SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_3192 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3192 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
33% identity, 86% coverage: 42:291/292 of query aligns to 8:257/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
T
 
T
R
 
K
D
 
K
T
 
E
R
 
G
G
 
N
V
 
L
V
 
F
T
 
W
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
x
D
R
x
K
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
G
 
N
S
 
A
E
 
K
M
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
D
R
 
R
A
 
A
L
 
V
D
 
S
D
 
Q
A
 
A
G
 
E
R
 
S
D
 
D
E
 
P
S
 
E
V
 
I
R
 
R
V
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
I
A
 
T
A
 
G
A
 
K
G
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
|
G
H
x
A
N
x
D
L
x
I
K
 
T
D
 
Q
M
x
F
A
 
N
A
 
Q
-
 
L
H
 
T
P
 
P
E
 
A
L
 
E
A
 
A
Y
 
W
Y
 
K
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
F
 
F
A
x
S
Q
 
K
C
 
K
S
 
G
R
|
R
-
 
E
M
 
I
M
 
M
L
 
D
T
 
K
I
 
I
H
 
E
K
 
A
L
 
L
S
 
S
V
 
K
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
M
V
 
I
Q
 
N
G
 
G
M
 
Y
A
 
A
T
x
L
A
x
G
A
x
G
G
 
G
C
 
L
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
L
Q
 
A
C
 
C
D
 
D
L
 
I
A
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
E
T
 
E
A
 
A
S
 
Q
F
 
L
A
 
G
T
 
L
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
N
Y
 
L
G
 
G
L
x
I
F
 
Y
C
x
P
A
x
G
T
 
Y
P
 
G
S
 
G
V
 
T
P
 
Q
-
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
V
V
 
I
P
 
G
A
 
K
K
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
L
E
 
E
M
 
M
L
 
M
L
 
M
T
 
T
G
 
G
D
 
D
F
x
R
I
 
I
D
 
P
A
 
G
P
 
K
T
 
D
A
 
A
L
 
E
A
 
K
Q
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
P
A
 
L
D
 
A
A
 
N
L
 
L
D
 
E
A
 
Q
E
 
E
V
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
L
V
 
A
L
 
E
S
 
K
I
 
I
L
 
A
Q
 
K
K
 
K
P
 
S
R
 
P
V
 
I
A
 
S
V
 
L
A
 
A
M
 
L
G
 
I
K
 
K
A
 
E
L
 
V
V
 
V
Y
 
N
Q
 
R
Q
 
G
R
 
L
E
 
D
L
 
S
G
 
P
M
 
L
D
 
L
A
 
S
A
 
G
Y
 
L
Q
x
A
L
 
L
A
 
E
G
 
S
Q
 
V
A
 
G
M
 
W
A
 
G
T
 
V
N
 
V
M
x
F
M
 
S
D
 
T
E
 
E
A
 
D
A
 
K
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
V
R
 
S
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
E
P
 
P
G
 
T
W
 
F
K
 
K

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
36% identity, 84% coverage: 47:291/292 of query aligns to 12:255/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
G
 
G
V
 
V
V
 
L
T
 
V
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
E
R
 
K
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
I
G
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
L
Q
 
Y
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
E
A
 
G
G
 
E
R
 
E
D
 
D
E
 
R
S
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
A
V
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
K
x
R
A
 
A
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
|
G
H
x
Q
N
x
D
L
|
L
K
 
T
D
 
E
M
x
F
A
 
G
A
 
D
H
 
R
-
 
K
P
 
P
E
 
D
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
Y
|
Y
Q
 
E
Q
 
A
L
x
H
F
x
L
A
 
R
Q
 
R
C
x
Y
S
x
N
R
 
R
M
 
V
M
 
V
L
 
E
T
 
A
I
 
L
H
 
S
K
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
V
A
 
V
R
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
M
x
V
A
 
A
T
x
A
A
x
G
A
|
A
G
 
G
C
 
M
Q
x
S
L
 
L
V
 
A
A
 
L
Q
 
W
C
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
T
T
 
T
S
x
A
G
x
F
I
 
V
H
 
R
Y
x
I
G
 
G
L
|
L
F
 
V
C
x
P
A
x
D
T
 
S
P
 
G
-
 
L
S
 
S
V
 
F
P
 
L
L
 
L
V
 
P
R
 
R
N
 
L
V
 
V
P
 
G
A
 
L
K
 
A
R
 
K
A
 
A
M
 
Q
E
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
S
D
 
P
F
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
A
P
 
E
T
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
P
A
 
A
D
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
L
K
 
S
L
 
L
V
 
A
L
 
K
S
 
E
I
 
L
L
 
A
Q
 
Q
K
 
G
P
 
P
R
 
T
V
 
R
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
M
 
L
G
 
T
K
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
L
Y
 
L
Q
 
E
Q
 
T
R
 
Y
E
 
R
L
 
L
G
 
S
M
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
A
Y
 
L
Q
x
A
L
 
L
A
 
E
G
 
A
-
 
V
-
 
L
Q
 
Q
A
 
G
M
 
Q
A
 
A
T
x
G
N
 
Q
M
 
T
M
 
Q
D
 
D
E
 
H
A
 
-
A
 
-
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
V
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
P
P
 
P
G
 
R
W
 
F
K
 
Q

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
36% identity, 84% coverage: 47:291/292 of query aligns to 9:243/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
G
 
G
V
 
V
V
 
L
T
 
V
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
E
R
x
K
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
I
G
 
T
S
 
G
E
 
E
M
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
A
L
 
L
Q
 
Y
R
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
E
A
 
G
G
 
E
R
 
E
D
 
D
E
 
R
S
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
A
V
 
L
V
 
L
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
K
x
R
A
 
A
F
 
F
C
 
S
A
|
A
G
|
G
H
x
Q
N
x
D
L
|
L
K
 
T
D
 
E
M
 
-
A
 
-
A
 
A
H
 
H
P
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
F
x
L
A
 
R
Q
 
R
C
x
Y
S
x
N
R
 
R
M
 
V
M
 
V
L
 
E
T
 
A
I
 
L
H
 
S
K
 
G
L
 
L
S
 
E
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
V
A
 
V
R
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
M
x
V
A
 
A
T
x
A
A
x
G
A
|
A
G
 
G
C
 
M
Q
x
S
L
 
L
V
 
A
A
 
L
Q
 
W
C
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
R
V
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
V
T
 
G
A
 
A
S
 
S
F
 
F
A
 
T
T
 
T
S
x
A
G
x
F
I
 
V
H
 
R
Y
x
I
G
 
G
L
|
L
F
 
V
C
x
P
A
x
N
T
 
S
P
 
G
-
 
L
S
 
S
V
 
F
P
 
L
L
 
L
V
 
P
R
 
R
N
 
L
V
 
V
P
 
G
A
 
L
K
 
A
R
 
K
A
 
A
M
 
Q
E
 
E
M
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
S
D
 
P
F
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
A
P
 
E
T
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
P
A
 
A
D
 
E
A
 
K
L
 
L
D
 
M
A
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
L
K
 
S
L
 
L
V
 
A
L
 
K
S
 
E
I
 
L
L
 
A
Q
 
Q
K
 
G
P
 
P
R
 
T
V
 
R
A
 
A
V
 
Y
A
 
A
M
 
L
G
 
T
K
 
K
A
 
K
L
 
L
V
 
L
Y
 
L
Q
 
E
Q
 
T
R
 
Y
E
 
R
L
 
L
G
 
S
M
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
A
Y
 
L
Q
x
A
L
 
L
A
 
E
G
 
A
-
 
V
-
 
L
Q
 
Q
A
 
G
M
 
Q
A
 
A
T
x
G
N
 
Q
M
 
T
M
 
Q
D
 
D
E
 
H
A
 
-
A
 
-
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
V
R
 
R
A
 
A
F
|
F
A
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
P
P
 
P
G
 
R
W
 
F
K
 
Q

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
32% identity, 84% coverage: 48:291/292 of query aligns to 18:264/266 of O53561

query
sites
O53561
V
 
T
V
 
L
T
 
I
L
 
V
T
 
T
L
 
M
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
A
R
 
A
F
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
S
S
 
T
E
 
E
M
 
M
L
 
M
A
 
R
A
 
I
L
 
M
Q
 
V
R
 
Q
A
 
A
L
 
W
D
 
D
D
 
R
A
 
V
G
 
D
R
 
N
D
 
D
E
 
P
S
 
D
V
 
I
R
 
R
V
 
C
V
 
C
V
 
I
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
G
A
 
Y
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
H
 
M
N
 
D
L
 
L
K
 
K
D
 
A
M
 
A
A
 
T
A
 
Q
H
 
K
P
 
P
E
 
P
L
 
G
A
 
D
Y
 
S
Y
 
F
Q
 
K
Q
 
D
L
 
G
F
 
S
A
 
Y
Q
 
G
C
 
P
S
 
S
R
 
R
M
 
I
-
 
D
-
 
A
M
 
L
L
 
L
T
 
K
I
 
G
H
 
R
K
 
R
L
 
L
S
 
T
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
M
 
P
A
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
T
Q
 
E
L
 
I
V
 
L
A
 
Q
Q
 
G
C
 
T
D
 
D
L
 
I
A
 
R
V
 
V
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
S
A
 
A
S
x
K
F
|
F
A
x
G
T
x
I
S
|
S
G
x
E
I
x
A
H
x
K
Y
 
W
G
 
S
L
 
L
F
 
Y
C
 
P
A
 
M
T
 
G
P
 
G
S
 
S
-
 
A
V
 
V
P
 
R
L
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
Q
V
 
I
P
 
P
A
 
Y
K
 
T
R
 
L
A
 
A
M
 
C
E
 
D
M
 
L
L
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
F
 
H
I
 
I
D
 
T
A
 
A
P
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
K
A
 
E
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
I
N
 
G
R
 
H
V
 
V
V
 
V
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
L
-
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
N
V
 
G
E
 
P
K
 
L
L
 
A
V
 
V
L
 
Q
S
 
A
I
 
I
L
 
L
Q
 
R
K
 
S
P
 
I
R
 
R
V
 
E
A
 
T
V
 
E
A
 
C
M
 
M
G
 
P
K
 
E
A
 
-
L
 
-
V
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
N
A
 
E
A
 
A
Y
 
F
Q
 
K
L
 
I
A
 
D
G
 
T
Q
 
Q
A
 
I
M
 
G
A
 
I
T
 
K
N
 
V
M
 
F
M
 
L
D
 
S
E
 
D
A
 
D
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
P
R
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
P
 
P
G
 
N
W
 
F
K
 
Q

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
32% identity, 86% coverage: 37:288/292 of query aligns to 3:247/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
E
 
E
L
 
T
L
 
I
Q
 
L
T
 
V
T
 
E
R
 
R
D
 
D
T
 
Q
R
 
R
G
 
-
V
 
V
V
 
G
T
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
Q
R
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
N
S
 
S
E
 
Q
M
 
V
L
 
M
A
 
N
A
 
E
L
 
V
Q
 
T
R
 
S
A
 
A
L
 
A
D
 
T
D
 
E
A
 
L
G
 
D
R
 
D
D
 
D
E
 
P
S
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
A
 
T
A
 
G
A
 
S
G
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
H
x
A
N
 
D
L
 
I
K
 
K
D
 
E
M
|
M
A
 
F
A
 
A
H
 
D
P
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
A
Y
 
F
Y
x
T
Q
 
A
Q
 
D
L
 
F
F
|
F
A
 
A
Q
 
T
C
 
W
S
 
G
R
 
K
M
 
L
M
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
A
K
 
A
L
 
V
S
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
A
T
 
L
A
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
K
Y
 
L
G
 
G
L
x
V
F
 
L
C
x
P
A
x
G
T
 
M
P
 
G
-
 
G
S
 
S
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
I
P
 
G
A
 
K
K
 
A
R
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
F
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
P
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
R
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
D
L
 
L
D
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
A
E
 
R
K
 
A
L
 
T
V
 
A
L
 
T
S
 
T
I
 
I
L
 
S
Q
 
Q
K
 
M
P
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
R
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
A
V
 
V
Y
 
N
Q
 
R
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
S
G
 
S
M
 
L
D
 
S
A
 
E
A
 
G
Y
 
L
Q
x
L
L
 
Y
A
 
E
G
 
R
Q
 
R
A
 
L
M
x
F
A
 
H
T
 
S
N
 
A
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
E
A
 
D
A
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
A
A
 
A
F
|
F
A
 
I
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
A
P
 
P

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
31% identity, 83% coverage: 51:291/292 of query aligns to 19:252/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
x
K
R
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
G
 
C
S
 
N
E
 
G
M
 
L
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
T
A
 
F
G
 
E
R
 
E
D
 
D
E
 
P
S
 
A
V
 
V
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
G
G
 
E
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
H
x
A
N
x
D
L
x
I
K
|
K
D
 
E
M
|
M
A
 
Q
A
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
Y
 
-
Q
 
N
Q
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
Q
Q
 
D
C
 
C
S
 
Y
R
x
S
M
 
H
M
 
W
L
 
D
T
 
H
I
 
I
H
 
T
K
 
R
L
 
I
S
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
M
x
Y
A
 
A
T
 
L
A
x
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
A
 
I
V
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
L
Y
x
L
G
 
G
L
x
T
F
 
I
-
x
P
C
x
G
A
|
A
T
 
G
P
 
G
S
 
T
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
V
P
 
G
A
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
M
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
L
 
P
A
 
V
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
I
K
 
Q
L
 
C
V
 
A
L
 
E
S
 
K
I
 
I
L
 
A
Q
 
N
K
 
N
P
 
S
R
 
K
V
 
I
A
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
S
V
 
V
Y
 
N
Q
 
A
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
M
G
 
T
M
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
G
Y
 
N
Q
x
K
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
K
A
 
L
M
 
F
A
 
Y
T
 
S
N
 
T
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
D
A
 
D
A
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
P
 
A
G
 
N
W
 
F
K
 
K

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
32% identity, 86% coverage: 37:288/292 of query aligns to 3:251/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
E
 
E
L
 
T
L
 
I
Q
 
L
T
 
V
T
 
E
R
 
R
D
 
D
T
 
Q
R
 
R
G
 
-
V
 
V
V
 
G
T
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
Q
R
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
N
S
 
S
E
 
Q
M
 
V
L
 
M
A
 
N
A
 
E
L
 
V
Q
 
T
R
 
S
A
 
A
L
 
A
D
 
T
D
 
E
A
 
L
G
 
D
R
 
D
D
 
D
E
 
P
S
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
A
 
T
A
 
G
A
 
S
G
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
H
x
A
N
 
D
L
 
I
K
 
K
D
 
E
M
|
M
A
 
A
A
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
D
L
 
L
A
 
T
Y
 
F
Y
 
A
Q
 
D
Q
 
A
L
 
F
F
x
T
A
 
A
Q
 
D
C
 
F
S
x
F
R
 
A
M
 
T
M
 
W
L
 
G
T
 
K
I
 
L
H
 
A
K
 
A
L
 
V
S
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
A
T
 
L
A
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
K
Y
 
L
G
 
G
L
x
V
F
 
L
C
x
P
A
x
G
T
 
M
P
 
G
-
 
G
S
 
S
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
I
P
 
G
A
 
K
K
 
A
R
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
F
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
P
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
E
A
x
R
Q
x
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
D
L
 
L
D
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
A
E
 
R
K
 
A
L
 
T
V
 
A
L
 
T
S
 
T
I
 
I
L
 
S
Q
 
Q
K
 
M
P
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
R
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
A
V
 
V
Y
 
N
Q
 
R
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
S
G
 
S
M
 
L
D
 
S
A
 
E
A
 
G
Y
 
L
Q
x
L
L
 
Y
A
 
E
G
 
R
Q
 
R
A
 
L
M
 
F
A
 
H
T
 
S
N
 
A
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
E
A
 
D
A
x
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
P
 
P

3q0jA Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
32% identity, 86% coverage: 37:288/292 of query aligns to 4:252/255 of 3q0jA

query
sites
3q0jA
E
 
E
L
 
T
L
 
I
Q
 
L
T
 
V
T
 
E
R
 
R
D
 
D
T
 
Q
R
 
R
G
 
-
V
 
V
V
 
G
T
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
Q
R
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
N
S
 
S
E
 
Q
M
 
V
L
 
M
A
 
N
A
 
E
L
 
V
Q
 
T
R
 
S
A
 
A
L
 
A
D
 
T
D
 
E
A
 
L
G
 
D
R
 
D
D
 
D
E
 
P
S
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
A
 
T
A
 
G
A
 
S
G
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
H
x
A
N
 
D
L
 
I
K
 
K
D
 
E
M
|
M
A
 
A
A
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
D
L
 
L
A
 
T
Y
 
F
Y
 
A
Q
 
D
Q
 
A
L
 
F
F
x
T
A
 
A
Q
 
D
C
 
F
S
x
F
R
 
A
M
 
T
M
 
W
L
 
G
T
 
K
I
 
L
H
 
A
K
 
A
L
 
V
S
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
A
T
 
L
A
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
K
Y
 
L
G
 
G
L
x
V
F
 
L
C
x
P
A
x
G
T
 
M
P
 
G
-
 
G
S
 
S
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
I
P
 
G
A
 
K
K
 
A
R
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
F
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
P
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
R
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
D
L
 
L
D
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
A
E
 
R
K
 
A
L
 
T
V
 
A
L
 
T
S
 
T
I
 
I
L
 
S
Q
 
Q
K
 
M
P
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
R
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
A
V
 
V
Y
 
N
Q
 
R
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
S
G
 
S
M
 
L
D
 
S
A
 
E
A
 
G
Y
 
L
Q
x
L
L
 
Y
A
 
E
G
 
R
Q
 
R
A
 
L
M
 
F
A
 
H
T
 
S
N
 
A
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
E
A
 
D
A
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
A
A
 
A
F
|
F
A
 
I
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
A
P
 
P

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
32% identity, 86% coverage: 37:288/292 of query aligns to 4:252/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
E
 
E
L
 
T
L
 
I
Q
 
L
T
 
V
T
 
E
R
 
R
D
 
D
T
 
Q
R
 
R
G
 
-
V
 
V
V
 
G
T
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
Q
R
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
G
 
N
S
 
S
E
 
Q
M
 
V
L
 
M
A
 
N
A
 
E
L
 
V
Q
 
T
R
 
S
A
 
A
L
 
A
D
 
T
D
 
E
A
 
L
G
 
D
R
 
D
D
 
D
E
 
P
S
 
D
V
 
I
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
I
L
 
I
A
 
T
A
 
G
A
 
S
G
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
H
x
A
N
x
D
L
x
I
K
|
K
D
 
E
M
|
M
A
 
A
A
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
D
L
 
L
A
 
T
Y
 
F
Y
 
A
Q
 
D
Q
 
A
L
 
F
F
x
T
A
 
A
Q
 
D
C
 
F
S
x
F
R
 
A
M
 
T
M
 
W
L
 
G
T
 
K
I
 
L
H
 
A
K
 
A
L
 
V
S
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
T
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
M
x
Y
A
 
A
T
 
L
A
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
V
A
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
A
S
 
K
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
K
Y
x
L
G
 
G
L
x
V
F
 
L
C
x
P
A
x
G
T
 
M
P
 
G
-
 
G
S
 
S
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
I
P
 
G
A
 
K
K
 
A
R
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
D
M
 
L
L
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
R
F
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
P
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
E
A
 
R
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
P
A
 
A
D
 
D
A
 
D
L
 
L
D
 
L
A
 
T
E
 
E
V
 
A
E
 
R
K
 
A
L
 
T
V
 
A
L
 
T
S
 
T
I
 
I
L
 
S
Q
 
Q
K
 
M
P
 
S
R
 
A
V
 
S
A
 
A
V
 
A
A
 
R
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
A
V
 
V
Y
 
N
Q
 
R
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
S
G
 
S
M
 
L
D
 
S
A
 
E
A
 
G
Y
 
L
Q
x
L
L
 
Y
A
 
E
G
 
R
Q
 
R
A
 
L
M
 
F
A
 
H
T
 
S
N
 
A
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
E
A
 
D
A
 
Q
Q
 
S
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
A
P
 
P

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
31% identity, 83% coverage: 51:291/292 of query aligns to 20:256/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
x
K
R
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
G
 
C
S
 
N
E
 
G
M
 
L
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
T
A
 
F
G
 
E
R
 
E
D
 
D
E
 
P
S
 
A
V
 
V
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
G
G
 
E
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
H
x
A
N
x
D
L
x
I
K
|
K
D
 
E
M
|
M
A
 
Q
A
 
N
H
 
R
P
 
T
E
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
Y
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
L
 
C
F
 
Y
A
x
S
Q
 
G
C
x
L
S
 
S
R
 
H
M
x
W
M
 
D
L
 
-
T
 
H
I
 
I
H
 
T
K
 
R
L
 
I
S
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
M
x
Y
A
 
A
T
x
L
A
x
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
A
 
I
V
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
L
Y
x
L
G
 
G
L
x
T
F
 
I
-
x
P
C
x
G
A
|
A
T
 
G
P
 
G
S
 
T
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
V
P
 
G
A
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
M
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
L
 
P
A
 
V
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
I
K
 
Q
L
 
C
V
 
A
L
 
E
S
 
K
I
 
I
L
 
A
Q
 
N
K
 
N
P
 
S
R
 
K
V
 
I
A
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
S
V
 
V
Y
 
N
Q
 
A
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
M
G
 
T
M
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
G
Y
 
N
Q
x
K
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
K
A
 
L
M
x
F
A
 
Y
T
 
S
N
 
T
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
D
A
 
D
A
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
S
A
 
A
F
|
F
A
 
V
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
K
P
 
A
G
 
N
W
 
F
K
 
K

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
31% identity, 83% coverage: 51:291/292 of query aligns to 18:256/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
x
K
R
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
G
 
C
S
 
N
E
 
G
M
 
L
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
T
A
 
F
G
 
E
R
 
E
D
 
D
E
 
P
S
 
A
V
 
V
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
H
x
A
N
x
D
L
x
I
K
|
K
D
 
E
M
|
M
A
 
Q
A
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
Y
 
-
Q
 
N
Q
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
Q
Q
 
D
C
 
C
S
 
Y
R
x
S
M
 
G
M
 
K
L
 
F
T
x
L
I
 
S
H
 
H
-
x
W
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
T
K
 
R
L
 
I
S
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
M
x
Y
A
 
A
T
x
L
A
x
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
A
 
I
V
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
L
Y
x
L
G
 
G
L
x
T
F
 
I
-
x
P
C
x
G
A
|
A
T
 
G
P
 
G
S
 
T
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
V
P
 
G
A
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
M
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
F
x
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
L
 
P
A
 
V
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
I
K
 
Q
L
 
C
V
 
A
L
 
E
S
 
K
I
 
I
L
 
A
Q
 
N
K
 
N
P
 
S
R
 
K
V
 
I
A
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
S
V
 
V
Y
 
N
Q
 
A
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
M
G
 
T
M
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
G
Y
 
N
Q
x
K
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
K
A
 
L
M
x
F
A
 
Y
T
 
S
N
 
T
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
D
A
 
D
A
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
S
A
 
A
F
|
F
A
 
V
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
K
P
 
A
G
 
N
W
 
F
K
 
K

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
31% identity, 83% coverage: 51:291/292 of query aligns to 20:258/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
x
K
R
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
G
 
C
S
 
N
E
 
G
M
 
L
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
T
A
 
F
G
 
E
R
 
E
D
 
D
E
 
P
S
 
A
V
 
V
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
G
G
 
E
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
H
x
A
N
x
D
L
x
I
K
|
K
D
 
E
M
|
M
A
 
Q
A
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
Y
 
-
Q
 
N
Q
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
Q
Q
 
D
C
 
C
S
 
Y
R
x
S
M
 
G
M
 
K
L
 
F
T
x
L
I
 
S
H
 
H
-
 
W
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
T
K
 
R
L
 
I
S
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
M
x
Y
A
 
A
T
x
L
A
x
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
A
 
I
V
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
L
Y
x
L
G
 
G
L
x
T
F
 
I
-
x
P
C
x
G
A
 
A
T
 
G
P
 
G
S
 
T
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
V
P
 
G
A
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
M
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
L
 
P
A
 
V
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
I
K
 
Q
L
 
C
V
 
A
L
 
E
S
 
K
I
 
I
L
 
A
Q
 
N
K
 
N
P
 
S
R
 
K
V
 
I
A
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
S
V
 
V
Y
 
N
Q
 
A
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
M
G
 
T
M
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
G
Y
 
N
Q
x
K
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
K
A
 
L
M
x
F
A
 
Y
T
 
S
N
 
T
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
D
A
 
D
A
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
S
A
 
A
F
|
F
A
 
V
E
 
E
K
|
K
R
 
R
Q
 
K
P
 
A
G
 
N
W
 
F
K
 
K

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
31% identity, 88% coverage: 34:291/292 of query aligns to 2:258/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
N
 
N
S
 
F
D
 
E
E
 
Y
L
 
I
L
 
I
Q
 
A
T
 
E
T
 
K
R
 
R
D
 
G
T
 
K
R
 
N
G
 
N
V
 
T
V
 
V
T
 
G
L
 
L
T
 
I
-
 
Q
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
x
K
R
x
A
F
x
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
G
 
C
S
 
D
E
 
G
M
 
L
L
 
I
A
 
D
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
K
D
 
I
A
 
F
G
 
E
R
 
E
D
 
D
E
 
P
S
 
A
V
 
V
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
G
G
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
H
x
A
N
x
D
L
x
I
K
|
K
D
 
E
M
|
M
A
 
Q
A
 
N
H
 
L
P
 
S
E
 
F
L
 
Q
A
 
D
Y
 
C
Y
 
Y
Q
x
S
Q
 
S
L
 
K
F
 
F
A
x
L
Q
 
K
C
 
H
S
 
W
R
 
D
M
 
H
M
 
L
L
 
T
T
 
Q
I
 
V
H
 
K
K
 
K
L
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
M
x
Y
A
 
A
T
x
F
A
 
G
A
x
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
A
 
I
V
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
A
 
A
T
 
Q
S
x
P
G
x
E
I
 
I
H
 
L
Y
 
I
G
 
G
L
x
T
F
 
I
-
x
P
C
x
G
A
 
A
T
 
G
P
 
G
S
 
T
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
V
P
 
G
A
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
M
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
C
L
 
P
A
 
V
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
I
K
 
Q
L
 
C
V
 
A
L
 
E
S
 
K
I
 
I
L
 
A
Q
 
S
K
 
N
P
 
S
R
 
K
V
 
I
A
 
V
V
 
V
A
 
A
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
S
V
 
V
Y
 
N
Q
 
A
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
M
G
 
T
M
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
G
Y
 
S
Q
x
K
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
K
A
 
L
M
 
F
A
 
Y
T
 
S
N
 
T
M
x
F
M
 
A
D
 
T
E
 
D
A
 
D
A
 
R
Q
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
P
 
A
G
 
N
W
 
F
K
 
K

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
31% identity, 83% coverage: 51:291/292 of query aligns to 50:288/290 of P14604

query
sites
P14604
L
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
K
R
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
G
 
C
S
 
N
E
 
G
M
 
L
L
 
I
A
 
E
A
 
E
L
 
L
Q
 
N
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
D
 
T
A
 
F
G
 
E
R
 
E
D
 
D
E
 
P
S
 
A
V
 
V
R
 
G
V
 
A
V
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
G
G
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
H
 
A
N
 
D
L
 
I
K
 
K
D
 
E
M
 
M
A
 
Q
A
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
-
L
 
-
A
 
-
Y
 
-
Y
 
-
Q
 
N
Q
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
Q
Q
 
D
C
 
C
S
 
Y
R
 
S
M
 
G
M
 
K
L
 
F
T
 
L
I
 
S
H
 
H
-
 
W
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
T
K
 
R
L
 
I
S
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
M
 
Y
A
 
A
T
 
L
A
 
G
A
 
G
G
 
G
C
 
C
Q
x
E
L
 
L
V
 
A
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
I
A
 
I
V
 
Y
A
 
A
A
 
G
D
 
E
T
 
K
A
 
A
S
 
Q
F
 
F
A
 
G
T
 
Q
S
 
P
G
x
E
I
 
I
H
 
L
Y
 
L
G
 
G
L
 
T
F
 
I
-
 
P
C
 
G
A
 
A
T
 
G
P
 
G
S
 
T
V
 
Q
P
 
R
L
 
L
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
V
P
 
G
A
 
K
K
 
S
R
 
L
A
 
A
M
 
M
E
 
E
M
 
M
L
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
D
 
D
F
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
P
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
Q
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
L
 
P
A
 
V
D
 
E
A
 
T
L
 
L
D
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
I
K
 
Q
L
 
C
V
 
A
L
 
E
S
 
K
I
 
I
L
 
A
Q
 
N
K
 
N
P
 
S
R
 
K
V
 
I
A
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
M
G
 
A
K
 
K
A
 
E
L
 
S
V
 
V
Y
 
N
Q
 
A
Q
 
A
R
 
F
E
 
E
L
 
M
G
 
T
M
 
L
D
 
T
A
 
E
A
 
G
Y
 
N
Q
 
K
L
 
L
A
 
E
G
 
K
Q
 
K
A
 
L
M
 
F
A
 
Y
T
 
S
N
 
T
M
 
F
M
 
A
D
 
T
E
 
D
A
 
D
A
 
R
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
M
R
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
Q
 
K
P
 
A
G
 
N
W
 
F
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4elxA Structure of apo e.Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coa synthases with cl (see paper)
32% identity, 88% coverage: 37:292/292 of query aligns to 20:263/268 of 4elxA

query
sites
4elxA
E
 
E
L
 
D
L
 
I
Q
 
R
T
 
Y
T
 
E
R
 
K
D
 
S
T
 
T
R
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
A
T
 
K
L
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
Q
R
 
V
F
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
G
 
R
S
 
P
E
 
L
M
 
T
L
 
V
A
 
K
A
 
E
L
 
M
Q
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
R
R
 
Y
D
 
D
E
 
D
S
 
N
V
 
I
R
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
S
G
 
G
H
 
-
N
 
-
L
 
-
K
x
G
D
 
D
M
 
Q
A
 
K
A
 
H
H
|
H
P
 
L
E
 
N
L
 
V
A
x
L
Y
 
D
Y
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
Q
F
 
I
A
 
R
Q
 
T
C
 
C
S
 
P
R
 
K
M
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
S
T
 
I
A
x
G
A
x
G
G
 
G
C
 
H
Q
x
V
L
 
L
V
 
H
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
A
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
A
 
G
T
x
Q
S
x
T
G
|
G
I
 
P
H
 
K
Y
 
V
G
 
G
L
x
S
F
 
F
C
x
D
A
x
G
T
 
G
P
 
W
S
 
G
V
 
A
P
 
S
-
 
Y
L
 
M
V
 
A
R
 
R
N
 
I
V
 
V
P
 
G
A
 
Q
K
 
K
R
 
K
A
 
A
M
 
R
E
 
E
M
 
I
L
x
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
D
 
R
F
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
P
 
K
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
D
Q
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
N
 
N
R
 
T
V
 
V
V
 
V
L
 
P
A
 
L
D
 
A
A
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
E
 
V
K
 
R
L
 
W
V
 
C
L
 
R
S
 
E
I
 
M
L
 
L
Q
 
Q
K
 
N
P
 
S
R
 
P
V
 
M
A
 
A
V
 
L
A
 
R
M
 
C
G
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
A
V
 
L
Y
 
N
Q
 
A
Q
 
D
R
 
C
E
 
D
L
 
-
G
 
G
M
 
Q
D
 
A
A
 
G
A
 
L
Y
 
Q
Q
 
E
L
 
L
A
|
A
G
 
G
Q
 
N
A
 
A
M
 
T
A
 
M
T
 
L
N
 
F
M
x
Y
M
 
M
D
 
T
E
 
E
A
 
E
A
 
G
Q
 
Q
E
 
E
G
 
G
A
 
R
R
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
G
 
D
W
 
F
K
 
S
R
 
K

4elwA Structure of e. Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coenzyme a synthases (menb) in complex with nitrate (see paper)
32% identity, 88% coverage: 37:292/292 of query aligns to 20:262/267 of 4elwA

query
sites
4elwA
E
 
E
L
 
D
L
 
I
Q
 
R
T
 
Y
T
 
E
R
 
K
D
 
S
T
 
T
R
 
D
G
 
G
V
 
I
V
 
A
T
 
K
L
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
D
 
R
P
 
P
A
 
Q
R
 
V
F
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
G
 
R
S
 
P
E
 
L
M
 
T
L
 
V
A
 
K
A
 
E
L
 
M
Q
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
R
R
 
Y
D
 
D
E
 
D
S
 
N
V
 
I
R
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
A
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
S
G
 
G
H
x
G
N
 
D
L
 
Q
K
 
K
D
 
-
M
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
H
P
 
L
E
 
N
L
 
V
A
x
L
Y
 
D
Y
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
Q
F
 
I
A
 
R
Q
 
T
C
 
C
S
 
P
R
 
K
M
 
-
M
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
-
H
 
-
K
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
M
 
Y
A
 
S
T
 
I
A
x
G
A
x
G
G
 
G
C
 
H
Q
x
V
L
 
L
V
 
H
A
 
M
Q
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
A
 
T
V
 
I
A
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
N
A
 
A
S
 
I
F
 
F
A
 
G
T
x
Q
S
x
T
G
|
G
I
 
P
H
 
K
Y
 
V
G
 
G
L
x
S
F
|
F
C
x
D
A
x
G
T
 
G
P
 
W
S
 
G
V
 
A
P
 
S
-
 
Y
L
 
M
V
 
A
R
 
R
N
 
I
V
 
V
P
 
G
A
 
Q
K
 
K
R
 
K
A
 
A
M
 
R
E
 
E
M
 
I
L