A
V
 
V
L
 
T
V
 
R
L
 
I
R
 
E
G
 
L
P
 
P
A
 
A
G
 
-
A
 
P
S
 
N
T
 
V
T
 
T
N
 
K
L
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
Q
 
P
G
 
D
G
 
L
Q
 
K
T
 
T
V
 
L
F
 
Y
V
 
F
T
 
T
D
 
T
S
 
A
T
 
R
H
 
K
G
 
G

3dr2A Structural and functional analyses of xc5397 from xanthomonas campestris: a gluconolactonase important in glucose secondary metabolic pathways (see paper)
27% identity, 79% coverage: 42:282/307 of query aligns to 42:288/299 of 3dr2A

query
sites
3dr2A
S
 
T
F
 
W
L
 
S
E
|
E
G
 
G
P
 
P
V
 
A
F
 
W
-
 
W
D
 
E
G
 
A
V
 
Q
G
 
R
N
 
T
L
 
L
Y
 
V
V
 
W
T
 
S
D
 
D
I
 
L
P
 
V
W
 
G
G
 
R
R
 
R
I
 
V
F
 
L
R
 
G
I
 
W
D
 
R
P
 
E
Q
 
D
G
 
G
A
 
T
W
 
V
T
 
D
L
 
V
V
 
L
A
 
L
E
 
D
Y
 
A
D
 
T
G
 
A
E
 
F
P
 
T
N
 
N
G
 
G
M
 
N
K
 
A
F
 
V
M
 
D
D
 
A
A
 
Q
G
 
Q
T
 
R
L
 
L
L
 
V
I
 
H
T
 
C
D
 
E
Y
 
H
K
 
G
N
 
R
G
 
R
L
 
A
M
 
I
R
 
T
L
 
R
D
 
S
I
 
D
A
 
A
T
 
D
G
 
G
G
 
Q
V
 
A
T
 
H
P
 
L
Y
 
L
L
 
V
E
 
G
R
 
R
R
 
Y
N
 
A
S
 
G
E
 
K
R
 
R
F
 
L
K
 
N
G
 
S
V
 
P
N
|
N
D
 
D
L
 
L
I
 
I
F
 
V
D
 
A
A
 
R
D
 
D
G
 
G
N
 
A
L
 
I
Y
 
W
F
 
F
T
 
T
D
 
D
Q
 
P
G
 
-
Q
 
P
S
 
F
G
 
G
L
 
L
H
 
R
D
 
K
P
 
P
S
 
S
G
 
Q
-
 
G
-
 
C
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
H
R
 
S
L
 
V
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
R
 
P
P
 
P
N
 
D
G
 
G
Q
 
S
L
 
P
D
 
L
L
 
Q
L
 
R
L
 
M
A
 
A
N
 
D
V
 
L
P
 
D
S
 
H
P
 
P
N
|
N
G
 
G
V
 
L
A
 
A
L
 
F
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
E
R
 
Q
V
 
T
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
A
 
S
A
 
Q
T
 
T
R
 
P
G
 
E
N
 
G
C
 
S
V
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
A
-
 
F
-
 
A
W
 
W
R
 
R
V
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
A
V
 
L
A
 
H
K
 
D
V
 
R
G
 
R
Q
 
H
F
 
F
F
 
A
T
 
S
S
 
V
H
 
-
G
 
-
P
 
P
S
 
D
G
 
G
-
 
L
P
 
P
D
|
D
G
 
G
L
 
F
A
 
C
V
 
V
D
 
D
T
 
R
S
 
G
G
 
G
R
 
-
L
 
W
L
 
L
V
 
W
A
 
S
N
 
S
P
 
S
G
 
G
L
 
T
G
 
G
Y
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
V
L
 
C
N
 
V
H
 
F
R
 
D
A
 
S
E
 
D
P
 
G
V
 
Q
L
 
L
V
 
L
L
 
G
R
 
H
G
 
I
P
 
P
A
 
T
G
 
P
A
 
G
S
 
T
T
 
A
T
 
S
N
 
N
L
 
C
A
 
T
F
 
F
G
 
-
G
 
D
Q
 
Q
G
 
A
G
 
Q
Q
 
Q
T
 
R
V
 
L
F
 
F
V
 
I
T
 
T

6rekA Crystal structure of pizza6-sh with cu2+ (see paper)
29% identity, 82% coverage: 45:296/307 of query aligns to 16:251/251 of 6rekA

query
sites
6rekA
E
 
S
G
 
G
P
 
V
V
 
A
F
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
A
G
 
G
N
 
T
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
D
I
x
H
P
 
G
W
 
N
G
 
N
R
 
R
I
 
V
F
 
V
R
 
K
I
 
L
D
 
A
P
 
A
Q
 
G
G
 
S
A
 
N
W
 
T
T
 
Q
L
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
P
Y
 
F
D
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
N
E
 
T
P
 
P
N
x
H
G
 
G
M
 
V
K
 
A
F
 
V
M
 
D
D
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
L
 
Y
I
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
x
H
K
 
G
N
 
N
G
 
N
L
 
R
M
 
V
R
 
-
L
 
V
D
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
S
V
 
N
T
 
T
P
 
Q
Y
 
T
L
 
V
E
 
L
R
 
P
R
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
K
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
D
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
G
L
 
V
I
 
A
F
 
V
D
 
D
A
 
S
D
 
A
G
 
G
N
 
T
L
 
V
Y
 
Y
F
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
x
H
G
 
G
Q
 
N
S
 
N
G
 
-
L
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
V
Y
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
A
-
 
A
-
 
G
P
 
S
N
 
N
G
 
T
Q
 
Q
L
 
T
D
 
V
L
 
L
L
 
P
L
 
F
A
 
T
N
 
G
V
 
L
P
 
N
S
 
T
P
 
P
N
x
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
S
 
D
P
 
S
D
 
A
G
 
G
R
 
T
V
 
V
L
 
Y
Y
 
-
L
 
-
A
 
V
A
 
T
T
 
D
R
x
H
G
 
G
N
 
N
C
 
N
V
 
-
W
 
-
R
 
R
V
 
V
P
 
V
L
 
K
L
 
L
P
 
A
D
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
T
G
 
V
Q
 
L
F
 
P
F
 
F
T
 
T
S
 
-
H
 
-
G
 
G
P
 
L
S
 
N
G
 
T
P
 
P
D
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
A
G
 
G
R
 
T
L
 
V
L
 
Y
V
 
V
A
 
T
N
 
D
P
x
H
G
 
G
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
N
H
 
N
R
 
R
A
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
V
L
 
V
R
 
K
G
 
L
P
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
S
S
 
N
T
 
T
-
 
Q
T
 
T
N
 
V
L
 
L
A
 
P
F
 
F
G
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
x
T
-
 
P
-
x
H
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
V
Q
 
D
G
 
S
G
 
A
Q
 
G
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
D
S
 
-
T
 
-
H
|
H
G
 
G
H
 
N
I
 
N
L
 
R
C
 
V
A
 
V
R
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
A

6rejA Crystal structure of pizza6-sh with zn2+ (see paper)
29% identity, 82% coverage: 45:296/307 of query aligns to 15:250/250 of 6rejA

query
sites
6rejA
E
 
S
G
 
G
P
 
V
V
 
A
F
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
A
G
 
G
N
 
T
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
D
I
x
H
P
 
G
W
 
N
G
 
N
R
 
R
I
 
V
F
 
V
R
 
K
I
 
L
D
 
A
P
 
A
Q
 
G
G
 
S
A
 
N
W
 
T
T
 
Q
L
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
P
Y
 
F
D
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
N
E
 
T
P
 
P
N
x
H
G
 
G
M
 
V
K
 
A
F
 
V
M
 
D
D
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
L
 
Y
I
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
H
K
 
G
N
 
N
G
 
N
L
 
R
M
 
V
R
 
-
L
 
V
D
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
S
V
 
N
T
 
T
P
 
Q
Y
 
T
L
 
V
E
 
L
R
 
P
R
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
K
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
D
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
G
L
 
V
I
 
A
F
 
V
D
 
D
A
 
S
D
 
A
G
 
G
N
 
T
L
 
V
Y
 
Y
F
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
x
H
G
 
G
Q
 
N
S
 
N
G
 
-
L
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
V
Y
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
A
P
 
A
-
 
G
-
 
S
N
 
N
G
 
T
Q
 
Q
L
 
T
D
 
V
L
 
L
L
 
P
L
 
F
A
 
T
N
 
G
V
 
L
P
 
N
S
 
T
P
 
P
N
x
H
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
S
 
D
P
 
S
D
 
A
G
 
G
R
 
T
V
 
V
L
 
Y
Y
 
-
L
 
-
A
 
V
A
 
T
T
 
D
R
 
H
G
 
G
N
 
N
C
 
N
V
 
-
W
 
-
R
 
R
V
 
V
P
 
V
L
 
K
L
 
L
P
 
A
D
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
T
G
 
V
Q
 
L
F
 
P
F
 
F
T
 
T
S
 
-
H
 
-
G
 
G
P
 
L
S
 
N
G
 
T
P
 
P
D
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
A
G
 
G
R
 
T
L
 
V
L
 
Y
V
 
V
A
 
T
N
 
D
P
x
H
G
 
G
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
-
W
 
-
V
 
-
L
 
-
N
 
N
H
 
N
R
 
R
A
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
V
L
 
V
R
 
K
G
 
L
P
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
S
S
 
N
T
 
T
-
 
Q
T
 
T
N
 
V
L
 
L
A
 
P
F
 
F
G
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
T
-
 
P
-
x
H
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
V
Q
 
D
G
 
S
G
 
A
Q
 
G
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
D
S
 
-
T
 
-
H
|
H
G
 
G
H
 
N
I
 
N
L
 
R
C
 
V
A
 
V
R
 
K
L
 
L
D
 
A
A
 
A

P9WI79 Serine/threonine-protein kinase PknD; EC 2.7.11.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 3 papers)
27% identity, 80% coverage: 45:290/307 of query aligns to 429:660/664 of P9WI79

query
sites
P9WI79
E
 
S
G
 
G
P
 
V
V
 
A
F
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
A
G
 
G
N
 
N
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
-
 
S
D
 
E
I
 
G
P
 
M
W
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
V
F
 
V
R
 
K
I
 
L
D
 
A
P
 
T
Q
 
G
G
 
S
A
 
T
W
 
G
T
 
T
L
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
P
Y
 
F
D
 
N
G
 
G
-
 
L
-
 
Y
E
 
Q
P
 
P
N
 
Q
G
 
G
M
 
L
K
 
A
F
 
V
M
 
D
D
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
L
 
Y
I
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
 
F
K
 
N
N
 
N
G
 
R
L
 
V
M
 
V
R
 
T
L
 
L
D
 
A
I
 
A
A
 
G
T
 
S
G
 
N
G
 
N
V
 
Q
T
 
T
P
 
V
Y
 
L
L
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
P
F
 
F
K
 
D
G
 
G
V
 
L
N
 
N
-
 
Y
-
 
P
-
 
E
D
 
G
L
 
L
I
 
A
F
 
V
D
 
D
A
 
T
D
 
Q
G
 
G
N
 
A
L
 
V
Y
 
Y
F
 
V
T
 
A
D
 
D
Q
 
R
G
 
G
Q
 
N
S
 
N
G
 
-
L
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
V
Y
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
A
P
 
A
N
 
G
G
 
S
Q
 
K
L
 
T
D
 
Q
L
 
T
L
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
F
A
 
T
N
 
G
V
 
L
P
 
N
S
 
D
P
 
P
N
 
D
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
S
 
D
P
 
N
D
 
S
G
 
G
R
 
N
V
 
V
L
 
-
Y
 
Y
L
 
V
A
 
T
A
 
D
T
 
T
R
 
D
G
 
N
N
 
N
C
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
R
V
 
V
P
 
V
L
 
K
L
 
L
P
 
E
D
 
A
G
 
E
S
 
S
V
 
N
A
 
N
K
 
Q
V
 
V
G
 
V
Q
 
L
F
 
P
F
 
F
T
 
T
S
 
D
H
 
I
G
 
-
P
 
-
S
 
T
G
 
A
P
 
P
D
 
W
G
 
G
L
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
T
L
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
N
 
-
P
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
V
 
V
W
 
Y
V
 
V
L
 
T
N
 
E
H
 
H
R
 
N
A
 
T
E
 
N
P
 
Q
V
 
V
L
 
V
V
 
K
L
 
L
R
 
L
G
 
A
P
 
G
A
 
S
G
 
T
A
 
T
S
 
S
T
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
G
-
 
L
-
 
N
T
 
T
N
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
V
G
 
A
G
 
V
Q
 
D
G
 
S
G
 
D
Q
 
R
T
 
T
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
T
 
A
D
 
D
S
 
R
T
 
G
H
 
N
G
 
D
H
 
R
I
 
V
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7ov7A The hybrid cage formed between pizza6-s and cu(ii)-substituted trilacunary keggin
29% identity, 64% coverage: 45:241/307 of query aligns to 58:242/250 of 7ov7A

query
sites
7ov7A
E
 
S
G
 
G
P
 
V
V
 
A
F
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
A
G
 
G
N
 
T
L
 
V
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
D
 
D
I
x
H
P
 
G
W
 
N
G
 
N
R
 
R
I
 
V
F
 
V
R
 
K
I
 
L
D
 
A
P
 
A
Q
 
G
G
 
S
A
 
N
W
 
T
T
 
Q
L
 
T
V
 
V
A
 
L
E
 
P
Y
 
F
D
 
T
G
 
G
-
 
L
-
 
N
E
 
T
P
 
P
N
 
S
G
 
G
M
 
V
K
 
A
F
 
V
M
 
D
D
 
S
A
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
V
L
 
Y
I
 
V
T
 
T
D
 
D
Y
x
H
K
 
G
N
 
N
G
 
N
L
 
R
M
 
V
R
 
-
L
 
V
D
 
K
I
 
L
A
 
A
T
 
A
G
 
G
G
 
S
V
 
N
T
 
T
P
 
Q
Y
 
T
L
 
V
E
 
L
R
 
P
R
 
-
N
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
F
 
F
K
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
D
 
T
-
 
P
-
 
S
-
 
G
L
 
V
I
 
A
F
 
V
D
 
D
A
 
S
D
 
A
G
 
G
N
 
T
L
 
V
Y
 
Y
F
 
V
T
 
T
D
 
D
Q
x
H
G
 
G
Q
 
N
S
 
N
G
 
-
L
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
R
L
 
V
Y
 
V
R
 
K
L
 
L
R
 
A
P
 
A
-
 
G
-
 
S
N
 
N
G
 
T
Q
 
Q
L
 
T
D
 
V
L
 
L
L
 
P
L
 
F
A
 
T
N
 
G
V
 
L
P
 
N
S
 
T
P
 
P
N
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
A
L
 
V
S
 
D
P
 
S
D
 
A
G
 
G
R
 
T
V
 
V
L
 
-
Y
 
Y
L
 
V
A
 
T
A
 
D
T
x
H
R
 
G
G
 
N
N
 
N
C
 
-
V
 
-
W
 
-
R
 
R
V
 
V
P
 
V
L
 
K
L
 
L
P
 
A
D
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
N
A
 
T
K
 
Q
V
 
T
G
 
V
Q
 
L
F
 
P
F
 
F
T
 
T
S
 
-
H
 
-
G
 
G
P
 
L
S
 
N
G
 
T
P
 
P
D
 
S
G
 
G
L
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
S
S
 
A
G
 
G
R
 
T
L
 
V
L
 
Y
V
 
V
A
 
T
N
 
D
P
x
H
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ac3H11_138 Gluconolactonase
MFLLQSPELRELAFFSSMPDTFRRPERSAWADANRGGTVTDSFLEGPVFDGVGNLYVTDI
PWGRIFRIDPQGAWTLVAEYDGEPNGMKFMDAGTLLITDYKNGLMRLDIATGGVTPYLER
RNSERFKGVNDLIFDADGNLYFTDQGQSGLHDPSGRLYRLRPNGQLDLLLANVPSPNGVA
LSPDGRVLYLAATRGNCVWRVPLLPDGSVAKVGQFFTSHGPSGPDGLAVDTSGRLLVANP
GLGYVWVLNHRAEPVLVLRGPAGASTTNLAFGGQGGQTVFVTDSTHGHILCARLDAPGLP
LHCSTLD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory