SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_2882 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_2882 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5f7qE Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to operator (see paper)
25% identity, 92% coverage: 15:393/412 of query aligns to 18:388/396 of 5f7qE

query
sites
5f7qE
S
 
T
V
 
V
L
 
L
Q
 
N
T
 
L
I
 
I
F
 
R
W
 
E
S
 
K
A
 
G
G
 
E
A
 
I
S
 
T
R
 
R
N
x
T
A
 
E
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
L
 
C
A
 
D
Y
 
F
S
 
G
K
 
M
S
|
S
K
x
T
A
 
L
N
 
T
A
 
Y
M
 
I
V
 
L
A
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
Q
D
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
I
D
 
L
E
 
E
V
 
G
G
 
A
L
 
E
Q
 
T
E
 
S
S
 
S
S
x
T
G
|
G
G
|
G
R
|
R
R
|
R
A
|
A
E
x
K
T
 
L
L
 
V
R
 
R
L
 
F
S
 
N
E
 
K
T
 
D
L
 
Y
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
V
G
 
S
A
 
V
D
 
K
L
 
V
G
 
E
A
 
E
T
 
E
S
 
Q
M
 
L
Q
 
L
I
 
F
A
 
A
V
 
L
M
 
T
R
 
D
P
 
L
D
 
N
M
 
A
T
 
E
V
 
I
L
 
I
A
 
E
R
 
N
H
 
T
R
 
S
E
 
I
P
 
P
I
 
F
D
 
S
V
 
S
R
 
E
Q
 
K
G
 
K
P
 
P
G
 
E
V
 
E
I
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
L
V
 
I
R
 
A
G
 
K
L
 
N
M
 
V
R
 
K
E
 
K
L
 
M
L
 
-
A
 
-
R
 
-
C
 
C
G
 
G
L
 
N
A
 
R
P
 
D
-
 
M
N
 
N
Q
 
H
V
 
L
I
 
L
A
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
S
G
 
G
P
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
V
 
I
N
 
R
P
 
S
P
 
T
L
 
M
M
 
L
P
 
G
D
 
-
W
 
W
D
 
E
G
 
N
F
 
V
S
 
A
I
 
L
R
 
E
D
 
A
Y
 
M
L
 
L
R
 
H
E
 
A
A
 
H
F
 
F
A
 
P
-
 
D
A
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
D
 
D
N
 
K
D
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
C
M
 
Y
A
 
T
L
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
L
Y
 
W
R
 
L
L
 
G
Q
 
E
-
 
G
R
 
K
N
 
Q
L
 
S
P
 
N
N
 
N
F
 
F
L
 
A
V
 
T
I
 
V
K
 
S
V
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
G
C
 
L
G
 
S
I
 
V
V
 
V
C
 
I
H
 
N
G
 
R
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
S
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
Q
Q
 
P
H
 
G
G
 
G
P
 
Y
R
 
K
C
|
C
H
 
H
C
|
C
G
 
G
N
 
Q
Q
 
K
G
 
G
C
|
C
V
 
L
E
 
E
A
 
-
M
 
M
A
 
Y
A
 
A
A
 
S
P
 
E
A
 
F
M
 
Y
A
 
F
R
 
R
M
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
S
 
E
A
 
L
L
 
K
L
 
E
A
 
A
E
 
Y
R
 
P
L
 
T
Q
 
S
S
 
E
T
 
L
G
 
N
A
 
D
L
 
F
T
 
H
I
 
F
E
 
D
D
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
S
 
A
R
 
R
T
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
E
A
 
M
A
 
A
N
 
T
A
 
E
I
 
L
I
 
M
Q
 
G
R
 
K
A
 
M
G
 
G
S
 
E
L
 
Y
V
 
L
G
 
G
Q
 
Y
M
 
G
L
 
I
A
 
R
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
E
H
 
K
V
 
V
F
 
I
I
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
E
V
 
G
T
 
L
D
 
H
M
 
H
G
 
R
P
 
D
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
T
S
 
K
V
 
I
R
 
D
Q
 
E
S
 
I
V
 
A
Y
 
S
H
 
Q
R
 
N
S
 
F
L
 
F
A
 
S
L
 
G
S
 
A
T
 
G
R
 
F
H
 
E
L
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
Y
 
T
A
 
T
P
 
S
L
 
L
A
 
E
D
 
D
D
 
P
A
 
A
G
 
W
V
 
L
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
V
M
 
I
Q
 
H
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

1z05A Crystal structure of the rok family transcriptional regulator, homolog of e.Coli mlc protein.
29% identity, 88% coverage: 27:389/412 of query aligns to 22:380/396 of 1z05A

query
sites
1z05A
S
 
S
R
 
R
N
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
R
 
E
L
 
S
A
 
E
Y
 
L
S
 
A
K
 
P
S
 
A
K
 
S
A
 
I
N
 
T
A
 
K
M
 
I
V
 
T
A
 
R
A
 
E
L
 
L
L
 
I
D
 
D
E
 
A
G
 
H
L
 
L
L
 
I
D
 
H
E
 
E
V
 
T
G
 
T
L
 
V
Q
 
Q
E
 
E
S
 
A
-
 
I
S
 
S
G
 
R
G
 
G
R
 
R
R
 
P
A
 
A
E
 
V
T
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
T
S
 
N
E
 
N
T
 
L
L
 
G
G
 
W
V
 
Q
V
 
F
I
 
L
G
 
S
A
 
M
D
 
R
L
 
L
G
 
G
A
 
R
T
 
G
S
 
Y
M
 
L
Q
 
T
I
 
I
A
 
A
V
 
L
M
 
H
R
 
E
P
 
L
D
 
G
M
 
G
T
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
I
R
 
D
H
 
T
R
 
K
E
 
-
P
 
-
I
 
I
D
 
D
V
 
I
R
 
H
Q
 
E
-
 
I
G
 
D
P
 
Q
G
 
D
V
 
D
I
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
L
R
 
L
G
 
F
L
 
E
M
 
I
R
 
E
E
 
E
L
 
F
L
 
F
A
 
Q
R
 
T
C
 
Y
G
 
A
L
 
A
A
 
Q
P
 
L
N
 
D
Q
 
R
V
 
V
I
 
T
A
 
S
I
 
I
G
 
A
M
 
I
G
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
S
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
V
 
L
N
 
Q
P
 
-
P
 
-
L
 
-
M
 
M
P
 
P
D
 
H
W
 
Y
D
 
N
-
 
V
-
 
K
G
 
N
F
 
L
S
 
A
I
 
L
R
 
G
D
 
P
Y
 
E
L
 
I
R
 
Y
E
 
K
A
 
A
F
 
T
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
F
V
 
V
D
 
A
N
 
N
D
 
D
V
 
T
N
 
R
L
 
A
M
 
W
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
-
 
K
M
 
L
Y
 
F
R
 
G
L
 
H
Q
 
S
R
 
Q
N
 
D
L
 
V
P
 
D
N
 
N
F
 
S
L
 
V
V
 
L
I
 
I
K
 
S
V
 
I
G
 
H
T
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
G
C
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
V
C
 
L
H
 
D
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
Y
 
L
R
 
Q
G
 
G
A
 
R
N
 
H
G
 
G
S
 
N
A
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
I
C
 
Q
V
 
I
D
 
D
Q
 
P
H
 
Q
G
 
G
P
 
K
R
 
R
C
|
C
H
 
H
C
|
C
G
 
G
N
 
N
Q
 
Y
G
 
G
C
|
C
V
 
L
E
 
E
A
 
T
M
 
V
A
 
A
A
 
S
A
 
S
P
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
R
R
 
D
M
 
Q
A
 
V
T
 
T
E
 
A
A
 
R
A
 
I
Q
 
Q
R
 
A
G
 
G
E
 
E
S
 
P
A
 
S
L
 
C
L
 
L
A
 
A
E
 
-
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
T
T
 
V
G
 
E
A
 
E
L
 
I
T
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
C
Q
 
A
A
 
A
S
 
A
R
 
A
T
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
P
A
 
L
A
 
A
N
 
V
A
 
D
I
 
V
I
 
I
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
Y
V
 
L
G
 
G
Q
 
A
M
 
A
L
 
I
A
 
A
S
 
I
I
 
V
V
 
I
N
 
N
F
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
E
H
 
K
V
 
I
F
 
L
I
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
V
V
 
I
T
 
N
D
 
Q
M
 
A
G
 
K
P
 
S
L
 
I
F
 
L
L
 
Y
A
 
P
S
 
S
V
 
I
R
 
E
Q
 
Q
S
 
C
V
 
I
Y
 
R
H
 
E
R
 
Q
S
 
S
L
 
L
A
 
P
L
 
V
S
 
Y
T
 
H
R
 
Q
H
 
D
L
 
L
E
 
K
I
 
L
Q
 
V
Y
 
E
A
 
S
P
 
R
L
 
F
A
 
Y
D
 
K
D
 
Q
A
 
A
G
 
T
V
 
M
V
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
L
L
 
I

2qm1B Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
30% identity, 76% coverage: 81:394/412 of query aligns to 8:323/325 of 2qm1B

query
sites
2qm1B
V
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
I
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
T
S
 
T
M
 
I
Q
 
K
I
 
F
A
 
A
V
 
I
M
 
L
R
 
T
P
 
T
D
 
D
M
 
G
T
 
V
V
 
V
L
 
Q
A
 
Q
R
 
K
H
 
W
R
 
S
E
 
I
P
 
E
I
 
T
D
 
N
V
 
I
R
 
L
Q
 
E
G
 
D
P
 
G
G
 
K
V
 
H
I
 
I
L
 
V
A
 
P
R
 
S
V
 
I
R
 
I
G
 
E
L
 
S
M
 
I
R
 
R
E
 
H
L
 
R
L
 
I
A
 
D
R
 
L
C
 
Y
G
 
N
L
 
M
A
 
K
P
 
K
N
 
E
Q
 
D
V
 
F
I
 
V
A
 
G
I
 
I
G
 
G
M
 
M
G
 
G
V
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
S
V
 
V
D
 
D
F
 
I
E
 
E
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
V
 
V
N
 
G
P
 
A
P
 
Y
L
 
N
M
 
L
P
 
-
D
 
N
W
 
W
D
 
T
G
 
T
F
 
V
S
 
Q
-
 
P
I
 
V
R
 
K
D
 
E
Y
 
Q
L
 
I
R
 
E
E
 
S
A
 
A
F
 
L
A
 
G
A
 
I
P
 
P
V
 
F
F
 
A
V
 
L
D
 
D
N
|
N
D
 
D
V
 
A
N
|
N
L
 
V
M
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
R
Y
 
W
R
 
K
-
 
G
L
 
A
Q
 
G
R
 
E
N
 
N
L
 
N
P
 
P
N
 
D
F
 
V
L
 
I
V
 
F
I
 
I
K
 
T
V
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
C
x
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
C
 
A
H
 
A
G
 
G
Q
 
K
V
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
G
A
 
V
N
 
A
G
 
G
S
 
C
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
V
G
 
G
H
|
H
I
 
V
C
 
T
V
 
V
D
 
D
Q
 
P
H
 
N
G
 
G
P
 
F
R
 
D
C
|
C
H
 
T
C
|
C
G
 
G
N
 
K
Q
 
R
G
 
G
C
|
C
V
 
L
E
 
E
A
 
T
M
 
V
A
 
S
A
 
S
A
 
A
P
 
T
A
 
G
M
 
V
A
 
V
R
 
R
M
 
V
A
 
A
T
 
R
E
 
H
A
 
L
A
 
S
Q
 
E
R
 
E
-
 
F
-
 
A
G
 
G
E
 
D
S
 
S
A
 
E
L
 
-
L
 
L
A
 
K
E
 
Q
R
 
A
L
 
I
Q
 
D
S
 
D
T
 
G
G
 
Q
A
 
D
L
 
V
T
 
S
I
 
S
E
 
K
D
 
D
V
 
V
A
 
F
Q
 
E
A
 
F
S
 
A
R
 
E
T
 
K
G
 
G
D
 
D
V
 
H
A
 
F
A
 
A
N
 
L
A
 
M
I
 
V
I
 
V
Q
 
D
R
 
R
A
 
V
G
 
C
S
 
F
L
 
Y
V
 
L
G
 
G
Q
 
L
M
 
A
L
 
T
A
 
G
S
 
N
I
 
L
V
 
G
N
 
N
F
 
T
F
 
L
N
 
N
P
 
P
S
 
D
H
 
S
V
 
V
F
 
V
I
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
G
V
 
V
T
 
S
D
 
A
M
 
A
G
 
G
P
 
E
L
 
F
F
 
L
L
 
R
A
 
S
S
 
R
V
 
V
R
 
E
Q
 
K
S
 
Y
V
 
F
Y
 
Q
H
 
E
R
 
F
S
 
T
L
 
F
A
 
P
L
 
Q
S
 
V
T
 
R
R
 
N
H
 
S
L
 
T
E
 
K
I
 
I
Q
 
K
Y
 
L
A
 
A
P
 
E
L
 
L
A
 
G
D
 
N
D
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
L
Q
 
Q
E
 
F
S
 
S

5f7rA Rok repressor lmo0178 from listeria monocytogenes bound to inducer (see paper)
25% identity, 76% coverage: 79:393/412 of query aligns to 1:304/306 of 5f7rA

query
sites
5f7rA
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
V
G
 
S
A
 
V
D
x
K
L
 
V
G
 
E
A
x
E
T
 
E
S
 
Q
M
 
L
Q
 
L
I
 
F
A
 
A
V
 
L
M
 
T
R
 
D
P
 
L
D
 
N
M
 
A
T
 
E
V
 
I
L
 
I
A
 
E
R
 
N
H
 
T
R
 
S
E
 
I
P
 
P
I
 
F
D
 
S
V
 
S
R
 
E
Q
 
K
G
 
K
P
 
P
G
 
E
V
 
E
I
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
L
V
 
I
R
 
A
G
 
K
L
 
N
M
 
V
R
 
K
E
 
K
L
 
M
L
 
-
A
 
-
R
 
-
C
 
C
G
 
G
L
 
N
A
 
R
P
 
D
-
 
M
N
 
N
Q
 
H
V
 
L
I
 
L
A
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
I
G
 
A
V
 
I
P
 
S
G
|
G
P
 
L
V
 
V
D
 
N
F
 
R
E
 
K
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
L
 
V
V
 
I
N
 
R
P
 
S
P
 
T
L
 
M
M
 
L
P
 
-
D
 
G
W
 
W
D
 
E
G
 
N
F
 
V
S
 
A
I
 
L
R
 
E
D
 
A
Y
 
M
L
 
L
R
 
H
E
 
A
A
 
H
F
 
F
A
 
P
-
 
D
A
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
V
 
V
D
 
D
N
 
K
D
x
N
V
 
I
N
 
N
L
 
C
M
 
Y
A
 
T
L
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
L
Y
 
W
R
 
L
L
 
G
Q
 
E
-
 
G
R
 
K
N
 
Q
L
 
S
P
 
N
N
 
N
F
 
F
L
 
A
V
 
T
I
 
V
K
x
S
V
|
V
G
 
G
T
 
A
G
|
G
I
x
L
G
|
G
C
 
L
G
 
S
I
 
V
V
 
V
C
 
I
H
 
N
G
 
R
Q
 
Q
V
 
I
Y
 
Y
R
 
Y
G
 
G
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
S
 
G
A
 
A
G
 
G
D
x
E
V
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
T
C
 
T
V
 
I
D
 
Q
Q
 
P
H
 
G
G
 
G
P
 
Y
R
 
K
C
|
C
H
 
H
C
|
C
G
 
G
N
 
Q
Q
 
K
G
 
G
C
|
C
V
 
L
E
|
E
A
 
-
M
 
M
A
 
Y
A
 
A
A
 
S
P
 
E
A
 
F
M
 
Y
A
 
F
R
 
R
M
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
S
 
E
A
 
L
L
 
K
L
 
E
A
 
A
E
 
Y
R
 
P
L
 
L
Q
 
N
S
 
D
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
F
T
 
H
I
 
F
E
 
D
D
 
K
V
 
V
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
S
 
A
R
 
R
T
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
E
A
 
M
A
 
A
N
 
T
A
 
E
I
 
L
I
 
M
Q
 
G
R
 
K
A
 
M
G
 
G
S
 
E
L
 
Y
V
 
L
G
 
G
Q
 
Y
M
 
G
L
 
I
A
 
R
S
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
F
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
E
H
 
K
V
 
V
F
 
I
I
 
I
A
 
V
G
 
G
R
x
E
V
 
G
T
 
L
D
 
H
M
 
H
G
 
R
P
 
D
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
T
S
 
K
V
 
I
R
 
D
Q
 
E
S
 
I
V
 
A
Y
 
S
H
 
Q
R
 
N
S
 
F
L
 
F
A
 
S
L
 
G
S
 
A
T
 
G
R
 
F
H
 
E
L
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
T
Y
 
T
A
 
T
P
 
S
L
 
L
A
 
E
D
 
D
D
 
P
A
 
A
G
x
W
V
 
L
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
V
M
 
I
Q
 
H
E
 
Q

1z6rA Crystal structure of mlc from escherichia coli (see paper)
23% identity, 66% coverage: 119:389/412 of query aligns to 100:366/382 of 1z6rA

query
sites
1z6rA
I
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
I
R
 
I
G
 
S
L
 
H
M
 
I
R
 
D
E
 
Q
L
 
F
L
 
F
A
 
I
R
 
R
C
 
H
G
 
Q
L
 
K
A
 
K
P
 
L
N
 
E
Q
 
R
V
 
L
I
 
T
A
 
S
I
 
I
G
 
A
M
 
I
G
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
I
V
 
I
D
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
N
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
V
 
H
N
 
R
P
 
M
P
 
P
L
 
F
M
 
Y
P
 
E
D
 
D
W
 
V
D
 
K
G
 
E
F
 
M
S
 
P
I
 
L
R
 
G
D
 
E
Y
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
A
 
H
F
 
T
A
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
V
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
V
 
I
N
 
S
L
 
A
M
 
W
A
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E
-
 
A
M
 
L
Y
 
F
R
 
G
L
 
A
Q
 
S
R
 
R
N
 
G
L
 
A
P
 
R
N
 
D
F
 
V
L
 
I
V
 
Q
I
 
V
K
 
V
V
 
I
G
 
D
T
 
H
G
 
N
I
 
V
G
 
G
C
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
C
 
T
H
 
D
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
N
 
S
G
 
S
S
 
S
A
 
L
G
 
V
D
 
E
V
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
C
 
Q
V
 
V
D
 
D
Q
 
P
H
 
Y
G
 
G
P
 
K
R
 
R
C
|
C
H
 
Y
C
|
C
G
 
G
N
 
N
Q
 
H
G
 
G
C
|
C
V
 
L
E
 
E
A
 
T
M
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
V
P
 
D
A
 
S
M
 
I
A
 
L
R
 
E
M
 
L
A
 
A
T
 
Q
E
 
L
A
 
R
A
 
L
Q
 
N
R
 
Q
G
 
S
E
 
M
S
 
S
A
 
S
L
 
M
L
 
L
A
 
H
E
 
G
R
 
Q
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
D
D
 
S
V
 
L
A
 
C
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
R
 
L
T
 
R
G
 
G
D
 
D
V
 
L
A
 
L
A
 
A
N
 
K
A
 
D
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
R
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
H
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
M
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
I
I
 
M
V
 
V
N
 
N
F
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
Q
H
 
K
V
 
I
F
 
L
I
 
I
A
 
G
G
 
S
R
 
P
V
 
L
T
 
S
D
 
K
M
 
A
G
 
A
P
 
D
L
 
I
F
 
L
L
 
F
A
 
P
S
 
V
V
 
I
R
 
S
Q
 
D
S
 
S
V
 
I
Y
 
R
H
 
Q
R
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
P
L
 
A
S
 
Y
T
 
S
R
 
Q
H
 
H
L
 
I
E
 
S
I
 
V
Q
 
E
Y
 
S
A
 
T
P
 
Q
L
 
F
A
 
S
D
 
N
D
 
Q
A
 
G
G
 
T
V
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
L
L
 
V

P50456 DNA-binding transcriptional repressor Mlc; Making large colonies protein; Membrane linked control from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
23% identity, 66% coverage: 119:389/412 of query aligns to 124:390/406 of P50456

query
sites
P50456
I
 
L
L
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
I
R
 
I
G
 
S
L
 
H
M
 
I
R
 
D
E
 
Q
L
 
F
L
x
F
A
 
I
R
 
R
C
 
H
G
 
Q
L
 
K
A
 
K
P
 
L
N
 
E
Q
 
R
V
 
L
I
 
T
A
 
S
I
 
I
G
 
A
M
 
I
G
 
T
V
 
L
P
 
P
G
 
G
P
 
I
V
 
I
D
 
D
F
 
T
E
 
E
S
 
N
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
V
 
H
N
 
R
P
 
M
P
 
P
L
 
F
M
 
Y
P
 
E
D
 
D
W
 
V
D
 
K
G
 
E
F
 
M
S
 
P
I
 
L
R
 
G
D
 
E
Y
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
Q
A
 
H
F
 
T
A
 
G
A
 
V
P
 
P
V
 
V
F
 
Y
V
 
I
D
 
Q
N
 
H
D
 
D
V
 
I
N
 
S
L
 
A
M
 
W
A
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E
-
 
A
M
 
L
Y
 
F
R
 
G
L
 
A
Q
 
S
R
 
R
N
 
G
L
 
A
P
 
R
N
 
D
F
 
V
L
 
I
V
 
Q
I
 
V
K
 
V
V
 
I
G
 
D
T
 
H
G
 
N
I
 
V
G
 
G
C
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
C
 
T
H
 
D
G
 
G
Q
 
H
V
 
L
Y
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
G
N
 
S
G
 
S
S
 
S
A
 
L
G
 
V
D
 
E
V
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
C
 
Q
V
 
V
D
 
D
Q
 
P
H
 
Y
G
 
G
P
 
K
R
 
R
C
|
C
H
 
Y
C
|
C
G
 
G
N
 
N
Q
 
H
G
 
G
C
|
C
V
 
L
E
 
E
A
 
T
M
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
V
P
 
D
A
 
S
M
 
I
A
 
L
R
 
E
M
 
L
A
 
A
T
 
Q
E
 
L
A
 
R
A
 
L
Q
 
N
R
 
Q
G
 
S
E
 
M
S
 
S
A
 
S
L
 
M
L
 
L
A
 
H
E
 
G
R
 
Q
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
D
D
 
S
V
 
L
A
 
C
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
R
 
L
T
x
R
G
 
G
D
 
D
V
 
L
A
x
L
A
 
A
N
 
K
A
 
D
I
 
I
I
 
I
Q
 
T
R
 
G
A
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
H
V
 
V
G
 
G
Q
 
R
M
 
I
L
 
L
A
 
A
S
 
I
I
 
M
V
 
V
N
 
N
F
 
L
F
 
F
N
 
N
P
 
P
S
 
Q
H
 
K
V
 
I
F
 
L
I
 
I
A
 
G
G
 
S
R
 
P
V
 
L
T
 
S
D
 
K
M
 
A
G
 
A
P
 
D
L
 
I
F
 
L
L
 
F
A
 
P
S
 
V
V
 
I
R
 
S
Q
 
D
S
 
S
V
 
I
Y
 
R
H
 
Q
R
 
Q
S
 
A
L
 
L
A
 
P
L
 
A
S
 
Y
T
 
S
R
 
Q
H
 
H
L
 
I
E
 
S
I
 
V
Q
 
E
Y
 
S
A
 
T
P
 
Q
L
 
F
A
 
S
D
 
N
D
 
Q
A
 
G
G
 
T
V
 
M
V
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

2yi1A Crystal structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetyl mannosamine 6-phosphate and adp. (see paper)
29% identity, 63% coverage: 82:341/412 of query aligns to 6:260/308 of 2yi1A

query
sites
2yi1A
I
 
L
G
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
L
G
|
G
A
x
G
T
|
T
S
x
N
M
 
L
Q
x
R
I
 
V
A
 
A
V
 
I
M
 
V
R
 
S
P
 
M
D
 
K
M
 
G
T
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
K
R
 
K
H
 
Y
R
 
T
E
 
Q
-
 
F
-
 
N
P
 
P
I
 
K
D
 
T
V
 
Y
R
 
E
Q
 
E
G
 
R
P
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
Q
R
 
M
-
 
C
V
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
A
M
 
A
R
 
E
E
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
L
R
 
N
C
 
C
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
Q
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
I
G
 
S
V
 
T
P
x
G
G
|
G
P
x
R
V
 
V
D
 
N
F
 
P
E
 
R
S
 
E
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
V
 
L
N
 
H
P
x
S
-
x
T
P
 
K
L
|
L
M
 
I
P
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
N
G
 
S
F
 
V
S
 
D
I
 
L
R
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
R
 
S
E
 
D
A
 
T
F
 
L
A
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
V
 
V
D
 
D
N
|
N
D
|
D
V
 
G
N
|
N
L
 
C
M
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
R
Y
 
K
R
 
F
L
 
G
Q
 
Q
-
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
T
I
 
L
K
 
I
V
 
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
|
I
G
 
G
C
x
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
H
H
 
Q
G
 
H
Q
 
E
V
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
N
 
S
G
 
F
S
 
C
A
 
A
G
x
A
D
x
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
C
 
V
V
 
V
D
 
S
Q
 
L
H
 
D
G
 
G
P
 
P
R
 
D
C
|
C
H
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
Q
 
H
G
 
G
C
|
C
V
 
I
E
|
E
A
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
x
G
P
 
M
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
R
 
R
M
 
E
A
 
A
T
 
K
E
 
K
A
 
L
A
 
-
Q
 
-
R
 
H
G
 
D
E
 
E
S
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
G
L
 
M
Q
 
S
S
 
A
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
|
L
T
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
H
V
 
L
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
L
G
 
G
D
 
N
V
 
A
A
 
K
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
I
I
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
A
V
 
L
G
 
G
Q
 
L
M
 
G
L
 
V
A
 
V
S
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
F
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
S
H
 
L
V
 
V
F
 
I
I
 
L
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2yhyA Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp (see paper)
29% identity, 63% coverage: 82:341/412 of query aligns to 6:260/308 of 2yhyA

query
sites
2yhyA
I
 
L
G
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
L
G
|
G
A
x
G
T
|
T
S
x
N
M
 
L
Q
x
R
I
 
V
A
 
A
V
 
I
M
 
V
R
 
S
P
 
M
D
 
K
M
 
G
T
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
K
R
 
K
H
 
Y
R
 
T
E
 
Q
-
 
F
-
 
N
P
 
P
I
 
K
D
 
T
V
 
Y
R
 
E
Q
 
E
G
 
R
P
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
Q
R
 
M
-
 
C
V
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
A
M
 
A
R
 
E
E
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
L
R
 
N
C
 
C
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
Q
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
I
G
 
S
V
 
T
P
 
G
G
 
G
P
 
R
V
 
V
D
 
N
F
 
P
E
 
R
S
 
E
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
V
 
L
N
 
H
P
 
S
-
 
T
P
 
K
L
 
L
M
 
I
P
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
N
G
 
S
F
 
V
S
 
D
I
 
L
R
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
R
 
S
E
 
D
A
 
T
F
 
L
A
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
V
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
V
 
G
N
|
N
L
 
C
M
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
R
Y
 
K
R
 
F
L
 
G
Q
 
Q
-
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
T
I
 
L
K
 
I
V
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
C
x
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
H
H
 
Q
G
 
H
Q
 
E
V
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
N
 
S
G
 
F
S
 
C
A
 
A
G
x
A
D
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
C
 
V
V
 
V
D
 
S
Q
 
L
H
 
D
G
 
G
P
 
P
R
 
D
C
|
C
H
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
Q
 
H
G
 
G
C
|
C
V
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
x
G
P
 
M
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
R
 
R
M
 
E
A
 
A
T
 
K
E
 
K
A
 
L
A
 
-
Q
 
-
R
 
H
G
 
D
E
 
E
S
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
G
L
 
M
Q
 
S
S
 
A
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
|
L
T
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
H
V
 
L
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
L
G
 
G
D
 
N
V
 
A
A
 
K
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
I
I
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
A
V
 
L
G
 
G
Q
 
L
M
 
G
L
 
V
A
 
V
S
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
F
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
S
H
 
L
V
 
V
F
 
I
I
 
L
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vovB Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus (see paper)
35% identity, 61% coverage: 143:393/412 of query aligns to 60:294/298 of 3vovB

query
sites
3vovB
A
 
A
I
 
I
G
 
G
M
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
P
V
 
L
D
 
D
F
 
F
E
 
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
-
L
 
-
V
 
V
N
 
I
P
 
R
P
 
P
L
 
N
M
 
I
P
 
P
D
 
G
W
 
V
D
 
Q
G
 
D
F
 
F
S
 
P
I
 
I
R
 
R
D
 
R
Y
 
I
L
 
L
R
 
E
E
 
E
A
 
A
F
 
T
A
 
G
A
 
R
P
 
P
V
 
V
F
 
F
V
 
L
D
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
L
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
H
Y
 
H
R
 
L
-
 
G
L
 
A
Q
 
A
R
 
Q
N
 
G
L
 
E
P
 
E
N
 
S
F
 
S
L
 
L
V
 
Y
I
 
L
K
 
T
V
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
C
 
G
G
 
G
I
 
V
V
 
V
C
 
L
H
 
G
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
Y
 
L
R
 
R
G
 
G
A
 
E
N
 
R
G
 
G
S
 
Q
A
 
G
G
 
G
D
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
C
 
T
V
 
L
D
 
L
Q
 
P
H
 
G
G
 
G
P
 
P
R
 
A
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
N
 
L
Q
 
E
G
 
G
C
|
C
V
 
L
E
 
E
A
 
A
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
E
R
 
R
M
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
Y
A
 
A
A
 
F
Q
 
Q
R
 
R
G
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
Q
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
P
L
 
V
T
 
D
I
 
T
E
 
R
D
 
E
V
 
L
A
 
F
Q
 
R
A
 
L
S
 
F
R
 
Q
T
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
P
A
 
K
A
 
A
N
 
E
A
 
R
I
 
L
I
 
V
Q
 
L
R
 
Q
A
 
A
G
 
A
S
 
R
L
 
Y
V
 
V
G
 
G
Q
 
I
M
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
S
I
 
L
V
 
V
N
 
K
F
 
A
F
 
F
N
 
D
P
 
P
S
 
G
H
 
V
V
 
V
F
 
V
I
 
L
A
 
G
G
 
G
R
 
G
V
 
V
T
 
A
D
 
L
M
 
N
G
 
A
P
 
P
L
 
E
F
 
G
L
 
Y
A
 
W
S
 
E
V
 
A
R
 
L
Q
 
L
S
 
E
V
 
A
Y
 
Y
H
 
R
R
 
R
S
 
Y
L
 
L
A
 
Q
L
 
-
S
 
G
T
 
W
R
 
E
H
 
A
L
 
P
E
 
P
I
 
L
Q
 
R
Y
 
R
A
 
A
P
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
A
D
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
L
L
 
T
A
 
A
M
 
Y
Q
 
L
E
 
E

2yhwA High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling. (see paper)
29% identity, 63% coverage: 82:341/412 of query aligns to 6:261/309 of 2yhwA

query
sites
2yhwA
I
 
L
G
 
A
A
 
V
D
 
D
L
 
L
G
 
G
A
 
G
T
 
T
S
 
N
M
 
L
Q
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
I
M
 
V
R
 
S
P
 
M
D
 
K
M
 
G
T
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
K
R
 
K
H
 
Y
R
 
T
E
 
Q
-
 
F
-
 
N
P
 
P
I
 
K
D
 
T
V
 
Y
R
 
E
Q
 
E
G
 
R
P
 
I
G
 
N
V
 
L
I
 
I
L
 
L
A
 
Q
R
 
M
-
 
C
V
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
A
M
 
A
R
 
E
E
 
A
L
 
V
L
 
K
A
 
L
R
 
N
C
 
C
G
 
-
L
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
Q
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
G
I
 
V
G
 
G
M
 
I
G
 
S
V
 
T
P
 
G
G
 
G
P
 
R
V
 
V
D
 
N
F
 
P
E
 
R
S
 
E
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
V
 
L
N
 
H
P
 
S
-
 
T
P
 
K
L
 
L
M
 
I
P
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
N
G
 
S
F
 
V
S
 
D
I
 
L
R
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
R
 
S
E
 
D
A
 
T
F
 
L
A
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
V
 
V
D
 
D
N
|
N
D
 
D
V
 
G
N
|
N
L
 
C
M
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
R
Y
 
K
R
 
F
L
 
G
Q
 
Q
-
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
T
I
 
L
K
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
C
x
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
H
H
 
Q
G
 
H
Q
 
E
V
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
N
 
S
G
 
F
S
 
C
A
 
A
G
x
A
D
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
C
 
V
V
 
V
D
 
S
Q
 
L
H
 
N
G
 
G
P
 
P
R
 
D
C
|
C
H
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
Q
 
H
G
 
G
C
|
C
V
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
G
P
 
M
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
R
 
R
M
 
E
A
 
A
T
 
K
E
 
K
A
 
L
A
 
-
Q
 
-
R
 
H
G
 
D
E
 
E
S
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
E
R
 
G
L
 
M
Q
 
S
-
 
V
S
 
A
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
H
V
 
L
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
L
G
 
G
D
 
N
V
 
A
A
 
K
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
I
I
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
A
V
 
L
G
 
G
Q
 
L
M
 
G
L
 
V
A
 
V
S
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
F
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
S
H
 
L
V
 
V
F
 
I
I
 
L
A
 
S
G
 
G

3vglA Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus in complex with glucose and amppnp (see paper)
30% identity, 76% coverage: 79:392/412 of query aligns to 1:311/312 of 3vglA

query
sites
3vglA
G
 
G
V
 
L
V
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
I
G
|
G
A
 
G
T
|
T
S
x
K
M
 
I
Q
 
A
I
 
A
A
 
G
V
 
V
M
 
V
R
 
D
P
 
E
D
 
E
M
 
G
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
S
R
 
T
H
 
F
R
 
K
E
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
G
 
P
P
 
P
G
 
-
V
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
T
V
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
I
M
 
V
R
 
D
E
 
A
L
 
I
L
 
C
A
 
A
R
 
A
C
 
V
G
 
A
L
 
G
A
 
A
P
 
S
-
 
E
-
 
G
N
 
H
Q
 
D
V
 
V
I
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
I
G
 
G
V
 
A
P
 
A
G
|
G
P
 
Y
V
 
V
D
 
D
F
 
D
E
 
K
S
 
R
G
 
A
Q
 
T
L
 
V
V
 
L
N
 
F
P
 
A
P
|
P
L
 
N
M
 
I
P
 
-
D
 
D
W
 
W
D
 
R
G
 
H
F
 
E
S
 
P
I
 
L
R
 
K
D
 
D
Y
 
K
L
 
V
R
 
E
E
 
Q
A
 
R
F
 
V
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
V
V
 
V
D
 
E
N
|
N
D
|
D
V
 
A
N
 
N
L
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
W
G
 
G
E
 
E
M
 
-
Y
 
Y
R
 
R
L
 
F
Q
 
G
-
 
A
-
 
G
R
 
Q
N
 
G
L
 
H
P
 
D
N
 
D
F
 
V
L
 
I
V
 
C
I
 
I
K
 
T
V
 
L
G
|
G
T
|
T
G
 
G
I
x
L
G
|
G
C
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
I
H
 
G
G
 
N
Q
 
K
V
 
L
Y
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
N
 
F
G
 
G
S
 
V
A
 
A
G
 
A
D
x
E
V
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
I
C
 
R
V
 
V
D
 
V
Q
 
P
H
 
D
G
 
G
P
 
L
R
 
L
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
C
|
C
V
 
W
E
|
E
A
 
Q
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
x
G
P
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
V
R
 
R
M
 
Y
A
 
A
T
 
K
E
 
Q
A
 
R
A
 
A
Q
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
P
R
 
E
G
 
N
E
 
A
S
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
G
E
 
L
R
 
G
L
 
D
Q
 
G
S
 
S
T
 
V
G
 
D
A
 
G
L
 
I
T
 
E
I
x
G
E
 
K
D
 
H
V
 
I
A
x
S
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
D
 
D
V
 
P
A
 
V
A
 
A
N
 
V
A
 
D
I
 
S
I
 
F
Q
 
R
R
 
E
A
 
L
G
 
A
S
 
R
L
 
W
V
 
A
G
 
G
Q
 
A
M
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
D
I
 
L
V
 
A
N
 
S
F
 
L
F
 
F
N
 
D
P
 
P
S
 
S
H
 
A
V
 
F
F
 
I
I
 
V
A
 
G
G
 
G
R
x
G
V
|
V
T
 
S
D
 
D
M
x
E
G
 
G
P
 
E
L
 
L
F
 
V
L
 
L
A
 
D
S
 
P
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
S
 
S
V
 
F
Y
 
R
H
 
R
R
 
W
S
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
G
S
 
E
T
 
W
R
 
R
-
 
P
H
 
H
L
 
A
E
 
Q
I
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
A
P
 
Q
L
 
L
A
 
G
D
 
G
D
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
R
Q
 
Q

3vgkB Crystal structure of a rok family glucokinase from streptomyces griseus (see paper)
30% identity, 76% coverage: 79:392/412 of query aligns to 1:311/312 of 3vgkB

query
sites
3vgkB
G
 
G
V
 
L
V
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
S
 
K
M
 
I
Q
 
A
I
 
A
A
 
G
V
 
V
M
 
V
R
 
D
P
 
E
D
 
E
M
 
G
T
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
S
R
 
T
H
 
F
R
 
K
E
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
V
R
 
A
Q
 
T
G
 
P
P
 
P
G
 
-
V
 
-
I
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
T
V
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
I
M
 
V
R
 
D
E
 
A
L
 
I
L
 
C
A
 
A
R
 
A
C
 
V
G
 
A
L
 
G
A
 
A
P
 
S
-
 
E
-
 
G
N
 
H
Q
 
D
V
 
V
I
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
M
 
I
G
 
G
V
 
A
P
 
A
G
 
G
P
 
Y
V
 
V
D
 
D
F
 
D
E
 
K
S
 
R
G
 
A
Q
 
T
L
 
V
V
 
L
N
 
F
P
 
A
P
 
P
L
 
N
M
 
I
P
 
-
D
 
D
W
 
W
D
 
R
G
 
H
F
 
E
S
 
P
I
 
L
R
 
K
D
 
D
Y
 
K
L
 
V
R
 
E
E
 
Q
A
 
R
F
 
V
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
V
V
 
V
D
 
E
N
 
N
D
 
D
V
 
A
N
 
N
L
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
W
G
 
G
E
 
E
M
 
-
Y
 
Y
R
 
R
L
 
F
Q
 
G
-
 
A
-
 
G
R
 
Q
N
 
G
L
 
H
P
 
D
N
 
D
F
 
V
L
 
I
V
 
C
I
 
I
K
 
T
V
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
L
G
 
G
C
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
I
H
 
G
G
 
N
Q
 
K
V
 
L
Y
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
R
N
 
F
G
 
G
S
 
V
A
 
A
G
 
A
D
 
E
V
 
F
G
 
G
H
|
H
I
 
I
C
 
R
V
 
V
D
 
V
Q
 
P
H
 
D
G
 
G
P
 
L
R
 
L
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
N
 
S
Q
 
Q
G
 
G
C
|
C
V
 
W
E
 
E
A
 
Q
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
L
A
 
V
R
 
R
M
 
Y
A
 
A
T
 
K
E
 
Q
A
 
R
A
 
A
Q
 
N
-
 
A
-
 
T
-
 
P
R
 
E
G
 
N
E
 
A
S
 
A
A
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
G
E
 
L
R
 
G
L
 
D
Q
 
G
S
 
S
T
 
V
G
 
D
A
 
G
L
 
I
T
 
E
I
 
G
E
 
K
D
 
H
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
R
 
R
T
 
Q
G
 
G
D
 
D
V
 
P
A
 
V
A
 
A
N
 
V
A
 
D
I
 
S
I
 
F
Q
 
R
R
 
E
A
 
L
G
 
A
S
 
R
L
 
W
V
 
A
G
 
G
Q
 
A
M
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
D
I
 
L
V
 
A
N
 
S
F
 
L
F
 
F
N
 
D
P
 
P
S
 
S
H
 
A
V
 
F
F
 
I
I
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
G
V
 
V
T
 
S
D
 
D
M
 
E
G
 
G
P
 
E
L
 
L
F
 
V
L
 
L
A
 
D
S
 
P
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
S
 
S
V
 
F
Y
 
R
H
 
R
R
 
W
S
 
L
L
 
I
A
 
G
L
 
G
S
 
E
T
 
W
R
 
R
-
 
P
H
 
H
L
 
A
E
 
Q
I
 
V
Q
 
L
Y
 
A
A
 
A
P
 
Q
L
 
L
A
 
G
D
 
G
D
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
D
L
 
L
A
 
A
M
 
R
Q
 
Q

Q9Y223 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Homo sapiens (Human) (see 18 papers)
29% identity, 65% coverage: 76:341/412 of query aligns to 405:669/722 of Q9Y223

query
sites
Q9Y223
E
 
E
T
 
T
L
 
L
G
 
S
V
 
A
V
 
-
I
 
L
G
 
A
A
 
V
D
|
D
L
 
L
G
 
G
A
x
G
T
|
T
S
x
N
M
 
L
Q
x
R
I
 
V
A
 
A
V
 
I
M
 
V
R
 
S
P
 
M
D
 
K
M
 
G
T
 
E
V
 
I
L
 
V
A
 
K
R
 
K
H
 
Y
R
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
T
R
 
Q
Q
 
F
G
 
N
P
 
P
G
 
K
V
 
T
I
 
Y
L
 
E
A
 
E
R
 
R
V
 
I
R
 
N
G
 
L
L
 
I
M
 
L
R
 
Q
-
 
M
-
 
C
-
 
V
E
 
E
L
 
A
L
 
A
A
 
A
R
 
E
C
 
A
G
 
V
L
 
K
A
 
L
P
 
N
N
 
C
Q
 
R
V
 
I
I
 
L
A
 
G
I
 
V
G
 
G
M
x
I
G
 
S
V
 
T
P
 
G
G
|
G
P
x
R
V
 
V
D
 
N
F
 
P
E
 
R
S
 
E
G
 
G
Q
 
I
L
 
V
V
 
L
N
 
H
P
 
S
-
x
T
P
 
K
L
 
L
M
 
I
P
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
N
G
 
S
F
 
V
S
 
D
I
 
L
R
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
R
 
S
E
 
D
A
 
T
F
 
L
A
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
V
 
V
D
 
D
N
|
N
D
|
D
V
 
G
N
|
N
L
 
C
M
 
A
A
 
A
L
 
L
G
x
A
E
 
E
M
 
R
Y
 
K
R
x
F
L
 
G
Q
 
Q
-
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
T
I
 
L
K
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
T
G
|
G
I
 
I
G
 
G
C
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
H
H
 
Q
G
 
H
Q
 
E
V
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
N
 
S
G
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
A
D
x
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
C
 
V
V
|
V
D
 
S
Q
 
L
H
 
D
G
|
G
P
 
P
R
 
D
C
|
C
H
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
Q
 
H
G
 
G
C
|
C
V
x
I
E
|
E
A
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
G
P
 
M
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
R
 
R
M
 
E
A
 
A
T
 
K
E
 
K
A
 
L
A
 
-
Q
 
-
R
 
H
G
 
D
E
 
E
S
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
S
-
 
V
-
 
P
R
 
K
L
 
D
Q
 
E
S
 
A
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
H
I
 
L
E
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
I
Q
 
Q
A
|
A
S
x
A
R
 
K
T
 
L
G
 
G
D
 
N
V
 
A
A
 
K
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
I
I
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
A
V
 
L
G
 
G
Q
 
L
M
 
G
L
 
V
A
 
V
S
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
F
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
S
H
 
L
V
 
V
F
 
I
I
 
L
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

O35826 Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase; UDP-GlcNAc-2-epimerase/ManAc kinase; EC 3.2.1.183; EC 2.7.1.60 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
29% identity, 65% coverage: 76:341/412 of query aligns to 405:669/722 of O35826

query
sites
O35826
E
 
E
T
|
T
L
|
L
G
x
S
V
x
A
V
 
-
I
x
L
G
x
A
A
x
V
D
|
D
L
|
L
G
|
G
A
x
G
T
|
T
S
x
N
M
x
L
Q
x
R
I
x
V
A
|
A
V
x
I
M
x
V
R
x
S
P
x
M
D
x
K
M
x
G
T
x
E
V
x
I
L
x
V
A
x
K
R
x
K
H
x
Y
R
 
-
E
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
V
x
T
R
x
Q
Q
x
F
G
x
N
P
|
P
G
x
K
V
x
T
I
x
Y
L
x
E
A
x
E
R
|
R
V
x
I
R
x
S
G
x
L
L
x
I
M
x
L
R
x
Q
-
x
M
-
x
C
-
x
V
E
|
E
L
x
A
L
x
A
A
|
A
R
x
E
C
x
A
G
x
V
L
x
K
A
x
L
P
x
N
N
x
C
Q
x
R
V
x
I
I
x
L
A
x
G
I
x
V
G
|
G
M
x
I
G
x
S
V
x
T
P
x
G
G
|
G
P
x
R
V
|
V
D
x
N
F
x
P
E
x
Q
S
x
E
G
|
G
Q
x
V
L
x
V
V
x
L
N
x
H
P
x
S
-
x
T
P
x
K
L
|
L
M
x
I
P
x
Q
D
x
E
W
|
W
D
x
N
G
x
S
F
x
V
S
x
D
I
x
L
R
|
R
D
x
T
Y
x
P
L
|
L
R
x
S
E
x
D
A
x
T
F
x
L
A
x
H
A
x
L
P
|
P
V
|
V
F
x
W
V
|
V
D
|
D
N
|
N
D
|
D
V
x
G
N
|
N
L
x
C
M
x
A
A
|
A
L
x
M
G
x
A
E
|
E
M
x
R
Y
x
K
R
x
F
L
x
G
Q
|
Q
-
x
G
R
x
K
N
x
G
L
x
Q
P
x
E
N
|
N
F
|
F
L
x
V
V
x
T
I
x
L
K
x
I
V
x
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
I
|
I
G
|
G
C
x
G
G
|
G
I
|
I
V
x
I
C
x
H
H
x
Q
G
x
H
Q
x
E
V
x
L
Y
x
I
R
x
H
G
|
G
A
x
S
N
x
S
G
x
F
S
x
C
A
|
A
G
x
A
D
x
E
V
x
L
G
|
G
H
|
H
I
x
L
C
x
V
V
|
V
D
x
S
Q
x
L
H
x
D
G
|
G
P
|
P
R
x
D
C
|
C
H
x
S
C
|
C
G
|
G
N
x
S
Q
x
H
G
|
G
C
|
C
V
x
I
E
|
E
A
|
A
M
x
Y
A
|
A
A
x
S
A
x
G
P
x
M
A
|
A
M
x
L
A
x
Q
R
|
R
M
x
E
A
|
A
T
x
K
E
x
K
A
x
L
A
 
-
Q
 
-
R
x
H
G
x
D
E
|
E
S
x
D
A
x
L
L
|
L
L
|
L
A
x
V
E
|
E
-
x
G
-
x
M
-
x
S
-
x
V
-
x
P
R
x
K
L
x
D
Q
x
E
S
x
A
T
x
V
G
|
G
A
|
A
L
|
L
T
x
H
I
x
L
E
 
-
D
 
-
V
 
-
A
x
I
Q
|
Q
A
|
A
S
x
A
R
x
K
T
x
L
G
|
G
D
x
N
V
|
V
A
x
K
A
|
A
N
x
Q
A
x
S
I
|
I
I
x
L
Q
x
R
R
x
T
A
|
A
G
|
G
S
x
T
L
x
A
V
x
L
G
|
G
Q
x
L
M
x
G
L
x
V
A
x
V
S
x
N
I
|
I
V
x
L
N
x
H
F
x
T
F
x
M
N
|
N
P
|
P
S
|
S
H
x
L
V
|
V
F
x
I
I
x
L
A
x
S
G
|
G

Sites not aligning to the query:

Q93LQ8 Beta-glucoside kinase; EC 2.7.1.85 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
27% identity, 73% coverage: 85:386/412 of query aligns to 7:281/297 of Q93LQ8

query
sites
Q93LQ8
D
|
D
L
 
I
G
|
G
A
 
G
T
 
T
S
 
A
M
 
L
Q
 
K
I
 
M
A
 
G
V
 
V
M
 
M
R
 
A
P
 
R
D
 
D
M
 
G
T
 
R
V
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
T
H
 
A
R
 
R
E
 
Q
P
 
S
I
 
I
D
 
N
V
 
D
R
 
S
Q
 
D
G
 
G
P
 
D
G
 
R
V
 
I
I
 
L
L
 
Q
A
 
A
R
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
M
R
 
L
E
 
S
L
 
W
L
 
L
A
 
A
R
 
-
C
 
-
G
 
-
L
 
-
A
 
A
P
 
H
N
 
P
Q
 
S
V
 
C
I
 
E
A
 
G
I
 
I
G
 
A
M
 
I
G
 
S
V
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
Y
V
 
I
D
 
D
F
 
P
E
 
H
S
 
S
G
 
G
Q
 
L
L
 
I
V
 
T
N
 
M
P
 
G
P
 
G
L
 
A
M
 
I
P
 
R
D
 
R
W
 
F
D
 
D
G
 
N
F
 
F
S
 
A
I
 
M
R
 
K
D
 
S
Y
 
W
L
 
L
R
 
E
E
 
T
A
 
R
F
 
T
A
 
G
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
S
V
 
V
D
 
E
N
 
N
D
|
D
V
 
A
N
 
N
L
 
C
M
 
V
A
 
L
L
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
R
Y
 
W
R
 
Q
L
 
G
Q
 
K
R
 
A
-
 
A
N
 
E
L
 
M
P
 
A
N
 
N
F
 
F
L
 
L
V
 
V
I
 
L
K
 
T
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
|
G
I
 
I
G
|
G
C
 
G
G
 
A
I
 
I
V
 
F
C
 
C
H
 
Q
G
 
H
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
I
R
 
N
G
 
G
A
 
A
N
 
R
G
 
F
S
 
R
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
F
G
 
G
H
 
Y
I
 
M
C
 
L
V
 
T
D
 
D
Q
 
R
H
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
R
-
 
D
P
 
P
R
 
R
C
 
R
H
 
Y
C
 
S
G
 
M
N
 
N
Q
 
E
G
 
N
C
 
C
V
 
T
E
 
-
A
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
M
 
L
A
 
R
R
 
V
M
 
L
A
 
R
T
 
H
E
 
R
A
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
R
 
H
G
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
I
A
 
G
E
 
A
R
 
P
L
 
L
Q
 
D
S
 
S
T
 
V
G
 
T
A
 
G
L
 
E
T
 
L
I
 
I
E
 
F
D
 
D
V
 
R
A
 
Y
Q
 
D
A
 
A
S
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
G
D
 
D
V
 
P
A
 
V
A
 
C
N
 
Q
A
 
R
I
 
L
I
 
V
Q
 
A
R
 
E
A
 
F
G
 
F
S
 
N
L
 
G
V
 
L
G
 
G
Q
 
H
M
 
G
L
 
L
A
 
Y
S
 
N
I
 
L
V
 
V
N
 
H
F
 
I
F
 
F
N
 
D
P
 
P
S
 
Q
H
 
T
V
 
I
F
 
F
I
 
I
A
 
G
G
 
G
R
 
G
V
 
V
T
 
V
D
 
E
M
 
R
G
 
-
P
 
P
L
 
G
F
 
F
L
 
L
A
 
T
S
 
L
V
 
L
R
 
R
Q
 
Q
S
 
H
V
 
L
Y
 
A
H
 
W
R
 
F
S
 
G
L
 
I
A
 
A
L
 
D
S
 
Y
T
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
L
Q
 
D
Y
 
T
A
 
V
P
 
S
L
 
H
A
 
G
D
 
N
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A

6jdoA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase with amp-pnp from pasteurella multocida
29% identity, 55% coverage: 160:386/412 of query aligns to 74:282/293 of 6jdoA

query
sites
6jdoA
V
 
L
N
 
N
P
 
P
P
 
K
L
 
N
M
 
L
P
 
G
D
 
G
W
 
L
D
 
A
G
 
E
F
 
F
S
 
P
I
 
L
R
 
K
D
 
E
Y
 
S
L
 
I
R
 
A
E
 
R
A
 
H
F
 
T
A
 
D
A
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
G
V
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
V
 
V
N
 
Q
L
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
C
G
 
A
E
 
E
M
 
Y
Y
 
K
R
 
D
L
 
E
Q
 
D
R
 
K
N
 
N
-
 
A
L
 
V
P
 
Q
N
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
F
I
 
I
K
 
T
V
 
V
G
x
S
T
|
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
C
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
L
H
 
E
G
 
R
Q
 
R
V
 
L
Y
 
L
R
 
T
G
 
E
A
 
P
N
 
N
G
 
G
S
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
H
V
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
C
 
L
V
 
A
D
 
D
Q
 
P
H
 
N
G
 
G
P
 
P
R
 
V
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
N
x
R
Q
 
V
G
 
G
C
 
C
V
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
V
A
 
A
A
 
A
A
x
G
P
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
E
R
 
A
M
 
V
A
 
S
T
 
S
E
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
Q
 
Q
S
 
W
T
 
N
G
 
P
A
 
P
L
 
C
T
 
T
I
x
P
E
 
K
D
 
Q
V
 
A
A
x
F
Q
 
E
A
 
L
S
 
F
R
 
R
T
 
K
G
 
N
D
 
D
V
 
E
A
 
K
A
 
A
N
 
T
A
 
A
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
A
S
 
S
L
 
A
V
 
I
G
 
A
Q
 
N
M
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
D
I
 
L
V
 
V
N
 
I
F
 
G
F
 
L
N
 
D
P
 
V
S
 
Q
H
 
K
V
 
V
F
 
V
I
 
V
A
 
G
G
 
G
R
x
S
V
 
V
T
 
-
D
 
G
M
 
L
G
 
A
P
 
E
L
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
P
S
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
S
 
-
V
 
-
Y
 
Y
H
 
L
R
 
N
S
 
T
L
 
M
A
 
P
L
 
-
S
 
H
T
 
F
R
 
Y
H
 
H
L
 
C
E
 
T
I
 
V
Q
 
E
Y
 
Q
A
 
A
P
 
R
L
 
H
A
 
G
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A

6jdhA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase from pasteurella multocida
29% identity, 55% coverage: 160:386/412 of query aligns to 74:282/293 of 6jdhA

query
sites
6jdhA
V
 
L
N
 
N
P
 
P
P
 
K
L
 
N
M
 
L
P
 
G
D
 
G
W
 
L
D
 
A
G
 
E
F
 
F
S
 
P
I
 
L
R
 
K
D
 
E
Y
 
S
L
 
I
R
 
A
E
 
R
A
 
H
F
 
T
A
 
D
A
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
G
V
 
L
D
 
L
N
 
N
D
 
D
V
 
V
N
 
Q
L
 
A
M
 
A
A
 
A
L
 
C
G
 
A
E
 
E
M
 
Y
Y
 
K
R
 
D
L
 
E
Q
 
D
R
 
K
N
 
N
-
 
A
L
 
V
P
 
Q
N
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
F
I
 
I
K
 
T
V
 
V
G
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
C
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
L
H
 
E
G
 
R
Q
 
R
V
 
L
Y
 
L
R
 
T
G
 
E
A
 
P
N
 
N
G
 
G
S
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
H
V
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
C
 
L
V
 
A
D
 
D
Q
 
P
H
 
N
G
 
G
P
 
P
R
 
V
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
N
 
R
Q
 
V
G
 
G
C
|
C
V
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
E
R
 
A
M
 
V
A
 
S
T
 
S
E
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
Q
 
Q
S
 
W
T
 
N
G
 
P
A
 
P
L
 
C
T
 
T
I
 
P
E
 
K
D
 
Q
V
 
A
A
 
F
Q
 
E
A
 
L
S
 
F
R
 
R
T
 
K
G
 
N
D
 
D
V
 
E
A
 
K
A
 
A
N
 
T
A
 
A
I
 
L
I
 
I
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
A
S
 
S
L
 
A
V
 
I
G
 
A
Q
 
N
M
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
D
I
 
L
V
 
V
N
 
I
F
 
G
F
 
L
N
 
D
P
 
V
S
 
Q
H
 
K
V
 
V
F
 
V
I
 
V
A
 
G
G
 
G
R
 
S
V
 
V
T
 
-
D
 
G
M
 
L
G
 
A
P
 
E
L
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
P
S
 
L
V
 
V
R
 
K
Q
 
Q
S
 
-
V
 
-
Y
 
Y
H
 
L
R
 
N
S
 
T
L
 
M
A
 
P
L
 
-
S
 
H
T
 
F
R
 
Y
H
 
H
L
 
C
E
 
T
I
 
V
Q
 
E
Y
 
Q
A
 
A
P
 
R
L
 
H
A
 
G
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A

3eo3A Crystal structure of the n-acetylmannosamine kinase domain of human gne protein (see paper)
35% identity, 41% coverage: 173:341/412 of query aligns to 71:240/288 of 3eo3A

query
sites
3eo3A
I
 
L
R
 
R
D
 
T
Y
 
P
L
 
L
R
 
S
E
 
D
A
 
T
F
 
L
A
 
H
A
 
L
P
 
P
V
 
V
F
 
W
V
 
V
D
 
D
N
 
N
D
 
D
V
 
G
N
 
N
L
 
C
M
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
E
 
E
M
 
R
Y
 
K
R
 
F
L
 
G
Q
 
Q
-
 
G
R
 
K
N
 
G
L
 
L
P
 
E
N
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
T
I
 
L
K
 
I
V
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
I
G
 
G
C
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
I
C
 
H
H
 
Q
G
 
H
Q
 
E
V
 
L
Y
 
I
R
 
H
G
 
G
A
 
S
N
 
S
G
 
F
S
 
C
A
 
A
G
 
A
D
 
E
V
 
L
G
 
G
H
|
H
I
 
L
C
 
V
V
 
V
D
 
S
Q
 
L
H
 
D
G
 
G
P
 
P
R
 
D
C
|
C
H
 
S
C
|
C
G
 
G
N
 
S
Q
 
H
G
 
G
C
|
C
V
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
G
P
 
M
A
 
A
M
 
L
A
 
Q
R
 
R
M
 
E
A
 
A
T
 
K
E
 
K
A
 
L
A
 
-
Q
 
-
R
 
H
G
 
D
E
 
E
S
 
D
A
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
V
E
 
E
-
 
G
-
 
M
-
 
S
-
 
V
-
 
P
R
 
K
L
 
D
Q
 
E
S
 
A
T
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
T
 
H
I
 
L
E
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
I
Q
 
Q
A
 
A
S
 
A
R
 
K
T
 
L
G
 
G
D
 
N
V
 
A
A
 
K
A
 
A
N
 
Q
A
 
S
I
 
I
I
 
L
Q
 
R
R
 
T
A
 
A
G
 
G
S
 
T
L
 
A
V
 
L
G
 
G
Q
 
L
M
 
G
L
 
V
A
 
V
S
 
N
I
 
I
V
 
L
N
 
H
F
 
T
F
 
M
N
 
N
P
 
P
S
 
S
H
 
L
V
 
V
F
 
I
I
 
L
A
 
S
G
 
G

6jdbA Crystal structure of n-acetyl mannosmaine kinase in complex with mannac-6p and adp from haemophilus influenzae
24% identity, 73% coverage: 85:386/412 of query aligns to 7:281/290 of 6jdbA

query
sites
6jdbA
D
 
D
L
 
I
G
 
G
A
 
G
T
 
T
S
x
K
M
 
I
Q
 
A
I
 
A
A
 
A
V
 
I
M
 
V
R
 
K
P
 
N
D
 
E
M
 
I
T
 
E
V
 
Q
L
 
R
A
 
Q
R
 
Q
H
 
I
R
 
H
E
 
T
P
 
P
I
 
R
D
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
G
V
 
M
R
 
H
Q
 
Q
G
 
A
P
 
L
G
 
G
V
 
K
I
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
V
 
Y
R
 
E
G
 
G
L
 
Q
M
 
F
R
 
D
E
 
Y
L
 
V
-
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
S
C
x
T
G
|
G
L
 
I
A
 
I
P
 
N
N
 
N
Q
 
G
V
 
I
I
 
L
A
 
S
I
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
E
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
x
A
V
x
L
N
|
N
P
 
P
P
 
K
L
x
N
M
 
L
P
 
G
D
 
G
W
 
L
D
 
A
G
 
E
F
 
F
S
 
P
I
 
L
R
 
K
D
 
A
Y
 
S
L
 
I
R
 
A
E
 
K
A
 
H
F
 
T
A
 
D
A
 
K
P
 
P
V
 
I
F
 
G
V
 
L
D
 
L
N
|
N
D
|
D
V
 
A
N
 
Q
L
 
A
M
 
A
A
 
T
L
 
Y
G
 
A
E
 
E
M
 
-
Y
 
Y
R
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
-
 
N
-
 
F
R
 
E
N
 
Q
L
 
V
P
 
S
N
 
N
F
 
F
L
 
V
V
 
F
I
 
I
K
 
T
V
 
V
G
x
S
T
|
T
G
 
G
I
 
V
G
 
G
C
 
G
G
 
G
I
 
I
V
 
V
C
 
L
H
 
N
G
 
Q
Q
 
I
V
 
L
Y
 
Q
R
 
T
G
 
G
A
 
S
N
 
R
G
 
G
S
 
I
A
 
A
G
 
G
D
x
H
V
 
I
G
 
G
H
|
H
I
 
T
C
 
L
V
 
A
D
 
D
Q
 
P
H
 
N
G
 
G
P
 
A
R
 
I
C
|
C
H
 
G
C
|
C
G
 
G
N
 
R
Q
 
R
G
 
G
C
|
C
V
 
V
E
|
E
A
 
A
M
 
I
A
 
A
A
 
S
A
 
G
P
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
E
R
 
A
M
 
V
A
 
S
T
 
S
E
 
Q
A
 
W
A
 
E
Q
 
D
R
 
P
G
 
C
E
 
D
S
x
P
A
x
K
L
 
E
L
 
V
A
 
F
E
 
E
R
 
R
L
 
F
Q
 
-
S
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
-
E
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
S
 
-
R
 
R
T
 
K
G
 
N
D
 
D
V
 
E
A
 
K
A
 
A
N
 
T
A
 
A
I
 
L
I
 
V
Q
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
A
S
 
K
L
 
A
V
 
I
G
 
A
Q
 
N
M
 
L
L
 
I
A
 
A
S
 
D
I
 
L
V
 
V
N
 
I
F
 
S
F
 
L
N
 
D
P
 
I
S
 
Q
H
 
K
V
 
I
F
 
A
I
 
I
A
 
G
G
 
G
R
x
S
V
 
V
T
 
-
D
 
G
M
 
L
G
 
A
P
 
E
L
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
S
S
 
L
V
 
V
R
 
E
Q
 
K
S
 
-
V
 
-
Y
 
Y
H
 
L
R
 
Q
S
 
D
L
 
F
A
 
P
L
 
-
S
 
S
T
 
I
R
 
Y
H
 
C
L
 
C
E
 
E
I
 
I
Q
 
E
Y
 
T
A
 
A
P
 
K
L
 
F
A
 
G
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
A

P32718 D-allose kinase; Allokinase; EC 2.7.1.55 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
25% identity, 79% coverage: 74:397/412 of query aligns to 1:303/309 of P32718

query
sites
P32718
L
 
M
S
 
Q
E
 
K
T
 
Q
L
 
H
G
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
D
L
 
M
G
 
G
A
 
A
T
 
T
S
 
H
M
 
I
Q
 
R
I
 
F
A
 
C
V
 
L
M
 
R
R
 
T
P
 
A
D
 
E
M
 
G
T
 
E
V
 
T
L
 
L
A
 
H
R
 
C
H
 
E
R
 
K
E
 
K
P
 
R
I
 
T
D
 
A
V
 
E
R
 
V
Q
 
I
G
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
V
L
 
S
A
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
E
R
 
M
V
 
I
R
 
D
G
 
E
L
 
Q
M
 
L
R
 
R
E
 
R
L
 
F
L
 
N
A
 
A
R
 
R
C
 
C
G
 
H
L
 
-
A
 
-
P
 
-
N
 
-
Q
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
G
I
 
L
G
 
V
M
 
M
G
 
G
V
 
F
P
 
P
G
x
A
P
 
L
V
 
V
D
 
S
F
 
K
E
 
D
S
 
K
G
 
R
Q
 
T
L
 
I
V
 
I
N
 
S
P
 
T
P
 
P
L
 
N
M
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
T
D
 
A
W
 
A
D
 
D
G
 
L
F
 
Y
S
 
D
I
 
L
R
 
A
D
 
D
Y
 
K
L
 
L
R
 
E
E
 
N
A
 
T
F
 
L
A
 
N
A
 
C
P
 
P
V
 
V
F
 
E
V
 
F
D
 
S
N
 
R
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
M
 
Q
A
 
L
L
 
S
G
 
W
E
 
D
M
 
V
Y
 
V
-
 
E
-
 
N
R
 
R
L
 
L
Q
 
T
R
 
Q
N
 
Q
L
 
L
P
 
-
N
 
-
F
 
V
L
 
L
V
 
A
I
 
A
K
 
Y
V
 
L
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
M
G
 
G
C
x
F
G
 
A
I
 
V
V
 
W
C
 
M
H
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
P
Y
 
W
R
 
T
G
 
G
A
 
A
N
 
H
G
 
G
S
 
V
A
 
A
G
 
G
D
 
E
V
 
L
G
 
G
H
 
H
I
 
I
C
 
P
V
 
L
D
 
G
Q
 
D
H
 
M
G
 
T
P
 
Q
R
 
H
C
 
C
H
 
A
C
 
C
G
 
G
N
 
N
Q
 
P
G
 
G
C
 
C
V
 
L
E
 
E
A
 
T
M
 
N
A
 
C
A
 
S
A
 
G
P
 
M
A
 
A
M
 
L
A
 
R
R
 
R
M
 
W
A
 
Y
T
 
E
E
 
Q
A
 
-
A
 
-
Q
 
Q
R
 
P
G
 
R
E
 
N
S
 
Y
A
 
P
L
 
L
L
 
R
A
 
D
E
 
L
R
 
F
L
 
V
Q
 
H
S
 
A
T
 
E
G
 
N
A
 
A
L
 
P
T
 
F
I
 
V
E
 
Q
D
 
S
V
 
L
A
 
L
Q
 
E
A
 
N
S
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
A
N
 
R
A
 
A
I
 
I
I
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
V
 
-
G
 
-
Q
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
A
S
 
T
I
 
S
V
 
I
N
 
N
F
 
L
F
 
F
N
 
D
P
 
P
S
 
D
H
 
A
V
 
V
F
 
I
I
 
L
A
 
G
G
 
G
R
 
G
V
 
V
T
 
M
D
 
D
M
 
M
G
 
-
P
 
P
L
 
A
F
 
F
L
 
P
A
 
R
S
 
E
V
 
T
R
 
L
Q
 
V
S
 
A
V
 
M
Y
 
T
H
 
Q
R
 
K
S
 
Y
L
 
L
A
 
R
L
 
R
S
 
P
T
 
L
R
 
P
H
 
H
L
 
Q
E
 
V
I
 
V
Q
 
R
Y
 
F
-
 
I
-
 
A
A
 
A
P
 
S
L
 
S
A
 
S
D
 
D
D
 
F
A
 
N
G
 
G
V
 
A
V
 
Q
G
 
G
A
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
L
A
 
A
M
 
H
Q
 
Q
E
 
R
S
 
F
L
 
L
S
 
P
R
 
Q

Query Sequence

>Ac3H11_2882 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_2882
LPSTRWSHCGTEDLSVLQTIFWSAGASRNALAQRLAYSKSKANAMVAALLDEGLLDEVGL
QESSGGRRAETLRLSETLGVVIGADLGATSMQIAVMRPDMTVLARHREPIDVRQGPGVIL
ARVRGLMRELLARCGLAPNQVIAIGMGVPGPVDFESGQLVNPPLMPDWDGFSIRDYLREA
FAAPVFVDNDVNLMALGEMYRLQRNLPNFLVIKVGTGIGCGIVCHGQVYRGANGSAGDVG
HICVDQHGPRCHCGNQGCVEAMAAAPAMARMATEAAQRGESALLAERLQSTGALTIEDVA
QASRTGDVAANAIIQRAGSLVGQMLASIVNFFNPSHVFIAGRVTDMGPLFLASVRQSVYH
RSLALSTRHLEIQYAPLADDAGVVGAGVLAMQESLSRAGSVTGAGVGAGVAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory