SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_3083 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3083 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1gawB Crystal structure analysis of the ferredoxin-NADP+ reductase from maize leaf (see paper)
36% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 20:305/305 of 1gawB

query
sites
1gawB
T
 
T
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
L
N
 
N
F
 
T
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
T
-
 
E
G
 
G
S
 
K
M
 
I
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
A
P
 
D
G
 
G
T
 
V
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
V
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
I
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
S
N
 
K
N
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
L
T
 
I
T
x
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
I
V
 
V
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
Q
V
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
N
V
 
V
Q
 
Q
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
A
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
F
R
 
E
S
 
K
S
 
H
G
 
D
K
 
D
F
 
Y
E
 
K
G
 
F
G
 
N
K
 
G
L
 
L
-
 
G
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
-
 
K
-
 
E
-
 
E
F
 
F
G
 
G
P
 
K
L
 
M
Q
 
K
N
 
E
L
 
R
P
 
A
K
 
P
D
 
E
F
 
N
I
 
F
D
 
R
I
 
V
N
 
D
L
 
Y
A
 
A
F
 
V
S
 
S
R
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
T
T
 
N
A
 
A
G
 
A
Q
 
G
P
 
E
K
 
R
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
E
R
 
Y
A
 
K
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
Y
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
E
E
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
F
T
 
D
V
 
Y
G
 
K
A
 
K
A
 
Q
L
 
L
Q
 
K
R
 
R
E
 
G
G
 
D
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
|
Y

3vo2A Crystal structure of zea mays leaf ferredoxin-NADP+ reductase iii (see paper)
36% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 11:296/296 of 3vo2A

query
sites
3vo2A
T
 
T
N
 
N
L
 
K
F
 
Y
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
S
N
 
N
F
 
T
N
 
R
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
T
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
I
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
A
P
 
D
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
L
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
S
N
 
K
N
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
|
V
K
 
K
R
 
R
-
x
L
V
 
V
T
x
Y
T
 
T
D
 
N
H
 
D
D
 
Q
G
 
G
N
 
E
A
 
I
V
 
V
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
A
K
 
D
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
A
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
L
R
 
E
S
 
E
S
 
H
G
 
E
K
 
D
F
 
Y
E
 
K
-
 
F
G
 
S
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
D
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
L
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
P
 
K
K
 
E
-
 
M
-
 
A
-
 
P
D
 
D
F
 
N
I
 
F
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
 
S
R
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
T
T
 
N
A
 
A
G
 
A
Q
 
G
P
 
E
K
 
K
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
E
R
 
Y
A
 
R
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
Y
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
L
D
 
N
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
M
T
 
Q
V
 
Y
G
 
K
A
 
K
A
 
Q
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
G
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
|
Y

1ewyA Anabaena pcc7119 ferredoxin:ferredoxin-NADP+-reductase complex (see paper)
34% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 12:303/303 of 1ewyA

query
sites
1ewyA
T
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
K
 
N
S
 
A
P
 
P
T
 
F
E
 
I
A
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
S
N
 
N
F
 
E
N
 
P
C
 
L
T
 
V
E
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
I
N
 
G
E
 
I
T
 
V
H
 
Q
H
 
H
V
 
I
V
 
K
L
 
F
D
 
D
F
 
L
G
 
T
S
 
G
M
 
G
P
 
N
F
 
L
P
 
K
V
 
Y
L
 
I
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
V
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
E
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
G
E
 
D
R
 
D
P
 
V
G
 
D
Y
 
D
N
 
K
N
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
 
R
R
 
Q
V
x
L
T
 
E
T
x
Y
D
 
K
H
 
H
-
 
P
-
 
E
D
 
S
G
 
G
N
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
Y
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
T
F
 
Y
V
 
L
C
 
T
D
 
H
L
 
I
K
 
E
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
D
H
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
A
H
 
N
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
M
R
 
R
A
 
T
M
 
Y
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
R
-
 
M
-
 
F
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
R
 
R
R
 
A
L
 
A
R
 
N
S
 
P
S
 
E
G
 
Y
K
 
Q
F
 
F
E
 
K
G
 
G
G
 
F
K
 
S
L
 
-
M
 
W
L
 
L
F
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
T
Q
 
P
E
 
N
L
 
I
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
L
Q
 
E
N
 
E
L
 
I
P
 
Q
K
 
Q
D
 
K
F
 
Y
I
 
P
D
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
R
I
 
L
N
 
T
L
 
Y
A
 
A
F
 
I
S
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
K
Q
 
N
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
K
 
R
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
L
 
R
M
 
V
R
 
A
E
 
E
R
 
H
A
 
A
A
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
K
D
 
N
G
 
Q
S
 
K
G
 
T
H
 
H
F
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
|
C
G
 
G
L
 
L
K
 
R
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
S
D
 
A
I
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
T
W
 
W
D
 
S
T
 
D
V
 
Y
G
 
Q
A
 
K
A
 
D
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
|
E
T
 
T
Y
|
Y

1queA X-ray structure of the ferredoxin:nadp+ reductase from the cyanobacterium anabaena pcc 7119 at 1.8 angstroms (see paper)
34% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 12:303/303 of 1queA

query
sites
1queA
T
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
K
 
N
S
 
A
P
 
P
T
 
F
E
 
I
A
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
S
N
 
N
F
 
E
N
 
P
C
 
L
T
 
V
E
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
I
N
 
G
E
 
I
T
 
V
H
 
Q
H
 
H
V
 
I
V
 
K
L
 
F
D
 
D
F
 
L
G
 
T
S
 
G
M
 
G
P
 
N
F
 
L
P
 
K
V
 
Y
L
 
I
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
V
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
E
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
G
E
 
D
R
 
D
P
 
V
G
 
D
Y
 
D
N
 
K
N
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
 
R
R
 
Q
V
x
L
T
 
E
T
x
Y
D
x
K
H
 
H
-
 
P
-
 
E
D
 
S
G
 
G
N
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
Y
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
T
F
 
Y
V
 
L
C
 
T
D
 
H
L
 
I
K
 
E
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
D
H
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
A
H
 
N
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
A
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
M
R
 
R
A
 
T
M
 
Y
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
R
-
 
M
-
 
F
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
R
 
R
R
 
A
L
 
A
R
 
N
S
 
P
S
 
E
G
 
Y
K
 
Q
F
 
F
E
 
K
G
 
G
G
 
F
K
 
S
L
 
-
M
 
W
L
 
L
F
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
T
Q
 
P
E
 
N
L
 
I
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
L
Q
 
E
N
 
E
L
 
I
P
 
Q
K
 
Q
D
 
K
F
 
Y
I
 
P
D
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
R
I
 
L
N
 
T
L
 
Y
A
 
A
F
 
I
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
K
Q
 
N
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
K
x
R
R
 
M
Y
|
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
L
 
R
M
 
V
R
 
A
E
 
E
R
 
H
A
 
A
A
 
D
D
 
Q
L
 
L
A
 
W
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
K
D
 
N
G
 
Q
S
 
K
G
 
T
H
 
H
F
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
|
C
G
 
G
L
 
L
K
 
R
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
S
D
 
A
I
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
T
W
 
W
D
 
S
T
 
D
V
 
Y
G
 
Q
A
 
K
A
 
D
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
|
E
T
 
T
Y
|
Y

1gjrA Ferredoxin-NADP+ reductase complexed with NADP+ by cocrystallization (see paper)
34% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 4:295/295 of 1gjrA

query
sites
1gjrA
T
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
K
 
N
S
 
A
P
 
P
T
 
F
E
 
I
A
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
S
N
 
N
F
 
E
N
 
P
C
 
L
T
 
V
E
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
I
N
 
G
E
 
I
T
 
V
H
 
Q
H
 
H
V
 
I
V
 
K
L
 
F
D
 
D
F
 
L
G
 
T
S
 
G
M
 
G
P
 
N
F
 
L
P
 
K
V
 
Y
L
 
I
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
V
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
E
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
G
E
 
D
R
 
D
P
 
V
G
 
D
Y
 
D
N
 
K
N
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
x
R
R
 
Q
V
x
L
T
 
E
T
x
Y
D
 
K
H
 
H
-
 
P
-
 
E
D
 
S
G
 
G
N
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
Y
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
T
F
 
Y
V
 
L
C
 
T
D
 
H
L
 
I
K
 
E
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
D
H
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
A
H
 
N
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
A
T
|
T
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
M
R
 
R
A
 
T
M
 
Y
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
R
-
 
M
-
 
F
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
R
 
R
R
 
A
L
 
A
R
 
N
S
 
P
S
 
E
G
 
Y
K
 
Q
F
 
F
E
 
K
G
 
G
G
 
F
K
 
S
L
 
-
M
 
W
L
 
L
F
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
V
R
x
P
T
 
T
Q
 
T
Q
 
P
E
 
N
L
 
I
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
L
Q
 
E
N
 
E
L
 
I
P
 
Q
K
 
Q
D
 
K
F
 
Y
I
 
P
D
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
R
I
 
L
N
 
T
L
 
Y
A
 
A
F
 
I
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
K
Q
 
N
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
K
x
R
R
 
M
Y
|
Y
V
 
I
Q
|
Q
D
 
D
L
 
R
M
 
V
R
 
A
E
 
E
R
 
H
A
 
A
A
 
D
D
 
Q
L
 
L
A
 
W
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
K
D
 
N
G
 
Q
S
 
K
G
 
T
H
 
H
F
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
|
C
G
|
G
L
|
L
K
 
R
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
S
D
 
A
I
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
T
W
 
W
D
 
S
T
 
D
V
 
Y
G
 
Q
A
 
K
A
 
D
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
|
E
T
 
T
Y
|
Y

2b5oA Ferredoxin-NADP reductase
34% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 4:292/292 of 2b5oA

query
sites
2b5oA
T
 
V
N
 
N
L
 
I
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
K
 
K
S
 
T
P
 
P
T
 
F
E
 
L
A
 
G
T
 
K
V
 
C
V
 
I
G
 
E
N
 
N
F
 
Y
N
 
E
C
 
L
T
 
V
E
 
D
A
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
S
N
 
G
E
 
T
T
 
V
H
 
R
H
 
H
V
 
V
V
 
T
L
 
F
D
 
D
F
 
I
G
 
S
S
 
E
M
 
G
P
 
D
F
 
L
P
 
R
V
 
Y
L
 
L
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
G
E
 
D
R
 
M
P
 
E
G
 
D
Y
 
N
N
 
K
N
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
 
R
R
 
Q
V
 
L
T
 
E
T
x
Y
D
 
Q
-
 
D
-
 
P
H
 
E
D
 
S
G
 
G
N
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
Y
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
T
F
 
Y
V
 
L
C
 
C
D
 
N
L
 
L
K
 
P
V
 
V
G
 
G
-
 
T
D
 
D
K
 
D
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
D
H
 
D
P
 
E
R
 
D
S
 
A
H
 
T
I
 
V
V
 
V
M
 
M
I
 
L
C
 
A
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
A
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
R
-
 
M
-
 
F
R
 
K
R
 
E
L
 
Q
R
 
H
S
 
E
S
 
D
G
 
Y
K
 
K
F
 
F
E
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
Y
Q
 
T
Q
 
A
E
 
N
L
 
I
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
D
P
 
D
L
 
F
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
P
 
A
K
 
A
-
 
E
-
 
N
-
 
P
D
 
D
F
 
N
I
 
F
D
 
R
I
 
L
N
 
T
L
 
Y
A
 
A
F
 
I
S
 
S
R
 
R
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
T
 
T
A
 
A
G
 
D
Q
 
G
P
 
G
K
 
K
R
 
V
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
D
 
S
L
 
R
M
 
V
R
 
S
E
 
E
R
 
Y
A
 
A
A
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
F
A
 
E
L
 
M
L
 
I
R
 
Q
D
 
K
G
 
P
S
 
N
G
 
T
H
 
H
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
Q
E
 
P
G
 
P
V
 
I
V
 
D
M
 
E
A
 
T
L
 
F
R
 
T
D
 
A
I
 
E
A
 
A
S
 
E
E
 
K
A
 
R
G
 
G
L
 
L
D
 
N
W
 
W
D
 
E
T
 
E
V
 
M
G
 
R
A
 
R
A
 
S
L
 
M
Q
 
K
R
 
K
E
 
E
G
 
H
R
 
R
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
|
Y

P00455 Ferredoxin--NADP reductase, chloroplastic; FNR; EC 1.18.1.2 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 3 papers)
34% identity, 66% coverage: 144:422/422 of query aligns to 85:369/369 of P00455

query
sites
P00455
N
 
N
L
 
K
F
 
F
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
T
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
L
N
 
N
F
 
T
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
H
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
I
P
 
P
F
 
Y
P
 
-
V
 
-
L
 
R
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
D
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
L
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
A
N
 
K
N
 
S
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
 
L
T
 
I
T
x
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
T
V
 
I
R
 
K
G
 
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
A
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
G
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
F
R
 
E
S
 
K
S
 
H
G
 
D
K
 
D
F
 
Y
E
 
K
-
 
F
G
 
N
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
P
 
K
K
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
P
D
 
D
F
 
N
I
 
F
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
T
Q
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
G
P
 
E
K
 
K
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
A
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
M
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
V
 
M
C
 
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
I
T
 
E
V
 
Y
G
 
K
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

P10933 Ferredoxin--NADP reductase, leaf isozyme, chloroplastic; FNR; EC 1.18.1.2 from Pisum sativum (Garden pea) (Lathyrus oleraceus) (see 2 papers)
35% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 75:360/360 of P10933

query
sites
P10933
T
 
V
N
 
N
L
 
K
F
 
F
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
L
N
 
N
F
 
T
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
T
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
P
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
I
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
S
N
 
K
N
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
|
V
K
|
K
R
 
R
V
 
L
T
 
V
T
x
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
V
V
 
V
R
 
K
G
 
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
G
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
F
R
 
E
S
 
K
S
 
H
G
 
E
K
 
D
F
 
Y
E
 
Q
-
 
F
G
 
N
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
x
V
R
x
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
A
P
 
P
K
 
E
D
 
N
F
 
F
I
 
-
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
V
Q
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
G
P
 
E
K
|
K
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
F
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
 
C
G
|
G
L
|
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
I
T
 
E
V
 
Y
G
 
K
A
 
R
A
 
T
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
|
Y

3mhpA Fnr-recruitment to the thylakoid (see paper)
35% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 10:295/296 of 3mhpA

query
sites
3mhpA
T
 
V
N
 
N
L
 
K
F
 
F
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
x
L
N
 
N
F
x
T
N
x
K
C
x
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
|
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
T
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
P
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
I
G
 
G
E
 
D
R
x
F
P
x
G
G
 
D
Y
 
S
N
 
K
N
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
 
K
R
 
R
V
x
L
T
 
V
T
 
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
V
V
 
V
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
G
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
|
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
x
F
R
x
E
S
x
K
S
 
H
G
x
E
K
 
D
F
 
Y
E
 
Q
-
 
F
G
 
N
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
x
S
Q
x
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
x
E
P
x
E
L
 
F
Q
 
E
N
x
K
L
 
M
-
 
K
-
 
E
-
x
K
-
 
A
P
 
P
K
 
E
D
 
N
F
 
F
I
 
-
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
V
Q
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
G
P
 
E
K
 
K
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
F
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
I
T
 
E
V
 
Y
G
 
K
A
 
R
A
 
T
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
|
Y

1qgaA Pea fnr y308w mutant in complex with NADP+ (see paper)
34% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 23:308/308 of 1qgaA

query
sites
1qgaA
T
 
V
N
 
N
L
 
K
F
 
F
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
L
N
 
N
F
 
T
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
T
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
P
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
I
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
S
N
 
K
N
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
|
K
R
 
R
V
x
L
T
 
V
T
x
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
V
V
 
V
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
G
T
 
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
F
R
 
E
S
 
K
S
 
H
G
 
E
K
 
D
F
 
Y
E
 
Q
-
 
F
G
 
N
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
x
V
R
x
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
A
P
 
P
K
 
E
D
 
N
F
 
F
I
 
-
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
V
Q
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
G
P
 
E
K
|
K
R
 
M
Y
|
Y
V
 
I
Q
|
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
F
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
|
G
L
|
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
I
T
 
E
V
 
Y
G
 
K
A
 
R
A
 
T
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
x
W

1fncA Refined crystal structure of spinach ferredoxin reductase at 1.7 angstroms resolution: oxidized, reduced, and 2'-phospho-5'-amp bound states (see paper)
34% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 11:296/296 of 1fncA

query
sites
1fncA
T
 
V
N
 
N
L
 
K
F
 
F
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
T
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
L
N
 
N
F
 
T
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
H
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
I
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
D
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
L
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
A
N
 
K
N
 
S
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
|
K
R
 
R
V
x
L
T
 
I
T
x
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
T
V
 
I
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
A
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
G
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
F
R
 
E
S
 
K
S
 
H
G
 
D
K
 
D
F
 
Y
E
 
K
-
 
F
G
 
N
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
x
V
R
x
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
P
 
K
K
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
P
D
 
D
F
 
N
I
 
F
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
T
Q
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
G
P
 
E
K
|
K
R
 
M
Y
|
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
A
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
M
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
Y
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
 
G
L
|
L
K
 
K
S
x
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
I
T
 
E
V
 
Y
G
 
K
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
|
Y

1bx0A Ferredoxin:nadp+ oxidoreductase (ferredoxin reductase) mutant e312l (see paper)
34% identity, 66% coverage: 143:422/422 of query aligns to 11:296/296 of 1bx0A

query
sites
1bx0A
T
 
V
N
 
N
L
 
K
F
 
F
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
T
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
L
N
 
N
F
 
T
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
H
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
I
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
D
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
L
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
A
N
 
K
N
 
S
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
L
T
 
I
T
x
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
T
V
 
I
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
A
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
I
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
G
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
F
R
 
E
S
 
K
S
 
H
G
 
D
K
 
D
F
 
Y
E
 
K
-
 
F
G
 
N
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
P
 
K
K
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
P
D
 
D
F
 
N
I
 
F
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
T
Q
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
G
P
 
E
K
 
K
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
A
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
M
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
I
T
 
E
V
 
Y
G
 
K
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
x
L
T
 
V
Y
|
Y

1qfzA Pea fnr y308s mutant in complex with NADPH (see paper)
35% identity, 66% coverage: 143:421/422 of query aligns to 23:307/308 of 1qfzA

query
sites
1qfzA
T
 
V
N
 
N
L
 
K
F
 
F
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
L
N
 
N
F
 
T
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
T
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
P
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
I
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
S
N
 
K
N
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
|
K
R
 
R
V
x
L
T
 
V
T
x
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
V
V
 
V
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
G
T
 
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
F
R
 
E
S
 
K
S
 
H
G
 
E
K
 
D
F
 
Y
E
 
Q
-
 
F
G
 
N
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
x
V
R
x
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
A
P
 
P
K
 
E
D
 
N
F
 
F
I
 
-
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
V
Q
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
G
P
 
E
K
 
K
R
 
M
Y
|
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
F
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
|
G
L
|
L
K
 
K
S
x
G
M
 
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
I
T
 
E
V
 
Y
G
 
K
A
 
R
A
 
T
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V

Sites not aligning to the query:

1qfyA Pea fnr y308s mutant in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 66% coverage: 143:421/422 of query aligns to 23:307/308 of 1qfyA

query
sites
1qfyA
T
 
V
N
 
N
L
 
K
F
 
F
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
Y
E
 
V
A
 
G
T
 
R
V
 
C
V
 
L
G
 
L
N
 
N
F
 
T
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
D
G
 
D
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
W
H
 
H
V
 
M
V
 
V
L
 
F
D
 
S
F
 
T
-
 
E
G
 
G
S
 
E
M
 
V
P
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
-
L
 
-
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
V
P
 
P
P
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
H
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
A
N
 
I
G
 
G
E
 
D
R
 
F
P
 
G
G
 
D
Y
 
S
N
 
K
N
 
T
L
 
V
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
|
K
R
 
R
V
x
L
T
 
V
T
x
Y
D
 
T
H
 
N
D
 
D
-
 
A
G
 
G
N
 
E
A
 
V
V
 
V
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
G
T
 
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
K
R
 
M
R
 
F
L
 
F
R
 
E
S
 
K
S
 
H
G
 
E
K
 
D
F
 
Y
E
 
Q
-
 
F
G
 
N
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
x
V
R
x
P
T
 
T
Q
 
S
Q
 
S
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
E
N
 
K
L
 
M
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
A
P
 
P
K
 
E
D
 
N
F
 
F
I
 
-
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
F
A
 
A
F
 
V
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
V
Q
 
N
-
 
D
-
 
K
-
 
G
P
 
E
K
|
K
R
 
M
Y
|
Y
V
 
I
Q
|
Q
D
 
T
L
 
R
M
 
M
R
 
A
E
 
Q
R
 
Y
A
 
A
A
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
E
L
 
L
L
 
L
R
 
K
D
 
K
G
 
D
S
 
N
G
 
T
H
 
F
F
 
V
Y
 
Y
V
 
M
C
|
C
G
|
G
L
|
L
K
 
K
S
x
G
M
|
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
D
A
 
I
L
 
M
R
 
V
D
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
D
G
 
G
L
 
I
D
 
D
W
 
W
D
 
I
T
 
E
V
 
Y
G
 
K
A
 
R
A
 
T
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
E
R
 
Q
L
 
W
H
 
N
L
 
V
E
|
E
T
 
V

Sites not aligning to the query:

2vzlA Ferredoxin-NADP reductase (mutations: t155g, a160t, l263p and y303s) complexed with NAD by cocrystallization (see paper)
32% identity, 66% coverage: 143:421/422 of query aligns to 4:294/295 of 2vzlA

query
sites
2vzlA
T
 
V
N
 
N
L
 
L
F
 
Y
P
 
R
P
 
P
K
 
N
S
 
A
P
 
P
T
 
F
E
 
I
A
 
G
T
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
S
N
 
N
F
 
E
N
 
P
C
 
L
T
 
V
E
 
K
A
 
E
G
 
G
F
 
G
E
 
I
N
 
G
E
 
I
T
 
V
H
 
Q
H
 
H
V
 
I
V
 
K
L
 
F
D
 
D
F
 
L
G
 
T
S
 
G
M
 
G
P
 
N
F
 
L
P
 
K
V
 
Y
L
 
I
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
V
D
 
D
A
 
K
L
 
N
G
 
G
K
 
K
E
 
P
H
 
E
H
 
K
A
 
L
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
T
R
 
R
N
 
H
G
 
G
E
 
D
R
 
D
P
 
V
G
 
D
Y
 
D
N
 
K
N
 
T
L
 
I
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
x
R
R
 
Q
V
x
L
T
 
E
T
x
Y
D
 
K
H
 
H
-
 
P
-
 
E
D
 
S
G
 
G
N
 
E
A
 
T
V
 
V
R
 
Y
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
T
F
 
Y
V
 
L
C
 
T
D
 
H
L
 
I
K
 
E
V
 
P
G
 
G
D
 
S
K
 
E
V
 
V
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
V
G
 
G
S
 
K
S
 
E
F
 
M
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
D
H
 
D
P
 
P
R
 
E
S
 
A
H
 
N
I
 
V
V
 
I
M
 
M
I
 
L
C
 
A
T
 
G
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
T
P
 
P
M
 
M
R
 
R
A
 
T
M
 
Y
T
 
L
E
 
-
W
 
W
R
 
R
-
 
M
-
 
F
-
 
K
-
 
D
-
 
A
-
 
E
R
 
R
R
 
A
L
 
A
R
 
N
S
 
P
S
 
E
G
 
Y
K
 
Q
F
 
F
E
 
K
G
 
G
G
 
F
K
 
S
L
 
-
M
 
W
L
 
L
F
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
V
R
 
P
T
 
T
Q
 
T
Q
 
P
E
 
N
L
 
I
P
 
L
Y
 
Y
F
 
K
G
 
E
P
 
E
L
 
L
Q
 
E
N
 
E
L
 
I
P
 
Q
K
 
Q
D
 
K
F
 
Y
I
 
P
D
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
R
I
 
L
N
 
T
L
 
Y
A
 
A
F
 
I
S
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
K
Q
 
N
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
K
 
R
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
L
 
R
M
 
V
R
 
A
E
 
E
R
 
H
A
 
A
A
 
D
D
 
E
L
 
L
A
 
W
A
 
Q
L
 
L
L
 
I
R
 
K
D
 
N
G
 
Q
S
 
K
G
 
T
H
 
H
F
 
T
Y
 
Y
V
 
I
C
|
C
G
|
G
L
x
P
K
 
R
S
 
G
M
 
M
E
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
I
V
 
D
M
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
S
D
 
A
I
 
A
A
 
A
S
 
A
E
 
K
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
T
W
 
W
D
 
S
T
 
D
V
 
Y
G
 
Q
A
 
K
A
 
D
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
|
E
T
 
T

Sites not aligning to the query:

5h59A Ferredoxin-NADP+ reductase from maize root (see paper)
34% identity, 68% coverage: 137:422/422 of query aligns to 14:311/311 of 5h59A

query
sites
5h59A
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
E
P
 
P
Y
 
P
T
 
L
N
 
N
L
 
T
F
 
Y
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
F
E
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
G
 
S
N
 
V
F
 
E
N
 
S
C
 
L
T
 
V
E
 
G
A
 
P
G
 
K
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
C
H
 
H
V
 
I
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
H
G
 
G
S
 
G
M
 
N
P
 
-
F
 
V
P
 
P
V
 
Y
L
 
W
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
E
D
 
N
A
 
P
L
 
K
-
 
K
-
 
P
G
 
G
K
 
A
E
 
P
H
 
Q
H
 
N
A
 
V
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
T
R
 
R
N
 
Y
G
 
G
E
 
D
R
 
N
P
 
F
G
 
D
Y
 
G
N
 
R
N
 
T
L
 
G
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
 
R
R
 
R
V
 
A
T
 
V
-
x
Y
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
E
T
 
T
D
 
G
H
 
K
D
 
E
G
 
D
N
 
P
A
 
S
V
x
K
R
 
N
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
N
L
 
S
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
I
Q
 
Q
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
S
G
 
G
S
 
K
S
 
I
F
 
M
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
E
H
 
E
-
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
H
V
 
I
M
 
M
I
 
I
C
 
A
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
 
G
S
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
G
M
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
Y
R
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
M
R
 
F
S
 
M
S
 
E
G
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
Y
K
 
R
F
 
F
E
 
-
G
 
G
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
A
T
 
N
Q
 
S
Q
 
D
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
D
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
T
N
 
S
L
 
Y
P
 
L
K
 
K
D
 
Q
F
 
Y
I
 
P
D
 
D
I
 
-
N
 
N
L
 
F
A
 
R
F
 
Y
S
 
D
R
 
K
T
 
V
A
 
L
G
 
S
Q
 
R
P
 
E
K
 
Q
R
 
K
-
 
N
-
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
M
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
L
 
K
M
 
I
R
 
E
E
 
E
R
 
Y
A
 
S
A
 
D
D
 
E
L
 
I
A
 
F
A
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
A
H
 
H
F
 
I
Y
 
Y
V
x
F
C
|
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
M
E
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
Q
M
 
D
A
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
K
I
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
E
D
 
S
W
 
W
D
 
D
T
 
Q
V
 
K
G
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
N
G
 
K
R
 
Q
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
|
E
T
 
V
Y
|
Y

5vw4A Nicotinamide soak of y316s mutant of corn root ferredoxin:nadp+ reductase (see paper)
35% identity, 68% coverage: 137:421/422 of query aligns to 12:308/309 of 5vw4A

query
sites
5vw4A
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
E
P
 
P
Y
 
P
T
 
L
N
 
N
L
 
T
F
 
Y
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
F
E
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
G
 
S
N
 
V
F
 
E
N
 
S
C
 
L
T
 
V
E
 
G
A
 
P
G
 
K
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
C
H
 
H
V
 
I
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
H
G
 
G
S
 
G
M
 
N
P
 
-
F
 
V
P
 
P
V
 
Y
L
 
W
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
E
D
 
N
A
 
P
L
 
K
-
 
K
-
 
P
G
 
G
K
 
A
E
 
P
H
 
Q
H
 
N
A
 
V
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
T
R
 
R
N
 
Y
G
 
G
E
 
D
R
 
N
P
 
F
G
 
D
Y
 
G
N
 
R
N
 
T
L
 
G
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
 
R
R
 
R
V
x
A
T
 
V
-
x
Y
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
E
T
 
T
D
 
G
H
 
K
D
 
E
G
 
D
N
 
P
A
 
S
V
x
K
R
 
N
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
N
L
 
S
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
I
Q
 
Q
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
S
G
 
G
S
 
K
S
 
I
F
 
M
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
E
H
 
E
-
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
H
V
 
I
M
 
M
I
 
I
C
 
A
T
 
T
G
 
G
T
|
T
G
|
G
S
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
G
M
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
Y
R
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
M
R
 
F
S
 
M
S
 
E
G
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
Y
K
 
R
F
 
F
E
 
-
G
 
G
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
A
T
 
N
Q
 
S
Q
 
D
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
D
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
T
N
 
S
L
 
Y
P
 
L
K
 
K
D
 
Q
F
 
Y
I
 
P
D
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
R
I
 
Y
N
 
D
L
 
K
A
 
A
F
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
K
Q
 
N
P
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
G
K
 
K
R
 
M
Y
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
L
 
K
M
 
I
R
 
E
E
 
E
R
 
Y
A
 
S
A
 
D
D
 
E
L
 
I
A
 
F
A
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
A
H
 
H
F
 
I
Y
 
Y
V
x
F
C
|
C
G
|
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
M
E
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
Q
M
 
D
A
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
K
I
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
E
D
 
S
W
 
W
D
 
D
T
 
Q
V
 
K
G
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
N
G
 
K
R
 
Q
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
|
E
T
x
V

Sites not aligning to the query:

5vw2A NADPH soak of y316s mutant of corn root ferredoxin:nadp+ reductase (see paper)
35% identity, 68% coverage: 137:421/422 of query aligns to 12:308/309 of 5vw2A

query
sites
5vw2A
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
E
P
 
P
Y
 
P
T
 
L
N
 
N
L
 
T
F
 
Y
P
 
K
P
 
P
K
 
K
S
 
E
P
 
P
T
 
F
E
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
I
V
 
V
G
 
S
N
 
V
F
 
E
N
 
S
C
 
L
T
 
V
E
 
G
A
 
P
G
 
K
F
 
A
E
 
P
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
C
H
 
H
V
 
I
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
H
G
 
G
S
 
G
M
 
N
P
 
-
F
 
V
P
 
P
V
 
Y
L
 
W
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
E
D
 
N
A
 
P
L
 
K
-
 
K
-
 
P
G
 
G
K
 
A
E
 
P
H
 
Q
H
 
N
A
 
V
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
T
R
 
R
N
 
Y
G
 
G
E
 
D
R
 
N
P
 
F
G
 
D
Y
 
G
N
 
R
N
 
T
L
 
G
A
 
S
L
 
L
T
x
C
V
 
V
K
x
R
R
 
R
V
x
A
T
 
V
-
x
Y
-
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
E
T
 
T
D
 
G
H
 
K
D
 
E
G
 
D
N
 
P
A
 
S
V
x
K
R
 
N
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
N
L
 
S
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
I
Q
 
Q
V
 
L
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
S
G
 
G
S
 
K
S
 
I
F
 
M
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
E
H
 
E
-
 
D
P
 
P
R
 
N
S
 
A
H
 
T
I
 
H
V
 
I
M
 
M
I
 
I
C
 
A
T
|
T
G
|
G
T
|
T
G
|
G
S
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
G
M
 
-
T
 
-
E
 
-
W
 
Y
R
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
M
R
 
F
S
 
M
S
 
E
G
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
N
-
 
Y
K
 
R
F
 
F
E
 
-
G
 
G
G
 
G
K
 
L
L
 
A
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
L
G
|
G
A
x
V
R
x
A
T
 
N
Q
 
S
Q
 
D
E
 
S
L
 
L
P
 
L
Y
 
Y
F
 
D
G
 
E
P
 
E
L
 
F
Q
 
T
N
 
S
L
 
Y
P
 
L
K
 
K
D
 
Q
F
 
Y
I
 
P
D
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
R
I
 
Y
N
 
D
L
 
K
A
 
A
F
 
L
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
K
Q
 
N
P
 
R
-
 
S
-
 
G
-
 
G
K
|
K
R
 
M
Y
|
Y
V
 
V
Q
|
Q
D
 
D
L
 
K
M
 
I
R
 
E
E
 
E
R
 
Y
A
 
S
A
 
D
D
 
E
L
 
I
A
 
F
A
 
K
L
 
L
L
 
L
R
 
-
D
 
D
G
 
G
S
 
G
G
 
A
H
 
H
F
 
I
Y
 
Y
V
x
F
C
|
C
G
|
G
L
|
L
K
 
K
S
x
G
M
|
M
E
 
M
E
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
Q
M
 
D
A
 
T
L
 
L
R
 
K
D
 
K
I
 
V
A
 
A
S
 
E
E
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
E
D
 
S
W
 
W
D
 
D
T
 
Q
V
 
K
G
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
Q
 
K
R
 
K
E
 
N
G
 
K
R
 
Q
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
|
E
T
x
V

Sites not aligning to the query:

P53991 Ferredoxin--NADP reductase, chloroplastic; FNR; EC 1.18.1.2 from Chlamydomonas reinhardtii (Chlamydomonas smithii)
34% identity, 66% coverage: 144:422/422 of query aligns to 64:354/354 of P53991

query
sites
P53991
N
 
N
L
 
T
F
 
Y
P
 
S
P
 
N
K
 
K
S
 
A
P
 
P
T
 
F
E
 
K
A
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
R
G
 
S
N
 
V
F
 
E
N
 
K
C
 
I
T
 
T
E
 
G
A
 
P
G
 
K
F
 
A
E
 
T
N
 
G
E
 
E
T
 
T
H
 
C
H
 
H
V
 
I
V
 
I
L
 
I
D
 
E
F
 
T
-
 
E
G
 
G
S
 
K
M
 
I
P
 
P
F
 
F
P
 
-
V
 
-
L
 
W
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
Y
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
x
K
-
 
I
D
 
N
A
 
S
L
 
K
G
 
G
K
|
K
E
 
E
H
 
V
-
 
P
H
 
T
A
 
A
R
 
R
Q
 
L
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
S
R
 
R
N
 
Y
G
 
G
E
 
D
R
 
D
P
 
G
G
 
D
Y
 
G
N
 
Q
N
 
T
L
 
A
A
 
S
L
 
L
T
 
C
V
 
V
K
 
R
R
 
R
V
 
A
T
 
V
-
 
Y
-
 
V
-
 
D
-
 
P
-
 
E
T
 
T
D
 
G
H
 
K
D
 
E
G
 
D
N
 
P
A
 
A
V
 
K
R
x
K
G
 
G
I
 
L
A
 
C
S
 
S
N
 
N
F
 
F
V
 
L
C
 
C
D
 
D
L
 
A
K
 
T
V
 
P
G
 
G
D
 
T
K
 
E
V
 
I
Q
 
S
V
 
M
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
T
G
 
G
S
 
K
S
 
V
F
 
L
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
A
H
 
D
P
 
A
R
 
N
S
 
A
H
 
P
I
 
L
V
 
I
M
 
C
I
 
V
C
 
A
T
 
T
G
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
R
A
 
S
M
 
F
T
 
-
E
 
-
W
 
W
R
 
R
R
 
R
R
 
C
L
 
F
R
 
I
S
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
P
S
 
S
G
 
Y
K
 
K
F
 
F
E
 
T
G
 
-
G
 
G
K
 
L
L
 
F
M
 
W
L
 
L
F
 
F
F
 
M
G
 
G
A
 
V
R
 
G
T
 
N
Q
 
S
Q
 
D
E
 
A
L
 
K
P
 
L
Y
 
Y
F
 
D
G
 
E
P
 
E
L
 
L
Q
 
Q
N
 
A
L
 
I
P
 
A
K
 
K
D
 
A
F
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
I
 
F
D
 
R
I
 
L
N
 
D
L
 
Y
A
 
A
F
 
L
S
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
Q
G
 
N
Q
 
N
P
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
G
K
 
K
R
 
M
Y
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
L
 
K
M
 
V
R
 
E
E
 
E
R
 
Y
A
 
A
A
 
D
D
 
E
L
 
I
A
 
F
A
 
D
L
 
L
L
 
L
R
 
D
D
 
N
G
 
G
S
 
A
G
 
-
H
 
H
F
 
M
Y
 
Y
V
 
F
C
 
C
G
 
G
L
 
L
K
 
K
S
 
G
M
 
M
E
 
M
E
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
Q
M
 
D
A
 
M
L
 
L
R
 
E
D
 
R
I
 
V
A
 
A
S
 
K
E
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
L
D
 
N
W
 
Y
D
 
E
T
 
E
V
 
W
G
 
V
A
 
E
A
 
G
L
 
L
Q
 
K
R
 
H
E
 
K
G
 
N
R
 
Q
L
 
W
H
 
H
L
 
V
E
 
E
T
 
V
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

2rc6A Refined structure of fnr from leptospira interrogans bound to NADP+ (see paper)
33% identity, 67% coverage: 141:422/422 of query aligns to 5:306/306 of 2rc6A

query
sites
2rc6A
P
 
P
Y
 
Q
T
 
I
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
K
P
 
K
K
 
S
S
 
N
P
 
P
T
 
Y
E
 
K
A
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
I
G
 
S
N
 
N
F
 
V
N
 
L
C
 
L
T
 
T
-
 
P
E
 
E
A
 
T
G
 
G
F
 
T
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
P
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
G
E
 
E
N
 
A
E
 
L
T
 
V
H
 
H
H
 
R
V
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
A
F
 
I
G
 
D
S
 
H
M
 
S
P
 
A
F
 
Y
P
 
P
V
 
Y
L
 
V
E
 
I
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
I
 
G
G
 
G
I
 
V
I
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
T
 
E
D
 
D
A
 
P
L
 
E
G
 
K
K
 
K
E
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
D
-
 
V
-
 
G
H
 
Y
H
 
T
A
 
V
R
|
R
Q
x
L
Y
|
Y
S
|
S
I
 
I
A
 
A
S
 
S
P
 
P
R
 
S
N
 
Y
G
 
S
E
 
F
R
 
G
P
 
M
G
 
K
Y
 
E
N
 
D
N
 
N
L
 
I
A
 
E
L
 
F
T
x
I
V
x
I
K
|
K
R
 
R
V
x
D
T
 
N
T
x
I
D
 
Y
H
 
N
D
 
G
G
 
N
N
 
I
A
 
Q
V
x
F
R
 
K
G
|
G
I
x
V
A
x
C
S
|
S
N
 
N
F
 
Y
V
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
K
 
K
V
 
P
G
 
G
D
 
D
K
 
E
V
 
V
Q
 
T
V
 
M
V
 
T
G
 
G
P
 
P
F
 
S
G
 
G
S
 
K
S
 
K
F
 
F
L
 
L
M
 
L
P
 
P
N
 
N
H
 
T
P
 
D
R
 
F
S
 
S
-
 
G
H
 
D
I
 
I
V
 
M
M
 
F
I
 
L
C
 
A
T
|
T
G
|
G
T
|
T
G
 
G
S
 
I
A
 
A
P
 
P
M
 
F
R
 
I
A
 
G
M
 
M
T
 
S
E
 
E
W
 
E
R
 
L
R
 
L
R
x
E
L
 
H
R
 
K
S
 
L
S
 
I
G
 
-
K
 
K
F
 
F
E
 
T
G
 
-
G
 
G
K
 
N
L
 
I
M
 
T
L
 
L
F
 
V
F
 
Y
G
 
G
A
|
A
R
x
P
T
 
Y
Q
 
S
Q
 
D
E
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
M
-
 
M
P
 
D
Y
 
Y
F
 
L
G
 
K
P
 
G
L
 
L
Q
 
E
N
 
S
L
 
K
P
x
H
K
 
K
D
 
N
F
 
F
I
 
K
D
 
L
I
 
I
N
 
T
L
 
-
A
 
A
F
 
I
S
|
S
R
|
R
T
 
E
A
 
E
G
 
K
Q
 
N
P
 
S
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
G
K
x
R
R
 
M
Y
|
Y
V
 
I
Q
 
S
D
 
H
L
 
R
M
 
V
R
 
R
E
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
E
D
 
A
L
 
V
A
 
K
A
 
K
L
 
I
L
 
L
R
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
G
G
 
G
H
 
R
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
C
|
C
G
 
G
L
 
G
-
x
P
K
 
K
S
 
G
M
|
M
E
 
E
E
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
I
M
 
E
A
 
E
L
 
I
R
 
Q
D
 
K
I
 
I
A
 
S
S
 
G
E
 
N
A
 
T
G
 
G
L
 
-
D
 
T
W
 
Y
D
 
E
T
 
E
V
 
F
G
 
K
A
 
H
A
 
H
L
 
L
Q
 
E
R
 
G
E
 
A
G
 
H
R
 
Q
L
 
L
H
 
F
L
 
V
E
|
E
T
 
T
Y
|
Y

Query Sequence

>Ac3H11_3083 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3083
MDMAVEAAVIKQHLIDPEICIRCNTCEATCPVGAITHDDNNYVVRADVCNGCMACISPCP
TGSIDNWRTMPLARAYTIEEQLTWEELPPELPPDALAAEGVAPSADAVPPTTPAAPVEPG
TQAFRSAQYGATVPPWSAAHPYTNLFPPKSPTEATVVGNFNCTEAGFENETHHVVLDFGS
MPFPVLEGQSIGIIPPGTDALGKEHHARQYSIASPRNGERPGYNNLALTVKRVTTDHDGN
AVRGIASNFVCDLKVGDKVQVVGPFGSSFLMPNHPRSHIVMICTGTGSAPMRAMTEWRRR
LRSSGKFEGGKLMLFFGARTQQELPYFGPLQNLPKDFIDINLAFSRTAGQPKRYVQDLMR
ERAADLAALLRDGSGHFYVCGLKSMEEGVVMALRDIASEAGLDWDTVGAALQREGRLHLE
TY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory