SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_1483 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1483 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

2eb6A Crystal structure of hpcg complexed with mg ion (see paper)
68% identity, 99% coverage: 3:249/249 of query aligns to 21:267/267 of 2eb6A

query
sites
2eb6A
R
 
R
T
 
E
Q
 
Q
L
 
I
R
 
R
H
 
A
F
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
M
 
I
T
 
T
I
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
W
 
W
V
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
K
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
H
K
 
K
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
R
 
K
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
I
 
A
A
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
T
 
S
E
 
E
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
A
 
G
P
 
A
L
 
L
M
 
L
D
 
D
D
 
D
M
 
M
F
 
F
F
 
F
D
 
H
A
 
D
G
 
G
G
 
S
D
 
D
I
 
I
P
 
P
F
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
V
P
 
P
R
 
R
V
 
I
E
|
E
V
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
V
L
 
L
G
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
N
V
 
C
T
 
T
L
 
L
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
I
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
E
 
H
Q
 
N
F
 
I
D
 
D
R
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
Q
V
 
R
M
 
P
R
 
R
K
 
K
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
D
 
D
F
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
D
D
 
E
V
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
W
 
W
V
 
I
G
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
Y
K
 
R
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
E
 
E
S
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
L
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
D
E
 
V
Q
 
Q
L
 
L
N
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
T
 
T
R
 
R
P
 
P
T
 
V
A
 
P
A
 
A
V
 
R
A
 
K
G
 
G
D
 
D
S
 
T
F
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
P
 
N
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
I
S
 
S
F
 
C
R
 
R
F
 
F
V
 
V

P42270 2-oxo-hept-4-ene-1,7-dioate hydratase; OHED hydratase; EC 4.2.1.163 from Escherichia coli (see paper)
68% identity, 99% coverage: 3:249/249 of query aligns to 21:267/267 of P42270

query
sites
P42270
R
 
R
T
 
E
Q
 
Q
L
 
I
R
 
R
H
 
A
F
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
M
 
I
T
 
T
I
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
W
 
W
V
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
K
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
H
K
 
K
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
R
 
K
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
I
 
A
A
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
T
 
S
E
 
E
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
A
 
G
P
 
A
L
 
L
M
 
L
D
 
D
D
 
D
M
 
M
F
 
F
F
 
F
D
 
H
A
 
D
G
 
G
G
 
S
D
 
D
I
 
I
P
 
P
F
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
V
P
 
P
R
 
R
V
 
I
E
|
E
V
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
V
L
 
L
G
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
N
V
 
C
T
 
T
L
 
L
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
I
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
E
 
H
Q
 
N
F
 
I
D
 
D
R
 
P
E
 
E
T
 
T
R
 
Q
V
 
R
M
 
P
R
 
R
K
 
K
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
D
 
D
F
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
D
D
 
E
V
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
W
 
W
V
 
I
G
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
Y
K
 
R
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
E
 
E
S
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
L
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
D
E
 
V
Q
 
Q
L
 
L
N
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
F
T
 
T
R
 
R
P
 
P
T
 
V
A
 
P
A
 
A
V
 
R
A
 
K
G
 
G
D
 
D
S
 
T
F
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
P
 
N
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
I
S
 
S
F
 
C
R
 
R
F
 
F
V
 
V

2eb5A Crystal structure of hpcg complexed with oxalate (see paper)
67% identity, 99% coverage: 3:249/249 of query aligns to 21:259/259 of 2eb5A

query
sites
2eb5A
R
 
R
T
 
E
Q
 
Q
L
 
I
R
 
R
H
 
A
F
 
I
S
 
S
L
 
L
Q
 
D
Y
 
Y
P
 
P
E
 
E
M
 
I
T
 
T
I
 
I
E
 
E
D
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
A
I
 
V
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
W
 
W
V
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
K
L
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
T
I
 
L
K
 
K
G
 
G
R
 
H
K
|
K
I
 
I
G
|
G
L
|
L
T
 
T
S
 
S
R
 
K
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
I
 
A
A
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
T
 
S
E
 
E
P
 
P
D
 
D
Y
 
Y
A
 
G
P
 
A
L
 
L
M
 
L
D
 
D
D
 
D
M
 
M
F
 
F
F
 
F
D
 
H
A
 
D
G
 
G
G
 
S
D
 
D
I
 
I
P
 
P
F
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
I
 
I
A
 
V
P
 
P
R
 
R
V
 
I
E
|
E
V
 
V
E
|
E
L
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
V
L
 
L
G
 
A
K
 
K
P
 
P
L
 
L
K
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
N
V
 
C
T
 
T
L
 
L
F
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
S
 
N
A
 
A
T
 
T
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
A
I
 
L
E
|
E
I
 
L
I
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
E
 
H
Q
 
N
F
 
I
D
 
-
R
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
K
 
K
V
 
V
F
 
F
D
 
D
T
 
T
I
 
I
S
 
S
D
 
D
F
 
N
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
P
V
 
I
K
 
K
P
 
P
L
 
D
D
 
E
V
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
R
W
 
W
V
 
I
G
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
M
H
 
Y
K
 
R
N
 
N
G
 
G
V
 
V
I
 
I
E
 
E
E
 
E
S
 
T
G
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
V
 
V
L
 
L
N
 
N
H
 
H
P
 
P
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
N
 
N
K
 
K
I
 
L
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
D
E
 
V
Q
 
Q
L
 
L
N
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
V
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
G
G
|
G
S
|
S
F
 
F
T
 
T
R
 
R
P
 
P
T
 
V
A
 
P
A
 
A
V
 
R
A
 
K
G
 
G
D
 
D
S
 
T
F
 
F
H
 
H
A
 
V
D
 
D
Y
 
Y
G
 
G
P
 
N
L
 
M
G
 
G
S
 
S
V
 
I
S
 
S
F
 
C
R
 
R
F
 
F
V
 
V

5d2kA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and 2-oxoadipate (see paper)
40% identity, 95% coverage: 13:249/249 of query aligns to 33:263/263 of 5d2kA

query
sites
5d2kA
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
M
 
M
T
 
T
I
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
D
I
 
V
Q
 
Q
R
 
W
E
 
E
W
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
A
E
 
R
G
 
G
R
 
N
T
 
K
I
 
I
K
 
V
G
 
G
R
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
L
|
L
T
 
T
S
 
S
R
 
W
A
 
A
M
x
K
Q
 
M
I
 
A
A
 
Q
S
x
M
Q
 
G
I
 
V
T
 
E
E
 
T
P
 
P
D
 
I
Y
 
Y
A
 
G
P
 
F
L
 
L
M
 
A
D
 
D
D
 
Y
M
 
F
F
 
S
F
 
V
D
 
P
A
 
D
G
 
G
G
 
G
D
 
V
I
 
V
P
 
D
F
 
C
E
 
S
R
 
K
F
 
L
I
 
I
A
 
H
P
 
P
R
 
K
V
 
I
E
|
E
V
 
A
E
|
E
L
 
I
A
 
S
F
 
V
I
 
V
L
 
T
G
 
K
K
 
A
P
 
P
L
 
L
K
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
L
 
L
F
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
T
I
 
V
E
|
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
Q
 
N
F
 
F
D
 
K
R
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
F
|
F
D
 
D
T
 
P
I
 
I
S
 
S
D
 
V
F
 
V
A
 
A
A
 
D
N
 
N
A
|
A
G
x
S
-
 
S
-
 
T
-
 
R
I
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
M
V
 
A
K
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
W
 
T
V
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
L
 
M
H
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
I
 
V
E
 
V
E
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
N
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
K
 
L
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
Q
 
H
L
 
I
N
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
T
V
 
F
V
 
I
L
 
M
A
 
T
G
|
G
S
x
G
F
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
A
T
 
V
A
 
P
A
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
N
F
 
I
H
 
T
A
 
V
D
 
R
Y
 
Y
G
 
Q
P
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
F
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I

5d2jA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and adipate (see paper)
40% identity, 95% coverage: 13:249/249 of query aligns to 33:263/263 of 5d2jA

query
sites
5d2jA
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
M
 
M
T
 
T
I
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
D
I
 
V
Q
 
Q
R
 
W
E
 
E
W
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
A
E
 
R
G
 
G
R
 
N
T
 
K
I
 
I
K
 
V
G
 
G
R
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
R
 
W
A
 
A
M
 
K
Q
 
M
I
 
A
A
 
Q
S
 
M
Q
 
G
I
 
V
T
 
E
E
 
T
P
 
P
D
 
I
Y
 
Y
A
 
G
P
 
F
L
 
L
M
 
A
D
 
D
D
 
Y
M
 
F
F
 
S
F
 
V
D
 
P
A
 
D
G
 
G
G
 
G
D
 
V
I
 
V
P
 
D
F
 
C
E
 
S
R
 
K
F
 
L
I
 
I
A
 
H
P
 
P
R
 
K
V
 
I
E
|
E
V
 
A
E
|
E
L
 
I
A
 
S
F
 
V
I
 
V
L
 
T
G
 
K
K
 
A
P
 
P
L
 
L
K
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
L
 
L
F
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
T
I
 
V
E
|
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
Q
 
N
F
 
F
D
 
K
R
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
F
 
F
D
 
D
T
 
P
I
 
I
S
 
S
D
 
V
F
 
V
A
 
A
A
 
D
N
 
N
A
 
A
G
x
S
-
 
S
-
 
T
-
 
R
I
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
M
V
 
A
K
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
W
 
T
V
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
L
 
M
H
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
I
 
V
E
 
V
E
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
N
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
K
 
L
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
Q
 
H
L
 
I
N
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
T
V
 
F
V
 
I
L
 
M
A
 
T
G
 
G
S
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
A
T
 
V
A
 
P
A
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
N
F
 
I
H
 
T
A
 
V
D
 
R
Y
 
Y
G
 
Q
P
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
F
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I

5d2iA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with calcium and acetate (see paper)
40% identity, 95% coverage: 13:249/249 of query aligns to 33:263/263 of 5d2iA

query
sites
5d2iA
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
M
 
M
T
 
T
I
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
D
I
 
V
Q
 
Q
R
 
W
E
 
E
W
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
A
E
 
R
G
 
G
R
 
N
T
 
K
I
 
I
K
 
V
G
 
G
R
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
R
 
W
A
 
A
M
 
K
Q
 
M
I
 
A
A
 
Q
S
 
M
Q
 
G
I
 
V
T
 
E
E
 
T
P
 
P
D
 
I
Y
 
Y
A
 
G
P
 
F
L
 
L
M
 
A
D
 
D
D
 
Y
M
 
F
F
 
S
F
 
V
D
 
P
A
x
D
G
 
G
G
 
G
D
 
V
I
 
V
P
 
D
F
 
C
E
 
S
R
 
K
F
 
L
I
 
I
A
 
H
P
 
P
R
 
K
V
 
I
E
|
E
V
 
A
E
|
E
L
 
I
A
 
S
F
 
V
I
 
V
L
 
T
G
 
K
K
 
A
P
 
P
L
 
L
K
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
L
 
L
F
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
T
I
 
V
E
|
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
Q
 
N
F
 
F
D
 
K
R
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
F
 
F
D
 
D
T
 
P
I
 
I
S
 
S
D
 
V
F
 
V
A
 
A
A
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
R
I
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
M
V
 
A
K
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
W
 
T
V
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
L
 
M
H
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
I
 
V
E
 
V
E
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
N
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
K
 
L
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
Q
 
H
L
 
I
N
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
T
V
 
F
V
 
I
L
 
M
A
 
T
G
 
G
S
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
A
T
 
V
A
 
P
A
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
N
F
 
I
H
 
T
A
 
V
D
 
R
Y
 
Y
G
 
Q
P
 
G
L
 
L
G
 
G
S
|
S
V
 
V
S
 
S
F
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I

5d2hA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and alpha-ketoglutarate (see paper)
40% identity, 95% coverage: 13:249/249 of query aligns to 33:263/263 of 5d2hA

query
sites
5d2hA
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
M
 
M
T
 
T
I
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
D
I
 
V
Q
 
Q
R
 
W
E
 
E
W
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
A
E
 
R
G
 
G
R
 
N
T
 
K
I
 
I
K
 
V
G
 
G
R
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
L
|
L
T
 
T
S
 
S
R
 
W
A
 
A
M
x
K
Q
 
M
I
 
A
A
 
Q
S
 
M
Q
 
G
I
 
V
T
 
E
E
 
T
P
 
P
D
 
I
Y
 
Y
A
 
G
P
 
F
L
 
L
M
 
A
D
 
D
D
 
Y
M
 
F
F
 
S
F
 
V
D
 
P
A
 
D
G
 
G
G
 
G
D
 
V
I
 
V
P
 
D
F
 
C
E
 
S
R
 
K
F
 
L
I
 
I
A
 
H
P
 
P
R
 
K
V
 
I
E
|
E
V
 
A
E
|
E
L
 
I
A
 
S
F
 
V
I
 
V
L
 
T
G
 
K
K
 
A
P
 
P
L
 
L
K
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
L
 
L
F
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
T
I
 
V
E
|
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
Q
 
N
F
 
F
D
 
K
R
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
F
 
F
D
 
D
T
 
P
I
 
I
S
 
S
D
 
V
F
 
V
A
 
A
A
 
D
N
 
N
A
|
A
G
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
R
I
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
M
V
 
A
K
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
W
 
T
V
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
L
 
M
H
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
I
 
V
E
 
V
E
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
N
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
K
 
L
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
Q
 
H
L
 
I
N
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
T
V
 
F
V
 
I
L
 
M
A
 
T
G
 
G
S
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
A
T
 
V
A
 
P
A
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
N
F
 
I
H
 
T
A
 
V
D
 
R
Y
 
Y
G
 
Q
P
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
F
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I

5d2gA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium (see paper)
40% identity, 95% coverage: 13:249/249 of query aligns to 33:263/263 of 5d2gA

query
sites
5d2gA
Y
 
F
P
 
P
E
 
E
M
 
M
T
 
T
I
 
F
E
 
A
D
 
D
G
 
A
Y
 
Y
A
 
D
I
 
V
Q
 
Q
R
 
W
E
 
E
W
 
I
V
 
R
R
 
R
L
 
R
E
 
K
L
 
E
A
 
A
E
 
R
G
 
G
R
 
N
T
 
K
I
 
I
K
 
V
G
 
G
R
 
L
K
 
K
I
 
M
G
 
G
L
 
L
T
 
T
S
 
S
R
 
W
A
 
A
M
 
K
Q
 
M
I
 
A
A
 
Q
S
 
M
Q
 
G
I
 
V
T
 
E
E
 
T
P
 
P
D
 
I
Y
 
Y
A
 
G
P
 
F
L
 
L
M
 
A
D
 
D
D
 
Y
M
 
F
F
 
S
F
 
V
D
 
P
A
 
D
G
 
G
G
 
G
D
 
V
I
 
V
P
 
D
F
 
C
E
 
S
R
 
K
F
 
L
I
 
I
A
 
H
P
 
P
R
 
K
V
 
I
E
|
E
V
 
A
E
|
E
L
 
I
A
 
S
F
 
V
I
 
V
L
 
T
G
 
K
K
 
A
P
 
P
L
 
L
K
 
H
G
 
G
P
 
P
G
 
G
V
 
C
T
 
H
L
 
L
F
 
G
D
 
D
V
 
V
L
 
I
S
 
A
A
 
A
T
 
I
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
T
I
 
V
E
|
E
I
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
Q
 
N
F
 
F
D
 
K
R
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
M
 
-
R
 
-
K
 
-
V
 
-
F
 
F
D
 
D
T
 
P
I
 
I
S
 
S
D
 
V
F
 
V
A
 
A
A
 
D
N
 
N
A
 
A
G
 
S
-
 
S
-
 
T
-
 
R
I
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
M
V
 
A
K
 
S
P
 
L
L
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
W
 
T
V
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
L
 
M
H
 
E
K
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
E
I
 
V
E
 
V
E
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
A
A
 
G
A
 
A
A
 
A
V
 
V
L
 
L
N
 
G
H
 
H
P
 
P
A
 
L
N
 
S
G
 
S
V
 
V
A
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
N
 
N
K
 
L
I
 
L
A
 
A
P
 
E
Y
 
R
G
 
G
E
 
E
Q
 
H
L
 
I
N
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
T
V
 
F
V
 
I
L
 
M
A
 
T
G
 
G
S
 
G
F
 
I
T
 
T
R
 
A
P
 
A
T
 
V
A
 
P
A
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
G
D
 
D
S
 
N
F
 
I
H
 
T
A
 
V
D
 
R
Y
 
Y
G
 
Q
P
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
S
V
 
V
S
 
S
F
 
A
R
 
R
F
 
F
V
 
I

Query Sequence

>Ac3H11_1483 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1483
MTRTQLRHFSLQYPEMTIEDGYAIQREWVRLELAEGRTIKGRKIGLTSRAMQIASQITEP
DYAPLMDDMFFDAGGDIPFERFIAPRVEVELAFILGKPLKGPGVTLFDVLSATDYVVPAI
EIIDSRIEQFDRETRVMRKVFDTISDFAANAGIVLGGRPVKPLDVDLRWVGALLHKNGVI
EESGLAAAVLNHPANGVAWLANKIAPYGEQLNAGDVVLAGSFTRPTAAVAGDSFHADYGP
LGSVSFRFV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory