SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_2936 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_2936 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
32% identity, 77% coverage: 18:278/337 of query aligns to 6:259/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
I
 
L
A
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
|
D
L
 
L
I
 
I
R
 
-
R
 
-
P
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
-
 
Q
-
 
H
Y
 
Y
L
 
L
P
 
K
C
 
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
L
 
P
Y
 
A
N
|
N
L
 
V
C
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
S
V
 
G
G
 
R
T
 
S
Q
 
A
Y
 
F
L
 
F
T
 
G
P
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
R
 
P
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
-
L
 
F
A
 
M
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
T
V
 
L
A
 
T
D
 
D
G
 
E
V
 
Q
V
 
V
L
 
D
A
 
C
Q
 
Q
P
 
H
-
 
L
-
 
H
-
 
F
E
 
D
P
 
P
V
 
V
Q
 
H
Q
 
R
V
 
-
T
 
T
S
 
S
L
 
T
A
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
E
H
|
H
G
 
G
H
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
|
F
Y
 
M
R
 
V
E
 
K
G
 
P
V
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
A
 
F
V
 
L
S
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
D
 
-
S
 
Q
C
 
L
T
 
S
A
 
D
L
 
I
P
 
P
A
 
S
L
 
F
Q
 
Q
L
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
H
V
 
V
C
 
C
T
 
S
G
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
N
D
 
Q
A
 
P
R
 
S
D
 
R
T
 
S
A
 
S
I
 
T
Y
 
F
L
 
A
P
 
A
W
 
-
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
Q
 
M
R
 
K
A
 
E
A
 
V
G
 
G
C
 
G
C
 
Y
V
 
V
V
 
S
V
 
F
D
 
D
A
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
P
 
E
S
 
E
V
 
V
M
 
W
P
 
S
D
 
E
L
 
P
A
 
Q
A
 
E
Y
 
L
R
 
Q
T
 
A
A
 
T
V
 
V
H
 
M
A
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
G
H
 
L
A
 
A
H
 
D
I
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
H
 
F
L
 
L
A
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
T
D
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
G
Q
 
L
H
 
Q
L
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
D
H
 
F
P
 
-
Q
 
Q
A
 
I
H
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
V
L
 
V
T
|
T
L
 
L
G
|
G
A
|
A
A
 
K
G
 
G
A
 
A
W
 
L
L
 
V
L
 
A
H
 
T
R
 
P
N
 
N
G
 
S
A
 
Q
Q
 
Q
C
 
I
F
 
V
A
 
S
K
 
G
E
 
K
A
|
A
Q
 
-
P
 
-
L
x
V
P
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
|
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
L
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
Y
H
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
31% identity, 91% coverage: 20:327/337 of query aligns to 12:308/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
M
I
 
L
R
 
P
R
 
R
P
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
G
D
 
E
G
 
T
S
 
A
Y
 
F
L
 
Q
P
 
P
C
 
F
L
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
V
Y
 
F
N
 
N
L
 
T
C
 
A
R
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
P
T
 
T
Q
 
G
Y
 
F
L
 
F
T
 
S
P
 
G
L
 
I
S
 
S
R
 
S
D
 
D
R
 
F
F
 
F
G
 
G
R
 
D
E
 
V
L
 
L
A
 
R
A
 
D
Q
 
T
L
 
L
V
 
A
A
 
R
D
 
S
G
 
N
V
 
V
V
 
D
L
 
Y
A
 
S
Q
 
F
P
 
A
E
 
A
P
 
I
V
 
S
Q
 
N
Q
 
R
V
 
P
T
 
T
S
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
F
V
 
V
N
 
R
L
 
L
D
 
-
A
 
V
H
 
D
G
 
G
H
 
Q
P
 
A
D
 
R
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
Y
 
Y
R
 
D
E
 
E
G
 
N
V
 
T
A
 
A
D
 
G
R
 
R
A
 
M
V
 
L
S
 
S
A
 
R
A
 
N
G
 
D
L
 
M
G
 
P
D
 
Y
S
 
V
C
 
D
T
 
E
A
 
T
L
 
I
P
 
S
A
 
A
L
 
M
Q
 
L
L
 
F
V
 
G
C
 
C
T
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
I
A
 
S
L
 
L
D
 
I
A
 
S
R
 
E
D
 
P
T
 
C
A
 
G
I
 
S
Y
 
V
L
 
Y
P
 
E
W
 
T
L
 
L
A
 
L
A
 
A
Q
 
R
R
 
E
A
 
A
A
 
P
G
 
N
C
 
R
C
 
V
V
 
M
V
 
F
V
 
L
D
 
D
A
 
P
N
 
N
L
 
I
R
 
R
P
 
A
S
 
N
V
 
L
M
 
I
P
 
T
D
 
V
L
 
R
A
 
K
A
 
T
Y
 
H
R
 
L
T
 
T
A
 
R
V
 
M
H
 
K
A
 
R
A
 
M
L
 
I
A
 
A
H
 
L
A
 
A
H
 
D
I
 
I
I
 
V
K
 
K
A
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
D
H
 
W
L
 
F
A
 
G
V
 
E
P
 
K
G
 
G
G
 
S
-
 
H
D
 
D
A
 
E
L
 
I
A
 
-
R
 
-
A
 
A
Q
 
A
H
 
E
L
 
W
L
 
L
A
 
K
A
 
L
H
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
-
H
 
-
L
 
L
L
 
V
A
 
V
L
 
I
T
|
T
L
 
K
G
|
G
A
|
A
A
 
H
G
|
G
A
 
A
W
 
-
L
 
V
L
 
A
H
 
Y
R
 
T
N
 
N
G
 
H
A
 
A
Q
 
T
C
 
V
F
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
P
L
 
V
P
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
V
-
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
T
F
x
V
L
 
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
A
H
 
S
L
 
L
L
 
H
R
 
S
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
L
A
 
L
A
 
T
E
 
K
L
 
D
A
 
A
S
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
V
 
L
D
 
A
G
 
N
L
 
L
T
 
S
A
 
E
D
 
D
A
 
Q
C
 
I
Q
 
H
Q
 
S
A
 
A
L
 
V
R
 
A
H
 
L
A
 
G
L
x
V
A
 
R
S
 
A
A
|
A
S
 
A
L
 
V
C
 
T
V
 
V
M
 
S
E
 
R
Q
 
A
G
 
G
C
 
A
V
 
N
P
 
P
P
 
P
A
 
-
W
 
W

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
32% identity, 77% coverage: 18:278/337 of query aligns to 10:263/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
I
 
L
A
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
|
D
L
 
L
I
 
I
R
 
-
R
 
-
P
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
Q
-
 
Q
-
 
H
Y
 
Y
L
 
L
P
 
K
C
 
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
L
 
P
Y
 
A
N
 
N
L
 
V
C
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
S
V
 
G
G
 
R
T
 
S
Q
 
A
Y
 
F
L
 
F
T
 
G
P
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
R
 
P
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
-
L
 
F
A
 
M
A
 
Q
Q
 
Q
L
 
T
V
 
L
A
 
T
D
 
D
G
 
E
V
 
Q
V
 
V
L
 
D
A
 
C
Q
 
Q
P
 
H
-
 
L
-
 
H
-
 
F
E
 
D
P
 
P
V
 
V
Q
 
H
Q
 
R
V
 
-
T
 
T
S
 
S
L
 
T
A
 
V
V
 
V
V
 
V
N
 
D
L
 
L
D
 
D
A
 
E
H
 
C
G
 
G
H
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
x
F
A
 
T
F
|
F
Y
 
M
R
 
V
E
 
K
G
 
P
V
 
S
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
A
 
F
V
 
L
S
 
Q
A
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
L
G
 
S
D
 
D
S
 
-
C
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
I
P
 
P
A
 
S
L
 
F
Q
 
Q
L
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
W
-
 
L
-
 
H
V
 
V
C
 
C
T
 
S
G
 
I
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
N
D
 
Q
A
 
P
R
 
S
D
 
R
T
 
S
A
 
S
I
 
T
Y
 
F
L
 
A
P
 
A
W
 
-
L
 
I
A
 
A
A
 
Q
Q
 
M
R
 
K
A
 
E
A
 
V
G
 
G
C
 
G
C
 
Y
V
 
V
V
 
S
V
 
F
D
 
D
A
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
P
 
E
S
 
E
V
 
V
M
 
W
P
 
S
D
 
E
L
 
P
A
 
Q
A
 
E
Y
 
L
R
 
Q
T
 
A
A
 
T
V
 
V
H
 
M
A
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
G
H
 
L
A
 
A
H
 
D
I
 
V
I
 
V
K
|
K
A
 
F
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
Q
H
 
F
L
 
L
A
 
T
V
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
T
D
 
Q
A
 
S
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
G
Q
 
L
H
 
Q
L
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
D
H
 
F
P
 
-
Q
 
Q
A
 
I
H
 
P
L
 
L
L
 
V
A
 
V
L
 
V
T
|
T
L
 
L
G
|
G
A
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
A
W
 
L
L
 
V
L
 
A
H
 
T
R
 
P
N
 
N
G
 
S
A
 
Q
Q
 
Q
C
 
I
F
 
V
A
 
S
K
 
G
E
 
K
A
|
A
Q
 
-
P
 
-
L
x
V
P
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
 
C
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
L
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
Y
H
 
R
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
33% identity, 78% coverage: 18:281/337 of query aligns to 6:243/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
I
 
V
A
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
I
I
 
V
R
 
D
R
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
P
S
 
A
Y
 
E
L
 
Y
P
 
-
C
 
-
L
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
P
Y
 
L
N
 
N
L
 
V
C
 
A
R
 
V
A
 
G
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
R
G
 
D
T
 
V
Q
 
D
Y
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
H
L
 
I
S
 
G
R
|
R
D
 
D
R
 
A
F
 
R
G
 
G
R
 
R
E
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
E
Q
 
Y
L
 
I
V
 
E
A
 
S
D
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
Q
L
 
L
A
 
V
Q
x
S
P
x
G
E
 
S
P
 
Q
V
 
T
Q
 
A
Q
 
D
V
 
R
T
 
T
S
 
P
L
 
T
A
 
A
V
 
T
V
 
A
N
 
R
L
 
T
D
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
-
H
 
-
P
 
-
D
 
-
Y
 
Y
A
 
A
F
 
F
Y
 
D
R
 
L
E
 
E
G
 
W
V
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
Q
L
 
I
G
 
P
D
 
D
S
 
T
C
 
P
T
 
P
A
 
V
L
 
A
P
 
P
A
 
P
L
 
L
Q
 
-
L
 
L
V
 
V
C
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
S
L
 
I
A
 
A
L
 
A
D
 
A
A
 
R
R
 
E
D
 
P
T
 
G
A
 
C
I
 
L
Y
 
A
L
 
V
P
 
A
W
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
D
Q
 
A
R
 
Y
A
 
R
A
 
A
G
 
A
C
 
A
C
 
T
V
 
V
V
 
S
V
 
F
D
 
D
A
 
P
N
 
N
L
 
V
R
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
L
M
 
S
P
 
A
D
 
D
L
 
P
A
 
D
A
 
L
Y
 
T
R
 
R
T
 
R
A
 
R
V
 
I
H
 
Q
A
 
R
A
 
L
L
 
V
A
 
E
H
 
R
A
 
S
H
 
D
I
 
I
I
 
I
K
 
K
A
 
A
S
 
S
D
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
E
 
-
H
 
H
L
 
W
A
 
I
V
 
D
P
 
P
G
 
T
G
 
Q
D
 
P
A
 
P
L
 
E
A
 
Q
R
 
T
A
 
A
Q
 
R
H
 
A
L
 
W
L
 
L
A
 
A
A
 
C
H
 
G
P
 
P
Q
 
A
A
 
-
H
 
-
L
 
I
L
 
V
A
 
A
L
 
L
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
W
 
V
L
 
A
L
 
F
H
 
C
R
 
A
N
 
A
G
 
G
A
 
P
Q
 
A
C
 
S
F
 
V
A
 
P
K
 
A
E
 
Q
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
F
 
F
L
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
D
H
 
T
L
 
L
L
 
W
R
 
E
Q
 
Q

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
31% identity, 90% coverage: 20:321/337 of query aligns to 9:302/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
L
 
M
I
 
L
R
 
A
R
 
Q
P
 
P
-
 
L
D
 
P
G
 
R
S
 
A
Y
 
F
L
 
L
P
 
Q
C
 
C
L
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
P
Y
 
A
N
 
N
L
 
V
C
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
G
G
 
A
T
 
V
Q
 
Q
Y
 
F
L
 
V
T
 
G
P
 
M
L
 
L
S
 
G
R
 
S
D
 
D
R
 
M
F
 
F
G
 
G
R
 
D
E
 
F
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
A
A
 
E
A
 
A
Q
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
T
D
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
V
L
 
R
A
 
T
Q
 
S
P
 
T
E
 
A
P
 
K
V
 
-
Q
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
F
V
 
V
N
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
-
H
 
-
G
 
G
H
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
 
F
A
 
S
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
E
 
P
G
 
P
V
 
A
A
 
A
D
 
D
R
 
L
A
 
L
V
 
F
S
 
R
A
 
V
A
 
E
G
 
H
L
 
F
G
 
Q
D
 
D
S
 
A
C
 
S
T
 
F
A
 
S
L
 
D
P
 
A
A
 
L
L
 
I
Q
 
F
L
 
H
V
 
A
C
 
C
T
 
S
G
 
N
A
 
S
L
 
M
A
 
T
L
 
-
D
 
D
A
 
A
R
 
D
D
 
I
T
 
A
A
 
E
I
 
V
Y
 
T
L
 
F
P
 
E
W
 
G
L
 
M
A
 
R
A
 
R
Q
 
A
R
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
A
C
 
I
V
 
V
V
 
S
V
 
F
D
 
D
A
 
L
N
 
N
L
 
F
R
 
R
P
 
P
S
 
M
V
 
L
M
 
W
P
 
P
D
 
N
L
 
G
A
 
E
A
 
N
Y
 
P
R
 
A
T
 
S
A
 
R
V
 
L
H
 
W
A
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
S
H
 
L
A
 
A
H
 
D
I
 
V
I
 
V
K
 
K
A
 
L
S
 
S
D
 
S
E
 
E
D
 
E
L
 
L
E
 
D
H
 
Y
L
 
L
A
 
A
-
 
N
V
 
T
P
 
L
G
 
A
G
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
N
A
 
A
R
 
V
A
 
I
Q
 
Q
H
 
Q
L
 
L
L
 
W
A
 
Q
A
 
G
H
 
R
P
 
A
Q
 
Q
A
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
L
L
 
L
T
 
V
L
x
T
G
x
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
P
-
 
V
-
 
H
W
 
W
L
 
Y
L
 
T
H
 
R
R
 
T
N
 
A
G
 
G
A
 
G
Q
 
E
C
 
V
F
 
P
A
x
T
K
 
F
E
 
R
A
 
V
Q
 
Q
P
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
V
V
 
Q
D
 
D
T
 
S
V
 
N
G
x
A
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
L
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
L
A
 
Y
H
 
T
L
 
F
L
 
A
R
 
Q
Q
 
Q
-
 
F
S
 
D
Q
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
L
A
 
I
S
 
D
F
 
F
A
 
C
Q
 
H
F
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
D
A
 
P
D
 
E
A
 
S
C
 
I
Q
 
V
Q
 
S
A
 
T
L
 
L
R
 
R
H
 
F
A
 
A
L
x
A
A
 
A
S
 
V
A
 
G
S
 
A
L
 
L
C
 
A
V
 
V
M
 
T
E
 
R
Q
 
Q
G
 
G

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
30% identity, 78% coverage: 18:280/337 of query aligns to 9:264/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
I
 
V
A
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
S
I
 
V
D
|
D
L
 
L
I
 
V
R
 
P
R
 
E
P
 
K
D
 
Q
G
 
N
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
P
 
K
C
 
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
L
 
S
Y
 
A
N
 
N
L
 
V
C
 
G
R
 
V
A
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
G
G
 
E
T
 
C
Q
 
G
Y
 
F
L
 
I
T
 
G
P
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
R
 
D
F
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
F
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
Q
 
V
L
 
F
V
 
Q
A
 
D
D
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
D
L
 
V
A
 
T
Q
 
F
P
 
L
E
 
R
P
 
L
V
 
D
Q
 
A
Q
 
D
V
 
L
T
 
T
S
 
S
-
 
A
L
 
V
A
 
L
V
 
I
V
 
V
N
 
N
L
 
L
D
 
T
A
 
A
H
 
D
G
 
G
H
 
E
P
 
R
D
 
S
Y
 
F
A
 
T
F
x
Y
Y
 
L
R
 
V
E
 
H
G
 
P
V
 
G
A
 
A
D
 
D
R
 
T
A
 
Y
V
 
V
S
 
S
A
 
P
A
 
Q
G
 
D
L
 
L
G
 
-
D
 
P
S
 
P
C
 
F
T
 
R
A
 
Q
L
 
Y
P
 
E
A
 
W
L
 
F
Q
 
Y
L
 
F
V
 
S
C
 
S
T
 
I
G
 
G
A
 
L
L
 
T
A
 
D
L
 
R
D
 
P
A
 
A
R
 
R
D
 
E
T
 
A
A
 
C
I
 
-
Y
 
-
L
 
L
P
 
E
W
 
G
L
 
A
A
 
R
A
 
R
Q
 
M
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
G
C
 
Y
V
 
V
V
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
P
 
S
S
 
K
V
 
M
M
 
W
P
 
G
D
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
E
Y
 
I
R
 
P
T
 
E
A
 
L
V
 
I
H
 
A
A
 
R
A
 
S
L
x
A
A
|
A
H
 
L
A
|
A
H
 
S
I
 
I
I
 
C
K
 
K
A
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
C
H
 
Q
L
 
L
A
 
S
V
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
A
D
 
S
A
 
H
L
 
W
A
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
R
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
A
 
-
A
 
R
H
 
D
P
 
L
Q
x
G
A
 
C
H
 
D
L
 
T
L
 
T
A
 
I
L
 
I
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
A
W
 
L
L
 
L
L
 
I
H
 
T
R
 
A
N
 
E
G
 
G
A
 
E
Q
 
-
C
 
-
F
 
F
A
 
H
K
 
F
E
 
P
A
 
A
Q
 
P
P
 
R
L
 
V
P
 
D
V
 
V
V
 
V
D
|
D
T
 
T
V
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
L
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
F
H
 
T
L
 
L
L
 
S
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
30% identity, 78% coverage: 14:276/337 of query aligns to 2:259/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
I
 
L
H
 
E
A
 
V
A
 
V
I
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
L
I
 
V
D
 
A
L
 
L
I
 
V
R
 
P
R
 
Q
P
 
E
D
 
P
G
 
G
S
 
H
Y
 
L
L
 
R
P
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
C
 
Y
L
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
L
x
E
Y
x
V
N
|
N
L
 
V
C
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
K
T
 
V
Q
 
G
Y
 
F
L
 
V
T
 
G
P
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
R
 
E
F
 
L
G
 
G
R
 
A
E
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
E
Q
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
T
Q
 
H
P
 
F
E
 
R
P
 
R
V
 
A
Q
 
P
Q
 
G
V
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
A
 
Y
V
 
L
V
 
R
N
 
E
L
 
Y
D
 
L
A
 
P
H
 
L
G
 
G
H
 
Q
P
 
G
D
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
x
Y
Y
|
Y
R
|
R
E
 
K
G
 
G
V
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
A
 
A
V
 
L
S
 
A
A
 
P
A
 
G
G
 
A
L
 
F
G
 
D
-
 
P
D
 
D
S
 
Y
C
 
L
T
 
E
A
 
G
L
 
V
P
 
R
A
 
F
L
 
L
Q
 
H
L
 
L
V
 
S
-
 
G
C
 
I
T
 
T
G
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
P
D
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
A
T
 
F
A
 
S
I
 
L
Y
 
W
L
 
A
P
 
M
W
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
K
Q
 
R
R
 
R
A
 
-
A
 
-
G
 
G
C
 
V
C
 
R
V
 
V
V
 
S
V
 
L
D
 
D
A
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
|
R
P
 
Q
S
 
T
V
 
L
M
 
W
-
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
-
Y
 
-
R
 
R
T
 
G
A
 
F
V
 
L
H
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
P
H
 
G
A
 
V
H
 
D
I
 
L
I
 
L
K
 
F
A
 
L
S
|
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
H
 
L
L
 
L
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
V
Q
 
E
H
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
A
H
 
L
P
 
-
Q
 
S
A
 
A
H
 
P
L
 
E
L
 
V
A
 
V
L
 
L
T
x
K
L
x
R
G
|
G
A
|
A
A
x
K
G
|
G
A
|
A
W
 
W
L
 
A
L
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
G
H
 
R
R
 
R
N
 
V
G
 
E
A
 
G
Q
 
S
C
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
30% identity, 78% coverage: 14:276/337 of query aligns to 2:259/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
I
 
L
H
 
E
A
 
V
A
 
V
I
 
T
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
P
L
 
L
I
 
V
D
 
A
L
 
L
I
 
V
R
 
P
R
 
Q
P
 
E
D
 
P
G
 
G
S
 
H
Y
 
L
L
 
R
P
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
V
C
 
Y
L
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
E
Y
 
V
N
 
N
L
 
V
C
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
K
T
 
V
Q
 
G
Y
 
F
L
 
V
T
 
G
P
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
R
 
E
F
 
L
G
 
G
R
 
A
E
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
E
Q
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
T
Q
 
H
P
 
F
E
 
R
P
 
R
V
 
A
Q
 
P
Q
 
G
V
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
A
 
Y
V
 
L
V
 
R
N
 
E
L
 
Y
D
 
L
A
 
P
H
 
L
G
 
G
H
 
Q
P
 
G
D
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
E
 
K
G
 
G
V
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
A
 
A
V
 
L
S
 
A
A
 
P
A
 
G
G
 
A
L
 
F
G
 
D
-
 
P
D
 
D
S
 
Y
C
 
L
T
 
E
A
 
G
L
 
V
P
 
R
A
 
F
L
 
L
Q
 
H
L
 
L
V
 
S
-
 
G
C
 
I
T
 
T
G
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
P
D
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
A
T
 
F
A
 
S
I
 
L
Y
 
W
L
 
A
P
 
M
W
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
K
Q
 
R
R
 
R
A
 
-
A
 
-
G
 
G
C
 
V
C
 
R
V
 
V
V
 
S
V
 
L
D
 
D
A
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
 
R
P
 
Q
S
 
T
V
 
L
M
 
W
-
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
-
Y
 
-
R
 
R
T
 
G
A
 
F
V
 
L
H
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
P
H
 
G
A
 
V
H
 
D
I
 
L
I
 
L
K
 
F
A
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
H
 
L
L
 
L
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
V
Q
 
E
H
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
A
H
 
L
P
 
-
Q
 
S
A
 
A
H
 
P
L
 
E
L
 
V
A
 
V
L
 
L
T
x
K
L
 
R
G
|
G
A
 
A
A
 
K
G
 
G
A
 
A
W
 
W
L
 
A
L
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
G
H
 
R
R
 
R
N
 
V
G
 
E
A
 
G
Q
 
S
C
x
A
F
|
F
A
 
A
K
x
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
31% identity, 71% coverage: 38:276/337 of query aligns to 32:259/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
L
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
L
 
E
Y
 
V
N
|
N
L
 
V
C
 
A
R
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
K
T
 
V
Q
 
G
Y
 
F
L
 
V
T
 
G
P
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
E
D
 
D
R
 
E
F
 
L
G
 
G
R
 
A
E
 
M
L
 
V
A
 
E
A
 
E
Q
 
R
L
 
L
V
 
R
A
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
D
L
 
L
A
 
T
Q
 
H
P
 
F
E
 
R
P
 
R
V
 
A
Q
 
P
Q
 
G
V
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
A
x
Y
V
 
L
V
 
R
N
 
E
L
 
Y
D
 
L
A
 
P
H
 
L
G
 
G
H
 
Q
P
 
G
D
 
R
Y
 
V
A
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
R
|
R
E
 
K
G
 
G
V
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
A
 
A
V
 
L
S
 
A
A
 
P
A
 
G
G
 
A
L
 
F
G
 
D
-
 
P
D
 
D
S
 
Y
C
 
L
T
 
E
A
 
G
L
 
V
P
 
R
A
 
F
L
 
L
Q
 
H
L
 
L
V
 
S
-
 
G
C
 
I
T
 
T
G
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
P
D
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
A
T
 
F
A
 
S
I
 
L
Y
 
W
L
 
A
P
 
M
W
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
K
Q
 
R
R
 
R
A
 
-
A
 
-
G
 
G
C
 
V
C
 
R
V
 
V
V
 
S
V
 
L
D
 
D
A
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
|
R
P
 
Q
S
 
T
V
 
L
M
 
W
-
 
S
P
 
P
D
 
E
L
 
E
A
 
A
A
 
-
Y
 
-
R
 
R
T
 
G
A
 
F
V
 
L
H
 
E
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
P
H
 
G
A
 
V
H
 
D
I
 
L
I
 
L
K
 
F
A
 
L
S
 
S
D
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
A
E
 
E
H
 
L
L
 
L
A
 
-
V
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
F
A
 
G
R
 
R
A
 
V
Q
 
E
H
 
E
L
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
A
H
 
L
P
 
-
Q
 
S
A
 
A
H
 
P
L
 
E
L
 
V
A
 
V
L
 
L
T
x
K
L
 
R
G
|
G
A
|
A
A
 
K
G
 
G
A
 
A
W
 
W
L
 
A
L
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
G
H
 
R
R
 
R
N
 
V
G
 
E
A
 
G
Q
 
S
C
 
A
F
 
F
A
 
A
K
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
D
 
D
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
L
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
29% identity, 78% coverage: 18:280/337 of query aligns to 5:253/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
I
 
V
A
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
x
S
I
 
V
D
|
D
L
 
L
I
 
V
R
 
P
R
 
E
P
 
K
D
 
Q
G
 
N
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
P
 
K
C
|
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
L
 
S
Y
 
A
N
 
N
L
 
V
C
 
G
R
 
V
A
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
G
G
 
E
T
 
C
Q
 
G
Y
 
F
L
 
I
T
 
G
P
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
R
 
D
F
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
F
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
Q
 
V
L
 
F
V
 
Q
A
 
D
D
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
D
L
 
V
A
 
T
Q
 
F
P
 
L
E
 
R
P
 
L
V
 
D
Q
 
A
Q
 
D
V
 
L
T
 
T
S
 
S
-
 
A
-
 
V
L
|
L
A
 
I
V
 
V
V
 
N
N
 
S
L
x
F
D
 
T
A
x
Y
H
 
L
G
 
V
H
 
H
P
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
Q
D
 
D
Y
 
L
A
 
P
F
 
P
Y
 
F
R
 
R
E
 
Q
G
 
-
V
 
Y
A
 
E
D
 
W
R
 
F
A
 
Y
V
 
F
S
 
S
A
 
S
A
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
T
D
 
D
S
 
R
C
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
P
A
 
A
L
 
R
Q
 
E
L
 
A
V
 
C
C
 
L
T
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
M
D
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
G
C
 
Y
V
 
V
V
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
P
 
S
S
 
K
V
x
M
M
 
W
P
 
G
D
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
E
Y
 
I
R
 
P
T
 
E
A
 
L
V
 
I
H
 
A
A
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
H
 
L
A
 
A
H
 
S
I
 
I
I
 
C
K
 
K
A
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
E
 
C
H
 
Q
L
 
L
A
 
S
V
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
A
D
 
S
A
 
H
L
 
W
A
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
R
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
A
 
R
A
 
-
H
 
D
P
 
L
Q
 
G
A
 
C
H
 
D
L
 
T
L
 
T
A
 
I
L
 
I
T
 
S
L
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
A
 
A
W
 
L
L
 
L
L
 
I
H
 
T
R
 
A
N
 
E
G
 
G
A
 
E
Q
 
-
C
 
-
F
 
F
A
 
H
K
 
F
E
 
P
A
 
A
Q
 
P
P
 
R
L
 
V
P
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
F
L
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
F
H
 
T
L
 
L
L
 
S
R
 
R

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
29% identity, 78% coverage: 18:280/337 of query aligns to 5:253/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
I
 
V
A
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
S
I
 
V
D
|
D
L
 
L
I
 
V
R
 
P
R
 
E
P
 
K
D
 
Q
G
 
N
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
P
 
K
C
|
C
L
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
L
 
S
Y
 
A
N
 
N
L
 
V
C
 
G
R
 
V
A
 
C
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
G
 
G
V
 
G
G
 
E
T
 
C
Q
 
G
Y
 
F
L
 
I
T
 
G
P
 
C
L
 
L
S
 
G
R
 
D
D
 
D
R
 
D
F
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
F
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
Q
 
V
L
 
F
V
 
Q
A
 
D
D
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
D
L
 
V
A
 
T
Q
 
F
P
 
L
E
 
R
P
 
L
V
 
D
Q
 
A
Q
 
D
V
 
L
T
 
T
S
 
S
-
 
A
-
 
V
L
 
L
A
 
I
V
 
V
V
 
N
N
 
S
L
x
F
D
 
T
A
x
Y
H
 
L
G
 
V
H
 
H
P
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
D
-
 
T
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
P
-
 
Q
D
 
D
Y
 
L
A
 
P
F
 
P
Y
 
F
R
 
R
E
 
Q
G
 
-
V
 
Y
A
 
E
D
 
W
R
 
F
A
 
Y
V
 
F
S
 
S
A
 
S
A
 
I
G
 
G
L
 
L
G
 
T
D
 
D
S
 
R
C
 
-
T
 
-
A
 
-
L
 
-
P
 
P
A
 
A
L
 
R
Q
 
E
L
 
A
V
 
C
C
 
L
T
 
E
G
 
G
A
 
A
L
 
R
A
 
R
L
 
M
D
 
-
A
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
C
 
G
C
 
Y
V
 
V
V
 
L
V
 
F
D
 
D
A
 
V
N
|
N
L
 
L
R
|
R
P
 
S
S
 
K
V
x
M
M
 
W
P
 
G
D
 
N
L
 
T
A
 
D
A
 
E
Y
 
I
R
 
P
T
 
E
A
 
L
V
 
I
H
 
A
A
 
R
A
 
S
L
 
A
A
 
A
H
 
L
A
 
A
H
 
S
I
 
I
I
 
C
K
|
K
A
 
V
S
 
S
D
 
A
E
 
D
D
x
E
L
 
L
E
 
C
H
 
Q
L
 
L
A
 
S
V
 
-
P
 
-
G
 
G
G
 
A
D
 
S
A
 
H
L
 
W
A
 
Q
R
 
D
A
 
A
Q
 
R
H
 
Y
L
 
Y
L
 
L
A
 
R
A
 
-
H
 
D
P
 
L
Q
 
G
A
 
C
H
 
D
L
 
T
L
 
T
A
 
I
L
 
I
T
x
S
L
 
L
G
|
G
A
|
A
A
 
D
G
|
G
A
 
A
W
 
L
L
 
L
L
 
I
H
 
T
R
 
A
N
 
E
G
 
G
A
 
E
Q
 
-
C
 
-
F
 
F
A
 
H
K
 
F
E
 
P
A
 
A
Q
 
P
P
 
R
L
 
V
P
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
|
F
L
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
F
H
 
T
L
 
L
L
 
S
R
 
R

Sites not aligning to the query:

Q97U29 2-dehydro-3-deoxygluconokinase/2-dehydro-3-deoxygalactonokinase; 2-dehydro-3-deoxyglucono/galactono-kinase; 2-keto-3-deoxy-galactonokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; KDGal kinase; EC 2.7.1.178 from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
22% identity, 87% coverage: 38:331/337 of query aligns to 32:305/313 of Q97U29

query
sites
Q97U29
L
 
V
G
 
A
G
|
G
A
x
S
L
x
E
Y
x
L
N
|
N
L
 
F
C
 
C
R
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
R
Q
 
N
G
 
H
V
 
L
G
 
S
T
 
C
Q
 
S
Y
 
L
L
 
I
T
 
A
P
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
E
 
N
L
 
I
A
 
I
A
 
E
Q
 
Y
L
 
S
V
 
R
A
 
A
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
V
 
D
L
 
T
A
 
S
Q
 
H
P
 
I
E
 
K
P
 
V
V
 
D
Q
 
N
Q
 
E
V
 
-
T
 
-
S
 
S
L
 
F
A
 
T
V
 
G
V
 
I
N
x
Y
L
 
F
D
 
I
A
 
Q
H
 
R
G
 
G
H
 
Y
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
K
-
 
S
D
 
E
Y
 
L
A
 
V
F
x
Y
Y
|
Y
R
|
R
E
 
K
G
 
G
V
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
A
 
R
V
 
L
S
 
S
A
 
P
A
 
E
G
 
D
L
 
I
G
 
N
D
 
E
S
 
N
C
 
Y
T
 
V
A
 
R
L
 
N
P
 
S
A
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
H
Q
 
S
L
 
T
V
 
G
C
 
I
T
 
T
G
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
S
L
 
D
D
 
N
A
 
A
R
 
K
D
 
E
T
 
A
A
 
V
I
 
I
Y
 
K
L
 
A
P
 
F
W
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
S
R
 
R
A
 
S
A
 
-
G
 
-
C
 
-
C
 
-
V
 
-
V
 
-
V
 
L
D
 
D
A
 
T
N
|
N
L
x
I
R
|
R
P
 
P
S
 
K
V
 
L
M
 
W
P
 
S
D
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
K
Y
 
A
R
 
K
T
 
E
A
 
T
V
 
I
H
 
L
A
 
S
A
 
I
L
 
L
A
 
K
H
 
K
A
 
Y
H
 
D
I
 
I
-
 
E
-
 
V
-
 
L
I
 
I
K
 
T
A
 
D
S
 
P
D
 
D
E
 
D
D
 
T
L
 
K
E
 
I
H
 
L
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
T
G
 
D
G
 
P
D
 
D
A
 
E
L
 
A
A
 
Y
R
 
R
A
 
K
Q
 
Y
H
 
K
L
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
-
H
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
V
H
 
K
L
 
V
L
 
L
A
 
L
L
 
Y
T
x
K
L
|
L
G
|
G
A
x
S
A
x
K
G
|
G
A
 
A
W
 
-
L
 
I
L
 
A
H
 
Y
R
 
K
N
 
D
G
 
N
A
 
V
Q
 
K
C
 
A
F
 
F
A
 
-
K
 
K
E
 
D
A
 
A
Q
 
Y
P
 
K
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
E
D
 
D
T
 
P
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
-
L
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
T
L
 
F
A
 
V
H
 
S
L
 
L
L
 
Y
R
 
L
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
K
A
 
D
A
 
I
E
 
E
L
 
Y
A
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
C
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
S
L
 
L
R
 
A
H
 
H
A
 
G
L
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
S
S
 
T
L
 
L
C
 
V
V
 
I
M
 
T
E
 
V
Q
 
R
G
 
G
C
x
D
-
 
N
-
 
E
V
 
L
P
 
T
P
 
P
A
 
T
W
 
L
E
 
E
A
 
D
A
 
A
Q
 
E

2varA Crystal structure of sulfolobus solfataricus 2-keto-3-deoxygluconate kinase complexed with 2-keto-3-deoxygluconate (see paper)
22% identity, 87% coverage: 38:331/337 of query aligns to 31:304/311 of 2varA

query
sites
2varA
L
 
V
G
 
A
G
|
G
A
x
S
L
 
E
Y
 
L
N
 
N
L
 
F
C
 
C
R
 
I
A
 
A
L
 
V
A
 
V
R
 
R
Q
 
N
G
 
H
V
 
L
G
 
S
T
 
C
Q
 
S
Y
 
L
L
 
I
T
 
A
P
 
R
L
 
V
S
 
G
R
 
N
D
 
D
R
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
K
E
 
N
L
 
I
A
 
I
A
 
E
Q
 
Y
L
 
S
V
 
R
A
 
A
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
V
 
D
L
 
T
A
 
S
Q
 
H
P
 
I
E
 
K
P
 
V
V
 
D
Q
 
N
Q
 
E
V
 
-
T
 
-
S
 
S
L
 
F
A
 
T
V
 
G
V
 
I
N
x
Y
L
 
F
D
 
I
A
 
Q
H
 
R
G
 
G
H
 
Y
P
 
P
-
 
I
-
 
P
-
 
M
-
 
K
-
 
S
D
 
E
Y
x
L
A
 
V
F
x
Y
Y
 
Y
R
|
R
E
 
K
G
 
G
V
 
S
A
 
A
D
 
G
R
 
S
A
 
R
V
 
L
S
 
S
A
 
P
A
 
E
G
 
D
L
 
I
G
 
N
D
 
E
S
 
N
C
 
Y
T
 
V
A
 
R
L
 
N
P
 
S
A
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
H
Q
 
S
L
 
T
V
 
G
C
x
I
T
 
T
G
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
S
L
 
D
D
 
N
A
 
A
R
 
K
D
 
E
T
 
A
A
 
V
I
 
I
Y
 
K
L
 
A
P
 
F
W
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
K
Q
 
S
R
 
R
A
 
S
A
 
-
G
 
-
C
 
-
C
 
-
V
 
-
V
 
-
V
 
L
D
 
D
A
 
T
N
 
N
L
 
I
R
|
R
P
 
P
S
 
K
V
 
L
M
 
W
P
 
S
D
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
K
Y
 
A
R
 
K
T
 
E
A
 
T
V
 
I
H
 
L
A
 
S
A
 
I
L
 
L
A
 
K
H
 
K
A
 
Y
H
 
D
I
 
I
-
 
E
-
 
V
-
 
L
I
 
I
K
 
T
A
 
D
S
 
P
D
 
D
E
 
D
D
 
T
L
 
K
E
 
I
H
 
L
L
 
L
A
 
D
V
 
V
P
 
T
G
 
D
G
 
P
D
 
D
A
 
E
L
 
A
A
 
Y
R
 
R
A
 
K
Q
 
Y
H
 
K
L
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
-
H
 
-
P
 
-
Q
 
-
A
 
V
H
 
K
L
 
V
L
 
L
A
 
L
L
 
Y
T
x
K
L
 
L
G
|
G
A
x
S
A
 
K
G
|
G
A
 
A
W
 
-
L
 
I
L
 
A
H
 
Y
R
 
K
N
 
D
G
 
N
A
 
V
Q
 
K
C
 
A
F
 
F
A
 
-
K
 
K
E
 
D
A
 
A
Q
 
Y
P
 
K
L
 
V
P
 
P
V
 
V
V
 
E
D
 
D
T
 
P
V
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
A
F
 
-
L
x
M
A
 
A
G
 
G
L
 
T
L
 
F
A
 
V
H
 
S
L
 
L
L
 
Y
R
 
L
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
K
A
 
D
A
 
I
E
 
E
L
 
Y
A
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
A
 
-
C
 
-
Q
 
-
Q
 
-
A
 
S
L
 
L
R
 
A
H
 
H
A
 
G
L
x
I
A
 
A
S
 
A
A
x
S
S
 
T
L
 
L
C
 
V
V
x
I
M
 
T
E
 
V
Q
 
R
G
 
G
C
x
D
-
 
N
-
 
E
V
 
L
P
 
T
P
 
P
A
 
T
W
 
L
E
 
E
A
 
D
A
 
A
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ac3H11_2936 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_2936
MTSAPNTSTATAPIHAAIAGEALIDLIRRPDGSYLPCLGGALYNLCRALARQGVGTQYLT
PLSRDRFGRELAAQLVADGVVLAQPEPVQQVTSLAVVNLDAHGHPDYAFYREGVADRAVS
AAGLGDSCTALPALQLVCTGALALDARDTAIYLPWLAAQRAAGCCVVVDANLRPSVMPDL
AAYRTAVHAALAHAHIIKASDEDLEHLAVPGGDALARAQHLLAAHPQAHLLALTLGAAGA
WLLHRNGAQCFAKEAQPLPVVDTVGAGDSFLAGLLAHLLRQSQAAELASFAQFVDGLTAD
ACQQALRHALASASLCVMEQGCVPPAWEAAQARALAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory