SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_1603 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1603 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
42% identity, 88% coverage: 34:300/305 of query aligns to 8:277/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
T
 
T
L
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
A
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
V
A
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
E
T
 
S
S
 
S
P
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
S
Y
 
Y
A
 
-
L
 
Y
G
 
D
A
 
N
N
 
Q
E
 
Q
K
 
K
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
H
 
S
V
 
Q
E
 
D
-
 
Y
-
 
S
-
 
N
-
 
A
L
 
I
C
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
L
 
K
K
 
K
E
 
K
I
 
L
-
 
N
A
 
K
P
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
Q
L
 
V
E
 
K
Y
 
L
M
 
I
A
 
P
V
 
I
T
 
T
A
x
S
Q
 
Q
N
 
N
T
x
R
L
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
F
D
 
D
I
 
F
G
 
E
C
 
C
G
 
G
P
x
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
T
 
V
A
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
T
T
 
I
Y
 
F
V
 
V
S
 
V
E
 
G
V
 
T
R
 
R
M
 
L
A
 
L
V
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
D
 
D
L
 
I
K
 
K
S
 
D
I
 
F
N
 
A
Q
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
A
I
 
V
A
 
V
A
 
V
S
 
T
T
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
S
V
 
E
Q
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
N
K
 
K
-
 
L
-
 
N
Q
 
E
E
 
E
R
 
Q
V
 
K
L
 
M
G
 
N
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
M
K
 
R
T
 
I
V
 
I
L
 
S
G
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
H
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
L
 
R
L
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
D
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
L
x
M
D
|
D
D
 
D
N
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
E
I
 
R
A
 
A
N
 
K
S
 
A
K
 
K
D
 
K
P
 
P
S
 
D
A
 
N
Y
 
W
R
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
Q
G
 
S
A
 
Q
E
 
E
P
 
A
I
 
Y
A
 
G
L
 
C
L
 
M
F
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
F
 
F
K
 
K
A
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
G
 
D
V
 
T
L
 
I
T
 
A
K
 
Q
L
 
V
M
 
Q
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
W
Y
 
F
T
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
V
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
N
 
N
M
 
L
S
 
N
L
 
M
N
 
N
L
 
F
P
 
E
L
 
L
G
 
S
T
 
D
T
 
E
L
 
M
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
K
T
 
E
P
 
P
N
 
N
D
 
D
K
 
K
P
 
A
L
 
L

2vhaA Debp (see paper)
42% identity, 88% coverage: 34:300/305 of query aligns to 7:276/276 of 2vhaA

query
sites
2vhaA
T
 
T
L
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
A
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
V
A
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
E
T
 
S
S
 
S
P
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
S
Y
 
Y
A
 
-
L
 
Y
G
 
D
A
 
N
N
 
Q
E
 
Q
K
 
K
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
H
 
S
V
 
Q
E
 
D
-
 
Y
-
 
S
-
 
N
-
 
A
L
 
I
C
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
V
L
 
K
K
 
K
E
 
K
I
 
L
-
 
N
A
 
K
P
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
Q
L
 
V
E
 
K
Y
 
L
M
 
I
A
 
P
V
 
I
T
 
T
A
x
S
Q
 
Q
N
 
N
T
x
R
L
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
F
D
 
D
I
 
F
G
 
E
C
 
C
G
 
G
P
x
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
T
 
V
A
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
T
T
 
I
Y
 
F
V
 
V
S
 
V
E
 
G
V
 
T
R
 
R
M
 
L
A
 
L
V
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
D
 
D
L
 
I
K
 
K
S
 
D
I
 
F
N
 
A
Q
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
A
I
 
V
A
 
V
A
 
V
S
 
T
T
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
S
V
 
E
Q
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
N
K
 
K
-
 
L
-
 
N
Q
 
E
E
 
E
R
 
Q
V
 
K
L
 
M
G
 
N
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
M
K
 
R
T
 
I
V
 
I
L
 
S
G
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
H
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
L
 
R
L
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
D
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
L
x
M
D
|
D
D
 
D
N
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
E
I
 
R
A
 
A
N
 
K
S
 
A
K
 
K
D
 
K
P
 
P
S
 
D
A
 
N
Y
 
W
R
 
D
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
Q
G
 
S
A
 
Q
E
 
E
P
 
A
I
 
Y
A
 
G
L
 
C
L
 
M
F
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
F
 
F
K
 
K
A
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
G
 
D
V
 
T
L
 
I
T
 
A
K
 
Q
L
 
V
M
 
Q
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
W
Y
 
F
T
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
V
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
K
N
 
N
M
 
L
S
 
N
L
 
M
N
 
N
L
 
F
P
 
E
L
 
L
G
 
S
T
 
D
T
 
E
L
 
M
R
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
F
A
 
K
T
 
E
P
 
P
N
 
N
D
 
D
K
 
K
P
 
A
L
 
L

8ovoA X-ray structure of the sf-iglusnfr-s72a in complex with l-aspartate
40% identity, 79% coverage: 34:273/305 of query aligns to 5:247/503 of 8ovoA

query
sites
8ovoA
T
 
T
L
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
A
A
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
V
A
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
H
R
|
R
E
 
E
T
 
S
S
 
S
P
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
S
Y
 
Y
A
 
-
L
 
Y
G
 
D
A
 
N
N
 
Q
E
 
Q
K
 
K
Y
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
H
 
S
V
 
Q
E
 
D
L
 
Y
C
 
S
E
 
N
R
 
A
V
 
I
L
 
V
K
 
E
E
 
A
I
 
V
A
 
K
-
 
K
-
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
K
P
 
P
D
 
D
A
 
L
K
 
Q
L
 
V
E
 
K
Y
 
L
M
 
I
A
 
P
V
 
I
T
 
T
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
T
x
R
L
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
F
D
 
D
I
 
F
G
 
E
C
 
C
G
 
G
P
x
S
T
 
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
T
 
V
A
 
E
R
|
R
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
T
T
 
I
Y
 
F
V
 
V
S
 
V
E
 
G
V
 
T
R
 
R
M
 
L
A
 
L
V
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
G
D
 
D
L
 
I
K
 
K
S
 
D
I
 
F
N
 
A
Q
 
N
L
 
L
A
 
K
G
 
D
R
 
K
T
 
A
I
 
V
A
 
V
A
 
V
S
 
T
T
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
S
V
 
E
Q
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
N
K
 
K
-
 
L
-
 
N
Q
 
E
E
 
E
R
 
Q
V
 
K
L
 
M
G
 
N
G
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
M
K
 
R
T
 
I
V
 
I
L
 
S
G
 
A
K
 
K
D
 
D
H
|
H
H
 
G
E
 
D
S
 
S
F
 
F
L
 
R
L
 
T
L
 
L
E
 
E
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
D
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
L
 
M
D
|
D
D
 
D
N
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
E
I
 
R
A
 
A
N
 
K
S
 
A
K
 
K
D
 
K
P
 
P
S
 
D
A
 
N
Y
 
W
R
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
K
P
 
P
L
 
Q
G
 
S
A
 
Q
E
 
E
P
 
A
I
 
Y
A
 
G
L
 
C
L
 
M
F
 
L
R
 
R
K
 
K
D
 
D
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
F
 
F
K
 
K
A
 
K
A
 
L
V
 
M
D
 
D
G
 
D
V
 
T
L
 
I
T
 
A
K
 
Q
L
 
V
M
 
Q
Q
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
W
Y
 
F
T
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
V
 
K
N
 
N
P
 
P
I
 
I

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
27% identity, 80% coverage: 32:276/305 of query aligns to 3:241/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
Q
 
E
P
 
D
T
 
I
L
 
L
E
 
E
K
 
R
I
 
S
K
 
K
A
 
S
S
 
T
G
 
N
K
 
E
A
 
I
V
 
I
L
 
W
G
 
G
V
 
V
R
 
K
E
 
Y
T
 
D
S
 
T
P
 
R
P
 
L
M
 
F
A
 
G
Y
 
M
A
 
M
L
 
D
G
 
I
A
 
E
N
 
S
E
 
R
K
 
T
Y
 
V
V
 
Q
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
I
C
 
A
E
 
K
R
 
A
V
 
I
L
 
T
K
 
K
E
 
K
I
 
I
A
 
L
P
 
G
D
 
D
-
 
N
A
 
G
K
 
K
L
 
T
E
 
E
Y
 
F
M
 
V
A
 
E
V
 
V
T
 
T
A
x
S
Q
 
K
N
 
T
T
x
R
L
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
T
 
N
L
 
I
D
 
D
I
 
A
G
 
I
C
 
I
G
 
A
P
x
T
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
T
 
D
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
V
T
 
Y
Y
 
F
V
 
D
S
 
A
E
 
G
V
 
Q
R
 
A
M
 
L
A
 
L
V
 
V
R
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
S
D
 
Q
L
 
I
K
 
K
S
 
S
I
 
V
N
 
D
Q
 
D
L
 
L
-
 
N
A
 
A
G
 
S
R
 
T
T
 
T
I
 
V
A
 
L
A
 
A
S
 
V
T
 
K
G
 
G
T
x
S
T
|
T
A
 
S
V
 
A
Q
 
A
L
 
N
L
 
I
R
 
R
K
 
Q
Q
 
H
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
P
I
 
D
K
 
A
T
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
E
-
 
L
K
 
E
D
 
N
H
x
Y
H
 
A
E
 
E
S
 
A
F
 
F
L
 
T
L
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
G
D
 
D
A
 
A
F
 
M
V
 
T
L
 
T
D
|
D
D
 
N
N
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
M
 
I
I
 
-
A
 
-
N
 
-
S
 
A
K
 
D
D
 
E
P
 
N
S
 
P
A
 
E
Y
 
Y
R
 
E
I
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
G
P
 
T
L
 
F
G
 
T
A
 
N
E
 
E
P
 
P
I
 
Y
A
 
G
L
 
I
L
 
A
F
 
I
R
 
N
K
 
K
D
 
G
D
 
Q
P
 
E
T
 
N
F
 
F
K
 
L
A
 
K
A
 
A
V
 
V
D
 
N
G
 
Q
V
 
A
L
 
L
T
 
E
K
 
E
L
 
M
M
 
H
Q
 
A
S
 
D
G
 
G
E
 
T
M
 
Y
E
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
Y
T
 
Q
K
 
K
W
 
W
F
 
F
V
 
P
N
 
N
P
 
E
I
 
T
P
 
E
P
 
G
K
 
K

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
28% identity, 73% coverage: 46:269/305 of query aligns to 8:223/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
x
E
E
 
A
T
 
T
S
x
F
P
 
P
P
 
P
M
 
F
A
 
G
Y
 
F
A
 
K
L
 
-
G
 
D
A
 
E
N
 
N
E
 
G
K
 
K
Y
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
L
C
 
A
E
 
K
R
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
G
P
 
-
D
 
-
A
 
V
K
 
K
L
 
V
E
 
E
Y
 
F
M
 
K
A
 
P
V
 
M
T
 
D
A
x
F
Q
 
D
N
 
G
T
 
I
L
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
V
G
 
V
C
 
I
G
 
A
P
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
T
 
E
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
P
T
 
Y
Y
 
F
V
 
E
S
 
A
E
 
G
V
 
Q
R
 
A
M
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
N
D
 
D
-
 
S
L
 
I
K
 
K
S
 
S
I
 
L
N
 
E
Q
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
K
I
 
V
A
 
G
A
 
V
S
 
Q
T
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
A
 
S
V
 
E
Q
 
Q
L
 
H
L
 
V
R
 
K
K
 
K
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
V
L
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
V
P
 
K
I
 
V
K
 
K
T
 
K
V
 
F
L
 
-
G
 
-
K
 
D
D
 
N
H
 
F
H
 
S
E
 
E
S
 
A
F
 
F
L
 
Q
L
 
E
L
 
L
E
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
-
V
 
V
L
 
V
D
 
T
D
|
D
N
 
N
L
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
L
M
 
A
I
 
Y
A
 
V
N
 
K
S
 
Q
K
 
N
D
 
P
P
 
N
S
 
A
A
 
G
Y
 
V
R
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
P
 
T
L
 
F
G
 
S
A
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
Y
A
 
G
L
 
I
L
 
A
F
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
S
T
 
E
F
 
L
K
 
L
A
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
N
G
 
K
V
 
A
L
 
L
T
 
E
K
 
E
L
 
M
M
 
K
Q
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
M
 
Y
E
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
Y
T
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
28% identity, 73% coverage: 46:269/305 of query aligns to 8:225/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
x
E
E
 
A
T
 
T
S
x
F
P
 
P
P
 
P
M
 
F
A
 
G
Y
 
F
A
 
K
L
 
-
G
 
D
A
 
E
N
 
N
E
 
G
K
 
K
Y
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
L
C
 
A
E
 
K
R
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
G
P
 
-
D
 
-
A
 
V
K
 
K
L
 
V
E
 
E
Y
 
F
M
 
K
A
 
P
V
 
M
T
 
D
A
x
F
Q
 
D
N
 
G
T
 
I
L
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
V
G
 
V
C
 
I
G
x
A
P
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
T
 
E
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
P
T
 
Y
Y
 
F
V
 
E
S
 
A
E
 
G
V
 
Q
R
 
A
M
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
K
K
 
K
D
 
G
S
 
N
D
 
D
-
 
S
L
 
I
K
 
K
S
 
S
I
 
L
N
 
E
Q
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
K
I
 
V
A
 
G
A
 
V
S
x
Q
T
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
A
 
S
V
 
E
Q
 
Q
L
 
H
L
 
V
R
 
K
K
 
K
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
V
L
 
A
G
 
K
G
 
D
A
 
A
P
 
G
I
 
V
K
 
K
T
 
V
V
 
K
L
 
K
G
 
F
K
 
D
D
 
N
H
 
F
H
 
S
E
 
E
S
 
A
F
 
F
L
 
Q
L
 
E
L
 
L
E
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
-
V
 
V
L
 
V
D
 
T
D
|
D
N
 
N
L
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
L
M
 
A
I
 
Y
A
 
V
N
 
K
S
 
Q
K
 
N
D
 
P
P
 
N
S
 
A
A
 
G
Y
 
V
R
 
K
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
P
 
T
L
 
F
G
 
S
A
 
G
E
 
E
P
 
P
I
 
Y
A
 
G
L
 
I
L
 
A
F
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
S
T
 
E
F
 
L
K
 
L
A
 
E
A
 
K
V
 
I
D
 
N
G
 
K
V
 
A
L
 
L
T
 
E
K
 
E
L
 
M
M
 
K
Q
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
M
 
Y
E
 
D
K
 
K
I
 
I
Y
 
Y
T
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
29% identity, 77% coverage: 34:269/305 of query aligns to 2:228/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
T
 
T
L
 
L
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
M
A
 
K
S
 
R
G
 
G
K
 
T
A
 
L
V
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
x
D
E
 
A
T
 
D
S
x
Y
P
 
K
P
 
P
M
 
F
A
 
S
Y
 
F
A
 
K
L
 
-
G
 
D
A
 
K
N
 
N
E
 
G
K
 
Q
Y
 
Y
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
L
C
 
A
E
 
K
R
 
A
V
 
L
L
 
A
K
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
G
P
 
-
D
 
-
A
 
V
K
 
K
L
 
V
E
 
E
Y
 
F
M
 
V
A
 
P
V
 
T
T
 
T
A
x
W
Q
 
D
N
 
G
T
 
I
L
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
T
G
 
G
T
 
K
L
 
F
D
 
D
I
 
I
G
 
V
C
 
M
G
x
S
P
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
T
 
P
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
K
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
P
T
 
Y
Y
 
M
V
 
T
S
 
A
E
 
G
V
 
Q
R
 
T
M
 
I
A
 
L
V
 
V
R
 
K
K
 
K
D
 
D
S
 
N
-
 
A
-
 
D
D
 
K
L
 
I
K
 
K
S
 
S
I
 
F
N
 
E
Q
 
D
L
 
L
A
 
N
-
 
K
-
 
P
G
 
D
R
 
V
T
 
K
I
 
V
A
 
A
A
 
V
S
x
Q
T
 
L
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
S
V
 
E
Q
 
Q
L
 
A
L
 
A
R
 
K
K
 
E
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
F
L
 
L
G
 
P
G
 
K
A
 
A
P
 
K
I
 
I
K
 
R
T
 
T
V
 
F
L
 
-
G
 
-
K
 
E
D
 
N
H
 
N
H
 
A
E
 
E
S
 
A
F
 
F
L
 
Q
L
 
E
L
 
V
E
 
V
S
 
S
G
 
G
R
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
M
V
 
V
L
 
T
D
|
D
D
 
-
N
 
S
L
 
P
L
 
V
A
 
A
G
 
A
M
 
Y
I
 
Y
A
 
A
N
 
K
S
 
L
K
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
A
Y
 
V
R
 
V
I
 
V
V
 
V
G
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
F
G
 
T
A
 
H
E
 
E
P
 
P
I
 
L
A
 
G
L
 
F
L
 
A
F
 
I
R
 
R
K
 
K
D
 
G
D
 
D
P
 
P
T
 
E
F
 
L
K
 
L
A
 
N
A
 
W
V
 
V
D
 
N
G
 
N
V
 
W
L
 
L
T
 
K
K
 
Q
L
 
M
M
 
K
Q
 
K
S
 
D
G
 
G
E
 
T
M
 
Y
E
 
D
K
 
K
I
 
L
Y
 
Y
T
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
28% identity, 77% coverage: 35:269/305 of query aligns to 3:227/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
L
 
I
E
 
D
K
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
S
S
 
R
G
 
G
K
 
Y
A
 
L
V
 
L
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
S
E
 
A
T
 
D
S
x
F
P
 
P
P
 
P
M
 
F
A
 
E
Y
 
F
A
 
-
L
 
V
G
 
D
A
 
E
N
 
N
E
 
G
K
 
N
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
L
C
 
A
E
 
K
R
 
E
V
 
I
L
 
A
K
 
R
E
 
R
I
 
L
A
 
G
P
 
V
D
 
E
A
 
L
K
 
K
L
 
I
E
 
V
Y
 
D
M
 
M
A
 
-
V
 
-
T
 
T
A
x
F
Q
 
D
N
 
G
T
 
L
L
 
I
P
 
P
L
 
S
V
 
L
Q
 
L
N
 
T
G
 
K
T
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
V
G
 
I
C
 
I
G
x
S
P
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
T
 
E
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
P
T
 
Y
Y
 
F
V
 
D
S
 
A
E
 
G
V
 
Q
R
 
V
M
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
D
S
 
S
D
 
D
L
 
F
-
 
R
-
 
P
K
 
K
S
 
T
I
 
Y
N
 
E
Q
 
D
L
 
L
A
 
V
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
V
S
x
Q
T
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
G
V
 
D
Q
 
I
L
 
E
L
 
V
R
 
S
K
 
K
Q
 
Y
E
 
D
R
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
P
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
V
V
 
V
L
 
R
G
 
F
K
 
D
D
 
K
H
 
F
H
 
T
E
 
D
S
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
E
L
 
L
E
 
K
S
 
R
G
 
G
R
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
L
 
L
D
|
D
D
 
S
N
 
A
L
 
T
L
 
A
A
 
R
G
 
A
M
 
F
I
 
V
A
 
A
N
 
K
S
 
N
K
 
P
D
 
D
P
 
L
S
 
V
A
 
-
Y
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
S
G
 
S
E
 
G
P
 
V
L
 
L
G
 
S
A
 
S
E
 
E
P
 
Q
I
 
Y
A
 
G
L
 
I
L
 
A
F
 
V
R
 
R
K
 
K
D
 
E
D
 
D
P
 
T
T
 
D
F
 
L
K
 
L
A
 
E
A
 
F
V
 
I
D
 
N
G
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
R
K
 
E
L
 
L
M
 
K
Q
 
K
S
 
S
G
 
G
E
 
K
M
 
Y
E
 
D
K
 
V
I
 
L
Y
 
I
T
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

1xt8B Crystal structure of cysteine-binding protein from campylobacter jejuni at 2.0 a resolution (see paper)
29% identity, 77% coverage: 31:265/305 of query aligns to 3:230/251 of 1xt8B

query
sites
1xt8B
T
 
T
Q
 
L
P
 
N
T
 
S
L
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
I
K
 
K
A
 
Q
S
 
N
G
 
G
K
 
V
A
 
V
V
 
R
L
 
I
G
 
G
V
 
V
R
x
F
E
 
G
T
 
D
S
x
K
P
 
P
P
 
P
M
 
F
A
 
G
Y
 
Y
A
 
V
-
 
D
-
 
E
L
 
K
G
 
G
A
 
N
N
 
N
E
 
Q
K
 
-
Y
 
-
V
 
-
G
 
G
Y
 
Y
H
 
D
V
 
I
E
 
A
L
 
L
C
 
A
E
 
K
R
 
R
V
 
I
L
 
A
K
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
F
P
 
G
D
 
D
A
 
E
-
 
N
K
 
K
L
 
V
E
 
Q
Y
 
F
M
 
V
A
 
L
V
 
V
T
 
E
A
 
A
Q
 
A
N
 
N
T
x
R
L
 
V
P
 
E
L
 
F
V
 
L
Q
 
K
N
 
S
G
 
N
T
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
I
C
 
L
G
 
A
P
x
N
T
 
F
T
|
T
N
 
Q
N
 
T
T
 
P
A
 
Q
R
|
R
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
C
V
 
S
T
 
P
T
 
Y
Y
 
M
V
 
K
S
 
V
E
 
A
V
 
L
R
 
G
M
 
V
A
 
A
V
 
V
R
 
P
K
 
K
D
 
D
S
 
S
D
 
N
L
 
I
K
 
T
S
 
S
I
 
V
N
 
E
Q
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
D
R
 
K
T
 
T
I
 
L
A
 
L
A
 
L
S
 
N
T
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
A
V
 
D
Q
 
A
L
 
Y
L
 
F
R
 
T
K
 
Q
Q
 
N
E
 
Y
R
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
P
P
 
N
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
L
L
 
K
G
 
Y
K
 
D
D
 
Q
H
 
N
H
 
T
E
 
E
S
 
T
F
 
F
L
 
A
L
 
A
L
 
L
E
 
M
S
 
D
G
 
K
R
 
R
A
 
G
D
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
L
x
H
D
|
D
D
 
N
N
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
F
G
 
A
M
 
W
I
 
V
A
 
-
N
 
-
S
 
-
K
 
K
D
 
D
P
 
H
S
 
P
A
 
D
Y
 
F
R
 
K
I
 
M
V
 
G
G
 
I
E
 
K
P
 
E
L
 
L
G
 
G
-
 
N
A
 
K
E
 
D
P
 
V
I
 
I
A
 
A
L
 
P
L
 
A
F
 
V
R
 
K
K
 
K
D
 
G
D
 
D
P
 
K
T
 
E
F
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
N
V
 
L
L
 
I
T
 
I
K
 
K
L
 
L
M
 
G
Q
 
Q
S
 
E
G
 
Q
E
 
F
M
 
F
E
 
H
K
 
K
I
 
A
Y
 
Y

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
24% identity, 77% coverage: 35:268/305 of query aligns to 3:229/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
L
 
L
E
 
E
K
 
S
I
 
I
K
 
K
A
 
S
S
 
K
G
 
G
K
 
Q
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
V
R
x
K
E
 
N
T
 
D
S
 
V
P
 
P
P
 
H
M
 
Y
A
 
A
Y
 
L
A
 
L
L
 
D
G
 
Q
A
 
A
N
 
T
E
 
G
K
 
E
Y
 
I
V
 
K
G
 
G
Y
 
F
H
 
E
V
 
V
E
 
D
L
 
V
C
 
A
E
 
K
R
 
L
V
 
L
L
 
A
K
 
K
E
 
S
I
 
I
-
 
L
A
 
G
P
 
D
D
 
D
A
 
K
K
 
K
L
 
I
E
 
K
Y
 
L
M
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
N
A
 
A
Q
 
K
N
 
T
T
x
R
L
 
G
P
 
P
L
 
L
V
 
L
Q
 
D
N
 
N
G
 
G
T
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
A
G
 
V
C
 
I
G
 
A
P
x
T
T
 
F
T
|
T
N
 
I
N
 
T
T
 
P
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
R
Q
 
I
V
 
Y
A
 
N
F
 
F
A
 
S
V
 
E
T
 
P
T
 
Y
Y
 
Y
V
 
Q
S
 
D
E
 
A
V
 
I
R
 
G
M
 
L
A
 
L
V
 
V
R
 
L
K
 
K
D
 
E
S
 
K
D
 
K
L
 
Y
K
 
K
S
 
S
I
 
L
N
 
A
Q
 
D
L
 
M
A
 
K
G
 
G
R
 
A
T
 
N
I
 
I
A
 
G
A
 
V
S
 
A
T
 
Q
G
 
A
T
x
A
T
|
T
A
 
T
V
 
K
Q
 
K
L
 
A
L
 
I
R
 
G
K
 
E
Q
 
A
E
 
A
R
 
K
V
 
K
L
 
I
G
 
-
G
 
G
A
 
I
P
 
D
I
 
V
K
 
K
T
 
F
V
 
S
L
 
E
G
 
F
K
 
P
D
 
D
H
x
Y
H
 
P
E
 
S
S
 
I
F
 
K
L
 
A
L
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
A
G
 
K
R
 
R
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
V
 
S
L
 
V
D
|
D
D
 
K
N
 
S
L
x
I
L
 
L
A
 
L
G
 
G
M
 
Y
I
 
V
A
 
D
N
 
D
S
 
K
K
 
S
D
 
E
P
 
-
S
 
-
A
 
-
Y
 
-
R
 
-
I
 
I
V
 
L
G
 
P
E
 
D
P
 
S
L
 
F
G
 
E
A
 
P
E
 
Q
P
 
S
I
 
Y
A
 
G
L
 
I
L
 
V
F
 
T
R
 
K
K
 
K
D
 
D
D
 
D
P
 
P
T
 
A
F
 
F
K
 
A
A
 
K
A
 
Y
V
 
V
D
 
D
G
 
D
V
 
F
L
 
V
T
 
K
K
 
E
L
 
-
M
 
-
Q
 
H
S
 
K
G
 
N
E
 
E
M
 
I
E
 
D
K
 
A
I
 
L
Y
 
A
T
 
K
K
 
K
W
 
W

8eyzA Engineered glutamine binding protein bound to gln and a cobaloxime ligand (see paper)
26% identity, 75% coverage: 40:269/305 of query aligns to 1:221/226 of 8eyzA

query
sites
8eyzA
A
 
A
S
 
D
G
 
K
K
 
K
A
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
A
V
 
T
R
x
D
E
 
T
T
 
A
S
x
F
P
 
V
P
 
P
M
 
F
A
 
E
Y
 
F
A
 
K
L
 
Q
G
 
G
A
 
-
N
 
-
E
 
D
K
 
I
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
L
C
 
W
E
 
A
R
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
K
E
 
E
I
 
L
A
 
K
P
 
L
D
 
D
A
 
Y
K
 
E
L
 
L
E
 
K
Y
 
P
M
 
M
A
 
D
V
x
F
T
 
S
A
 
G
Q
 
-
N
 
-
T
 
I
L
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
T
G
 
K
T
 
N
L
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
A
C
 
L
G
x
A
P
x
G
T
 
I
T
|
T
N
 
I
N
x
C
T
 
D
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
A
V
 
I
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
G
T
 
Y
Y
 
Y
V
 
K
S
 
S
E
 
G
V
 
L
R
 
L
M
 
V
A
 
M
V
 
V
R
 
K
-
 
A
K
 
N
D
 
N
S
 
N
D
 
D
L
 
V
K
 
K
S
 
S
I
 
V
N
 
K
Q
 
D
L
 
L
A
 
D
G
 
G
R
 
K
T
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
V
S
 
K
T
 
S
G
 
G
T
 
T
T
x
G
A
 
S
V
 
V
Q
x
D
L
 
Y
L
 
A
R
 
K
K
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
A
P
 
N
I
 
I
K
 
K
T
 
T
V
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
K
D
 
D
H
 
L
H
 
R
E
 
Q
-
 
F
-
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
D
-
 
N
S
 
A
F
 
Y
L
 
M
L
 
E
L
 
L
E
 
G
S
 
T
G
 
N
R
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
L
L
 
H
D
|
D
D
 
T
-
 
P
N
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
-
G
 
-
M
 
Y
I
 
F
A
 
I
N
 
K
S
 
T
K
 
A
D
 
G
P
 
N
S
 
G
A
 
Q
Y
 
F
R
 
K
I
 
A
V
 
V
G
 
G
E
 
D
P
 
S
L
 
L
G
 
E
A
 
A
E
 
Q
P
 
Q
I
 
Y
A
 
G
L
 
I
L
 
A
F
 
F
R
 
P
K
 
K
D
 
G
D
 
S
P
 
D
T
 
E
F
 
L
K
 
R
A
 
D
A
 
K
V
 
V
D
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
L
T
 
K
K
 
T
L
 
L
M
 
R
Q
 
E
S
 
N
G
 
G
E
 
T
M
 
Y
E
 
N
K
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F

4i62A 1.05 angstrom crystal structure of an amino acid abc transporter substrate-binding protein abpa from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a bound to l-arginine
27% identity, 77% coverage: 35:269/305 of query aligns to 1:231/237 of 4i62A

query
sites
4i62A
L
 
I
E
 
E
K
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
S
S
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
A
V
 
L
R
x
N
E
 
P
T
 
D
S
x
F
P
 
A
P
 
P
M
 
F
A
 
E
Y
 
Y
-
 
Q
-
 
K
A
 
V
L
 
V
G
 
D
A
 
G
N
 
K
E
 
N
K
 
Q
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
S
H
 
D
V
 
I
E
 
E
L
 
L
C
 
A
E
 
K
R
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
T
E
 
E
I
 
L
A
 
G
P
 
-
D
 
-
A
 
V
K
 
E
L
 
L
E
 
E
Y
 
L
M
 
S
A
 
P
V
 
M
T
 
S
A
x
F
Q
 
D
N
 
N
T
 
V
L
 
L
P
 
A
L
 
S
V
 
V
Q
 
Q
N
 
S
G
 
G
T
 
K
L
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
A
C
 
I
G
x
S
P
x
G
T
x
V
T
x
S
N
 
K
N
 
T
T
 
D
A
 
E
R
|
R
Q
 
S
Q
 
K
Q
 
V
V
 
F
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
T
T
 
P
T
 
Y
Y
 
Y
V
 
T
S
 
A
E
 
K
V
 
N
R
 
K
M
 
L
A
 
I
V
 
V
R
 
K
K
 
K
D
 
-
S
 
S
D
 
D
L
 
L
-
 
A
-
 
T
-
 
Y
K
 
Q
S
 
S
I
 
V
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
R
 
K
T
 
K
I
 
V
A
 
G
A
 
A
S
x
Q
T
 
K
G
 
G
-
x
S
-
x
I
-
x
Q
-
 
E
T
 
T
T
 
M
A
 
A
V
 
K
Q
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
-
K
 
-
Q
 
Q
E
 
N
R
 
S
V
 
S
L
 
L
G
 
V
G
 
S
A
 
L
P
 
P
I
 
K
K
 
N
T
 
G
V
 
N
L
 
L
G
 
I
K
 
T
D
 
D
H
 
-
H
 
-
E
 
-
S
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
L
E
 
K
S
 
S
G
 
G
R
 
Q
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
I
L
 
F
D
x
E
D
 
E
N
 
P
L
 
V
L
 
A
A
 
K
G
 
G
M
 
F
I
 
V
A
 
E
N
 
N
S
 
N
K
 
P
D
 
D
P
 
L
S
 
A
A
 
I
Y
 
A
R
 
D
I
 
L
V
 
N
G
 
F
E
 
E
P
 
K
L
 
Q
G
 
D
A
 
-
E
 
D
P
 
S
I
 
Y
A
 
A
L
 
V
L
 
A
F
 
M
R
 
K
K
 
K
D
 
D
D
 
S
P
 
K
T
 
E
F
 
L
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
K
V
 
T
L
 
I
T
 
Q
K
 
K
L
 
L
M
 
K
Q
 
E
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
L
E
 
D
K
 
K
I
 
L
Y
 
I
T
 
E
K
 
D
W
 
A
F
 
F

4ymxA Crystal structure of the substrate binding protein of an amino acid abc transporter (see paper)
25% identity, 75% coverage: 42:269/305 of query aligns to 1:222/224 of 4ymxA

query
sites
4ymxA
G
 
G
K
 
V
A
 
I
V
 
V
L
 
M
G
 
G
V
 
T
R
x
S
E
 
A
T
x
D
S
x
F
P
 
P
P
 
P
M
 
F
A
 
E
Y
 
F
-
 
H
-
 
K
A
 
V
L
 
E
G
 
G
A
 
G
N
 
K
E
 
D
K
 
E
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
I
E
 
D
L
 
I
C
 
A
E
 
N
R
 
A
V
 
I
L
 
A
K
 
K
E
 
K
I
 
L
A
 
G
P
 
-
D
 
-
A
 
V
K
 
K
L
 
L
E
 
E
Y
 
I
M
 
K
A
 
D
V
 
M
T
 
D
A
x
F
Q
 
K
N
 
G
T
 
L
L
 
I
P
 
P
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
A
G
 
G
T
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
M
G
 
V
C
 
I
G
x
A
P
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
P
N
 
T
T
 
A
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
K
Q
 
S
V
 
V
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
L
T
 
Y
Y
 
Y
V
 
D
S
 
S
E
 
R
V
 
Q
R
 
V
M
 
V
A
 
V
V
 
V
R
 
K
K
 
N
D
 
D
S
 
S
D
 
P
L
 
I
K
 
S
S
 
K
I
 
F
N
 
D
Q
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
V
R
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
V
S
x
Q
T
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
S
V
 
E
Q
 
E
L
 
A
L
 
A
R
 
K
K
 
K
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
I
G
 
P
G
 
N
A
 
V
P
 
K
I
 
L
K
 
K
T
 
Q
V
 
L
L
 
-
G
 
-
K
 
N
D
 
R
H
 
V
H
 
S
E
 
D
S
 
E
F
 
F
L
 
M
L
 
D
L
 
L
E
 
Q
S
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
I
V
 
V
L
 
V
D
x
E
D
 
D
N
 
T
L
 
V
L
 
A
A
 
K
G
 
A
M
 
Y
I
 
L
A
 
K
N
 
E
S
 
Y
K
 
K
D
 
D
P
 
M
S
 
K
A
 
I
Y
 
L
R
 
Y
I
 
M
V
 
D
G
 
E
E
 
I
P
 
N
L
 
N
G
 
V
A
 
E
E
 
N
P
 
G
I
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
A
F
 
V
R
 
A
K
 
K
D
 
G
D
 
N
P
 
K
T
 
S
F
 
L
K
 
L
A
 
D
A
 
V
V
 
V
D
 
N
G
 
E
V
 
V
L
 
I
T
 
K
K
 
E
L
 
L
M
 
K
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
E
 
E
M
 
Y
E
 
D
K
 
K
I
 
L
Y
 
V
T
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
22% identity, 78% coverage: 38:275/305 of query aligns to 47:281/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
I
 
I
K
 
R
A
 
A
S
 
R
G
 
G
K
 
R
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
D
E
 
I
T
 
G
S
 
S
P
 
N
P
 
L
M
 
F
A
 
S
Y
 
F
A
 
R
L
 
D
G
 
P
A
 
I
N
 
T
E
 
G
K
 
E
Y
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
I
C
 
A
E
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
A
K
 
R
E
 
D
I
 
I
-
 
F
A
 
G
P
 
V
D
 
P
A
 
S
K
 
H
L
 
V
E
 
E
Y
 
Y
M
 
R
A
 
I
V
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
A
N
 
E
T
x
R
L
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
L
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
V
C
 
V
G
 
K
P
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
T
 
C
A
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
A
 
S
V
 
T
T
 
V
T
 
Y
Y
 
L
V
 
D
S
 
A
E
 
N
V
 
Q
R
 
R
M
 
I
A
 
L
V
 
A
R
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
D
 
P
L
 
I
K
 
T
S
 
K
I
 
V
N
 
S
Q
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
K
T
 
R
I
 
V
A
 
C
A
 
V
S
 
A
T
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
S
V
 
L
Q
 
R
L
 
R
L
 
I
R
 
R
K
 
E
Q
 
I
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
A
A
 
P
P
 
P
I
 
P
K
 
V
T
 
I
V
 
V
L
 
S
G
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
H
 
A
E
 
D
S
 
C
F
 
L
L
 
V
L
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
L
 
T
D
|
D
D
 
D
N
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
I
 
V
A
 
-
N
 
-
S
 
E
K
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
Y
A
 
L
Y
 
H
R
 
-
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
P
 
D
L
 
M
G
 
A
A
 
D
E
 
Q
P
 
P
I
 
Y
A
 
G
L
 
V
L
 
G
F
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
P
 
T
T
 
G
F
 
L
K
 
V
A
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
G
 
G
V
 
T
L
 
L
T
 
E
K
 
R
L
 
I
M
 
R
Q
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
M
 
W
E
 
N
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
T
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
V
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
N
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
22% identity, 78% coverage: 38:275/305 of query aligns to 47:281/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
I
 
I
K
 
R
A
 
A
S
 
R
G
 
G
K
 
R
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
D
E
 
I
T
 
G
S
 
S
P
 
N
P
 
L
M
 
F
A
 
S
Y
 
F
A
 
R
L
 
D
G
 
P
A
 
I
N
 
T
E
 
G
K
 
E
Y
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
I
C
 
A
E
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
A
K
 
R
E
 
D
I
 
I
-
 
F
A
 
G
P
 
V
D
 
P
A
 
S
K
 
H
L
 
V
E
 
E
Y
 
Y
M
 
R
A
 
I
V
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
A
N
 
E
T
x
R
L
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
L
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
V
C
 
V
G
 
K
P
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
T
 
C
A
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
A
 
S
V
 
T
T
 
V
T
 
Y
Y
 
L
V
 
D
S
 
A
E
 
N
V
 
Q
R
 
R
M
 
I
A
 
L
V
 
A
R
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
D
 
P
L
 
I
K
 
T
S
 
K
I
 
V
N
 
S
Q
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
K
T
 
R
I
 
V
A
 
C
A
 
V
S
 
A
T
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
S
V
 
L
Q
 
R
L
 
R
L
 
I
R
 
R
K
 
E
Q
 
I
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
A
A
 
P
P
 
P
I
 
P
K
 
V
T
 
I
V
 
V
L
 
S
G
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
H
 
A
E
 
D
S
 
C
F
 
L
L
 
V
L
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
L
 
T
D
|
D
D
 
D
N
 
T
L
x
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
I
 
V
A
 
-
N
 
-
S
 
E
K
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
Y
A
 
L
Y
 
H
R
 
-
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
P
 
D
L
 
M
G
 
A
A
 
D
E
 
Q
P
 
P
I
 
Y
A
 
G
L
 
V
L
 
G
F
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
P
 
T
T
 
G
F
 
L
K
 
V
A
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
G
 
G
V
 
T
L
 
L
T
 
E
K
 
R
L
 
I
M
 
R
Q
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
M
 
W
E
 
N
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
T
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
V
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
N
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
22% identity, 78% coverage: 38:275/305 of query aligns to 48:282/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
I
 
I
K
 
R
A
 
A
S
 
R
G
 
G
K
 
R
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
R
 
D
E
 
I
T
 
G
S
 
S
P
 
N
P
 
L
M
 
F
A
 
S
Y
 
F
A
 
R
L
 
D
G
 
P
A
 
I
N
 
T
E
 
G
K
 
E
Y
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
I
C
 
A
E
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
A
K
 
R
E
 
D
I
 
I
-
 
F
A
 
G
P
 
V
D
 
P
A
 
S
K
 
H
L
 
V
E
 
E
Y
 
Y
M
 
R
A
 
I
V
 
L
T
 
S
A
 
A
Q
 
A
N
 
E
T
x
R
L
 
V
P
 
T
L
 
A
V
 
L
Q
 
Q
N
 
K
G
 
S
T
 
Q
L
 
V
D
 
D
I
 
I
G
 
V
C
 
V
G
 
K
P
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
T
 
C
A
 
E
R
|
R
Q
 
R
Q
 
K
Q
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
A
 
S
V
 
T
T
 
V
T
 
Y
Y
 
L
V
 
D
S
 
A
E
 
N
V
 
Q
R
 
R
M
 
I
A
 
L
V
 
A
R
 
P
K
 
R
D
 
D
S
 
S
D
 
P
L
 
I
K
 
T
S
 
K
I
 
V
N
 
S
Q
 
D
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
K
T
 
R
I
 
V
A
 
C
A
 
V
S
 
A
T
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
S
V
 
L
Q
 
R
L
 
R
L
 
I
R
 
R
K
 
E
Q
 
I
E
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
A
A
 
P
P
 
P
I
 
P
K
 
V
T
 
I
V
 
V
L
 
S
G
 
V
K
 
V
D
 
N
H
x
W
H
 
A
E
 
D
S
 
C
F
 
L
L
 
V
L
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
Q
G
 
R
R
 
E
A
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
L
 
T
D
|
D
D
 
D
N
 
T
L
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
L
I
 
V
A
 
-
N
 
-
S
 
E
K
 
E
D
 
D
P
 
P
S
 
Y
A
 
L
Y
 
H
R
 
-
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
P
P
 
D
L
 
M
G
 
A
A
 
D
E
 
Q
P
 
P
I
 
Y
A
 
G
L
 
V
L
 
G
F
 
I
R
 
N
K
 
L
D
 
D
D
 
N
P
 
T
T
 
G
F
 
L
K
 
V
A
 
R
A
 
F
V
 
V
D
 
N
G
 
G
V
 
T
L
 
L
T
 
E
K
 
R
L
 
I
M
 
R
Q
 
N
S
 
D
G
 
G
E
 
T
M
 
W
E
 
N
K
 
T
I
 
L
Y
 
Y
T
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
V
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
N
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P

2pyyB Crystal structure of the glur0 ligand-binding core from nostoc punctiforme in complex with (l)-glutamate (see paper)
25% identity, 69% coverage: 67:277/305 of query aligns to 19:214/217 of 2pyyB

query
sites
2pyyB
G
 
G
Y
 
F
H
 
S
V
 
I
E
 
D
L
 
L
C
 
W
E
 
R
R
 
S
V
 
I
L
 
A
K
 
T
E
 
Q
I
 
I
A
 
G
P
 
I
D
 
E
A
 
S
K
 
K
L
 
L
-
 
I
E
 
E
Y
 
Y
M
 
S
A
 
S
V
|
V
T
 
P
A
 
-
Q
 
-
N
 
E
T
 
L
L
 
I
P
 
S
L
 
A
V
 
I
Q
 
K
N
 
D
G
 
N
T
 
K
L
 
V
D
 
N
I
 
L
G
 
G
C
 
I
G
 
A
P
x
A
T
x
I
T
x
S
N
 
I
N
 
T
T
 
A
A
 
E
R
|
R
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
N
V
 
F
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
L
T
 
P
T
 
I
Y
 
F
V
 
A
S
 
S
E
 
G
V
 
L
R
 
Q
M
 
I
A
 
M
V
 
V
R
 
R
K
 
-
D
 
N
S
 
G
D
 
D
L
 
I
K
 
R
S
 
S
I
 
I
N
 
D
Q
 
D
L
 
L
A
 
P
G
 
G
R
 
K
T
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
T
S
x
T
T
 
A
G
 
G
T
x
S
T
|
T
A
 
A
V
 
A
Q
 
T
L
 
Y
L
 
L
R
 
R
K
 
E
Q
 
H
E
 
H
R
 
I
V
 
S
L
 
V
G
 
L
G
 
E
A
 
V
P
 
P
I
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
K
H
 
I
H
 
E
E
 
E
S
 
A
F
 
Y
L
 
K
L
 
A
L
 
L
E
 
Q
S
 
T
G
 
K
R
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
L
 
F
D
|
D
D
 
A
N
 
P
L
 
V
L
 
L
A
 
L
G
 
F
M
 
Y
I
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
-
K
 
E
D
 
G
P
 
K
S
 
G
A
 
K
Y
 
V
R
 
E
I
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
S
P
 
I
L
 
L
G
 
R
A
 
E
E
 
E
P
 
S
I
 
Y
A
 
G
L
 
I
L
 
I
F
 
L
R
 
P
K
 
N
D
 
N
D
 
S
P
 
P
T
 
-
F
 
Y
K
 
R
A
 
K
A
 
P
V
 
I
D
 
N
G
 
Q
V
 
A
L
 
L
T
 
L
K
 
N
L
 
L
M
 
K
Q
 
E
S
 
N
G
 
G
E
 
T
M
 
Y
E
 
Q
K
 
S
I
 
L
Y
 
Y
T
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
V
 
-
N
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
D
P
 
P
K
 
K
N
 
N

Sites not aligning to the query:

6detA The crystal structure of tv2483 bound to l-arginine (see paper)
26% identity, 79% coverage: 30:269/305 of query aligns to 1:232/243 of 6detA

query
sites
6detA
V
 
I
T
 
E
Q
 
D
P
 
P
T
 
S
L
 
W
E
 
S
K
 
K
I
 
V
K
 
Q
A
 
V
S
 
K
G
 
S
K
 
A
A
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
V
R
x
S
E
 
D
T
 
F
S
x
V
P
 
P
P
 
I
M
 
L
A
 
S
Y
 
F
A
 
R
L
 
N
G
 
E
A
 
K
N
 
N
E
 
E
K
 
-
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
H
 
D
V
 
I
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
T
E
 
E
L
 
L
C
 
C
E
 
R
R
 
R
V
 
L
L
 
-
K
 
-
E
 
G
I
 
I
A
 
H
P
 
P
D
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
I
E
 
F
Y
 
Y
M
 
P
A
 
I
V
 
Q
T
x
W
A
 
A
Q
 
Q
N
 
K
T
 
E
L
 
I
P
 
-
L
 
L
V
 
L
Q
 
N
N
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
I
D
 
D
I
 
C
G
 
I
C
 
A
G
x
S
P
x
G
T
x
F
T
x
S
N
 
V
N
 
T
T
 
E
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
Q
Q
 
H
V
 
Y
A
 
R
F
 
M
A
 
C
V
 
-
T
 
T
T
 
P
Y
 
Y
V
 
L
S
 
Q
E
 
N
V
 
A
R
 
K
M
 
I
A
 
V
V
 
V
R
 
T
-
 
L
K
 
A
D
 
G
S
 
R
D
 
G
L
 
Y
K
 
Q
S
 
T
I
 
L
N
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
Q
G
 
N
R
 
R
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
V
S
x
E
T
 
A
G
 
D
T
|
T
T
 
A
A
 
G
V
 
D
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
R
 
L
K
 
N
Q
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
L
L
 
K
G
 
D
G
 
H
A
 
V
P
 
I
I
 
I
K
 
K
T
 
A
V
 
M
L
 
A
G
 
T
K
 
I
D
 
D
H
 
-
H
 
-
E
 
Q
S
 
L
F
 
Y
L
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
D
S
 
S
G
 
G
R
 
T
A
 
C
D
 
D
A
 
A
F
 
I
V
 
V
L
 
V
D
|
D
D
 
-
N
 
-
L
 
L
L
 
I
A
x
Y
G
 
S
M
 
L
I
 
D
A
 
T
N
 
L
S
 
D
K
 
K
D
 
N
P
 
P
S
 
Q
A
 
-
Y
 
Y
R
 
S
I
 
I
V
 
I
G
 
N
E
 
E
P
 
A
L
 
I
G
 
S
A
 
T
E
 
E
P
 
Y
I
 
Y
A
 
T
L
 
F
L
 
A
F
 
F
R
 
R
K
 
Q
D
 
A
D
 
D
P
 
A
T
 
S
F
 
L
K
 
V
A
 
A
A
 
K
V
 
I
D
 
E
G
 
S
V
 
V
L
 
L
T
 
A
K
 
E
L
 
M
M
 
N
Q
 
E
S
 
D
G
 
E
E
 
T
M
 
I
E
 
P
K
 
N
I
 
F
Y
 
S
T
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
F

2q2cA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
26% identity, 74% coverage: 43:269/305 of query aligns to 2:220/231 of 2q2cA

query
sites
2q2cA
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
 
D
E
 
A
T
 
A
S
x
F
P
 
A
P
 
P
M
 
F
A
 
E
Y
 
Y
A
 
M
L
 
Q
G
 
K
A
 
G
N
 
-
E
 
-
K
 
K
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
L
C
 
L
E
 
D
R
 
A
V
 
V
L
 
M
K
 
K
E
 
A
I
 
A
A
 
G
P
 
L
D
 
D
A
 
Y
K
 
E
L
 
L
E
 
K
Y
 
N
M
 
I
A
 
G
V
x
W
T
 
D
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
S
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
K
T
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
M
G
 
G
C
 
I
G
x
S
P
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
T
 
D
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
Y
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
P
T
 
Y
Y
 
F
V
 
E
S
 
A
E
 
T
V
 
Q
R
 
V
M
 
I
A
 
L
V
 
V
R
 
K
K
 
Q
D
 
G
S
 
S
D
 
P
L
 
V
K
 
K
S
 
N
I
 
A
N
 
L
Q
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
G
A
 
V
S
x
Q
T
 
N
G
 
A
T
|
T
T
|
T
A
 
G
V
 
Q
Q
 
E
L
 
A
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Q
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
K
A
 
G
P
 
P
I
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
H
H
 
I
E
 
K
S
 
K
F
 
F
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
I
L
 
M
L
 
E
L
 
L
E
 
L
S
 
N
G
 
G
R
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
-
V
 
V
L
 
I
D
 
T
D
|
D
N
 
N
L
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
N
M
 
E
I
 
Y
A
 
V
N
 
K
S
 
N
K
 
N
D
 
P
P
 
N
S
 
K
A
 
K
Y
 
L
R
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
E
E
 
D
P
 
P
-
 
K
-
 
N
L
 
F
G
 
A
A
 
S
E
 
E
P
 
Y
I
 
Y
A
 
G
L
 
M
L
 
I
F
 
F
R
 
P
K
 
K
D
 
-
D
 
N
P
 
S
T
 
E
F
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
K
K
 
N
L
 
V
M
 
I
Q
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
K
M
 
Y
E
 
T
K
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F

2q2aA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
26% identity, 74% coverage: 43:269/305 of query aligns to 12:230/241 of 2q2aA

query
sites
2q2aA
K
 
K
A
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
x
D
E
 
A
T
 
A
S
x
F
P
 
A
P
 
P
M
 
F
A
 
E
Y
 
Y
A
 
M
L
 
Q
G
 
K
A
 
G
N
 
-
E
 
-
K
 
K
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
H
 
D
V
 
V
E
 
D
L
 
L
C
 
L
E
 
D
R
 
A
V
 
V
L
 
M
K
 
K
E
 
A
I
 
A
A
 
G
P
 
L
D
 
D
A
 
Y
K
 
E
L
 
L
E
 
K
Y
 
N
M
 
I
A
 
G
V
x
W
T
 
D
A
 
-
Q
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
S
V
 
L
Q
 
Q
N
 
S
G
 
K
T
 
E
L
 
V
D
 
D
I
 
M
G
 
G
C
 
I
G
x
S
P
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
T
 
D
A
 
E
R
|
R
Q
 
K
Q
 
Q
Q
 
S
V
 
Y
A
 
D
F
 
F
A
 
S
V
 
D
T
 
P
T
 
Y
Y
 
F
V
 
E
S
 
A
E
 
T
V
 
Q
R
 
V
M
 
I
A
 
L
V
 
V
R
 
K
K
 
Q
D
 
G
S
 
S
D
 
P
L
 
V
K
 
K
S
 
N
I
 
A
N
 
L
Q
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
G
R
 
K
T
 
T
I
 
I
A
 
G
A
 
V
S
x
Q
T
 
N
G
 
A
T
|
T
T
|
T
A
 
G
V
 
Q
Q
 
E
L
 
A
L
 
-
R
 
-
K
 
-
Q
 
A
E
 
E
R
 
K
V
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
K
A
 
G
P
 
P
I
 
-
K
 
-
T
 
-
V
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
D
 
-
H
 
H
H
 
I
E
 
K
S
 
K
F
 
F
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
I
L
 
M
L
 
E
L
 
L
E
 
L
S
 
N
G
 
G
R
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
-
V
 
V
L
 
I
D
 
T
D
|
D
N
 
N
L
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
N
M
 
E
I
 
Y
A
 
V
N
 
K
S
 
N
K
 
N
D
 
P
P
 
N
S
 
K
A
 
K
Y
 
L
R
 
Q
I
 
V
V
 
I
G
 
E
E
 
D
P
 
P
-
 
K
-
 
N
L
 
F
G
 
A
A
 
S
E
 
E
P
 
Y
I
 
Y
A
 
G
L
 
M
L
 
I
F
 
F
R
 
P
K
 
K
D
 
-
D
 
N
P
 
S
T
 
E
F
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
E
V
 
A
L
 
L
T
 
K
K
 
N
L
 
V
M
 
I
Q
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
K
M
 
Y
E
 
T
K
 
E
I
 
I
Y
 
Y
T
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F

Query Sequence

>Ac3H11_1603 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1603
MAISRKTFTALAAGLTLACLTTAPALAQTVTQPTLEKIKASGKAVLGVRETSPPMAYALG
ANEKYVGYHVELCERVLKEIAPDAKLEYMAVTAQNTLPLVQNGTLDIGCGPTTNNTARQQ
QVAFAVTTYVSEVRMAVRKDSDLKSINQLAGRTIAASTGTTAVQLLRKQERVLGGAPIKT
VLGKDHHESFLLLESGRADAFVLDDNLLAGMIANSKDPSAYRIVGEPLGAEPIALLFRKD
DPTFKAAVDGVLTKLMQSGEMEKIYTKWFVNPIPPKNMSLNLPLGTTLRQLFATPNDKPL
ETYQQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory