SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_1882 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1882 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4b5bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 2:293/293 of 4b5bA

query
sites
4b5bA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4b4gA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 2:293/293 of 4b4gA

query
sites
4b4gA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
|
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4b42A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 2:293/293 of 4b42A

query
sites
4b42A
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
F
|
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4b3uA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 8:299/299 of 4b3uA

query
sites
4b3uA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
x
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4asyA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 2:293/293 of 4asyA

query
sites
4asyA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4b2xB Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 11:302/302 of 4b2xB

query
sites
4b2xB
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
x
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

3zllA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 6:297/297 of 3zllA

query
sites
3zllA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

3zlkA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 6:297/297 of 3zlkA

query
sites
3zlkA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

5fu8A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 6:297/297 of 5fu8A

query
sites
5fu8A
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
|
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
x
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4b2wA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 6:297/297 of 4b2wA

query
sites
4b2wA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

5fuhA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 7:298/298 of 5fuhA

query
sites
5fuhA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
|
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
x
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4b4bA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 7:298/298 of 4b4bA

query
sites
4b4bA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4b4mA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 5:296/296 of 4b4mA

query
sites
4b4mA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
|
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

5fyeA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 5:296/296 of 5fyeA

query
sites
5fyeA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

5fu0A Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 5:296/296 of 5fu0A

query
sites
5fu0A
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
|
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
x
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

5ftvA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 5:296/296 of 5ftvA

query
sites
5ftvA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
|
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
x
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

5ftsA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 5:296/296 of 5ftsA

query
sites
5ftsA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
 
F
H
|
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
|
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

4asjA Pseudomonas aeruginosa rmla in complex with allosteric inhibitor (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 1:292/292 of 4asjA

query
sites
4asjA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
|
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
|
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
P
 
P
S
 
S
P
 
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
N
 
N
I
 
L
F
x
Y
Y
 
Y
G
|
G
H
 
H
D
 
D
F
|
F
H
 
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
x
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
|
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
 
G
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
x
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
 
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

1g3lA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Tdp-l-rhamnose complex. (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 1:292/292 of 1g3lA

query
sites
1g3lA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
R
 
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
D
|
D
F
|
F
H
|
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
|
Y
G
|
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
|
E
K
|
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
|
V
T
|
T
G
|
G
L
 
L
Y
|
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
|
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
|
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

1g2vA The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (rmla). Ttp complex. (see paper)
82% identity, 99% coverage: 3:294/294 of query aligns to 1:292/292 of 1g2vA

query
sites
1g2vA
Q
 
K
R
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
I
 
I
L
|
L
A
|
A
G
|
G
G
|
G
S
 
S
G
|
G
T
|
T
R
|
R
L
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
A
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
K
 
K
Q
|
Q
L
 
L
L
 
L
P
 
P
V
 
V
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
P
 
P
M
 
M
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
S
T
 
T
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
 
I
S
 
S
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
P
R
 
R
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
Q
 
N
W
 
W
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
S
 
S
P
|
P
D
 
D
G
 
G
L
|
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
L
I
 
I
G
 
G
E
 
E
D
 
S
F
 
F
L
 
I
A
 
G
G
 
N
A
 
D
P
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
G
 
G
D
|
D
N
 
N
I
 
L
F
 
Y
Y
|
Y
G
|
G
H
|
H
D
|
D
F
|
F
H
|
H
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
N
 
S
A
 
A
R
 
S
Q
 
Q
R
 
R
T
 
Q
D
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
V
 
V
F
 
F
A
 
A
Y
 
Y
H
 
H
V
 
V
Q
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
V
E
 
E
F
 
F
D
 
D
D
 
Q
Q
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
A
L
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
K
 
K
P
 
P
K
 
L
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
S
 
S
S
 
N
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
D
 
D
G
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
K
P
 
P
S
 
S
P
 
P
R
 
R
G
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
T
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
N
R
 
R
L
 
A
Y
 
Y
L
 
L
E
 
E
Q
 
R
G
 
G
Q
 
Q
L
 
L
N
 
S
V
 
V
E
 
E
I
 
I
M
 
M
G
|
G
R
|
R
G
|
G
Y
 
Y
A
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
H
E
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
E
H
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
I
 
V
A
 
A
C
 
C
P
 
P
E
 
E
E
|
E
I
|
I
S
 
A
W
 
Y
R
 
R
S
 
Q
G
 
K
W
 
W
I
 
I
D
 
D
S
 
A
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
L
 
L
L
 
L
N
 
T
D
 
E
K
 
T
V
 
V
Y
 
Y

Query Sequence

>Ac3H11_1882 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1882
MTQRKGIILAGGSGTRLHPATLAISKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLGGIRDILIISTPQD
TPRFAQLLGDGSQWGLNLQYAVQPSPDGLAQAFVIGEDFLAGAPSALVLGDNIFYGHDFH
ELLGNARQRTDGASVFAYHVQDPERYGVAEFDDQGKVLSLEEKPKQPKSSYAVTGLYFYD
GQVVQMAKDLKPSPRGELEITDLNRLYLEQGQLNVEIMGRGYAWLDTGTHESLLEAGQFI
ATLEHRQGLKIACPEEISWRSGWIDSEQLARLAQPLSKNGYGQYLQRLLNDKVY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory