SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_1954 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1954 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2vhaA Debp (see paper)
41% identity, 91% coverage: 25:296/299 of query aligns to 4:274/276 of 2vhaA

query
sites
2vhaA
A
 
A
A
 
G
T
 
S
V
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
I
S
 
A
A
 
K
G
 
N
G
 
G
K
 
V
L
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
G
H
 
H
R
|
R
E
 
E
S
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
D
 
D
S
 
N
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
-
K
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
V
 
Q
D
 
D
L
 
Y
C
 
S
L
 
N
R
 
A
M
 
I
A
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
R
 
K
K
 
K
K
 
K
T
 
L
G
 
N
K
 
K
K
 
P
D
 
D
M
 
L
E
 
Q
V
 
V
E
 
K
F
 
L
V
 
I
A
 
P
V
 
I
T
 
T
P
x
S
A
 
Q
N
 
N
R
|
R
I
 
I
T
 
P
M
 
L
I
 
L
E
 
Q
E
 
N
G
 
G
K
 
T
A
 
F
D
 
D
M
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
A
 
V
E
 
E
R
|
R
R
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
T
H
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
T
K
 
K
S
 
K
A
 
G
S
 
G
P
 
D
I
 
I
D
 
K
K
 
D
V
 
F
E
 
A
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
V
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
S
L
 
E
K
 
V
A
 
L
A
 
L
D
 
N
Q
 
K
A
 
L
N
 
N
R
 
E
E
 
E
R
 
Q
L
 
K
M
 
M
G
 
N
I
 
M
T
 
R
I
 
I
M
 
I
E
 
S
A
 
A
P
 
K
D
 
D
H
|
H
A
 
G
K
 
D
A
 
S
V
 
F
E
 
R
M
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
R
A
 
A
D
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
V
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
E
A
 
R
A
 
A
G
 
K
R
 
A
P
 
K
D
 
K
P
 
P
K
 
D
A
 
N
L
 
W
K
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
K
F
 
P
M
 
Q
T
 
S
T
 
Q
E
 
E
P
 
A
L
 
Y
A
 
G
I
 
C
M
 
M
L
 
L
P
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
M
D
 
D
E
 
D
E
 
T
M
 
I
R
 
A
R
 
Q
L
 
V
I
 
Q
T
 
T
S
 
S
R
 
G
D
 
E
I
 
A
Y
 
E
P
 
K
I
 
W
Y
 
F
D
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
K
K
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
N
 
K
N
 
N
T
 
L
V
 
N
L
 
M
N
 
N
L
 
F
P
 
E
V
 
L
S
 
S
Y
 
D
L
 
E
L
 
M
R
 
K
D
 
A
F
 
L
W
 
F
K
 
K
Y
 
E
P
 
P
T
 
N
D
 
D
Q
 
K

2ia4B Crystal structure of novel amino acid binding protein from shigella flexneri
41% identity, 92% coverage: 21:296/299 of query aligns to 1:275/278 of 2ia4B

query
sites
2ia4B
A
 
A
S
 
A
V
 
P
Q
 
A
A
 
A
A
 
G
T
 
S
V
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
I
S
 
A
A
 
K
G
 
N
G
 
G
K
 
V
L
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
G
H
 
H
R
|
R
E
 
E
S
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
D
 
D
S
 
N
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
-
K
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
V
 
Q
D
 
D
L
 
Y
C
 
S
L
 
N
R
 
A
M
 
I
A
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
R
 
K
K
 
K
K
 
K
T
 
L
G
 
N
K
 
K
K
 
P
D
 
D
M
 
L
E
 
Q
V
 
V
E
 
K
F
 
L
V
 
I
A
 
P
V
 
I
T
 
T
P
x
S
A
 
Q
N
 
N
R
|
R
I
 
I
T
 
P
M
 
L
I
 
L
E
 
Q
E
 
N
G
 
G
K
 
T
A
 
F
D
 
D
M
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
|
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
A
 
V
E
 
E
R
|
R
R
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
T
H
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
T
K
 
K
S
 
K
A
 
G
S
 
G
P
 
D
I
 
I
D
 
K
K
 
D
V
 
F
E
 
A
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
V
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
S
L
 
E
K
 
V
A
 
L
A
 
L
D
 
N
Q
 
K
A
 
L
N
 
N
R
 
E
E
 
E
R
 
Q
L
 
K
M
 
M
G
 
N
I
 
M
T
 
R
I
 
I
M
 
I
E
 
S
A
 
A
P
 
K
D
 
D
H
|
H
A
 
G
K
 
D
A
 
S
V
 
F
E
 
R
M
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
R
A
 
A
D
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
M
|
M
D
|
D
D
 
D
V
 
A
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
E
A
 
R
A
 
A
G
 
K
R
 
A
P
 
K
D
 
K
P
 
P
K
 
D
A
 
N
L
 
W
K
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
K
F
 
P
M
 
Q
T
 
S
T
 
Q
E
 
E
P
 
A
L
 
Y
A
 
G
I
 
C
M
 
M
L
 
L
P
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
M
D
 
D
E
 
D
E
 
T
M
 
I
R
 
A
R
 
Q
L
 
V
I
 
Q
T
 
T
S
 
S
R
 
G
D
 
E
I
 
A
Y
 
E
P
 
K
I
 
W
Y
 
F
D
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
K
K
 
N
P
 
P
I
 
I
P
 
P
P
 
P
N
 
K
N
 
N
T
 
L
V
 
N
L
 
M
N
 
N
L
 
F
P
 
E
V
 
L
S
 
S
Y
 
D
L
 
E
L
 
M
R
 
K
D
 
A
F
 
L
W
 
F
K
 
K
Y
 
E
P
 
P
T
 
N
D
 
D
Q
 
K

8ovoA X-ray structure of the sf-iglusnfr-s72a in complex with l-aspartate
41% identity, 83% coverage: 25:271/299 of query aligns to 2:247/503 of 8ovoA

query
sites
8ovoA
A
 
A
A
 
G
T
 
S
V
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
I
S
 
A
A
 
K
G
 
N
G
 
G
K
 
V
L
 
I
V
 
V
I
 
V
A
 
G
H
 
H
R
|
R
E
 
E
S
 
S
S
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
Y
V
 
Y
D
 
D
S
 
N
Q
 
Q
S
 
Q
G
 
-
K
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
V
 
Q
D
 
D
L
 
Y
C
 
S
L
 
N
R
 
A
M
 
I
A
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
V
R
 
K
K
 
K
K
 
K
T
 
L
G
 
N
K
 
K
K
 
P
D
 
D
M
 
L
E
 
Q
V
 
V
E
 
K
F
 
L
V
 
I
A
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
A
A
 
Q
N
 
N
R
|
R
I
 
I
T
 
P
M
 
L
I
 
L
E
 
Q
E
 
N
G
 
G
K
 
T
A
 
F
D
 
D
M
 
F
E
 
E
C
 
C
G
 
G
S
|
S
T
 
T
T
|
T
N
 
N
N
 
N
A
 
V
E
 
E
R
|
R
R
 
Q
Q
 
K
K
 
Q
V
 
A
A
 
A
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
T
H
 
I
F
 
F
I
 
V
T
 
V
G
 
G
A
 
T
R
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
T
K
 
K
S
 
K
A
 
G
S
 
G
P
 
D
I
 
I
D
 
K
K
 
D
V
 
F
E
 
A
D
 
N
L
 
L
N
 
K
G
 
D
K
 
K
K
 
A
L
 
V
V
 
V
S
 
V
T
 
T
K
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
S
L
 
E
K
 
V
A
 
L
A
 
L
D
 
N
Q
 
K
A
 
L
N
 
N
R
 
E
E
 
E
R
 
Q
L
 
K
M
 
M
G
 
N
I
 
M
T
 
R
I
 
I
M
 
I
E
 
S
A
 
A
P
 
K
D
 
D
H
|
H
A
 
G
K
 
D
A
 
S
V
 
F
E
 
R
M
 
T
V
 
L
E
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
R
A
 
A
D
 
V
A
 
A
F
 
F
V
 
M
M
 
M
D
|
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
E
A
 
R
A
 
A
G
 
K
R
 
A
P
 
K
D
 
K
P
 
P
K
 
D
A
 
N
L
 
W
K
 
E
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
K
F
 
P
M
 
Q
T
 
S
T
 
Q
E
 
E
P
 
A
L
 
Y
A
 
G
I
 
C
M
 
M
L
 
L
P
 
R
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
F
 
F
K
 
K
K
 
K
L
 
L
V
 
M
D
 
D
E
 
D
E
 
T
M
 
I
R
 
A
R
 
Q
L
 
V
I
 
Q
T
 
T
S
 
S
R
 
G
D
 
E
I
 
A
Y
 
E
P
 
K
I
 
W
Y
 
F
D
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
K
K
 
N
P
 
P
I
 
I

5eyfB Crystal structure of solute-binding protein from enterococcus faecium with bound glutamate
30% identity, 83% coverage: 28:276/299 of query aligns to 5:238/243 of 5eyfB

query
sites
5eyfB
V
 
I
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
S
S
 
K
A
 
S
G
 
T
G
 
N
K
 
E
L
 
I
V
 
I
I
 
W
A
 
G
H
 
V
R
 
K
E
 
Y
S
 
D
S
 
T
V
 
R
P
 
L
F
 
F
S
 
G
Y
 
M
V
 
M
D
 
D
S
 
I
Q
 
E
S
 
S
G
 
R
K
 
T
P
 
V
V
 
Q
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
C
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
A
E
 
K
V
 
A
V
 
I
R
 
T
K
 
K
K
 
K
T
 
I
G
 
L
K
 
G
K
 
D
D
 
N
M
 
G
E
 
K
V
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
V
A
 
E
V
 
V
T
 
T
P
x
S
A
 
K
N
 
T
R
|
R
I
 
I
T
 
P
M
 
L
I
 
L
E
 
K
E
 
N
G
 
G
K
 
N
A
 
I
D
 
D
M
 
A
E
 
I
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
K
K
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
V
H
 
Y
F
 
F
I
 
D
T
 
A
G
 
G
A
 
Q
R
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
K
A
 
G
S
 
S
P
 
Q
I
 
I
D
 
K
K
 
S
V
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
N
 
N
G
 
A
K
 
S
K
 
T
L
 
T
V
 
V
-
 
L
S
 
A
T
 
V
K
 
K
G
 
G
T
x
S
T
|
T
P
 
S
L
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
A
A
 
A
N
 
N
-
 
I
R
 
R
E
 
Q
R
 
H
L
 
A
M
 
P
G
 
D
I
 
A
T
 
K
I
 
I
M
 
L
E
 
E
A
 
L
P
 
E
D
 
N
H
x
Y
A
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
F
E
 
T
M
 
A
V
 
L
E
 
Q
K
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
G
D
 
D
A
 
A
F
 
M
V
 
T
M
 
T
D
|
D
D
 
N
V
 
A
L
 
I
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
I
A
 
A
A
 
D
G
 
E
R
 
N
P
 
P
D
 
E
P
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
Y
K
 
E
V
 
L
V
 
V
G
 
G
R
 
G
F
 
T
M
 
F
T
 
T
T
 
N
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
I
 
I
M
 
A
L
 
I
P
 
N
K
 
K
N
 
G
D
 
Q
P
 
E
E
 
N
F
 
F
K
 
L
K
 
K
L
 
A
V
 
V
D
 
N
E
 
Q
E
 
A
M
 
L
R
 
E
R
 
E
L
 
M
I
 
H
T
 
A
S
 
D
R
 
G
D
 
T
I
 
Y
Y
 
D
P
 
K
I
 
I
Y
 
Y
D
 
Q
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
-
P
 
P
N
 
N
N
 
E
T
 
T

6h20A Glnh bound to asn, mycobacterium tuberculosis (see paper)
27% identity, 86% coverage: 19:274/299 of query aligns to 34:282/287 of 6h20A

query
sites
6h20A
L
 
F
A
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
D
T
 
A
V
 
A
L
 
V
E
 
A
R
 
D
V
 
I
S
 
R
A
 
A
G
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
G
H
 
L
R
 
D
E
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
D
 
D
S
 
P
Q
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
C
 
A
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
A
R
 
R
K
 
D
K
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
V
K
 
P
D
 
S
M
 
-
E
 
H
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
V
 
R
A
 
I
V
 
L
T
 
S
P
 
A
A
 
A
N
 
E
R
|
R
I
 
V
T
 
T
M
 
A
I
 
L
E
 
Q
E
 
K
G
 
S
K
 
Q
A
 
V
D
 
D
M
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
R
 
R
Q
 
K
K
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
T
 
S
I
 
T
P
 
V
H
 
Y
F
 
L
I
 
D
T
 
A
G
 
N
A
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
K
 
P
S
 
R
A
 
D
S
 
S
P
 
P
I
 
I
D
 
T
K
 
K
V
 
V
E
 
S
D
 
D
L
 
L
N
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
V
V
 
C
S
 
V
T
 
A
K
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
R
A
 
I
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
I
L
 
A
M
 
P
G
 
P
I
 
P
T
 
V
I
 
I
M
 
V
E
 
S
A
 
V
P
 
V
D
 
N
H
x
W
A
 
A
K
 
D
A
 
C
V
 
L
E
 
V
M
 
A
V
 
L
E
 
Q
K
 
Q
G
 
R
E
 
E
A
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
V
 
T
L
 
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
E
G
 
E
R
 
D
P
 
P
D
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
Y
L
 
L
K
 
H
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
P
F
 
D
M
 
M
T
 
A
T
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
I
 
V
M
 
G
L
 
I
P
 
N
K
 
L
N
 
D
D
 
N
P
 
T
E
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
L
 
F
V
 
V
D
 
N
E
 
G
E
 
T
M
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
I
I
 
R
T
 
N
S
 
D
R
 
G
D
 
T
I
 
W
Y
 
N
P
 
T
I
 
L
Y
 
Y
D
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
N
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
K
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P
N
 
T

6h1uA Glnh bound to asp, mycobacterium tuberculosis (see paper)
27% identity, 86% coverage: 19:274/299 of query aligns to 34:282/287 of 6h1uA

query
sites
6h1uA
L
 
F
A
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
D
T
 
A
V
 
A
L
 
V
E
 
A
R
 
D
V
 
I
S
 
R
A
 
A
G
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
G
H
 
L
R
 
D
E
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
D
 
D
S
 
P
Q
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
C
 
A
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
A
R
 
R
K
 
D
K
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
V
K
 
P
D
 
S
M
 
-
E
 
H
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
V
 
R
A
 
I
V
 
L
T
 
S
P
 
A
A
 
A
N
 
E
R
|
R
I
 
V
T
 
T
M
 
A
I
 
L
E
 
Q
E
 
K
G
 
S
K
 
Q
A
 
V
D
 
D
M
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
R
 
R
Q
 
K
K
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
T
 
S
I
 
T
P
 
V
H
 
Y
F
 
L
I
 
D
T
 
A
G
 
N
A
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
K
 
P
S
 
R
A
 
D
S
 
S
P
 
P
I
 
I
D
 
T
K
 
K
V
 
V
E
 
S
D
 
D
L
 
L
N
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
V
V
 
C
S
 
V
T
 
A
K
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
R
A
 
I
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
I
L
 
A
M
 
P
G
 
P
I
 
P
T
 
V
I
 
I
M
 
V
E
 
S
A
 
V
P
 
V
D
 
N
H
x
W
A
 
A
K
 
D
A
 
C
V
 
L
E
 
V
M
 
A
V
 
L
E
 
Q
K
 
Q
G
 
R
E
 
E
A
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
V
 
T
L
x
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
E
G
 
E
R
 
D
P
 
P
D
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
Y
L
 
L
K
 
H
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
P
F
 
D
M
 
M
T
 
A
T
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
I
 
V
M
 
G
L
 
I
P
 
N
K
 
L
N
 
D
D
 
N
P
 
T
E
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
L
 
F
V
 
V
D
 
N
E
 
G
E
 
T
M
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
I
I
 
R
T
 
N
S
 
D
R
 
G
D
 
T
I
 
W
Y
 
N
P
 
T
I
 
L
Y
 
Y
D
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
N
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
K
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P
N
 
T

6h2tA Glnh bound to glu, mycobacterium tuberculosis (see paper)
27% identity, 86% coverage: 19:274/299 of query aligns to 35:283/288 of 6h2tA

query
sites
6h2tA
L
 
F
A
 
A
A
 
T
S
 
K
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
A
 
D
T
 
A
V
 
A
L
 
V
E
 
A
R
 
D
V
 
I
S
 
R
A
 
A
G
 
R
G
 
G
K
 
R
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
G
H
 
L
R
 
D
E
 
I
S
 
G
S
 
S
V
 
N
P
 
L
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
R
D
 
D
S
 
P
Q
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
I
C
 
A
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
A
R
 
R
K
 
D
K
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
V
K
 
P
D
 
S
M
 
-
E
 
H
V
 
V
E
 
E
F
 
Y
V
 
R
A
 
I
V
 
L
T
 
S
P
 
A
A
 
A
N
 
E
R
|
R
I
 
V
T
 
T
M
 
A
I
 
L
E
 
Q
E
 
K
G
 
S
K
 
Q
A
 
V
D
 
D
M
 
I
E
 
V
C
 
V
G
 
K
S
x
T
T
 
M
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
C
E
 
E
R
|
R
R
 
R
Q
 
K
K
 
L
V
 
V
A
 
N
F
 
F
T
 
S
I
 
T
P
 
V
H
 
Y
F
 
L
I
 
D
T
 
A
G
 
N
A
 
Q
R
 
R
L
 
I
L
 
L
V
 
A
K
 
P
S
 
R
A
 
D
S
 
S
P
 
P
I
 
I
D
 
T
K
 
K
V
 
V
E
 
S
D
 
D
L
 
L
N
 
S
G
 
G
K
 
K
K
 
R
L
 
V
V
 
C
S
 
V
T
 
A
K
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
R
A
 
I
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
I
L
 
A
M
 
P
G
 
P
I
 
P
T
 
V
I
 
I
M
 
V
E
 
S
A
 
V
P
 
V
D
 
N
H
x
W
A
 
A
K
 
D
A
 
C
V
 
L
E
 
V
M
 
A
V
 
L
E
 
Q
K
 
Q
G
 
R
E
 
E
A
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
S
M
 
T
D
|
D
D
 
D
V
 
T
L
 
I
L
 
L
Y
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
V
A
 
E
G
 
E
R
 
D
P
 
P
D
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
Y
L
 
L
K
 
H
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
P
F
 
D
M
 
M
T
 
A
T
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
I
 
V
M
 
G
L
 
I
P
 
N
K
 
L
N
 
D
D
 
N
P
 
T
E
 
G
F
 
L
K
 
V
K
 
R
L
 
F
V
 
V
D
 
N
E
 
G
E
 
T
M
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
I
I
 
R
T
 
N
S
 
D
R
 
G
D
 
T
I
 
W
Y
 
N
P
 
T
I
 
L
Y
 
Y
D
 
R
K
 
K
W
 
W
F
 
L
N
 
T
-
 
V
-
 
L
-
 
G
-
 
P
K
 
A
P
 
P
I
 
A
P
 
P
P
 
P
N
 
T

4zv2A An ancestral arginine-binding protein bound to glutamine (see paper)
28% identity, 78% coverage: 36:269/299 of query aligns to 4:225/225 of 4zv2A

query
sites
4zv2A
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
R
I
 
V
A
 
G
H
 
T
R
x
E
E
 
A
S
 
T
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
V
 
K
D
 
D
S
 
-
Q
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
C
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
A
E
 
K
V
 
A
V
 
I
R
 
A
K
 
K
K
 
K
T
 
L
G
 
G
K
 
-
K
 
-
D
 
-
M
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
K
A
 
P
V
 
M
T
 
D
P
x
F
A
 
D
N
 
G
R
 
I
I
 
I
T
 
P
M
 
A
I
 
L
E
 
Q
E
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
I
D
 
D
M
 
V
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
K
K
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
I
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
Q
R
 
A
L
 
I
L
 
V
V
 
V
K
 
K
S
 
K
A
 
G
S
 
N
-
 
D
P
 
S
I
 
I
D
 
K
K
 
S
V
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
V
V
 
G
S
 
V
T
 
Q
K
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
P
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
S
D
 
E
Q
 
Q
A
 
H
N
 
V
R
 
K
E
 
K
R
 
V
L
 
A
M
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
K
I
 
V
M
 
K
E
 
K
A
 
F
P
 
D
D
 
N
H
 
F
A
 
S
K
 
E
A
 
A
V
 
F
E
 
Q
M
 
E
V
 
L
E
 
K
K
 
S
G
 
G
E
 
R
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
V
 
A
L
 
V
L
 
-
Y
 
-
G
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
G
 
V
R
 
K
P
 
Q
D
 
N
P
 
P
K
 
N
A
 
A
-
 
G
L
 
V
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
E
F
 
T
M
 
F
T
 
S
T
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
I
 
I
M
 
A
L
 
V
P
 
R
K
 
K
N
 
G
D
 
N
P
 
S
E
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
E
L
 
K
V
 
I
D
 
N
E
 
K
E
 
A
M
 
L
R
 
E
R
 
E
L
 
M
I
 
K
T
 
K
S
 
D
R
 
G
D
 
T
I
 
Y
Y
 
D
P
 
K
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
G
K
 
E

4zv1A An ancestral arginine-binding protein bound to arginine (see paper)
28% identity, 78% coverage: 36:268/299 of query aligns to 4:226/226 of 4zv1A

query
sites
4zv1A
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
R
I
 
V
A
 
G
H
 
T
R
x
E
E
 
A
S
 
T
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
F
V
 
K
D
 
D
S
 
-
Q
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
L
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
C
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
A
E
 
K
V
 
A
V
 
I
R
 
A
K
 
K
K
 
K
T
 
L
G
 
G
K
 
-
K
 
-
D
 
-
M
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
K
A
 
P
V
 
M
T
 
D
P
x
F
A
 
D
N
 
G
R
 
I
I
 
I
T
 
P
M
 
A
I
 
L
E
 
Q
E
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
I
D
 
D
M
 
V
E
 
V
C
 
I
G
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
K
K
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
I
 
E
T
 
A
G
 
G
A
 
Q
R
 
A
L
 
I
L
 
V
V
 
V
K
 
K
S
 
K
A
 
G
S
 
N
-
 
D
P
 
S
I
 
I
D
 
K
K
 
S
V
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
V
V
 
G
S
 
V
T
x
Q
K
 
L
G
 
G
T
x
S
T
|
T
P
 
S
L
 
E
K
 
Q
A
 
H
A
 
V
D
 
K
Q
 
K
A
 
V
N
 
A
R
 
K
E
 
D
R
 
-
L
 
-
M
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
K
I
 
V
M
 
K
E
 
K
A
 
F
P
 
D
D
 
N
H
 
F
A
 
S
K
 
E
A
 
A
V
 
F
E
 
Q
M
 
E
V
 
L
E
 
K
K
 
S
G
 
G
E
 
R
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
N
V
 
A
L
 
V
L
 
-
Y
 
-
G
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
Y
G
 
V
R
 
K
P
 
Q
D
 
N
P
 
P
K
 
N
A
 
A
-
 
G
L
 
V
K
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
E
F
 
T
M
 
F
T
 
S
T
 
G
E
 
E
P
 
P
L
 
Y
A
 
G
I
 
I
M
 
A
L
 
V
P
 
R
K
 
K
N
 
G
D
 
N
P
 
S
E
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
E
L
 
K
V
 
I
D
 
N
E
 
K
E
 
A
M
 
L
R
 
E
R
 
E
L
 
M
I
 
K
T
 
K
S
 
D
R
 
G
D
 
T
I
 
Y
Y
 
D
P
 
K
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
G

5t0wA Crystal structure of the ancestral amino acid-binding protein anccdt- 1, a precursor of cyclohexadienyl dehydratase
31% identity, 81% coverage: 27:267/299 of query aligns to 1:228/229 of 5t0wA

query
sites
5t0wA
T
 
S
V
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
E
V
 
I
S
 
M
A
 
K
G
 
R
G
 
G
K
 
T
L
 
L
V
 
R
I
 
V
A
 
G
H
 
T
R
x
D
E
 
A
S
 
D
S
x
Y
V
 
K
P
 
P
F
 
F
S
 
S
Y
 
F
V
 
K
D
 
D
S
 
-
Q
 
K
S
 
N
G
 
G
K
 
Q
P
 
Y
V
 
T
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
L
C
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
A
E
 
K
V
 
A
V
 
L
R
 
A
K
 
K
K
 
E
T
 
L
G
 
G
K
 
-
K
 
-
D
 
-
M
 
V
E
 
K
V
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
V
A
 
P
V
 
T
T
 
T
P
x
W
A
 
D
N
 
G
R
 
I
I
 
I
T
 
P
M
 
A
I
 
L
E
 
Q
E
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
F
D
 
D
M
 
I
E
 
V
C
 
M
G
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
P
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
P
H
 
Y
F
 
M
I
 
T
T
 
A
G
 
G
A
 
Q
R
 
T
L
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
K
-
 
K
-
 
D
S
 
N
A
 
A
S
 
D
P
 
K
I
 
I
D
 
K
K
 
S
V
 
F
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
N
G
 
K
K
 
P
-
 
D
-
 
V
K
 
K
L
 
V
V
 
A
S
 
V
T
x
Q
K
 
L
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
S
D
 
E
Q
 
Q
A
 
A
N
 
A
R
 
K
E
 
E
R
 
F
L
 
L
M
 
P
G
 
K
I
 
A
T
 
K
I
 
I
M
 
R
E
 
T
A
 
F
P
 
E
D
 
N
H
 
N
A
 
A
K
 
E
A
 
A
V
 
F
E
 
Q
M
 
E
V
 
V
E
 
V
K
 
S
G
 
G
E
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
M
V
 
V
M
 
T
D
|
D
D
 
S
V
 
P
L
 
V
L
 
A
Y
 
A
G
 
Y
L
 
Y
A
 
A
A
 
K
G
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
-
K
 
L
A
 
A
L
 
V
K
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
D
R
 
E
F
 
P
M
 
F
T
 
T
T
 
H
E
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
G
I
 
F
M
 
A
L
 
I
P
 
R
K
 
K
N
 
G
D
 
D
P
 
P
E
 
E
F
 
L
K
 
L
K
 
N
L
 
W
V
 
V
D
 
N
E
 
N
E
 
W
M
 
L
R
 
K
R
 
Q
L
 
M
I
 
K
T
 
K
S
 
D
R
 
G
D
 
T
I
 
Y
Y
 
D
P
 
K
I
 
L
Y
 
Y
D
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F

2q2cA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
30% identity, 78% coverage: 37:269/299 of query aligns to 2:222/231 of 2q2cA

query
sites
2q2cA
K
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
G
H
 
T
R
 
D
E
 
A
S
 
A
S
x
F
V
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
V
 
M
D
 
-
S
 
-
Q
 
Q
S
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
L
C
 
L
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
-
E
 
D
V
 
A
V
 
V
R
 
M
K
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
G
K
 
L
K
 
-
D
 
D
M
 
Y
E
 
E
V
 
L
E
 
K
F
 
N
V
 
I
A
 
G
V
x
W
T
 
D
P
 
P
A
 
L
N
 
-
R
 
-
I
 
F
T
 
A
M
 
S
I
 
L
E
 
Q
E
 
S
G
 
K
K
 
E
A
 
V
D
 
D
M
 
M
E
 
G
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
Q
K
 
S
V
 
Y
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
I
 
E
T
 
A
G
 
T
A
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
Q
A
 
G
S
 
S
P
 
P
I
 
V
D
 
K
K
 
N
V
 
A
E
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
I
V
 
G
S
 
V
T
x
Q
K
 
N
G
 
A
T
|
T
T
|
T
P
 
G
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
G
I
 
K
T
 
G
-
 
P
-
 
H
I
 
I
M
 
K
E
 
K
A
 
F
P
 
E
D
 
T
H
 
T
A
 
V
K
 
V
A
 
A
V
 
I
E
 
M
M
 
E
V
 
L
E
 
L
K
 
N
G
 
G
E
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
I
M
 
T
D
|
D
D
 
N
V
 
A
L
 
V
L
 
A
Y
 
N
G
 
E
L
 
Y
A
 
V
A
 
K
G
 
N
R
 
N
P
 
P
D
 
N
P
 
K
K
 
K
A
 
-
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
G
 
E
-
 
D
-
 
P
R
 
K
F
 
N
M
 
F
T
 
A
T
 
S
E
 
E
P
 
Y
L
 
Y
A
 
G
I
 
M
M
 
I
L
 
F
P
 
P
K
 
K
N
 
N
D
 
-
P
 
S
E
 
E
F
 
L
K
 
K
K
 
A
L
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
M
 
L
R
 
K
R
 
N
L
 
V
I
 
I
T
 
N
S
 
S
R
 
G
D
 
K
I
 
Y
Y
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
 
Y
D
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
G
K
 
K

2q2aA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
30% identity, 78% coverage: 37:269/299 of query aligns to 12:232/241 of 2q2aA

query
sites
2q2aA
K
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
G
H
 
T
R
x
D
E
 
A
S
 
A
S
x
F
V
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
V
 
M
D
 
-
S
 
-
Q
 
Q
S
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
L
C
 
L
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
-
E
 
D
V
 
A
V
 
V
R
 
M
K
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
G
K
 
L
K
 
-
D
 
D
M
 
Y
E
 
E
V
 
L
E
 
K
F
 
N
V
 
I
A
 
G
V
x
W
T
 
D
P
 
P
A
 
L
N
 
-
R
 
-
I
 
F
T
 
A
M
 
S
I
 
L
E
 
Q
E
 
S
G
 
K
K
 
E
A
 
V
D
 
D
M
 
M
E
 
G
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
Q
K
 
S
V
 
Y
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
I
 
E
T
 
A
G
 
T
A
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
Q
A
 
G
S
 
S
P
 
P
I
 
V
D
 
K
K
 
N
V
 
A
E
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
I
V
 
G
S
 
V
T
x
Q
K
 
N
G
 
A
T
|
T
T
|
T
P
 
G
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
G
I
 
K
T
 
G
I
 
P
M
 
H
E
 
I
A
 
K
P
 
K
D
 
F
H
 
E
A
 
T
K
 
T
A
 
V
V
 
V
E
 
A
M
 
I
V
 
M
E
 
E
-
 
L
-
 
L
K
 
N
G
 
G
E
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
I
M
 
T
D
|
D
D
 
N
V
 
A
L
 
V
L
 
A
Y
 
N
G
 
E
L
 
Y
A
 
V
A
 
K
G
 
N
R
 
N
P
 
P
D
 
N
P
 
K
K
 
K
A
 
-
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
G
 
E
-
 
D
-
 
P
R
 
K
F
 
N
M
 
F
T
 
A
T
 
S
E
 
E
P
 
Y
L
 
Y
A
 
G
I
 
M
M
 
I
L
 
F
P
 
P
K
 
K
N
 
N
D
 
-
P
 
S
E
 
E
F
 
L
K
 
K
K
 
A
L
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
M
 
L
R
 
K
R
 
N
L
 
V
I
 
I
T
 
N
S
 
S
R
 
G
D
 
K
I
 
Y
Y
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
 
Y
D
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
G
K
 
K

2pvuA Crystal structures of the arginine-, lysine-, histidine-binding protein artj from the thermophilic bacterium geobacillus stearothermophilus (see paper)
30% identity, 78% coverage: 37:269/299 of query aligns to 6:226/235 of 2pvuA

query
sites
2pvuA
K
 
K
L
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
G
H
 
T
R
 
D
E
 
A
S
 
A
S
x
F
V
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
V
 
M
D
 
-
S
 
-
Q
 
Q
S
 
K
G
 
G
K
 
K
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
L
C
 
L
L
 
-
R
 
-
M
 
-
A
 
-
E
 
D
V
 
A
V
 
V
R
 
M
K
 
K
K
 
A
T
 
A
G
 
G
K
 
L
K
 
-
D
 
D
M
 
Y
E
 
E
V
 
L
E
 
K
F
 
N
V
 
I
A
 
G
V
x
W
T
 
D
P
 
P
A
 
L
N
 
-
R
 
-
I
 
F
T
 
A
M
 
S
I
 
L
E
 
Q
E
 
S
G
 
K
K
 
E
A
 
V
D
 
D
M
 
M
E
 
G
C
 
I
G
 
S
S
x
G
T
x
I
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
Q
K
 
S
V
 
Y
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
I
 
E
T
 
A
G
 
T
A
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
L
V
 
V
K
 
K
S
 
Q
A
 
G
S
 
S
P
 
P
I
 
V
D
 
K
K
 
N
V
 
A
E
 
L
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
I
V
 
G
S
 
V
T
x
Q
K
 
N
G
 
A
T
|
T
T
|
T
P
 
G
L
 
Q
K
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
E
R
 
K
L
 
L
M
 
F
G
 
G
I
 
K
T
 
G
I
 
P
M
 
H
E
 
I
A
 
K
P
 
K
D
 
F
H
 
E
A
 
T
K
 
T
A
 
V
V
 
V
E
 
A
M
 
I
V
 
M
E
 
E
-
 
L
-
 
L
K
 
N
G
 
G
E
 
G
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
I
M
 
T
D
|
D
D
 
N
V
 
A
L
 
V
L
 
A
Y
 
N
G
 
E
L
 
Y
A
 
V
A
 
K
G
 
N
R
 
N
P
 
P
D
 
N
P
 
K
K
 
K
A
 
-
L
 
L
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
G
 
E
-
 
D
-
 
P
R
 
K
F
 
N
M
 
F
T
 
A
T
 
S
E
 
E
P
 
Y
L
 
Y
A
 
G
I
 
M
M
 
I
L
 
F
P
 
P
K
 
K
N
 
N
D
 
-
P
 
S
E
 
E
F
 
L
K
 
K
K
 
A
L
 
K
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
M
 
L
R
 
K
R
 
N
L
 
V
I
 
I
T
 
N
S
 
S
R
 
G
D
 
K
I
 
Y
Y
 
T
P
 
E
I
 
I
Y
 
Y
D
 
K
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
G
K
 
K

1xt8B Crystal structure of cysteine-binding protein from campylobacter jejuni at 2.0 a resolution (see paper)
27% identity, 79% coverage: 29:265/299 of query aligns to 7:232/251 of 1xt8B

query
sites
1xt8B
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
I
S
 
K
A
 
Q
G
 
N
G
 
G
K
 
V
L
 
V
V
 
R
I
 
I
A
 
G
H
 
V
R
x
F
E
 
G
S
 
D
S
x
K
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
G
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
S
 
-
Q
 
E
S
 
K
G
 
G
K
 
N
P
 
N
V
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
V
 
I
D
 
A
L
 
L
C
 
A
L
 
K
R
 
R
M
 
I
A
 
A
E
 
K
V
 
E
V
 
L
R
 
F
K
 
G
K
 
D
T
 
E
G
 
N
K
 
K
K
 
-
D
 
-
M
 
-
E
 
-
V
 
V
E
 
Q
F
 
F
V
 
V
A
 
L
V
 
V
T
 
E
P
 
A
A
 
A
N
 
N
R
|
R
I
 
V
T
 
E
M
 
F
I
 
L
E
 
K
E
 
S
G
 
N
K
 
K
A
 
V
D
 
D
M
 
I
E
 
I
C
 
L
G
 
A
S
x
N
T
 
F
T
|
T
N
 
Q
N
 
T
A
 
P
E
 
Q
R
|
R
R
 
A
Q
 
E
K
 
Q
V
 
V
A
 
D
F
 
F
T
 
C
I
 
S
P
 
P
H
 
Y
F
 
M
I
 
K
T
 
V
G
 
A
A
 
L
R
 
G
L
 
V
L
 
A
V
 
V
K
 
P
S
 
K
A
 
D
S
 
S
P
 
N
I
 
I
D
 
T
K
 
S
V
 
V
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
D
K
 
K
K
 
T
L
 
L
V
 
L
S
 
L
T
 
N
K
 
K
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
A
D
 
D
Q
 
A
A
 
Y
N
 
F
R
 
T
E
 
Q
R
 
N
L
 
Y
M
 
P
G
 
N
I
 
I
T
 
K
I
 
T
M
 
L
E
 
K
A
 
Y
P
 
D
D
 
Q
H
 
N
A
 
T
K
 
E
A
 
T
V
 
F
E
 
A
M
 
A
V
 
L
E
 
M
K
 
D
G
 
K
E
 
R
A
 
G
D
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
M
x
H
D
|
D
D
 
N
V
 
T
L
 
L
L
 
L
Y
 
F
G
 
A
L
 
W
A
 
V
A
 
K
G
 
D
R
 
H
P
 
P
D
 
D
P
 
F
K
 
K
-
 
M
A
 
G
L
 
I
K
 
K
V
 
E
V
 
L
G
 
G
R
 
-
F
 
-
M
 
-
T
 
N
T
 
K
E
 
D
P
 
V
L
 
I
A
 
A
I
 
P
M
 
A
L
 
V
P
 
K
K
 
K
N
 
G
D
 
D
P
 
K
E
 
E
F
 
L
K
 
K
K
 
E
L
 
F
V
 
I
D
 
D
E
 
N
E
 
L
M
 
I
R
 
I
R
 
K
L
 
L
I
 
G
T
 
Q
S
 
E
R
 
Q
D
 
F
I
 
F
Y
 
H
P
 
K
I
 
A
Y
 
Y
D
 
D
K
 
E

2pyyB Crystal structure of the glur0 ligand-binding core from nostoc punctiforme in complex with (l)-glutamate (see paper)
27% identity, 70% coverage: 61:268/299 of query aligns to 19:211/217 of 2pyyB

query
sites
2pyyB
G
 
G
Y
 
F
A
 
S
V
 
I
D
 
D
L
 
L
C
 
W
L
 
R
R
 
S
M
 
I
A
 
A
E
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
T
K
 
Q
T
 
I
G
 
G
K
 
I
K
 
E
D
 
S
M
 
K
E
 
L
V
 
I
E
 
E
F
 
Y
V
 
S
A
 
S
V
|
V
T
 
-
P
 
-
A
 
P
N
 
E
R
 
L
I
 
I
T
 
S
M
 
A
I
 
I
E
 
K
E
 
D
G
 
N
K
 
K
A
 
V
D
 
N
M
 
L
E
 
G
C
 
I
G
 
A
S
x
A
T
x
I
T
x
S
N
 
I
N
 
T
A
 
A
E
 
E
R
|
R
R
 
E
Q
 
Q
K
 
N
V
 
F
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
L
P
 
P
H
 
I
F
 
F
I
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
L
R
 
Q
L
 
I
L
 
M
V
 
V
K
 
R
S
 
N
A
 
G
S
 
D
P
 
-
I
 
I
D
 
R
K
 
S
V
 
I
E
 
D
D
 
D
L
 
L
N
 
P
G
 
G
K
 
K
K
 
V
L
 
V
V
 
A
S
 
T
T
|
T
K
 
A
G
 
G
T
x
S
T
|
T
P
 
A
L
 
A
K
 
T
A
 
Y
A
 
L
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
-
E
 
-
R
 
R
L
 
E
M
 
H
G
 
H
I
 
I
T
 
S
I
 
V
M
 
L
E
 
E
A
 
V
P
 
P
D
 
K
H
 
I
A
 
E
K
 
E
A
 
A
V
 
Y
E
 
K
M
 
A
V
 
L
E
 
Q
K
 
T
G
 
K
E
 
K
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
M
 
F
D
|
D
D
 
A
V
 
P
L
 
V
L
 
L
Y
 
L
G
 
F
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
N
R
 
E
P
 
G
D
 
K
P
 
G
K
 
K
A
 
-
L
 
V
K
 
E
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
S
F
 
I
M
 
L
T
 
R
T
 
E
E
 
E
P
 
S
L
 
Y
A
 
G
I
 
I
M
 
I
L
 
L
P
 
P
K
 
N
N
 
N
D
 
S
P
 
P
E
 
-
F
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
P
V
 
I
D
 
N
E
 
Q
E
 
A
M
 
L
R
 
L
R
 
N
L
 
L
I
 
K
T
 
E
S
 
N
R
 
G
D
 
T
I
 
Y
Y
 
Q
P
 
S
I
 
L
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
D

Sites not aligning to the query:

6svfA Crystal structure of the p235gk mutant of argbp from t. Maritima (see paper)
26% identity, 81% coverage: 29:269/299 of query aligns to 3:229/229 of 6svfA

query
sites
6svfA
L
 
I
E
 
D
R
 
E
V
 
I
S
 
K
A
 
S
G
 
R
G
 
G
K
 
Y
L
 
L
V
 
L
I
 
V
A
 
G
H
 
L
R
 
S
E
 
A
S
 
D
S
x
F
V
 
P
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
V
 
V
D
 
D
S
 
-
Q
 
E
S
 
N
G
 
G
K
 
N
P
 
I
V
 
V
G
 
G
Y
 
F
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
L
C
 
A
L
 
K
R
 
E
M
 
I
A
 
A
E
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
K
 
R
K
 
R
T
 
L
G
 
G
K
 
-
K
 
-
D
 
-
M
 
V
E
 
E
V
 
L
E
 
K
F
 
I
V
 
V
A
 
D
V
 
M
T
 
T
P
x
F
A
 
D
N
 
G
R
 
L
I
 
I
T
 
P
M
 
S
I
 
L
E
 
L
E
 
T
G
 
K
K
 
K
A
 
I
D
 
D
M
 
V
E
 
I
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
E
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
K
K
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
S
I
 
D
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
I
 
D
T
 
A
G
 
G
A
 
Q
R
 
V
L
 
I
L
 
V
V
 
V
K
 
R
S
 
K
A
 
D
S
 
S
P
 
D
I
 
F
-
 
R
-
 
P
D
 
K
K
 
T
V
 
Y
E
 
E
D
 
D
L
 
L
N
 
V
G
 
G
K
 
K
K
 
T
L
 
V
V
 
A
S
 
V
T
x
Q
K
 
I
G
 
G
T
|
T
T
|
T
P
 
G
L
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
Q
 
D
A
 
I
N
 
E
R
 
V
E
 
S
R
 
K
L
 
Y
M
 
D
G
 
G
I
 
I
T
 
K
I
 
V
M
 
V
E
 
R
A
 
F
P
 
D
D
 
K
H
 
F
A
 
T
K
 
D
A
 
A
V
 
F
E
 
L
M
 
E
V
 
L
E
 
K
K
 
R
G
 
G
E
 
R
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
V
M
 
L
D
|
D
D
 
S
V
 
A
L
 
T
L
 
A
Y
 
R
G
 
A
L
 
F
A
 
V
A
 
A
G
 
K
R
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
L
K
 
V
V
 
I
V
 
S
G
 
S
R
 
G
F
 
V
M
 
L
T
 
S
T
 
S
E
 
E
P
 
Q
L
 
Y
A
 
G
I
 
I
M
 
A
L
 
V
P
 
R
K
 
K
N
 
E
D
 
D
P
 
T
E
 
D
F
 
L
K
 
L
K
 
E
L
 
F
V
 
I
D
 
N
E
 
S
E
 
V
M
 
L
R
 
R
R
 
E
L
 
L
I
 
K
T
 
K
S
 
S
R
 
G
D
 
K
I
 
Y
Y
 
D
P
 
V
I
 
L
Y
 
I
D
 
E
K
 
K
W
 
W
F
 
F
N
 
S
K
 
E

4zefA Crystal structure of substrate binding domain 2 (sbd2) of abc transporter glnpq from enterococcus faecalis
30% identity, 60% coverage: 37:214/299 of query aligns to 17:186/239 of 4zefA

query
sites
4zefA
K
 
K
L
 
Y
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
S
R
 
D
E
 
S
S
 
T
S
x
F
V
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
V
 
Q
D
 
N
S
 
A
Q
 
Q
S
 
-
G
 
G
K
 
D
P
 
Y
V
 
V
G
 
G
Y
 
I
A
 
D
V
 
V
D
 
D
L
 
L
C
 
V
L
 
K
R
 
R
M
 
A
A
 
A
E
 
E
V
 
L
V
 
-
R
 
-
K
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
Q
D
 
G
M
 
F
E
 
T
V
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
K
A
 
F
V
 
I
T
 
G
P
x
F
A
 
S
N
 
S
R
 
A
I
 
V
T
 
Q
M
 
A
I
 
V
E
 
E
E
 
S
G
 
G
K
 
Q
A
 
A
D
 
D
M
 
G
E
 
M
C
 
V
G
x
A
S
x
G
T
x
M
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
D
E
 
D
R
|
R
R
 
K
Q
 
K
K
 
A
V
 
F
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
V
P
 
P
H
 
Y
F
 
F
I
 
D
T
 
S
G
 
G
A
 
I
R
 
Q
L
 
I
L
 
A
V
 
V
K
 
K
S
 
K
A
 
G
S
 
N
-
 
D
P
 
K
I
 
I
D
 
K
K
 
S
V
 
Y
E
 
D
D
 
D
L
 
L
N
 
K
G
 
G
K
 
K
K
 
K
L
 
V
V
 
G
S
 
V
T
x
K
K
 
I
G
 
G
T
|
T
T
x
E
P
 
S
L
 
A
K
 
D
A
 
F
A
 
L
D
 
E
Q
 
K
A
 
N
N
 
K
R
 
K
E
 
K
R
 
Y
L
 
D
M
 
Y
G
 
S
I
 
I
T
 
K
I
 
Y
M
 
L
E
 
D
A
 
T
P
 
T
D
 
D
H
 
A
A
 
L
K
 
Y
A
 
S
V
 
A
E
 
-
M
 
-
V
 
L
E
 
E
K
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
-
V
 
M
M
 
M
D
 
D
D
|
D
-
 
Y
-
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
G
Y
 
Y
G
 
G
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
G
 
N
R
 
Q
P
 
P

4i62A 1.05 angstrom crystal structure of an amino acid abc transporter substrate-binding protein abpa from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a bound to l-arginine
22% identity, 81% coverage: 29:271/299 of query aligns to 1:235/237 of 4i62A

query
sites
4i62A
L
 
I
E
 
E
R
 
A
V
 
I
S
 
K
A
 
S
G
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
H
 
L
R
x
N
E
 
P
S
 
D
S
x
F
V
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
Y
V
 
Q
D
 
K
S
 
V
Q
 
V
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
N
V
 
Q
G
 
I
Y
 
V
A
 
G
V
 
S
D
 
D
L
 
I
C
 
-
L
 
-
R
 
E
M
 
L
A
 
A
E
 
K
V
 
A
V
 
I
R
 
A
K
 
T
K
 
E
T
 
L
G
 
G
K
 
-
K
 
-
D
 
-
M
 
V
E
 
E
V
 
L
E
 
E
F
 
L
V
 
S
A
 
P
V
 
M
T
 
S
P
x
F
A
 
D
N
 
N
R
 
V
I
 
L
T
 
A
M
 
S
I
 
V
E
 
Q
E
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
D
 
D
M
 
L
E
 
A
C
 
I
G
x
S
S
x
G
T
x
V
T
x
S
N
 
K
N
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
R
 
S
Q
 
K
K
 
V
V
 
F
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
T
P
 
P
H
 
Y
F
 
Y
I
 
T
T
 
A
G
 
K
A
 
N
R
 
K
L
 
L
L
 
I
V
 
V
K
 
K
S
 
K
A
 
S
-
 
D
-
 
L
S
 
A
P
 
T
I
 
Y
D
 
Q
K
 
S
V
 
V
E
 
N
D
 
D
L
 
L
N
 
A
G
 
Q
K
 
K
K
 
K
L
 
V
V
 
G
S
 
A
T
x
Q
K
 
K
G
 
G
T
x
S
T
x
I
P
x
Q
L
 
E
K
 
T
A
 
M
A
 
A
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
R
 
K
E
 
D
R
 
L
L
 
L
M
 
Q
G
 
N
I
 
S
T
 
S
I
 
L
M
 
V
E
 
S
A
 
L
P
 
P
D
 
K
H
 
N
A
 
G
K
 
N
A
 
L
V
 
I
E
 
T
M
 
D
V
 
L
E
 
K
K
 
S
G
 
G
E
 
Q
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
I
M
 
F
D
x
E
D
 
E
V
 
P
L
 
V
L
 
A
Y
 
K
G
 
G
L
 
F
A
 
V
A
 
E
G
 
N
R
 
N
P
 
P
D
 
D
P
 
L
K
 
-
A
 
A
L
 
I
K
 
A
V
 
D
V
 
L
G
 
N
R
 
F
F
 
E
M
 
K
T
 
Q
T
 
D
E
 
D
P
 
S
L
 
Y
A
 
A
I
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
K
K
 
K
N
 
D
D
 
S
P
 
K
E
 
E
F
 
L
K
 
K
K
 
E
L
 
A
V
 
V
D
 
D
E
 
K
E
 
T
M
 
I
R
 
Q
R
 
K
L
 
L
I
 
K
T
 
E
S
 
S
R
 
G
D
 
E
I
 
L
Y
 
D
P
 
K
I
 
L
Y
 
I
D
 
E
K
 
D
W
 
A
F
 
F
N
 
K
K
 
A
P
 
S
I
 
I

2v25A Structure of the campylobacter jejuni antigen peb1a, an aspartate and glutamate receptor with bound aspartate (see paper)
22% identity, 80% coverage: 29:266/299 of query aligns to 3:229/231 of 2v25A

query
sites
2v25A
L
 
L
E
 
E
R
 
S
V
 
I
S
 
K
A
 
S
G
 
K
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
V
 
I
I
 
V
A
 
G
H
 
V
R
x
K
E
 
N
S
 
D
S
 
V
V
 
P
P
 
H
F
 
Y
S
 
A
Y
 
L
V
 
L
D
 
D
S
 
Q
Q
 
A
S
 
T
G
 
G
K
 
E
P
 
I
V
 
K
G
 
G
Y
 
F
A
 
E
V
 
V
D
 
D
L
 
-
C
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
V
A
 
A
E
 
K
V
 
L
V
 
L
R
 
A
K
 
K
K
 
S
T
 
I
G
 
L
K
 
G
K
 
D
D
 
D
M
 
K
E
 
K
V
 
I
E
 
K
F
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
N
P
 
A
A
 
K
N
 
T
R
|
R
I
 
G
T
 
P
M
 
L
I
 
L
E
 
D
E
 
N
G
 
G
K
 
S
A
 
V
D
 
D
M
 
A
E
 
V
C
 
I
G
 
A
S
x
T
T
 
F
T
|
T
N
 
I
N
 
T
A
 
P
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
R
K
 
I
V
 
Y
A
 
N
F
 
F
T
 
S
I
 
E
P
 
P
H
 
Y
F
 
Y
I
 
Q
T
 
D
G
 
A
A
 
I
R
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
L
S
 
K
A
 
E
S
 
K
P
 
K
I
 
Y
D
 
K
K
 
S
V
 
L
E
 
A
D
 
D
L
 
M
N
 
K
G
 
G
K
 
A
K
 
N
L
 
I
V
 
G
S
 
V
T
 
A
K
 
Q
G
 
A
T
x
A
T
|
T
P
 
T
L
 
K
K
 
K
A
 
A
A
 
I
D
 
G
Q
 
E
A
 
A
N
 
A
R
 
K
E
 
K
R
 
I
L
 
G
M
 
I
G
 
D
I
 
V
T
 
K
I
 
F
M
 
S
E
 
E
A
 
F
P
 
P
D
 
D
H
x
Y
A
 
P
K
 
S
A
 
I
V
 
K
E
 
A
M
 
A
V
 
L
E
 
D
K
 
A
G
 
K
E
 
R
A
 
V
D
 
D
A
 
A
F
 
F
V
 
S
M
 
V
D
|
D
D
 
K
V
 
S
L
x
I
L
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
Y
A
 
V
A
 
D
G
 
D
R
 
K
P
 
S
D
 
E
P
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
K
 
-
V
 
I
V
 
L
G
 
P
R
 
D
F
 
S
M
 
F
T
 
E
T
 
P
E
 
Q
P
 
S
L
 
Y
A
 
G
I
 
I
M
 
V
L
 
T
P
 
K
K
 
K
N
 
D
D
 
D
P
 
P
E
 
A
F
 
F
K
 
A
K
 
K
L
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
D
E
 
F
M
 
V
R
 
K
R
 
E
L
 
-
I
 
-
T
 
H
S
 
K
R
 
N
D
 
E
I
 
I
Y
 
D
P
 
A
I
 
L
Y
 
A
D
 
K
K
 
K
W
 
W

4h5fA Crystal structure of an amino acid abc transporter substrate-binding protein from streptococcus pneumoniae canada mdr_19a bound to l- arginine, form 1
25% identity, 76% coverage: 27:253/299 of query aligns to 2:221/240 of 4h5fA

query
sites
4h5fA
T
 
S
V
 
A
L
 
V
E
 
E
R
 
A
V
 
I
S
 
K
A
 
Q
G
 
K
G
 
G
K
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
V
A
 
A
H
 
T
R
x
S
E
 
P
S
x
D
S
x
Y
V
 
A
P
 
P
F
 
F
S
 
E
Y
 
F
V
 
Q
D
 
S
S
 
L
Q
 
V
S
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
N
-
 
Q
-
 
V
V
 
V
G
 
G
Y
 
A
A
 
D
V
 
I
D
 
D
L
 
-
C
 
-
L
 
-
R
 
-
M
 
M
A
 
A
E
 
Q
V
 
A
V
 
I
R
 
A
K
 
D
K
 
E
T
 
L
G
 
G
K
 
V
K
 
K
D
 
-
M
 
-
E
 
-
V
 
L
E
 
E
F
 
I
V
 
L
A
 
S
V
 
M
T
 
S
P
x
F
A
 
D
N
 
N
R
 
V
I
 
L
T
 
T
M
 
S
I
 
L
E
 
Q
E
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
A
D
 
D
M
 
L
E
 
A
C
 
V
G
x
A
S
x
G
T
x
I
T
x
S
N
 
A
N
 
T
A
 
D
E
 
E
R
|
R
R
 
K
Q
 
E
K
 
V
V
 
F
A
 
D
F
 
F
T
 
S
I
 
I
P
 
P
H
 
Y
F
 
Y
I
 
E
T
 
N
G
 
K
A
 
I
R
 
S
L
 
F
L
 
L
V
 
V
K
 
H
S
 
K
A
 
A
S
 
D
P
 
-
I
 
V
D
 
E
K
 
K
V
 
Y
E
 
K
D
 
D
L
 
L
N
 
T
-
 
S
-
 
L
-
 
E
G
 
S
K
 
A
K
 
N
L
 
I
V
 
A
S
 
A
T
x
Q
K
 
K
G
 
G
T
|
T
T
 
V
P
 
P
L
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
E
Q
 
S
A
 
M
N
 
V
R
 
K
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
M
 
P
G
 
K
I
 
A
T
 
Q
I
 
L
M
 
T
E
 
S
A
 
L
P
 
T
D
 
N
H
 
M
A
 
G
K
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
N
M
 
E
V
 
L
E
 
Q
K
 
A
G
 
G
E
 
K
A
 
I
D
 
D
A
 
A
F
 
V
V
 
H
M
 
M
D
|
D
D
 
E
V
 
P
L
 
V
L
 
A
Y
 
L
G
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
K
R
 
N
P
 
A
D
 
G
P
 
L
K
 
A
A
 
V
L
 
A
K
 
T
V
 
V
V
 
S
G
 
L
R
 
K
F
 
M
M
 
K
T
 
D
T
 
G
E
 
D
P
 
A
L
 
N
A
 
A
I
 
V
M
 
A
L
 
L
P
 
R
K
 
K
N
 
N
D
 
S
P
 
D
E
 
D
F
 
L
K
 
K
K
 
E
L
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
K
E
 
V
M
 
I
R
 
Q
R
 
K
L
 
L

Query Sequence

>Ac3H11_1954 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_1954
MKVQHWRFAKGLVALGCLLAASVQAATVLERVSAGGKLVIAHRESSVPFSYVDSQSGKPV
GYAVDLCLRMAEVVRKKTGKKDMEVEFVAVTPANRITMIEEGKADMECGSTTNNAERRQK
VAFTIPHFITGARLLVKSASPIDKVEDLNGKKLVSTKGTTPLKAADQANRERLMGITIME
APDHAKAVEMVEKGEADAFVMDDVLLYGLAAGRPDPKALKVVGRFMTTEPLAIMLPKNDP
EFKKLVDEEMRRLITSRDIYPIYDKWFNKPIPPNNTVLNLPVSYLLRDFWKYPTDQVPF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory