SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_1922 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1922 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9BY49 Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase; TERP; 2,4-dienoyl-CoA reductase-related protein; DCR-RP; HPDHase; Short chain dehydrogenase/reductase family 29C member 1; pVI-ARL; EC 1.3.1.38 from Homo sapiens (Human) (see paper)
49% identity, 82% coverage: 10:261/309 of query aligns to 8:265/303 of Q9BY49

query
sites
Q9BY49
Q
 
R
S
 
S
V
 
Y
F
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
K
C
 
A
T
 
I
A
 
V
H
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
L
H
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
S
H
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
S
R
 
R
K
 
K
P
 
L
E
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
K
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
L
T
 
Q
A
 
A
D
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
T
-
 
K
G
 
Q
G
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
I
C
 
P
Q
 
I
V
 
Q
C
 
C
D
 
N
I
 
I
R
 
R
S
 
N
E
 
E
E
 
E
G
 
E
V
 
V
V
 
N
A
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
Q
 
S
I
 
T
V
 
L
A
 
D
A
 
T
Q
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
N
A
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
P
L
 
A
E
 
E
S
 
H
I
 
I
S
 
S
A
 
S
K
 
K
G
 
G
W
 
W
E
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
E
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
Y
M
 
M
A
 
C
R
 
K
E
 
A
F
 
V
Y
 
Y
R
 
S
Q
 
S
W
 
W
M
 
M
A
 
K
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
V
D
 
P
M
 
T
W
 
K
G
 
A
S
 
G
M
 
F
P
 
P
G
 
L
M
 
A
G
 
V
H
 
H
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
Y
S
 
N
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
W
A
 
A
H
 
C
S
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
V
I
 
I
A
 
Y
S
 
S
-
 
Q
S
 
T
G
 
A
M
 
V
D
 
E
N
 
N
Y
 
Y
P
 
G
P
 
S
E
 
W
A
 
G
A
 
Q
D
 
S
M
 
F
L
 
F
R
 
E
A
 
G
M
 
S
P
 
F
R
 
Q
T
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
K
R
 
R
F
 
I
G
 
G
N
 
V
E
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
S
A
 
V
I
 
V
T
 
C
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
S
L
 
V
R
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1yxmB Crystal structure of peroxisomal trans 2-enoyl coa reductase
49% identity, 82% coverage: 10:261/309 of query aligns to 1:250/283 of 1yxmB

query
sites
1yxmB
Q
 
R
S
 
S
V
 
Y
F
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
F
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
G
 
A
S
 
T
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
K
C
 
A
T
 
I
A
 
V
H
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
L
H
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
S
H
 
N
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
A
G
x
S
R
|
R
K
 
K
P
 
L
E
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
K
A
 
S
V
 
A
A
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
L
T
 
Q
A
 
A
D
 
N
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
T
-
 
K
G
 
Q
G
 
A
R
 
R
V
 
V
S
 
I
C
 
P
Q
 
I
V
 
Q
C
|
C
D
x
N
I
|
I
R
 
R
S
 
N
E
 
E
E
 
E
G
 
E
V
 
V
V
 
N
A
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
Q
 
S
I
 
T
V
 
L
A
 
D
A
 
T
Q
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
N
A
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
G
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
P
L
 
A
E
 
E
S
 
H
I
 
I
S
 
S
A
 
S
K
 
K
G
 
G
W
 
W
E
 
H
A
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
E
T
|
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
Y
M
 
M
A
 
C
R
 
K
E
 
A
F
 
V
Y
 
Y
R
 
S
Q
 
S
W
 
W
M
 
M
A
 
K
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
x
V
D
 
P
M
 
T
W
 
K
G
 
A
S
x
G
M
 
F
P
 
P
G
 
L
M
 
A
G
 
V
H
|
H
S
|
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
Y
S
 
N
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
W
A
 
A
H
 
C
S
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
V
I
 
I
A
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
-
N
 
-
Y
 
Y
P
 
S
P
 
Q
E
 
T
A
 
A
A
 
Q
D
 
S
M
 
F
L
 
F
R
 
E
A
 
G
M
 
S
P
 
F
R
 
Q
T
 
K
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
K
R
 
R
F
 
I
G
 
G
N
 
V
E
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
S
A
 
V
I
 
V
T
 
C
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
S
L
 
V
R
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
G
R
 
R

4fc7A Studies on dcr shed new light on peroxisomal beta-oxidation: crystal structure of the ternary complex of pdcr (see paper)
34% identity, 82% coverage: 8:259/309 of query aligns to 13:266/274 of 4fc7A

query
sites
4fc7A
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
H
V
 
L
F
 
F
A
 
C
P
 
P
G
 
D
L
 
L
F
 
L
Q
 
R
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
C
 
R
T
 
I
A
 
A
H
 
E
E
 
I
L
 
F
A
 
M
H
 
R
L
 
H
G
 
G
A
 
C
H
 
H
V
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
A
G
x
S
R
|
R
K
x
S
P
 
L
E
 
P
K
x
R
L
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
A
A
 
A
E
 
R
E
 
K
I
 
L
T
 
A
A
 
G
D
 
A
G
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
R
S
 
C
C
 
L
Q
 
P
V
 
L
C
 
S
-
 
M
D
|
D
I
x
V
R
|
R
S
 
A
E
 
P
E
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
D
Q
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
K
A
 
E
Q
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
x
C
A
|
A
G
x
A
G
|
G
Q
x
N
F
|
F
M
 
L
A
 
C
P
 
P
L
 
A
E
 
G
S
 
A
I
 
L
S
|
S
A
 
F
K
x
N
G
x
A
W
 
F
E
 
K
A
x
T
V
 
V
L
 
M
H
 
D
T
 
I
N
 
D
L
 
T
T
 
S
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
N
M
 
V
A
 
S
R
 
R
E
 
V
F
 
L
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
K
W
 
F
M
 
F
A
 
R
Q
 
D
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
V
 
T
A
|
A
D
 
T
M
 
L
W
 
G
G
 
N
S
 
R
M
 
G
P
 
Q
G
 
A
M
 
L
G
x
Q
-
 
V
H
|
H
S
x
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
R
x
K
A
 
A
G
 
A
M
 
V
V
 
D
S
 
A
L
 
M
T
 
T
E
 
R
T
 
H
A
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
G
H
 
P
S
 
Q
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
P
I
 
I
A
 
S
-
 
G
S
x
T
S
x
E
G
|
G
M
 
L
D
 
R
N
x
R
Y
 
L
-
 
G
P
 
G
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
D
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
S
A
 
T
M
 
K
P
 
V
R
 
T
T
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
Q
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
N
E
 
K
A
 
T
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
H
A
 
S
I
 
V
T
 
L
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
L
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
V
L
 
L
R
 
V
V
 
A
D
 
D
G
 
G

Q9NUI1 Peroxisomal 2,4-dienoyl-CoA reductase [(3E)-enoyl-CoA-producing]; pDCR; 2,4-dienoyl-CoA reductase 2; Short chain dehydrogenase/reductase family 17C member 1; EC 1.3.1.124 from Homo sapiens (Human) (see paper)
34% identity, 82% coverage: 8:259/309 of query aligns to 16:269/292 of Q9NUI1

query
sites
Q9NUI1
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
H
V
 
L
F
 
F
A
 
C
P
 
P
G
 
D
L
 
L
F
 
L
Q
 
R
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
C
 
R
T
 
I
A
 
A
H
 
E
E
 
I
L
 
F
A
 
M
H
 
R
L
 
H
G
 
G
A
 
C
H
 
H
V
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
A
G
 
S
R
|
R
K
x
S
P
x
L
E
x
P
K
x
R
L
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
A
A
 
A
E
 
R
E
 
K
I
 
L
T
 
A
A
 
G
D
 
A
G
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
R
S
 
C
C
 
L
Q
 
P
V
 
L
C
 
S
-
 
M
D
|
D
I
 
V
R
 
R
S
 
A
E
 
P
E
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
D
Q
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
K
A
 
E
Q
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
A
G
 
G
Q
 
N
F
 
F
M
 
L
A
 
C
P
 
P
L
 
A
E
 
G
S
 
A
I
 
L
S
 
S
A
 
F
K
 
N
G
 
A
W
 
F
E
 
K
A
 
T
V
 
V
L
 
M
H
 
D
T
 
I
N
x
D
L
 
T
T
 
S
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
N
M
 
V
A
 
S
R
 
R
E
 
V
F
 
L
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
K
W
 
F
M
 
F
A
 
R
Q
 
D
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
T
A
 
A
D
 
T
M
 
L
W
 
G
G
 
N
S
 
R
M
 
G
P
 
Q
G
 
A
M
 
L
G
 
Q
-
 
V
H
 
H
S
 
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
R
x
K
A
 
A
G
 
A
M
 
V
V
x
D
S
 
A
L
 
M
T
 
T
E
 
R
T
 
H
A
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
G
H
 
P
S
 
Q
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
x
P
I
|
I
A
x
S
-
x
G
S
x
T
S
 
E
G
 
G
M
 
L
D
 
R
N
 
R
Y
 
L
-
 
G
P
 
G
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
D
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
S
A
 
T
M
 
K
P
 
V
R
 
T
T
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
Q
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
N
E
 
K
A
 
T
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
H
A
 
S
I
 
V
T
 
L
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
L
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
V
L
 
L
R
 
V
V
 
A
D
|
D
G
 
G

4fc6B Studies on dcr shed new light on peroxisomal beta-oxidation: crystal structure of the ternary complex of pdcr (see paper)
34% identity, 82% coverage: 8:259/309 of query aligns to 14:267/276 of 4fc6B

query
sites
4fc6B
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
S
 
H
V
 
L
F
 
F
A
 
C
P
 
P
G
 
D
L
 
L
F
 
L
Q
 
R
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
F
C
 
R
T
 
I
A
 
A
H
 
E
E
 
I
L
 
F
A
 
M
H
 
R
L
 
H
G
 
G
A
 
C
H
 
H
V
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
A
G
x
S
R
|
R
K
x
S
P
 
L
E
 
P
K
x
R
L
 
V
L
 
L
A
 
T
V
 
A
A
 
A
E
 
R
E
 
K
I
 
L
T
 
A
A
 
G
D
 
A
G
 
T
G
 
G
R
 
R
V
 
R
S
 
C
C
 
L
Q
 
P
V
 
L
C
 
S
-
x
M
D
|
D
I
x
V
R
 
R
S
 
A
E
 
P
E
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
L
 
A
V
 
V
Q
 
D
Q
 
Q
I
 
A
V
 
L
A
 
K
A
 
E
Q
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
x
C
A
|
A
G
x
A
G
|
G
Q
x
N
F
|
F
M
 
L
A
 
C
P
 
P
L
 
A
E
 
G
S
 
A
I
 
L
S
|
S
A
 
F
K
x
N
G
x
A
W
 
F
E
 
K
A
x
T
V
 
V
L
 
M
H
 
D
T
x
I
N
 
D
L
 
T
T
 
S
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
N
M
 
V
A
 
S
R
 
R
E
 
V
F
 
L
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
K
W
 
F
M
 
F
A
 
R
Q
 
D
H
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
V
 
T
A
|
A
D
 
T
M
x
L
W
 
G
G
 
N
S
 
R
M
 
G
P
 
Q
G
 
A
M
 
L
G
x
Q
-
 
V
H
|
H
S
x
A
G
 
G
A
 
S
A
 
A
R
x
K
A
 
A
G
 
A
M
 
V
V
 
D
S
 
A
L
 
M
T
 
T
E
 
R
T
 
H
A
 
L
A
 
A
L
 
V
E
 
E
W
 
W
A
 
G
H
 
P
S
 
Q
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
P
I
 
I
A
 
S
-
 
G
S
x
T
S
x
E
G
|
G
M
 
L
D
 
R
N
x
R
Y
 
L
-
 
G
P
 
G
P
 
P
E
 
Q
A
 
A
A
 
S
D
 
-
M
 
-
L
 
L
R
 
S
A
 
T
M
 
K
P
 
V
R
 
T
T
 
A
V
 
S
P
 
P
L
 
L
G
 
Q
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
N
E
 
K
A
 
T
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
H
A
 
S
I
 
V
T
 
L
F
 
Y
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
L
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
A
T
 
V
L
 
L
R
 
V
V
 
A
D
 
D
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
36% identity, 78% coverage: 18:259/309 of query aligns to 3:243/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
F
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
C
 
D
T
 
I
A
 
A
H
 
I
E
 
N
L
 
L
A
 
A
H
 
K
L
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
F
L
 
F
-
x
N
V
x
Y
G
x
N
R
x
G
K
x
S
P
 
P
E
 
E
K
 
A
L
 
A
L
 
E
A
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
K
E
 
L
I
 
V
T
 
A
A
 
E
D
 
H
G
 
G
G
 
V
R
 
E
V
 
V
S
 
E
C
 
A
Q
 
M
V
 
K
C
 
A
D
x
N
I
x
V
R
 
A
S
 
I
E
 
A
E
 
E
G
 
D
V
 
V
V
 
D
A
 
A
L
 
F
V
 
F
Q
 
K
Q
 
Q
I
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
R
Q
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
G
x
I
Q
 
T
F
 
R
M
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
S
 
R
I
 
M
S
 
K
A
 
E
K
 
D
G
 
E
W
 
W
E
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
I
H
 
N
T
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
T
R
 
K
E
 
A
F
 
V
Y
 
S
R
 
R
Q
 
T
W
 
M
M
 
M
A
 
K
Q
 
Q
H
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
-
 
A
-
x
S
V
 
V
A
 
V
D
 
G
M
 
L
W
 
I
G
 
G
S
 
N
M
 
-
P
 
A
G
 
G
M
x
Q
G
 
A
H
 
N
S
x
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
S
R
x
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
T
A
 
T
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
L
A
 
A
H
 
P
S
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
Y
 
F
I
|
I
A
 
T
S
x
T
S
 
D
G
 
M
M
 
T
D
 
D
N
 
K
Y
 
L
P
 
D
P
 
E
E
 
K
A
 
T
A
 
K
D
 
E
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
A
M
 
M
P
 
L
R
 
A
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
Y
G
 
G
N
 
T
E
 
T
A
 
E
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
N
A
 
A
I
 
V
T
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
S
S
 
K
F
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
L
R
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
34% identity, 78% coverage: 18:259/309 of query aligns to 3:259/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
F
 
F
Q
 
N
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
C
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
x
G
G
x
N
I
|
I
G
 
G
R
 
L
C
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
L
E
 
R
L
 
L
A
 
A
H
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
T
H
 
A
V
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
L
G
x
D
R
x
M
K
 
N
P
 
R
E
 
E
K
 
A
L
 
L
L
 
E
A
 
K
V
 
A
A
 
E
E
 
A
E
 
S
I
 
V
T
 
R
A
 
E
D
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
E
V
 
A
S
 
R
C
 
S
Q
 
Y
V
 
V
C
 
C
D
|
D
I
x
V
R
 
T
S
 
S
E
 
E
E
 
E
G
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
G
L
 
T
V
 
V
Q
 
D
Q
 
S
I
 
V
V
 
V
A
 
R
A
 
D
Q
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
A
 
F
L
 
L
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
 
Y
Q
 
Q
-
 
G
F
 
A
M
 
F
A
 
A
P
 
P
L
 
V
E
 
Q
S
 
D
I
 
Y
S
 
P
A
 
S
K
 
D
G
 
D
W
 
F
E
 
A
A
 
R
V
 
V
L
 
L
H
 
T
T
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
F
 
F
L
 
H
M
 
V
A
 
L
R
 
K
E
 
A
F
 
V
Y
 
S
R
 
R
Q
 
Q
W
 
M
M
 
I
A
 
T
Q
 
Q
H
 
N
G
 
Y
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
-
V
x
T
A
 
A
D
x
S
M
 
M
W
 
A
G
 
G
S
 
V
M
 
K
-
 
G
-
 
P
P
 
P
G
 
N
M
 
M
G
 
A
H
 
A
S
x
Y
G
 
G
A
 
T
A
 
S
R
x
K
A
 
G
G
 
A
M
 
I
V
 
I
S
 
A
L
 
L
T
 
T
E
 
E
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
W
 
L
A
 
A
H
 
P
S
 
Y
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
S
P
|
P
G
 
G
Y
 
Y
I
x
M
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
Q
-
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
Q
A
 
A
S
 
K
S
 
V
G
 
G
M
 
S
D
 
Q
N
 
Y
Y
 
F
P
 
S
P
 
T
E
x
D
A
 
P
A
 
K
D
 
V
M
 
V
L
 
A
R
 
Q
A
 
Q
M
 
M
P
 
I
R
 
G
T
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
M
G
 
R
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
 
D
E
 
I
A
 
N
E
 
E
V
 
I
S
 
P
A
 
G
A
 
V
I
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
G
P
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
S
F
 
F
I
 
M
S
 
T
G
 
G
T
 
V
T
 
N
L
 
L
R
 
P
V
 
I
D
 
A
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
34% identity, 79% coverage: 18:261/309 of query aligns to 3:243/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
F
 
I
Q
 
Q
G
 
N
Q
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
A
S
|
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
C
 
Q
T
 
T
A
 
A
H
 
L
E
 
R
L
 
F
A
 
A
H
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
G
x
D
R
 
I
K
 
D
P
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
L
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
V
E
 
D
E
 
E
I
 
F
T
 
S
A
 
A
D
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
L
C
 
G
Q
 
A
V
 
V
C
 
A
D
|
D
I
|
I
R
 
G
S
 
N
E
 
K
E
 
A
G
 
A
V
 
V
V
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
V
Q
 
K
Q
 
Q
I
 
T
V
 
I
A
 
D
A
 
A
Q
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
M
Q
 
E
F
 
R
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
L
E
 
R
S
 
K
I
 
L
S
 
S
A
 
E
K
 
A
G
 
D
W
 
W
E
 
D
A
 
V
V
 
T
L
 
I
H
 
N
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
T
R
 
Q
E
 
A
F
 
V
Y
 
H
R
 
G
Q
 
H
W
 
M
M
 
V
A
 
E
Q
 
N
H
 
K
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
V
 
A
A
 
S
D
 
R
M
 
A
W
 
W
G
 
L
S
 
G
M
 
G
P
 
A
G
 
G
M
 
Q
G
 
T
H
 
P
S
x
Y
G
 
S
A
 
S
A
 
A
R
x
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
W
 
L
A
 
G
H
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
 
I
A
 
H
S
 
T
S
 
P
G
 
M
M
 
W
D
 
D
N
 
E
Y
 
L
P
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
D
A
 
Q
D
 
Q
M
 
F
L
 
L
R
 
L
A
 
S
M
 
R
P
 
Q
R
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
F
 
L
G
 
G
N
 
E
E
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
N
A
 
T
I
 
L
T
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
L
R
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
A
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
34% identity, 79% coverage: 18:261/309 of query aligns to 2:242/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
F
 
I
Q
 
Q
G
 
N
Q
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
S
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
K
C
 
Q
T
 
T
A
 
A
H
 
L
E
 
R
L
 
F
A
 
A
H
 
E
L
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
A
V
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
G
x
D
R
x
I
K
 
D
P
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
L
 
R
A
 
A
V
 
T
A
 
V
E
 
D
E
 
E
I
 
F
T
 
S
A
 
A
D
 
R
G
 
G
G
 
H
R
 
R
V
 
V
S
 
L
C
 
G
Q
 
A
V
 
V
C
 
A
D
 
D
I
|
I
R
 
G
S
 
N
E
 
K
E
 
A
G
 
A
V
 
V
V
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
V
Q
 
K
Q
 
Q
I
 
T
V
 
I
A
 
D
A
 
A
Q
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
G
 
M
Q
 
E
F
 
R
M
 
A
A
 
G
P
 
A
L
 
L
E
 
R
S
 
K
I
 
L
S
 
S
A
 
E
K
 
A
G
 
D
W
 
W
E
 
D
A
 
V
V
 
T
L
 
I
H
 
N
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
G
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
T
R
 
Q
E
 
A
F
 
V
Y
 
H
R
 
G
Q
 
H
W
 
M
M
 
V
A
 
E
Q
 
N
H
 
K
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
V
 
A
A
x
S
D
 
R
M
 
A
W
 
W
G
 
L
S
 
G
M
 
G
P
 
A
G
 
G
M
 
Q
G
 
T
H
 
P
S
x
Y
G
 
S
A
 
S
A
 
A
R
x
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
M
T
 
T
E
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
W
 
L
A
 
G
H
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
L
I
|
I
A
 
H
S
 
T
S
 
P
G
 
M
M
 
W
D
 
D
N
 
E
Y
 
L
P
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
D
A
 
Q
D
 
Q
M
 
F
L
 
L
R
 
L
A
 
S
M
 
R
P
 
Q
R
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
P
L
 
T
G
 
G
R
 
K
F
 
L
G
 
G
N
 
E
E
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
N
A
 
T
I
 
L
T
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
D
P
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
F
 
F
I
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
L
R
 
Y
V
 
V
D
 
C
G
 
G
A
 
G
R
 
R

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
39% identity, 77% coverage: 21:259/309 of query aligns to 7:242/247 of P73574

query
sites
P73574
Q
 
Q
V
 
V
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
G
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
K
C
 
A
T
 
T
A
 
A
H
 
L
E
 
A
L
 
L
A
 
A
H
 
A
L
 
T
G
 
G
A
 
M
H
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
-
 
N
V
 
Y
G
 
A
R
 
Q
K
 
S
P
 
S
E
 
T
K
 
A
L
 
A
L
 
D
A
 
A
V
 
V
A
 
V
E
 
A
E
 
E
I
 
I
T
 
I
A
 
A
D
 
N
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
A
S
 
I
C
 
A
Q
 
V
V
 
Q
C
 
A
D
 
N
I
 
V
R
 
A
S
 
N
E
 
A
E
 
D
G
 
E
V
 
V
V
 
D
A
 
Q
L
 
L
V
 
I
Q
 
K
Q
 
T
I
 
T
V
 
L
A
 
D
A
 
K
Q
 
F
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
Q
 
T
F
 
R
M
 
D
A
 
T
P
 
L
L
 
L
E
 
L
S
 
R
I
 
M
S
 
K
A
 
L
K
 
E
G
 
D
W
 
W
E
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
I
H
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
T
R
 
K
E
 
A
F
 
V
Y
 
S
R
 
K
Q
 
L
W
 
M
M
 
L
A
 
K
Q
 
Q
H
 
K
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
-
 
T
-
 
S
V
 
V
A
 
A
D
 
G
M
 
M
W
 
M
G
 
G
S
 
N
M
 
-
P
|
P
G
 
G
M
 
Q
G
 
A
H
 
N
S
 
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
R
x
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
T
E
 
K
T
 
T
A
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
L
A
 
A
H
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
x
F
I
 
I
A
 
A
S
 
T
S
 
D
G
 
M
M
 
T
D
 
E
N
 
N
Y
 
L
P
x
N
P
 
A
E
 
E
A
 
-
A
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
P
M
 
I
P
 
L
R
 
Q
T
 
F
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
 
Q
E
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
T
I
 
I
T
 
R
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
T
-
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
F
R
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
36% identity, 76% coverage: 24:259/309 of query aligns to 8:242/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
G
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
C
 
S
T
 
I
A
 
A
H
 
L
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
H
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
Y
H
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
-
 
N
-
 
Y
V
 
A
G
 
G
R
 
S
K
 
K
P
 
-
E
 
E
K
 
K
L
 
A
L
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
A
 
A
D
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
V
 
S
S
 
F
C
 
A
Q
 
I
V
 
Q
C
 
A
D
 
N
I
 
V
R
 
A
S
 
D
E
 
A
E
 
D
G
 
E
V
 
V
V
 
K
A
 
A
L
 
M
V
 
I
Q
 
K
Q
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
Q
Q
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
Q
 
T
F
 
R
M
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
S
 
R
I
 
M
S
 
K
A
 
E
K
 
Q
G
 
E
W
 
W
E
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
I
H
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
G
 
V
F
 
F
L
 
N
M
 
C
A
 
I
R
 
Q
E
 
K
F
 
A
Y
 
T
R
 
P
Q
 
Q
W
 
M
M
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
R
G
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
V
 
-
A
 
S
D
x
S
M
 
V
W
 
V
G
 
G
S
 
A
M
 
V
-
 
G
-
 
N
P
 
P
G
 
G
M
x
Q
G
 
A
H
 
N
S
x
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
T
R
x
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
L
A
 
A
H
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
S
 
S
S
 
D
G
 
M
M
 
T
D
 
D
N
 
A
Y
 
L
P
 
S
P
 
D
E
 
E
A
 
-
A
 
-
D
 
-
M
 
L
L
 
K
R
 
E
A
 
Q
M
 
M
P
 
L
R
 
T
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
G
N
 
Q
E
 
D
A
 
T
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
N
A
 
T
I
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
K
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
R
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
35% identity, 78% coverage: 18:259/309 of query aligns to 11:254/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
F
 
L
Q
 
K
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
C
 
A
T
 
M
A
 
A
H
 
V
E
 
R
L
 
F
A
 
G
H
 
Q
L
 
E
G
 
E
A
 
A
H
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
-
 
N
V
 
Y
G
x
Y
R
 
N
K
 
N
P
 
E
E
 
E
K
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
D
V
 
A
A
 
K
E
 
K
E
 
E
I
 
V
T
 
E
A
 
E
D
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
V
 
A
S
 
I
C
 
I
Q
 
V
V
 
Q
C
 
G
D
|
D
I
x
V
R
 
T
S
 
K
E
 
E
E
 
E
G
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
T
I
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
E
Q
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
x
V
Q
x
E
F
 
N
M
 
P
A
 
V
P
 
P
L
 
S
E
 
H
S
 
E
I
 
L
S
 
S
A
 
L
K
 
D
G
 
N
W
 
W
E
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
F
 
A
Y
 
I
R
 
K
Q
 
Y
W
 
F
M
 
V
A
 
E
Q
 
N
H
 
D
-
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
-
 
S
-
x
S
V
 
V
A
x
H
D
 
E
M
 
M
-
 
I
-
 
P
W
|
W
G
 
-
S
 
-
M
 
-
P
 
P
G
 
L
M
 
F
G
 
V
H
 
H
S
x
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
S
R
x
K
A
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
K
S
 
L
L
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
Y
A
 
A
H
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
I
x
M
A
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
-
N
 
N
Y
x
T
P
|
P
P
x
I
E
x
N
A
 
A
A
 
E
D
x
K
M
 
F
L
 
A
R
 
D
A
 
P
M
 
V
P
 
Q
R
 
R
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
S
T
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
Y
F
 
I
G
 
G
N
 
K
E
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
A
T
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
Q
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
R
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G

7ucwB Structure of mouse decr1 in complex with 2'-5' oligoadenylate (see paper)
32% identity, 81% coverage: 9:259/309 of query aligns to 10:256/281 of 7ucwB

query
sites
7ucwB
Y
 
F
Q
 
Q
S
 
P
V
 
V
F
 
L
A
 
K
P
 
P
G
 
M
L
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
D
-
 
A
F
 
F
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
 
G
S
x
T
G
 
G
I
 
L
G
 
G
R
 
K
C
 
A
T
 
M
A
 
T
H
 
T
E
 
F
L
 
L
A
 
S
H
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
Q
V
 
C
V
 
V
L
 
I
V
 
A
G
x
S
R
|
R
K
x
N
P
 
I
E
 
D
K
 
V
L
 
L
L
 
K
A
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
S
A
 
S
D
 
K
-
 
T
G
 
G
G
 
N
R
 
K
V
 
V
S
 
H
C
 
A
Q
 
I
V
 
R
C
 
C
D
|
D
I
x
V
R
 
R
S
 
D
E
 
P
E
 
D
G
 
M
V
 
V
V
 
H
A
 
N
L
 
T
V
 
V
Q
 
L
Q
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
K
A
 
V
Q
 
A
G
 
G
R
 
H
I
 
P
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
x
A
G
 
G
Q
 
N
F
 
F
M
 
I
A
 
S
P
 
P
L
 
S
E
 
E
S
 
R
I
 
L
S
 
T
A
 
P
K
 
N
G
 
G
W
 
W
E
 
K
A
 
T
V
 
I
L
 
T
H
 
D
T
x
I
N
 
V
L
 
L
T
 
N
G
 
G
G
 
T
F
 
A
L
 
Y
M
 
V
A
 
T
R
 
L
E
 
E
F
 
I
Y
 
G
R
 
K
Q
 
Q
W
 
L
M
 
I
-
 
K
A
 
A
Q
 
Q
H
 
K
G
 
G
G
 
A
S
 
A
I
 
F
V
 
L
N
 
A
I
 
I
V
 
T
A
 
T
D
 
I
M
 
Y
W
 
A
G
 
E
S
 
S
M
 
G
P
 
S
G
 
G
M
 
F
G
 
V
H
 
M
-
 
P
S
 
S
G
 
S
A
 
S
A
 
A
R
 
K
A
 
S
G
 
G
M
 
V
V
 
E
S
 
A
L
 
M
T
 
N
E
 
K
T
 
S
A
 
L
A
 
A
L
 
A
E
 
E
W
 
W
A
 
G
H
 
R
S
 
Y
G
 
G
V
 
M
R
 
R
V
 
F
N
 
N
A
 
I
V
 
I
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
Y
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
S
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
-
N
 
-
Y
 
-
P
 
-
P
 
P
E
 
I
A
 
K
A
 
G
D
 
R
M
 
F
L
 
E
R
 
K
A
 
E
M
 
M
P
 
I
R
 
D
T
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
C
G
 
G
R
 
R
F
 
L
G
 
G
N
 
T
E
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
L
S
 
A
A
 
N
A
 
L
I
 
A
T
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
C
S
 
S
P
 
D
A
 
Y
A
 
A
S
 
S
F
 
W
I
 
I
S
 
N
G
 
G
T
 
A
T
 
V
L
 
I
R
 
R
V
 
F
D
 
D
G
 
G

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
35% identity, 76% coverage: 24:259/309 of query aligns to 5:235/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
C
 
S
T
 
I
A
 
A
H
 
L
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
H
 
E
L
 
E
G
 
G
A
 
Y
H
 
N
V
 
V
V
 
A
L
 
V
-
x
N
-
x
Y
V
x
A
G
|
G
R
x
S
K
 
K
P
 
-
E
 
E
K
 
K
L
 
A
L
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
V
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
A
 
A
D
 
K
G
 
G
G
 
V
R
 
D
V
 
S
S
 
F
C
 
A
Q
 
I
V
 
Q
C
x
A
D
x
N
I
x
V
R
 
A
S
 
D
E
 
A
E
 
D
G
 
E
V
 
V
V
 
K
A
 
A
L
 
M
V
 
I
Q
 
K
Q
 
E
I
 
V
V
 
V
A
 
S
A
 
Q
Q
 
F
G
 
G
R
 
S
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
G
 
I
Q
 
T
F
 
R
M
 
D
A
 
N
P
 
L
L
 
L
E
 
M
S
 
R
I
 
M
S
 
K
A
 
E
K
 
Q
G
 
E
W
 
W
E
 
D
A
 
D
V
 
V
L
 
I
H
 
D
T
|
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
G
 
V
F
 
F
L
 
N
M
 
C
A
 
I
R
 
Q
E
 
K
F
 
A
Y
 
T
R
 
P
Q
 
Q
W
 
M
M
 
L
A
 
R
Q
 
Q
H
 
R
G
 
S
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
V
 
-
A
 
S
D
x
S
M
 
V
W
 
V
G
 
G
S
 
A
M
 
V
-
 
G
-
 
N
P
 
P
G
 
G
M
x
Q
G
 
A
H
 
N
S
x
Y
G
 
V
A
 
A
A
 
T
R
x
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
L
A
 
A
H
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
 
I
A
 
V
S
 
S
S
 
D
G
 
M
M
 
T
D
 
D
N
 
E
Y
 
L
P
 
K
P
 
E
E
 
Q
A
 
-
A
 
-
D
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
M
P
 
L
R
 
T
T
 
Q
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
G
N
 
Q
E
 
D
A
 
T
E
 
D
V
 
I
S
 
A
A
 
N
A
 
T
I
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
K
A
 
A
S
 
K
F
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
T
L
 
I
R
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G

3uf0A Crystal structure of a putative NAD(p) dependent gluconate 5- dehydrogenase from beutenbergia cavernae(efi target efi-502044) with bound NADP (low occupancy)
38% identity, 79% coverage: 15:259/309 of query aligns to 2:244/249 of 3uf0A

query
sites
3uf0A
P
 
P
G
 
F
L
 
S
F
 
L
Q
 
A
G
 
G
Q
 
R
V
 
T
V
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
C
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
G
L
 
Y
A
 
A
H
 
R
L
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
V
V
 
L
L
 
A
V
 
W
G
 
G
R
|
R
K
 
T
P
 
-
E
 
D
K
 
G
L
 
V
L
 
K
A
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
D
E
 
E
I
 
I
T
 
A
A
 
D
D
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
S
V
 
A
S
 
E
C
 
A
Q
 
V
V
 
V
C
 
A
D
|
D
I
x
L
R
 
A
S
 
D
E
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
A
A
 
N
L
 
V
V
 
A
Q
 
E
Q
 
E
I
 
L
V
 
A
A
 
A
A
 
T
Q
 
R
G
 
-
R
 
R
I
 
V
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
G
x
I
Q
 
I
F
 
A
M
 
R
A
 
A
P
 
P
L
 
A
E
 
E
S
 
E
I
 
V
S
 
S
A
 
L
K
 
G
G
 
R
W
 
W
E
 
R
A
 
E
V
 
V
L
 
L
H
 
T
T
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
D
G
 
A
G
 
A
F
 
W
L
 
V
M
 
L
A
 
S
R
 
R
E
 
S
F
 
F
Y
 
G
R
 
T
Q
 
A
W
 
M
M
 
L
A
 
A
Q
 
H
H
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
T
I
|
I
V
x
A
A
x
S
D
 
M
M
 
L
W
 
-
G
 
-
S
 
S
M
 
F
P
 
Q
G
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
N
M
x
V
G
 
A
H
 
A
S
x
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
S
R
x
K
A
 
H
G
 
A
M
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
S
E
 
E
W
 
W
A
 
A
H
 
G
S
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
G
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
Y
I
x
V
A
 
V
S
x
T
S
 
A
G
 
-
M
 
-
D
 
-
N
|
N
Y
x
T
P
 
A
P
 
A
E
 
L
A
 
R
A
 
A
D
 
D
M
 
D
L
 
E
R
 
R
A
 
A
M
 
A
P
 
E
R
 
I
T
 
T
-
 
A
-
 
R
V
 
I
P
 
P
L
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
W
G
 
A
N
 
T
E
 
P
A
 
E
E
 
D
V
 
M
S
 
V
A
 
G
A
 
P
I
 
A
T
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
S
 
H
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
L
R
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G

P40288 Glucose 1-dehydrogenase; EC 1.1.1.47 from Priestia megaterium (Bacillus megaterium) (see 2 papers)
34% identity, 80% coverage: 18:263/309 of query aligns to 5:252/261 of P40288

query
sites
P40288
F
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
V
|
V
V
x
I
T
|
T
G
|
G
G
x
S
G
x
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
x
K
C
x
S
T
x
M
A
|
A
H
x
I
E
x
R
L
x
F
A
|
A
H
x
T
L
x
E
G
x
K
A
|
A
H
x
K
V
|
V
V
|
V
L
 
V
V
 
N
G
 
Y
R
 
R
-
 
S
K
 
K
P
 
E
E
 
D
K
 
E
L
 
A
L
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
A
 
K
D
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
A
S
 
I
C
 
A
Q
 
V
V
 
K
C
 
G
D
 
D
I
 
V
R
 
T
S
 
V
E
 
E
E
 
S
G
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
S
I
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
E
Q
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
L
Q
x
E
F
 
N
M
 
P
A
 
V
P
 
S
L
 
S
E
 
H
S
 
E
I
 
M
S
 
S
A
 
L
K
 
S
G
x
D
W
 
W
E
 
N
A
 
K
V
|
V
L
 
I
H
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
F
 
A
Y
 
I
R
 
K
Q
 
Y
W
 
F
M
 
V
A
x
E
Q
 
N
H
 
D
-
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
 
M
V
 
S
A
 
S
D
 
V
M
 
H
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
P
W
 
W
G
 
-
S
 
-
M
 
-
P
 
P
G
 
L
M
 
F
G
 
V
H
 
H
S
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
S
R
 
K
A
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
K
S
 
L
L
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
Y
A
 
A
H
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
|
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
 
P
G
 
G
Y
 
A
I
 
I
-
 
N
-
 
T
-
x
P
-
 
I
-
 
N
A
 
A
S
 
E
S
 
K
G
 
F
M
 
A
D
 
D
N
 
-
Y
 
-
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
A
 
R
A
 
A
D
 
D
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
V
P
x
E
R
 
S
T
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
x
Y
F
 
I
G
 
G
N
 
E
E
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
A
T
 
A
F
 
W
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
R
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
R
 
M
P
 
T
Q
|
Q

Sites not aligning to the query:

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
36% identity, 77% coverage: 22:259/309 of query aligns to 3:240/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
C
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
G
H
 
K
L
 
A
G
 
G
A
 
C
H
 
K
V
 
V
V
 
L
L
 
V
-
x
N
V
x
Y
G
x
A
R
|
R
K
x
S
P
 
A
E
 
K
K
 
A
L
 
A
L
 
E
A
 
E
V
 
V
A
 
S
E
 
K
E
 
Q
I
 
I
T
 
E
A
 
A
D
 
Y
G
 
G
G
 
G
R
 
Q
V
 
A
S
 
I
C
 
T
Q
 
F
V
 
G
C
 
G
D
|
D
I
x
V
R
 
S
S
 
K
E
 
E
E
 
A
G
 
D
V
 
V
V
 
E
A
 
A
L
 
M
V
 
M
Q
 
K
Q
 
T
I
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
A
Q
 
W
G
 
G
R
 
T
I
 
I
D
 
D
A
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
G
 
I
Q
 
T
F
 
R
M
 
D
A
 
T
P
 
L
L
 
L
E
 
I
S
 
R
I
 
M
S
 
K
A
 
K
K
 
S
G
 
Q
W
 
W
E
 
D
A
 
E
V
 
V
L
 
I
H
 
D
T
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
T
R
 
Q
E
 
A
F
 
A
Y
 
T
R
 
K
Q
 
I
W
 
M
M
 
M
A
 
K
Q
 
K
H
 
R
G
 
K
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
-
 
A
-
x
S
V
 
V
A
 
V
D
 
G
M
 
L
W
 
I
G
 
G
S
 
N
M
 
I
P
 
-
G
 
G
M
 
Q
G
 
A
H
 
N
S
x
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
A
R
x
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
F
T
 
S
E
 
K
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
W
 
G
A
 
A
H
 
S
S
 
R
G
 
N
V
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
|
I
A
 
A
S
|
S
S
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
D
N
x
M
Y
 
T
P
 
A
P
 
K
E
 
L
A
 
G
A
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
E
R
 
K
A
 
K
M
 
I
P
 
L
R
 
G
T
 
T
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
T
G
 
G
N
 
Q
E
 
P
A
 
E
E
 
N
V
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
L
I
 
V
T
 
E
F
 
F
L
 
L
-
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
A
L
 
F
R
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
G

1g6kA Crystal structure of glucose dehydrogenase mutant e96a complexed with NAD+
34% identity, 80% coverage: 18:263/309 of query aligns to 5:252/261 of 1g6kA

query
sites
1g6kA
F
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
K
C
 
S
T
 
M
A
 
A
H
 
I
E
 
R
L
 
F
A
 
A
H
 
T
L
 
E
G
 
K
A
 
A
H
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
N
G
 
Y
R
|
R
-
 
S
K
 
K
P
 
E
E
 
D
K
 
E
L
 
A
L
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
K
A
 
K
D
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
A
S
 
I
C
 
A
Q
 
V
V
 
K
C
 
G
D
|
D
I
x
V
R
 
T
S
 
V
E
 
E
E
 
S
G
 
D
V
 
V
V
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
Q
 
S
I
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
E
Q
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
 
-
Q
 
-
F
 
L
M
 
A
A
 
N
P
 
P
L
 
V
E
 
S
S
 
S
-
 
H
-
 
E
I
 
M
S
 
S
A
 
L
K
 
S
G
 
D
W
 
W
E
 
N
A
 
K
V
 
V
L
 
I
H
 
D
T
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
G
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
E
F
 
A
Y
 
I
R
 
K
Q
 
Y
W
 
F
M
 
V
A
 
E
Q
 
N
H
 
D
-
 
I
G
 
K
G
 
G
S
 
T
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
V
 
S
A
x
S
D
 
V
M
 
H
-
 
E
-
 
K
-
 
I
-
 
P
W
 
W
G
 
-
S
 
-
M
 
-
P
 
P
G
 
L
M
 
F
G
 
V
H
 
H
S
x
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
S
R
x
K
A
 
G
G
 
G
M
 
M
V
 
K
S
 
L
L
 
M
T
 
T
E
 
E
T
 
T
A
 
L
A
 
A
L
 
L
E
 
E
W
 
Y
A
 
A
H
 
P
S
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
Y
 
A
I
|
I
-
 
N
-
x
T
-
 
P
-
 
I
-
 
N
A
 
A
S
 
E
S
 
K
G
 
F
M
 
A
D
 
D
N
 
-
Y
 
-
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
A
 
R
A
 
A
D
 
D
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
M
 
V
P
 
E
R
 
S
T
 
M
V
 
I
P
 
P
L
 
M
G
 
G
R
 
Y
F
 
I
G
 
G
N
 
E
E
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
A
T
 
A
F
 
W
L
 
L
L
 
A
S
 
S
P
 
S
A
 
E
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
T
 
I
T
 
T
L
 
L
R
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
G
R
 
M
P
 
T
Q
 
Q

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
37% identity, 78% coverage: 18:259/309 of query aligns to 3:235/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
F
 
L
Q
 
T
G
 
D
Q
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
C
 
A
T
 
I
A
 
A
H
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
H
 
A
L
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
K
V
 
V
-
 
A
V
 
V
L
 
N
V
 
Y
G
x
A
R
x
S
K
x
S
P
 
A
E
 
G
K
 
A
L
 
A
L
 
D
A
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
A
E
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
A
S
 
F
C
 
A
Q
 
V
V
 
K
C
x
A
D
|
D
I
x
V
R
 
S
S
 
Q
E
 
E
E
 
S
G
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
A
L
 
L
V
 
F
Q
 
A
Q
 
A
I
 
V
V
 
I
A
 
E
A
 
R
Q
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
A
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
G
 
I
Q
 
T
F
 
R
M
 
D
A
 
T
P
 
L
L
 
L
E
 
L
S
 
R
I
 
M
S
 
K
A
 
R
K
 
D
G
 
D
W
 
W
E
 
Q
A
 
S
V
 
V
L
 
L
H
 
D
T
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
G
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
C
A
 
S
R
 
R
E
 
A
F
 
A
Y
 
A
R
 
K
Q
 
I
W
 
M
M
 
L
A
 
K
Q
 
Q
H
 
R
G
 
S
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
V
 
-
A
 
A
D
x
S
M
 
V
W
 
V
G
 
G
S
 
E
M
 
M
-
 
G
-
 
N
P
 
P
G
 
G
M
x
Q
G
 
A
H
 
N
S
x
Y
G
 
S
A
 
A
A
 
A
R
x
K
A
 
A
G
 
G
M
 
V
V
 
I
S
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
T
 
T
A
 
V
A
 
A
L
 
K
E
 
E
W
 
L
A
 
A
H
 
S
S
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
Y
 
F
I
|
I
A
 
A
S
x
T
S
 
D
G
 
-
M
 
-
D
 
-
N
 
-
Y
 
-
P
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
M
 
-
L
x
M
R
 
T
A
 
S
M
 
L
P
 
L
R
 
E
T
 
V
V
 
I
P
 
P
L
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
 
E
E
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
V
S
 
A
A
 
G
A
 
V
I
 
V
T
 
R
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
A
-
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
T
 
Q
T
 
V
L
 
I
R
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
35% identity, 79% coverage: 18:261/309 of query aligns to 11:263/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
F
 
F
Q
 
T
G
 
D
Q
 
R
V
 
V
V
 
V
V
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
C
x
A
T
|
T
A
|
A
H
x
V
E
x
R
L
|
L
A
|
A
H
x
A
L
x
E
G
|
G
A
|
A
H
x
K
V
x
L
V
x
S
L
|
L
V
 
V
G
 
D
R
 
V
K
 
S
P
 
S
E
 
E
K
 
G
L
 
L
L
 
E
A
 
A
V
 
S
A
 
K
E
 
A
E
 
A
I
 
V
-
 
L
-
 
E
T
 
T
A
 
A
D
 
P
G
 
D
G
 
A
R
 
E
V
 
V
S
 
L
C
 
T
Q
 
T
V
 
V
C
 
A
D
 
D
I
 
V
R
 
S
S
 
D
E
 
E
E
 
A
G
 
Q
V
 
V
V
 
E
A
 
A
L
 
Y
V
 
V
Q
 
T
Q
 
A
I
 
T
V
 
T
A
 
E
A
 
R
Q
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
A
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
I
Q
x
E
-
 
G
F
 
K
M
 
Q
A
 
N
P
 
P
L
 
T
E
 
E
S
 
S
I
 
F
S
 
T
A
 
A
K
 
A
G
 
E
W
 
F
E
 
D
A
 
K
V
 
V
L
 
V
H
 
S
T
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
G
 
G
G
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
G
A
 
L
R
 
E
E
 
K
F
 
V
Y
 
L
R
 
K
Q
 
I
W
 
M
M
 
R
A
 
E
Q
 
Q
H
 
G
G
 
S
G
 
G
S
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
T
V
 
A
A
 
S
D
 
-
M
 
-
W
 
V
G
 
G
S
 
G
M
 
I
P
 
R
G
 
G
M
 
I
G
 
G
H
 
N
S
 
Q
G
 
S
-
 
G
-
 
Y
-
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
H
G
 
G
M
 
V
V
 
V
S
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
R
T
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
W
 
Y
A
 
G
H
 
R
S
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
A
I
 
I
-
 
W
-
 
T
-
 
P
-
 
M
A
 
V
S
 
E
S
 
N
G
 
S
M
 
M
D
 
K
N
 
Q
Y
 
L
P
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
R
-
 
K
-
 
A
A
 
A
A
 
E
D
 
E
M
 
F
L
 
I
R
 
Q
A
 
V
M
 
N
P
 
P
R
 
S
T
 
K
V
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
N
 
E
E
 
A
A
 
P
E
 
E
V
 
I
S
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
P
 
D
A
 
D
A
 
A
S
 
S
F
 
Y
I
 
V
S
 
N
G
 
A
T
 
T
T
 
V
L
 
V
R
 
P
V
 
I
D
 
D
G
 
G
A
 
G
R
 
Q

Query Sequence

>Ac3H11_1922 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1922
MAPTARNAYQSVFAPGLFQGQVVVVTGGGSGIGRCTAHELAHLGAHVVLVGRKPEKLLAV
AEEITADGGRVSCQVCDIRSEEGVVALVQQIVAAQGRIDALVNNAGGQFMAPLESISAKG
WEAVLHTNLTGGFLMAREFYRQWMAQHGGSIVNIVADMWGSMPGMGHSGAARAGMVSLTE
TAALEWAHSGVRVNAVAPGYIASSGMDNYPPEAADMLRAMPRTVPLGRFGNEAEVSAAIT
FLLSPAASFISGTTLRVDGARPQVRMGWPQRPPGATAAAHPAVRPFDGFHRAQVPQVFAP
SHTPKTEAA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory