SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_2940 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_2940 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5jo9A Structural characterization of the thermostable bradyrhizobium japonicum d-sorbitol dehydrogenase (see paper)
79% identity, 98% coverage: 6:244/244 of query aligns to 1:239/239 of 5jo9A

query
sites
5jo9A
N
 
E
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
L
A
 
A
S
 
S
A
 
A
Q
 
E
T
 
A
M
 
M
A
 
L
D
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
M
I
 
V
D
 
D
R
 
R
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
K
K
 
A
A
 
L
C
 
C
A
 
N
T
 
K
I
 
H
G
 
G
P
 
D
N
 
T
A
 
V
L
 
I
P
 
P
L
 
L
V
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
P
R
 
E
Q
 
D
C
 
C
A
 
A
S
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
P
R
 
R
T
 
V
L
 
L
A
 
E
L
 
K
A
 
A
G
 
C
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
I
 
I
F
 
L
H
 
H
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
T
Y
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
T
D
 
M
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
M
 
M
L
 
L
N
 
N
L
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
M
 
M
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
N
 
D
V
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
E
R
 
R
G
 
R
T
 
T
G
 
G
D
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
V
T
 
T
S
 
S
S
|
S
L
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
H
F
 
F
P
 
P
T
 
T
P
 
P
W
 
W
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Y
|
Y
A
 
A
S
 
S
S
 
S
K
|
K
W
 
W
A
 
A
V
 
I
N
 
N
C
 
C
F
 
F
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
V
 
V
R
 
R
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
F
 
F
K
 
K
H
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
G
S
 
S
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
|
G
P
 
P
V
 
V
I
 
V
T
 
S
S
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
D
 
D
W
|
W
P
 
P
A
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
S
E
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
M
F
 
F
M
 
M
L
 
L
T
 
T
R
 
R
P
 
P
R
 
R
G
 
G
M
 
M
T
 
T
I
 
I
R
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
L
M
 
M
M
 
L
P
 
P
T
 
T
N
 
N
F
 
F
D
 
D
L
 
L

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
31% identity, 89% coverage: 7:223/244 of query aligns to 5:223/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
Q
 
Q
G
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
L
A
 
E
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
T
 
V
M
 
F
A
 
M
D
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
A
D
|
D
R
x
F
D
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
-
A
 
G
K
 
K
A
 
E
C
 
A
A
 
V
T
 
E
I
 
A
G
 
N
P
 
P
N
 
G
A
 
V
L
 
V
P
 
F
L
 
I
V
 
R
L
x
V
D
|
D
L
x
V
L
 
S
D
 
D
A
 
R
R
 
E
Q
 
S
C
 
V
A
 
H
S
 
R
L
 
L
L
 
V
Q
 
E
R
 
N
T
 
V
L
 
A
A
 
E
L
 
R
A
 
F
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
L
H
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
x
I
Y
 
T
V
 
R
G
x
D
G
 
S
D
 
M
L
 
L
V
 
S
D
x
K
A
 
M
D
 
T
P
 
V
D
 
D
A
 
Q
I
 
F
D
 
Q
R
 
Q
M
 
V
L
 
I
N
 
N
L
 
V
N
|
N
V
 
L
N
 
T
V
 
G
V
 
V
M
 
F
K
 
H
N
 
C
V
 
T
H
 
Q
N
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
T
 
K
G
 
G
D
 
K
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
|
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
T
A
 
G
H
 
T
F
 
Y
P
 
G
T
x
N
P
x
V
W
 
G
E
x
Q
P
 
T
V
 
N
Y
|
Y
A
 
A
S
 
A
S
 
A
K
|
K
W
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
I
C
 
G
F
 
M
V
 
T
Q
 
K
T
 
T
V
 
W
R
 
A
R
 
K
Q
 
E
V
 
L
F
 
A
K
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
G
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
A
P
|
P
G
 
G
P
x
F
V
x
T
I
 
E
T
|
T
S
 
A
L
x
M
L
 
V
A
 
A
D
 
E
W
 
V
P
 
P
A
 
E
E
 
K
K
 
V
L
 
I
A
 
E
E
x
K
A
 
M
K
 
K
A
 
A
S
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
M
G
 
G
S
 
R
L
 
L
I
 
G
E
 
K
A
 
P
A
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
N
V
 
A
V
 
Y
L
 
L
F
 
F
M
 
L

2japA Clavulanic acid dehydrogenase: structural and biochemical analysis of the final step in the biosynthesis of the beta- lactamase inhibitor clavulanic acid (see paper)
33% identity, 96% coverage: 7:241/244 of query aligns to 3:243/245 of 2japA

query
sites
2japA
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
E
A
 
A
S
 
T
A
 
A
Q
 
R
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
A
D
x
A
R
|
R
D
x
R
E
 
V
A
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
E
C
 
L
A
 
T
T
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
A
N
 
K
A
 
V
L
 
H
P
 
V
L
 
L
V
 
E
L
|
L
D
|
D
L
x
V
L
 
A
D
 
D
A
 
R
R
 
Q
Q
 
G
C
 
V
A
 
D
S
 
A
L
 
A
L
 
V
Q
 
A
R
 
S
T
 
T
L
 
V
A
 
E
L
 
A
A
 
L
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
F
 
L
H
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
Y
x
M
V
 
L
G
 
L
G
 
G
D
 
P
L
 
V
V
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
T
D
 
T
A
 
D
I
 
W
D
 
T
R
 
R
M
 
M
L
 
I
N
 
D
L
x
T
N
 
N
V
 
L
N
 
L
V
 
G
V
 
L
M
 
M
K
 
Y
N
 
M
V
 
T
H
 
R
N
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
H
M
 
L
I
 
L
E
 
-
R
 
R
G
 
S
T
 
K
G
 
G
D
 
T
I
 
V
I
 
V
V
 
Q
T
x
M
S
|
S
S
|
S
L
 
I
A
|
A
A
 
G
H
 
R
F
 
V
P
 
N
T
 
V
P
 
R
W
 
N
E
 
A
P
 
A
V
 
V
Y
|
Y
A
 
Q
S
 
A
S
 
T
K
|
K
W
 
F
A
 
G
V
 
V
N
 
N
C
 
A
F
 
F
V
 
S
Q
 
E
T
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
Q
 
E
V
 
V
F
 
T
K
 
E
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
V
S
 
V
I
 
I
S
 
E
P
|
P
G
 
G
P
x
T
V
x
T
I
 
D
T
|
T
S
x
E
L
|
L
-
 
R
-
 
G
-
 
H
L
 
I
A
 
T
D
 
H
W
 
T
P
x
A
A
 
T
E
 
K
K
 
E
L
 
M
A
x
Y
E
 
E
A
 
Q
K
x
R
A
 
I
S
 
S
G
 
Q
-
 
I
S
 
R
L
 
K
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
V
L
 
R
F
 
Y
M
 
A
L
 
V
T
 
T
R
 
A
P
 
P
R
 
H
G
 
H
M
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
H
D
 
E
V
 
I
V
 
F
M
 
I
M
 
R
P
 
P
T
 
T
N
 
D

2jahC Biochemical and structural analysis of the clavulanic acid dehydeogenase (cad) from streptomyces clavuligerus (see paper)
33% identity, 96% coverage: 7:241/244 of query aligns to 4:244/246 of 2jahC

query
sites
2jahC
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
E
A
 
A
S
 
T
A
 
A
Q
 
R
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
A
D
x
A
R
|
R
D
x
R
E
 
V
A
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
G
K
 
D
A
 
E
C
 
L
A
 
T
T
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
A
N
 
K
A
 
V
L
 
H
P
 
V
L
 
L
V
 
E
L
 
L
D
|
D
L
x
V
L
 
A
D
 
D
A
 
R
R
 
Q
Q
 
G
C
 
V
A
 
D
S
 
A
L
 
A
L
 
V
Q
 
A
R
 
S
T
 
T
L
 
V
A
 
E
L
 
A
A
 
L
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
F
 
L
H
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
Y
 
M
V
 
L
G
 
L
G
 
G
D
 
P
L
 
V
V
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
T
D
 
T
A
 
D
I
 
W
D
 
T
R
 
R
M
 
M
L
 
I
N
 
D
L
x
T
N
 
N
V
 
L
N
 
L
V
 
G
V
 
L
M
 
M
K
 
Y
N
 
M
V
 
T
H
 
R
N
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
H
M
 
L
I
 
L
E
 
-
R
 
R
G
 
S
T
 
K
G
 
G
D
 
T
I
 
V
I
 
V
V
 
Q
T
x
M
S
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
H
 
R
F
 
V
P
 
N
T
 
V
P
 
R
W
 
N
E
 
A
P
 
A
V
 
V
Y
|
Y
A
 
Q
S
 
A
S
 
T
K
|
K
W
 
F
A
 
G
V
 
V
N
 
N
C
 
A
F
 
F
V
 
S
Q
 
E
T
 
T
V
 
L
R
 
R
R
 
Q
Q
 
E
V
 
V
F
 
T
K
 
E
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
V
S
 
V
I
 
I
S
 
E
P
|
P
G
|
G
P
x
T
V
x
T
I
 
D
T
|
T
S
x
E
L
|
L
-
 
R
-
 
G
-
 
H
L
 
I
A
 
T
D
 
H
W
 
T
P
x
A
A
 
T
E
 
K
K
 
E
L
 
M
A
 
Y
E
 
E
A
 
Q
K
 
R
A
 
I
S
 
S
G
 
Q
-
 
I
S
 
R
L
 
K
I
 
L
E
 
Q
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
V
L
 
R
F
 
Y
M
 
A
L
 
V
T
 
T
R
 
A
P
 
P
R
 
H
G
 
H
M
 
A
T
 
T
I
 
V
R
 
H
D
 
E
V
 
I
V
 
F
M
 
I
M
 
R
P
 
P
T
 
T
N
 
D

5t2uA Short chain dehydrogenase/reductase family protein (see paper)
34% identity, 91% coverage: 6:228/244 of query aligns to 3:223/241 of 5t2uA

query
sites
5t2uA
N
 
E
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
L
V
 
T
A
 
A
A
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
F
 
L
A
 
E
S
 
S
A
 
A
Q
 
R
T
 
L
M
 
M
A
 
A
D
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
T
D
 
G
R
|
R
D
|
D
E
 
A
A
 
Q
A
x
R
L
 
G
A
 
E
K
 
Q
A
 
A
C
 
A
A
 
A
T
 
D
I
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
G
A
 
A
L
 
R
P
 
F
L
 
V
V
 
Q
L
 
A
D
|
D
L
|
L
L
 
G
D
 
D
A
 
L
R
 
D
Q
 
S
C
 
V
A
 
A
S
 
D
L
 
L
L
 
A
Q
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
Q
A
 
A
G
 
P
Q
 
D
L
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
L
H
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
Y
|
Y
V
 
P
G
 
Q
G
 
A
D
 
S
L
 
T
V
 
F
D
 
D
A
 
Q
D
 
D
P
 
V
D
 
A
A
 
G
I
 
F
D
 
Q
R
 
Q
M
 
L
L
 
F
N
 
D
L
 
T
N
 
N
V
 
V
N
 
R
V
 
G
V
 
T
M
 
Y
K
 
F
N
 
L
V
 
V
H
 
A
N
 
A
V
 
A
L
 
A
P
 
K
H
 
G
M
 
M
I
 
V
E
 
A
R
 
R
G
 
G
T
 
H
G
 
G
D
 
S
I
 
I
I
 
V
V
 
N
T
x
I
S
 
T
S
x
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
H
F
 
K
P
 
G
T
 
F
P
 
P
W
 
G
E
x
T
P
 
S
V
 
V
Y
|
Y
A
 
G
S
 
A
S
 
T
K
|
K
W
 
A
A
 
A
V
 
L
N
 
E
C
 
S
F
 
L
V
 
T
Q
 
R
T
 
T
V
 
W
R
 
A
R
 
A
Q
 
E
V
 
F
F
 
G
K
 
A
H
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
S
P
|
P
G
 
G
P
|
P
V
x
T
I
 
R
T
|
T
S
 
P
L
x
T
L
x
T
A
 
L
D
 
E
W
 
Q
P
 
L
A
 
G
E
 
D
K
 
F
L
 
I
A
 
D
E
 
D
A
 
V
K
 
A
A
 
A
S
 
G
G
 
L
S
 
P
L
 
L
I
 
R
E
 
R
A
 
T
A
 
A
-
 
A
-
 
P
-
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
E
 
Q
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
M
 
-
L
 
L
T
 
A
R
 
S
P
 
P
R
 
R

3p19A Improved NADPH-dependent blue fluorescent protein (see paper)
29% identity, 95% coverage: 10:241/244 of query aligns to 3:236/239 of 3p19A

query
sites
3p19A
Q
 
K
V
 
L
A
 
V
A
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
E
A
 
A
S
 
I
A
 
A
Q
 
R
T
 
R
M
 
F
A
 
S
D
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
H
R
 
P
V
 
L
V
 
L
L
 
L
I
 
L
D
x
A
R
|
R
D
x
R
E
 
V
A
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
K
K
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
A
T
 
L
I
 
N
G
 
L
P
 
P
N
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
C
L
 
A
V
 
Q
L
 
V
D
|
D
L
x
V
L
 
T
D
 
D
A
 
K
R
 
Y
Q
 
T
C
 
F
A
 
D
S
 
T
L
 
A
L
 
I
Q
 
T
R
 
R
T
 
A
L
 
E
A
 
K
L
 
I
A
 
Y
G
 
G
Q
 
P
L
 
A
D
 
D
I
 
A
F
 
I
H
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
M
Y
 
M
V
 
L
G
 
L
G
 
G
D
 
Q
L
 
I
V
 
D
D
 
T
A
 
Q
D
 
E
P
 
A
D
 
N
A
 
E
I
 
W
D
 
Q
R
 
R
M
 
M
L
 
F
N
 
D
L
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
L
V
 
G
V
 
L
M
 
L
K
 
N
N
 
G
V
 
M
H
 
Q
N
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
A
H
 
P
M
 
M
I
 
K
E
 
A
R
 
R
G
 
N
T
 
C
G
 
G
D
 
T
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
x
I
S
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
A
A
 
G
H
 
K
F
 
K
P
 
T
T
 
F
P
 
P
W
 
D
E
 
H
P
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
C
S
 
G
S
 
T
K
|
K
W
 
F
A
 
A
V
 
V
N
 
H
C
 
A
F
 
I
V
 
S
Q
 
E
T
 
N
V
 
V
R
 
R
R
 
E
Q
 
E
V
 
V
F
 
A
K
 
A
H
 
S
G
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
M
S
 
T
I
 
I
S
 
A
P
|
P
G
 
S
P
x
A
V
|
V
I
 
K
T
|
T
S
x
E
L
|
L
L
 
L
A
 
S
D
 
H
W
 
T
P
 
T
A
 
S
E
 
Q
K
 
Q
L
 
I
A
 
K
E
 
D
A
 
G
K
 
Y
A
 
D
S
 
A
-
 
W
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
M
G
 
G
S
 
G
L
 
V
I
 
L
E
 
A
A
 
A
A
 
D
E
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
R
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
M
 
A
L
 
Y
T
 
Q
R
 
Q
P
 
P
R
 
Q
G
 
N
M
 
V
T
 
C
I
 
I
R
 
R
D
 
E
V
 
I
V
 
A
M
 
L
M
 
A
P
 
P
T
 
T
N
 
K

A0A1U8QWA2 Glycine betaine reductase ATRR; Nonribosomal peptide synthetase-like protein ATRR; EC 1.2.1.-; EC 1.1.1.- from Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) (Aspergillus nidulans) (see paper)
28% identity, 96% coverage: 7:241/244 of query aligns to 1027:1267/1270 of A0A1U8QWA2

query
sites
A0A1U8QWA2
L
|
L
Q
x
S
G
|
G
Q
x
K
V
|
V
A
|
A
A
x
V
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
F
x
A
A
|
A
S
x
V
A
|
A
Q
x
T
T
x
A
M
x
L
A
|
A
D
x
R
A
x
E
G
|
G
A
|
A
R
x
H
V
|
V
V
x
A
L
|
L
I
x
G
D
x
A
R
|
R
D
x
R
E
x
L
A
x
D
A
|
A
L
|
L
A
x
E
K
x
S
A
x
L
C
x
K
A
x
E
T
x
K
I
x
L
G
x
S
P
x
A
N
x
S
A
x
G
L
x
V
P
x
K
L
x
V
V
|
V
L
x
T
-
x
C
-
x
K
-
x
T
D
|
D
L
x
V
L
x
T
D
|
D
A
x
R
R
x
K
Q
|
Q
C
x
V
A
x
E
S
x
G
L
|
L
L
x
V
Q
x
K
R
x
A
T
x
A
L
x
T
A
x
E
L
x
E
A
x
L
G
|
G
Q
x
P
L
x
V
D
|
D
I
|
I
F
x
L
H
x
V
A
|
A
N
x
C
A
|
A
G
|
G
L
x
V
Y
x
M
V
x
Y
G
x
F
G
x
T
D
x
M
L
x
M
V
x
A
D
x
N
A
x
T
D
x
Q
P
x
M
D
|
D
A
x
E
I
x
W
D
x
E
R
|
R
M
x
T
L
x
V
N
x
D
L
x
V
N
|
N
V
x
C
N
x
K
V
x
G
V
x
I
M
x
L
K
x
N
N
x
S
V
x
L
H
x
A
N
x
S
V
x
T
L
x
V
P
|
P
H
x
G
M
|
M
I
x
L
E
x
A
R
|
R
G
|
G
T
x
K
G
|
G
D
x
H
I
x
V
I
x
V
V
x
A
T
x
I
S
|
S
S
|
S
L
x
D
A
|
A
A
x
G
H
x
R
F
x
K
P
x
V
T
x
F
P
|
P
W
x
G
E
x
L
P
x
G
V
|
V
Y
|
Y
A
x
S
S
x
A
S
|
S
K
|
K
W
x
F
A
x
F
V
|
V
N
x
E
C
x
A
F
x
T
V
x
L
Q
|
Q
T
x
A
V
x
L
R
|
R
R
x
L
Q
x
E
V
x
T
F
x
A
K
x
G
H
x
Q
G
|
G
I
x
L
R
|
R
V
|
V
G
x
T
S
x
A
I
x
V
S
x
Q
P
|
P
G
|
G
P
x
N
V
x
T
I
x
A
T
|
T
S
x
D
L
|
L
L
|
L
A
x
G
-
x
M
-
x
S
-
x
T
D
|
D
W
x
A
P
x
E
A
|
A
E
x
I
K
|
K
L
x
K
A
x
Y
E
x
G
A
x
E
K
x
P
A
x
S
S
x
G
G
x
A
S
x
Q
L
x
I
I
x
L
E
x
D
A
x
P
A
x
E
E
x
D
V
|
V
A
|
A
E
x
N
V
x
S
V
x
I
L
x
I
F
x
Y
M
x
A
L
|
L
T
x
R
R
x
Q
P
|
P
R
x
E
G
x
H
M
x
V
T
 
A
I
 
M
R
 
N
D
 
E
V
 
I
V
 
L
M
 
I
M
 
E
P
 
P
T
 
R
N
 
D

Sites not aligning to the query:

7qujA Structure of nsneps2, a 7s-cis-trans nepetalactone synthase (see paper)
35% identity, 77% coverage: 5:192/244 of query aligns to 2:197/259 of 7qujA

query
sites
7qujA
R
 
K
N
 
K
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
E
A
 
T
S
 
A
A
 
A
Q
 
R
T
 
I
M
 
F
A
 
A
D
 
D
A
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
A
V
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
A
R
x
D
D
x
I
E
x
Q
A
 
S
A
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
R
A
 
M
C
 
V
A
 
A
-
 
E
T
 
S
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
K
A
 
R
L
 
C
P
 
S
L
 
Y
V
 
V
-
 
Q
L
x
C
D
|
D
L
x
I
L
 
A
D
 
D
A
 
E
R
 
E
Q
 
Q
C
 
V
A
 
K
S
 
S
L
 
A
L
 
V
Q
 
E
R
 
W
T
 
T
L
 
A
A
 
T
L
 
T
A
 
Y
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
F
 
M
H
 
F
A
 
C
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
I
Y
 
M
V
 
S
G
 
H
G
 
S
D
 
D
-
 
S
-
 
G
-
 
Q
-
 
T
L
 
V
V
 
M
D
 
E
A
 
L
D
 
D
P
 
M
D
 
S
A
 
K
I
 
F
D
 
D
R
 
E
M
 
V
L
 
M
N
 
R
L
 
V
N
 
N
V
 
T
N
 
R
V
 
G
V
 
T
M
 
A
K
 
A
N
 
C
V
 
V
H
 
K
N
 
Q
V
 
A
L
 
A
P
 
R
H
 
K
M
 
M
I
 
V
E
 
E
R
 
L
G
 
G
T
 
T
-
 
R
-
 
G
G
 
G
D
 
A
I
 
I
I
 
I
V
 
C
T
|
T
S
|
S
S
 
S
L
 
P
A
 
L
A
 
A
H
 
T
F
 
R
P
 
G
T
 
G
P
 
H
W
 
V
E
 
D
P
 
T
V
 
D
Y
|
Y
A
 
V
S
 
M
S
 
S
K
|
K
W
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
L
C
 
G
F
 
L
V
 
V
Q
 
R
T
 
S
V
 
A
R
 
S
R
 
M
Q
 
Q
V
 
L
F
 
G
K
 
A
H
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
S
P
|
P
G
x
M
P
x
A
V
|
V
I
 
L
T
|
T
S
 
P
L
|
L

Sites not aligning to the query:

6zyzA Structure of the borneol dehydrogenases of salvia rosmarinus with NAD+ (see paper)
28% identity, 90% coverage: 5:223/244 of query aligns to 1:227/259 of 6zyzA

query
sites
6zyzA
R
 
R
N
 
R
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
A
A
 
S
S
 
T
A
 
V
Q
 
R
T
 
L
M
 
F
A
 
H
D
 
D
A
 
H
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
A
D
|
D
R
x
I
D
x
Q
E
 
D
A
 
D
A
 
L
L
 
G
A
 
Q
K
 
T
A
 
L
C
 
A
A
 
D
T
 
R
I
 
L
G
 
G
P
 
R
N
 
N
A
 
I
L
 
S
P
 
Y
L
 
T
V
 
H
L
x
C
D
|
D
L
x
V
L
 
T
D
 
D
A
 
E
R
 
D
Q
 
Q
C
 
V
A
 
R
S
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
D
R
 
A
T
 
A
L
 
V
A
 
A
L
 
K
A
 
H
G
 
G
Q
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
M
H
 
F
A
 
S
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
Y
x
V
V
 
E
G
 
G
-
x
P
G
x
N
D
x
S
L
 
I
V
 
F
D
|
D
A
 
V
D
 
D
P
 
K
D
 
D
A
 
E
I
 
L
D
 
E
R
 
R
M
 
L
L
 
M
N
 
G
L
x
I
N
 
N
V
 
L
N
 
V
V
 
G
V
 
A
M
 
F
K
 
L
N
 
A
V
 
A
H
 
K
N
 
H
V
 
A
L
 
A
P
 
R
H
 
V
M
 
M
I
 
V
E
 
P
R
 
A
G
 
K
T
 
K
G
 
G
D
 
C
I
 
I
I
 
I
V
 
F
T
|
T
S
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
C
A
 
T
H
 
E
F
 
I
P
 
A
T
 
G
P
 
I
W
 
A
E
 
G
P
 
H
V
 
S
Y
|
Y
A
 
T
S
 
A
S
 
S
K
|
K
W
 
Y
A
 
G
V
 
I
N
 
V
C
 
G
F
 
L
V
 
M
Q
 
K
T
 
S
V
 
L
R
 
A
R
 
V
Q
 
E
V
 
L
F
 
G
K
 
S
H
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
A
G
 
N
S
 
C
I
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
F
P
 
G
V
|
V
I
 
L
T
 
T
S
 
G
L
 
I
L
 
V
A
 
P
D
 
D
W
 
D
P
 
E
A
 
A
E
 
S
K
 
K
L
 
L
-
 
M
-
 
F
-
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
M
-
 
S
A
 
K
E
 
V
A
 
G
K
 
N
A
 
L
S
 
K
G
 
G
S
 
K
L
 
I
I
 
L
E
 
T
A
 
A
A
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
V
V
 
T
V
 
V
L
 
L
F
 
Y
M
 
L

3rkrA Crystal structure of a metagenomic short-chain oxidoreductase (sdr) in complex with NADP (see paper)
30% identity, 96% coverage: 6:240/244 of query aligns to 2:219/221 of 3rkrA

query
sites
3rkrA
N
 
S
L
 
L
Q
 
S
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
F
 
A
A
 
A
S
 
I
A
 
A
Q
 
R
T
 
K
M
 
L
A
 
G
D
 
S
A
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
T
D
x
A
R
|
R
D
|
D
E
 
V
A
 
E
-
 
K
-
 
L
-
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
E
K
 
R
A
 
E
C
 
I
A
 
V
T
 
A
I
 
A
G
 
G
P
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
E
P
 
S
L
 
H
V
 
A
L
x
C
D
|
D
L
|
L
L
 
S
D
 
H
A
 
S
R
 
D
Q
 
A
C
 
I
A
 
A
S
 
A
L
 
F
L
 
A
Q
 
T
R
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
H
G
 
G
Q
 
R
L
 
C
D
 
D
I
 
V
F
 
L
H
 
V
A
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
L
x
V
-
x
G
Y
 
W
V
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
P
L
 
L
V
 
H
D
 
T
A
 
M
D
 
K
P
 
P
D
 
A
A
 
E
I
 
W
D
 
D
R
 
A
M
 
L
L
 
I
N
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
L
N
 
K
V
 
A
V
 
P
M
 
Y
K
 
L
N
 
L
V
 
L
H
 
R
N
 
A
V
 
F
L
 
A
P
 
P
H
 
A
M
 
M
I
 
I
E
 
A
R
 
A
G
 
K
T
 
R
G
 
G
D
 
H
I
 
I
I
 
I
V
 
N
T
 
I
S
 
S
S
|
S
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
K
F
 
N
P
 
P
T
 
V
P
 
A
W
 
D
E
 
G
P
 
A
V
 
A
Y
|
Y
A
 
T
S
 
A
S
 
S
K
|
K
W
 
W
A
 
G
V
 
L
N
 
N
C
 
G
F
 
L
V
 
M
Q
 
T
T
 
S
V
 
A
R
 
A
R
 
E
Q
 
E
V
 
L
F
 
R
K
 
Q
H
 
H
G
 
Q
I
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
S
S
 
L
I
 
V
S
 
A
P
 
P
G
 
G
P
 
S
V
 
V
I
 
A
T
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
-
D
 
-
W
 
-
P
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
I
E
 
E
A
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
A
F
 
L
M
 
L
L
 
A
T
 
T
R
 
Q
P
 
A
R
 
D
G
 
Q
M
 
S
T
 
F
I
 
I
R
 
S
D
 
E
V
 
V
V
 
L
M
 
V
M
 
R
P
 
P
T
 
T

4esoB Crystal structure of a putative oxidoreductase protein from sinorhizobium meliloti 1021 in complex with NADP
31% identity, 89% coverage: 6:223/244 of query aligns to 2:226/251 of 4esoB

query
sites
4esoB
N
 
N
L
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
V
 
K
A
 
A
A
 
I
I
 
V
T
 
I
G
|
G
A
 
G
A
x
T
S
x
H
G
|
G
I
x
M
G
 
G
F
 
L
A
 
A
S
 
T
A
 
V
Q
 
R
T
 
R
M
 
L
A
 
V
D
 
E
A
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
L
I
 
T
D
 
G
R
|
R
D
x
N
E
 
E
A
 
S
A
x
N
L
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
I
C
 
R
A
 
E
T
 
E
I
 
F
G
 
G
P
 
P
N
 
R
A
 
V
L
 
H
P
 
A
L
 
L
V
 
R
L
x
S
D
|
D
L
x
I
L
 
A
D
 
D
A
 
L
R
 
N
Q
 
E
C
 
I
A
 
A
S
 
V
L
 
L
L
 
G
Q
 
A
R
 
A
T
 
A
L
 
G
A
 
Q
L
 
T
A
 
L
G
 
G
Q
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
L
F
 
L
H
 
H
A
 
I
N
|
N
A
|
A
G
|
G
L
 
V
Y
 
S
V
 
E
G
 
L
G
 
E
D
 
P
L
 
F
V
 
D
D
 
Q
A
 
V
D
 
S
P
 
E
D
 
A
A
 
S
I
 
Y
D
 
D
R
 
R
M
 
Q
L
 
F
N
 
A
L
 
V
N
 
N
V
 
T
N
 
K
V
 
G
V
 
A
M
 
F
K
 
F
N
 
T
V
 
V
H
 
Q
N
 
R
V
 
L
L
 
T
P
 
P
H
 
-
M
 
L
I
 
I
E
 
R
R
 
E
G
 
G
T
 
-
G
 
G
D
 
S
I
 
I
I
 
V
V
 
F
T
|
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
A
A
 
D
H
 
E
F
 
G
P
 
G
T
 
H
P
 
P
W
 
G
E
x
M
P
 
S
V
 
V
Y
|
Y
A
 
S
S
 
A
S
 
S
K
|
K
W
 
A
A
 
A
V
 
L
N
 
V
C
 
S
F
 
F
V
 
A
Q
 
S
T
 
V
V
 
L
R
 
A
R
 
A
Q
 
E
V
 
L
F
 
L
K
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
P
 
F
V
x
I
I
 
D
T
|
T
S
 
P
L
x
T
-
x
K
-
x
G
L
 
V
A
 
A
D
 
G
W
 
I
P
 
T
A
 
E
E
 
A
K
 
E
L
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
F
K
 
K
A
 
T
S
 
L
G
 
G
S
 
D
L
 
N
I
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
N
-
 
G
E
 
T
A
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
R
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
M
 
L

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
31% identity, 89% coverage: 7:223/244 of query aligns to 3:222/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
|
S
-
 
E
-
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
S
 
T
A
 
A
Q
 
E
T
 
I
M
 
F
A
 
A
D
 
Q
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
I
I
 
V
D
|
D
R
x
L
D
 
D
E
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
S
A
 
Q
K
 
N
A
 
A
C
 
A
A
 
K
T
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
E
N
 
G
A
 
H
L
 
M
P
 
G
L
 
L
V
 
A
L
x
A
D
x
N
L
x
V
L
 
A
D
 
N
A
 
E
R
 
E
Q
 
Q
C
 
V
A
 
K
S
 
A
L
 
A
L
 
V
Q
 
E
R
 
Q
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
L
 
H
A
 
Y
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
F
 
L
H
 
I
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
L
 
I
Y
 
T
V
 
Q
G
 
P
G
 
I
D
 
K
L
 
T
V
 
L
D
 
D
A
 
I
D
 
Q
P
 
R
D
 
S
A
 
D
I
 
Y
D
 
D
R
 
R
M
 
V
L
 
L
N
 
D
L
x
V
N
 
S
V
 
L
N
 
R
V
 
G
V
 
T
M
 
L
K
 
I
N
 
M
V
 
S
H
 
Q
N
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
H
 
S
M
 
M
I
 
K
E
 
A
R
 
N
G
 
G
T
 
G
G
 
G
D
 
S
I
 
I
I
 
V
V
 
C
T
 
L
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
S
A
 
A
H
 
Q
F
 
R
P
 
G
T
 
G
P
 
G
-
 
I
-
 
F
W
 
G
E
 
G
P
 
P
V
 
H
Y
|
Y
A
 
S
S
 
A
S
 
A
K
|
K
W
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
L
C
 
G
F
 
L
V
 
A
Q
 
K
T
 
A
V
 
M
R
 
A
R
 
R
Q
 
E
V
 
F
F
 
G
K
 
G
H
 
D
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
N
S
 
S
I
 
L
S
 
T
P
 
P
G
 
G
P
 
L
V
x
I
I
 
Q
T
|
T
S
 
D
L
 
M
L
 
N
A
 
D
D
 
D
W
 
R
P
 
R
A
 
H
E
 
D
K
 
I
L
 
L
A
 
A
E
 
G
A
 
I
K
 
P
A
 
L
S
 
-
G
 
G
S
 
R
L
 
L
I
 
G
E
 
K
A
 
A
A
 
Q
E
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
N
V
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
M
 
L

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
30% identity, 89% coverage: 6:223/244 of query aligns to 3:227/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
N
 
R
L
 
L
Q
 
L
G
 
N
Q
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
N
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
F
 
L
A
 
A
S
 
T
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
M
 
F
A
 
V
D
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
V
 
F
L
 
I
I
 
V
D
 
G
R
|
R
D
x
R
E
 
R
A
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
E
K
 
Q
A
 
A
C
 
A
A
 
A
T
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
R
N
 
N
A
 
V
L
 
T
P
 
A
L
 
V
V
 
K
L
x
A
D
|
D
L
x
V
L
 
T
D
 
K
A
 
L
R
 
E
Q
 
D
C
 
L
A
 
D
S
 
R
L
 
L
L
 
Y
Q
 
A
R
 
I
T
 
V
L
 
R
A
 
E
L
 
Q
A
 
R
G
 
G
Q
 
S
L
 
I
D
 
D
I
 
V
F
 
L
H
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
A
Y
 
I
V
 
E
G
 
Q
G
 
K
D
 
T
L
 
L
V
 
E
D
 
E
A
 
I
D
 
T
P
 
P
D
 
E
A
 
H
I
 
Y
D
 
D
R
 
R
M
 
T
L
 
F
N
 
D
L
x
V
N
 
N
V
 
V
N
 
R
V
 
G
V
 
L
M
 
I
K
 
F
N
 
T
V
 
V
H
 
Q
N
 
K
V
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
L
M
 
L
I
 
-
E
 
-
R
 
R
G
 
D
T
 
G
G
 
G
D
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
L
T
 
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
A
A
 
G
H
 
V
F
 
L
P
 
G
T
 
L
P
 
Q
W
 
A
E
x
H
P
 
D
V
 
T
Y
|
Y
A
 
S
S
 
A
S
 
A
K
|
K
W
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
R
C
 
S
F
 
L
V
 
A
Q
 
R
T
 
T
V
 
W
R
 
T
R
 
T
Q
 
E
V
 
L
F
 
K
K
 
G
H
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
S
P
 
P
G
|
G
P
 
A
V
x
I
I
 
D
T
|
T
S
 
P
L
x
I
L
 
I
-
 
E
-
 
N
-
 
Q
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
x
Q
-
 
E
-
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
E
P
 
L
A
 
R
E
 
A
K
 
K
L
 
F
A
 
A
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
P
S
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
V
I
 
G
E
 
R
A
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
M
 
L

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
31% identity, 91% coverage: 7:227/244 of query aligns to 3:230/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
Q
 
D
G
 
N
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
L
A
 
A
S
 
V
A
 
A
Q
 
H
T
 
S
M
 
Y
A
 
A
D
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
V
I
 
S
D
|
D
R
x
I
D
 
N
E
 
E
A
 
D
A
 
H
L
 
G
A
 
N
K
 
K
A
 
A
C
 
V
A
 
E
T
 
D
I
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
Q
G
 
G
P
 
G
N
 
E
A
 
A
L
 
S
P
 
F
L
 
V
V
 
K
L
x
A
D
|
D
L
x
T
L
 
S
D
 
N
A
 
P
R
 
E
Q
 
E
C
 
V
A
 
E
S
 
A
L
 
L
L
 
V
Q
 
K
R
 
R
T
 
T
L
 
V
A
 
E
L
 
I
A
 
Y
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
F
 
A
H
 
C
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
-
Y
 
-
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
E
L
 
Q
V
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
G
D
 
D
A
 
Y
D
 
G
P
 
L
D
 
D
A
 
S
I
 
W
D
 
R
R
 
K
M
 
V
L
 
L
N
 
S
L
 
I
N
 
N
V
 
L
N
 
D
V
 
G
V
 
V
M
 
F
K
 
Y
N
 
G
V
 
C
H
 
K
N
 
Y
V
 
E
L
 
L
P
 
E
H
 
Q
M
 
M
I
 
E
E
 
K
R
 
N
G
 
G
T
 
G
G
 
G
D
 
V
I
 
I
I
 
V
V
 
N
T
x
M
S
 
A
S
|
S
L
 
I
A
 
H
A
 
G
H
 
I
F
 
V
P
 
A
T
 
A
P
 
P
W
 
L
E
 
S
P
 
S
V
 
A
Y
|
Y
A
 
T
S
 
S
S
 
A
K
|
K
W
 
H
A
 
A
V
 
V
N
 
V
C
 
G
F
 
L
V
 
T
Q
 
K
T
 
N
V
 
I
R
 
G
R
 
A
Q
 
E
V
 
Y
F
 
G
K
 
Q
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
G
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
G
P
|
P
G
x
A
P
x
Y
V
x
I
I
 
E
T
 
T
S
 
P
L
|
L
L
 
L
A
 
E
D
 
S
W
 
L
P
 
T
A
 
K
E
 
E
K
 
-
L
 
M
A
 
K
E
 
E
A
 
A
K
 
L
A
 
I
S
 
S
-
 
K
-
 
H
-
 
P
-
 
M
G
 
G
S
 
R
L
 
L
I
 
G
E
 
K
A
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
E
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
L
F
 
F
M
 
L
L
 
S
T
 
S
R
 
E
P
 
K

P08074 Carbonyl reductase [NADPH] 2; Adipocyte protein P27; AP27; Lung carbonyl reductase; LCR; NADPH-dependent carbonyl reductase 2; EC 1.1.1.184 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
30% identity, 90% coverage: 6:225/244 of query aligns to 4:224/244 of P08074

query
sites
P08074
N
 
N
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
L
V
 
R
A
 
A
A
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
F
x
R
A
x
D
S
x
T
A
x
V
Q
x
K
T
x
A
M
x
L
A
x
H
D
x
A
A
x
S
G
|
G
A
|
A
R
x
K
V
|
V
V
|
V
L
x
A
I
x
V
D
x
T
R
|
R
-
 
T
-
 
N
-
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
C
 
C
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
P
 
P
N
 
G
A
 
I
L
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
C
L
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
G
D
 
D
A
 
W
R
 
D
Q
 
A
C
 
T
A
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
E
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
G
A
 
I
G
 
G
Q
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
L
F
 
L
H
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
A
L
 
L
Y
 
V
V
 
I
G
 
M
G
 
Q
D
 
P
L
 
F
V
 
L
D
 
E
A
 
V
D
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
D
R
 
R
M
 
S
L
 
F
N
 
S
L
 
V
N
 
N
V
 
L
N
 
R
V
 
S
V
 
V
M
 
F
K
 
Q
N
 
V
V
 
S
H
 
Q
N
 
M
V
 
V
L
 
A
P
 
R
H
 
D
M
 
M
I
 
I
E
 
N
R
 
R
G
 
G
T
 
V
-
 
P
G
 
G
D
 
S
I
 
I
I
 
V
V
 
N
T
 
V
S
 
S
S
 
S
L
 
M
A
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
V
P
 
T
T
 
F
P
 
P
W
 
N
E
 
L
P
 
I
V
 
T
Y
 
Y
A
 
S
S
 
S
S
 
T
K
 
K
W
 
G
A
 
A
V
 
M
N
 
T
C
 
M
F
 
L
V
 
T
Q
 
K
T
 
A
V
 
M
R
 
A
R
 
M
Q
 
E
V
 
L
F
 
G
K
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
N
P
 
P
G
 
T
P
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
S
 
D
L
 
M
L
 
G
A
 
K
D
 
K
W
 
V
P
 
S
A
 
A
E
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
R
K
 
H
A
 
P
S
 
L
G
 
R
S
 
K
L
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
V
A
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
V
E
 
N
V
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
F
M
 
L
L
 
L
T
 
S

1cydA Carbonyl reductase complexed with NADPH and 2-propanol (see paper)
30% identity, 90% coverage: 6:225/244 of query aligns to 2:222/242 of 1cydA

query
sites
1cydA
N
 
N
L
 
F
Q
 
S
G
 
G
Q
 
L
V
 
R
A
 
A
A
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
D
S
 
T
A
 
V
Q
 
K
T
 
A
M
 
L
A
 
H
D
 
A
A
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
A
I
 
V
D
 
T
R
|
R
-
x
T
-
 
N
-
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
C
 
C
A
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
P
 
P
N
 
G
A
 
I
L
 
E
P
 
P
L
 
V
V
 
C
L
 
V
D
|
D
L
|
L
L
 
G
D
 
D
A
 
W
R
 
D
Q
 
A
C
 
T
A
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
Q
 
E
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
G
L
 
G
A
 
I
G
 
G
Q
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
L
F
 
L
H
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
L
 
L
Y
 
V
V
 
I
G
 
M
G
 
Q
D
 
P
L
 
F
V
 
L
D
 
E
A
 
V
D
 
T
P
 
K
D
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
D
R
 
R
M
 
S
L
 
F
N
 
S
L
x
V
N
 
N
V
 
L
N
 
R
V
 
S
V
 
V
M
 
F
K
 
Q
N
 
V
V
 
S
H
 
Q
N
 
M
V
 
V
L
 
A
P
 
R
H
 
D
M
 
M
I
 
I
E
 
N
R
 
R
G
 
G
T
 
V
-
 
P
G
 
G
D
 
S
I
 
I
I
 
V
V
 
N
T
x
V
S
 
S
S
|
S
L
 
M
A
 
V
A
 
A
H
 
H
F
 
V
P
 
T
T
 
F
P
 
P
W
 
N
E
x
L
P
 
I
V
 
T
Y
|
Y
A
 
S
S
 
S
S
 
T
K
|
K
W
 
G
A
 
A
V
 
M
N
 
T
C
 
M
F
 
L
V
 
T
Q
 
K
T
 
A
V
 
M
R
 
A
R
 
M
Q
 
E
V
 
L
F
 
G
K
 
P
H
 
H
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
N
S
 
S
I
 
V
S
 
N
P
|
P
G
x
T
P
x
V
V
|
V
I
 
L
T
|
T
S
 
D
L
x
M
L
x
G
A
 
K
D
 
K
W
x
V
P
 
S
A
 
A
E
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
R
K
 
K
L
 
L
A
 
K
E
 
E
A
 
R
K
 
H
A
 
P
S
 
L
G
 
R
S
 
K
L
 
F
I
 
A
E
 
E
A
 
V
A
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
V
E
 
N
V
 
S
V
 
I
L
 
L
F
 
F
M
 
L
L
 
L
T
 
S

4yacA Crystal structure of ligo in complex with nadh from sphingobium sp. Strain syk-6 (see paper)
31% identity, 75% coverage: 5:186/244 of query aligns to 2:188/270 of 4yacA

query
sites
4yacA
R
 
Q
N
 
D
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
F
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
 
V
G
 
A
F
 
L
A
 
G
S
 
Q
A
 
A
Q
 
K
T
 
V
M
 
L
A
 
A
D
 
E
-
 
E
A
 
A
G
 
Q
A
 
M
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
A
D
|
D
R
x
I
D
 
R
E
 
Q
A
 
D
A
x
H
L
 
L
A
 
D
K
 
E
A
 
A
C
 
M
A
 
G
T
 
Y
I
 
F
G
 
S
P
 
Q
N
 
K
A
 
N
L
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
H
P
 
P
L
 
V
V
 
R
L
|
L
D
|
D
L
|
L
L
 
T
D
 
D
A
 
R
R
 
A
Q
 
A
C
 
Y
A
 
A
S
 
A
L
 
A
L
 
V
Q
 
D
R
 
E
T
 
A
L
 
E
A
 
Q
L
 
V
A
 
F
G
 
G
Q
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
L
F
 
L
H
 
C
A
 
N
N
 
T
A
 
A
G
 
G
L
 
V
Y
 
S
V
 
Q
G
 
F
G
 
G
D
 
P
L
 
I
V
 
E
D
 
K
A
 
A
D
 
T
P
 
F
D
 
D
A
 
D
I
 
W
D
 
D
R
 
W
M
 
Q
L
 
M
N
 
D
L
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
G
V
 
V
M
 
I
K
 
N
N
 
G
V
 
V
H
 
M
N
 
T
V
 
V
L
 
M
P
 
P
H
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
R
 
R
G
 
G
T
 
Q
-
 
G
G
 
G
D
 
H
I
 
I
I
 
L
V
 
I
T
 
T
S
 
A
S
|
S
L
 
M
A
 
S
A
 
A
H
 
F
F
 
V
P
 
A
T
 
L
P
 
P
W
 
T
E
 
T
P
 
G
V
 
I
Y
|
Y
A
 
C
S
 
T
S
 
T
K
|
K
W
 
Y
A
 
A
V
 
V
N
 
R
C
 
G
F
 
L
V
 
A
Q
 
E
T
 
S
V
 
L
R
 
R
R
 
V
Q
 
E
V
 
M
F
 
P
K
 
K
H
 
Y
G
 
N
I
 
I
R
 
G
V
 
V
G
 
S
S
 
L
I
 
L
S
 
C
P
 
P
G
 
G

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
30% identity, 89% coverage: 7:223/244 of query aligns to 4:227/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
L
 
L
Q
 
L
G
 
N
Q
 
K
V
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
L
A
 
A
S
 
T
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
M
 
F
A
 
V
D
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
V
 
F
L
 
I
I
 
V
D
 
G
R
|
R
D
x
R
E
 
R
A
 
K
A
 
E
L
 
L
A
 
E
K
 
Q
A
 
A
C
 
A
A
 
A
T
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
R
N
 
N
A
 
V
L
 
T
P
 
A
L
 
V
V
 
K
L
 
A
D
|
D
L
x
V
L
 
T
D
 
K
A
 
L
R
 
E
Q
 
D
C
 
L
A
 
D
S
 
R
L
 
L
L
 
Y
Q
 
A
R
 
I
T
 
V
L
 
R
A
 
E
L
 
Q
A
 
R
G
 
G
Q
 
S
L
 
I
D
 
D
I
 
V
F
 
L
H
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
L
 
A
Y
 
V
V
 
E
G
 
Q
G
 
K
D
 
T
L
 
L
V
 
E
D
 
E
A
 
I
D
 
T
P
 
P
D
 
E
A
 
H
I
 
Y
D
 
D
R
 
R
M
 
T
L
 
F
N
 
D
L
x
V
N
 
N
V
 
V
N
 
R
V
 
G
V
 
L
M
 
I
K
 
F
N
 
T
V
 
V
H
 
Q
N
 
K
V
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
L
M
 
L
I
 
-
E
 
-
R
 
R
G
 
D
T
 
G
G
 
G
D
 
S
I
 
V
I
 
I
V
 
L
T
|
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
A
A
 
G
H
 
V
F
 
L
P
 
G
T
 
L
P
 
Q
W
 
A
E
x
H
P
 
D
V
 
T
Y
|
Y
A
 
S
S
 
A
S
 
A
K
|
K
W
 
A
A
 
A
V
 
V
N
 
R
C
 
S
F
 
L
V
 
A
Q
 
R
T
 
T
V
 
W
R
 
T
R
 
T
Q
 
E
V
 
L
F
 
K
K
 
G
H
 
R
G
 
S
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
S
P
|
P
G
|
G
P
x
A
V
x
I
I
 
D
T
|
T
S
 
P
L
x
S
L
|
L
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
Q
-
 
E
-
 
E
A
 
A
D
 
D
W
 
E
P
 
L
A
 
R
E
 
A
K
 
K
L
 
A
A
 
A
E
 
A
A
 
A
K
 
T
A
 
P
S
 
L
G
 
G
S
 
R
L
 
V
I
 
G
E
 
R
A
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
A
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
M
 
L

Sites not aligning to the query:

6b9uA Crystal structure of 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from brucella melitensis complexed with nadh
29% identity, 95% coverage: 6:237/244 of query aligns to 1:236/244 of 6b9uA

query
sites
6b9uA
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
I
x
F
G
 
G
F
 
E
A
 
G
S
 
M
A
 
A
Q
 
K
T
 
R
M
 
F
A
 
A
D
 
K
A
 
G
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
V
D
|
D
R
|
R
D
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
G
L
 
A
A
 
E
K
 
R
A
 
V
C
 
A
A
 
G
T
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
D
N
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
A
L
 
V
V
 
A
L
x
A
D
|
D
L
x
I
L
 
S
D
 
K
A
 
E
R
 
A
Q
 
D
C
 
V
A
 
D
S
 
A
L
 
A
L
 
V
Q
 
E
R
 
A
T
 
A
L
 
L
A
 
S
L
 
K
A
 
F
G
 
G
Q
 
K
L
 
V
D
 
D
I
 
I
F
 
L
H
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
L
 
I
Y
 
G
-
 
H
-
 
K
-
 
P
V
 
Q
G
 
N
G
 
A
D
 
E
L
 
L
V
 
V
D
 
-
A
 
-
D
 
E
P
 
P
D
 
E
A
 
E
I
 
F
D
 
D
R
 
R
M
 
I
L
 
V
N
 
G
L
 
V
N
 
N
V
 
V
N
 
R
V
 
G
V
 
V
M
 
Y
K
 
L
N
 
M
V
 
T
H
 
R
N
 
K
V
 
L
L
 
I
P
 
P
H
 
H
M
 
F
I
 
K
E
 
E
R
 
N
G
 
G
T
 
A
G
 
K
D
 
G
-
 
Q
-
 
E
-
 
C
-
 
V
I
 
I
I
 
L
V
 
N
T
x
V
S
 
A
S
|
S
L
 
T
A
 
G
A
 
A
H
 
G
F
 
R
P
 
P
T
 
R
P
 
P
W
 
N
E
x
L
P
 
A
V
 
W
Y
|
Y
A
 
N
S
 
A
S
 
T
K
|
K
W
 
G
A
 
W
V
 
V
N
 
V
C
 
S
F
 
V
V
 
T
Q
 
K
T
 
A
V
 
L
R
 
A
R
 
I
Q
 
E
V
 
L
F
 
A
K
 
P
H
 
A
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
G
 
V
S
 
A
I
 
L
S
 
N
P
 
P
G
 
V
P
x
A
V
x
G
I
 
E
T
|
T
S
x
P
L
|
L
L
 
L
A
 
T
D
 
T
W
x
F
P
 
M
A
 
R
E
 
K
K
 
K
L
 
F
A
 
R
E
 
D
A
 
S
K
 
I
A
 
P
S
 
M
G
 
G
S
 
R
L
 
L
I
 
L
E
 
K
A
 
P
A
 
D
E
 
D
V
 
L
A
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
A
L
 
A
F
 
F
M
 
L
L
 
C
T
 
S
R
 
-
P
 
P
R
 
Q
G
 
A
M
 
S
T
 
M
I
 
I
R
 
T
D
 
G
V
 
V
V
 
A
M
 
L

6ci9D Rmm microcompartment-associated aminopropanol dehydrogenase NADP + aminoacetone holo-structure (see paper)
29% identity, 90% coverage: 6:225/244 of query aligns to 6:232/259 of 6ci9D

query
sites
6ci9D
N
 
S
L
 
L
Q
 
E
G
 
G
Q
 
R
V
 
S
A
 
A
A
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
S
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
F
 
R
A
 
G
S
 
I
A
 
A
Q
 
E
T
 
T
M
 
F
A
 
A
D
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
V
R
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
T
D
x
G
R
|
R
D
x
N
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
T
C
 
V
A
 
A
T
 
D
I
 
L
G
 
S
P
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
G
N
 
K
A
 
V
L
 
T
P
 
A
L
 
V
V
 
R
L
 
A
D
|
D
L
x
V
L
 
T
D
 
D
A
 
P
R
 
E
Q
 
D
C
 
A
A
 
R
S
 
R
L
 
T
L
 
V
Q
 
A
R
 
E
T
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
R
A
 
H
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
I
F
 
V
H
 
C
A
 
A
N
|
N
A
 
A
G
|
G
L
 
I
Y
x
F
V
 
P
G
 
S
G
 
G
D
 
R
L
 
L
V
 
E
D
 
D
A
 
L
D
 
T
P
 
P
D
 
D
A
 
D
I
 
I
D
 
E
R
 
Q
M
 
V
L
 
L
N
 
G
L
 
V
N
 
N
V
 
F
N
 
K
V
 
G
V
 
T
M
 
V
K
 
Y
N
 
I
V
 
V
H
 
Q
N
 
A
V
 
A
L
 
L
P
 
Q
H
 
A
M
 
L
I
 
T
E
 
A
R
 
S
G
 
G
T
 
H
G
 
G
D
 
R
I
 
V
I
 
V
V
 
V
T
|
T
S
 
S
S
|
S
L
 
I
A
x
T
A
 
G
H
 
P
F
 
I
P
 
T
-
 
G
T
 
Y
P
 
P
W
 
G
E
x
W
P
 
S
V
 
H
Y
|
Y
A
 
G
S
 
A
S
 
S
K
|
K
W
 
A
A
 
A
V
 
Q
N
 
L
C
 
G
F
 
F
V
 
L
Q
 
R
T
 
T
V
 
A
R
 
A
R
 
M
Q
 
E
V
 
L
F
 
A
K
 
P
H
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
I
G
 
N
S
 
A
I
 
V
S
 
L
P
|
P
G
|
G
P
x
N
V
x
I
I
 
M
T
|
T
S
 
E
L
x
G
L
|
L
A
 
D
D
 
E
W
 
M
P
 
G
A
 
Q
-
 
D
-
 
Y
-
 
L
E
 
D
K
 
Q
L
 
M
A
 
A
E
 
S
A
 
A
K
 
I
A
 
P
S
 
A
G
 
G
S
 
R
L
 
L
I
 
G
E
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
D
V
 
I
A
 
G
E
 
N
V
 
A
V
 
A
L
 
L
F
 
F
M
 
F
L
 
A
T
 
T

Query Sequence

>Ac3H11_2940 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_2940
MSAARNLQGQVAAITGAASGIGFASAQTMADAGARVVLIDRDEAALAKACATIGPNALPL
VLDLLDARQCASLLQRTLALAGQLDIFHANAGLYVGGDLVDADPDAIDRMLNLNVNVVMK
NVHNVLPHMIERGTGDIIVTSSLAAHFPTPWEPVYASSKWAVNCFVQTVRRQVFKHGIRV
GSISPGPVITSLLADWPAEKLAEAKASGSLIEAAEVAEVVLFMLTRPRGMTIRDVVMMPT
NFDL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory