SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing Ac3H11_3590 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3590 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4zohC Crystal structure of glyceraldehyde oxidoreductase (see paper)
54% identity, 99% coverage: 1:154/156 of query aligns to 10:161/161 of 4zohC

query
sites
4zohC
M
 
V
Q
 
K
V
 
I
Q
 
T
F
 
L
T
 
K
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
E
A
 
K
A
 
Y
S
 
E
V
 
T
D
 
E
V
 
V
P
 
E
P
 
P
N
 
R
T
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
H
A
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
-
L
 
L
L
 
G
L
 
F
T
 
T
G
 
G
T
 
V
H
 
H
V
 
I
G
 
G
C
|
C
D
 
D
T
 
T
S
|
S
Q
 
N
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
I
V
 
M
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
S
V
 
V
K
 
K
S
 
S
C
|
C
A
 
T
M
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
-
D
 
D
G
 
G
T
 
K
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
I
Q
 
Q
A
 
E
A
 
A
F
 
F
K
 
W
E
 
E
C
 
N
H
 
H
G
 
A
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
I
M
 
M
S
 
E
A
 
A
V
 
Y
D
 
W
L
 
L
C
 
L
K
 
R
N
 
E
H
 
K
P
 
P
G
 
N
A
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
G
L
 
I
E
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
K
V
 
A
G
 
A
Q
 
A
K
 
E
A
 
K
M
 
L
A
 
S

P19921 Carbon monoxide dehydrogenase small chain; CO dehydrogenase subunit S; CO-DH S; EC 1.2.5.3 from Afipia carboxidovorans (strain ATCC 49405 / DSM 1227 / KCTC 32145 / OM5) (Oligotropha carboxidovorans) (see 2 papers)
57% identity, 94% coverage: 2:147/156 of query aligns to 5:150/166 of P19921

query
sites
P19921
Q
 
H
V
 
I
Q
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
H
A
 
P
A
 
V
S
 
E
V
 
A
D
 
L
V
 
V
P
 
E
P
 
P
N
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
F
L
 
I
R
 
R
E
 
E
H
 
Q
L
 
Q
L
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
 
H
V
 
I
G
 
G
C
|
C
D
 
D
T
 
T
S
 
S
Q
 
H
C
|
C
G
 
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
D
V
 
L
N
 
D
G
 
G
R
 
M
A
 
S
V
 
V
K
 
K
S
 
S
C
|
C
A
 
T
M
 
M
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
T
M
 
L
H
 
S
P
 
A
M
 
L
Q
 
Q
A
 
E
A
 
G
F
 
F
K
 
R
E
 
M
C
 
M
H
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
I
M
 
M
S
 
R
A
 
S
V
 
H
D
 
R
L
 
L
C
 
L
K
 
Q
N
 
E
H
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
F
L
 
G
L
 
I
E
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q

1n5wA Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); oxidized form (see paper)
57% identity, 94% coverage: 2:147/156 of query aligns to 3:148/161 of 1n5wA

query
sites
1n5wA
Q
 
H
V
 
I
Q
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
H
A
 
P
A
 
V
S
 
E
V
 
A
D
 
L
V
 
V
P
 
E
P
 
P
N
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
F
L
 
I
R
 
R
E
 
E
H
 
Q
L
 
Q
L
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
 
H
V
x
I
G
|
G
C
|
C
D
 
D
T
 
T
S
|
S
Q
x
H
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
D
V
 
L
N
 
D
G
 
G
R
 
M
A
 
S
V
 
V
K
 
K
S
 
S
C
|
C
A
 
T
M
 
M
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
T
M
 
L
H
 
S
P
 
A
M
 
L
Q
 
Q
A
 
E
A
 
G
F
 
F
K
 
R
E
 
M
C
 
M
H
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
I
M
 
M
S
 
R
A
 
S
V
 
H
D
 
R
L
 
L
C
 
L
K
 
Q
N
 
E
H
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
F
L
 
G
L
 
I
E
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q

1n5wD Crystal structure of the cu,mo-co dehydrogenase (codh); oxidized form (see paper)
57% identity, 94% coverage: 2:147/156 of query aligns to 3:148/158 of 1n5wD

query
sites
1n5wD
Q
 
H
V
 
I
Q
 
E
F
 
L
T
 
T
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
H
A
 
P
A
 
V
S
 
E
V
 
A
D
 
L
V
 
V
P
 
E
P
 
P
N
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
F
L
 
I
R
 
R
E
 
E
H
 
Q
L
 
Q
L
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
 
H
V
 
I
G
 
G
C
|
C
D
 
D
T
 
T
S
|
S
Q
x
H
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
D
V
 
L
N
 
D
G
 
G
R
 
M
A
 
S
V
 
V
K
 
K
S
 
S
C
|
C
A
 
T
M
 
M
L
 
F
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
T
M
 
L
H
 
S
P
 
A
M
 
L
Q
 
Q
A
 
E
A
 
G
F
 
F
K
 
R
E
 
M
C
 
M
H
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
I
M
 
M
S
 
R
A
 
S
V
 
H
D
 
R
L
 
L
C
 
L
K
 
Q
N
 
E
H
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
F
L
 
G
L
 
I
E
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q

1ffvA Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava (see paper)
55% identity, 97% coverage: 3:153/156 of query aligns to 4:153/155 of 1ffvA

query
sites
1ffvA
V
 
I
Q
 
T
F
 
V
T
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
Q
S
 
E
V
 
K
D
 
A
V
 
V
P
 
E
P
 
P
N
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
L
 
L
L
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
 
H
V
x
I
G
 
G
C
|
C
D
 
E
T
 
T
S
|
S
Q
 
H
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
S
V
 
V
K
 
K
S
 
S
C
|
C
A
 
T
M
 
H
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
C
Q
 
D
G
 
G
A
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
-
A
 
A
A
 
N
D
 
K
G
 
G
T
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
A
M
 
V
Q
 
Q
A
 
E
A
 
G
F
 
F
K
 
Y
E
 
K
C
 
E
H
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
L
M
 
M
S
 
R
A
 
A
V
 
Y
D
 
R
L
 
F
C
 
L
K
 
Q
N
 
E
H
 
N
P
 
P
G
 
N
A
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
M
L
 
G
L
 
M
E
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
Y
G
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
K
M
 
L

1ffuD Carbon monoxide dehydrogenase from hydrogenophaga pseudoflava which lacks the mo-pyranopterin moiety of the molybdenum cofactor (see paper)
55% identity, 97% coverage: 3:153/156 of query aligns to 5:154/156 of 1ffuD

query
sites
1ffuD
V
 
I
Q
 
T
F
 
V
T
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
Q
S
 
E
V
 
K
D
 
A
V
 
V
P
 
E
P
 
P
N
 
R
T
 
T
L
 
L
L
 
L
V
 
I
H
 
H
A
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
E
L
 
L
L
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
A
H
 
H
V
 
I
G
 
G
C
|
C
D
 
E
T
 
T
S
|
S
Q
x
H
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
D
V
 
I
N
 
D
G
 
G
R
 
R
A
 
S
V
 
V
K
 
K
S
 
S
C
|
C
A
 
T
M
 
H
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
C
Q
 
D
G
 
G
A
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
L
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
-
A
 
A
A
 
N
D
 
K
G
 
G
T
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
A
M
 
V
Q
 
Q
A
 
E
A
 
G
F
 
F
K
 
Y
E
 
K
C
 
E
H
 
H
G
 
G
L
 
L
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
L
M
 
M
S
 
R
A
 
A
V
 
Y
D
 
R
L
 
F
C
 
L
K
 
Q
N
 
E
H
 
N
P
 
P
G
 
N
A
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
M
L
 
G
L
 
M
E
 
T
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
N
I
 
I
V
 
V
R
 
K
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
V
 
Y
G
 
A
Q
 
A
K
 
R
A
 
K
M
 
L

5y6qA Crystal structure of an aldehyde oxidase from methylobacillus sp. Ky4400 (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:155/156 of query aligns to 3:157/157 of 5y6qA

query
sites
5y6qA
M
 
I
Q
 
S
V
 
L
Q
 
T
F
 
M
T
 
Q
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
A
 
P
A
 
Y
S
 
P
V
 
M
D
 
E
V
 
I
P
 
D
P
 
P
N
 
R
T
 
V
L
 
T
L
 
L
V
 
L
H
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
H
L
 
L
L
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
K
V
 
K
G
|
G
C
|
C
D
|
D
T
 
Q
S
x
G
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
A
 
R
V
 
V
K
 
L
S
 
S
C
|
C
A
 
L
M
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
T
 
T
T
 
S
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
Q
A
 
S
A
 
A
D
 
S
G
 
G
T
 
E
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
V
Q
 
Q
A
 
R
A
 
C
F
 
F
K
 
V
E
 
E
C
 
N
H
 
D
G
 
A
L
 
F
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
Q
V
 
I
M
 
M
S
 
S
A
 
A
V
 
V
D
 
A
L
 
C
C
 
I
K
 
K
N
 
E
H
 
G
P
 
H
G
 
A
A
 
G
S
 
S
E
 
D
G
 
D
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
Y
L
 
M
E
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
G
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
P
N
 
H
I
 
I
V
 
I
R
 
D
A
 
A
V
 
I
Q
 
K
V
 
Q
G
 
A
Q
 
A
K
 
A
A
 
E
M
 
M
A
 
A
S
 
K

1sb3C Structure of 4-hydroxybenzoyl-coa reductase from thauera aromatica (see paper)
48% identity, 96% coverage: 3:152/156 of query aligns to 5:153/161 of 1sb3C

query
sites
1sb3C
V
 
L
Q
 
R
F
 
L
T
 
T
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
A
A
 
R
S
 
E
V
 
D
D
 
L
V
 
V
P
 
P
P
 
D
N
 
N
T
 
M
L
 
L
L
 
L
V
 
L
H
 
D
A
 
Y
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
T
L
 
V
L
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
K
V
x
Q
G
 
G
C
|
C
D
 
D
T
 
G
S
x
G
Q
 
E
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
L
V
 
V
N
 
D
G
 
D
R
 
R
A
 
P
V
 
R
K
 
L
S
 
A
C
|
C
A
 
S
M
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
H
Q
 
Q
A
 
V
Q
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
K
V
 
V
T
 
E
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
-
D
 
Q
G
 
G
T
 
T
M
 
L
H
 
S
P
 
K
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
K
 
H
E
 
E
C
 
K
H
 
L
G
 
G
L
 
T
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
I
M
 
M
S
 
A
A
 
S
V
 
E
D
 
A
L
 
L
C
 
L
K
 
R
N
 
K
H
 
N
P
 
P
G
 
S
A
 
P
S
 
S
E
 
R
G
 
D
E
 
E
I
 
I
R
 
K
E
 
A
L
 
A
L
 
L
E
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
V
N
 
K
I
 
I
V
 
I
R
 
K
A
 
S
V
 
V
Q
 
E
V
 
T
G
 
A
Q
 
A
K
 
A
A
 
A

P77165 Aldehyde oxidoreductase iron-sulfur-binding subunit PaoA; EC 1.2.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
46% identity, 94% coverage: 1:147/156 of query aligns to 61:221/229 of P77165

query
sites
P77165
M
 
M
Q
 
P
V
 
L
Q
 
T
F
 
L
T
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
T
A
 
E
S
 
Q
V
 
L
D
 
E
V
 
V
P
 
D
P
 
T
N
 
R
T
 
T
L
 
T
L
 
L
V
 
L
H
 
D
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
H
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
H
 
K
V
 
K
G
 
G
C
|
C
D
 
D
T
 
H
S
 
G
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
R
V
 
L
K
 
N
S
 
A
C
|
C
A
 
L
M
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Q
 
M
A
 
H
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
G
A
 
S
A
 
P
D
 
D
G
 
N
T
 
-
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
K
 
I
E
 
K
C
 
H
H
 
D
G
 
G
L
 
F
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
S
G
 
G
M
 
Q
V
 
I
M
 
C
S
 
S
A
 
S
V
 
V
D
 
A
L
 
V
C
 
L
K
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
S
-
 
H
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
V
N
 
S
H
 
A
P
 
P
G
 
E
A
 
T
S
 
T
E
 
A
G
 
D
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
R
L
 
M
E
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
G
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
L
R
 
A
A
 
A
V
 
I
Q
 
E

5g5gA Escherichia coli periplasmic aldehyde oxidase (see paper)
46% identity, 94% coverage: 1:147/156 of query aligns to 10:170/175 of 5g5gA

query
sites
5g5gA
M
 
M
Q
 
P
V
 
L
Q
 
T
F
 
L
T
 
K
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
T
A
 
E
S
 
Q
V
 
L
D
 
E
V
 
V
P
 
D
P
 
T
N
 
R
T
 
T
L
 
T
L
 
L
V
 
L
H
 
D
A
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
N
L
 
L
L
 
H
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
H
 
K
V
 
K
G
|
G
C
|
C
D
|
D
T
 
H
S
x
G
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
L
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
R
A
 
R
V
 
L
K
 
N
S
 
A
C
|
C
A
 
L
M
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Q
 
M
A
 
H
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
G
A
 
S
A
 
P
D
 
D
G
 
-
T
 
N
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
M
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
F
 
F
K
 
I
E
 
K
C
 
H
H
 
D
G
 
G
L
 
F
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
S
G
 
G
M
 
Q
V
 
I
M
 
C
S
 
S
A
 
S
V
 
V
D
 
A
L
 
V
C
 
L
K
 
K
-
 
E
-
 
I
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
-
 
I
-
 
P
-
 
S
-
 
H
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
V
N
 
S
H
 
A
P
 
P
G
 
E
A
 
T
S
 
T
E
 
A
G
 
D
E
 
E
I
 
I
R
 
R
E
 
E
L
 
R
L
 
M
E
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
G
G
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
L
R
 
A
A
 
A
V
 
I
Q
 
E

1t3qA Crystal structure of quinoline 2-oxidoreductase from pseudomonas putida 86 (see paper)
42% identity, 94% coverage: 1:146/156 of query aligns to 4:148/162 of 1t3qA

query
sites
1t3qA
M
 
M
Q
 
R
V
 
I
Q
 
S
F
 
A
T
 
T
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
P
A
 
R
S
 
V
V
 
F
D
 
Y
V
 
V
P
 
E
P
 
P
N
 
R
T
 
M
L
 
H
L
 
L
V
 
A
H
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
V
L
 
V
L
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
K
V
x
I
G
 
G
C
|
C
D
x
E
T
 
Q
S
x
G
Q
 
V
C
|
C
G
|
G
A
 
S
C
|
C
T
 
T
V
 
I
H
 
L
V
 
I
N
 
D
G
 
G
R
 
A
A
 
P
V
 
M
K
x
R
S
 
S
C
|
C
A
 
L
M
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
C
E
 
S
V
 
I
T
 
E
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
S
A
 
Q
A
 
G
D
 
E
G
 
-
T
 
K
M
 
L
H
 
N
P
 
A
M
 
L
Q
 
Q
A
 
D
A
 
S
F
 
F
K
 
R
E
 
R
C
 
H
H
 
H
G
 
A
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
A
G
 
G
M
 
M
V
 
L
M
 
A
S
 
T
A
 
A
V
 
R
D
 
S
L
 
I
C
 
L
K
 
A
N
 
E
H
 
N
P
 
P
G
 
A
A
 
P
S
 
S
E
 
R
G
 
D
E
 
E
I
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
V
L
 
M
E
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
N
 
T
I
 
I
V
 
I
R
 
D
A
 
A
V
 
I

7dqxC Crystal structure of xanthine dehydrogenase family protein
45% identity, 93% coverage: 1:145/156 of query aligns to 4:148/160 of 7dqxC

query
sites
7dqxC
M
 
F
Q
 
R
V
 
L
Q
 
T
F
 
V
T
 
E
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
V
A
 
T
A
 
H
S
 
A
V
 
T
D
 
D
V
 
V
P
 
E
P
 
P
N
 
R
T
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
A
H
 
D
A
 
F
L
 
L
R
 
R
E
 
D
H
 
D
L
 
L
L
 
H
L
 
L
T
 
R
G
 
G
T
 
T
H
 
R
V
 
V
G
 
G
C
|
C
D
 
E
T
 
H
S
x
G
Q
x
V
C
|
C
G
 
G
A
 
S
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
R
 
Q
A
 
P
V
 
V
K
x
R
S
 
S
C
|
C
A
 
T
M
 
V
L
 
L
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
N
G
 
N
A
 
S
E
 
R
V
 
I
T
 
E
T
 
T
I
 
V
E
 
E
G
 
S
M
 
L
A
 
-
A
 
Q
A
 
K
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
A
 
R
A
 
S
F
 
F
K
 
S
E
 
K
C
 
C
H
 
H
G
 
A
L
 
L
Q
|
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
S
G
 
G
M
 
F
V
 
L
M
 
M
S
 
T
A
 
L
V
 
K
D
 
P
L
 
L
C
 
Y
K
 
D
N
 
D
H
 
E
P
 
D
G
 
V
A
 
T
S
 
L
E
 
D
G
 
A
-
 
T
E
 
S
I
 
A
R
 
R
E
 
E
L
 
A
L
 
I
E
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
Q
I
 
I
V
 
V
R
 
E
A
 
A

8gy3B Cryo-em structure of membrane-bound aldehyde dehydrogenase from gluconobacter oxydans
40% identity, 94% coverage: 1:147/156 of query aligns to 1:145/154 of 8gy3B

query
sites
8gy3B
M
 
M
Q
 
T
V
 
T
Q
 
K
F
 
F
T
 
E
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
Q
A
 
P
A
 
V
S
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
A
P
 
P
P
 
A
N
 
D
T
 
T
L
 
P
L
 
L
V
 
L
H
 
W
A
 
V
L
 
I
R
 
R
E
 
D
H
 
D
L
 
L
L
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
K
V
 
F
G
|
G
C
|
C
D
x
G
T
 
I
S
x
G
Q
 
E
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
H
V
 
V
N
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
T
K
 
R
S
 
S
C
|
C
A
 
I
M
 
T
L
 
P
A
 
L
V
 
S
Q
 
A
A
 
V
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
L
A
 
D
A
 
P
A
 
A
D
 
G
G
 
N
T
 
-
M
 
-
H
 
H
P
 
V
M
 
V
Q
 
Q
A
 
V
A
 
A
F
 
W
K
 
R
E
 
D
C
 
Q
H
 
Q
G
 
V
L
 
P
Q
|
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
T
x
Q
P
 
S
G
 
G
M
 
Q
V
 
I
M
 
M
S
 
Q
A
 
A
V
 
A
D
 
S
L
 
L
C
 
L
K
 
K
N
 
D
H
 
Y
P
 
P
G
 
N
A
 
P
S
 
T
E
 
D
G
 
D
E
 
Q
I
 
I
R
 
D
E
 
G
L
 
V
L
 
M
E
 
G
G
 
G
N
 
S
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
M
G
 
T
Y
 
Y
Q
 
I
N
 
R
I
 
I
V
 
R
R
 
K
A
 
A
V
 
I
Q
 
K

3hrdD Crystal structure of nicotinate dehydrogenase (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:156/156 of query aligns to 4:158/160 of 3hrdD

query
sites
3hrdD
M
 
I
Q
 
T
V
 
I
Q
 
N
F
 
L
T
 
N
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
V
V
 
T
P
 
E
P
 
P
N
 
N
T
 
K
L
 
R
L
 
L
V
 
L
H
 
D
A
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
D
L
 
F
L
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
S
T
 
V
H
 
K
V
x
E
G
 
G
C
|
C
D
x
S
T
x
E
S
x
G
Q
x
E
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
I
V
 
F
N
 
N
G
 
G
R
 
D
A
 
P
V
 
V
K
 
T
S
 
T
C
|
C
A
 
C
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
D
G
 
E
A
 
S
E
 
T
V
 
I
T
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
-
D
 
D
G
 
G
T
 
K
M
 
P
H
 
S
P
 
L
M
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
C
F
 
F
K
 
L
E
 
E
C
 
A
H
 
G
G
 
A
L
 
V
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
I
M
 
L
S
 
T
A
 
A
V
 
K
D
 
A
L
 
L
C
 
L
K
 
D
N
 
K
H
 
N
P
 
P
G
 
D
A
 
P
S
 
T
E
 
D
G
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
T
E
 
V
L
 
A
L
 
M
E
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
I
N
 
K
I
 
I
V
 
H
R
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
R
V
 
Y
G
 
A
Q
 
V
K
 
E
A
 
R
M
 
C
A
 
A
S
 
N
A
 
A

1dgjA Crystal structure of the aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio desulfuricans atcc 27774 (see paper)
45% identity, 91% coverage: 5:146/156 of query aligns to 6:149/906 of 1dgjA

query
sites
1dgjA
F
 
L
T
 
I
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
M
A
 
A
A
 
R
S
 
R
V
 
L
D
 
L
V
 
V
P
 
S
P
 
P
N
 
N
T
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
V
H
 
D
A
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
S
H
 
Q
L
 
L
L
 
Q
L
 
L
T
 
T
G
 
S
T
 
V
H
 
K
V
|
V
G
|
G
C
|
C
D
x
G
T
 
K
S
x
G
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
V
V
 
V
K
x
R
S
 
A
C
|
C
A
 
I
M
 
I
-
 
K
L
 
M
A
 
S
V
 
R
Q
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
N
A
 
A
E
 
S
V
 
V
T
 
T
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
P
D
 
D
G
 
-
T
 
C
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
A
 
H
A
 
A
F
 
W
K
 
I
E
 
Q
C
 
H
H
 
G
G
 
A
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
K
D
 
A
L
 
L
C
 
L
K
 
D
N
 
E
H
 
N
P
 
V
G
 
A
A
 
P
S
 
S
E
 
R
G
 
E
E
 
D
I
 
V
R
 
R
E
 
D
L
 
W
L
 
F
E
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
H
N
 
N
I
 
I
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
K
N
 
P
I
 
L
V
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Q0QLF3 Nicotinate dehydrogenase small FeS subunit; NDH; Nicotinic acid hydroxylase small FeS subunit; NAH; EC 1.17.1.5 from Eubacterium barkeri (Clostridium barkeri) (see paper)
42% identity, 94% coverage: 1:147/156 of query aligns to 4:149/157 of Q0QLF3

query
sites
Q0QLF3
M
 
I
Q
 
T
V
 
I
Q
 
N
F
 
L
T
 
N
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
R
S
 
S
V
 
I
D
 
V
V
 
T
P
 
E
P
 
P
N
 
N
T
 
K
L
 
R
L
 
L
V
 
L
H
 
D
A
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
E
H
 
D
L
 
F
L
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
S
T
 
V
H
 
K
V
 
E
G
 
G
C
|
C
D
 
S
T
 
E
S
 
G
Q
 
E
C
|
C
G
 
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
I
V
 
F
N
 
N
G
 
G
R
 
D
A
 
P
V
 
V
K
 
T
S
 
T
C
|
C
A
 
C
M
 
M
L
 
L
A
 
A
V
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
D
G
 
E
A
 
S
E
 
T
V
 
I
T
 
I
T
 
T
I
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
V
A
 
-
A
 
A
A
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
K
M
 
P
H
 
S
P
 
L
M
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
C
F
 
F
K
 
L
E
 
E
C
 
A
H
 
G
G
 
A
L
 
V
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
Y
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
M
V
 
I
M
 
L
S
 
T
A
 
A
V
 
K
D
 
A
L
 
L
C
 
L
K
 
D
N
 
K
H
 
N
P
 
P
G
 
D
A
 
P
S
 
T
E
 
D
G
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
T
E
 
V
L
 
A
L
 
M
E
 
S
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
I
N
 
K
I
 
I
V
 
H
R
 
A
A
 
A
V
 
V
Q
 
R

2w54A Crystal structure of xanthine dehydrogenase from rhodobacter capsulatus in complex with bound inhibitor pterin-6-aldehyde (see paper)
43% identity, 92% coverage: 1:144/156 of query aligns to 1:144/450 of 2w54A

query
sites
2w54A
M
 
M
Q
 
E
V
 
I
Q
 
A
F
 
F
T
 
L
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
A
 
T
A
 
R
S
 
R
V
 
V
D
 
R
V
 
I
-
 
E
P
 
D
P
 
P
N
 
T
T
 
Q
L
 
S
L
 
L
V
 
L
H
 
E
A
 
W
L
 
L
R
 
R
E
 
A
H
 
E
L
 
G
L
 
L
L
 
-
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
K
V
 
E
G
|
G
C
|
C
D
x
N
T
 
E
S
x
G
Q
 
D
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
M
V
 
I
N
 
R
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
G
G
 
S
R
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
N
S
 
A
C
|
C
A
 
L
M
 
M
L
 
M
A
 
L
V
 
P
Q
 
Q
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
A
V
 
L
T
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
R
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
V
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
F
 
M
K
 
I
E
 
D
C
 
H
H
 
H
G
 
G
L
 
S
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
V
S
 
S
A
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
M
C
 
A
K
 
A
N
 
A
H
 
H
P
 
-
G
 
D
A
 
R
S
 
D
E
 
R
G
 
K
E
 
D
I
 
Y
R
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
|
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
A
N
 
P
I
 
I
V
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1jroA Crystal structure of xanthine dehydrogenase from rhodobacter capsulatus (see paper)
43% identity, 92% coverage: 1:144/156 of query aligns to 1:144/450 of 1jroA

query
sites
1jroA
M
 
M
Q
 
E
V
 
I
Q
 
A
F
 
F
T
 
L
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
A
 
T
A
 
R
S
 
R
V
 
V
D
 
R
V
 
I
-
 
E
P
 
D
P
 
P
N
 
T
T
 
Q
L
 
S
L
 
L
V
 
L
H
 
E
A
 
L
L
 
L
R
 
R
E
 
A
H
 
E
L
 
G
L
 
L
L
 
-
T
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
K
V
x
E
G
|
G
C
|
C
D
x
N
T
 
E
S
x
G
Q
x
D
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
T
V
 
V
H
 
M
V
 
I
N
 
R
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
G
G
 
S
R
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
N
S
 
A
C
|
C
A
 
L
M
 
M
L
 
M
A
 
L
V
 
P
Q
 
Q
A
 
I
Q
 
A
G
 
G
A
 
K
E
 
A
V
 
L
T
 
R
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
P
D
 
D
G
 
G
T
 
R
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
V
Q
 
Q
A
 
Q
A
 
A
F
 
M
K
 
I
E
 
D
C
 
H
H
 
H
G
 
G
L
 
S
Q
 
Q
C
|
C
G
 
G
F
 
F
C
|
C
T
 
T
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
V
S
 
S
A
 
-
V
 
-
D
 
-
L
 
M
C
 
A
K
 
A
N
 
A
H
 
H
P
 
-
G
 
D
A
 
R
S
 
D
E
 
R
G
 
K
E
 
D
I
 
Y
R
 
D
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
A
G
 
G
N
 
N
I
 
L
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
A
N
 
P
I
 
I
V
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4usaA Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with trans-cinnamaldehyde (see paper)
41% identity, 94% coverage: 1:146/156 of query aligns to 2:149/907 of 4usaA

query
sites
4usaA
M
 
I
Q
 
Q
V
 
K
Q
 
V
F
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
A
 
E
A
 
Q
S
 
N
V
 
L
D
 
F
V
 
V
P
 
D
P
 
A
N
 
E
T
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
S
H
 
D
A
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
H
 
Q
L
 
L
L
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
H
 
K
V
|
V
G
 
G
C
|
C
D
x
E
T
 
Q
S
x
G
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
H
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
V
V
 
V
K
x
R
S
 
A
C
|
C
A
 
V
M
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
V
 
R
Q
 
V
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
V
A
 
G
A
 
Q
A
 
P
D
 
E
G
 
-
T
 
N
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
F
 
W
K
 
V
E
 
L
C
 
H
H
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
K
D
 
G
L
 
L
C
 
L
K
 
D
N
 
T
H
 
N
P
 
A
G
 
D
A
 
P
S
 
S
E
 
R
G
 
E
E
 
D
I
 
V
R
 
R
E
 
D
L
 
W
L
 
F
E
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
K
N
 
P
I
 
L
V
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

4us9A Aldehyde oxidoreductase from desulfovibrio gigas (mop), soaked with 3- phenylpropionaldehyde (see paper)
41% identity, 94% coverage: 1:146/156 of query aligns to 2:149/907 of 4us9A

query
sites
4us9A
M
 
I
Q
 
Q
V
 
K
Q
 
V
F
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
I
A
 
E
A
 
Q
S
 
N
V
 
L
D
 
F
V
 
V
P
 
D
P
 
A
N
 
E
T
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
S
H
 
D
A
 
V
L
 
L
R
 
R
E
 
Q
H
 
Q
L
 
L
L
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
H
 
K
V
|
V
G
 
G
C
|
C
D
x
E
T
 
Q
S
x
G
Q
 
Q
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
T
 
S
V
 
V
H
 
I
V
 
L
N
 
D
G
 
G
R
 
K
A
 
V
V
 
V
K
x
R
S
 
A
C
|
C
A
 
V
M
 
T
-
 
K
L
 
M
A
 
K
V
 
R
Q
 
V
A
 
A
Q
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
V
 
I
T
 
T
T
 
T
I
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
V
A
 
G
A
 
Q
A
 
P
D
 
E
G
 
-
T
 
N
M
 
L
H
 
H
P
 
P
M
 
L
Q
 
Q
A
 
K
A
 
A
F
 
W
K
 
V
E
 
L
C
 
H
H
 
G
G
 
G
L
 
A
Q
|
Q
C
|
C
G
|
G
F
 
F
C
|
C
T
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
F
V
 
I
M
 
V
S
 
S
A
 
A
V
 
K
D
 
G
L
 
L
C
 
L
K
 
D
N
 
T
H
 
N
P
 
A
G
 
D
A
 
P
S
 
S
E
 
R
G
 
E
E
 
D
I
 
V
R
 
R
E
 
D
L
 
W
L
 
F
E
 
Q
G
 
K
-
 
H
-
 
R
N
 
N
I
 
A
C
|
C
R
 
R
C
|
C
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
K
N
 
P
I
 
L
V
 
V
R
 
D
A
 
A
V
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>Ac3H11_3590 FitnessBrowser__acidovorax_3H11:Ac3H11_3590
MQVQFTVNGRAASVDVPPNTLLVHALREHLLLTGTHVGCDTSQCGACTVHVNGRAVKSCA
MLAVQAQGAEVTTIEGMAAADGTMHPMQAAFKECHGLQCGFCTPGMVMSAVDLCKNHPGA
SEGEIRELLEGNICRCTGYQNIVRAVQVGQKAMASA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory