SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_315 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_315 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P00370 NADP-specific glutamate dehydrogenase; NADP-GDH; EC 1.4.1.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
71% identity, 95% coverage: 22:464/464 of query aligns to 6:447/447 of P00370

query
sites
P00370
S
 
S
A
 
L
G
 
E
S
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
N
H
 
H
V
 
V
A
 
Q
L
 
K
R
 
R
N
 
D
P
 
P
G
 
N
Q
 
Q
P
 
T
E
 
E
F
 
F
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
E
 
T
S
 
T
L
 
L
W
 
W
P
 
P
F
 
F
I
 
L
A
 
E
E
 
Q
H
 
N
P
 
P
R
 
K
Y
 
Y
A
 
R
E
 
Q
H
 
M
G
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
E
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
I
M
 
Q
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
V
W
 
W
V
 
V
D
 
D
D
 
D
H
 
R
G
 
N
T
 
Q
V
 
I
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
A
Y
 
W
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
S
M
 
S
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
R
F
 
F
H
 
H
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
I
L
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
 
Q
T
 
T
F
 
F
K
 
K
N
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
T
L
 
L
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
M
 
M
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
V
 
M
S
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
R
 
R
H
 
H
V
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
F
 
F
M
 
M
A
 
A
G
 
G
M
 
M
M
 
M
K
 
K
K
 
K
L
 
L
S
 
S
N
 
N
R
 
N
A
 
T
D
 
A
C
 
C
V
 
V
F
 
F
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
L
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
A
 
T
Q
 
E
E
 
A
M
 
M
L
 
L
R
 
K
A
 
R
N
 
H
G
 
G
R
 
M
S
 
G
L
 
F
D
 
E
G
 
G
L
 
M
R
 
R
V
 
V
S
 
S
V
 
V
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
I
T
 
T
V
 
A
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
S
G
 
G
T
 
T
I
 
V
V
 
V
D
 
D
E
 
E
D
 
S
G
 
G
F
 
F
T
 
T
P
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
A
I
 
R
L
 
L
M
 
I
D
 
E
V
 
I
K
 
K
N
 
A
H
 
S
H
 
R
Y
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
V
S
 
A
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
E
 
K
R
 
E
T
 
F
G
 
G
V
 
L
K
 
V
F
 
Y
E
 
L
A
 
E
G
 
G
V
 
Q
R
 
Q
P
 
P
W
 
W
H
 
S
V
 
L
P
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
C
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
L
 
L
D
 
D
A
 
V
R
 
D
D
 
A
A
 
A
A
 
H
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
K
C
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
M
 
M
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
T
K
 
E
V
 
L
F
 
F
E
 
Q
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
L
 
L
Y
 
F
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
A
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
G
W
 
W
P
 
K
R
 
A
E
 
E
E
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
H
Q
 
H
I
 
I
M
 
M
Q
 
L
G
 
D
I
 
I
H
 
H
A
 
H
A
 
A
C
 
C
L
 
V
R
 
E
Y
 
H
G
 
G
K
 
G
H
 
E
A
 
G
D
 
E
G
 
-
R
 
Q
V
 
T
S
 
N
Y
 
Y
V
 
V
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
I

5ijzA Crystal structure of glutamate dehydrogenase(gdh) from corynebacterium glutamicum (see paper)
56% identity, 95% coverage: 25:464/464 of query aligns to 9:447/447 of 5ijzA

query
sites
5ijzA
S
 
N
F
 
Y
L
 
Y
S
 
D
H
 
M
V
 
L
A
 
L
L
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
A
E
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
L
W
 
K
P
 
I
F
 
V
I
 
L
A
 
E
E
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
H
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
I
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
V
 
C
E
 
E
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
Q
V
 
L
M
 
I
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
P
W
 
W
V
 
V
D
 
D
D
 
D
H
 
Q
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
Q
 
H
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
N
M
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
 
L
R
|
R
F
 
F
H
 
H
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
G
V
 
I
L
 
V
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
|
Q
T
 
I
F
 
F
K
|
K
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
|
K
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
D
G
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
M
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
V
 
M
S
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
H
R
 
R
H
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
Y
T
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
G
 
G
D
|
D
I
|
I
G
|
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
M
 
L
A
 
F
G
 
G
M
 
H
M
 
Y
K
 
R
K
 
R
L
 
M
S
 
A
N
 
N
R
 
Q
A
 
H
D
 
E
C
 
S
-
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
T
F
 
W
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
R
|
R
P
 
T
E
 
E
A
 
A
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
C
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
A
 
V
Q
 
S
E
 
E
M
 
M
L
 
I
R
 
K
A
 
A
N
 
K
G
 
G
R
 
E
S
 
S
L
 
I
D
 
S
G
 
G
L
 
Q
R
 
K
V
 
I
S
 
I
V
 
V
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
A
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
I
T
 
G
V
 
F
S
 
S
D
|
D
S
|
S
S
 
S
G
 
G
T
 
W
I
 
V
V
 
H
D
 
T
E
 
P
D
 
N
G
 
G
F
 
V
T
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
D
L
 
V
A
 
A
I
 
K
L
 
L
M
 
R
D
 
E
V
 
I
K
 
K
N
 
E
H
 
V
H
 
R
Y
 
R
G
 
A
R
|
R
V
 
V
S
 
S
D
 
V
Y
 
Y
A
 
A
-
 
D
E
 
E
R
 
V
T
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
T
F
 
Y
E
 
H
A
 
T
G
 
D
V
 
G
R
 
S
P
 
I
W
 
W
H
 
D
V
 
L
P
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
|
C
A
|
A
T
|
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
L
 
L
D
 
N
A
 
G
R
 
E
D
 
N
A
 
A
A
 
K
T
 
T
L
 
L
I
 
A
K
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
C
V
 
R
C
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
|
G
A
|
A
N
|
N
M
 
M
P
 
P
S
 
S
T
 
T
I
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
V
K
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
R
A
 
E
A
 
R
G
 
D
V
 
I
L
 
R
Y
 
F
A
 
G
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
|
G
V
|
V
A
 
A
T
 
T
S
|
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
Q
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
A
 
S
R
 
R
L
 
D
A
 
S
W
 
W
P
 
S
R
 
F
E
 
E
E
 
Y
V
 
T
D
 
D
A
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
Q
Q
 
V
I
 
I
M
 
M
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
H
 
F
A
 
K
A
 
T
C
 
C
L
 
A
R
 
E
Y
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
E
A
 
Y
D
 
G
G
 
H
R
 
E
V
 
N
S
 
D
Y
 
Y
V
 
V
D
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
I

5gudA Glutamate dehydrogenase from corynebacterium glutamicum (alpha- iminoglutarate/NADP+ complex) (see paper)
57% identity, 93% coverage: 33:464/464 of query aligns to 17:447/447 of 5gudA

query
sites
5gudA
R
 
R
N
 
N
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
A
E
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
L
W
 
K
P
 
I
F
 
V
I
 
L
A
 
E
E
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
H
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
I
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
V
 
C
E
 
E
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
Q
V
 
L
M
 
I
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
P
W
 
W
V
 
V
D
 
D
D
 
D
H
 
Q
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
Q
 
H
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
N
M
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
 
L
R
|
R
F
 
F
H
|
H
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
G
V
 
I
L
 
V
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
|
Q
T
 
I
F
 
F
K
|
K
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
|
K
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
D
G
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
M
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
V
 
M
S
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
H
R
 
R
H
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
Y
T
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
G
|
G
D
|
D
I
|
I
G
|
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
M
 
L
A
 
F
G
 
G
M
 
H
M
 
Y
K
 
R
K
 
R
L
 
M
S
 
A
N
 
N
R
 
Q
A
 
H
D
 
E
C
 
S
-
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
T
F
 
W
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
R
|
R
P
 
T
E
 
E
A
 
A
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
C
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
A
 
V
Q
 
S
E
 
E
M
 
M
L
 
I
R
 
K
A
 
A
N
 
K
G
 
G
R
 
E
S
 
S
L
 
I
D
 
S
G
 
G
L
 
Q
R
 
K
V
 
I
S
 
I
V
 
V
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
A
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
I
T
 
G
V
 
F
S
 
S
D
|
D
S
|
S
S
 
S
G
 
G
T
 
W
I
 
V
V
 
H
D
 
T
E
 
P
D
 
N
G
 
G
F
 
V
T
 
-
P
 
-
E
 
-
K
 
D
L
 
V
A
 
A
I
 
K
L
 
L
M
 
R
D
 
E
V
 
I
K
 
K
N
 
E
H
 
V
H
 
R
Y
 
R
G
 
A
R
|
R
V
 
V
S
 
S
D
 
V
Y
 
Y
A
 
A
-
 
D
E
 
E
R
 
I
T
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
T
F
 
Y
E
 
H
A
 
T
G
 
D
V
 
G
R
 
S
P
 
I
W
 
W
H
 
D
V
 
L
P
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
|
C
A
|
A
T
|
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
L
 
L
D
 
N
A
 
G
R
 
E
D
 
N
A
 
A
A
 
K
T
 
T
L
 
L
I
 
A
K
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
C
V
 
R
C
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
|
G
A
|
A
N
|
N
M
 
M
P
 
P
S
 
S
T
 
T
I
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
V
K
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
R
A
 
E
A
 
R
G
 
D
V
 
I
L
 
R
Y
 
F
A
 
G
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
|
G
V
|
V
A
 
A
T
 
T
S
|
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
Q
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
A
 
S
R
 
R
L
 
D
A
 
S
W
 
W
P
 
S
R
 
F
E
 
E
E
 
Y
V
 
T
D
 
D
A
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
Q
Q
 
V
I
 
I
M
 
M
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
H
 
F
A
 
K
A
 
T
C
 
C
L
 
A
R
 
E
Y
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
E
A
 
Y
D
 
G
G
 
H
R
 
E
V
 
N
S
 
D
Y
 
Y
V
 
V
D
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
I

5gudE Glutamate dehydrogenase from corynebacterium glutamicum (alpha- iminoglutarate/NADP+ complex) (see paper)
57% identity, 93% coverage: 33:464/464 of query aligns to 30:460/460 of 5gudE

query
sites
5gudE
R
 
R
N
 
N
P
 
A
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
H
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
T
 
A
E
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
E
S
 
S
L
 
L
W
 
K
P
 
I
F
 
V
I
 
L
A
 
E
E
 
K
H
 
D
P
 
P
R
 
H
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
I
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
V
 
C
E
 
E
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
Q
V
 
L
M
 
I
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
P
W
 
W
V
 
V
D
 
D
D
 
D
H
 
Q
G
 
G
T
 
Q
V
 
V
Q
 
H
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
N
M
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
R
F
 
F
H
 
H
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
G
V
 
I
L
 
V
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
 
Q
T
 
I
F
 
F
K
 
K
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
G
L
 
L
P
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
D
G
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
M
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
A
 
S
F
 
F
V
 
M
S
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
H
R
 
R
H
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
Y
T
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
|
D
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
M
 
L
A
 
F
G
 
G
M
 
H
M
 
Y
K
 
R
K
 
R
L
 
M
S
 
A
N
 
N
R
 
Q
A
 
H
D
 
E
C
 
S
-
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
T
F
 
W
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
T
E
 
E
A
 
A
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
C
V
 
V
Y
 
Y
F
 
F
A
 
V
Q
 
S
E
 
E
M
 
M
L
 
I
R
 
K
A
 
A
N
 
K
G
 
G
R
 
E
S
 
S
L
 
I
D
 
S
G
 
G
L
 
Q
R
 
K
V
 
I
S
 
I
V
 
V
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
A
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
E
 
E
K
 
K
A
 
A
L
 
Q
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
I
T
 
G
V
 
F
S
|
S
D
|
D
S
|
S
S
 
S
G
 
G
T
 
W
I
 
V
V
 
H
D
 
T
E
 
P
D
 
N
G
 
G
F
 
V
T
 
D
P
 
V
E
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
R
I
 
E
L
 
I
M
 
K
D
 
E
V
 
V
K
 
R
N
 
R
H
 
-
H
 
-
Y
 
-
G
 
A
R
|
R
V
 
V
S
 
S
D
 
V
Y
 
Y
A
 
A
-
 
D
E
 
E
R
 
I
T
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
T
F
 
Y
E
 
H
A
 
T
G
 
D
V
 
G
R
 
S
P
 
I
W
 
W
H
 
D
V
 
L
P
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
|
C
A
|
A
T
|
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
L
 
L
D
 
N
A
 
G
R
 
E
D
 
N
A
 
A
A
 
K
T
 
T
L
 
L
I
 
A
K
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
C
V
 
R
C
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
|
A
N
|
N
M
 
M
P
 
P
S
 
S
T
 
T
I
 
P
E
 
E
A
 
A
A
 
V
K
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
R
A
 
E
A
 
R
G
 
D
V
 
I
L
 
R
Y
 
F
A
 
G
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
T
S
 
S
G
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
Q
Q
 
Q
N
 
N
A
 
A
A
 
S
R
 
R
L
 
D
A
 
S
W
 
W
P
 
S
R
 
F
E
 
E
E
 
Y
V
 
T
D
 
D
A
 
E
R
 
R
L
 
L
L
 
Q
Q
 
V
I
 
I
M
 
M
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
H
 
F
A
 
K
A
 
T
C
 
C
L
 
A
R
 
E
Y
 
T
G
 
A
K
 
A
H
 
E
A
 
Y
D
 
G
G
 
H
R
 
E
V
 
N
S
 
D
Y
 
Y
V
 
V
D
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
K
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
V
 
I

P24295 NAD-specific glutamate dehydrogenase; NAD-GDH; EC 1.4.1.2 from Clostridium symbiosum (Bacteroides symbiosus) (see 4 papers)
52% identity, 94% coverage: 27:463/464 of query aligns to 9:448/450 of P24295

query
sites
P24295
L
 
I
S
 
A
H
 
E
V
 
V
A
 
E
L
 
K
R
 
K
N
 
Y
P
 
A
G
 
D
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
V
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
T
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
S
S
 
S
L
 
L
W
 
G
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
D
E
 
A
H
 
H
P
 
P
R
 
E
Y
 
Y
A
 
E
E
 
E
H
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
M
V
 
V
E
 
I
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
I
M
 
E
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
P
W
 
W
V
 
E
D
 
D
D
 
D
H
 
N
G
 
G
T
 
K
V
 
V
Q
 
H
V
 
V
N
 
N
R
 
T
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
N
M
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
R
F
 
F
H
 
A
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
I
L
 
M
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
|
Q
T
 
A
F
 
F
K
|
K
N
 
D
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
T
L
 
L
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
D
G
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
M
S
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
R
 
R
H
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
P
D
 
D
T
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
|
G
D
|
D
I
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
M
 
M
A
 
Y
G
 
G
M
 
Q
M
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
I
-
 
V
S
 
G
N
 
G
R
 
F
A
 
Y
D
 
N
C
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
A
L
 
R
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
V
Q
 
E
E
 
A
M
 
V
L
 
M
R
 
K
A
 
H
N
 
E
G
 
N
R
 
D
S
 
T
L
 
L
D
 
V
G
 
G
L
 
K
R
 
T
V
 
V
S
 
A
V
 
L
S
 
A
G
 
G
S
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
W
Y
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
K
K
 
K
A
 
L
L
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
A
I
 
V
T
 
T
V
 
L
S
 
S
D
 
G
S
 
P
S
 
D
G
 
G
T
 
Y
I
 
I
V
 
Y
D
 
D
E
 
P
D
 
E
G
 
G
F
 
I
T
 
T
P
 
T
-
 
E
E
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
N
I
 
Y
L
 
M
M
 
L
D
 
E
V
 
M
K
 
R
N
 
A
H
 
S
H
 
G
Y
 
R
G
 
N
R
 
K
V
 
V
S
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
K
T
 
F
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
F
 
F
E
 
F
A
 
P
G
 
G
V
 
E
R
 
K
P
 
P
W
 
W
H
 
G
V
 
Q
P
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
I
L
 
M
P
 
P
C
 
C
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
L
R
 
E
D
 
Q
A
 
A
A
 
K
T
 
K
L
 
I
I
 
V
K
 
A
N
 
N
G
 
N
V
 
V
V
 
K
C
 
Y
V
 
Y
A
 
I
E
 
E
G
 
V
A
 
A
N
 
N
M
 
M
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
L
K
 
R
-
 
F
V
 
L
F
 
M
E
 
Q
A
 
Q
A
 
P
G
 
N
V
 
M
L
 
V
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
S
K
 
K
A
 
A
S
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
L
T
 
V
S
|
S
G
 
G
L
 
F
E
 
E
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
A
 
S
A
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
W
 
W
P
 
T
R
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
S
R
 
K
L
 
L
L
 
H
Q
 
Q
I
 
V
M
 
M
Q
 
T
G
 
D
I
 
I
H
 
H
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
A
A
 
A
A
 
A
C
 
A
L
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
K
 
L
H
 
G
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
Y
S
 
N
Y
 
L
V
 
V
D
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
Q
K
 
K
V
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
M
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
I

Sites not aligning to the query:

1bgvA Glutamate dehydrogenase (see paper)
52% identity, 94% coverage: 27:463/464 of query aligns to 8:447/449 of 1bgvA

query
sites
1bgvA
L
 
I
S
 
A
H
 
E
V
 
V
A
 
E
L
 
K
R
 
K
N
 
Y
P
 
A
G
 
D
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
V
Q
 
Q
A
 
T
V
 
V
T
 
E
E
 
E
V
 
V
M
 
L
E
 
S
S
 
S
L
 
L
W
 
G
P
 
P
F
 
V
I
 
V
A
 
D
E
 
A
H
 
H
P
 
P
R
 
E
Y
 
Y
A
 
E
E
 
E
H
 
V
G
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
M
V
 
V
E
 
I
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
I
M
 
E
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
P
W
 
W
V
 
E
D
 
D
D
 
D
H
 
N
G
 
G
T
 
K
V
 
V
Q
 
H
V
 
V
N
 
N
R
 
T
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
N
M
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
 
L
R
 
R
F
 
F
H
 
A
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
I
L
 
M
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
|
Q
T
 
A
F
 
F
K
|
K
N
 
D
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
T
L
 
L
P
 
P
M
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
N
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
D
G
 
R
E
 
E
V
 
V
M
 
M
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
V
 
M
S
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
R
 
R
H
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
P
D
 
D
T
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
G
|
G
D
|
D
I
 
L
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
M
 
M
A
 
Y
G
 
G
M
 
Q
M
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
I
-
 
V
S
 
G
N
 
G
R
 
F
A
 
Y
D
 
N
C
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
A
L
 
R
S
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
V
Q
 
E
E
 
A
M
 
V
L
 
M
R
 
K
A
 
H
N
 
E
G
 
N
R
 
D
S
 
T
L
 
L
D
 
V
G
 
G
L
 
K
R
 
T
V
 
V
S
 
A
V
 
L
S
 
A
G
 
G
S
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
W
Y
 
G
A
 
A
V
 
A
E
 
K
K
 
K
A
 
L
L
 
A
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
A
I
 
V
T
 
T
V
 
L
S
 
S
D
 
G
S
 
P
S
 
D
G
 
G
T
 
Y
I
 
I
V
 
Y
D
 
D
E
 
P
D
 
E
G
 
G
F
 
I
T
 
T
P
 
T
-
 
E
E
 
E
K
 
K
L
 
I
A
 
N
I
 
Y
L
 
M
M
 
L
D
 
E
V
 
M
K
 
R
N
 
A
H
 
S
H
 
G
Y
 
R
G
 
N
R
 
K
V
 
V
S
 
Q
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
K
T
 
F
G
 
G
V
 
V
K
 
Q
F
 
F
E
 
F
A
 
P
G
 
G
V
 
E
R
 
K
P
 
P
W
 
W
H
 
G
V
 
Q
P
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
I
L
 
M
P
 
P
C
 
C
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
D
L
 
V
D
 
D
A
 
L
R
 
E
D
 
Q
A
 
A
A
 
K
T
 
K
L
 
I
I
 
V
K
 
A
N
 
N
G
 
N
V
 
V
V
 
K
C
 
Y
V
 
Y
A
 
I
E
 
E
G
 
V
A
 
A
N
 
N
M
 
M
P
 
P
S
 
T
T
 
T
I
 
N
E
 
E
A
 
A
A
 
L
K
 
R
-
 
F
V
 
L
F
 
M
E
 
Q
A
 
Q
A
 
P
G
 
N
V
 
M
L
 
V
Y
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
S
K
 
K
A
 
A
S
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
|
V
A
 
L
T
 
V
S
|
S
G
 
G
L
 
F
E
 
E
M
 
M
S
 
S
Q
 
Q
N
 
N
A
 
S
A
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
S
W
 
W
P
 
T
R
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
S
R
 
K
L
 
L
L
 
H
Q
 
Q
I
 
V
M
 
M
Q
 
T
G
 
D
I
 
I
H
 
H
-
 
D
-
 
G
-
 
S
-
 
A
A
 
A
A
 
A
C
 
A
L
 
E
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
K
 
L
H
 
G
A
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
Y
S
 
N
Y
 
L
V
 
V
D
 
A
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
V
G
 
G
F
 
F
V
 
Q
K
 
K
V
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
M
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
V
 
I

7f79C Crystal structure of glutamate dehydrogenase 3 from candida albicans in complex with alpha-ketoglutarate and NADPH (see paper)
51% identity, 94% coverage: 28:464/464 of query aligns to 1:457/458 of 7f79C

query
sites
7f79C
S
 
S
H
 
H
V
 
M
A
 
V
L
 
L
R
 
-
N
 
-
P
 
P
G
 
H
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
V
 
Y
T
 
D
E
 
E
V
 
L
M
 
V
E
 
S
S
 
A
L
 
V
W
 
E
-
 
D
-
 
S
P
 
T
F
 
L
I
 
F
A
 
K
E
 
E
H
 
E
P
 
P
R
 
Q
Y
 
Y
A
 
K
E
 
K
H
 
-
G
 
-
L
 
V
L
 
I
E
 
P
R
 
V
L
 
V
V
 
S
E
 
I
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
I
V
 
I
M
 
Q
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
T
W
 
W
V
 
E
D
 
N
D
 
D
H
 
K
G
 
G
T
 
E
V
 
I
Q
 
E
V
 
V
N
 
N
R
 
N
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
Y
S
 
N
M
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
 
L
R
|
R
F
 
F
H
|
H
P
 
P
S
 
T
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
I
L
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
|
Q
T
 
I
F
 
F
K
|
K
N
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
G
L
 
L
P
 
S
M
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
N
P
 
P
K
|
K
G
 
N
R
 
R
S
 
S
P
 
D
G
 
N
E
 
E
V
 
I
M
 
R
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
V
A
 
S
F
 
F
V
 
M
S
 
R
E
 
Q
L
 
L
F
 
A
R
 
R
H
 
Y
V
 
I
G
 
G
A
 
P
D
 
D
T
 
T
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
G
 
G
D
|
D
I
|
I
G
|
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
F
G
 
G
M
 
A
M
 
Y
K
 
K
K
 
Q
L
 
M
S
 
R
N
 
N
R
 
N
A
 
W
D
 
A
C
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
T
F
 
W
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
R
|
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
C
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
V
Q
 
E
E
 
K
M
 
M
L
 
I
R
 
E
-
 
K
-
 
A
A
 
T
N
 
N
G
 
G
R
 
K
-
 
E
S
 
T
L
 
F
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
R
V
 
V
S
 
A
V
 
I
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
E
 
L
K
 
K
A
 
V
L
 
I
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
T
V
 
V
I
 
V
T
 
S
V
 
L
S
 
S
D
|
D
S
|
S
S
 
K
G
 
G
T
 
S
I
 
I
V
 
I
D
 
S
E
 
K
D
 
N
G
 
G
F
 
I
T
 
T
P
 
A
E
 
D
K
 
Q
L
 
V
A
 
Y
I
 
A
L
 
I
M
 
A
D
 
A
V
 
A
K
|
K
N
 
L
H
 
K
H
 
F
Y
 
K
G
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
V
-
 
A
-
 
D
R
 
S
V
 
V
S
 
Q
D
 
L
Y
 
F
A
 
S
E
 
G
R
 
D
T
 
H
G
 
S
V
 
V
K
 
E
F
 
Y
E
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
R
P
 
P
W
 
W
H
 
T
V
 
K
-
 
V
-
 
G
P
 
Q
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
x
S
A
|
A
T
|
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
L
 
V
D
 
S
A
 
G
R
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
K
T
 
A
L
 
L
I
 
V
K
 
D
N
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
K
C
 
F
V
 
I
A
 
A
E
 
E
G
|
G
A
x
S
N
|
N
M
 
M
P
 
G
S
 
S
T
 
T
I
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
A
 
A
-
 
N
-
 
R
-
 
D
-
 
S
A
 
N
G
 
G
V
 
V
L
 
W
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
N
|
N
A
 
C
G
 
G
G
|
G
V
|
V
A
 
A
T
 
V
S
|
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
A
Q
 
Q
N
 
N
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
Q
W
 
W
P
 
T
R
 
N
E
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
K
L
 
L
L
 
K
Q
 
E
I
 
I
M
 
M
Q
 
Y
G
 
T
I
 
C
H
 
F
A
 
E
A
 
N
C
 
C
L
 
Y
R
 
K
Y
 
T
G
 
A
-
 
Q
-
 
K
-
 
Y
-
 
S
-
 
I
-
 
E
K
 
K
H
 
N
A
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
L
V
 
P
S
 
S
Y
 
L
V
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
A
N
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
I
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
F
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
D
V
 
V

P00369 NADP-specific glutamate dehydrogenase; NADP-GDH; NADP-dependent glutamate dehydrogenase; EC 1.4.1.4 from Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) (see paper)
54% identity, 92% coverage: 35:462/464 of query aligns to 5:448/454 of P00369

query
sites
P00369
P
 
P
G
 
S
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
E
Q
 
Q
A
 
A
V
 
Y
T
 
K
E
 
E
V
 
L
M
 
A
E
 
Y
S
 
T
L
 
L
W
 
E
-
 
N
-
 
S
P
 
S
F
 
L
I
 
F
A
 
Q
E
 
K
H
 
H
P
 
P
R
 
E
Y
 
Y
A
 
R
E
 
T
H
 
A
G
 
L
L
 
T
L
 
V
E
 
A
R
 
S
L
 
I
V
 
-
E
 
-
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
I
M
 
Q
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
V
W
 
W
V
 
E
D
 
D
D
 
D
H
 
N
G
 
G
T
 
N
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
N
M
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
R
F
 
L
H
 
H
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
I
L
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
 
Q
T
 
I
F
 
F
K
 
K
N
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
G
L
 
L
P
 
S
M
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
S
 
A
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
D
G
 
A
E
 
E
V
 
I
M
 
R
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
C
A
 
A
F
 
F
V
 
M
S
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
H
R
 
K
H
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
D
I
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
M
 
M
A
 
F
G
 
G
M
 
A
M
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
A
S
 
A
N
 
N
R
 
R
A
 
F
D
 
E
C
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
L
S
 
S
F
 
W
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
R
 
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
L
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
V
Q
 
G
E
 
H
M
 
M
L
 
L
R
 
E
A
 
Y
N
 
S
G
 
G
R
 
A
-
 
G
S
 
S
L
 
Y
D
 
A
G
 
G
L
 
K
R
 
R
V
 
V
S
 
A
V
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
E
 
L
K
 
K
A
 
L
L
 
I
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
V
T
 
S
V
 
L
S
 
S
D
 
D
S
 
S
S
 
K
G
 
G
T
 
A
I
 
L
V
 
V
-
 
A
-
 
T
D
 
G
E
 
E
D
 
S
G
 
G
F
 
I
T
 
T
P
 
V
E
 
E
K
 
D
L
 
I
A
 
N
I
 
A
L
 
V
M
 
M
D
 
A
V
 
I
K
 
K
N
 
E
H
 
A
H
 
R
Y
 
Q
G
 
-
R
 
S
V
 
L
S
 
T
D
 
S
Y
 
F
A
 
Q
E
 
H
R
 
A
T
 
G
G
 
H
V
 
L
K
 
K
F
 
W
E
 
I
A
 
E
G
 
G
V
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
-
 
L
H
 
H
V
 
V
-
 
G
P
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
 
C
A
 
A
T
 
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
L
 
V
D
 
S
A
 
K
R
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
E
T
 
G
L
 
L
I
 
L
K
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
K
C
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
S
N
 
N
M
 
M
P
 
G
S
 
C
T
 
T
I
 
L
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
E
V
 
V
F
 
F
E
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
R
-
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
K
A
 
G
A
 
E
G
 
A
V
 
V
L
 
W
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
G
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
V
S
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
A
Q
 
Q
N
 
N
A
 
S
A
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
N
W
 
W
P
 
T
R
 
Q
E
 
A
E
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
E
R
 
K
L
 
L
L
 
K
Q
 
D
I
 
I
M
 
M
Q
 
K
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
F
-
 
N
G
 
G
I
 
L
H
 
N
A
 
T
A
 
A
C
 
-
L
 
K
R
 
T
Y
 
Y
G
 
V
K
 
E
H
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
L
-
 
P
S
 
S
Y
 
L
V
 
V
D
 
A
G
 
G
A
 
S
N
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
M
 
M
L
 
H
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5xwcA Crystal structure of aspergillus niger glutamate dehydrogenase complexed with alpha-iminoglutarate, 2-amino-2-hydroxyglutarate and NADP (see paper)
53% identity, 92% coverage: 35:462/464 of query aligns to 4:456/459 of 5xwcA

query
sites
5xwcA
P
 
P
G
 
H
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
E
Q
 
Q
A
 
A
V
 
Y
T
 
K
E
 
E
V
 
L
M
 
A
E
 
S
S
 
T
L
 
L
W
 
E
-
 
N
-
 
S
P
 
T
F
 
L
I
 
F
A
 
Q
E
 
K
H
 
N
P
 
P
R
 
E
Y
 
Y
A
 
R
E
 
K
H
 
-
G
 
-
L
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
V
L
 
V
V
 
S
E
 
V
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
I
M
 
Q
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
V
W
 
W
V
 
E
D
 
D
D
 
D
H
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
N
M
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
 
L
R
|
R
F
 
F
H
|
H
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
I
L
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
|
Q
T
 
I
F
 
F
K
|
K
N
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
G
L
 
L
P
 
N
M
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
|
K
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
D
G
 
N
E
 
E
V
 
I
M
 
R
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
V
A
 
S
F
 
F
V
 
M
S
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
C
R
 
K
H
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
G
|
G
D
|
D
I
|
I
G
|
G
V
 
V
G
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
F
G
 
G
M
 
Q
M
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
I
S
 
R
N
 
N
R
 
Q
A
 
W
D
 
E
C
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
G
S
 
S
F
 
W
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
R
|
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
V
Q
 
E
E
 
H
M
 
M
L
 
I
-
 
A
-
 
H
R
 
A
A
 
T
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
-
 
E
S
 
S
L
 
F
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
R
V
 
V
S
 
A
V
 
I
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
E
 
L
K
 
K
A
 
V
L
 
I
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
S
V
 
V
I
 
V
T
 
S
V
 
L
S
 
S
D
|
D
S
|
S
S
 
Q
G
 
G
T
 
S
I
 
L
V
 
I
-
 
I
-
 
N
D
 
G
E
 
E
D
 
G
G
 
S
F
 
F
T
 
T
P
 
P
E
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
E
I
 
L
L
 
I
M
 
A
D
 
Q
V
 
T
K
|
K
N
 
V
H
 
E
H
 
R
Y
 
K
G
x
Q
R
 
L
V
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
A
D
 
P
Y
 
F
A
 
S
E
 
D
R
 
A
T
 
N
G
 
K
V
 
F
K
 
K
F
 
Y
E
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
-
 
V
H
 
H
V
 
V
-
 
G
P
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
x
S
A
|
A
T
|
T
Q
 
Q
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
A
 
G
R
 
E
D
 
E
A
 
A
A
 
Q
T
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
N
N
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
K
C
 
F
V
 
I
A
 
A
E
 
E
G
|
G
A
x
S
N
|
N
M
 
M
P
 
G
S
 
C
T
 
T
I
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
I
K
 
D
V
 
T
F
 
F
E
 
E
-
 
A
-
 
H
-
 
R
-
 
T
-
 
A
-
 
N
-
 
A
-
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
I
L
 
W
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
A
 
A
S
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
|
G
V
|
V
A
 
A
T
 
V
S
|
S
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
A
Q
 
Q
N
 
N
A
 
S
A
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
S
W
 
W
P
 
T
R
 
S
E
 
E
E
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
K
Q
 
D
I
 
I
M
 
M
Q
 
R
G
 
D
I
 
C
H
 
F
A
 
K
A
 
N
C
 
G
L
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
Q
R
 
E
Y
 
Y
G
 
A
K
 
T
H
 
P
A
 
A
D
 
E
G
 
G
R
 
V
V
 
L
-
 
P
S
 
S
Y
 
L
V
 
V
D
 
T
G
 
G
A
 
S
N
 
N
I
 
I
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
T
K
 
K
V
 
V
A
 
A
D
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
K
A
 
D
Q
 
Q
G
 
G

5xw0A Crystal structure of aspergillus niger glutamate dehydrogenase complexed with isophthalate and NADPH (see paper)
53% identity, 92% coverage: 35:462/464 of query aligns to 4:456/459 of 5xw0A

query
sites
5xw0A
P
 
P
G
 
H
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
E
Q
 
Q
A
 
A
V
 
Y
T
 
K
E
 
E
V
 
L
M
 
A
E
 
S
S
 
T
L
 
L
W
 
E
-
 
N
-
 
S
P
 
T
F
 
L
I
 
F
A
 
Q
E
 
K
H
 
N
P
 
P
R
 
E
Y
 
Y
A
 
R
E
 
K
H
 
-
G
 
-
L
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
V
L
 
V
V
 
S
E
 
V
P
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
V
 
I
M
 
Q
F
 
F
R
 
R
V
 
V
S
 
V
W
 
W
V
 
E
D
 
D
D
 
D
H
 
A
G
 
G
T
 
N
V
 
V
Q
 
Q
V
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
H
 
F
S
 
N
M
 
S
A
 
A
I
 
L
G
 
G
P
 
P
F
 
Y
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
 
L
R
|
R
F
 
F
H
|
H
P
 
P
S
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
S
 
S
V
 
I
L
 
L
K
 
K
F
 
F
L
 
L
A
 
G
F
 
F
E
 
E
Q
|
Q
T
 
I
F
 
F
K
|
K
N
 
N
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
G
L
 
L
P
 
N
M
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
S
 
S
D
 
D
F
 
F
D
 
D
P
 
P
K
|
K
G
 
G
R
 
K
S
 
S
P
 
D
G
 
N
E
 
E
V
 
I
M
 
R
R
 
R
F
 
F
C
 
C
Q
 
V
A
 
S
F
 
F
V
 
M
S
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
C
R
 
K
H
 
H
V
 
I
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
D
 
D
V
 
V
P
 
P
A
|
A
G
|
G
D
|
D
I
|
I
G
|
G
V
 
V
G
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
F
G
 
G
M
 
Q
M
 
Y
K
 
R
K
 
K
L
 
I
S
 
R
N
 
N
R
 
Q
A
 
W
D
 
E
C
 
G
V
 
V
F
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
K
G
 
G
L
 
G
S
 
S
F
 
W
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
R
|
R
P
 
P
E
 
E
A
 
A
T
|
T
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
V
V
 
V
Y
 
Y
F
 
Y
A
 
V
Q
 
E
E
 
H
M
 
M
L
 
I
-
 
A
-
 
H
R
 
A
A
 
T
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
-
 
E
S
 
S
L
 
F
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
R
V
 
V
S
 
A
V
 
I
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
N
|
N
V
|
V
A
 
A
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
E
 
L
K
 
K
A
 
V
L
 
I
Q
 
E
L
 
L
G
 
G
A
 
G
K
 
S
V
 
V
I
 
V
T
 
S
V
 
L
S
 
S
D
|
D
S
|
S
S
 
Q
G
 
G
T
 
S
I
 
L
V
 
I
-
 
I
-
 
N
D
 
G
E
 
E
D
 
G
G
 
S
F
 
F
T
 
T
P
 
P
E
 
E
K
 
E
L
 
I
A
 
E
I
 
L
L
 
I
M
 
A
D
 
Q
V
 
T
K
 
K
N
 
V
H
 
E
H
 
R
Y
 
K
G
x
Q
R
 
L
V
 
A
S
 
S
-
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
A
D
 
P
Y
 
F
A
 
S
E
 
D
R
 
A
T
 
N
G
 
K
V
 
F
K
 
K
F
 
Y
E
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
R
P
 
P
W
 
W
-
 
V
H
 
H
V
 
V
-
 
G
P
 
K
V
 
V
D
 
D
V
 
V
A
 
A
L
 
L
P
 
P
C
x
S
A
|
A
T
|
T
Q
 
Q